View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14621_high_1 (Length: 392)

Name: NF14621_high_1
Description: NF14621
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14621_high_1
NF14621_high_1
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (1-392)||(49975909-49976300)
chr4 (271-392)||(24287564-24287686)
chr4 (266-392)||(10733810-10733936)
chr4 (266-392)||(10947579-10947705)
chr4 (271-392)||(6257665-6257786)
chr4 (271-392)||(10739797-10739918)
chr4 (271-392)||(10953566-10953687)
chr4 (274-392)||(4631955-4632074)
chr4 (266-392)||(26957264-26957390)
chr4 (266-392)||(48166751-48166877)
chr4 (271-392)||(48160537-48160658)
chr4 (266-389)||(50168167-50168291)
chr4 (271-392)||(26972015-26972136)
chr4 (274-392)||(17627235-17627354)
chr4 (326-392)||(50426880-50426946)
chr4 (271-370)||(33461797-33461896)
chr4 (326-392)||(35177423-35177493)
chr4 (271-370)||(33458672-33458771)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (266-389)||(24927232-24927356)
chr1 (271-392)||(24964165-24964286)
chr1 (266-392)||(25381996-25382123)
chr1 (271-392)||(1077821-1077943)
chr1 (271-392)||(50305774-50305896)
chr1 (275-392)||(25275507-25275625)
chr1 (271-392)||(25387963-25388085)
chr1 (266-392)||(31057617-31057743)
chr1 (282-392)||(44409588-44409699)
chr1 (271-392)||(31051122-31051243)
chr1 (266-369)||(12184080-12184184)
chr1 (271-392)||(34739564-34739685)
chr1 (266-392)||(33458370-33458494)
chr1 (274-392)||(27954741-27954860)
chr1 (326-392)||(4280190-4280256)
chr1 (271-392)||(8093306-8093428)
chr1 (328-392)||(38152418-38152482)
chr1 (333-392)||(27396242-27396301)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (271-392)||(12801999-12802121)
chr6 (266-392)||(17581176-17581303)
chr6 (271-392)||(4580782-4580904)
chr6 (266-391)||(21191332-21191457)
chr6 (271-392)||(25343204-25343326)
chr6 (284-392)||(25353803-25353912)
chr6 (266-392)||(21771025-21771151)
chr6 (266-392)||(8651264-8651390)
chr6 (271-392)||(30906041-30906163)
chr6 (271-392)||(21197502-21197623)
chr6 (284-385)||(13007305-13007407)
chr6 (271-392)||(6096888-6097009)
chr6 (326-392)||(21783786-21783852)
chr6 (337-390)||(17900603-17900656)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (274-392)||(19060234-19060353)
chr5 (271-389)||(19066571-19066690)
chr5 (271-392)||(12692741-12692863)
chr5 (266-392)||(32094682-32094809)
chr5 (275-392)||(12686639-12686757)
chr5 (266-392)||(41296852-41296978)
chr5 (271-392)||(20499715-20499837)
chr5 (271-392)||(32097482-32097604)
chr5 (271-392)||(14609710-14609830)
chr5 (266-392)||(28525846-28525972)
chr5 (271-373)||(33753710-33753813)
chr5 (271-373)||(33849341-33849444)
chr5 (271-392)||(28531942-28532063)
chr5 (271-392)||(30384844-30384966)
chr5 (271-392)||(7390008-7390129)
chr5 (292-392)||(30771881-30771979)
chr5 (266-389)||(26509430-26509548)
chr5 (325-392)||(22647948-22648015)
chr5 (326-392)||(8706847-8706913)
chr5 (321-382)||(38548004-38548065)
chr5 (330-392)||(26318703-26318765)
chr5 (331-392)||(11640719-11640780)
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (271-392)||(1883298-1883420)
chr8 (271-392)||(36818549-36818671)
chr8 (266-392)||(32896584-32896711)
chr8 (266-392)||(5542622-5542748)
chr8 (266-392)||(32890460-32890587)
chr8 (266-384)||(17954078-17954197)
chr8 (271-392)||(42033375-42033496)
chr8 (271-392)||(42993460-42993582)
chr8 (266-392)||(39727745-39727871)
chr8 (271-392)||(9934860-9934982)
chr8 (290-392)||(10705434-10705537)
chr8 (266-392)||(14417534-14417660)
chr8 (290-390)||(10699625-10699726)
chr8 (266-392)||(22220188-22220313)
chr8 (328-392)||(39735999-39736063)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (266-392)||(11840186-11840313)
chr3 (271-392)||(10244795-10244917)
chr3 (273-392)||(42191681-42191801)
chr3 (273-392)||(42197623-42197743)
chr3 (266-392)||(10238673-10238800)
chr3 (271-392)||(17056252-17056374)
chr3 (271-392)||(26429878-26430000)
chr3 (271-392)||(55003862-55003984)
chr3 (266-392)||(10761111-10761237)
chr3 (271-392)||(10769430-10769551)
chr3 (271-392)||(11846438-11846559)
chr3 (271-392)||(30051561-30051682)
chr3 (271-392)||(23138877-23138998)
chr3 (290-392)||(28964476-28964579)
chr3 (266-392)||(38449524-38449650)
chr3 (266-392)||(49157252-49157378)
chr3 (271-392)||(38456011-38456132)
chr3 (271-392)||(49151190-49151311)
chr3 (271-392)||(8331365-8331486)
chr3 (271-375)||(9586490-9586594)
chr3 (327-392)||(17601994-17602059)
chr3 (266-389)||(24643954-24644078)
chr3 (273-392)||(8474595-8474716)
chr3 (328-392)||(53071712-53071776)
chr3 (275-392)||(2982687-2982805)
chr3 (274-392)||(34300018-34300137)
chr3 (325-388)||(52222937-52223000)
chr3 (274-392)||(12109127-12109246)
chr3 (357-392)||(46656344-46656379)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (271-392)||(36749991-36750113)
chr2 (272-392)||(23283821-23283942)
chr2 (273-392)||(13455678-13455798)
chr2 (273-392)||(13461619-13461739)
chr2 (270-392)||(23343139-23343262)
chr2 (266-392)||(35085140-35085267)
chr2 (271-392)||(19879171-19879293)
chr2 (271-392)||(35091113-35091235)
chr2 (264-392)||(30964898-30965026)
chr2 (271-392)||(31001954-31002075)
chr2 (266-392)||(35439831-35439957)
chr2 (271-392)||(13150150-13150271)
chr2 (271-392)||(44717266-44717387)
chr2 (266-392)||(28683405-28683531)
chr2 (290-392)||(35442293-35442396)
chr2 (328-392)||(31007989-31008053)
chr2 (328-392)||(7771647-7771711)
chr2 (288-389)||(38731128-38731231)
chr2 (271-318)||(11049028-11049075)
chr2 (275-349)||(25233042-25233117)
chr2 (279-350)||(16361448-16361520)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (271-392)||(5979636-5979759)
chr7 (275-392)||(28421419-28421537)
chr7 (266-392)||(26383240-26383368)
chr7 (266-392)||(351360-351486)
chr7 (271-392)||(338959-339080)
chr7 (265-392)||(35152989-35153116)
chr7 (271-392)||(3817771-3817892)
chr7 (284-392)||(8824401-8824510)
chr7 (266-392)||(35148469-35148596)
chr7 (266-392)||(3811629-3811757)
chr7 (271-392)||(5849109-5849229)
chr7 (271-392)||(43539570-43539694)
chr7 (329-392)||(30219535-30219598)
chr7 (328-392)||(22742390-22742454)
chr7 (336-392)||(26380751-26380807)
chr7 (271-336)||(18657182-18657247)
chr7 (274-354)||(38023688-38023769)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (271-392)||(6099-6221)
scaffold0208 (275-392)||(11976-12094)
[»] scaffold1114 (1 HSPs)
scaffold1114 (271-392)||(640-762)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (266-392)||(13845-13972)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (271-391)||(5544-5665)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (271-392)||(173350-173472)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (274-392)||(1648-1766)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (266-392)||(1059-1185)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (274-389)||(38008-38124)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 49975909 - 49976300
Alignment:
Q  1 atattgtgaaataaagagagtaagttgtgcctccactnnnnnnngcctataacaatttcagttctgctaatcataaatggaacaatgattttggttatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49975909 atattgtgaaataaagagagtaagttgtgcctccactaaaaaaagcctataacaatttcagttctgctaatcataaatggaataatgattttggttatgt 49976008  T
Q  101 cggtaaggtaaaataagtgcatatgttcgatcaaatgagaggattttgtaactcaaaaagaaatagagggtctgagtgagagatctaagggtggaaagta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49976009 cggtaaggtaaaataagtgcatatcttcggtcaaatgagaggattttctaactcaaaaaggaatagagggtctgagttagagatctaagggtggaaagta 49976108  T
Q  201 ttagtgtcttggcaaaatgaaagtgaaggtttctatttcaagattaagagttttggaaagaggttattggtggaatattttaatatttaattatatttca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49976109 ttagtgtcttggcaaaatgaaagtgaaggtttctattttaagattaagagttttggaaagaggttattgtttgaatattttaatatttaattatatttca 49976208  T
Q  301 ataacattatgtgggcaatatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49976209 atgacattatgtgggcaatatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 49976300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 24287564 - 24287686
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  24287564 tggaatattttattatttaataatatttcaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttataaattgtgagccttaattga 24287663  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24287664 ttagtgatcaaattaagtaataa 24287686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10733936 - 10733810
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  10733936 attgttggaatatttta-tattttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 10733838  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  10733837 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 10733810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10947705 - 10947579
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  10947705 attgttggaatatttta-tattttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 10947607  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  10947606 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 10947579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6257786 - 6257665
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  6257786 tggaatatttta-tattttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttga 6257688  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6257687 ttagtgatcaaattaagtaataa 6257665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10739918 - 10739797
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  10739918 tggaatatttta-tattttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttga 10739820  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10739819 ttagtgatcaaattaagtaataa 10739797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10953687 - 10953566
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  10953687 tggaatatttta-tattttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttga 10953589  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10953588 ttagtgatcaaattaagtaataa 10953566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 392
Target Start/End: Original strand, 4631955 - 4632074
Alignment:
Q  274 aatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggca-atatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgatta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  4631955 aatattttaatatttaattatattccgacgatattatgtgagcatatatctctatagtaattatattagttatttatcaatttgaagtcttaattgatta 4632054  T
Q  373 gtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    || |||||||||||||||||    
T  4632055 gtaatcaaattaagtaataa 4632074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26957390 - 26957264
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  26957390 attgttggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 26957292  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26957291 attaattagtgatcaaattaagtaataa 26957264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Original strand, 48166751 - 48166877
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||    
T  48166751 attgttggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggcctta 48166849  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  48166850 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 48166877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 48160537 - 48160658
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||    
T  48160537 tggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttga 48160635  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  48160636 ttagtgatcaaattaagtaataa 48160658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 266 - 389
Target Start/End: Original strand, 50168167 - 50168291
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  50168167 attgttggaatattttattatttaattatattccaataacattacgtcggaaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagtctta 50168266  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaa 389  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||    
T  50168267 attgattagtggtcaaatcaagtaa 50168291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26972136 - 26972015
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||    | |||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  26972136 tggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttaattga 26972038  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  26972037 ttagtgatcaaattaagtgataa 26972015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17627354 - 17627235
Alignment:
Q  274 aatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgatta 372  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||||||    
T  17627354 aatattttattatttaataatatttcgatatcattatgtgggaaaatatcgtaataataattatattagctatttatcgattgtgagtctgaattgatta 17627255  T
Q  373 gtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  17627254 gtgattaaattaagtaataa 17627235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 392
Target Start/End: Original strand, 50426880 - 50426946
Alignment:
Q  326 ataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50426880 ataataattatattagttatttatcaagtgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 50426946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33461896 - 33461797
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaat-atctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  33461896 tggaatattttattattta-ttatattccaatatctttatgtgggcaattatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttga 33461798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 326 - 392
Target Start/End: Original strand, 35177423 - 35177493
Alignment:
Q  326 ataataattatattagctatttattaatt-tg---gagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35177423 ataataattatattagatatttatcaattatgaacgagcattaattgattagtgatcaaattaagtaataa 35177493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33458771 - 33458672
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaat-atctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||   | ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  33458771 tggaatattttattattta-ttatattccaatatccttatgtgggcaattatcgtaacaataattatattaactatttatcaattgtgagccttagttga 33458673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24927356 - 24927232
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24927356 attgttggaatattttaatatttaattatattccaatgacattatgtgggcaaatatctctataataattatattagctatttatcaatttggagtctta 24927257  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaa 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24927256 attgattagtgatcaaattaagtaa 24927232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24964286 - 24964165
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24964286 tggaatgttttaatatt-aattatattccaatgatattatgtgggtaaatatctctataataattatattagctatttatcaatttgaagccttaattga 24964188  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24964187 ttagtgatcaaattaagtaataa 24964165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25382123 - 25381996
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  25382123 attgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 25382024  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25382023 attgattagtgatcaaattaagtaataa 25381996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 1077821 - 1077943
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  1077821 tggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattga 1077920  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1077921 ttagtgatcaaattaagtaataa 1077943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 50305774 - 50305896
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  50305774 tggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattga 50305873  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  50305874 ttagtgatcaaattaagtaataa 50305896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25275625 - 25275507
Alignment:
Q  275 atattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattag 373  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  25275625 atattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattag 25275526  T
Q  374 tgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25275525 tgatcaaattaagtaataa 25275507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25388085 - 25387963
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||    
T  25388085 tggaatattttattaattaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattatttatttatcaattgtgagccttaattga 25387986  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25387985 ttagtgatcaaattaagtaataa 25387963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Original strand, 31057617 - 31057743
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||    
T  31057617 attgttggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggcctta 31057715  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  31057716 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 31057743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 282 - 392
Target Start/End: Original strand, 44409588 - 44409699
Alignment:
Q  282 aatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaa 380  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  44409588 aatattttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgattaa 44409687  T
Q  381 attaagtaataa 392  Q
    |||| |||||||    
T  44409688 attaggtaataa 44409699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 31051122 - 31051243
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||    
T  31051122 tggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttga 31051220  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31051221 ttagtgatcaaattaagtaataa 31051243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 266 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12184184 - 12184080
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggc-aatatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  12184184 attgttggaatattttattatttaataatatttcaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagcctta 12184085  T
Q  365 attga 369  Q
    |||||    
T  12184084 attga 12184080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 34739564 - 34739685
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||    
T  34739564 tggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttataaattgagggccttagttga 34739662  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34739663 ttagtgatcaaattaagtaataa 34739685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33458494 - 33458370
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaatatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaa 365  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||| || ||||||| ||| || || |||||| ||||||| | ||||||| ||||  |||||||||    
T  33458494 attgttggaatattttattatttaattatattctgatatcagtatgtggacaa-atatc-ataatagttatattggttatttatcaattgtgagccttaa 33458397  T
Q  366 ttgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33458396 ttgattagtgatcaaattaagtaataa 33458370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 392
Target Start/End: Original strand, 27954741 - 27954860
Alignment:
Q  274 aatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaata-tctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgatta 372  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||| |||||||| | ||   ||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||    
T  27954741 aatattttattatttaattatattctgatatcattacgtgggcaaaaatcgtaatactaattatattagttatttatcaattgtgaggcttaattgatta 27954840  T
Q  373 gtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27954841 gtgatcaaattaagtaataa 27954860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4280256 - 4280190
Alignment:
Q  326 ataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4280256 ataataattatattaactatttatcaattgtgaaccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 4280190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8093428 - 8093306
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaatatctctat-aataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||   |  ||  |||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||| ||||    
T  8093428 tggaatattttattatttaattatattccaatatcattatccgggcaaatgccgtaacaataattatattagttatttatcaattgtgagtcttagttga 8093329  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||| | |||||||||||||||||    
T  8093328 ttaataatcaaattaagtaataa 8093306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 328 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 38152482 - 38152418
Alignment:
Q  328 aataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38152482 aataattatattaattatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataa 38152418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27396301 - 27396242
Alignment:
Q  333 ttatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  27396301 ttatattagttatttattaatttgaagtcttaattaattaatgatcaatttaagtaataa 27396242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12802121 - 12801999
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12802121 tggaatattttaatatttaattatattccaatgacattacgtgggcaaatatctctataataattatattagctatttgtcaatttggagccttaattga 12802022  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  12802021 ttagtgatcaatttaagtaataa 12801999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Original strand, 17581176 - 17581303
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| |    
T  17581176 attgttggaatattttattatttaattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattaactatttatcaattgtgagcctca 17581275  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17581276 attgattagtgatcaaattaagtaataa 17581303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4580904 - 4580782
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  4580904 tggaatattttattaattaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattga 4580805  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4580804 ttagtgatcaaattaagtaataa 4580782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21191457 - 21191332
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  21191457 attgttggaatattttattatttaataatattcca-tatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagcctta 21191359  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaata 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21191358 attgattagtgatcaaattaagtaata 21191332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 25343204 - 25343326
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  25343204 tggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgaaccttaattga 25343303  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  25343304 ttagtgattaaattaagtaataa 25343326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 284 - 392
Target Start/End: Original strand, 25353803 - 25353912
Alignment:
Q  284 tatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaat 382  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25353803 tatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaat 25353902  T
Q  383 taagtaataa 392  Q
    ||||||||||    
T  25353903 taagtaataa 25353912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21771151 - 21771025
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  21771151 attgttggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtggacaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 21771053  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21771052 attgattagtgatcaaattaagtaataa 21771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8651390 - 8651264
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  8651390 attgttggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtctta 8651292  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  8651291 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 8651264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30906163 - 30906041
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggc-aatatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  30906163 tggaatattttattattttattatatttcaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttagttga 30906064  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||| | ||||| |||||||||    
T  30906063 ttagtaaccaaataaagtaataa 30906041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21197623 - 21197502
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  21197623 tggaatatttttttatttaataatattcca-tatcattatgtgggtaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaactga 21197525  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21197524 ttagtgatcaaattaagtaataa 21197502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 284 - 385
Target Start/End: Original strand, 13007305 - 13007407
Alignment:
Q  284 tatttaattatatttcaataacattatgtgggcaatat-ctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaat 382  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||| | ||| |  || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13007305 tatttaattatattccaatgtcattatgtagacaaaaaactttataataattatattagttatttatcaatttggagccctaattgattaatgatcaaat 13007404  T
Q  383 taa 385  Q
    |||    
T  13007405 taa 13007407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 6096888 - 6097009
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||    | |||||||||||||  ||||| | ||||   ||||||| ||||    
T  6096888 tggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatagtaacaataattatattacttatttgtcaattgtcagccttacttga 6096986  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  6096987 ttagtgatgaaattaagtaataa 6097009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 326 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21783852 - 21783786
Alignment:
Q  326 ataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21783852 ataataattatattaactatttatcaattgtgagtcttagtggattagtgatcaaattaagtaataa 21783786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17900656 - 17900603
Alignment:
Q  337 attagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaat 390  Q
    ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17900656 attagttattgatcaatttggagtcttaattgattggtgatcaaattaagtaat 17900603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 274 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19060353 - 19060234
Alignment:
Q  274 aatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgatta 372  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  19060353 aatattttaatatttaattctatttcaatgacattatgtgggcaaatatctccataataattatattagctatttgtcaatttggagacttaattgatta 19060254  T
Q  373 gtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19060253 gtgatcaaattaagtaataa 19060234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 271 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 19066690 - 19066571
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  19066690 tggaatattttaatatttaattatattcccataatattatgtgggcaaatatctccataataattatattaattatttgtcaatctggagccttaattga 19066591  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaa 389  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19066590 ttagtgatcaaattaagtaa 19066571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12692863 - 12692741
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12692863 tggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattga 12692764  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12692763 ttagtgatcaaattaagtaataa 12692741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32094809 - 32094682
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  32094809 attgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattaactatttatcaattgtgagcctta 32094710  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32094709 attgattagtgatcaaattaagtaataa 32094682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12686757 - 12686639
Alignment:
Q  275 atattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattag 373  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  12686757 atattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattag 12686658  T
Q  374 tgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12686657 tgatcaaattaagtaataa 12686639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Original strand, 41296852 - 41296978
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  41296852 attgttggaatatttta-tattttattatattacaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 41296950  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  41296951 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 41296978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 20499715 - 20499837
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  20499715 tggaatattttattatttaattatatttcaacatcattatatggacaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagtcttaattga 20499814  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20499815 ttagtgatcaaattaagtaataa 20499837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32097604 - 32097482
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||     
T  32097604 tggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgg 32097505  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  32097504 ttagtgatcaaattaaataataa 32097482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 14609710 - 14609830
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||| || |||| ||||  |||||||||||||    
T  14609710 tggaatattttattatttaa--atattccaatatcattatgtgtgcaaatatcgtaataataattatattagttacttatcaattgtgagccttaattga 14609807  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14609808 ttagtgatcaaattaagtaataa 14609830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28525972 - 28525846
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||    
T  28525972 attgttggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggcctta 28525874  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  28525873 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 28525846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 271 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33753813 - 33753710
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  33753813 tggattattttattatttaattatatttcaatatcattatgtgggtaaatattattatcataattatattagctatttatcaatttggagctttaattga 33753714  T
Q  370 ttag 373  Q
    ||||    
T  33753713 ttag 33753710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 271 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33849444 - 33849341
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| || ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33849444 tggattattttattatttaattatatttcaatatcactatatgggtaaatatttttatcataattatattagctatttattaatttggagctttaattga 33849345  T
Q  370 ttag 373  Q
    ||||    
T  33849344 ttag 33849341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28532063 - 28531942
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||    
T  28532063 tggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttga 28531965  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28531964 ttagtgatcaaattaagtaataa 28531942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30384966 - 30384844
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||| |||    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  30384966 tggaatattttattattttattatattccgatatcattatgtggacaaatattgtaataataattatattagctatttatcagttgtgagccttaattga 30384867  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  30384866 ttagtgattaaattaagtaataa 30384844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7390129 - 7390008
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||   |  ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||    
T  7390129 tggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaacgataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagttga 7390031  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7390030 ttagtgatcaaattaagtaataa 7390008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 292 - 392
Target Start/End: Original strand, 30771881 - 30771979
Alignment:
Q  292 tatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaat 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||   ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30771881 tatatttcaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagct---tatcagttgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaat 30771977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 389
Target Start/End: Original strand, 26509430 - 26509548
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26509430 attgttggaatattttattattttattatattccattgtcattaagtgggcaaatatct-tgtaataattatattaactatttatcaatttggagcctta 26509528  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaa 389  Q
    |     |||||||||||||||||||    
T  26509529 a-----tagtgatcaaattaagtaa 26509548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22648015 - 22647948
Alignment:
Q  325 tataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22648015 tataataattatattaattatttataaatttggagtcttaattaattagttatcaaattaagtaataa 22647948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 326 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8706913 - 8706847
Alignment:
Q  326 ataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8706913 ataataattatattagctatttatcaactgtgggtcttaattgattagtgatcaaattaagtgataa 8706847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 38548004 - 38548065
Alignment:
Q  321 tctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaat 382  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38548004 tctctataatgattatattatttatttatcaactaggagacttaattgattagtgatcaaat 38548065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26318765 - 26318703
Alignment:
Q  330 taattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26318765 taattatattagttatctatcaattctgagacttaattgattagtgattaaattaattaataa 26318703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11640780 - 11640719
Alignment:
Q  331 aattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11640780 aattataatagctatttaacaattaggagttttaattgattagttatcaaattatgtaataa 11640719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1883420 - 1883298
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1883420 tggaatattttattatttaattatattccaataatattatgcgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaatttggagccttacttga 1883321  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1883320 ttagtgatcaaattaagtaataa 1883298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 36818549 - 36818671
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  36818549 tggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattga 36818648  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36818649 ttagtgatcaaattaagtaataa 36818671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Original strand, 32896584 - 32896711
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  32896584 attgttggaatgttttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 32896683  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896684 attgattagtgatcaaattaagtaataa 32896711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5542748 - 5542622
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  5542748 attgttggaatattttattatttaataatatt-ctatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagcctta 5542650  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542649 attgattagtgatcaaattaagtaataa 5542622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Original strand, 32890460 - 32890587
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||    
T  32890460 attgttggaatgttttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgaccctta 32890559  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890560 attgattagtgatcaaattaagtaataa 32890587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 384
Target Start/End: Original strand, 17954078 - 17954197
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17954078 attgatggaatgttttattttttaattatatttcaatgtcattttgtgggaaaatatctttataataattatattagctatttatcaatttggagactta 17954177  T
Q  365 attgattagtgatcaaatta 384  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  17954178 attgattagtgatcagatta 17954197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 42033375 - 42033496
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  42033375 tggaatattttattattta-ttatatttcaatatcattatgcgggtaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattga 42033473  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  42033474 ttagtgatcaaattaagtaataa 42033496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 42993582 - 42993460
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||    
T  42993582 tggaatgttttattatttaataatattccaatatcattatatgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattga 42993483  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  42993482 ttagtgatcaaattaagtaataa 42993460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39727871 - 39727745
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  39727871 attgttggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagactta 39727773  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  39727772 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 39727745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 9934860 - 9934982
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||    |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  9934860 tggaatattttattatttaataatatttcaatatgattatgtgggtaaatattgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagtcttaattga 9934959  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9934960 ttagtgatcaaattaagtaataa 9934982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 290 - 392
Target Start/End: Original strand, 10705434 - 10705537
Alignment:
Q  290 attatatttcaataacattatgtgggc-aatatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagta 388  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705434 attatattccaatatcattttgtgggcgaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagta 10705533  T
Q  389 ataa 392  Q
    ||||    
T  10705534 ataa 10705537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Original strand, 14417534 - 14417660
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||| || ||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||    
T  14417534 attgttggaatattttattattta-ttatataccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagtctta 14417632  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  14417633 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 14417660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 290 - 390
Target Start/End: Original strand, 10699625 - 10699726
Alignment:
Q  290 attatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagta 388  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10699625 attatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatactagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagta 10699724  T
Q  389 at 390  Q
    ||    
T  10699725 at 10699726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22220313 - 22220188
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||| ||||||||||||||||| |||    |||||||    
T  22220313 attgttggaatattttattact--attatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaatagttatattagctatttatcaatcgtaagcctta 22220216  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  22220215 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 22220188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39736063 - 39735999
Alignment:
Q  328 aataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39736063 aataattatattagctatttatcaattgtgagcattagttgattagtgatcaaattaagtaataa 39735999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11840313 - 11840186
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  11840313 attgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 11840214  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11840213 attgattagtgatcaaattaagtaataa 11840186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10244917 - 10244795
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  10244917 tggaatattttattatttaataatatttcaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattga 10244818  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  10244817 ttagtgttcaaattaagtaataa 10244795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 42191801 - 42191681
Alignment:
Q  273 gaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgatt 371  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  42191801 gaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgatt 42191702  T
Q  372 agtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  42191701 agtgatcaaattaagtaataa 42191681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 42197743 - 42197623
Alignment:
Q  273 gaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgatt 371  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  42197743 gaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgatt 42197644  T
Q  372 agtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  42197643 agtgatcaaattaagtaataa 42197623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10238800 - 10238673
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  10238800 attgttggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 10238701  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10238700 attgattagtgttcaaattaagtaataa 10238673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17056374 - 17056252
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  17056374 tggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattatctatttatcaattgtgagccttaattga 17056275  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17056274 ttagtgatcaaattaagtaataa 17056252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26430000 - 26429878
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  26430000 tggaatgttttattatttaataatattctaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattga 26429901  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26429900 ttagtgatcaaattaagtaataa 26429878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 55003984 - 55003862
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  55003984 tggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtggacaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaattta 55003885  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  55003884 ttagtgatcaaattaagtaataa 55003862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10761237 - 10761111
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  10761237 attgttggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 10761139  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  10761138 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 10761111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10769551 - 10769430
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  10769551 tggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttga 10769453  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10769452 ttagtgatcaaattaagtaataa 10769430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11846559 - 11846438
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  11846559 tggaatattttattatttaataatattcca-tatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaatgga 11846461  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11846460 ttagtgatcaaattaagtaataa 11846438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30051682 - 30051561
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  30051682 tggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttga 30051584  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30051583 ttagtgatcaaattaagtaataa 30051561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23138998 - 23138877
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||    
T  23138998 tggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagttga 23138900  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23138899 ttagtgatcaaattaagtaataa 23138877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 290 - 392
Target Start/End: Original strand, 28964476 - 28964579
Alignment:
Q  290 attatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagta 388  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28964476 attatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttataaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagta 28964575  T
Q  389 ataa 392  Q
    ||||    
T  28964576 ataa 28964579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 38449650 - 38449524
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  38449650 attgttggaatatttttttattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtctta 38449552  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  38449551 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 38449524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Original strand, 49157252 - 49157378
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||    
T  49157252 attgttggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggcctta 49157350  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  49157351 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 49157378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 38456132 - 38456011
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||    
T  38456132 tggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtgttagttga 38456034  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  38456033 ttagtgatcaaattaagtaataa 38456011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 49151190 - 49151311
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||    
T  49151190 tggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttga 49151288  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  49151289 ttagtgatcaaattaagtaataa 49151311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 8331365 - 8331486
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatt-tggagccttaattg 368  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||   | |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||    
T  8331365 tggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtggacaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgga-ccttagttg 8331462  T
Q  369 attagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8331463 attagtgatcaaattaagtaataa 8331486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 271 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9586594 - 9586490
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  9586594 tggaatatttta-tattttattatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttga 9586496  T
Q  370 ttagtg 375  Q
    ||||||    
T  9586495 ttagtg 9586490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17602059 - 17601994
Alignment:
Q  327 taataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17602059 taataattatattagttatttatcaatttagagccttaattgattagtggtcaaattaagtaataa 17601994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24644078 - 24643954
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||   | |||||||| ||||| ||||||| ||||  ||| ||||    
T  24644078 attgttggaatattttattattttattatattccaatattattatgtgggcaaatatcctaacaataattacattagttatttatcaattgtgagtctta 24643979  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaa 389  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24643978 gttgattagtgatcaaattaagtaa 24643954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8474716 - 8474595
Alignment:
Q  273 gaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctt-aattgat 370  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||   ||||||||||||||| || || || ||||  | ||||| |||||||    
T  8474716 gaatattttattatttaattatatttcgatatcattatgtgaacaaatatcgtaataataattatattaacttttaatcaattgtgggcctttaattgat 8474617  T
Q  371 tagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8474616 tagtgatcaaattaagtaataa 8474595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 53071776 - 53071712
Alignment:
Q  328 aataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53071776 aataattatattagttatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataa 53071712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2982805 - 2982687
Alignment:
Q  275 atattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattag 373  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||| |||    ||||||||||||| | |||||||| |||   |||||||| ||||||||    
T  2982805 atattttattatttaattatatttcgatatcattatgcgaacaaatattgtaataataattatataatctatttatcaatagcgagccttatttgattag 2982706  T
Q  374 tgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  2982705 tgatcaaattaaataataa 2982687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 392
Target Start/End: Original strand, 34300018 - 34300137
Alignment:
Q  274 aatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaat-atctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgatta 372  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  |||   ||||||||||||||| |||||||| ||||  |||  |||||||||||    
T  34300018 aatattttattattttattatttttcgatatcattacgtgggcaaacatcataataataattatattaactatttatcaattgtgagaattaattgatta 34300117  T
Q  373 gtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    || ||  |||||||||||||    
T  34300118 gtaattgaattaagtaataa 34300137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 52223000 - 52222937
Alignment:
Q  325 tataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagta 388  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  52223000 tatagtaattatattatctatttatcaatttggggccttaattaattagtgatataattaagta 52222937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12109246 - 12109127
Alignment:
Q  274 aatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgatta 372  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||||  |||||||| | || ||||   ||||||||| |||||| ||||||| ||||  || | |||||||||||    
T  12109246 aatattttattattttattatattataatattattatgtgagtaaatatcgtaataataattgtattagttatttatcaattgtgatctttaattgatta 12109147  T
Q  373 gtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
T  12109146 gtgataaaattaagtgataa 12109127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 357 - 392
Target Start/End: Original strand, 46656344 - 46656379
Alignment:
Q  357 gagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46656344 gagctttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 46656379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 36749991 - 36750113
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  36749991 tggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattga 36750090  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36750091 ttagtgatcaaattaagtaataa 36750113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 272 - 392
Target Start/End: Original strand, 23283821 - 23283942
Alignment:
Q  272 ggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgat 370  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23283821 ggaatattttattattttattatatttcaatatcattatgtggacaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttggagtcttaattgat 23283920  T
Q  371 tagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23283921 tagtgatcaaattaagtaataa 23283942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 392
Target Start/End: Original strand, 13455678 - 13455798
Alignment:
Q  273 gaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgatt 371  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  13455678 gaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgatt 13455777  T
Q  372 agtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13455778 agtgatcaaattaagtaataa 13455798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 392
Target Start/End: Original strand, 13461619 - 13461739
Alignment:
Q  273 gaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgatt 371  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  13461619 gaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgatt 13461718  T
Q  372 agtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13461719 agtgatcaaattaagtaataa 13461739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 270 - 392
Target Start/End: Original strand, 23343139 - 23343262
Alignment:
Q  270 gtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattg 368  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23343139 gtggaatattttattattttattatattctaatatcattatgtggacaaatatcataataataattatattaactatttatcaatttggagccttaattg 23343238  T
Q  369 attagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23343239 attagtgatcaaattaagtaataa 23343262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35085267 - 35085140
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  35085267 attgttggaatgttttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagcctta 35085168  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35085167 attgattagtgatcaaattaagtaataa 35085140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 19879171 - 19879293
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  19879171 tggaatattttaatattttattatattccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaataataactatattagctatttattaattgtgagccttagttga 19879270  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19879271 ttagtgatcaaattaagtaataa 19879293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35091235 - 35091113
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  35091235 tggaatgttttattatttaataatattccaatatcattatgtgggtaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattga 35091136  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35091135 ttagtgatcaaattaagtaataa 35091113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 264 - 392
Target Start/End: Original strand, 30964898 - 30965026
Alignment:
Q  264 ttattggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcct 362  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||    
T  30964898 ttattgttggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggcct 30964996  T
Q  363 taattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30964997 tagttgattagtgatcaaattaagtaataa 30965026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 31001954 - 31002075
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||    
T  31001954 tggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcataacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttga 31002052  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31002053 ttagtgatcaaattaagtaataa 31002075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35439957 - 35439831
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||     
T  35439957 attgttggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattcgttatttatcaattgtgagccttg 35439859  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35439858 attgattagtgatcaaattaagtaataa 35439831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13150271 - 13150150
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  | || ||| ||||    
T  13150271 tggaatattttattattta-ttatatttcaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggcattagttga 13150173  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  13150172 ttattgatcaaattaagtaataa 13150150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44717387 - 44717266
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggca-atatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||    
T  44717387 tggaatattttatgattta-ttatattccaatatcattatgtgggcacatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagttga 44717289  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44717288 ttagtgatcaaattaagtaataa 44717266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28683531 - 28683405
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||    
T  28683531 attgttggaatattttattattta-ttatatcttaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagttatttatcaattgtgggcctta 28683433  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  28683432 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 28683405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 290 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35442396 - 35442293
Alignment:
Q  290 attatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagta 388  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||   | |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35442396 attatattccaatatcattatgtgggtaaatatcgtaacaataattatattcgctatttatcaattgtgagccttgattgattagtgatcaaattaagta 35442297  T
Q  389 ataa 392  Q
    ||||    
T  35442296 ataa 35442293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 392
Target Start/End: Original strand, 31007989 - 31008053
Alignment:
Q  328 aataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31007989 aataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataa 31008053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 328 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7771711 - 7771647
Alignment:
Q  328 aataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   || |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7771711 aataattatattagctatttatcaattgtaagtcttagttgattactgatcaaattaagtaataa 7771647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 389
Target Start/End: Original strand, 38731128 - 38731231
Alignment:
Q  288 taattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggag-ccttaattgattagtgatcaaattaa 385  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | || ||||||||||| || ||||||    
T  38731128 taattatatctcaatttccttatgtggtcaaatatctttataataattatattagtcatttatcaatttggagtctttgattgattagtggtcgaattaa 38731227  T
Q  386 gtaa 389  Q
    ||||    
T  38731228 gtaa 38731231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11049075 - 11049028
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  11049075 tggaatattttattatttaattatattccaatattattatgtgggcaa 11049028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 25233042 - 25233117
Alignment:
Q  275 atattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggc-aatatctctataataattatattagctatttat 349  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||| || |||||    
T  25233042 atattttattatttaattatatttcaatttcattatgttggcaaatatctttataattattttattaactttttat 25233117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 350
Target Start/End: Original strand, 16361448 - 16361520
Alignment:
Q  279 tttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttatt 350  Q
    |||| ||| ||||||||||||||   |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16361448 tttattatataattatatttcaacgtcattatgtggacaactatctttattataattatattagttatttatt 16361520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5979759 - 5979636
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggc-aatatctctataataattatattagctatttattaatttggag-ccttaattg 368  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  5979759 tggaatattttattatttaataatatttcaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagcccttaattg 5979660  T
Q  369 attagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5979659 attagtgatcaaattaagtaataa 5979636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28421537 - 28421419
Alignment:
Q  275 atattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattag 373  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  28421537 atattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattag 28421438  T
Q  374 tgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28421437 tgatcaaattaagtaataa 28421419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Original strand, 26383240 - 26383368
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatattt-aattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctt 363  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  26383240 attgttggaatattttattattttaattatatttcaatatcattttgtgggcaaatatcataataataattatattagctatttatcaattgtgagcctt 26383339  T
Q  364 aattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26383340 agttgattagtgatcaaattaagtaataa 26383368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Original strand, 351360 - 351486
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  351360 attgttggaatattttattattta-ttatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtcagcctta 351458  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  351459 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 351486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 338959 - 339080
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||    
T  338959 tggaatattttattatttc-ttatatttcaatatcattatgtgggcaaatatcataacaataattatattagctatttatcaattgtcagccttagttga 339057  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  339058 ttagtgatcaaattaagtaataa 339080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35153116 - 35152989
Alignment:
Q  265 tattggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctt 363  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||    
T  35153116 tattgttggaatattttattattta-ttatattccaatgtcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagatatttatcaattgtgagcctt 35153018  T
Q  364 aattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35153017 agttgattagtgatcaaattaagtaataa 35152989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3817892 - 3817771
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||    
T  3817892 tggaatattttattattta-ttatatttcaatatcattatgtaggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttga 3817794  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  3817793 ttagtgatgaaattaagtaataa 3817771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 284 - 392
Target Start/End: Original strand, 8824401 - 8824510
Alignment:
Q  284 tatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaat 382  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||| |||    
T  8824401 tatttaattatattttaatgtcattatgtaggcaaatatctttataataattatattagctatttatcaattgtgaggcttaattgattaatgatcgaat 8824500  T
Q  383 taagtaataa 392  Q
    || |||||||    
T  8824501 taggtaataa 8824510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35148596 - 35148469
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggc--aatatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctt 363  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||   ||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  35148596 attgttggaatattttattattta-ttatattctaatatcattatgtggggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattatgagcctt 35148498  T
Q  364 aattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35148497 agttgattagtgatcaaattaagtaataa 35148469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3811757 - 3811629
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataa--cattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcct 362  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||   |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||    
T  3811757 attgttggaatattttattattta-ttatattccaatatatcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggcct 3811659  T
Q  363 taattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3811658 tagttgattagtgatcaaattaagtaataa 3811629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 5849109 - 5849229
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||  |||| ||||||||||| || ||||   | |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  5849109 tggaatattttattatt--attatattctaatatcattatgtgggtaaatatcgtaacaataattatattagttatttatcaattgtgagccttagttga 5849206  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5849207 ttagtgatcaaattaagtaataa 5849229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 43539570 - 43539694
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaatt--atatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaatt 367  Q
    |||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||   | |||||||||||||  ||||||| | ||  |||||||||||    
T  43539570 tggaatgttttattatttaattttatattccaatatcattatgtgtgcaaatatcgtaaaaataattatattaattatttatcatttgtgagccttaatt 43539669  T
Q  368 gattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43539670 gattagtgatcaaattaagtaataa 43539694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30219598 - 30219535
Alignment:
Q  329 ataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30219598 ataataatagtagttatttattaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagttataa 30219535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 328 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22742454 - 22742390
Alignment:
Q  328 aataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22742454 aataattatattagttatttatcaactgtgagccttagttgattagtgataaaattaagtaataa 22742390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 392
Target Start/End: Original strand, 26380751 - 26380807
Alignment:
Q  336 tattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26380751 tattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaaataataa 26380807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 271 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18657247 - 18657182
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaatatctctataataattat 336  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  18657247 tggaatattttattatttaattatatttgaatgtcattatgtggaaaatatctttatactaattat 18657182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 354
Target Start/End: Original strand, 38023688 - 38023769
Alignment:
Q  274 aatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggc-aatatctctataataattatattagctatttattaatt 354  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||  | ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  38023688 aatattttattatttatttatatttcaatattattatgtgaacaaatatctttataattattatattagttatttataaatt 38023769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 6099 - 6221
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  6099 tggaatattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttaaagccttaattga 6198  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6199 ttagtgatcaaattaagtaataa 6221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 11976 - 12094
Alignment:
Q  275 atattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattag 373  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  11976 atattttattatttaataatattccaatatcattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattag 12075  T
Q  374 tgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12076 tgatcaaattaagtaataa 12094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 640 - 762
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  640 tggaatattttattatttaattatattccaatatcattatgtgggaaaatatcataataataattatattagttatttatcaattgtgagcctcaattga 739  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  740 ttagtgatcaaattaagtaataa 762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Original strand, 13845 - 13972
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||    |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  13845 attgttggaatattttattatttaattatattccaatatcattatgtgggaaaatatagtaataataattatattagctatttatcaatcgtgagcctta 13944  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13945 attgactagtgatcaaattaagtaataa 13972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 271 - 391
Target Start/End: Original strand, 5544 - 5665
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | | | |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||    
T  5544 tggaatatttaattatttaattatattccgaaatcattttgtaggcaaatatcgctataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattga 5643  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaata 391  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5644 ttagtgatcaaattaagtaata 5665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 173472 - 173350
Alignment:
Q  271 tggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattga 369  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||  | | |||| ||||    
T  173472 tggaatattttattattttattatattccaatattattatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagcgatttatcaattgtgggtcttagttga 173373  T
Q  370 ttagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  173372 ttagtgatcaaattaagtaataa 173350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1766 - 1648
Alignment:
Q  274 aatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgatta 372  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||   | |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||| |||||||    
T  1766 aatattttattattta-ttatatttcaatattattatgtgggtaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgatta 1668  T
Q  373 gtgatcaaattaagtaataa 392  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1667 gtgatcaaattaagtaataa 1648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1185 - 1059
Alignment:
Q  266 attggtggaatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggcaa-tatctctataataattatattagctatttattaatttggagcctta 364  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||| || ||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||    
T  1185 attgttggaatattttattattta-ttatataccaatatcattatgtgggaaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagtctta 1087  T
Q  365 attgattagtgatcaaattaagtaataa 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  1086 gttgattagtgatcaaattaagtaataa 1059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 389
Target Start/End: Original strand, 38008 - 38124
Alignment:
Q  274 aatattttaatatttaattatatttcaataacattatgtgggc-aatatctctataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgatta 372  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||||| || || |||   ||||||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  38008 aatattttattatttaaacatattccaatgtcattatgtgagcgaaaatcataataataattttattagttatttatcaatttgaaaccttaattgaata 38107  T
Q  373 gtgatcaaattaagtaa 389  Q
    |||||||||||||||||    
T  38108 gtgatcaaattaagtaa 38124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University