View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14629_low_1 (Length: 935)

Name: NF14629_low_1
Description: NF14629
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14629_low_1
NF14629_low_1
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (16-929)||(7476902-7477815)
chr3 (16-925)||(7493592-7494502)
chr3 (215-575)||(31284152-31284513)
chr3 (215-601)||(25248020-25248408)
chr3 (305-616)||(25230540-25230851)
chr3 (305-616)||(25238127-25238438)
chr3 (305-601)||(25230098-25230394)
chr3 (305-601)||(25237685-25237981)
chr3 (305-570)||(28561746-28562010)
chr3 (305-614)||(39653164-39653473)
chr3 (249-600)||(8067223-8067575)
chr3 (305-600)||(30529687-30529981)
chr3 (348-616)||(13150389-13150657)
chr3 (305-600)||(20884968-20885263)
chr3 (313-600)||(32227072-32227359)
chr3 (313-598)||(11179887-11180172)
chr3 (305-601)||(16811381-16811675)
chr3 (240-578)||(27187202-27187542)
chr3 (313-600)||(50347754-50348041)
chr3 (305-614)||(14813949-14814258)
chr3 (305-600)||(37045035-37045327)
chr3 (313-597)||(13149953-13150237)
chr3 (345-601)||(25238534-25238790)
chr3 (341-584)||(25802415-25802658)
chr3 (230-467)||(41472225-41472462)
chr3 (305-616)||(16810925-16811236)
chr3 (341-600)||(32227536-32227795)
chr3 (305-600)||(14820154-14820449)
chr3 (336-575)||(32386610-32386849)
chr3 (305-600)||(2911095-2911379)
chr3 (357-600)||(4067212-4067454)
chr3 (344-492)||(29224363-29224511)
chr3 (305-495)||(25802960-25803150)
chr3 (305-491)||(39640937-39641123)
chr3 (305-455)||(25239073-25239223)
chr3 (216-469)||(41473907-41474161)
chr3 (227-371)||(12820565-12820710)
chr3 (373-615)||(3899868-3900110)
chr3 (216-339)||(32388843-32388967)
chr3 (305-448)||(32796938-32797081)
chr3 (395-575)||(53150688-53150868)
chr3 (810-920)||(20418351-20418461)
chr3 (510-616)||(25238962-25239068)
chr3 (810-918)||(16794213-16794321)
chr3 (810-925)||(16882408-16882524)
chr3 (810-905)||(8728939-8729034)
chr3 (810-905)||(9080826-9080921)
chr3 (316-454)||(31103955-31104095)
chr3 (365-541)||(15377344-15377520)
chr3 (810-914)||(22766470-22766569)
chr3 (365-584)||(15405606-15405825)
chr3 (365-584)||(15411015-15411234)
chr3 (352-453)||(26309987-26310088)
chr3 (510-575)||(41473746-41473811)
chr3 (365-541)||(15417431-15417607)
chr3 (365-584)||(15392570-15392789)
chr3 (810-905)||(19197821-19197916)
chr3 (501-603)||(18318851-18318953)
chr3 (365-584)||(15388203-15388422)
chr3 (518-601)||(25230947-25231030)
chr3 (239-274)||(29224233-29224268)
chr3 (539-601)||(26309839-26309901)
chr3 (864-925)||(27374950-27375012)
chr3 (432-469)||(15381257-15381294)
chr3 (432-469)||(15396492-15396529)
chr3 (432-469)||(15410628-15410665)
chr3 (239-280)||(33466904-33466945)
chr3 (308-393)||(45047071-45047156)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (216-616)||(30966144-30966545)
chr2 (216-601)||(30966600-30966986)
chr2 (216-600)||(24818236-24818620)
chr2 (215-601)||(5399667-5400054)
chr2 (306-615)||(16378938-16379247)
chr2 (216-567)||(29259504-29259856)
chr2 (305-601)||(1912525-1912820)
chr2 (305-601)||(16379393-16379689)
chr2 (305-601)||(25337847-25338143)
chr2 (309-555)||(15619902-15620148)
chr2 (305-600)||(33174958-33175251)
chr2 (305-615)||(33174505-33174812)
chr2 (314-615)||(30963554-30963857)
chr2 (352-600)||(15639781-15640029)
chr2 (307-611)||(30963103-30963407)
chr2 (313-556)||(8256534-8256777)
chr2 (341-600)||(33771037-33771296)
chr2 (305-600)||(25433907-25434202)
chr2 (305-535)||(41754289-41754519)
chr2 (227-438)||(1953078-1953288)
chr2 (305-600)||(1707042-1707336)
chr2 (231-575)||(30961759-30962111)
chr2 (305-467)||(29804682-29804844)
chr2 (239-564)||(82953-83276)
chr2 (305-491)||(11388189-11388373)
chr2 (305-555)||(27882822-27883072)
chr2 (305-455)||(18098874-18099024)
chr2 (305-491)||(38898872-38899058)
chr2 (336-491)||(11394566-11394719)
chr2 (307-453)||(20502023-20502170)
chr2 (810-925)||(24157948-24158063)
chr2 (341-575)||(13191010-13191244)
chr2 (305-415)||(18447954-18448064)
chr2 (437-601)||(32377757-32377921)
chr2 (411-575)||(32377592-32377756)
chr2 (810-916)||(22383587-22383693)
chr2 (315-575)||(8073902-8074162)
chr2 (810-884)||(21846263-21846337)
chr2 (315-443)||(9909102-9909230)
chr2 (513-599)||(20502172-20502258)
chr2 (305-408)||(16541985-16542088)
chr2 (356-420)||(36924453-36924519)
chr2 (510-584)||(11389688-11389762)
chr2 (510-584)||(11406349-11406423)
chr2 (356-408)||(8181394-8181446)
chr2 (41-135)||(35494341-35494434)
chr2 (532-601)||(29804874-29804943)
chr2 (466-600)||(8181212-8181346)
chr2 (371-420)||(27190628-27190677)
chr2 (371-420)||(27840442-27840491)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (216-611)||(42515002-42515398)
chr7 (214-604)||(9124867-9125258)
chr7 (216-616)||(13124968-13125372)
chr7 (305-600)||(34405442-34405737)
chr7 (251-575)||(2941633-2941958)
chr7 (313-616)||(36422260-36422562)
chr7 (215-560)||(5406478-5406824)
chr7 (305-575)||(28495854-28496124)
chr7 (305-575)||(42515544-42515814)
chr7 (305-600)||(679817-680111)
chr7 (305-601)||(35473971-35474267)
chr7 (216-601)||(18833196-18833582)
chr7 (216-454)||(11517386-11517624)
chr7 (336-613)||(26421598-26421875)
chr7 (305-600)||(6718926-6719220)
chr7 (305-601)||(2193256-2193552)
chr7 (305-601)||(29038870-29039166)
chr7 (315-566)||(29357341-29357592)
chr7 (264-571)||(25182320-25182627)
chr7 (305-614)||(2189144-2189453)
chr7 (341-600)||(2465960-2466218)
chr7 (305-584)||(22529102-22529381)
chr7 (305-584)||(2611526-2611798)
chr7 (305-600)||(6747457-6747744)
chr7 (305-491)||(46425741-46425927)
chr7 (305-600)||(28495470-28495754)
chr7 (349-524)||(2465777-2465952)
chr7 (401-600)||(7646329-7646528)
chr7 (305-491)||(35527081-35527267)
chr7 (230-393)||(13124759-13124923)
chr7 (404-615)||(7646514-7646725)
chr7 (305-555)||(9623208-9623457)
chr7 (246-545)||(31406495-31406790)
chr7 (810-925)||(9064100-9064215)
chr7 (389-575)||(13122380-13122567)
chr7 (305-441)||(31743834-31743970)
chr7 (305-453)||(36015409-36015557)
chr7 (334-474)||(33316757-33316892)
chr7 (307-466)||(11372453-11372612)
chr7 (305-426)||(43233413-43233534)
chr7 (810-925)||(16307653-16307768)
chr7 (308-446)||(1628719-1628854)
chr7 (305-405)||(26957603-26957703)
chr7 (434-601)||(3305198-3305365)
chr7 (355-474)||(26421282-26421401)
chr7 (341-467)||(20966087-20966213)
chr7 (307-466)||(11372901-11373060)
chr7 (479-575)||(26419111-26419207)
chr7 (510-614)||(43233162-43233266)
chr7 (335-426)||(6585638-6585731)
chr7 (500-589)||(6747938-6748027)
chr7 (354-443)||(16192368-16192457)
chr7 (513-601)||(31743739-31743827)
chr7 (496-600)||(36422573-36422677)
chr7 (336-420)||(37672191-37672275)
chr7 (419-563)||(43776178-43776322)
chr7 (336-392)||(16811905-16811961)
chr7 (337-402)||(2490071-2490136)
chr7 (501-575)||(33316897-33316971)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (214-616)||(22556444-22556848)
chr5 (228-600)||(1821828-1822201)
chr5 (216-615)||(3886893-3887293)
chr5 (216-616)||(2473869-2474260)
chr5 (216-601)||(2474315-2474701)
chr5 (305-600)||(8641886-8642180)
chr5 (216-600)||(3886452-3886837)
chr5 (216-600)||(188990-189363)
chr5 (231-602)||(22556894-22557267)
chr5 (305-612)||(34371612-34371919)
chr5 (305-616)||(10927238-10927549)
chr5 (305-600)||(17445306-17445601)
chr5 (305-601)||(27646684-27646981)
chr5 (305-601)||(20039326-20039620)
chr5 (305-600)||(42788497-42788792)
chr5 (305-530)||(21886067-21886292)
chr5 (305-600)||(39146939-39147227)
chr5 (305-524)||(10926873-10927092)
chr5 (319-600)||(18750047-18750328)
chr5 (305-571)||(8391202-8391467)
chr5 (315-601)||(29679958-29680236)
chr5 (313-601)||(2193824-2194100)
chr5 (305-584)||(24182113-24182391)
chr5 (305-600)||(15512863-15513159)
chr5 (269-575)||(30684432-30684739)
chr5 (305-602)||(34372068-34372365)
chr5 (305-466)||(34867790-34867951)
chr5 (216-470)||(30719786-30720041)
chr5 (305-567)||(18304431-18304693)
chr5 (239-381)||(22975080-22975223)
chr5 (307-575)||(16370588-16370852)
chr5 (246-408)||(2058699-2058862)
chr5 (385-575)||(11757157-11757347)
chr5 (310-419)||(11160713-11160822)
chr5 (359-600)||(20858393-20858633)
chr5 (275-466)||(4657979-4658167)
chr5 (334-470)||(32574639-32574774)
chr5 (810-925)||(26119734-26119849)
chr5 (305-477)||(5066865-5067037)
chr5 (526-624)||(21883912-21884010)
chr5 (279-420)||(43356651-43356790)
chr5 (811-878)||(23589831-23589898)
chr5 (424-610)||(30720101-30720287)
chr5 (305-466)||(42429146-42429306)
chr5 (305-470)||(4102812-4102961)
chr5 (354-455)||(4673467-4673568)
chr5 (814-915)||(20969318-20969419)
chr5 (510-589)||(1880281-1880360)
chr5 (305-441)||(5549344-5549481)
chr5 (457-555)||(26341171-26341269)
chr5 (509-575)||(30684887-30684953)
chr5 (814-896)||(31588951-31589033)
chr5 (510-555)||(187763-187808)
chr5 (306-339)||(11757354-11757387)
chr5 (813-878)||(20567923-20567987)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (216-600)||(2061-2446)
scaffold0040 (560-616)||(2501-2557)
scaffold0040 (216-268)||(2554-2606)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (216-600)||(10210-10594)
[»] chr4 (80 HSPs)
chr4 (228-616)||(44471154-44471543)
chr4 (216-600)||(23350128-23350513)
chr4 (216-575)||(35871538-35871897)
chr4 (216-583)||(49998546-49998914)
chr4 (216-615)||(13266002-13266396)
chr4 (217-615)||(27578739-27579137)
chr4 (305-600)||(1645594-1645889)
chr4 (305-616)||(21067282-21067593)
chr4 (305-616)||(50398823-50399133)
chr4 (354-615)||(23943072-23943333)
chr4 (240-600)||(44470720-44471080)
chr4 (305-600)||(3169206-3169501)
chr4 (251-616)||(14571982-14572345)
chr4 (216-575)||(27578327-27578683)
chr4 (305-600)||(50398383-50398678)
chr4 (305-535)||(12691909-12692139)
chr4 (305-614)||(24629267-24629573)
chr4 (305-600)||(51331128-51331421)
chr4 (305-584)||(9423719-9423998)
chr4 (305-600)||(23942634-23942929)
chr4 (279-568)||(8467690-8467964)
chr4 (305-613)||(31817686-31817992)
chr4 (341-600)||(7678467-7678726)
chr4 (305-608)||(14351795-14352098)
chr4 (216-484)||(15306052-15306326)
chr4 (249-464)||(14571702-14571918)
chr4 (305-562)||(4127772-4128029)
chr4 (305-489)||(29628624-29628807)
chr4 (336-600)||(21067765-21068026)
chr4 (354-614)||(17628560-17628821)
chr4 (305-508)||(24628914-24629120)
chr4 (305-448)||(4127434-4127577)
chr4 (215-464)||(41869829-41870077)
chr4 (305-477)||(53996083-53996255)
chr4 (338-454)||(27029310-27029426)
chr4 (305-555)||(13613788-13614037)
chr4 (305-610)||(1464147-1464451)
chr4 (371-540)||(50814730-50814899)
chr4 (338-607)||(4185748-4186015)
chr4 (305-470)||(21220306-21220471)
chr4 (417-554)||(27578177-27578314)
chr4 (432-570)||(14571563-14571701)
chr4 (305-467)||(31817376-31817538)
chr4 (495-624)||(15267994-15268123)
chr4 (279-608)||(17028849-17029177)
chr4 (283-470)||(17628946-17629132)
chr4 (337-568)||(27026535-27026765)
chr4 (810-925)||(13027893-13028010)
chr4 (341-601)||(23976062-23976323)
chr4 (433-600)||(4127263-4127430)
chr4 (316-426)||(43928982-43929092)
chr4 (309-514)||(17029334-17029539)
chr4 (307-584)||(52048538-52048804)
chr4 (305-393)||(53854859-53854947)
chr4 (307-444)||(24271552-24271690)
chr4 (314-453)||(4186176-4186315)
chr4 (312-392)||(2499647-2499727)
chr4 (307-530)||(26200208-26200425)
chr4 (343-439)||(53391925-53392021)
chr4 (510-601)||(7381472-7381563)
chr4 (814-925)||(14357014-14357125)
chr4 (469-600)||(31816983-31817114)
chr4 (366-467)||(23091489-23091590)
chr4 (343-584)||(33764898-33765139)
chr4 (501-601)||(35477856-35477956)
chr4 (365-470)||(20306139-20306241)
chr4 (816-925)||(16324399-16324508)
chr4 (853-922)||(18776147-18776216)
chr4 (309-404)||(17506389-17506484)
chr4 (343-430)||(44831035-44831122)
chr4 (526-597)||(53995978-53996049)
chr4 (510-584)||(4414248-4414322)
chr4 (276-352)||(33987164-33987239)
chr4 (322-378)||(34801394-34801450)
chr4 (343-415)||(42838661-42838733)
chr4 (305-368)||(2682707-2682770)
chr4 (508-575)||(5810037-5810104)
chr4 (433-524)||(11828406-11828497)
chr4 (814-875)||(20570932-20570993)
chr4 (311-420)||(45682209-45682318)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (216-600)||(107314-107699)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (216-616)||(25147446-25147846)
chr8 (215-616)||(34308770-34309176)
chr8 (216-601)||(34308329-34308715)
chr8 (305-601)||(8080193-8080488)
chr8 (300-600)||(2044053-2044353)
chr8 (216-597)||(12100602-12100982)
chr8 (216-594)||(27819105-27819481)
chr8 (310-601)||(17103086-17103378)
chr8 (215-601)||(21315960-21316346)
chr8 (308-601)||(10844465-10844758)
chr8 (305-601)||(27925899-27926194)
chr8 (305-616)||(22548830-22549141)
chr8 (305-600)||(22026379-22026675)
chr8 (304-600)||(22548400-22548696)
chr8 (305-617)||(27022173-27022484)
chr8 (231-575)||(25147892-25148236)
chr8 (305-575)||(41658981-41659251)
chr8 (313-601)||(12827104-12827392)
chr8 (227-470)||(25144693-25144937)
chr8 (305-555)||(32292397-32292647)
chr8 (305-600)||(33852109-33852404)
chr8 (383-616)||(31283487-31283719)
chr8 (338-584)||(41913003-41913249)
chr8 (305-465)||(10844883-10845043)
chr8 (345-589)||(15818878-15819121)
chr8 (305-491)||(28453338-28453524)
chr8 (216-415)||(22705090-22705282)
chr8 (305-489)||(6464872-6465056)
chr8 (308-566)||(3745104-3745362)
chr8 (315-426)||(27021904-27022015)
chr8 (316-427)||(28375078-28375189)
chr8 (343-584)||(30527349-30527589)
chr8 (305-491)||(22840490-22840675)
chr8 (457-614)||(32292093-32292250)
chr8 (305-582)||(30334779-30335054)
chr8 (404-603)||(10729722-10729921)
chr8 (305-492)||(15567515-15567702)
chr8 (395-575)||(25307856-25308034)
chr8 (338-492)||(1297040-1297194)
chr8 (334-563)||(3744667-3744896)
chr8 (502-600)||(6463394-6463493)
chr8 (810-925)||(17916746-17916861)
chr8 (216-361)||(9250913-9251057)
chr8 (435-606)||(15567854-15568025)
chr8 (814-912)||(12194020-12194118)
chr8 (814-912)||(12438448-12438546)
chr8 (279-581)||(6466686-6466982)
chr8 (305-408)||(17429501-17429603)
chr8 (401-523)||(10729614-10729736)
chr8 (305-402)||(29971450-29971547)
chr8 (343-408)||(36968438-36968503)
chr8 (216-283)||(31283365-31283432)
chr8 (513-584)||(34688044-34688115)
chr8 (356-420)||(15568036-15568100)
chr8 (305-369)||(25307765-25307829)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (216-601)||(9351973-9352358)
chr6 (249-616)||(7911821-7912189)
chr6 (216-569)||(13492699-13493054)
chr6 (216-470)||(16519879-16520133)
chr6 (305-601)||(17027381-17027677)
chr6 (228-600)||(17730960-17731337)
chr6 (305-600)||(23986168-23986463)
chr6 (231-575)||(7912235-7912580)
chr6 (305-575)||(20850321-20850591)
chr6 (313-596)||(2720419-2720702)
chr6 (216-575)||(13191389-13191749)
chr6 (305-600)||(20126033-20126328)
chr6 (305-600)||(20896538-20896834)
chr6 (269-615)||(9440693-9441037)
chr6 (337-600)||(21312003-21312266)
chr6 (305-613)||(17850918-17851226)
chr6 (283-505)||(9440255-9440477)
chr6 (305-614)||(21311515-21311824)
chr6 (336-576)||(2890714-2890954)
chr6 (305-600)||(2681071-2681362)
chr6 (305-491)||(6330872-6331058)
chr6 (366-615)||(13492393-13492643)
chr6 (313-575)||(14771595-14771857)
chr6 (341-491)||(11062321-11062471)
chr6 (305-484)||(17851374-17851553)
chr6 (313-601)||(23776449-23776736)
chr6 (440-616)||(3652658-3652834)
chr6 (265-393)||(9440486-9440614)
chr6 (305-445)||(27334161-27334301)
chr6 (305-445)||(27394901-27395041)
chr6 (305-453)||(3652486-3652634)
chr6 (339-614)||(1991587-1991862)
chr6 (307-600)||(28065687-28065982)
chr6 (279-420)||(32292859-32293000)
chr6 (336-538)||(33774915-33775119)
chr6 (305-455)||(15929582-15929732)
chr6 (341-575)||(20735731-20735965)
chr6 (305-427)||(31821716-31821838)
chr6 (342-587)||(17205376-17205620)
chr6 (340-477)||(20732613-20732750)
chr6 (404-600)||(28780209-28780405)
chr6 (433-597)||(31415943-31416106)
chr6 (305-570)||(12194330-12194592)
chr6 (305-575)||(28582964-28583234)
chr6 (404-584)||(2891161-2891340)
chr6 (810-929)||(14325284-14325404)
chr6 (810-929)||(14418294-14418414)
chr6 (340-566)||(10964339-10964564)
chr6 (341-444)||(15929235-15929338)
chr6 (836-925)||(10704474-10704563)
chr6 (240-363)||(13490055-13490179)
chr6 (810-925)||(18171945-18172061)
chr6 (810-925)||(24718654-24718770)
chr6 (307-377)||(3652981-3653051)
chr6 (316-390)||(9441061-9441135)
chr6 (334-426)||(30729864-30729956)
chr6 (344-415)||(3885123-3885194)
chr6 (508-615)||(15929342-15929449)
chr6 (851-925)||(24728477-24728552)
chr6 (517-575)||(27334305-27334363)
chr6 (517-575)||(27395045-27395103)
chr6 (532-600)||(21719256-21719324)
chr6 (532-600)||(21727092-21727160)
chr6 (491-582)||(1663993-1664084)
chr6 (814-913)||(16462575-16462674)
chr6 (537-600)||(21312470-21312533)
chr6 (814-903)||(13145257-13145347)
chr6 (817-915)||(24398786-24398884)
chr6 (810-875)||(23006019-23006084)
chr6 (810-875)||(23782282-23782347)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (305-614)||(20054373-20054682)
chr1 (305-614)||(20054829-20055138)
chr1 (305-614)||(20055285-20055594)
chr1 (305-614)||(20055741-20056050)
chr1 (305-614)||(20056197-20056506)
chr1 (305-614)||(20057100-20057409)
chr1 (305-616)||(20057554-20057865)
chr1 (216-600)||(35759459-35759844)
chr1 (305-615)||(50002543-50002853)
chr1 (305-575)||(20845537-20845807)
chr1 (305-602)||(20053929-20054226)
chr1 (305-601)||(43057373-43057669)
chr1 (305-600)||(38340906-38341201)
chr1 (249-600)||(46693586-46693940)
chr1 (341-614)||(20056653-20056926)
chr1 (230-454)||(20061188-20061413)
chr1 (305-601)||(43056915-43057210)
chr1 (218-520)||(35760845-35761148)
chr1 (305-616)||(50002910-50003221)
chr1 (305-600)||(52250206-52250501)
chr1 (305-600)||(16451784-16452079)
chr1 (305-600)||(16460937-16461232)
chr1 (227-570)||(23180652-23180995)
chr1 (305-491)||(30872910-30873096)
chr1 (216-453)||(2328225-2328463)
chr1 (360-600)||(20060191-20060431)
chr1 (315-575)||(51372750-51373010)
chr1 (305-470)||(50002266-50002431)
chr1 (305-483)||(2634924-2635102)
chr1 (305-469)||(31822645-31822809)
chr1 (305-615)||(2634465-2634776)
chr1 (279-583)||(16907209-16907513)
chr1 (341-473)||(12728027-12728160)
chr1 (403-600)||(52250641-52250838)
chr1 (403-600)||(52250978-52251175)
chr1 (305-504)||(12883524-12883723)
chr1 (305-491)||(7548091-7548277)
chr1 (810-922)||(9346872-9346984)
chr1 (814-925)||(18129865-18129976)
chr1 (813-914)||(16870087-16870188)
chr1 (814-915)||(26279914-26280015)
chr1 (814-925)||(18517014-18517126)
chr1 (512-616)||(35759899-35760003)
chr1 (349-420)||(10820636-10820707)
chr1 (459-615)||(7547791-7547947)
chr1 (479-569)||(31823001-31823091)
chr1 (433-491)||(35009956-35010014)
chr1 (42-141)||(27795950-27796048)
chr1 (343-470)||(16410704-16410831)
chr1 (518-603)||(49996528-49996613)
chr1 (395-575)||(7229819-7229999)
chr1 (341-420)||(2739558-2739637)
chr1 (509-615)||(8278154-8278260)
chr1 (517-611)||(39582553-39582647)
chr1 (354-427)||(16440603-16440676)
chr1 (374-427)||(31823108-31823161)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (216-610)||(105630-106025)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (305-601)||(1901-2197)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (305-601)||(18966-19262)
scaffold0322 (234-369)||(18203-18339)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (215-575)||(162553-162915)
scaffold0022 (268-600)||(69666-69998)
scaffold0022 (404-616)||(162969-163181)
scaffold0022 (401-600)||(163167-163366)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (305-600)||(1220-1515)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (251-616)||(245031-245394)
scaffold0005 (249-464)||(245458-245674)
scaffold0005 (432-570)||(245675-245813)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (305-613)||(17974-18280)
scaffold0047 (309-601)||(17448-17740)
[»] scaffold0333 (3 HSPs)
scaffold0333 (305-614)||(4561-4869)
scaffold0333 (305-601)||(5016-5316)
scaffold0333 (514-602)||(5331-5420)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (305-601)||(2742-3038)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (216-420)||(142305-142510)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (313-597)||(154765-155049)
scaffold0002 (514-616)||(154511-154613)
[»] scaffold0557 (1 HSPs)
scaffold0557 (354-600)||(2154-2391)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (395-600)||(13384-13589)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (305-545)||(14741-14981)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (810-925)||(7444-7559)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (309-553)||(26074-26316)
scaffold0036 (309-404)||(16038-16135)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (404-600)||(14553-14749)
[»] scaffold0522 (2 HSPs)
scaffold0522 (810-925)||(4142-4257)
scaffold0522 (810-925)||(11425-11540)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (373-615)||(7009-7251)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (305-430)||(4003-4128)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (305-417)||(23673-23785)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (810-903)||(20188-20281)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (810-925)||(754-870)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (416-600)||(421-605)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (813-925)||(10280-10393)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (450-600)||(1552-1702)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (810-876)||(87025-87091)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (305-408)||(45387-45489)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (365-541)||(44631-44807)
[»] scaffold1126 (1 HSPs)
scaffold1126 (337-386)||(981-1030)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 850; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 850; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 929
Target Start/End: Original strand, 7476902 - 7477815
Alignment:
Q  16 atttttgttgtttaaacattaaaacaattctacttgatcaacaactaaaaattgctaaactacattttcaaaccctcaaccaattctacttgatcgacaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7476902 atttttgttgtttaaacattaaaacaattctacttgatcaacaactaaaaattgctaaactacattttcaaaccctcaaccaattctacttgatcgacaa 7477001  T
Q  116 ctaaaaactccaaccttcaacaaaaattaatgagaggaaatttaacacttattgggtttgagaagaaatttgcaacaaatacaatgtctttggcgttagt 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7477002 ctaaaaactctaaccttcaacaaaaattaattttttgtaatttaacacttattgggtttgagaagaaatttgcaacaaatacaatgtctttggcgttagt 7477101  T
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcgg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7477102 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcgg 7477201  T
Q  316 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7477202 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 7477301  T
Q  416 cttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7477302 cttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttagagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgt 7477401  T
Q  516 gcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7477402 gcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagtcgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 7477501  T
Q  616 ggtaggtccagtcagaccaaaaccnnnnnnnncctttgtatgcgacaagtatgtaagtactttcgatacttgtttcgttctattaggttggtctgagcaa 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7477502 ggtaggtccagtcagaccaaaaccttttttttcctttgtatgcgacaagtatgtaagtactttcgatacttgtttcgttctactaggttggtctgagcaa 7477601  T
Q  716 agtggggggagaggcaacatacttcaagtgtggtggaacacgacaagtagaggcatcattgaacgaagaagcacatgtgtttatgatgtttgctttccat 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7477602 agtggggggagaggcaacatacttcaagtgtggtggaacacgacaagtagaggcatcattgaacgaagaagcacatgtgtttatgatgtttgctttccat 7477701  T
Q  816 tccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcagac 915  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7477702 tccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcagac 7477801  T
Q  916 tctctgatgatgtc 929  Q
    ||||||||||||||    
T  7477802 tctctgatgatgtc 7477815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 760; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 925
Target Start/End: Original strand, 7493592 - 7494502
Alignment:
Q  16 atttttgttgtttaaacattaaaacaattctacttgatcaacaactaaaaattgctaaactacattttcaaaccctcaaccaattctacttgatcgacaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7493592 atttttgttgtttaaacattaaaacaattctacttgatcaacaactaaaaattgctaaactacattttcaaaccctaaaccaattctacttgatcgacaa 7493691  T
Q  116 ctaaaaactccaaccttcaacaaaaattaa-tgagaggaaatttaacacttattgggtttgagaagaaatttgcaacaaatacaatgtctttggcgttag 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7493692 ctaaaaactctaaccttcaacaaaaattaaatgagaggaaatt-aacacttatcgggtttgagaagaaatttgcaacaaatacaatgtctttggcgttag 7493790  T
Q  215 ttgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7493791 ttgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccggcttctggcggcttctaggcaaaacataatcacatcg 7493890  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7493891 gaatgagagagatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatgcatct 7493990  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||||    
T  7493991 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagttgtcttagcatggctgaccttctaggaaatttcccgtaaagcg 7494090  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagc 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7494091 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagtcgtctaggatgttacaagtggtatcagaac 7494190  T
Q  615 aggtaggtccagtcagaccaaaacc-nnnnnnnncctttgtatgcgacaagtatgtaagtactttcgatacttgtttcgttctattaggttggtctgagc 713  Q
    |||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7494191 aggtaggtccagtcagaccaaaacctttttttttcctttgtatgcgacaagtatgtaagtactgtcgatacttgtttcgttctattaggttggtctgagc 7494290  T
Q  714 aaagtggggggagaggcaacatacttcaagtgtggtggaacacgacaagtagaggcatcattgaacgaagaagcacatgtgtttatgatgtttgctttcc 813  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7494291 aaagtggggggagaggcaacatgcttcaagtgtggtggaacacgacaagtagaggcatcattgaacgaagaagcacatgtgtttatgatgtttgctttcc 7494390  T
Q  814 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcag 913  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7494391 attacttctgcaatgatatgaattcataatagcaacgtttaactaactccagcttccaatcttcatactctgatgaacttcagcttctgatgctcttcag 7494490  T
Q  914 actctctgatga 925  Q
    ||||||||||||    
T  7494491 actctctgatga 7494502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 215 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31284513 - 31284152
Alignment:
Q  215 ttgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatc 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  31284513 ttgtaacgcctccgcttagtgggcatgtatcgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 31284414  T
Q  314 ggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatc 413  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31284413 ggaatgagagggatcttgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 31284314  T
Q  414 ttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagc 513  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||  ||  ||||    
T  31284313 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctgccgggaagttttccgacaagc 31284214  T
Q  514 gtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    ||||||||| | ||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31284213 gtgcgagtggggacaaaacacgccgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 31284152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 215 - 601
Target Start/End: Original strand, 25248020 - 25248408
Alignment:
Q  215 ttgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatc 313  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  |||| || ||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||  |||||||||    
T  25248020 ttgtaacgcctccgcttgatgggttagtaacgcccgaggctaatgagggtggggagtggtcaggctcctggcatgcttataggcaaaactgaatcacatc 25248119  T
Q  314 ggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatc 413  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25248120 ggaatgagagggattctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttaaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 25248219  T
Q  414 ttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagc 513  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||||    
T  25248220 ttctttttggtagcccattccataataactccacggttcagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatggatgacctaccgggaagtttcacggtaagc 25248319  T
Q  514 gtgcgagtgagaacaaagcacgttg-aaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  25248320 gtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaaagactcgtgttgatttgtgaggttagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttacaa 25248408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 305 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 25230851 - 25230540
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25230851 aatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 25230752  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||  |||||| ||||    
T  25230751 agatgcattttctttttggtagcccattccataagaactcaacaattaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgccctactgggaagtttc 25230652  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||| ||    
T  25230651 ccggtaagcgtgcgagtgagatcaaaacacgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtctacaatgcataaagtcgtttaggatgttacaaatg 25230552  T
Q  605 gtatcagagcag 616  Q
    ||||||||||||    
T  25230551 gtatcagagcag 25230540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 305 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 25238438 - 25238127
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | | | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25238438 aatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 25238339  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||  |||||| ||||    
T  25238338 agatgcattttctttttggtagcccattccataagaactcaacaattaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgccctactgggaagtttc 25238239  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||| ||    
T  25238238 ccggtaagcgtgcgagtgagatcaaaacacgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtctacaatgcataaagtcgtttaggatgttacaaatg 25238139  T
Q  605 gtatcagagcag 616  Q
    ||||||||||||    
T  25238138 gtatcagagcag 25238127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 25230394 - 25230098
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25230394 aatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaaca 25230295  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    |||| |||     
T  25230294 agatacatcttctttttggtagcccattcaataagaactccacagttatgcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacctatcaggaagtttt 25230195  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||    
T  25230194 ccggtaagcgagcgagtgaggacaaaacacgttggaaagactagtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtttgagatgttacaa 25230098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 25237981 - 25237685
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25237981 aatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaaca 25237882  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    |||| |||     
T  25237881 agatacatcttctttttggtagcccattcaataagaactccacagttatgcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacctatcaggaagtttt 25237782  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||    
T  25237781 ccggtaagcgagcgagtgaggacaaaacacgttggaaagactagtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtttgagatgttacaa 25237685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 305 - 570
Target Start/End: Original strand, 28561746 - 28562010
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28561746 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 28561845  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  28561846 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgg-tgacctacggggaagtttc 28561944  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcg 570  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28561945 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcg 28562010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 305 - 614
Target Start/End: Original strand, 39653164 - 39653473
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||    
T  39653164 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgttggatactacctatatcaaca 39653263  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  39653264 agatgcatcttcttttcggtagctcattccatgagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 39653363  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  39653364 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctaaaagcagtctgggatgttacaaatg 39653463  T
Q  605 gtatcagagc 614  Q
    ||||||||||    
T  39653464 gtatcagagc 39653473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 249 - 600
Target Start/End: Original strand, 8067223 - 8067575
Alignment:
Q  249 cgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatg 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||    
T  8067223 cgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaagcaaaattgaatcacatcggaatgagagggaccctgaggccgtgcaggtatg 8067322  T
Q  348 agactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccac 447  Q
     || ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||     
T  8067323 ggattgcatggttgaaggccggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatctttttttcggtagctcattccataagaactccat 8067422  T
Q  448 atttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactc 547  Q
    | |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  8067423 agttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactc 8067522  T
Q  548 atgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||||||| |||| ||||| ||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  8067523 gtgttggtttgtgaggtcaatcggcaatcctaaaagcagtctgggatgttaca 8067575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Original strand, 30529687 - 30529981
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30529687 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaagtaaggcttataagaattttttggtactacctatatcaaca 30529786  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||| ||||    
T  30529787 agatgcatcttctttttggtagcccattccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacc-tactggaagtttc 30529885  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     | | |||| |||||||||| ||||| |||| | ||||||||  ||||||| ||  |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30529886 ccagtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagacttgtgttggtttgcagggttagtcggcaatgcttaaagttgtctaggatgttaca 30529981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 348 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 13150657 - 13150389
Alignment:
Q  348 agactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccac 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  13150657 agactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccac 13150558  T
Q  448 atttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactc 547  Q
    | |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  13150557 agttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactc 13150458  T
Q  548 atgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 616  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13150457 gtgttgatttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtatcagagcag 13150389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 20885263 - 20884968
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  20885263 aatcacatcgcaatgagagggatcttgaggtcgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttgatactacctatatcaaca 20885164  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||   ||||||||||    
T  20885163 agatgcatcttctttttagtagcacattccataagaactccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtatttggatgggtgacctaccgggaaatttc 20885064  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||  |||||||| ||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  20885063 ccgttaagcgtgcaagttaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtctgcaatgcttaaagtcgtttgggatgttaca 20884968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 313 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 32227359 - 32227072
Alignment:
Q  313 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 412  Q
    |||||||||||||||||||| | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  32227359 cggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaacaagatgcat 32227260  T
Q  413 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 512  Q
    |||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| |||    
T  32227259 cttctttttggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaag 32227160  T
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  32227159 tgtgcgagtgaggaaaaaacacattgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 32227072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 313 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 11180172 - 11179887
Alignment:
Q  313 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 412  Q
    |||||||||||||||||| | | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  11180172 cggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 11180073  T
Q  413 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 512  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||  |||| ||| |||    
T  11180072 cttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggatgtttcccggtaag 11179973  T
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgtta 598  Q
     ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||    
T  11179972 tgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgtta 11179887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Original strand, 16811381 - 16811675
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  16811381 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtttgggactccatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatttcaaca 16811480  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  16811481 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 16811580  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||  |||| |||||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  16811581 ccgataagcatgcgagtgaggacaaa--acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 16811675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 240 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27187542 - 27187202
Alignment:
Q  240 tgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgt 338  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||    
T  27187542 tgtaacgcccgaggctgatgagggcggcaagtggtccggctcctagcaagcttctaggaaaaattgaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgt 27187443  T
Q  339 gcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataa 438  Q
    ||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||   |||||    
T  27187442 gcatgtatgggactgcatggttaaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcactaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataa 27187343  T
Q  439 gaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaac-aaagcacgtt 537  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||  ||||||||||||||| || ||| |||| |    
T  27187342 gaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagcgtgcgagtgaggacaaaaacacgct 27187243  T
Q  538 gaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattct 578  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27187242 gaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaattct 27187202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 600
Target Start/End: Original strand, 50347754 - 50348041
Alignment:
Q  313 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 412  Q
    |||||||||||||||||| | | | || | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  50347754 cggaatgagagggatcctgaggccttgtatgtatgagactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 50347853  T
Q  413 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 512  Q
    |||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   | ||| |||| ||  |||    
T  50347854 cttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgagaagtttcccgataag 50347953  T
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  50347954 tgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 50348041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 305 - 614
Target Start/End: Original strand, 14813949 - 14814258
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |    
T  14813949 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgagactgcatggttaaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaata 14814048  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||  ||||| ||||||   |  |  ||||    
T  14814049 agatgcatcttcttttcggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgtgatgggtgacctaccgaaaggtttc 14814148  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  14814149 ccggtaagcgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggttagtcggcaatactgaaagcagtctgggatgttacaaatg 14814248  T
Q  605 gtatcagagc 614  Q
    |||| |||||    
T  14814249 gtattagagc 14814258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Original strand, 37045035 - 37045327
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | | |||| |||| || |||| ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  37045035 aatcacatctgaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtgtgggactacatgaatgaaggaatgcttataagaattgtttggtaatacctatatcaaca 37045134  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    || | ||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||   |||    
T  37045135 aggtgcatcttctttttggtaccctattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccggga---ttc 37045231  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||  |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  37045232 ccgataagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 37045327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 13150237 - 13149953
Alignment:
Q  313 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 412  Q
    ||||||||||||| |||| | | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| |||    
T  13150237 cggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctgtatcaacaagatgcat 13150138  T
Q  413 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 512  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || | |||| ||||||   ||||| |||||||| |||    
T  13150137 cttcttttcagtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctaccgggaagtttctcggtaag 13150038  T
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgtt 597  Q
     |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||    
T  13150037 tgtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgtt 13149953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 345 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 25238790 - 25238534
Alignment:
Q  345 atgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactc 444  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  25238790 atgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactatctttatcaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactc 25238691  T
Q  445 cacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaaga 544  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||   ||||| ||| | || |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  25238690 cacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggattggtgacctatcgggaagttttttggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaga 25238591  T
Q  545 ctcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    ||| ||||||| |||  |||| |||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  25238590 ctcgtgttggtttgtatggtcggtcggcaatggttaaagtcgtctgggatgttacaa 25238534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 341 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 25802658 - 25802415
Alignment:
Q  341 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 440  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  25802658 aggtatgagactgcatggttaacggaaggctgataagaatggtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcgatagcccattccataaga 25802559  T
Q  441 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 540  Q
    | |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| ||||||| |||| |||||||| ||  |||| |||| ||||    
T  25802558 aatccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtcttaggacgggtgaccttctaggaagtttctcgaaaagagtgcgagtaaggtcaaaacacgctgaa 25802459  T
Q  541 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 584  Q
    |||||   ||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  25802458 aagacgtgtgttggtttgtagggtcagtcaacaatgcttaaagt 25802415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 230 - 467
Target Start/End: Original strand, 41472225 - 41472462
Alignment:
Q  230 ttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatc 328  Q
    |||||||| |||||| || | ||||||| ||||  || |||||||||| ||||||||| |  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41472225 ttggtgggcatgtaacgcccaaggctgaagagggtggtgagtggtccggctcctggcatgcatctaggcaagactgaatcacatcggaatgagagggatc 41472324  T
Q  329 ctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcc 428  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  41472325 ctgaggtcgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaag-cttataagaattgtttggtactacatatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagat 41472423  T
Q  429 caaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttg 467  Q
    ||  |||||||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  41472424 cattccataagaactccacggttaaacgtgcttgacttg 41472462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 305 - 616
Target Start/End: Original strand, 16810925 - 16811236
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | |||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||| |||    
T  16810925 aatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtagatatgggactgcatggttgatggaaggcttataagaattgttgcgtactaactatatctaca 16811024  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  16811025 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacatttaagtgtgcttgacttgtagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 16811124  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     | | ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||| || ||||   ||| ||||||||||| ||    
T  16811125 cccgtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacgctgaaaagattcgtgttggtttgtggggtcggtcggcaatcctgaaagcaatctgggatgttacaaatg 16811224  T
Q  605 gtatcagagcag 616  Q
    |||||| |||||    
T  16811225 gtatcatagcag 16811236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 341 - 600
Target Start/End: Original strand, 32227536 - 32227795
Alignment:
Q  341 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 440  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||    
T  32227536 aggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataaga 32227635  T
Q  441 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 540  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||  ||| ||||||||||| | ||| ||| |||||    
T  32227636 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagtgtgcgagtgaggaaaaaacacattgaa 32227735  T
Q  541 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  32227736 aagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 32227795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Original strand, 14820154 - 14820449
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| |   |||| ||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14820154 aatcacaccgcaatgagagggttcctgagcccgtgtaggtatggggctgcacggctaaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaaca 14820253  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaa-ttt 503  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | | || |||||| ||||| ||| ||||| |||    
T  14820254 agatgcatcttattttcggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggaacaattttgggatgggtgacc-tatcggaaagttt 14820352  T
Q  504 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    | ||| |||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  14820353 cccggtaagcatgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 14820449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 336 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 32386849 - 32386610
Alignment:
Q  336 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaacca 435  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||  |  |||    
T  32386849 cgtgcaggtatgggactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcagtagctaattcca 32386750  T
Q  436 taagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacg 535  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||    || || ||||| || |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  32386749 taagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacccaccggaaagtttcttggtaagcgtccgagtgaggacaaaacacg 32386650  T
Q  536 ttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
     | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32386649 ctaaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 32386610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Original strand, 2911095 - 2911379
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  | | |||||||||||| |||  |||||||||| ||| | |||||| |||| |||| || ||| ||||||||||    
T  2911095 aatcacacctgaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggaccacatggttgaaagaatggttataaaaattgtttgatattacctatatcaaca 2911194  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||           |||    
T  2911195 agatgcatattctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgagtgacc-----------ttc 2911283  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| |||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  2911284 tcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtaggatcaatcgacaatgcttaaagtcgtgtgggatgttaca 2911379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 357 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 4067454 - 4067212
Alignment:
Q  357 ggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagca 456  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||     
T  4067454 ggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcattacataagaactccacagttaagcg 4067355  T
Q  457 tgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctc-ggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 555  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||| || || || |||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||   |||||||    
T  4067354 tgcttgacttggagtagtctttggatggatgacc-taccggaaagttttctggtaagcgtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagaccagtgttggt 4067256  T
Q  556 atgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  4067255 ttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtct-ggatgttaca 4067212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 344 - 492
Target Start/End: Original strand, 29224363 - 29224511
Alignment:
Q  344 tatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaact 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29224363 tatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatactaacaagatgcatcttcttttcggtagcccaaaccataagaact 29224462  T
Q  444 ccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacctt 492  Q
     |||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||||    
T  29224463 tcacaattaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctt 29224511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 305 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 25803150 - 25802960
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  25803150 aatcatatcggaataagagggttcctaatgtcgtgtaggtatgggactgcatggttgaagtaagacttgtaagaattgtttggtactacctataaaaaca 25803051  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatg 495  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25803050 agatgtatcttcttttcggtatcccatttcataagaactccgtagttaagcgtgcttgacttggactagtcttaggatgggtgaccttatg 25802960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 305 - 491
Target Start/End: Original strand, 39640937 - 39641123
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  39640937 aatcacatcagaatgagagagatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagagttgtttggtactacctatatcaata 39641036  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 491  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||| |||| | ||||||    
T  39641037 agatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcagtctttggattggtgacct 39641123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 305 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 25239223 - 25239073
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25239223 aatcacaccggtatgagagggattctgaggtcgtgtaggtatgggactatatggttgaaggaacgcttataagaattttttggtactacctatatcaaca 25239124  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 455  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  25239123 agatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagc 25239073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 216 - 469
Target Start/End: Original strand, 41473907 - 41474161
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||| ||  ||||||||||    
T  41473907 tgtaacgcctccgcttgatgggcatgtaacgcctgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctcggcaagactgaatcacatcg 41474006  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
     ||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||  || |    
T  41474007 aaatgagagggatcttgaggtcgttcaggtatgtgactggatggttaaaggaagacttataagaattgtttgatacttcctatatcaacaagattgatat 41474106  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttgga 469  Q
    |||||| ||| |  ||  | |||| ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  41474107 tctttttggtggatcattctataaaaactccacagtcaagcgtgcttgacttgga 41474161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 371
Target Start/End: Original strand, 12820565 - 12820710
Alignment:
Q  227 cgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagaggg 325  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12820565 cgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctccttgcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagaggg 12820664  T
Q  326 atcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggct 371  Q
    || |||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12820665 attctaaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaagaaaggct 12820710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 373 - 615
Target Start/End: Original strand, 3899868 - 3900110
Alignment:
Q  373 ataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagta 472  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  | | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  3899868 ataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatctttttttcgacaacacaaatcataagaactccacaataaagcatgcttgacttggagca 3899967  T
Q  473 gtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgac 572  Q
     | || | |||| ||||||| ||| || |||| |  |||||||| ||||  | ||||| || | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |    
T  3899968 attttggtatgggtgaccttctggaaagtttcccaaaaagcgtgtgagtatggacaaaacaaggtgaaaagactcgtgttgatctgtggggtcagtcagc 3900067  T
Q  573 aattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 615  Q
    |||||| ||| | || | ||||||||||||| |||||||||||    
T  3900068 aattctgaaaatggtatgggatgttacaagtagtatcagagca 3900110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 32388967 - 32388843
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||    
T  32388967 tgtaacgcctccgcttagtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcg 32388868  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtg 339  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  32388867 gaatgagagggatcctgaggtcgtg 32388843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 305 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 32797081 - 32796938
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |   | || |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32797081 aatcacatcgaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgaaactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 32796982  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccaca 448  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  32796981 agatgcatcttcttttttgtagcacattccataagaactccaca 32796938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 395 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 53150868 - 53150688
Alignment:
Q  395 tatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttat 494  Q
    ||||| |||||||| ||| || |||||||||||| |   |||||||||| |||| |||| | ||||| |||||||| | | || |||||| |||||||||    
T  53150868 tatattaacaagatgcatatttttttcggtagccaatttcataagaacttcacagttaaccgtgcttaacttggagcaattttgggatgggtgaccttat 53150769  T
Q  495 gggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    | ||| |||| |  |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  53150768 gagaagtttcccaaaaagcgggcgagtgaggacaaaacatgttgaaaagactcatgttagtttgtggggtcagtcaacaat 53150688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 810 - 920
Target Start/End: Original strand, 20418351 - 20418461
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 909  Q
    ||||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20418351 ttccatttcttctacaatcatgtgtattcagaataacaacttttaactaactccagcttccaatcttcagaatctgatgaacttcagcttctgaggctct 20418450  T
Q  910 tcagactctct 920  Q
    |||||||||||    
T  20418451 tcagactctct 20418461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 510 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 25239068 - 25238962
Alignment:
Q  510 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatc 609  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| |||||||    
T  25239068 aagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtatgagatgttacaaatggtatc 25238969  T
Q  610 agagcag 616  Q
    |||||||    
T  25238968 agagcag 25238962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 810 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 16794321 - 16794213
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 909  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||| || |||||||||| || ||    
T  16794321 ttccattccttctgcaatcatatgcattcagaataacaacttttaactaacttcagcttccaggcttcagactctgatgagctccagcttctgaggccct 16794222  T
Q  910 tcagactct 918  Q
    ||| |||||    
T  16794221 tcatactct 16794213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 810 - 925
Target Start/End: Original strand, 16882408 - 16882524
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctc 908  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| || || || | |||||||| | ||    
T  16882408 ttccattccttctgcaatcatatccattcagaataacaacttttaacaaactttagcttccagtcttcaaactctgatcaattttaacttctgatggttc 16882507  T
Q  909 ttcagactctctgatga 925  Q
    |||||||||||||||||    
T  16882508 ttcagactctctgatga 16882524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 810 - 905
Target Start/End: Complemental strand, 8729034 - 8728939
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatg 905  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||| ||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8729034 ttccattccttctgcaatcatatgcattcaaaataacaacatttaacaaacttcagtttccagtcttcagactctgatgaacttcagcttctgatg 8728939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 810 - 905
Target Start/End: Complemental strand, 9080921 - 9080826
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatg 905  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||| ||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9080921 ttccattccttctgcaatcatatgcattcaaaataacaacatttaacaaacttcagtttccagtcttcagactctgatgaacttcagcttctgatg 9080826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 31104095 - 31103955
Alignment:
Q  316 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 415  Q
    ||||| ||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||| |||| |||| ||| ||    
T  31104095 aatgatagggatcttaaggttgtacaggtatgagattgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttgatactatctataccaactagatgcatttt 31103996  T
Q  416 cttttcggtagcccaaa--ccataagaactccacatttaag 454  Q
    ||||| |||||| |  |  ||||||||||| ||||||||||    
T  31103995 ctttttggtagctctcattccataagaacttcacatttaag 31103955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 365 - 541
Target Start/End: Original strand, 15377344 - 15377520
Alignment:
Q  365 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 464  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| |  ||||||||| ||| ||   ||||| ||||||||||| ||||   ||||||||    
T  15377344 gaaggcttataagaattgtttggtattactggtaccaacaagatgccacttcttttcagtacccaggaccattagaactccacagttaaatgtgcttgac 15377443  T
Q  465 ttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaa 541  Q
    |||||  | | || |||||| ||||||| |||||| |||  |  |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15377444 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgttgaaa 15377520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 810 - 914
Target Start/End: Complemental strand, 22766569 - 22766470
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 909  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  || ||||||    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  22766569 ttccattccttctgcaatcataagcattcagaataacaac-ttaaactaa----agcttccagtcttcagactttgatgaacttcagcttctgatgatct 22766475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 584
Target Start/End: Original strand, 15405606 - 15405825
Alignment:
Q  365 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 464  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||||||||| |  ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| | ||||   ||||||||    
T  15405606 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15405705  T
Q  465 ttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggt 564  Q
    |||||  | | || |||||| ||||||| |||||| |||  |  |||| |||| |||||| |||||||||| |||||  || | ||||||| |||  |||    
T  15405706 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgctgaaagaacccgtgttggtttgtaaggt 15405805  T
Q  565 cagtcgacaattcttaaagt 584  Q
    ||| ||||||| | ||||||    
T  15405806 caggcgacaatacataaagt 15405825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 584
Target Start/End: Original strand, 15411015 - 15411234
Alignment:
Q  365 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 464  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||||||||| |  ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| | ||||   ||||||||    
T  15411015 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15411114  T
Q  465 ttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggt 564  Q
    |||||  | | || |||||| ||||||| |||||| |||  |  |||| |||| |||||| |||||||||| |||||  || | ||||||| |||  |||    
T  15411115 ttggatcaattttgggatgggtgaccttttgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacaaagcacggtgaaagaacccgtgttggtttgtaaggt 15411214  T
Q  565 cagtcgacaattcttaaagt 584  Q
    ||| ||||||| | ||||||    
T  15411215 cagacgacaatacataaagt 15411234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 26310088 - 26309987
Alignment:
Q  352 tgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacattt 451  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||| ||  |||| ||||||| ||| ||    
T  26310088 tgcatggttgaaggacgatttataagaattttttgttactacatataccaaaaagatgcatcttctttatggtagctcattccattagaactcgacagtt 26309989  T
Q  452 aa 453  Q
    ||    
T  26309988 aa 26309987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 510 - 575
Target Start/End: Original strand, 41473746 - 41473811
Alignment:
Q  510 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41473746 aagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtggggtcagtcgccaat 41473811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 541
Target Start/End: Original strand, 15417431 - 15417607
Alignment:
Q  365 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 464  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||||||||| |  ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| | ||||   ||||||||    
T  15417431 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15417530  T
Q  465 ttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaa 541  Q
    |||||  | | || |||||| ||||||| |||||| |||  |  |||| |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  15417531 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgctgaaa 15417607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 365 - 584
Target Start/End: Original strand, 15392570 - 15392789
Alignment:
Q  365 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 464  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||||||||| |  ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| | ||||   ||||||||    
T  15392570 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccatcagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15392669  T
Q  465 ttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggt 564  Q
    |||||  | | || |||||| ||||||| |||||| |||  |  |||| |||| |||||| ||| |||||| |||||  |||| ||||||| |||  |||    
T  15392670 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacatagcacgctgaaagaactcgtgttggtttgtaaggt 15392769  T
Q  565 cagtcgacaattcttaaagt 584  Q
     || ||||||| | ||||||    
T  15392770 aaggcgacaatacataaagt 15392789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 810 - 905
Target Start/End: Complemental strand, 19197916 - 19197821
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatg 905  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||  |  ||||||||||||   ||| |||| ||| |||||||||||    
T  19197916 ttccattccttctgcaatcatatgcattcagaataacaaaatttagctaactgaatattccagtcttcagcttctgatgatctttagcttctgatg 19197821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 501 - 603
Target Start/End: Original strand, 18318851 - 18318953
Alignment:
Q  501 tttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||| ||| ||| || ||| |||| |  ||||| ||||  |||||||||    
T  18318851 tttctcgcaaagcgtgcgagtgagaacaaaacacgctgaaaagattcgggttggtttgttgggacaatcggcaatccagaaagtcgtctgtgatgttaca 18318950  T
Q  601 agt 603  Q
    |||    
T  18318951 agt 18318953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 584
Target Start/End: Original strand, 15388203 - 15388422
Alignment:
Q  365 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 464  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||   || ||||||||| |  ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| | ||||   ||||||||    
T  15388203 gaaggcttataagaattgtttcgtattaccagtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccatcagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15388302  T
Q  465 ttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggt 564  Q
    |||||  | | || |||||| ||||||| |||||| |||  |  |||| |||| |||||| ||| |||||| |||||  |||| ||||||| |||  |||    
T  15388303 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacatagcacgctgaaagaactcgtgttggtttgtaaggt 15388402  T
Q  565 cagtcgacaattcttaaagt 584  Q
     || ||||||| | ||||||    
T  15388403 aaggcgacaatacataaagt 15388422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 518 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 25231030 - 25230947
Alignment:
Q  518 gagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||  |||| |||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  25231030 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtatggtcggtcggcaatggttaaagtcgtctgggatgttacaa 25230947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 274
Target Start/End: Original strand, 29224233 - 29224268
Alignment:
Q  239 atgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggt 274  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29224233 atgtaacgctcgaggctgatgaggacggggagtggt 29224268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 539 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 26309901 - 26309839
Alignment:
Q  539 aaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  26309901 aaaagactcatgttggtttgtggggttagttaacaataattaaagtcgtctgggatgttacaa 26309839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 864 - 925
Target Start/End: Original strand, 27374950 - 27375012
Alignment:
Q  864 agcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctcttcagactctctgatga 925  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27374950 agcttccaatcttcatactttgatgaactctagcttctgatggttcttcagactctctgatga 27375012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 469
Target Start/End: Original strand, 15381257 - 15381294
Alignment:
Q  432 accataagaactccacatttaagcatgcttgacttgga 469  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15381257 accataagaactccacatttaagtgtgcttgacttgga 15381294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 469
Target Start/End: Original strand, 15396492 - 15396529
Alignment:
Q  432 accataagaactccacatttaagcatgcttgacttgga 469  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15396492 accataagaactccacatttaagtgtgcttgacttgga 15396529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 469
Target Start/End: Original strand, 15410628 - 15410665
Alignment:
Q  432 accataagaactccacatttaagcatgcttgacttgga 469  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15410628 accataagaactccacatttaagtgtgcttgacttgga 15410665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33466945 - 33466904
Alignment:
Q  239 atgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgact 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33466945 atgtaatgcccgaggctgatgagggcggggagtggttcgact 33466904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 45047156 - 45047071
Alignment:
Q  308 cacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactac 393  Q
    ||||||| ||||| || |||||| |  ||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||| |||||||||||    
T  45047156 cacatcgaaatgatagtgatcctcagatcgtgcgagtatgagactgtatgattgaagaaaaacttataagaattatttggtactac 45047071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 216 - 616
Target Start/End: Original strand, 30966144 - 30966545
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||| |||||    
T  30966144 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcgcatcg 30966243  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30966244 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 30966343  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  | | || |||||| ||||||   ||||| |||||||| ||||     
T  30966344 tcttttcggtatctcattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttggaccaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttctcggtaagca 30966443  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagc 614  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| |||||||| || ||||||||||||    
T  30966444 tgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttagaaatggtatcagagc 30966543  T
Q  615 ag 616  Q
    ||    
T  30966544 ag 30966545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 216 - 601
Target Start/End: Original strand, 30966600 - 30966986
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||| |||||    
T  30966600 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcgcatcg 30966699  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||| | | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30966700 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 30966799  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||||||| |||||    
T  30966800 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttaacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttctcggtaagcg 30966899  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  30966900 tgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggagtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 30966986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 216 - 600
Target Start/End: Original strand, 24818236 - 24818620
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||    
T  24818236 tgtaacgcctgcgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaaaactgaatcacatcg 24818335  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||| | | |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24818336 gaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatct 24818435  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||  || |||||    
T  24818436 ttttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaat-tttggatgggtgacctaccgggaagtttcctggtaagcg 24818534  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||    
T  24818535 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagtagtcggggatgttaca 24818620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 215 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 5400054 - 5399667
Alignment:
Q  215 ttgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatc 313  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||   |||||||||    
T  5400054 ttgtaacgcctccgcttggtgagcatgtaatgcctgaggctgatgagggcagggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatc 5399955  T
Q  314 ggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatc 413  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5399954 ggaatgagagggatcttgaggtcgtgcaagtatgggagtgtatggtttaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 5399855  T
Q  414 ttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagc 513  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||    |||| |||  ||| ||||    
T  5399854 ttcttttcggtagctcattccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagaaattttgggatgggtgacctaccaggaagttttccggtaagc 5399755  T
Q  514 gtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  5399754 gtgcgagtgagaacaaaacacgctggaaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttacaa 5399667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 306 - 615
Target Start/End: Original strand, 16378938 - 16379247
Alignment:
Q  306 atcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaa 405  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  16378938 atcacaccggaatgagagggattccgaggccgtgcaagtatgagactgcatggttgaaggaagtcttatacgaattgtttgatactacctatatcaacaa 16379037  T
Q  406 gatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttct 505  Q
    ||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||| ||||     
T  16379038 gatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctatcgggaagtttcc 16379137  T
Q  506 cggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtgg 605  Q
     || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||    
T  16379138 gggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagttgtttggaatgttacaaatgg 16379237  T
Q  606 tatcagagca 615  Q
    ||||||||||    
T  16379238 tatcagagca 16379247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 216 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 29259856 - 29259504
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| || ||  ||||||||||    
T  29259856 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaagactgaatcacatcg 29259757  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||| |   ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29259756 gaatgagagggatcctgagaccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaaggcttattaaaattgtttggtactacatatatcaacaagatgcatct 29259657  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||| || | |||||| |||||||||| ||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||||     
T  29259656 tcttttcggtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagca 29259557  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcag 567  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  29259556 tgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcag 29259504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Original strand, 1912525 - 1912820
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1912525 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggttatgtaggtatgagactacatggttgaaagtagatttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 1912624  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| |||||| | ||||   ||||| ||||    
T  1912625 agatgcatcttctttt-ggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttggagtactctttggatgggttacctaccgggaagtttc 1912723  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  1912724 tcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagagtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttacaa 1912820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Original strand, 16379393 - 16379689
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16379393 aatcaaattggaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatacgaattgtttggtactacctatatcaaca 16379492  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  16379493 agatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtaatctttggatgggtgacctaccgggaagtttc 16379592  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     | | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  16379593 actgtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcattcgacaatgcttaaagttgtctcgaatgttacaa 16379689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 25338143 - 25337847
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  25338143 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 25338044  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  25338043 agatgcatcttcttttcgatagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 25337944  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  ||||  ||||||||||    
T  25337943 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgagatgttacaa 25337847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 309 - 555
Target Start/End: Original strand, 15619902 - 15620148
Alignment:
Q  309 acatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagat 408  Q
    ||||| |||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15619902 acatcagaatgagagggatcccgatgccgtgcaagtatgagactgcatagttgaaggcaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagat 15620001  T
Q  409 acatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcgg 508  Q
    |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||    
T  15620002 acatcttctttttggaaacccaatccataagaactccacaattaagcgtgcttgactttgagtagtctttggatgggtgacctactgggaagtttctcgg 15620101  T
Q  509 aaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 555  Q
     ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  15620102 taagcgtgcgagtgaggacaaaactcgctgaaaagactcgtgttggt 15620148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Original strand, 33174958 - 33175251
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33174958 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 33175057  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||   |||||| |||    
T  33175058 agatgcatcttctttttggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtg-ttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggaaa-ttc 33175155  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| |||| || ||| |||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  33175156 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctggaaagactcgtgttagtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 33175251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 305 - 615
Target Start/End: Original strand, 33174505 - 33174812
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33174505 aatcacatcggaatgagagggatcctgatgccgtgtaggtatgggactaca--gttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 33174602  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |   |||||| |||    
T  33174603 agatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacataccgggaaa-ttc 33174701  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| |||||||||||| || | ||| || | |  |||||| | |||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||| ||| ||    
T  33174702 ccggtaagcgtgcgagttaggaaaaaacatgctagaaagacccgtgtttgtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtatgtgatgttgcaaatg 33174801  T
Q  605 gtatcagagca 615  Q
    |||||||||||    
T  33174802 gtatcagagca 33174812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 314 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 30963857 - 30963554
Alignment:
Q  314 ggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatc 413  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  30963857 ggaatgagagggatcatgaagccgtgcaggtaagagaatgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtatggttctacctatatcaacaagatgcatc 30963758  T
Q  414 ttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagc 513  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| || |||| | ||||||| | |||| ||| ||||||| |    
T  30963757 ttctttctggtagcccaaaccataataactccacagttaagcgtgcttgacttggcggagttttgggataggtgaccttctaggaagtttgtcggaaacc 30963658  T
Q  514 gtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaatt--cttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcag 611  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| || ||  || ||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  30963657 gtgcgagtgaggacaaaacacagtgaaaagactcgttttggtttgtgggatcagtcggcactttcctgaaagaagtcttgggtgttacaagtggtatcag 30963558  T
Q  612 agca 615  Q
    ||||    
T  30963557 agca 30963554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 352 - 600
Target Start/End: Original strand, 15639781 - 15640029
Alignment:
Q  352 tgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacattt 451  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| |||||||||||| ||    
T  15639781 tgcatagttgaaggcacgcttataggaattgtttggtactacctatatcaacaacatacatcttctttttggaaacccaatccacaagaactccacaatt 15639880  T
Q  452 aagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgt 551  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||    
T  15639881 aagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctactgggaagtttctcgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgcagaaaagactcgtgt 15639980  T
Q  552 tggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||||  || |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  15639981 tggttggtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 15640029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 307 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 30963407 - 30963103
Alignment:
Q  307 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaag 406  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||| ||  || ||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  30963407 tcacatcagaatgagagggatcatgaagccgcacatgtatatgaatgcatgattgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaag 30963308  T
Q  407 atacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctc 506  Q
    || |||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||  ||||||| | |||| ||||||    
T  30963307 atgcatcttatttttggtagcccaaatcataagaattcaacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgagtgaccttcttggaagtttctc 30963208  T
Q  507 ggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggt 606  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||||  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  30963207 ggaaagcgtgcgagtgaggataaaatacgttgaaaagactcgtgttggtttgtgaggtcaatcggcaatcatgaaagcagttttggatgttacaagtggt 30963108  T
Q  607 atcag 611  Q
    |||||    
T  30963107 atcag 30963103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 313 - 556
Target Start/End: Original strand, 8256534 - 8256777
Alignment:
Q  313 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 412  Q
    |||||||||||||||| | ||| | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  8256534 cggaatgagagggatcttgaagccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 8256633  T
Q  413 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 512  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| |||  ||  |||    
T  8256634 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctgctgggaagttttccgataag 8256733  T
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggta 556  Q
    |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  8256734 cgtgcgagtgaggacaaaatacgctgaaaagactcatgttggta 8256777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 341 - 600
Target Start/End: Original strand, 33771037 - 33771296
Alignment:
Q  341 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 440  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||    
T  33771037 aggtatgggactgcagggttgaagaaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataaga 33771136  T
Q  441 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 540  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||| |||  ||||    
T  33771137 actccacagttaagcatgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacactgaa 33771236  T
Q  541 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||   ||| ||||||||||    
T  33771237 aagactcgtgttggtttgtggggtcagccggcaattctgaaagcaatctgggatgttaca 33771296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 25434202 - 25433907
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || | ||||||||    
T  25434202 aatcacaccggaatgagagggatcctgaggccgtgctggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatacaacctttatcaaca 25434103  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    ||||| |||     
T  25434102 agatgcatctcctttctggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtggtctttggatgggtgaccaacagggaagtttt 25434003  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
      || ||||||| |||| || ||||| |||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  25434002 ctggtaagcgtgtgagtaaggacaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcatctgggatgttaca 25433907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 305 - 535
Target Start/End: Original strand, 41754289 - 41754519
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  41754289 aatcacaccggaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaaca 41754388  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   || || ||||    
T  41754389 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggatgacctaccggaaagtttc 41754488  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacg 535  Q
     ||| || |||||||||||| ||||| ||||    
T  41754489 ccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacacg 41754519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 227 - 438
Target Start/End: Original strand, 1953078 - 1953288
Alignment:
Q  227 cgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagaggga 326  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||| |||||||| |  ||||||||||| || ||| ||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1953078 cgcttggtgggcatgtagcactcgaggatgatgagggcaaggagtggtccggcttctgacagctttt-ggcaaaaccgaatcacatcggaatgagaggga 1953176  T
Q  327 tcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtag 426  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  1953177 tcctgaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacctataagaattgtttggtactacctatatcaactagatgcatcttctttttggtag 1953276  T
Q  427 cccaaaccataa 438  Q
     |||||||||||    
T  1953277 tccaaaccataa 1953288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Original strand, 1707042 - 1707336
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |    ||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1707042 aatcacatcggaatgagagg-atcctgagactgtgtaggtatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 1707140  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||| |||||| ||||||    |||| ||||    
T  1707141 agatgcatcttctttttggtagcccatctcataagaactccacagttaagagtgtttgacttgaagtagtctttggatgggtgacctaccaggaagtttc 1707240  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||| ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||| ||  |||| | | | |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  1707241 ccggtaagcgtgcgagtgaatacaaaacacgctaaaaagattcgcgttgatttatagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 1707336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 231 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 30962111 - 30961759
Alignment:
Q  231 tggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcct 330  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||   |||  |||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||   ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30962111 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgtcaagggtggggagtggttcagctcctggcagcttctaggaaaaatcgaatcacatcagaatgagagagatcct 30962012  T
Q  331 aaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaagga--------aggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcg 422  Q
     ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||        || ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||    
T  30962011 gaagccgtgtaggtatgggattgcatggttgaaggatttaaggaagtcttataagatttgattggtactacctatatcaacaagatgcatatttttttcg 30961912  T
Q  423 gtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtg 522  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||| | | || |||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  30961911 gtagccgaaaccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttagagcaattttgggatgggtgaccttctgggtagtttctcagaaagcgtgcgagtg 30961812  T
Q  523 agaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    || ||||| |||  ||||||||||  |||| || |||||||||| ||| ||||    
T  30961811 aggacaaaacacagtgaaaagacttgtgttagtttgtggggtcaatcggcaat 30961759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 305 - 467
Target Start/End: Original strand, 29804682 - 29804844
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  29804682 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggcaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 29804781  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttg 467  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29804782 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 29804844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 239 - 564
Target Start/End: Original strand, 82953 - 83276
Alignment:
Q  239 atgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgt 338  Q
    |||||| || ||| ||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||| ||||||||||||||| |  | ||    
T  82953 atgtaacgcccgaagctgacgagggcggagagtggtctggctcctggcagcttctaggcaa--ctgaatcacgtcgaaatgagagggatcctgagattgt 83050  T
Q  339 gcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataa 438  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||| |||||| ||  ||||||    
T  83051 gcaggtatgagactacatggttgaaggtatgcttataagaatcgtttggtactacctataccaacaagatgaatcttttttttggtagctcattccataa 83150  T
Q  439 gaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttg 538  Q
    |||||| ||| |||||| || |||| |||||  | | ||  |||   |||||||  ||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  83151 gaactctacagttaagcgtgtttgatttggaacaattttgtgatatgtgacctttagggtaatttttcagaaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgttg 83250  T
Q  539 aaaagactcatgttggtatgtggggt 564  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||    
T  83251 ataagacttatgttggtttgtggggt 83276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 305 - 491
Target Start/End: Original strand, 11388189 - 11388373
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11388189 aatcacatcggaatgagagg-atcctgatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttaaaa-aattgtttggtactacctatatcaaca 11388286  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 491  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||    
T  11388287 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacct 11388373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 305 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 27883072 - 27882822
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| |    
T  27883072 aatcacaccgaaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgagactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtattatctatatcaata 27882973  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||   |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||| | ||||||  || ||| |||     
T  27882972 agatgcatcttcttttttgtaggccgttccataagaactccacaattaagcgtgtttgacttggagtagtctttggataggtgacctactgagaagtttt 27882873  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 555  Q
    |||| ||| |||| ||| || ||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  27882872 tcggtaagtgtgcaagtcaggacaaaacacgctgaaaagaatcttgttggt 27882822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 305 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 18099024 - 18098874
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18099024 aatcacatcggaatgagaggaatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 18098925  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 455  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| | ||||||    
T  18098924 agatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccatagttaagc 18098874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 305 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 38899058 - 38898872
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | | | |||| |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38899058 aatcacatcggaaggagagtgatcttgaggccgtgtaggtatcagactacatggttgaaggagagcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 38898959  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 491  Q
    |||| ||| ||||||| |||| | ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||    
T  38898958 agatgcattttctttttggtaacacatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttagagtagtctttggataggtgacct 38898872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 336 - 491
Target Start/End: Original strand, 11394566 - 11394719
Alignment:
Q  336 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaacca 435  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |  |||    
T  11394566 cgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttaaaa-aattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtag-ctattcca 11394663  T
Q  436 taagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 491  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||    
T  11394664 taagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacct 11394719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 307 - 453
Target Start/End: Original strand, 20502023 - 20502170
Alignment:
Q  307 tcacatcggaatgagagggatcctaaa--gtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  20502023 tcacaccggaatgagagggatcccaaaaggtcgtgcaagtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactttctatatcaaca 20502122  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 453  Q
    |||| | |||| |||| |||||||||   |||||||||| |||| ||||    
T  20502123 agatgcttctt-tttttggtagcccatttcataagaacttcacaattaa 20502170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 810 - 925
Target Start/End: Original strand, 24157948 - 24158063
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 909  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | |||    
T  24157948 ttccattccttctacaatgatatgcattcagaataacaacttttaactaacttcagcttccagtcttcagactctgatgaactccagcttttgaggttct 24158047  T
Q  910 tcagactctctgatga 925  Q
    ||||| ||||||||||    
T  24158048 tcagattctctgatga 24158063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 341 - 575
Target Start/End: Original strand, 13191010 - 13191244
Alignment:
Q  341 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 440  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||    ||||||    
T  13191010 aggtataagactgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatcttctttttggtagtccattttataaga 13191109  T
Q  441 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 540  Q
    |||||| | ||| |  ||||||||||| || | | ||  ||| | ||||||| ||| || ||||||  |||||||| || || | ||||| |||| | ||    
T  13191110 actccatagttatgtgtgcttgacttgaagaaattttgagataggtgaccttctggaaagtttctcaaaaagcgtgtgaatgcggacaaaacacgctaaa 13191209  T
Q  541 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    ||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  13191210 aagactagtgttggtttatggagtcagtcgacaat 13191244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 305 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18448064 - 18447954
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18448064 aatcacatcggaatgatagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaagtaagacttataagaattgtttggtactacttgtatcaaca 18447965  T
Q  405 agatacatctt 415  Q
    |||| ||||||    
T  18447964 agatgcatctt 18447954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 437 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 32377921 - 32377757
Alignment:
Q  437 aagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgt 536  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||| | | || |||||| ||| ||  |||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||     
T  32377921 aagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatgggtgatctactgggaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgc 32377822  T
Q  537 tgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  32377821 tgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 32377757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 411 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 32377756 - 32377592
Alignment:
Q  411 atcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaa 510  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || |||| | ||||||   || || |||  ||| |    
T  32377756 atcttgttttcggtagctcattccaaaagaactccacagttaagcatgcttgacttggagcaattttgggataggtgacctaccggaaagttttccggta 32377657  T
Q  511 agcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32377656 agcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaaactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 32377592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 810 - 916
Target Start/End: Original strand, 22383587 - 22383693
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 909  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||||| |||    
T  22383587 ttccattccttctacaatgatatgtcttcagaataacaacttttaactaactctagcttgcagccttcagactctgttgacctttagcttctgatgatct 22383686  T
Q  910 tcagact 916  Q
    |||||||    
T  22383687 tcagact 22383693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 315 - 575
Target Start/End: Original strand, 8073902 - 8074162
Alignment:
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||| | |  | ||||||||||| | ||  | ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8073902 gaatgagagggatcatgagattgtgcaggtatgggtctataaggttgaagggagacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatct 8074001  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    |||||   ||||||||   ||||||||||||| |  ||||| | ||||||||||   | | || |||||  |||||||   | || ||||||| |||| |    
T  8074002 tctttcttgtagcccatttcataagaactccatagataagccttcttgacttggttaaattttgggatgagtgaccttccagaaagtttctcgaaaagtg 8074101  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    || || |||||||||| |||| |||||| |||  |||| || |||||| ||||||||||||    
T  8074102 tgtgattgagaacaaaacacgatgaaaaaacttgtgtttgtttgtgggatcagtcgacaat 8074162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 810 - 884
Target Start/End: Original strand, 21846263 - 21846337
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactct 884  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  21846263 ttccattccttctgcaatgatatgcattcagaataacaacttttaactaacttcagcttccagtcttcagactct 21846337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 9909102 - 9909230
Alignment:
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||  |||||||||||| || ||||||  |||  |||||||||| |||| ||||||||| || ||    
T  9909102 gaatgagagggatcctgaaatcgtataagtatgagactatatggttgaaggagggtttataatgattaattggtactacctataccaacaagattcaact 9909201  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaact 443  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  9909202 tctttttggtagcccaacacataagaact 9909230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 513 - 599
Target Start/End: Original strand, 20502172 - 20502258
Alignment:
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttac 599  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20502172 cgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttagtttgtagggtcagtcggcaatttttaaagttgtctgggatgttac 20502258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 408
Target Start/End: Original strand, 16541985 - 16542088
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| | ||  ||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  16541985 aatcacatcagaatgatagggatcccagagctgtgtaggtatgactctacatggttgaaggaagacttataataattgttttgtactacctatatcaaca 16542084  T
Q  405 agat 408  Q
    ||||    
T  16542085 agat 16542088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 36924519 - 36924453
Alignment:
Q  356 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactact--tatatcaacaagatacatcttctttt 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  36924519 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtattacttatatatcaacaagatgcatcttctttt 36924453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 584
Target Start/End: Original strand, 11389688 - 11389762
Alignment:
Q  510 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 584  Q
    |||| |||||||||||| ||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  11389688 aagcatgcgagtgagaataaaacatgctgaaaaaactcatgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagt 11389762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 584
Target Start/End: Original strand, 11406349 - 11406423
Alignment:
Q  510 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 584  Q
    |||| |||||||||||| ||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  11406349 aagcatgcgagtgagaataaaacatgctgaaaaaactcatgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagt 11406423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8181446 - 8181394
Alignment:
Q  356 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagat 408  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8181446 tggttgaaggaagacttttaagaattgtttggtactacctatatcaacaagat 8181394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 135
Target Start/End: Original strand, 35494341 - 35494434
Alignment:
Q  41 aattctacttgatcaacaact-aaaaattgctaaactacattttcaaaccctcaaccaattctacttgatcgacaactaaaaactccaaccttcaa 135  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||  || | || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35494341 aattctacttgatcaacaactaaaaaattcataaactaca--ttcaaaccctatacaatttatacttaatcaacaactaaaaactctaaccttcaa 35494434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 532 - 601
Target Start/End: Original strand, 29804874 - 29804943
Alignment:
Q  532 cacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  29804874 cacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacaa 29804943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 8181346 - 8181212
Alignment:
Q  466 tggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtc 565  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||  |||||| |||  ||  || ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||   ||||    
T  8181346 tggagtagtcgttggatgggtgacctactgggaagttttccgataaacgtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttg-caggtc 8181248  T
Q  566 agtcgacaattctt-aaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  8181247 agtcgacaatgcttaaaagtcgtctgggatgttaca 8181212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 27190677 - 27190628
Alignment:
Q  371 ttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 420  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27190677 ttataagaatttattgatactacatatgtcaacaaaatacatcttctttt 27190628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 27840491 - 27840442
Alignment:
Q  371 ttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 420  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27840491 ttataagaatttattgatactacatatgtcaacaaaatacatcttctttt 27840442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-99; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 216 - 611
Target Start/End: Original strand, 42515002 - 42515398
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||    
T  42515002 tgtaacgtctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggagagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcg 42515101  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  42515102 gaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattt 42515201  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    |||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    |||| ||| |||| |||||    
T  42515202 tctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacataccaggaactttttcggtaagcg 42515301  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcag 611  Q
    |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||| |||||||||    
T  42515302 tgcgggtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgtgatgttacaaatggtatcag 42515398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 214 - 604
Target Start/End: Original strand, 9124867 - 9125258
Alignment:
Q  214 gttgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  9124867 gttgtaacgccttcgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacat 9124966  T
Q  313 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 412  Q
    ||||||||||| |||| | | | |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  9124967 cggaatgagagagatcttgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 9125066  T
Q  413 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 512  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||  ||| |||    
T  9125067 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactcggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttttccggtaag 9125166  T
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
    |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| || |||||||||||    
T  9125167 cgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggggtgttacaagtg 9125258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 216 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 13125372 - 13124968
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||    
T  13125372 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggcggatgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatatcg 13125273  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||| | | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  13125272 gaatgagagggatcttgaggccctgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatct 13125173  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| | | |||||    
T  13125172 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccagtaagcg 13125073  T
Q  515 tgcgagtgagaac-aaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtct--aggatgttacaagtggtatcag 611  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  ||||   || |||||||| |||||||||    
T  13125072 tgcgagtgaggacaaaaacacgctgaaaggactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggggggtgttacaaatggtatcag 13124973  T
Q  612 agcag 616  Q
    |||||    
T  13124972 agcag 13124968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 34405737 - 34405442
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  34405737 aatcacaccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 34405638  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  34405637 ggatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 34405538  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34405537 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagttgtctaggatgttaca 34405442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 251 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2941958 - 2941633
Alignment:
Q  251 aggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgag 349  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| |||| | || | |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | | ||| |||||||| |    
T  2941958 aggctgatgagggcgaggagtggcccggctcccgccatgcttctaggcaaaactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatggg 2941859  T
Q  350 actgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacat 449  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||     
T  2941858 actgcatggttgaaggaaggctgataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacag 2941759  T
Q  450 ttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcat 549  Q
    |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |    
T  2941758 ttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggagaaaacacgctgaaaagactcgt 2941659  T
Q  550 gttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  2941658 gttggtttgtgcggtcagtcggcaat 2941633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 313 - 616
Target Start/End: Original strand, 36422260 - 36422562
Alignment:
Q  313 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 412  Q
    |||||||||||||||||||| | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  36422260 cggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 36422359  T
Q  413 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 512  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| |||    
T  36422360 cttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaat-ttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaag 36422458  T
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcaga 612  Q
     ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36422459 tgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtatcaga 36422558  T
Q  613 gcag 616  Q
    ||||    
T  36422559 gcag 36422562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 215 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 5406824 - 5406478
Alignment:
Q  215 ttgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  5406824 ttgtaacgcctccgcttcgtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggtggagagtggtccggctcatgacagcttctaagcaaaactgaatcacatcg 5406725  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  5406724 gaatgatagggatcctaaagtcgtgccggtatgggactgcatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtattacctatatcaacaagatgcatct 5406625  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcg-gaaagc 513  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | | || |||||| |||| || ||| || |||  ||  ||| |    
T  5406624 tatttttggttgcccaaaccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatggatgactttctggaaagttttccgaaaaaac 5406525  T
Q  514 gtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtg 560  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||| |||| ||||||| ||||    
T  5406524 gtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaacactcgtgttggtctgtg 5406478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 305 - 575
Target Start/End: Original strand, 28495854 - 28496124
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  28495854 aatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaactgttgggtactacctatatcaaca 28495953  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| ||||    
T  28495954 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctattgggaagtttc 28496053  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28496054 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 28496124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 305 - 575
Target Start/End: Original strand, 42515544 - 42515814
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  42515544 aatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgtttggtactacctatatcaaca 42515643  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||    ||||||||     
T  42515644 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctacatggaaatttt 42515743  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42515744 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 42515814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Original strand, 679817 - 680111
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  679817 aatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggagtacatggctgaaggaaggcttataagaattgtt-ggtactacctatatcaaca 679915  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  679916 agatgcatattctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctgccgggaagtttc 680015  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaac-aaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||| || | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  680016 gcggtaaacatgcgagtgagaacaaaaacacgctgaaaagactcatgttggtttgt-aggtcagtctacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 680111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 35474267 - 35473971
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  35474267 aatcacaccggaatgagagggatccttaggtcgtgtaggtatgagactacatggttgaagaaagacttataagaattgtttagtactacttatatcaaca 35474168  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| |   ||||| ||||    
T  35474167 agatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgacgtaccgggaattttc 35474068  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  35474067 tcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaatgacttgtgttggtttgtagggttagagggcaatgtttaaagtcgtctaggatgttacaa 35473971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 216 - 601
Target Start/End: Original strand, 18833196 - 18833582
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  18833196 tgtaacgcccccgcttggtgggcatgtaacgctcagggctgatgagggcggggagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 18833295  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    ||||||||||| |||| | | ||| ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18833296 gaatgagagggttcctgaggccgtacaggtatggaactgcatggttgagggaaagcttatatgaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatct 18833395  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    |||||||||||||  |   ||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| || ||    
T  18833396 tcttttcggtagctaattacataagaactccacagttaagcgtgtttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaaacg 18833495  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||| | ||||| |||| || ||||  |||| || ||||||||    
T  18833496 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtgggataagtcggcaatcctgaaagcagtctggggtgttacaa 18833582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 216 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 11517624 - 11517386
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  11517624 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggttgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 11517525  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11517524 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggt-gaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 11517426  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaag 454  Q
     |||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||    
T  11517425 acttttcggtagctcattccataagaactccgcagttaag 11517386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 336 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 26421875 - 26421598
Alignment:
Q  336 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaacca 435  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||    
T  26421875 cgtgcatgtatgagactgcatggttgaagtaaggctcataagaattgttaggtactccctataccaacaagatgaatcttcttttcggtagcccattcca 26421776  T
Q  436 taagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacg 535  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| ||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| ||||| | || ||||||| |||||| | |    
T  26421775 taagaactacacagttaagcgtgtttggcttcgagtagtctttggattggtgaccttatgggaagtttcttggaaaacatgtgagtgaggacaaagaatg 26421676  T
Q  536 ttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagag 613  Q
      ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26421675 ccgaaaatactcgtgttggtatgtagggtcagtcgtcattgcttaaagttgtctgggatgttacaagtggtatcagag 26421598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 6719220 - 6718926
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6719220 aatcacattggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 6719121  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | || |||||| |||| |   ||||| ||||    
T  6719120 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccagagttaagcgtgcttgacttggagtaat-ttgggatgggtgacatatcgggaactttc 6719022  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  6719021 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagaatcgtgttggtttgtggggtcagtcagcaatcctaaaagtcgtctgggatgttaca 6718926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Original strand, 2193256 - 2193552
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2193256 aatcacaccggaatgagagggttcctgagaccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 2193355  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||   |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  2193356 agatgcatcttctattcggtagctcatttcataggaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 2193455  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| || ||||  ||||  ||||||||||    
T  2193456 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgagatgttacaa 2193552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 29039166 - 29038870
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | | |||| || |||| |||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29039166 aatcacatcggaatgagaggcatcctgaggccgtgtagatatgtgactacatggttgaatggaggcttacaagaattgtttggtactacctatatcaaca 29039067  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    | || ||||||||||| | ||  |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   || || ||||    
T  29039066 acatgcatcttctttttgataatccattccataagaactctacatttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctaccggtaagtttc 29038967  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||| ||||||| || |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  29038966 ccggtaagcgtgtgactgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttacaa 29038870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 315 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 29357592 - 29357341
Alignment:
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  29357592 gaatgagaggtatcccgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactaactatatcaacaagatgcatct 29357493  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    |||||||| ||||||    |||||||||| |||| |||| | || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  || || || |||| ||||||    
T  29357492 tcttttcgatagcccgtttcataagaactacacagttaaccgtgtttgacttagagtagtcttaagatggatgaccttccggtaagttcctcgaaaagcg 29357393  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtca 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  29357392 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagggtca 29357341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 264 - 571
Target Start/End: Original strand, 25182320 - 25182627
Alignment:
Q  264 cggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaa 363  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||| |    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25182320 cggggagtggtcaggctcctagcagcttctaggcaaagacgagtcacatcggaatgagagagatcctgagactgtgcaagtatgagactgcatggttgaa 25182419  T
Q  364 ggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttga 463  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||| |||| |||||  || ||||    
T  25182420 ggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttattttcggtaactcattccataagaacttcacagttaagtgtgtttga 25182519  T
Q  464 cttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtgggg 563  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||| | |||| |||| | ||||  |||||||    
T  25182520 cttggagtagtctttggatggaggaccttctgggaagtttctcaaaaagcgttcgagtgagggcaaaacacgctaaaaaaactcgtattgggttgtgggg 25182619  T
Q  564 tcagtcga 571  Q
    ||| ||||    
T  25182620 tcaatcga 25182627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 305 - 614
Target Start/End: Original strand, 2189144 - 2189453
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | |  |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  2189144 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggctgtgcaggtgtgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggcactacctatatcaaca 2189243  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||  ||||||   ||||| ||||    
T  2189244 agatgcatcttcttttcgatagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgagtgacctaccgggaagtttc 2189343  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||| || ||||  |||| ||||||||| | ||    
T  2189344 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgagaagactcgtgttgatttgtggggacagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttactaatg 2189443  T
Q  605 gtatcagagc 614  Q
    ||||||||||    
T  2189444 gtatcagagc 2189453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 341 - 600
Target Start/End: Original strand, 2465960 - 2466218
Alignment:
Q  341 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 440  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  2465960 aggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagttgcatcttcttttcggtagctcattccataaga 2466059  T
Q  441 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 540  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| | | |  |||||| ||||||   |||||||||| ||| |||| ||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  2466060 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttcgggatgggtgacctaccgggaaatttcccggtaagcatgcaagtgaggacaaaacacgctgaa 2466159  T
Q  541 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||||||| |||| || |||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  2466160 aagactcgtgttagtttgt-aggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 2466218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 305 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 22529381 - 22529102
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | ||| || | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||    
T  22529381 aatcatatccgaatgagagggatcctgaggtcatgtaagtatgggcctacatggttgaaggaaggcttataagaaatgtttggtactatctatataaaca 22529282  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||| ||| | ||   || ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||| ||||    
T  22529281 agatgcatcttcttttcagtaactcattacaaaagaacttcacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgacctactgagaagtttc 22529182  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 584  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22529181 tcggtaagcgtgtgagtgaggacaaaatacgctgaaaagactcatgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagt 22529102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 305 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 2611798 - 2611526
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||    
T  2611798 aatcacatcggaatgagaggggtcctgaggtcatgtaggtatgagactatatggtggaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctataacaaca 2611699  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||   ||| || |      
T  2611698 agatgcatcttctttttggtagcccattctataagaactccatagttaagcgtgctttacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggtaact-- 2611601  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 584  Q
         ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2611600 -----aagcgtgcgagtgaggacaaaacactctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagt 2611526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 6747744 - 6747457
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6747744 aatcacattggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgatactacatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaaca 6747645  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||| |||||| ||||||   ||||| |||     
T  6747644 agatgcatcttctttttggtagcctattccataaaaactccacagttaagcgtgcttgacttatcgtagtctttggatgggtgacctatcgggaagttt- 6747546  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
           || |||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  6747545 -------gcttgcgagtgaggacaaaacaagttgaaaagacttgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagcagtctgggatgttaca 6747457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 305 - 491
Target Start/End: Original strand, 46425741 - 46425927
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   | || ||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  46425741 aatcacatcggaatgagagggatcctgagaccatgtaggtatgggactacatggttgaaataaggcttataagaattgtttggtattacctatatcaaca 46425840  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 491  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  46425841 agatgcatcttcttttcggtatcttattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacct 46425927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 28495754 - 28495470
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||  ||| ||||||||||    
T  28495754 aatcccatcggaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgttgagttttacctatatcaaca 28495655  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||           | |    
T  28495654 agatgcatcttcttttaggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc-----------tac 28495566  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
      |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  ||||  |||||||||    
T  28495565 cgggaaagcgtgcgagtgaggacaaaacccgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcgatgttaca 28495470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 349 - 524
Target Start/End: Original strand, 2465777 - 2465952
Alignment:
Q  349 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccaca 448  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  2465777 gactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 2465876  T
Q  449 tttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgag 524  Q
     |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   |||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  2465877 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaatttcccggtaagcatgcgagtgag 2465952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 7646528 - 7646329
Alignment:
Q  401 aacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaa 500  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   |||||     
T  7646528 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaag 7646429  T
Q  501 tttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  7646428 tttctcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 7646329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 305 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 35527267 - 35527081
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||  |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  35527267 aatcacaccgaaatgagagggatcccgaggtcgtgcaaatatgggactggttggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaaca 35527168  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 491  Q
    |||| ||| |||||||| |||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  35527167 agatgcatattcttttcagtagtccattccataggaactccacagttaagcatgcttgacttggagtagtctttgcatgggtgacct 35527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 230 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13124923 - 13124759
Alignment:
Q  230 ttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatc 328  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  13124923 ttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatattggaatgagagggatc 13124824  T
Q  329 ctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactac 393  Q
     | | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13124823 ttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtgtggtactac 13124759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 404 - 615
Target Start/End: Original strand, 7646514 - 7646725
Alignment:
Q  404 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 503  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||| |  ||||| ||    
T  7646514 aagatgcatcttgttttcggtaactcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacct-accggaaagtt 7646612  T
Q  504 ctcgga-aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaag 602  Q
     || || ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||     
T  7646613 ttccgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggttagtcgacaatcctaaaagtcgtctgggatgttacaaa 7646712  T
Q  603 tggtatcagagca 615  Q
    |||||||||||||    
T  7646713 tggtatcagagca 7646725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 555
Target Start/End: Original strand, 9623208 - 9623457
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  | || ||||| | |||||||| |||||| ||||||   |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  9623208 aatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtttgataccacctatatcaaca 9623307  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||  | |||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| |||||| |||| || || ||| |||     
T  9623308 agatgcatcttc-tttcggtagttcattctataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggactagtctttggatgggtgacgttctgagaagtttt 9623406  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 555  Q
      | ||||| | |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9623407 ctgaaaagccttcgagtgaggacaaagcacgctgtaaagactcatgttggt 9623457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 246 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 31406790 - 31406495
Alignment:
Q  246 gctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacat--aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcagg 343  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||| || |||||  ||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||     
T  31406790 gctcgaggctgatgagggcggggagtggttcagctcttggaagcttctaaacaaaa-atcgaatcacatcaaaatgagagggatcctgaagccgtgcaga 31406692  T
Q  344 tatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaact 443  Q
    | || ||||| ||||||||| || | ||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  31406691 tctgggactgaatggttgaaagatgacttattagaattgtttggtgttacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccgtttcataagaact 31406592  T
Q  444 ccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaag 543  Q
    ||||| |||||| ||||    ||||||||||||| |||||| || |||| |  ||  |||||  ||||||||| ||||||| ||||| || | |||||||    
T  31406591 ccacagttaagcgtgct----ttggagtagtctttggatgggtggccttct-agacgtttcttagaaagcgtgtgagtgaggacaaaacatgctgaaaag 31406497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 810 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 9064215 - 9064100
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 909  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||| |||||||| | |||||    
T  9064215 ttccattccttctacaatgatatgaattcagaataacaacttttaactaactccagctttcagtcttcagactatgatgaactccagcttctaaggctct 9064116  T
Q  910 tcagactctctgatga 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  9064115 tcagactctctgatga 9064100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 389 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13122567 - 13122380
Alignment:
Q  389 actacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctga 488  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | | || |||||| |||    
T  13122567 actacatatattaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattttgggatgggtga 13122468  T
Q  489 ccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaac-aaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    |||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  13122467 cctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcggcaat 13122380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 31743970 - 31743834
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||| | || ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||    
T  31743970 aatcatatcgaaatgagatggatcttgaaatcgtgcaagcatgagactgcatggttgaaggaatgcttataagaatggtttggtgctatctatatcaaca 31743871  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaa 441  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31743870 agatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaa 31743834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 36015557 - 36015409
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36015557 aatcacaccggaatgagagggatcccaaggcagtgcaagtatgagactccatggttgaaggaaagcttaaaagaattgtttggtactacatatatcaaca 36015458  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 453  Q
    |||| | |||||||||   |||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  36015457 agatgcctcttcttttaaatagcccattccataagaacttcacagttaa 36015409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 334 - 474
Target Start/End: Original strand, 33316757 - 33316892
Alignment:
Q  334 gtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaac 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||    
T  33316757 gtcgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaaaaattataagaattgtttgacaatacttatatcaacaagat-----gtcttttcggtagcccaaac 33316851  T
Q  434 cataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagt 474  Q
     |||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||    
T  33316852 tataagaactccacaattaaacgtgtttgacttgaagtagt 33316892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 307 - 466
Target Start/End: Original strand, 11372453 - 11372612
Alignment:
Q  307 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaag 406  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| || | | || |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| |    
T  11372453 tcacattggaacgagagggttcccaaggccatgtaggtatgaaattgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctgtaccaacatg 11372552  T
Q  407 atacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgactt 466  Q
    || ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||    
T  11372553 atgcatgttatttttggtagctcaaaccataagaactccaaagttaagcacgtttgactt 11372612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 305 - 426
Target Start/End: Original strand, 43233413 - 43233534
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| || ||||||||||||| | | | |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  43233413 aatcacaccgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgtgactgtatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactatctatatcaaca 43233512  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtag 426  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  43233513 agatgcatctttttttcggtag 43233534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 810 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 16307768 - 16307653
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 909  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| | |||    
T  16307768 ttccattccttctataatgatatacattcagaataacaacttttaactaactccagcttccagttttcagactctgatgaactccagcttctgaggttct 16307669  T
Q  910 tcagactctctgatga 925  Q
    | ||||||| ||||||    
T  16307668 ttagactctatgatga 16307653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 308 - 446
Target Start/End: Original strand, 1628719 - 1628854
Alignment:
Q  308 cacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaaga 407  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||   |||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  1628719 cacattggaatgagagggatgttgaagccgtgcagatatgggattgcatggttgaagaaaggcttat---aattgtttggtactatcgatatcaacaaga 1628815  T
Q  408 tacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactcca 446  Q
    | |||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  1628816 tgcatcttcttttttgaagcccataccataagaactcca 1628854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 305 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 26957703 - 26957603
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |  ||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26957703 aatcacatcggaatgagagggatcttgaggctgtgtaggtatggaactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 26957604  T
Q  405 a 405  Q
    |    
T  26957603 a 26957603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 434 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 3305365 - 3305198
Alignment:
Q  434 cataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagca 533  Q
    ||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||   || || ||||  || ||| ||||||||||||||||| ||    
T  3305365 cataaaaacttcacagttaagcgtgcttgatttggagtagtctttggatgggtgacctaccggaaagtttcctggtaagagtgcgagtgagaacaaaaca 3305266  T
Q  534 cgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    || ||||||||||| ||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  3305265 cgctgaaaagactcgtgttgatttgtaggatcagtcagcaatacttaaagtcgtctggaatgttacaa 3305198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 26421401 - 26421282
Alignment:
Q  355 atggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaag 454  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||     
T  26421401 atggttgaaggaagacttataagaattgcttgatactacctatatcaacaagatgcatatttttttcggtagtccattccataagaactccacagttaaa 26421302  T
Q  455 catgcttgacttggagtagt 474  Q
    | || |||| ||||| ||||    
T  26421301 cgtgtttgaattggattagt 26421282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 467
Target Start/End: Original strand, 20966087 - 20966213
Alignment:
Q  341 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 440  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||  || || ||||||||||| ||  ||||||||    
T  20966087 aggtatgagactgcatgattgaaggatgacttataagaattattttgtaatacctataccaacaagatgtatattattttcggtagctcattccataaga 20966186  T
Q  441 actccacatttaagcatgcttgacttg 467  Q
    ||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  20966187 acttcacagttaaacatgcatgacttg 20966213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 307 - 466
Target Start/End: Original strand, 11372901 - 11373060
Alignment:
Q  307 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaag 406  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| | | || |||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| |||  || ||  |||| |||||||    
T  11372901 tcacatcaaaatgagagggttcctaaggccatgtaggtatgagattgcatggttgaatgaagacttgtaagaattgtttcatagtatctataccaacaag 11373000  T
Q  407 atacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgactt 466  Q
    ||   |||||||||  |||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  11373001 atgagtcttctttttcgtagcctaaaccataagaactacacaattaagtgtgcttgactt 11373060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 479 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26419207 - 26419111
Alignment:
Q  479 ggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    |||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| | || ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26419207 ggatgggtgaccttctgagaattttctcgaaaatcatgtgagtgaggacaaaacatgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaat 26419111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 510 - 614
Target Start/End: Original strand, 43233162 - 43233266
Alignment:
Q  510 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatc 609  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |  | ||||| ||||| |||||||    
T  43233162 aagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagattgggatgctacaaatggtatc 43233261  T
Q  610 agagc 614  Q
    |||||    
T  43233262 agagc 43233266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 426
Target Start/End: Original strand, 6585638 - 6585731
Alignment:
Q  335 tcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaac--aagatacatcttcttttcggtag 426  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  6585638 tcgtgcagatatgagattgcatgattgaaagaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaagatacatcttccttttggtag 6585731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 6748027 - 6747938
Alignment:
Q  500 atttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtct 589  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  6748027 atttttcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtct 6747938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 443
Target Start/End: Original strand, 16192368 - 16192457
Alignment:
Q  354 catggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaact 443  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||    
T  16192368 catgattgaatgaaggattataagaattgtttggtattacctacatcaacaagatgcatcttcgttttggtagcccattccataagaact 16192457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 31743827 - 31743739
Alignment:
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  31743827 cgtgcgagtgaggtcaacgcacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggttagtcgacaatgcttaaagtcgtttgggatgttacaa 31743739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 496 - 600
Target Start/End: Original strand, 36422573 - 36422677
Alignment:
Q  496 ggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatg 595  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||||    
T  36422573 ggaagtttcccggcaagtgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatgctaaaagtaatctgggatg 36422672  T
Q  596 ttaca 600  Q
    |||||    
T  36422673 ttaca 36422677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 420
Target Start/End: Original strand, 37672191 - 37672275
Alignment:
Q  336 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 420  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  |||| |||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  37672191 cgtgcaggtataagactgcatggttgcaaaaaggtttataataattgtttggtactacttgtaccaacaagatgcaacttctttt 37672275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 419 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 43776322 - 43776178
Alignment:
Q  419 ttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcg 518  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || | |||| ||||||   ||||| |||  | | |||||||||    
T  43776322 ttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctgcggggaagttttccagtaagcgtgcg 43776223  T
Q  519 agtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtgggg 563  Q
    | |||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  43776222 aatgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggg 43776178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16811961 - 16811905
Alignment:
Q  336 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtacta 392  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  16811961 cgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattgttttgtacta 16811905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 402
Target Start/End: Original strand, 2490071 - 2490136
Alignment:
Q  337 gtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaa 402  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||||||    
T  2490071 gtgcacgtatgtgactgcatgattgaaggaatgcttataagaagtgtttgttactacctatatcaa 2490136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 33316897 - 33316971
Alignment:
Q  501 tttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    ||||||  ||| ||||||||| |  |||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  33316897 tttctcaaaaaacgtgcgagtaatgacaaaatacgttgaaaagacccatgttggtttgtgaggtcagtcgacaat 33316971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-99; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 214 - 616
Target Start/End: Original strand, 22556444 - 22556848
Alignment:
Q  214 gttgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacat 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  22556444 gttgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctaatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacat 22556543  T
Q  313 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 412  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22556544 cggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 22556643  T
Q  413 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 512  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||| |||| |||||| ||  |||||||||| | | || |||||| ||||||    |||| |||||||| |||    
T  22556644 cttcttttcggtagctcattctttaagaacttcacagttaagcgtggctgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccaggaagtttctcggtaag 22556743  T
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttg-aaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcag 611  Q
    |||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  22556744 cgtgcgagtgaggacaaaacacgctgtaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatccttaatgtcgtctgggatgttacaaatggtatcag 22556843  T
Q  612 agcag 616  Q
    |||||    
T  22556844 agcag 22556848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 228 - 600
Target Start/End: Original strand, 1821828 - 1822201
Alignment:
Q  228 gcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagaggga 326  Q
    |||||||||| |||||| |   |||||||| ||||  ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||    ||| ||||||||||||||| ||    
T  1821828 gcttggtgggcatgtaacgtctgaggctgacgagggtggggagtggtccggctcatggcatgcttctaggcaaagttgaattacatcggaatgagagaga 1821927  T
Q  327 tcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtag 426  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1821928 tcttaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtag 1822027  T
Q  427 cccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaa 526  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||||||| || |||| |    
T  1822028 cccattccataagaactccacatttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgtgaatgagga 1822127  T
Q  527 caaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  1822128 caaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcggtcaacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 1822201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 216 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 3887293 - 3886893
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||    
T  3887293 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccagctcctggcatgcttttaggcaaaactgaatcacatcg 3887194  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    ||||||||| |||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3887193 gaatgagagtgatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 3887094  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| |||| | | |||||    
T  3887093 tcttttcggtaactcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcccagtaagcg 3886994  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagc 614  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  3886993 tgcgagtgaggacaaaacacgctgacaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtgtcagagc 3886894  T
Q  615 a 615  Q
    |    
T  3886893 a 3886893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 216 - 616
Target Start/End: Original strand, 2473869 - 2474260
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||  ||||||||||    
T  2473869 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaagctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttttaggaaaaactgaatcacatcg 2473968  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  2473969 gaatgagagggatcctaaggtcgtacaggcatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 2474068  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||          | || ||| |||||    
T  2474069 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc----------tatcccggtaagcg 2474158  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagc 614  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  || | ||||||||| | ||||||||||||    
T  2474159 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtatgggatgttaccaatggtatcagagc 2474258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 216 - 601
Target Start/End: Original strand, 2474315 - 2474701
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||    
T  2474315 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 2474414  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2474415 gaatgagagagatcctaaggtcgtacagatatgggactgcatggttgaaggaagacttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 2474514  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||  ||||| ||||||   || || |||| ||| ||||     
T  2474515 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgagatgggtgacctaccggaaagtttcccggtaagca 2474614  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||| |||||||    
T  2474615 tgcgagtgaggaaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtctgggacgttacaa 2474701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 8642180 - 8641886
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8642180 aatcacatcagaatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaaca 8642081  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  8642080 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttaagatgggtgacc-tacgggaagtttc 8641982  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  8641981 tcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 8641886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 216 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 3886837 - 3886452
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||| ||||   ||||||||||    
T  3886837 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggaatggtccggctcctagcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcg 3886738  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3886737 gaatgagagggatcctgaggtcgtacaagtatgggactgcatggtagaaggaatgcttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 3886638  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| | | |||||    
T  3886637 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacgtggagcaatttttggatgggtgacctaccgggaagtttcccagtaagcg 3886538  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||   ||| ||||||||||    
T  3886537 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcattctgggatgttaca 3886452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 216 - 600
Target Start/End: Original strand, 188990 - 189363
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcgg 315  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||            |||||||||||||  |||||||||||    
T  188990 tgtaacgcctccgcttggtgggcatataacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccgg-----------ttctaggcaaaactgaatcacatcgg 189078  T
Q  316 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 415  Q
    ||||||||||||||| | | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  189079 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgtatctt 189178  T
Q  416 cttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgt 515  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||   || || |||| ||| || |||    
T  189179 cttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcatgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagtttcccggtaaacgt 189278  T
Q  516 gcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  189279 gcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagtccgcaatcctgaaagtagtctgggatgttaca 189363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 231 - 602
Target Start/End: Original strand, 22556894 - 22557267
Alignment:
Q  231 tggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcc 329  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||     
T  22556894 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttcttggcaaaactgaatcacatcggaatgagagagttca 22556993  T
Q  330 taaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagccc 429  Q
    | | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  22556994 tgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactaccaatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctc 22557093  T
Q  430 aaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaa 529  Q
    |  |  |||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22557094 attctttaagaacttcacagttaagcgtgcctgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaa 22557193  T
Q  530 agcacgttg-aaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaag 602  Q
    | |||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || || || |||| ||||||||||||    
T  22557194 aacacgctgtaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatcctgaatgtcgtctgggatgttacaag 22557267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 305 - 612
Target Start/End: Original strand, 34371612 - 34371919
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| || | ||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34371612 aatcacaccggaatgagagggttcccaaggccgtacaggtgtgggactgcatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaaca 34371711  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| ||||    
T  34371712 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacaccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagtttc 34371811  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  34371812 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 34371911  T
Q  605 gtatcaga 612  Q
    ||||||||    
T  34371912 gtatcaga 34371919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 305 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 10927549 - 10927238
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10927549 aatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 10927450  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    ||||| |||     
T  10927449 agatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgaccgaccgggaagtttt 10927350  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
    |||| ||||||| || |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| |  ||||  || | |||||||| || ||    
T  10927349 tcggtaagcgtgtgaatgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcggtcgacaatcccaaaagacgtatgggatgttagaaatg 10927250  T
Q  605 gtatcagagcag 616  Q
     |||||||||||    
T  10927249 atatcagagcag 10927238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 17445601 - 17445306
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17445601 aatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 17445502  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  17445501 agatgcatcttcttatcggtagctcattccataagaaatccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 17445402  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||    
T  17445401 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagtcgcctgggatgttaca 17445306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 27646981 - 27646684
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  27646981 aatcacatcggaatgagagggatcctagggccgtgtaggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctataacaaca 27646882  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | |||| ||||||   ||||| ||||    
T  27646881 agatgcatcttctttttggtagcccatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgtcttggagtagtctttgcatgggtgacctaccgggaagtttc 27646782  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtc-gacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     |   || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| |||  |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27646781 ccaataaacgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcatgttggtttgtatggtcagtcggaaaatgcttaaagttgtctgggatgttacaa 27646684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 20039620 - 20039326
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | |||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20039620 aatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtataggactacatagttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20039521  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||  |||||| ||||    
T  20039520 agatgcattttctttt-ggtagcccattccataagaactctacagttaagtgtgcttgacttagagtagtctttggattggtgacctattgggaagtttc 20039422  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20039421 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcatgttggtttgt-tgatcagttggcaatgcttaaagtcgtctaggatgttacaa 20039326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 42788792 - 42788497
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | |||| |||  || |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42788792 aatcacaacggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggattgggactacatggttgaaagaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 42788693  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||| | ||||||   ||||| ||||    
T  42788692 agatgcatcttcttttcggtagctcattccacaagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggataggtgacctaccgggaagtttc 42788593  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  42788592 tcggtaagcttgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtggagtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 42788497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 305 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 21886292 - 21886067
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21886292 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacatatatcaaca 21886193  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| ||||    
T  21886192 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaaagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagtttc 21886093  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaa 530  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||    
T  21886092 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaa 21886067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Original strand, 39146939 - 39147227
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | | |||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  39146939 aatcacatcgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtagacttataagaattgtttgatactacttatattaaca 39147038  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||        
T  39147039 agatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtcgtatgatgggtgacctactgggaaa---- 39147134  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
       | ||||||||||| ||| |||||  ||| |  |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  39147135 ---gtaagcgtgcgagagaggacaaaaaacgctagaaagactcatgttggtttgtagggtcaatcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 39147227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 305 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 10927092 - 10926873
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10927092 aatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 10926993  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| |||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  10926992 agatgcatcttccttttggtagtccattccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttc 10926893  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgag 524  Q
      || ||||||| |||||||    
T  10926892 ctggtaagcgtgtgagtgag 10926873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 319 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 18750328 - 18750047
Alignment:
Q  319 gagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctt 418  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||    
T  18750328 gagagagatcctgaagtcgtgcaggtttggaactgcatggttgaaggaaggattataacaattgtttggtactacctataccaaaaagatgcatcttctt 18750229  T
Q  419 ttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcg 518  Q
    |||||||||  |  |||||||||||||| | |||| | | |||||||||||| | | ||||||||| ||||||| | |||| ||| |  ||||| |||||    
T  18750228 ttcggtagcttattccataagaactccataattaatcgtacttgacttggagcaattttaggatgggtgaccttctaggaagttttttagaaagtgtgcg 18750129  T
Q  519 agtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||||| ||||| |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  18750128 agtgaggacaaaacacactgaaaagactcgagttggtttgtggggtcagtcaacaatacttaaagtcgtatgggatgttaca 18750047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 305 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 8391467 - 8391202
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | | |||| ||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||    
T  8391467 aatcacatcggaatgagagggattctgaggccgtgtaggcatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactcctg-tatcaaca 8391369  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  8391368 agatgcatcttcttttcggtagctaattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 8391269  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcga 571  Q
    |||  || |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  8391268 tcgataaacgtgcgagtgaggacaaaacacgctgagaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcga 8391202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 315 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 29680236 - 29679958
Alignment:
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    ||||||||| |||| | | | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||       ||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  29680236 gaatgagagagatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataag-------tggtaatacctatatcaacaagatgcatct 29680144  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    |||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||  | ||| |||| ||  |||||    
T  29680143 tctttttggtagcccattacataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgaccttccgagaagtttcccgataagcg 29680044  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    ||| | |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  29680043 tgcaaatgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtct-ggatgttacaa 29679958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 313 - 601
Target Start/End: Original strand, 2193824 - 2194100
Alignment:
Q  313 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 412  Q
    |||||||||||||||| | | | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  2193824 cggaatgagagggatcatgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 2193923  T
Q  413 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 512  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||            |  ||| |||    
T  2193924 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc------------taccggtaag 2194011  T
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  2194012 tgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacaa 2194100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 305 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 24182391 - 24182113
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||  |||||||||||||| | |   |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||    
T  24182391 aatcacattagaatgagagggatcttgagaacgtgcaagtatgagacgaaatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactatctataccaaca 24182292  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| || ||||||||||| | | || |||||| ||||||| |   || ||||    
T  24182291 agatgcatcttc-tttcggtaccccaaaccataataacttaacagttaagcgtggttgacttggagcaattttgggatgggtgaccttctaaaaagtttc 24182193  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 584  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| || |||||    
T  24182192 tcggaaagtgtgcgagtgaggataaaacacgttgaaaagattcgtgttggtttgtggggttagtcgacaatcctgaaagt 24182113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 15513159 - 15512863
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaag--gcttataagaattttttggtactacttatatcaa 402  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |  ||| ||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||  |||||||    
T  15513159 aatcacatcggaatgagagggatcattaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatatgcttataagaattgtt-ggtactaccaatatcaa 15513061  T
Q  403 caagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatt 502  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || | | || |||||| ||||||   ||||| ||    
T  15513060 caagatgcatcttctttttggtatctcattccataagaactccacaattaaacgtgcttgacttgaagcaattttgggatggatgacctaccgggaagtt 15512961  T
Q  503 tctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| |||| |||||    
T  15512960 tcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatattaca 15512863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 269 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 30684739 - 30684432
Alignment:
Q  269 agtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaa 367  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||  ||  ||| |||||||| |    
T  30684739 agtggtccgactcctggcatgcttataggcaaaaccaaatcacatcggaatgagggggatcctgaggttgtgcaagtatggaacatcattgttgaaggga 30684640  T
Q  368 ggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttg 467  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||    
T  30684639 ggcttatatgaattgtttggtactatctataaaaacaagatgcatcttcttttcggtaggtcaaaccataagaactccacagttaagcgtgctcaacttg 30684540  T
Q  468 gagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcag 567  Q
    ||| | | || |||||| ||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||| || |||||  |   | ||||||||||| ||| | ||||||||||     
T  30684539 gagcaattttgggatgggtgaccttctgaaaagtttctcgaaaagcgtgcgagtaaggacaaaatatactaaaaagactcatattgatttgtggggtcaa 30684440  T
Q  568 tcgacaat 575  Q
    ||| ||||    
T  30684439 tcgtcaat 30684432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 305 - 602
Target Start/End: Original strand, 34372068 - 34372365
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||| || | ||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34372068 aatcacaccagaatgagagggttcccaaggccgtacaagtatgggactacatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaaca 34372167  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | | || |||| | ||||||   ||||| |||     
T  34372168 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggattggtgacctaccgggaagtttt 34372267  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaag 602  Q
     ||  ||||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||| ||||||| | ||| |||||||| |||| || ||||  |||| | ||||||||||    
T  34372268 ccgataagcgtgcgagtgaggaaaaaacacgctgaaaatactcgtgttggtttatggcgtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggaatgttacaag 34372365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 305 - 466
Target Start/End: Original strand, 34867790 - 34867951
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34867790 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 34867889  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgactt 466  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||    
T  34867890 agatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccatagttaagcgtgcttaactt 34867951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 216 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 30720041 - 30719786
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||| |  |||| ||||  ||| |  | |||||||||||||||| || | || | ||||||||  |||||||||     
T  30720041 tgtaacgcctccacttggtgggcatgtaacgtccgagactgacaagggcatgtagtggtccgactcctgacacgcttattggcaaaaccgaatcacatca 30719942  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  30719941 gaatgagagggatcctgaggttgtgcaagtatgggacatcattgttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctataaaaacaagatgcatct 30719842  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggag 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  30719841 tcttttcggtaggtcaaaccataagaactccacaattaagcgtgctcaacttggag 30719786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 305 - 567
Target Start/End: Original strand, 18304431 - 18304693
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||| ||||| ||| | || |||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18304431 aatcacaacggaatgagaaggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggatgatgaaaagcttatataaattgtttggtactacctatatcaaca 18304530  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||  ||||| ||||||| || ||| ||||    
T  18304531 agatgcatattcttttcggtagctcattccataagaattccacagttaagcatgtttgacttggagcaattttgtgatgggtgaccttttgagaagtttc 18304630  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcag 567  Q
     | ||||  ||||||||||| ||||| |||| |||| | |||| ||||| | | |||||||||    
T  18304631 acagaaattgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaacaaactcgtgttgatttctggggtcag 18304693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 239 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 22975223 - 22975080
Alignment:
Q  239 atgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcg 337  Q
    |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  22975223 atgtaacgcccgaggctgatgagggcgaggagtggtccagctcttggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccg 22975124  T
Q  338 tgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaatt 381  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22975123 tgcaggtatgtgactgcatggttgaagaaaagcttataagaatt 22975080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 307 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16370852 - 16370588
Alignment:
Q  307 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaag 406  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | | | || |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16370852 tcacatcgaaatgagagggttcctgatgccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacttatatcaacaag 16370753  T
Q  407 atacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctc 506  Q
    |   |||||||||| ||||||| ||   || ||||| || || ||||||||| ||||||||||| | | || |||||| |||| || ||  || ||||||    
T  16370752 acgtatcttctttttggtagcctaa---atcagaaccccgcagttaagcatgtttgacttggagcaattttgggatgggtgacattctgaaaagtttctc 16370656  T
Q  507 ggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
      ||||||||||| |||| | ||| |||  |||||||| | | |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  16370655 ataaagcgtgcgaatgaggaaaaaacacactgaaaagatttacgttgatatgt-gggtcagttgacaat 16370588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 246 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 2058862 - 2058699
Alignment:
Q  246 gctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaa-cataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggt 344  Q
    |||| ||| |||||||| | | ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |    
T  2058862 gctcaagggtgatgagggcagagagtggttcgactcctgtcatcttctaggcaaaaaccgaatcacatcggattgagagagatcctgaagtcatgcagct 2058763  T
Q  345 atgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagat 408  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2058762 atgagactggatgattgaaggaagacttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagat 2058699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 385 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11757347 - 11757157
Alignment:
Q  385 tggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatgg 484  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  || | | |   |||||    
T  11757347 tggtactacttatatcaacaaaatgcatcttcttttcggtagttcaatccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttacagcaatttcgagatgg 11757248  T
Q  485 ctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
     ||||||   ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||   || | ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  11757247 gtgacctaccgggaaatttttcggtaagcgtgtgagtgaggacgaaatccgcttaaaagactcttgttggtttgcggggtcagtcggcaat 11757157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 310 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 11160822 - 11160713
Alignment:
Q  310 catcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagata 409  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||     
T  11160822 catcggaatgagagggatcatgaagtcgtgtaggtatgacactacatagttgaaggaaggcttataataattgtttggtactatctatgtcaacaagatg 11160723  T
Q  410 catcttcttt 419  Q
    ||| ||||||    
T  11160722 catattcttt 11160713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 359 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 20858633 - 20858393
Alignment:
Q  359 ttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatg 458  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| | |||||  ||    
T  20858633 ttgaagaaaggcttataagaattgtttggtattttctatatcaacaagatgcttcttcttttctgtagctcattccataagaactccatagttaaggttg 20858534  T
Q  459 cttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatg 558  Q
    |||||||||||| |   || |||||| ||||||| |||||| |||   | ||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||| |||| ||||| | ||    
T  20858533 cttgacttggagcaactttgggatgg-tgaccttctgggaagttttctgaaaagcatgctagtgaggacaaaacacgctgaaaatactcgtgttgatttg 20858435  T
Q  559 tggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |  |||||||||||||| || ||||  || | ||||||||||    
T  20858434 ttaggtcagtcgacaatcctgaaagaagtttgggatgttaca 20858393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4658167 - 4657979
Alignment:
Q  275 ccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttat 374  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||    
T  4658167 ccgactcctgacagcctctaggcaaa-ctgaatcacatcgaaataagagggatcttgaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaacgaa-gattat 4658070  T
Q  375 aagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgactt 466  Q
    |||| || |||| |||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| |||| || | ||||||||||||    
T  4658069 aagacttgtttgatactacctataacaacaacatgcatcttctttttggtagtccattccataagaacttcacagtt-atcatgcttgactt 4657979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 334 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32574774 - 32574639
Alignment:
Q  334 gtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaac 433  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || ||||||  ||| ||||||||||||    
T  32574774 gtcgtgtaggtatgagactgcacggttaaag-aaggcttataggaattgtttggtactacctatacaaacaaaatgcatctttcttttggtagcccaaac 32574676  T
Q  434 cataagaactccacatttaagcatgcttgacttggag 470  Q
     |||| |||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  32574675 tataataacttcatagttaagcgtgcttgacttggag 32574639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 810 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 26119849 - 26119734
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 909  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||| ||| | ||||| | |||||| ||| |||||    
T  26119849 ttccattccttttgcaatgatatgcattcaaaataacaacagttaactaacttcagcttccagttttcagactatgatgaaatccagcttttgaggctct 26119750  T
Q  910 tcagactctctgatga 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  26119749 tcagactctctgatga 26119734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 305 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 5067037 - 5066865
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||  | | |||||| ||||||||||| ||| || ||||||  |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||    
T  5067037 aatcacaccagaatgagagagatcccgaggccgtgcatgtatgagactgtatgattaaaggaaaacttataagaattgtttggtattatctatatcaaca 5066938  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtctt 477  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| | |   ||||| ||||||||| |||| | || ||| ||||||||||||||    
T  5066937 agatgcattttctttttggtagtctatttcataaaaactccacaattaaacgtgtttgccttggagtagtctt 5066865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 526 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 21884010 - 21883912
Alignment:
Q  526 acaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcaggtaggtcc 624  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  21884010 acaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcttgaaagcagtctgggatgttagaattggtatcagagcaggtcggtcc 21883912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 43356790 - 43356651
Alignment:
Q  279 ctcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataaga 378  Q
    |||||||| |||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||    
T  43356790 ctcctggcggtttctaggcgaactaaattcacatcggaatgagaggg-tcctgagatcatgcaggtatgagactgcatgattga-ggatgacttataaga 43356693  T
Q  379 attttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 420  Q
    ||| |||||||| || || | |||||| || |||||||||||    
T  43356692 attgtttggtacaacctaaaccaacaatatgcatcttctttt 43356651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 811 - 878
Target Start/End: Original strand, 23589831 - 23589898
Alignment:
Q  811 tccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttca 878  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  23589831 tccattccttctgcaatcatatgcattcagaataacaacatttaactaacttcagcttccagtcttca 23589898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 424 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 30720287 - 30720101
Alignment:
Q  424 tagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtga 523  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| |||| | |||||||||||||  | | || |||||| |||| || | | ||  ||  || |||||||||||| ||    
T  30720287 tagcctaaacaataagaactctacagttaatcgtgcttgacttggaacaattttgggatggatgactttcttgaaagctttccgaaaagcgtgcgagcga 30720188  T
Q  524 gaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatca 610  Q
    | ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||  | ||||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  30720187 ggacaaaacacgctgaaaagactcctgttggtttgtggagtcaatcgacaatcttgaaagcagtctgggatgttacacgtggtatca 30720101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 466
Target Start/End: Original strand, 42429146 - 42429306
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |   |||| ||||||| ||   ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  42429146 aatcacatcggaataagagg-atcctgagaccgtgtaggtatgtgaacacatggttgaaggaggacttataagaattgtttggtactacctttatcaaca 42429244  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgactt 466  Q
    | || ||| |||||||| |||||||    |||||||||| || | |||||  ||||||||||    
T  42429245 atatgcatattcttttccgtagcccgttacataagaacttcatagttaagggtgcttgactt 42429306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 470
Target Start/End: Original strand, 4102812 - 4102961
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||     ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || | ||       
T  4102812 aatcacatctgaatgagagggattctgataccgtgcaggtatgagactg-----ttgaaagaatgcttataagaattgtttggtactacatacacca--- 4102903  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggag 470  Q
            ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||    
T  4102904 --------ctttttttcggtagcccaaaccataagaacttcacagttaaacgtgcttgacttggag 4102961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 4673568 - 4673467
Alignment:
Q  354 catggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 453  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || | |||||||||||| ||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||| ||||    
T  4673568 catgattgaaggaagtcttataagaattatttggtagcacctgtatcaacaagatgcatattctttttggtatttcattccataagaactccacagttaa 4673469  T
Q  454 gc 455  Q
    ||    
T  4673468 gc 4673467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 814 - 915
Target Start/End: Original strand, 20969318 - 20969419
Alignment:
Q  814 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcag 913  Q
    ||||||||| || |||| ||  |||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| | |||||||    
T  20969318 attccttctacagtgatgtgtcttcaaaataacaagctttaactaactacagcttccagtcttcagactttgaagaacttcagcttctgaggatcttcag 20969417  T
Q  914 ac 915  Q
    ||    
T  20969418 ac 20969419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 510 - 589
Target Start/End: Original strand, 1880281 - 1880360
Alignment:
Q  510 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtct 589  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  1880281 aagcgagcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtaaggtccgtcgacaatgcttaaagtcgtct 1880360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 441
Target Start/End: Original strand, 5549344 - 5549481
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattt-tttggtactacttatatcaac 403  Q
    |||||||||||||||||| || || | ||  | || |||||||||| || ||  |||||||||  ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  5549344 aatcacatcggaatgagatggttcatgaaaccatgtaggtatgagattgtataattgaaggaaaacttataaaaaattgtttggtactacgtataccaac 5549443  T
Q  404 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaa 441  Q
    || ||   | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5549444 aatatgtttattctttttggtagcccaaaccataagaa 5549481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 457 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 26341269 - 26341171
Alignment:
Q  457 tgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 555  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||| | |||| | || ||||||| ||||| |||||  ||||||||  |||||||    
T  26341269 tgcttgatttggagtagtctttggatgggtgaccttttgaaaaatttcccagaaaacatgtgagtgaggacaaaacacgtctaaaagactggtgttggt 26341171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 509 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 30684953 - 30684887
Alignment:
Q  509 aaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    ||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30684953 aaagcgtgcaagcgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcggcaat 30684887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 814 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 31589033 - 31588951
Alignment:
Q  814 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcag 896  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||| |||||  | |||| |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  31589033 attccttctgcaatgatgtgtcttcagaataacaaactttaattaactgcaacttctagtcttcagactctgatgatcttcag 31588951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 555
Target Start/End: Original strand, 187763 - 187808
Alignment:
Q  510 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 555  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  187763 aagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 187808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11757387 - 11757354
Alignment:
Q  306 atcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11757387 atcacatcggaatgagagggatcctaaagccgtg 11757354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 813 - 878
Target Start/End: Original strand, 20567923 - 20567987
Alignment:
Q  813 cattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttca 878  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  20567923 cattccttctgcaatcataagcatt-agaataacaacatttaactaacttcagcttccagtcttca 20567987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 182; Significance: 7e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 216 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 2446 - 2061
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  || || ||| | ||||||| |||||  ||||||||||    
T  2446 tgtaatgcctccgcttggtgggtatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccagcttctagcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 2347  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2346 gaatgagaaggatcctaaggccgtgcaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 2247  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||  ||| |||||    
T  2246 tcttttcggtagcttattccataagaactcaatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttttccggtaagcg 2147  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  2146 tgcgagtgaggacaaaacacattgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagttgtctgggatgttaca 2061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 560 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 2557 - 2501
Alignment:
Q  560 ggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 616  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2557 ggggtcagtcgacaatcctaaaagttgtctgggatgttacaaatggtatcagagcag 2501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2606 - 2554
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacgggg 268  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  2606 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcgggg 2554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 178; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 216 - 600
Target Start/End: Original strand, 10210 - 10594
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||    
T  10210 tgtaacgcctgcgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaaaactgaatcacatcg 10309  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||| | | |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10310 gaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatct 10409  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||  || |||||    
T  10410 ttttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaat-tttggatgggtgacctaccgggaagtttcctggtaagcg 10508  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||    
T  10509 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagtagtcggggatgttaca 10594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 2e-95; HSPs: 80)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 228 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 44471543 - 44471154
Alignment:
Q  228 gcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagaggga 326  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  44471543 gcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagaga 44471444  T
Q  327 tcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtag 426  Q
    || | | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44471443 tcttgaggccgtacaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtag 44471344  T
Q  427 cccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaa 526  Q
    | ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | | || |||||| ||||||   |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |    
T  44471343 ctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaatttcccggtaagcgggcgagtgagga 44471244  T
Q  527 caaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 616  Q
    |||| || | || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||    
T  44471243 caaaacatgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaattcttaaagtcgtttggggtgttacaaatggtatcagagcag 44471154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 216 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 23350513 - 23350128
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  23350513 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 23350414  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    ||||||||| |||| | | | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  23350413 gaatgagagagatcttgaggccgtacaggtaggggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtacttcctatatcaacaagatgcatct 23350314  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   | ||| |||||| | |||||    
T  23350313 tcttttcggtagctccttccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggatgacctaccgagaagtttctctgtaagcg 23350214  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    || ||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |||| || |||||||    
T  23350213 tgtgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaattctgaaagcagtctggggtgttaca 23350128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 216 - 575
Target Start/End: Original strand, 35871538 - 35871897
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  35871538 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 35871637  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |    
T  35871638 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtaccacctatatcaacaagatgcat-t 35871736  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaa-tttctcggaaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||| ||| ||||| |||| ||| || |    
T  35871737 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc-tatcggaaagtttcccggtaaac 35871835  T
Q  514 gtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  35871836 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagtcggcaat 35871897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 216 - 583
Target Start/End: Original strand, 49998546 - 49998914
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  49998546 tgtaacgcctccccttggtgggcatgtaaagctcaaggctgatgagggcggggagtggtccagctcttggcatgcttctagacaaaactaaatcacatcg 49998645  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  49998646 gaatgagagggatcctaaggctgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 49998745  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||| |    
T  49998746 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 49998845  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaag 583  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  49998846 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggacagtcggcaattctgaaag 49998914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 216 - 615
Target Start/End: Original strand, 13266002 - 13266396
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcgg 315  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||     ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||   ||||||||  |    
T  13266002 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctggtgagg-----gagtggtccgacttctggcaacttctgggcaaaattgaatcacattag 13266096  T
Q  316 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 415  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||||    
T  13266097 aatgagagggatcttaaagccgtgcaggtatgggaatgcatggttgaaggaaggcttataataattttttagtactccctatatcaataagatgcatctt 13266196  T
Q  416 cttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgt 515  Q
     |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | | ||||||||| ||||||| |||||| |||  || |||| ||    
T  13266197 attttcggtagcccaaatcacaagaaccccacagttaagcgtgcttgactttgagaaattttaggatgggtgaccttttgggaagttttccgaaaagtgt 13266296  T
Q  516 gcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 615  Q
    ||||||||| | ||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || | |||||||||||||||||||| ||||    
T  13266297 gcgagtgaggagaaaacatgttgaaaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtatgggatgttacaagtggtatcaaagca 13266396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 217 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 27579137 - 27578739
Alignment:
Q  217 gtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcgga 316  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  27579137 gtaacgccttcgtttggtgggcatgtaatgctcgaggctggtgagggtggggagtggtccgactcttgacagcttctaggtaaaaccgaatcacatcgga 27579038  T
Q  317 atgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttc 416  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  27579037 ataagagggatcttaaagtcgtgtaggtatgacactacttggttgactgaagacttataagaattgtttggtactacatatatcaattagacacatcttc 27578938  T
Q  417 ttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtg 516  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||   | || |||||  ||||||| |||||| |||| | |||||||||    
T  27578937 ttttcagtagccctatccataagaactacacagttaagcgtgcttaacttggagcgattttgggatgcgtgaccttctgggaagtttcccagaaagcgtg 27578838  T
Q  517 cgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 615  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||||||  ||||| | ||| |||||| |||| ||| ||||| || ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  27578837 cgagtgaggacaaatcatgctgaaaagacttgtgttgatttgtagggtcaatcgagaatacttaatgtcgtctgagatgttacaactggtatcagagca 27578739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 1645889 - 1645594
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  1645889 aatcacatcggaatgagaggaatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtattacctatatcaaca 1645790  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||| ||||    
T  1645789 agatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccaggaagtttc 1645690  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |  | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  1645689 tttgtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagttggcaatgcttaaagtcgtatgggatgttaca 1645594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 305 - 616
Target Start/End: Original strand, 21067282 - 21067593
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21067282 aatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcatgtatgagactgcatggttgaaggaagactaataataattatttggtactacatatatcaaca 21067381  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||  | | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||   || || ||||    
T  21067382 agatgcatcttctttccggtagctcattctaaaagtactccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtctttggaggggtgacctaccggaaagtttc 21067481  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||  ||||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  21067482 tcggtaagcgtgcgagtggggacaaaacacactgaaaagactcgtgttagtttgttgggtcagtccacaatgcttaaagtcgtctgggatgttacaaatg 21067581  T
Q  605 gtatcagagcag 616  Q
    ||||||||||||    
T  21067582 gtatcagagcag 21067593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 305 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 50399133 - 50398823
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50399133 aatcacatcggaatgagagggatcctgagaccgtgtaggtatgagattacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 50399034  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||   ||| || |||    
T  50399033 cgatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccggggaa-ttc 50398935  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| || ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  50398934 ccggtaaacgtgcaagtgaggacaaaacacgttggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 50398835  T
Q  605 gtatcagagcag 616  Q
    ||||||||||||    
T  50398834 gtatcagagcag 50398823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 354 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 23943333 - 23943072
Alignment:
Q  354 catggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 453  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  23943333 catggttgaaggaagacttataaaaaatatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaa 23943234  T
Q  454 gcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttg 553  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  23943233 gcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgaccaaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 23943134  T
Q  554 gtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 615  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23943133 gtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttacaaatggtatcagagca 23943072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 240 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 44471080 - 44470720
Alignment:
Q  240 tgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgt 338  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | | |  ||    
T  44471080 tgtaacgcccgaggctaatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagagatcatgacgctgt 44470981  T
Q  339 gcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataa 438  Q
     || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| || | ||  ||||||    
T  44470980 acaagtatgtgactgtatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctgttcg-taactcattccataa 44470882  T
Q  439 gaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttg 538  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  44470881 gaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggttgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctg 44470782  T
Q  539 aaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||    
T  44470781 gaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcaacaattcttaaagtcgtctggggtgttaca 44470720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Original strand, 3169206 - 3169501
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3169206 aatcacatcggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaaca 3169305  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    | || ||||    
T  3169306 agatgcatcttctttttggtaacccaatccataagaactccacacttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgagtgacctaccagaaagtttc 3169405  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    | || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  3169406 ttggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaatactcgtgttggtttgtagggtcagttggcaatacttaaagtcgtctaggatgctaca 3169501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 251 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 14572345 - 14571982
Alignment:
Q  251 aggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacat-aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatga 348  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |  |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| | | | || |||||||     
T  14572345 aggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcatctaga-aaaatatgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgg 14572247  T
Q  349 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccaca 448  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14572246 gactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc-tttcggtagcctaaaccataagaactccaca 14572148  T
Q  449 tttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactca 548  Q
       |||| |||||||||| ||| | | ||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||     
T  14572147 ---aagcgtgcttgacttagagcaattttgagatgggtgaccttctgggaagtttctcggaaagcgtgtgagtgaggacaaaacacggtgaaaagactcg 14572051  T
Q  549 tgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtct-aggatgttacaagtggtatcagagcag 616  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||| || ||||  || |  || |||||||| ||||||||||||||    
T  14572050 tgttggtttgcggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggggtgttacaaatggtatcagagcag 14571982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 216 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27578683 - 27578327
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcgg 315  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| |    
T  27578683 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacactcgaggctgatgagggcggggagcggtccggctcctggcagcttctaggcaaaaccgaatcatatcag 27578584  T
Q  316 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 415  Q
    ||||||| ||   || |||||||| |||| ||||||||  |||||||| || || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  27578583 aatgagatgg---ctgaagtcgtggaggtgtgagactgtgtggttgaatgatggtttataagaattatttggtgctacctatatcaacaagatgcatctt 27578487  T
Q  416 cttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgt 515  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||  | | || |||||   |||||| |||||| |||  ||  ||||||    
T  27578486 cttttcggtatcccaaaccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttcgaacaattttgggatgagcgaccttctgggaagttttccgacaagcgt 27578387  T
Q  516 gcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |||||||||| || |||| |||||| |||||| |||||    
T  27578386 gcgagtgaggacaaaacacgcagaaaagactcgtgatggtttgtgggatcagtcaacaat 27578327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 50398678 - 50398383
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50398678 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtataggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 50398579  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||   ||||| |||     
T  50398578 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggaagttta 50398479  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||  ||  || |||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||  ||||  |||||||||    
T  50398478 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacactggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgagatgttaca 50398383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 305 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 12692139 - 12691909
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12692139 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 12692040  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| ||||    
T  12692039 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagtttc 12691940  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacg 535  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12691939 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacg 12691909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 305 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 24629573 - 24629267
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24629573 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggtcgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 24629474  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||| | |   ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||||   |    
T  24629473 agatgcatcttcttttcggtacctcgttccataagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaa---c 24629377  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| || ||||  ||||  |||||||||| ||    
T  24629376 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttagtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgtgatgttacaaatg 24629277  T
Q  605 gtatcagagc 614  Q
    ||||||||||    
T  24629276 gtatcagagc 24629267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 51331421 - 51331128
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  51331421 aatcacatcggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaaca 51331322  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||   |||||||||     
T  51331321 agatacatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggaaattt- 51331223  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||  |||||||||| |||| ||||| |||  || |||||||| | || || ||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||    
T  51331222 tcgataagcgtgcgaatgaggacaaaacacactg-aaagactcgtattagtttgtagggtcagtcggcaatcctaaaagtagtctaggatgttaca 51331128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 305 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 9423998 - 9423719
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9423998 aatcacaccggaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaaca 9423899  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||  ||||||||| | |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  9423898 agatgcatcttctttctagtagcccattccataagaatttcacaattaagtgtgcttgaattggagtagtcttaggatgggtgacctaccgggaaatttc 9423799  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 584  Q
     ||  |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||  |||| || | |||| ||||||||    
T  9423798 ccgttaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtgtgtacggtccgttggcaatgcttaaagt 9423719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 23942929 - 23942634
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23942929 aatcacatcggaatgagagggatcctggggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 23942830  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   || || ||||    
T  23942829 agatgcatcttcttttttgtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctaccggaaagtttc 23942730  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
         ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||| ||   |||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  23942729 caaataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaggacccgtgttggtttgtaggaatagtcaacaatgcttaaagttgtatgggatgttaca 23942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 279 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 8467964 - 8467690
Alignment:
Q  279 ctcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataaga 378  Q
    |||||||||| ||||||||||  |  || |||||| |||||| ||||||||| |    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8467964 ctcctggcagcttctaggcaa--ccgaaccacatcagaatgaaagggatcctgagactgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataaga 8467867  T
Q  379 attttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtctta 478  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |      
T  8467866 attgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttcggtagccc--------agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt-- 8467777  T
Q  479 ggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagt 568  Q
       ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8467776 ---tgggtgaccttatgggaagtttctcggaaagcatgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagt 8467690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 305 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 31817992 - 31817686
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||    
T  31817992 aatcacatcggaataagagggattatgaggtcatgcatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttcggtactacctataccaaca 31817893  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||  | ||| ||||    
T  31817892 agatgcatcttcttttcggtagtccatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttgtagtagttttaggatgggcgaccttcggtgaagtttc 31817793  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| || |||| || ||||| ||||||| || ||| ||||||  |||| || ||||  |||| ||||| ||||||||    
T  31817792 gcggaaagcgtgcgagtgaggacaaatcatgttg-aatgactcgtgttggtttgagggatcagtcagcaatcctgaaagcagtct-ggatgctacaagtg 31817695  T
Q  605 gtatcagag 613  Q
    |||||||||    
T  31817694 gtatcagag 31817686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 341 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 7678726 - 7678467
Alignment:
Q  341 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 440  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  7678726 aggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcttattccataaga 7678627  T
Q  441 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 540  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  7678626 actccacagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 7678527  T
Q  541 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  7678526 aagactcgtgtaggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 7678467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 305 - 608
Target Start/End: Original strand, 14351795 - 14352098
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  14351795 aatcacaccagaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgagtctgcatggttgaaggaaggcttgtaagagttttttggtactatctatatcaaca 14351894  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||  || |||     
T  14351895 agatgcatcttctttttggtatcctattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttcgagtagtctttggatggatgacctactgcaaagtttt 14351994  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     | | |||||||| |||||  |||||  | | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||| |||||||| || | ||||||||||| ||    
T  14351995 ccagtaagcgtgcaagtgaagacaaaatatgctgaaaagactcatgttggtttgtatggtcagtcagcaatgcttaaagtcgtatgggatgttacaaatg 14352094  T
Q  605 gtat 608  Q
    ||||    
T  14352095 gtat 14352098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 216 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 15306326 - 15306052
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcgg 315  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| || |||||| |    
T  15306326 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcgaggagtggtctggctcctggcagcttctaggcaaaacagaaccacatcag 15306227  T
Q  316 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaatt------ttttggtactacttatatcaacaagata 409  Q
    ||||||||||||||| | |  ||| ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||      |||||||||||| ||||| ||||||||     
T  15306226 aatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggtcgaaagaagacttataagatttgagcaattttggtactacctatataaacaagatg 15306127  T
Q  410 catcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatgg 484  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||| ||||||    
T  15306126 catcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaatcttgggatgg 15306052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 249 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 14571918 - 14571702
Alignment:
Q  249 cgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatg 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||  |||||||||  ||||| ||||||| | |   |||| |||||||    
T  14571918 cgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcttggttctaggaaaaactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccgtgtaggtatg 14571819  T
Q  348 agactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccac 447  Q
     |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14571818 ggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagcctaaaccataagaactccac 14571719  T
Q  448 atttaagcatgcttgac 464  Q
    | |||||| ||||||||    
T  14571718 agttaagcgtgcttgac 14571702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 305 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 4128029 - 4127772
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4128029 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggcatgagactatatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 4127930  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || | |||||| |||||| ||| ||| | | || |||||| ||||||   |  || |||     
T  4127929 agatgcatcttcttttcggtagccaattccataagaacttcagagttaagcgtgcttggcttagagcaattttgggatgggtgacctaccgaaaagtttt 4127830  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggg 562  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4127829 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 4127772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 305 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 29628807 - 29628624
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29628807 aatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 29628708  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgac 489  Q
    ||||   |||| | || |||||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29628707 agatgtgtctt-tgtttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgac 29628624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 336 - 600
Target Start/End: Original strand, 21067765 - 21068026
Alignment:
Q  336 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaacca 435  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   | |||| ||||| |||  |||    
T  21067765 cgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagataca---tttttttggtagtccattcca 21067861  T
Q  436 taagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacg 535  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||   ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||| |||     
T  21067862 taagaacttcacagttaagcgtgcttgacttgaagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttaccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacaca 21067961  T
Q  536 ttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     |||||| | || ||||||| ||| || | ||||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  21067962 ctgaaaaaattcgtgttggtttgtaggcttagtcggcaatgcttaaagtcatctgggatgttaca 21068026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 354 - 614
Target Start/End: Original strand, 17628560 - 17628821
Alignment:
Q  354 catggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 453  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || |    
T  17628560 catggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttcgatagcccaacccataagaattccacagttga 17628659  T
Q  454 gcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttg 553  Q
    || ||| |||||||||| | | ||  ||||| ||||||| | ||||  ||| |  |||||||| ||||||| ||||| |||  || |||||||  |||||    
T  17628660 gcgtgcctgacttggagcaattttgagatgggtgaccttctaggaagattcccataaagcgtgtgagtgaggacaaaacacactggaaagacttgtgttg 17628759  T
Q  554 gtatgtggggtcagtcgacaattct-taaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagc 614  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||  ||||  || | |||| |||||||||||||||||||    
T  17628760 gtatgtggagtcagtcggcaatcctgaaaagcggtgttggattttacaagtggtatcagagc 17628821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 305 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 24629120 - 24628914
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaa---ggcttataagaattttttggtactacttatatca 401  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24629120 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaattaggcttataagaattgtttggtactacctatatca 24629021  T
Q  402 acaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaat 501  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   | |||||    
T  24629020 acaagatgcatcttcttttcagtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgcgaaat 24628921  T
Q  502 ttctcgg 508  Q
    |||||||    
T  24628920 ttctcgg 24628914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 305 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4127577 - 4127434
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4127577 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 4127478  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccaca 448  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4127477 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 4127434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 464
Target Start/End: Original strand, 41869829 - 41870077
Alignment:
Q  215 ttgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| ||| |  |||||||||| || ||||||  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  41869829 ttgtaacgcctccgcttggtggacatgtaacgctcaaggctggtgacgg-ggggagtggtacgtctcctgtaagcttctaggcaaaactaaatcacatcg 41869927  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    || ||||||||||||| |    || ||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||  |||||    
T  41869928 gagtgagagggatcctgagactgtacatatatgggactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtatgatactacctatatcaacaagacgcatct 41870027  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 464  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  41870028 tcttttcagtaacccaaatcataagaacttcacaattatgcatgtttgac 41870077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 305 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 53996255 - 53996083
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |   || || |||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  53996255 aatcacatcggaatgagaaggatcctgaggctatgtagatatgggactacatggttgaaggaatgcttataaaaattgtttggtactacctatatcaaca 53996156  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtctt 477  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  53996155 agattcatcttctttttggtatctcattccataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagtagtctt 53996083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 338 - 454
Target Start/End: Original strand, 27029310 - 27029426
Alignment:
Q  338 tgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccata 437  Q
    |||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  27029310 tgcaggaatgagactacacgattgaaggaagacttataagaattatttggtactacttatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccata 27029409  T
Q  438 agaactccacatttaag 454  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27029410 agaactccacagttaag 27029426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 13614037 - 13613788
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  | || ||||| | |||||||| |||||| ||||||   |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  13614037 aatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtttgataccacctatatcaaca 13613938  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||  | |||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| |||||| |||| || || ||| |||     
T  13613937 agatgcatcttc-tttcggtagttcattctataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggactagtctttggatgggtgacgttctgagaagtttt 13613839  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 555  Q
      | ||||| | |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13613838 ctgaaaagccttcgagtgaggacaaagcacgctgtaaagactcatgttggt 13613788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 305 - 610
Target Start/End: Original strand, 1464147 - 1464451
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |     |||| |||||||||| | ||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1464147 aatcacatcagaatgagagggatcatgcgaccgtgtaggtatgagaatacatagttgaaagaaaacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 1464246  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||| || ||| ||||| |||||||| | | || |||||| ||||||| || ||| |||     
T  1464247 agatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaacttcacaatttagcgtgcttaacttggagcaattttgggatgggtgaccttctgagaagtttt 1464346  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     |  ||| ||||||||| || ||| | |||| |||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||| ||| || ||||  |||| |||||||| ||||     
T  1464347 ccaaaaaacgtgcgagttaggacacaacacgctgaaaa-actcgtgttgatttgtggggtcggtcgataatcctaaaagcagtctgggatgttataagta 1464445  T
Q  605 gtatca 610  Q
    ||||||    
T  1464446 gtatca 1464451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 50814899 - 50814730
Alignment:
Q  371 ttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggag 470  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  50814899 ttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggag 50814800  T
Q  471 tagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 540  Q
     | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| || |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  50814799 caattttgggatggatgacctaccgggaagtttcccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 50814730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 338 - 607
Target Start/End: Original strand, 4185748 - 4186015
Alignment:
Q  338 tgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccata 437  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||  | | |    
T  4185748 tgcaggtatgagacggcatggttaaaggaatacatataagaattgtttgataccacatataccaacaagatgcatcttctttttggtagctcattctaca 4185847  T
Q  438 agaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgtt 537  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | | || |||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||||| |||  |    
T  4185848 agaactctacagttaagtatgcttgacttggagcaattttgggataggtgaccttatgcgaaatttctcgaaaagcgtgtgaatgaggacaaaacacact 4185947  T
Q  538 gaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggta 607  Q
     ||||||||  ||||  | ||| ||||||||| ||||| ||||||||  | | ||||||||||| |||||    
T  4185948 aaaaagact-gtgttaatttgt-gggtcagtcaacaatacttaaagtcatttgggatgttacaaatggta 4186015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 305 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21220471 - 21220306
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | | | | || |||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21220471 aatcacatcagaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgaaactatatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 21220372  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggag 470  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||  | ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  21220371 agatgcatcttctttttggtaactcattctataagaactacacagttaagcgtgtttgacttggag 21220306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 417 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 27578314 - 27578177
Alignment:
Q  417 ttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtg 516  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  27578314 ttttcggtagcccaaactataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcagttttgggatgagtgaccttatgggaagtttccctgaaaacgtg 27578215  T
Q  517 cgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttgg 554  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27578214 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgg 27578177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 432 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 14571701 - 14571563
Alignment:
Q  432 accataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaag 531  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |   ||||| ||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||     
T  14571701 accataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttcgagatgggtgatcttttgggaagtttctcggaaagtgtgtgagtgaggacaaaa 14571602  T
Q  532 cacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcg 570  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14571601 cacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcg 14571563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 305 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 31817538 - 31817376
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  31817538 aatcacatcgaaataagagggatcatgaggtcgtgcatgtatgagacttcatggttgaaggaacgtttataataattgtttggtactacctataccaaca 31817439  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttg 467  Q
    | || |||||||||||| | ||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||    
T  31817438 aaatgcatcttcttttccgcagcccattccttaagaactctacaattaagcgtgtttgacttg 31817376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 495 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 15268123 - 15267994
Alignment:
Q  495 gggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggat 594  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| || |    
T  15268123 gggaaatttctcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctcggct 15268024  T
Q  595 gttacaagtggtatcagagcaggtaggtcc 624  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15268023 gttacaaatggtatcagagcaggttggtcc 15267994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 279 - 608
Target Start/End: Original strand, 17028849 - 17029177
Alignment:
Q  279 ctcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataaga 378  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||||| ||||||||| |  || |||||    
T  17028849 ctccttgcagcttctaggcaaa-ctgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagccttgcatgtatgggactgcatagttgaaggaggatttgtaaga 17028947  T
Q  379 attttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtctta 478  Q
    ||| || ||| |||| |||||||||||||| | |||| ||||   ||||  |  ||||||||||| || | |||||  |||||||||||||| | | |      
T  17028948 attgttaggtgctacctatatcaacaagatgcgtcttattttacctagcttattccataagaacttcatagttaagagtgcttgacttggagcaatttcg 17029047  T
Q  479 ggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattct 578  Q
    |||||| | | |||||||||| ||||||| |||| |||| | |||| | ||| || ||||||||||||  ||||||| |    ||||| ||| ||||  |    
T  17029048 ggatgggtaaacttatgggaagtttctcgaaaagtgtgctaatgaggagaaaacatgttgaaaagacttctgttggtttacatggtcaatcggcaataat 17029147  T
Q  579 taaagttgtctaggatgttacaagtggtat 608  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  17029148 taaagtcatctgggatgttacaagtggtat 17029177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 283 - 470
Target Start/End: Original strand, 17628946 - 17629132
Alignment:
Q  283 tggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattt 382  Q
    |||||| ||||||||||| |  |  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||  ||  ||||||||||||     
T  17628946 tggcagcttctaggcaaatcgaatccacatcagaatgagtgggatcctaaggtcgtgcaggtatgtgaatgtatggttgaataaaaacttataagaattg 17629045  T
Q  383 tttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggag 470  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||| | |||||||||  | ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17629046 tttggtactacctatactaataagatgcctcttctttttagaagcccaatccaaaagaattccaca-ttaagcatgcttgacttggag 17629132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 337 - 568
Target Start/End: Original strand, 27026535 - 27026765
Alignment:
Q  337 gtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccat 436  Q
    ||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||  ||||    
T  27026535 gtgcaggtatgggactacacgattgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcatctt-tttttggtagcccattccat 27026633  T
Q  437 aagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgt 536  Q
    ||||||| |  | |||||| ||||||||||| || | | || ||| || ||||||| | |||| |||  |  |||||||| || |||| | ||| ||||     
T  27026634 aagaactacgtagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggaagggtgaccttctaggaagtttaccaaaaagcgtgtgactgaggaaaaaacacgc 27026733  T
Q  537 tgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagt 568  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| ||||    
T  27026734 tgaaaagactcgtgtttgtttgtggggccagt 27026765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 810 - 925
Target Start/End: Original strand, 13027893 - 13028010
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctc 908  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | ||    
T  13027893 ttccattccttctgcaatgatatgcattcagaataaaaacatttaactaacttcagcttcccgtcttcagactctgatgaactccagcttctgatggttc 13027992  T
Q  909 tt-cagactctctgatga 925  Q
    || |||||||||||||||    
T  13027993 ttccagactctctgatga 13028010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 341 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 23976323 - 23976062
Alignment:
Q  341 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcgg-tagcccaaaccataag 439  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||    ||||| ||| |||||     
T  23976323 aggtatgggtctgcatgattgaaggaagagttataagaattgtttggtactacctatactaacaagatgcatcttcttttttcatagccaaaatcataaa 23976224  T
Q  440 aactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttga 539  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||| || | || |||||  ||| |||||| ||  |||| |  ||| | ||||  |||| | ||| |||| |||    
T  23976223 aactccacagttaaacgtgcttgacttggaataattttgggatgagtgagcttatgtgatgtttcccaaaaaacatgcggctgaggaaaaaacacgctga 23976124  T
Q  540 aaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||| |  |||| ||||||||||    
T  23976123 aaagactaatgttggtttatggggtcagtcaacaattctaaaaatcatctaagatgttacaa 23976062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 433 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 4127430 - 4127263
Alignment:
Q  433 ccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagc 532  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | | || |||||| ||| ||   ||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||||| |    
T  4127430 ccataagaactccacagttaagcatgattggcttggagcaattttgggatgggtgagctatcgggaagtttcccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaac 4127331  T
Q  533 acgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  || ||| ||||||||    
T  4127330 acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtttagaatgttaca 4127263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 43929092 - 43928982
Alignment:
Q  316 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 415  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  43929092 aatgagagggttcctgaagccgtgcaggtatgagactatttggtcgaaggaaagcttacaagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatctt 43928993  T
Q  416 cttttcggtag 426  Q
    ||||| |||||    
T  43928992 ctttttggtag 43928982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 309 - 514
Target Start/End: Original strand, 17029334 - 17029539
Alignment:
Q  309 acatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagat 408  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17029334 acatcggaatgagagggatctagaggtcgtgcaagtatgggactgcatagttgaatgaagacttgtaataattgtttagtactacctatatcaacaagat 17029433  T
Q  409 acatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcgg 508  Q
     ||| ||  ||| |||| |  |  |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| | | || || ||| ||||||| |||||| |||| | |    
T  17029434 gcatattacttttggtaccttattccataagaactccacagttaagagtgcttaacttggagcatttttgggttgggtgaccttctgggaagtttcccag 17029533  T
Q  509 aaagcg 514  Q
    ||||||    
T  17029534 aaagcg 17029539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 307 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 52048804 - 52048538
Alignment:
Q  307 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaag 406  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||   ||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||    
T  52048804 tcacgtcggaatgagagggttcctaaggccgtacaggtatgaaactgcatagctgaaggaaaatttataagaattgtttgatactacgtatactaacaag 52048705  T
Q  407 atacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctc 506  Q
    || ||||||| |||  |||   ||  |||||||||||||||| ||||         |||||||| | | ||| ||||| ||||||| | |||| ||||||    
T  52048704 atgcatcttcattt-tgtaagtcattccataagaactccacagttaa---------acttggagcaatttta-gatggatgaccttctaggaagtttctc 52048616  T
Q  507 ggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 584  Q
    | |||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||| | ||||||    
T  52048615 gaaaagagtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagattcatgttggtttgtgagatcagtcgacaatacataaagt 52048538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 305 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 53854947 - 53854859
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactac 393  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  53854947 aatcacatcggaatgagagggatcatgaagcagtgtaggtatgagactatatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactac 53854859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 307 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24271690 - 24271552
Alignment:
Q  307 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtg--caggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |||||||||| |||| |||||| ||||  ||||    
T  24271690 tcacatcggaatgagagggttcctgaggtcgtgtgcaggtatgagactacatggttaaagtaagacatataagaattatttgatactacctatacgaaca 24271591  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactc 444  Q
    |||| ||| || |||| |||||||||  ||||||||||||    
T  24271590 agatgcatatt-ttttgggtagcccattccataagaactc 24271552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 453
Target Start/End: Original strand, 4186176 - 4186315
Alignment:
Q  314 ggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatc 413  Q
    |||||||||||| || ||| | | |||| ||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  4186176 ggaatgagagggttcgtaaggccatgcacgtatgagactaaatgtttaaaggaatgcttataagaatgatttggtactacctacatgaacaagattcatc 4186275  T
Q  414 ttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 453  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||| |||| ||||    
T  4186276 ttctttttggtagcccattgcataagaactacacagttaa 4186315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2499727 - 2499647
Alignment:
Q  312 tcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtacta 392  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  2499727 tcggaatgagagggattctaaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaagcaacacttataaaaattgtttggtacta 2499647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 26200425 - 26200208
Alignment:
Q  307 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaag--gcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |  | ||| ||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||  ||||  ||||    
T  26200425 tcacatcagaatgagagggatcctgatattgtgtaggtatgggacatcatggttgaaggaagaggcttataacaattgtttgatactaactatacaaaca 26200326  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||||||       |||| |||||||||||||||| | | || |||||| |||||||  | ||| ||||    
T  26200325 agatgcatattctttgtggtagccgaaaccataagaac-------ttaa-catgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccttcagcgaagtttc 26200234  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaa 530  Q
     || |||||||| ||||||| |||||    
T  26200233 acgaaaagcgtgtgagtgaggacaaa 26200208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 439
Target Start/End: Original strand, 53391925 - 53392021
Alignment:
Q  343 gtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataag 439  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||    
T  53391925 gtatgagactgcatggttgaagaaatgcttataaaaattgtttgataccatctatatcaacaagatacatatttttttcggtagttcagaccataag 53392021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 601
Target Start/End: Original strand, 7381472 - 7381563
Alignment:
Q  510 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| || | |||||||||||    
T  7381472 aagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtatgggatgttacaa 7381563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 814 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 14357125 - 14357014
Alignment:
Q  814 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcag 913  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||  || ||||| |||| | |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14357125 attccttttgcaatgatgtgtcttcagaataacaacttttaactaacttcagtttccaatctttagactctgttgaacttcagcttttgaggctcttcag 14357026  T
Q  914 actctctgatga 925  Q
    | ||||||||||    
T  14357025 attctctgatga 14357014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 469 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 31817114 - 31816983
Alignment:
Q  469 agtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagt 568  Q
    ||||||||| |||||| |||| || |||||| |||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||| || |    
T  31817114 agtagtctttggatgggtgacattctgggaagtttcccagaaagcgtacgagtgaggacaaaacatgttgaaaagactcgtgctggtttgtggggccaat 31817015  T
Q  569 cgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||||||| || | ||| || | ||||||||||    
T  31817014 cgacaatcctgatagtagtatgggatgttaca 31816983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 23091590 - 23091489
Alignment:
Q  366 aaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgact 465  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||  |  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23091590 aaggcgtataaaaattgtttggtactacatatattaacaagatgcatcttctttctggtagcttattctataaaaactccacagttaagcatgcttgact 23091491  T
Q  466 tg 467  Q
    ||    
T  23091490 tg 23091489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 584
Target Start/End: Original strand, 33764898 - 33765139
Alignment:
Q  343 gtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaac 442  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||| ||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||  ||||| ||    ||||||||    
T  33764898 gtataagactacatggttggatgaagacttttaagaattgtttggtgctacctataccaacaagatgcatcttcttttttgtagctcattttataagaac 33764997  T
Q  443 tccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaa 542  Q
    | |||| |||||| ||||||| |||||  | | || |||||| |||| || | |||  ||| ||  ||||| || ||| |||  |||| |||  | ||||    
T  33764998 ttcacacttaagcgtgcttgatttggatcaattttgggatgggtgactttctaggagttttttcaaaaagcatgtgagcgaggtcaaaacacactaaaaa 33765097  T
Q  543 gactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 584  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  33765098 gactcgtgttggtttgtgaggtcaatcgacaatgcttaaagt 33765139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 601
Target Start/End: Original strand, 35477856 - 35477956
Alignment:
Q  501 tttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||||||| || |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  || | ||||||||||    
T  35477856 tttctcggtaaacgtgcgagagaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgttaca 35477955  T
Q  601 a 601  Q
    |    
T  35477956 a 35477956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20306241 - 20306139
Alignment:
Q  365 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 464  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||   |||| ||||   |||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  20306241 gaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttttt---ggtatcccatttcataagaactacacggttaagcgtgcttgac 20306145  T
Q  465 ttggag 470  Q
    ||||||    
T  20306144 ttggag 20306139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 816 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 16324508 - 16324399
Alignment:
Q  816 tccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcagac 915  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||| |  ||| ||||||||||| | ||| ||||||| || ||| ||| | |||||||||    
T  16324508 tccttctacaatgatatgcattcagaataacaacttttgactaatttcagcatccagtcttcagattctgatgaactccaacttttgaggttcttcagac 16324409  T
Q  916 tctctgatga 925  Q
    ||||| ||||    
T  16324408 tctctaatga 16324399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 853 - 922
Target Start/End: Original strand, 18776147 - 18776216
Alignment:
Q  853 taactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcagactctctga 922  Q
    |||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||    
T  18776147 taactaactgcagcttccaatcttcagactctaatgaatttcagcttctgatgatttttagactctctga 18776216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 404
Target Start/End: Original strand, 17506389 - 17506484
Alignment:
Q  309 acatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||| |||||||||||||| | | ||| |||| |||||||| |||||| || || |||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||    
T  17506389 acatcagaatgagagggatcatgaggtcatgcatgtatgagagtgcatgattaaaagaagacttataagaattgtatagtactacctatatcaaca 17506484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Original strand, 44831035 - 44831122
Alignment:
Q  343 gtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagccca 430  Q
    |||||||| | |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| || |  ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  44831035 gtatgagattacatggttgaagggaagcttataaaaattgtttggtactacctaaactaacaagatgtatattcttttcggtagccca 44831122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 526 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 53996049 - 53995978
Alignment:
Q  526 acaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgtt 597  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  53996049 acaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtggacaatgtttaaagtcgtctcggatgtt 53995978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 4414322 - 4414248
Alignment:
Q  510 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 584  Q
    |||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  4414322 aagcgtgcgagtcaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagt 4414248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 33987239 - 33987164
Alignment:
Q  276 cgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagact 352  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| ||||    
T  33987239 cgactcttggcagcttctaggcaaa-ctgaatcacatcggaatgagagggatcatgagatcgtgcaggtatgtgact 33987164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34801450 - 34801394
Alignment:
Q  322 agggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataaga 378  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  34801450 agggatcctaaggtcgtgtaggtatgagactatatagttgaaggagggcttataaga 34801394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 415
Target Start/End: Original strand, 42838661 - 42838733
Alignment:
Q  343 gtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 415  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  42838661 gtatgagactacatagttcaaggaagacgtataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgcatctt 42838733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2682770 - 2682707
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaag 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||| || |||||| ||||||||||    
T  2682770 aatcacatcgaaatgagagggatcctgaaaccgtgcatgtatgtgattgcatgattgaaggaag 2682707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 508 - 575
Target Start/End: Original strand, 5810037 - 5810104
Alignment:
Q  508 gaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    ||||||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||    
T  5810037 gaaagcgtgtgagtgaggataaaacacgctgaaaagactcatgttgatttgtggggttagtcggcaat 5810104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 11828497 - 11828406
Alignment:
Q  433 ccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgag 524  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | | || |||||| ||||||| ||| ||||||| |  |||  |||||||||||    
T  11828497 ccataagaactccacagttaagcgtgctttacttggagcatttttgggatgggtgaccttctggaaaatttcccaaaaaatgtgcgagtgag 11828406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 814 - 875
Target Start/End: Complemental strand, 20570993 - 20570932
Alignment:
Q  814 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtct 875  Q
    ||||||||| |||| || ||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  20570993 attccttctacaattatgtgacttcagaataacaacctttaactaactgcagcttccagtct 20570932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 420
Target Start/End: Original strand, 45682209 - 45682318
Alignment:
Q  311 atcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatac 410  Q
    ||||||||||||| |||| | | | | ||||  |||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||| |    
T  45682209 atcggaatgagagagatcttgaggccatgcatatatgggactacatgattgaatgaaggtttataagaattatttggtattatctataccaacaagatgc 45682308  T
Q  411 atcttctttt 420  Q
    || |||||||    
T  45682309 attttctttt 45682318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 174; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 216 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 107699 - 107314
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||    
T  107699 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacggggagtggtccggttcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 107600  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    ||||||||||||| || | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  107599 gaatgagagggattctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactaccaatatcaacaagatgcatct 107500  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||| |   ||||| |||| ||| |||||    
T  107499 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacgtaccgggaagtttcccggtaagcg 107400  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  107399 tgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggctattctgaaagcagtctgggatgttaca 107314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 4e-93; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 216 - 616
Target Start/End: Original strand, 25147446 - 25147846
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  25147446 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacactcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcttctaggcaaaactaaatcacatcg 25147545  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    ||||||||| ||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  25147546 gaatgagagagatcctaagactgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgcatct 25147645  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||  |  |||||    
T  25147646 tcttttcggtagctcattccataagaactccatagttaatcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcctgataagcg 25147745  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagc 614  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||  |||| || |||||||| ||||||||||||    
T  25147746 tgcgagtgagtacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt-gggtcagtcggcaatcctgaaagcagtcttgggtgttacaaatggtatcagagc 25147844  T
Q  615 ag 616  Q
    ||    
T  25147845 ag 25147846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 215 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 34309176 - 34308770
Alignment:
Q  215 ttgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatc 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  34309176 ttgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcgaggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 34309077  T
Q  314 ggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactac----ttatatcaacaagata 409  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     ||||||||||||||     
T  34309076 ggaatgagagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatatatatcaacaagatg 34308977  T
Q  410 catcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcgga 509  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| | | ||  ||||| ||||||   ||||| |||| |||     
T  34308976 catcttcttttcggtagcctattccataagaactccacagttaagcgtgcttggcttggagcaattttgagatgggtgacctaccgggaagtttcccggt 34308877  T
Q  510 aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatc 609  Q
    |||| || ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| || ||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  34308876 aagcatgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcagcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtatc 34308777  T
Q  610 agagcag 616  Q
    |||||||    
T  34308776 agagcag 34308770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 216 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 34308715 - 34308329
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||    
T  34308715 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgataagggcggggagtggtccggctcctggcgtgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 34308616  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||| ||||||||| | | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34308615 gaatgaaagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 34308516  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| | | ||  ||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||||     
T  34308515 tcttttcggtagcctattccataagaactccacacttaagcgtgcttggcttggagcaattttgagatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagca 34308416  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    || ||||||| ||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  34308415 tgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgctggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 34308329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 8080488 - 8080193
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8080488 aatcacatcggaatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagctgataagaattgtttggtactacctatatcaaca 8080389  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||  | |||| ||||    
T  8080388 agatgcattttctttttggtagcccattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtaacctactaggaagtttc 8080289  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  8080288 tcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggccagtcgacaatgcttaaagtcgtct-ggatgttacaa 8080193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 300 - 600
Target Start/End: Original strand, 2044053 - 2044353
Alignment:
Q  300 aacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatat 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  2044053 aacagaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctatat 2044152  T
Q  400 caacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaa 499  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  2044153 caacaagatgcattttctttttggtagcccattccataataactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaatgggaa 2044252  T
Q  500 atttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttac 599  Q
     |||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||  |||| |||||||| || | |||||||||    
T  2044253 gttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtattggtttgtagggtcagtcaccaatgcttaaagtcgtttgggatgttac 2044352  T
Q  600 a 600  Q
    |    
T  2044353 a 2044353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 216 - 597
Target Start/End: Original strand, 12100602 - 12100982
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| |||| |||| | ||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||    
T  12100602 tgtaacgcctccgctcggtgtgcatgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 12100701  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
     ||||||| | ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  12100702 aaatgagaag-atcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggcaagcttataagatttgtttggtactacctatatcaataagatgcatct 12100800  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||   | |||||    
T  12100801 tcttttcggtagctcatttcataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaat-tttggatgggtgacctaccgggaagtttcctcgtaagcg 12100899  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgtt 597  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||    
T  12100900 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagtcgtatgggatgtt 12100982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 216 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 27819481 - 27819105
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcgg 315  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||   || ||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||| |    
T  27819481 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaaggctcgaggttgatgagggtaggaagtggtccgactcctggaagcttttaggcaaaaccgaatcacatcag 27819382  T
Q  316 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 415  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  27819381 aatgagagggatcatgaagtcatgcaagtatgagacttcatggttgaaggaaggctaataagaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgcatctt 27819282  T
Q  416 cttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgt 515  Q
    ||||||  |||| ||  |||||| ||||||||| |||||  || ||||||| ||||||| || |||||| ||||||| ||  || |||  | ||||||||    
T  27819281 cttttcaatagctcattccataaaaactccacagttaagtgtgtttgactttgagtagtatttggatgggtgaccttctgataagttttccagaaagcgt 27819182  T
Q  516 gcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggat 594  Q
    | ||||||| || ||||||  ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||    
T  27819181 gtgagtgaggac-aagcacactgaaaagacccgtgttgat-tgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtctaggat 27819105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 310 - 601
Target Start/End: Original strand, 17103086 - 17103378
Alignment:
Q  310 catcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagata 409  Q
    |||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |     
T  17103086 catcggaatgagagagatcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagctg 17103185  T
Q  410 catcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggat-ggctgaccttatgggaaatttctcgg 508  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| | | || |||| || ||||||   ||||| |||| |||    
T  17103186 catcttcttttcggtagctcattccataagaactccacggttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggttgacctaccgggaagtttcccgg 17103285  T
Q  509 aaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  17103286 taagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagtcgtctgggatgttacaa 17103378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 215 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 21316346 - 21315960
Alignment:
Q  215 ttgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatc 313  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |  |||||| ||||   |||||||||    
T  21316346 ttgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggcttctggcaagcatctaggaaaaattgaatcacatc 21316247  T
Q  314 ggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatc 413  Q
    |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21316246 gcgatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaatgagcgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 21316147  T
Q  414 ttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagc 513  Q
     ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | || | | || ||||||   | ||| |||| ||| ||||    
T  21316146 gtcttttcagtagctcatttcataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagtaattttggtaagggtgacctaccgcgaagtttc-cggtaagc 21316048  T
Q  514 gtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  21316047 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttacaa 21315960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 308 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 10844758 - 10844465
Alignment:
Q  308 cacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaaga 407  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  10844758 cacaccggaatgagagggttcctgaggccttgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatattaacaaga 10844659  T
Q  408 tacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcg 507  Q
    | |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | | || |||||| ||||||   ||||| |||||||    
T  10844658 tgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttctcg 10844559  T
Q  508 gaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    | |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  10844558 gtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgtttgtttgtagggtcagtcgacaatcctaaaagtcgtctgggatgttacaa 10844465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Original strand, 27925899 - 27926194
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27925899 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaaca 27925998  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||  |   ||||| ||||    
T  27925999 agatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaat-ttgggatgggtgaggtaccgggaagtttc 27926097  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||| ||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  27926098 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttacaa 27926194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 305 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 22549141 - 22548830
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22549141 aatcacaccggaatgagaggcttcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 22549042  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  22549041 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataaaaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 22548942  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     | | ||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  || | ||||||||||| ||    
T  22548941 ccagtaagcgtgcgagtgaggataaaacacgctgaacagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgttacaaatg 22548842  T
Q  605 gtatcagagcag 616  Q
    ||||||||||||    
T  22548841 gtatcagagcag 22548830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Original strand, 22026379 - 22026675
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22026379 aatcacaccggaatgagagggttcgtgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 22026478  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| | ||||   ||||| ||||    
T  22026479 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatattgggatgggtaacctatcgggaagtttc 22026578  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaac-aaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||| ||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  22026579 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 22026675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 304 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 22548696 - 22548400
Alignment:
Q  304 taatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaac 403  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22548696 taatcacaccggaatgagagggttcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagttttataagaattgtttggtactacctatatcaac 22548597  T
Q  404 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 503  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||    
T  22548596 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataataactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 22548497  T
Q  504 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    | | | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  || | ||||||||||    
T  22548496 cccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgttaca 22548400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 305 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 27022484 - 27022173
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | | || ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27022484 aatcacatcggaatgagagggatcttgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 27022385  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    | || |||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||| ||  ||||| ||     
T  27022384 acatgcatcttattttcggcagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc-tactggaaagttt 27022286  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
    | || ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  27022285 ttggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttacaaatg 27022186  T
Q  605 gtatcagagcagg 617  Q
    |||||| ||||||    
T  27022185 gtatcaaagcagg 27022173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 231 - 575
Target Start/End: Original strand, 25147892 - 25148236
Alignment:
Q  231 tggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcc 329  Q
    ||||||| |||||| |||||||  |||||||| |||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  25147892 tggtgggcatgtaacgctcgagtatgatgagggcggggagtggtttggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacataagaatgagagggatcc 25147991  T
Q  330 taaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagccc 429  Q
      | |||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  25147992 cgaggtcgtgtaggtatgggactgtgtcgttgaaggaaggcttataagaattgtttggtcttacctatatcaacaagatgcatattcttttcggtagctc 25148091  T
Q  430 aaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaa 529  Q
    |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||  || ||||||||||||  |||    
T  25148092 attccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc-cgataaacgtgcgagtgaggtcaa 25148190  T
Q  530 agcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25148191 aacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaat 25148236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 305 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 41659251 - 41658981
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41659251 aatcacaccggaatgagagggttcctgatgtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 41659152  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | | || |||| | ||||||   ||||| ||||    
T  41659151 agatgcatcttcttttcgatagctcattacataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggataggtgacctaccgggaagtttc 41659052  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
     | | ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41659051 cctgtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 41658981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 12827392 - 12827104
Alignment:
Q  313 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 412  Q
    |||||||||||||||||| | | | || ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  12827392 cggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 12827293  T
Q  413 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 512  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| |||    
T  12827292 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaag 12827193  T
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     |||||||||||   ||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  12827192 tgtgcgagtgaggttaaaacacttttaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 12827104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 227 - 470
Target Start/End: Original strand, 25144693 - 25144937
Alignment:
Q  227 cgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagaggg 325  Q
    |||||||| || |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |    
T  25144693 cgcttggtaggcatgtaacgttcgaggctgatgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcagaatgagagag 25144792  T
Q  326 atcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggta 425  Q
    |||   | |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25144793 atctcgaggtcgtgcaggtatgggattgcatgattgaaggcaggcttataagaattgtttggtactacctatatcagcaagatgcatcttcttttcggta 25144892  T
Q  426 gcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggag 470  Q
    || ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25144893 gctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggag 25144937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 305 - 555
Target Start/End: Original strand, 32292397 - 32292647
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  32292397 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactatctatatcaaca 32292496  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    || | ||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||| |||     
T  32292497 agttgcatcttctttttgctagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgatctaccgggaagtttt 32292596  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggt 555  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  32292597 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 32292647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 33852404 - 33852109
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  |   |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  33852404 aatcacaccagaatgagagggatcccgagaccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatattaaca 33852305  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaa-ttt 503  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| |||    
T  33852304 agatgtatcttctttttggtagcccattccataagaacttcacaattaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacc-tatcggaaagttt 33852206  T
Q  504 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |  |  ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||| | |||  |||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  33852205 catgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcatgttgatttgtcaggtcagacagcaatgcttaaagttgtcacggatgttaca 33852109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 383 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 31283719 - 31283487
Alignment:
Q  383 tttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggat 482  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | | || ||||    
T  31283719 tttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagtgtgcttgactttgagcaatttt-ggat 31283621  T
Q  483 ggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaa 582  Q
    || ||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | |||    
T  31283620 gggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacgcgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgttgaaa 31283521  T
Q  583 gttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 616  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31283520 gtcgtctgggatgttacaaatggtatcagagcag 31283487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 338 - 584
Target Start/End: Original strand, 41913003 - 41913249
Alignment:
Q  338 tgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccata 437  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||    
T  41913003 tgcaggtatgggactgcatgtttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgcgtcttctttttggtagcccattccata 41913102  T
Q  438 agaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgtt 537  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||  | | || ||||| || |||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  41913103 agaactccgcagttaagcgtgcttgacttgaagtagtctttggatgagtgacctactagaaagtttcttggtaagcgtgcaagtgaggacaaaacacgtt 41913202  T
Q  538 gaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 584  Q
    ||||| |||| |||| || | | |||||||||||||||  |||||||    
T  41913203 gaaaaaactcgtgttagtttatagggtcagtcgacaatgtttaaagt 41913249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 305 - 465
Target Start/End: Original strand, 10844883 - 10845043
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10844883 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 10844982  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgact 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10844983 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 10845043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 345 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 15819121 - 15818878
Alignment:
Q  345 atgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactc 444  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  15819121 atgagacaacatggttgaaggaatgcttagaaaaattgtttggtactacatatatcaacatgatgcatcttcttttcggtagcacattccataagaactc 15819022  T
Q  445 cacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaaga 544  Q
     ||| ||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  15819021 -acagttaaatttgcttgacttggagtaggctttggatgggcgaccttctgggaagtttcccgaaaagtgtgcgagtgaggacaaagcacactgaaaaga 15818923  T
Q  545 ctcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtct 589  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||    
T  15818922 cttgtgttggtttgtggggccagtcggcaatacttaaagtcgtct 15818878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 305 - 491
Target Start/End: Original strand, 28453338 - 28453524
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||    
T  28453338 aatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcaggtatgagacttcatggttgaaagaaaacttataagaattgttttatactacctatattaaca 28453437  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 491  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  28453438 agatgcatcttctttatggtagcccattccataagaactctacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacct 28453524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 216 - 415
Target Start/End: Original strand, 22705090 - 22705282
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcgg 315  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||  ||       ||    
T  22705090 tgtaacgcctccgctcggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgaggacggggagtggtcaggctcctggcagcttcaaggcaaaaccgaa-------gg 22705182  T
Q  316 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 415  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22705183 aatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactggatgattgaaggaagggttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 22705282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 305 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 6465056 - 6464872
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | | | |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6465056 aatcacattggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 6464957  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgac 489  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6464956 agatgcattttctttttggtagctcattccataacaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgac 6464872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 308 - 566
Target Start/End: Original strand, 3745104 - 3745362
Alignment:
Q  308 cacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcagg-tatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaag 406  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||     
T  3745104 cacatcgaaatgagagggatcctaaggtcgtgcaggctaag-gactacatggttgaaggaaaacttataagaactgtttagtactacctataccaacaat 3745202  T
Q  407 atacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctc 506  Q
    || ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| | |||| |||||||||| ||| | | || |||||||||||| | || ||| ||||||    
T  3745203 atgcatcttctttttggtagcccattccataataactccacagtcaagcgtgcttgacttagagcaattttgggatggctgaccatctgagaagtttctc 3745302  T
Q  507 ggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtca 566  Q
      |||||||| || ||| || ||| || | ||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  3745303 aaaaagcgtgtgaatgataataaaacatgctgaaaagactcatgttgatttgttgggtca 3745362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 315 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 27022015 - 27021904
Alignment:
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||| | | | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27022015 gaatgagagggatcctgaggccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaacaagatgcatct 27021916  T
Q  415 tcttttcggtag 426  Q
    ||||||||||||    
T  27021915 tcttttcggtag 27021904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 316 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28375189 - 28375078
Alignment:
Q  316 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 415  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  28375189 aatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctacatcaacaagatgcatctt 28375090  T
Q  416 cttttcggtagc 427  Q
    ||||||||||||    
T  28375089 cttttcggtagc 28375078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 343 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 30527589 - 30527349
Alignment:
Q  343 gtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaac 442  Q
    ||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||    
T  30527589 gtatgagactgcatgtttgaacca-gacttataagaattgtttggtaccacttacatcaataagatacatcttcttttgggtagcccatttcataagaac 30527491  T
Q  443 tccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaa 542  Q
    |||||| |||||  || ||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||    | ||| ||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  30527490 tccacagttaagattgtttgactttgagtaatctttggatgggtgatctacctgaaaacttcccggtaagcgtgcgagtgaggataaaacacgctgaaaa 30527391  T
Q  543 gactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 584  Q
    ||||| ||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  30527390 gactcgtgttgatttgtaggatcagtcgacaatgcttaaagt 30527349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 22840675 - 22840490
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |   || |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  22840675 aatcacatcggaatgagagagatcctgaggctttgtaggtatgagactacatggtcgaatgaagacttataagaattgtttggtactatctatatcaaca 22840576  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 491  Q
    |||| ||||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  22840575 agatgcatcttctttttgttagctcattccataagaactccaca-gtaatcatgcttgacttagattagtctttggatgggtgacct 22840490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 457 - 614
Target Start/End: Original strand, 32292093 - 32292250
Alignment:
Q  457 tgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggta 556  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||     
T  32292093 tgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtt 32292192  T
Q  557 tgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagc 614  Q
    ||| |||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  32292193 tgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtattagagc 32292250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 305 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 30335054 - 30334779
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||| |||| |||||    
T  30335054 aatcacatcggaattagatggatcctgagactgtgcaggtatgcgactgcaaggttgaaagaagacttataaaaattgtttgatactacctataccaaca 30334955  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||| || | ||||   || |||||||| | || | || |||| | |||| ||||| ||| ||||    
T  30334954 agatacatcttcttttcgatagctcaattcataataacttcatagttaaatgtgtttgacttgaaatattatttggataggtgacattatgagaagtttc 30334855  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaa 582  Q
     |  ||| |||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||    
T  30334854 ccataaaacgt--gagtgaaaacaaaacacgttaaaaagactcatgttgatttgtgggatcaatcgacaatacttaaa 30334779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 404 - 603
Target Start/End: Original strand, 10729722 - 10729921
Alignment:
Q  404 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 503  Q
    ||||| |||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |    
T  10729722 aagatgcatcttgttttctgttacccattccataagaactccacaattaagcgtgatagacttggagtagtcttttgatgggtgaccttatgggaaatat 10729821  T
Q  504 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagt 603  Q
    |   ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||  | ||  | || ||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  10729822 cctagaaagcgtgcgagtgtggacaaagcacgctgaaaagactcgtgttattttgaagagttagttggcaatactgaaagtcgtctaggatgttacaagt 10729921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 305 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15567702 - 15567515
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  ||| ||| |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||    
T  15567702 aatcacatcggaatgagagagatcttgacatcgcgcaagtattagacatcatggtggaaggaaggcttataagaattgtttgacactacatataccaaca 15567603  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacctt 492  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||   |||||||||||| || |||| | || ||||||||||||||| || | |||| |||||||    
T  15567602 agatacatcttctttttggtagttcatttcataagaactccgcagttaatcgtgtttgacttggagtagttttggaatggatgacctt 15567515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 395 - 575
Target Start/End: Original strand, 25307856 - 25308034
Alignment:
Q  395 tatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttat 494  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |  |    
T  25307856 tatatcaacaagatacatctttttt--ggtagcccattctgtaagaactccacagttaagcttgcttgacttggtgtagtctttggatgggtgacgtact 25307953  T
Q  495 gggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
     | || ||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| | | |||| ||||||| ||||    
T  25307954 tgaaagtttttcggcaagcgtgcgagtgaggacaaagtacgctgaaaagactcgtgttgatttatgggatcagtcggcaat 25308034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 492
Target Start/End: Original strand, 1297040 - 1297194
Alignment:
Q  338 tgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccata 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||| ||||    |||    
T  1297040 tgcaggtatgagactgcatggttgaagtaaaacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatttatattcttttcggtatcccattatata 1297139  T
Q  438 agaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacctt 492  Q
    ||||||||| | |||||  || |||||||| |||| |||| |||||  |||||||    
T  1297140 agaactccatagttaagtgtgtttgacttgaagtaatctttggatgagtgacctt 1297194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 334 - 563
Target Start/End: Original strand, 3744667 - 3744896
Alignment:
Q  334 gtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaac 433  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||| || || |||||||| |||||| ||       
T  3744667 gtcgtgtaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttgacactacctataccaacaatatgcaccttctttttggtagcacattt 3744766  T
Q  434 cataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagca 533  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |  || |||| ||| | | || |||| | ||||  | || ||| |||||| ||||| |||  | |||||||||| ||    
T  3744767 cataagaactctacaattaagctttattaactttgagcaattttgggattggtgactatttgagaagtttctcagaaagtgtgttaatgagaacaaaaca 3744866  T
Q  534 cgttgaaaagactcatgttggtatgtgggg 563  Q
    |  ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3744867 cactgaaaagactcgtgttggtttgtgggg 3744896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 502 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 6463493 - 6463394
Alignment:
Q  502 ttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttgg-tatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6463493 ttctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttttttagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctaggatgttaca 6463394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 810 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 17916861 - 17916746
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 909  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||  ||||||||| || | |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| | |||    
T  17916861 ttccattccttctgcaatgatttacattaagaataacaacttttaactaattccaacttccaatcttcagactctgatgaactccagcttctgacggtct 17916762  T
Q  910 tcagactctctgatga 925  Q
    | ||||||||||||||    
T  17916761 ttagactctctgatga 17916746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 361
Target Start/End: Original strand, 9250913 - 9251057
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcgg 315  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||| | ||||| |||  || ||||||||||  ||||||||| |    
T  9250913 tgtaacacctccgcttggtggatatgtaacgttcgaggctgatgaaggcgaggagtggtctgcctcctagcaacttttaggcaaaaccgaatcacatcag 9251012  T
Q  316 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttg 361  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||| |||||||||||||    
T  9251013 aatgagagggatcctgaag-cctagaggtatgggactgcatggttg 9251057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 435 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 15568025 - 15567854
Alignment:
Q  435 ataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcac 534  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||  ||| | | || |||||| |||  || | |||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||    
T  15568025 ataagaactccacaattaagcgtacttgactcagagcaattttgggatgggtgaatttctaggaagtttctcggaaaatgtgagagtgaggacaaaacac 15567926  T
Q  535 gttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggt 606  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  15567925 gttaaaaagacccgtgttagtatgtggggccagtcggcaatacttaaagtcgtctgagatattacaagtggt 15567854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 814 - 912
Target Start/End: Original strand, 12194020 - 12194118
Alignment:
Q  814 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttca 912  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  12194020 attccctctacaatgatgtgtcttcagaataacaaactttaactaactgtagtttccagtcttcaaactctgatgaacttcagcttctgaggatcttca 12194118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 814 - 912
Target Start/End: Original strand, 12438448 - 12438546
Alignment:
Q  814 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttca 912  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  12438448 attccctctacaatgatgtgtcttcagaataacaaactttaactaactgtagtttccagtcttcaaactctgatgaacttcagcttctgaggatcttca 12438546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 581
Target Start/End: Original strand, 6466686 - 6466982
Alignment:
Q  279 ctcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataaga 378  Q
    |||||| ||| ||| ||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| || |    |||| ||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||| |    
T  6466686 ctcctgacagcttccaggcaaacca-aatcatatcagaatgagagggattctgagactgtgcgggtatggaactgcatggttaaagga-gacttataaaa 6466783  T
Q  379 attttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtctta 478  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||  ||||| |   |||||||||| || |||||||  | |||||||||||| | | ||     
T  6466784 attgtttggtactacctataccaacaagatgcatctt--tttca-tagcc-atttcataagaactacaaatttaagtgtacttgacttggagcaattttg 6466879  T
Q  479 ggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattct 578  Q
    | |||| ||||||| | |||| |||    |||||| | ||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  6466880 gtatgggtgaccttcttggaagttttctagaaagcatacgagtgaaaacaaagcacactaaaaaaactcatgttggtttgtggggtcagtcggcaatgct 6466979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 408
Target Start/End: Original strand, 17429501 - 17429603
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |   ||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17429501 aatcacatcggaatgagagg-atcttgagaccgtgcatatatgtgactgcattgttgaaggaagacttatgagtattatttggtactacctatatcaaca 17429599  T
Q  405 agat 408  Q
    ||||    
T  17429600 agat 17429603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 10729736 - 10729614
Alignment:
Q  401 aacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaa 500  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||| |||||  |||||| |||| || | | || ||||| |||||||||||| ||     
T  10729736 aacaagatgcatcttctttttggtagcctattccataaggactccacaattaagggtgcttggcttgaagcaattttgggatgactgaccttatggaaag 10729637  T
Q  501 tttctcggaaagcgtgcgagtga 523  Q
    ||||  | |||||||||||||||    
T  10729636 tttcatgaaaagcgtgcgagtga 10729614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 29971547 - 29971450
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaa 402  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||  ||||||||    
T  29971547 aatcacatcagaattggaaggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttgatactatctatatcaa 29971450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 36968503 - 36968438
Alignment:
Q  343 gtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagat 408  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  36968503 gtatgaaactgtatggttgaaggatgacttataagaattgattggtgctacttatatcaacaagat 36968438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31283432 - 31283365
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcct 283  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  31283432 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggagagtggtccggctcct 31283365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 584
Target Start/End: Original strand, 34688044 - 34688115
Alignment:
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 584  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||| ||||||||    
T  34688044 cgtgcgaatgaggacaaaacacgttgaaaagactcatgttggtttgtaggaccagtggacaatacttaaagt 34688115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 15568100 - 15568036
Alignment:
Q  356 tggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 420  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||    
T  15568100 tggttgaaggaagacttataacaattgtttggtatgacctatatcaacaagatgcatcttttttt 15568036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 305 - 369
Target Start/End: Original strand, 25307765 - 25307829
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagg 369  Q
    |||||||  |||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25307765 aatcacactggaatgagagcgattccaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaagg 25307829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 174; Significance: 4e-93; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 216 - 601
Target Start/End: Original strand, 9351973 - 9352358
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcgg 315  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  9351973 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcagcttctaggcaaaacataatcacatcga 9352072  T
Q  316 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 415  Q
    ||||||||||||||| | |  ||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  9352073 aatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaagggagacttataatatttgtttggtactacctatataaacaagatgcatctt 9352172  T
Q  416 cttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgt 515  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||    |||| |||||||| ||||||    
T  9352173 cttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctacctggaagtttctcggtaagcgt 9352272  T
Q  516 gcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    ||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||| |||||||    
T  9352273 gcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggacgttacaa 9352358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 249 - 616
Target Start/End: Original strand, 7911821 - 7912189
Alignment:
Q  249 cgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatg 347  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||     
T  7911821 cgaggctgatgagagcggggagtggtccgactcctggcatgtttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagggatctcgaggccgtgcaggtata 7911920  T
Q  348 agactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccac 447  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  7911921 ggactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccac 7912020  T
Q  448 atttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactc 547  Q
    | ||| || |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   |||||  ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||     
T  7912021 agttatgcttgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagattctcggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactt 7912120  T
Q  548 atgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 616  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7912121 gtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtatcagagcag 7912189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 216 - 569
Target Start/End: Original strand, 13492699 - 13493054
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||    
T  13492699 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatatcg 13492798  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13492799 gaatgagaaggatcctgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 13492898  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | | || |||||| ||||||   || || || | ||| |||||    
T  13492899 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttagagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagttacccggtaagcg 13492998  T
Q  515 tgcgagtgagaac-aaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtc 569  Q
    |||||||||| || ||| || | ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  13492999 tgcgagtgaggacaaaaacatgctgaaaagactcgtgttgatttgtagggtcagtc 13493054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 216 - 470
Target Start/End: Original strand, 16519879 - 16520133
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcgg 315  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16519879 tgtaacgcctccacttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcagcttctaggcaaaacagaatcacatcgg 16519978  T
Q  316 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 415  Q
    ||||||||||||||| | |  ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16519979 aatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaaggaaggcttatgagatttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 16520078  T
Q  416 cttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggag 470  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16520079 cttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggag 16520133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 17027677 - 17027381
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17027677 aatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 17027578  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  17027577 agattcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 17027478  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  17027477 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 17027381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 228 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 17731337 - 17730960
Alignment:
Q  228 gcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagaggga 326  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17731337 gcttggtgggcatgtaacgcctgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcggaatgagaggga 17731238  T
Q  327 tcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagata----catcttcttttcg 422  Q
    |||| | | ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  17731237 tcctgaggccgttcaggtatgggactgcatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatagatgcatcttcttttcg 17731138  T
Q  423 gtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtg 522  Q
    ||||| ||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||  ||| | ||||||   || || ||| |||| |||||||| ||||    
T  17731137 gtagctcattctttaagaactccacatttaagcgtgcttgacttggagcaattttgagataggtgacctaccggaaagtttatcggtaagcgtgcaagtg 17731038  T
Q  523 agaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    || ||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  17731037 aggacaaaacacgctaaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatcctgagagtcgtctaggatgttaca 17730960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 23986463 - 23986168
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  23986463 aatcacatcggaatgagagggatccggaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctatatgaaca 23986364  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| | | || |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  23986363 agatgcatcttcttttcggtagctcaaaccataagaacttcacagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccttctgggaagtttc 23986264  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||    
T  23986263 acggaaagcgtgcgagtgaggagaagacacgctgaaaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcggcaattctgaaagcagtatgggatgttaca 23986168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 231 - 575
Target Start/End: Original strand, 7912235 - 7912580
Alignment:
Q  231 tggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcc 329  Q
    ||||||| |||||| || ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  7912235 tggtgggcatgtaacgcccgacgcagatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagggatct 7912334  T
Q  330 taaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagccc 429  Q
      | | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  7912335 cgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaaacttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttcttttcggtagctc 7912434  T
Q  430 aaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaa 529  Q
    |  |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| | | || | |||| ||||||  |||||| |||| ||  |||||| |||||||| ||||    
T  7912435 attccataagaactccatagttaaacgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctgctgggaagtttcccgttaagcgtacgagtgaggacaa 7912534  T
Q  530 agcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  7912535 aacacgctgaaaagactcatgttggtttgtggggttagtcggcaat 7912580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 305 - 575
Target Start/End: Original strand, 20850321 - 20850591
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  20850321 aatcacaccggaatgagagggttcatgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttttgtactacctatatcaaca 20850420  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20850421 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactctacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20850520  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20850521 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 20850591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 313 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 2720702 - 2720419
Alignment:
Q  313 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 412  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  2720702 cggaatgagagggatcccaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaagacacat 2720603  T
Q  413 c-ttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaa 511  Q
    | || |||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  |||||| |||| ||  ||    
T  2720602 ctttttttttggtagctcattccataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacatattgggaagtttcccgataa 2720503  T
Q  512 gcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgt 596  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||| ||  |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  2720502 gcgtgcgagtgagaacaaaacacgctgagaagactcgtgtcggtttgcagggtcagtcggcaatgctt-aagtagtctaggatgt 2720419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 216 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13191749 - 13191389
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||| | | ||| ||| |||||  ||||||||||    
T  13191749 tgtaatgcctccgcttggtgggcatgtaacgcctgaggctgatgagggcggcgagtagtccggctcttggtatgcttcgaggaaaaactaaatcacatcg 13191650  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    ||||||||||||||||||     || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13191649 gaatgagagggatcctaagactatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 13191550  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | | ||  ||||| |||||    ||||| |||| ||  |||||    
T  13191549 tcttttcggtagctcgttccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgagatgggtgaccaaccgggaagtttcccgataagcg 13191450  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    |||||||||| |||||  ||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13191449 tgcgagtgaggacaaaatacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 13191389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 20126328 - 20126033
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  20126328 aatcacatcggaatgagagggatcctaaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaatggtttgatactacctatatcaaca 20126229  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||     ||| ||||    
T  20126228 agatgcatcttctttttggtagcacattccataagaattccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtctttgaatgggcgacctacctagaagtttc 20126129  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     | | ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  20126128 ccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtagggtccgtcgacaatgcttaaagtcgtctgggacgttaca 20126033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 20896834 - 20896538
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20896834 aatcacatcggaatgagagggatccttaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20896735  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| | | || |||||| ||||||   ||||||||||    
T  20896734 agatgcatcttcttttcagtagctcattccataagaactccacggttaagcgtgcttggcttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaatttc 20896635  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtga-gaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||| ||| |||||||||| ||  ||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||  | ||||  |||| ||||||||||    
T  20896634 ccggtaagtgtgcgagtgaggagaaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccggcaatcttgaaagcagtctgggatgttaca 20896538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 269 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9441037 - 9440693
Alignment:
Q  269 agtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaag 368  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||   |||||||||||  ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||     
T  9441037 agtggtccggctcctggcagcttctaggcaaaactgaatcacatcaaaatagaagggatcctaa--tcgtgcaggcatggaactacatggttgaaggaat 9440940  T
Q  369 gcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttgg 468  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||| |    
T  9440939 gcttataagaattctttggtactacttttatcaacaagatgcattttcttttcagtagcccaaaccataagaacttcacagttaagtgtgtttgactttg 9440840  T
Q  469 agtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagt 568  Q
    || | | || |||||| ||||||| | |||| |||| || |||  |||| |||||  |||||  ||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  9440839 agcaattttgggatgggtgaccttcttggaagtttcccgaaaaatgtgcaagtgatgacaaaatacgctgaaaaaactcgtgctggtttgtggggtcagt 9440740  T
Q  569 cgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 615  Q
    || ||||  | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9440739 cggcaatcttgaaagcagtctgggatgttacaagtggtatcagagca 9440693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 337 - 600
Target Start/End: Original strand, 21312003 - 21312266
Alignment:
Q  337 gtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccat 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||    
T  21312003 gtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagcccatttcat 21312102  T
Q  437 aagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgt 536  Q
    ||||| |||| | |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||   ||||| |||| ||| ||| |||  |||||  ||||| ||| |    
T  21312103 aagaaatccatagttaaacgtgcttgacttggagcagtcttatgatgagtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgtaagtgaagacaaaacacat 21312202  T
Q  537 tgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  21312203 tgaaaagactggtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 21312266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 305 - 613
Target Start/End: Original strand, 17850918 - 17851226
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||| ||||||  | ||||||||||| | ||||||||    
T  17850918 aatcacaccggaatgagagggatcctgaggtcgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaatgctgataagatatgtttggtactacctttatcaaca 17851017  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  |||||| ||||    
T  17851018 agatgcatcttctttctggtagcccattctataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtcttcggatgggagacctactgggaagtttc 17851117  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
       | | |||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||| || ||||  | |||||||||||    
T  17851118 ctagtacgcgtgcgagttaggacaaaacaagtcgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcaatcggcaatacttaatgtcgtctgagttgttacaagtg 17851217  T
Q  605 gtatcagag 613  Q
    |||||||||    
T  17851218 gtatcagag 17851226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 283 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 9440477 - 9440255
Alignment:
Q  283 tggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattt 382  Q
    |||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  9440477 tggcagcttctagggaagaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaatgaaagcttataagaattg 9440378  T
Q  383 tttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggat 482  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| | | || ||||    
T  9440377 ttcggtactacttatatcaacaagatgcattttcttttcggtagctcactccataagaacttcacagttaagtgtgcttgatttggagcaatttttggat 9440278  T
Q  483 ggctgaccttatgggaaatttct 505  Q
    || |||||||||||||| |||||    
T  9440277 gggtgaccttatgggaagtttct 9440255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 305 - 614
Target Start/End: Original strand, 21311515 - 21311824
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | | ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || || ||||    
T  21311515 aatcacatcggaatgagagggttcatgaggccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaagccttataagaattgtttggtattacctagataaaca 21311614  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||   ||||  |||     
T  21311615 agatccatcttctttttggaagctcattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgactttgagtagtcttatgatgggtgacctaccgggatgtttt 21311714  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||||| |||| || || ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  21311715 ccggtaagtgtgcgagtgaagacaaaacacgctgtaaggactcgtgttggtttgtagggtcaatcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttacaaatg 21311814  T
Q  605 gtatcagagc 614  Q
    |||| |||||    
T  21311815 gtattagagc 21311824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 336 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 2890954 - 2890714
Alignment:
Q  336 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaacca 435  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||  |||    
T  2890954 cgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttataagaattgttagggactacctatatcaaaaagatgcttcttcttttcagtagcccattcca 2890855  T
Q  436 taagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacg 535  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||  |||||||| ||||||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2890854 taagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaaatagtactaggatgggtgacctactgagaagtttcccgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacg 2890755  T
Q  536 ttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaatt 576  Q
     | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2890754 ctaaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatt 2890714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 2681362 - 2681071
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||| |||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  2681362 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtttgggactgcatggttgaatgaagacttataagaattgtttggtactacccatatcaaca 2681263  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||  | | || |||||| | ||    |||||| ||||    
T  2681262 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacaattaagcgtgcttaatttggaacaattttgggatgggttac----tgggaagtttc 2681167  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
       | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  2681166 ctagtaagcgtgcaagtgaggacaaaacacgttgagaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagctgtctgggatgttaca 2681071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 305 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 6331058 - 6330872
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6331058 aatcacatcggaatgagatggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 6330959  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 491  Q
    | || |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    
T  6330958 atatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagtattcttatgattggtgacct 6330872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 366 - 615
Target Start/End: Original strand, 13492393 - 13492643
Alignment:
Q  366 aaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgact 465  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13492393 aaggcttataagaattgtttgatattacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctaattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 13492492  T
Q  466 tggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtga-gaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggt 564  Q
    ||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13492493 tggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccagtaagcgtgcgagtgaggaaaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggt 13492592  T
Q  565 cagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 615  Q
    |||||| ||||  | ||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13492593 cagtcggcaatcttgaaagcagtctagggtgttacaaatggtatcagagca 13492643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 313 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14771857 - 14771595
Alignment:
Q  313 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 412  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14771857 cggaatgagagggatcccgaagccgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatccat 14771758  T
Q  413 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 512  Q
     ||||||| ||||  | |  |||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||  | |||| |||  | | ||     
T  14771757 attctttttggtaatctattccataagaactccacagttaagtgtgctagacgtggagtagtctttggatgagtgacctactcggaagtttaccagtaaa 14771658  T
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    ||| |||| ||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  14771657 cgtacgagcgaggacaaaacacgctgataagactcatgttggtttgtagagtcagtcgacaat 14771595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 341 - 491
Target Start/End: Original strand, 11062321 - 11062471
Alignment:
Q  341 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 440  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  11062321 aggtatgaaactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgttttgtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataaga 11062420  T
Q  441 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 491  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  11062421 actccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacct 11062471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 305 - 484
Target Start/End: Original strand, 17851374 - 17851553
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||||||    
T  17851374 aatcacaccggaatgagagggatcccgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaaggcttataagatatgtttggtactacctttatcaaca 17851473  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatgg 484  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17851474 agatgcatcttctttttggtagcccattctataagaactccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtcttcggatgg 17851553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 313 - 601
Target Start/End: Original strand, 23776449 - 23776736
Alignment:
Q  313 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 412  Q
    |||||||||||| ||||| | | | || ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  23776449 cggaatgagaggtatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaatcgtctggtactacctatatcaacaagatgcat 23776548  T
Q  413 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 512  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| ||||   | ||     
T  23776549 cttcttttcggtagctcatttcataagaacttcaca-ttaagcgtacttgacttggagcaattttgggatggatgacctactgggaagtttcctagtaaa 23776647  T
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
    |||||||||||  ||||| |||| |||||||| || ||||||| ||||| |||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  23776648 cgtgcgagtgacgacaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgtggagtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 23776736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 440 - 616
Target Start/End: Original strand, 3652658 - 3652834
Alignment:
Q  440 aactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttga 539  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||  | | |||    
T  3652658 aactccacagttaagcttgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagcttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaaaagctga 3652757  T
Q  540 aaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagcag 616  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  3652758 aaagactcttgttggtttgtagggtcagttgacaatgcttaaagttgtctgagatgttacaattggtatcagagcag 3652834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 265 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 9440614 - 9440486
Alignment:
Q  265 ggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaag 364  Q
    ||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  9440614 ggggagtggtccggctctttgcagcttctagggaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgggacttcatggttgaat 9440515  T
Q  365 gaaggcttataagaattttttggtactac 393  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9440514 gaaggcttataagaattgtttggtactac 9440486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 305 - 445
Target Start/End: Original strand, 27334161 - 27334301
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27334161 aatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 27334260  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactcc 445  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  27334261 agatgaatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 27334301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 305 - 445
Target Start/End: Original strand, 27394901 - 27395041
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27394901 aatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 27395000  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactcc 445  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  27395001 agatgaatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 27395041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 305 - 453
Target Start/End: Original strand, 3652486 - 3652634
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  3652486 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtctgatactacctatatcaaca 3652585  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 453  Q
    |||| ||||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||| ||||    
T  3652586 agatgcatcttctttttggtagttcattccataagaactccacagttaa 3652634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 339 - 614
Target Start/End: Original strand, 1991587 - 1991862
Alignment:
Q  339 gcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataa 438  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||    
T  1991587 gcaggtatgagactacatggttggaagaaggcttacaagaattgtttggtattacatatctaaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataa 1991686  T
Q  439 gaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttg 538  Q
    ||||| |||| |||| |||  |||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||  || |||  || ||||| || ||||||  |||||| ||| ||    
T  1991687 gaacttcacagttaaacattattgatttggagtagtttttggatgggtgaccttctgaaaagttttccgaaaagcatgtgagtgaagacaaagtacgctg 1991786  T
Q  539 aaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagc 614  Q
    |||| |||| ||||| | |||||| |||||| |||||  |||||||   ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  1991787 aaaaaactcgtgttgatttgtgggatcagtcaacaatatttaaagtcaactgagatgttacaagtggtattagagc 1991862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 307 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 28065982 - 28065687
Alignment:
Q  307 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaag 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  28065982 tcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtgtagaaatgagactgtatgattgaatgaaagcttataagaattgtttggtactatctctatcaacaag 28065883  T
Q  407 atacatc---ttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 503  Q
    || ||||   || |||| ||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| ||  ||||| | |||||  | ||| |||    
T  28065882 atgcatctttttttttttggtagcttattccataagaactccacaattaagcatgtttgactttgagcagttttgtgatgggtaacctttcgagaagttt 28065783  T
Q  504 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    | || |||||||| || |||  ||||| |||| | ||||  ||||||||||  |  ||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  28065782 c-cgaaaagcgtgtgaatgatgacaaaacacgctaaaaaatctcatgttggattacggggtcaatcgacaatacttaaagttgtctgcgatgttaca 28065687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 279 - 420
Target Start/End: Original strand, 32292859 - 32293000
Alignment:
Q  279 ctcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataaga 378  Q
    |||||||||  ||||||||||| || | |||||| ||||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32292859 ctcctggcatcttctaggcaaaccaaattcacattggaatgagagaaatccttagatcgtgcaggtatgagactgcatggttgaatgaaggcttataaga 32292958  T
Q  379 attttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 420  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  32292959 attgtttggtactacctataccaacaaaatacatcttgtttt 32293000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 336 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 33775119 - 33774915
Alignment:
Q  336 cgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagata--catcttcttttcggtagcccaaac 433  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||| | ||| |||  |    
T  33775119 cgtgcaagtatgtgaccgcatggttgaaggaaggattataagaattgtctggtgctacctatatcaacaagagatgcatcttctttttgatagtccattc 33775020  T
Q  434 cataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagca 533  Q
    ||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||| |||||| ||||||  || ||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||    
T  33775019 cataagaactccacagttaagtgtgtttgacttgcagtagtctttggatgggtgacctactgagaagtttttcggtaagcgtgcgagtgaggaaaaaaca 33774920  T
Q  534 cgttg 538  Q
    |||||    
T  33774919 cgttg 33774915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 305 - 455
Target Start/End: Original strand, 15929582 - 15929732
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||| | | || | ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15929582 aatcacatcagaataagagagatcctaatgccttgtatgtattggactacatggttgaatgaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaaca 15929681  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagc 455  Q
    | || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  15929682 aaatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagc 15929732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 341 - 575
Target Start/End: Original strand, 20735731 - 20735965
Alignment:
Q  341 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 440  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | |||| |    
T  20735731 aggtatgtgactacatgattgtaggaaggcttataagaattgtttgatactacttatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagtccattctataaaa 20735830  T
Q  441 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 540  Q
    |||||| | |||||  || ||| |||||||||| ||| |||||| | |||||   |||| ||||  ||||||| ||| | |||| ||||| |||| | ||    
T  20735831 actccatagttaagtgtggttggcttggagtagcctttggatgggtaaccttcaaggaagtttccaggaaagcatgcaattgaggacaaaacacgctaaa 20735930  T
Q  541 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    ||||||   || ||| |||||||||||| ||||||    
T  20735931 aagacttgcgtcggtttgtggggtcagttgacaat 20735965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 305 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31821838 - 31821716
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  31821838 aatcacatcggaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattatttggtactaactatatcaaca 31821739  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagc 427  Q
    |||| |||||| |||| ||||||    
T  31821738 agatgcatcttttttttggtagc 31821716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 342 - 587
Target Start/End: Original strand, 17205376 - 17205620
Alignment:
Q  342 ggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaa 441  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  17205376 ggtatgaaactgcatgattgaatgaagaattataagaattgtttggtactacctttaccaacaagattcatcttgtttt-ggtagcccattccataagaa 17205474  T
Q  442 ctccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaa 541  Q
    |||||   |||| ||||||||| |||||||| | || ||||||  ||||||   | || ||| ||||||| | |||||||||||||||| |||   ||||    
T  17205475 ctccattgttaaacatgcttgatttggagtaattttgggatgggagacctttatgaaagtttttcggaaaacatgcgagtgagaacaaaacacaccgaaa 17205574  T
Q  542 agactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgt 587  Q
    ||||||  |||| | || ||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  17205575 agactcgcgttgatttgcgggattagtcggcaattctcaaagttgt 17205620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 340 - 477
Target Start/End: Original strand, 20732613 - 20732750
Alignment:
Q  340 caggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataag 439  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| |||||||||||||||||  | ||||     
T  20732613 caggtatgtgactacatggttgtaggaaggcttataagaattatttggtactacctatattaataatatgcatattcttttcggtagcccattcaataaa 20732712  T
Q  440 aactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtctt 477  Q
    ||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  20732713 aactctacggttaagagtgcttgacttggagtagtctt 20732750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 600
Target Start/End: Original strand, 28780209 - 28780405
Alignment:
Q  404 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 503  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||    
T  28780209 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 28780308  T
Q  504 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
       || ||| ||||||||||| | ||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  28780309 tctggtaagtgtgcgagtgaggataaaacattttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 28780405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 433 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 31416106 - 31415943
Alignment:
Q  433 ccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagc 532  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||| || |||| || ||||||  || ||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||| ||||| |    
T  31416106 ccataagaactccacaattaagcgtgtttgacttagattagttttgggatggacgatcttatggaaagtttctcgaaaaacgtgtgagtgaggacaaaac 31416007  T
Q  533 acgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgtt 597  Q
    ||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  31416006 acgctgaaaaga-tcgtgttggtttgtgggatcagtcggcaatacttaaagttgtctagaatgtt 31415943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 305 - 570
Target Start/End: Original strand, 12194330 - 12194592
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |   ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||    
T  12194330 aatcacattggaatgagaggaatcctgagaccgtgcagatatga-actgcatgattgaagaaagacttataa-atttttttggcactatctatatcaaca 12194427  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||   ||   ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | | ||||||||| ||||||| | | || |||     
T  12194428 agatgcatcttcttttttataattcattccataagaactccacagttaagcatgtttgacatggagcaattttaggatggatgaccttttagaaagtttt 12194527  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcg 570  Q
     | |||| |||| ||||  | ||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12194528 ccagaaaacgtgtgagtttggacaaaacacactgaaaagactcatgttggt-tttggggtcagtcg 12194592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 305 - 575
Target Start/End: Original strand, 28582964 - 28583234
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||||||||   || ||||  |||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||    
T  28582964 aatcacatcggaatagaagtgatctaaaagtcgtgcaggtat-agattgtatggttgaatgaaggcttataagaattatttgatacgatctatatcaaca 28583062  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttgg-agtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 503  Q
    |||| |||| ||||| ||||||  ||  ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| ||| | ||||||| | |||  | || || ||| || |||    
T  28583063 agatgcatcatctttccggtagttcattccataagaaatccacagctaagtgtccttgacatggaattagtctttgtatgagttactttctggaaagttt 28583162  T
Q  504 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    | | ||||||||| ||||| | ||||| ||   |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  28583163 cccagaaagcgtgtgagtggggacaaaacatactgaaaagactcatgttagtttgtggggtcagtcggcaat 28583234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 404 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 2891340 - 2891161
Alignment:
Q  404 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 503  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||||  |||||| ||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  |  ||  |||    
T  2891340 aagatgcatctttgttttggtagcccattccataaaaactccacagttaaatgtgcttgatttggagtagtctttggatgggtgacctactacgatgttt 2891241  T
Q  504 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagt 584  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  2891240 c-cggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagt 2891161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 810 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 14325404 - 14325284
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctc 908  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||| | ||    
T  14325404 ttccattcattctgcaatcatatgtattcagaataacaacatttaactaacttcagcttctagtcttcagactttgatgaactttagcttctgatggttc 14325305  T
Q  909 ttcagactctctgatgatgtc 929  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  14325304 tttagactttctgatgatgtc 14325284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 810 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 14418414 - 14418294
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctc 908  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||| | ||    
T  14418414 ttccattcattctgcaatcatatgtattcagaataacaacatttaactaacttcagcttctagtcttcagactttgatgaactttagcttctgatggttc 14418315  T
Q  909 ttcagactctctgatgatgtc 929  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  14418314 tttagactttctgatgatgtc 14418294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 340 - 566
Target Start/End: Original strand, 10964339 - 10964564
Alignment:
Q  340 caggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataag 439  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| || ||||||| ||||||  || ||||||     
T  10964339 caggtatgagactgtatggtagaagaaagacttacaagaattgtttggtactacatatatcaataaaataaatattctttttggtagcttaatccataaa 10964438  T
Q  440 aactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttga 539  Q
    |||||||||  ||||  |  |||| ||||| |  | ||||||||  |||||||||| ||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||| ||  |  |    
T  10964439 aactccacaaataagtgtatttgagttgga-tcattttaggatgattgaccttatgagaagtttttcgaaaagtgtgcaagtgagaacaaaccatataaa 10964537  T
Q  540 aaagactcatgttggtatgtggggtca 566  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  10964538 aaagactcatattggtttgtagggtca 10964564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 341 - 444
Target Start/End: Original strand, 15929235 - 15929338
Alignment:
Q  341 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 440  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  15929235 aggtatgagactacaaggttgaagaaaagcttataagaattgtttggtaatgcctatatcaataagatgcatattcttttcggtagctcattccataaga 15929334  T
Q  441 actc 444  Q
    ||||    
T  15929335 actc 15929338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 836 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 10704563 - 10704474
Alignment:
Q  836 ttcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcagactctctgatga 925  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  10704563 ttcaaaataacaaactttaactaactgcagcttccagtcttcagactttgatgaacttcagcttctggggatcttcagactctctgatga 10704474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 363
Target Start/End: Original strand, 13490055 - 13490179
Alignment:
Q  240 tgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgt 338  Q
    ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| | | |  ||    
T  13490055 tgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtccggctcctgacatgcttctaggaaaaacttaatcacatcgaaatgagagagatcatgaggctgt 13490154  T
Q  339 gcaggtatgagactgcatggttgaa 363  Q
    ||||||||  |||||||||||||||    
T  13490155 gcaggtataggactgcatggttgaa 13490179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 810 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 18172061 - 18171945
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctc 908  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| || | ||||||||||| |||||| |||| | |     
T  18172061 ttccataccttctgcaatcatatgcattcagaataacaacatttaactaacttcagctttcagtctccagattctaatgaactccagcttttgatggtta 18171962  T
Q  909 ttcagactctctgatga 925  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18171961 ttcacactctctgatga 18171945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 810 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 24718770 - 24718654
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctc 908  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| || | ||    
T  24718770 ttccattccatcagcaatcatatgcattcagaaaaagaacatttaactaacttcagcttacagtcttcagactctgatgaactccagcttctaatggttc 24718671  T
Q  909 ttcagactctctgatga 925  Q
    |||||||||||||||||    
T  24718670 ttcagactctctgatga 24718654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 307 - 377
Target Start/End: Original strand, 3652981 - 3653051
Alignment:
Q  307 tcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataag 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3652981 tcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactgcatggttgaacgaaggcttataag 3653051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Original strand, 9441061 - 9441135
Alignment:
Q  316 aatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtac 390  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9441061 aatgagaggaatcctaaagccgtgcagatatgtgactacatgattgaaggaaagcttataagaattgtttggtac 9441135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 334 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 30729956 - 30729864
Alignment:
Q  334 gtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtag 426  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||| |||| ||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||| |||||    
T  30729956 gtcgtgcaagtatgagacagcatggttgaaggaggactcataaaaattgtttggtactacgtatataaacatgattgatcttcttttgggtag 30729864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3885194 - 3885123
Alignment:
Q  344 tatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatctt 415  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  3885194 tatgagactgcatagttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacatatactaacaaaatacatctt 3885123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 508 - 615
Target Start/End: Original strand, 15929342 - 15929449
Alignment:
Q  508 gaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggta 607  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  ||| | ||||||||  ||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  15929342 gaaagcgtgtgagtgaggacaaaatacgctaaaaagacttgtgttgatttgtggggtcactcggcaatccttaaagcagtctgggatgttacaagtggta 15929441  T
Q  608 tcagagca 615  Q
    ||| ||||    
T  15929442 tcaaagca 15929449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 851 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 24728552 - 24728477
Alignment:
Q  851 tttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctcttcagactctctgatga 925  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  24728552 tttaactaacttcagcttccagtcttcagactctgatgaactccagcttctgatggttcttgagactctctgatga 24728477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 517 - 575
Target Start/End: Original strand, 27334305 - 27334363
Alignment:
Q  517 cgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  27334305 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaat 27334363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 517 - 575
Target Start/End: Original strand, 27395045 - 27395103
Alignment:
Q  517 cgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  27395045 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaat 27395103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 532 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 21719324 - 21719256
Alignment:
Q  532 cacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||   ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21719324 cacgttgaaaatacttatgttggtttggtaggtcagtcgtcaatacttaaagttgtttaggatgttaca 21719256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 532 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 21727160 - 21727092
Alignment:
Q  532 cacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||   ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21727160 cacgttgaaaatacttatgttggtttggtaggtcagtcgtcaatacttaaagttgtttaggatgttaca 21727092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 491 - 582
Target Start/End: Original strand, 1663993 - 1664084
Alignment:
Q  491 ttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaa 582  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||  | | | |||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||    
T  1663993 ttatgagaagtttcttagaaagcgtgcgagtgagaacaaaatatgctaaaaagattcatgttggtttgtctggtcaatcgacaatacttaaa 1664084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 814 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 16462674 - 16462575
Alignment:
Q  814 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcag 913  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||   ||| |||| |||||  |||||||| |||||||    
T  16462674 attccttctgtaatgatgtccattcagaataacaaaatttaactaacttcagcttccaatcttcaacttctgatgatcttcaaattctgatgatcttcag 16462575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 600
Target Start/End: Original strand, 21312470 - 21312533
Alignment:
Q  537 tgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  21312470 tgaaaagactggtgttggtttgtagggtcagtcgacaatggttaaagtcgtctgggatgttaca 21312533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 814 - 903
Target Start/End: Original strand, 13145257 - 13145347
Alignment:
Q  814 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagt-cttcatactctaatgaacttcagcttctga 903  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |||  |||||  ||||| ||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13145257 attccttctgcaatgatgtgtctttagagaaacaaactttaagtaacagcagcttccagttcttcagactctaatgaacttcagcttctga 13145347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 817 - 915
Target Start/End: Original strand, 24398786 - 24398884
Alignment:
Q  817 ccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcagac 915  Q
    |||||||||||||| ||  || ||||||||||  |||||||||||  ||||||    || || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  24398786 ccttctgcaatgatgtgtcttgagaataacaaactttaactaactgcagcttcttaactacagactctaatgaacttcagactctgatggtcttcagac 24398884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 810 - 875
Target Start/End: Complemental strand, 23006084 - 23006019
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtct 875  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||    
T  23006084 ttccataccttttgcaatcatatgcattcagaataacaacatttaactaacttcagcttctagtct 23006019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 810 - 875
Target Start/End: Original strand, 23782282 - 23782347
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtct 875  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||    
T  23782282 ttccataccttttgcaatcatatgcattcagaataacaacatttaactaacttcagcttctagtct 23782347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 6e-86; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 305 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 20054682 - 20054373
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20054682 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20054583  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20054582 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20054483  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  20054482 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 20054383  T
Q  605 gtatcagagc 614  Q
    ||||||||||    
T  20054382 gtatcagagc 20054373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 305 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 20055138 - 20054829
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20055138 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20055039  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20055038 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20054939  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  20054938 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 20054839  T
Q  605 gtatcagagc 614  Q
    ||||||||||    
T  20054838 gtatcagagc 20054829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 305 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 20055594 - 20055285
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20055594 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20055495  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20055494 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20055395  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  20055394 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 20055295  T
Q  605 gtatcagagc 614  Q
    ||||||||||    
T  20055294 gtatcagagc 20055285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 305 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 20056050 - 20055741
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20056050 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20055951  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20055950 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20055851  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  20055850 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 20055751  T
Q  605 gtatcagagc 614  Q
    ||||||||||    
T  20055750 gtatcagagc 20055741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 305 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 20056506 - 20056197
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20056506 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20056407  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20056406 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20056307  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  20056306 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 20056207  T
Q  605 gtatcagagc 614  Q
    ||||||||||    
T  20056206 gtatcagagc 20056197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 305 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 20057409 - 20057100
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20057409 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20057310  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20057309 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20057210  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  20057209 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 20057110  T
Q  605 gtatcagagc 614  Q
    ||||||||||    
T  20057109 gtatcagagc 20057100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 305 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 20057865 - 20057554
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20057865 aatcacaccgaaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20057766  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20057765 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20057666  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  20057665 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 20057566  T
Q  605 gtatcagagcag 616  Q
    ||||||||||||    
T  20057565 gtatcagagcag 20057554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 216 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 35759844 - 35759459
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||| | ||||||| ||||   ||||||||||    
T  35759844 tgtaacgcctccacttggtgggtatgtaacgcccgaggctgatgacggcggggagtggtctggctcctagcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcg 35759745  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  35759744 gaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 35759645  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||   | || |||| | ||||||   ||||| ||| |||| |||||    
T  35759644 tcttttcggtagctcattccataagaacttcatagttaaacgtgcttgacttggagctattttgggattggtgacctaccgggaagtttttcggtaagcg 35759545  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||  | ||||| |||| || |||||||    
T  35759544 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttttggggtcagtcggcaatcatgaaagtagtctggggtgttaca 35759459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 305 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 50002853 - 50002543
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | | |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50002853 aatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 50002754  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||| | |||||| || ||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| || |    
T  50002753 agatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaactccatagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatggatgacctaccgggaagttcc 50002654  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||    
T  50002653 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagtcgtctaggatgttacaaatg 50002554  T
Q  605 gtatcagagca 615  Q
    |||||||||||    
T  50002553 gtatcagagca 50002543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 305 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20845807 - 20845537
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  20845807 aatcacaccggaatgagacggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgttactacctatatcaaca 20845708  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  20845707 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagaaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20845608  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20845607 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 20845537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 305 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 20054226 - 20053929
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20054226 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20054127  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||     
T  20054126 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactaggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttt 20054027  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaag 602  Q
      || ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||||    
T  20054026 ctggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttacaag 20053929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 43057669 - 43057373
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  43057669 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaaca 43057570  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||| | ||||||  |||||| ||||    
T  43057569 agatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttggagtggtctttggatcggtgacctactgggaagtttc 43057470  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||| |||| || ||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||| |||   |||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  43057469 ccggtaagcatgtgagtgagaacaaaacacgctaaaaagacttgtgttggtttgtattgtcagtcagcaattcttaaagtcgttaaggatgttacaa 43057373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Original strand, 38340906 - 38341201
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||| || |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38340906 aatcacaccggaatgagatggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 38341005  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| ||||    
T  38341006 agatgcatcttcatttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagtttc 38341105  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  38341106 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgcggaaaagactcgtgttggtttatggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 38341201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 249 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 46693940 - 46693586
Alignment:
Q  249 cgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacat-aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtat 346  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||| || || | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  46693940 cgaggctgatgagggctaggagtggtccgactcttgtcatgcttctaggcaaaagttgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtgcatgtat 46693841  T
Q  347 gagactgc-atggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactcc 445  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||   ||||| ||||||    
T  46693840 gggactgtgatggttgaaggaaggcttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtatctcatttcataataactcc 46693741  T
Q  446 acatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagac 545  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   || || |||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  46693740 acagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagtttcccggtatgcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagac 46693641  T
Q  546 tcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || | ||||||||||    
T  46693640 ccgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtttgggatgttaca 46693586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 341 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 20056926 - 20056653
Alignment:
Q  341 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 440  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  20056926 aggtatgggactgcagggttgaaggaaggcttatgagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataaga 20056827  T
Q  441 actccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaa 540  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  20056826 actccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 20056727  T
Q  541 aagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagc 614  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20056726 aagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtatcagagc 20056653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20061413 - 20061188
Alignment:
Q  230 ttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagt-ttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatc 328  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  20061413 ttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcaatcttctaggctaaactgaatcacatcagaatgagagggatc 20061314  T
Q  329 ctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcc 428  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20061313 ctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagct 20061214  T
Q  429 caaaccataagaactccacatttaag 454  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||    
T  20061213 cattccataagaactccacagttaag 20061188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 43057210 - 43056915
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  43057210 aatcacatcagaatgag-gggatcctaaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaaggcttagaagaattgtttgatactacctatatcaaca 43057112  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||  |||||| ||||    
T  43057111 agatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttagagtggtctttggatgggtgacctactgggaagtttc 43057012  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||| |||| |||||||||| ||||| |||  |||||| |||  ||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||    
T  43057011 ccggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacactgaaaaaacttgtgttggtttgtagggtcagtcggcaattattaaagtcgtcggggatgttacaa 43056915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 218 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 35761148 - 35760845
Alignment:
Q  218 taacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcgga 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||   ||||||||||||    
T  35761148 taacgcctccgcttggtgggtatgtaacgtccgaggctgatgagggtggcgagtggtctggctcctggcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcgga 35761049  T
Q  317 atgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttc 416  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35761048 atgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 35760949  T
Q  417 ttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtg 516  Q
    |||| |||||| ||  |||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||| | | || |||||| | ||||   ||||| |||| ||| |||||||    
T  35760948 tttttggtagctcattccatgagaactccgtagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtaacctatcgggaagtttcccggtaagcgtg 35760849  T
Q  517 cgag 520  Q
    ||||    
T  35760848 cgag 35760845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 305 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 50003221 - 50002910
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||  |||||||||||| |||| || ||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  50003221 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgcaggtataggactgcatggttaaagggagacttataataattgttgggtactacctatatcaaca 50003122  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  50003121 agatgcatcttcttttcagtagctcattccaaaagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctaccgggaagtttc 50003022  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||    
T  50003021 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcagcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaaatg 50002922  T
Q  605 gtatcagagcag 616  Q
    ||||||||||||    
T  50002921 gtatcagagcag 50002910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Original strand, 52250206 - 52250501
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | | | || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  52250206 aatcacaccggaatgagagggatcatgaggccttgtaggtatgggactacatggtcgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 52250305  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | | || | |||| ||||||   ||||| ||||    
T  52250306 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttggaatgggtgacctaccgggaagtttc 52250405  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  52250406 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 52250501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 16452079 - 16451784
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  16452079 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 16451980  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||| ||  ||||| ||     
T  16451979 agatgcatcttcttttcggtagttcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc-taccggaaagttt 16451881  T
Q  505 tcgga-aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||  | ||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  16451880 tccaataagcgtgcgcgtgatgacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 16451784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 16461232 - 16460937
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  16461232 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 16461133  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||| ||  ||||| ||     
T  16461132 agatgcatcttcttttcggtagttcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc-taccggaaagttt 16461034  T
Q  505 tcgga-aagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||  | ||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  16461033 tccaataagcgtgcgcgtgatgacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 16460937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 227 - 570
Target Start/End: Original strand, 23180652 - 23180995
Alignment:
Q  227 cgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagaggga 326  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| | || || |||| ||||   |||||||| |||||||||||||    
T  23180652 cgcttggtgggcatgtaacgctcgtggctgatgaaggcggggagtggtccgactcctagtagcttataggaaaaattgaatcacattggaatgagaggga 23180751  T
Q  327 tcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtag 426  Q
    || | ||| |||| ||| ||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| |||    
T  23180752 tcttgaagccgtgtaggaatgggactacgtggttgaaggaatgattataagaattgcttggtactacctatatcaacaagatgtatcttctattcgctag 23180851  T
Q  427 cccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaa 526  Q
    ||||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| | ||||| ||| || ||| ||  |||  ||||||||||  |    
T  23180852 cccattccataagaattccacaattaagcgtgcttgacttggagaaattttgggatgggttaccttctggaaagtttttcaaaaaatgtgcgagtgacga 23180951  T
Q  527 caaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcg 570  Q
    |||| || | |||||||||| |||||||| ||| |||| |||||    
T  23180952 caaaacatgctgaaaagactaatgttggtttgtcgggttagtcg 23180995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 305 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 30873096 - 30872910
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  30873096 aatcacaccggaatgagagggattctgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaagacttttaagaattgtttgatactacctatatcaaca 30872997  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 491  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  30872996 agatgcatcttctttttggtagtccattctataagaactccacaattaagcatgcttgacttgcagtagtctttggatgggtgacct 30872910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 216 - 453
Target Start/End: Original strand, 2328225 - 2328463
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||  | | |||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| | || ||||||||||  |||||||| |    
T  2328225 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggagagtggtctggctcctggcatgcttttaggcaaaactgaatcacattg 2328324  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||  ||  | | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  2328325 gaatgagagaaattatgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatct 2328424  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 453  Q
    |||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  2328425 tctttttggtagcacattccataagaactccacagttaa 2328463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 360 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 20060431 - 20060191
Alignment:
Q  360 tgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgc 459  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||  |||    
T  20060431 tgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagtgtgc 20060332  T
Q  460 ttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgt 559  Q
    ||||||||||  | | || |||||| ||||||   ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||| |||    
T  20060331 ttgacttggatcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgatggaaagactcgtgttggtttgt 20060232  T
Q  560 ggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||||||||||| |||| || ||||  |||| || |||||||    
T  20060231 ggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggggtgttaca 20060191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 315 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 51373010 - 51372750
Alignment:
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||  | | | | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  51373010 gaatgagagggatcccgaggccatacaggtatgtgactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcgacaagatgcatct 51372911  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | | || |||||| ||||||    |||| ||| |||| |||||    
T  51372910 tattttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctatcaggaagtttttcggtaagcg 51372811  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    |||||||||| |||||   || ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  51372810 tgcgagtgaggacaaaatccgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcggcaat 51372750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 305 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 50002431 - 50002266
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | |||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  50002431 aatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctttatcaaca 50002332  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggag 470  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  50002331 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttgagtgtgcttgacttggag 50002266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 305 - 483
Target Start/End: Original strand, 2634924 - 2635102
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  2634924 aatcacatcggaatgagagggatcatgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggataactcataagaattgtttggtactacctataccaaca 2635023  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatg 483  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||| |||| |||||    
T  2635024 agatgcatcttcttttcggtagctcattcaataagaactccacagttaagcgtgtttggcttggagtaatctttggatg 2635102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 305 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 31822809 - 31822645
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31822809 aatcacatcagaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattatttggtactacatatatcaaca 31822710  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttgga 469  Q
    | || |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  31822709 atatgcatcttcttttcggtagctcaatccaaaagaactccacagttaagcgtttttgacttgga 31822645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 305 - 615
Target Start/End: Original strand, 2634465 - 2634776
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagaggg-atcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaac 403  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| | || ||| | |||||||| |||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||  |||    
T  2634465 aatcacatcgaaatgagaggggatcctgaggttgtgtatgtatgagattgcatgattaaaggaaggcttgcaagaattgtttggtactagctatacaaac 2634564  T
Q  404 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 503  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |  | ||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||| |||    
T  2634565 aagatgcatcttcttttcgatagtctattcaataagaacttcactgttaaacgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacattctgggaagttt 2634664  T
Q  504 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagt 603  Q
      |  ||||| ||||| |||| |  ||||||| ||||||||||| |||| || |||  ||||||||  || | ||||||||  | |||||||||||||||    
T  2634665 tccaaaaagcatgcgaatgaggatgaagcacgctgaaaagactcttgtttgtttgtaaggtcagtcatcattgcttaaagtcatttaggatgttacaagt 2634764  T
Q  604 ggtatcagagca 615  Q
    ||||||||||||    
T  2634765 ggtatcagagca 2634776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 279 - 583
Target Start/End: Original strand, 16907209 - 16907513
Alignment:
Q  279 ctcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataaga 378  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||  | |    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16907209 ctcctggcagcttctaggcaaacca-aatcatatcaaaatgagagggattttgagactgtgcaggtatgaaactgcatggttgaaagaaggcttataaga 16907307  T
Q  379 attttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtctta 478  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||  | | |||||||||| | |||||| || ||||||||||| | | ||     
T  16907308 attgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttcttttcagtggtccattctacaagaactccatagttaagcgtgtttgacttggagcaattttg 16907407  T
Q  479 ggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagt-gagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattc 577  Q
     ||||| ||||||| || ||| ||||| | ||||| ||| |||  || |||||  ||  || |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| |    
T  16907408 agatgggtgaccttttgagaagtttcttgaaaagcatgcaagtaaaggacaaaatacactggaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccaacaatcc 16907507  T
Q  578 ttaaag 583  Q
    ||||||    
T  16907508 ttaaag 16907513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 341 - 473
Target Start/End: Original strand, 12728027 - 12728160
Alignment:
Q  341 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggt-actacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataag 439  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  12728027 aggtatgggacaacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggttactgcctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcacattccataag 12728126  T
Q  440 aactccacatttaagcatgcttgacttggagtag 473  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12728127 aactccacagttaagcatgcttgacttggagtag 12728160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 403 - 600
Target Start/End: Original strand, 52250641 - 52250838
Alignment:
Q  403 caagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatt 502  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | | || |||||| ||||||   ||||| ||    
T  52250641 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt 52250740  T
Q  503 tctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    || ||| ||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  52250741 tcccggtaagtgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 52250838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 403 - 600
Target Start/End: Original strand, 52250978 - 52251175
Alignment:
Q  403 caagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatt 502  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | | || |||||| ||||||   ||||| ||    
T  52250978 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt 52251077  T
Q  503 tctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    || ||| ||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  52251078 tcccggtaagtgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 52251175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 504
Target Start/End: Original strand, 12883524 - 12883723
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  | |  ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12883524 aatcacaccggaatgagatggatcccgaggctgtgcaggtatgggactgcatgattgaaggaatacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 12883623  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||| |||||  || |||||||| |||||| || |||||| ||||||  |||||| ||||    
T  12883624 agatgcattttctttttggtagctcattccataaaaactccacagttaagtgtgtttgacttgaagtagtttttggatggatgacctactgggaagtttc 12883723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 305 - 491
Target Start/End: Original strand, 7548091 - 7548277
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||| | ||||||||||||| | | | |||| |||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||    
T  7548091 aatcacattgcaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatgattaaaggaagacttataaaaattgtttggtattaactatatcaaca 7548190  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 491  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7548191 agatgcatattctttttggtagcccatttgataagaactccacaattaagcgtacttgacttggagtagtctttggatgggtgacct 7548277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 810 - 922
Target Start/End: Original strand, 9346872 - 9346984
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 909  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || |||||    
T  9346872 ttccatttcttctgcaatgatatgaattcagaataacaacttttaactaagtccagcttccagtcttcagactctgttgaacttcagcttccgaggctct 9346971  T
Q  910 tcagactctctga 922  Q
    |||||||||||||    
T  9346972 tcagactctctga 9346984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 814 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 18129976 - 18129865
Alignment:
Q  814 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcag 913  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18129976 attccttctgcaatgacgtgtcttcagaataacaacttttaactaacttcagcttccagacttcagactctgatgaacttcagcttctgaggctcttcag 18129877  T
Q  914 actctctgatga 925  Q
    ||||||||||||    
T  18129876 actctctgatga 18129865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 813 - 914
Target Start/End: Original strand, 16870087 - 16870188
Alignment:
Q  813 cattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttca 912  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| | ||||||    
T  16870087 cattcattctgcaatgatatgcattcagaataataacttttaactaacttcagcttccagtcttcagactctgataaactccagcttctgaggttcttca 16870186  T
Q  913 ga 914  Q
    ||    
T  16870187 ga 16870188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 814 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 26280015 - 26279914
Alignment:
Q  814 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttcag 913  Q
    ||||||||| || |||| ||  |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26280015 attccttctacagtgatgtgtcttcaaaataacaaaatttaactaactgtagcttctagtcttcagactctgatgaacttcagcttctgatgatcttcag 26279916  T
Q  914 ac 915  Q
    ||    
T  26279915 ac 26279914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 814 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 18517126 - 18517014
Alignment:
Q  814 attccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatg-tttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctcttca 912  Q
    |||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||   |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18517126 attccttctgtaatgatgtgtcttcagaataaaaaaactttaactaactgcagcttccagtcttcagactctgatgaacttcaacttctgatgatcttca 18517027  T
Q  913 gactctctgatga 925  Q
    |||||| ||||||    
T  18517026 gactctttgatga 18517014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 512 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 35760003 - 35759899
Alignment:
Q  512 gcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcag 611  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  | ||||  |||| ||||||||||| |||||||||    
T  35760003 gcgtgcgagcgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcatgaaagcagtctgggatgttacaaatggtatcag 35759904  T
Q  612 agcag 616  Q
    |||||    
T  35759903 agcag 35759899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 420
Target Start/End: Original strand, 10820636 - 10820707
Alignment:
Q  349 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 420  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  10820636 gactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtactacctatatcaataagatacatcttttttt 10820707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 459 - 615
Target Start/End: Original strand, 7547791 - 7547947
Alignment:
Q  459 cttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatg 558  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||   || || ||| |||  |||||||||||| || ||||| |||  ||||||| ||| ||||| | ||    
T  7547791 cttgacttggagtagtgtttggatgggtgacctaccggaaagtttttcgataagcgtgcgagtaaggacaaaacacactgaaaagtctcgtgttgatttg 7547890  T
Q  559 tggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 615  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||| || |||||| ||||||    
T  7547891 tagggtcagtcgacaatgcttaaactcatataggatgttataaatggtattagagca 7547947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 479 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 31823091 - 31823001
Alignment:
Q  479 ggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtc 569  Q
    |||||| ||||||  |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  31823091 ggatgggtgacctactgggaagtttctcggtaagcatgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtc 31823001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 35010014 - 35009956
Alignment:
Q  433 ccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgacct 491  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35010014 ccataagaactccacggttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacct 35009956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 27796048 - 27795950
Alignment:
Q  42 attctacttgatcaacaactaaaaattgctaaactacattttcaaaccctcaaccaattctacttgatcgacaact-aaaaactccaaccttcaacaaaa 140  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| ||| | || ||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  27796048 attctacttgatcaataactacaaattcctaaactaca--ttcaaaccctaaacaatttttacttcatcaacaactcaaaaaccctaaccttcaacaaaa 27795951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16410831 - 16410704
Alignment:
Q  343 gtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaac 442  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |  | | ||||||    
T  16410831 gtatgggaatgcattgttgaaggaaagcttataagaattatttactactaccaataccaacaagatgcatcttgtttttggtagcctattctagaagaac 16410732  T
Q  443 tccacatttaagcatgcttgacttggag 470  Q
    | || | |||| |||| |||||||||||    
T  16410731 ttcaaagttaaacatgtttgacttggag 16410704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 49996613 - 49996528
Alignment:
Q  518 gagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagt 603  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| || ||||  ||||  ||||||||||||    
T  49996613 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcttgttagtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtctgagatgttacaagt 49996528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 395 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7229999 - 7229819
Alignment:
Q  395 tatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttat 494  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||||||  ||   ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | ||||||| | |||||||||    
T  7229999 tatatcaacacgaagcatcttcatttcggtagttcattacataagaactccatagataagcatgtttgacttggagcaattttaggattggtgaccttat 7229900  T
Q  495 gggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
       || ||| ||| ||||||||  |||||| | ||| || | |||||| |||| ||||| | |||||||| ||||| ||||    
T  7229899 ataaagtttttcgaaaagcgtgaaagtgaggataaaacatgctgaaaaaactcgtgttgctttgtggggtgagtcgtcaat 7229819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 420
Target Start/End: Original strand, 2739558 - 2739637
Alignment:
Q  341 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttctttt 420  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  2739558 aggtatgagactgtatggttaaggaaagacttataagaattgtttagcactacatatatcaacaatatgtatcttctttt 2739637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 509 - 615
Target Start/End: Original strand, 8278154 - 8278260
Alignment:
Q  509 aaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtat 608  Q
    ||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| || ||| ||||  ||||| ||| ||  ||| ||| | ||||||||||| ||||||    
T  8278154 aaagcttgcaagtgaggacaaaacacgttaaaaagactcgtgttagtctgtagggttggtcgaaaatcctggaagctgtttgggatgttacaaatggtat 8278253  T
Q  609 cagagca 615  Q
    |||||||    
T  8278254 cagagca 8278260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 517 - 611
Target Start/End: Original strand, 39582553 - 39582647
Alignment:
Q  517 cgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcag 611  Q
    |||||||| ||||| |||| ||| ||||||| | ||||| ||| || ||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||| | |||||||    
T  39582553 cgagtgaggacaaaacacgctgagaagactcgttttggtttgtaggatcagtcggcaatgcttaaagtagtttgggatgttacaaatcgtatcag 39582647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16440676 - 16440603
Alignment:
Q  354 catggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagc 427  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  16440676 catggttgaagaaagacttataagaactgtttgctactaccgataacaacaagatgcatattctttttggtagc 16440603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31823161 - 31823108
Alignment:
Q  374 taagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagc 427  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  31823161 taagaattatttggtactacctatatcaataaaatgcatcttctttttggtagc 31823108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 160; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 216 - 610
Target Start/End: Original strand, 105630 - 106025
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||  | | |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  105630 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggggagtggtctggttcctggcatgcttctaggcaaaactaaatcacatcg 105729  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||| | | ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  105730 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatggaactgcagggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgcatct 105829  T
Q  415 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 514  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||  ||||||   | ||| ||||  || |||||    
T  105830 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgtgtgacctaccgagaagtttcctggtaagcg 105929  T
Q  515 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatca 610  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||| ||||||| ||||  ||||  |||||||||| ||||||||    
T  105930 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttatagggtcagtcggcaattctgaaagcagtctgagatgttacaaatggtatca 106025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 2197 - 1901
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| | |||||| |||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2197 aatcacaccagaatgaaagggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 2098  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  2097 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 1998  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||    
T  1997 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagtcgtttgggatgttacaa 1901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Original strand, 18966 - 19262
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18966 aatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 19065  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  19066 agattcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 19165  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  19166 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacaa 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 234 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18339 - 18203
Alignment:
Q  234 tgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaa 332  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |    
T  18339 tgggcatgtaacgctcgaggcggatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaacactgaatcacatcggaatgagagggatccaga 18240  T
Q  333 agtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagg 369  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18239 ggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagg 18203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 215 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 162915 - 162553
Alignment:
Q  215 ttgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatc 313  Q
    ||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || | |||||||||||||  ||| |||||    
T  162915 ttgtaacgcctcctcttggtggacatgtaatgcccgaggctgatgagggtggggagtggtctggctcctgacatgcttctaggcaaaactgaattacatc 162816  T
Q  314 ggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatc 413  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  162815 ggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatc 162716  T
Q  414 ttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagc 513  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |   || |||||  ||||||    |||| |||| ||  ||||    
T  162715 ttcttttcggtagctcattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgacttggagcaactttgggatgagtgacctacctggaagtttcgcgataagc 162616  T
Q  514 gtgcgagtgagaacaaagcacgttg-aaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 575  Q
    ||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  162615 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaat 162553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 268 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 69998 - 69666
Alignment:
Q  268 gagtggtccgactcctggcagtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaa 367  Q
    |||||||| |||| |||| || ||||||| ||| |  | |||||||  |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  69998 gagtggtctgacttctggaagcttctaggtaaagccgattcacatcataatgagagggatcctaagactatgcaggtatgagactgcatcgttgaaggaa 69899  T
Q  368 ggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttg 467  Q
     |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |    
T  69898 tgcttataataattgtttggtactacctatatcaacatgatgcatctttttttcattagctcattccataagaactccacagttatgcgggcttgactag 69799  T
Q  468 gagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcag 567  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||| | |||||||||| ||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||| || ||||    
T  69798 gagtagtctttggatgggtgaccttcagggaagtttatgggaaagcgtgtgagtgatgacaaaccacgctaaaaagactcgtgttggtttgttggttcag 69699  T
Q  568 tcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    ||| |||| || ||||  || | ||||||||||    
T  69698 tcggcaatcctgaaagcagtttgggatgttaca 69666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 404 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 163181 - 162969
Alignment:
Q  404 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 503  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||    
T  163181 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctatcgggaagttt 163082  T
Q  504 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagt 603  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| || |||   |||| ||||||||||| |    
T  163081 ctcggtaagcgttcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggccagtcggcaatcctgaaaacagtctgggatgttacaaat 162982  T
Q  604 ggtatcagagcag 616  Q
    |||||||||||||    
T  162981 ggtatcagagcag 162969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 401 - 600
Target Start/End: Original strand, 163167 - 163366
Alignment:
Q  401 aacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaa 500  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||  |  |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   | |||     
T  163167 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgagaag 163266  T
Q  501 tttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||| | | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  163267 tttcccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtctgtcgacaatcctgaaagtcgtctgggatgttaca 163366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 140; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Original strand, 1220 - 1515
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| |||||||||| || |||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  1220 aatcacaccggaatgagacggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatataaaca 1319  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  1320 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 1419  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  1420 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggcgtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 1515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 135; Significance: 7e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 251 - 616
Target Start/End: Original strand, 245031 - 245394
Alignment:
Q  251 aggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacat-aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatga 348  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |  |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| | | | || |||||||     
T  245031 aggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcatctaga-aaaatatgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgg 245129  T
Q  349 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccaca 448  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  245130 gactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc-tttcggtagcctaaaccataagaactccaca 245228  T
Q  449 tttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactca 548  Q
       |||| |||||||||| ||| | | ||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||     
T  245229 ---aagcgtgcttgacttagagcaattttgagatgggtgaccttctgggaagtttctcggaaagcgtgtgagtgaggacaaaacacggtgaaaagactcg 245325  T
Q  549 tgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtct-aggatgttacaagtggtatcagagcag 616  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||| || ||||  || |  || |||||||| ||||||||||||||    
T  245326 tgttggtttgcggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggggtgttacaaatggtatcagagcag 245394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 249 - 464
Target Start/End: Original strand, 245458 - 245674
Alignment:
Q  249 cgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatg 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||  |||||||||  ||||| ||||||| | |   |||| |||||||    
T  245458 cgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcttggttctaggaaaaactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccgtgtaggtatg 245557  T
Q  348 agactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccac 447  Q
     |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  245558 ggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagcctaaaccataagaactccac 245657  T
Q  448 atttaagcatgcttgac 464  Q
    | |||||| ||||||||    
T  245658 agttaagcgtgcttgac 245674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 432 - 570
Target Start/End: Original strand, 245675 - 245813
Alignment:
Q  432 accataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaag 531  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |   ||||| ||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||     
T  245675 accataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttcgagatgggtgatcttttgggaagtttctcggaaagtgtgtgagtgaggacaaaa 245774  T
Q  532 cacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcg 570  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  245775 cacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcg 245813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 305 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 18280 - 17974
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  18280 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttgatactacctatatcaaca 18181  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||| |||| ||||||  |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| || |||     
T  18180 agatgcatcttttttt-ggtagctaattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctattggaaagtttt 18082  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
    |||| || |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  18081 tcggtaaacgtgcgagtgaggacacaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtagggtcaatcgacaatgcttaaagtcgtct-ggatgttacaaatg 17983  T
Q  605 gtatcagag 613  Q
    |||||||||    
T  17982 gtatcagag 17974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 309 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 17740 - 17448
Alignment:
Q  309 acatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagat 408  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  17740 acatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaggat 17641  T
Q  409 acatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcgg 508  Q
      |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  | | || ||| ||||    
T  17640 gtatcttctttttggtagctcaattcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtactctttggatgggtgacctactcgaaagtttttcgg 17541  T
Q  509 aaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||   | |||||||||| |||| |||||| | |||| | |||||||||    
T  17540 taagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttcatagggtcagtcggcaatacttaaaatcgtctggaatgttacaa 17448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 130; Significance: 7e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 305 - 614
Target Start/End: Original strand, 4561 - 4869
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4561 aatcacatcggaaggagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttagaagaattgtttggtactacctatatcaaca 4660  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| ||||    
T  4661 agatgcatcttcttttcggtagctcattttataagaactccacagttaagtgtgcttaacttggagcaat-ttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 4759  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtg 604  Q
     ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| ||    
T  4760 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgactgggatgttacaaatg 4859  T
Q  605 gtatcagagc 614  Q
    ||||||||||    
T  4860 gtatcagagc 4869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Original strand, 5016 - 5316
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggctt-----ataagaattttttggtactacttatat 399  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  5016 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttaaaagagaagaattgtttggtactacctatat 5115  T
Q  400 caacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaa 499  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | | || |||||| ||||||    ||||    
T  5116 taacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttaacttggagcaat-ttgggatgggtgacctacctggaa 5214  T
Q  500 atttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttac 599  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5215 atttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttac 5314  T
Q  600 aa 601  Q
    ||    
T  5315 aa 5316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 514 - 602
Target Start/End: Original strand, 5331 - 5420
Alignment:
Q  514 gtgcgagtgagaacaaag-cacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaag 602  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  5331 gtgcgagtgaggacaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtaagtcgacaatgcttaaagtcgtctaggatgttacaag 5420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 129; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 305 - 601
Target Start/End: Original strand, 2742 - 3038
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  2742 aatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 2841  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || ||||||  |||||   ||||| ||||    
T  2842 agatgcatattcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggagacctaccgggaagtttc 2941  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaa 601  Q
     ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  2942 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagcagtctcggatgttacaa 3038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 122; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 216 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 142510 - 142305
Alignment:
Q  216 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||    
T  142510 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaggacggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 142411  T
Q  315 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 414  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  142410 gaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggacttcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 142311  T
Q  415 tctttt 420  Q
    ||||||    
T  142310 tctttt 142305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 597
Target Start/End: Original strand, 154765 - 155049
Alignment:
Q  313 cggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacat 412  Q
    ||||||||||||| |||| | | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| |||    
T  154765 cggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctgtatcaacaagatgcat 154864  T
Q  413 cttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaag 512  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || | |||| ||||||   ||||| |||||||| |||    
T  154865 cttcttttcagtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctaccgggaagtttctcggtaag 154964  T
Q  513 cgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgtt 597  Q
     |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||    
T  154965 tgtgctagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgtt 155049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 514 - 616
Target Start/End: Original strand, 154511 - 154613
Alignment:
Q  514 gtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagag 613  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  154511 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacaaatggtatcagag 154610  T
Q  614 cag 616  Q
    |||    
T  154611 cag 154613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 354 - 600
Target Start/End: Original strand, 2154 - 2391
Alignment:
Q  354 catggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaa 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||    
T  2154 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactccctatataaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccttaagaactccacagttaa 2253  T
Q  454 gcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttg 553  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||            ||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||    
T  2254 gcatgcttgacatggagtagtcttatgatgggtgacct---------accctcggtaagcgtgcgagtgaggagaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 2344  T
Q  554 gtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    || ||| || |||||||||||| || ||||  |||| |||| |||||    
T  2345 gtttgtaggatcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggattttaca 2391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 395 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 13589 - 13384
Alignment:
Q  395 tatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttat 494  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | | || |||||| ||||||       
T  13589 tatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctacc 13490  T
Q  495 gggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggat 594  Q
    ||||| |||||  | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||  |||  ||||    
T  13489 gggaagtttctttgtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtccgggat 13390  T
Q  595 gttaca 600  Q
    ||||||    
T  13389 gttaca 13384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 305 - 545
Target Start/End: Original strand, 14741 - 14981
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  14741 aatcacatcggaacaagagggatcctaatatcgtgcatgtataggactgcagtgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtaatacctatatcaata 14840  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttc 504  Q
    |||| |||| |||||||||||   ||    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||     
T  14841 agatgcatcgtcttttcggtaattcattgaataagaacttcacagttaagcatgtttgacttggagtggtctttggatgggtgaccatatgggaagtttt 14940  T
Q  505 tcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagac 545  Q
     || ||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||    
T  14941 ccgaaaaacgtgcgagtgatgacaaaacacgctaaaaagac 14981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 810 - 925
Target Start/End: Original strand, 7444 - 7559
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 909  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  7444 ttccattccttctgcaatcatatgaattcaaaataacaacttttaactaactctagcttccagtctttagactctgttgaacttcagcttctgaggctct 7543  T
Q  910 tcagactctctgatga 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  7544 tcagactctctgatga 7559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 78; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 309 - 553
Target Start/End: Original strand, 26074 - 26316
Alignment:
Q  309 acatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagat 408  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |  | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26074 acatcagaaagagagggatcctaaggccgtgcaggtgtgagacttcatggttgcataatggcttatacaaattttttggtactacatatatcaacatgat 26173  T
Q  409 acatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcgg 508  Q
     ||||||||||| |||||| ||    ||||||||||  || |||||  |||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||| | || |||||||     
T  26174 gcatcttctttttggtagctcattttataagaactc--cagttaagtgtgcttgacttggagtatttttaggatgagtgagcttatagaaagtttctcga 26271  T
Q  509 aaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttg 553  Q
    ||||| |||||| ||||||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  26272 aaagcttgcgagggagaacataacacgctgaaaagactcgtgttg 26316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 404
Target Start/End: Original strand, 16038 - 16135
Alignment:
Q  309 acatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgc--aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  16038 acatcagaatgagagggatcctgatatcgtgcataggtatgagattgcatagttgaatgatgacttgtaagaattgtttggtgctatctatatcaaca 16135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 73; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 404 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 14749 - 14553
Alignment:
Q  404 aagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaattt 503  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||    
T  14749 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 14650  T
Q  504 ctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    | ||| ||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  14649 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 14553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0522 (Bit Score: 72; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0522
Description:

Target: scaffold0522; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 810 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 4257 - 4142
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 909  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  4257 ttccattccttctacaatcatatgaattcaaaataacaacttttaactaactccagcttccagtcttcagactctgttgaacttcagcttctgaggctct 4158  T
Q  910 tcagactctctgatga 925  Q
    ||||||||| ||||||    
T  4157 tcagactctttgatga 4142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0522; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 810 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 11540 - 11425
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgatgctct 909  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  11540 ttccattccttctacaatcatatgaattcaaaataacaacttttaactaactccagcttccagtcttcagactctgttgaacttcagcttctgaggctct 11441  T
Q  910 tcagactctctgatga 925  Q
    ||||||||| ||||||    
T  11440 tcagactctttgatga 11425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 72; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 373 - 615
Target Start/End: Original strand, 7009 - 7251
Alignment:
Q  373 ataagaattttttggtactacttat-atcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagt 471  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| || ||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  7009 ataagaattgtttggtactacatattaccaacaagatgcaccttttttttgacaatccaaaccataagaactccacagttaagcatgcttgacttggagc 7108  T
Q  472 agtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcga 571  Q
    | | || | |||| ||||||| ||| || |||| || ||||| || ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  7109 aattttggtatgggtgaccttttggaaagtttcccgaaaagcatgtgagtggggacaaa-caaggtgaaaagactcgtgttggcctgtggggtcaatcga 7207  T
Q  572 caattcttaaagttgtctaggatgttacaagtggtatcagagca 615  Q
    ||||||| ||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  7208 caattctgaaaatcgtctggaatgttacaagtagtatcagagca 7251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 70; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 305 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 4128 - 4003
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  4128 aatcacaccagaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctgtatcaaca 4029  T
Q  405 agatacatcttcttttcggtagccca 430  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||    
T  4028 agatgcatcttctttttggtagccca 4003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 417
Target Start/End: Original strand, 23673 - 23785
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    ||||||| || |||||||||| || | | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23673 aatcacaccgaaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 23772  T
Q  405 agatacatcttct 417  Q
    |||| ||||||||    
T  23773 agatgcatcttct 23785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 810 - 903
Target Start/End: Original strand, 20188 - 20281
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctga 903  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20188 ttccattccttctgcaatcatatgagttcaaaataacaacttttaactaactccagcttccagtcttcagactctattgaacttcagcttctga 20281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 57; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 810 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 870 - 754
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctc 908  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| | ||    
T  870 ttccattccttatgcaatgatatgcatacagaataacaacatttaactaacttcagcttccagtcttcagactcttatgaactccaacttctgatggttc 771  T
Q  909 ttcagactctctgatga 925  Q
    |||| ||||||||||||    
T  770 ttcaaactctctgatga 754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 53; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 416 - 600
Target Start/End: Original strand, 421 - 605
Alignment:
Q  416 cttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgt 515  Q
    |||||||||||| ||  |||||| | ||||| | |||||| |||||||| ||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||  |||| |    
T  421 cttttcggtagctcattccataaaatctccatagttaagcgtgcttgacatggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagcat 520  T
Q  516 gcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    | ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  521 gtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagtagtctcggatgttaca 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 813 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 10393 - 10280
Alignment:
Q  813 cattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtcttcatactctaatgaacttcagcttctgat-gctcttc 911  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||| || | |||||    
T  10393 cattccttccgcaatgatatgcattaagaataacaacatttaactaacttcagcttccagtctttagactctgatgaactccagcttctaatggttcttc 10294  T
Q  912 agactctctgatga 925  Q
    |||||||| |||||    
T  10293 agactctccgatga 10280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 450 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 1702 - 1552
Alignment:
Q  450 ttaagcatgcttgacttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcat 549  Q
    |||||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||   ||||| |||| ||| |||| || ||||||| ||||| |||| | ||||||||| |    
T  1702 ttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcatgtgagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcgt 1603  T
Q  550 gttggtatgtggggtcagtcgacaattcttaaagttgtctaggatgttaca 600  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| || ||||  |||| ||||||||||    
T  1602 gttggtttgtggggtcagtcgataatcctgaaagcagtctgggatgttaca 1552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 810 - 876
Target Start/End: Original strand, 87025 - 87091
Alignment:
Q  810 ttccattccttctgcaatgatatgaattcagaataacaatgtttaactaactctagcttccagtctt 876  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  87025 ttccattccttctgcaatcatatgaattcagaataaaaacttttaactaactccagcttccagtctt 87091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 408
Target Start/End: Original strand, 45387 - 45489
Alignment:
Q  305 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |   ||||||  |||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45387 aatcacatcggaatgagagg-atcttgagaccgtgcatatatgtgactacattgttgaaggaagacttatgagaattatttggtactacctatatcaaca 45485  T
Q  405 agat 408  Q
    ||||    
T  45486 agat 45489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 44807 - 44631
Alignment:
Q  365 gaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgac 464  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||||||||| |  ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| | ||||   ||||||||    
T  44807 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 44708  T
Q  465 ttggagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttgaaa 541  Q
    |||||  | | || |||||| ||||||| |||||| |||  |  |||| |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  44707 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttcctaaaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgctgaaa 44631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1126 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1126
Description:

Target: scaffold1126; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 1030 - 981
Alignment:
Q  337 gtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttg 386  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  1030 gtgcagatatgagactgcatggttgaaagaagacttataataattttttg 981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University