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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF14642_high_41 (Length: 252)
Name: NF14642_high_41
Description: NF14642
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF14642_high_41 |
 | |
|
| [»] chr1 (4 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0060 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0045 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0468 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0070 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0330 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0240 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Original strand, 16749715 - 16749957
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16749715 |
atgaaccaaaagttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttaatggcacataaactagaaat |
16749814 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaa----gcttgatattttcaatttttataacgaagattga |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16749815 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgaaaaataaaattgacaagtgcgcttgatattttcaatttttataacgaagattga |
16749914 |
T |
|
| Q |
210 |
aatttatagagtacccaagtctaagaacaaaaaattttaatta |
252 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16749915 |
aatttatagagtacccaagtctaagaacaaaaaattctaatta |
16749957 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10139148 - 10138920
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10139148 |
atgaaccaaaagttcatagaaatcagaatttagagaatatgaatctctaaatataatagattatgatatgtgtaaacttgatggcacataaactagaaat |
10139049 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10139048 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgattgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatt |
10138949 |
T |
|
| Q |
214 |
tatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10138948 |
tatagagtatccaagtctgagaacaaaaa |
10138920 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 47453125 - 47453353
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
47453125 |
atgaaccaaaagttcatataaatcattgtttagagaattcgaatctctaaacttaa-aaattaagatacgtgggaacttgatgacatataaactagaaat |
47453223 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
47453224 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgactgtgaattctgaaaaataaaatcgatatgcttgatatattcaatttttataacaaaaatttaaatt |
47453323 |
T |
|
| Q |
214 |
-tatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47453324 |
gaatagactacctaagtctaagaacaaaaa |
47453353 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25854249 - 25854008
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25854249 |
atgaaccaaaagttcatataaattagaatttagagaatatgaatctctaaatataatagattatgatatgtgggaa-ttgatggcacataaactagaaat |
25854151 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttatt--------------gatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25854150 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgcttgtttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataa |
25854051 |
T |
|
| Q |
200 |
cgaagattgaaatttatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25854050 |
cgaaaattgaaatttatagagtacccaagcctaagaacaaaaa |
25854008 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30650033 - 30649805
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30650033 |
atgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaactagaaat |
30649934 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30649933 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatt |
30649834 |
T |
|
| Q |
214 |
tatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30649833 |
tatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
30649805 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 17971640 - 17971868
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17971640 |
atgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatagcacatacactagaaat |
17971739 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17971740 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgactgcgaattttgaaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttctttaacgaaaattgaaatt |
17971839 |
T |
|
| Q |
214 |
tatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17971840 |
tatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
17971868 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Original strand, 25479839 - 25480067
Alignment:
| Q |
21 |
aaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaatgataaaa |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25479839 |
aaaagttcatataaatcggtgtttagagaatttgaatctctaaatttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataacctagaaatgataaaa |
25479938 |
T |
|
| Q |
121 |
taatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaattt------ |
214 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
25479939 |
taatcttttatcatacttattgatgactgtgaattttggaaactaaaattgatacgtttgatatgttcaacttctataatgaaaattgaaatttatgttg |
25480038 |
T |
|
| Q |
215 |
-atagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25480039 |
gatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
25480067 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Original strand, 25487445 - 25487673
Alignment:
| Q |
21 |
aaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaatgataaaa |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25487445 |
aaaagttcatataaatcggtgtttagagaatttgaatctctaaatttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataacctagaaatgataaaa |
25487544 |
T |
|
| Q |
121 |
taatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaattt------ |
214 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
25487545 |
taatcttttatcatacttattgatgactgtgaattttggaaactaaaattgatacgtttgatatgttcaacttctataatgaaaattgaaatttatgttg |
25487644 |
T |
|
| Q |
215 |
-atagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25487645 |
gatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
25487673 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 9181693 - 9181847
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9181693 |
atgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagaaat |
9181792 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaa |
168 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9181793 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgactgcgaattttgaaaaataaaa |
9181847 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30654642 - 30654487
Alignment:
| Q |
89 |
acttgatggcacataaactagaaatgataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttc |
188 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
30654642 |
acttgatggcacataaattaaaaatgataaaataatcttttatcataatcatcgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatgcgcttgatatgttc |
30654543 |
T |
|
| Q |
189 |
aatttttataacgaagattgaaattt-------atagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30654542 |
aatttctataa-----attgaaatttatgttggatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
30654487 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31272599 - 31272371
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31272599 |
atgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaactagaaat |
31272500 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
31272499 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataatgaaaattgaaatt |
31272400 |
T |
|
| Q |
214 |
tatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31272399 |
tatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
31272371 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 242
Target Start/End: Original strand, 37260845 - 37261067
Alignment:
| Q |
20 |
caaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaatgataaa |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37260845 |
caaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaactagaaatgataaa |
37260944 |
T |
|
| Q |
120 |
ataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatttataga |
219 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37260945 |
atgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttataga |
37261044 |
T |
|
| Q |
220 |
gtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37261045 |
gtacccaggtctaagaacaaaaa |
37261067 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41815831 - 41815659
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
41815831 |
atgaaccaaaagttcatacaaatcattgtttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataacctagaaat |
41815732 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattt |
186 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
41815731 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgactgcgaattttgaaaaataaaattgatatgcttgatattt |
41815659 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 33465286 - 33465521
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
33465286 |
atgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctctaaacataataaattatgatatgtgtaaatttgatggcacataaattagaaat |
33465385 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataata-ttttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaat |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
33465386 |
gataaaataatatttttatcatatttattgatgactctgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttctttaacgaaaattgaaat |
33465485 |
T |
|
| Q |
213 |
t-------tatagagtacccaagtctaagaacaaaa |
241 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33465486 |
ttatgttgtatagagtacccaagtctaagaacaaaa |
33465521 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19105846 - 19105661
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
19105846 |
atgaatcaaaagttcatatgaatcagtgtttagagaatttgaatctctaaatttaataaattatgatatgtgcgaacttgatgatatataacctagaaat |
19105747 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataa |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19105746 |
gataaaataatcttttatcatacttactgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatacgcttgatatgttcaatttttataa |
19105661 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Original strand, 32222132 - 32222377
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
32222132 |
atgaaccaaaagttcatataaatcagtgtt-agagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatgaaacataaattagaaat |
32222230 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttg--aaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaa |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||| | | ||||| | |||||||| | ||||||| || |||| |
|
|
| T |
32222231 |
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32222329 |
T |
|
| Q |
212 |
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252 |
Q |
| |
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||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
32222330 |
tttatgttgtacagagtactcaagtcaaagaacaaaaaattctaatta |
32222377 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30778537 - 30778450
Alignment:
| Q |
52 |
ttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaatgataaaataatattttatcatatttat |
140 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| | ||| || ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30778537 |
ttgaagctctagacttaataaattttgatatatgtgaacttgatgtcgcattgacgagatatgattaaa-gatattttatcatatttat |
30778450 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 7)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 23662388 - 23662616
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23662388 |
atgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaactagaaat |
23662487 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatt |
213 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
23662488 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataatgaaaattgaaatt |
23662587 |
T |
|
| Q |
214 |
tatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23662588 |
tatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
23662616 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 24755466 - 24755702
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaactt-aataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaa |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24755466 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatgtttacagaatttgaatctctaatgtttaataaattatgatatgtgcaaacttgacggcacataacctagaaa |
24755565 |
T |
|
| Q |
113 |
tgataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaat |
212 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||| |
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| T |
24755566 |
tgataaaacggtattttatcatatttattgatgactgcgaattttgaaaaataaaattgatatgcttgaaatgttcaatttctataatgaaaattgaaat |
24755665 |
T |
|
| Q |
213 |
tt-------atagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
24755666 |
ctatgttggatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
24755702 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 24764463 - 24764699
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaactt-aataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaa |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24764463 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatgtttacagaatttgaatctctaatgtttaataaattatgatatgtgcaaacttgacggcacataacctagaaa |
24764562 |
T |
|
| Q |
113 |
tgataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaat |
212 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
24764563 |
tgataaaacggtattttatcatatttattgatgactgcgaattttgaaaaataaaattgatatgcttgaaatgttcaatttctataatgaaaattgaaat |
24764662 |
T |
|
| Q |
213 |
tt-------atagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24764663 |
ctatgttggatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
24764699 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Original strand, 12966790 - 12966989
Alignment:
| Q |
22 |
aaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactag--------aaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
12966790 |
aaagttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcaaacttgatgacacataaattagaaatgataaaat |
12966889 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12966890 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgaaaaataaaattgatatgtttgatatgctcaatttctaaaacgaaaattgaaatt |
12966989 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18471046 - 18470830
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18471046 |
atgaatcaaaagttcatataaattaatgcttagagaatt-gaatctctaaacttaataaattat--tatgtgcgaatttgatggcacataaattagaaat |
18470950 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatatttt-atcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaat |
212 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18470949 |
gataaaaggatatttttatcatatttattgattactgtgaattttggaaaataaaa---------ttgatatgttcaa-ttttataacgaaaattgaaat |
18470860 |
T |
|
| Q |
213 |
ttatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18470859 |
ttatagagtacccaagtttaagaacaaaaa |
18470830 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8886978 - 8886870
Alignment:
| Q |
91 |
ttgatggcacataaactagaaatgataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaa |
190 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |
|
|
| T |
8886978 |
ttgatagcacataaattagaaatgataaaataatcttttatcatacttatcgatgattgtgaattttgaaaaataaaattgatgcgcttgatgtgttcaa |
8886879 |
T |
|
| Q |
191 |
tttttataa |
199 |
Q |
| |
|
||| ||||| |
|
|
| T |
8886878 |
tttctataa |
8886870 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Original strand, 7572208 - 7572256
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctcta |
62 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7572208 |
atgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctcta |
7572256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39522270 - 39522043
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39522270 |
atgaaccaaaagttcatataaattaatgtttagagaatt-gaatctctaaacttaatagattatgatatgtgtgaacttgatgggacataaattagaaat |
39522172 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
39522171 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgctcaatttttataacgaaaattgaaatt |
39522072 |
T |
|
| Q |
214 |
tatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
39522071 |
tatagagtacccaagtttaagaacaaaaa |
39522043 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26671122 - 26670894
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26671122 |
atgaaccaaaatttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctcaaaatataatagattatgatatgtgtgaatttgatggcacatacactagaaat |
26671023 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26671022 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatt |
26670923 |
T |
|
| Q |
214 |
tatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26670922 |
tatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
26670894 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26942719 - 26942491
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26942719 |
atgaaccaaaatttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctcaaaatataatagattatgatatgtgtgaatttgatggcacatacactagaaat |
26942620 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26942619 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatt |
26942520 |
T |
|
| Q |
214 |
tatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26942519 |
tatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
26942491 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36427484 - 36427256
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36427484 |
atgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagaga-tataaatctctaaacataataaattatgatatgtgtgaatttgatggcacataaagtagaaat |
36427386 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatatttt-atcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaat |
212 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
36427385 |
gatgaaaggatatttttatcatatttattgatgactgtgaattttgaaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaat |
36427286 |
T |
|
| Q |
213 |
ttatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36427285 |
ttatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
36427256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 23978430 - 23978628
Alignment:
| Q |
18 |
accaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23978430 |
accaaaagttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatatctaaatttaataaattatgatatgtgcaaacttgatggcacataacctagaaatgata |
23978529 |
T |
|
| Q |
118 |
aaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatttat |
216 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| |
|
|
| T |
23978530 |
aaatgatattttatcttatttatggatgactacgaattttgaaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaatttaagtttat |
23978628 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 89 - 242
Target Start/End: Original strand, 36938540 - 36938695
Alignment:
| Q |
89 |
acttgatggcacataaactagaaatgataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttc |
188 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
36938540 |
acttgatagcacataaattagaaatgataaaataatcttttatcatacttatcgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatgcgcttgatatgttc |
36938639 |
T |
|
| Q |
189 |
aatttttataacgaagattgaaattt-------atagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36938640 |
aatttctataa-----attgaaatttatgttggatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
36938695 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42000472 - 42000319
Alignment:
| Q |
91 |
ttgatggcacataaactagaaatgataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaa |
190 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42000472 |
ttgatagcacataaattagaaatgataaaataatcttttatcatacttatcgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatgcgcttgatatgttcaa |
42000373 |
T |
|
| Q |
191 |
tttttataac--gaagattgaaatttatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42000372 |
tttctataacttgaagtttatgttggatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
42000319 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 560520 - 560365
Alignment:
| Q |
89 |
acttgatggcacataaactagaaatgataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttc |
188 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
560520 |
acttgatagcacataaattagaaatgataaaataatcttttatcatacttatcaatgactgtgaattttggaaaataaaattgatgcgcttgatatgttc |
560421 |
T |
|
| Q |
189 |
aatttttataacgaagattgaaattt-------atagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
560420 |
aatttctataa-----attgaaatttatgttggatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
560365 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 40126855 - 40127084
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
40126855 |
atgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatttctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagaaat |
40126954 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttc-aatttttataacgaagattgaaat |
212 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
40126955 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaaatttttataacgaaaattgaaat |
40127054 |
T |
|
| Q |
213 |
ttatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
40127055 |
ttatagagtacccaagtctacgaacaaaaa |
40127084 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 23082849 - 23083078
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatat-gtgcgaacttgatggcacataaactagaaa |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23082849 |
atgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctctaaatataatagattatgatattgtgtgaacttgatgacacataaactagaaa |
23082948 |
T |
|
| Q |
113 |
tgataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaat |
212 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23082949 |
tgataatatgatattttatcatatttatcgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgtttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaat |
23083048 |
T |
|
| Q |
213 |
ttatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23083049 |
ttatagagtacccaagtctaagaataaaaa |
23083078 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34117481 - 34117237
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
34117481 |
atgaactaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctctaaacataataaattatgatatgtgtgaacttgatgacacataaactagaaat |
34117382 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | | ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
34117381 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaatattgaaaaataaaatcgatatgtttgatatgttcaatttctataaagaaaattgaaatt |
34117282 |
T |
|
| Q |
214 |
t-------atagagtacccaagtctaagaacaaaaaattttaatta |
252 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34117281 |
tgtgttggaaagagtacccaagtctaagaac-gaaaattttaatta |
34117237 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 8319598 - 8319834
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaactt-aataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaa |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8319598 |
atgaaccaaaagttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatctctaaactttaataaattatgatatgtgcaaacttgatggcacataacctagaaa |
8319697 |
T |
|
| Q |
113 |
tgataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaat |
212 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
8319698 |
tgataaaacgatattttatcaaatttattggtgactgcgaattttgaaaaataaaattgatatgcttaaaatgttcaatttctataatgaaaattgaaat |
8319797 |
T |
|
| Q |
213 |
tt-------atagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8319798 |
ctatgttggatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
8319834 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 240
Target Start/End: Original strand, 38183606 - 38183805
Alignment:
| Q |
42 |
tttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaatgataaaataatat-tttatcatatttat |
140 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38183606 |
tttagagaattagaatctc-aaacttaataaattatgatatgtgcaaatttgatggcacataaattagaaataataaaatgatatgtttatcatatttat |
38183704 |
T |
|
| Q |
141 |
tgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatttat-agagtacccaagtctaagaacaa |
239 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38183705 |
tgatgacggtgaattttggaaaataaaattgatatgtttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaattcataagagtacccaagtctgagaacaa |
38183804 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 212
Target Start/End: Original strand, 25368702 - 25368901
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaactt-aataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaa |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| | || |||| ||||||| |
|
|
| T |
25368702 |
atgaaccaaaagttcatataaattagtgtttagagaatttgaatctctaaactttaataaattatgatatgtgcaaatttgacgacaaataacctagaaa |
25368801 |
T |
|
| Q |
113 |
tgataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaat |
212 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
25368802 |
tgataaaacgatattttatcatatttattgatgactgcgaattttgaaaaataaaattgatatgcttgaaatgttcaatttctataatgaaaattgaaat |
25368901 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17024025 - 17023868
Alignment:
| Q |
85 |
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183 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
17024025 |
gcgaatttgatggcacataaattagaaatgataaaaggatatttttatcatatttat-gatgattgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgata |
17023927 |
T |
|
| Q |
184 |
ttttcaatttttataacgaagattgaaatttatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17023926 |
tgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagttcccaagtctaagaacaaaaa |
17023868 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17554518 - 17554361
Alignment:
| Q |
85 |
gcgaacttgatggcacataaactagaaatgataaaataatatttt-atcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgata |
183 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
17554518 |
gcgaatttgatggcacataaattagaaatgataaaaggatatttttatcatatttat-gatgattgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgata |
17554420 |
T |
|
| Q |
184 |
ttttcaatttttataacgaagattgaaatttatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17554419 |
tgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagttcccaagtctaagaacaaaaa |
17554361 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 199
Target Start/End: Original strand, 4239367 - 4239477
Alignment:
| Q |
89 |
acttgatggcacataaactagaaatgataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttc |
188 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
4239367 |
acttgatagcacataaattagaaatgataaaataatcttttatcatacttatcgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatgcgcttgatatgttc |
4239466 |
T |
|
| Q |
189 |
aatttttataa |
199 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
4239467 |
aatttctataa |
4239477 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 17024969 - 17024895
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaa |
89 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17024969 |
atgaaccaaaagttcatataaattaatgattagagaatt-gaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaa |
17024895 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 17555461 - 17555387
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaa |
89 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17555461 |
atgaaccaaaagttcatataaattaatgattagagaatt-gaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaa |
17555387 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 10389315 - 10389471
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10389315 |
atgaatcaaaagttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatctctaaacttaataaaatatgatatgtgcaaacttgatggcacataaattagaaat |
10389414 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaatt |
170 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10389415 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaatt |
10389471 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21668409 - 21668182
Alignment:
| Q |
15 |
tgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaatg |
114 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21668409 |
tgaaccagaagttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatctctaaacttaataaatcatgatataagcgaacttgatagcacataaactagaaatg |
21668310 |
T |
|
| Q |
115 |
ataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaa---aaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaa |
211 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21668309 |
atagaataatattttatcatat----------cagtgaattttgaaaagaaaaaaaattgatatgcttgatatgtttaattttcataacgaaaattgaaa |
21668220 |
T |
|
| Q |
212 |
ttt-------atagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21668219 |
tttatgttggatagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
21668182 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:
Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 48990 - 49226
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaactt-aataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaa |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48990 |
atgaaccaaaagttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatctctaaactttaataaattatgatatgtgcaaactttatggcacataacctagaaa |
49089 |
T |
|
| Q |
113 |
tgataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaat |
212 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||| || |||||||| |
|
|
| T |
49090 |
tgataaaacgatattttatcatatttattgatgactgcgaattttgaaaaataaaattgatatgcttgaaatgttcaatttctataacaaaaattgaaat |
49189 |
T |
|
| Q |
213 |
tt-------atagagtacccaagtctaagaacaaaaa |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49190 |
ctaagttggatagagtatccaagtctaagaacaaaaa |
49226 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0045 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:
Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 82157 - 81999
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
82157 |
atgaaccaaaagttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatctctaaacttaatgaattatgatatgtgtgaacttgatgacacataacctagaaat |
82058 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattga |
172 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
82057 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgactgcgaattttaaaaaataaaattga |
81999 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0468 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:
Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 151 - 353
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
151 |
atgaaccaaaagttcatataaattagtgtttagggaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgtgaacttgatggcacataacctagaaaa |
250 |
T |
|
| Q |
114 |
gataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||| |||| | | ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
251 |
gataaaatgatattttatcatatttattgatgattgcgaattataaaaaaaaaatttgatatgtttgatatgttcaatttatttaacgaaaattgaaatt |
350 |
T |
|
| Q |
214 |
tat |
216 |
Q |
| |
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||| |
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| T |
351 |
tat |
353 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0070 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:
Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 62421 - 62222
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaactt-aataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaa |
112 |
Q |
| |
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|
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| T |
62421 |
atgaaccaaaagttcatataaattagtgtttagagaatttgaatctctaaactttaataaattatgatatgtgcaaatttgacgacaaataacctagaaa |
62322 |
T |
|
| Q |
113 |
tgataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaat |
212 |
Q |
| |
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|
| T |
62321 |
tgataaaacgatattttatcatatttattgatgactgcgaattttgaaaaataaaattgatatgcttgaaatgttcaatttctataatgaaaattgaaat |
62222 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 216
Target Start/End: Original strand, 15997615 - 15997787
Alignment:
| Q |
44 |
tagagaatttgaatctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataaactagaaatgataaaataatattttatcatatttattga |
143 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
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| T |
15997615 |
tagagaatttgaacctctaaacttaataaattatgatatgtgcaaacttgatggaacataaactagaatttataaaaatatattgtatcatatttattga |
15997714 |
T |
|
| Q |
144 |
tgaccgtgaattttgaaaaataaaattgacaagcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatttat |
216 |
Q |
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|
|
| T |
15997715 |
tgaccgtaaattttgacaaataaaattgatacactttatatgttcaagttttataacaaaaattgaaatttat |
15997787 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0330 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:
Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18818 - 18755
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattat |
77 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18818 |
atgaactaaaagttcatataaaccagtgtttagagaatttgaatctctaaacttaataaattat |
18755 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 2836 - 2773
Alignment:
| Q |
14 |
atgaaccaaaagttcatataaatcaatatttagagaatttgaatctctaaacttaataaattat |
77 |
Q |
| |
|
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|
| T |
2836 |
atgaactaaaagttcatataaaccagtgtttagagaatttgaatctctaaacttaataaattat |
2773 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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