View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14600_low_1 (Length: 340)

Name: NF14600_low_1
Description: NF14600
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14600_low_1
NF14600_low_1
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (14-340)||(2041-2367)
scaffold0234 (14-340)||(10932-11258)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (14-340)||(17684189-17684515)
chr6 (14-340)||(27380972-27381298)
chr6 (14-340)||(27471355-27471681)
chr6 (14-340)||(17691160-17691486)
chr6 (14-338)||(11651886-11652210)
chr6 (14-340)||(29309051-29309377)
chr6 (14-340)||(29316011-29316336)
chr6 (14-338)||(188697-189021)
chr6 (14-247)||(27296883-27297116)
chr6 (14-287)||(16394165-16394438)
chr6 (15-236)||(16559193-16559414)
chr6 (18-255)||(25536915-25537152)
chr6 (31-333)||(13359010-13359308)
chr6 (231-340)||(16566257-16566366)
chr6 (14-330)||(22859888-22860199)
chr6 (14-330)||(16789062-16789373)
chr6 (14-314)||(27508347-27508642)
chr6 (14-330)||(1586108-1586419)
chr6 (28-314)||(27527947-27528228)
chr6 (24-316)||(2669478-2669768)
chr6 (155-330)||(18019981-18020152)
chr6 (14-330)||(8612906-8613221)
chr6 (14-330)||(14074471-14074782)
chr6 (36-330)||(10359073-10359360)
chr6 (148-333)||(27925922-27926103)
chr6 (117-333)||(17850321-17850534)
chr6 (92-303)||(28172754-28172963)
chr6 (99-246)||(20736413-20736557)
chr6 (88-243)||(8510181-8510333)
chr6 (197-332)||(20553492-20553625)
chr6 (186-307)||(19347092-19347212)
chr6 (283-340)||(25537148-25537205)
chr6 (64-323)||(19218427-19218676)
chr6 (111-246)||(21994662-21994794)
chr6 (14-246)||(17120505-17120733)
chr6 (99-246)||(5758565-5758709)
chr6 (111-323)||(4073574-4073781)
chr6 (142-322)||(22560311-22560487)
chr6 (14-127)||(33317055-33317167)
chr6 (226-330)||(13995151-13995254)
chr6 (31-170)||(28756145-28756283)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (14-340)||(18262373-18262699)
chr4 (14-340)||(18269234-18269560)
chr4 (14-340)||(55612844-55613170)
chr4 (14-340)||(26963801-26964127)
chr4 (14-340)||(26970624-26970950)
chr4 (14-340)||(868758-869084)
chr4 (14-340)||(19926480-19926806)
chr4 (14-340)||(10621053-10621379)
chr4 (14-339)||(8858329-8858654)
chr4 (14-338)||(5707483-5707807)
chr4 (14-338)||(5714111-5714435)
chr4 (14-340)||(10628132-10628458)
chr4 (14-340)||(28392854-28393180)
chr4 (14-339)||(8845365-8845690)
chr4 (14-340)||(4426336-4426650)
chr4 (14-339)||(35223722-35224047)
chr4 (14-338)||(5667849-5668169)
chr4 (10-338)||(20311455-20311781)
chr4 (14-246)||(10677303-10677534)
chr4 (14-246)||(10890943-10891174)
chr4 (14-330)||(15461488-15461799)
chr4 (14-330)||(34975542-34975853)
chr4 (14-330)||(2677004-2677315)
chr4 (14-330)||(15815012-15815323)
chr4 (14-330)||(18111043-18111354)
chr4 (14-330)||(26531604-26531915)
chr4 (14-330)||(3369023-3369334)
chr4 (14-330)||(17299959-17300270)
chr4 (189-332)||(56516225-56516368)
chr4 (115-265)||(21453961-21454110)
chr4 (14-330)||(18163153-18163464)
chr4 (14-330)||(20243928-20244239)
chr4 (14-316)||(5870423-5870720)
chr4 (14-330)||(4675983-4676294)
chr4 (30-246)||(19365593-19365806)
chr4 (14-246)||(1941798-1942026)
chr4 (14-253)||(9487618-9487853)
chr4 (14-300)||(32646523-32646807)
chr4 (30-246)||(5616469-5616681)
chr4 (14-234)||(30040489-30040705)
chr4 (31-242)||(19362488-19362695)
chr4 (116-246)||(32636558-32636685)
chr4 (30-246)||(5528495-5528707)
chr4 (30-253)||(9538026-9538244)
chr4 (239-316)||(24700214-24700291)
chr4 (99-246)||(4546154-4546298)
chr4 (14-231)||(11421096-11421309)
chr4 (147-274)||(34777850-34777975)
chr4 (111-265)||(33888594-33888743)
chr4 (31-170)||(23056080-23056218)
chr4 (92-142)||(24701361-24701411)
chr4 (277-338)||(10677538-10677599)
chr4 (277-338)||(10891178-10891239)
chr4 (42-123)||(9937745-9937826)
chr4 (263-328)||(9937933-9937998)
chr4 (153-244)||(9937830-9937923)
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (14-340)||(6110225-6110551)
chr3 (14-340)||(16482203-16482529)
chr3 (14-340)||(15600604-15600930)
chr3 (14-340)||(15607149-15607475)
chr3 (14-338)||(10579075-10579399)
chr3 (14-340)||(10572312-10572638)
chr3 (14-340)||(18520136-18520462)
chr3 (14-340)||(15357306-15357632)
chr3 (14-340)||(17780838-17781164)
chr3 (18-340)||(18522824-18523146)
chr3 (14-340)||(8490649-8490982)
chr3 (14-340)||(15341939-15342265)
chr3 (14-338)||(13211465-13211789)
chr3 (14-340)||(13248768-13249094)
chr3 (14-340)||(32056619-32056946)
chr3 (10-338)||(17199900-17200228)
chr3 (14-339)||(13516973-13517294)
chr3 (14-340)||(1647241-1647567)
chr3 (14-340)||(17136520-17136840)
chr3 (14-338)||(29925134-29925458)
chr3 (14-338)||(29974287-29974611)
chr3 (14-304)||(16200627-16200917)
chr3 (14-330)||(15846536-15846847)
chr3 (14-330)||(21034229-21034540)
chr3 (14-330)||(20147554-20147865)
chr3 (99-333)||(24253197-24253427)
chr3 (14-321)||(21398792-21399094)
chr3 (14-330)||(12299902-12300212)
chr3 (14-330)||(55427012-55427323)
chr3 (14-321)||(14890391-14890693)
chr3 (14-246)||(25978728-25978956)
chr3 (112-330)||(14147012-14147226)
chr3 (48-253)||(15526820-15527021)
chr3 (14-199)||(28088227-28088408)
chr3 (14-246)||(11787661-11787889)
chr3 (283-340)||(19089734-19089791)
chr3 (88-280)||(32280313-32280507)
chr3 (14-246)||(15317176-15317401)
chr3 (153-282)||(28953965-28954093)
chr3 (52-167)||(30464147-30464261)
chr3 (236-338)||(9504446-9504548)
chr3 (262-340)||(16200286-16200363)
chr3 (210-303)||(8251933-8252026)
chr3 (111-175)||(36138033-36138097)
chr3 (111-175)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (14-340)||(18252191-18252517)
chr1 (14-340)||(18532234-18532560)
chr1 (14-340)||(27131130-27131455)
chr1 (14-337)||(27310297-27310620)
chr1 (14-337)||(16358755-16359078)
chr1 (14-340)||(3855639-3855965)
chr1 (14-340)||(36816354-36816679)
chr1 (14-295)||(22641594-22641871)
chr1 (14-340)||(27277278-27277603)
chr1 (142-340)||(21171081-21171279)
chr1 (14-340)||(23507061-23507385)
chr1 (14-330)||(19706439-19706750)
chr1 (181-338)||(22657108-22657265)
chr1 (14-330)||(43802365-43802676)
chr1 (14-315)||(28134723-28135019)
chr1 (14-206)||(9916497-9916688)
chr1 (92-332)||(12014084-12014322)
chr1 (14-330)||(9456107-9456418)
chr1 (14-330)||(20391239-20391550)
chr1 (14-330)||(20779645-20779956)
chr1 (14-330)||(22670257-22670568)
chr1 (14-330)||(42816989-42817300)
chr1 (14-330)||(22612483-22612794)
chr1 (212-340)||(9917837-9917964)
chr1 (34-321)||(633934-634216)
chr1 (14-330)||(8727658-8727969)
chr1 (30-246)||(29096796-29097008)
chr1 (14-330)||(47667485-47667785)
chr1 (114-246)||(21881475-21881604)
chr1 (99-340)||(12006350-12006585)
chr1 (189-330)||(35930573-35930713)
chr1 (111-246)||(51997353-51997485)
chr1 (14-127)||(28145723-28145835)
chr1 (187-313)||(26923553-26923678)
chr1 (101-184)||(24301691-24301774)
chr1 (116-175)||(10852402-10852461)
chr1 (212-265)||(16219748-16219801)
chr1 (153-232)||(31236402-31236478)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (15-340)||(21940826-21941151)
chr8 (14-337)||(22171651-22171974)
chr8 (14-340)||(6094284-6094610)
chr8 (14-338)||(24642812-24643135)
chr8 (14-277)||(15326422-15326685)
chr8 (14-277)||(15506791-15507054)
chr8 (14-155)||(28548393-28548534)
chr8 (88-316)||(14983717-14983942)
chr8 (14-330)||(8371253-8371564)
chr8 (14-330)||(21969324-21969635)
chr8 (129-326)||(24797224-24797419)
chr8 (14-330)||(12562114-12562425)
chr8 (14-330)||(27007517-27007828)
chr8 (14-330)||(27014660-27014971)
chr8 (14-330)||(27880487-27880798)
chr8 (14-330)||(28020668-28020979)
chr8 (30-331)||(38232115-38232414)
chr8 (14-330)||(22130609-22130920)
chr8 (14-330)||(25611186-25611497)
chr8 (14-316)||(22659494-22659791)
chr8 (14-330)||(21916667-21916978)
chr8 (14-330)||(45534273-45534584)
chr8 (111-330)||(18835341-18835556)
chr8 (14-246)||(26240558-26240786)
chr8 (31-306)||(8781892-8782162)
chr8 (123-298)||(2375214-2375386)
chr8 (14-246)||(6430960-6431188)
chr8 (194-340)||(32872741-32872887)
chr8 (14-246)||(2962932-2963164)
chr8 (24-121)||(24796731-24796826)
chr8 (30-217)||(20535226-20535409)
chr8 (224-316)||(29645539-29645631)
chr8 (300-340)||(28555044-28555084)
chr8 (9-127)||(36970439-36970556)
chr8 (10-127)||(2375411-2375528)
chr8 (222-274)||(10920427-10920479)
chr8 (190-265)||(27677551-27677626)
chr8 (188-247)||(34659059-34659118)
chr8 (101-163)||(29645675-29645737)
chr8 (14-75)||(8968015-8968076)
chr8 (249-302)||(24535514-24535567)
chr8 (214-246)||(36970339-36970371)
chr8 (26-74)||(41368106-41368154)
chr8 (26-74)||(41375077-41375125)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (14-340)||(7268-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (14-340)||(6654-6980)
scaffold0390 (14-340)||(13670-13996)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (18-340)||(15152604-15152926)
chr7 (14-340)||(29327945-29328271)
chr7 (14-340)||(11535782-11536108)
chr7 (14-340)||(11542700-11543026)
chr7 (14-339)||(12750988-12751313)
chr7 (14-340)||(12738697-12739023)
chr7 (14-340)||(18561168-18561485)
chr7 (14-340)||(13392311-13392637)
chr7 (8-339)||(18257559-18257887)
chr7 (14-330)||(2204543-2204854)
chr7 (14-330)||(18400095-18400406)
chr7 (14-330)||(18407079-18407390)
chr7 (14-330)||(19230879-19231190)
chr7 (14-330)||(48808496-48808807)
chr7 (14-321)||(8464999-8465301)
chr7 (14-330)||(15729742-15730053)
chr7 (14-330)||(18139338-18139649)
chr7 (26-330)||(30254129-30254428)
chr7 (14-254)||(2365169-2365407)
chr7 (14-246)||(41680968-41681196)
chr7 (14-330)||(10668901-10669213)
chr7 (26-330)||(47166871-47167170)
chr7 (189-302)||(10235361-10235474)
chr7 (36-316)||(24443349-24443624)
chr7 (14-246)||(34128647-34128875)
chr7 (99-329)||(19388544-19388774)
chr7 (14-246)||(28130635-28130863)
chr7 (280-340)||(15148303-15148363)
chr7 (36-323)||(25845498-25845780)
chr7 (36-323)||(25845917-25846199)
chr7 (14-246)||(18259124-18259352)
chr7 (25-162)||(39112138-39112275)
chr7 (111-246)||(14591924-14592056)
chr7 (111-246)||(16011515-16011647)
chr7 (100-239)||(31190524-31190660)
chr7 (52-246)||(19393462-19393652)
chr7 (114-246)||(22969024-22969153)
chr7 (243-332)||(7396358-7396450)
chr7 (198-316)||(7662569-7662686)
chr7 (212-316)||(47833875-47833979)
chr7 (188-305)||(3132870-3132986)
chr7 (221-321)||(19859122-19859221)
chr7 (88-163)||(22948499-22948574)
chr7 (14-202)||(15169290-15169474)
chr7 (214-256)||(7396469-7396511)
chr7 (283-338)||(2365057-2365112)
chr7 (232-287)||(29983179-29983234)
chr7 (104-168)||(29984308-29984372)
chr7 (221-333)||(39111980-39112092)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (14-338)||(24695186-24695510)
chr5 (14-339)||(19714218-19714543)
chr5 (14-339)||(19706939-19707263)
chr5 (14-337)||(18569581-18569906)
chr5 (136-340)||(39538749-39538953)
chr5 (14-305)||(17298621-17298912)
chr5 (14-305)||(17285470-17285759)
chr5 (101-330)||(18806843-18807070)
chr5 (10-188)||(27347252-27347428)
chr5 (14-121)||(24701950-24702057)
chr5 (14-330)||(20941018-20941329)
chr5 (14-330)||(25805385-25805696)
chr5 (147-338)||(22546872-22547060)
chr5 (14-330)||(31890-32201)
chr5 (14-330)||(12789663-12789974)
chr5 (14-330)||(22941241-22941552)
chr5 (14-330)||(23545913-23546224)
chr5 (14-330)||(24933306-24933617)
chr5 (14-330)||(31096807-31097118)
chr5 (26-316)||(20100255-20100540)
chr5 (14-330)||(5097642-5097953)
chr5 (14-330)||(7865430-7865745)
chr5 (14-330)||(12764990-12765305)
chr5 (101-239)||(18806483-18806619)
chr5 (101-239)||(18806663-18806799)
chr5 (14-330)||(9811733-9812048)
chr5 (14-330)||(12703874-12704189)
chr5 (108-263)||(18829377-18829530)
chr5 (249-340)||(27347433-27347524)
chr5 (10-322)||(26129689-26129996)
chr5 (14-330)||(26245093-26245404)
chr5 (10-99)||(28719471-28719558)
chr5 (31-243)||(31651802-31652009)
chr5 (14-95)||(39538954-39539035)
chr5 (189-316)||(33477193-33477319)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (14-340)||(18449-18774)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (10-340)||(25706-26036)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (14-340)||(21329968-21330294)
chr2 (14-337)||(18796670-18796993)
chr2 (8-332)||(18619973-18620296)
chr2 (14-340)||(36270327-36270650)
chr2 (26-340)||(18822244-18822556)
chr2 (14-339)||(22183206-22183528)
chr2 (28-326)||(6991847-6992146)
chr2 (14-285)||(20978091-20978360)
chr2 (14-330)||(24250032-24250343)
chr2 (14-330)||(30174368-30174679)
chr2 (14-330)||(24229215-24229526)
chr2 (26-246)||(15342014-15342230)
chr2 (191-316)||(18851956-18852081)
chr2 (189-340)||(19279449-19279600)
chr2 (12-246)||(29800545-29800775)
chr2 (212-315)||(36801899-36802003)
chr2 (14-177)||(17241034-17241196)
chr2 (99-246)||(19616509-19616653)
chr2 (112-251)||(40301034-40301169)
chr2 (111-253)||(21626817-21626955)
chr2 (39-249)||(41316305-41316511)
chr2 (14-81)||(41661694-41661761)
chr2 (92-161)||(36799756-36799826)
chr2 (99-175)||(28740910-28740986)
chr2 (285-330)||(12098609-12098654)
chr2 (187-247)||(28718943-28719003)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (33-340)||(1154-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (10-340)||(5690-6013)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (14-270)||(230111-230367)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (14-330)||(174-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (14-330)||(3675-3986)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (14-330)||(119721-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (26-330)||(12961-13260)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (52-330)||(130262-130535)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (14-246)||(67374-67602)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (111-330)||(8296-8511)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (14-246)||(26616-26844)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (14-321)||(39988-40290)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (42-244)||(8807-9005)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (198-332)||(90019-90154)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (14-204)||(102-288)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (111-246)||(83111-83243)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (14-246)||(11526-11758)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (14-246)||(53839-54066)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (138-234)||(11328-11421)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (191-282)||(45956-46051)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 2041 - 2367
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2041 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 2140  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2141 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 2240  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2241 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 2340  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2341 atagtctctatgctttaatgatatccc 2367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 10932 - 11258
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10932 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11031  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11131  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11132 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 11231  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11232 atagtctctatgctttaatgatatccc 11258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 17684189 - 17684515
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17684189 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17684288  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684289 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17684388  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684389 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 17684488  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17684489 atagtctctatgctttaatgatatccc 17684515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 27380972 - 27381298
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27380972 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27381071  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381072 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27381171  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381172 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 27381271  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27381272 atagtctctatgctttaatgatatccc 27381298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 27471355 - 27471681
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27471355 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27471454  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471455 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27471554  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471555 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 27471654  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27471655 atagtctctatgctttaatgatatccc 27471681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 17691160 - 17691486
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17691160 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17691259  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691260 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17691359  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 17691459  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17691460 atagtctttatgctttaatgatatccc 17691486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 14 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11652210 - 11651886
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11652210 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11652111  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652110 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11652011  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11652010 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 11651911  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  11651910 atagtctctatgctttaatgatatc 11651886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29309377 - 29309051
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  29309377 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacctgactccaacatctagggtacat 29309278  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309277 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29309178  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309177 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 29309078  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29309077 atagtctctatgctttaatgatatccc 29309051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29316336 - 29316011
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29316336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcact-gactccaacatctagggtacat 29316238  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316237 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29316138  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316137 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 29316038  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29316037 atagtctctatgctttaatgatatccc 29316011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 14 - 338
Target Start/End: Original strand, 188697 - 189021
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  188697 catgatttatggagtatccatcaatcaactttatagtcattctgttacagacaatatttgaatgataacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 188796  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188797 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 188896  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  188897 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 188996  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  188997 atagtctctatgctttaatgatatc 189021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27297116 - 27296883
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27297116 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27297017  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297016 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27296917  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296916 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 27296883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 16394165 - 16394438
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16394165 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgattccaacatctagggtacat 16394264  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  16394265 agtggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctcatggtgggtc 16394364  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16394365 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactgtttatccatgatatgtga 16394438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 236
Target Start/End: Original strand, 16559193 - 16559414
Alignment:
Q  15 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16559193 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctacggtacata 16559292  T
Q  115 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16559293 gcggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtggatca 16559392  T
Q  215 atccaatataaatattactcct 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559393 atccaatataaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 255
Target Start/End: Original strand, 25536915 - 25537152
Alignment:
Q  18 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25536915 attcatggagtacccatcaaccaactttataatcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtaaatagtg 25537014  T
Q  118 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537015 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 25537114  T
Q  218 caatataaatattactcctaatatttatatttatgtga 255  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  25537115 caatataaatatgacacctaatatttatatctatgtga 25537152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 333
Target Start/End: Original strand, 13359010 - 13359308
Alignment:
Q  31 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13359010 ccatcaaccgactttatagtcatcctgttacggacgatgtttgtacggcaacaaaatactcgactcctacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaa 13359109  T
Q  131 gggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatat 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||  ||| | |||||||||  |||||| |   |||| |||||||||||     
T  13359110 gggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataa--ttttcaatgtagtat--tcatggtgagacaattcaatataaatac 13359204  T
Q  230 tactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgcttt 329  Q
    |||| |||||| |||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| | | |||||| |||||| |||||    
T  13359205 tacttctaatacttatatctaagtgaagatttgataactttttatccatgatttgcgagatgtgatcatcagtctatccatataatagtctctacgcttt 13359304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 231 - 340
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566366
Alignment:
Q  231 actcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgcttta 330  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16566257 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 16566356  T
Q  331 atgatatccc 340  Q
    ||||||||||    
T  16566357 atgatatccc 16566366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 22859888 - 22860199
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22859888 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 22859986  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  22859987 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22860083  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22860084 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22860182  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  22860183 atagtctcgacgcttta 22860199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16789373 - 16789062
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  16789373 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 16789275  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  16789274 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 16789178  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  16789177 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 16789079  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  16789078 atagtctcgacgcttta 16789062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 314
Target Start/End: Original strand, 27508347 - 27508642
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27508347 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 27508445  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27508446 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27508542  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27508543 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27508641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 1586108 - 1586419
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  1586108 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 1586206  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  1586207 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 1586303  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  1586304 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 1586402  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  1586403 atagtctcgacgcttta 1586419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 27527947 - 27528228
Alignment:
Q  28 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 127  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  27527947 tacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtc 27528045  T
Q  128 gaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaat 227  Q
     ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||    
T  27528046 taagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaat 27528142  T
Q  228 attactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 314  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  27528143 attactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataa 27528228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2669768 - 2669478
Alignment:
Q  24 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 123  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |   |||||  ||  |||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  2669768 ggagtaccaatcaactgactttatagtcatcctgttatagataacatttgaacgacaacaaagtaccggactcctacatctagagtacataatgatttca 2669669  T
Q  124 ggtcgaagggtggaatacaccacta-tcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaata 222  Q
    |||| ||  ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||   | ||| ||  |||||||||||| |||||  |  |||||| ||||    
T  2669668 ggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataacttatgatacttaa-acaacatt--ctatgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaata 2669572  T
Q  223 taaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataata 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  2669571 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgattcatgagatgtgatcatcaatctacccatataata 2669478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 155 - 330
Target Start/End: Original strand, 18019981 - 18020152
Alignment:
Q  155 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtg 254  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18019981 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgta 18020077  T
Q  255 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgcttta 330  Q
     |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  18020078 tagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 18020152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8613221 - 8612906
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  8613221 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 8613123  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |   | |||||||   |||||||||||||||||| || ||    
T  8613122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 8613025  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 310  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8613024 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8612926  T
Q  311 ataatattctctatgcttta 330  Q
    |||||| |||| | ||||||    
T  8612925 ataatagtctcgacgcttta 8612906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14074782 - 14074471
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||| ||  ||||| |||| || || | |||||||||  |||    
T  14074782 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaaaggcaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 14074684  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||||||   ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  14074683 agtggtttcaggtctaagagcaatatacacttttatcattgtgaaaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14074587  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  14074586 aatccattataaatattactcccaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 14074488  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  14074487 atagtctcgacgcttta 14074471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 330
Target Start/End: Original strand, 10359073 - 10359360
Alignment:
Q  36 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 135  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||   | ||| ||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  10359073 aaccaacttaatggttatcctgttacggacaatgtttgaatgacaataaagcacacgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtg 10359171  T
Q  136 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcc 235  Q
    | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||||       
T  10359172 gtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac--ttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtataaatattaccta 10359267  T
Q  236 taatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgcttta 330  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||| |||   || ||||| |  ||||||||| |||||| ||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  10359268 taatatttatatctatgtatagacttaatatctc-acattcatga-ccatgagatgtggtcatcactctacatatataatagtctctacgcttta 10359360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27926103 - 27925922
Alignment:
Q  148 atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 247  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||| |||  || ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  27926103 atcactatgataataacctatgaca-tttacataatttt--ctgtgtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaatattattcctaat-ttaatat 27926008  T
Q  248 ttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatg 333  Q
     |||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | |||||||| ||| | ||||| ||||    
T  27926007 ctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatccgtgagatgagatcatcagtttatccacataatagtctttgtgcttcaatg 27925922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 333
Target Start/End: Original strand, 17850321 - 17850534
Alignment:
Q  117 ggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaat 216  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||     |  |||||||||||| | || || |||||    
T  17850321 ggtttcaggtcaaagggtggtatacatcactatcactataagaataacttatgatactta-cataaaaccca--atgtagtattcttaaggagggtcaat 17850417  T
Q  217 ccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataata 316  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||  |||||||| || || ||||||| | |||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17850418 ccaatatatatattactcataatatttatacctatgtgaatacacgataactcgttgtcaatgatctataagatatgatcatcagtctacccatataata 17850517  T
Q  317 ttctctatgctttaatg 333  Q
     ||| ||| ||| ||||    
T  17850518 gtctatatacttgaatg 17850534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28172963 - 28172754
Alignment:
Q  92 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttact 190  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||  | | |||   ||  |||||  ||   |    
T  28172963 gactcctatatctagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccacttatcactataaagatgacgtgtga-gtttcacataaagtt--at 28172867  T
Q  191 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagat 290  Q
    |||||  |||||||||| || ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||    
T  28172866 atgtaacattctcatggagggtcaatccaatataaacactacccttaatatttatatctatgtaaagacttgataactttttaacaatgatctgtaagat 28172767  T
Q  291 gtgatcatcagtc 303  Q
    |||||||||||||    
T  28172766 gtgatcatcagtc 28172754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 20736413 - 20736557
Alignment:
Q  99 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 198  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |  | |||||||||    
T  20736413 acatctagggatcatagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcatagcat--aatatgtagta 20736509  T
Q  199 ttctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20736510 ttctcacgatggatcaatccagtataaatattactcctaatatttata 20736557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8510333 - 8510181
Alignment:
Q  88 actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttt 187  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||| |||||||||||| || || ||||||| || |||||| ||     
T  8510333 actcgactcctacatctaaggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaactaatgacac-ttacataacatt- 8510236  T
Q  188 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatattt 243  Q
     |||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8510235 -ctatgtagtattatcattgtaggtcaatcaaatataaatattacttctaatattt 8510181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Original strand, 20553492 - 20553625
Alignment:
Q  197 tattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 296  Q
    ||||||||||  || |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||   ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20553492 tattctcatgatgggtcaatc-aatataaatattattcttaatatt-atatctatgtgaatgtttgatatttctttatcgatgatatgtgagatgtgatc 20553589  T
Q  297 atcagtctacctacataatattctctatgctttaat 332  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  20553590 atcagtctaccaacataaaaatctttatgctttaat 20553625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Original strand, 19347092 - 19347212
Alignment:
Q  186 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  19347092 ttactatgtagtattctaatggcagttcaatccattacaaatattattc-taatgtttatacttatgtgaaaacatgacaactctttatcaatgatatgt 19347190  T
Q  286 gagatgtgatcatcagtctacc 307  Q
    ||||| || |||||| ||||||    
T  19347191 gagatatggtcatcaatctacc 19347212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 283 - 340
Target Start/End: Original strand, 25537148 - 25537205
Alignment:
Q  283 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25537148 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatccc 25537205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 19218676 - 19218427
Alignment:
Q  64 acaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 163  Q
    ||||||||||||||   | |||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||| || | ||| | || ||||| | |||||||||    
T  19218676 acaacgtttgaatgacaataaaacacttgagtccaa-atttagggatcatagtggtttcaggtctaagagtagtatatatcattatcattctgagaatat 19218578  T
Q  164 cttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttga 263  Q
    ||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| || || |     |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| |    
T  19218577 cttatga-aattttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggt-----caatataaattttactcctaatatttatacatatgtatagacttaa 19218486  T
Q  264 taactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctcta 323  Q
    || |||  ||| ||||| |  |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19218485 tatctc-atattcatgacccatgaggtgtggtcatcagtctacatacataatagtctcta 19218427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994662
Alignment:
Q  111 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatttagtattctcatggtgg 21994698  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
     ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  21994697 gtcattccagtataaatattactcgtaatgtttata 21994662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 17120505 - 17120733
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||| |||||   ||||| |||| || ||| |||| |||||  |||    
T  17120505 catgattcatcaagcacccatcaaccaacgttatggttatcctttgacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatatagggatcat 17120603  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||| |||||||  | || ||    
T  17120604 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatttagcattctcacagtgggtc 17120700  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  17120701 aatccagtataaatactactcctagtatttata 17120733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 5758565 - 5758709
Alignment:
Q  99 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 198  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||| || | | |||||| |  |||||||||||    
T  5758565 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatggcaatct-cataacgt--actatgtagta 5758661  T
Q  199 ttctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    ||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5758662 ttctcacagtggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4073781 - 4073574
Alignment:
Q  111 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |  ||||||||||||||| ||  |    
T  4073781 catagtggttttaggtctaagattggtatacatcgttatcattatgagaatatcttatgaa--ttttcataacatat--tatgtagtattctcacggtag 4073686  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 310  Q
     |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||  ||| ||||| || || ||||||||| ||| |||||  ||    
T  4073685 gtcaatcaaatataaatattacctctaatatttacacttatgtatagacttaatatctc-atattcatgacctatgggatgtgatcctcaatctacaaac 4073587  T
Q  311 ataatattctcta 323  Q
    |||||| ||||||    
T  4073586 ataatagtctcta 4073574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 322
Target Start/End: Original strand, 22560311 - 22560487
Alignment:
Q  142 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 241  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||||||| |  | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22560311 accattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtataaatattactcctaatat 22560407  T
Q  242 ttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctct 322  Q
    ||| |  |||||  | |||| ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  22560408 ttaaacctatgtataaacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatgcataatagtctct 22560487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 33317167 - 33317055
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  33317167 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 33317069  T
Q  114 agtggtttcaggtc 127  Q
    ||||||||||||||    
T  33317068 agtggtttcaggtc 33317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 330
Target Start/End: Original strand, 13995151 - 13995254
Alignment:
Q  226 atattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatg 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| | |    
T  13995151 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacg 13995249  T
Q  326 cttta 330  Q
    |||||    
T  13995250 cttta 13995254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 170
Target Start/End: Original strand, 28756145 - 28756283
Alignment:
Q  31 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 130  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| |||||| |||  ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  |    
T  28756145 ccatcaaccgactttataggcatcttgttacatacaacatttga-tggtgataaagtacatgactcctacatatatggtacacagtggtttcaggtcata 28756243  T
Q  131 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatga 170  Q
    || ||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||||    
T  28756244 ggatgagataaatcattatcactatgagaatattttatga 28756283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18262699 - 18262373
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18262699 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18262600  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262599 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18262500  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262499 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18262400  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18262399 atagtctctatgctttaatgatatccc 18262373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18269560 - 18269234
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18269560 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18269461  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269460 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18269361  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18269261  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18269260 atagtctctatgctttaatgatatccc 18269234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 55613170 - 55612844
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55613170 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 55613071  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613070 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 55612971  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612970 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 55612871  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  55612870 atagtctctatgctttaatgatatccc 55612844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26964127 - 26963801
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26964127 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26964028  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964027 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26963928  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963927 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 26963828  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26963827 atagtctctatgctttaatgatatccc 26963801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26970950 - 26970624
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26970950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26970851  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970850 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26970751  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970750 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 26970651  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26970650 atagtctctatgctttaatgatatccc 26970624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 869084 - 868758
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  869084 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 868985  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868984 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 868885  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868884 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 868785  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  868784 atagtctctatgctttaatgatatccc 868758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 19926480 - 19926806
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19926480 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19926579  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926580 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19926679  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926680 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatttgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 19926779  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19926780 atagtctctatgctttaatgatatccc 19926806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 10621053 - 10621379
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10621053 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10621152  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621153 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10621252  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621253 aatccaatataaatattactcctaaaatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10621352  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10621353 atagtctctatgctttaatgatatccc 10621379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8858654 - 8858329
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8858654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8858555  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858554 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8858455  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8858454 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatatgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacata 8858355  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatcc 339  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8858354 atagtctctatgctttaatgatatcc 8858329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 14 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5707807 - 5707483
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5707807 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5707708  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707707 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5707608  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707607 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 5707508  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  5707507 atagtctctatgctttaatgatatc 5707483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 14 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5714435 - 5714111
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5714435 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5714336  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714335 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5714236  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714235 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 5714136  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  5714135 atagtctctatgctttaatgatatc 5714111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 10628132 - 10628458
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10628132 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10628231  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628232 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10628331  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628332 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10628431  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10628432 atagtctctatgctttaataatatccc 10628458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 28392854 - 28393180
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28392854 catgattcatggagtactcatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28392953  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392954 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 28393053  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28393054 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 28393153  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28393154 atagtctctatgctttaatgatatccc 28393180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8845690 - 8845365
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8845690 catgattcatggagtacccatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8845591  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845590 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8845491  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8845490 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatataaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacata 8845391  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatcc 339  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8845390 atagtctctatgctttaatgatatcc 8845365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 4426336 - 4426650
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4426336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaatgtttgaatggtaacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 4426435  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426436 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaa------------cttttcatagattttactatgtagtattctcatggcggatc 4426523  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4426524 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 4426623  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4426624 atagtctctatgctttaatgatatccc 4426650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 35224047 - 35223722
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  35224047 catgattcgtggagtacacatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatgttgataaagcactcgactccaacatctaaggtacat 35223948  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  35223947 cgtggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggtggttc 35223848  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35223847 aatccagtataaatattactcctaatatttatacatatgtaaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatccgtctacccacata 35223748  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatcc 339  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  35223747 atagtctatatgctttaatgttatcc 35223722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 338
Target Start/End: Original strand, 5667849 - 5668169
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  5667849 catgattcgtggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgac--caacatctagggtacat 5667946  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  5667947 agtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgagtc 5668046  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||| | |||||    
T  5668047 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctacgtgaagatatgataactctttatctatgatccgtgaga--tgatcatcggtctatccacata 5668144  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||    
T  5668145 atagtctctatgatttaatgttatc 5668169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20311781 - 20311455
Alignment:
Q  10 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 109  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  20311781 tcatcatgattcgtggagtaccgattaaccgactttatagtcatcctgctacggacaacgtttgtacgggaacaaagtactcgaatcctacatctagggt 20311682  T
Q  110 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 208  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| | ||  ||||||| |  |||||||||||||||||| |    
T  20311681 aaatagtggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgtatgatagtta-cataactgt--ctatgtagtattctcatgac 20311585  T
Q  209 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 308  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||     
T  20311584 aggtcaatccaatataaaaattactcctaatatttacatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccatgatatgtgatcatcaatctaccc 20311485  T
Q  309 acataatattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  20311484 acaaaatagtctctatgctttaatgatatc 20311455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 10677303 - 10677534
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10677303 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10677401  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  10677402 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10677501  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677502 aatccagtataaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 10890943 - 10891174
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10890943 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10891041  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  10891042 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10891141  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891142 aatccagtataaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15461799 - 15461488
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  15461799 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 15461701  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15461700 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15461604  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15461603 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15461505  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  15461504 atagtctcgacgcttta 15461488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 34975853 - 34975542
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  34975853 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 34975755  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  34975754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 34975658  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  34975657 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 34975559  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  34975558 atagtctcgacgcttta 34975542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2677315 - 2677004
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  2677315 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2677217  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  2677216 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2677120  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  2677119 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 2677021  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  2677020 atagtctcgacgcttta 2677004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15815323 - 15815012
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  15815323 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15815225  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  15815224 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15815128  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15815127 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15815029  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  15815028 atagtctcgacgcttta 15815012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 18111043 - 18111354
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18111043 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18111141  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18111142 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18111238  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18111239 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18111337  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  18111338 atagtctcgacgcttta 18111354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26531915 - 26531604
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  26531915 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 26531817  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  26531816 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 26531720  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  26531719 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtatagccttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 26531621  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  26531620 atagtctcgacgcttta 26531604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 3369023 - 3369334
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||| || |  |||    
T  3369023 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catcaagagatcat 3369121  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  3369122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3369218  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3369219 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 3369317  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  3369318 atagtctcgacgcttta 3369334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 17299959 - 17300270
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  17299959 catgattcatcaagtgctcatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 17300057  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  17300058 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 17300154  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  17300155 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 17300253  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  17300254 atagtctcgacgcttta 17300270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516225
Alignment:
Q  189 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 288  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtgag 56516269  T
Q  289 atgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaat 332  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  56516268 atttgatcattaatctacctacataatagtctctatgttttaat 56516225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 115 - 265
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454110
Alignment:
Q  115 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 214  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||  || |||||||||||||||||| || |||    
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatatcttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtca 21454059  T
Q  215 atccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 265  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21454060 attcaatataaatattactcctaatatttatatgtatgtgaaaacttgata 21454110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18163464 - 18163153
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18163464 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18163366  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |     
T  18163365 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtg 18163269  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18163268 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcgatcatcagtctacatacata 18163170  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  18163169 atagtctcgacgcttta 18163153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20244239 - 20243928
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20244239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20244141  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  20244140 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20244044  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20244043 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20243945  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  20243944 atagtctcgacgcttta 20243928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5870720 - 5870423
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  5870720 catgattcatcaagtactcatcaaccaacgttattgttatcctattatagacaacgttagaatgacaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 5870622  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  5870621 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 5870525  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  5870524 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 5870426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 4675983 - 4676294
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||  |||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  4675983 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttataatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 4676081  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  4676082 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 4676178  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  4676179 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 4676277  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  4676278 atagtctcgacgcttta 4676294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19365806 - 19365593
Alignment:
Q  30 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 129  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | ||| |||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| |    
T  19365806 cccattaactaacgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtcta 19365708  T
Q  130 agggtggaatacaccactatcacta-tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 228  Q
    || |||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  19365707 agagtggtatacaccattatcattggtgagaatatcttatgacacttt-cataacat--actatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtataaata 19365611  T
Q  229 ttactcctaatatttata 246  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19365610 ttactcctaatatttata 19365593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1942026 - 1941798
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || ||||||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  1942026 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacattagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 1941928  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| |||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || |     
T  1941927 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtt 1941831  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1941830 aatccaatataaatattactcctaatatttata 1941798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9487853 - 9487618
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||  ||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  9487853 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatcctattacagacaacgttataatgacaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 9487755  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  9487754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacgatgggtc 9487658  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 253  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9487657 tatccagtataaatattactcctaatatttatacttatgt 9487618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Original strand, 32646523 - 32646807
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||||||| | |   |||||  || ||||||  ||||| ||| ||||     
T  32646523 catgattcatccggtacccatcaaccgacttcataatcatcctgttatggatgacgtttgtacgacaacaaagtacccgactcatacatccaggatacag 32646622  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 212  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||| || | ||||  | | |||||| |||  ||||||| ||||| ||||  | |    
T  32646623 agttgtttcaggtcgaagggtaaaatacaccacttatcactacgggaatgtcatgtgact-tatacataaccttt--tatgtagcattcttatggtaggt 32646719  T
Q  213 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatca 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32646720 caatccaatgtaaatattattcctaatatttatatctatgtgaagactcgatattcctttatcaatgatccgtgagatgtgatcatca 32646807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5616681 - 5616469
Alignment:
Q  30 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 129  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||  |||||||||||||| || |    
T  5616681 cccattaaccaacgttacagttatcttgttacaaacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagatcta 5616583  T
Q  130 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatat 229  Q
    ||  ||| |||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||    
T  5616582 agattggtatacaccattatcattgtaagaatatcttatgacacttt-cataa--taaactctgtagtattctcacggttggtcaatccagtataaatat 5616486  T
Q  230 tactcctaatatttata 246  Q
    |||| ||||||||||||    
T  5616485 tacttctaatatttata 5616469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 30040489 - 30040705
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| || |||||   ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  30040489 catgattcatcaagtactcattaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacattagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 30040587  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| |||||||| || ||    
T  30040588 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcatggtgggtc 30040684  T
Q  214 aatccaatataaatattactc 234  Q
    |||| | ||||||||||||||    
T  30040685 aatctagtataaatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19362695 - 19362488
Alignment:
Q  31 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 130  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | ||| || |  | |||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  19362695 ccattaaccaccgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcatttaagtcca-catctaaggatcatagtggtttcaggtttaa 19362597  T
Q  131 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 230  Q
    | |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||||||||||    
T  19362596 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatatt 19362500  T
Q  231 actcctaatatt 242  Q
    ||||||||||||    
T  19362499 actcctaatatt 19362488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32636685 - 32636558
Alignment:
Q  116 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 215  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  32636685 tggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacattgggtcaa 32636589  T
Q  216 tccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32636588 tccaatataaatattactcataatatttata 32636558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 5528495 - 5528707
Alignment:
Q  30 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 129  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||| || |||||||||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||  |||||  |||||||||  |    
T  5528495 cccattaaccaacattatggttatcctgttacagataacgtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagcagtttcaggtata 5528593  T
Q  130 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatat 229  Q
    || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||| || ||||||||| |  || | ||| ||||||||||||    
T  5528594 agagtgttatacaccattatcattatgagaatatcttatggca-ttttcataa--tatactacgtggtattctcacgttgggttaatacaatataaatat 5528690  T
Q  230 tactcctaatatttata 246  Q
     ||||||||||||||||    
T  5528691 cactcctaatatttata 5528707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9538244 - 9538026
Alignment:
Q  30 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 129  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | ||| |||| || |||| |||| | ||  ||| ||||||| ||||| |    
T  9538244 cccattaaccaacgttatggttatcctgttacggacaatgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catccaaggatcatggtggtttgaggtcta 9538146  T
Q  130 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatat 229  Q
    ||  ||||  || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||    
T  9538145 agactggac-acgccattatcattgtgagaatatcttatgacacttt-cataacatg--ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatat 9538050  T
Q  230 tactcctaatatttatatttatgt 253  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  9538049 tactcctaacatttatacttatgt 9538026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24700291 - 24700214
Alignment:
Q  239 tatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataata 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24700291 tatttatatctatgtgaagacttaatatctctttatccaagatctgtaagatgtgattatcagtctacccacataata 24700214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4546298 - 4546154
Alignment:
Q  99 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 198  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||    
T  4546298 acatctagggatcatagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagta 4546202  T
Q  199 ttctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    |||||| || || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4546201 ttctcacggtgggtctgtccagtataaatattactcctaatatttata 4546154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11421309 - 11421096
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   | ||| |||| || | || |||||| ||  |||    
T  11421309 catgattcatcgagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaataaagcacttgagtaca-catctacggatcat 11421211  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| | | |||  |||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| | || || ||    
T  11421210 agtggtttcaggtctatgagtgatatacattattatccctgtgataatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctaacggtgggtc 11421114  T
Q  214 aatccaatataaatatta 231  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11421113 aatccaatataaatatta 11421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 274
Target Start/End: Original strand, 34777850 - 34777975
Alignment:
Q  147 tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |   | | |||||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  34777850 tatcactatcaaaatatcttatgacactttacataagtc--aatgtgtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaaattactcattatatttata 34777947  T
Q  247 tttatgtgaagacttgataactctttat 274  Q
      ||| |||||||||||||||| |||||    
T  34777948 catatttgaagacttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 33888743 - 33888594
Alignment:
Q  111 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||   | | ||||| ||||| |||||| ||    
T  33888743 catagtgatttcaggtcgaaatgtggcatacaccactgtcaatatgatattatcttatcacactttacataa--atcattatgtggtattatcatggtgg 33888646  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 265  Q
     ||||| |   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  33888645 gtcaattc---ataaatattacacataatatttatatctatgtgaaaacttgata 33888594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 170
Target Start/End: Original strand, 23056080 - 23056218
Alignment:
Q  31 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 130  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||   | |||||||| || | || |||||||||  ||||||||||| ||||| ||    
T  23056080 ccattaaccaactttatagttatcctgttacagataacatttgaatgtcaataaaacacttgagttca-catctagggatcatagtggtttgaggtctaa 23056178  T
Q  131 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatga 170  Q
    | |||| |||||  | || | |||||||||||||||||||    
T  23056179 gagtggtatacaatattacctctatgagaatatcttatga 23056218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24701411 - 24701361
Alignment:
Q  92 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 142  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24701411 gactcctacatctagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaataca 24701361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 338
Target Start/End: Original strand, 10677538 - 10677599
Alignment:
Q  277 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  10677538 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatactttaatgttatc 10677599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 338
Target Start/End: Original strand, 10891178 - 10891239
Alignment:
Q  277 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  10891178 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatactttaatgttatc 10891239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 123
Target Start/End: Original strand, 9937745 - 9937826
Alignment:
Q  42 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 123  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  || |||  | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  9937745 ctttatagtcatccttttacgaacaatgtttgaacgacgataaagtattcgactcttacatctagggtacatagtgatttca 9937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 328
Target Start/End: Original strand, 9937933 - 9937998
Alignment:
Q  263 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctt 328  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  9937933 ataactctttattcatgatttatgagatgtgatcatgactctacccacacaatagtctatatgctt 9937998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Original strand, 9937830 - 9937923
Alignment:
Q  153 tatgagaatatcttatgacacttttcataacttttacta---tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatattta 244  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  |||||    |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9937830 tatgagaatatcttatggcacatttcataattcatactaagtagtagtattctcatgacgg-tcactgcaatataaatattacttctattattta 9937923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6110551 - 6110225
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6110551 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6110452  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110451 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6110352  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110351 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 6110252  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6110251 atagtctctatgctttaatgatatccc 6110225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 16482203 - 16482529
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16482203 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16482302  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482303 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16482402  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482403 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 16482502  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16482503 atagtctctatgctttaatgatatccc 16482529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 15600604 - 15600930
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15600604 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15600703  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600704 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15600803  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600804 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15600903  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15600904 atagtctctatgctttaatgatatccc 15600930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 15607149 - 15607475
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15607149 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15607248  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607249 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15607348  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607349 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15607448  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15607449 atagtctctatgctttaatgatatccc 15607475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 14 - 338
Target Start/End: Original strand, 10579075 - 10579399
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10579075 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10579174  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10579175 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 10579274  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579275 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10579374  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  10579375 atagtctctatgctttaatgatatc 10579399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 10572312 - 10572638
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10572312 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 10572411  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572412 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10572511  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572512 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10572611  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10572612 atagtctctatgctttaatgatatccc 10572638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18520462 - 18520136
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18520462 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18520363  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520362 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18520263  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520262 aatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18520163  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18520162 atagtctctatgctttaatgatatccc 18520136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 15357306 - 15357632
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15357306 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15357405  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357406 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15357505  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357506 aacccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15357605  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15357606 atagtctctatgttttaatgatatccc 15357632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 17780838 - 17781164
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17780838 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17780937  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780938 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggcggatc 17781037  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781038 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatctatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 17781137  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17781138 atagtctctatgctttaatgatatccc 17781164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 18 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18523146 - 18522824
Alignment:
Q  18 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523146 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 18523047  T
Q  118 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18523046 gtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggcggatcaatc 18522947  T
Q  218 caatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18522946 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 18522847  T
Q  318 tctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  18522846 tctctatgcttaaatgatatccc 18522824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8490982 - 8490649
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8490982 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8490883  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490882 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8490783  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490782 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 8490683  T
Q  314 a-------tattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    |       || |||||||||||||||||||||||    
T  8490682 atcgtctgtagtctctatgctttaatgatatccc 8490649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 15341939 - 15342265
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15341939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15342038  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342039 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgacggatc 15342138  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342139 aatccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15342238  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15342239 atagtctctatgttttaatgatatccc 15342265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 14 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13211789 - 13211465
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13211789 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13211690  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13211689 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcggatc 13211590  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13211589 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacata 13211490  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  13211489 atagtctctatgctttaatgatatc 13211465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13249094 - 13248768
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13249094 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13248995  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13248994 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcgaatc 13248895  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13248894 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacata 13248795  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13248794 atagtctctatgctttaatgttatccc 13248768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 32056619 - 32056946
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32056619 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 32056718  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056719 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 32056818  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaata-tttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32056819 aatccaatataaatattactcataatattttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcattagtctacccacat 32056918  T
Q  313 aatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32056919 aatagtctctatgctttaatgatatccc 32056946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 10 - 338
Target Start/End: Original strand, 17199900 - 17200228
Alignment:
Q  10 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17199900 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgatacgaacaacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaaggt 17199999  T
Q  110 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17200000 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagcg 17200099  T
Q  210 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 309  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17200100 ggtcaatccaatacaaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccacgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccca 17200199  T
Q  310 cataatattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17200200 cataatagtctctatgctttaatgatatc 17200228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13517294 - 13516973
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13517294 catgattcatggagtacccatctaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtacat 13517195  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13517194 agtggtttcaggtcgaagggtgggg----ccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatggaggatc 13517099  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13517098 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 13516999  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatcc 339  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13516998 atagtctctgtgctttaatgatatcc 13516973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 1647241 - 1647567
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1647241 catgattcatggagtactcatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtatat 1647340  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  1647341 agtggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatatcgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgagtc 1647440  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1647441 aatcaaatataaacattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacata 1647540  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1647541 atagtctctatgctttaattatatccc 1647567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17136840 - 17136520
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17136840 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatgtttactaagcactcgactccaacatctagggtacat 17136741  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17136740 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 17136641  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17136640 aatccaatataaatattactccta------atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatgtgatcatcagtctacccacata 17136547  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17136546 atagtctctatgttttaatgatatccc 17136520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29925458 - 29925134
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29925458 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29925359  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||    
T  29925358 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29925259  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||    
T  29925258 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacata 29925159  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||    
T  29925158 atagcctccatgctttaatgatatc 29925134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29974611 - 29974287
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29974611 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29974512  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||    
T  29974511 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29974412  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||    
T  29974411 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacata 29974312  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||    
T  29974311 atagcctccatgctttaatgatatc 29974287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16200917 - 16200627
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16200917 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacatttgaatggtgacaaagcactcgacttcaacatctagggtacat 16200818  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  16200817 agtggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatactttacataattttgactatgtagtattctcatggtgggtc 16200718  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtct 304  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16200717 aatccaatatgaatattacacctaatatttgtatctatatgaatacttgataattctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtct 16200627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 15846536 - 15846847
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  15846536 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagggatcat 15846634  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15846635 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15846731  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15846732 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15846830  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  15846831 atagtctcgacgcttta 15846847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21034540 - 21034229
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21034540 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21034442  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21034441 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21034345  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  21034344 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 21034246  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  21034245 atagtctcgacgcttta 21034229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 20147554 - 20147865
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20147554 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20147652  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  20147653 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20147749  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20147750 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20147848  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  20147849 atagtctcgacgcttta 20147865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 333
Target Start/End: Original strand, 24253197 - 24253427
Alignment:
Q  99 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||   ||||| ||  ||||| | ||    
T  24253197 acatctaaggtacatagtggttttaggtcgaatg-tggaatacaccgttatcactatgagaataacttatgatccttaa-ataacatt--ctatgcatta 24253292  T
Q  199 ttctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 298  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  24253293 ttctcatggagggtcaaaccaatataaatataactcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccataattcgtgagatatgatcat 24253392  T
Q  299 cagtctacctacataatattctctatgctttaatg 333  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24253393 tagtctaccgacataatagtctctatgctttaatg 24253427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21399094 - 21398792
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  21399094 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 21398996  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21398995 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21398899  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  21398898 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgaggtcataagtctacatacata 21398800  T
Q  314 atattctc 321  Q
    ||| ||||    
T  21398799 atagtctc 21398792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12300212 - 12299902
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  12300212 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaatcacttgagtcca-catctagagatcat 12300114  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  12300113 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 12300017  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12300016 aatccaatataaatattactcctaacatttatatctatg-atagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 12299919  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  12299918 atagtctcgacgcttta 12299902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 55427323 - 55427012
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  55427323 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 55427225  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  55427224 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 55427128  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  55427127 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 55427029  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  55427028 atagtctcgacgcttta 55427012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14890693 - 14890391
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| ||||||| |  ||     
T  14890693 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttataattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcac 14890595  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||| ||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  14890594 agtgctttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14890498  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  14890497 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 14890399  T
Q  314 atattctc 321  Q
    ||| ||||    
T  14890398 atagtctc 14890391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 25978728 - 25978956
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  25978728 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 25978826  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  25978827 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25978923  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25978924 tatccagtataaatattactcctaataattata 25978956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147012
Alignment:
Q  112 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 211  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||| |     
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatatcttacgaca-ttttcataacat--actatgtagcattctcacggcagg 14147130  T
Q  212 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 311  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| || |    
T  14147129 tcaatccagtataaatattcctcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatata 14147031  T
Q  312 taatattctctatgcttta 330  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  14147030 taatagtctctgtgcttta 14147012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15527021 - 15526820
Alignment:
Q  48 agtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact 147  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| || |||| ||| || ||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  15527021 agtcatgctgttacagacaacgtttgaatggttataaagcacttgagtcca-catgtatggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccatt 15526923  T
Q  148 atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 247  Q
    | || | | |||||||||||||||| |||||||| | |  ||||| ||||| ||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  15526922 aacattgtaagaatatcttatgaca-ttttcatagcat--actatttagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatattactcctaagatttatac 15526826  T
Q  248 ttatgt 253  Q
    ||||||    
T  15526825 ttatgt 15526820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28088408 - 28088227
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| | || || |||| |||||||||  |||    
T  28088408 catgattcatcaagtatccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcccttgagtcca-catctagggatcat 28088310  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 199  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  28088309 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtat 28088227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11787889 - 11787661
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || |  |  ||||||||  |||    
T  11787889 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccatttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgattatag-atctagggatcat 11787791  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  11787790 aatggtttcaggtctaagagcgatatacaatattatcattgtgagaatatcttatga-aaatatcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 11787694  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11787693 tatccagtataaatattactcctaatatttata 11787661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 283 - 340
Target Start/End: Original strand, 19089734 - 19089791
Alignment:
Q  283 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19089734 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgatttaatgatatccc 19089791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32280507 - 32280313
Alignment:
Q  88 actcgactccaacatctagggtacata----gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataac 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||  || |||  |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  32280507 actcgactcctacatctagggtacatatatagtggtttcaagtgaaaaggtaaaataaatcattatcactatgagaatatcttatgacactttacatgac 32280408  T
Q  184 ttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatga 280  Q
      | |||||||| ||||||||| | || |||| | | | ||||||||| || ||||  |||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  32280407 --tcactatgtattattctcattgtgggtcaaccgagtgtaaatattattcgtaatgattatacctatgtgaagattaaataactctttatccatga 32280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 15317176 - 15317401
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||  | ||||  |||| ||||||||| |||||   |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  15317176 catgattcatcaagtacccgtcaaccaacgttatgattatccgtttacagacaacgttagaatg---acaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 15317271  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |   ||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | |||||| |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15317272 agtggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15317368  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15317369 tatctagtataaatattactcctaatatttata 15317401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28954093 - 28953965
Alignment:
Q  153 tatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatat-aaatattactcctaatatttatatttat 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||  || | ||||||| |  |||||||||||||||| | ||||  |||    
T  28954093 tatgagaatatcatatgacactttaaataacttat--tatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactcctaatgtgtatacatat 28953996  T
Q  252 gtgaagacttgataactctttatccatgatc 282  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  28953995 gtgaagactttgtaactctttatcaatgatc 28953965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30464261 - 30464147
Alignment:
Q  52 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||    
T  30464261 atccttttacagacaacgtttgaatgtcaataaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatca 30464163  T
Q  152 ctatgagaatatctta 167  Q
     |||||||||||||||    
T  30464162 ttatgagaatatctta 30464147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9504548 - 9504446
Alignment:
Q  236 taatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatgat 335  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||    
T  9504548 taatatttttatgtatgttaatacttgataactccttatccatgacccgtgagataagattatcagtctacccacataatagtttctatcctttaaagat 9504449  T
Q  336 atc 338  Q
    |||    
T  9504448 atc 9504446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16200363 - 16200286
Alignment:
Q  262 gataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16200363 gataactctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtctctccaca-aatagtctccatgctttaatgatatccc 16200286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 210 - 303
Target Start/End: Original strand, 8251933 - 8252026
Alignment:
Q  210 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||| ||||||    
T  8251933 gatcaatcaaatataaatattactcgaaatatgtaaatttatgtaaagatttgataacattttattcatgatccgtaagatgtgatcttcagtc 8252026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 36138033 - 36138097
Alignment:
Q  111 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 175  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36138033 catagtgatttcaggttgaagggtggtatacaccattatcactttggaaatatcttatggcactt 36138097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 36142880 - 36142816
Alignment:
Q  111 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36142880 catagtggtttcaggttgaagggtgacatacatcattatcactttggaaatatcttatggcactt 36142816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18252517 - 18252191
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18252517 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18252418  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252417 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18252318  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252317 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18252218  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18252217 atagtctctatgctttaatgatatccc 18252191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 18532234 - 18532560
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18532234 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18532333  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532334 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18532433  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18532434 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatctacata 18532533  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18532534 atagtctctatgctttaatgatatccc 18532560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 27131130 - 27131455
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27131130 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg-tacat 27131228  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131229 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27131328  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131329 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 27131428  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27131429 atagtctttatgctttaatgatatccc 27131455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 14 - 337
Target Start/End: Original strand, 27310297 - 27310620
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27310297 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27310396  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310397 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27310496  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27310497 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccataatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 27310596  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatat 337  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  27310597 atagtctctatgctttaatgatat 27310620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 14 - 337
Target Start/End: Original strand, 16358755 - 16359078
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16358755 catgattcatggagtacccatcaaccaactttaaagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16358854  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358855 ggtggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16358954  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16358955 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaaggcttgataactctttatccattatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 16359054  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatat 337  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  16359055 atagtctctatgctttaatgatat 16359078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 3855639 - 3855965
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  3855639 catgattcatggagtaccggtcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgcttgaatggtgacaaagcgctcaactccaacatctagggtacat 3855738  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  3855739 agtggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgcgggtc 3855838  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  3855839 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagactttataactctttatccatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacccacgta 3855938  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  3855939 atagtctccatgctttaataatatccc 3855965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 36816354 - 36816679
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36816354 catgatttgtggagtacctatcaaccaactttatagttatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaaacgctcgactccaacatctagggtacat 36816453  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  36816454 agtggtttcagttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataattt-ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 36816552  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  36816553 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacata 36816652  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36816653 atagtctctatgctttaatggtatccc 36816679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 295
Target Start/End: Original strand, 22641594 - 22641871
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22641594 catgattcgtggagtacccatcgaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 22641693  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  22641694 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggtgggtc 22641792  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgat 295  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||   |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22641793 aatctagtataaatattattcctaa---ttatatctatgtgaacacttaataactctttatccatgatctatgagatgtgat 22641871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 27277278 - 27277603
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27277278 catgatttatggagtacccttcaaccaactttatggtcatcttgttacaaacaatgtttgaattatgataaagcactcgactccaacatccagggtacat 27277377  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||    
T  27277378 agtggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatggcac-tttcatgacttttactatgcaatattcttatggtgggtc 27277476  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27277477 aatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaaaacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggtctacccacata 27277576  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27277577 atagtctctatgctttaatgttatccc 27277603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 142 - 340
Target Start/End: Original strand, 21171081 - 21171279
Alignment:
Q  142 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171081 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 21171180  T
Q  242 ttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21171181 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgttatcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatccc 21171279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23507385 - 23507061
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||| |||    |||| ||| | |||||  |||| | ||  ||||||||||||||     
T  23507385 catgatttatggagtacccataaatcgaatttatagtcatcctattacagacggtatttgtatgataacaaagtactcaaatcttacatctagggtacac 23507286  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||| || ||| ||  || ||||| ||||| |||| || |    
T  23507285 agtggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataacttatg-ctttttacacaacgtt--ctctgtagcattctaatggtgggt 23507189  T
Q  213 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 312  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |    
T  23507188 taatccaatataaatattactcctattatttatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatccgtgagatgtgatcatcagtctatccacct 23507089  T
Q  313 aatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
     ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  23507088 tatattctatatactttaatgctatccc 23507061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 19706439 - 19706750
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  19706439 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 19706537  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  19706538 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 19706634  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19706635 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 19706733  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  19706734 atagtctcgacgcttta 19706750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 181 - 338
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657265
Alignment:
Q  181 aacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatga 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttaataactctttatctatga 22657207  T
Q  281 tctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatgatatc 338  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22657208 gctatgagatgtgatcatcagtctatccacatgatagtctctatgctttaatgatatc 22657265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 43802365 - 43802676
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  43802365 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 43802463  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  43802464 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 43802560  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  43802561 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 43802659  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  43802660 atagtctcgacgcttta 43802676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Original strand, 28134723 - 28135019
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||| |||||  |||    
T  28134723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catttagggatcat 28134821  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  28134822 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtggatc 28134918  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  28134919 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 28135017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 9916497 - 9916688
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  9916497 catgattcgtggagaactcataaactaactttatagtcaccttgttacggacaacgtttggacggtaacaaagtactcgactcctacatctagggtacat 9916596  T
Q  114 agtgg-tttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9916597 agtggttttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatg 9916688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 332
Target Start/End: Original strand, 12014084 - 12014322
Alignment:
Q  92 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttact 190  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||   |||| | |  || | ||    
T  12014084 gactcctacatctagagtacacagtgattttaggttgaagggtgaaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtga---tttttacatattgttct 12014180  T
Q  191 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagat 290  Q
    |||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  12014181 atgtaacattctcatgccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttatgtgaagacttgataactccttatcaatgatccgtgagat 12014280  T
Q  291 gtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaat 332  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  ||| || ||||||||    
T  12014281 gtgatcatcattctacccacataatggtctttacgctttaat 12014322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9456418 - 9456107
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  9456418 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 9456320  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  9456319 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 9456223  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  9456222 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 9456124  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  9456123 atagtctcgacgcttta 9456107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 20391239 - 20391550
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20391239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20391337  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||  | ||||| | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  20391338 agtggtttcaggtctaagagcggtatacattattatcattgtgagaatatcttatgaaaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20391434  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20391435 aatccaatataaatattactcctaacatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20391533  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  20391534 atagtctcgacgcttta 20391550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 20779645 - 20779956
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20779645 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20779743  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  20779744 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20779840  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20779841 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20779939  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  20779940 atagtctcgacgcttta 20779956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 22670257 - 22670568
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22670257 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22670355  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  22670356 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22670452  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22670453 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22670551  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  22670552 atagtctcgacgcttta 22670568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 42816989 - 42817300
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  42816989 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 42817087  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  42817088 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 42817184  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  42817185 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 42817283  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  42817284 atagtctcgacgcttta 42817300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22612794 - 22612483
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  | ||||| |||  ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22612794 catgattcatcaagtagccatcaaccaacgttatgattatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagtgatcat 22612696  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22612695 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22612599  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||  ||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22612598 aatccaataaaaatattactcccaatatttatatctatgtatagacttgatatatc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22612500  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  22612499 atagtctcgacgcttta 22612483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 340
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9917964
Alignment:
Q  212 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 311  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||    
T  9917837 tcaatccaatataaatattactca-aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccacgagatgtgatcatcaacctaccgaca 9917935  T
Q  312 taatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||    
T  9917936 tagtattctctatgcttcaatgctatccc 9917964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 634216 - 633934
Alignment:
Q  34 tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggg 133  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |    
T  634216 tcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagag 634118  T
Q  134 tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattact 233  Q
     |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||    
T  634117 cgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggttaatccagtataaatattact 634021  T
Q  234 cctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctc 321  Q
    |||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  || | |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  634020 cctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atagctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 633934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8727969 - 8727658
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||  |||||||||  |||    
T  8727969 catgattcatcaagtacccattagccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtccg-catctagggatcat 8727871  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||| |||||| ||| |||  ||||||   |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||    
T  8727870 agtggttccaggtctaagagtgatatacactcttatcactaagagaatatcttatggta-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtggatc 8727774  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||||  |||||||||||| || |||    
T  8727773 aatccagtataaatattacttctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatagata 8727675  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  8727674 atagtctcgacgcttta 8727658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29097008 - 29096796
Alignment:
Q  30 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 129  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||| |||| || ||||||||||| |  | |||||||| || ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  29097008 cccattaaccaacgttatggttatcctattacagataacgtttgaatcgaaataaaacacttgagtccat-atctagggatcatagtggtttcatgtcta 29096910  T
Q  130 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatat 229  Q
    || |||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||| || || ||||||||| | |||||||||    
T  29096909 agagtgtgaaacaccattatcattatgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atgctatgtagtattcacacggtggatcaatctagtataaatat 29096813  T
Q  230 tactcctaatatttata 246  Q
    || ||||||||| ||||    
T  29096812 tattcctaatatgtata 29096796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 47667485 - 47667785
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  47667485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 47667583  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||           ||| || || ||    
T  47667584 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--act-----------tcacggtgggtc 47667669  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  47667670 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 47667768  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  47667769 atagtctcgacgcttta 47667785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881604
Alignment:
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggtc 21881571  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  21881572 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 340
Target Start/End: Original strand, 12006350 - 12006585
Alignment:
Q  99 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagt 197  Q
    |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||| ||||  ||| ||||||  |  || | ||      
T  12006350 acatctagagtacacaatgatttcaggtcgaagggtggaaaacaccacttatcagtatgagaatgacttgtgact-tttacataacgct--ctctctaac 12006446  T
Q  198 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 297  Q
    ||||||||||||| ||    || |||||||||||||| |||||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||| |||||  || || ||||||||    
T  12006447 attctcatggcgggtc----cagtataaatattactcttaatatttatatctgtgcgaacacttgataactccttatcaatgattcgtaagttgtgatca 12006542  T
Q  298 tcagtctacctacataatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||||||||   |||||| | |||||| | ||||||| ||||||    
T  12006543 tcagtctatgcacataacaatctctaagttttaatgttatccc 12006585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930573
Alignment:
Q  189 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 288  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgag 35930615  T
Q  289 atgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgcttta 330  Q
    ||| | |||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||    
T  35930614 atgcggtcatcagtctatatacataatagtctcgacgcttta 35930573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 51997485 - 51997353
Alignment:
Q  111 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||| ||| | || ||||| |||||||||| ||||||| || || |||||  |||  || ||||||||||||||| ||    
T  51997485 catagtagtttctggtctaagcgtggtatatatcattatcaatatgagaataacttatgatacatt-cataatattt--tacgtagtattctcatggtgg 51997389  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51997388 gtcaatctaatataaatattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 28145723 - 28145835
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || ||| ||||||||||  |||    
T  28145723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 28145821  T
Q  114 agtggtttcaggtc 127  Q
    ||||||||||||||    
T  28145822 agtggtttcaggtc 28145835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 313
Target Start/End: Original strand, 26923553 - 26923678
Alignment:
Q  187 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 286  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||| |||   ||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||    
T  26923553 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtataaatattactcctaatattcataccaatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatg 26923651  T
Q  287 agatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26923652 agatgtggtcatcagtctacatacata 26923678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 184
Target Start/End: Original strand, 24301691 - 24301774
Alignment:
Q  101 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataact 184  Q
    ||||||||  |||| || ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||    
T  24301691 atctagggatcataatgattttaggtcaaagggttgtatacaccactatcactatgagaatgtcttatgatacttaacataact 24301774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 175
Target Start/End: Original strand, 10852402 - 10852461
Alignment:
Q  116 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 175  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10852402 tggtttcaggttgaagggtgacatacaccattatcactttaaaaatatcttatgacactt 10852461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 265
Target Start/End: Original strand, 16219748 - 16219801
Alignment:
Q  212 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 265  Q
    ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16219748 tcaattcaataaaattattacttctaatatttatacttatgtgacgacttgata 16219801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 232
Target Start/End: Original strand, 31236402 - 31236478
Alignment:
Q  153 tatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattac 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||| ||||||    
T  31236402 tatgagaatatcttacgacacttt-cataa--tatactatgtagtattctcatgatagatcaattcagtataagtattac 31236478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21941151 - 21940826
Alignment:
Q  15 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941151 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 21941052  T
Q  115 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941051 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 21940952  T
Q  215 atccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940951 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 21940852  T
Q  315 tattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  21940851 tagtctctatgctttaatgatatccc 21940826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 14 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22171974 - 22171651
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22171974 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 22171875  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171874 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 22171775  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171774 aatccaatataaatattactcataatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcagtctacctacata 22171675  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatat 337  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  22171674 atagtctctatgctttaatgatat 22171651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6094610 - 6094284
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6094610 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacgaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6094511  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6094510 agtggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggcggatc 6094411  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  6094410 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcactctacccatata 6094311  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6094310 atagtctctatgctttaatgatatccc 6094284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 14 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24643135 - 24642812
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24643135 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagaccacgtttgaatggtgacaaaacacttgactccaacatctagggtacat 24643036  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24643035 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctcatggaggatc 24642937  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24642936 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 24642837  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24642836 atagtctctatactttaatgatatc 24642812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15326685 - 15326422
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15326685 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15326586  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326585 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15326486  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatcca 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15326485 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15507054 - 15506791
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15507054 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15506955  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506954 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15506855  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatcca 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15506854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28548534 - 28548393
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28548534 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcaccctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28548435  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548434 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 316
Target Start/End: Original strand, 14983717 - 14983942
Alignment:
Q  88 actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttt 186  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  14983717 actcgactcttacatctagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt 14983815  T
Q  187 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 286  Q
      |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  14983816 --ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatataa-tattactcctaatatctacatctatgtgaagacttgataacactttttccatgatccgtg 14983912  T
Q  287 agatgtgatcatcagtctacctacataata 316  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  14983913 agatatgatcattagtctacccacataata 14983942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 8371253 - 8371564
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  8371253 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgatcatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 8371351  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  8371352 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8371448  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  8371449 aatccaatataaatattactcttaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 8371547  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| ||||||||    
T  8371548 atagtctcgatgcttta 8371564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21969635 - 21969324
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21969635 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21969537  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21969536 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21969440  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  21969439 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgatccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 21969341  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  21969340 atagtctcgacgcttta 21969324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 129 - 326
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797419
Alignment:
Q  129 aagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaatt 24797322  T
Q  229 ttactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgc 326  Q
    |||||| |||||||||||  || |||||||| ||||| | || ||||||||| |  ||||||||  |||||| | |||  |||||||| |||||||||    
T  24797323 ttactcataatatttatacctacgtgaagacatgatatc-ctatatccatgacccatgagatgtagtcatcaatatactcacataatagtctctatgc 24797419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12562425 - 12562114
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  12562425 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 12562327  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  12562326 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 12562230  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12562229 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 12562131  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  12562130 atagtctcgacgcttta 12562114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 27007517 - 27007828
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27007517 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27007615  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27007616 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27007712  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27007713 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27007811  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  27007812 atagtctcgacgcttta 27007828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 27014660 - 27014971
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27014660 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27014758  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27014759 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27014855  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27014856 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27014954  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  27014955 atagtctcgacgcttta 27014971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 27880487 - 27880798
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27880487 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27880585  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27880586 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27880682  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27880683 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27880781  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  27880782 atagtctcgacgcttta 27880798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 28020668 - 28020979
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  28020668 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 28020766  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  28020767 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 28020863  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  28020864 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 28020962  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  28020963 atagtctcgacgcttta 28020979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Original strand, 38232115 - 38232414
Alignment:
Q  30 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 129  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| | |   |||||  |||||||| | ||||| |||||||| |    ||||| |||      
T  38232115 cccatcaaccaactttataaccatcatgtcacggacaacgtttgtacgacaacaaagtactcgacttctacatcaagggtacacatcaatttcaagtctg 38232214  T
Q  130 agggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 228  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| | | ||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38232215 aggatggaatacaccacttatcattatgcgaataacctgtgaca-tttacataacttt--ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaata 38232311  T
Q  229 ttactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctt 328  Q
    |||| | |||||| | ||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | | |||||||    
T  38232312 ttacccataatatgtgtatctatgtcaagactggatcactctttatccatgatccgtgagatgtgattatcagtctacccacaaaatagtttttatgctt 38232411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 22130609 - 22130920
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22130609 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22130707  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  22130708 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22130804  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22130805 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22130903  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  22130904 atagtctcgacgcttta 22130920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25611497 - 25611186
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  25611497 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacactatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 25611399  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  25611398 agtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacagttt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25611302  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| ||||||    
T  25611301 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacata 25611203  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  25611202 atagtctcgacgcttta 25611186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 22659494 - 22659791
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  22659494 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22659592  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22659593 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22659689  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| ||||||    
T  22659690 aatccagtatacatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacata 22659788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21916978 - 21916667
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21916978 catgattcatcaagtgcccatcaaccaaagttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21916880  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||  | || ||    
T  21916879 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--acaatgtagtattctcacagtgggtc 21916783  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  21916782 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgcatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 21916684  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  21916683 atagtctcgacgcttta 21916667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 45534273 - 45534584
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  45534273 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 45534371  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  45534372 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 45534468  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  45534469 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 45534567  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  45534568 atagtctcgacgcttta 45534584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835341
Alignment:
Q  111 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||| | ||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatatcttatgacatttttaa-aacat--actatgtagtattctcacggtgg 18835460  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 310  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||||| | |||||||||| |||    
T  18835459 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtaatcagtctacatac 18835361  T
Q  311 ataatattctctatgcttta 330  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  18835360 ataatagtctcgatgcttta 18835341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26240786 - 26240558
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||  |||||||| |||||   ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  26240786 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacaaacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 26240688  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||| ||||| ||| | |  |||||  |  |||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  26240687 agtggttttaggtctaagagcgatatacattataatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 26240591  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26240590 aatccaatataaatattactcctaatatttata 26240558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 306
Target Start/End: Original strand, 8781892 - 8782162
Alignment:
Q  31 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 130  Q
    |||| ||| ||| |||| || ||| ||||||  ||||||||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  8781892 ccattaacgaacgttatggttatcatgttacaaacaacgtttgaatgacaataaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaa 8781990  T
Q  131 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 230  Q
    | |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  8781991 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--agactatgtagtattctcacggtggatcaatcaagtataaatatt 8782087  T
Q  231 actcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctac 306  Q
    | |||||||||||||  ||||||  |||||  ||| |||  ||||||||| || | ||| ||| ||||||||||||    
T  8782088 agtcctaatatttatgcttatgtatagactaaatatctc-atatccatgacctataagacgtggtcatcagtctac 8782162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2375386 - 2375214
Alignment:
Q  123 aggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 221  Q
    ||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||   ||| ||||||||||  ||||||| ||| | |||| || ||||||||||    
T  2375386 aggtcaaatggttgaatacaccacttatcactatgagaataact-atgagt-tttacataactttt--tatgtagaattataatggagggtcaatccaat 2375291  T
Q  222 ataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 298  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  2375290 atacatattactcataatatttatatttatgtgaaaatttgataactcattatccatgatacgtgtgatgtgatcat 2375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6431188 - 6430960
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  6431188 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 6431090  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||| |||||||||  || | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  6431089 agtgatttcaggtcttagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 6430993  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6430992 tatctagtataaatattactcctaatatttata 6430960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32872887
Alignment:
Q  194 tagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtg 293  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaatattattactaatacttatgccgatgtaaagacttgatacctctttattcatgatctgtgagataag 32872840  T
Q  294 atcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| | |||| | |  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  32872841 atcgtgagtccagccgcataatagtctctatgctttgatgttatccc 32872887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 2962932 - 2963164
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||||| ||||||  |||||  ||| || ||| || |||||||  |||    
T  2962932 catgattcatcaagtaaccatcaaccaacgttatggttatccttttgcagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acgtctagggatcat 2963030  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |   | ||||||  | |||||||||||||||||  ||  |    
T  2963031 agtggtttcaggtctaagagggatatacgctattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataa--tgtactatgtagtattctcgcggtag 2963128  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2963129 gtctatccagtataaatattactcctaatatttata 2963164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 121
Target Start/End: Original strand, 24796731 - 24796826
Alignment:
Q  24 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||| ||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24796731 ggagtacccatcaaccaattttatagccattatattacaga--acgattgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtatatagtggttt 24796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 217
Target Start/End: Original strand, 20535226 - 20535409
Alignment:
Q  30 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 129  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | ||| |||| || ||||  || || ||  |||||||||| |||||| |    
T  20535226 cccattaaccaacattatggttatcctgttatagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtccat-atttaaggatcatagtggttccaggtcta 20535324  T
Q  130 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 217  Q
    || |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  20535325 agagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac-tttcataac--atactatgcaatattctcatggtgggtcaatc 20535409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29645631 - 29645539
Alignment:
Q  224 aaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataata 316  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| |||| || |||||    
T  29645631 aaatattactcttaatgtttatatatatgtgaagagttgataaatctttatgcatgaaccatgagatgtggtcatcagtttacccacgtaata 29645539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 300 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28555084 - 28555044
Alignment:
Q  300 agtctacctacataatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28555084 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatccc 28555044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 36970556 - 36970439
Alignment:
Q  9 atcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaggg 108  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||  | |||||| ||||||  ||||| |||| || ||| ||||||||||    
T  36970556 atcagcatgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttacccttttacatataacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctaggg 36970458  T
Q  109 tacatagtggtttcaggtc 127  Q
      |||||||||||||||||    
T  36970457 atcatagtggtttcaggtc 36970439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 2375528 - 2375411
Alignment:
Q  10 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 109  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||  | ||||| || |  |||||  |||||||||| ||||||| |||    
T  2375528 tcatcataattcatggagcacccatcaaccgactttatagttatccaattgcggatgatgtttgtatagcaacaaagtactcgactcctacatctatggt 2375429  T
Q  110 acatagtggtttcaggtc 127  Q
    | ||| | ||||||||||    
T  2375428 aaataatagtttcaggtc 2375411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10920479 - 10920427
Alignment:
Q  222 ataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttat 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  10920479 ataaatattactcataatatttatacatatgtgaatatttgataactctttat 10920427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 265
Target Start/End: Original strand, 27677551 - 27677626
Alignment:
Q  190 tatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 265  Q
    |||||||||||||| | | |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  27677551 tatgtagtattctcgtagtgtgtcaatcaaatataaatatcactcctaataattatacttatgtatagacttgata 27677626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34659118 - 34659059
Alignment:
Q  188 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 247  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34659118 actatttagtatttgcatggtggataaatccaatataaatattagtcctaatatatatat 34659059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29645737 - 29645675
Alignment:
Q  101 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 163  Q
    ||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  29645737 atctaggatacgtagaagtttcaggtcgaatggtgaagtacatcactatcactatgagaatat 29645675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Original strand, 8968015 - 8968076
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaa 75  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  8968015 catgatttatggagtacccatcagtcgactttataatcatctttttatggacaacgtttgaa 8968076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24535567 - 24535514
Alignment:
Q  249 tatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 302  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||||||||||    
T  24535567 tatgtgaaaacttgataactcattattcatgatccgtaagatatgatcatcagt 24535514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36970371 - 36970339
Alignment:
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36970371 aatccagtataaatattactcctaatatttata 36970339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 74
Target Start/End: Original strand, 41368106 - 41368154
Alignment:
Q  26 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 74  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41368106 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41368154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 74
Target Start/End: Original strand, 41375077 - 41375125
Alignment:
Q  26 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 74  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41375077 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41375125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7594 - 7268
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7594 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 7495  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7494 agttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 7395  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7394 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 7295  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7294 atagtctctatgctttaatgatatccc 7268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 6654 - 6980
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6753  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6754 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6853  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 6953  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6954 atagtctctatgctttaatgatatccc 6980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 13670 - 13996
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13670 catgattcatggagtaaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 13769  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13770 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 13869  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13870 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 13969  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13970 atagtctttatgctttaatgatatccc 13996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 18 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15152926 - 15152604
Alignment:
Q  18 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152926 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 15152827  T
Q  118 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152826 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 15152727  T
Q  218 caatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15152726 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 15152627  T
Q  318 tctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15152626 tctctatgctttaatgatatccc 15152604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29328271 - 29327945
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29328271 catgattcatggagtacccatcaagcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 29328172  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328171 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29328072  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328071 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 29327972  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29327971 atagtctctatgctttaatgatatccc 29327945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 11535782 - 11536108
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11535782 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11535881  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535882 agtggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11535981  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535982 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagactggataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 11536081  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11536082 atagtctctatgctttaatgatatccc 11536108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 11542700 - 11543026
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11542700 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaatcactcgactccagcatctagggtacat 11542799  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542800 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggcggatc 11542899  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542900 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 11542999  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11543000 atagtctctatgctttaatgatatccc 11543026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12751313 - 12750988
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  12751313 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacct 12751214  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751213 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12751114  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12751113 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgagaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacata 12751014  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatcc 339  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12751013 atagtctctatgctttaatgatatcc 12750988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12739023 - 12738697
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12739023 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactacaacatctagggtacat 12738924  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738923 agtagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12738824  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12738823 aatccaatataaatattatgagtaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcttcagtctacccacata 12738724  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12738723 atagtctctatgctttaatgatatccc 12738697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18561485 - 18561168
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18561485 catgattcgtgcagtacctatcaatcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaatcactcaactccaacatctagggtacat 18561386  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  18561385 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactat---------ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagagggtc 18561295  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18561294 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 18561195  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18561194 atagtctctatgctttaatgatatccc 18561168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13392637 - 13392311
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  13392637 catgattcatggagtacccatcaaccaattttatagtcatcttgttacaaacaacgtttgtatggtgacaaagcacctgactccaacatctatggtacat 13392538  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  13392537 agtgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggtgggtc 13392438  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| | | |    
T  13392437 aatccagtataaatatttctcctaatatttattcctatgtgaagacaggataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcgatctaccaataca 13392338  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  13392337 atagtctctatgttttaatgttatccc 13392311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 339
Target Start/End: Original strand, 18257559 - 18257887
Alignment:
Q  8 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagg 107  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| |||| || |||| ||||||||    
T  18257559 catcaacatgattcttcaagtacccatcaaccaactttatagttatcttgttacacacaacgtttgaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagg 18257657  T
Q  108 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 207  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||| |||||| | ||    
T  18257658 gatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttttcatgacat--actatgtaatattctgacgg 18257755  T
Q  208 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 307  Q
     || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  18257756 tgggttaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcaatctatc 18257855  T
Q  308 tacataatattctctatgctttaatgatatcc 339  Q
     |||||||| ||| ||||| ||| || |||||    
T  18257856 cacataatagtctttatgcattattgttatcc 18257887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2204854 - 2204543
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  2204854 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2204756  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  2204755 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2204659  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  2204658 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 2204560  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  2204559 atagtctcgacgcttta 2204543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18400406 - 18400095
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18400406 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18400308  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18400307 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18400211  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18400210 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18400112  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  18400111 atagtctcgacgcttta 18400095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18407390 - 18407079
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18407390 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18407292  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18407291 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18407195  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18407194 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18407096  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  18407095 atagtctcgacgcttta 18407079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19231190 - 19230879
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  |||    
T  19231190 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catttagggatcat 19231092  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||| || || ||    
T  19231091 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataacttat--tatgtagtattctcacggtgggtc 19230995  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19230994 aatccagtataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 19230896  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  19230895 atagtctcgacgcttta 19230879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 48808496 - 48808807
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  48808496 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 48808594  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  48808595 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 48808691  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  48808692 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 48808790  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  48808791 atagtctcgacgcttta 48808807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8465301 - 8464999
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||| ||  |||    
T  8465301 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctaaggatcat 8465203  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  8465202 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8465106  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  8465105 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 8465007  T
Q  314 atattctc 321  Q
    ||| ||||    
T  8465006 atagtctc 8464999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15730053 - 15729742
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  15730053 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15729955  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  15729954 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15729858  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15729857 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15729759  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  15729758 atagtctcgacgcttta 15729742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 18139338 - 18139649
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18139338 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 18139436  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18139437 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18139533  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18139534 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacctgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18139632  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  18139633 atagtctcgacgcttta 18139649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30254428 - 30254129
Alignment:
Q  26 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||| |    
T  30254428 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaag 30254330  T
Q  126 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 225  Q
    || ||| ||   |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  30254329 tctaagagtaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaa 30254233  T
Q  226 atattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatg 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| | |    
T  30254232 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacg 30254134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2365407 - 2365169
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |   |||||  ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  2365407 catgattcgttgagcactcatcaaccgactttatagtcaatctgttacggacgacgtttgtacgacaacaaagtacttgactccaaggtctagggtacat 2365308  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 212  Q
    ||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||   |||||||| ||| |||||| || |    
T  2365307 agtggctttaggtcgaatggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataacttatgaca-tttacataacttc--ctatgtagcattttcatggtgggt 2365211  T
Q  213 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtg 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2365210 caatccaatgtaaatattactcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 41680968 - 41681196
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  41680968 catgattcatcaagtaccaatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 41681066  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  41681067 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 41681163  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41681164 aatccagtataaatattactcataatatttata 41681196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 10668901 - 10669213
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| || | || |||| ||| || ||  |||    
T  10668901 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcatttgagtcca-catttacggatcat 10668999  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat-gagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 212  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| |   ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |    
T  10669000 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcaattgcgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggt 10669096  T
Q  213 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 312  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||    
T  10669097 caatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacat 10669195  T
Q  313 aatattctctatgcttta 330  Q
    |||| |||| | ||||||    
T  10669196 aatagtctcgacgcttta 10669213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 330
Target Start/End: Original strand, 47166871 - 47167170
Alignment:
Q  26 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 125  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||  ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  47166871 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 47166969  T
Q  126 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 225  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || || ||| | |||||    
T  47166970 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataa 47167066  T
Q  226 atattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatg 325  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| | |    
T  47167067 atattactcataatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacg 47167165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 10235474 - 10235361
Alignment:
Q  189 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 288  Q
    |||||||  |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10235474 ctatgtataattctcatggtgagtcaatccgatataaatattattcctaatatttatacatatgggaacacctgataactctttatcaatgatctgtgag 10235375  T
Q  289 atgtgatcatcagt 302  Q
    ||||||||||||||    
T  10235374 atgtgatcatcagt 10235361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 316
Target Start/End: Original strand, 24443349 - 24443624
Alignment:
Q  36 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 135  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    | ||| |||| || |||| |||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||    
T  24443349 aaccaacgttatggtcatcctgttacacacaacgtttgaataacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaagtctaagagtg 24443447  T
Q  136 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcc 235  Q
      |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || || | |||| | |||||||||||||||    
T  24443448 ttatacaccattatcactgtgagaataacttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtactctcacggtgggttaatctagtataaatattactcc 24443544  T
Q  236 taatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataata 316  Q
    ||||||| |||  |||||  | |||| ||| || | ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24443545 taatattcatacctatgtataaacttaatatct-tatattcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatacataata 24443624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34128875 - 34128647
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||  ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  34128875 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 34128777  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  | |||||||   ||||||||||||||||||    |||||    
T  34128776 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacaatggatc 34128680  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34128679 tatccagtataaatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19388774 - 19388544
Alignment:
Q  99 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactt--ttactatgtag 196  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |   |||||||    
T  19388774 acatctagggctcataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgacac-tttcataacatactatatatgtag 19388676  T
Q  197 tattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 296  Q
    ||||||||||   |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||  | |||| ||| |||  ||| ||||| | ||||||| || ||    
T  19388675 tattctcatgattgggcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctttgtacaaacttaatatctc-atattcatgacccgtgagatatggtc 19388577  T
Q  297 atcagtctacctacataatattctctatgcttt 329  Q
    |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19388576 atcaatctatatacataataatctctatgcttt 19388544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28130863 - 28130635
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| |||||| ||  |||    
T  28130863 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctacggatcat 28130765  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||| ||||||||| |||  ||  |||||| | ||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| ||||||||  | || ||    
T  28130764 agtgatttcaggtctaagaatgatatacactattattattgtgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgtaatattctcacagtgggtc 28130668  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28130667 aatccagtataaatattactcctgatatttata 28130635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 280 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15148363 - 15148303
Alignment:
Q  280 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15148363 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatccc 15148303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 25845498 - 25845780
Alignment:
Q  36 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 135  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845498 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25845596  T
Q  136 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcc 235  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  25845597 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25845693  T
Q  236 taatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctcta 323  Q
    ||||||| | |  || ||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  25845694 taatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgcataatagtctcta 25845780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 25845917 - 25846199
Alignment:
Q  36 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 135  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845917 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25846015  T
Q  136 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcc 235  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  25846016 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25846112  T
Q  236 taatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctcta 323  Q
    ||||||| | |  || ||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  25846113 taatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgcataatagtctcta 25846199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 18259124 - 18259352
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  18259124 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 18259222  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |  ||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||| |||||||||| || || ||    
T  18259223 aagggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgcagtattctcacggtgggtc 18259319  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
     ||||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  18259320 tatccagtataaatattactttcaatatttata 18259352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39112275 - 39112138
Alignment:
Q  25 gagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcag 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |   |||||| ||| || ||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  39112275 gagtacctatcaaccaactttatagtcaccttattacagacaacgtttgaacgacaacaaaatacttgattcctacatctagagtacatagtgatttcat 39112176  T
Q  125 gtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 162  Q
    || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112175 gttgaataatggaatacaccactatcactaagagaata 39112138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14592056 - 14591924
Alignment:
Q  111 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    ||| ||||||||||||| || ||    
T  14592056 catagtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtgtagtattctcacggtgg 14591960  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14591959 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16011647 - 16011515
Alignment:
Q  111 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    ||| | |||||||||||||| ||    
T  16011647 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtatagtattctcatggtgg 16011551  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16011550 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 239
Target Start/End: Original strand, 31190524 - 31190660
Alignment:
Q  100 catctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 199  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||   ||| |||||||||    
T  31190524 catctagggatcttagtggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatatcttaagaca-tattcataac--atacaatgtagtat 31190620  T
Q  200 tctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaat 239  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31190621 tctcatggtgggtcaatccagtataaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 246
Target Start/End: Original strand, 19393462 - 19393652
Alignment:
Q  52 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 151  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| ||| ||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||| |||||||| ||| |||  |||||| | |||||    
T  19393462 atccttttacagacaacattagaaaggtaacaaagcacttgagtc-aacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatca 19393560  T
Q  152 ctatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
     | |||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||  | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19393561 ttgtgagaatatcttatgaga-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtataaatattactcctaatatttata 19393652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969024
Alignment:
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggtc 22969057  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  22969056 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7396450 - 7396358
Alignment:
Q  243 tatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc---tacataatattctctatgctttaat 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||    |||||||| |||||||||||||||    
T  7396450 tatatttatgtgaatacttgataattctttattcatgatatgtgagatgtgatcatcagttcaccctgcacataatagtctctatgctttaat 7396358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 316
Target Start/End: Original strand, 7662569 - 7662686
Alignment:
Q  198 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 297  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||  || |||| ||||||    
T  7662569 attctcatggcgggtcaatctaataaaaatattacttataat-tttatatctatgtgaagacttgataagtttttatacatgattcgtaagatatgatca 7662667  T
Q  298 tcagtctacctacataata 316  Q
    ||||| || | ||||||||    
T  7662668 tcagtgtatccacataata 7662686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 316
Target Start/End: Original strand, 47833875 - 47833979
Alignment:
Q  212 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 311  Q
    |||||| |||||||||||||    |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||     
T  47833875 tcaatcaaatataaatattatgagtaatatttatacctatgtgaaaacttggtaactctttattcatgatcggtgagatctgatcaccagcctacctacg 47833974  T
Q  312 taata 316  Q
    |||||    
T  47833975 taata 47833979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3132986 - 3132870
Alignment:
Q  188 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 287  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |  ||  | |||| |||    
T  3132986 actatgtagtattcttatgacaggtcaatccaatataaatatta-acataataattatacatatgtgaagacttgatatctcatattcatttatctatga 3132888  T
Q  288 gatgtgatcatcagtcta 305  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3132887 gatgtgatcatcagtcta 3132870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19859221 - 19859122
Alignment:
Q  221 tataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattct 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||    
T  19859221 tataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtct 19859123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 163
Target Start/End: Original strand, 22948499 - 22948574
Alignment:
Q  88 actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 163  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22948499 actcaactcctacatctaaggtacatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Original strand, 15169290 - 15169474
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||||| |||| || |||||||||  || |||||||||||||  | ||| || |  | |||| ||||| |||  |||    
T  15169290 catgattcatcaagtgcctatcaaccaacgttatggttatcctgttatagataacgtttgaatggcaataaagcatttaagtcca-catcttgggatcat 15169388  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 202  Q
    |||||||| ||| | ||| || | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15169389 agtggttttaggactaagagtagcatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattct 15169474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7396511 - 7396469
Alignment:
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaa 256  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7396511 aatccaatataaatattacccataatatttatatttatgtgaa 7396469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2365112 - 2365057
Alignment:
Q  283 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||||| ||||    
T  2365112 tgtgagatgtgatcatcagtcgacccacatgatagtctctatgttttaatgttatc 2365057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29983234 - 29983179
Alignment:
Q  232 ctcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 287  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29983234 ctcctaatatttatacatatgtgaaaatttgttaactctttatccatgatccgtga 29983179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29984372 - 29984308
Alignment:
Q  104 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttat 168  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||  || || ||||  |||||||||||||||||||    
T  29984372 tagggtacatggtggtttcaagttgaagggtgatatgcatcacttccactatgagaatatcttat 29984308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 39112092 - 39111980
Alignment:
Q  221 tataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattct 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||  |  ||||||||||||||||| || || ||| | | ||| ||||||||   |||||| |||    
T  39112092 tataaataatactcctaatatttatgtatatatgaagaaattgtaactctttatccatgacctatgtgatattaccattagtctacccttataatagtct 39111993  T
Q  321 ctatgctttaatg 333  Q
    ||||  |||||||    
T  39111992 ctatattttaatg 39111980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 14 - 338
Target Start/End: Original strand, 24695186 - 24695510
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24695186 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24695285  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695286 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 24695385  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695386 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 24695485  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||    
T  24695486 atagtctctatgctttattgatatc 24695510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Original strand, 19714218 - 19714543
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19714218 catgattcatgtagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19714317  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714318 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19714417  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19714418 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 19714517  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatcc 339  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19714518 atagtctctatgctttaatgatatcc 19714543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Original strand, 19706939 - 19707263
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19706939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacggacaacgtttgaatggtgacagagcactcgactccaatatctagggtacat 19707038  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707039 agttatt-caggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19707137  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19707138 aatccaatataaatattactcctagtatttatatctatgtgaagatttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 19707237  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatcc 339  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19707238 atagtctctatgctttaatgatatcc 19707263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 14 - 337
Target Start/End: Original strand, 18569581 - 18569906
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18569581 catgattcatgaagtacccatcaaccaattttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgataaagcactcgactccaacatgtagggtacat 18569680  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18569681 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgataatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtc 18569780  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctt--tatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18569781 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgatatctctttatatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctaccaaca 18569880  T
Q  312 taatattctctatgctttaatgatat 337  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18569881 taatagtctttatgctttaatgatat 18569906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 136 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39538953 - 39538749
Alignment:
Q  136 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcc 235  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  39538953 gaatataccactatcactatgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactcc 39538854  T
Q  236 taatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatgat 335  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||    
T  39538853 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatatgaccatcagtctacccacataatagtcttcatgctttaatgat 39538754  T
Q  336 atccc 340  Q
    |||||    
T  39538753 atccc 39538749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 305
Target Start/End: Original strand, 17298621 - 17298912
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||  |||||||||| | | |||||||||||    
T  17298621 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaacgtttgtacggaaacaaagtactcgactcctaaacctagggtacat 17298720  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 212  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| || |    
T  17298721 attggtttcaggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattctcatggtgggt 17298817  T
Q  213 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga--tgtgatcatcagtcta 305  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||    
T  17298818 caatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtgaagatttaataactctttatccatgacccgtgatatgtgtgatcatcagtcta 17298912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 305
Target Start/End: Original strand, 17285470 - 17285759
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||  |||||  |||||| ||| | | |||||||||||    
T  17285470 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaaagtttgtacggaaacaaagtactcgaatcctaaacctagggtacat 17285569  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 212  Q
    | || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| | | | |||||||||  ||||||||||||||||| | || |    
T  17285570 attgatttcaggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataacttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattctcattgtgggt 17285666  T
Q  213 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 305  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17285667 caatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtgatatgtgatcatcagtcta 17285759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 101 - 330
Target Start/End: Original strand, 18806843 - 18807070
Alignment:
Q  101 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||  |||||||  ||    
T  18806843 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgacagtta-caaaacttt--ctatgtatcat 18806939  T
Q  200 tctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatc 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  18806940 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatatgaaatgtgatcatc 18807039  T
Q  300 agtctacctacataatattctctatgcttta 330  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  18807040 agtctacccgcataatagtctctatgcttta 18807070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 27347252 - 27347428
Alignment:
Q  10 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347252 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttaaagataacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 27347350  T
Q  110 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 188  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27347351 acatagtggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacac-tttcataactttta 27347428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Original strand, 24701950 - 24702057
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24701950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24702049  T
Q  114 agtggttt 121  Q
    ||||||||    
T  24702050 agtggttt 24702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20941329 - 20941018
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  20941329 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 20941231  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  20941230 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 20941134  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20941133 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20941035  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  20941034 atagtctcgacgcttta 20941018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 25805385 - 25805696
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  25805385 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 25805483  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||  ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  25805484 agtggtttcaggtgtaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25805580  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  25805581 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 25805679  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  25805680 atagtctcgacgcttta 25805696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 147 - 338
Target Start/End: Original strand, 22546872 - 22547060
Alignment:
Q  147 tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22546872 tatcattatgaaaataacttatgata-tttacataactttt--tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttata 22546968  T
Q  247 tttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatgatatc 338  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||  ||||||| ||||    
T  22546969 tctatatgaaaacttgataactctttatccatgatttgtgagatgtgatcatcggtctatccacataatagtctctatattttaatgttatc 22547060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32201 - 31890
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  32201 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 32103  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  32102 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 32006  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  32005 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 31907  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  31906 atagtctcgacgcttta 31890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 12789663 - 12789974
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  12789663 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 12789761  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| |  | |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  12789762 agtggtttcaggtctaagagcagtatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 12789858  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12789859 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 12789957  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  12789958 atagtctcgacgcttta 12789974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22941552 - 22941241
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  22941552 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22941454  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22941453 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22941357  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||  |||| |||| |  ||||||  | |||||||||||| ||||||    
T  22941356 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtataaacttgatatctc-atatctatgacccatgagatacggtcatcagtctacatacata 22941258  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  22941257 atagtctcgacgcttta 22941241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23546224 - 23545913
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  23546224 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 23546126  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  23546125 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 23546029  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  23546028 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 23545930  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  23545929 atagtctcgacgcttta 23545913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 24933306 - 24933617
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  24933306 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 24933404  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  24933405 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24933501  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  24933502 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 24933600  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  24933601 atagtctcgacgcttta 24933617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31097118 - 31096807
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  31097118 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgattcca-catctagggatcat 31097020  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  31097019 aatggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 31096923  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  31096922 aatccaatataaatattactcctataatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 31096824  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  31096823 atagtctcgacgcttta 31096807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Original strand, 20100255 - 20100540
Alignment:
Q  26 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 125  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||  | ||| |||| || |||| ||||| |||  ||||||||||||| |    
T  20100255 agtacccatcaaccaacattatggttatccttttacagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catcttgggatcatagtggtttcatg 20100353  T
Q  126 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 225  Q
    || ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||| |  || |||| ||| |||||    
T  20100354 tctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttgggtcaagccagtataa 20100450  T
Q  226 atattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataata 316  Q
     |||||||||||||||| |||  ||| |  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20100451 gtattactcctaatattgatacctatctatagacttaatatctc-atattcatgacccatgagatgtgatcatcagtctacatacataata 20100540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5097953 - 5097642
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||| |||  |||    
T  5097953 catgattcatcatgtacccatcaacaaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctcgggatcat 5097855  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || |     
T  5097854 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataacttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgggtt 5097758  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  5097757 aatccaatataaatattactcataatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatacata 5097659  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  5097658 atagtctcgacgcttta 5097642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 7865430 - 7865745
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  7865430 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 7865528  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |   | |||||||   |||||||||||||||||| || ||    
T  7865529 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 7865626  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 310  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  7865627 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 7865725  T
Q  311 ataatattctctatgcttta 330  Q
    |||||| |||| | ||||||    
T  7865726 ataatagtctcgacgcttta 7865745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 12764990 - 12765305
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || |||| |||| || |  |||    
T  12764990 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 12765088  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||| |||||||||| |   | |||||||  ||||||||||||||||||| || ||    
T  12765089 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatgacaattaatctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgg 12765186  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 310  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||    
T  12765187 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 12765285  T
Q  311 ataatattctctatgcttta 330  Q
    |||||| |||| | ||||||    
T  12765286 ataatagtctcgacgcttta 12765305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 239
Target Start/End: Original strand, 18806483 - 18806619
Alignment:
Q  101 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||  |||||||  ||    
T  18806483 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806579  T
Q  200 tctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaat 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806580 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 239
Target Start/End: Original strand, 18806663 - 18806799
Alignment:
Q  101 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||  |||||||  ||    
T  18806663 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806759  T
Q  200 tctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaat 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806760 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 9811733 - 9812048
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || |||| |||| || |  |||    
T  9811733 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 9811831  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  9811832 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 9811929  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 310  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||    
T  9811930 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 9812028  T
Q  311 ataatattctctatgcttta 330  Q
    ||| || |||| | ||||||    
T  9812029 atagtagtctcgacgcttta 9812048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 12703874 - 12704189
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || |||| |||| || |  |||    
T  12703874 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 12703972  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  12703973 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 12704070  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 310  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||    
T  12704071 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 12704169  T
Q  311 ataatattctctatgcttta 330  Q
    ||| || |||| | ||||||    
T  12704170 atagtagtctcgacgcttta 12704189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 263
Target Start/End: Original strand, 18829377 - 18829530
Alignment:
Q  108 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||  |||||||||  |||||||  |||||||||    
T  18829377 gtacatagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataacttatggaactta-cataacttt--ctatgtatcattctcatg 18829473  T
Q  207 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttga 263  Q
    | || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18829474 gtgggtcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatatgagaacacttga 18829530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 249 - 340
Target Start/End: Original strand, 27347433 - 27347524
Alignment:
Q  249 tatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27347433 tatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtgagatgtgatcatcggcctatccacaaaatagtctctatgctttaatgttatccc 27347524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 322
Target Start/End: Original strand, 26129689 - 26129996
Alignment:
Q  10 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 109  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||| | |||  ||||| ||| ||||||  | ||| |||| || |||| ||||||| |     
T  26129689 tcatcatgattcattaagtacccattagccaacgttatggttatctttttatagacaatgttagaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagtga 26129787  T
Q  110 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 209  Q
     ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||| ||||| ||| || |    
T  26129788 tcatagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtggtattttcacggtg 26129884  T
Q  210 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 309  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||  |||||| ||| ||   ||||||| | |  |||||| || | || ||||||| ||    
T  26129885 ggtcaatccagtataaatattactcataatatttgtatatatgtatagacttaatatct-aatatccataacccatgagatatggtaattagtctacata 26129983  T
Q  310 cataatattctct 322  Q
    |||||||||||||    
T  26129984 cataatattctct 26129996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26245404 - 26245093
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||| ||||  | ||||  |||||| |  |||    
T  26245404 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgctatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttaagtccat-atctagagatcat 26245306  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||| | || || | |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| |||||||| |  | |||||    
T  26245305 aatggtttcaggtctaagagcgatatacactattaacattgtgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgcagtattctgacagtggatc 26245209  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||  | |||| ||| |||  |||| |||| |  |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  26245208 aatcaagtataaatattactcctaatatttatacctatgtataaacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcaatcatcagtctacatacata 26245110  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  26245109 atagtctcgacgcttta 26245093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Original strand, 28719471 - 28719558
Alignment:
Q  10 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaa 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  28719471 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttacagacaacgtttg-acggtgataaagcactcgactccaa 28719558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 243
Target Start/End: Original strand, 31651802 - 31652009
Alignment:
Q  31 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 130  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||   | |||||||  || | ||| ||||| ||  ||| ||||||||| ||| ||    
T  31651802 ccattaactaactttacagttatcctgttacagataacgtttgaatgacaataaaacacgtgatttcaa-atctaaggatcatggtggtttcaagtctaa 31651900  T
Q  131 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 230  Q
    | ||||  | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||   ||||||||| ||||||||| |  | |||||||| ||| ||| ||    
T  31651901 gagtggcgtgcactattatcactatgagaatatcttatgatac--ttcataac--atactatgtaatattctcatagtaggtcaatccattattaatgtt 31651996  T
Q  231 actcctaatattt 243  Q
    |||||||||||||    
T  31651997 actcctaatattt 31652009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 39539035 - 39538954
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgact 95  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  39539035 catgattcgtggagtacctaccaaccaactttataatcatcctattccaaacaacatttgaatggtgataaagcactcgact 39538954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 316
Target Start/End: Original strand, 33477193 - 33477319
Alignment:
Q  189 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 288  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||||||  ||  ||||||||| || |||     
T  33477193 ctatgtagtattcttatggcagatcaattatgtataaatattactcttaatattaatatttatttgtagatttgatatttc-atatccatgacctttgat 33477291  T
Q  289 atgtgatcatcagtctacctacataata 316  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||||    
T  33477292 atgtgattatcagtttactcacataata 33477319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18774 - 18449
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18774 catgattcatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18676  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18675 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18576  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18575 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18476  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18475 atagtctctatgctttaatgatatccc 18449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 10 - 340
Target Start/End: Original strand, 25706 - 26036
Alignment:
Q  10 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25706 tcatcatgatttatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 25805  T
Q  110 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25806 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 25905  T
Q  210 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25906 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 26005  T
Q  310 cataatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26006 cataatagtcgctatgctttaatgatatccc 26036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 21329968 - 21330294
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21329968 catgattcatggagtccccatcaacctactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 21330067  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330068 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 21330167  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21330168 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtccacctacata 21330267  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21330268 atagtctctatgctttaatgatatccc 21330294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 14 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18796993 - 18796670
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796993 catgattcatggtgtacccatcaacaaactttatagtcatcctgttacgtacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacat 18796894  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  18796893 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagaggatc 18796794  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18796793 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 18796694  T
Q  314 atattctctatgctttaatgatat 337  Q
    ||| |||| |||||||||||||||    
T  18796693 atagtctcaatgctttaatgatat 18796670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18620296 - 18619973
Alignment:
Q  8 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagg 107  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||   | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  18620296 catcagcatgattagtggagtacccatcaaccaactttatggtcatcttgttacatacataatgtgaatggtgataaagcactcgactccaacatttagg 18620197  T
Q  108 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18620196 gtacatagtggtttcaggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatatcttatgacacttt-cataacttttactatgtagtattctcatgg 18620098  T
Q  208 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 307  Q
     || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  18620097 tgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggcctacc 18619998  T
Q  308 tacataatattctctatgctttaat 332  Q
     |||||||| ||| |||||||||||    
T  18619997 cacataatagtctatatgctttaat 18619973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36270650 - 36270327
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| | ||  |||||  | |||||||  ||||||||||| |||    
T  36270650 catgattcattgagtacccaacaaccgactttatagtcatcctgttacgaacgacttttgtacggcaacaaagtattcgactcatacatctagggtgcat 36270551  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 212  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||| ||||| |||  |||||||  ||||||||||||  |    
T  36270550 ggtggttttaggtcgaagggtg-aatacaccacttatcactatgagaatgacttgtgac-ctttacataatttt--ctatgtaacattctcatggcgagt 36270455  T
Q  213 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||| |||     
T  36270454 caatccaatataaatattactcctaatatttaaatcgaagtgaaaacttgataactctttctctatgactcgtgagatgtgatcatcagtctacccacac 36270355  T
Q  313 aatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    |||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  36270354 aatagtctttatactttaatgttatccc 36270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18822556 - 18822244
Alignment:
Q  26 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  |||   | |||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18822556 agtacccattaaccaactttatagtcattgtgttacggatgacgtttatatgacaaaaaagtacttgactcctacatctagggtacacagtggtttcagg 18822457  T
Q  126 tcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||  ||  |||| |||||| |||  ||||||  | ||||||||| |||||||||||||||    
T  18822456 tcgaagggtggaatacaccacttatctatatgagaatgacttgagat-ctttacataacgttt--tatgtaacaatctcatggcagatcaatccaatata 18822360  T
Q  225 aatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctat 324  Q
    ||||||||   |||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| | |    
T  18822359 aatattaccattaatatttatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgatccgtgatatgtgatcatcagtctattgacataataatctatct 18822260  T
Q  325 gctttaatgatatccc 340  Q
    ||||||||||||||||    
T  18822259 gctttaatgatatccc 18822244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Original strand, 22183206 - 22183528
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |     |||||  |||||||||| ||||| || |||||     
T  22183206 catgattcatcaaatacccatcaatcgactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgtacaacaacaaagtactcgactcctacatcaagagtacac 22183305  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 212  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||  ||| |||||| ||   ||||||  ||| ||||||||| |    
T  22183306 gttggtttcaggtcaaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctgtgact-tttacataacatta--tatgtaacattgtcatggcgggt 22183402  T
Q  213 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 312  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || |    
T  22183403 caatccaatataa-tattactcttaatatttatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaagatctgtgagatttgatcatcaatctacccacgt 22183501  T
Q  313 aatattctctatgctttaatgatatcc 339  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||    
T  22183502 aatagtctctatactttaatgttatcc 22183528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 326
Target Start/End: Original strand, 6991847 - 6992146
Alignment:
Q  28 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaac-actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggt 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||  |  ||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||     
T  6991847 tacccatcaaccgactttatagtcatcgtgtcatagacaacgtttaaacagaaacaaaagtactcgactcctacatctagggaacatagtgatttcaggc 6991946  T
Q  127 cgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| || |||||  ||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||    
T  6991947 cgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagtttatgtcac-ttacataa--ttttctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatataa 6992043  T
Q  226 atattactcctaatatttatatttatgtgaag--acttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctcta 323  Q
    ||||||||||| | |||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||| ||    
T  6992044 atattactcctgagatttatacctatgtgaagatacttgataaatctttatttataatctgtgagatatgatcattagtctacccatataataatcttta 6992143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20978360 - 20978091
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||    ||||  |||||| ||| |||||||||||||||    
T  20978360 catgatttgtggagtatccatcaatcgactttatagttatcatgttacggactacgtttatatgacatcaaagtactcgaatcctacatctagggtacat 20978261  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 212  Q
    ||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||  | || ||  ||||||||||||| |    
T  20978260 agtagtgtcatgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataacttatgaca-ttttcataatttt--ccatataaaattctcatggcgggt 20978164  T
Q  213 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20978163 caatccaatataaatattactcataataattatatctcggtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 20978091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 24250032 - 24250343
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  24250032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 24250130  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  24250131 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24250227  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  24250228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 24250326  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  24250327 atagtctcgacgcttta 24250343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30174679 - 30174368
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  30174679 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 30174581  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  30174580 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 30174484  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  30174483 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 30174385  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  30174384 atagtctcgacgcttta 30174368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 24229215 - 24229526
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||| |||| || || | |||||||||  |||    
T  24229215 catgattcatcaagtacccttcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 24229313  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||| | | ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  24229314 agtggtttcaaggctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 24229410  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  24229411 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgaaccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 24229509  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  24229510 atagtctcgacgcttta 24229526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Original strand, 15342014 - 15342230
Alignment:
Q  26 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 125  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||  ||||||| |  | ||| || | || | || |||||||||  |||||||||||||||    
T  15342014 agtacccattaaccaacgttatggtcatcctgttacaaacaatttttgaattgcaataaagcatttgagttca-catctagggatcatagtggtttcagg 15342112  T
Q  126 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 225  Q
    || ||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||| || || | |||||| |||||    
T  15342113 tctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactatcttatgacac-tttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggttaatccagtataa 15342209  T
Q  226 atattactcctaatatttata 246  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15342210 atattactcctaatatttata 15342230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 316
Target Start/End: Original strand, 18851956 - 18852081
Alignment:
Q  191 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagat 290  Q
    ||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18851956 atgtaatattcttatagcgagtcaatccaatataaatattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatccgtgagat 18852055  T
Q  291 gtgatcatcagtctacctacataata 316  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||    
T  18852056 gggatcattagtctaccgacataata 18852081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279449
Alignment:
Q  189 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 288  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaatatctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgatacgtgag 19279501  T
Q  289 atgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
    |||||||||| |||| ||   ||||||| ||| |||||||||| | ||||||    
T  19279500 atgtgatcattagtcaactcgcataatagtctttatgctttaaagttatccc 19279449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29800775 - 29800545
Alignment:
Q  12 atcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtac 111  Q
    |||||||||| |  ||| ||||| ||||||| ||||  | |||||||||| ||||| |||||||||   | ||| |||| || |||| |||||||||  |    
T  29800775 atcatgattcgtcaagtgcccattaaccaacattatgattatcctgttacagacaatgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatc 29800677  T
Q  112 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 211  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||     
T  29800676 atagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatccttgtgagaatatcatgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtggg 29800580  T
Q  212 tcaatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29800579 tcaatccagtataaatattactcctaatatttata 29800545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 315
Target Start/End: Original strand, 36801899 - 36802003
Alignment:
Q  212 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatattt-atgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 310  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||    
T  36801899 tcaattcaatataaatattacccttaatatttatattttatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtgaggtgtgatcatcagtctactcac 36801998  T
Q  311 ataat 315  Q
    |||||    
T  36801999 ataat 36802003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17241196 - 17241034
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||| |||||| |||||  ||| ||| | ||||||| | || ||||||  |||||||||||  ||||| |||  ||| |||||| |||||||  ||||||    
T  17241196 catgtttcatgaagtacatatctaccgattttataggcttcatgttacacacaacgtttgagcggtgataaagtacttgactcctacatctacagtacat 17241097  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt 177  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17241096 agtggttttaggtcgaagg-tgaaatacaccattatcactatgagaatatcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19616653 - 19616509
Alignment:
Q  99 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 198  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    ||||||||||||    
T  19616653 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcatatgaca-ttttcataa--aatactatgtagta 19616557  T
Q  199 ttctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    |||||| || || ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  19616556 ttctcacggtgggtcaattcagaataaatgttactcctaatatttata 19616509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 251
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301169
Alignment:
Q  112 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 211  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | |  |||||||||||||||||| ||     
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgacactt--cataacatgt--tatgtagtattctcatggtggg 40301129  T
Q  212 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttat 251  Q
    ||||||   ||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  40301130 tcaatctggtataaatattacttctaatatgtatacttat 40301169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21626955 - 21626817
Alignment:
Q  111 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |   |||||||||||||||| ||    
T  21626955 catagtgatttcaggtctaacagtggtagacactattatcactatgagaatatcttatgacacttt-cataacat--agcgtgtagtattctcatggtgg 21626859  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 253  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  21626858 -tcaattcaatataaatattactcatattatttatacttatgt 21626817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 249
Target Start/End: Original strand, 41316305 - 41316511
Alignment:
Q  39 caactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||   | ||| | ||  | |||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||| |    
T  41316305 caactttatagttatcctgttacagataacgtttgaatgacaataaagcccttaagtcca-catctagggatcatagtggattcaggtctaagaatggta 41316403  T
Q  139 tacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaa 238  Q
    | | ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| || ||||||||||| || || ||  | |||||||||||||| |||    
T  41316404 ttctccgttatcagtatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atactatataatattctcatggtgggtcgattaagtataaatattactcataa 41316500  T
Q  239 tatttatattt 249  Q
    |||||| ||||    
T  41316501 tatttacattt 41316511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 41661761 - 41661694
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtga 81  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  41661761 catgtttcatggagtacccatcaaccaactttatgatcatcttattatagacaacgtttgaatggtga 41661694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 161
Target Start/End: Original strand, 36799756 - 36799826
Alignment:
Q  92 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 161  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36799756 gactcctacatctagggcgcatagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 175
Target Start/End: Original strand, 28740910 - 28740986
Alignment:
Q  99 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 175  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28740910 acatctagggatcatagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgacactt 28740986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 330
Target Start/End: Original strand, 12098609 - 12098654
Alignment:
Q  285 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgcttta 330  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  12098609 tgagatctgatcatcagtctacatacataatagtctctatgtttta 12098654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 247
Target Start/End: Original strand, 28718943 - 28719003
Alignment:
Q  187 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 247  Q
    |||| ||||||||||||| |  |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28718943 tactgtgtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatat 28719003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 33 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1461 - 1154
Alignment:
Q  33 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 132  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1461 atcaaccaactttatatttatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 1362  T
Q  133 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattac 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1361 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattac 1262  T
Q  233 tcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgctttaat 332  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1261 tcttaatatttatatctatggcaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 1162  T
Q  333 gatatccc 340  Q
    ||||||||    
T  1161 gatatccc 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6013 - 5690
Alignment:
Q  10 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6013 tcatcatgattgatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacttgactccaacatctagggt 5914  T
Q  110 acatagtggtttcaggtcgaaggg-tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt-cataacttttactatgtagtattctcatgg 207  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||| |||         ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5913 acatagtggtttcatgtcgaaaggatggaatgcac---------tatgagaatatcttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatgg 5823  T
Q  208 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5822 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgacctgtgagatgtgatcatcagtctacc 5723  T
Q  308 tacataatattctctatgctttaatgatatccc 340  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5722 cacataatagtctttatgctttaatgatatccc 5690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 230111 - 230367
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  230111 catgattcatggtgtatccaccaaccaactttattgtcatcttgttacagacaacgtttgaatagtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 230210  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  230211 aatggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatc 230310  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactct 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  230311 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 485 - 174
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 387  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  386 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 290  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  289 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtcatcagtcgacatacata 191  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  190 atagtctcgacgcttta 174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 3675 - 3986
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  3675 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 3773  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  3774 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3870  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3871 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 3969  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  3970 atagtctcgacgcttta 3986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 120032 - 119721
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  120032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 119934  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  119933 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 119837  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  119836 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacgtacata 119738  T
Q  314 atattctctatgcttta 330  Q
    ||| |||| | ||||||    
T  119737 atagtctcgacgcttta 119721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 330
Target Start/End: Original strand, 12961 - 13260
Alignment:
Q  26 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 125  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| || | || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  12961 agtacccatcaaccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaagcaattgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 13059  T
Q  126 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 225  Q
    || ||| |||  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||  |||||    
T  13060 tctaagagtgatatacactattatcattatgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtataa 13156  T
Q  226 atattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatg 325  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| | |    
T  13157 atattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatacataatagtctcgacg 13255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 330
Target Start/End: Original strand, 130262 - 130535
Alignment:
Q  52 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 151  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | |||||    
T  130262 atccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatca 130360  T
Q  152 ctatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttat 251  Q
     | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  130361 ttgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 130457  T
Q  252 gtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatattctctatgcttta 330  Q
    ||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  130458 gtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 130535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 67374 - 67602
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  67374 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 67472  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| |||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  67473 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 67569  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67570 aatccaatataaatattactcctaatatttata 67602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8296
Alignment:
Q  111 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  8511 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8415  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8414 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8316  T
Q  311 ataatattctctatgcttta 330  Q
    |||||| |||| | ||||||    
T  8315 ataatagtctcgacgcttta 8296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26844 - 26616
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||  ||||   | ||| ||||||| |||| ||| |||||  |||    
T  26844 catgattcatcgagtacccattatccaacgttatggttatccttttacagacaacattaaaatgacaataaagcactcgagtcca-catatagggatcat 26746  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| || || ||    
T  26745 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatatagtattctcaaggtgggtc 26649  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26648 aatccagtataaatattactcctaatatttata 26616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 321
Target Start/End: Original strand, 39988 - 40290
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  |||| |||| | |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | ||| |||| || ||||  || |||||  |||    
T  39988 catgattcatcaagtaaccattagccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggaaataaagcacttgagtccat-atttagggatcat 40086  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||| ||| ||| ||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||  | || ||    
T  40087 agtggtttcaagtctaagagttatatacaccattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacagtgggtc 40183  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 313  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  |||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  40184 aatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggccatcagtctacatacata 40282  T
Q  314 atattctc 321  Q
    ||| ||||    
T  40283 atagtctc 40290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9005 - 8807
Alignment:
Q  42 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatac 141  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||   | |||||||| ||||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||| | | |||| ||||    
T  9005 ctttatagttatcatgttacagagaacgtttgaatgacaataaaacacttgactcca-catttaaggatcattgtggtttcaggtctaggagtggtatac 8907  T
Q  142 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||| ||||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8906 accattatcactatgagaatatcttatgaca-tcttcataac--atactaagtagtattctcattgggggtcaatctagtataaatattactcctaatat 8810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 332
Target Start/End: Original strand, 90019 - 90154
Alignment:
Q  198 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactc-tttatccatgatctgtgagatgtgatc 296  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||     
T  90019 attctcatcgcgtgtcaatccaatataaatgttatacgtaatatttatatctatgtgaagtgttgataactcttttacccatgatccgtgagatgtgatt 90118  T
Q  297 atcagtctacctacataatattctctatgctttaat 332  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  90119 atcagtctatctacatagtagtctttatgctttaat 90154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 102
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||  ||| || |||| |||||||||  ||     
T  288 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcag 190  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctca 204  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  189 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83243
Alignment:
Q  111 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatatcttatgacacctt-cgtaacat--actatgtagtattctcattgtgg 83207  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
     |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  83208 gtcaatccagtataaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 11526 - 11758
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || ||| ||||||||||  ||     
T  11526 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcaa 11624  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 210  Q
    |||||||||||||| ||| | |   |||||   ||||| | |||||||||||||||||| |   |  ||||||   ||||||||||||||||||  | ||    
T  11625 agtggtttcaggtctaagagcgatgtacactgttatcattgtgagaatatcttatgacaattaatcacataac--gtactatgtagtattctcacagtgg 11722  T
Q  211 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11723 gtctatccagtataaatattactcctaatatttata 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 54066 - 53839
Alignment:
Q  14 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | ||| |||| || |||| || ||||||  |||    
T  54066 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggc-ataaagcacttgagtcca-cacctagggatcat 53969  T
Q  114 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 213  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||| || | || ||   |||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  53968 agtggtttcaggtctaagagcaatataaactattaacatgttgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgggtc 53872  T
Q  214 aatccaatataaatattactcctaatatttata 246  Q
    || ||| | | |||||||||| |||||||||||    
T  53871 aacccagtgtgaatattactcttaatatttata 53839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11421 - 11328
Alignment:
Q  138 atacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactc 234  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||    
T  11421 atacaccattatcactattagaataacttataaca-tcttcataacat--actatgtagtattctcatggtgggtaaatccatcataaatattactc 11328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 46051 - 45956
Alignment:
Q  191 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactccta----atatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 282  Q
    |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    |||||||||| ||| |||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  46051 atgtagcattctaatggtgggtcaattcaatataaatattactcataatatatatttatatctatatgaatatttgacaactttttatccatgatc 45956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University