View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14629_high_1 (Length: 696)

Name: NF14629_high_1
Description: NF14629
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14629_high_1
NF14629_high_1
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (18-690)||(7477143-7477815)
chr3 (18-686)||(7493833-7494502)
chr3 (18-336)||(31284152-31284471)
chr3 (66-377)||(25230540-25230851)
chr3 (66-377)||(25238127-25238438)
chr3 (17-362)||(25248061-25248408)
chr3 (66-362)||(25230098-25230394)
chr3 (66-362)||(25237685-25237981)
chr3 (66-331)||(28561746-28562010)
chr3 (66-375)||(39653164-39653473)
chr3 (66-361)||(30529687-30529981)
chr3 (18-361)||(8067231-8067575)
chr3 (109-377)||(13150389-13150657)
chr3 (66-361)||(20884968-20885263)
chr3 (74-361)||(32227072-32227359)
chr3 (74-359)||(11179887-11180172)
chr3 (66-362)||(16811381-16811675)
chr3 (74-361)||(50347754-50348041)
chr3 (66-375)||(14813949-14814258)
chr3 (66-361)||(37045035-37045327)
chr3 (74-358)||(13149953-13150237)
chr3 (106-362)||(25238534-25238790)
chr3 (102-345)||(25802415-25802658)
chr3 (30-339)||(27187202-27187513)
chr3 (66-377)||(16810925-16811236)
chr3 (102-361)||(32227536-32227795)
chr3 (66-361)||(14820154-14820449)
chr3 (29-228)||(41472263-41472462)
chr3 (97-336)||(32386610-32386849)
chr3 (66-361)||(2911095-2911379)
chr3 (118-361)||(4067212-4067454)
chr3 (105-253)||(29224363-29224511)
chr3 (66-256)||(25802960-25803150)
chr3 (66-252)||(39640937-39641123)
chr3 (66-216)||(25239073-25239223)
chr3 (134-376)||(3899868-3900110)
chr3 (18-230)||(41473948-41474161)
chr3 (66-209)||(32796938-32797081)
chr3 (156-336)||(53150688-53150868)
chr3 (18-132)||(12820595-12820710)
chr3 (571-681)||(20418351-20418461)
chr3 (271-377)||(25238962-25239068)
chr3 (571-679)||(16794213-16794321)
chr3 (571-686)||(16882408-16882524)
chr3 (571-666)||(8728939-8729034)
chr3 (571-666)||(9080826-9080921)
chr3 (77-215)||(31103955-31104095)
chr3 (126-302)||(15377344-15377520)
chr3 (571-675)||(22766470-22766569)
chr3 (18-100)||(32388843-32388926)
chr3 (126-345)||(15405606-15405825)
chr3 (126-345)||(15411015-15411234)
chr3 (113-214)||(26309987-26310088)
chr3 (271-336)||(41473746-41473811)
chr3 (126-302)||(15417431-15417607)
chr3 (126-345)||(15392570-15392789)
chr3 (571-666)||(19197821-19197916)
chr3 (262-364)||(18318851-18318953)
chr3 (126-345)||(15388203-15388422)
chr3 (279-362)||(25230947-25231030)
chr3 (300-362)||(26309839-26309901)
chr3 (625-686)||(27374950-27375012)
chr3 (193-230)||(15381257-15381294)
chr3 (193-230)||(15396492-15396529)
chr3 (193-230)||(15410628-15410665)
chr3 (69-154)||(45047071-45047156)
chr3 (134-182)||(3890046-3890094)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (26-361)||(1821865-1822201)
chr5 (66-361)||(8641886-8642180)
chr5 (17-377)||(22556486-22556848)
chr5 (18-377)||(2473910-2474260)
chr5 (18-376)||(3886893-3887252)
chr5 (18-362)||(2474356-2474701)
chr5 (66-373)||(34371612-34371919)
chr5 (51-361)||(189053-189363)
chr5 (66-377)||(10927238-10927549)
chr5 (66-361)||(17445306-17445601)
chr5 (18-363)||(22556920-22557267)
chr5 (18-361)||(3886452-3886796)
chr5 (66-362)||(27646684-27646981)
chr5 (66-362)||(20039326-20039620)
chr5 (66-361)||(42788497-42788792)
chr5 (66-291)||(21886067-21886292)
chr5 (66-361)||(39146939-39147227)
chr5 (66-285)||(10926873-10927092)
chr5 (80-361)||(18750047-18750328)
chr5 (66-332)||(8391202-8391467)
chr5 (76-362)||(29679958-29680236)
chr5 (74-362)||(2193824-2194100)
chr5 (66-345)||(24182113-24182391)
chr5 (66-361)||(15512863-15513159)
chr5 (30-336)||(30684432-30684739)
chr5 (66-363)||(34372068-34372365)
chr5 (66-227)||(34867790-34867951)
chr5 (30-231)||(30719786-30719988)
chr5 (66-328)||(18304431-18304693)
chr5 (68-336)||(16370588-16370852)
chr5 (29-169)||(2058699-2058840)
chr5 (18-142)||(22975080-22975205)
chr5 (146-336)||(11757157-11757347)
chr5 (71-180)||(11160713-11160822)
chr5 (120-361)||(20858393-20858633)
chr5 (36-227)||(4657979-4658167)
chr5 (95-231)||(32574639-32574774)
chr5 (571-686)||(26119734-26119849)
chr5 (66-238)||(5066865-5067037)
chr5 (287-385)||(21883912-21884010)
chr5 (40-181)||(43356651-43356790)
chr5 (572-639)||(23589831-23589898)
chr5 (185-371)||(30720101-30720287)
chr5 (66-227)||(42429146-42429306)
chr5 (66-231)||(4102812-4102961)
chr5 (115-216)||(4673467-4673568)
chr5 (575-676)||(20969318-20969419)
chr5 (271-350)||(1880281-1880360)
chr5 (66-202)||(5549344-5549481)
chr5 (218-316)||(26341171-26341269)
chr5 (270-336)||(30684887-30684953)
chr5 (575-657)||(31588951-31589033)
chr5 (271-316)||(187763-187808)
chr5 (67-100)||(11757354-11757387)
chr5 (574-639)||(20567923-20567987)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (26-377)||(30966193-30966545)
chr2 (18-362)||(30966641-30966986)
chr2 (67-376)||(16378938-16379247)
chr2 (26-361)||(24818285-24818620)
chr2 (66-362)||(1912525-1912820)
chr2 (66-362)||(16379393-16379689)
chr2 (66-362)||(25337847-25338143)
chr2 (18-362)||(5399667-5400012)
chr2 (70-316)||(15619902-15620148)
chr2 (66-361)||(33174958-33175251)
chr2 (18-328)||(29259504-29259815)
chr2 (66-376)||(33174505-33174812)
chr2 (75-376)||(30963554-30963857)
chr2 (113-361)||(15639781-15640029)
chr2 (68-372)||(30963103-30963407)
chr2 (74-317)||(8256534-8256777)
chr2 (102-361)||(33771037-33771296)
chr2 (66-361)||(25433907-25434202)
chr2 (66-296)||(41754289-41754519)
chr2 (66-361)||(1707042-1707336)
chr2 (26-336)||(30961759-30962077)
chr2 (56-199)||(1953145-1953288)
chr2 (66-228)||(29804682-29804844)
chr2 (66-252)||(11388189-11388373)
chr2 (66-316)||(27882822-27883072)
chr2 (20-325)||(82973-83276)
chr2 (66-216)||(18098874-18099024)
chr2 (66-252)||(38898872-38899058)
chr2 (97-252)||(11394566-11394719)
chr2 (68-214)||(20502023-20502170)
chr2 (571-686)||(24157948-24158063)
chr2 (102-336)||(13191010-13191244)
chr2 (66-176)||(18447954-18448064)
chr2 (198-362)||(32377757-32377921)
chr2 (172-336)||(32377592-32377756)
chr2 (571-677)||(22383587-22383693)
chr2 (76-336)||(8073902-8074162)
chr2 (571-645)||(21846263-21846337)
chr2 (76-204)||(9909102-9909230)
chr2 (274-360)||(20502172-20502258)
chr2 (66-169)||(16541985-16542088)
chr2 (117-181)||(36924453-36924519)
chr2 (271-345)||(11389688-11389762)
chr2 (271-345)||(11406349-11406423)
chr2 (117-169)||(8181394-8181446)
chr2 (293-362)||(29804874-29804943)
chr2 (227-361)||(8181212-8181346)
chr2 (132-181)||(27190628-27190677)
chr2 (132-181)||(27840442-27840491)
chr2 (355-395)||(36733704-36733744)
chr2 (131-227)||(37552632-37552726)
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (25-377)||(7911836-7912189)
chr6 (18-362)||(9352014-9352358)
chr6 (66-362)||(17027381-17027677)
chr6 (66-361)||(23986168-23986463)
chr6 (66-336)||(20850321-20850591)
chr6 (18-336)||(7912261-7912580)
chr6 (18-361)||(17730960-17731308)
chr6 (18-330)||(13492740-13493054)
chr6 (18-231)||(16519920-16520133)
chr6 (74-357)||(2720419-2720702)
chr6 (66-361)||(20126033-20126328)
chr6 (66-361)||(20896538-20896834)
chr6 (30-376)||(9440693-9441037)
chr6 (98-361)||(21312003-21312266)
chr6 (66-336)||(13191389-13191659)
chr6 (66-374)||(17850918-17851226)
chr6 (44-266)||(9440255-9440477)
chr6 (66-375)||(21311515-21311824)
chr6 (97-337)||(2890714-2890954)
chr6 (66-361)||(2681071-2681362)
chr6 (66-252)||(6330872-6331058)
chr6 (127-376)||(13492393-13492643)
chr6 (74-336)||(14771595-14771857)
chr6 (102-252)||(11062321-11062471)
chr6 (66-245)||(17851374-17851553)
chr6 (74-362)||(23776449-23776736)
chr6 (201-377)||(3652658-3652834)
chr6 (26-154)||(9440486-9440614)
chr6 (66-206)||(27334161-27334301)
chr6 (66-206)||(27394901-27395041)
chr6 (66-214)||(3652486-3652634)
chr6 (100-375)||(1991587-1991862)
chr6 (68-361)||(28065687-28065982)
chr6 (40-181)||(32292859-32293000)
chr6 (97-299)||(33774915-33775119)
chr6 (66-216)||(15929582-15929732)
chr6 (102-336)||(20735731-20735965)
chr6 (66-188)||(31821716-31821838)
chr6 (103-348)||(17205376-17205620)
chr6 (101-238)||(20732613-20732750)
chr6 (165-361)||(28780209-28780405)
chr6 (194-358)||(31415943-31416106)
chr6 (66-331)||(12194330-12194592)
chr6 (66-336)||(28582964-28583234)
chr6 (165-345)||(2891161-2891340)
chr6 (571-690)||(14325284-14325404)
chr6 (571-690)||(14418294-14418414)
chr6 (101-327)||(10964339-10964564)
chr6 (102-205)||(15929235-15929338)
chr6 (597-686)||(10704474-10704563)
chr6 (571-686)||(18171945-18172061)
chr6 (571-686)||(24718654-24718770)
chr6 (68-138)||(3652981-3653051)
chr6 (77-151)||(9441061-9441135)
chr6 (95-187)||(30729864-30729956)
chr6 (105-176)||(3885123-3885194)
chr6 (269-376)||(15929342-15929449)
chr6 (612-686)||(24728477-24728552)
chr6 (25-124)||(13490079-13490179)
chr6 (212-359)||(3653048-3653191)
chr6 (278-336)||(27334305-27334363)
chr6 (278-336)||(27395045-27395103)
chr6 (293-361)||(21719256-21719324)
chr6 (293-361)||(21727092-21727160)
chr6 (252-343)||(1663993-1664084)
chr6 (575-674)||(16462575-16462674)
chr6 (298-361)||(21312470-21312533)
chr6 (575-664)||(13145257-13145347)
chr6 (578-676)||(24398786-24398884)
chr6 (571-636)||(23006019-23006084)
chr6 (571-636)||(23782282-23782347)
chr6 (301-377)||(6331203-6331279)
chr6 (574-666)||(17445591-17445683)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (29-372)||(42515054-42515398)
chr7 (18-365)||(9124910-9125258)
chr7 (66-361)||(34405442-34405737)
chr7 (18-377)||(13124968-13125331)
chr7 (74-377)||(36422260-36422562)
chr7 (51-336)||(2941633-2941918)
chr7 (66-336)||(28495854-28496124)
chr7 (66-336)||(42515544-42515814)
chr7 (66-361)||(679817-680111)
chr7 (66-362)||(35473971-35474267)
chr7 (97-374)||(26421598-26421875)
chr7 (66-361)||(6718926-6719220)
chr7 (66-362)||(2193256-2193552)
chr7 (66-362)||(29038870-29039166)
chr7 (76-327)||(29357341-29357592)
chr7 (29-321)||(5406478-5406771)
chr7 (25-332)||(25182320-25182627)
chr7 (66-375)||(2189144-2189453)
chr7 (18-362)||(18833237-18833582)
chr7 (102-361)||(2465960-2466218)
chr7 (66-345)||(22529102-22529381)
chr7 (66-345)||(2611526-2611798)
chr7 (66-361)||(6747457-6747744)
chr7 (18-215)||(11517386-11517583)
chr7 (66-252)||(46425741-46425927)
chr7 (66-361)||(28495470-28495754)
chr7 (110-285)||(2465777-2465952)
chr7 (162-361)||(7646329-7646528)
chr7 (66-252)||(35527081-35527267)
chr7 (165-376)||(7646514-7646725)
chr7 (66-316)||(9623208-9623457)
chr7 (571-686)||(9064100-9064215)
chr7 (150-336)||(13122380-13122567)
chr7 (18-154)||(13124759-13124896)
chr7 (66-202)||(31743834-31743970)
chr7 (66-214)||(36015409-36015557)
chr7 (66-306)||(31406495-31406730)
chr7 (95-235)||(33316757-33316892)
chr7 (68-227)||(11372453-11372612)
chr7 (66-187)||(43233413-43233534)
chr7 (571-686)||(16307653-16307768)
chr7 (69-207)||(1628719-1628854)
chr7 (66-166)||(26957603-26957703)
chr7 (195-362)||(3305198-3305365)
chr7 (116-235)||(26421282-26421401)
chr7 (102-228)||(20966087-20966213)
chr7 (68-227)||(11372901-11373060)
chr7 (240-336)||(26419111-26419207)
chr7 (271-375)||(43233162-43233266)
chr7 (96-187)||(6585638-6585731)
chr7 (261-350)||(6747938-6748027)
chr7 (115-204)||(16192368-16192457)
chr7 (274-362)||(31743739-31743827)
chr7 (257-361)||(36422573-36422677)
chr7 (97-181)||(37672191-37672275)
chr7 (180-324)||(43776178-43776322)
chr7 (97-153)||(16811905-16811961)
chr7 (98-163)||(2490071-2490136)
chr7 (262-336)||(33316897-33316971)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (66-375)||(20054373-20054682)
chr1 (66-375)||(20054829-20055138)
chr1 (66-375)||(20055285-20055594)
chr1 (66-375)||(20055741-20056050)
chr1 (66-375)||(20056197-20056506)
chr1 (66-375)||(20057100-20057409)
chr1 (66-377)||(20057554-20057865)
chr1 (66-376)||(50002543-50002853)
chr1 (66-336)||(20845537-20845807)
chr1 (66-363)||(20053929-20054226)
chr1 (66-362)||(43057373-43057669)
chr1 (66-361)||(38340906-38341201)
chr1 (102-375)||(20056653-20056926)
chr1 (25-361)||(35759459-35759796)
chr1 (66-362)||(43056915-43057210)
chr1 (28-361)||(46693586-46693922)
chr1 (66-377)||(50002910-50003221)
chr1 (66-361)||(52250206-52250501)
chr1 (18-215)||(20061188-20061386)
chr1 (66-361)||(16451784-16452079)
chr1 (66-361)||(16460937-16461232)
chr1 (29-281)||(35760845-35761098)
chr1 (66-252)||(30872910-30873096)
chr1 (121-361)||(20060191-20060431)
chr1 (76-336)||(51372750-51373010)
chr1 (25-331)||(23180689-23180995)
chr1 (66-231)||(50002266-50002431)
chr1 (66-244)||(2634924-2635102)
chr1 (66-230)||(31822645-31822809)
chr1 (66-376)||(2634465-2634776)
chr1 (18-214)||(2328266-2328463)
chr1 (40-344)||(16907209-16907513)
chr1 (102-234)||(12728027-12728160)
chr1 (164-361)||(52250641-52250838)
chr1 (164-361)||(52250978-52251175)
chr1 (66-265)||(12883524-12883723)
chr1 (66-252)||(7548091-7548277)
chr1 (571-683)||(9346872-9346984)
chr1 (575-686)||(18129865-18129976)
chr1 (574-675)||(16870087-16870188)
chr1 (575-676)||(26279914-26280015)
chr1 (575-686)||(18517014-18517126)
chr1 (273-377)||(35759899-35760003)
chr1 (110-181)||(10820636-10820707)
chr1 (220-376)||(7547791-7547947)
chr1 (240-330)||(31823001-31823091)
chr1 (194-252)||(35009956-35010014)
chr1 (104-231)||(16410704-16410831)
chr1 (279-364)||(49996528-49996613)
chr1 (156-336)||(7229819-7229999)
chr1 (102-181)||(2739558-2739637)
chr1 (270-376)||(8278154-8278260)
chr1 (278-372)||(39582553-39582647)
chr1 (115-188)||(16440603-16440676)
chr1 (135-188)||(31823108-31823161)
chr1 (77-153)||(842992-843068)
[»] chr4 (83 HSPs)
chr4 (18-377)||(44471154-44471514)
chr4 (27-376)||(13266047-13266396)
chr4 (18-344)||(49998587-49998914)
chr4 (18-336)||(35871579-35871897)
chr4 (66-361)||(1645594-1645889)
chr4 (66-377)||(21067282-21067593)
chr4 (66-377)||(50398823-50399133)
chr4 (115-376)||(23943072-23943333)
chr4 (18-361)||(23350128-23350472)
chr4 (66-361)||(3169206-3169501)
chr4 (17-361)||(44470720-44471064)
chr4 (66-377)||(14571982-14572290)
chr4 (26-376)||(27578739-27579089)
chr4 (66-361)||(50398383-50398678)
chr4 (66-296)||(12691909-12692139)
chr4 (66-375)||(24629267-24629573)
chr4 (66-361)||(51331128-51331421)
chr4 (66-345)||(9423719-9423998)
chr4 (66-361)||(23942634-23942929)
chr4 (40-329)||(8467690-8467964)
chr4 (66-374)||(31817686-31817992)
chr4 (102-361)||(7678467-7678726)
chr4 (66-369)||(14351795-14352098)
chr4 (18-336)||(27578327-27578642)
chr4 (66-323)||(4127772-4128029)
chr4 (18-225)||(14571702-14571910)
chr4 (66-250)||(29628624-29628807)
chr4 (97-361)||(21067765-21068026)
chr4 (18-245)||(15306052-15306285)
chr4 (115-375)||(17628560-17628821)
chr4 (66-269)||(24628914-24629120)
chr4 (66-209)||(4127434-4127577)
chr4 (66-238)||(53996083-53996255)
chr4 (99-215)||(27029310-27029426)
chr4 (66-316)||(13613788-13614037)
chr4 (66-371)||(1464147-1464451)
chr4 (132-301)||(50814730-50814899)
chr4 (26-225)||(41869878-41870077)
chr4 (99-368)||(4185748-4186015)
chr4 (66-231)||(21220306-21220471)
chr4 (178-315)||(27578177-27578314)
chr4 (193-331)||(14571563-14571701)
chr4 (66-228)||(31817376-31817538)
chr4 (256-385)||(15267994-15268123)
chr4 (40-369)||(17028849-17029177)
chr4 (44-231)||(17628946-17629132)
chr4 (98-329)||(27026535-27026765)
chr4 (571-686)||(13027893-13028010)
chr4 (102-362)||(23976062-23976323)
chr4 (194-361)||(4127263-4127430)
chr4 (77-187)||(43928982-43929092)
chr4 (70-275)||(17029334-17029539)
chr4 (68-345)||(52048538-52048804)
chr4 (66-154)||(53854859-53854947)
chr4 (68-205)||(24271552-24271690)
chr4 (75-214)||(4186176-4186315)
chr4 (73-153)||(2499647-2499727)
chr4 (68-291)||(26200208-26200425)
chr4 (104-200)||(53391925-53392021)
chr4 (271-362)||(7381472-7381563)
chr4 (575-686)||(14357014-14357125)
chr4 (230-361)||(31816983-31817114)
chr4 (127-228)||(23091489-23091590)
chr4 (104-345)||(33764898-33765139)
chr4 (262-362)||(35477856-35477956)
chr4 (126-231)||(20306139-20306241)
chr4 (577-686)||(16324399-16324508)
chr4 (614-683)||(18776147-18776216)
chr4 (70-165)||(17506389-17506484)
chr4 (104-191)||(44831035-44831122)
chr4 (287-358)||(53995978-53996049)
chr4 (271-345)||(4414248-4414322)
chr4 (37-113)||(33987164-33987239)
chr4 (83-139)||(34801394-34801450)
chr4 (104-176)||(42838661-42838733)
chr4 (66-129)||(2682707-2682770)
chr4 (269-336)||(5810037-5810104)
chr4 (194-285)||(11828406-11828497)
chr4 (575-636)||(20570932-20570993)
chr4 (72-181)||(45682209-45682318)
chr4 (193-350)||(53854703-53854860)
chr4 (66-118)||(35477803-35477855)
chr4 (144-188)||(39902471-39902515)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (18-361)||(2061-2405)
scaffold0040 (321-377)||(2501-2557)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (18-361)||(107314-107658)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (26-361)||(10259-10594)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (66-362)||(8080193-8080488)
chr8 (61-361)||(2044053-2044353)
chr8 (18-377)||(25147487-25147846)
chr8 (18-377)||(34308770-34309134)
chr8 (25-362)||(34308329-34308667)
chr8 (71-362)||(17103086-17103378)
chr8 (69-362)||(10844465-10844758)
chr8 (66-362)||(27925899-27926194)
chr8 (66-377)||(22548830-22549141)
chr8 (18-358)||(12100643-12100982)
chr8 (66-361)||(22026379-22026675)
chr8 (65-361)||(22548400-22548696)
chr8 (66-378)||(27022173-27022484)
chr8 (66-336)||(41658981-41659251)
chr8 (74-362)||(12827104-12827392)
chr8 (30-355)||(27819105-27819428)
chr8 (18-336)||(25147918-25148236)
chr8 (66-316)||(32292397-32292647)
chr8 (18-362)||(21315960-21316304)
chr8 (66-361)||(33852109-33852404)
chr8 (18-231)||(25144723-25144937)
chr8 (144-377)||(31283487-31283719)
chr8 (99-345)||(41913003-41913249)
chr8 (66-226)||(10844883-10845043)
chr8 (106-350)||(15818878-15819121)
chr8 (66-252)||(28453338-28453524)
chr8 (66-250)||(6464872-6465056)
chr8 (69-327)||(3745104-3745362)
chr8 (76-187)||(27021904-27022015)
chr8 (77-188)||(28375078-28375189)
chr8 (104-345)||(30527349-30527589)
chr8 (66-252)||(22840490-22840675)
chr8 (218-375)||(32292093-32292250)
chr8 (18-176)||(22705131-22705282)
chr8 (66-343)||(30334779-30335054)
chr8 (165-364)||(10729722-10729921)
chr8 (66-253)||(15567515-15567702)
chr8 (156-336)||(25307856-25308034)
chr8 (99-253)||(1297040-1297194)
chr8 (95-324)||(3744667-3744896)
chr8 (263-361)||(6463394-6463493)
chr8 (571-686)||(17916746-17916861)
chr8 (196-367)||(15567854-15568025)
chr8 (575-673)||(12194020-12194118)
chr8 (575-673)||(12438448-12438546)
chr8 (40-342)||(6466686-6466982)
chr8 (66-169)||(17429501-17429603)
chr8 (162-284)||(10729614-10729736)
chr8 (66-163)||(29971450-29971547)
chr8 (104-169)||(36968438-36968503)
chr8 (274-345)||(34688044-34688115)
chr8 (117-181)||(15568036-15568100)
chr8 (66-130)||(25307765-25307829)
chr8 (28-122)||(9250964-9251057)
chr8 (309-361)||(39371775-39371827)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (66-362)||(1901-2197)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (66-362)||(18966-19262)
scaffold0322 (18-130)||(18203-18316)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (18-371)||(105671-106025)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (66-361)||(1220-1515)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (66-374)||(17974-18280)
scaffold0047 (70-362)||(17448-17740)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (66-377)||(245086-245394)
scaffold0005 (18-225)||(245466-245674)
scaffold0005 (193-331)||(245675-245813)
[»] scaffold0333 (3 HSPs)
scaffold0333 (66-375)||(4561-4869)
scaffold0333 (66-362)||(5016-5316)
scaffold0333 (275-363)||(5331-5420)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (66-362)||(2742-3038)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (26-336)||(162553-162865)
scaffold0022 (29-361)||(69666-69998)
scaffold0022 (165-377)||(162969-163181)
scaffold0022 (162-361)||(163167-163366)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (74-358)||(154765-155049)
scaffold0002 (275-377)||(154511-154613)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (18-181)||(142305-142469)
[»] scaffold0557 (1 HSPs)
scaffold0557 (115-361)||(2154-2391)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (156-361)||(13384-13589)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (66-306)||(14741-14981)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (571-686)||(7444-7559)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (70-314)||(26074-26316)
scaffold0036 (70-165)||(16038-16135)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (165-361)||(14553-14749)
[»] scaffold0522 (2 HSPs)
scaffold0522 (571-686)||(4142-4257)
scaffold0522 (571-686)||(11425-11540)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (134-376)||(7009-7251)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (66-191)||(4003-4128)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (66-178)||(23673-23785)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (571-664)||(20188-20281)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (571-686)||(754-870)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (177-361)||(421-605)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (574-686)||(10280-10393)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (211-361)||(1552-1702)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (571-637)||(87025-87091)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (66-169)||(45387-45489)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (126-302)||(44631-44807)
[»] scaffold1126 (1 HSPs)
scaffold1126 (98-147)||(981-1030)
[»] scaffold1026 (1 HSPs)
scaffold1026 (571-682)||(3087-3199)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (184-252)||(246725-246793)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 637; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 637; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 690
Target Start/End: Original strand, 7477143 - 7477815
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7477143 atgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcat 7477242  T
Q  118 ggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7477243 ggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagca 7477342  T
Q  218 tgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggta 317  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7477343 tgcttgacttagagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggta 7477442  T
Q  318 tgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcaggtaggtccagtcagaccaaaaccnnnnnnnncctttgtat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||    
T  7477443 tgtggggtcagtcgacaattcttaaagtcgtctaggatgttacaagtggtatcagagcaggtaggtccagtcagaccaaaaccttttttttcctttgtat 7477542  T
Q  418 gcgacaagtatgtaagtactttcgatacttgtttcgttctattaggttggtctgagcaaagtggggggagaggcaacatacttcaagtgtggtggaacac 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7477543 gcgacaagtatgtaagtactttcgatacttgtttcgttctactaggttggtctgagcaaagtggggggagaggcaacatacttcaagtgtggtggaacac 7477642  T
Q  518 gacaagtagaggcatcattgaacgaagaagcacatgtgtttatgatgtttgctttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaac 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7477643 gacaagtagaggcatcattgaacgaagaagcacatgtgtttatgatgtttgctttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaac 7477742  T
Q  618 taactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcagactctctgatgatgtc 690  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7477743 taactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcagactctctgatgatgtc 7477815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 686
Target Start/End: Original strand, 7493833 - 7494502
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7493833 atgaggacggggagtggtccggcttctggcggcttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagagatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcat 7493932  T
Q  118 ggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7493933 ggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagca 7494032  T
Q  218 tgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggta 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7494033 tgcttgacttggagttgtcttagcatggctgaccttctaggaaatttcccgtaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggta 7494132  T
Q  318 tgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcaggtaggtccagtcagaccaaaacc-nnnnnnnncctttgta 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||    
T  7494133 tgtggggtcagtcgacaattcttaaagtcgtctaggatgttacaagtggtatcagaacaggtaggtccagtcagaccaaaacctttttttttcctttgta 7494232  T
Q  417 tgcgacaagtatgtaagtactttcgatacttgtttcgttctattaggttggtctgagcaaagtggggggagaggcaacatacttcaagtgtggtggaaca 516  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7494233 tgcgacaagtatgtaagtactgtcgatacttgtttcgttctattaggttggtctgagcaaagtggggggagaggcaacatgcttcaagtgtggtggaaca 7494332  T
Q  517 cgacaagtagaggcatcattgaacgaagaagcacatgtgtttatgatgtttgctttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaa 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  7494333 cgacaagtagaggcatcattgaacgaagaagcacatgtgtttatgatgtttgctttccattacttctgcaatgatatgaattcataatagcaacgtttaa 7494432  T
Q  617 ctaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcagactctctgatga 686  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7494433 ctaactccagcttccaatcttcatactctgatgaacttcagcttctgatgctcttcagactctctgatga 7494502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31284471 - 31284152
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||    
T  31284471 atgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcttgaggtcgtgcaggtatgggactgca 31284372  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  31284371 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 31284272  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||  ||  ||||||||||||| | ||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  31284271 gtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctgccgggaagttttccgacaagcgtgcgagtggggacaaaacacgccgaaaagactcgtgttggt 31284172  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaat 336  Q
     |||||||||||||| ||||    
T  31284171 ttgtggggtcagtcggcaat 31284152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 66 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25230851 - 25230540
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25230851 aatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 25230752  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||  |||||| ||||    
T  25230751 agatgcattttctttttggtagcccattccataagaactcaacaattaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgccctactgggaagtttc 25230652  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||| ||    
T  25230651 ccggtaagcgtgcgagtgagatcaaaacacgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtctacaatgcataaagtcgtttaggatgttacaaatg 25230552  T
Q  366 gtatcagagcag 377  Q
    ||||||||||||    
T  25230551 gtatcagagcag 25230540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 66 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25238438 - 25238127
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25238438 aatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 25238339  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||  |||||| ||||    
T  25238338 agatgcattttctttttggtagcccattccataagaactcaacaattaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgccctactgggaagtttc 25238239  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||| ||    
T  25238238 ccggtaagcgtgcgagtgagatcaaaacacgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtctacaatgcataaagtcgtttaggatgttacaaatg 25238139  T
Q  366 gtatcagagcag 377  Q
    ||||||||||||    
T  25238138 gtatcagagcag 25238127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 362
Target Start/End: Original strand, 25248061 - 25248408
Alignment:
Q  17 aatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgc 115  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||    
T  25248061 aatgagggtggggagtggtcaggctcctggcatgcttataggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggattctaaggccgtgcaggtatgggactgc 25248160  T
Q  116 atggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaag 215  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||  || ||    
T  25248161 atggttaaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataataactccacggttcag 25248260  T
Q  216 catgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttg-aaaagactcatgttg 314  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  25248261 cgtgcttgacttggagtagtcttatgatggatgacctaccgggaagtttcacggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaaagactcgtgttg 25248360  T
Q  315 gtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     | |||| ||| |||||||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  25248361 atttgtgaggttagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttacaa 25248408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25230394 - 25230098
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25230394 aatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaaca 25230295  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    |||| |||     
T  25230294 agatacatcttctttttggtagcccattcaataagaactccacagttatgcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacctatcaggaagtttt 25230195  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||    
T  25230194 ccggtaagcgagcgagtgaggacaaaacacgttggaaagactagtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtttgagatgttacaa 25230098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25237981 - 25237685
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25237981 aatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaaca 25237882  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    |||| |||     
T  25237881 agatacatcttctttttggtagcccattcaataagaactccacagttatgcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacctatcaggaagtttt 25237782  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||    
T  25237781 ccggtaagcgagcgagtgaggacaaaacacgttggaaagactagtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtttgagatgttacaa 25237685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 331
Target Start/End: Original strand, 28561746 - 28562010
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28561746 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 28561845  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  28561846 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgg-tgacctacggggaagtttc 28561944  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcg 331  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28561945 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcg 28562010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 375
Target Start/End: Original strand, 39653164 - 39653473
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||    
T  39653164 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgttggatactacctatatcaaca 39653263  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  39653264 agatgcatcttcttttcggtagctcattccatgagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 39653363  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  39653364 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctaaaagcagtctgggatgttacaaatg 39653463  T
Q  366 gtatcagagc 375  Q
    ||||||||||    
T  39653464 gtatcagagc 39653473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Original strand, 30529687 - 30529981
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30529687 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaagtaaggcttataagaattttttggtactacctatatcaaca 30529786  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||| ||||    
T  30529787 agatgcatcttctttttggtagcccattccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacc-tactggaagtttc 30529885  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     | | |||| |||||||||| ||||| |||| | ||||||||  ||||||| ||  |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30529886 ccagtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagacttgtgttggtttgcagggttagtcggcaatgcttaaagttgtctaggatgttaca 30529981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Original strand, 8067231 - 8067575
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| || ||||    
T  8067231 atgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaagcaaaattgaatcacatcggaatgagagggaccctgaggccgtgcaggtatgggattgca 8067330  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||    
T  8067331 tggttgaaggccggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatctttttttcggtagctcattccataagaactccatagttaagc 8067430  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  8067431 gtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 8067530  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     |||| ||||| ||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  8067531 ttgtgaggtcaatcggcaatcctaaaagcagtctgggatgttaca 8067575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 109 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13150657 - 13150389
Alignment:
Q  109 agactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccac 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  13150657 agactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccac 13150558  T
Q  209 atttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactc 308  Q
    | |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  13150557 agttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactc 13150458  T
Q  309 atgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 377  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13150457 gtgttgatttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtatcagagcag 13150389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20885263 - 20884968
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  20885263 aatcacatcgcaatgagagggatcttgaggtcgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttgatactacctatatcaaca 20885164  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||   ||||||||||    
T  20885163 agatgcatcttctttttagtagcacattccataagaactccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtatttggatgggtgacctaccgggaaatttc 20885064  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||  |||||||| ||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  20885063 ccgttaagcgtgcaagttaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtctgcaatgcttaaagtcgtttgggatgttaca 20884968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 74 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32227359 - 32227072
Alignment:
Q  74 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 173  Q
    |||||||||||||||||||| | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  32227359 cggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaacaagatgcat 32227260  T
Q  174 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 273  Q
    |||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| |||    
T  32227259 cttctttttggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaag 32227160  T
Q  274 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  32227159 tgtgcgagtgaggaaaaaacacattgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 32227072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11180172 - 11179887
Alignment:
Q  74 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 173  Q
    |||||||||||||||||| | | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  11180172 cggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 11180073  T
Q  174 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 273  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||  |||| ||| |||    
T  11180072 cttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggatgtttcccggtaag 11179973  T
Q  274 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgtta 359  Q
     ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||    
T  11179972 tgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgtta 11179887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Original strand, 16811381 - 16811675
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  16811381 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtttgggactccatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatttcaaca 16811480  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  16811481 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 16811580  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||  |||| |||||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  16811581 ccgataagcatgcgagtgaggacaaa--acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 16811675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 361
Target Start/End: Original strand, 50347754 - 50348041
Alignment:
Q  74 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 173  Q
    |||||||||||||||||| | | | || | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  50347754 cggaatgagagggatcctgaggccttgtatgtatgagactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 50347853  T
Q  174 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 273  Q
    |||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   | ||| |||| ||  |||    
T  50347854 cttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgagaagtttcccgataag 50347953  T
Q  274 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  50347954 tgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 50348041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 375
Target Start/End: Original strand, 14813949 - 14814258
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |    
T  14813949 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgagactgcatggttaaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaata 14814048  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||  ||||| ||||||   |  |  ||||    
T  14814049 agatgcatcttcttttcggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgtgatgggtgacctaccgaaaggtttc 14814148  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  14814149 ccggtaagcgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggttagtcggcaatactgaaagcagtctgggatgttacaaatg 14814248  T
Q  366 gtatcagagc 375  Q
    |||| |||||    
T  14814249 gtattagagc 14814258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Original strand, 37045035 - 37045327
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | | |||| |||| || |||| ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  37045035 aatcacatctgaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtgtgggactacatgaatgaaggaatgcttataagaattgtttggtaatacctatatcaaca 37045134  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    || | ||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||   |||    
T  37045135 aggtgcatcttctttttggtaccctattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccggga---ttc 37045231  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||  |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  37045232 ccgataagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 37045327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13150237 - 13149953
Alignment:
Q  74 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 173  Q
    ||||||||||||| |||| | | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| |||    
T  13150237 cggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctgtatcaacaagatgcat 13150138  T
Q  174 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 273  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || | |||| ||||||   ||||| |||||||| |||    
T  13150137 cttcttttcagtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctaccgggaagtttctcggtaag 13150038  T
Q  274 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgtt 358  Q
     |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||    
T  13150037 tgtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgtt 13149953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25238790 - 25238534
Alignment:
Q  106 atgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactc 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  25238790 atgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactatctttatcaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactc 25238691  T
Q  206 cacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaaga 305  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||   ||||| ||| | || |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  25238690 cacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggattggtgacctatcgggaagttttttggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaga 25238591  T
Q  306 ctcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    ||| ||||||| |||  |||| |||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  25238590 ctcgtgttggtttgtatggtcggtcggcaatggttaaagtcgtctgggatgttacaa 25238534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25802658 - 25802415
Alignment:
Q  102 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 201  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  25802658 aggtatgagactgcatggttaacggaaggctgataagaatggtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcgatagcccattccataaga 25802559  T
Q  202 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 301  Q
    | |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| ||||||| |||| |||||||| ||  |||| |||| ||||    
T  25802558 aatccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtcttaggacgggtgaccttctaggaagtttctcgaaaagagtgcgagtaaggtcaaaacacgctgaa 25802459  T
Q  302 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 345  Q
    |||||   ||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  25802458 aagacgtgtgttggtttgtagggtcagtcaacaatgcttaaagt 25802415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27187513 - 27187202
Alignment:
Q  30 agtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaa 128  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||| ||||| |||||||||||| || |||    
T  27187513 agtggtccggctcctagcaagcttctaggaaaaattgaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgtgcatgtatgggactgcatggttaaatgaa 27187414  T
Q  129 ggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttg 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  27187413 ggcttataagaattgtttggtactacctatatcactaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttt 27187314  T
Q  229 gagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaac-aaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtca 327  Q
    ||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||  ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27187313 gagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagcgtgcgagtgaggacaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtca 27187214  T
Q  328 gtcgacaattct 339  Q
    |||| |||||||    
T  27187213 gtcggcaattct 27187202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 377
Target Start/End: Original strand, 16810925 - 16811236
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | |||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||| |||    
T  16810925 aatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtagatatgggactgcatggttgatggaaggcttataagaattgttgcgtactaactatatctaca 16811024  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  16811025 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacatttaagtgtgcttgacttgtagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 16811124  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     | | ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||| || ||||   ||| ||||||||||| ||    
T  16811125 cccgtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacgctgaaaagattcgtgttggtttgtggggtcggtcggcaatcctgaaagcaatctgggatgttacaaatg 16811224  T
Q  366 gtatcagagcag 377  Q
    |||||| |||||    
T  16811225 gtatcatagcag 16811236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 361
Target Start/End: Original strand, 32227536 - 32227795
Alignment:
Q  102 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 201  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||    
T  32227536 aggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataaga 32227635  T
Q  202 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 301  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||  ||| ||||||||||| | ||| ||| |||||    
T  32227636 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagtgtgcgagtgaggaaaaaacacattgaa 32227735  T
Q  302 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  32227736 aagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 32227795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Original strand, 14820154 - 14820449
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| |   |||| ||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14820154 aatcacaccgcaatgagagggttcctgagcccgtgtaggtatggggctgcacggctaaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaaca 14820253  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaa-ttt 264  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | | || |||||| ||||| ||| ||||| |||    
T  14820254 agatgcatcttattttcggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggaacaattttgggatgggtgacc-tatcggaaagttt 14820352  T
Q  265 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    | ||| |||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  14820353 cccggtaagcatgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 14820449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 228
Target Start/End: Original strand, 41472263 - 41472462
Alignment:
Q  29 gagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaagga 127  Q
    |||||||||| ||||||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41472263 gagtggtccggctcctggcatgcatctaggcaagactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggtcgtacaggtatgagactgcatggttgaagga 41472362  T
Q  128 aggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgactt 227  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||  |||| | ||||||||||    
T  41472363 ag-cttataagaattgtttggtactacatatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagatcattccataagaactccacggttaaacgtgcttgactt 41472461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 32386849 - 32386610
Alignment:
Q  97 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaacca 196  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||  |  |||    
T  32386849 cgtgcaggtatgggactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcagtagctaattcca 32386750  T
Q  197 taagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacg 296  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||    || || ||||| || |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  32386749 taagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacccaccggaaagtttcttggtaagcgtccgagtgaggacaaaacacg 32386650  T
Q  297 ttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
     | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32386649 ctaaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 32386610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Original strand, 2911095 - 2911379
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  | | |||||||||||| |||  |||||||||| ||| | |||||| |||| |||| || ||| ||||||||||    
T  2911095 aatcacacctgaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggaccacatggttgaaagaatggttataaaaattgtttgatattacctatatcaaca 2911194  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||           |||    
T  2911195 agatgcatattctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgagtgacc-----------ttc 2911283  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| |||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  2911284 tcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtaggatcaatcgacaatgcttaaagtcgtgtgggatgttaca 2911379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4067454 - 4067212
Alignment:
Q  118 ggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagca 217  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||     
T  4067454 ggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcattacataagaactccacagttaagcg 4067355  T
Q  218 tgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctc-ggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||| || || || |||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||   |||||||    
T  4067354 tgcttgacttggagtagtctttggatggatgacc-taccggaaagttttctggtaagcgtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagaccagtgttggt 4067256  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  4067255 ttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtct-ggatgttaca 4067212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 253
Target Start/End: Original strand, 29224363 - 29224511
Alignment:
Q  105 tatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaact 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29224363 tatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatactaacaagatgcatcttcttttcggtagcccaaaccataagaact 29224462  T
Q  205 ccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacctt 253  Q
     |||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||||    
T  29224463 tcacaattaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctt 29224511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25803150 - 25802960
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  25803150 aatcatatcggaataagagggttcctaatgtcgtgtaggtatgggactgcatggttgaagtaagacttgtaagaattgtttggtactacctataaaaaca 25803051  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatg 256  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25803050 agatgtatcttcttttcggtatcccatttcataagaactccgtagttaagcgtgcttgacttggactagtcttaggatgggtgaccttatg 25802960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 252
Target Start/End: Original strand, 39640937 - 39641123
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  39640937 aatcacatcagaatgagagagatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagagttgtttggtactacctatatcaata 39641036  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 252  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||| |||| | ||||||    
T  39641037 agatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcagtctttggattggtgacct 39641123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25239223 - 25239073
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25239223 aatcacaccggtatgagagggattctgaggtcgtgtaggtatgggactatatggttgaaggaacgcttataagaattttttggtactacctatatcaaca 25239124  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  25239123 agatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagc 25239073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 376
Target Start/End: Original strand, 3899868 - 3900110
Alignment:
Q  134 ataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagta 233  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  | | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  3899868 ataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatctttttttcgacaacacaaatcataagaactccacaataaagcatgcttgacttggagca 3899967  T
Q  234 gtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgac 333  Q
     | || | |||| ||||||| ||| || |||| |  |||||||| ||||  | ||||| || | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |    
T  3899968 attttggtatgggtgaccttctggaaagtttcccaaaaagcgtgtgagtatggacaaaacaaggtgaaaagactcgtgttgatctgtggggtcagtcagc 3900067  T
Q  334 aattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 376  Q
    |||||| ||| | || | ||||||||||||| |||||||||||    
T  3900068 aattctgaaaatggtatgggatgttacaagtagtatcagagca 3900110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 41473948 - 41474161
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||| |    
T  41473948 atgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctcggcaagactgaatcacatcgaaatgagagggatcttgaggtcgttcaggtatgtgactgga 41474047  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||| ||| |  ||  | |||| ||||||||| | ||||    
T  41474048 tggttaaaggaagacttataagaattgtttgatacttcctatatcaacaagattgatattctttttggtggatcattctataaaaactccacagtcaagc 41474147  T
Q  217 atgcttgacttgga 230  Q
     |||||||||||||    
T  41474148 gtgcttgacttgga 41474161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32797081 - 32796938
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |   | || |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32797081 aatcacatcgaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgaaactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 32796982  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccaca 209  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  32796981 agatgcatcttcttttttgtagcacattccataagaactccaca 32796938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 53150868 - 53150688
Alignment:
Q  156 tatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttat 255  Q
    ||||| |||||||| ||| || |||||||||||| |   |||||||||| |||| |||| | ||||| |||||||| | | || |||||| |||||||||    
T  53150868 tatattaacaagatgcatatttttttcggtagccaatttcataagaacttcacagttaaccgtgcttaacttggagcaattttgggatgggtgaccttat 53150769  T
Q  256 gggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    | ||| |||| |  |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  53150768 gagaagtttcccaaaaagcgggcgagtgaggacaaaacatgttgaaaagactcatgttagtttgtggggtcagtcaacaat 53150688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 132
Target Start/End: Original strand, 12820595 - 12820710
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||| |||||||    
T  12820595 atgagggcggggagtggtccggctccttgcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggattctaaggccgtacaggtatgggactgca 12820694  T
Q  117 tggttgaaggaaggct 132  Q
    ||||||||| ||||||    
T  12820695 tggttgaagaaaggct 12820710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 571 - 681
Target Start/End: Original strand, 20418351 - 20418461
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 670  Q
    ||||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20418351 ttccatttcttctacaatcatgtgtattcagaataacaacttttaactaactccagcttccaatcttcagaatctgatgaacttcagcttctgaggctct 20418450  T
Q  671 tcagactctct 681  Q
    |||||||||||    
T  20418451 tcagactctct 20418461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25239068 - 25238962
Alignment:
Q  271 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatc 370  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| |||||||    
T  25239068 aagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtatgagatgttacaaatggtatc 25238969  T
Q  371 agagcag 377  Q
    |||||||    
T  25238968 agagcag 25238962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 16794321 - 16794213
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 670  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||| || |||||||||| || ||    
T  16794321 ttccattccttctgcaatcatatgcattcagaataacaacttttaactaacttcagcttccaggcttcagactctgatgagctccagcttctgaggccct 16794222  T
Q  671 tcagactct 679  Q
    ||| |||||    
T  16794221 tcatactct 16794213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 686
Target Start/End: Original strand, 16882408 - 16882524
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctc 669  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| || || || | |||||||| | ||    
T  16882408 ttccattccttctgcaatcatatccattcagaataacaacttttaacaaactttagcttccagtcttcaaactctgatcaattttaacttctgatggttc 16882507  T
Q  670 ttcagactctctgatga 686  Q
    |||||||||||||||||    
T  16882508 ttcagactctctgatga 16882524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 8729034 - 8728939
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatg 666  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||| ||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8729034 ttccattccttctgcaatcatatgcattcaaaataacaacatttaacaaacttcagtttccagtcttcagactctgatgaacttcagcttctgatg 8728939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 9080921 - 9080826
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatg 666  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||| ||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9080921 ttccattccttctgcaatcatatgcattcaaaataacaacatttaacaaacttcagtttccagtcttcagactctgatgaacttcagcttctgatg 9080826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31104095 - 31103955
Alignment:
Q  77 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 176  Q
    ||||| ||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||| |||| |||| ||| ||    
T  31104095 aatgatagggatcttaaggttgtacaggtatgagattgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttgatactatctataccaactagatgcatttt 31103996  T
Q  177 cttttcggtagcccaaa--ccataagaactccacatttaag 215  Q
    ||||| |||||| |  |  ||||||||||| ||||||||||    
T  31103995 ctttttggtagctctcattccataagaacttcacatttaag 31103955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 302
Target Start/End: Original strand, 15377344 - 15377520
Alignment:
Q  126 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| |  ||||||||| ||| ||   ||||| ||||||||||| ||||   ||||||||    
T  15377344 gaaggcttataagaattgtttggtattactggtaccaacaagatgccacttcttttcagtacccaggaccattagaactccacagttaaatgtgcttgac 15377443  T
Q  226 ttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaa 302  Q
    |||||  | | || |||||| ||||||| |||||| |||  |  |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15377444 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgttgaaa 15377520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 22766569 - 22766470
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 670  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  || ||||||    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  22766569 ttccattccttctgcaatcataagcattcagaataacaac-ttaaactaa----agcttccagtcttcagactttgatgaacttcagcttctgatgatct 22766475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 32388926 - 32388843
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32388926 atgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggtcgtg 32388843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 345
Target Start/End: Original strand, 15405606 - 15405825
Alignment:
Q  126 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||||||||| |  ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| | ||||   ||||||||    
T  15405606 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15405705  T
Q  226 ttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggt 325  Q
    |||||  | | || |||||| ||||||| |||||| |||  |  |||| |||| |||||| |||||||||| |||||  || | ||||||| |||  |||    
T  15405706 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgctgaaagaacccgtgttggtttgtaaggt 15405805  T
Q  326 cagtcgacaattcttaaagt 345  Q
    ||| ||||||| | ||||||    
T  15405806 caggcgacaatacataaagt 15405825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 345
Target Start/End: Original strand, 15411015 - 15411234
Alignment:
Q  126 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||||||||| |  ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| | ||||   ||||||||    
T  15411015 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15411114  T
Q  226 ttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggt 325  Q
    |||||  | | || |||||| ||||||| |||||| |||  |  |||| |||| |||||| |||||||||| |||||  || | ||||||| |||  |||    
T  15411115 ttggatcaattttgggatgggtgaccttttgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacaaagcacggtgaaagaacccgtgttggtttgtaaggt 15411214  T
Q  326 cagtcgacaattcttaaagt 345  Q
    ||| ||||||| | ||||||    
T  15411215 cagacgacaatacataaagt 15411234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26310088 - 26309987
Alignment:
Q  113 tgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacattt 212  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||| ||  |||| ||||||| ||| ||    
T  26310088 tgcatggttgaaggacgatttataagaattttttgttactacatataccaaaaagatgcatcttctttatggtagctcattccattagaactcgacagtt 26309989  T
Q  213 aa 214  Q
    ||    
T  26309988 aa 26309987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 336
Target Start/End: Original strand, 41473746 - 41473811
Alignment:
Q  271 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41473746 aagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtggggtcagtcgccaat 41473811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 302
Target Start/End: Original strand, 15417431 - 15417607
Alignment:
Q  126 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||||||||| |  ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| | ||||   ||||||||    
T  15417431 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15417530  T
Q  226 ttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaa 302  Q
    |||||  | | || |||||| ||||||| |||||| |||  |  |||| |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  15417531 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgctgaaa 15417607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 345
Target Start/End: Original strand, 15392570 - 15392789
Alignment:
Q  126 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||||||||| |  ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| | ||||   ||||||||    
T  15392570 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccatcagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15392669  T
Q  226 ttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggt 325  Q
    |||||  | | || |||||| ||||||| |||||| |||  |  |||| |||| |||||| ||| |||||| |||||  |||| ||||||| |||  |||    
T  15392670 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacatagcacgctgaaagaactcgtgttggtttgtaaggt 15392769  T
Q  326 cagtcgacaattcttaaagt 345  Q
     || ||||||| | ||||||    
T  15392770 aaggcgacaatacataaagt 15392789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 19197916 - 19197821
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatg 666  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||  |  ||||||||||||   ||| |||| ||| |||||||||||    
T  19197916 ttccattccttctgcaatcatatgcattcagaataacaaaatttagctaactgaatattccagtcttcagcttctgatgatctttagcttctgatg 19197821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 364
Target Start/End: Original strand, 18318851 - 18318953
Alignment:
Q  262 tttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||| ||| ||| || ||| |||| |  ||||| ||||  |||||||||    
T  18318851 tttctcgcaaagcgtgcgagtgagaacaaaacacgctgaaaagattcgggttggtttgttgggacaatcggcaatccagaaagtcgtctgtgatgttaca 18318950  T
Q  362 agt 364  Q
    |||    
T  18318951 agt 18318953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 345
Target Start/End: Original strand, 15388203 - 15388422
Alignment:
Q  126 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 225  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||   || ||||||||| |  ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| | ||||   ||||||||    
T  15388203 gaaggcttataagaattgtttcgtattaccagtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccatcagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15388302  T
Q  226 ttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggt 325  Q
    |||||  | | || |||||| ||||||| |||||| |||  |  |||| |||| |||||| ||| |||||| |||||  |||| ||||||| |||  |||    
T  15388303 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacatagcacgctgaaagaactcgtgttggtttgtaaggt 15388402  T
Q  326 cagtcgacaattcttaaagt 345  Q
     || ||||||| | ||||||    
T  15388403 aaggcgacaatacataaagt 15388422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25231030 - 25230947
Alignment:
Q  279 gagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||  |||| |||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  25231030 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtatggtcggtcggcaatggttaaagtcgtctgggatgttacaa 25230947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26309901 - 26309839
Alignment:
Q  300 aaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  26309901 aaaagactcatgttggtttgtggggttagttaacaataattaaagtcgtctgggatgttacaa 26309839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 625 - 686
Target Start/End: Original strand, 27374950 - 27375012
Alignment:
Q  625 agcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctcttcagactctctgatga 686  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27374950 agcttccaatcttcatactttgatgaactctagcttctgatggttcttcagactctctgatga 27375012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 230
Target Start/End: Original strand, 15381257 - 15381294
Alignment:
Q  193 accataagaactccacatttaagcatgcttgacttgga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15381257 accataagaactccacatttaagtgtgcttgacttgga 15381294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 230
Target Start/End: Original strand, 15396492 - 15396529
Alignment:
Q  193 accataagaactccacatttaagcatgcttgacttgga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15396492 accataagaactccacatttaagtgtgcttgacttgga 15396529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 230
Target Start/End: Original strand, 15410628 - 15410665
Alignment:
Q  193 accataagaactccacatttaagcatgcttgacttgga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15410628 accataagaactccacatttaagtgtgcttgacttgga 15410665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 45047156 - 45047071
Alignment:
Q  69 cacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactac 154  Q
    ||||||| ||||| || |||||| |  ||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||| |||||||||||    
T  45047156 cacatcgaaatgatagtgatcctcagatcgtgcgagtatgagactgtatgattgaagaaaaacttataagaattatttggtactac 45047071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 182
Target Start/End: Original strand, 3890046 - 3890094
Alignment:
Q  134 ataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttc 182  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  3890046 ataagaattgtttgctactacatatatcaacaagatgcatctttttttc 3890094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 1821865 - 1822201
Alignment:
Q  26 ggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaa 124  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||    ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1821865 ggggagtggtccggctcatggcatgcttctaggcaaagttgaattacatcggaatgagagagatcttaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaa 1821964  T
Q  125 ggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttga 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1821965 ggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacatttaagcgtgcttga 1822064  T
Q  225 cttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtgggg 324  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||||||| || |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  1822065 cttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgtgaatgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtaggg 1822164  T
Q  325 tcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    || ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  1822165 tcggtcaacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 1822201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8642180 - 8641886
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8642180 aatcacatcagaatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaaca 8642081  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  8642080 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttaagatgggtgacc-tacgggaagtttc 8641982  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  8641981 tcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 8641886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Original strand, 22556486 - 22556848
Alignment:
Q  17 aatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgc 115  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||    
T  22556486 aatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgc 22556585  T
Q  116 atggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaag 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |  |||||||| |||| |||||    
T  22556586 atggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaacttcacagttaag 22556685  T
Q  216 catgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttg-aaaagactcatgttg 314  Q
    | ||  |||||||||| | | || |||||| ||||||    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| |||||    
T  22556686 cgtggctgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccaggaagtttctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgtaaaagactcgtgttg 22556785  T
Q  315 gtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 377  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22556786 gtttgtagggtcagtcgacaatccttaatgtcgtctgggatgttacaaatggtatcagagcag 22556848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Original strand, 2473910 - 2474260
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  2473910 atgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttttaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtacaggcatgagactgca 2474009  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  2474010 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 2474109  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||||||| | | || |||||| |||||          | || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  2474110 gtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc----------tatcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 2474199  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 377  Q
     |||||||||||||| |||| || ||||  || | ||||||||| | ||||||||||||||    
T  2474200 ttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtatgggatgttaccaatggtatcagagcag 2474260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3887252 - 3886893
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||||| |||||||    
T  3887252 atgagggcggggagtggtccagctcctggcatgcttttaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggccgtacaggtatgggactgca 3887153  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  3887152 tggttgaaggaagacttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtaactcattccataagaacttcacagttaagc 3887053  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  3887052 gtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgacaagactcgtgttggt 3886953  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 376  Q
     |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  3886952 ttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtgtcagagca 3886893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 2474356 - 2474701
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  2474356 atgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagagatcctaaggtcgtacagatatgggactgca 2474455  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  2474456 tggttgaaggaagacttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 2474555  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||||||| | | ||  ||||| ||||||   || || |||| ||| |||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  2474556 gtgcttgacttggagcaattttgagatgggtgacctaccggaaagtttcccggtaagcatgcgagtgaggaaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 2474655  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||| |||||||    
T  2474656 ttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtctgggacgttacaa 2474701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 66 - 373
Target Start/End: Original strand, 34371612 - 34371919
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| || | ||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34371612 aatcacaccggaatgagagggttcccaaggccgtacaggtgtgggactgcatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaaca 34371711  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| ||||    
T  34371712 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacaccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagtttc 34371811  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  34371812 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 34371911  T
Q  366 gtatcaga 373  Q
    ||||||||    
T  34371912 gtatcaga 34371919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 51 - 361
Target Start/End: Original strand, 189053 - 189363
Alignment:
Q  51 ttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggta 150  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  189053 ttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggta 189152  T
Q  151 ctacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgac 250  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||    
T  189153 ctacctatatcaacaagatgtatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcatgcttgacttggagcaattttgggatgggtgac 189252  T
Q  251 cttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtct 350  Q
    ||   || || |||| ||| || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||| || ||||| ||||    
T  189253 ctaccggaaagtttcccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagtccgcaatcctgaaagtagtct 189352  T
Q  351 aggatgttaca 361  Q
     ||||||||||    
T  189353 gggatgttaca 189363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10927549 - 10927238
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10927549 aatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 10927450  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    ||||| |||     
T  10927449 agatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgaccgaccgggaagtttt 10927350  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
    |||| ||||||| || |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| |  ||||  || | |||||||| || ||    
T  10927349 tcggtaagcgtgtgaatgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcggtcgacaatcccaaaagacgtatgggatgttagaaatg 10927250  T
Q  366 gtatcagagcag 377  Q
     |||||||||||    
T  10927249 atatcagagcag 10927238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17445601 - 17445306
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17445601 aatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 17445502  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  17445501 agatgcatcttcttatcggtagctcattccataagaaatccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 17445402  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||    
T  17445401 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagtcgcctgggatgttaca 17445306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 363
Target Start/End: Original strand, 22556920 - 22557267
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | || | | | |||||||||||| |||||||    
T  22556920 atgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttcttggcaaaactgaatcacatcggaatgagagagttcatgaggccgtgcaggtatgggactgca 22557019  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |  |||||||| |||| ||||||    
T  22557020 tggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactaccaatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaacttcacagttaagc 22557119  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttg-aaaagactcatgttgg 315  Q
     ||| |||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||    
T  22557120 gtgcctgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgtaaaagactcgtgttgg 22557219  T
Q  316 tatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaag 363  Q
    | ||| ||||||||||||||| || || || |||| ||||||||||||    
T  22557220 tttgtagggtcagtcgacaatcctgaatgtcgtctgggatgttacaag 22557267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3886796 - 3886452
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  3886796 atgagggcggggaatggtccggctcctagcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggtcgtacaagtatgggactgca 3886697  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  3886696 tggtagaaggaatgcttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 3886597  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     || ||||| ||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  3886596 gtgtttgacgtggagcaatttttggatgggtgacctaccgggaagtttcccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 3886497  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     |||||||||||||| |||| || ||||   ||| ||||||||||    
T  3886496 ttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcattctgggatgttaca 3886452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27646981 - 27646684
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  27646981 aatcacatcggaatgagagggatcctagggccgtgtaggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctataacaaca 27646882  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | |||| ||||||   ||||| ||||    
T  27646881 agatgcatcttctttttggtagcccatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgtcttggagtagtctttgcatgggtgacctaccgggaagtttc 27646782  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtc-gacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     |   || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| |||  |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27646781 ccaataaacgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcatgttggtttgtatggtcagtcggaaaatgcttaaagttgtctgggatgttacaa 27646684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20039620 - 20039326
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | |||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20039620 aatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtataggactacatagttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20039521  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||  |||||| ||||    
T  20039520 agatgcattttctttt-ggtagcccattccataagaactctacagttaagtgtgcttgacttagagtagtctttggattggtgacctattgggaagtttc 20039422  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20039421 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcatgttggtttgt-tgatcagttggcaatgcttaaagtcgtctaggatgttacaa 20039326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 42788792 - 42788497
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | |||| |||  || |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42788792 aatcacaacggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggattgggactacatggttgaaagaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 42788693  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||| | ||||||   ||||| ||||    
T  42788692 agatgcatcttcttttcggtagctcattccacaagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggataggtgacctaccgggaagtttc 42788593  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  42788592 tcggtaagcttgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtggagtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 42788497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21886292 - 21886067
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21886292 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacatatatcaaca 21886193  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| ||||    
T  21886192 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaaagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagtttc 21886093  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaa 291  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||    
T  21886092 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaa 21886067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Original strand, 39146939 - 39147227
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | | |||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  39146939 aatcacatcgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtagacttataagaattgtttgatactacttatattaaca 39147038  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||        
T  39147039 agatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtcgtatgatgggtgacctactgggaaa---- 39147134  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
       | ||||||||||| ||| |||||  ||| |  |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  39147135 ---gtaagcgtgcgagagaggacaaaaaacgctagaaagactcatgttggtttgtagggtcaatcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 39147227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10927092 - 10926873
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10927092 aatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 10926993  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| |||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  10926992 agatgcatcttccttttggtagtccattccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttc 10926893  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgag 285  Q
      || ||||||| |||||||    
T  10926892 ctggtaagcgtgtgagtgag 10926873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 80 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18750328 - 18750047
Alignment:
Q  80 gagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctt 179  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||    
T  18750328 gagagagatcctgaagtcgtgcaggtttggaactgcatggttgaaggaaggattataacaattgtttggtactacctataccaaaaagatgcatcttctt 18750229  T
Q  180 ttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcg 279  Q
    |||||||||  |  |||||||||||||| | |||| | | |||||||||||| | | ||||||||| ||||||| | |||| ||| |  ||||| |||||    
T  18750228 ttcggtagcttattccataagaactccataattaatcgtacttgacttggagcaattttaggatgggtgaccttctaggaagttttttagaaagtgtgcg 18750129  T
Q  280 agtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |||||| ||||| |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  18750128 agtgaggacaaaacacactgaaaagactcgagttggtttgtggggtcagtcaacaatacttaaagtcgtatgggatgttaca 18750047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8391467 - 8391202
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | | |||| ||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||    
T  8391467 aatcacatcggaatgagagggattctgaggccgtgtaggcatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactcctg-tatcaaca 8391369  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  8391368 agatgcatcttcttttcggtagctaattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 8391269  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcga 332  Q
    |||  || |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  8391268 tcgataaacgtgcgagtgaggacaaaacacgctgagaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcga 8391202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29680236 - 29679958
Alignment:
Q  76 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 175  Q
    ||||||||| |||| | | | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||       ||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  29680236 gaatgagagagatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataag-------tggtaatacctatatcaacaagatgcatct 29680144  T
Q  176 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 275  Q
    |||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||  | ||| |||| ||  |||||    
T  29680143 tctttttggtagcccattacataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgaccttccgagaagtttcccgataagcg 29680044  T
Q  276 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    ||| | |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  29680043 tgcaaatgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtct-ggatgttacaa 29679958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 362
Target Start/End: Original strand, 2193824 - 2194100
Alignment:
Q  74 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 173  Q
    |||||||||||||||| | | | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  2193824 cggaatgagagggatcatgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 2193923  T
Q  174 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 273  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||            |  ||| |||    
T  2193924 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc------------taccggtaag 2194011  T
Q  274 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  2194012 tgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacaa 2194100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24182391 - 24182113
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||  |||||||||||||| | |   |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||    
T  24182391 aatcacattagaatgagagggatcttgagaacgtgcaagtatgagacgaaatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactatctataccaaca 24182292  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| || ||||||||||| | | || |||||| ||||||| |   || ||||    
T  24182291 agatgcatcttc-tttcggtaccccaaaccataataacttaacagttaagcgtggttgacttggagcaattttgggatgggtgaccttctaaaaagtttc 24182193  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 345  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| || |||||    
T  24182192 tcggaaagtgtgcgagtgaggataaaacacgttgaaaagattcgtgttggtttgtggggttagtcgacaatcctgaaagt 24182113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15513159 - 15512863
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaag--gcttataagaattttttggtactacttatatcaa 163  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |  ||| ||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||  |||||||    
T  15513159 aatcacatcggaatgagagggatcattaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatatgcttataagaattgtt-ggtactaccaatatcaa 15513061  T
Q  164 caagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatt 263  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || | | || |||||| ||||||   ||||| ||    
T  15513060 caagatgcatcttctttttggtatctcattccataagaactccacaattaaacgtgcttgacttgaagcaattttgggatggatgacctaccgggaagtt 15512961  T
Q  264 tctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| |||| |||||    
T  15512960 tcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatattaca 15512863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30684739 - 30684432
Alignment:
Q  30 agtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||  ||  ||| |||||||| |    
T  30684739 agtggtccgactcctggcatgcttataggcaaaaccaaatcacatcggaatgagggggatcctgaggttgtgcaagtatggaacatcattgttgaaggga 30684640  T
Q  129 ggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttg 228  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||    
T  30684639 ggcttatatgaattgtttggtactatctataaaaacaagatgcatcttcttttcggtaggtcaaaccataagaactccacagttaagcgtgctcaacttg 30684540  T
Q  229 gagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcag 328  Q
    ||| | | || |||||| ||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||| || |||||  |   | ||||||||||| ||| | ||||||||||     
T  30684539 gagcaattttgggatgggtgaccttctgaaaagtttctcgaaaagcgtgcgagtaaggacaaaatatactaaaaagactcatattgatttgtggggtcaa 30684440  T
Q  329 tcgacaat 336  Q
    ||| ||||    
T  30684439 tcgtcaat 30684432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 363
Target Start/End: Original strand, 34372068 - 34372365
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||| || | ||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34372068 aatcacaccagaatgagagggttcccaaggccgtacaagtatgggactacatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaaca 34372167  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | | || |||| | ||||||   ||||| |||     
T  34372168 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggattggtgacctaccgggaagtttt 34372267  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaag 363  Q
     ||  ||||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||| ||||||| | ||| |||||||| |||| || ||||  |||| | ||||||||||    
T  34372268 ccgataagcgtgcgagtgaggaaaaaacacgctgaaaatactcgtgttggtttatggcgtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggaatgttacaag 34372365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 227
Target Start/End: Original strand, 34867790 - 34867951
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34867790 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 34867889  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgactt 227  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||    
T  34867890 agatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccatagttaagcgtgcttaactt 34867951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30719988 - 30719786
Alignment:
Q  30 agtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaa 128  Q
    |||||||||||||||| || | || | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||  ||| ||||||||||    
T  30719988 agtggtccgactcctgacacgcttattggcaaaaccgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggttgtgcaagtatgggacatcattgttgaaggaa 30719889  T
Q  129 ggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttg 228  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||    
T  30719888 ggcttatatgaattgtttggtactacctataaaaacaagatgcatcttcttttcggtaggtcaaaccataagaactccacaattaagcgtgctcaacttg 30719789  T
Q  229 gag 231  Q
    |||    
T  30719788 gag 30719786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 328
Target Start/End: Original strand, 18304431 - 18304693
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||| ||||| ||| | || |||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18304431 aatcacaacggaatgagaaggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggatgatgaaaagcttatataaattgtttggtactacctatatcaaca 18304530  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||  ||||| ||||||| || ||| ||||    
T  18304531 agatgcatattcttttcggtagctcattccataagaattccacagttaagcatgtttgacttggagcaattttgtgatgggtgaccttttgagaagtttc 18304630  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcag 328  Q
     | ||||  ||||||||||| ||||| |||| |||| | |||| ||||| | | |||||||||    
T  18304631 acagaaattgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaacaaactcgtgttgatttctggggtcag 18304693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16370852 - 16370588
Alignment:
Q  68 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaag 167  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | | | || |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16370852 tcacatcgaaatgagagggttcctgatgccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacttatatcaacaag 16370753  T
Q  168 atacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctc 267  Q
    |   |||||||||| ||||||| ||   || ||||| || || ||||||||| ||||||||||| | | || |||||| |||| || ||  || ||||||    
T  16370752 acgtatcttctttttggtagcctaa---atcagaaccccgcagttaagcatgtttgacttggagcaattttgggatgggtgacattctgaaaagtttctc 16370656  T
Q  268 ggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
      ||||||||||| |||| | ||| |||  |||||||| | | |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  16370655 ataaagcgtgcgaatgaggaaaaaacacactgaaaagatttacgttgatatgt-gggtcagttgacaat 16370588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2058840 - 2058699
Alignment:
Q  29 gagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaa-cataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaagga 127  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  2058840 gagtggttcgactcctgtcatcttctaggcaaaaaccgaatcacatcggattgagagagatcctgaagtcatgcagctatgagactggatgattgaagga 2058741  T
Q  128 aggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagat 169  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2058740 agacttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagat 2058699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 22975205 - 22975080
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| || ||||||||||  ||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||    
T  22975205 atgagggcgaggagtggtccagctcttggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgtgactgca 22975106  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaatt 142  Q
    ||||||||| || |||||||||||||    
T  22975105 tggttgaagaaaagcttataagaatt 22975080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 11757347 - 11757157
Alignment:
Q  146 tggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatgg 245  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  || | | |   |||||    
T  11757347 tggtactacttatatcaacaaaatgcatcttcttttcggtagttcaatccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttacagcaatttcgagatgg 11757248  T
Q  246 ctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
     ||||||   ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||   || | ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  11757247 gtgacctaccgggaaatttttcggtaagcgtgtgagtgaggacgaaatccgcttaaaagactcttgttggtttgcggggtcagtcggcaat 11757157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11160822 - 11160713
Alignment:
Q  71 catcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagata 170  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||     
T  11160822 catcggaatgagagggatcatgaagtcgtgtaggtatgacactacatagttgaaggaaggcttataataattgtttggtactatctatgtcaacaagatg 11160723  T
Q  171 catcttcttt 180  Q
    ||| ||||||    
T  11160722 catattcttt 11160713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20858633 - 20858393
Alignment:
Q  120 ttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatg 219  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| | |||||  ||    
T  20858633 ttgaagaaaggcttataagaattgtttggtattttctatatcaacaagatgcttcttcttttctgtagctcattccataagaactccatagttaaggttg 20858534  T
Q  220 cttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatg 319  Q
    |||||||||||| |   || |||||| ||||||| |||||| |||   | ||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||| |||| ||||| | ||    
T  20858533 cttgacttggagcaactttgggatgg-tgaccttctgggaagttttctgaaaagcatgctagtgaggacaaaacacgctgaaaatactcgtgttgatttg 20858435  T
Q  320 tggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |  |||||||||||||| || ||||  || | ||||||||||    
T  20858434 ttaggtcagtcgacaatcctgaaagaagtttgggatgttaca 20858393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4658167 - 4657979
Alignment:
Q  36 ccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttat 135  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||    
T  4658167 ccgactcctgacagcctctaggcaaa-ctgaatcacatcgaaataagagggatcttgaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaacgaa-gattat 4658070  T
Q  136 aagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgactt 227  Q
    |||| || |||| |||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| |||| || | ||||||||||||    
T  4658069 aagacttgtttgatactacctataacaacaacatgcatcttctttttggtagtccattccataagaacttcacagtt-atcatgcttgactt 4657979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32574774 - 32574639
Alignment:
Q  95 gtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaac 194  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || ||||||  ||| ||||||||||||    
T  32574774 gtcgtgtaggtatgagactgcacggttaaag-aaggcttataggaattgtttggtactacctatacaaacaaaatgcatctttcttttggtagcccaaac 32574676  T
Q  195 cataagaactccacatttaagcatgcttgacttggag 231  Q
     |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  32574675 tataataacttcatagttaagcgtgcttgacttggag 32574639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 571 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 26119849 - 26119734
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 670  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||| ||| | ||||| | |||||| ||| |||||    
T  26119849 ttccattccttttgcaatgatatgcattcaaaataacaacagttaactaacttcagcttccagttttcagactatgatgaaatccagcttttgaggctct 26119750  T
Q  671 tcagactctctgatga 686  Q
    ||||||||||||||||    
T  26119749 tcagactctctgatga 26119734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5067037 - 5066865
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||  | | |||||| ||||||||||| ||| || ||||||  |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||    
T  5067037 aatcacaccagaatgagagagatcccgaggccgtgcatgtatgagactgtatgattaaaggaaaacttataagaattgtttggtattatctatatcaaca 5066938  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtctt 238  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| | |   ||||| ||||||||| |||| | || ||| ||||||||||||||    
T  5066937 agatgcattttctttttggtagtctatttcataaaaactccacaattaaacgtgtttgccttggagtagtctt 5066865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 287 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 21884010 - 21883912
Alignment:
Q  287 acaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcaggtaggtcc 385  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  21884010 acaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcttgaaagcagtctgggatgttagaattggtatcagagcaggtcggtcc 21883912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 43356790 - 43356651
Alignment:
Q  40 ctcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataaga 139  Q
    |||||||| |||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||    
T  43356790 ctcctggcggtttctaggcgaactaaattcacatcggaatgagaggg-tcctgagatcatgcaggtatgagactgcatgattga-ggatgacttataaga 43356693  T
Q  140 attttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 181  Q
    ||| |||||||| || || | |||||| || |||||||||||    
T  43356692 attgtttggtacaacctaaaccaacaatatgcatcttctttt 43356651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 572 - 639
Target Start/End: Original strand, 23589831 - 23589898
Alignment:
Q  572 tccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttca 639  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  23589831 tccattccttctgcaatcatatgcattcagaataacaacatttaactaacttcagcttccagtcttca 23589898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30720287 - 30720101
Alignment:
Q  185 tagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtga 284  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| |||| | |||||||||||||  | | || |||||| |||| || | | ||  ||  || |||||||||||| ||    
T  30720287 tagcctaaacaataagaactctacagttaatcgtgcttgacttggaacaattttgggatggatgactttcttgaaagctttccgaaaagcgtgcgagcga 30720188  T
Q  285 gaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatca 371  Q
    | ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||  | ||||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  30720187 ggacaaaacacgctgaaaagactcctgttggtttgtggagtcaatcgacaatcttgaaagcagtctgggatgttacacgtggtatca 30720101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 227
Target Start/End: Original strand, 42429146 - 42429306
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |   |||| ||||||| ||   ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  42429146 aatcacatcggaataagagg-atcctgagaccgtgtaggtatgtgaacacatggttgaaggaggacttataagaattgtttggtactacctttatcaaca 42429244  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgactt 227  Q
    | || ||| |||||||| |||||||    |||||||||| || | |||||  ||||||||||    
T  42429245 atatgcatattcttttccgtagcccgttacataagaacttcatagttaagggtgcttgactt 42429306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Original strand, 4102812 - 4102961
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||     ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || | ||       
T  4102812 aatcacatctgaatgagagggattctgataccgtgcaggtatgagactg-----ttgaaagaatgcttataagaattgtttggtactacatacacca--- 4102903  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggag 231  Q
            ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||    
T  4102904 --------ctttttttcggtagcccaaaccataagaacttcacagttaaacgtgcttgacttggag 4102961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4673568 - 4673467
Alignment:
Q  115 catggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 214  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || | |||||||||||| ||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||| ||||    
T  4673568 catgattgaaggaagtcttataagaattatttggtagcacctgtatcaacaagatgcatattctttttggtatttcattccataagaactccacagttaa 4673469  T
Q  215 gc 216  Q
    ||    
T  4673468 gc 4673467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 676
Target Start/End: Original strand, 20969318 - 20969419
Alignment:
Q  575 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcag 674  Q
    ||||||||| || |||| ||  |||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| | |||||||    
T  20969318 attccttctacagtgatgtgtcttcaaaataacaagctttaactaactacagcttccagtcttcagactttgaagaacttcagcttctgaggatcttcag 20969417  T
Q  675 ac 676  Q
    ||    
T  20969418 ac 20969419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 350
Target Start/End: Original strand, 1880281 - 1880360
Alignment:
Q  271 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtct 350  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  1880281 aagcgagcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtaaggtccgtcgacaatgcttaaagtcgtct 1880360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 202
Target Start/End: Original strand, 5549344 - 5549481
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattt-tttggtactacttatatcaac 164  Q
    |||||||||||||||||| || || | ||  | || |||||||||| || ||  |||||||||  ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  5549344 aatcacatcggaatgagatggttcatgaaaccatgtaggtatgagattgtataattgaaggaaaacttataaaaaattgtttggtactacgtataccaac 5549443  T
Q  165 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaa 202  Q
    || ||   | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5549444 aatatgtttattctttttggtagcccaaaccataagaa 5549481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26341269 - 26341171
Alignment:
Q  218 tgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||| | |||| | || ||||||| ||||| |||||  ||||||||  |||||||    
T  26341269 tgcttgatttggagtagtctttggatgggtgaccttttgaaaaatttcccagaaaacatgtgagtgaggacaaaacacgtctaaaagactggtgttggt 26341171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30684953 - 30684887
Alignment:
Q  270 aaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    ||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30684953 aaagcgtgcaagcgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcggcaat 30684887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 575 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 31589033 - 31588951
Alignment:
Q  575 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcag 657  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||| |||||  | |||| |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  31589033 attccttctgcaatgatgtgtcttcagaataacaaactttaattaactgcaacttctagtcttcagactctgatgatcttcag 31588951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 316
Target Start/End: Original strand, 187763 - 187808
Alignment:
Q  271 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  187763 aagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 187808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 11757387 - 11757354
Alignment:
Q  67 atcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11757387 atcacatcggaatgagagggatcctaaagccgtg 11757354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 639
Target Start/End: Original strand, 20567923 - 20567987
Alignment:
Q  574 cattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttca 639  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  20567923 cattccttctgcaatcataagcatt-agaataacaacatttaactaacttcagcttccagtcttca 20567987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 377
Target Start/End: Original strand, 30966193 - 30966545
Alignment:
Q  26 ggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaa 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30966193 ggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcgcatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaa 30966292  T
Q  125 ggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttga 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  30966293 ggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtatctcattccataagaactccatagttaagcgtgcttga 30966392  T
Q  225 cttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtgggg 324  Q
    ||||||  | | || |||||| ||||||   ||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30966393 cttggaccaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttctcggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtgggg 30966492  T
Q  325 tcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 377  Q
    ||||||| |||| || ||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  30966493 tcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttagaaatggtatcagagcag 30966545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 30966641 - 30966986
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||||||    
T  30966641 atgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcgcatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgca 30966740  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  30966741 tggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 30966840  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     ||||| |||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30966841 gtgcttaacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggt 30966940  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||||| |||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  30966941 ttgtggagtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 30966986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 67 - 376
Target Start/End: Original strand, 16378938 - 16379247
Alignment:
Q  67 atcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  16378938 atcacaccggaatgagagggattccgaggccgtgcaagtatgagactgcatggttgaaggaagtcttatacgaattgtttgatactacctatatcaacaa 16379037  T
Q  167 gatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttct 266  Q
    ||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||| ||||     
T  16379038 gatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctatcgggaagtttcc 16379137  T
Q  267 cggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtgg 366  Q
     || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||    
T  16379138 gggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagttgtttggaatgttacaaatgg 16379237  T
Q  367 tatcagagca 376  Q
    ||||||||||    
T  16379238 tatcagagca 16379247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 24818285 - 24818620
Alignment:
Q  26 ggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaa 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24818285 ggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaa 24818384  T
Q  125 ggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttga 224  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24818385 ggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatctttttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttga 24818484  T
Q  225 cttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtgggg 324  Q
    ||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||  || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24818485 cttggagcaat-tttggatgggtgacctaccgggaagtttcctggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggg 24818583  T
Q  325 tcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||    
T  24818584 tcagtcgacaatgctgaaagtagtcggggatgttaca 24818620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Original strand, 1912525 - 1912820
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1912525 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggttatgtaggtatgagactacatggttgaaagtagatttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 1912624  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| |||||| | ||||   ||||| ||||    
T  1912625 agatgcatcttctttt-ggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttggagtactctttggatgggttacctaccgggaagtttc 1912723  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  1912724 tcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagagtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttacaa 1912820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Original strand, 16379393 - 16379689
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16379393 aatcaaattggaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatacgaattgtttggtactacctatatcaaca 16379492  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  16379493 agatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtaatctttggatgggtgacctaccgggaagtttc 16379592  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     | | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  16379593 actgtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcattcgacaatgcttaaagttgtctcgaatgttacaa 16379689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25338143 - 25337847
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  25338143 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 25338044  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  25338043 agatgcatcttcttttcgatagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 25337944  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  ||||  ||||||||||    
T  25337943 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgagatgttacaa 25337847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5400012 - 5399667
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||| || || |    
T  5400012 atgagggcagggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcggaatgagagggatcttgaggtcgtgcaagtatgggagtgta 5399913  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | ||||||    
T  5399912 tggtttaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcatagttaagc 5399813  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||||||| | | || |||||| ||||||    |||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||||    
T  5399812 gtgcttgacttggagaaattttgggatgggtgacctaccaggaagttttccggtaagcgtgcgagtgagaacaaaacacgctggaaagacttgtgttggt 5399713  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  5399712 ttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttacaa 5399667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 316
Target Start/End: Original strand, 15619902 - 15620148
Alignment:
Q  70 acatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagat 169  Q
    ||||| |||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15619902 acatcagaatgagagggatcccgatgccgtgcaagtatgagactgcatagttgaaggcaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagat 15620001  T
Q  170 acatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcgg 269  Q
    |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||    
T  15620002 acatcttctttttggaaacccaatccataagaactccacaattaagcgtgcttgactttgagtagtctttggatgggtgacctactgggaagtttctcgg 15620101  T
Q  270 aaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  15620102 taagcgtgcgagtgaggacaaaactcgctgaaaagactcgtgttggt 15620148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Original strand, 33174958 - 33175251
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33174958 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 33175057  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||   |||||| |||    
T  33175058 agatgcatcttctttttggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtg-ttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggaaa-ttc 33175155  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| |||| || ||| |||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  33175156 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctggaaagactcgtgttagtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 33175251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29259815 - 29259504
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| |   ||| || ||||| |||||||    
T  29259815 atgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaagactgaatcacatcggaatgagagggatcctgagaccgtacaagtatgggactgca 29259716  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||| || | ||||||    
T  29259715 tggttgaaggaaggcttattaaaattgtttggtactacatatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaacttcatagttaagc 29259616  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||| ||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29259615 gtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggt 29259516  T
Q  317 atgtggggtcag 328  Q
     |||||| ||||    
T  29259515 ttgtgggatcag 29259504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 376
Target Start/End: Original strand, 33174505 - 33174812
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33174505 aatcacatcggaatgagagggatcctgatgccgtgtaggtatgggactaca--gttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 33174602  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |   |||||| |||    
T  33174603 agatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacataccgggaaa-ttc 33174701  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| |||||||||||| || | ||| || | |  |||||| | |||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||| ||| ||    
T  33174702 ccggtaagcgtgcgagttaggaaaaaacatgctagaaagacccgtgtttgtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtatgtgatgttgcaaatg 33174801  T
Q  366 gtatcagagca 376  Q
    |||||||||||    
T  33174802 gtatcagagca 33174812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30963857 - 30963554
Alignment:
Q  75 ggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatc 174  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  30963857 ggaatgagagggatcatgaagccgtgcaggtaagagaatgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtatggttctacctatatcaacaagatgcatc 30963758  T
Q  175 ttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagc 274  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| || |||| | ||||||| | |||| ||| ||||||| |    
T  30963757 ttctttctggtagcccaaaccataataactccacagttaagcgtgcttgacttggcggagttttgggataggtgaccttctaggaagtttgtcggaaacc 30963658  T
Q  275 gtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaatt--cttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcag 372  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| || ||  || ||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  30963657 gtgcgagtgaggacaaaacacagtgaaaagactcgttttggtttgtgggatcagtcggcactttcctgaaagaagtcttgggtgttacaagtggtatcag 30963558  T
Q  373 agca 376  Q
    ||||    
T  30963557 agca 30963554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 113 - 361
Target Start/End: Original strand, 15639781 - 15640029
Alignment:
Q  113 tgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacattt 212  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| |||||||||||| ||    
T  15639781 tgcatagttgaaggcacgcttataggaattgtttggtactacctatatcaacaacatacatcttctttttggaaacccaatccacaagaactccacaatt 15639880  T
Q  213 aagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgt 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||    
T  15639881 aagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctactgggaagtttctcgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgcagaaaagactcgtgt 15639980  T
Q  313 tggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||||  || |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  15639981 tggttggtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 15640029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30963407 - 30963103
Alignment:
Q  68 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaag 167  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||| ||  || ||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  30963407 tcacatcagaatgagagggatcatgaagccgcacatgtatatgaatgcatgattgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaag 30963308  T
Q  168 atacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctc 267  Q
    || |||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||  ||||||| | |||| ||||||    
T  30963307 atgcatcttatttttggtagcccaaatcataagaattcaacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgagtgaccttcttggaagtttctc 30963208  T
Q  268 ggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggt 367  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||||  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  30963207 ggaaagcgtgcgagtgaggataaaatacgttgaaaagactcgtgttggtttgtgaggtcaatcggcaatcatgaaagcagttttggatgttacaagtggt 30963108  T
Q  368 atcag 372  Q
    |||||    
T  30963107 atcag 30963103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 317
Target Start/End: Original strand, 8256534 - 8256777
Alignment:
Q  74 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 173  Q
    |||||||||||||||| | ||| | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  8256534 cggaatgagagggatcttgaagccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 8256633  T
Q  174 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 273  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| |||  ||  |||    
T  8256634 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctgctgggaagttttccgataag 8256733  T
Q  274 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggta 317  Q
    |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  8256734 cgtgcgagtgaggacaaaatacgctgaaaagactcatgttggta 8256777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 102 - 361
Target Start/End: Original strand, 33771037 - 33771296
Alignment:
Q  102 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||    
T  33771037 aggtatgggactgcagggttgaagaaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataaga 33771136  T
Q  202 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||| |||  ||||    
T  33771137 actccacagttaagcatgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacactgaa 33771236  T
Q  302 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||   ||| ||||||||||    
T  33771237 aagactcgtgttggtttgtggggtcagccggcaattctgaaagcaatctgggatgttaca 33771296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25434202 - 25433907
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || | ||||||||    
T  25434202 aatcacaccggaatgagagggatcctgaggccgtgctggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatacaacctttatcaaca 25434103  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    ||||| |||     
T  25434102 agatgcatctcctttctggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtggtctttggatgggtgaccaacagggaagtttt 25434003  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
      || ||||||| |||| || ||||| |||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  25434002 ctggtaagcgtgtgagtaaggacaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcatctgggatgttaca 25433907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 296
Target Start/End: Original strand, 41754289 - 41754519
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  41754289 aatcacaccggaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaaca 41754388  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   || || ||||    
T  41754389 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggatgacctaccggaaagtttc 41754488  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacg 296  Q
     ||| || |||||||||||| ||||| ||||    
T  41754489 ccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacacg 41754519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Original strand, 1707042 - 1707336
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |    ||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1707042 aatcacatcggaatgagagg-atcctgagactgtgtaggtatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 1707140  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||| |||||| ||||||    |||| ||||    
T  1707141 agatgcatcttctttttggtagcccatctcataagaactccacagttaagagtgtttgacttgaagtagtctttggatgggtgacctaccaggaagtttc 1707240  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||| ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||| ||  |||| | | | |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  1707241 ccggtaagcgtgcgagtgaatacaaaacacgctaaaaagattcgcgttgatttatagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 1707336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30962077 - 30961759
Alignment:
Q  26 ggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaag 125  Q
    |||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||   ||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  30962077 ggggagtggttcagctcctggcagcttctaggaaaaatcgaatcacatcagaatgagagagatcctgaagccgtgtaggtatgggattgcatggttgaag 30961978  T
Q  126 ga--------aggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagca 217  Q
    ||        || ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |     
T  30961977 gatttaaggaagtcttataagatttgattggtactacctatatcaacaagatgcatatttttttcggtagccgaaaccataagaactccacagttaaacg 30961878  T
Q  218 tgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggta 317  Q
    |||||||||| ||| | | || |||||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||  |||| ||     
T  30961877 tgcttgacttagagcaattttgggatgggtgaccttctgggtagtttctcagaaagcgtgcgagtgaggacaaaacacagtgaaaagacttgtgttagtt 30961778  T
Q  318 tgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  30961777 tgtggggtcaatcggcaat 30961759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 199
Target Start/End: Original strand, 1953145 - 1953288
Alignment:
Q  56 ggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactact 155  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||     
T  1953145 ggcaaaaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacctataagaattgtttggtactacc 1953244  T
Q  156 tatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataa 199  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1953245 tatatcaactagatgcatcttctttttggtagtccaaaccataa 1953288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 228
Target Start/End: Original strand, 29804682 - 29804844
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  29804682 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggcaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 29804781  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttg 228  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29804782 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 29804844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 252
Target Start/End: Original strand, 11388189 - 11388373
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11388189 aatcacatcggaatgagagg-atcctgatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttaaaa-aattgtttggtactacctatatcaaca 11388286  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 252  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||    
T  11388287 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacct 11388373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27883072 - 27882822
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| |    
T  27883072 aatcacaccgaaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgagactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtattatctatatcaata 27882973  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||   |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||| | ||||||  || ||| |||     
T  27882972 agatgcatcttcttttttgtaggccgttccataagaactccacaattaagcgtgtttgacttggagtagtctttggataggtgacctactgagaagtttt 27882873  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
    |||| ||| |||| ||| || ||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  27882872 tcggtaagtgtgcaagtcaggacaaaacacgctgaaaagaatcttgttggt 27882822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 325
Target Start/End: Original strand, 82973 - 83276
Alignment:
Q  20 gaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatgg 119  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| |||||    
T  82973 gagggcggagagtggtctggctcctggcagcttctaggcaa--ctgaatcacgtcgaaatgagagggatcctgagattgtgcaggtatgagactacatgg 83070  T
Q  120 ttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatg 219  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||| |||||| ||  |||||||||||| ||| |||||| ||    
T  83071 ttgaaggtatgcttataagaatcgtttggtactacctataccaacaagatgaatcttttttttggtagctcattccataagaactctacagttaagcgtg 83170  T
Q  220 cttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatg 319  Q
     |||| |||||  | | ||  |||   |||||||  ||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||    
T  83171 tttgatttggaacaattttgtgatatgtgacctttagggtaatttttcagaaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgttgataagacttatgttggtttg 83270  T
Q  320 tggggt 325  Q
    ||||||    
T  83271 tggggt 83276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18099024 - 18098874
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18099024 aatcacatcggaatgagaggaatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 18098925  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| | ||||||    
T  18098924 agatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccatagttaagc 18098874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 38899058 - 38898872
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | | | |||| |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38899058 aatcacatcggaaggagagtgatcttgaggccgtgtaggtatcagactacatggttgaaggagagcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 38898959  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 252  Q
    |||| ||| ||||||| |||| | ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||    
T  38898958 agatgcattttctttttggtaacacatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttagagtagtctttggataggtgacct 38898872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 252
Target Start/End: Original strand, 11394566 - 11394719
Alignment:
Q  97 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaacca 196  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |  |||    
T  11394566 cgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttaaaa-aattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtag-ctattcca 11394663  T
Q  197 taagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 252  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||    
T  11394664 taagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacct 11394719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 214
Target Start/End: Original strand, 20502023 - 20502170
Alignment:
Q  68 tcacatcggaatgagagggatcctaaa--gtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  20502023 tcacaccggaatgagagggatcccaaaaggtcgtgcaagtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactttctatatcaaca 20502122  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 214  Q
    |||| | |||| |||| |||||||||   |||||||||| |||| ||||    
T  20502123 agatgcttctt-tttttggtagcccatttcataagaacttcacaattaa 20502170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 571 - 686
Target Start/End: Original strand, 24157948 - 24158063
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 670  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | |||    
T  24157948 ttccattccttctacaatgatatgcattcagaataacaacttttaactaacttcagcttccagtcttcagactctgatgaactccagcttttgaggttct 24158047  T
Q  671 tcagactctctgatga 686  Q
    ||||| ||||||||||    
T  24158048 tcagattctctgatga 24158063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 336
Target Start/End: Original strand, 13191010 - 13191244
Alignment:
Q  102 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 201  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||    ||||||    
T  13191010 aggtataagactgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatcttctttttggtagtccattttataaga 13191109  T
Q  202 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 301  Q
    |||||| | ||| |  ||||||||||| || | | ||  ||| | ||||||| ||| || ||||||  |||||||| || || | ||||| |||| | ||    
T  13191110 actccatagttatgtgtgcttgacttgaagaaattttgagataggtgaccttctggaaagtttctcaaaaagcgtgtgaatgcggacaaaacacgctaaa 13191209  T
Q  302 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    ||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  13191210 aagactagtgttggtttatggagtcagtcgacaat 13191244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18448064 - 18447954
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18448064 aatcacatcggaatgatagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaagtaagacttataagaattgtttggtactacttgtatcaaca 18447965  T
Q  166 agatacatctt 176  Q
    |||| ||||||    
T  18447964 agatgcatctt 18447954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 198 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32377921 - 32377757
Alignment:
Q  198 aagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgt 297  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||| | | || |||||| ||| ||  |||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||     
T  32377921 aagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatgggtgatctactgggaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgc 32377822  T
Q  298 tgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  32377821 tgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 32377757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 32377756 - 32377592
Alignment:
Q  172 atcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaa 271  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || |||| | ||||||   || || |||  ||| |    
T  32377756 atcttgttttcggtagctcattccaaaagaactccacagttaagcatgcttgacttggagcaattttgggataggtgacctaccggaaagttttccggta 32377657  T
Q  272 agcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32377656 agcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaaactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 32377592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 571 - 677
Target Start/End: Original strand, 22383587 - 22383693
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 670  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||||| |||    
T  22383587 ttccattccttctacaatgatatgtcttcagaataacaacttttaactaactctagcttgcagccttcagactctgttgacctttagcttctgatgatct 22383686  T
Q  671 tcagact 677  Q
    |||||||    
T  22383687 tcagact 22383693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 336
Target Start/End: Original strand, 8073902 - 8074162
Alignment:
Q  76 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 175  Q
    |||||||||||||| | |  | ||||||||||| | ||  | ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8073902 gaatgagagggatcatgagattgtgcaggtatgggtctataaggttgaagggagacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatct 8074001  T
Q  176 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 275  Q
    |||||   ||||||||   ||||||||||||| |  ||||| | ||||||||||   | | || |||||  |||||||   | || ||||||| |||| |    
T  8074002 tctttcttgtagcccatttcataagaactccatagataagccttcttgacttggttaaattttgggatgagtgaccttccagaaagtttctcgaaaagtg 8074101  T
Q  276 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    || || |||||||||| |||| |||||| |||  |||| || |||||| ||||||||||||    
T  8074102 tgtgattgagaacaaaacacgatgaaaaaacttgtgtttgtttgtgggatcagtcgacaat 8074162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 571 - 645
Target Start/End: Original strand, 21846263 - 21846337
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactct 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  21846263 ttccattccttctgcaatgatatgcattcagaataacaacttttaactaacttcagcttccagtcttcagactct 21846337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Original strand, 9909102 - 9909230
Alignment:
Q  76 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 175  Q
    |||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||  |||||||||||| || ||||||  |||  |||||||||| |||| ||||||||| || ||    
T  9909102 gaatgagagggatcctgaaatcgtataagtatgagactatatggttgaaggagggtttataatgattaattggtactacctataccaacaagattcaact 9909201  T
Q  176 tcttttcggtagcccaaaccataagaact 204  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  9909202 tctttttggtagcccaacacataagaact 9909230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 360
Target Start/End: Original strand, 20502172 - 20502258
Alignment:
Q  274 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttac 360  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20502172 cgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttagtttgtagggtcagtcggcaatttttaaagttgtctgggatgttac 20502258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 16541985 - 16542088
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| | ||  ||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  16541985 aatcacatcagaatgatagggatcccagagctgtgtaggtatgactctacatggttgaaggaagacttataataattgttttgtactacctatatcaaca 16542084  T
Q  166 agat 169  Q
    ||||    
T  16542085 agat 16542088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 36924519 - 36924453
Alignment:
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactact--tatatcaacaagatacatcttctttt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  36924519 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtattacttatatatcaacaagatgcatcttctttt 36924453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 11389688 - 11389762
Alignment:
Q  271 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 345  Q
    |||| |||||||||||| ||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  11389688 aagcatgcgagtgagaataaaacatgctgaaaaaactcatgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagt 11389762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 11406349 - 11406423
Alignment:
Q  271 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 345  Q
    |||| |||||||||||| ||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  11406349 aagcatgcgagtgagaataaaacatgctgaaaaaactcatgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagt 11406423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8181446 - 8181394
Alignment:
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagat 169  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8181446 tggttgaaggaagacttttaagaattgtttggtactacctatatcaacaagat 8181394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 362
Target Start/End: Original strand, 29804874 - 29804943
Alignment:
Q  293 cacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  29804874 cacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacaa 29804943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8181346 - 8181212
Alignment:
Q  227 tggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtc 326  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||  |||||| |||  ||  || ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||   ||||    
T  8181346 tggagtagtcgttggatgggtgacctactgggaagttttccgataaacgtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttg-caggtc 8181248  T
Q  327 agtcgacaattctt-aaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  8181247 agtcgacaatgcttaaaagtcgtctgggatgttaca 8181212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27190677 - 27190628
Alignment:
Q  132 ttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 181  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27190677 ttataagaatttattgatactacatatgtcaacaaaatacatcttctttt 27190628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27840491 - 27840442
Alignment:
Q  132 ttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 181  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27840491 ttataagaatttattgatactacatatgtcaacaaaatacatcttctttt 27840442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 395
Target Start/End: Original strand, 36733704 - 36733744
Alignment:
Q  355 tgttacaagtggtatcagagcaggtaggtccagtcagacca 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36733704 tgttacaattggtatcagagcaggttggtccagtccgacca 36733744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 227
Target Start/End: Original strand, 37552632 - 37552726
Alignment:
Q  131 cttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgactt 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | ||| | ||||||||| || ||| ||  || |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37552632 cttataagaattgtttggtactacatata-caaaatgatgc-tcttctttttggcagcgcattccgtaagaattccacagttaagcatgcttgactt 37552726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Original strand, 7911836 - 7912189
Alignment:
Q  25 cggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  7911836 cggggagtggtccgactcctggcatgtttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagggatctcgaggccgtgcaggtataggactgcatggttga 7911935  T
Q  124 aggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttg 223  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  7911936 aggaaaacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttatgcttgcttg 7912035  T
Q  224 acttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggg 323  Q
    |||||||| | | || |||||| ||||||   |||||  ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||    
T  7912036 acttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagattctcggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacttgtgttggtttgtggg 7912135  T
Q  324 gtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 377  Q
    ||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7912136 gtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtatcagagcag 7912189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 9352014 - 9352358
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcat 117  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||| |||||||||||| |||    
T  9352014 atgagggcggggagtggtccggctcctggcagcttctaggcaaaacataatcacatcgaaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacat 9352113  T
Q  118 ggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagca 217  Q
    ||| ||||| || ||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||     
T  9352114 ggtcgaagggagacttataatatttgtttggtactacctatataaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcg 9352213  T
Q  218 tgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggta 317  Q
    |||||||||||||| | | || |||||| ||||||    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||     
T  9352214 tgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctacctggaagtttctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtt 9352313  T
Q  318 tgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||| |||||||    
T  9352314 tgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggacgttacaa 9352358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17027677 - 17027381
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17027677 aatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 17027578  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  17027577 agattcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 17027478  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  17027477 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 17027381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23986463 - 23986168
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  23986463 aatcacatcggaatgagagggatccggaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctatatgaaca 23986364  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| | | || |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  23986363 agatgcatcttcttttcggtagctcaaaccataagaacttcacagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccttctgggaagtttc 23986264  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||    
T  23986263 acggaaagcgtgcgagtgaggagaagacacgctgaaaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcggcaattctgaaagcagtatgggatgttaca 23986168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 336
Target Start/End: Original strand, 20850321 - 20850591
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  20850321 aatcacaccggaatgagagggttcatgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttttgtactacctatatcaaca 20850420  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20850421 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactctacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20850520  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20850521 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 20850591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 336
Target Start/End: Original strand, 7912261 - 7912580
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||| |||||||    
T  7912261 atgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagggatctcgaggccgtgcaggtatgggactgca 7912360  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||| |    
T  7912361 tggttgaaggaaaacttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttcttttcggtagctcattccataagaactccatagttaaac 7912460  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||||||| | | || | |||| ||||||  |||||| |||| ||  |||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  7912461 gtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctgctgggaagtttcccgttaagcgtacgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcatgttggt 7912560  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaat 336  Q
     |||||||| ||||| ||||    
T  7912561 ttgtggggttagtcggcaat 7912580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17731308 - 17730960
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||    
T  17731308 atgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgttcaggtatgggactgca 17731209  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagata----catcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacattt 212  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  17731208 tggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaactccacattt 17731109  T
Q  213 aagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgt 312  Q
    |||| |||||||||||||| | | ||  ||| | ||||||   || || ||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||| | ||||||||| |||    
T  17731108 aagcgtgcttgacttggagcaattttgagataggtgacctaccggaaagtttatcggtaagcgtgcaagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcgtgt 17731009  T
Q  313 tggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  17731008 tggtttgtagggtcagtcgacaatcctgagagtcgtctaggatgttaca 17730960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 330
Target Start/End: Original strand, 13492740 - 13493054
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  13492740 atgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatatcggaatgagaaggatcctgaggctgtgcaggtatgagactgca 13492839  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  13492840 tggttgaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 13492939  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaac-aaagcacgttgaaaagactcatgttgg 315  Q
     |||||||||| ||| | | || |||||| ||||||   || || || | ||| ||||||||||||||| || ||| || | ||||||||||| |||||     
T  13492940 gtgcttgacttagagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagttacccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaacatgctgaaaagactcgtgttga 13493039  T
Q  316 tatgtggggtcagtc 330  Q
    | ||| |||||||||    
T  13493040 tttgtagggtcagtc 13493054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 16519920 - 16520133
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcat 117  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  ||| |||||||||||| |||    
T  16519920 atgagggcggggagtggtccggctcctggcagcttctaggcaaaacagaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacat 16520019  T
Q  118 ggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagca 217  Q
    ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||     
T  16520020 ggtcgaaggaaggcttatgagatttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcg 16520119  T
Q  218 tgcttgacttggag 231  Q
    ||||||||||||||    
T  16520120 tgcttgacttggag 16520133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2720702 - 2720419
Alignment:
Q  74 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 173  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  2720702 cggaatgagagggatcccaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaagacacat 2720603  T
Q  174 c-ttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaa 272  Q
    | || |||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  |||||| |||| ||  ||    
T  2720602 ctttttttttggtagctcattccataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacatattgggaagtttcccgataa 2720503  T
Q  273 gcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgt 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||| ||  |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  2720502 gcgtgcgagtgagaacaaaacacgctgagaagactcgtgtcggtttgcagggtcagtcggcaatgctt-aagtagtctaggatgt 2720419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20126328 - 20126033
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  20126328 aatcacatcggaatgagagggatcctaaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaatggtttgatactacctatatcaaca 20126229  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||     ||| ||||    
T  20126228 agatgcatcttctttttggtagcacattccataagaattccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtctttgaatgggcgacctacctagaagtttc 20126129  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     | | ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  20126128 ccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtagggtccgtcgacaatgcttaaagtcgtctgggacgttaca 20126033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20896834 - 20896538
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20896834 aatcacatcggaatgagagggatccttaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20896735  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| | | || |||||| ||||||   ||||||||||    
T  20896734 agatgcatcttcttttcagtagctcattccataagaactccacggttaagcgtgcttggcttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaatttc 20896635  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtga-gaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||| ||| |||||||||| ||  ||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||  | ||||  |||| ||||||||||    
T  20896634 ccggtaagtgtgcgagtgaggagaaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccggcaatcttgaaagcagtctgggatgttaca 20896538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9441037 - 9440693
Alignment:
Q  30 agtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaag 129  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||   |||||||||||  ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||     
T  9441037 agtggtccggctcctggcagcttctaggcaaaactgaatcacatcaaaatagaagggatcctaa--tcgtgcaggcatggaactacatggttgaaggaat 9440940  T
Q  130 gcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttgg 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||| |    
T  9440939 gcttataagaattctttggtactacttttatcaacaagatgcattttcttttcagtagcccaaaccataagaacttcacagttaagtgtgtttgactttg 9440840  T
Q  230 agtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagt 329  Q
    || | | || |||||| ||||||| | |||| |||| || |||  |||| |||||  |||||  ||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  9440839 agcaattttgggatgggtgaccttcttggaagtttcccgaaaaatgtgcaagtgatgacaaaatacgctgaaaaaactcgtgctggtttgtggggtcagt 9440740  T
Q  330 cgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 376  Q
    || ||||  | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9440739 cggcaatcttgaaagcagtctgggatgttacaagtggtatcagagca 9440693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 21312003 - 21312266
Alignment:
Q  98 gtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||    
T  21312003 gtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagcccatttcat 21312102  T
Q  198 aagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgt 297  Q
    ||||| |||| | |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||   ||||| |||| ||| ||| |||  |||||  ||||| ||| |    
T  21312103 aagaaatccatagttaaacgtgcttgacttggagcagtcttatgatgagtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgtaagtgaagacaaaacacat 21312202  T
Q  298 tgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  21312203 tgaaaagactggtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 21312266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13191659 - 13191389
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13191659 aatcacatcggaatgagagggatcctaagactatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 13191560  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | | ||  ||||| |||||    ||||| ||||    
T  13191559 agatgcatcttcttttcggtagctcgttccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgagatgggtgaccaaccgggaagtttc 13191460  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
     ||  ||||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13191459 ccgataagcgtgcgagtgaggacaaaatacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 13191389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 374
Target Start/End: Original strand, 17850918 - 17851226
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||| ||||||  | ||||||||||| | ||||||||    
T  17850918 aatcacaccggaatgagagggatcctgaggtcgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaatgctgataagatatgtttggtactacctttatcaaca 17851017  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  |||||| ||||    
T  17851018 agatgcatcttctttctggtagcccattctataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtcttcggatgggagacctactgggaagtttc 17851117  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
       | | |||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||| || ||||  | |||||||||||    
T  17851118 ctagtacgcgtgcgagttaggacaaaacaagtcgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcaatcggcaatacttaatgtcgtctgagttgttacaagtg 17851217  T
Q  366 gtatcagag 374  Q
    |||||||||    
T  17851218 gtatcagag 17851226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9440477 - 9440255
Alignment:
Q  44 tggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattt 143  Q
    |||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  9440477 tggcagcttctagggaagaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaatgaaagcttataagaattg 9440378  T
Q  144 tttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggat 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| | | || ||||    
T  9440377 ttcggtactacttatatcaacaagatgcattttcttttcggtagctcactccataagaacttcacagttaagtgtgcttgatttggagcaatttttggat 9440278  T
Q  244 ggctgaccttatgggaaatttct 266  Q
    || |||||||||||||| |||||    
T  9440277 gggtgaccttatgggaagtttct 9440255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 375
Target Start/End: Original strand, 21311515 - 21311824
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | | ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || || ||||    
T  21311515 aatcacatcggaatgagagggttcatgaggccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaagccttataagaattgtttggtattacctagataaaca 21311614  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||   ||||  |||     
T  21311615 agatccatcttctttttggaagctcattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgactttgagtagtcttatgatgggtgacctaccgggatgtttt 21311714  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||||| |||| || || ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  21311715 ccggtaagtgtgcgagtgaagacaaaacacgctgtaaggactcgtgttggtttgtagggtcaatcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttacaaatg 21311814  T
Q  366 gtatcagagc 375  Q
    |||| |||||    
T  21311815 gtattagagc 21311824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2890954 - 2890714
Alignment:
Q  97 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaacca 196  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||  |||    
T  2890954 cgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttataagaattgttagggactacctatatcaaaaagatgcttcttcttttcagtagcccattcca 2890855  T
Q  197 taagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacg 296  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||  |||||||| ||||||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2890854 taagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaaatagtactaggatgggtgacctactgagaagtttcccgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacg 2890755  T
Q  297 ttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaatt 337  Q
     | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2890754 ctaaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatt 2890714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2681362 - 2681071
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||| |||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  2681362 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtttgggactgcatggttgaatgaagacttataagaattgtttggtactacccatatcaaca 2681263  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||  | | || |||||| | ||    |||||| ||||    
T  2681262 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacaattaagcgtgcttaatttggaacaattttgggatgggttac----tgggaagtttc 2681167  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
       | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  2681166 ctagtaagcgtgcaagtgaggacaaaacacgttgagaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagctgtctgggatgttaca 2681071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6331058 - 6330872
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6331058 aatcacatcggaatgagatggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 6330959  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 252  Q
    | || |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    
T  6330958 atatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagtattcttatgattggtgacct 6330872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 127 - 376
Target Start/End: Original strand, 13492393 - 13492643
Alignment:
Q  127 aaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgact 226  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13492393 aaggcttataagaattgtttgatattacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctaattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 13492492  T
Q  227 tggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtga-gaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggt 325  Q
    ||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13492493 tggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccagtaagcgtgcgagtgaggaaaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggt 13492592  T
Q  326 cagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 376  Q
    |||||| ||||  | ||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13492593 cagtcggcaatcttgaaagcagtctagggtgttacaaatggtatcagagca 13492643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14771857 - 14771595
Alignment:
Q  74 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 173  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14771857 cggaatgagagggatcccgaagccgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatccat 14771758  T
Q  174 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 273  Q
     ||||||| ||||  | |  |||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||  | |||| |||  | | ||     
T  14771757 attctttttggtaatctattccataagaactccacagttaagtgtgctagacgtggagtagtctttggatgagtgacctactcggaagtttaccagtaaa 14771658  T
Q  274 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    ||| |||| ||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  14771657 cgtacgagcgaggacaaaacacgctgataagactcatgttggtttgtagagtcagtcgacaat 14771595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 252
Target Start/End: Original strand, 11062321 - 11062471
Alignment:
Q  102 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 201  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  11062321 aggtatgaaactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgttttgtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataaga 11062420  T
Q  202 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 252  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  11062421 actccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacct 11062471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Original strand, 17851374 - 17851553
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||||||    
T  17851374 aatcacaccggaatgagagggatcccgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaaggcttataagatatgtttggtactacctttatcaaca 17851473  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatgg 245  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17851474 agatgcatcttctttttggtagcccattctataagaactccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtcttcggatgg 17851553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 362
Target Start/End: Original strand, 23776449 - 23776736
Alignment:
Q  74 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 173  Q
    |||||||||||| ||||| | | | || ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  23776449 cggaatgagaggtatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaatcgtctggtactacctatatcaacaagatgcat 23776548  T
Q  174 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 273  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| ||||   | ||     
T  23776549 cttcttttcggtagctcatttcataagaacttcaca-ttaagcgtacttgacttggagcaattttgggatggatgacctactgggaagtttcctagtaaa 23776647  T
Q  274 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    |||||||||||  ||||| |||| |||||||| || ||||||| ||||| |||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  23776648 cgtgcgagtgacgacaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgtggagtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 23776736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 377
Target Start/End: Original strand, 3652658 - 3652834
Alignment:
Q  201 aactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttga 300  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||  | | |||    
T  3652658 aactccacagttaagcttgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagcttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaaaagctga 3652757  T
Q  301 aaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 377  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  3652758 aaagactcttgttggtttgtagggtcagttgacaatgcttaaagttgtctgagatgttacaattggtatcagagcag 3652834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9440614 - 9440486
Alignment:
Q  26 ggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaag 125  Q
    ||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  9440614 ggggagtggtccggctctttgcagcttctagggaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgggacttcatggttgaat 9440515  T
Q  126 gaaggcttataagaattttttggtactac 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9440514 gaaggcttataagaattgtttggtactac 9440486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 206
Target Start/End: Original strand, 27334161 - 27334301
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27334161 aatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 27334260  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactcc 206  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  27334261 agatgaatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 27334301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 206
Target Start/End: Original strand, 27394901 - 27395041
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27394901 aatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 27395000  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactcc 206  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  27395001 agatgaatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 27395041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 214
Target Start/End: Original strand, 3652486 - 3652634
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  3652486 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtctgatactacctatatcaaca 3652585  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 214  Q
    |||| ||||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||| ||||    
T  3652586 agatgcatcttctttttggtagttcattccataagaactccacagttaa 3652634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 375
Target Start/End: Original strand, 1991587 - 1991862
Alignment:
Q  100 gcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataa 199  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||    
T  1991587 gcaggtatgagactacatggttggaagaaggcttacaagaattgtttggtattacatatctaaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataa 1991686  T
Q  200 gaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttg 299  Q
    ||||| |||| |||| |||  |||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||  || |||  || ||||| || ||||||  |||||| ||| ||    
T  1991687 gaacttcacagttaaacattattgatttggagtagtttttggatgggtgaccttctgaaaagttttccgaaaagcatgtgagtgaagacaaagtacgctg 1991786  T
Q  300 aaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagc 375  Q
    |||| |||| ||||| | |||||| |||||| |||||  |||||||   ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  1991787 aaaaaactcgtgttgatttgtgggatcagtcaacaatatttaaagtcaactgagatgttacaagtggtattagagc 1991862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28065982 - 28065687
Alignment:
Q  68 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaag 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  28065982 tcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtgtagaaatgagactgtatgattgaatgaaagcttataagaattgtttggtactatctctatcaacaag 28065883  T
Q  168 atacatc---ttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 264  Q
    || ||||   || |||| ||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| ||  ||||| | |||||  | ||| |||    
T  28065882 atgcatctttttttttttggtagcttattccataagaactccacaattaagcatgtttgactttgagcagttttgtgatgggtaacctttcgagaagttt 28065783  T
Q  265 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    | || |||||||| || |||  ||||| |||| | ||||  ||||||||||  |  ||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  28065782 c-cgaaaagcgtgtgaatgatgacaaaacacgctaaaaaatctcatgttggattacggggtcaatcgacaatacttaaagttgtctgcgatgttaca 28065687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Original strand, 32292859 - 32293000
Alignment:
Q  40 ctcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataaga 139  Q
    |||||||||  ||||||||||| || | |||||| ||||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32292859 ctcctggcatcttctaggcaaaccaaattcacattggaatgagagaaatccttagatcgtgcaggtatgagactgcatggttgaatgaaggcttataaga 32292958  T
Q  140 attttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 181  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  32292959 attgtttggtactacctataccaacaaaatacatcttgtttt 32293000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33775119 - 33774915
Alignment:
Q  97 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagata--catcttcttttcggtagcccaaac 194  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||| | ||| |||  |    
T  33775119 cgtgcaagtatgtgaccgcatggttgaaggaaggattataagaattgtctggtgctacctatatcaacaagagatgcatcttctttttgatagtccattc 33775020  T
Q  195 cataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagca 294  Q
    ||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||| |||||| ||||||  || ||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||    
T  33775019 cataagaactccacagttaagtgtgtttgacttgcagtagtctttggatgggtgacctactgagaagtttttcggtaagcgtgcgagtgaggaaaaaaca 33774920  T
Q  295 cgttg 299  Q
    |||||    
T  33774919 cgttg 33774915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 15929582 - 15929732
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||| | | || | ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15929582 aatcacatcagaataagagagatcctaatgccttgtatgtattggactacatggttgaatgaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaaca 15929681  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    | || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  15929682 aaatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 15929732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 336
Target Start/End: Original strand, 20735731 - 20735965
Alignment:
Q  102 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 201  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | |||| |    
T  20735731 aggtatgtgactacatgattgtaggaaggcttataagaattgtttgatactacttatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagtccattctataaaa 20735830  T
Q  202 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 301  Q
    |||||| | |||||  || ||| |||||||||| ||| |||||| | |||||   |||| ||||  ||||||| ||| | |||| ||||| |||| | ||    
T  20735831 actccatagttaagtgtggttggcttggagtagcctttggatgggtaaccttcaaggaagtttccaggaaagcatgcaattgaggacaaaacacgctaaa 20735930  T
Q  302 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    ||||||   || ||| |||||||||||| ||||||    
T  20735931 aagacttgcgtcggtttgtggggtcagttgacaat 20735965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31821838 - 31821716
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  31821838 aatcacatcggaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattatttggtactaactatatcaaca 31821739  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagc 188  Q
    |||| |||||| |||| ||||||    
T  31821738 agatgcatcttttttttggtagc 31821716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 348
Target Start/End: Original strand, 17205376 - 17205620
Alignment:
Q  103 ggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaa 202  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  17205376 ggtatgaaactgcatgattgaatgaagaattataagaattgtttggtactacctttaccaacaagattcatcttgtttt-ggtagcccattccataagaa 17205474  T
Q  203 ctccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaa 302  Q
    |||||   |||| ||||||||| |||||||| | || ||||||  ||||||   | || ||| ||||||| | |||||||||||||||| |||   ||||    
T  17205475 ctccattgttaaacatgcttgatttggagtaattttgggatgggagacctttatgaaagtttttcggaaaacatgcgagtgagaacaaaacacaccgaaa 17205574  T
Q  303 agactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgt 348  Q
    ||||||  |||| | || ||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  17205575 agactcgcgttgatttgcgggattagtcggcaattctcaaagttgt 17205620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 238
Target Start/End: Original strand, 20732613 - 20732750
Alignment:
Q  101 caggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataag 200  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| |||||||||||||||||  | ||||     
T  20732613 caggtatgtgactacatggttgtaggaaggcttataagaattatttggtactacctatattaataatatgcatattcttttcggtagcccattcaataaa 20732712  T
Q  201 aactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtctt 238  Q
    ||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  20732713 aactctacggttaagagtgcttgacttggagtagtctt 20732750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 361
Target Start/End: Original strand, 28780209 - 28780405
Alignment:
Q  165 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 264  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||    
T  28780209 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 28780308  T
Q  265 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
       || ||| ||||||||||| | ||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  28780309 tctggtaagtgtgcgagtgaggataaaacattttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 28780405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 194 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31416106 - 31415943
Alignment:
Q  194 ccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagc 293  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||| || |||| || ||||||  || ||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||| ||||| |    
T  31416106 ccataagaactccacaattaagcgtgtttgacttagattagttttgggatggacgatcttatggaaagtttctcgaaaaacgtgtgagtgaggacaaaac 31416007  T
Q  294 acgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgtt 358  Q
    ||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  31416006 acgctgaaaaga-tcgtgttggtttgtgggatcagtcggcaatacttaaagttgtctagaatgtt 31415943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 331
Target Start/End: Original strand, 12194330 - 12194592
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |   ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||    
T  12194330 aatcacattggaatgagaggaatcctgagaccgtgcagatatga-actgcatgattgaagaaagacttataa-atttttttggcactatctatatcaaca 12194427  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||   ||   ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | | ||||||||| ||||||| | | || |||     
T  12194428 agatgcatcttcttttttataattcattccataagaactccacagttaagcatgtttgacatggagcaattttaggatggatgaccttttagaaagtttt 12194527  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcg 331  Q
     | |||| |||| ||||  | ||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12194528 ccagaaaacgtgtgagtttggacaaaacacactgaaaagactcatgttggt-tttggggtcagtcg 12194592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 336
Target Start/End: Original strand, 28582964 - 28583234
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||||||||   || ||||  |||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||    
T  28582964 aatcacatcggaatagaagtgatctaaaagtcgtgcaggtat-agattgtatggttgaatgaaggcttataagaattatttgatacgatctatatcaaca 28583062  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttgg-agtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 264  Q
    |||| |||| ||||| ||||||  ||  ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| ||| | ||||||| | |||  | || || ||| || |||    
T  28583063 agatgcatcatctttccggtagttcattccataagaaatccacagctaagtgtccttgacatggaattagtctttgtatgagttactttctggaaagttt 28583162  T
Q  265 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    | | ||||||||| ||||| | ||||| ||   |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  28583163 cccagaaagcgtgtgagtggggacaaaacatactgaaaagactcatgttagtttgtggggtcagtcggcaat 28583234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2891340 - 2891161
Alignment:
Q  165 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 264  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||||  |||||| ||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  |  ||  |||    
T  2891340 aagatgcatctttgttttggtagcccattccataaaaactccacagttaaatgtgcttgatttggagtagtctttggatgggtgacctactacgatgttt 2891241  T
Q  265 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 345  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  2891240 c-cggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagt 2891161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 14325404 - 14325284
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctc 669  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||| | ||    
T  14325404 ttccattcattctgcaatcatatgtattcagaataacaacatttaactaacttcagcttctagtcttcagactttgatgaactttagcttctgatggttc 14325305  T
Q  670 ttcagactctctgatgatgtc 690  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  14325304 tttagactttctgatgatgtc 14325284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 14418414 - 14418294
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctc 669  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||| | ||    
T  14418414 ttccattcattctgcaatcatatgtattcagaataacaacatttaactaacttcagcttctagtcttcagactttgatgaactttagcttctgatggttc 14418315  T
Q  670 ttcagactctctgatgatgtc 690  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  14418314 tttagactttctgatgatgtc 14418294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 327
Target Start/End: Original strand, 10964339 - 10964564
Alignment:
Q  101 caggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataag 200  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| || ||||||| ||||||  || ||||||     
T  10964339 caggtatgagactgtatggtagaagaaagacttacaagaattgtttggtactacatatatcaataaaataaatattctttttggtagcttaatccataaa 10964438  T
Q  201 aactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttga 300  Q
    |||||||||  ||||  |  |||| ||||| |  | ||||||||  |||||||||| ||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||| ||  |  |    
T  10964439 aactccacaaataagtgtatttgagttgga-tcattttaggatgattgaccttatgagaagtttttcgaaaagtgtgcaagtgagaacaaaccatataaa 10964537  T
Q  301 aaagactcatgttggtatgtggggtca 327  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  10964538 aaagactcatattggtttgtagggtca 10964564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Original strand, 15929235 - 15929338
Alignment:
Q  102 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 201  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  15929235 aggtatgagactacaaggttgaagaaaagcttataagaattgtttggtaatgcctatatcaataagatgcatattcttttcggtagctcattccataaga 15929334  T
Q  202 actc 205  Q
    ||||    
T  15929335 actc 15929338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 597 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 10704563 - 10704474
Alignment:
Q  597 ttcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcagactctctgatga 686  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  10704563 ttcaaaataacaaactttaactaactgcagcttccagtcttcagactttgatgaacttcagcttctggggatcttcagactctctgatga 10704474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 571 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 18172061 - 18171945
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctc 669  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| || | ||||||||||| |||||| |||| | |     
T  18172061 ttccataccttctgcaatcatatgcattcagaataacaacatttaactaacttcagctttcagtctccagattctaatgaactccagcttttgatggtta 18171962  T
Q  670 ttcagactctctgatga 686  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18171961 ttcacactctctgatga 18171945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 571 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 24718770 - 24718654
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctc 669  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| || | ||    
T  24718770 ttccattccatcagcaatcatatgcattcagaaaaagaacatttaactaacttcagcttacagtcttcagactctgatgaactccagcttctaatggttc 24718671  T
Q  670 ttcagactctctgatga 686  Q
    |||||||||||||||||    
T  24718670 ttcagactctctgatga 24718654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 138
Target Start/End: Original strand, 3652981 - 3653051
Alignment:
Q  68 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3652981 tcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactgcatggttgaacgaaggcttataag 3653051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 151
Target Start/End: Original strand, 9441061 - 9441135
Alignment:
Q  77 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtac 151  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9441061 aatgagaggaatcctaaagccgtgcagatatgtgactacatgattgaaggaaagcttataagaattgtttggtac 9441135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30729956 - 30729864
Alignment:
Q  95 gtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtag 187  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||| |||| ||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||| |||||    
T  30729956 gtcgtgcaagtatgagacagcatggttgaaggaggactcataaaaattgtttggtactacgtatataaacatgattgatcttcttttgggtag 30729864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3885194 - 3885123
Alignment:
Q  105 tatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 176  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  3885194 tatgagactgcatagttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacatatactaacaaaatacatctt 3885123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 376
Target Start/End: Original strand, 15929342 - 15929449
Alignment:
Q  269 gaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggta 368  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  ||| | ||||||||  ||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  15929342 gaaagcgtgtgagtgaggacaaaatacgctaaaaagacttgtgttgatttgtggggtcactcggcaatccttaaagcagtctgggatgttacaagtggta 15929441  T
Q  369 tcagagca 376  Q
    ||| ||||    
T  15929442 tcaaagca 15929449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 612 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 24728552 - 24728477
Alignment:
Q  612 tttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctcttcagactctctgatga 686  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  24728552 tttaactaacttcagcttccagtcttcagactctgatgaactccagcttctgatggttcttgagactctctgatga 24728477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 124
Target Start/End: Original strand, 13490079 - 13490179
Alignment:
Q  25 cggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttga 123  Q
    |||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| | | |  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  13490079 cggggagtggtccggctcctgacatgcttctaggaaaaacttaatcacatcgaaatgagagagatcatgaggctgtgcaggtataggactgcatggttga 13490178  T
Q  124 a 124  Q
    |    
T  13490179 a 13490179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 359
Target Start/End: Original strand, 3653048 - 3653191
Alignment:
Q  212 taagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatg 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   | ||| |||| ||  ||||||||    ||| ||||| |||| ||||||||||| |     
T  3653048 taagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctatcgagaagtttcccgataagcgtgc----gaggacaaaacacgctgaaaagactcgta 3653143  T
Q  312 ttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgtta 359  Q
    ||||| ||| |||||| ||| |||| |||||| | |||| ||||||||    
T  3653144 ttggtttgtagggtcaatcggcaatgcttaaaatcgtctgggatgtta 3653191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 336
Target Start/End: Original strand, 27334305 - 27334363
Alignment:
Q  278 cgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  27334305 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaat 27334363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 336
Target Start/End: Original strand, 27395045 - 27395103
Alignment:
Q  278 cgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  27395045 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaat 27395103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21719324 - 21719256
Alignment:
Q  293 cacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||   ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21719324 cacgttgaaaatacttatgttggtttggtaggtcagtcgtcaatacttaaagttgtttaggatgttaca 21719256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21727160 - 21727092
Alignment:
Q  293 cacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||   ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21727160 cacgttgaaaatacttatgttggtttggtaggtcagtcgtcaatacttaaagttgtttaggatgttaca 21727092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 343
Target Start/End: Original strand, 1663993 - 1664084
Alignment:
Q  252 ttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaa 343  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||  | | | |||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||    
T  1663993 ttatgagaagtttcttagaaagcgtgcgagtgagaacaaaatatgctaaaaagattcatgttggtttgtctggtcaatcgacaatacttaaa 1664084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 16462674 - 16462575
Alignment:
Q  575 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcag 674  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||   ||| |||| |||||  |||||||| |||||||    
T  16462674 attccttctgtaatgatgtccattcagaataacaaaatttaactaacttcagcttccaatcttcaacttctgatgatcttcaaattctgatgatcttcag 16462575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 361
Target Start/End: Original strand, 21312470 - 21312533
Alignment:
Q  298 tgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  21312470 tgaaaagactggtgttggtttgtagggtcagtcgacaatggttaaagtcgtctgggatgttaca 21312533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 575 - 664
Target Start/End: Original strand, 13145257 - 13145347
Alignment:
Q  575 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagt-cttcatactctaatgaacttcagcttctga 664  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |||  |||||  ||||| ||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13145257 attccttctgcaatgatgtgtctttagagaaacaaactttaagtaacagcagcttccagttcttcagactctaatgaacttcagcttctga 13145347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 578 - 676
Target Start/End: Original strand, 24398786 - 24398884
Alignment:
Q  578 ccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcagac 676  Q
    |||||||||||||| ||  || ||||||||||  |||||||||||  ||||||    || || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  24398786 ccttctgcaatgatgtgtcttgagaataacaaactttaactaactgcagcttcttaactacagactctaatgaacttcagactctgatggtcttcagac 24398884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 23006084 - 23006019
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtct 636  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||    
T  23006084 ttccataccttttgcaatcatatgcattcagaataacaacatttaactaacttcagcttctagtct 23006019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 636
Target Start/End: Original strand, 23782282 - 23782347
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtct 636  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||    
T  23782282 ttccataccttttgcaatcatatgcattcagaataacaacatttaactaacttcagcttctagtct 23782347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6331279 - 6331203
Alignment:
Q  301 aaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 377  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||  | ||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  6331279 aaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcttgaaagcagtctgagatgttacaaatggtatcagagcag 6331203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 574 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 17445683 - 17445591
Alignment:
Q  574 cattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatg 666  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| |   ||| |||||| ||| |||||||||    
T  17445683 cattccttctccaatgatgagcattcaaaataacaacatttaactaacttcagcttccagtctttagcttctgatgaacctcaacttctgatg 17445591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Original strand, 42515054 - 42515398
Alignment:
Q  29 gagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaagga 127  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42515054 gagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaagga 42515153  T
Q  128 aggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgactt 227  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42515154 agacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactt 42515253  T
Q  228 ggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtca 327  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |    |||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  42515254 ggagtagtctttggatgggtgacataccaggaactttttcggtaagcgtgcgggtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtca 42515353  T
Q  328 gtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcag 372  Q
    |||| |||| |||||||| ||||  |||||||||| |||||||||    
T  42515354 gtcggcaatgcttaaagtcgtctgtgatgttacaaatggtatcag 42515398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 365
Target Start/End: Original strand, 9124910 - 9125258
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | | | |||||||||||||||||| |    
T  9124910 atgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagagatcttgaggccgtgcaggtatgagactgta 9125009  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  9125010 tggttaaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 9125109  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     ||||||||| |||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  9125110 gtgcttgactcggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggt 9125209  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     |||||||||||||| |||| || ||||  |||| || |||||||||||    
T  9125210 ttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggggtgttacaagtg 9125258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 34405737 - 34405442
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  34405737 aatcacaccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 34405638  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  34405637 ggatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 34405538  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34405537 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagttgtctaggatgttaca 34405442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13125331 - 13124968
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | | | | |||||||||| |||||||    
T  13125331 atgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatatcggaatgagagggatcttgaggccctgcaggtatgggactgca 13125232  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  13125231 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 13125132  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaac-aaagcacgttgaaaagactcatgttgg 315  Q
     |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| | | ||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  13125131 gtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaaacacgctgaaaggactcgtgttgg 13125032  T
Q  316 tatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtct--aggatgttacaagtggtatcagagcag 377  Q
    | |||||||||||||| |||| || ||||  ||||   || |||||||| ||||||||||||||    
T  13125031 tttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggggggtgttacaaatggtatcagagcag 13124968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 74 - 377
Target Start/End: Original strand, 36422260 - 36422562
Alignment:
Q  74 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 173  Q
    |||||||||||||||||||| | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  36422260 cggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 36422359  T
Q  174 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 273  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| |||    
T  36422360 cttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaat-ttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaag 36422458  T
Q  274 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcaga 373  Q
     ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36422459 tgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtatcaga 36422558  T
Q  374 gcag 377  Q
    ||||    
T  36422559 gcag 36422562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 51 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2941918 - 2941633
Alignment:
Q  51 ttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggta 150  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2941918 ttctaggcaaaactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggctgataagaattgtttggta 2941819  T
Q  151 ctacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgac 250  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||    
T  2941818 ctacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgac 2941719  T
Q  251 cttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    ||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  2941718 ctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggagaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgcggtcagtcggcaat 2941633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 336
Target Start/End: Original strand, 28495854 - 28496124
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  28495854 aatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaactgttgggtactacctatatcaaca 28495953  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| ||||    
T  28495954 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctattgggaagtttc 28496053  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28496054 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 28496124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 336
Target Start/End: Original strand, 42515544 - 42515814
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  42515544 aatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgtttggtactacctatatcaaca 42515643  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||    ||||||||     
T  42515644 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctacatggaaatttt 42515743  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42515744 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 42515814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Original strand, 679817 - 680111
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  679817 aatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggagtacatggctgaaggaaggcttataagaattgtt-ggtactacctatatcaaca 679915  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  679916 agatgcatattctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctgccgggaagtttc 680015  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaac-aaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||| || | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  680016 gcggtaaacatgcgagtgagaacaaaaacacgctgaaaagactcatgttggtttgt-aggtcagtctacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 680111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 35474267 - 35473971
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  35474267 aatcacaccggaatgagagggatccttaggtcgtgtaggtatgagactacatggttgaagaaagacttataagaattgtttagtactacttatatcaaca 35474168  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| |   ||||| ||||    
T  35474167 agatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgacgtaccgggaattttc 35474068  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  35474067 tcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaatgacttgtgttggtttgtagggttagagggcaatgtttaaagtcgtctaggatgttacaa 35473971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26421875 - 26421598
Alignment:
Q  97 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaacca 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||    
T  26421875 cgtgcatgtatgagactgcatggttgaagtaaggctcataagaattgttaggtactccctataccaacaagatgaatcttcttttcggtagcccattcca 26421776  T
Q  197 taagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacg 296  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| ||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| ||||| | || ||||||| |||||| | |    
T  26421775 taagaactacacagttaagcgtgtttggcttcgagtagtctttggattggtgaccttatgggaagtttcttggaaaacatgtgagtgaggacaaagaatg 26421676  T
Q  297 ttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagag 374  Q
      ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26421675 ccgaaaatactcgtgttggtatgtagggtcagtcgtcattgcttaaagttgtctgggatgttacaagtggtatcagag 26421598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6719220 - 6718926
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6719220 aatcacattggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 6719121  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | || |||||| |||| |   ||||| ||||    
T  6719120 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccagagttaagcgtgcttgacttggagtaat-ttgggatgggtgacatatcgggaactttc 6719022  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  6719021 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagaatcgtgttggtttgtggggtcagtcagcaatcctaaaagtcgtctgggatgttaca 6718926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Original strand, 2193256 - 2193552
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2193256 aatcacaccggaatgagagggttcctgagaccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 2193355  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||   |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  2193356 agatgcatcttctattcggtagctcatttcataggaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 2193455  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| || ||||  ||||  ||||||||||    
T  2193456 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgagatgttacaa 2193552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29039166 - 29038870
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | | |||| || |||| |||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29039166 aatcacatcggaatgagaggcatcctgaggccgtgtagatatgtgactacatggttgaatggaggcttacaagaattgtttggtactacctatatcaaca 29039067  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    | || ||||||||||| | ||  |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   || || ||||    
T  29039066 acatgcatcttctttttgataatccattccataagaactctacatttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctaccggtaagtttc 29038967  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||| ||||||| || |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  29038966 ccggtaagcgtgtgactgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttacaa 29038870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 76 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29357592 - 29357341
Alignment:
Q  76 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 175  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  29357592 gaatgagaggtatcccgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactaactatatcaacaagatgcatct 29357493  T
Q  176 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 275  Q
    |||||||| ||||||    |||||||||| |||| |||| | || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  || || || |||| ||||||    
T  29357492 tcttttcgatagcccgtttcataagaactacacagttaaccgtgtttgacttagagtagtcttaagatggatgaccttccggtaagttcctcgaaaagcg 29357393  T
Q  276 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtca 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  29357392 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagggtca 29357341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5406771 - 5406478
Alignment:
Q  29 gagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaa 128  Q
    |||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5406771 gagtggtccggctcatgacagcttctaagcaaaactgaatcacatcggaatgatagggatcctaaagtcgtgccggtatgggactgcatggttgaaggaa 5406672  T
Q  129 ggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttg 228  Q
    |  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  5406671 gatttataagaattgtttggtattacctatatcaacaagatgcatcttatttttggttgcccaaaccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttt 5406572  T
Q  229 gagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcg-gaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtg 321  Q
    ||| | | || |||||| |||| || ||| || |||  ||  ||| |||||||||||| ||||| |||  |||||| |||| ||||||| ||||    
T  5406571 gagcaattttgggatggatgactttctggaaagttttccgaaaaaacgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaacactcgtgttggtctgtg 5406478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 332
Target Start/End: Original strand, 25182320 - 25182627
Alignment:
Q  25 cggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaa 124  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||| |    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25182320 cggggagtggtcaggctcctagcagcttctaggcaaagacgagtcacatcggaatgagagagatcctgagactgtgcaagtatgagactgcatggttgaa 25182419  T
Q  125 ggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttga 224  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||| |||| |||||  || ||||    
T  25182420 ggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttattttcggtaactcattccataagaacttcacagttaagtgtgtttga 25182519  T
Q  225 cttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtgggg 324  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||| | |||| |||| | ||||  |||||||    
T  25182520 cttggagtagtctttggatggaggaccttctgggaagtttctcaaaaagcgttcgagtgagggcaaaacacgctaaaaaaactcgtattgggttgtgggg 25182619  T
Q  325 tcagtcga 332  Q
    ||| ||||    
T  25182620 tcaatcga 25182627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 375
Target Start/End: Original strand, 2189144 - 2189453
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | |  |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  2189144 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggctgtgcaggtgtgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggcactacctatatcaaca 2189243  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||  ||||||   ||||| ||||    
T  2189244 agatgcatcttcttttcgatagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgagtgacctaccgggaagtttc 2189343  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||| || ||||  |||| ||||||||| | ||    
T  2189344 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgagaagactcgtgttgatttgtggggacagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttactaatg 2189443  T
Q  366 gtatcagagc 375  Q
    ||||||||||    
T  2189444 gtatcagagc 2189453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 18833237 - 18833582
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | | ||| ||||||||  ||||||    
T  18833237 atgagggcggggagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggttcctgaggccgtacaggtatggaactgca 18833336  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||| ||||||    
T  18833337 tggttgagggaaagcttatatgaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctaattacataagaactccacagttaagc 18833436  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     || ||||||| ||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| |    
T  18833437 gtgtttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgat 18833536  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     |||||| | ||||| |||| || ||||  |||| || ||||||||    
T  18833537 ttgtgggataagtcggcaatcctgaaagcagtctggggtgttacaa 18833582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 361
Target Start/End: Original strand, 2465960 - 2466218
Alignment:
Q  102 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 201  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  2465960 aggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagttgcatcttcttttcggtagctcattccataaga 2466059  T
Q  202 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 301  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| | | |  |||||| ||||||   |||||||||| ||| |||| ||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  2466060 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttcgggatgggtgacctaccgggaaatttcccggtaagcatgcaagtgaggacaaaacacgctgaa 2466159  T
Q  302 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||||||| |||| || |||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  2466160 aagactcgtgttagtttgt-aggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 2466218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22529381 - 22529102
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | ||| || | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||    
T  22529381 aatcatatccgaatgagagggatcctgaggtcatgtaagtatgggcctacatggttgaaggaaggcttataagaaatgtttggtactatctatataaaca 22529282  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||| ||| | ||   || ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||| ||||    
T  22529281 agatgcatcttcttttcagtaactcattacaaaagaacttcacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgacctactgagaagtttc 22529182  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 345  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22529181 tcggtaagcgtgtgagtgaggacaaaatacgctgaaaagactcatgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagt 22529102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2611798 - 2611526
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||    
T  2611798 aatcacatcggaatgagaggggtcctgaggtcatgtaggtatgagactatatggtggaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctataacaaca 2611699  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||   ||| || |      
T  2611698 agatgcatcttctttttggtagcccattctataagaactccatagttaagcgtgctttacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggtaact-- 2611601  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 345  Q
         ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2611600 -----aagcgtgcgagtgaggacaaaacactctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagt 2611526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6747744 - 6747457
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6747744 aatcacattggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgatactacatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaaca 6747645  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||| |||||| ||||||   ||||| |||     
T  6747644 agatgcatcttctttttggtagcctattccataaaaactccacagttaagcgtgcttgacttatcgtagtctttggatgggtgacctatcgggaagttt- 6747546  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
           || |||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  6747545 -------gcttgcgagtgaggacaaaacaagttgaaaagacttgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagcagtctgggatgttaca 6747457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11517583 - 11517386
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||    
T  11517583 atgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgca 11517484  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaag 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||    
T  11517483 tggt-gaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctacttttcggtagctcattccataagaactccgcagttaag 11517386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 252
Target Start/End: Original strand, 46425741 - 46425927
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   | || ||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  46425741 aatcacatcggaatgagagggatcctgagaccatgtaggtatgggactacatggttgaaataaggcttataagaattgtttggtattacctatatcaaca 46425840  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 252  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  46425841 agatgcatcttcttttcggtatcttattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacct 46425927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28495754 - 28495470
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||  ||| ||||||||||    
T  28495754 aatcccatcggaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgttgagttttacctatatcaaca 28495655  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||           | |    
T  28495654 agatgcatcttcttttaggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc-----------tac 28495566  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
      |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  ||||  |||||||||    
T  28495565 cgggaaagcgtgcgagtgaggacaaaacccgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcgatgttaca 28495470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 285
Target Start/End: Original strand, 2465777 - 2465952
Alignment:
Q  110 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccaca 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  2465777 gactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 2465876  T
Q  210 tttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgag 285  Q
     |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   |||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  2465877 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaatttcccggtaagcatgcgagtgag 2465952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 162 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7646528 - 7646329
Alignment:
Q  162 aacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   |||||     
T  7646528 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaag 7646429  T
Q  262 tttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  7646428 tttctcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 7646329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 35527267 - 35527081
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||  |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  35527267 aatcacaccgaaatgagagggatcccgaggtcgtgcaaatatgggactggttggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaaca 35527168  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 252  Q
    |||| ||| |||||||| |||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  35527167 agatgcatattcttttcagtagtccattccataggaactccacagttaagcatgcttgacttggagtagtctttgcatgggtgacct 35527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 376
Target Start/End: Original strand, 7646514 - 7646725
Alignment:
Q  165 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 264  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||| |  ||||| ||    
T  7646514 aagatgcatcttgttttcggtaactcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacct-accggaaagtt 7646612  T
Q  265 ctcgga-aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaag 363  Q
     || || ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||     
T  7646613 ttccgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggttagtcgacaatcctaaaagtcgtctgggatgttacaaa 7646712  T
Q  364 tggtatcagagca 376  Q
    |||||||||||||    
T  7646713 tggtatcagagca 7646725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 316
Target Start/End: Original strand, 9623208 - 9623457
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  | || ||||| | |||||||| |||||| ||||||   |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  9623208 aatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtttgataccacctatatcaaca 9623307  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||  | |||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| |||||| |||| || || ||| |||     
T  9623308 agatgcatcttc-tttcggtagttcattctataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggactagtctttggatgggtgacgttctgagaagtttt 9623406  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
      | ||||| | |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9623407 ctgaaaagccttcgagtgaggacaaagcacgctgtaaagactcatgttggt 9623457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 571 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 9064215 - 9064100
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 670  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||| |||||||| | |||||    
T  9064215 ttccattccttctacaatgatatgaattcagaataacaacttttaactaactccagctttcagtcttcagactatgatgaactccagcttctaaggctct 9064116  T
Q  671 tcagactctctgatga 686  Q
    ||||||||||||||||    
T  9064115 tcagactctctgatga 9064100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13122567 - 13122380
Alignment:
Q  150 actacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctga 249  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | | || |||||| |||    
T  13122567 actacatatattaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattttgggatgggtga 13122468  T
Q  250 ccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaac-aaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    |||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  13122467 cctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcggcaat 13122380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13124896 - 13124759
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| | | | |||||||||||| |||||||    
T  13124896 atgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatattggaatgagagggatcttgaggccgtgcaggtatgggactgca 13124797  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13124796 tggttgaaggaaggcttataagaattgtgtggtactac 13124759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31743970 - 31743834
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||| | || ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||    
T  31743970 aatcatatcgaaatgagatggatcttgaaatcgtgcaagcatgagactgcatggttgaaggaatgcttataagaatggtttggtgctatctatatcaaca 31743871  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaa 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31743870 agatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaa 31743834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36015557 - 36015409
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36015557 aatcacaccggaatgagagggatcccaaggcagtgcaagtatgagactccatggttgaaggaaagcttaaaagaattgtttggtactacatatatcaaca 36015458  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 214  Q
    |||| | |||||||||   |||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  36015457 agatgcctcttcttttaaatagcccattccataagaacttcacagttaa 36015409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31406730 - 31406495
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| | || ||||| ||||||||| || | ||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  31406730 aatcacatcaaaatgagagggatcctgaagccgtgcagatctgggactgaatggttgaaagatgacttattagaattgtttggtgttacctatatcaaca 31406631  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||| ||||    ||||||||||||| |||||| || |||| |  ||  ||||    
T  31406630 agatgcatcttcttttcggtagcccgtttcataagaactccacagttaagcgtgct----ttggagtagtctttggatgggtggccttct-agacgtttc 31406536  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagac 306  Q
    |  ||||||||| ||||||| ||||| || | |||||||||    
T  31406535 ttagaaagcgtgtgagtgaggacaaaacatgctgaaaagac 31406495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 235
Target Start/End: Original strand, 33316757 - 33316892
Alignment:
Q  95 gtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaac 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||    
T  33316757 gtcgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaaaaattataagaattgtttgacaatacttatatcaacaagat-----gtcttttcggtagcccaaac 33316851  T
Q  195 cataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagt 235  Q
     |||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||    
T  33316852 tataagaactccacaattaaacgtgtttgacttgaagtagt 33316892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 227
Target Start/End: Original strand, 11372453 - 11372612
Alignment:
Q  68 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaag 167  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| || | | || |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| |    
T  11372453 tcacattggaacgagagggttcccaaggccatgtaggtatgaaattgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctgtaccaacatg 11372552  T
Q  168 atacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgactt 227  Q
    || ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||    
T  11372553 atgcatgttatttttggtagctcaaaccataagaactccaaagttaagcacgtttgactt 11372612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 187
Target Start/End: Original strand, 43233413 - 43233534
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| || ||||||||||||| | | | |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  43233413 aatcacaccgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgtgactgtatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactatctatatcaaca 43233512  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtag 187  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  43233513 agatgcatctttttttcggtag 43233534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 571 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 16307768 - 16307653
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 670  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| | |||    
T  16307768 ttccattccttctataatgatatacattcagaataacaacttttaactaactccagcttccagttttcagactctgatgaactccagcttctgaggttct 16307669  T
Q  671 tcagactctctgatga 686  Q
    | ||||||| ||||||    
T  16307668 ttagactctatgatga 16307653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 207
Target Start/End: Original strand, 1628719 - 1628854
Alignment:
Q  69 cacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaaga 168  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||   |||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  1628719 cacattggaatgagagggatgttgaagccgtgcagatatgggattgcatggttgaagaaaggcttat---aattgtttggtactatcgatatcaacaaga 1628815  T
Q  169 tacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactcca 207  Q
    | |||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  1628816 tgcatcttcttttttgaagcccataccataagaactcca 1628854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26957703 - 26957603
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |  ||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26957703 aatcacatcggaatgagagggatcttgaggctgtgtaggtatggaactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 26957604  T
Q  166 a 166  Q
    |    
T  26957603 a 26957603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3305365 - 3305198
Alignment:
Q  195 cataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagca 294  Q
    ||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||   || || ||||  || ||| ||||||||||||||||| ||    
T  3305365 cataaaaacttcacagttaagcgtgcttgatttggagtagtctttggatgggtgacctaccggaaagtttcctggtaagagtgcgagtgagaacaaaaca 3305266  T
Q  295 cgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    || ||||||||||| ||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  3305265 cgctgaaaagactcgtgttgatttgtaggatcagtcagcaatacttaaagtcgtctggaatgttacaa 3305198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26421401 - 26421282
Alignment:
Q  116 atggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaag 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||     
T  26421401 atggttgaaggaagacttataagaattgcttgatactacctatatcaacaagatgcatatttttttcggtagtccattccataagaactccacagttaaa 26421302  T
Q  216 catgcttgacttggagtagt 235  Q
    | || |||| ||||| ||||    
T  26421301 cgtgtttgaattggattagt 26421282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 20966087 - 20966213
Alignment:
Q  102 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||  || || ||||||||||| ||  ||||||||    
T  20966087 aggtatgagactgcatgattgaaggatgacttataagaattattttgtaatacctataccaacaagatgtatattattttcggtagctcattccataaga 20966186  T
Q  202 actccacatttaagcatgcttgacttg 228  Q
    ||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  20966187 acttcacagttaaacatgcatgacttg 20966213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 227
Target Start/End: Original strand, 11372901 - 11373060
Alignment:
Q  68 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaag 167  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| | | || |||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| |||  || ||  |||| |||||||    
T  11372901 tcacatcaaaatgagagggttcctaaggccatgtaggtatgagattgcatggttgaatgaagacttgtaagaattgtttcatagtatctataccaacaag 11373000  T
Q  168 atacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgactt 227  Q
    ||   |||||||||  |||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  11373001 atgagtcttctttttcgtagcctaaaccataagaactacacaattaagtgtgcttgactt 11373060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26419207 - 26419111
Alignment:
Q  240 ggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    |||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| | || ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26419207 ggatgggtgaccttctgagaattttctcgaaaatcatgtgagtgaggacaaaacatgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaat 26419111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 375
Target Start/End: Original strand, 43233162 - 43233266
Alignment:
Q  271 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatc 370  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |  | ||||| ||||| |||||||    
T  43233162 aagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagattgggatgctacaaatggtatc 43233261  T
Q  371 agagc 375  Q
    |||||    
T  43233262 agagc 43233266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 187
Target Start/End: Original strand, 6585638 - 6585731
Alignment:
Q  96 tcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaac--aagatacatcttcttttcggtag 187  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  6585638 tcgtgcagatatgagattgcatgattgaaagaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaagatacatcttccttttggtag 6585731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6748027 - 6747938
Alignment:
Q  261 atttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtct 350  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  6748027 atttttcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtct 6747938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 204
Target Start/End: Original strand, 16192368 - 16192457
Alignment:
Q  115 catggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaact 204  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||    
T  16192368 catgattgaatgaaggattataagaattgtttggtattacctacatcaacaagatgcatcttcgttttggtagcccattccataagaact 16192457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31743827 - 31743739
Alignment:
Q  274 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  31743827 cgtgcgagtgaggtcaacgcacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggttagtcgacaatgcttaaagtcgtttgggatgttacaa 31743739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 257 - 361
Target Start/End: Original strand, 36422573 - 36422677
Alignment:
Q  257 ggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatg 356  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||||    
T  36422573 ggaagtttcccggcaagtgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatgctaaaagtaatctgggatg 36422672  T
Q  357 ttaca 361  Q
    |||||    
T  36422673 ttaca 36422677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 181
Target Start/End: Original strand, 37672191 - 37672275
Alignment:
Q  97 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  |||| |||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  37672191 cgtgcaggtataagactgcatggttgcaaaaaggtttataataattgtttggtactacttgtaccaacaagatgcaacttctttt 37672275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43776322 - 43776178
Alignment:
Q  180 ttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcg 279  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || | |||| ||||||   ||||| |||  | | |||||||||    
T  43776322 ttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctgcggggaagttttccagtaagcgtgcg 43776223  T
Q  280 agtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtgggg 324  Q
    | |||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  43776222 aatgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggg 43776178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16811961 - 16811905
Alignment:
Q  97 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtacta 153  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  16811961 cgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattgttttgtacta 16811905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 163
Target Start/End: Original strand, 2490071 - 2490136
Alignment:
Q  98 gtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaa 163  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||||||    
T  2490071 gtgcacgtatgtgactgcatgattgaaggaatgcttataagaagtgtttgttactacctatatcaa 2490136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 336
Target Start/End: Original strand, 33316897 - 33316971
Alignment:
Q  262 tttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    ||||||  ||| ||||||||| |  |||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  33316897 tttctcaaaaaacgtgcgagtaatgacaaaatacgttgaaaagacccatgttggtttgtgaggtcagtcgacaat 33316971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20054682 - 20054373
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20054682 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20054583  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20054582 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20054483  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  20054482 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 20054383  T
Q  366 gtatcagagc 375  Q
    ||||||||||    
T  20054382 gtatcagagc 20054373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20055138 - 20054829
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20055138 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20055039  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20055038 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20054939  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  20054938 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 20054839  T
Q  366 gtatcagagc 375  Q
    ||||||||||    
T  20054838 gtatcagagc 20054829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20055594 - 20055285
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20055594 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20055495  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20055494 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20055395  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  20055394 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 20055295  T
Q  366 gtatcagagc 375  Q
    ||||||||||    
T  20055294 gtatcagagc 20055285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20056050 - 20055741
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20056050 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20055951  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20055950 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20055851  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  20055850 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 20055751  T
Q  366 gtatcagagc 375  Q
    ||||||||||    
T  20055750 gtatcagagc 20055741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20056506 - 20056197
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20056506 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20056407  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20056406 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20056307  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  20056306 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 20056207  T
Q  366 gtatcagagc 375  Q
    ||||||||||    
T  20056206 gtatcagagc 20056197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20057409 - 20057100
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20057409 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20057310  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20057309 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20057210  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  20057209 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 20057110  T
Q  366 gtatcagagc 375  Q
    ||||||||||    
T  20057109 gtatcagagc 20057100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 66 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20057865 - 20057554
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20057865 aatcacaccgaaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20057766  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20057765 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20057666  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  20057665 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 20057566  T
Q  366 gtatcagagcag 377  Q
    ||||||||||||    
T  20057565 gtatcagagcag 20057554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 66 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 50002853 - 50002543
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | | |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50002853 aatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 50002754  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||| | |||||| || ||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| || |    
T  50002753 agatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaactccatagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatggatgacctaccgggaagttcc 50002654  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||    
T  50002653 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagtcgtctaggatgttacaaatg 50002554  T
Q  366 gtatcagagca 376  Q
    |||||||||||    
T  50002553 gtatcagagca 50002543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 66 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20845807 - 20845537
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  20845807 aatcacaccggaatgagacggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgttactacctatatcaaca 20845708  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20845707 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagaaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20845608  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20845607 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 20845537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20054226 - 20053929
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20054226 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20054127  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||     
T  20054126 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactaggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttt 20054027  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaag 363  Q
      || ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||||    
T  20054026 ctggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttacaag 20053929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43057669 - 43057373
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  43057669 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaaca 43057570  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||| | ||||||  |||||| ||||    
T  43057569 agatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttggagtggtctttggatcggtgacctactgggaagtttc 43057470  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||| |||| || ||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||   |||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  43057469 ccggtaagcatgtgagtgagaacaaaacacgctaaaaagacttgtgttggtttgtattgtcagtcagcaattcttaaagtcgttaaggatgttacaa 43057373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Original strand, 38340906 - 38341201
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||| || |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38340906 aatcacaccggaatgagatggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 38341005  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| ||||    
T  38341006 agatgcatcttcatttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagtttc 38341105  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  38341106 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgcggaaaagactcgtgttggtttatggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 38341201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20056926 - 20056653
Alignment:
Q  102 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  20056926 aggtatgggactgcagggttgaaggaaggcttatgagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataaga 20056827  T
Q  202 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 301  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  20056826 actccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 20056727  T
Q  302 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagc 375  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20056726 aagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtatcagagc 20056653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 35759796 - 35759459
Alignment:
Q  25 cggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttga 123  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35759796 cggggagtggtctggctcctagcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttga 35759697  T
Q  124 aggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttg 223  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || | |||| | ||||||    
T  35759696 aggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcatagttaaacgtgcttg 35759597  T
Q  224 acttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggg 323  Q
    ||||||||   | || |||| | ||||||   ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||    
T  35759596 acttggagctattttgggattggtgacctaccgggaagtttttcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttttggg 35759497  T
Q  324 gtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |||||||| ||||  | ||||| |||| || |||||||    
T  35759496 gtcagtcggcaatcatgaaagtagtctggggtgttaca 35759459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43057210 - 43056915
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  43057210 aatcacatcagaatgag-gggatcctaaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaaggcttagaagaattgtttgatactacctatatcaaca 43057112  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||  |||||| ||||    
T  43057111 agatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttagagtggtctttggatgggtgacctactgggaagtttc 43057012  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||| |||| |||||||||| ||||| |||  |||||| |||  ||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||    
T  43057011 ccggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacactgaaaaaacttgtgttggtttgtagggtcagtcggcaattattaaagtcgtcggggatgttacaa 43056915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 46693922 - 46693586
Alignment:
Q  28 ggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacat-aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgc-atggttgaa 124  Q
    ||||||||||||||| || || | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  46693922 ggagtggtccgactcttgtcatgcttctaggcaaaagttgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtgcatgtatgggactgtgatggttgaa 46693823  T
Q  125 ggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttga 224  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||   ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  46693822 ggaaggcttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtatctcatttcataataactccacagttaagcgtgcttga 46693723  T
Q  225 cttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtgggg 324  Q
    ||||||| | | || |||||| ||||||   || || |||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||    
T  46693722 cttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagtttcccggtatgcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtgggg 46693623  T
Q  325 tcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |||||||||||| || ||||  || | ||||||||||    
T  46693622 tcagtcgacaatcctgaaagcagtttgggatgttaca 46693586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 50003221 - 50002910
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||  |||||||||||| |||| || ||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  50003221 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgcaggtataggactgcatggttaaagggagacttataataattgttgggtactacctatatcaaca 50003122  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  50003121 agatgcatcttcttttcagtagctcattccaaaagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctaccgggaagtttc 50003022  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  50003021 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcagcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 50002922  T
Q  366 gtatcagagcag 377  Q
    ||||||||||||    
T  50002921 gtatcagagcag 50002910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Original strand, 52250206 - 52250501
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | | | || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  52250206 aatcacaccggaatgagagggatcatgaggccttgtaggtatgggactacatggtcgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 52250305  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | | || | |||| ||||||   ||||| ||||    
T  52250306 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttggaatgggtgacctaccgggaagtttc 52250405  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  52250406 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 52250501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20061386 - 20061188
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggcagt-ttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  20061386 atgagggcggggagtggtccggctcttggcaatcttctaggctaaactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgcaggtatgggactgca 20061287  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaag 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  20061286 tggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaag 20061188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16452079 - 16451784
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  16452079 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 16451980  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||| ||  ||||| ||     
T  16451979 agatgcatcttcttttcggtagttcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc-taccggaaagttt 16451881  T
Q  266 tcgga-aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||  | ||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  16451880 tccaataagcgtgcgcgtgatgacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 16451784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16461232 - 16460937
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  16461232 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 16461133  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||| ||  ||||| ||     
T  16461132 agatgcatcttcttttcggtagttcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc-taccggaaagttt 16461034  T
Q  266 tcgga-aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||  | ||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  16461033 tccaataagcgtgcgcgtgatgacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 16460937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35761098 - 35760845
Alignment:
Q  29 gagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaagga 127  Q
    |||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35761098 gagtggtctggctcctggcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaagga 35760999  T
Q  128 aggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgactt 227  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||  | |||||| ||||||||||    
T  35760998 aagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcattccatgagaactccgtagttaagcgtgcttgactt 35760899  T
Q  228 ggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgag 281  Q
    |||| | | || |||||| | ||||   ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  35760898 ggagcaattttgggatgggtaacctatcgggaagtttcccggtaagcgtgcgag 35760845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30873096 - 30872910
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  30873096 aatcacaccggaatgagagggattctgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaagacttttaagaattgtttgatactacctatatcaaca 30872997  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 252  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  30872996 agatgcatcttctttttggtagtccattctataagaactccacaattaagcatgcttgacttgcagtagtctttggatgggtgacct 30872910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20060431 - 20060191
Alignment:
Q  121 tgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgc 220  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||  |||    
T  20060431 tgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagtgtgc 20060332  T
Q  221 ttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgt 320  Q
    ||||||||||  | | || |||||| ||||||   ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||| |||    
T  20060331 ttgacttggatcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgatggaaagactcgtgttggtttgt 20060232  T
Q  321 ggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||||||||||| |||| || ||||  |||| || |||||||    
T  20060231 ggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggggtgttaca 20060191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 51373010 - 51372750
Alignment:
Q  76 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 175  Q
    |||||||||||||||  | | | | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  51373010 gaatgagagggatcccgaggccatacaggtatgtgactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcgacaagatgcatct 51372911  T
Q  176 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 275  Q
    | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | | || |||||| ||||||    |||| ||| |||| |||||    
T  51372910 tattttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctatcaggaagtttttcggtaagcg 51372811  T
Q  276 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    |||||||||| |||||   || ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  51372810 tgcgagtgaggacaaaatccgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcggcaat 51372750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 331
Target Start/End: Original strand, 23180689 - 23180995
Alignment:
Q  25 cggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaa 124  Q
    |||||||||||||||||||| | || || |||| ||||   |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||| |||| | ||||||||    
T  23180689 cggggagtggtccgactcctagtagcttataggaaaaattgaatcacattggaatgagagggatcttgaagccgtgtaggaatgggactacgtggttgaa 23180788  T
Q  125 ggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttga 224  Q
    |||| | |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  23180789 ggaatgattataagaattgcttggtactacctatatcaacaagatgtatcttctattcgctagcccattccataagaattccacaattaagcgtgcttga 23180888  T
Q  225 cttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtgggg 324  Q
    ||||||| | | || |||||| | ||||| ||| || ||| ||  |||  ||||||||||  ||||| || | |||||||||| |||||||| ||| |||    
T  23180889 cttggagaaattttgggatgggttaccttctggaaagtttttcaaaaaatgtgcgagtgacgacaaaacatgctgaaaagactaatgttggtttgtcggg 23180988  T
Q  325 tcagtcg 331  Q
    | |||||    
T  23180989 ttagtcg 23180995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50002431 - 50002266
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | |||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  50002431 aatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctttatcaaca 50002332  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggag 231  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  50002331 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttgagtgtgcttgacttggag 50002266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 244
Target Start/End: Original strand, 2634924 - 2635102
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  2634924 aatcacatcggaatgagagggatcatgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggataactcataagaattgtttggtactacctataccaaca 2635023  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||| |||| |||||    
T  2635024 agatgcatcttcttttcggtagctcattcaataagaactccacagttaagcgtgtttggcttggagtaatctttggatg 2635102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31822809 - 31822645
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31822809 aatcacatcagaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattatttggtactacatatatcaaca 31822710  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttgga 230  Q
    | || |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  31822709 atatgcatcttcttttcggtagctcaatccaaaagaactccacagttaagcgtttttgacttgga 31822645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 376
Target Start/End: Original strand, 2634465 - 2634776
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagaggg-atcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaac 164  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| | || ||| | |||||||| |||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||  |||    
T  2634465 aatcacatcgaaatgagaggggatcctgaggttgtgtatgtatgagattgcatgattaaaggaaggcttgcaagaattgtttggtactagctatacaaac 2634564  T
Q  165 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 264  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |  | ||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||| |||    
T  2634565 aagatgcatcttcttttcgatagtctattcaataagaacttcactgttaaacgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacattctgggaagttt 2634664  T
Q  265 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagt 364  Q
      |  ||||| ||||| |||| |  ||||||| ||||||||||| |||| || |||  ||||||||  || | ||||||||  | |||||||||||||||    
T  2634665 tccaaaaagcatgcgaatgaggatgaagcacgctgaaaagactcttgtttgtttgtaaggtcagtcatcattgcttaaagtcatttaggatgttacaagt 2634764  T
Q  365 ggtatcagagca 376  Q
    ||||||||||||    
T  2634765 ggtatcagagca 2634776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 2328266 - 2328463
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| ||| |||||||| | ||||||||| | || ||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||  | | | ||| |||||||| |||||||    
T  2328266 atgagggcggagagtggtctggctcctggcatgcttttaggcaaaactgaatcacattggaatgagagaaattatgaggccgtacaggtatgggactgca 2328365  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  2328366 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaa 2328463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 344
Target Start/End: Original strand, 16907209 - 16907513
Alignment:
Q  40 ctcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataaga 139  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||  | |    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16907209 ctcctggcagcttctaggcaaacca-aatcatatcaaaatgagagggattttgagactgtgcaggtatgaaactgcatggttgaaagaaggcttataaga 16907307  T
Q  140 attttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtctta 239  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||  | | |||||||||| | |||||| || ||||||||||| | | ||     
T  16907308 attgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttcttttcagtggtccattctacaagaactccatagttaagcgtgtttgacttggagcaattttg 16907407  T
Q  240 ggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagt-gagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattc 338  Q
     ||||| ||||||| || ||| ||||| | ||||| ||| |||  || |||||  ||  || |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| |    
T  16907408 agatgggtgaccttttgagaagtttcttgaaaagcatgcaagtaaaggacaaaatacactggaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccaacaatcc 16907507  T
Q  339 ttaaag 344  Q
    ||||||    
T  16907508 ttaaag 16907513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 234
Target Start/End: Original strand, 12728027 - 12728160
Alignment:
Q  102 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggt-actacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataag 200  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  12728027 aggtatgggacaacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggttactgcctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcacattccataag 12728126  T
Q  201 aactccacatttaagcatgcttgacttggagtag 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12728127 aactccacagttaagcatgcttgacttggagtag 12728160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 361
Target Start/End: Original strand, 52250641 - 52250838
Alignment:
Q  164 caagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatt 263  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | | || |||||| ||||||   ||||| ||    
T  52250641 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt 52250740  T
Q  264 tctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    || ||| ||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  52250741 tcccggtaagtgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 52250838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 361
Target Start/End: Original strand, 52250978 - 52251175
Alignment:
Q  164 caagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatt 263  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | | || |||||| ||||||   ||||| ||    
T  52250978 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt 52251077  T
Q  264 tctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    || ||| ||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  52251078 tcccggtaagtgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 52251175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 265
Target Start/End: Original strand, 12883524 - 12883723
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  | |  ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12883524 aatcacaccggaatgagatggatcccgaggctgtgcaggtatgggactgcatgattgaaggaatacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 12883623  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||| |||||  || |||||||| |||||| || |||||| ||||||  |||||| ||||    
T  12883624 agatgcattttctttttggtagctcattccataaaaactccacagttaagtgtgtttgacttgaagtagtttttggatggatgacctactgggaagtttc 12883723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 252
Target Start/End: Original strand, 7548091 - 7548277
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||| | ||||||||||||| | | | |||| |||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||    
T  7548091 aatcacattgcaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatgattaaaggaagacttataaaaattgtttggtattaactatatcaaca 7548190  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 252  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7548191 agatgcatattctttttggtagcccatttgataagaactccacaattaagcgtacttgacttggagtagtctttggatgggtgacct 7548277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 571 - 683
Target Start/End: Original strand, 9346872 - 9346984
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 670  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || |||||    
T  9346872 ttccatttcttctgcaatgatatgaattcagaataacaacttttaactaagtccagcttccagtcttcagactctgttgaacttcagcttccgaggctct 9346971  T
Q  671 tcagactctctga 683  Q
    |||||||||||||    
T  9346972 tcagactctctga 9346984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 575 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 18129976 - 18129865
Alignment:
Q  575 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcag 674  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18129976 attccttctgcaatgacgtgtcttcagaataacaacttttaactaacttcagcttccagacttcagactctgatgaacttcagcttctgaggctcttcag 18129877  T
Q  675 actctctgatga 686  Q
    ||||||||||||    
T  18129876 actctctgatga 18129865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 574 - 675
Target Start/End: Original strand, 16870087 - 16870188
Alignment:
Q  574 cattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttca 673  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| | ||||||    
T  16870087 cattcattctgcaatgatatgcattcagaataataacttttaactaacttcagcttccagtcttcagactctgataaactccagcttctgaggttcttca 16870186  T
Q  674 ga 675  Q
    ||    
T  16870187 ga 16870188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 575 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 26280015 - 26279914
Alignment:
Q  575 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcag 674  Q
    ||||||||| || |||| ||  |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26280015 attccttctacagtgatgtgtcttcaaaataacaaaatttaactaactgtagcttctagtcttcagactctgatgaacttcagcttctgatgatcttcag 26279916  T
Q  675 ac 676  Q
    ||    
T  26279915 ac 26279914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 575 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 18517126 - 18517014
Alignment:
Q  575 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatg-tttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttca 673  Q
    |||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||   |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18517126 attccttctgtaatgatgtgtcttcagaataaaaaaactttaactaactgcagcttccagtcttcagactctgatgaacttcaacttctgatgatcttca 18517027  T
Q  674 gactctctgatga 686  Q
    |||||| ||||||    
T  18517026 gactctttgatga 18517014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 273 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35760003 - 35759899
Alignment:
Q  273 gcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcag 372  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  | ||||  |||| ||||||||||| |||||||||    
T  35760003 gcgtgcgagcgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcatgaaagcagtctgggatgttacaaatggtatcag 35759904  T
Q  373 agcag 377  Q
    |||||    
T  35759903 agcag 35759899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 181
Target Start/End: Original strand, 10820636 - 10820707
Alignment:
Q  110 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 181  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  10820636 gactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtactacctatatcaataagatacatcttttttt 10820707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 376
Target Start/End: Original strand, 7547791 - 7547947
Alignment:
Q  220 cttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatg 319  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||   || || ||| |||  |||||||||||| || ||||| |||  ||||||| ||| ||||| | ||    
T  7547791 cttgacttggagtagtgtttggatgggtgacctaccggaaagtttttcgataagcgtgcgagtaaggacaaaacacactgaaaagtctcgtgttgatttg 7547890  T
Q  320 tggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 376  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||| || |||||| ||||||    
T  7547891 tagggtcagtcgacaatgcttaaactcatataggatgttataaatggtattagagca 7547947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31823091 - 31823001
Alignment:
Q  240 ggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtc 330  Q
    |||||| ||||||  |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  31823091 ggatgggtgacctactgggaagtttctcggtaagcatgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtc 31823001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 35010014 - 35009956
Alignment:
Q  194 ccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 252  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35010014 ccataagaactccacggttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacct 35009956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16410831 - 16410704
Alignment:
Q  104 gtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaac 203  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |  | | ||||||    
T  16410831 gtatgggaatgcattgttgaaggaaagcttataagaattatttactactaccaataccaacaagatgcatcttgtttttggtagcctattctagaagaac 16410732  T
Q  204 tccacatttaagcatgcttgacttggag 231  Q
    | || | |||| |||| |||||||||||    
T  16410731 ttcaaagttaaacatgtttgacttggag 16410704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 49996613 - 49996528
Alignment:
Q  279 gagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagt 364  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| || ||||  ||||  ||||||||||||    
T  49996613 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcttgttagtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtctgagatgttacaagt 49996528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7229999 - 7229819
Alignment:
Q  156 tatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttat 255  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||||||  ||   ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | ||||||| | |||||||||    
T  7229999 tatatcaacacgaagcatcttcatttcggtagttcattacataagaactccatagataagcatgtttgacttggagcaattttaggattggtgaccttat 7229900  T
Q  256 gggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
       || ||| ||| ||||||||  |||||| | ||| || | |||||| |||| ||||| | |||||||| ||||| ||||    
T  7229899 ataaagtttttcgaaaagcgtgaaagtgaggataaaacatgctgaaaaaactcgtgttgctttgtggggtgagtcgtcaat 7229819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Original strand, 2739558 - 2739637
Alignment:
Q  102 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 181  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  2739558 aggtatgagactgtatggttaaggaaagacttataagaattgtttagcactacatatatcaacaatatgtatcttctttt 2739637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 376
Target Start/End: Original strand, 8278154 - 8278260
Alignment:
Q  270 aaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtat 369  Q
    ||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| || ||| ||||  ||||| ||| ||  ||| ||| | ||||||||||| ||||||    
T  8278154 aaagcttgcaagtgaggacaaaacacgttaaaaagactcgtgttagtctgtagggttggtcgaaaatcctggaagctgtttgggatgttacaaatggtat 8278253  T
Q  370 cagagca 376  Q
    |||||||    
T  8278254 cagagca 8278260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 372
Target Start/End: Original strand, 39582553 - 39582647
Alignment:
Q  278 cgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcag 372  Q
    |||||||| ||||| |||| ||| ||||||| | ||||| ||| || ||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||| | |||||||    
T  39582553 cgagtgaggacaaaacacgctgagaagactcgttttggtttgtaggatcagtcggcaatgcttaaagtagtttgggatgttacaaatcgtatcag 39582647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16440676 - 16440603
Alignment:
Q  115 catggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagc 188  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  16440676 catggttgaagaaagacttataagaactgtttgctactaccgataacaacaagatgcatattctttttggtagc 16440603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31823161 - 31823108
Alignment:
Q  135 taagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagc 188  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  31823161 taagaattatttggtactacctatatcaataaaatgcatcttctttttggtagc 31823108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 843068 - 842992
Alignment:
Q  77 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtacta 153  Q
    ||||||||||||| | |  ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| | | |||||||| ||||||||||    
T  843068 aatgagagggatcatgagatcgtgtaggtatgtgtctgcatgattgaaggaagtcgtgtaagaattgtttggtacta 842992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 83)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 44471514 - 44471154
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| | | | ||| ||||||||||||| ||    
T  44471514 atgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagagatcttgaggccgtacaggtatgagactaca 44471415  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  44471414 tggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 44471315  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     ||||||| |||||| | | || |||||| ||||||   |||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| || | || |||||||| |||||||    
T  44471314 gtgcttgatttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaatttcccggtaagcgggcgagtgaggacaaaacatgctggaaagactcgtgttggt 44471215  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 377  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||    
T  44471214 ttgtagggtcagtcgacaattcttaaagtcgtttggggtgttacaaatggtatcagagcag 44471154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Original strand, 13266047 - 13266396
Alignment:
Q  27 gggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaagg 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||   ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13266047 gggagtggtccgacttctggcaacttctgggcaaaattgaatcacattagaatgagagggatcttaaagccgtgcaggtatgggaatgcatggttgaagg 13266146  T
Q  127 aaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgact 226  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  13266147 aaggcttataataattttttagtactccctatatcaataagatgcatcttattttcggtagcccaaatcacaagaaccccacagttaagcgtgcttgact 13266246  T
Q  227 tggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtc 326  Q
    | ||| | | ||||||||| ||||||| |||||| |||  || |||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  13266247 ttgagaaattttaggatgggtgaccttttgggaagttttccgaaaagtgtgcgagtgaggagaaaacatgttgaaaagacttgtgttggtttgtggggtc 13266346  T
Q  327 agtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 376  Q
    |||||||||| || ||||  || | |||||||||||||||||||| ||||    
T  13266347 agtcgacaatcctgaaagcagtatgggatgttacaagtggtatcaaagca 13266396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 344
Target Start/End: Original strand, 49998587 - 49998914
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| ||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| |||||||    
T  49998587 atgagggcggggagtggtccagctcttggcatgcttctagacaaaactaaatcacatcggaatgagagggatcctaaggctgtgtaggcatgggactgca 49998686  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  49998687 tggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 49998786  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     || ||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  49998787 gtgtttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 49998886  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaag 344  Q
     ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  49998887 ttgtggggacagtcggcaattctgaaag 49998914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 336
Target Start/End: Original strand, 35871579 - 35871897
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||| ||    
T  35871579 atgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggacttca 35871678  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  35871679 tggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtaccacctatatcaacaagatgcat-ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 35871777  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaa-tttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttgg 315  Q
     |||||||||||||| | | || |||||| ||||| ||| ||||| |||| ||| || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  35871778 gtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc-tatcggaaagtttcccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgg 35871876  T
Q  316 tatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    | |||||| ||||||| ||||    
T  35871877 tttgtgggatcagtcggcaat 35871897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1645889 - 1645594
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  1645889 aatcacatcggaatgagaggaatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtattacctatatcaaca 1645790  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||| ||||    
T  1645789 agatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccaggaagtttc 1645690  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |  | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  1645689 tttgtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagttggcaatgcttaaagtcgtatgggatgttaca 1645594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 377
Target Start/End: Original strand, 21067282 - 21067593
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21067282 aatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcatgtatgagactgcatggttgaaggaagactaataataattatttggtactacatatatcaaca 21067381  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||  | | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||   || || ||||    
T  21067382 agatgcatcttctttccggtagctcattctaaaagtactccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtctttggaggggtgacctaccggaaagtttc 21067481  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||  ||||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  21067482 tcggtaagcgtgcgagtggggacaaaacacactgaaaagactcgtgttagtttgttgggtcagtccacaatgcttaaagtcgtctgggatgttacaaatg 21067581  T
Q  366 gtatcagagcag 377  Q
    ||||||||||||    
T  21067582 gtatcagagcag 21067593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 50399133 - 50398823
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50399133 aatcacatcggaatgagagggatcctgagaccgtgtaggtatgagattacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 50399034  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||   ||| || |||    
T  50399033 cgatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccggggaa-ttc 50398935  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| || ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  50398934 ccggtaaacgtgcaagtgaggacaaaacacgttggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 50398835  T
Q  366 gtatcagagcag 377  Q
    ||||||||||||    
T  50398834 gtatcagagcag 50398823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23943333 - 23943072
Alignment:
Q  115 catggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  23943333 catggttgaaggaagacttataaaaaatatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaa 23943234  T
Q  215 gcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttg 314  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  23943233 gcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgaccaaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 23943134  T
Q  315 gtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 376  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23943133 gtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttacaaatggtatcagagca 23943072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23350472 - 23350128
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | | | ||| |||||| | |||||||    
T  23350472 atgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagagatcttgaggccgtacaggtaggggactgca 23350373  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |   ||||||||||| || | ||||||    
T  23350372 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtacttcctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctccttccataagaacttcatagttaagc 23350273  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   | ||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  23350272 gtgcttgacttggagcaattttgggatggatgacctaccgagaagtttctctgtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggt 23350173  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     |||||||||||||| ||||||| ||||  |||| || |||||||    
T  23350172 ttgtggggtcagtcggcaattctgaaagcagtctggggtgttaca 23350128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Original strand, 3169206 - 3169501
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3169206 aatcacatcggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaaca 3169305  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    | || ||||    
T  3169306 agatgcatcttctttttggtaacccaatccataagaactccacacttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgagtgacctaccagaaagtttc 3169405  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    | || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  3169406 ttggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaatactcgtgttggtttgtagggtcagttggcaatacttaaagtcgtctaggatgctaca 3169501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 44471064 - 44470720
Alignment:
Q  17 aatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgc 115  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | | |  || || ||||| |||||     
T  44471064 aatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagagatcatgacgctgtacaagtatgtgactgt 44470965  T
Q  116 atggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaag 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| || | ||  |||||||||||||||| |||||    
T  44470964 atggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctgttcg-taactcattccataagaactccacagttaag 44470866  T
Q  216 catgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttgg 315  Q
    | |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||    
T  44470865 cgtgcttgacttggagcaattttgggatggttgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctggaaagactcgtgttgg 44470766  T
Q  316 tatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||    
T  44470765 tttgtagggtcagtcaacaattcttaaagtcgtctggggtgttaca 44470720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 66 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14572290 - 14571982
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14572290 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 14572191  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||| | | ||  ||||| ||||||| |||||| ||||    
T  14572190 agatgcatcttc-tttcggtagcctaaaccataagaactccaca---aagcgtgcttgacttagagcaattttgagatgggtgaccttctgggaagtttc 14572095  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtct-aggatgttacaagt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| || ||||  || |  || |||||||| |    
T  14572094 tcggaaagcgtgtgagtgaggacaaaacacggtgaaaagactcgtgttggtttgcggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggggtgttacaaat 14571995  T
Q  365 ggtatcagagcag 377  Q
    |||||||||||||    
T  14571994 ggtatcagagcag 14571982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27579089 - 27578739
Alignment:
Q  26 ggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaag 125  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||      
T  27579089 ggggagtggtccgactcttgacagcttctaggtaaaaccgaatcacatcggaataagagggatcttaaagtcgtgtaggtatgacactacttggttgact 27578990  T
Q  126 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 225  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||    
T  27578989 gaagacttataagaattgtttggtactacatatatcaattagacacatcttcttttcagtagccctatccataagaactacacagttaagcgtgcttaac 27578890  T
Q  226 ttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggt 325  Q
    ||||||   | || |||||  ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||  ||||| | ||| ||||    
T  27578889 ttggagcgattttgggatgcgtgaccttctgggaagtttcccagaaagcgtgcgagtgaggacaaatcatgctgaaaagacttgtgttgatttgtagggt 27578790  T
Q  326 cagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 376  Q
    || |||| ||| ||||| || ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  27578789 caatcgagaatacttaatgtcgtctgagatgttacaactggtatcagagca 27578739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 50398678 - 50398383
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50398678 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtataggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 50398579  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||   ||||| |||     
T  50398578 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggaagttta 50398479  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||  ||  || |||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||  ||||  |||||||||    
T  50398478 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacactggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgagatgttaca 50398383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12692139 - 12691909
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12692139 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 12692040  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| ||||    
T  12692039 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagtttc 12691940  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacg 296  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12691939 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacg 12691909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24629573 - 24629267
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24629573 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggtcgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 24629474  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||| | |   ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||||   |    
T  24629473 agatgcatcttcttttcggtacctcgttccataagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaa---c 24629377  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| || ||||  ||||  |||||||||| ||    
T  24629376 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttagtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgtgatgttacaaatg 24629277  T
Q  366 gtatcagagc 375  Q
    ||||||||||    
T  24629276 gtatcagagc 24629267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 51331421 - 51331128
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  51331421 aatcacatcggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaaca 51331322  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||   |||||||||     
T  51331321 agatacatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggaaattt- 51331223  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |||  |||||||||| |||| ||||| |||  || |||||||| | || || ||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||    
T  51331222 tcgataagcgtgcgaatgaggacaaaacacactg-aaagactcgtattagtttgtagggtcagtcggcaatcctaaaagtagtctaggatgttaca 51331128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9423998 - 9423719
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9423998 aatcacaccggaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaaca 9423899  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||  ||||||||| | |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  9423898 agatgcatcttctttctagtagcccattccataagaatttcacaattaagtgtgcttgaattggagtagtcttaggatgggtgacctaccgggaaatttc 9423799  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 345  Q
     ||  |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||  |||| || | |||| ||||||||    
T  9423798 ccgttaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtgtgtacggtccgttggcaatgcttaaagt 9423719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23942929 - 23942634
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23942929 aatcacatcggaatgagagggatcctggggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 23942830  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   || || ||||    
T  23942829 agatgcatcttcttttttgtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctaccggaaagtttc 23942730  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
         ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||| ||   |||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  23942729 caaataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaggacccgtgttggtttgtaggaatagtcaacaatgcttaaagttgtatgggatgttaca 23942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8467964 - 8467690
Alignment:
Q  40 ctcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataaga 139  Q
    |||||||||| ||||||||||  |  || |||||| |||||| ||||||||| |    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8467964 ctcctggcagcttctaggcaa--ccgaaccacatcagaatgaaagggatcctgagactgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataaga 8467867  T
Q  140 attttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtctta 239  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |      
T  8467866 attgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttcggtagccc--------agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt-- 8467777  T
Q  240 ggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagt 329  Q
       ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8467776 ---tgggtgaccttatgggaagtttctcggaaagcatgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagt 8467690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31817992 - 31817686
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||    
T  31817992 aatcacatcggaataagagggattatgaggtcatgcatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttcggtactacctataccaaca 31817893  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||  | ||| ||||    
T  31817892 agatgcatcttcttttcggtagtccatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttgtagtagttttaggatgggcgaccttcggtgaagtttc 31817793  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| || |||| || ||||| ||||||| || ||| ||||||  |||| || ||||  |||| ||||| ||||||||    
T  31817792 gcggaaagcgtgcgagtgaggacaaatcatgttg-aatgactcgtgttggtttgagggatcagtcagcaatcctgaaagcagtct-ggatgctacaagtg 31817695  T
Q  366 gtatcagag 374  Q
    |||||||||    
T  31817694 gtatcagag 31817686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7678726 - 7678467
Alignment:
Q  102 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 201  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  7678726 aggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcttattccataaga 7678627  T
Q  202 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 301  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  7678626 actccacagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 7678527  T
Q  302 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  7678526 aagactcgtgtaggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 7678467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 369
Target Start/End: Original strand, 14351795 - 14352098
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  14351795 aatcacaccagaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgagtctgcatggttgaaggaaggcttgtaagagttttttggtactatctatatcaaca 14351894  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||  || |||     
T  14351895 agatgcatcttctttttggtatcctattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttcgagtagtctttggatggatgacctactgcaaagtttt 14351994  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     | | |||||||| |||||  |||||  | | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||| |||||||| || | ||||||||||| ||    
T  14351995 ccagtaagcgtgcaagtgaagacaaaatatgctgaaaagactcatgttggtttgtatggtcagtcagcaatgcttaaagtcgtatgggatgttacaaatg 14352094  T
Q  366 gtat 369  Q
    ||||    
T  14352095 gtat 14352098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27578642 - 27578327
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcat 117  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||   || |||||||| |||| ||||||||  |    
T  27578642 atgagggcggggagcggtccggctcctggcagcttctaggcaaaaccgaatcatatcagaatgagatgg---ctgaagtcgtggaggtgtgagactgtgt 27578546  T
Q  118 ggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagca 217  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||     
T  27578545 ggttgaatgatggtttataagaattatttggtgctacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtatcccaaaccataagaactccatagttaagcg 27578446  T
Q  218 tgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggta 317  Q
    |||||||||| ||  | | || |||||   |||||| |||||| |||  ||  ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| || ||||     
T  27578445 tgcttgacttcgaacaattttgggatgagcgaccttctgggaagttttccgacaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgcagaaaagactcgtgatggtt 27578346  T
Q  318 tgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  27578345 tgtgggatcagtcaacaat 27578327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4128029 - 4127772
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4128029 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggcatgagactatatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 4127930  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || | |||||| |||||| ||| ||| | | || |||||| ||||||   |  || |||     
T  4127929 agatgcatcttcttttcggtagccaattccataagaacttcagagttaagcgtgcttggcttagagcaattttgggatgggtgacctaccgaaaagtttt 4127830  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggg 323  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4127829 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 4127772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14571910 - 14571702
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||  |||||||||  ||||| ||||||| | |   |||| ||||||| |||| ||    
T  14571910 atgagggcggggagtggtccggctcctggcttggttctaggaaaaactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccgtgtaggtatgggacttca 14571811  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  14571810 tggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagcctaaaccataagaactccacagttaagc 14571711  T
Q  217 atgcttgac 225  Q
     ||||||||    
T  14571710 gtgcttgac 14571702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29628807 - 29628624
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29628807 aatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 29628708  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgac 250  Q
    ||||   |||| | || |||||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29628707 agatgtgtctt-tgtttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgac 29628624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 361
Target Start/End: Original strand, 21067765 - 21068026
Alignment:
Q  97 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaacca 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   | |||| ||||| |||  |||    
T  21067765 cgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagataca---tttttttggtagtccattcca 21067861  T
Q  197 taagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacg 296  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||   ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||| |||     
T  21067862 taagaacttcacagttaagcgtgcttgacttgaagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttaccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacaca 21067961  T
Q  297 ttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     |||||| | || ||||||| ||| || | ||||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  21067962 ctgaaaaaattcgtgttggtttgtaggcttagtcggcaatgcttaaagtcatctgggatgttaca 21068026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15306285 - 15306052
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcat 117  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | |  ||| ||||||| |||| |||    
T  15306285 atgagggcgaggagtggtctggctcctggcagcttctaggcaaaacagaaccacatcagaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacat 15306186  T
Q  118 ggttgaaggaaggcttataagaatt------ttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatt 211  Q
    ||| ||| |||| ||||||||| ||      |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |    
T  15306185 ggtcgaaagaagacttataagatttgagcaattttggtactacctatataaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 15306086  T
Q  212 taagcatgcttgacttggagtagtcttaggatgg 245  Q
    ||||| |||||||||| ||| | |||| ||||||    
T  15306085 taagcgtgcttgactttgagcaatcttgggatgg 15306052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 115 - 375
Target Start/End: Original strand, 17628560 - 17628821
Alignment:
Q  115 catggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || |    
T  17628560 catggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttcgatagcccaacccataagaattccacagttga 17628659  T
Q  215 gcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttg 314  Q
    || ||| |||||||||| | | ||  ||||| ||||||| | ||||  ||| |  |||||||| ||||||| ||||| |||  || |||||||  |||||    
T  17628660 gcgtgcctgacttggagcaattttgagatgggtgaccttctaggaagattcccataaagcgtgtgagtgaggacaaaacacactggaaagacttgtgttg 17628759  T
Q  315 gtatgtggggtcagtcgacaattct-taaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagc 375  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||  ||||  || | |||| |||||||||||||||||||    
T  17628760 gtatgtggagtcagtcggcaatcctgaaaagcggtgttggattttacaagtggtatcagagc 17628821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24629120 - 24628914
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaa---ggcttataagaattttttggtactacttatatca 162  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24629120 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaattaggcttataagaattgtttggtactacctatatca 24629021  T
Q  163 acaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaat 262  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   | |||||    
T  24629020 acaagatgcatcttcttttcagtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgcgaaat 24628921  T
Q  263 ttctcgg 269  Q
    |||||||    
T  24628920 ttctcgg 24628914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4127577 - 4127434
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4127577 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 4127478  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccaca 209  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4127477 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 4127434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 53996255 - 53996083
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |   || || |||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  53996255 aatcacatcggaatgagaaggatcctgaggctatgtagatatgggactacatggttgaaggaatgcttataaaaattgtttggtactacctatatcaaca 53996156  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtctt 238  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  53996155 agattcatcttctttttggtatctcattccataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagtagtctt 53996083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 215
Target Start/End: Original strand, 27029310 - 27029426
Alignment:
Q  99 tgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccata 198  Q
    |||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  27029310 tgcaggaatgagactacacgattgaaggaagacttataagaattatttggtactacttatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccata 27029409  T
Q  199 agaactccacatttaag 215  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27029410 agaactccacagttaag 27029426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13614037 - 13613788
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  | || ||||| | |||||||| |||||| ||||||   |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  13614037 aatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtttgataccacctatatcaaca 13613938  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||  | |||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| |||||| |||| || || ||| |||     
T  13613937 agatgcatcttc-tttcggtagttcattctataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggactagtctttggatgggtgacgttctgagaagtttt 13613839  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
      | ||||| | |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13613838 ctgaaaagccttcgagtgaggacaaagcacgctgtaaagactcatgttggt 13613788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 371
Target Start/End: Original strand, 1464147 - 1464451
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |     |||| |||||||||| | ||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1464147 aatcacatcagaatgagagggatcatgcgaccgtgtaggtatgagaatacatagttgaaagaaaacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 1464246  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||| || ||| ||||| |||||||| | | || |||||| ||||||| || ||| |||     
T  1464247 agatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaacttcacaatttagcgtgcttaacttggagcaattttgggatgggtgaccttctgagaagtttt 1464346  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     |  ||| ||||||||| || ||| | |||| |||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||| ||| || ||||  |||| |||||||| ||||     
T  1464347 ccaaaaaacgtgcgagttaggacacaacacgctgaaaa-actcgtgttgatttgtggggtcggtcgataatcctaaaagcagtctgggatgttataagta 1464445  T
Q  366 gtatca 371  Q
    ||||||    
T  1464446 gtatca 1464451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 50814899 - 50814730
Alignment:
Q  132 ttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggag 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  50814899 ttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggag 50814800  T
Q  232 tagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 301  Q
     | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| || |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  50814799 caattttgggatggatgacctaccgggaagtttcccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 50814730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 41869878 - 41870077
Alignment:
Q  26 ggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaag 125  Q
    |||||||||| || ||||||  || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |    || ||  |||| ||||||||| ||||||    
T  41869878 ggggagtggtacgtctcctgtaagcttctaggcaaaactaaatcacatcggagtgagagggatcctgagactgtacatatatgggactgcatgattgaag 41869977  T
Q  126 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 225  Q
    |||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  41869978 gaagacttataagaattgtatgatactacctatatcaacaagacgcatcttcttttcagtaacccaaatcataagaacttcacaattatgcatgtttgac 41870077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 368
Target Start/End: Original strand, 4185748 - 4186015
Alignment:
Q  99 tgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccata 198  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||  | | |    
T  4185748 tgcaggtatgagacggcatggttaaaggaatacatataagaattgtttgataccacatataccaacaagatgcatcttctttttggtagctcattctaca 4185847  T
Q  199 agaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgtt 298  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | | || |||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||||| |||  |    
T  4185848 agaactctacagttaagtatgcttgacttggagcaattttgggataggtgaccttatgcgaaatttctcgaaaagcgtgtgaatgaggacaaaacacact 4185947  T
Q  299 gaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggta 368  Q
     ||||||||  ||||  | ||| ||||||||| ||||| ||||||||  | | ||||||||||| |||||    
T  4185948 aaaaagact-gtgttaatttgt-gggtcagtcaacaatacttaaagtcatttgggatgttacaaatggta 4186015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21220471 - 21220306
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | | | | || |||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21220471 aatcacatcagaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgaaactatatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 21220372  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggag 231  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||  | ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  21220371 agatgcatcttctttttggtaactcattctataagaactacacagttaagcgtgtttgacttggag 21220306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27578314 - 27578177
Alignment:
Q  178 ttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtg 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  27578314 ttttcggtagcccaaactataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcagttttgggatgagtgaccttatgggaagtttccctgaaaacgtg 27578215  T
Q  278 cgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttgg 315  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27578214 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgg 27578177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14571701 - 14571563
Alignment:
Q  193 accataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaag 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |   ||||| ||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||     
T  14571701 accataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttcgagatgggtgatcttttgggaagtttctcggaaagtgtgtgagtgaggacaaaa 14571602  T
Q  293 cacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcg 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14571601 cacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcg 14571563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31817538 - 31817376
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  31817538 aatcacatcgaaataagagggatcatgaggtcgtgcatgtatgagacttcatggttgaaggaacgtttataataattgtttggtactacctataccaaca 31817439  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttg 228  Q
    | || |||||||||||| | ||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||    
T  31817438 aaatgcatcttcttttccgcagcccattccttaagaactctacaattaagcgtgtttgacttg 31817376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15268123 - 15267994
Alignment:
Q  256 gggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggat 355  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| || |    
T  15268123 gggaaatttctcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctcggct 15268024  T
Q  356 gttacaagtggtatcagagcaggtaggtcc 385  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15268023 gttacaaatggtatcagagcaggttggtcc 15267994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 369
Target Start/End: Original strand, 17028849 - 17029177
Alignment:
Q  40 ctcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataaga 139  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||||| ||||||||| |  || |||||    
T  17028849 ctccttgcagcttctaggcaaa-ctgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagccttgcatgtatgggactgcatagttgaaggaggatttgtaaga 17028947  T
Q  140 attttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtctta 239  Q
    ||| || ||| |||| |||||||||||||| | |||| ||||   ||||  |  ||||||||||| || | |||||  |||||||||||||| | | |      
T  17028948 attgttaggtgctacctatatcaacaagatgcgtcttattttacctagcttattccataagaacttcatagttaagagtgcttgacttggagcaatttcg 17029047  T
Q  240 ggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattct 339  Q
    |||||| | | |||||||||| ||||||| |||| |||| | |||| | ||| || ||||||||||||  ||||||| |    ||||| ||| ||||  |    
T  17029048 ggatgggtaaacttatgggaagtttctcgaaaagtgtgctaatgaggagaaaacatgttgaaaagacttctgttggtttacatggtcaatcggcaataat 17029147  T
Q  340 taaagttgtctaggatgttacaagtggtat 369  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  17029148 taaagtcatctgggatgttacaagtggtat 17029177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 17628946 - 17629132
Alignment:
Q  44 tggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattt 143  Q
    |||||| ||||||||||| |  |  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||  ||  ||||||||||||     
T  17628946 tggcagcttctaggcaaatcgaatccacatcagaatgagtgggatcctaaggtcgtgcaggtatgtgaatgtatggttgaataaaaacttataagaattg 17629045  T
Q  144 tttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggag 231  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||| | |||||||||  | ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17629046 tttggtactacctatactaataagatgcctcttctttttagaagcccaatccaaaagaattccaca-ttaagcatgcttgacttggag 17629132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 329
Target Start/End: Original strand, 27026535 - 27026765
Alignment:
Q  98 gtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccat 197  Q
    ||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||  ||||    
T  27026535 gtgcaggtatgggactacacgattgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcatctt-tttttggtagcccattccat 27026633  T
Q  198 aagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgt 297  Q
    ||||||| |  | |||||| ||||||||||| || | | || ||| || ||||||| | |||| |||  |  |||||||| || |||| | ||| ||||     
T  27026634 aagaactacgtagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggaagggtgaccttctaggaagtttaccaaaaagcgtgtgactgaggaaaaaacacgc 27026733  T
Q  298 tgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagt 329  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| ||||    
T  27026734 tgaaaagactcgtgtttgtttgtggggccagt 27026765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 571 - 686
Target Start/End: Original strand, 13027893 - 13028010
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctc 669  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | ||    
T  13027893 ttccattccttctgcaatgatatgcattcagaataaaaacatttaactaacttcagcttcccgtcttcagactctgatgaactccagcttctgatggttc 13027992  T
Q  670 tt-cagactctctgatga 686  Q
    || |||||||||||||||    
T  13027993 ttccagactctctgatga 13028010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23976323 - 23976062
Alignment:
Q  102 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcgg-tagcccaaaccataag 200  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||    ||||| ||| |||||     
T  23976323 aggtatgggtctgcatgattgaaggaagagttataagaattgtttggtactacctatactaacaagatgcatcttcttttttcatagccaaaatcataaa 23976224  T
Q  201 aactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttga 300  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||| || | || |||||  ||| |||||| ||  |||| |  ||| | ||||  |||| | ||| |||| |||    
T  23976223 aactccacagttaaacgtgcttgacttggaataattttgggatgagtgagcttatgtgatgtttcccaaaaaacatgcggctgaggaaaaaacacgctga 23976124  T
Q  301 aaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||| |  |||| ||||||||||    
T  23976123 aaagactaatgttggtttatggggtcagtcaacaattctaaaaatcatctaagatgttacaa 23976062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 194 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4127430 - 4127263
Alignment:
Q  194 ccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagc 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | | || |||||| ||| ||   ||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||||| |    
T  4127430 ccataagaactccacagttaagcatgattggcttggagcaattttgggatgggtgagctatcgggaagtttcccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaac 4127331  T
Q  294 acgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  || ||| ||||||||    
T  4127330 acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtttagaatgttaca 4127263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43929092 - 43928982
Alignment:
Q  77 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 176  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  43929092 aatgagagggttcctgaagccgtgcaggtatgagactatttggtcgaaggaaagcttacaagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatctt 43928993  T
Q  177 cttttcggtag 187  Q
    ||||| |||||    
T  43928992 ctttttggtag 43928982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 275
Target Start/End: Original strand, 17029334 - 17029539
Alignment:
Q  70 acatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagat 169  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17029334 acatcggaatgagagggatctagaggtcgtgcaagtatgggactgcatagttgaatgaagacttgtaataattgtttagtactacctatatcaacaagat 17029433  T
Q  170 acatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcgg 269  Q
     ||| ||  ||| |||| |  |  |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| | | || || ||| ||||||| |||||| |||| | |    
T  17029434 gcatattacttttggtaccttattccataagaactccacagttaagagtgcttaacttggagcatttttgggttgggtgaccttctgggaagtttcccag 17029533  T
Q  270 aaagcg 275  Q
    ||||||    
T  17029534 aaagcg 17029539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 52048804 - 52048538
Alignment:
Q  68 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaag 167  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||   ||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||    
T  52048804 tcacgtcggaatgagagggttcctaaggccgtacaggtatgaaactgcatagctgaaggaaaatttataagaattgtttgatactacgtatactaacaag 52048705  T
Q  168 atacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctc 267  Q
    || ||||||| |||  |||   ||  |||||||||||||||| ||||         |||||||| | | ||| ||||| ||||||| | |||| ||||||    
T  52048704 atgcatcttcattt-tgtaagtcattccataagaactccacagttaa---------acttggagcaatttta-gatggatgaccttctaggaagtttctc 52048616  T
Q  268 ggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 345  Q
    | |||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||| | ||||||    
T  52048615 gaaaagagtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagattcatgttggtttgtgagatcagtcgacaatacataaagt 52048538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 53854947 - 53854859
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  53854947 aatcacatcggaatgagagggatcatgaagcagtgtaggtatgagactatatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactac 53854859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24271690 - 24271552
Alignment:
Q  68 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtg--caggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |||||||||| |||| |||||| ||||  ||||    
T  24271690 tcacatcggaatgagagggttcctgaggtcgtgtgcaggtatgagactacatggttaaagtaagacatataagaattatttgatactacctatacgaaca 24271591  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactc 205  Q
    |||| ||| || |||| |||||||||  ||||||||||||    
T  24271590 agatgcatatt-ttttgggtagcccattccataagaactc 24271552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 4186176 - 4186315
Alignment:
Q  75 ggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatc 174  Q
    |||||||||||| || ||| | | |||| ||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  4186176 ggaatgagagggttcgtaaggccatgcacgtatgagactaaatgtttaaaggaatgcttataagaatgatttggtactacctacatgaacaagattcatc 4186275  T
Q  175 ttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 214  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||| |||| ||||    
T  4186276 ttctttttggtagcccattgcataagaactacacagttaa 4186315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2499727 - 2499647
Alignment:
Q  73 tcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtacta 153  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  2499727 tcggaatgagagggattctaaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaagcaacacttataaaaattgtttggtacta 2499647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26200425 - 26200208
Alignment:
Q  68 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaag--gcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |  | ||| ||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||  ||||  ||||    
T  26200425 tcacatcagaatgagagggatcctgatattgtgtaggtatgggacatcatggttgaaggaagaggcttataacaattgtttgatactaactatacaaaca 26200326  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||||||       |||| |||||||||||||||| | | || |||||| |||||||  | ||| ||||    
T  26200325 agatgcatattctttgtggtagccgaaaccataagaac-------ttaa-catgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccttcagcgaagtttc 26200234  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaa 291  Q
     || |||||||| ||||||| |||||    
T  26200233 acgaaaagcgtgtgagtgaggacaaa 26200208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 200
Target Start/End: Original strand, 53391925 - 53392021
Alignment:
Q  104 gtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataag 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||    
T  53391925 gtatgagactgcatggttgaagaaatgcttataaaaattgtttgataccatctatatcaacaagatacatatttttttcggtagttcagaccataag 53392021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 362
Target Start/End: Original strand, 7381472 - 7381563
Alignment:
Q  271 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| || | |||||||||||    
T  7381472 aagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtatgggatgttacaa 7381563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 575 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 14357125 - 14357014
Alignment:
Q  575 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcag 674  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||  || ||||| |||| | |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14357125 attccttttgcaatgatgtgtcttcagaataacaacttttaactaacttcagtttccaatctttagactctgttgaacttcagcttttgaggctcttcag 14357026  T
Q  675 actctctgatga 686  Q
    | ||||||||||    
T  14357025 attctctgatga 14357014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31817114 - 31816983
Alignment:
Q  230 agtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagt 329  Q
    ||||||||| |||||| |||| || |||||| |||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||| || |    
T  31817114 agtagtctttggatgggtgacattctgggaagtttcccagaaagcgtacgagtgaggacaaaacatgttgaaaagactcgtgctggtttgtggggccaat 31817015  T
Q  330 cgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||||||| || | ||| || | ||||||||||    
T  31817014 cgacaatcctgatagtagtatgggatgttaca 31816983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23091590 - 23091489
Alignment:
Q  127 aaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgact 226  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||  |  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23091590 aaggcgtataaaaattgtttggtactacatatattaacaagatgcatcttctttctggtagcttattctataaaaactccacagttaagcatgcttgact 23091491  T
Q  227 tg 228  Q
    ||    
T  23091490 tg 23091489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 345
Target Start/End: Original strand, 33764898 - 33765139
Alignment:
Q  104 gtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaac 203  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||| ||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||  ||||| ||    ||||||||    
T  33764898 gtataagactacatggttggatgaagacttttaagaattgtttggtgctacctataccaacaagatgcatcttcttttttgtagctcattttataagaac 33764997  T
Q  204 tccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaa 303  Q
    | |||| |||||| ||||||| |||||  | | || |||||| |||| || | |||  ||| ||  ||||| || ||| |||  |||| |||  | ||||    
T  33764998 ttcacacttaagcgtgcttgatttggatcaattttgggatgggtgactttctaggagttttttcaaaaagcatgtgagcgaggtcaaaacacactaaaaa 33765097  T
Q  304 gactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 345  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  33765098 gactcgtgttggtttgtgaggtcaatcgacaatgcttaaagt 33765139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 35477856 - 35477956
Alignment:
Q  262 tttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |||||||| || |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  || | ||||||||||    
T  35477856 tttctcggtaaacgtgcgagagaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgttaca 35477955  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  35477956 a 35477956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20306241 - 20306139
Alignment:
Q  126 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||   |||| ||||   |||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  20306241 gaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttttt---ggtatcccatttcataagaactacacggttaagcgtgcttgac 20306145  T
Q  226 ttggag 231  Q
    ||||||    
T  20306144 ttggag 20306139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 577 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 16324508 - 16324399
Alignment:
Q  577 tccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcagac 676  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||| |  ||| ||||||||||| | ||| ||||||| || ||| ||| | |||||||||    
T  16324508 tccttctacaatgatatgcattcagaataacaacttttgactaatttcagcatccagtcttcagattctgatgaactccaacttttgaggttcttcagac 16324409  T
Q  677 tctctgatga 686  Q
    ||||| ||||    
T  16324408 tctctaatga 16324399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 614 - 683
Target Start/End: Original strand, 18776147 - 18776216
Alignment:
Q  614 taactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcagactctctga 683  Q
    |||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||    
T  18776147 taactaactgcagcttccaatcttcagactctaatgaatttcagcttctgatgatttttagactctctga 18776216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 165
Target Start/End: Original strand, 17506389 - 17506484
Alignment:
Q  70 acatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||| |||||||||||||| | | ||| |||| |||||||| |||||| || || |||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||    
T  17506389 acatcagaatgagagggatcatgaggtcatgcatgtatgagagtgcatgattaaaagaagacttataagaattgtatagtactacctatatcaaca 17506484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 44831035 - 44831122
Alignment:
Q  104 gtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagccca 191  Q
    |||||||| | |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| || |  ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  44831035 gtatgagattacatggttgaagggaagcttataaaaattgtttggtactacctaaactaacaagatgtatattcttttcggtagccca 44831122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 53996049 - 53995978
Alignment:
Q  287 acaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgtt 358  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  53996049 acaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtggacaatgtttaaagtcgtctcggatgtt 53995978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4414322 - 4414248
Alignment:
Q  271 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 345  Q
    |||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  4414322 aagcgtgcgagtcaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagt 4414248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33987239 - 33987164
Alignment:
Q  37 cgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagact 113  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| ||||    
T  33987239 cgactcttggcagcttctaggcaaa-ctgaatcacatcggaatgagagggatcatgagatcgtgcaggtatgtgact 33987164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 34801450 - 34801394
Alignment:
Q  83 agggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataaga 139  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  34801450 agggatcctaaggtcgtgtaggtatgagactatatagttgaaggagggcttataaga 34801394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 176
Target Start/End: Original strand, 42838661 - 42838733
Alignment:
Q  104 gtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 176  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  42838661 gtatgagactacatagttcaaggaagacgtataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgcatctt 42838733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2682770 - 2682707
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaag 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||| || |||||| ||||||||||    
T  2682770 aatcacatcgaaatgagagggatcctgaaaccgtgcatgtatgtgattgcatgattgaaggaag 2682707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 336
Target Start/End: Original strand, 5810037 - 5810104
Alignment:
Q  269 gaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
    ||||||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||    
T  5810037 gaaagcgtgtgagtgaggataaaacacgctgaaaagactcatgttgatttgtggggttagtcggcaat 5810104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11828497 - 11828406
Alignment:
Q  194 ccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgag 285  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | | || |||||| ||||||| ||| ||||||| |  |||  |||||||||||    
T  11828497 ccataagaactccacagttaagcgtgctttacttggagcatttttgggatgggtgaccttctggaaaatttcccaaaaaatgtgcgagtgag 11828406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 20570993 - 20570932
Alignment:
Q  575 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtct 636  Q
    ||||||||| |||| || ||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  20570993 attccttctacaattatgtgacttcagaataacaacctttaactaactgcagcttccagtct 20570932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 181
Target Start/End: Original strand, 45682209 - 45682318
Alignment:
Q  72 atcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatac 171  Q
    ||||||||||||| |||| | | | | ||||  |||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||| |    
T  45682209 atcggaatgagagagatcttgaggccatgcatatatgggactacatgattgaatgaaggtttataagaattatttggtattatctataccaacaagatgc 45682308  T
Q  172 atcttctttt 181  Q
    || |||||||    
T  45682309 attttctttt 45682318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 53854860 - 53854703
Alignment:
Q  193 accataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaag 292  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||| |||||| || |||||  ||||||      || |||  ||| || |||||||||||  |||||     
T  53854860 accataagaactccatagttaagcatgttagacttgaagtagtttttggatgtgtgacctaccaaaaagtttaccggtaaacgtgcgagtgatgacaaaa 53854761  T
Q  293 cacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtct 350  Q
     ||||||||||||||| ||||| | ||| |||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  53854760 tacgttgaaaagactcgtgttgatttgtagggttagtcggcaatgcttaaagtcgtct 53854703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 118
Target Start/End: Original strand, 35477803 - 35477855
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatg 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| ||| |||||||||||    
T  35477803 aatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgtgcaagtacgagactgcatg 35477855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39902515 - 39902471
Alignment:
Q  144 tttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagc 188  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  39902515 tttggtactatctatatcaacaagatgcatcttcttttcgatagc 39902471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2405 - 2061
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||  || || ||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||    
T  2405 atgagggcggggagtggtccagcttctagcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagaaggatcctaaggccgtgcaggtatgggactaca 2306  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| | | ||||||    
T  2305 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcttattccataagaactcaatagttaagc 2206  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  2205 gtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacattgaaaagactcgtgttggt 2106  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  2105 ttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagttgtctgggatgttaca 2061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2557 - 2501
Alignment:
Q  321 ggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 377  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2557 ggggtcagtcgacaatcctaaaagttgtctgggatgttacaaatggtatcagagcag 2501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 107658 - 107314
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || | | ||| |||||||| |||||||    
T  107658 atgaggacggggagtggtccggttcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagggattctgaggccgtacaggtatgggactgca 107559  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  107558 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactaccaatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 107459  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||||||| | | || |||||| |||| |   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  107458 gtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacgtaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggt 107359  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     |||||||||||||| | ||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  107358 ttgtggggtcagtcggctattctgaaagcagtctgggatgttaca 107314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 10259 - 10594
Alignment:
Q  26 ggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaa 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  10259 ggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaa 10358  T
Q  125 ggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttga 224  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10359 ggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatctttttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttga 10458  T
Q  225 cttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtgggg 324  Q
    ||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||  || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10459 cttggagcaat-tttggatgggtgacctaccgggaagtttcctggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggg 10557  T
Q  325 tcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||    
T  10558 tcagtcgacaatgctgaaagtagtcggggatgttaca 10594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8080488 - 8080193
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8080488 aatcacatcggaatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagctgataagaattgtttggtactacctatatcaaca 8080389  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||  | |||| ||||    
T  8080388 agatgcattttctttttggtagcccattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtaacctactaggaagtttc 8080289  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  8080288 tcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggccagtcgacaatgcttaaagtcgtct-ggatgttacaa 8080193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 61 - 361
Target Start/End: Original strand, 2044053 - 2044353
Alignment:
Q  61 aacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatat 160  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  2044053 aacagaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctatat 2044152  T
Q  161 caacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaa 260  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  2044153 caacaagatgcattttctttttggtagcccattccataataactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaatgggaa 2044252  T
Q  261 atttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttac 360  Q
     |||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||  |||| |||||||| || | |||||||||    
T  2044253 gttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtattggtttgtagggtcagtcaccaatgcttaaagtcgtttgggatgttac 2044352  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  2044353 a 2044353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Original strand, 25147487 - 25147846
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    ||| |||||||||||||||    
T  25147487 atgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcttctaggcaaaactaaatcacatcggaatgagagagatcctaagactgtgtaggtatgagactgca 25147586  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||| |    
T  25147587 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccatagttaatc 25147686  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||  |  ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  25147687 gtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcctgataagcgtgcgagtgagtacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 25147786  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 377  Q
     ||| |||||||||| |||| || ||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  25147787 ttgt-gggtcagtcggcaatcctgaaagcagtcttgggtgttacaaatggtatcagagcag 25147846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 34309134 - 34308770
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | | ||| || ||||||||||| |    
T  34309134 atgagggcgaggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgta 34309035  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactac----ttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacattt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||    
T  34309034 tggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatatatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcctattccataagaactccacagtt 34308935  T
Q  213 aagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgt 312  Q
    |||| |||||| ||||||| | | ||  ||||| ||||||   ||||| |||| ||| |||| || ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||    
T  34308934 aagcgtgcttggcttggagcaattttgagatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcatgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgt 34308835  T
Q  313 tggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 377  Q
    |||| |||||||||||||  |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34308834 tggtttgtggggtcagtcagcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtatcagagcag 34308770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 34308667 - 34308329
Alignment:
Q  25 cggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttga 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | | ||| || ||||||||||| ||||||||    
T  34308667 cggggagtggtccggctcctggcgtgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgaaagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttga 34308568  T
Q  124 aggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttg 223  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34308567 aggaaggcttataagaactgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcctattccataagaactccacacttaagcgtgcttg 34308468  T
Q  224 acttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggg 323  Q
     ||||||| | | ||  ||||| ||||||   ||||| |||| ||| |||| || ||||||| ||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||    
T  34308467 gcttggagcaattttgagatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcatgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgctggtttgtggg 34308368  T
Q  324 gtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    |||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  34308367 gtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 34308329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 71 - 362
Target Start/End: Original strand, 17103086 - 17103378
Alignment:
Q  71 catcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagata 170  Q
    |||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |     
T  17103086 catcggaatgagagagatcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagctg 17103185  T
Q  171 catcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggat-ggctgaccttatgggaaatttctcgg 269  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| | | || |||| || ||||||   ||||| |||| |||    
T  17103186 catcttcttttcggtagctcattccataagaactccacggttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggttgacctaccgggaagtttcccgg 17103285  T
Q  270 aaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  17103286 taagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagtcgtctgggatgttacaa 17103378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10844758 - 10844465
Alignment:
Q  69 cacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaaga 168  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  10844758 cacaccggaatgagagggttcctgaggccttgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatattaacaaga 10844659  T
Q  169 tacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcg 268  Q
    | |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | | || |||||| ||||||   ||||| |||||||    
T  10844658 tgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttctcg 10844559  T
Q  269 gaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
    | |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  10844558 gtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgtttgtttgtagggtcagtcgacaatcctaaaagtcgtctgggatgttacaa 10844465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Original strand, 27925899 - 27926194
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27925899 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaaca 27925998  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||  |   ||||| ||||    
T  27925999 agatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaat-ttgggatgggtgaggtaccgggaagtttc 27926097  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||| ||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  27926098 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttacaa 27926194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22549141 - 22548830
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22549141 aatcacaccggaatgagaggcttcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 22549042  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  22549041 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataaaaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 22548942  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     | | ||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  || | ||||||||||| ||    
T  22548941 ccagtaagcgtgcgagtgaggataaaacacgctgaacagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgttacaaatg 22548842  T
Q  366 gtatcagagcag 377  Q
    ||||||||||||    
T  22548841 gtatcagagcag 22548830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 12100643 - 12100982
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||| ||||||| | ||||| | | ||| ||||||||||||||||    
T  12100643 atgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcgaaatgagaag-atcctgaggccgtacaggtatgagactgca 12100741  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||| ||||||    
T  12100742 tggttgaaggcaagcttataagatttgtttggtactacctatatcaataagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaacttcacagttaagc 12100841  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||   | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  12100842 gtgcttgacttggagcaat-tttggatgggtgacctaccgggaagtttcctcgtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 12100940  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgtt 358  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||    
T  12100941 ttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagtcgtatgggatgtt 12100982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Original strand, 22026379 - 22026675
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22026379 aatcacaccggaatgagagggttcgtgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 22026478  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| | ||||   ||||| ||||    
T  22026479 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatattgggatgggtaacctatcgggaagtttc 22026578  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaac-aaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||| ||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  22026579 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 22026675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22548696 - 22548400
Alignment:
Q  65 taatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaac 164  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22548696 taatcacaccggaatgagagggttcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagttttataagaattgtttggtactacctatatcaac 22548597  T
Q  165 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 264  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||    
T  22548596 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataataactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 22548497  T
Q  265 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    | | | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  || | ||||||||||    
T  22548496 cccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgttaca 22548400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27022484 - 27022173
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | | || ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27022484 aatcacatcggaatgagagggatcttgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 27022385  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    | || |||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||| ||  ||||| ||     
T  27022384 acatgcatcttattttcggcagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc-tactggaaagttt 27022286  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
    | || ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  27022285 ttggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttacaaatg 27022186  T
Q  366 gtatcagagcagg 378  Q
    |||||| ||||||    
T  27022185 gtatcaaagcagg 27022173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 41659251 - 41658981
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41659251 aatcacaccggaatgagagggttcctgatgtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 41659152  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | | || |||| | ||||||   ||||| ||||    
T  41659151 agatgcatcttcttttcgatagctcattacataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggataggtgacctaccgggaagtttc 41659052  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
     | | ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41659051 cctgtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 41658981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12827392 - 12827104
Alignment:
Q  74 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 173  Q
    |||||||||||||||||| | | | || ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  12827392 cggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 12827293  T
Q  174 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 273  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| |||    
T  12827292 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaag 12827193  T
Q  274 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     |||||||||||   ||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  12827192 tgtgcgagtgaggttaaaacacttttaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 12827104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27819428 - 27819105
Alignment:
Q  30 agtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaag 129  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27819428 agtggtccgactcctggaagcttttaggcaaaaccgaatcacatcagaatgagagggatcatgaagtcatgcaagtatgagacttcatggttgaaggaag 27819329  T
Q  130 gcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttgg 229  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||| ||  |||||| ||||||||| |||||  || ||||||| |    
T  27819328 gctaataagaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgcatcttcttttcaatagctcattccataaaaactccacagttaagtgtgtttgactttg 27819229  T
Q  230 agtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagt 329  Q
    |||||| || |||||| ||||||| ||  || |||  | ||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  27819228 agtagtatttggatgggtgaccttctgataagttttccagaaagcgtgtgagtgaggac-aagcacactgaaaagacccgtgttgat-tgtggggtcagt 27819131  T
Q  330 cgacaattcttaaagttgtctaggat 355  Q
    ||||||| || ||||  |||||||||    
T  27819130 cgacaatcctaaaagcagtctaggat 27819105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 336
Target Start/End: Original strand, 25147918 - 25148236
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||      
T  25147918 atgagggcggggagtggtttggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacataagaatgagagggatcccgaggtcgtgtaggtatgggactgtg 25148017  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  25148018 tcgttgaaggaaggcttataagaattgtttggtcttacctatatcaacaagatgcatattcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 25148117  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||| ||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||  || ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  25148118 gtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc-cgataaacgtgcgagtgaggtcaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 25148216  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaat 336  Q
     |||||||||||||||||||    
T  25148217 ttgtggggtcagtcgacaat 25148236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 316
Target Start/End: Original strand, 32292397 - 32292647
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  32292397 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactatctatatcaaca 32292496  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    || | ||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||| |||     
T  32292497 agttgcatcttctttttgctagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgatctaccgggaagtttt 32292596  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  32292597 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 32292647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21316304 - 21315960
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| |  |||||| ||||   ||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  21316304 atgagggcggggagtggtccggcttctggcaagcatctaggaaaaattgaatcacatcgcgatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgagactgta 21316205  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    ||||| || ||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||| |||||     
T  21316204 tggttaaatgagcgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcgtcttttcagtagctcatttcataagaactccacagttaagt 21316105  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||||||||| | || | | || ||||||   | ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  21316104 gtgcttgacttggagtaattttggtaagggtgacctaccgcgaagtttc-cggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 21316006  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     |||||||||| |||||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  21316005 ttgtggggtcaatcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttacaa 21315960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33852404 - 33852109
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  |   |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  33852404 aatcacaccagaatgagagggatcccgagaccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatattaaca 33852305  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaa-ttt 264  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| |||    
T  33852304 agatgtatcttctttttggtagcccattccataagaacttcacaattaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacc-tatcggaaagttt 33852206  T
Q  265 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |  |  ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||| | |||  |||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  33852205 catgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcatgttgatttgtcaggtcagacagcaatgcttaaagttgtcacggatgttaca 33852109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 25144723 - 25144937
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||   | |||||||||||||| || ||||    
T  25144723 atgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcagaatgagagagatctcgaggtcgtgcaggtatgggattgca 25144822  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  25144823 tgattgaaggcaggcttataagaattgtttggtactacctatatcagcaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 25144922  T
Q  217 atgcttgacttggag 231  Q
     ||||||||||||||    
T  25144923 gtgcttgacttggag 25144937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 144 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31283719 - 31283487
Alignment:
Q  144 tttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggat 243  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | | || ||||    
T  31283719 tttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagtgtgcttgactttgagcaatttt-ggat 31283621  T
Q  244 ggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaa 343  Q
    || ||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | |||    
T  31283620 gggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacgcgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgttgaaa 31283521  T
Q  344 gttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 377  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31283520 gtcgtctgggatgttacaaatggtatcagagcag 31283487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 345
Target Start/End: Original strand, 41913003 - 41913249
Alignment:
Q  99 tgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccata 198  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||    
T  41913003 tgcaggtatgggactgcatgtttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgcgtcttctttttggtagcccattccata 41913102  T
Q  199 agaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgtt 298  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||  | | || ||||| || |||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  41913103 agaactccgcagttaagcgtgcttgacttgaagtagtctttggatgagtgacctactagaaagtttcttggtaagcgtgcaagtgaggacaaaacacgtt 41913202  T
Q  299 gaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 345  Q
    ||||| |||| |||| || | | |||||||||||||||  |||||||    
T  41913203 gaaaaaactcgtgttagtttatagggtcagtcgacaatgtttaaagt 41913249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 226
Target Start/End: Original strand, 10844883 - 10845043
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10844883 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 10844982  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgact 226  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10844983 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 10845043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15819121 - 15818878
Alignment:
Q  106 atgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactc 205  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  15819121 atgagacaacatggttgaaggaatgcttagaaaaattgtttggtactacatatatcaacatgatgcatcttcttttcggtagcacattccataagaactc 15819022  T
Q  206 cacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaaga 305  Q
     ||| ||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  15819021 -acagttaaatttgcttgacttggagtaggctttggatgggcgaccttctgggaagtttcccgaaaagtgtgcgagtgaggacaaagcacactgaaaaga 15818923  T
Q  306 ctcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtct 350  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||    
T  15818922 cttgtgttggtttgtggggccagtcggcaatacttaaagtcgtct 15818878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 252
Target Start/End: Original strand, 28453338 - 28453524
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||    
T  28453338 aatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcaggtatgagacttcatggttgaaagaaaacttataagaattgttttatactacctatattaaca 28453437  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 252  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  28453438 agatgcatcttctttatggtagcccattccataagaactctacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacct 28453524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6465056 - 6464872
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | | | |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6465056 aatcacattggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 6464957  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgac 250  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6464956 agatgcattttctttttggtagctcattccataacaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgac 6464872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 327
Target Start/End: Original strand, 3745104 - 3745362
Alignment:
Q  69 cacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcagg-tatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaag 167  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||     
T  3745104 cacatcgaaatgagagggatcctaaggtcgtgcaggctaag-gactacatggttgaaggaaaacttataagaactgtttagtactacctataccaacaat 3745202  T
Q  168 atacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctc 267  Q
    || ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| | |||| |||||||||| ||| | | || |||||||||||| | || ||| ||||||    
T  3745203 atgcatcttctttttggtagcccattccataataactccacagtcaagcgtgcttgacttagagcaattttgggatggctgaccatctgagaagtttctc 3745302  T
Q  268 ggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtca 327  Q
      |||||||| || ||| || ||| || | ||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  3745303 aaaaagcgtgtgaatgataataaaacatgctgaaaagactcatgttgatttgttgggtca 3745362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27022015 - 27021904
Alignment:
Q  76 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 175  Q
    |||||||||||||||| | | | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27022015 gaatgagagggatcctgaggccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaacaagatgcatct 27021916  T
Q  176 tcttttcggtag 187  Q
    ||||||||||||    
T  27021915 tcttttcggtag 27021904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28375189 - 28375078
Alignment:
Q  77 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 176  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  28375189 aatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctacatcaacaagatgcatctt 28375090  T
Q  177 cttttcggtagc 188  Q
    ||||||||||||    
T  28375089 cttttcggtagc 28375078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30527589 - 30527349
Alignment:
Q  104 gtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaac 203  Q
    ||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||    
T  30527589 gtatgagactgcatgtttgaacca-gacttataagaattgtttggtaccacttacatcaataagatacatcttcttttgggtagcccatttcataagaac 30527491  T
Q  204 tccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaa 303  Q
    |||||| |||||  || ||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||    | ||| ||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  30527490 tccacagttaagattgtttgactttgagtaatctttggatgggtgatctacctgaaaacttcccggtaagcgtgcgagtgaggataaaacacgctgaaaa 30527391  T
Q  304 gactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 345  Q
    ||||| ||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  30527390 gactcgtgttgatttgtaggatcagtcgacaatgcttaaagt 30527349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22840675 - 22840490
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |   || |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  22840675 aatcacatcggaatgagagagatcctgaggctttgtaggtatgagactacatggtcgaatgaagacttataagaattgtttggtactatctatatcaaca 22840576  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 252  Q
    |||| ||||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  22840575 agatgcatcttctttttgttagctcattccataagaactccaca-gtaatcatgcttgacttagattagtctttggatgggtgacct 22840490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 218 - 375
Target Start/End: Original strand, 32292093 - 32292250
Alignment:
Q  218 tgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggta 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||     
T  32292093 tgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtt 32292192  T
Q  318 tgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagc 375  Q
    ||| |||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  32292193 tgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtattagagc 32292250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 22705131 - 22705282
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcat 117  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||  ||       ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  22705131 atgaggacggggagtggtcaggctcctggcagcttcaaggcaaaaccgaa-------ggaatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactggat 22705223  T
Q  118 ggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 176  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22705224 gattgaaggaagggttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 22705282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30335054 - 30334779
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||| |||| |||||    
T  30335054 aatcacatcggaattagatggatcctgagactgtgcaggtatgcgactgcaaggttgaaagaagacttataaaaattgtttgatactacctataccaaca 30334955  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||| || | ||||   || |||||||| | || | || |||| | |||| ||||| ||| ||||    
T  30334954 agatacatcttcttttcgatagctcaattcataataacttcatagttaaatgtgtttgacttgaaatattatttggataggtgacattatgagaagtttc 30334855  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaa 343  Q
     |  ||| |||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||    
T  30334854 ccataaaacgt--gagtgaaaacaaaacacgttaaaaagactcatgttgatttgtgggatcaatcgacaatacttaaa 30334779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 364
Target Start/End: Original strand, 10729722 - 10729921
Alignment:
Q  165 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 264  Q
    ||||| |||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |    
T  10729722 aagatgcatcttgttttctgttacccattccataagaactccacaattaagcgtgatagacttggagtagtcttttgatgggtgaccttatgggaaatat 10729821  T
Q  265 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagt 364  Q
    |   ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||  | ||  | || ||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  10729822 cctagaaagcgtgcgagtgtggacaaagcacgctgaaaagactcgtgttattttgaagagttagttggcaatactgaaagtcgtctaggatgttacaagt 10729921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15567702 - 15567515
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  ||| ||| |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||    
T  15567702 aatcacatcggaatgagagagatcttgacatcgcgcaagtattagacatcatggtggaaggaaggcttataagaattgtttgacactacatataccaaca 15567603  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacctt 253  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||   |||||||||||| || |||| | || ||||||||||||||| || | |||| |||||||    
T  15567602 agatacatcttctttttggtagttcatttcataagaactccgcagttaatcgtgtttgacttggagtagttttggaatggatgacctt 15567515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Original strand, 25307856 - 25308034
Alignment:
Q  156 tatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttat 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |  |    
T  25307856 tatatcaacaagatacatctttttt--ggtagcccattctgtaagaactccacagttaagcttgcttgacttggtgtagtctttggatgggtgacgtact 25307953  T
Q  256 gggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 336  Q
     | || ||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| | | |||| ||||||| ||||    
T  25307954 tgaaagtttttcggcaagcgtgcgagtgaggacaaagtacgctgaaaagactcgtgttgatttatgggatcagtcggcaat 25308034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Original strand, 1297040 - 1297194
Alignment:
Q  99 tgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccata 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||| ||||    |||    
T  1297040 tgcaggtatgagactgcatggttgaagtaaaacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatttatattcttttcggtatcccattatata 1297139  T
Q  199 agaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacctt 253  Q
    ||||||||| | |||||  || |||||||| |||| |||| |||||  |||||||    
T  1297140 agaactccatagttaagtgtgtttgacttgaagtaatctttggatgagtgacctt 1297194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 324
Target Start/End: Original strand, 3744667 - 3744896
Alignment:
Q  95 gtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaac 194  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||| || || |||||||| |||||| ||       
T  3744667 gtcgtgtaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttgacactacctataccaacaatatgcaccttctttttggtagcacattt 3744766  T
Q  195 cataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagca 294  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |  || |||| ||| | | || |||| | ||||  | || ||| |||||| ||||| |||  | |||||||||| ||    
T  3744767 cataagaactctacaattaagctttattaactttgagcaattttgggattggtgactatttgagaagtttctcagaaagtgtgttaatgagaacaaaaca 3744866  T
Q  295 cgttgaaaagactcatgttggtatgtgggg 324  Q
    |  ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3744867 cactgaaaagactcgtgttggtttgtgggg 3744896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 263 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6463493 - 6463394
Alignment:
Q  263 ttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttgg-tatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6463493 ttctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttttttagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctaggatgttaca 6463394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 571 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 17916861 - 17916746
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 670  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||  ||||||||| || | |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| | |||    
T  17916861 ttccattccttctgcaatgatttacattaagaataacaacttttaactaattccaacttccaatcttcagactctgatgaactccagcttctgacggtct 17916762  T
Q  671 tcagactctctgatga 686  Q
    | ||||||||||||||    
T  17916761 ttagactctctgatga 17916746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15568025 - 15567854
Alignment:
Q  196 ataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcac 295  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||  ||| | | || |||||| |||  || | |||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||    
T  15568025 ataagaactccacaattaagcgtacttgactcagagcaattttgggatgggtgaatttctaggaagtttctcggaaaatgtgagagtgaggacaaaacac 15567926  T
Q  296 gttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggt 367  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  15567925 gttaaaaagacccgtgttagtatgtggggccagtcggcaatacttaaagtcgtctgagatattacaagtggt 15567854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 673
Target Start/End: Original strand, 12194020 - 12194118
Alignment:
Q  575 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttca 673  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  12194020 attccctctacaatgatgtgtcttcagaataacaaactttaactaactgtagtttccagtcttcaaactctgatgaacttcagcttctgaggatcttca 12194118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 673
Target Start/End: Original strand, 12438448 - 12438546
Alignment:
Q  575 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttca 673  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  12438448 attccctctacaatgatgtgtcttcagaataacaaactttaactaactgtagtttccagtcttcaaactctgatgaacttcagcttctgaggatcttca 12438546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 342
Target Start/End: Original strand, 6466686 - 6466982
Alignment:
Q  40 ctcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataaga 139  Q
    |||||| ||| ||| ||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| || |    |||| ||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||| |    
T  6466686 ctcctgacagcttccaggcaaacca-aatcatatcagaatgagagggattctgagactgtgcgggtatggaactgcatggttaaagga-gacttataaaa 6466783  T
Q  140 attttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtctta 239  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||  ||||| |   |||||||||| || |||||||  | |||||||||||| | | ||     
T  6466784 attgtttggtactacctataccaacaagatgcatctt--tttca-tagcc-atttcataagaactacaaatttaagtgtacttgacttggagcaattttg 6466879  T
Q  240 ggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattct 339  Q
    | |||| ||||||| | |||| |||    |||||| | ||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  6466880 gtatgggtgaccttcttggaagttttctagaaagcatacgagtgaaaacaaagcacactaaaaaaactcatgttggtttgtggggtcagtcggcaatgct 6466979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 17429501 - 17429603
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |   ||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17429501 aatcacatcggaatgagagg-atcttgagaccgtgcatatatgtgactgcattgttgaaggaagacttatgagtattatttggtactacctatatcaaca 17429599  T
Q  166 agat 169  Q
    ||||    
T  17429600 agat 17429603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10729736 - 10729614
Alignment:
Q  162 aacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||| |||||  |||||| |||| || | | || ||||| |||||||||||| ||     
T  10729736 aacaagatgcatcttctttttggtagcctattccataaggactccacaattaagggtgcttggcttgaagcaattttgggatgactgaccttatggaaag 10729637  T
Q  262 tttctcggaaagcgtgcgagtga 284  Q
    ||||  | |||||||||||||||    
T  10729636 tttcatgaaaagcgtgcgagtga 10729614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29971547 - 29971450
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaa 163  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||  ||||||||    
T  29971547 aatcacatcagaattggaaggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttgatactatctatatcaa 29971450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 36968503 - 36968438
Alignment:
Q  104 gtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagat 169  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  36968503 gtatgaaactgtatggttgaaggatgacttataagaattgattggtgctacttatatcaacaagat 36968438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 345
Target Start/End: Original strand, 34688044 - 34688115
Alignment:
Q  274 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 345  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||| ||||||||    
T  34688044 cgtgcgaatgaggacaaaacacgttgaaaagactcatgttggtttgtaggaccagtggacaatacttaaagt 34688115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15568100 - 15568036
Alignment:
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 181  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||    
T  15568100 tggttgaaggaagacttataacaattgtttggtatgacctatatcaacaagatgcatcttttttt 15568036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 130
Target Start/End: Original strand, 25307765 - 25307829
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagg 130  Q
    |||||||  |||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25307765 aatcacactggaatgagagcgattccaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaagg 25307829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 122
Target Start/End: Original strand, 9250964 - 9251057
Alignment:
Q  28 ggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttg 122  Q
    ||||||||| | ||||| |||  || ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| | |  ||||||| |||||||||||||    
T  9250964 ggagtggtctgcctcctagcaacttttaggcaaaaccgaatcacatcagaatgagagggatcctgaag-cctagaggtatgggactgcatggttg 9251057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39371827 - 39371775
Alignment:
Q  309 atgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  39371827 atgtttgtttgtggggtcagtcgacaatcttaaaaattgtctaggatgttaca 39371775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2197 - 1901
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| | |||||| |||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2197 aatcacaccagaatgaaagggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 2098  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  2097 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 1998  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||    
T  1997 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagtcgtttgggatgttacaa 1901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Original strand, 18966 - 19262
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18966 aatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 19065  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  19066 agattcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 19165  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  19166 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18316 - 18203
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||    
T  18316 atgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaacactgaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgca 18217  T
Q  117 tggttgaaggaagg 130  Q
    ||||||||||||||    
T  18216 tggttgaaggaagg 18203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Original strand, 105671 - 106025
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||  ||||||    
T  105671 atgagggcggggagtggtctggttcctggcatgcttctaggcaaaactaaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatggaactgca 105770  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  105771 gggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 105870  T
Q  217 atgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 316  Q
     |||||||||||||| | | || |||||  ||||||   | ||| ||||  || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  105871 gtgcttgacttggagcaattttgggatgtgtgacctaccgagaagtttcctggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 105970  T
Q  317 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatca 371  Q
     | | |||||||||| ||||||| ||||  ||||  |||||||||| ||||||||    
T  105971 ttatagggtcagtcggcaattctgaaagcagtctgagatgttacaaatggtatca 106025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 361
Target Start/End: Original strand, 1220 - 1515
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| |||||||||| || |||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  1220 aatcacaccggaatgagacggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatataaaca 1319  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  1320 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 1419  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  1420 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggcgtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 1515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18280 - 17974
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  18280 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttgatactacctatatcaaca 18181  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||| |||| ||||||  |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| || |||     
T  18180 agatgcatcttttttt-ggtagctaattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctattggaaagtttt 18082  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
    |||| || |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  18081 tcggtaaacgtgcgagtgaggacacaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtagggtcaatcgacaatgcttaaagtcgtct-ggatgttacaaatg 17983  T
Q  366 gtatcagag 374  Q
    |||||||||    
T  17982 gtatcagag 17974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17740 - 17448
Alignment:
Q  70 acatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagat 169  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  17740 acatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaggat 17641  T
Q  170 acatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcgg 269  Q
      |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  | | || ||| ||||    
T  17640 gtatcttctttttggtagctcaattcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtactctttggatgggtgacctactcgaaagtttttcgg 17541  T
Q  270 aaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||   | |||||||||| |||| |||||| | |||| | |||||||||    
T  17540 taagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttcatagggtcagtcggcaatacttaaaatcgtctggaatgttacaa 17448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 66 - 377
Target Start/End: Original strand, 245086 - 245394
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  245086 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 245185  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||| | | ||  ||||| ||||||| |||||| ||||    
T  245186 agatgcatcttc-tttcggtagcctaaaccataagaactccaca---aagcgtgcttgacttagagcaattttgagatgggtgaccttctgggaagtttc 245281  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtct-aggatgttacaagt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| || ||||  || |  || |||||||| |    
T  245282 tcggaaagcgtgtgagtgaggacaaaacacggtgaaaagactcgtgttggtttgcggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggggtgttacaaat 245381  T
Q  365 ggtatcagagcag 377  Q
    |||||||||||||    
T  245382 ggtatcagagcag 245394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 245466 - 245674
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||  |||||||||  ||||| ||||||| | |   |||| ||||||| |||| ||    
T  245466 atgagggcggggagtggtccggctcctggcttggttctaggaaaaactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccgtgtaggtatgggacttca 245565  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 216  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  245566 tggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagcctaaaccataagaactccacagttaagc 245665  T
Q  217 atgcttgac 225  Q
     ||||||||    
T  245666 gtgcttgac 245674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Original strand, 245675 - 245813
Alignment:
Q  193 accataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaag 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |   ||||| ||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||     
T  245675 accataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttcgagatgggtgatcttttgggaagtttctcggaaagtgtgtgagtgaggacaaaa 245774  T
Q  293 cacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcg 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  245775 cacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcg 245813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 66 - 375
Target Start/End: Original strand, 4561 - 4869
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4561 aatcacatcggaaggagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttagaagaattgtttggtactacctatatcaaca 4660  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  4661 agatgcatcttcttttcggtagctcattttataagaactccacagttaagtgtgcttaacttggagcaat-ttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 4759  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 365  Q
     ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| ||    
T  4760 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgactgggatgttacaaatg 4859  T
Q  366 gtatcagagc 375  Q
    ||||||||||    
T  4860 gtatcagagc 4869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Original strand, 5016 - 5316
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggctt-----ataagaattttttggtactacttatat 160  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  5016 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttaaaagagaagaattgtttggtactacctatat 5115  T
Q  161 caacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaa 260  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | | || |||||| ||||||    ||||    
T  5116 taacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttaacttggagcaat-ttgggatgggtgacctacctggaa 5214  T
Q  261 atttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttac 360  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5215 atttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttac 5314  T
Q  361 aa 362  Q
    ||    
T  5315 aa 5316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 363
Target Start/End: Original strand, 5331 - 5420
Alignment:
Q  275 gtgcgagtgagaacaaag-cacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaag 363  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  5331 gtgcgagtgaggacaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtaagtcgacaatgcttaaagtcgtctaggatgttacaag 5420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 362
Target Start/End: Original strand, 2742 - 3038
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  2742 aatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 2841  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || ||||||  |||||   ||||| ||||    
T  2842 agatgcatattcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggagacctaccgggaagtttc 2941  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 362  Q
     ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  2942 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagcagtctcggatgttacaa 3038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 162865 - 162553
Alignment:
Q  26 ggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaa 124  Q
    ||||||||||| | |||||| || | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  162865 ggggagtggtctggctcctgacatgcttctaggcaaaactgaattacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgtgactgcatggttgaa 162766  T
Q  125 ggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttga 224  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  162765 ggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccgcagttaagcgtgcttga 162666  T
Q  225 cttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttg-aaaagactcatgttggtatgtggg 323  Q
    ||||||| |   || |||||  ||||||    |||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  162665 cttggagcaactttgggatgagtgacctacctggaagtttcgcgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaagactcgtgttggtttgtggg 162566  T
Q  324 gtcagtcgacaat 336  Q
    |||||||| ||||    
T  162565 gtcagtcggcaat 162553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 69998 - 69666
Alignment:
Q  29 gagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaa 128  Q
    |||||||| |||| |||| || ||||||| ||| |  | |||||||  |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  69998 gagtggtctgacttctggaagcttctaggtaaagccgattcacatcataatgagagggatcctaagactatgcaggtatgagactgcatcgttgaaggaa 69899  T
Q  129 ggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttg 228  Q
     |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |    
T  69898 tgcttataataattgtttggtactacctatatcaacatgatgcatctttttttcattagctcattccataagaactccacagttatgcgggcttgactag 69799  T
Q  229 gagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcag 328  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||| | |||||||||| ||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||| || ||||    
T  69798 gagtagtctttggatgggtgaccttcagggaagtttatgggaaagcgtgtgagtgatgacaaaccacgctaaaaagactcgtgttggtttgttggttcag 69699  T
Q  329 tcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    ||| |||| || ||||  || | ||||||||||    
T  69698 tcggcaatcctgaaagcagtttgggatgttaca 69666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 165 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 163181 - 162969
Alignment:
Q  165 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 264  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||    
T  163181 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctatcgggaagttt 163082  T
Q  265 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagt 364  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| || |||   |||| ||||||||||| |    
T  163081 ctcggtaagcgttcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggccagtcggcaatcctgaaaacagtctgggatgttacaaat 162982  T
Q  365 ggtatcagagcag 377  Q
    |||||||||||||    
T  162981 ggtatcagagcag 162969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 162 - 361
Target Start/End: Original strand, 163167 - 163366
Alignment:
Q  162 aacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||  |  |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   | |||     
T  163167 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgagaag 163266  T
Q  262 tttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |||| | | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  163267 tttcccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtctgtcgacaatcctgaaagtcgtctgggatgttaca 163366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 358
Target Start/End: Original strand, 154765 - 155049
Alignment:
Q  74 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 173  Q
    ||||||||||||| |||| | | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| |||    
T  154765 cggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctgtatcaacaagatgcat 154864  T
Q  174 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 273  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || | |||| ||||||   ||||| |||||||| |||    
T  154865 cttcttttcagtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctaccgggaagtttctcggtaag 154964  T
Q  274 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgtt 358  Q
     |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||    
T  154965 tgtgctagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgtt 155049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 377
Target Start/End: Original strand, 154511 - 154613
Alignment:
Q  275 gtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagag 374  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  154511 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtatcagag 154610  T
Q  375 cag 377  Q
    |||    
T  154611 cag 154613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 142469 - 142305
Alignment:
Q  18 atgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| ||    
T  142469 atgaggacggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggacttca 142370  T
Q  117 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 181  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  142369 tggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 142305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 115 - 361
Target Start/End: Original strand, 2154 - 2391
Alignment:
Q  115 catggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||    
T  2154 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactccctatataaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccttaagaactccacagttaa 2253  T
Q  215 gcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttg 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||            ||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||    
T  2254 gcatgcttgacatggagtagtcttatgatgggtgacct---------accctcggtaagcgtgcgagtgaggagaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 2344  T
Q  315 gtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    || ||| || |||||||||||| || ||||  |||| |||| |||||    
T  2345 gtttgtaggatcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggattttaca 2391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13589 - 13384
Alignment:
Q  156 tatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttat 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | | || |||||| ||||||       
T  13589 tatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctacc 13490  T
Q  256 gggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggat 355  Q
    ||||| |||||  | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||  ||||    
T  13489 gggaagtttctttgtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtccgggat 13390  T
Q  356 gttaca 361  Q
    ||||||    
T  13389 gttaca 13384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 306
Target Start/End: Original strand, 14741 - 14981
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  14741 aatcacatcggaacaagagggatcctaatatcgtgcatgtataggactgcagtgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtaatacctatatcaata 14840  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 265  Q
    |||| |||| |||||||||||   ||    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||     
T  14841 agatgcatcgtcttttcggtaattcattgaataagaacttcacagttaagcatgtttgacttggagtggtctttggatgggtgaccatatgggaagtttt 14940  T
Q  266 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagac 306  Q
     || ||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||    
T  14941 ccgaaaaacgtgcgagtgatgacaaaacacgctaaaaagac 14981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 571 - 686
Target Start/End: Original strand, 7444 - 7559
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 670  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  7444 ttccattccttctgcaatcatatgaattcaaaataacaacttttaactaactctagcttccagtctttagactctgttgaacttcagcttctgaggctct 7543  T
Q  671 tcagactctctgatga 686  Q
    ||||||||||||||||    
T  7544 tcagactctctgatga 7559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 314
Target Start/End: Original strand, 26074 - 26316
Alignment:
Q  70 acatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagat 169  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |  | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26074 acatcagaaagagagggatcctaaggccgtgcaggtgtgagacttcatggttgcataatggcttatacaaattttttggtactacatatatcaacatgat 26173  T
Q  170 acatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcgg 269  Q
     ||||||||||| |||||| ||    ||||||||||  || |||||  |||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||| | || |||||||     
T  26174 gcatcttctttttggtagctcattttataagaactc--cagttaagtgtgcttgacttggagtatttttaggatgagtgagcttatagaaagtttctcga 26271  T
Q  270 aaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttg 314  Q
    ||||| |||||| ||||||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  26272 aaagcttgcgagggagaacataacacgctgaaaagactcgtgttg 26316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 165
Target Start/End: Original strand, 16038 - 16135
Alignment:
Q  70 acatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgc--aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  16038 acatcagaatgagagggatcctgatatcgtgcataggtatgagattgcatagttgaatgatgacttgtaagaattgtttggtgctatctatatcaaca 16135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14749 - 14553
Alignment:
Q  165 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 264  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||    
T  14749 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 14650  T
Q  265 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    | ||| ||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  14649 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 14553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0522 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0522
Description:

Target: scaffold0522; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 571 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 4257 - 4142
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 670  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  4257 ttccattccttctacaatcatatgaattcaaaataacaacttttaactaactccagcttccagtcttcagactctgttgaacttcagcttctgaggctct 4158  T
Q  671 tcagactctctgatga 686  Q
    ||||||||| ||||||    
T  4157 tcagactctttgatga 4142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0522; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 571 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 11540 - 11425
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 670  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  11540 ttccattccttctacaatcatatgaattcaaaataacaacttttaactaactccagcttccagtcttcagactctgttgaacttcagcttctgaggctct 11441  T
Q  671 tcagactctctgatga 686  Q
    ||||||||| ||||||    
T  11440 tcagactctttgatga 11425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 376
Target Start/End: Original strand, 7009 - 7251
Alignment:
Q  134 ataagaattttttggtactacttat-atcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagt 232  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| || ||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  7009 ataagaattgtttggtactacatattaccaacaagatgcaccttttttttgacaatccaaaccataagaactccacagttaagcatgcttgacttggagc 7108  T
Q  233 agtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcga 332  Q
    | | || | |||| ||||||| ||| || |||| || ||||| || ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  7109 aattttggtatgggtgaccttttggaaagtttcccgaaaagcatgtgagtggggacaaa-caaggtgaaaagactcgtgttggcctgtggggtcaatcga 7207  T
Q  333 caattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 376  Q
    ||||||| ||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  7208 caattctgaaaatcgtctggaatgttacaagtagtatcagagca 7251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4128 - 4003
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  4128 aatcacaccagaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctgtatcaaca 4029  T
Q  166 agatacatcttcttttcggtagccca 191  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||    
T  4028 agatgcatcttctttttggtagccca 4003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 178
Target Start/End: Original strand, 23673 - 23785
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    ||||||| || |||||||||| || | | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23673 aatcacaccgaaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 23772  T
Q  166 agatacatcttct 178  Q
    |||| ||||||||    
T  23773 agatgcatcttct 23785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 571 - 664
Target Start/End: Original strand, 20188 - 20281
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctga 664  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20188 ttccattccttctgcaatcatatgagttcaaaataacaacttttaactaactccagcttccagtcttcagactctattgaacttcagcttctga 20281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 571 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 870 - 754
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctc 669  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| | ||    
T  870 ttccattccttatgcaatgatatgcatacagaataacaacatttaactaacttcagcttccagtcttcagactcttatgaactccaacttctgatggttc 771  T
Q  670 ttcagactctctgatga 686  Q
    |||| ||||||||||||    
T  770 ttcaaactctctgatga 754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 361
Target Start/End: Original strand, 421 - 605
Alignment:
Q  177 cttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgt 276  Q
    |||||||||||| ||  |||||| | ||||| | |||||| |||||||| ||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||  |||| |    
T  421 cttttcggtagctcattccataaaatctccatagttaagcgtgcttgacatggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagcat 520  T
Q  277 gcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    | ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  521 gtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagtagtctcggatgttaca 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 574 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 10393 - 10280
Alignment:
Q  574 cattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctcttc 672  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||| || | |||||    
T  10393 cattccttccgcaatgatatgcattaagaataacaacatttaactaacttcagcttccagtctttagactctgatgaactccagcttctaatggttcttc 10294  T
Q  673 agactctctgatga 686  Q
    |||||||| |||||    
T  10293 agactctccgatga 10280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1702 - 1552
Alignment:
Q  211 ttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcat 310  Q
    |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| |||| || ||||||| ||||| |||| | ||||||||| |    
T  1702 ttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcatgtgagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcgt 1603  T
Q  311 gttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 361  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  1602 gttggtttgtggggtcagtcgataatcctgaaagcagtctgggatgttaca 1552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 571 - 637
Target Start/End: Original strand, 87025 - 87091
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtctt 637  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  87025 ttccattccttctgcaatcatatgaattcagaataaaaacttttaactaactccagcttccagtctt 87091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 45387 - 45489
Alignment:
Q  66 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |   ||||||  |||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45387 aatcacatcggaatgagagg-atcttgagaccgtgcatatatgtgactacattgttgaaggaagacttatgagaattatttggtactacctatatcaaca 45485  T
Q  166 agat 169  Q
    ||||    
T  45486 agat 45489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 44807 - 44631
Alignment:
Q  126 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||||||||| |  ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| | ||||   ||||||||    
T  44807 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 44708  T
Q  226 ttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaa 302  Q
    |||||  | | || |||||| ||||||| |||||| |||  |  |||| |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  44707 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgctgaaa 44631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1126 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1126
Description:

Target: scaffold1126; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1030 - 981
Alignment:
Q  98 gtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttg 147  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  1030 gtgcagatatgagactgcatggttgaaagaagacttataataattttttg 981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1026 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1026
Description:

Target: scaffold1026; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 682
Target Start/End: Original strand, 3087 - 3199
Alignment:
Q  571 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctc 669  Q
    |||||| |||||| |||||||  || |||||||||||||  || |||| | |  |||||||| |||||| ||||| |||||||  |||| ||||| | ||    
T  3087 ttccataccttctacaatgatcagacttcagaataacaactttgaactgatttcagcttccaatcttcagactctgatgaactctagctcctgatggttc 3186  T
Q  670 ttcagactctctg 682  Q
    |||||||||||||    
T  3187 ttcagactctctg 3199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 246793 - 246725
Alignment:
Q  184 gtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 252  Q
    ||||||||| |||||||||||| | | |||| | ||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  246793 gtagcccaatccataagaactctataattaatcgtgcttaatttggagtagtctttggatgggtgacct 246725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University