View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1461_high_13 (Length: 338)

Name: NF1461_high_13
Description: NF1461
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1461_high_13
NF1461_high_13
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (15-327)||(36162647-36162959)
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (15-292)||(30078770-30079047)
chr8 (15-311)||(26034648-26034944)
chr8 (35-316)||(25895438-25895719)
chr8 (35-308)||(20507324-20507597)
chr8 (15-308)||(25030719-25031012)
chr8 (102-307)||(26038611-26038816)
chr8 (51-311)||(25924138-25924398)
chr8 (14-99)||(24525629-24525714)
chr8 (105-188)||(4409987-4410070)
chr8 (136-188)||(24951709-24951761)
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (20-304)||(45795041-45795325)
chr3 (15-304)||(45793767-45794056)
chr3 (18-256)||(45795389-45795630)
chr3 (18-254)||(45794120-45794359)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (36-308)||(17773012-17773285)
chr4 (110-187)||(46839732-46839809)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 327
Target Start/End: Original strand, 36162647 - 36162959
Alignment:
Q  15 aggaggaaccaccaccattgagaacatggcagccggagtcaacaacagtttctcaatgtctcaaatctcacttgacatatattcatttagaagggtatca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36162647 aggaggaaccaccaccattgagaacatggcagccggagtcaacaacagtttctcaatgtctcaaatctcacttgacatatattcatttagaagggtatca 36162746  T
Q  115 aggacttgaagatgagctgacatttgctgaatatattttgcggaacggacttgttttgaagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36162747 aggacttgaagatgagctgacatttgctgaatatattttgcggaacggactttttttgaagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaaag 36162846  T
Q  215 gacaaggactgctctctcaaaagattaactgacataccaaggggctctatcatgtgtcaacttgaatttgacccagctgtatctccttaaggtgaaacct 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36162847 gacaaggactgctctctcaaaagattaactgacataccaaggggctctatcatgtgtcaacttgaatttgacccagctgtatctccttaaggtgaagcct 36162946  T
Q  315 cttgctgtccttt 327  Q
    |||||||||||||    
T  36162947 cttgctgtccttt 36162959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Original strand, 30078770 - 30079047
Alignment:
Q  15 aggaggaaccaccaccattgagaacatggcagccggagtcaacaacagtttctcaatgtctcaaatctcacttgacatatattcatttagaagggtatca 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  30078770 aggaggaaccacgaccattgagaacatgggagccagagtcaacaacagtttttgaatgtctcaaatcccacctgacttatattcacatagaaggatatca 30078869  T
Q  115 aggacttgaagatgagctgacatttgctgaatatattttgcggaacggacttgttttgaagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaaaa 214  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30078870 aggattggaagatgagctggcatttgctgactatattttgcggaacggacttgtattgaagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaaca 30078969  T
Q  215 gacaaggactgctctctcaaaagattaactgacataccaaggggctctatcatgtgtcaacttgaatttgacccagct 292  Q
     ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  ||| ||||| ||||||||||||||    
T  30078970 aacaagtattgttctctcaaaagattaactgacataccaaagggctctgttacatgtgaacttaaatttgacccagct 30079047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Original strand, 26034648 - 26034944
Alignment:
Q  15 aggaggaaccaccaccattgagaacatggcagccggagtcaacaacagtttctcaatgtctcaaatctcacttgacatatattcatttagaagggtatca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  26034648 aggaggaaccaccaccattgagaacatggcaactgaagtcaacaacagtttctgaatgtctcaaatcccacctgacctatgttcacatagaagggtatca 26034747  T
Q  115 aggacttgaagatgagctgacatttgctgaatatattttgcggaacggacttgttttgaagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaaaa 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||      
T  26034748 aggacttgaatatgagctgacatttgctgaatatattttgcagaacggacttgttttgaggacaatgttaatttttgttgatagtttaatggacaaaacg 26034847  T
Q  215 gacaaggactgctctctcaaaagattaactgacataccaaggggctctatcatgtgtcaacttgaatttgacccagctgtatctccttaaggtgaaa 311  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  | ||| ||| ||||||| |||  || |||||| | || |||||| |||||||  | ||||||||||    
T  26034848 gacaaggaatgttctctcaaaagattaacaaatatatcaaagggctctgtcacttgccaacttaagttcgacccaactgtatcctcataaggtgaaa 26034944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25895719 - 25895438
Alignment:
Q  35 agaacatggcagccggagtcaacaacagtttctcaatgtctcaaatctcacttgacatatattcatttagaagggtatcaaggacttgaagatgagctga 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |    
T  25895719 agaacatggcagccagagtcaacaacggttcctgaatgtctcaaatcccacctgacctatattcacatagaaggatatcaaggatttgaagacgagctta 25895620  T
Q  135 catttgctgaatatattttgcggaacggacttgttttgaagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaaaagacaaggactgctctctcaa 234  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||   | ||| |    ||| ||||    
T  25895619 catttgctgaatatcttctgaggaacggacttgttttgcaaacaatgcttatttttgttgatacttcaatgcacacaacgaataagtatctttctgtcaa 25895520  T
Q  235 aagattaactgacataccaaggggctctatcatgtgtcaacttgaatttgacccagctgtatctccttaaggtgaaacctct 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  25895519 aagattaactgatataccaaggggctctgtcacctgccaacttaaatttgacccagccgtctctctttaaggtgaaaactct 25895438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Original strand, 20507324 - 20507597
Alignment:
Q  35 agaacatggcagccggagtcaacaacagtttctcaatgtctcaaatctcacttgacatatattcatttagaagggtatcaaggacttgaagatgagctga 134  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| ||||| || |||||||  |||| ||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  20507324 agaacatgggagccaaagtcaacatcagttcctaaatgtcttgaatcccacctgacctatattcatatagaaggatatcaaggatttgaagatgagctgg 20507423  T
Q  135 catttgctgaatatattttgcggaacggacttgttttgaagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaaaagacaaggactgctctctcaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  | |||||||| |||||| | |||| ||||||||||  |  | ||||| |||| ||| ||||    
T  20507424 catttgctgaatatattttgcgtaacggaattgttttacacacaatgctcatttttttcgatacttcaatggacctatcaaacaagaactgttctatcaa 20507523  T
Q  235 aagattaactgacataccaaggggctctatcatgtgtcaacttgaatttgacccagctgtatctccttaaggtg 308  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  20507524 aagcttaactgatataccaaggggctctgtcacatgccaacttaaatttgactcagctgtgtcttcataaggtg 20507597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25031012 - 25030719
Alignment:
Q  15 aggaggaaccaccaccattgagaacatggcagccggagtcaacaacagtttctcaatgtctcaaatctcacttgacatatattcatttagaagggtatca 114  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||| | ||||||  ||||||| |||||    
T  25031012 aggaggaaccatcacttttaagaacatgggagccaaagtcaacaacagttcctaaatgtttcaaatcccacctgacctttattcacatagaaggatatca 25030913  T
Q  115 aggacttgaagatgagctgacatttgctgaatatattttgcggaacggacttgttttgaagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaaaa 214  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||||||  ||||| | ||||  |||||||||  ||      
T  25030912 aggatttgaagatgagctggcatttgctgaatatgttttgcagaacggacttgttttacacacaatgctcgtttttttcgatacatcaatggacctaact 25030813  T
Q  215 gacaaggactgctctctcaaaagattaactgacataccaaggggctctatcatgtgtcaacttgaatttgacccagctgtatctccttaaggtg 308  Q
     ||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  25030812 aacaagaactgttctatcagaagattaactgatataccaaggggctctgtcacatgccaacttaaatttgattcagctgtgtctccataaggtg 25030719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 307
Target Start/End: Original strand, 26038611 - 26038816
Alignment:
Q  102 tagaagggtatcaaggacttgaagatgagctgacatttgctgaatatattttgcggaacggacttgttttgaagacaatgcttatttttgttgatatttc 201  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26038611 tagaaggatatcaaggatttgaagacgagctgacatttgccgaatttattttgcgtaacggacttgttttggagacaatgcttatttttgttgacatttc 26038710  T
Q  202 aatggacaaaaaagacaaggactgctctctcaaaagattaactgacataccaaggggctctatcatgtgtcaacttgaatttgacccagctgtatctcct 301  Q
    | |||||| || | ||||| || | ||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||  || |||||| | |||||  ||| ||  ||||||    
T  26038711 attggacataacaaacaagtaccgttctatcaaaagattaacaaatataccaaggggctctgtcacttgccaacttaactttgatgcagatgggtctcct 26038810  T
Q  302 taaggt 307  Q
    ||||||    
T  26038811 taaggt 26038816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 311
Target Start/End: Original strand, 25924138 - 25924398
Alignment:
Q  51 agtcaacaacagtttctcaatgtctcaaatctcacttgacatatattcatttagaagggtatcaaggacttgaagatgagctgacatttgctgaatatat 150  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||| | || ||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25924138 agtcaataacagttcctggatgtctcaaatcccacctaacctatattcagatagaaggatatcaaggatgtgaagatgagttggcatttgctgaatatat 25924237  T
Q  151 tttgcggaacggacttgttttgaagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaaaagacaaggactgctctctcaaaagattaactgacata 250  Q
    ||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||| |||  ||||||||||  || | | ||| | || ||| |||||||||||  ||| ||     
T  25924238 tttgcggaatggacttgttttggaggcgatgcttatttatgtcgatgcttcaatggacccaacaaataagtattgttctgtcaaaagattacttgaaatt 25924337  T
Q  251 ccaaggggctctatcatgtgtcaacttgaatttgacccagctgtatctccttaaggtgaaa 311  Q
    || |||||||||  || ||| ||  ||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25924338 cccaggggctctgccaagtgccagattagatttgacccagccgtatcttcttaaggtgaaa 25924398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 24525629 - 24525714
Alignment:
Q  14 caggaggaaccaccaccattgagaacatggcagccggagtcaacaacagtttctcaatgtctcaaatctcacttgacatatattca 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  24525629 caggaggaacaaccaccattgagaacatggcagccggagtcaacaagagtttctgaatgtctcaagtcccacctgacctatattca 24525714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Original strand, 4409987 - 4410070
Alignment:
Q  105 aagggtatcaaggacttgaagatgagctgacatttgctgaatatattttgcggaacggacttgttttgaagacaatgcttattt 188  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  4409987 aaggctatcaaggacttccagatgagttgttatttgttgagtatattttgcgaaatggatttgctttgaagacaatggttattt 4410070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24951761 - 24951709
Alignment:
Q  136 atttgctgaatatattttgcggaacggacttgttttgaagacaatgcttattt 188  Q
    ||||||||  ||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24951761 atttgctggttatgttttgcagtatggacttgttttgaagacaatgcttattt 24951709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Original strand, 45795041 - 45795325
Alignment:
Q  20 gaaccaccaccattgagaacatggcagccggagtcaacaacagtttctcaatgtctcaaatctcacttgacatatattcatttagaagggtatcaaggac 119  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||   | ||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| ||| || |  ||||||| |||||| |||    
T  45795041 gaaccaccaccattggggacatgacatgtgaagtcaacaacaatttttgaatgtctcaaatcccacttgacctatgtttacatagaaggatatcaaagac 45795140  T
Q  120 ttgaagatgagctgacatttgctgaatatattttgcggaacggacttgttttgaagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaaaagacaa 219  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||   |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  45795141 ttgaagatgaaatgatatttgctgaatatattttgtggaacatgcaagtttggaagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaatggacaa 45795240  T
Q  220 ggactgctctctcaaaagattaactgacataccaaggggctctatcatgtgtcaacttgaatttgacccagctgtatctccttaa 304  Q
     || || |||||  |||||||| || |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||    
T  45795241 tgattgttctcttcaaagattatctaacatgctaaggggctctatcaagtgtcaacttaaatttaaccctgatgtatcttcttaa 45795325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 304
Target Start/End: Original strand, 45793767 - 45794056
Alignment:
Q  15 aggaggaaccaccaccattgagaacatggcagccggagtcaacaacagtttctcaatgtctcaaatctcacttgacatatattcatttagaagggtatca 114  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||||| |||   ||||||||||||  |||||||| | | || |  ||||||| |||||    
T  45793767 aggatgaaccaccaccattgaggacatggcatgtgaagtcaacaacaattttcgaatgtctcaaattccacttgacctttgtttacatagaaggatatca 45793866  T
Q  115 aggacttgaagatgagctgacatttgctgaatatattttgcggaacggacttgttttgaagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaaaa 214  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||   |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  45793867 aagacttgaagatgagttgatatttgctgaatatattttgtggaacatgcaagtttggaagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaatg 45793966  T
Q  215 gacaaggactgctctctcaaaagattaactgacataccaaggggctctatcatgtgtcaacttgaatttgacccagctgtatctccttaa 304  Q
    | ||| ||||| ||| | ||||||||| || ||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  | ||||||| |||||    
T  45793967 ggcaatgactgttcttttaaaagattatctaacatgataaggggctctatcaagtgtcaacttaaatttaaccatgatgtatcttcttaa 45794056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45795630 - 45795389
Alignment:
Q  18 aggaaccaccaccattgagaacatggcagccggagtcaacaacagtttctcaatgtctcaaatctcacttgacatatattcatttagaagggtatcaagg 117  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||   ||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||  ||| ||||  ||||||| |||||||     
T  45795630 aggaaccgccaccatcaagaacatggcagttagagtcaacaactgttttcaaatgtctcaaatcccacttgaactatgttcacatagaaggatatcaaga 45795531  T
Q  118 acttgaagatgagctgacatttgctgaatatattttgcggaacggacttgttttg---aagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||      
T  45795530 acttgaagatgaggtgtcatttgccgaatatattttgcggagcatacttgttttgaagaagacaatgcttatttttgttgataattcgatgaacaaaatg 45795431  T
Q  215 gacaaggactgctctctcaaaagattaactgacataccaagg 256  Q
    |||||| ||   ||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  45795430 gacaagaaccattctctaaaaagattaactaacacaccaagg 45795389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 45794359 - 45794120
Alignment:
Q  18 aggaaccaccaccattgagaacatggcagccggagtcaacaacagtttctcaatgtctcaaatctcacttgacatatattcatttagaagggtatcaagg 117  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||   ||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||     
T  45794359 aggaaccgccaccatcaagaacatgacagttagagtcaacaaccgttttcgaatgtctcaaatcccacttgacctatgttcacatagaaggatatcaaga 45794260  T
Q  118 acttgaagatgagctgacatttgctgaatatattttgcggaacggacttgttttg---aagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  45794259 acttgaagatgatgtgtcatttgccgaatatattttggggagcatacttgttttgaagaagacaatgcttatttttgttgataattcaatggacaaaatg 45794160  T
Q  215 gacaaggactgctctctcaaaagattaactgacataccaa 254  Q
    |||||| ||   | ||| |||||||||||| ||| |||||    
T  45794159 gacaagaaccattatcttaaaagattaactaacacaccaa 45794120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 308
Target Start/End: Original strand, 17773012 - 17773285
Alignment:
Q  36 gaacatggcagccggagtcaacaacagtttctcaatgtctcaaatctcacttgacatatattcatttagaagggtatcaaggacttgaag-atgagctga 134  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| ||||  |  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| | || |||     
T  17773012 gaacatgggagccaaagtcaacaatagttcctaaatgtctcgaatccaatctgacatatattcacatagaaggatatcaaggatttgaaggaggacctgg 17773111  T
Q  135 catttgctgaatatattttgcggaacggacttgttttgaagacaatgcttatttttgttgatatttcaatggacaaaaaagacaaggactgctctctcaa 234  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||| |||||||||   ||   ||||| |  | || |||||    
T  17773112 catttgctgaatatatcttgcgtaacggacttgttttgcacacaatgcttatatttttcgatacttcaatggatctaactaacaagtatcgttccctcaa 17773211  T
Q  235 aagattaactgacataccaaggggctctatcatgtgtcaacttgaatttgacccagctgtatctccttaaggtg 308  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||  || |||| |||||||||||||    
T  17773212 aagattaaccgatataccaaggggctctgtcacatgccaacttaaatttgattcaactgtgtctccttaaggtg 17773285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 46839809 - 46839732
Alignment:
Q  110 tatcaaggacttgaagatgagctgacatttgctgaatatattttgcggaacggacttgttttgaagacaatgcttatt 187  Q
    ||||||||||||  |||||||||   ||||| ||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  46839809 tatcaaggacttccagatgagctattatttgttgagtatattttgaaaaaaggacttgttttgaagacaatgattatt 46839732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University