View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1460_high_26 (Length: 280)

Name: NF1460_high_26
Description: NF1460
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1460_high_26
NF1460_high_26
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (10-262)||(4154570-4154822)
chr8 (109-258)||(4154282-4154432)
chr8 (26-262)||(9620596-9620832)
chr8 (119-263)||(3038301-3038447)
chr8 (119-262)||(3669689-3669834)
chr8 (119-263)||(25561826-25561973)
chr8 (118-263)||(34835210-34835357)
chr8 (125-262)||(40518584-40518723)
chr8 (134-262)||(41972160-41972293)
chr8 (119-263)||(34834877-34835023)
chr8 (148-262)||(45121952-45122066)
chr8 (147-262)||(9608747-9608862)
chr8 (147-261)||(147454-147568)
chr8 (150-262)||(8918808-8918920)
chr8 (147-262)||(9309357-9309472)
chr8 (147-262)||(45122098-45122213)
chr8 (119-262)||(3670062-3670207)
chr8 (119-262)||(40518071-40518218)
chr8 (125-254)||(18372011-18372142)
chr8 (147-263)||(30359272-30359388)
chr8 (147-263)||(33113408-33113524)
chr8 (165-261)||(40991756-40991852)
chr8 (134-222)||(45122666-45122756)
chr8 (119-262)||(1014256-1014401)
chr8 (119-262)||(30441083-30441232)
chr8 (118-263)||(34835475-34835623)
chr8 (118-263)||(34835741-34835889)
chr8 (134-262)||(5420653-5420783)
chr8 (119-262)||(6876873-6877019)
chr8 (134-257)||(70300-70425)
chr8 (119-201)||(5915930-5916014)
chr8 (147-263)||(30359610-30359726)
chr8 (148-222)||(9483229-9483303)
chr8 (134-262)||(20870599-20870731)
chr8 (150-264)||(37544534-37544648)
chr8 (119-257)||(9482615-9482755)
chr8 (155-263)||(1513964-1514072)
chr8 (129-262)||(5274777-5274912)
chr8 (85-185)||(20995393-20995495)
chr8 (207-262)||(20995502-20995557)
chr8 (159-262)||(9308979-9309084)
chr8 (148-210)||(9507836-9507898)
chr8 (147-241)||(9609108-9609202)
chr8 (160-260)||(18372988-18373085)
chr8 (148-222)||(40579548-40579622)
chr8 (181-242)||(34219208-34219269)
chr8 (85-201)||(32640508-32640627)
chr8 (147-262)||(6731906-6732012)
chr8 (156-262)||(1013921-1014027)
chr8 (147-201)||(6651557-6651611)
chr8 (187-257)||(41416252-41416322)
chr8 (155-261)||(43274828-43274934)
chr8 (225-262)||(147831-147868)
chr8 (110-259)||(2467507-2467656)
chr8 (156-263)||(18372656-18372759)
chr8 (192-261)||(18372785-18372854)
chr8 (152-260)||(43398114-43398225)
chr8 (140-260)||(18380051-18380171)
chr8 (119-242)||(15836411-15836528)
chr8 (187-262)||(33831980-33832055)
chr8 (156-263)||(45121706-45121812)
chr8 (182-232)||(4715308-4715358)
chr8 (165-223)||(11442894-11442952)
chr8 (147-196)||(147888-147937)
chr8 (192-261)||(18372342-18372411)
chr8 (202-262)||(9620384-9620444)
chr8 (150-222)||(32305519-32305591)
chr8 (186-262)||(44358150-44358226)
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (118-262)||(30323466-30323610)
chr2 (125-262)||(30313180-30313318)
chr2 (119-263)||(29874034-29874180)
chr2 (156-262)||(33561501-33561607)
chr2 (118-262)||(29873547-29873693)
chr2 (119-262)||(962600-962745)
chr2 (134-260)||(28254265-28254391)
chr2 (125-262)||(36178622-36178761)
chr2 (119-262)||(41283486-41283631)
chr2 (147-263)||(15880264-15880380)
chr2 (147-262)||(14745708-14745823)
chr2 (119-263)||(36005891-36006036)
chr2 (147-262)||(42514651-42514766)
chr2 (147-264)||(6421385-6421502)
chr2 (155-262)||(28531363-28531470)
chr2 (151-258)||(33953816-33953923)
chr2 (54-262)||(35580670-35580879)
chr2 (147-262)||(37105926-37106041)
chr2 (155-262)||(37106190-37106297)
chr2 (147-258)||(40679670-40679781)
chr2 (148-262)||(5543040-5543154)
chr2 (134-262)||(38796644-38796776)
chr2 (147-262)||(41678409-41678525)
chr2 (119-248)||(6422126-6422257)
chr2 (28-261)||(30312792-30313028)
chr2 (147-262)||(5542666-5542781)
chr2 (54-262)||(7598230-7598440)
chr2 (134-257)||(15511521-15511646)
chr2 (148-262)||(31385739-31385853)
chr2 (136-263)||(40733518-40733647)
chr2 (117-259)||(33731653-33731797)
chr2 (147-258)||(14745335-14745446)
chr2 (189-262)||(7598611-7598684)
chr2 (156-262)||(31468800-31468902)
chr2 (165-233)||(2336655-2336723)
chr2 (147-262)||(16542451-16542566)
chr2 (18-166)||(33561745-33561894)
chr2 (179-261)||(31899499-31899581)
chr2 (156-261)||(3594228-3594333)
chr2 (119-201)||(6421794-6421878)
chr2 (147-263)||(6712977-6713094)
chr2 (157-262)||(36178320-36178425)
chr2 (71-251)||(23346250-23346431)
chr2 (147-262)||(33954303-33954417)
chr2 (134-246)||(36178197-36178311)
chr2 (155-262)||(37632646-37632753)
chr2 (134-253)||(40163398-40163520)
chr2 (147-256)||(29676543-29676646)
chr2 (147-206)||(35580479-35580540)
chr2 (159-248)||(28254165-28254254)
chr2 (155-256)||(37895110-37895211)
chr2 (147-263)||(5367456-5367572)
chr2 (157-261)||(12910231-12910335)
chr2 (183-262)||(1769894-1769973)
chr2 (187-262)||(38796299-38796374)
chr2 (119-201)||(6421689-6421773)
chr2 (181-262)||(18204459-18204540)
chr2 (147-259)||(29676908-29677025)
chr2 (179-262)||(12529101-12529184)
chr2 (187-233)||(2323647-2323693)
chr2 (158-263)||(34481267-34481372)
chr2 (147-211)||(3673121-3673185)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (109-262)||(12092483-12092638)
chr6 (129-262)||(6071134-6071269)
chr6 (119-262)||(3409261-3409406)
chr6 (147-262)||(10074404-10074519)
chr6 (119-262)||(14748353-14748494)
chr6 (147-262)||(8481929-8482043)
chr6 (54-262)||(29518505-29518715)
chr6 (54-263)||(16107679-16107892)
chr6 (119-262)||(29518922-29519067)
chr6 (119-262)||(32741181-32741326)
chr6 (54-263)||(16454576-16454787)
chr6 (150-264)||(2377754-2377868)
chr6 (119-251)||(31714683-31714815)
chr6 (148-263)||(2578485-2578599)
chr6 (147-262)||(10074032-10074147)
chr6 (119-263)||(16454908-16455054)
chr6 (119-262)||(2378128-2378273)
chr6 (119-262)||(2579883-2580028)
chr6 (119-262)||(35210206-35210351)
chr6 (147-262)||(3058228-3058343)
chr6 (147-261)||(6999837-6999951)
chr6 (119-262)||(12071702-12071847)
chr6 (147-260)||(3415462-3415575)
chr6 (120-262)||(12085046-12085189)
chr6 (109-258)||(1127366-1127517)
chr6 (147-262)||(10073657-10073770)
chr6 (147-262)||(26544051-26544166)
chr6 (156-259)||(32460630-32460733)
chr6 (134-259)||(2579518-2579645)
chr6 (54-262)||(2578781-2578990)
chr6 (119-262)||(3409662-3409807)
chr6 (119-264)||(2843554-2843702)
chr6 (147-262)||(10911567-10911683)
chr6 (194-262)||(33605656-33605724)
chr6 (155-262)||(593758-593865)
chr6 (148-262)||(1846750-1846864)
chr6 (147-261)||(1950226-1950340)
chr6 (179-263)||(16108064-16108148)
chr6 (155-258)||(9062399-9062501)
chr6 (118-264)||(5832037-5832184)
chr6 (205-254)||(33605985-33606034)
chr6 (184-231)||(5034899-5034946)
chr6 (28-60)||(12092343-12092375)
chr6 (190-233)||(34661693-34661736)
chr6 (119-260)||(17135080-17135223)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (54-262)||(1085562-1085772)
chr7 (109-262)||(7517582-7517737)
chr7 (134-263)||(30245078-30245205)
chr7 (150-262)||(118345-118457)
chr7 (137-262)||(7554027-7554154)
chr7 (147-263)||(30244271-30244387)
chr7 (147-263)||(45434637-45434753)
chr7 (155-262)||(22566711-22566818)
chr7 (147-262)||(37533052-37533166)
chr7 (119-262)||(22567050-22567194)
chr7 (147-263)||(6054561-6054677)
chr7 (54-262)||(8128386-8128597)
chr7 (147-263)||(34218075-34218191)
chr7 (147-258)||(23418-23529)
chr7 (119-262)||(14681512-14681655)
chr7 (147-262)||(16569198-16569313)
chr7 (147-262)||(16596349-16596464)
chr7 (147-262)||(29157567-29157682)
chr7 (119-262)||(40094785-40094930)
chr7 (147-262)||(24177437-24177552)
chr7 (147-257)||(11845198-11845308)
chr7 (147-262)||(37345918-37346035)
chr7 (54-261)||(37533310-37533519)
chr7 (134-262)||(36534812-36534940)
chr7 (134-263)||(45754717-45754847)
chr7 (119-263)||(45433242-45433388)
chr7 (134-223)||(30253533-30253620)
chr7 (134-256)||(19122740-19122863)
chr7 (147-264)||(47129095-47129212)
chr7 (147-258)||(4124129-4124240)
chr7 (179-262)||(28301616-28301699)
chr7 (155-262)||(36939782-36939889)
chr7 (147-261)||(9901648-9901760)
chr7 (193-254)||(10341842-10341903)
chr7 (160-261)||(20599317-20599418)
chr7 (181-261)||(41910669-41910749)
chr7 (134-261)||(24838727-24838857)
chr7 (159-262)||(36622962-36623065)
chr7 (147-262)||(40230332-40230447)
chr7 (155-208)||(1085297-1085350)
chr7 (189-233)||(42282101-42282145)
chr7 (191-262)||(30245496-30245567)
chr7 (163-262)||(43241497-43241596)
chr7 (90-229)||(15902335-15902475)
chr7 (147-195)||(28300294-28300342)
chr7 (191-262)||(30255341-30255412)
chr7 (147-197)||(21416182-21416232)
chr7 (187-225)||(45335547-45335585)
chr7 (71-152)||(30244466-30244547)
chr7 (182-243)||(10342275-10342338)
chr7 (147-195)||(23569043-23569091)
chr7 (194-262)||(30244703-30244771)
chr7 (218-262)||(37345563-37345607)
chr7 (119-176)||(47129457-47129516)
[»] chr1 (64 HSPs)
chr1 (90-262)||(19283437-19283611)
chr1 (134-263)||(26661548-26661679)
chr1 (119-262)||(1188599-1188744)
chr1 (147-263)||(17294578-17294694)
chr1 (147-262)||(22077536-22077651)
chr1 (125-262)||(5319982-5320121)
chr1 (125-262)||(22793280-22793420)
chr1 (147-262)||(32594757-32594872)
chr1 (119-262)||(41142374-41142520)
chr1 (134-263)||(26661924-26662055)
chr1 (147-262)||(3550722-3550837)
chr1 (54-260)||(9955911-9956121)
chr1 (119-262)||(44290835-44290981)
chr1 (118-262)||(66099-66245)
chr1 (119-262)||(41156993-41157138)
chr1 (119-262)||(41157377-41157522)
chr1 (150-262)||(44290502-44290614)
chr1 (119-259)||(3537610-3537752)
chr1 (147-262)||(24600355-24600470)
chr1 (147-262)||(34364927-34365042)
chr1 (119-263)||(34649439-34649585)
chr1 (134-263)||(37556112-37556243)
chr1 (125-262)||(66489-66628)
chr1 (147-262)||(1187405-1187520)
chr1 (147-242)||(10351182-10351277)
chr1 (147-262)||(39066241-39066356)
chr1 (149-235)||(22077153-22077239)
chr1 (119-262)||(34364509-34364654)
chr1 (119-262)||(41759485-41759630)
chr1 (170-262)||(41184489-41184581)
chr1 (147-262)||(29798201-29798316)
chr1 (134-262)||(31767187-31767317)
chr1 (155-262)||(40082409-40082515)
chr1 (147-262)||(48588529-48588644)
chr1 (148-262)||(22077871-22077984)
chr1 (119-262)||(24448279-24448424)
chr1 (119-262)||(30630649-30630794)
chr1 (147-261)||(50052064-50052178)
chr1 (125-263)||(38804372-38804512)
chr1 (118-258)||(24131998-24132137)
chr1 (187-262)||(3537228-3537303)
chr1 (147-254)||(3875372-3875479)
chr1 (147-258)||(5575110-5575221)
chr1 (134-261)||(37555733-37555861)
chr1 (119-262)||(37850611-37850756)
chr1 (147-256)||(14318875-14318984)
chr1 (119-201)||(32168709-32168793)
chr1 (150-262)||(44685458-44685570)
chr1 (147-263)||(11977281-11977397)
chr1 (210-262)||(47379889-47379941)
chr1 (189-262)||(45084384-45084457)
chr1 (147-254)||(5528795-5528902)
chr1 (119-262)||(5996883-5997027)
chr1 (71-193)||(47380129-47380254)
chr1 (150-235)||(4956220-4956305)
chr1 (147-220)||(44043813-44043886)
chr1 (119-263)||(45839628-45839778)
chr1 (198-262)||(50556453-50556517)
chr1 (187-262)||(21378122-21378197)
chr1 (147-262)||(45494015-45494135)
chr1 (188-249)||(44091909-44091970)
chr1 (205-262)||(50469180-50469237)
chr1 (198-258)||(4878809-4878869)
chr1 (190-230)||(30576667-30576707)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (129-262)||(39336252-39336385)
chr3 (131-262)||(47964541-47964674)
chr3 (125-263)||(43346808-43346948)
chr3 (54-262)||(15772856-15773066)
chr3 (132-261)||(25317161-25317292)
chr3 (147-262)||(12114603-12114718)
chr3 (119-262)||(21832356-21832499)
chr3 (119-263)||(37990650-37990796)
chr3 (147-263)||(35946523-35946639)
chr3 (147-262)||(22304571-22304686)
chr3 (147-262)||(29644622-29644737)
chr3 (147-262)||(29644943-29645058)
chr3 (119-263)||(37990988-37991134)
chr3 (119-258)||(33803263-33803404)
chr3 (125-262)||(42342405-42342544)
chr3 (147-263)||(52634677-52634792)
chr3 (147-262)||(47964956-47965071)
chr3 (119-245)||(41359776-41359904)
chr3 (156-261)||(46546375-46546480)
chr3 (90-263)||(25755395-25755570)
chr3 (119-263)||(32462911-32463058)
chr3 (156-263)||(33175711-33175821)
chr3 (147-263)||(49336728-49336844)
chr3 (147-262)||(25739466-25739581)
chr3 (148-262)||(39389072-39389186)
chr3 (119-210)||(42342101-42342194)
chr3 (119-262)||(54018209-54018354)
chr3 (158-262)||(1634366-1634471)
chr3 (134-262)||(32589706-32589835)
chr3 (119-255)||(39934966-39935104)
chr3 (147-262)||(54017857-54017972)
chr3 (129-224)||(39335991-39336088)
chr3 (157-262)||(3384317-3384422)
chr3 (198-259)||(36986040-36986101)
chr3 (198-259)||(37011479-37011540)
chr3 (147-263)||(45901714-45901831)
chr3 (150-262)||(4823657-4823769)
chr3 (142-262)||(15773194-15773314)
chr3 (147-262)||(8327906-8328021)
chr3 (147-262)||(39914254-39914369)
chr3 (147-257)||(3135114-3135224)
chr3 (119-262)||(45395664-45395809)
chr3 (119-263)||(22303966-22304105)
chr3 (165-258)||(54451235-54451328)
chr3 (181-261)||(7767389-7767469)
chr3 (147-262)||(53118016-53118130)
chr3 (147-262)||(31190019-31190126)
chr3 (119-261)||(11661954-11662098)
chr3 (147-262)||(9240151-9240266)
chr3 (155-226)||(12749207-12749278)
chr3 (155-206)||(22303708-22303759)
chr3 (155-210)||(52634994-52635049)
chr3 (147-262)||(53577366-53577481)
chr3 (224-262)||(12747870-12747908)
chr3 (148-254)||(42584864-42584970)
chr3 (188-262)||(50612534-50612608)
chr3 (180-262)||(51886563-51886645)
chr3 (219-262)||(2299978-2300021)
chr3 (109-176)||(7766784-7766851)
chr3 (148-194)||(54017590-54017636)
chr3 (200-258)||(54769708-54769766)
chr3 (142-210)||(33362331-33362397)
chr3 (157-209)||(16871010-16871062)
chr3 (148-176)||(41359533-41359561)
[»] chr4 (70 HSPs)
chr4 (119-262)||(36629239-36629384)
chr4 (147-262)||(28034231-28034346)
chr4 (119-263)||(39792869-39793015)
chr4 (130-259)||(760194-760324)
chr4 (119-263)||(39404019-39404165)
chr4 (119-262)||(25483338-25483483)
chr4 (124-250)||(15841382-15841510)
chr4 (125-262)||(4955332-4955471)
chr4 (147-263)||(34646688-34646804)
chr4 (151-262)||(2741073-2741184)
chr4 (147-262)||(3244490-3244605)
chr4 (15-261)||(34544107-34544349)
chr4 (147-262)||(50630794-50630909)
chr4 (119-262)||(3340809-3340954)
chr4 (147-262)||(2740702-2740817)
chr4 (147-262)||(16888855-16888970)
chr4 (147-262)||(22183303-22183418)
chr4 (119-263)||(39404399-39404545)
chr4 (155-262)||(44620662-44620768)
chr4 (147-262)||(50002428-50002543)
chr4 (147-262)||(55933163-55933278)
chr4 (119-262)||(32941132-32941277)
chr4 (119-262)||(54017604-54017749)
chr4 (109-262)||(52884697-52884853)
chr4 (125-258)||(1731662-1731797)
chr4 (72-228)||(11783515-11783671)
chr4 (129-262)||(23556885-23557020)
chr4 (147-262)||(52884889-52885005)
chr4 (147-262)||(49880162-49880277)
chr4 (119-262)||(41370359-41370504)
chr4 (155-261)||(49302907-49303015)
chr4 (150-210)||(31691206-31691266)
chr4 (147-263)||(41707504-41707619)
chr4 (147-262)||(22028000-22028115)
chr4 (137-249)||(45496820-45496934)
chr4 (147-263)||(54936201-54936313)
chr4 (119-262)||(10245922-10246066)
chr4 (157-263)||(15841034-15841139)
chr4 (147-249)||(54108928-54109029)
chr4 (157-262)||(54741227-54741332)
chr4 (147-263)||(36572020-36572136)
chr4 (179-258)||(11348399-11348478)
chr4 (147-262)||(34004624-34004737)
chr4 (147-262)||(36608700-36608815)
chr4 (156-262)||(3341130-3341236)
chr4 (119-210)||(23817690-23817783)
chr4 (119-261)||(50459724-50459868)
chr4 (125-222)||(22028384-22028483)
chr4 (187-231)||(41603270-41603314)
chr4 (134-255)||(44620362-44620485)
chr4 (155-255)||(44621011-44621111)
chr4 (119-254)||(54343017-54343147)
chr4 (147-262)||(4390140-4390255)
chr4 (147-262)||(16889575-16889690)
chr4 (147-263)||(43174507-43174624)
chr4 (155-263)||(20825837-20825945)
chr4 (147-258)||(6975495-6975606)
chr4 (147-210)||(18932788-18932851)
chr4 (147-258)||(20826223-20826334)
chr4 (125-262)||(54108540-54108678)
chr4 (168-229)||(29802576-29802637)
chr4 (181-262)||(49076521-49076602)
chr4 (148-192)||(11706584-11706628)
chr4 (120-201)||(19504759-19504842)
chr4 (187-262)||(7147721-7147795)
chr4 (156-251)||(54017750-54017845)
chr4 (156-210)||(3271841-3271895)
chr4 (147-197)||(11197293-11197343)
chr4 (204-262)||(12197380-12197438)
chr4 (187-235)||(31249937-31249985)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (134-262)||(36568595-36568723)
chr5 (179-262)||(31509625-31509708)
chr5 (119-262)||(18603131-18603276)
chr5 (131-262)||(36521919-36522052)
chr5 (147-263)||(1028558-1028674)
chr5 (148-262)||(299491-299605)
chr5 (119-262)||(40296326-40296471)
chr5 (125-262)||(13415777-13415916)
chr5 (147-263)||(26074613-26074729)
chr5 (147-250)||(31509745-31509849)
chr5 (147-258)||(9498695-9498806)
chr5 (119-263)||(34753036-34753182)
chr5 (119-262)||(32487396-32487540)
chr5 (119-262)||(36492228-36492373)
chr5 (147-261)||(36522278-36522392)
chr5 (155-263)||(6224197-6224305)
chr5 (125-258)||(41170640-41170775)
chr5 (147-262)||(26074187-26074302)
chr5 (147-262)||(41632784-41632899)
chr5 (13-261)||(3622795-3623035)
chr5 (119-262)||(6500453-6500597)
chr5 (147-263)||(26075202-26075319)
chr5 (119-263)||(42405609-42405753)
chr5 (147-262)||(6500825-6500939)
chr5 (147-261)||(25327938-25328052)
chr5 (129-263)||(26074802-26074939)
chr5 (147-262)||(624198-624313)
chr5 (147-262)||(3295056-3295170)
chr5 (147-262)||(15370101-15370216)
chr5 (148-262)||(24489248-24489360)
chr5 (134-262)||(27502062-27502192)
chr5 (147-262)||(35150009-35150123)
chr5 (119-261)||(3295356-3295498)
chr5 (156-257)||(11417027-11417128)
chr5 (147-252)||(33747783-33747888)
chr5 (147-259)||(38427553-38427664)
chr5 (147-262)||(623820-623935)
chr5 (155-262)||(12662701-12662808)
chr5 (187-262)||(26074320-26074395)
chr5 (147-262)||(26590951-26591066)
chr5 (147-262)||(29549296-29549411)
chr5 (147-220)||(15370446-15370519)
chr5 (187-261)||(9510601-9510675)
chr5 (222-263)||(36527199-36527240)
chr5 (157-261)||(2411010-2411114)
chr5 (110-235)||(19275558-19275683)
chr5 (191-233)||(6557471-6557513)
chr5 (147-233)||(32445916-32446002)
chr5 (169-263)||(42508613-42508707)
chr5 (147-197)||(13042606-13042656)
chr5 (71-207)||(36527054-36527196)
chr5 (157-222)||(6557098-6557163)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (150-264)||(558-672)
scaffold0702 (194-262)||(230-298)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (15-262)||(39459-39705)
scaffold0113 (199-262)||(39840-39903)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (147-262)||(5359-5474)
scaffold0078 (119-262)||(4984-5129)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (147-263)||(1147-1263)
scaffold0391 (147-210)||(1732-1795)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (179-262)||(5779-5862)
scaffold0734 (147-262)||(5398-5514)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (148-262)||(17496-17612)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (187-264)||(10192-10269)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (170-233)||(3109-3172)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (147-262)||(47362-47477)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 4154570 - 4154822
Alignment:
Q  10 attattctttgtcaagaagactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgag 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4154570 attattctttgtcaagaagactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaactcggctttgataccactgttgggtcatgaagggagtccgag 4154669  T
Q  110 ggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttata 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4154670 ggaccactcacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttata 4154769  T
Q  210 aagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4154770 aagtgttcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 4154822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 258
Target Start/End: Original strand, 4154282 - 4154432
Alignment:
Q  109 gggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaa--gcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactt 206  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||  ||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4154282 gggaccacccacatctaggccagagcaaccaaacaattgagagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgggtc-tctcactt 4154380  T
Q  207 ataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 258  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4154381 ataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtaggacatataactcaca 4154432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Original strand, 9620596 - 9620832
Alignment:
Q  26 aagactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatcta 125  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |  || ||||||||| ||| ||||| || ||||| ||| ||||||    ||||| |    
T  9620596 aagactttcgacacaaggatccgatagaacccttcgtcgaaccacaactctgataccatcgttgggtcacgaggggagcccgggggaccgtccacatcca 9620695  T
Q  126 ggccagagcaaccacacaagcgagagacgc--cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctc 223  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  |  || |||||||   |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9620696 ggcctgagcaaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgatcaacttc 9620793  T
Q  224 cacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
     ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  9620794 tacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttg 9620832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Original strand, 3038301 - 3038447
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  3038301 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaagtgtt 3038400  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3038401 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgt 3038447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3669834 - 3669689
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |    
T  3669834 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgtt 3669735  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3669734 caacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 3669689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Original strand, 25561826 - 25561973
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttaccc-aaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgc 215  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  25561826 acatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 25561925  T
Q  216 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    ||||| |  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25561926 tcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgt 25561973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34835357 - 34835210
Alignment:
Q  118 tacatctaggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgc 215  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  34835357 tacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 34835258  T
Q  216 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  34835257 tcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttgt 34835210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 40518723 - 40518584
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  40518723 aggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacct 40518624  T
Q  223 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40518623 ttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 40518584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41972293 - 41972160
Alignment:
Q  134 caaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaa---aaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactt 228  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||    
T  41972293 caaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcacttataaggtgttcaacctttactt 41972194  T
Q  229 ttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41972193 ttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 41972160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34835023 - 34834877
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| |    
T  34835023 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 34834924  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
     |||||  ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34834923 taacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgt 34834877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Original strand, 45121952 - 45122066
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || |||  |||||||||||    
T  45121952 agagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggaca 45122051  T
Q  248 tataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||||    
T  45122052 tataactcacacttg 45122066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9608862 - 9608747
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  9608862 gagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggac 9608763  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  9608762 atataactcacacttg 9608747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 147568 - 147454
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  147568 gagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 147469  T
Q  247 atataactcacactt 261  Q
    |||||||||||||||    
T  147468 atataactcacactt 147454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 262
Target Start/End: Original strand, 8918808 - 8918920
Alignment:
Q  150 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| | ||||| ||||||||||||     
T  8918808 agacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatg 8918907  T
Q  250 taactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||    
T  8918908 taactcacacttg 8918920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9309472 - 9309357
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||||||    
T  9309472 gagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggac 9309373  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  9309372 atataactcacacttg 9309357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 45122098 - 45122213
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||| |||    
T  45122098 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagac 45122197  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  45122198 atataactcacacttg 45122213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3670207 - 3670062
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||||||  |||||||| ||| |    
T  3670207 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgggtcctcatacttataaggtgtt 3670108  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
     |||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3670107 aaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3670062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 40518218 - 40518071
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  | |||||||| ||| |    
T  40518218 acatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttacttataaggtgtt 40518119  T
Q  217 caacctccac--ttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||  |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  40518118 caacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttg 40518071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 254
Target Start/End: Original strand, 18372011 - 18372142
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  18372011 aggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacct 18372110  T
Q  223 ccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
      ||| || |||  ||||||| ||||||||||    
T  18372111 ttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30359388 - 30359272
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| |||||| |||    
T  30359388 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgcttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagac 30359289  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  30359288 atataactcacacttgt 30359272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Original strand, 33113408 - 33113524
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||  ||| || |||| ||||| ||||    
T  33113408 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagacgttcaacctttactattttatccgatgtaggac 33113507  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||| ||||||    
T  33113508 atataactcaaacttgt 33113524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40991852 - 40991756
Alignment:
Q  165 acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 261  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| | ||||||||||||    
T  40991852 acccaaaaccttgaggcattgggtttatgggtcctctcacttatgaagtgttcaacctccacttttctaagcaatgtgggacttctaactcacactt 40991756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 45122756 - 45122666
Alignment:
Q  134 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  45122756 caaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 45122666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 1014256 - 1014401
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||  || || ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
T  1014256 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggtgtt 1014355  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1014356 caacctttactattttatctgatgtatgacatataactcacacttg 1014401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30441232 - 30441083
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactta----taaag 212  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||||    ||| |    
T  30441232 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataattaagg 30441133  T
Q  213 tgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    || |||||||  ||| || || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30441132 tgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttg 30441083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34835623 - 34835475
Alignment:
Q  118 tacatctaggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgc 215  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  34835623 tacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 34835524  T
Q  216 tcaacctccacttttctatc-agatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    | |||||  ||| || ||||  || |||||||||||||||||| |||||    
T  34835523 taaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgt 34835475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34835889 - 34835741
Alignment:
Q  118 tacatctaggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgc 215  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  34835889 tacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 34835790  T
Q  216 tcaacctccacttttctatc-agatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    | |||||  ||| || ||||  || |||||||||||||||||| |||||    
T  34835789 taaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgt 34835741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5420783 - 5420653
Alignment:
Q  134 caaccacacaagcgag--agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    |||||||||||| |||  ||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  || |||||||  ||| |||    
T  5420783 caaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattc 5420684  T
Q  232 tatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  5420683 tatccgatgtgggacatataatacacacttg 5420653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 6876873 - 6877019
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||  | |||||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||| ||| | |||||| ||| |    
T  6876873 acatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttatttataaggtgtt 6876972  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggac-atataactcacacttg 262  Q
    ||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6876973 caacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttg 6877019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 257
Target Start/End: Original strand, 70300 - 70425
Alignment:
Q  134 caaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |  ||| ||     
T  70300 caaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacatttactcttt 70399  T
Q  232 tatcagatgtgggacatataactcac 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  70400 tatccgatgtgggacatataactcac 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5916014 - 5915930
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctct 201  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5916014 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctct 5915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30359726 - 30359610
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||  ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| |||||| |||    
T  30359726 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagac 30359627  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  30359626 atataactcacacttgt 30359610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 222
Target Start/End: Original strand, 9483229 - 9483303
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  9483229 agagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 9483303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 262
Target Start/End: Original strand, 20870599 - 20870731
Alignment:
Q  134 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| |||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  ||| ||     
T  20870599 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattt 20870698  T
Q  232 tatcagatgtgggac--atataactcacacttg 262  Q
    |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  20870699 tatctgatgtggaacatatataactcacacttg 20870731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 264
Target Start/End: Original strand, 37544534 - 37544648
Alignment:
Q  150 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   | ||||  ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||| ||| ||    
T  37544534 agacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttcttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgactta 37544633  T
Q  250 taactcacacttgtg 264  Q
    |||||||||||||||    
T  37544634 taactcacacttgtg 37544648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 257
Target Start/End: Original strand, 9482615 - 9482755
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||  |||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  9482615 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 9482714  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcac 257  Q
    ||||||  ||| || ||||  |||||| |||||||||||||    
T  9482715 caacctttactcttttatcccatgtggaacatataactcac 9482755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 263
Target Start/End: Original strand, 1513964 - 1514072
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||||    
T  1513964 ccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataact 1514063  T
Q  255 cacacttgt 263  Q
    || ||||||    
T  1514064 catacttgt 1514072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5274912 - 5274777
Alignment:
Q  129 cagagcaaccacacaagcga--gagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccac 226  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||||  |    
T  5274912 cagagcaacaacacaagcgatagagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctcc 5274813  T
Q  227 ttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||| |||   |||| | |||||||||||| |||||    
T  5274812 ttttttattcaatgtagaacatataactcatacttg 5274777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 185
Target Start/End: Original strand, 20995393 - 20995495
Alignment:
Q  85 tgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaa--gcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggca 182  Q
    |||| ||||| || ||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  20995393 tgttgggtcacgaggggagccagagggaccacccatatctaggccagagcaaccacacaagtgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggca 20995492  T
Q  183 atg 185  Q
    |||    
T  20995493 atg 20995495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 262
Target Start/End: Original strand, 20995502 - 20995557
Alignment:
Q  207 ataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20995502 ataaagtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 20995557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9309084 - 9308979
Alignment:
Q  159 actcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtg--ggacatataactca 256  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |  ||| || |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  9309084 actcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactca 9308985  T
Q  257 cacttg 262  Q
    ||||||    
T  9308984 cacttg 9308979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9507898 - 9507836
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  9507898 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataa 9507836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9609202 - 9609108
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||  || |||||||  ||||||||||| |||||    
T  9609202 gagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttacttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 260
Target Start/End: Original strand, 18372988 - 18373085
Alignment:
Q  160 ctcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacac 259  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||  ||| || |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  18372988 ctcttacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacac 18373084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 222
Target Start/End: Original strand, 40579548 - 40579622
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  40579548 agagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 40579622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 242
Target Start/End: Original strand, 34219208 - 34219269
Alignment:
Q  181 caatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtg 242  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  34219208 caataagtttatggatcctctctcttataaagtgttcaacctccacttttctaaccgatgtg 34219269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 201
Target Start/End: Original strand, 32640508 - 32640627
Alignment:
Q  85 tgtttggtcatgaagggag-tccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggc 181  Q
    ||||||||||||| ||||| || |  ||||| || ||||| |||| ||| ||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  32640508 tgtttggtcatgaggggagctctggcggaccgctcacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggc 32640607  T
Q  182 aatgagtttatgggtcctct 201  Q
    |||| |||||| ||||||||    
T  32640608 aatgggtttatcggtcctct 32640627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6732012 - 6731906
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||         |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  6732012 gagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttactt---------tcaacctttactattttatccgatgtgggac 6731922  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  6731921 atataactcacacttg 6731906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 262
Target Start/End: Original strand, 1013921 - 1014027
Alignment:
Q  156 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 255  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||| |||||||||||    
T  1013921 cacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggtgttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactc 1014020  T
Q  256 acacttg 262  Q
    |||||||    
T  1014021 acacttg 1014027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6651611 - 6651557
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctct 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||    
T  6651611 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctct 6651557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 257
Target Start/End: Original strand, 41416252 - 41416322
Alignment:
Q  187 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcac 257  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  41416252 gtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 41416322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 261
Target Start/End: Original strand, 43274828 - 43274934
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    |||||||||||| |||||||||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||  ||| || |||| ||||||  ||||||||||    
T  43274828 ccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatataact 43274927  T
Q  255 cacactt 261  Q
    |||||||    
T  43274928 cacactt 43274934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 147868 - 147831
Alignment:
Q  225 acttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147868 acttttttatcagatgtgggacatataactcacacttg 147831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2467656 - 2467507
Alignment:
Q  110 ggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaa--gcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactta 207  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||  | |||||||| |||||| ||||| ||||| ||  | ||| ||||||||| |  |||||||  |    
T  2467656 ggaccacatacatctaggctaaagcaaccatacaagtgagagagacgtcacacttttaccaaaaactttaagacaacgagtttatgtgctctctcac--a 2467559  T
Q  208 taaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacac 259  Q
    || |||| ||||| || | ||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  2467558 tatagtgttcaacttctaattttctatccgacgtgagacatataactcacac 2467507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 263
Target Start/End: Original strand, 18372656 - 18372759
Alignment:
Q  156 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 255  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| || |||| ||  ||| |||||||| ||    
T  18372656 cacactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttat-aagtgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatc 18372751  T
Q  256 acacttgt 263  Q
    ||||||||    
T  18372752 acacttgt 18372759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 261
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372854
Alignment:
Q  192 tgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 261  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 18372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 260
Target Start/End: Original strand, 43398114 - 43398225
Alignment:
Q  152 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatggg---tcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacat 248  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||   |||||| | |||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||| || || ||    
T  43398114 acgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatat 43398213  T
Q  249 ataactcacact 260  Q
    ||||||||||||    
T  43398214 ataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 18380051 - 18380171
Alignment:
Q  140 cacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagat 239  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||  || | || |||||| || || || |||||||| ||| |||||||  ||| || |||  |||    
T  18380051 cacaagcaagaggcaccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgat 18380150  T
Q  240 gtgggacatataactcacact 260  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  18380151 gtgggatatataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 242
Target Start/End: Original strand, 15836411 - 15836528
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctca 218  Q
    |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| || |||| ||| | |||| |||  |||||||||| |||||    |||||||  ||||||| |||    
T  15836411 acatctaggccatatcaacaacataagcgagagacaccgcacttttatctaaaatcttaaggcaatgagtctatgg----tctcact--taaagtgttca 15836504  T
Q  219 acctccacttttctatcagatgtg 242  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||    
T  15836505 acctccactttactatcggatgtg 15836528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33832055 - 33831980
Alignment:
Q  187 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| |   | ||| |||||||||||||||||||    
T  33832055 gtttataggtcctcttacttataaagtgttcaacttctacttttctcttcaacgtgagacatataactcacacttg 33831980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 263
Target Start/End: Original strand, 45121706 - 45121812
Alignment:
Q  156 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||  |  |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||| | |||||    
T  45121706 cacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataaggtgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactc 45121804  T
Q  256 acacttgt 263  Q
    ||||||||    
T  45121805 acacttgt 45121812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4715358 - 4715308
Alignment:
Q  182 aatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttct 232  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4715358 aatgagtttatagatcgtctcatttataaagtgttcaacctccacttttct 4715308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11442952 - 11442894
Alignment:
Q  165 acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctc 223  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  11442952 acccaaaaccttaaggcattgagtttatgggtcctctcacttgtatgttgctcaacctc 11442894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 147937 - 147888
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  147937 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggt 147888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 261
Target Start/End: Original strand, 18372342 - 18372411
Alignment:
Q  192 tgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 261  Q
    |||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18372342 tgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 18372411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 262
Target Start/End: Original strand, 9620384 - 9620444
Alignment:
Q  202 cacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||   | |||||| |||||||| |||||||    
T  9620384 cacttataaagtgttcaaactccacttttctattcaacgtgggatatataactgacacttg 9620444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32305591 - 32305519
Alignment:
Q  150 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  || |||| |||||| |||| ||| |||||||| ||| |||||||    
T  32305591 agacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttacttataaggtgttcaacct 32305519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 262
Target Start/End: Original strand, 44358150 - 44358226
Alignment:
Q  186 agtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | ||||||| |||| |||||| ||||| | ||| |||||||    
T  44358150 agtttatgagtcatctcacttataaaatggtcaacattcacttttttatctgatgtgagacatgttactgacacttg 44358226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30323610 - 30323466
Alignment:
Q  118 tacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctc 217  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  30323610 tacatccagaccagagcaacaacacaaatgagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttc 30323511  T
Q  218 aacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30323510 aacctccaattttctatctgatttgggacatataacacacacttg 30323466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 125 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30313318 - 30313180
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30313318 aggccagagcaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcacttat-aagtgttcaacct 30313220  T
Q  223 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30313219 ccacttttctatccgatgtgagacatataacacacgcttg 30313180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Original strand, 29874034 - 29874180
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |    
T  29874034 acatccaggccaaagcaaccgcacaagtgggatagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaattataaagtgtt 29874133  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29874134 caacctccacttttctatctgatgtgggacatataacacacacttgt 29874180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 262
Target Start/End: Original strand, 33561501 - 33561607
Alignment:
Q  156 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 255  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33561501 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaacatataactc 33561600  T
Q  256 acacttg 262  Q
    |||||||    
T  33561601 acacttg 33561607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 118 - 262
Target Start/End: Original strand, 29873547 - 29873693
Alignment:
Q  118 tacatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgc 215  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||     
T  29873547 tacatccagaccagagcaaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcccacttataaaatgt 29873646  T
Q  216 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||    
T  29873647 tcaacctccacttttctatctgatgtgggacatgtaacacacccttg 29873693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 962745 - 962600
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  962745 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgtt 962646  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  962645 caacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 962600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 260
Target Start/End: Original strand, 28254265 - 28254391
Alignment:
Q  134 caaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 233  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  |||||||||    
T  28254265 caaccccacaagagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttacttttcta 28254364  T
Q  234 tcagatgtgggacatataactcacact 260  Q
    || |||||||||||||||| |||||||    
T  28254365 tccgatgtgggacatataagtcacact 28254391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 262
Target Start/End: Original strand, 36178622 - 36178761
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  36178622 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 36178721  T
Q  223 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
      ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36178722 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 36178761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 41283486 - 41283631
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  41283486 acatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 41283585  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41283586 caacctttactattttatccgatatgggacatataactcacacttg 41283631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15880380 - 15880264
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||| ||    
T  15880380 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaac 15880281  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  15880280 atataactcacacttgt 15880264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 14745708 - 14745823
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||  |||||||||    
T  14745708 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggac 14745807  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  14745808 atataactcacacttg 14745823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Original strand, 36005891 - 36006036
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  36005891 acatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 36005990  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    |||| |  || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  36005991 caacttttac-tttctattcgatgtgggacatataactcacacttgt 36006036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 42514766 - 42514651
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  42514766 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggac 42514667  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  42514666 atataactcacacttg 42514651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6421502 - 6421385
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  6421502 gagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 6421403  T
Q  247 atataactcacacttgtg 264  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6421402 atataactcacacttgtg 6421385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 28531363 - 28531470
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28531363 ccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttacttataaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataact 28531462  T
Q  255 cacacttg 262  Q
    ||||||||    
T  28531463 cacacttg 28531470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 258
Target Start/End: Original strand, 33953816 - 33953923
Alignment:
Q  151 gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatat 250  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||  |||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33953816 gacgtcacactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttat 33953915  T
Q  251 aactcaca 258  Q
    ||||||||    
T  33953916 aactcaca 33953923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 262
Target Start/End: Original strand, 35580670 - 35580879
Alignment:
Q  54 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagag 151  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||||| || ||||||   ||||||| | ||||||    ||||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||    
T  35580670 acccttcgtcgaaccggggctctgataccattattgggtcattgggggagtcagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagag 35580769  T
Q  152 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |  | | || |||| |||||||||||||||    
T  35580770 acgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-ggtcctctcacttataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatata 35580868  T
Q  252 actcacacttg 262  Q
    |||||||||||    
T  35580869 actcacacttg 35580879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37106041 - 37105926
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||  ||| || |||  ||||||||||    
T  37106041 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggac 37105942  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  37105941 atataactcacacttg 37105926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37106297 - 37106190
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  37106297 ccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 37106198  T
Q  255 cacacttg 262  Q
    ||||||||    
T  37106197 cacacttg 37106190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 258
Target Start/End: Original strand, 40679670 - 40679781
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||   ||||||||||| ||| ||||||    
T  40679670 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggac 40679769  T
Q  247 atataactcaca 258  Q
    ||||||||||||    
T  40679770 atataactcaca 40679781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Original strand, 5543040 - 5543154
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||||||    
T  5543040 agagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggaca 5543139  T
Q  248 tataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||||    
T  5543140 tataactcacacttg 5543154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 262
Target Start/End: Original strand, 38796644 - 38796776
Alignment:
Q  134 caaccacacaagcga--gagacgccaca--ctcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttt 229  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  | | |    
T  38796644 caaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattgt 38796743  T
Q  230 tctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796744 tttatcagatgtgggacatataactcacacttg 38796776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 41678409 - 41678525
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  41678409 gagagacgttacactcttactcaaaaccttaaggcaaag-gtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagac 41678507  T
Q  247 --atataactcacacttg 262  Q
      ||||||||||||||||    
T  41678508 atatataactcacacttg 41678525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6422257 - 6422126
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |    
T  6422257 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaattataatgtgtt 6422158  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacat 248  Q
    ||||||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  6422157 caacctttacttttttatctgatgtgggacat 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30313028 - 30312792
Alignment:
Q  28 gactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaact-cggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctag 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||||  |  || |||||||| |||| ||||| || |||||  || ||||||||  ||||  ||    
T  30313028 gactttcgacacaaggagccggtcgaactcttcc-cgaaaccacaactctgataccactgttgggtcacgaggggagctcgggggaccacccacattcag 30312930  T
Q  127 gccagagcaaccacacaa---gcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctc 223  Q
    |||||||||||| |||||   | |||||||  |||||| ||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  30312929 gccagagcaaccgcacaaattgagagagactacacacttttacccaaaaccttaaggaaataagtttatgggtcatctaagttataaagtgttcaacctc 30312830  T
Q  224 cac-ttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 261  Q
    ||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||    
T  30312829 cactttttctat-tgatgtggggcatataacacacactt 30312792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 5542666 - 5542781
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||  ||| ||||||    
T  5542666 gagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggac 5542765  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  5542766 atataactcacacttg 5542781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7598440 - 7598230
Alignment:
Q  54 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga- 152  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| || |||||  |  ||||||  | ||||| ||||  || ||||| |||||| ||||||     
T  7598440 acccttcgtcgaacctgggctttgataccagtgttgggtcacgaggggagatcaggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagag 7598341  T
Q  153 -cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 251  Q
     | ||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||| | |||||  ||||||||||  ||||| | |||||||    
T  7598340 acaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacatata 7598241  T
Q  252 actcacacttg 262  Q
    | |||||||||    
T  7598240 attcacacttg 7598230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 257
Target Start/End: Original strand, 15511521 - 15511646
Alignment:
Q  134 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||     
T  15511521 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataacgtgttcaacctttactcttt 15511620  T
Q  232 tatcagatgtgggacatataactcac 257  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||    
T  15511621 tatccgttgtgtgacatataactcac 15511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31385853 - 31385739
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 247  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||  |||     
T  31385853 agagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacctccatttttctaaccgatgtcagact 31385754  T
Q  248 tataactcacacttg 262  Q
    | |||||||||||||    
T  31385753 tctaactcacacttg 31385739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40733647 - 40733518
Alignment:
Q  136 accacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 233  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||  ||   |  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  |||||| ||    
T  40733647 accacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactttttta 40733548  T
Q  234 tcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  40733547 tctgatgtgggacatataactcacacttgt 40733518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33731797 - 33731653
Alignment:
Q  117 ttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtg 214  Q
    ||||||| |||| ||| ||||| || ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  33731797 ttacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtg 33731698  T
Q  215 ctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacac 259  Q
    ||||||||  ||| || |||| |||||| || |||||||||||||    
T  33731697 ctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 258
Target Start/End: Original strand, 14745335 - 14745446
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||  || ||||||   ||| || |||  ||||||||||    
T  14745335 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaagatgttcaaccattactattttattcgatgtgggac 14745434  T
Q  247 atataactcaca 258  Q
    ||||||||||||    
T  14745435 atataactcaca 14745446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7598684 - 7598611
Alignment:
Q  189 ttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7598684 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 7598611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 262
Target Start/End: Original strand, 31468800 - 31468902
Alignment:
Q  156 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 255  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    |||||||  |  |||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  31468800 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcct----cttataagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 31468895  T
Q  256 acacttg 262  Q
    |||||||    
T  31468896 acacttg 31468902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2336723 - 2336655
Alignment:
Q  165 acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 233  Q
    |||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2336723 acccaaaatcttaaggcattgaatttatgggtcctctcacttataaagtgttcaacctccacttttcta 2336655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16542566 - 16542451
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  16542566 gagagatgctacactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 16542467  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
     |||||||||||||||    
T  16542466 ttataactcacacttg 16542451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 33561745 - 33561894
Alignment:
Q  18 ttgtcaagaagactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccact 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| | |||  |  |||  |||||||||| ||    
T  33561745 ttgtcaagaagactttcgaaacaaggagtcggttgtaccctttgtcg-aaccaggctctgataccattgttggttcacaagaggaacccgagggaccgct 33561843  T
Q  118 tacatctaggccagagcaaccacacaa--gcgagagacgccacactcttac 166  Q
     | |||||| |||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  33561844 catatctagtccagagcaaccatacaagtgagagagacaccacactcttac 33561894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 261
Target Start/End: Original strand, 31899499 - 31899581
Alignment:
Q  179 ggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  31899499 ggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 31899581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 261
Target Start/End: Original strand, 3594228 - 3594333
Alignment:
Q  156 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 255  Q
    ||||||||||| ||||| |||   |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  | ||||  ||||| |||||    
T  3594228 cacactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctatcacttataaagtgttcgacctccacttttctattcgttgtgaaacatacaactc 3594327  T
Q  256 acactt 261  Q
    ||||||    
T  3594328 acactt 3594333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6421878 - 6421794
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctct 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  6421878 acatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctct 6421794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6713094 - 6712977
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaa-ccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtggga 245  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||   |||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| |||||| ||    
T  6713094 gagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgaga 6712995  T
Q  246 catataactcacacttgt 263  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6712994 catataactcacacttgt 6712977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 262
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178425
Alignment:
Q  157 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactca 256  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||| || |||||||| ||| || ||||  ||| || |||| || |||||||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  257 cacttg 262  Q
    ||||||    
T  36178420 cacttg 36178425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23346431 - 23346250
Alignment:
Q  71 ggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttaccc 168  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||  || | ||||    |||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||     
T  23346431 ggctctgataccattgttgggtcatgaggggagctcgggcgaccgtccacatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccg 23346332  T
Q  169 aaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 251  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||| | |||||  ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  23346331 aaaaccttaaggctatgggtttatgggccctctta-ttataaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 33954303 - 33954417
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||  || |||||| ||| | | | ||||| | || | |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33954303 gagagacgccacactcttacccaaaatcgtaaggcataga-tttatgagtcatttaagttatataatgtttaacctcaacttttctatctgatgtgggac 33954401  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  33954402 atataactcacacttg 33954417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 246
Target Start/End: Original strand, 36178197 - 36178311
Alignment:
Q  134 caaccacacaagcgagagacgc--cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| | || |||||||| ||| |||||||  ||| ||     
T  36178197 caaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggttcccttacttataaggtgttcaacctttactattt 36178296  T
Q  232 tatcagatgtgggac 246  Q
    |||| ||||||||||    
T  36178297 tatccgatgtgggac 36178311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 37632646 - 37632753
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||  ||| || |||| ||||| ||||||||||||    
T  37632646 ccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctcttacttataaaatgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataact 37632745  T
Q  255 cacacttg 262  Q
    ||||||||    
T  37632746 cacacttg 37632753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 253
Target Start/End: Original strand, 40163398 - 40163520
Alignment:
Q  134 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttgggg-caatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactttt 230  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||   | || |  ||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  40163398 caaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactttt 40163497  T
Q  231 ctatcagatgtgggacatataac 253  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  40163498 ctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29676646 - 29676543
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||  ||| || ||||  ||||| |||    
T  29676646 gagagacaccacactcttacccaaaa------ggcaatgagtttatgggttctctcacttataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagac 29676553  T
Q  247 atataactca 256  Q
    ||||||||||    
T  29676552 atataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 35580479 - 35580540
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactct--tacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactt 206  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  35580479 gagagacgccacactctcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcacactt 35580540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 248
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  159 actcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacat 248  Q
    |||||||||| |||| ||  ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 256
Target Start/End: Original strand, 37895110 - 37895211
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| || || | |||| ||| ||  ||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37895110 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatataact 37895209  T
Q  255 ca 256  Q
    ||    
T  37895210 ca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5367572 - 5367456
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||| |||| || ||| |||||||| ||| |||||||   || || |||| ||| ||||||    
T  5367572 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaacctttgctcttttatccgatctgggac 5367473  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||  ||||||||||    
T  5367472 atatatatcacacttgt 5367456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12910335 - 12910231
Alignment:
Q  157 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactca 256  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||  ||| | |||||||||| | | |||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  12910335 acactcttacccaaaaccttaagacaatgaatttataagtcatttcacttataaggggttcaacctgtacttttccatccgatgtggaacatataactca 12910236  T
Q  257 cactt 261  Q
     ||||    
T  12910235 aactt 12910231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1769973 - 1769894
Alignment:
Q  183 atgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  1769973 atgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttg 1769894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 262
Target Start/End: Original strand, 38796299 - 38796374
Alignment:
Q  187 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38796299 gtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 38796374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6421773 - 6421689
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctct 201  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||  |||||||||||||||    
T  6421773 acatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctct 6421689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 262
Target Start/End: Original strand, 18204459 - 18204540
Alignment:
Q  181 caatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||| |||||||| | ||  |||||| | |||||||||||||    
T  18204459 caatgagtttatgggtcctttcatttattaaatgctcaatctccgcttttctaaccgacttgggacttctaactcacacttg 18204540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29677025 - 29676908
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtc-----ctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgt 241  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| ||||  ||||||| |||||||||||     ||||||| ||||| ||| | |||||  ||| || |||| |||||    
T  29677025 gagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctctcacctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgt 29676926  T
Q  242 gggacatataactcacac 259  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29676925 gggacatataactcacac 29676908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 262
Target Start/End: Original strand, 12529101 - 12529184
Alignment:
Q  179 ggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||| ||  ||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12529101 ggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgttcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttg 12529184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2323693 - 2323647
Alignment:
Q  187 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  2323693 gtttatggatcctctcacttataaagtgtccaacctccatttttcta 2323647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34481372 - 34481267
Alignment:
Q  158 cactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcac 257  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| | ||||| | | || ||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||     
T  34481372 cactcttacccaaaaccttaaagcaataaatttatagattctatcatttataaaatattcaacctccacttttatatccgacgtgagaaatataactcat 34481273  T
Q  258 acttgt 263  Q
    ||||||    
T  34481272 acttgt 34481267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3673185 - 3673121
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaa 211  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3673185 gagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttataaa 3673121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 262
Target Start/End: Original strand, 12092483 - 12092638
Alignment:
Q  109 gggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactt 206  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12092483 gggaccacccacatccaggccagagcaacctcacaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcactt 12092582  T
Q  207 ataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||    
T  12092583 ataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggacatctaacacacccttg 12092638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 129 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6071269 - 6071134
Alignment:
Q  129 cagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccac 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6071269 cagagcaaccatacaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccac 6071170  T
Q  227 ttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  6071169 ttttctattcaatgtgggacatataactcacacttg 6071134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3409406 - 3409261
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  3409406 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 3409307  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3409306 caacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 3409261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 10074404 - 10074519
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  10074404 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggac 10074503  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
     | |||||||||||||    
T  10074504 ctctaactcacacttg 10074519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 14748353 - 14748494
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctca 218  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||    
T  14748353 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagac--cacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttca 14748450  T
Q  219 acctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14748451 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 14748494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8482043 - 8481929
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  8482043 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgt-ggac 8481945  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  8481944 atataactcacacttg 8481929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29518715 - 29518505
Alignment:
Q  54 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagag 151  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||| ||||  ||||  || ||||||    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  |||||    
T  29518715 acccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggttatgagaggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagag 29518616  T
Q  152 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||||||||||    
T  29518615 acaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 29518516  T
Q  252 actcacacttg 262  Q
    |||||||||||    
T  29518515 actcacacttg 29518505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16107892 - 16107679
Alignment:
Q  54 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtca-tgaaggg-agtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gag 149  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||  | || |||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||  |||    
T  16107892 acccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggtcactgaaggggagttaggggtaccacccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagag 16107793  T
Q  150 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||  |||||| |||| ||||||  |||||    
T  16107792 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtttaacctttacttttttatccgatgtgacacata 16107693  T
Q  250 taactcacacttgt 263  Q
    ||||||||||||||    
T  16107692 taactcacacttgt 16107679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29519067 - 29518922
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  29519067 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 29518968  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29518967 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 29518922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32741326 - 32741181
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  32741326 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 32741227  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32741226 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 32741181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16454787 - 16454576
Alignment:
Q  54 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagag 151  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||| || |||||  || ||||||    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  |||||    
T  16454787 acccttcgtcgaacctgggctctgataccactgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagag 16454688  T
Q  152 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 251  Q
    |||||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  | | || |||| ||||||||||| |||    
T  16454687 acgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacata 16454588  T
Q  252 actcacacttgt 263  Q
    ||||||||||||    
T  16454587 actcacacttgt 16454576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2377868 - 2377754
Alignment:
Q  150 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || || | |||||||||||||    
T  2377868 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacata 2377769  T
Q  250 taactcacacttgtg 264  Q
    |||||||||||||||    
T  2377768 taactcacacttgtg 2377754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31714815 - 31714683
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga-cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctc 217  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  | ||    
T  31714815 acatcgaggctagagcaaccacacaagcgaaaaaacgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatgggtcctctca-ttatataacgttc 31714717  T
Q  218 aacctccacttttctatcagatgtgggacatata 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31714716 aacctccacttttctatccgatgtaggacatata 31714683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 263
Target Start/End: Original strand, 2578485 - 2578599
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || |||| | |||||||||    
T  2578485 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggaca 2578583  T
Q  248 tataactcacacttgt 263  Q
    ||||||||||||||||    
T  2578584 tataactcacacttgt 2578599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 10074032 - 10074147
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||     
T  10074032 gagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggat 10074131  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||| ||||    
T  10074132 atataactcacccttg 10074147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16455054 - 16454908
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||| |    
T  16455054 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctattacttataaggtgtt 16454955  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16454954 caacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcacatttgt 16454908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 2378273 - 2378128
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  2378273 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 2378174  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2378173 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 2378128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 2579883 - 2580028
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  2579883 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttatgggtcctcttacttataatgtgtt 2579982  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2579983 caacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 2580028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 35210351 - 35210206
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  35210351 acatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctcttacttataaggtgtt 35210252  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  35210251 caacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 35210206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3058343 - 3058228
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  3058343 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcatacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 3058244  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    |||||||| |||||||    
T  3058243 atataactaacacttg 3058228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 261
Target Start/End: Original strand, 6999837 - 6999951
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||| ||||| |  |||||| |||| ||||| ||||    
T  6999837 gagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatataaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggac 6999936  T
Q  247 atataactcacactt 261  Q
    |||||||||||||||    
T  6999937 atataactcacactt 6999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 12071702 - 12071847
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||  ||  ||||||| ||||| ||  |||||||||| |    
T  12071702 acatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtcataggtttatgagtcctttctattataaagtgtt 12071801  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  12071802 caaactccatttttctatctgatgcgagacatataactcacacttg 12071847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3415575 - 3415462
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||  ||| || |||  ||||||||||    
T  3415575 gagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggac 3415476  T
Q  247 atataactcacact 260  Q
    ||||||||||||||    
T  3415475 atataactcacact 3415462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 262
Target Start/End: Original strand, 12085046 - 12085189
Alignment:
Q  120 catctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctc 217  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||| ||||| ||  |||||||||| ||    
T  12085046 catcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggccatggttttatgagtcctttctattataaagtgttc 12085145  T
Q  218 aacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    || |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  12085146 aaactccac-tttctatctgatgcaggacatataactcacacttg 12085189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1127517 - 1127366
Alignment:
Q  109 gggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactt 206  Q
    ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  1127517 gggaccacccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttactt 1127418  T
Q  207 ataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 258  Q
    |||| ||| |||||||  ||| || || | ||||||||| ||||||||||||    
T  1127417 ataaggtgttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcaca 1127366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 10073657 - 10073770
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  |||||||  || ||||||||||    
T  10073657 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttc--tccgatgtgggac 10073754  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    |||||||| |||||||    
T  10073755 atataactaacacttg 10073770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26544166 - 26544051
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||  |||  || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  26544166 gagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 26544067  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  26544066 atataactcacacttg 26544051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 259
Target Start/End: Original strand, 32460630 - 32460733
Alignment:
Q  156 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 255  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||  |||||||||||||||||||    
T  32460630 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactc 32460729  T
Q  256 acac 259  Q
    ||||    
T  32460730 acac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Original strand, 2579518 - 2579645
Alignment:
Q  134 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||   | ||||  ||||||     
T  2579518 caaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggccctcttacttataaggtatccgacctttacttttt 2579617  T
Q  232 tatcagatgtgggacatataactcacac 259  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  2579618 tgtccgatgtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 262
Target Start/End: Original strand, 2578781 - 2578990
Alignment:
Q  54 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcga--gag 151  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||   |||||| ||||| | | ||||||    ||||| ||| |||| ||||||||||||| |  |||    
T  2578781 acccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgattcatgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagag 2578880  T
Q  152 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| | |||||| ||  ||||| |  |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  2578881 acaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttatggatcctcttatttataaggtattcaacatttactttt-tatccgatgagggacatata 2578979  T
Q  252 actcacacttg 262  Q
    | |||||||||    
T  2578980 aatcacacttg 2578990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3409807 - 3409662
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |    
T  3409807 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgtt 3409708  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||| |  ||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3409707 caacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttg 3409662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2843702 - 2843554
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttat-gggtcctctcacttataaagtgc 215  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||     
T  2843702 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggggtcctcttacttataaggtgt 2843603  T
Q  216 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgtg 264  Q
    ||||| |  | | || |||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  2843602 tcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcacaattgtg 2843554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10911683 - 10911567
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccac-ttttctatcagatgtggga 245  Q
    |||||||  ||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  || |||| |||| ||||| |||    
T  10911683 gagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactttttttatctgatgtagga 10911584  T
Q  246 catataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||||||    
T  10911583 catataactcacacttg 10911567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33605724 - 33605656
Alignment:
Q  194 ggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  33605724 ggtcttctcaattataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgagacatatagctcacacttg 33605656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 593758 - 593865
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| |  ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||| ||||    
T  593758 ccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaact 593857  T
Q  255 cacacttg 262  Q
    ||||||||    
T  593858 cacacttg 593865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1846864 - 1846750
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 247  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||| ||||    
T  1846864 agagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagaca 1846765  T
Q  248 tataactcacacttg 262  Q
    || || |||||||||    
T  1846764 tagaattcacacttg 1846750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 261
Target Start/End: Original strand, 1950226 - 1950340
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |   ||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  1950226 gagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 1950325  T
Q  247 atataactcacactt 261  Q
    |||||||||||||||    
T  1950326 atataactcacactt 1950340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16108148 - 16108064
Alignment:
Q  179 ggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16108148 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttgt 16108064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 258
Target Start/End: Original strand, 9062399 - 9062501
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||  || |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  9062399 ccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 9062497  T
Q  255 caca 258  Q
    ||||    
T  9062498 caca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 264
Target Start/End: Original strand, 5832037 - 5832184
Alignment:
Q  118 tacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaacctt--ggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagt 213  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||   ||  |||||||||||||| |||||||| ||    
T  5832037 tacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagggg---tggctttatgggtcctcttacttataaggt 5832133  T
Q  214 gctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgtg 264  Q
    | |||||||  ||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5832134 gttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttgtg 5832184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33606034 - 33605985
Alignment:
Q  205 ttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33606034 ttataaagtgttcaacctccacttttctattcgatgtgggacatataact 33605985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 5034899 - 5034946
Alignment:
Q  184 tgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5034899 tgagttgatgggtcatctcacttataaagtggtcaacctccacttttc 5034946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Original strand, 12092343 - 12092375
Alignment:
Q  28 gactttcgatacaaggagccggttgaacccttc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12092343 gactttcgatacaaggagccggttgaacccttc 12092375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 233
Target Start/End: Original strand, 34661693 - 34661736
Alignment:
Q  190 tatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 233  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34661693 tatgggttctcttacttataaagtgatcaacctccacttttcta 34661736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 260
Target Start/End: Original strand, 17135080 - 17135223
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||  || |||||||||| ||||||| ||    |||||||||||||  ||||||  ||||||| ||  |    
T  17135080 acatcaaggccggaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttctaacaatgagtttatgaatcctcttgcttataaggtatt 17135179  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacact 260  Q
     ||| |  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17135180 aaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 262
Target Start/End: Original strand, 1085562 - 1085772
Alignment:
Q  54 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagag 151  Q
    ||||||| ||||| |  |||| |||||||| |||| |||||||| ||||| | | ||||||    ||||| |||| ||| ||||||||||||   |||||    
T  1085562 acccttcatcgaaccggggctatgataccactgttgggtcatgaggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagag 1085661  T
Q  152 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || |||| |||||||||||||||    
T  1085662 acgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 1085761  T
Q  252 actcacacttg 262  Q
    |||||||||||    
T  1085762 actcacacttg 1085772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7517737 - 7517582
Alignment:
Q  109 gggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactt 206  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7517737 gggaccacccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 7517638  T
Q  207 ataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7517637 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 7517582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30245205 - 30245078
Alignment:
Q  134 caaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 233  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||    
T  30245205 caaccacacaag--agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactctttta 30245108  T
Q  234 tcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  30245107 tccgatgtggaacatataactcacacttgt 30245078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 262
Target Start/End: Original strand, 118345 - 118457
Alignment:
Q  150 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| |||||| |||||| | ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  118345 agacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatggatcctcttacttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacata 118444  T
Q  250 taactcacacttg 262  Q
    ||||| |||||||    
T  118445 taacttacacttg 118457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 137 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7554154 - 7554027
Alignment:
Q  137 ccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctat 234  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||    
T  7554154 ccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 7554055  T
Q  235 cagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7554054 ccgatgtgggacatataactcacacttg 7554027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30244387 - 30244271
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  30244387 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 30244288  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  30244287 atataactcacacttgt 30244271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 45434753 - 45434637
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  45434753 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggac 45434654  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||| ||||||||    
T  45434653 atataacttacacttgt 45434637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 22566711 - 22566818
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||||||||| |||    
T  22566711 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatattact 22566810  T
Q  255 cacacttg 262  Q
    ||||||||    
T  22566811 cacacttg 22566818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 37533052 - 37533166
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||  |||||||||    
T  37533052 gagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggac 37533150  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  37533151 atataactcacacttg 37533166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 22567050 - 22567194
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  22567050 acatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 22567149  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22567150 caacctttactcttttatccgatgt-ggacatattactcacacttg 22567194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6054677 - 6054561
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| |||||| |||    
T  6054677 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagac 6054578  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||| ||||||||    
T  6054577 atataactaacacttgt 6054561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 262
Target Start/End: Original strand, 8128386 - 8128597
Alignment:
Q  54 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtca-tgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagag- 151  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||| || |||||   | ||||| | || ||| |||||||| |||||||||     
T  8128386 acccttcgtcgaaccagggctttgataccactgttgggttagtgaggggagtgcgggggactgttcacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagt 8128485  T
Q  152 -acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatat 250  Q
     || ||||||||||| ||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||  | ||||||||| ||| ||||||||||    
T  8128486 gacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttacatataaggtgttcaacctttatttttctatccgatatgggacatat 8128585  T
Q  251 aactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||    
T  8128586 aactcacacttg 8128597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Original strand, 34218075 - 34218191
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |  |||||| |||| |||||| |||    
T  34218075 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttataaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagac 34218174  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||| ||||    
T  34218175 atataactcacatttgt 34218191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 258
Target Start/End: Original strand, 23418 - 23529
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||| ||    
T  23418 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaac 23517  T
Q  247 atataactcaca 258  Q
    ||||||||||||    
T  23518 atataactcaca 23529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14681655 - 14681512
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctca 218  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||| |||    
T  14681655 acatcaaggctagaacaaccacacttgtgagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttacaaggtgttca 14681556  T
Q  219 acctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||  ||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14681555 acctttactattttatctgatgtgggacatataacttacacttg 14681512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16569313 - 16569198
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||| ||||||| |||||| |||    
T  16569313 gagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgagac 16569214  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  16569213 atataactcacacttg 16569198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 16596349 - 16596464
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||| ||||||| |||||| |||    
T  16596349 gagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgagac 16596448  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  16596449 atataactcacacttg 16596464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29157682 - 29157567
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| | ||||||||    
T  29157682 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggac 29157583  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  29157582 atataactcacacttg 29157567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 40094785 - 40094930
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  40094785 acatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 40094884  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
     |||||  ||| || |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  40094885 gaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttg 40094930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24177552 - 24177437
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||  ||| || |||| ||||||||||    
T  24177552 gagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggac 24177453  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    |||||||||| |||||    
T  24177452 atataactcatacttg 24177437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11845308 - 11845198
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||| ||    
T  11845308 gagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaac 11845209  T
Q  247 atataactcac 257  Q
    |||||||||||    
T  11845208 atataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37346035 - 37345918
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |  |||    
T  37346035 gagagacgtcacactcttactcaaaactttaaggcaatatgtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttctatcagatatatgac 37345936  T
Q  247 --atataactcacacttg 262  Q
      ||||||||||||||||    
T  37345935 atatataactcacacttg 37345918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 261
Target Start/End: Original strand, 37533310 - 37533519
Alignment:
Q  54 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcga--gag 151  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||||| || |||||  || ||||||    ||||| |||| ||| ||||| ||||||| |  |||    
T  37533310 acccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggtcacgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagag 37533409  T
Q  152 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||   |||| | |||||||    
T  37533410 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtagaacatata 37533509  T
Q  252 actcacactt 261  Q
    ||||||||||    
T  37533510 actcacactt 37533519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 262
Target Start/End: Original strand, 36534812 - 36534940
Alignment:
Q  134 caaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 233  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| || ||    
T  36534812 caaccacacttgtgagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctctactgtttta 36534911  T
Q  234 tcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    || || ||||||||||||| | |||||||    
T  36534912 tccgaggtgggacatataagttacacttg 36534940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 45754847 - 45754717
Alignment:
Q  134 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||| |  ||| ||     
T  45754847 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgttcaacatttactattt 45754748  T
Q  232 tatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  45754747 tatccgatgt-ggacatataactcacacttgt 45754717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 45433388 - 45433242
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||| || |||| |||||||| ||| |    
T  45433388 acatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatgagttctcttacttataaggtgtt 45433289  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  45433288 caacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttgt 45433242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30253620 - 30253533
Alignment:
Q  134 caaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctc 223  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||    
T  30253620 caaccacacaag--agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataaggtcttcaacctc 30253533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19122863 - 19122740
Alignment:
Q  134 caaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||     
T  19122863 caaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 19122764  T
Q  232 tatcagatgtgggacatataactca 256  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||    
T  19122763 tatccgatgt-ggacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 47129212 - 47129095
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||   || ||| ||||||||||||||| ||||||||   | |||||||  ||| || |||| |||||| |||    
T  47129212 gagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcgatgggtttatgggtcctcttacttataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagac 47129113  T
Q  247 atataactcacacttgtg 264  Q
    ||||||||||||||||||    
T  47129112 atataactcacacttgtg 47129095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 258
Target Start/End: Original strand, 4124129 - 4124240
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||| | ||||| ||||    
T  4124129 gagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttataaagtgtcaaacctcaaattttctaaccgatgtaggac 4124228  T
Q  247 atataactcaca 258  Q
    || ||| |||||    
T  4124229 atgtaattcaca 4124240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 262
Target Start/End: Original strand, 28301616 - 28301699
Alignment:
Q  179 ggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28301616 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttg 28301699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 36939782 - 36939889
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||  ||| ||||||||||||||    
T  36939782 ccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactattttatacgatttgggacatataact 36939881  T
Q  255 cacacttg 262  Q
    ||||||||    
T  36939882 cacacttg 36939889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9901760 - 9901648
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| || |||||  || |||||||  ||| || |||| ||||| ||||    
T  9901760 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctct-acgtataagatgttcaacctttactgttttatccgatgt-ggac 9901663  T
Q  247 atataactcacactt 261  Q
    |||||||||||||||    
T  9901662 atataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10341903 - 10341842
Alignment:
Q  193 gggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10341903 gggttctcccacttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataact 10341842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20599418 - 20599317
Alignment:
Q  160 ctcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacac 259  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| | | |||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20599418 ctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttatttataaagtgtttatcctttacttttttatccgatatgggacatataactcacac 20599319  T
Q  260 tt 261  Q
    ||    
T  20599318 tt 20599317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 261
Target Start/End: Original strand, 41910669 - 41910749
Alignment:
Q  181 caatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 261  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41910669 caatgggtttatgggtcctctcagttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 41910749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 261
Target Start/End: Original strand, 24838727 - 24838857
Alignment:
Q  134 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcc-tctcacttataaagtgctcaacctccactttt 230  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| | |||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||    
T  24838727 caaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttactctt 24838826  T
Q  231 ctatcagatgtgggacatataactcacactt 261  Q
     |||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  24838827 ttattcgatgtgagacatataacttacactt 24838857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 36623065 - 36622962
Alignment:
Q  159 actcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 258  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||  ||||||||| || | |||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36623065 actcctacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 36622966  T
Q  259 cttg 262  Q
    ||||    
T  36622965 cttg 36622962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 40230332 - 40230447
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |  |||||| |||  ||||||||||    
T  40230332 gagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacttttacttttttattcgatgtgggac 40230431  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    |||||||| |||||||    
T  40230432 atataacttacacttg 40230447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 208
Target Start/End: Original strand, 1085297 - 1085350
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1085297 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttat 1085350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 42282101 - 42282145
Alignment:
Q  189 ttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42282101 ttatgggtcctttcacttataaagtgttcaacctccacttttcta 42282145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30245567 - 30245496
Alignment:
Q  191 atgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30245567 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 30245496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43241596 - 43241497
Alignment:
Q  163 ttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||| ||||||||  | |||| |||||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||  | |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43241596 ttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 43241497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15902475 - 15902335
Alignment:
Q  90 ggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgag 187  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||  || ||||||| ||| ||||||||||  | ||| |||    
T  15902475 ggtcacgaggggagtccgggggaccacccacatccaggc-agaacaatcacacaagtgagagcgacaccacacttttatccaaaaccttaagacaacgag 15902377  T
Q  188 tttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttt 229  Q
     ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15902376 cttatgtgtgatttcacttataaagtgttcaacctccacttt 15902335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Original strand, 28300294 - 28300342
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatggg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||    
T  28300294 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatggg 28300342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30255412 - 30255341
Alignment:
Q  191 atgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30255412 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttg 30255341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 197
Target Start/End: Original strand, 21416182 - 21416232
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtc 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||    
T  21416182 gagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 21416232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 225
Target Start/End: Original strand, 45335547 - 45335585
Alignment:
Q  187 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctcca 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45335547 gtttatgggttctctcacttataaagtgctcaacatcca 45335585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 30244547 - 30244466
Alignment:
Q  71 ggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    ||||| ||||  || |||||||||||| ||||||    
T  30244547 ggctttgataccattgttgggtcatgaggggagcctgagggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagaga 30244466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10342338 - 10342275
Alignment:
Q  182 aatgagtttatgggtcctctc--acttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgg 243  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||    
T  10342338 aatgagtttatgggttctctcccacttataaagtgtttaacctctacttttctatatgatgtgg 10342275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569091
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatggg 195  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 23569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30244771 - 30244703
Alignment:
Q  194 ggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||| | |||||| ||| |||||||  ||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30244771 ggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttg 30244703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37345607 - 37345563
Alignment:
Q  218 aacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37345607 aacctccactttcctattcgatgtgggacatataactcactcttg 37345563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47129516 - 47129457
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaacctt 176  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47129516 acatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt 47129457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 64)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 262
Target Start/End: Original strand, 19283437 - 19283611
Alignment:
Q  90 ggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgag 187  Q
    |||||||| |||||||   |||||| |  ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||    
T  19283437 ggtcatgaggggagtcaaggggacctcccacatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgatgag 19283536  T
Q  188 tttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19283537 tttatgtgtcctctcatttacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttg 19283611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 263
Target Start/End: Original strand, 26661548 - 26661679
Alignment:
Q  134 caaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||     
T  26661548 caaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaacctttactcttt 26661647  T
Q  232 tatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26661648 tacccgatgtgggacatataactcacacttgt 26661679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 1188599 - 1188744
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |    
T  1188599 acatctaggtcagagcaaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgagtcttctcacttataaaatatt 1188698  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1188699 caacctccacttttctatccgatatggaacatataactcacacttg 1188744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17294694 - 17294578
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  17294694 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 17294595  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  17294594 atataactcacacttgt 17294578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 22077536 - 22077651
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||    
T  22077536 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagac 22077635  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  22077636 atataactcacacttg 22077651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 262
Target Start/End: Original strand, 5319982 - 5320121
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  5319982 aggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaactt 5320081  T
Q  223 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
      ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5320082 ttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttg 5320121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22793420 - 22793280
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaa-tgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacc 221  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  22793420 aggccagaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataaagttttcaacc 22793321  T
Q  222 tccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22793320 tctacttttctatacgatgtgggacatataactcacacttg 22793280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 32594757 - 32594872
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| ||||    
T  32594757 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtaggac 32594856  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  32594857 atataactcacacttg 32594872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41142520 - 41142374
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactctt-acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgc 215  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||     
T  41142520 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaggtgt 41142421  T
Q  216 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41142420 tcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 41142374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 263
Target Start/End: Original strand, 26661924 - 26662055
Alignment:
Q  134 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||| ||     
T  26661924 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactcttt 26662023  T
Q  232 tatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26662024 tatctgatatgggatatataactcacacttgt 26662055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3550837 - 3550722
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  3550837 gagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac 3550738  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  3550737 atataactcacacttg 3550722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9956121 - 9955911
Alignment:
Q  54 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagag 151  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||||| || | ||| |   |||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||    
T  9956121 acccttcgtcgaaccgaggctctgataccactgttgggtcacgaggagagcctaggggaccgctcacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagag 9956022  T
Q  152 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagttta-tgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttct-atcagatgtgggacata 249  Q
    ||  |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||| | ||| |||||||||||||    
T  9956021 acatcacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttaatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgtgggacata 9955922  T
Q  250 taactcacact 260  Q
    |||||||||||    
T  9955921 taactcacact 9955911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 44290835 - 44290981
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactctt-acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgc 215  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||     
T  44290835 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 44290934  T
Q  216 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44290935 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 44290981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 262
Target Start/End: Original strand, 66099 - 66245
Alignment:
Q  118 tacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctc 217  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  66099 tacatcgaggccagaacaaccatacaagtgagaggcgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 66198  T
Q  218 -aacctccacttttctatcagatgtgggacat-ataactcacacttg 262  Q
     |||||  ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  66199 aaacctttacttttctatccgatgtgagacatgattactcacacttg 66245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41157138 - 41156993
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcga--gagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  41157138 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 41157039  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| | | |||||||||||| |||||||||    
T  41157038 caacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttg 41156993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41157522 - 41157377
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  41157522 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 41157423  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||| |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41157422 caacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 41157377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 262
Target Start/End: Original strand, 44290502 - 44290614
Alignment:
Q  150 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 249  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  ||| || |||| |||||||||||||    
T  44290502 agacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 44290601  T
Q  250 taactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||    
T  44290602 taactcacacttg 44290614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 259
Target Start/End: Original strand, 3537610 - 3537752
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||| |    
T  3537610 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttataggtcctcttactcataaggtgtt 3537709  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacac 259  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3537710 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacac 3537752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 24600355 - 24600470
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||| || |||| ||||||||  || |||||||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  24600355 gagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataatatgttcaacctttacttttctatccgatatgggac 24600454  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  24600455 atataactcacacttg 24600470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34365042 - 34364927
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  | | || |||| |||||| |||    
T  34365042 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtgtgac 34364943  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  34364942 atataactcacacttg 34364927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34649585 - 34649439
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||| ||  ||||||||| ||| |    
T  34649585 acatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcacttataaggtgtt 34649486  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34649485 caacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgt 34649439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 37556243 - 37556112
Alignment:
Q  134 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccact-ttt 230  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||  || |||||||  ||| |||    
T  37556243 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgg-tcctcttacttataagatgttcaacctttactattt 37556145  T
Q  231 ctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37556144 ttatccgatgtgggacatataactcacacttgt 37556112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 262
Target Start/End: Original strand, 66489 - 66628
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  66489 aggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggccatatgtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacct 66588  T
Q  223 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
      ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  66589 ttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttg 66628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 1187405 - 1187520
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||  |||||| |||    
T  1187405 gagagacgtcacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgagac 1187504  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    |||||| |||||||||    
T  1187505 atataattcacacttg 1187520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10351277 - 10351182
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||   | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  10351277 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctctatttttctatctgatgtg 10351182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 39066241 - 39066356
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |     
T  39066241 gagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttagttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaat 39066340  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  39066341 atataactcacacttg 39066356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 149 - 235
Target Start/End: Original strand, 22077153 - 22077239
Alignment:
Q  149 gagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatc 235  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  |||||||||||    
T  22077153 gagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatc 22077239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34364654 - 34364509
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgc--cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||||||||| || ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| || |||||| |||||||| ||| |    
T  34364654 acatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacggatcctcttacttataaggtgtt 34364555  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  34364554 caacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 34364509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41759630 - 41759485
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| || ||| |||||||| ||| |    
T  41759630 acatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttacttataaggtgtt 41759531  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||| |  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41759530 caacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttg 41759485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 262
Target Start/End: Original strand, 41184489 - 41184581
Alignment:
Q  170 aaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41184489 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 41184581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29798316 - 29798201
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||  |||| ||||    
T  29798316 gagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggac 29798217  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  29798216 atataactcacacttg 29798201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 262
Target Start/End: Original strand, 31767187 - 31767317
Alignment:
Q  134 caaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||  |||| |  ||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||     
T  31767187 caaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggttaatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttt 31767286  T
Q  232 tatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31767287 tatccgatgtggaacatataacccacacttg 31767317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 40082515 - 40082409
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| ||||||||||||    
T  40082515 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatga-tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataact 40082417  T
Q  255 cacacttg 262  Q
    ||||||||    
T  40082416 cacacttg 40082409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 48588529 - 48588644
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| ||||    
T  48588529 gagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggac 48588628  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||| ||||||||||||    
T  48588629 atagaactcacacttg 48588644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Original strand, 22077871 - 22077984
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  | ||||||||| ||| |   |||    
T  22077871 agagacgccacactcttaccccaaaccttagg-ctatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaaca 22077969  T
Q  248 tataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||||    
T  22077970 tataactcacacttg 22077984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24448424 - 24448279
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagagac--gccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||| |||||||  |||||||| ||| |||||| |||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||| || |    
T  24448424 acatctaggcctgaacaacctcataagtgagagacacgccacacttttatccaaaatcttaagacaatgagtttatgagccctctcacttataaaatgtt 24448325  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||   |||||||||| |||||||    
T  24448324 caacttccacttttctttgagatgtctaacatataacttacacttg 24448279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 30630649 - 30630794
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||| || ||  ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||      
T  30630649 acatcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgtc 30630748  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
     |||||  | |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  30630749 aaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcacacttg 30630794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 261
Target Start/End: Original strand, 50052064 - 50052178
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |  |||  ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  50052064 gagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaaataggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 50052163  T
Q  247 atataactcacactt 261  Q
    |||||||||||||||    
T  50052164 atataactcacactt 50052178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 263
Target Start/End: Original strand, 38804372 - 38804512
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  38804372 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaacct 38804471  T
Q  223 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
      ||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38804472 ttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgt 38804512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 258
Target Start/End: Original strand, 24131998 - 24132137
Alignment:
Q  118 tacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctc 217  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||| || ||||||  |  ||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| || | |||||| ||| ||    
T  24131998 tacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttacccaaa-ccttaaggcaatgagtttatggatccccttatttataaggtgttc 24132096  T
Q  218 aacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 258  Q
    |||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24132097 aacctttacttttctatccgatgagggacatataactcaca 24132137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 262
Target Start/End: Original strand, 3537228 - 3537303
Alignment:
Q  187 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3537228 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3537303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 254
Target Start/End: Original strand, 3875372 - 3875479
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||  |||||| |||| |||||| |||    
T  3875372 gagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgac 3875471  T
Q  247 atataact 254  Q
    ||||||||    
T  3875472 atataact 3875479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5575221 - 5575110
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||  ||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||||||| || |||||||    
T  5575221 gagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttctatccgacgtgggac 5575122  T
Q  247 atataactcaca 258  Q
    |||||| |||||    
T  5575121 atataattcaca 5575110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37555861 - 37555733
Alignment:
Q  134 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| | |  |||| || |||||| |||||||| ||  ||||||| |||| ||     
T  37555861 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggatttaagg-tcctcttacttataatgtattcaaccttcactattt 37555763  T
Q  232 tatcagatgtgggacatataactcacactt 261  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  37555762 tatccgatgtgggacttataactcacactt 37555733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 37850611 - 37850756
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||| || |||||||    || |  |||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  37850611 acatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttatgggttctcttacttataaggtgtt 37850710  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||| ||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37850711 caacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttg 37850756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14318984 - 14318875
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| || |||| ||    
T  14318984 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaac 14318885  T
Q  247 atataactca 256  Q
    ||||||||||    
T  14318884 atataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 201
Target Start/End: Original strand, 32168709 - 32168793
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctct 201  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||    
T  32168709 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctct 32168793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 44685570 - 44685458
Alignment:
Q  150 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaa-cctccacttttctatcagatgtgggacat 248  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||    
T  44685570 agacgtcacactgttacccaaa-cattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggttttcaaacctttacttttctatccgatatgggacat 44685472  T
Q  249 ataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||    
T  44685471 ataactcacacttg 44685458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11977397 - 11977281
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||| || |||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || || | ||||||||||    
T  11977397 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggac 11977298  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  11977297 atataactcacacttgt 11977281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 262
Target Start/End: Original strand, 47379889 - 47379941
Alignment:
Q  210 aagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  47379889 aagtgttcaacctccacttttctatccgatgtgggatatataactcacacttg 47379941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 45084457 - 45084384
Alignment:
Q  189 ttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  45084457 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttg 45084384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 254
Target Start/End: Original strand, 5528795 - 5528902
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||| | ||||||  || |||||||  ||| || |||| |||||| |||    
T  5528795 gagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagatgttcaacctttactcttttatccgatgtgagac 5528894  T
Q  247 atataact 254  Q
    ||||||||    
T  5528895 atataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 5996883 - 5997027
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaa--gcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| || |||||||||    |||||  | ||||| |||||||| ||||||| || |    
T  5996883 acatctcggctagagcaaccacacaaatgagagagacaccacactctcactcaaaaccttaaa-caatggatatatggatcctctcatttataaaatgtt 5996981  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||| | ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||    
T  5996982 caagcaccacttttctaacttatgtgggacatataacccacgcttg 5997027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 193
Target Start/End: Original strand, 47380129 - 47380254
Alignment:
Q  71 ggctttgataccattgtttggtca-tgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagac--gccacactcttacc 167  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||   ||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||   | ||||||||||||    
T  47380129 ggctctgataccattgttgggtcaattaggggagtctaggggaccacccacatctaggcttgagcaaccagacaagtgagagagatgtcacactcttacc 47380228  T
Q  168 caaaaccttggggcaatgagtttatg 193  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||    
T  47380229 caaaactttaaggcaatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4956305 - 4956220
Alignment:
Q  150 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatc 235  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||| ||||||||  || |||||||  |||||||||||    
T  4956305 agacgtcacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatc 4956220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 220
Target Start/End: Original strand, 44043813 - 44043886
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaac 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||    
T  44043813 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaac 44043886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 45839778 - 45839628
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||||||| ||| | |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| |   |||||||||| ||| |||||||| ||| |    
T  45839778 acatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgtt 45839679  T
Q  217 c-----aacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    |     |||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45839678 cgattcaaccttta-ttttctatccgatgtgggacatataactcatacttgt 45839628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 50556517 - 50556453
Alignment:
Q  198 ctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||    
T  50556517 ctctcacttataaattgttcaacctccgcttttctatatgatgtgtgatatataacccacacttg 50556453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 262
Target Start/End: Original strand, 21378122 - 21378197
Alignment:
Q  187 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  21378122 gtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttg 21378197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 45494015 - 45494135
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaa----gtgctcaacctccacttttctatcagatgtg 242  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| ||||||| |    ||| |||||||  ||| || |||| ||||||    
T  45494015 gagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggatcatcttacttatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 45494114  T
Q  243 ggacatat-aactcacacttg 262  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  45494115 ggacatataaactcacacttg 45494135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44091970 - 44091909
Alignment:
Q  188 tttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 249  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||| |||||| ||||||    
T  44091970 tttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctttacttttacatctgatgtgtgacata 44091909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 262
Target Start/End: Original strand, 50469180 - 50469237
Alignment:
Q  205 ttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50469180 ttataaagtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttg 50469237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4878869 - 4878809
Alignment:
Q  198 ctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 258  Q
    |||||||||||||| || |||| || |||| || |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4878869 ctctcacttataaaatgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcaca 4878809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 230
Target Start/End: Original strand, 30576667 - 30576707
Alignment:
Q  190 tatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactttt 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  30576667 tatgggtcctctcactcataaagtgttcaacctctactttt 30576707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 129 - 262
Target Start/End: Original strand, 39336252 - 39336385
Alignment:
Q  129 cagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactt 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  39336252 cagagcaaccacacgagcgagagaggcaacactattatccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaact 39336351  T
Q  229 ttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39336352 ttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 39336385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Original strand, 47964541 - 47964674
Alignment:
Q  131 gagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |    
T  47964541 gagcaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacat 47964640  T
Q  229 ttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  47964641 ttctatccgatgcgggacatacaactcacacttg 47964674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 263
Target Start/End: Original strand, 43346808 - 43346948
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||    
T  43346808 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacct 43346907  T
Q  223 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
      ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43346908 ttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgt 43346948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15773066 - 15772856
Alignment:
Q  54 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagag 151  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||  | |||||    ||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||    
T  15773066 acccttcgtcgaatcagggctctgataccactgttgggtcatgaggggagtcaaaaggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagag 15772967  T
Q  152 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 251  Q
    || ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||| |||||||||||    
T  15772966 acaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacatata 15772867  T
Q  252 actcacacttg 262  Q
    |||||||||||    
T  15772866 actcacacttg 15772856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25317292 - 25317161
Alignment:
Q  132 agcaaccacacaagcgagagacgcc--acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttt 229  Q
    |||||||||||||| ||||||| |   ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25317292 agcaaccacacaagtgagagacacactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctctcagttacaaagtgctcaacctccacttt 25317193  T
Q  230 tctatcagatgtgggacatataactcacactt 261  Q
    || ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25317192 tccatctggtgtgggacacataactcacactt 25317161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 12114603 - 12114718
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||     
T  12114603 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggat 12114702  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    |||||||| |||||||    
T  12114703 atataacttacacttg 12114718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 21832356 - 21832499
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctca 218  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||  |  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||    
T  21832356 acatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgccactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttca 21832455  T
Q  219 acctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21832456 acctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacacttg 21832499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Original strand, 37990650 - 37990796
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |    
T  37990650 acatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgtt 37990749  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    |||| |  ||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37990750 caacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgt 37990796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35946639 - 35946523
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  35946639 gagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggac 35946540  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  35946539 atataactcacacttgt 35946523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22304686 - 22304571
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  22304686 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggac 22304587  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22304586 atatagctcacacttg 22304571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 29644622 - 29644737
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||  ||| ||||||||||    
T  29644622 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggac 29644721  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  29644722 atataactcacacttg 29644737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 29644943 - 29645058
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  29644943 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggac 29645042  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    |||||||| |||||||    
T  29645043 atataacttacacttg 29645058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Original strand, 37990988 - 37991134
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  37990988 acatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttataggtcctcttacttataaggtgtt 37991087  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    ||||||  ||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37991088 caacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttgt 37991134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 258
Target Start/End: Original strand, 33803263 - 33803404
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgag--agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| |    
T  33803263 acatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttacttatatggtgtt 33803362  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 258  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  33803363 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 33803404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 262
Target Start/End: Original strand, 42342405 - 42342544
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||| ||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||    
T  42342405 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttgaacct 42342504  T
Q  223 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
      ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42342505 ttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttg 42342544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 52634792 - 52634677
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| |||||||| | | |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  52634792 gagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt-ctcttacttataaggcgttcaacctttactgttttatccgatgtgggac 52634694  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  52634693 atataactcacacttgt 52634677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 47964956 - 47965071
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||| | ||||||||||||| | || | |||||||||||||||||| |||||   ||    
T  47964956 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcacttatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaac 47965055  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  47965056 atataactcacacttg 47965071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 245
Target Start/End: Original strand, 41359776 - 41359904
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  41359776 acatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtatt 41359875  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtggga 245  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||||||    
T  41359876 caacctttactattgtatccgatgtggga 41359904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 261
Target Start/End: Original strand, 46546375 - 46546480
Alignment:
Q  156 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||    
T  46546375 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactc 46546474  T
Q  256 acactt 261  Q
    ||||||    
T  46546475 acactt 46546480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25755570 - 25755395
Alignment:
Q  90 ggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgag 187  Q
    |||||||| |||||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| || || |||||      
T  25755570 ggtcatgaggggagttcgggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatgga 25755471  T
Q  188 tttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||  ||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25755470 tttatgagtcctcttacttataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgt 25755395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Original strand, 32462911 - 32463058
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||  |    
T  32462911 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttataaggtatt 32463010  T
Q  217 caacc-tccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    ||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32463011 caaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacacttgt 32463058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 263
Target Start/End: Original strand, 33175711 - 33175821
Alignment:
Q  156 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttat---gggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataa 252  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||   |||| |||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33175711 cacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttattatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataa 33175810  T
Q  253 ctcacacttgt 263  Q
    |||||||||||    
T  33175811 ctcacacttgt 33175821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Original strand, 49336728 - 49336844
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||  | | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||    
T  49336728 gagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataaggtggtcaacctttacttttctatccgatgtgagac 49336827  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    || ||||||||||||||    
T  49336828 atgtaactcacacttgt 49336844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 25739466 - 25739581
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||   || ||||| |  ||| || |||| ||||||||||    
T  25739466 gagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggac 25739565  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  25739566 atataactcacacttg 25739581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39389186 - 39389072
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| | || ||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| |||||    
T  39389186 agagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtgttcaacctttactattttatccgatgtaggaca 39389087  T
Q  248 tataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||||    
T  39389086 tataactcacacttg 39389072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 210
Target Start/End: Original strand, 42342101 - 42342194
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 210  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  42342101 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataa 42342194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 54018209 - 54018354
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |  ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  54018209 acatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 54018308  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||| ||  ||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  54018309 caatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttg 54018354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 262
Target Start/End: Original strand, 1634366 - 1634471
Alignment:
Q  158 cactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacc-tccacttttctatcagatgtgggacatataactca 256  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1634366 cactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactca 1634465  T
Q  257 cacttg 262  Q
    ||||||    
T  1634466 cacttg 1634471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32589835 - 32589706
Alignment:
Q  134 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    |||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  | | ||     
T  32589835 caaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattattt 32589736  T
Q  232 tatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  32589735 tatcttatgtgggacatat-actcacacttg 32589706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 255
Target Start/End: Original strand, 39934966 - 39935104
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  39934966 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgtt 39935065  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 255  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||| |||||||||||||    
T  39935066 caacctttactcttttatccgatgtaggacatataactc 39935104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 54017857 - 54017972
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |  ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| ||||    
T  54017857 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggac 54017956  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  54017957 atataactcacacttg 54017972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 224
Target Start/End: Original strand, 39335991 - 39336088
Alignment:
Q  129 cagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctcc 224  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||    
T  39335991 cagagcaatcacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtcttatcatttataaagtgttcaacctcc 39336088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 262
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384422
Alignment:
Q  157 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactca 256  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  257 cacttg 262  Q
    | ||||    
T  3384417 cgcttg 3384422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 259
Target Start/End: Original strand, 36986040 - 36986101
Alignment:
Q  198 ctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacac 259  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36986040 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 36986101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 259
Target Start/End: Original strand, 37011479 - 37011540
Alignment:
Q  198 ctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacac 259  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37011479 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 37011540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 45901831 - 45901714
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactt-ttctatcagatgtggga 245  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||    || || |||| |||||||||    
T  45901831 gagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttacttataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtggga 45901732  T
Q  246 catataactcacacttgt 263  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45901731 catataactcacacttgt 45901714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4823769 - 4823657
Alignment:
Q  150 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 249  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | ||| |  ||| || |||| |||||| ||| ||    
T  4823769 agacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaacttttactattttatccgatgtgagactta 4823670  T
Q  250 taactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||    
T  4823669 taactcacacttg 4823657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15773314 - 15773194
Alignment:
Q  142 caagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgt 241  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  || ||||| |  ||| || |||  |||||    
T  15773314 caagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgagtcctcttacttataagatgttcaacttttactcttttattcgatgt 15773215  T
Q  242 gggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15773214 gggacatataactcacacttg 15773194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8328021 - 8327906
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||| |||| ||||||||  |  ||| |||  ||| || |||| ||||||||||    
T  8328021 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctcttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggac 8327922  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  8327921 atataactcacacttg 8327906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39914369 - 39914254
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||  |||| |  ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||| || |||| |||||| |||    
T  39914369 gagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacctctactgttttatctgatgtgagac 39914270  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  39914269 atataactcacacttg 39914254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 257
Target Start/End: Original strand, 3135114 - 3135224
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||| || |||||||||| || | |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||||||    
T  3135114 gagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgggac 3135213  T
Q  247 atataactcac 257  Q
    |||||||||||    
T  3135214 atataactcac 3135224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 45395664 - 45395809
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  45395664 acatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttataacgtgtt 45395763  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
     |||||  ||| || |||  ||||||||| |||||||| |||||||    
T  45395764 taacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttg 45395809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Original strand, 22303966 - 22304105
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||||||          
T  22303966 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataa------ 22304059  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
      ||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22304060 -gacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgt 22304105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 258
Target Start/End: Original strand, 54451235 - 54451328
Alignment:
Q  165 acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 258  Q
    ||||||||||||  | |||| ||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  54451235 acccaaaaccttaagacaataagtatatggatcatctcactcataaagtgttcaacctccatttttctttttgatgtgggacatataactcaca 54451328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 261
Target Start/End: Original strand, 7767389 - 7767469
Alignment:
Q  181 caatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 261  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  7767389 caatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 53118016 - 53118130
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||| ||| ||    
T  53118016 gagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaac 53118114  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  53118115 atataactcacacttg 53118130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31190126 - 31190019
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||        |||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  31190126 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 31190035  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    |||| |||||||||||    
T  31190034 atatcactcacacttg 31190019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11662098 - 11661954
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaa-gcgagagacgccacactcttacccaaaa-ccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||| | |||||||||| ||| ||| |    
T  11662098 acatcgaggctagaacaaccacacaatgagagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcacttttaaggtgtt 11661999  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 261  Q
    ||||||  ||| || ||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  11661998 caacctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcacactt 11661954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9240266 - 9240151
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||| |||  || ||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| | |  |||| |||||| ||||||| ||    
T  9240266 gagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttctctatccgatgtggaac 9240167  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  9240166 atataactcacacttg 9240151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12749278 - 12749207
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccac 226  Q
    ||||||||||| | ||||||||   |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12749278 ccacactcttatcaaaaaccttaatgcaattggtttatgggtcctcacacttataaagtgttcaacctccac 12749207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 206
Target Start/End: Original strand, 22303708 - 22303759
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22303708 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 52635049 - 52634994
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 210  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  52635049 ccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataa 52634994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 53577481 - 53577366
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||||| ||| || | || |||  || |||||||  ||| || |||| |||||| |||    
T  53577481 gagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatttttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgac 53577382  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  53577381 atataactcacacttg 53577366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 262
Target Start/End: Original strand, 12747870 - 12747908
Alignment:
Q  224 cacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12747870 cacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 12747908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 254
Target Start/End: Original strand, 42584864 - 42584970
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 247  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| |||  | ||||  |||||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  42584864 agagacaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggaca 42584963  T
Q  248 tataact 254  Q
    |||||||    
T  42584964 tataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 262
Target Start/End: Original strand, 50612534 - 50612608
Alignment:
Q  188 tttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50612534 tttatgagtcctcttacttataaggtgttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 50612608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 51886645 - 51886563
Alignment:
Q  180 gcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||||  ||| || |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  51886645 gcaatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacacttg 51886563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 2300021 - 2299978
Alignment:
Q  219 acctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  2300021 acctccacttttctatctgacgtgggacatataacccacacttg 2299978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 176
Target Start/End: Original strand, 7766784 - 7766851
Alignment:
Q  109 gggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaacctt 176  Q
    |||||||  |||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7766784 gggaccatctacatcgaggctagaacaaccatacaagtgagagacgccacaatcttacctaaaacctt 7766851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 194
Target Start/End: Original strand, 54017590 - 54017636
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgg 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  54017590 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 258
Target Start/End: Original strand, 54769708 - 54769766
Alignment:
Q  200 ctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 258  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  54769708 ctcacttataaagtgatcaactttcacttttctatttgatgtacgacatataactcaca 54769766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 210
Target Start/End: Original strand, 33362331 - 33362397
Alignment:
Q  142 caagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 210  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  33362331 caagagagagacgccacact--tacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataa 33362397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 16871010 - 16871062
Alignment:
Q  157 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttata 209  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  16871010 acactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttccctctcttata 16871062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 176
Target Start/End: Original strand, 41359533 - 41359561
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaacctt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41359533 agagacgccacactcttacccaaaacctt 41359561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 70)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 36629384 - 36629239
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  36629384 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 36629285  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
     ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36629284 taacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 36629239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28034346 - 28034231
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28034346 gagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcgggac 28034247  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    |||||| |||||||||    
T  28034246 atataattcacacttg 28034231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Original strand, 39792869 - 39793015
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||  ||||||| ||| |    
T  39792869 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttacggttcctctttcttataaggtgtt 39792968  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39792969 caacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgt 39793015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 760324 - 760194
Alignment:
Q  130 agagcaaccacacaa--gcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccact 227  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  760324 agagcaaccacacaaatgagagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagttctcaaccttcatt 760226  T
Q  228 tttctatcagatgtgggacatataactcacac 259  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  760225 tttctattcgatgtgggacatataactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39404165 - 39404019
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  39404165 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgtt 39404066  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    ||||||  ||| || |||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  39404065 caacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacacttgt 39404019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25483483 - 25483338
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||  || |    
T  25483483 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagatgtt 25483384  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25483383 caacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 25483338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 250
Target Start/End: Original strand, 15841382 - 15841510
Alignment:
Q  124 taggccagagcaaccacacaagcgagagacgc--cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacc 221  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||    
T  15841382 taggctagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacc 15841481  T
Q  222 tccacttttctatcagatgtgggacatat 250  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||    
T  15841482 tccacttttctatttgatgtgagacatat 15841510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 262
Target Start/End: Original strand, 4955332 - 4955471
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  4955332 aggctagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacct 4955431  T
Q  223 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
      ||| || |||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  4955432 taactattttatccgatatgagacatataactcacacttg 4955471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Original strand, 34646688 - 34646804
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||||||    
T  34646688 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggac 34646787  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  34646788 atataactcacacttgt 34646804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 2741184 - 2741073
Alignment:
Q  151 gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2741184 gacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatat 2741085  T
Q  251 aactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||    
T  2741084 aactcacacttg 2741073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 3244490 - 3244605
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  ||||||||||| |||||| |||    
T  3244490 gagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgagac 3244589  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  3244590 atataactcacacttg 3244605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34544349 - 34544107
Alignment:
Q  15 tctttgtcaagaagactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| | | ||||||    
T  34544349 tctttgtcaagaagactttcgacacaaggag-------aacacttcgttgaacctcggctctgataccaatgttgggtcacgaggggagccag-gggacc 34544258  T
Q  115 acttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacg--ccacactcttacccaaaa-ccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaa 211  Q
    ||  |||||  ||   ||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34544257 acccacatcctgggg-gagcaaccgtacaagtgagagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaa 34544159  T
Q  212 gtgctcaacctccacttttctatcagatgtggg--acatataactcacactt 261  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||| |  | |||||||||||||||    
T  34544158 gtgatcaacctccacttttctattcgatgtgagatatatataactcacactt 34544107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 50630794 - 50630909
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| ||||    
T  50630794 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggac 50630893  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||| ||||    
T  50630894 atataactcacgcttg 50630909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3340954 - 3340809
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3340954 acatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgct 3340855  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3340854 caacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacacttg 3340809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 2740817 - 2740702
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||  || |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  2740817 gagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggac 2740718  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  2740717 atataactcacacttg 2740702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 16888855 - 16888970
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  16888855 gagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttataggttctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtgggac 16888954  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  16888955 atataactcacacttg 16888970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 22183303 - 22183418
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |  ||| || |||| |||||||||     
T  22183303 gagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggat 22183402  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  22183403 atataactcacacttg 22183418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39404545 - 39404399
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  39404545 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 39404446  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    | ||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39404445 ccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgt 39404399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 44620768 - 44620662
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  44620768 ccacactcttacccaaaaccttaaggttatg-gtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataact 44620670  T
Q  255 cacacttg 262  Q
    ||||||||    
T  44620669 cacacttg 44620662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 50002543 - 50002428
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||| || |||| |||||| |||    
T  50002543 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttacttaaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagac 50002444  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  50002443 atataactcacacttg 50002428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 55933163 - 55933278
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||   ||| || |||| ||||| ||||    
T  55933163 gagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggac 55933262  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  55933263 atataactcacacttg 55933278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 32941132 - 32941277
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||| |    
T  32941132 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataaggtgtt 32941231  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| |||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  32941232 caacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttg 32941277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 54017604 - 54017749
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| ||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |    
T  54017604 acatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgtt 54017703  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  54017704 caacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttg 54017749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 52884853 - 52884697
Alignment:
Q  109 gggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttaccc-aaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcact 205  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| | || ||| |||    
T  52884853 gggaccacgcacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttact 52884754  T
Q  206 tataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52884753 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 52884697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 258
Target Start/End: Original strand, 1731662 - 1731797
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||  || |||||||    
T  1731662 aggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttatttataagatgttcaacct 1731761  T
Q  223 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 258  Q
      ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1731762 ttactgttttatctgatgtgggacatataactcaca 1731797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Original strand, 11783515 - 11783671
Alignment:
Q  72 gctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttaccca 169  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||| | | | ||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  11783515 gctttgataccactgttgggtcatgaggggtgccagggggaccacccacatctaggctagagcaactatacaagcgagagaaacgacacactcttaccca 11783614  T
Q  170 aaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactt 228  Q
    |||| ||  ||||||  || |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  11783615 aaactttatggcaataggtgtatgggtcctctcac--ataaagggcttaacctccactt 11783671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 262
Target Start/End: Original strand, 23556885 - 23557020
Alignment:
Q  129 cagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccac 226  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||| | |||| | ||||||| || |||||||||||    
T  23556885 cagagcaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccac 23556984  T
Q  227 ttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||| |||||   |||| |||||||||||||    
T  23556985 ttttctatccgatgtaaaacatttaactcacacttg 23557020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 52885005 - 52884889
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttaccc-aaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtggga 245  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||||    
T  52885005 gagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 52884906  T
Q  246 catataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||||||    
T  52884905 catataactcacacttg 52884889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 49880277 - 49880162
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||   |||||||||    
T  49880277 gagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtgggac 49880178  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  49880177 atataactcacacttg 49880162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41370504 - 41370359
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  41370504 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtttt 41370405  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||| |  ||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41370404 caacatttactattttatccgatttgggacatataactcacacttg 41370359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 49303015 - 49302907
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcac--ttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  49303015 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttttataagatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataa 49302916  T
Q  253 ctcacactt 261  Q
    |||||||||    
T  49302915 ctcacactt 49302907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31691266 - 31691206
Alignment:
Q  150 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31691266 agacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataa 31691206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Original strand, 41707504 - 41707619
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| || | |||||||  ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  41707504 gagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 41707602  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707603 atataactcacacttgt 41707619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 22028000 - 22028115
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    | || |||| ||||||||||    
T  22028000 gagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatatgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggac 22028099  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    |||||| |||||||||    
T  22028100 atataagtcacacttg 22028115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45496934 - 45496820
Alignment:
Q  137 ccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctat 234  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||  ||  || |||    
T  45496934 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttat 45496835  T
Q  235 cagatgtgggacata 249  Q
    | |||||||||||||    
T  45496834 ccgatgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 54936313 - 54936201
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||      
T  54936313 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggg-- 54936216  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
      |||||||||||||||    
T  54936215 --ataactcacacttgt 54936201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10246066 - 10245922
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgag--agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  10246066 acatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttatgg-tcctcttacttataaggtgtt 10245968  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10245967 caacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttg 10245922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 263
Target Start/End: Original strand, 15841034 - 15841139
Alignment:
Q  157 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactca 256  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||| |||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  15841034 acactcttacccaaaac-ttaaagcaatgggtttatagatcctctcacttataaaatgttcagcctccacttttctatctgatatgggacatataattca 15841132  T
Q  257 cacttgt 263  Q
    || ||||    
T  15841133 catttgt 15841139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 54109029 - 54108928
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  54109029 gagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 54108931  T
Q  247 ata 249  Q
    |||    
T  54108930 ata 54108928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 262
Target Start/End: Original strand, 54741227 - 54741332
Alignment:
Q  157 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactca 256  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||  || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  54741227 acactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataattca 54741326  T
Q  257 cacttg 262  Q
    ||||||    
T  54741327 cacttg 54741332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 36572136 - 36572020
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||  ||||||||||    
T  36572136 gagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggac 36572037  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  36572036 atataactcacacttgt 36572020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 258
Target Start/End: Original strand, 11348399 - 11348478
Alignment:
Q  179 ggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 258  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11348399 ggcaatgaatatatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactcaca 11348478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 34004624 - 34004737
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  | |||| ||||| ||||| |||    
T  34004624 gagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg-aatgagtttatgggtcctcttacttataagttgttcaacctttagtttt-tatcatatgtgtgac 34004721  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  34004722 atataactcacacttg 34004737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 36608700 - 36608815
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||| |||||| |||||| | ||| ||||| |  ||| || |||| ||||| ||||    
T  36608700 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatggatcctcttacttatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggac 36608799  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  36608800 atataactcacacttg 36608815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3341236 - 3341130
Alignment:
Q  156 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 255  Q
    ||||||||||||||||| |||    ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| || ||||  ||||||||||||||||||    
T  3341236 cacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttacttataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactc 3341137  T
Q  256 acacttg 262  Q
    |||||||    
T  3341136 acacttg 3341130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 210
Target Start/End: Original strand, 23817690 - 23817783
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 210  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  23817690 acatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttacttataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 50459868 - 50459724
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| ||||||||  |  |||| ||||||| ||||||| ||||||||  || |    
T  50459868 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttacttataagatgtt 50459769  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 261  Q
    ||||||  ||| || || | ||||||| |||||||||||||||||    
T  50459768 caacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 222
Target Start/End: Original strand, 22028384 - 22028483
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  22028384 aggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttactaataaggtgttcaacct 22028483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 231
Target Start/End: Original strand, 41603270 - 41603314
Alignment:
Q  187 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41603270 gtttatgggtcttctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 41603314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 44620485 - 44620362
Alignment:
Q  134 caaccacacaagcgagagacgc--cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    ||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| ||| |||||||  ||| ||     
T  44620485 caaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggctctcttatttataaggtgttcaacctttactgttt 44620386  T
Q  232 tatcagatgtgggacatataactc 255  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  44620385 tatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 44621111 - 44621011
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||| |||| ||||    
T  44621111 ccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaact 44621012  T
Q  255 c 255  Q
    |    
T  44621011 c 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 254
Target Start/End: Original strand, 54343017 - 54343147
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||       ||||||||| |||||||| ||| |    
T  54343017 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctcttacttataaggtgtt 54343109  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  54343110 caacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 4390140 - 4390255
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| | | | || |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||||     
T  4390140 gagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggat 4390239  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    || |||||||||||||    
T  4390240 atgtaactcacacttg 4390255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 16889575 - 16889690
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||  |||||| |||||||| ||  |||||||  ||||||||||| ||| || |||    
T  16889575 gagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagac 16889674  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  16889675 atataactcacacttg 16889690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43174624 - 43174507
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccact-tttctatcagatgtggga 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  ||  ||  ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||| |||||| |     
T  43174624 gagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatgtgtcctcttacttataaggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtgg 43174525  T
Q  246 catataactcacacttgt 263  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43174524 catataactcacacttgt 43174507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20825945 - 20825837
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |   |||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||| ||||||||||    
T  20825945 ccacactcttacccaaaaccttaaggctaaaggtttatgggtgctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataact 20825846  T
Q  255 cacacttgt 263  Q
    |||| ||||    
T  20825845 cacatttgt 20825837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 258
Target Start/End: Original strand, 6975495 - 6975606
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |  ||||  |||||| ||||||| ||||||||  |  |||||||  ||| || |||| |||||| |||    
T  6975495 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatgtgagac 6975594  T
Q  247 atataactcaca 258  Q
    ||||||||||||    
T  6975595 atataactcaca 6975606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 210
Target Start/End: Original strand, 18932788 - 18932851
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 210  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  18932788 gagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttatttataa 18932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20826334 - 20826223
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||  ||  ||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||||||    
T  20826334 gagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataacgtgttcaacttttactattttatccgatgtgggac 20826235  T
Q  247 atataactcaca 258  Q
    ||||||||||||    
T  20826234 atataactcaca 20826223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 54108678 - 54108540
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatg-agtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacc 221  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||    
T  54108678 aggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttacttataaggtgttcaacc 54108579  T
Q  222 tccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |  ||| || ||||  || ||||||  ||||||||||||||    
T  54108578 tttactattttatcctatatgggac--ataactcacacttg 54108540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29802637 - 29802576
Alignment:
Q  168 caaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttt 229  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  29802637 caaaaccttaaggcattgggtttatgggtcctctcagttgtcaagtgctcaacctccacttt 29802576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 262
Target Start/End: Original strand, 49076521 - 49076602
Alignment:
Q  181 caatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  49076521 caatgggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttg 49076602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 192
Target Start/End: Original strand, 11706584 - 11706628
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttat 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  11706584 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttat 11706628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504759
Alignment:
Q  120 catctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctct 201  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||   ||||||||||||||    
T  19504842 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctct 19504759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 262
Target Start/End: Original strand, 7147721 - 7147795
Alignment:
Q  187 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||| | |||||||||||||    
T  7147721 gtttacgggtcctctcactta-aaagtgttcaacctccacttttctaagcaatgtgagacttctaactcacacttg 7147795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 251
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017845
Alignment:
Q  156 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  | ||||| |  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||| |||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatata 54017845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3271895 - 3271841
Alignment:
Q  156 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 210  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  3271895 cacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctcttacttataa 3271841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11197343 - 11197293
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtc 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||    
T  11197343 gagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 11197293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12197438 - 12197380
Alignment:
Q  204 cttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  12197438 cttataaagtattgaaccttcacttttctatttgatgtgggacctataactcacacttg 12197380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Original strand, 31249937 - 31249985
Alignment:
Q  187 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatc 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  31249937 gtttatgggtcctctaacttataaagtgttcaacattcacctttctatc 31249985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 262
Target Start/End: Original strand, 36568595 - 36568723
Alignment:
Q  134 caaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| |  |||||||||    
T  36568595 caaccacacaagagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttacgggtcatctcacttataaggtgttcaacttttacttttcta 36568694  T
Q  234 tcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  36568695 tccgatgtgggacatataactcacacttg 36568723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31509708 - 31509625
Alignment:
Q  179 ggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31509708 ggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttg 31509625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 18603131 - 18603276
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  18603131 acatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 18603230  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18603231 caacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 18603276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Original strand, 36521919 - 36522052
Alignment:
Q  131 gagcaaccacacaa--gcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactt 228  Q
    ||||||||||||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||    
T  36521919 gagcaaccacacaaatgagagagatgacacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaactt 36522018  T
Q  229 ttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36522019 ttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 36522052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Original strand, 1028558 - 1028674
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1028558 gagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggac 1028657  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  1028658 atataactcacacttgt 1028674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 299605 - 299491
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||||||    
T  299605 agagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggaca 299506  T
Q  248 tataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||||    
T  299505 tataactcacacttg 299491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 40296326 - 40296471
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  40296326 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 40296425  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||   || || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40296426 caaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 40296471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 262
Target Start/End: Original strand, 13415777 - 13415916
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  13415777 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 13415876  T
Q  223 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
      |||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13415877 ttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttg 13415916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26074729 - 26074613
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||| ||| ||    
T  26074729 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaac 26074630  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  26074629 atataactcacacttgt 26074613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31509849 - 31509745
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaa-ccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtggga 245  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31509849 gagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgaga 31509750  T
Q  246 catat 250  Q
    |||||    
T  31509749 catat 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 258
Target Start/End: Original strand, 9498695 - 9498806
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||||||| |||||| |||    
T  9498695 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagac 9498794  T
Q  247 atataactcaca 258  Q
    ||||||||||||    
T  9498795 atataactcaca 9498806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Original strand, 34753036 - 34753182
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||| |    
T  34753036 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttataaggtgtt 34753135  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    |||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34753136 caacttttacttttctatccaatgtgggacatataacttacatttgt 34753182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32487540 - 32487396
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| |    
T  32487540 acatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat-aggtgtt 32487442  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32487441 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 32487396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Original strand, 36492228 - 36492373
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||   || |||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  36492228 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttacttataaggtgtt 36492327  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36492328 caacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 36492373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 261
Target Start/End: Original strand, 36522278 - 36522392
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||  ||||| |||    
T  36522278 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgagac 36522377  T
Q  247 atataactcacactt 261  Q
    |||||||||||||||    
T  36522378 atataactcacactt 36522392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6224305 - 6224197
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| || |||||||||||||||    
T  6224305 ccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataact 6224206  T
Q  255 cacacttgt 263  Q
    |||||||||    
T  6224205 cacacttgt 6224197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41170775 - 41170640
Alignment:
Q  125 aggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  41170775 aggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacct 41170676  T
Q  223 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 258  Q
      ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41170675 ttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 41170640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 26074187 - 26074302
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| || ||| | ||| |||||||  |||||| |||| |||||| |||    
T  26074187 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgtgac 26074286  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  26074287 atataactcacacttg 26074302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41632899 - 41632784
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||   ||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||    
T  41632899 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagac 41632800  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    |||||||| |||||||    
T  41632799 atataacttacacttg 41632784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 3622795 - 3623035
Alignment:
Q  13 attctttgtcaagaagactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgaggga 112  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||| || || ||  ||||    
T  3622795 attctttgtcaagaaaacttttgacacaaggagtcggtcgaacccttcgtcgaacctcaactctgataccattgttgggtcatgagggaagccctgggga 3622894  T
Q  113 ccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcg--agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 210  Q
    ||||  ||||| ||| ||| |||||||||| || |  ||||||| |||||||||||| |||| |||  ||||        |||| | || |||||||||     
T  3622895 ccacccacatccagg-cagggcaaccacactagtgacagagacgtcacactcttacctaaaa-cttaaggca--------atggattctttcacttatag 3622984  T
Q  211 agtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 261  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  3622985 agtgttcaacttccacttttctatccgatttaagacatataactcacactt 3623035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6500597 - 6500453
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||| |||||||| ||| |    
T  6500597 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaaaggtcctcttacttataaggtgtt 6500498  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6500497 caacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttg 6500453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Original strand, 26075202 - 26075319
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactctt-acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtggga 245  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||| ||    
T  26075202 gagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgaga 26075301  T
Q  246 catataactcacacttgt 263  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  26075302 catataaatcacacttgt 26075319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Original strand, 42405609 - 42405753
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctca 218  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||| ||||| | |||| ||| ||| |||    
T  42405609 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtccttttacttgtaaggtgttca 42405708  T
Q  219 acctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    ||||  ||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42405709 acctttactattttatccgatgttggacatataactcacacttgt 42405753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6500939 - 6500825
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| ||||    
T  6500939 gagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtccttttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggac 6500841  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  6500840 atataactcacacttg 6500825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25328052 - 25327938
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||| ||||    
T  25328052 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggac 25327953  T
Q  247 atataactcacactt 261  Q
    |||||||||||||||    
T  25327952 atataactcacactt 25327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 263
Target Start/End: Original strand, 26074802 - 26074939
Alignment:
Q  129 cagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactctt-acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctcca 225  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||  |    
T  26074802 cagagcaaccacacttgcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaaccttta 26074901  T
Q  226 cttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26074902 ctcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgt 26074939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 624313 - 624198
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||   |||||||||    
T  624313 gagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatgggtcatcttacttataacgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggac 624214  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  624213 atataactcacacttg 624198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 3295056 - 3295170
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  3295056 gagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 3295155  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    |||| |||||||||||    
T  3295156 atat-actcacacttg 3295170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15370216 - 15370101
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||  |||||||||||||| ||||||||  || |||||||  ||| || |||  ||||||||||    
T  15370216 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggac 15370117  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  15370116 atataactcacacttg 15370101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Original strand, 24489248 - 24489360
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||||  ||| ||| |||| ||| | |||||   |||||||||| |||||||||||    
T  24489248 agagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatgggt--tcttactaataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggaca 24489345  T
Q  248 tataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||||    
T  24489346 tataactcacacttg 24489360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 262
Target Start/End: Original strand, 27502062 - 27502192
Alignment:
Q  134 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 231  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||| |||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||  ||| ||     
T  27502062 caaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactattt 27502161  T
Q  232 tatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27502162 tatccaatgtgggacatataactcacacttg 27502192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 35150123 - 35150009
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  | |||||  |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  35150123 gagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtc-tcttacttataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggac 35150025  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  35150024 atataactcacacttg 35150009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 261
Target Start/End: Original strand, 3295356 - 3295498
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  3295356 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 3295454  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 261  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3295455 caacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacactt 3295498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Original strand, 11417027 - 11417128
Alignment:
Q  156 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||| |||||||||||    
T  11417027 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactc 11417126  T
Q  256 ac 257  Q
    ||    
T  11417127 ac 11417128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33747888 - 33747783
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  33747888 gagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttataaagtatttaacctttactattttatccgatgtgggac 33747789  T
Q  247 atataa 252  Q
    ||||||    
T  33747788 atataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38427664 - 38427553
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||  || ||||||||||| ||||||||  || |||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  38427664 gagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctct-acttataagatgttcaacctttacttttctatccaatgtgggac 38427566  T
Q  247 atataactcacac 259  Q
    |||||||||||||    
T  38427565 atataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 623935 - 623820
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||| ||  || |||| ||||||| |||||||  ||| || |||| |||||| |||    
T  623935 gagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttacttgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagac 623836  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  623835 atataactcacacttg 623820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 12662701 - 12662808
Alignment:
Q  155 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 254  Q
    |||||||||||||||||| |||  | |||||  |||||||||  ||| ||||||||| || |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  12662701 ccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttacttataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 12662800  T
Q  255 cacacttg 262  Q
    ||||||||    
T  12662801 cacacttg 12662808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26074395 - 26074320
Alignment:
Q  187 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26074395 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 26074320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 26590951 - 26591066
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||| ||  ||| ||| ||    
T  26590951 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttcgattcgatatggaac 26591050  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    || ||| |||||||||    
T  26591051 atttaaatcacacttg 26591066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 29549296 - 29549411
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||  ||| || |||| ||| ||| ||    
T  29549296 gagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttactattttatctgatatggaac 29549395  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  29549396 atataactcacacttg 29549411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15370519 - 15370446
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaac 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  15370519 gagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 15370446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 261
Target Start/End: Original strand, 9510601 - 9510675
Alignment:
Q  187 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||    
T  9510601 gtttatggctcctctcacttataaatgactcaacctccacttttctattcaatgtgaaacatataactcacactt 9510675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 263
Target Start/End: Original strand, 36527199 - 36527240
Alignment:
Q  222 tccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36527199 tccacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgt 36527240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2411114 - 2411010
Alignment:
Q  157 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactca 256  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||  || ||||| |  |||| ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  2411114 acactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgggttctcttacttacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactca 2411015  T
Q  257 cactt 261  Q
    |||||    
T  2411014 cactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19275683 - 19275558
Alignment:
Q  110 ggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactta 207  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||  | |||||| |||||||||| |||  ||||    
T  19275683 ggaccgctcacatccaggcca-agcagccaaacaagcgagacagacgccacaatcttacccaaaatcttaagacaatgaatttatgggtcttcttcctta 19275585  T
Q  208 taaagtgctcaacctccacttttctatc 235  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19275584 t-aagtgttcaacctctacttttctatc 19275558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 233
Target Start/End: Original strand, 6557471 - 6557513
Alignment:
Q  191 atgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6557471 atggatcctctcacttataaagtgctcaacctacacttttcta 6557513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32446002 - 32445916
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 233  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||||    
T  32446002 gagagacaccacactttaacccaaaaccttaaggcgttgggtttatgggtcctctcacttgtaaagtgcaccacctcctcttctcta 32445916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508613
Alignment:
Q  169 aaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 263  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |  || | |||||  ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttgt 42508613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13042656 - 13042606
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtc 197  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  13042656 gagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 13042606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 207
Target Start/End: Original strand, 36527054 - 36527196
Alignment:
Q  71 ggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctagg----ccagagcaaccacacaagcgagagacgc--cacactctt 164  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| |||  |||||||||    | ||| || ||||||||| ||||||  |  |||||||||    
T  36527054 ggctctgataccattgttgggtcacgaagggagcccggtggatcacccacatctaggtgagcaagaacagccacacaagtgagagagacagcacactctt 36527153  T
Q  165 acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactta 207  Q
    | |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36527154 atccaaaatcttaaggcaatgcgtttatggatcctctcactta 36527196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 222
Target Start/End: Original strand, 6557098 - 6557163
Alignment:
Q  157 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 222  Q
    ||||| |||||||| |||||| | |||||| |||||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  6557098 acacttttacccaacaccttgagacaatgaatttatgagttctctcgcttgtaaagtgctcaacct 6557163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 264
Target Start/End: Original strand, 558 - 672
Alignment:
Q  150 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || || | |||||||||||||    
T  558 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacata 657  T
Q  250 taactcacacttgtg 264  Q
    |||||||||||||||    
T  658 taactcacacttgtg 672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 262
Target Start/End: Original strand, 230 - 298
Alignment:
Q  194 ggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  230 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39705 - 39459
Alignment:
Q  15 tctttgtcaagaagactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggacc 114  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||  | ||||| | | || ||     
T  39705 tctttgtctataagactttcgacacaaggagatggtcgaacccttcgtcgaacctcggctctgataccactgttgggtcactaggggagccaggggaact 39606  T
Q  115 acttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgcca-cactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaa 211  Q
    ||  ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||   |||||| | |||||||||||||||     
T  39605 acccacatc-aggc-agatcaaccacacaagcaagagagacgccaacacttttacccaaaac-ttaaggcaacatgtttatagttcctctcacttataag 39509  T
Q  212 gtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    | | |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||    
T  39508 gagttcaacctccacttttctatgcg-tgtgagacatataactcacacttg 39459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39903 - 39840
Alignment:
Q  199 tctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39903 tctcacttataaagagtccaaccaccacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 39840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5474 - 5359
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||||||| ||||||| ||    
T  5474 gagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtggaac 5375  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    ||||||||||||||||    
T  5374 atataactcacacttg 5359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5129 - 4984
Alignment:
Q  119 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 216  Q
    ||||| |||| ||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | | ||||||||  |  |    
T  5129 acatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataagatatt 5030  T
Q  217 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
     |||||  ||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||||    
T  5029 aaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttg 4984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1263
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||| || ||||  |||||||||    
T  1147 gagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctttttcttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggac 1246  T
Q  247 atataactcacacttgt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  1247 atataactcacacttgt 1263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 210
Target Start/End: Original strand, 1732 - 1795
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 210  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1732 gagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataa 1795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5862 - 5779
Alignment:
Q  179 ggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5862 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttg 5779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5514 - 5398
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttgggg-caatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtggga 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||   | ||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| |||    
T  5514 gagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtagga 5415  T
Q  246 catataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||||||    
T  5414 catataactcacacttg 5398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Original strand, 17496 - 17612
Alignment:
Q  148 agagacgccacactcttacccaaaa--ccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtggga 245  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||  ||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||  ||| || |||| |||||| ||    
T  17496 agagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtga 17595  T
Q  246 catataactcacacttg 262  Q
    |||||||||||||||||    
T  17596 catataactcacacttg 17612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 264
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10269
Alignment:
Q  187 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgtg 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||  || |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttgtg 10269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3172 - 3109
Alignment:
Q  170 aaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 233  Q
    |||||||  |||||||||||||| | | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  3172 aaaccttaaggcaatgagtttattgatgctctcacttataaagtgtataacctccacttttcta 3109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 47477 - 47362
Alignment:
Q  147 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 246  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||| |||| ||  ||| || |||| |||||| |||    
T  47477 gagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttacttataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagac 47378  T
Q  247 atataactcacacttg 262  Q
    || ||| |||||||||    
T  47377 atttaattcacacttg 47362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University