View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14642_low_4 (Length: 564)

Name: NF14642_low_4
Description: NF14642
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14642_low_4
NF14642_low_4
[»] chr1 (163 HSPs)
chr1 (134-547)||(16124545-16124960)
chr1 (135-381)||(775495-775739)
chr1 (1-198)||(16226248-16226446)
chr1 (1-198)||(28840761-28840958)
chr1 (134-377)||(29651637-29651879)
chr1 (135-381)||(19072749-19072995)
chr1 (135-381)||(19120639-19120885)
chr1 (134-394)||(13598205-13598466)
chr1 (1-198)||(47179794-47179991)
chr1 (1-198)||(51750120-51750318)
chr1 (1-198)||(46431708-46431907)
chr1 (135-374)||(47098854-47099090)
chr1 (1-198)||(16231644-16231841)
chr1 (1-198)||(27336942-27337139)
chr1 (1-198)||(51752446-51752642)
chr1 (1-198)||(9459419-9459617)
chr1 (1-198)||(9463246-9463444)
chr1 (1-198)||(31735523-31735721)
chr1 (134-377)||(47703965-47704208)
chr1 (1-195)||(2617597-2617792)
chr1 (1-198)||(10399830-10400028)
chr1 (1-198)||(47177443-47177640)
chr1 (134-378)||(27104401-27104640)
chr1 (1-198)||(15294836-15295034)
chr1 (12-198)||(51757623-51757809)
chr1 (1-198)||(20302540-20302737)
chr1 (135-374)||(47102871-47103107)
chr1 (1-198)||(6823095-6823293)
chr1 (1-198)||(13761918-13762115)
chr1 (1-198)||(20291538-20291735)
chr1 (1-198)||(27339133-27339330)
chr1 (16-198)||(23785935-23786118)
chr1 (1-198)||(17324638-17324836)
chr1 (1-198)||(47906351-47906549)
chr1 (1-198)||(28842576-28842773)
chr1 (1-198)||(15823627-15823825)
chr1 (1-198)||(12302507-12302705)
chr1 (1-198)||(24325744-24325942)
chr1 (1-198)||(50307548-50307746)
chr1 (138-376)||(26644930-26645166)
chr1 (1-198)||(39932154-39932353)
chr1 (1-162)||(21948226-21948387)
chr1 (1-198)||(16428734-16428933)
chr1 (133-377)||(21536597-21536839)
chr1 (1-198)||(13215162-13215365)
chr1 (1-198)||(39462600-39462798)
chr1 (1-198)||(2510327-2510524)
chr1 (134-379)||(9476087-9476329)
chr1 (1-198)||(41647001-41647199)
chr1 (1-198)||(18839668-18839867)
chr1 (135-377)||(32889266-32889506)
chr1 (1-198)||(38925483-38925678)
chr1 (1-198)||(11457477-11457675)
chr1 (1-141)||(48665258-48665400)
chr1 (137-377)||(3281537-3281773)
chr1 (1-198)||(14097971-14098170)
chr1 (1-198)||(6995702-6995900)
chr1 (1-174)||(15669419-15669594)
chr1 (5-198)||(16429042-16429237)
chr1 (134-375)||(37069597-37069838)
chr1 (1-198)||(50076674-50076872)
chr1 (1-198)||(2949234-2949431)
chr1 (1-198)||(4131377-4131579)
chr1 (1-189)||(9241096-9241286)
chr1 (1-198)||(28998255-28998453)
chr1 (1-198)||(29003971-29004169)
chr1 (1-198)||(18307190-18307388)
chr1 (1-186)||(50078834-50079021)
chr1 (216-377)||(40816842-40817003)
chr1 (1-198)||(42922311-42922511)
chr1 (1-186)||(17186141-17186328)
chr1 (1-198)||(14183592-14183792)
chr1 (1-198)||(25127953-25128152)
chr1 (1-198)||(25248553-25248752)
chr1 (1-198)||(25251276-25251475)
chr1 (1-116)||(31422958-31423073)
chr1 (1-198)||(3579619-3579816)
chr1 (61-198)||(23816027-23816165)
chr1 (1-198)||(6756609-6756807)
chr1 (1-198)||(31425017-31425218)
chr1 (1-188)||(31489994-31490181)
chr1 (1-198)||(17324144-17324343)
chr1 (5-198)||(28207070-28207262)
chr1 (1-187)||(8347284-8347473)
chr1 (134-381)||(13604652-13604897)
chr1 (1-198)||(6115104-6115303)
chr1 (1-139)||(50248633-50248772)
chr1 (1-184)||(40134025-40134210)
chr1 (1-198)||(16432475-16432675)
chr1 (25-196)||(47451747-47451919)
chr1 (20-175)||(21353372-21353525)
chr1 (169-395)||(50521165-50521391)
chr1 (1-116)||(6823966-6824088)
chr1 (1-198)||(17318974-17319166)
chr1 (1-116)||(49495296-49495411)
chr1 (134-356)||(19358872-19359095)
chr1 (1-164)||(18800608-18800773)
chr1 (134-396)||(19361461-19361725)
chr1 (134-396)||(19380101-19380365)
chr1 (2-162)||(155788-155950)
chr1 (17-198)||(2232597-2232772)
chr1 (5-198)||(8349052-8349248)
chr1 (2-198)||(26613240-26613440)
chr1 (230-395)||(9023956-9024118)
chr1 (2-186)||(27916576-27916765)
chr1 (2-188)||(30738638-30738830)
chr1 (1-189)||(30790411-30790601)
chr1 (1-188)||(13125468-13125659)
chr1 (134-373)||(24202798-24203033)
chr1 (20-198)||(2401221-2401400)
chr1 (20-198)||(9526469-9526648)
chr1 (1-198)||(16561547-16561748)
chr1 (1-108)||(26520206-26520320)
chr1 (17-198)||(4144683-4144865)
chr1 (125-198)||(13358779-13358852)
chr1 (20-130)||(25134074-25134181)
chr1 (135-356)||(17345549-17345768)
chr1 (20-198)||(9521718-9521897)
chr1 (20-189)||(2393292-2393461)
chr1 (2-77)||(26332613-26332688)
chr1 (2-79)||(28279346-28279424)
chr1 (138-203)||(25445110-25445174)
chr1 (154-214)||(28265537-28265598)
chr1 (138-203)||(39445500-39445564)
chr1 (138-203)||(44023894-44023958)
chr1 (154-217)||(3156989-3157053)
chr1 (154-213)||(28220210-28220270)
chr1 (2-79)||(14353047-14353126)
chr1 (245-348)||(32737134-32737236)
chr1 (154-214)||(834150-834211)
chr1 (138-203)||(1055032-1055096)
chr1 (154-214)||(13137959-13138020)
chr1 (92-198)||(15916562-15916671)
chr1 (156-222)||(41361040-41361108)
chr1 (138-202)||(24787397-24787460)
chr1 (154-213)||(28223405-28223465)
chr1 (154-217)||(31659362-31659426)
chr1 (138-202)||(41390582-41390645)
chr1 (138-202)||(41398237-41398300)
chr1 (154-217)||(44455284-44455348)
chr1 (154-217)||(49918474-49918538)
chr1 (156-214)||(45644337-45644396)
chr1 (231-294)||(48382607-48382669)
chr1 (134-214)||(3847104-3847186)
chr1 (17-79)||(14997040-14997101)
chr1 (2-44)||(26332719-26332761)
chr1 (163-292)||(35109594-35109720)
chr1 (62-189)||(46783189-46783319)
chr1 (91-214)||(50167158-50167280)
chr1 (154-214)||(4552620-4552681)
chr1 (154-217)||(37559847-37559912)
chr1 (154-214)||(40122179-40122240)
chr1 (6-79)||(43104245-43104318)
chr1 (138-203)||(43988485-43988549)
chr1 (154-214)||(50169193-50169254)
chr1 (137-356)||(22819273-22819494)
chr1 (154-217)||(37503537-37503601)
chr1 (2-44)||(49959129-49959172)
chr1 (159-211)||(196893-196946)
chr1 (154-214)||(13659319-13659380)
chr1 (177-217)||(30476426-30476467)
chr1 (154-214)||(36683804-36683865)
chr1 (154-214)||(46065042-46065103)
[»] chr4 (183 HSPs)
chr4 (134-381)||(10047202-10047447)
chr4 (134-381)||(25862051-25862296)
chr4 (134-381)||(39245816-39246062)
chr4 (1-198)||(7941458-7941656)
chr4 (1-198)||(44599838-44600036)
chr4 (1-198)||(9148388-9148585)
chr4 (1-198)||(22046686-22046883)
chr4 (1-198)||(22132392-22132589)
chr4 (1-198)||(38409340-38409537)
chr4 (1-198)||(8631419-8631617)
chr4 (1-198)||(16931789-16931987)
chr4 (1-198)||(16934143-16934341)
chr4 (1-198)||(18709164-18709361)
chr4 (1-198)||(37089372-37089569)
chr4 (1-198)||(51015381-51015578)
chr4 (1-198)||(22780373-22780571)
chr4 (1-198)||(22782738-22782936)
chr4 (1-198)||(2484873-2485070)
chr4 (1-198)||(22044391-22044588)
chr4 (1-198)||(31849599-31849796)
chr4 (134-380)||(54867006-54867251)
chr4 (1-198)||(6764979-6765177)
chr4 (1-198)||(9176474-9176672)
chr4 (1-198)||(17662245-17662443)
chr4 (1-198)||(24348353-24348551)
chr4 (1-198)||(22134618-22134814)
chr4 (1-188)||(11006247-11006435)
chr4 (134-377)||(5143086-5143327)
chr4 (138-377)||(5147504-5147741)
chr4 (134-362)||(5269220-5269449)
chr4 (1-198)||(11435090-11435287)
chr4 (134-379)||(24333635-24333877)
chr4 (1-198)||(26085977-26086174)
chr4 (134-377)||(16630709-16630950)
chr4 (1-198)||(11008568-11008764)
chr4 (1-198)||(5198555-5198753)
chr4 (1-198)||(18847288-18847485)
chr4 (134-377)||(38152468-38152710)
chr4 (12-194)||(47210756-47210939)
chr4 (1-198)||(47868536-47868734)
chr4 (1-198)||(9174146-9174344)
chr4 (1-198)||(22800862-22801060)
chr4 (1-198)||(24888931-24889129)
chr4 (1-198)||(36921493-36921691)
chr4 (1-198)||(40637209-40637407)
chr4 (135-394)||(42599602-42599864)
chr4 (1-198)||(22802734-22802932)
chr4 (1-198)||(36919584-36919782)
chr4 (1-198)||(40091415-40091613)
chr4 (134-379)||(3796548-3796794)
chr4 (1-198)||(24879124-24879323)
chr4 (1-198)||(14633454-14633651)
chr4 (134-348)||(3777406-3777617)
chr4 (1-198)||(47274861-47275058)
chr4 (1-198)||(48486454-48486652)
chr4 (1-198)||(24880586-24880785)
chr4 (134-356)||(5396700-5396923)
chr4 (1-198)||(12395845-12396043)
chr4 (1-198)||(38928177-38928375)
chr4 (1-141)||(3824627-3824768)
chr4 (1-139)||(5637524-5637663)
chr4 (1-198)||(12400807-12401005)
chr4 (134-381)||(6743444-6743694)
chr4 (1-189)||(19322828-19323019)
chr4 (1-195)||(33415491-33415686)
chr4 (1-198)||(19096018-19096216)
chr4 (1-198)||(16455376-16455575)
chr4 (1-198)||(36378427-36378626)
chr4 (60-198)||(11437557-11437695)
chr4 (1-189)||(16453444-16453634)
chr4 (2-174)||(13544095-13544268)
chr4 (2-198)||(14787429-14787628)
chr4 (1-175)||(18537497-18537673)
chr4 (14-188)||(13547302-13547477)
chr4 (61-198)||(5635476-5635614)
chr4 (1-183)||(37313080-37313264)
chr4 (1-198)||(36380484-36380683)
chr4 (43-198)||(4215483-4215639)
chr4 (1-198)||(38890224-38890424)
chr4 (1-198)||(53405264-53405466)
chr4 (8-198)||(2891433-2891625)
chr4 (245-377)||(16624147-16624279)
chr4 (134-341)||(31985663-31985866)
chr4 (1-198)||(619448-619645)
chr4 (1-194)||(56030579-56030770)
chr4 (1-172)||(18534858-18535031)
chr4 (134-356)||(28468558-28468776)
chr4 (155-377)||(8689533-8689748)
chr4 (134-362)||(36315258-36315467)
chr4 (134-362)||(36329467-36329676)
chr4 (134-238)||(16623322-16623426)
chr4 (1-188)||(12102221-12102412)
chr4 (135-378)||(34495853-34496093)
chr4 (1-189)||(41997627-41997816)
chr4 (1-173)||(8756276-8756451)
chr4 (2-198)||(28453818-28454017)
chr4 (1-188)||(15032557-15032747)
chr4 (17-198)||(16185834-16186018)
chr4 (135-381)||(1983330-1983572)
chr4 (17-198)||(11853549-11853730)
chr4 (1-116)||(18409430-18409545)
chr4 (2-116)||(52942542-52942643)
chr4 (2-198)||(9863842-9864046)
chr4 (1-84)||(6133007-6133090)
chr4 (20-198)||(8529270-8529449)
chr4 (20-198)||(18586969-18587148)
chr4 (20-198)||(31300427-31300605)
chr4 (1-94)||(3937314-3937407)
chr4 (17-175)||(7050281-7050439)
chr4 (5-187)||(3982186-3982374)
chr4 (2-189)||(10113003-10113195)
chr4 (1-116)||(30136684-30136799)
chr4 (1-161)||(31983564-31983727)
chr4 (20-189)||(15831144-15831314)
chr4 (2-198)||(25357772-25357976)
chr4 (2-116)||(47150977-47151092)
chr4 (17-198)||(55822265-55822445)
chr4 (20-198)||(4558314-4558492)
chr4 (20-198)||(15316961-15317139)
chr4 (20-198)||(16688940-16689119)
chr4 (17-198)||(4570094-4570275)
chr4 (1-101)||(27499180-27499280)
chr4 (17-189)||(36769479-36769652)
chr4 (20-175)||(4556084-4556238)
chr4 (138-373)||(24741769-24742004)
chr4 (20-198)||(4884877-4885056)
chr4 (17-190)||(5336788-5336964)
chr4 (20-161)||(16489352-16489493)
chr4 (67-198)||(5101130-5101261)
chr4 (2-172)||(9022438-9022613)
chr4 (154-217)||(9927438-9927502)
chr4 (20-188)||(15312319-15312488)
chr4 (20-170)||(13072010-13072160)
chr4 (135-192)||(39774335-39774392)
chr4 (2-79)||(40999071-40999148)
chr4 (154-217)||(12739530-12739594)
chr4 (154-217)||(26175616-26175680)
chr4 (20-79)||(25699752-25699810)
chr4 (17-188)||(36771396-36771568)
chr4 (138-203)||(3814024-3814088)
chr4 (138-203)||(5732665-5732729)
chr4 (138-203)||(18855727-18855791)
chr4 (91-202)||(27416961-27417070)
chr4 (154-214)||(48893621-48893682)
chr4 (138-202)||(9224428-9224491)
chr4 (154-217)||(12743905-12743969)
chr4 (154-217)||(12745294-12745358)
chr4 (138-202)||(29760642-29760705)
chr4 (138-202)||(51520458-51520521)
chr4 (135-214)||(5112226-5112304)
chr4 (135-352)||(18377223-18377426)
chr4 (154-214)||(46147374-46147435)
chr4 (154-214)||(52467337-52467398)
chr4 (154-217)||(5429803-5429867)
chr4 (138-202)||(9229215-9229278)
chr4 (154-217)||(29254618-29254682)
chr4 (154-217)||(34570394-34570458)
chr4 (154-202)||(36463385-36463433)
chr4 (138-202)||(45347838-45347901)
chr4 (138-202)||(45357317-45357380)
chr4 (154-212)||(5871944-5872003)
chr4 (20-79)||(47566496-47566554)
chr4 (2-44)||(10114463-10114505)
chr4 (138-180)||(56146732-56146774)
chr4 (293-377)||(5112068-5112151)
chr4 (17-161)||(16638827-16638973)
chr4 (230-350)||(37781716-37781836)
chr4 (154-222)||(45687157-45687226)
chr4 (154-214)||(47038394-47038455)
chr4 (2-120)||(54906722-54906843)
chr4 (84-198)||(3578671-3578786)
chr4 (245-308)||(4956083-4956144)
chr4 (86-161)||(24446678-24446754)
chr4 (291-373)||(29760470-29760554)
chr4 (154-214)||(36994648-36994708)
chr4 (154-217)||(37740749-37740813)
chr4 (138-217)||(48053068-48053148)
chr4 (154-217)||(54199887-54199950)
chr4 (104-188)||(26557823-26557909)
chr4 (285-314)||(7816394-7816423)
chr4 (144-198)||(14789428-14789484)
chr4 (125-198)||(47563021-47563094)
chr4 (61-89)||(38270120-38270148)
[»] chr7 (168 HSPs)
chr7 (135-395)||(20283898-20284156)
chr7 (1-198)||(1046925-1047122)
chr7 (1-198)||(1049296-1049493)
chr7 (134-379)||(29159627-29159871)
chr7 (1-198)||(40836743-40836940)
chr7 (1-198)||(7351652-7351850)
chr7 (1-198)||(38394077-38394275)
chr7 (1-186)||(7349285-7349471)
chr7 (1-198)||(20299551-20299749)
chr7 (135-381)||(33332480-33332724)
chr7 (134-381)||(4796696-4796944)
chr7 (134-381)||(46516339-46516585)
chr7 (1-198)||(20626129-20626327)
chr7 (1-198)||(20630020-20630218)
chr7 (1-198)||(20642439-20642637)
chr7 (1-198)||(31155911-31156109)
chr7 (134-379)||(49091487-49091729)
chr7 (135-378)||(9190038-9190279)
chr7 (1-198)||(3035812-3036013)
chr7 (1-198)||(7470022-7470220)
chr7 (1-198)||(7471980-7472178)
chr7 (1-198)||(18345632-18345830)
chr7 (135-381)||(23403043-23403287)
chr7 (1-198)||(44724670-44724868)
chr7 (5-198)||(48457748-48457942)
chr7 (1-195)||(20297453-20297648)
chr7 (1-198)||(3878668-3878866)
chr7 (1-198)||(38396726-38396923)
chr7 (1-198)||(1850072-1850270)
chr7 (134-356)||(2647725-2647946)
chr7 (16-198)||(2935374-2935557)
chr7 (1-198)||(35720-35918)
chr7 (1-198)||(27306230-27306428)
chr7 (1-198)||(40946419-40946617)
chr7 (155-377)||(21988733-21988955)
chr7 (1-198)||(25542621-25542817)
chr7 (134-377)||(21983109-21983352)
chr7 (134-379)||(55764-56015)
chr7 (1-198)||(7092213-7092410)
chr7 (135-395)||(9185195-9185451)
chr7 (16-198)||(1606486-1606668)
chr7 (1-195)||(7094463-7094658)
chr7 (16-198)||(9027194-9027376)
chr7 (16-198)||(22137184-22137366)
chr7 (16-198)||(40552211-40552393)
chr7 (1-195)||(43253520-43253715)
chr7 (1-142)||(11757321-11757463)
chr7 (1-198)||(28487644-28487842)
chr7 (135-395)||(2580197-2580457)
chr7 (184-381)||(9235634-9235831)
chr7 (16-198)||(22108173-22108355)
chr7 (1-198)||(31435046-31435245)
chr7 (16-198)||(40549933-40550115)
chr7 (1-198)||(44655-44853)
chr7 (134-377)||(35960641-35960884)
chr7 (1-198)||(24748685-24748884)
chr7 (1-198)||(4295934-4296132)
chr7 (1-198)||(13099474-13099674)
chr7 (1-198)||(42330997-42331197)
chr7 (1-198)||(20137109-20137307)
chr7 (1-188)||(9680911-9681099)
chr7 (1-189)||(37412134-37412325)
chr7 (1-198)||(443686-443885)
chr7 (1-174)||(27832656-27832831)
chr7 (1-198)||(11355349-11355547)
chr7 (1-198)||(21592143-21592341)
chr7 (1-198)||(21990241-21990439)
chr7 (2-198)||(9679151-9679348)
chr7 (134-375)||(47263509-47263744)
chr7 (134-375)||(2479168-2479404)
chr7 (1-198)||(24813497-24813697)
chr7 (1-189)||(21680118-21680307)
chr7 (1-165)||(20091580-20091743)
chr7 (1-198)||(28485657-28485854)
chr7 (1-198)||(42223249-42223447)
chr7 (134-375)||(44848713-44848953)
chr7 (1-198)||(21678157-21678355)
chr7 (1-188)||(24817362-24817552)
chr7 (1-103)||(26804663-26804765)
chr7 (1-116)||(25276232-25276347)
chr7 (1-198)||(39145986-39146185)
chr7 (138-356)||(18408613-18408827)
chr7 (133-373)||(21639641-21639877)
chr7 (1-186)||(24258554-24258744)
chr7 (134-341)||(18413506-18413707)
chr7 (17-116)||(22828716-22828815)
chr7 (135-381)||(28617255-28617500)
chr7 (17-198)||(25351353-25351533)
chr7 (1-165)||(7188630-7188796)
chr7 (135-275)||(5817300-5817438)
chr7 (1-175)||(2120881-2121057)
chr7 (17-198)||(3320051-3320232)
chr7 (17-198)||(3324799-3324980)
chr7 (17-198)||(25405393-25405574)
chr7 (2-108)||(24465629-24465735)
chr7 (17-198)||(25357047-25357227)
chr7 (134-356)||(21645855-21646074)
chr7 (17-198)||(25410130-25410312)
chr7 (17-198)||(7069780-7069961)
chr7 (138-373)||(1533477-1533709)
chr7 (26-108)||(22251641-22251723)
chr7 (17-187)||(7074787-7074957)
chr7 (17-198)||(8378504-8378686)
chr7 (17-198)||(15540996-15541177)
chr7 (17-198)||(42006663-42006845)
chr7 (2-198)||(6332311-6332511)
chr7 (2-78)||(16297146-16297222)
chr7 (64-198)||(22393876-22394012)
chr7 (58-186)||(6046641-6046772)
chr7 (20-175)||(30246973-30247128)
chr7 (17-199)||(21369642-21369825)
chr7 (1-55)||(22392552-22392606)
chr7 (61-189)||(26295598-26295728)
chr7 (20-198)||(44512526-44512704)
chr7 (40-116)||(6348912-6348988)
chr7 (20-188)||(44010760-44010929)
chr7 (288-395)||(3047061-3047167)
chr7 (2-198)||(11081598-11081800)
chr7 (154-232)||(30814560-30814637)
chr7 (5-110)||(40281466-40281572)
chr7 (2-79)||(11084467-11084544)
chr7 (154-262)||(22270097-22270204)
chr7 (154-217)||(27347941-27348005)
chr7 (20-68)||(44143997-44144045)
chr7 (20-79)||(34546984-34547042)
chr7 (20-198)||(7464519-7464697)
chr7 (138-203)||(19992313-19992377)
chr7 (138-203)||(24024347-24024411)
chr7 (154-214)||(41317417-41317478)
chr7 (138-202)||(2057966-2058029)
chr7 (138-202)||(4866731-4866794)
chr7 (154-217)||(48489555-48489619)
chr7 (2-79)||(26210631-26210710)
chr7 (2-133)||(6048961-6049094)
chr7 (154-214)||(12097850-12097911)
chr7 (138-203)||(16880073-16880137)
chr7 (138-203)||(16884929-16884993)
chr7 (138-203)||(24261344-24261408)
chr7 (138-203)||(24266223-24266287)
chr7 (138-203)||(31109604-31109668)
chr7 (154-214)||(41648994-41649055)
chr7 (138-202)||(12396912-12396975)
chr7 (154-213)||(14069817-14069877)
chr7 (154-213)||(14379845-14379905)
chr7 (138-202)||(20357580-20357643)
chr7 (154-217)||(31732949-31733013)
chr7 (154-217)||(47676116-47676180)
chr7 (154-211)||(8153466-8153524)
chr7 (17-55)||(12310160-12310198)
chr7 (154-214)||(1113781-1113842)
chr7 (138-203)||(21812259-21812323)
chr7 (110-198)||(34546880-34546972)
chr7 (154-214)||(36146391-36146452)
chr7 (26-198)||(6067198-6067373)
chr7 (146-198)||(11759364-11759416)
chr7 (138-202)||(12406332-12406395)
chr7 (154-217)||(18126768-18126832)
chr7 (160-217)||(26417445-26417504)
chr7 (154-217)||(43864368-43864432)
chr7 (154-211)||(2759183-2759241)
chr7 (20-175)||(44016685-44016840)
chr7 (160-217)||(47673924-47673982)
chr7 (110-198)||(2075205-2075297)
chr7 (154-214)||(24525485-24525546)
chr7 (158-214)||(38671205-38671262)
chr7 (344-380)||(2647964-2648000)
chr7 (135-214)||(3047243-3047322)
chr7 (154-217)||(4586285-4586349)
[»] chr3 (218 HSPs)
chr3 (134-398)||(48438020-48438282)
chr3 (134-379)||(40592801-40593048)
chr3 (1-198)||(4103894-4104091)
chr3 (1-198)||(458345-458543)
chr3 (1-198)||(6063444-6063642)
chr3 (1-198)||(5522625-5522822)
chr3 (1-198)||(455968-456166)
chr3 (1-186)||(28413042-28413228)
chr3 (134-377)||(30709809-30710051)
chr3 (1-198)||(50494060-50494258)
chr3 (1-198)||(1321540-1321738)
chr3 (1-198)||(6065794-6065992)
chr3 (134-377)||(8370505-8370747)
chr3 (1-198)||(10621528-10621726)
chr3 (1-198)||(43226146-43226344)
chr3 (1-198)||(3859589-3859786)
chr3 (1-198)||(7606586-7606783)
chr3 (134-397)||(3716021-3716283)
chr3 (1-198)||(746818-747016)
chr3 (1-198)||(38210431-38210629)
chr3 (1-198)||(43228352-43228550)
chr3 (1-198)||(5191714-5191910)
chr3 (134-379)||(26298807-26299056)
chr3 (135-382)||(1417510-1417754)
chr3 (1-198)||(4308279-4308477)
chr3 (1-198)||(42990365-42990563)
chr3 (134-381)||(40844476-40844719)
chr3 (1-198)||(10084387-10084585)
chr3 (1-198)||(18099168-18099366)
chr3 (1-198)||(25533503-25533701)
chr3 (1-198)||(38890101-38890299)
chr3 (2-198)||(11170466-11170663)
chr3 (134-396)||(6794732-6794991)
chr3 (1-198)||(9604605-9604803)
chr3 (1-198)||(10956025-10956223)
chr3 (1-198)||(25388967-25389164)
chr3 (1-198)||(30005902-30006100)
chr3 (1-198)||(51727005-51727203)
chr3 (1-198)||(45883000-45883199)
chr3 (1-198)||(10958321-10958519)
chr3 (1-198)||(53917662-53917860)
chr3 (1-198)||(5886261-5886457)
chr3 (1-198)||(5899734-5899930)
chr3 (134-379)||(24695183-24695425)
chr3 (134-379)||(16264174-16264418)
chr3 (1-188)||(18096908-18097096)
chr3 (1-198)||(1313470-1313668)
chr3 (135-381)||(37466114-37466358)
chr3 (1-195)||(25688161-25688357)
chr3 (134-377)||(36028932-36029161)
chr3 (134-366)||(21711064-21711291)
chr3 (4-198)||(11168165-11168360)
chr3 (1-198)||(10191308-10191505)
chr3 (1-198)||(22114303-22114501)
chr3 (1-198)||(27101179-27101377)
chr3 (134-377)||(39040011-39040251)
chr3 (1-160)||(29956747-29956907)
chr3 (1-194)||(26720609-26720802)
chr3 (135-319)||(3328376-3328558)
chr3 (134-293)||(18552902-18553059)
chr3 (1-198)||(6484421-6484619)
chr3 (1-199)||(32264034-32264235)
chr3 (134-394)||(33386685-33386943)
chr3 (1-198)||(1626681-1626879)
chr3 (2-198)||(18162725-18162922)
chr3 (1-198)||(43421413-43421611)
chr3 (1-198)||(43423461-43423659)
chr3 (1-198)||(53915494-53915692)
chr3 (161-377)||(35925309-35925524)
chr3 (134-356)||(32143170-32143389)
chr3 (1-198)||(880449-880647)
chr3 (1-198)||(3314745-3314944)
chr3 (1-198)||(5926762-5926960)
chr3 (1-155)||(6561871-6562028)
chr3 (1-162)||(28102036-28102198)
chr3 (1-198)||(51674764-51674962)
chr3 (1-198)||(51943432-51943629)
chr3 (134-381)||(27986465-27986708)
chr3 (1-198)||(6231862-6232059)
chr3 (134-356)||(27974971-27975188)
chr3 (1-166)||(35917973-35918139)
chr3 (1-198)||(36011888-36012086)
chr3 (1-198)||(47148893-47149090)
chr3 (1-189)||(889780-889968)
chr3 (2-198)||(53468451-53468651)
chr3 (1-198)||(32219145-32219344)
chr3 (1-116)||(39715530-39715645)
chr3 (1-198)||(12267973-12268160)
chr3 (245-377)||(27026772-27026904)
chr3 (1-198)||(28761425-28761625)
chr3 (1-174)||(31151406-31151579)
chr3 (1-116)||(13420267-13420382)
chr3 (1-198)||(15780932-15781138)
chr3 (1-198)||(24979768-24979967)
chr3 (1-198)||(48361669-48361867)
chr3 (134-259)||(1736324-1736447)
chr3 (222-389)||(8126516-8126682)
chr3 (1-199)||(53591245-53591443)
chr3 (135-280)||(25795704-25795848)
chr3 (14-162)||(23633528-23633677)
chr3 (1-105)||(35777482-35777587)
chr3 (1-198)||(4666575-4666773)
chr3 (245-377)||(27038117-27038249)
chr3 (2-189)||(36871307-36871497)
chr3 (256-376)||(47924011-47924128)
chr3 (236-381)||(1417089-1417232)
chr3 (1-174)||(17795319-17795494)
chr3 (1-174)||(19103759-19103934)
chr3 (1-187)||(561783-561973)
chr3 (6-108)||(25635447-25635549)
chr3 (67-198)||(47701669-47701801)
chr3 (1-186)||(53597297-53597485)
chr3 (138-373)||(8477193-8477426)
chr3 (1-116)||(23637084-23637199)
chr3 (20-198)||(29913955-29914132)
chr3 (135-356)||(1305798-1306015)
chr3 (13-198)||(27635656-27635830)
chr3 (1-198)||(42992347-42992529)
chr3 (2-210)||(1620446-1620657)
chr3 (17-198)||(10094075-10094256)
chr3 (135-306)||(25929463-25929633)
chr3 (2-108)||(1674034-1674140)
chr3 (1-95)||(28100143-28100237)
chr3 (1-162)||(54691608-54691770)
chr3 (134-274)||(26928620-26928757)
chr3 (17-198)||(10100092-10100273)
chr3 (17-198)||(10200955-10201136)
chr3 (1-100)||(28181083-28181182)
chr3 (20-198)||(10897008-10897187)
chr3 (20-198)||(54193229-54193408)
chr3 (138-352)||(4386950-4387166)
chr3 (134-246)||(27452915-27453026)
chr3 (17-198)||(10208001-10208182)
chr3 (2-88)||(28137415-28137501)
chr3 (290-379)||(47649565-47649655)
chr3 (20-198)||(47878171-47878350)
chr3 (17-198)||(22625984-22626166)
chr3 (134-215)||(47923925-47924006)
chr3 (17-175)||(6303310-6303467)
chr3 (18-116)||(3306839-3306937)
chr3 (20-198)||(54188512-54188690)
chr3 (17-189)||(5858546-5858717)
chr3 (17-198)||(27544273-27544454)
chr3 (20-198)||(10612778-10612957)
chr3 (184-356)||(1309703-1309872)
chr3 (306-379)||(3323752-3323825)
chr3 (17-175)||(11079517-11079675)
chr3 (58-186)||(24181498-24181629)
chr3 (154-268)||(34491336-34491449)
chr3 (1-116)||(54884216-54884330)
chr3 (20-198)||(10595034-10595213)
chr3 (17-79)||(16462203-16462264)
chr3 (295-381)||(18554465-18554551)
chr3 (17-79)||(47883003-47883064)
chr3 (21-175)||(10949284-10949438)
chr3 (1-80)||(4560401-4560480)
chr3 (2-116)||(14634523-14634638)
chr3 (25-198)||(4535622-4535797)
chr3 (20-198)||(27761986-27762165)
chr3 (132-198)||(53894055-53894121)
chr3 (20-79)||(20031439-20031497)
chr3 (132-198)||(35919113-35919179)
chr3 (138-203)||(18656435-18656499)
chr3 (17-198)||(38002869-38003051)
chr3 (125-198)||(41849245-41849318)
chr3 (138-202)||(2671619-2671682)
chr3 (138-202)||(7167245-7167308)
chr3 (138-202)||(8739096-8739159)
chr3 (138-202)||(9091334-9091397)
chr3 (138-202)||(22173216-22173279)
chr3 (154-217)||(29813187-29813251)
chr3 (138-202)||(40372828-40372891)
chr3 (154-217)||(51398938-51399002)
chr3 (2-79)||(11066652-11066731)
chr3 (1-44)||(24177337-24177380)
chr3 (156-214)||(31314571-31314630)
chr3 (138-205)||(32480341-32480407)
chr3 (138-237)||(2672952-2673052)
chr3 (138-237)||(2677108-2677208)
chr3 (135-181)||(3323710-3323756)
chr3 (134-214)||(9666449-9666531)
chr3 (138-203)||(8512217-8512281)
chr3 (138-203)||(8517097-8517161)
chr3 (2-55)||(13419941-13419994)
chr3 (154-214)||(23391892-23391953)
chr3 (154-214)||(29196369-29196430)
chr3 (138-203)||(32475485-32475549)
chr3 (158-214)||(32744419-32744476)
chr3 (154-203)||(44331669-44331718)
chr3 (2-42)||(7768632-7768672)
chr3 (293-356)||(27452806-27452870)
chr3 (138-202)||(28503897-28503960)
chr3 (154-217)||(40734622-40734686)
chr3 (154-217)||(40735507-40735571)
chr3 (154-201)||(40913417-40913464)
chr3 (160-217)||(5236437-5236495)
chr3 (2-44)||(25633982-25634024)
chr3 (59-182)||(46966664-46966789)
chr3 (2-42)||(31021300-31021341)
chr3 (84-186)||(15823659-15823763)
chr3 (329-381)||(25929635-25929687)
chr3 (154-202)||(39153357-39153405)
chr3 (20-79)||(3329896-3329954)
chr3 (25-175)||(13893470-13893622)
chr3 (257-373)||(7167072-7167187)
chr3 (29-79)||(11007633-11007683)
chr3 (17-79)||(16996875-16996936)
chr3 (154-215)||(29810992-29811054)
chr3 (154-214)||(760971-761032)
chr3 (323-379)||(4387239-4387293)
chr3 (154-214)||(16499153-16499214)
chr3 (154-214)||(23410312-23410373)
chr3 (245-348)||(29100026-29100127)
chr3 (154-214)||(29682483-29682544)
chr3 (154-199)||(30236249-30236294)
chr3 (1-29)||(7606828-7606856)
chr3 (291-373)||(28504040-28504124)
chr3 (134-210)||(29100151-29100227)
[»] chr8 (132 HSPs)
chr8 (134-381)||(4696625-4696877)
chr8 (134-384)||(5702512-5702760)
chr8 (1-198)||(43079739-43079937)
chr8 (134-380)||(9765848-9766093)
chr8 (1-198)||(18810845-18811042)
chr8 (1-198)||(27829434-27829631)
chr8 (1-198)||(43082110-43082308)
chr8 (1-198)||(18813019-18813216)
chr8 (134-381)||(26403259-26403505)
chr8 (1-198)||(3874147-3874345)
chr8 (1-198)||(44720980-44721178)
chr8 (1-198)||(27827123-27827320)
chr8 (1-198)||(24873181-24873379)
chr8 (1-198)||(22684653-22684854)
chr8 (1-198)||(608871-609069)
chr8 (1-198)||(28251567-28251765)
chr8 (1-198)||(43530252-43530450)
chr8 (1-198)||(32339446-32339644)
chr8 (1-163)||(14807888-14808051)
chr8 (1-198)||(15809355-15809553)
chr8 (134-379)||(23799606-23799849)
chr8 (1-198)||(28283221-28283417)
chr8 (135-377)||(19752424-19752665)
chr8 (1-198)||(4424155-4424353)
chr8 (1-198)||(30480503-30480701)
chr8 (134-379)||(6127043-6127289)
chr8 (1-198)||(15072847-15073046)
chr8 (134-377)||(4455855-4456096)
chr8 (5-198)||(15068122-15068316)
chr8 (134-377)||(19175783-19176027)
chr8 (1-198)||(27106897-27107095)
chr8 (1-198)||(14419190-14419389)
chr8 (1-195)||(27911151-27911345)
chr8 (1-195)||(27957570-27957764)
chr8 (1-198)||(1225303-1225502)
chr8 (1-198)||(15956094-15956293)
chr8 (1-198)||(41384881-41385079)
chr8 (134-356)||(31071258-31071478)
chr8 (1-198)||(31162346-31162548)
chr8 (1-189)||(21480639-21480829)
chr8 (134-375)||(7412166-7412409)
chr8 (22-198)||(41382820-41382997)
chr8 (2-198)||(3005630-3005829)
chr8 (1-198)||(13858484-13858682)
chr8 (1-198)||(21482447-21482646)
chr8 (5-195)||(5372179-5372372)
chr8 (1-108)||(14477413-14477520)
chr8 (1-198)||(25952657-25952856)
chr8 (1-198)||(36865675-36865872)
chr8 (134-356)||(26287750-26287969)
chr8 (134-356)||(26313001-26313220)
chr8 (1-134)||(181636-181772)
chr8 (1-198)||(31035254-31035456)
chr8 (138-395)||(6813487-6813747)
chr8 (134-373)||(1261983-1262217)
chr8 (17-198)||(16757268-16757449)
chr8 (2-198)||(31578276-31578476)
chr8 (17-198)||(28327908-28328089)
chr8 (17-198)||(9021107-9021289)
chr8 (1-198)||(15185714-15185908)
chr8 (17-198)||(28895502-28895684)
chr8 (17-198)||(4812488-4812669)
chr8 (17-198)||(16752524-16752704)
chr8 (17-198)||(28332631-28332812)
chr8 (1-80)||(33541507-33541586)
chr8 (141-380)||(5990596-5990830)
chr8 (20-175)||(29554809-29554964)
chr8 (20-175)||(33032657-33032812)
chr8 (2-79)||(31573847-31573924)
chr8 (135-379)||(9054867-9055106)
chr8 (20-198)||(25684646-25684824)
chr8 (138-373)||(36979205-36979441)
chr8 (20-189)||(590797-590967)
chr8 (2-189)||(17847661-17847846)
chr8 (70-188)||(2468139-2468259)
chr8 (20-198)||(23179561-23179740)
chr8 (17-198)||(17799424-17799606)
chr8 (134-215)||(26301143-26301226)
chr8 (20-130)||(3276347-3276454)
chr8 (17-198)||(6376141-6376325)
chr8 (154-217)||(15212910-15212974)
chr8 (138-356)||(33037839-33038059)
chr8 (257-373)||(4760229-4760345)
chr8 (17-102)||(13985176-13985262)
chr8 (134-217)||(4733809-4733894)
chr8 (133-202)||(18853196-18853264)
chr8 (133-202)||(18870590-18870658)
chr8 (138-203)||(39784843-39784907)
chr8 (138-202)||(6311298-6311361)
chr8 (138-202)||(7289947-7290010)
chr8 (138-202)||(10689176-10689239)
chr8 (138-202)||(25328299-25328362)
chr8 (135-211)||(28307552-28307628)
chr8 (154-217)||(33352274-33352338)
chr8 (154-217)||(43036547-43036611)
chr8 (1-44)||(2468261-2468304)
chr8 (154-216)||(27811402-27811465)
chr8 (140-202)||(30655647-30655708)
chr8 (138-237)||(35745355-35745455)
chr8 (134-217)||(4731761-4731846)
chr8 (138-203)||(10684285-10684349)
chr8 (156-222)||(19491673-19491741)
chr8 (17-198)||(21033870-21034051)
chr8 (110-198)||(28890855-28890947)
chr8 (154-214)||(40321204-40321265)
chr8 (138-202)||(4760108-4760171)
chr8 (154-217)||(30143464-30143528)
chr8 (30-82)||(37214317-37214369)
chr8 (257-373)||(30655469-30655585)
chr8 (1-55)||(5622882-5622936)
chr8 (154-211)||(6599096-6599154)
chr8 (154-211)||(6674549-6674607)
chr8 (2-78)||(13985933-13986011)
chr8 (17-79)||(30423212-30423274)
chr8 (125-195)||(33541413-33541483)
chr8 (154-214)||(4743197-4743258)
chr8 (154-214)||(5689395-5689456)
chr8 (154-199)||(10930198-10930243)
chr8 (154-214)||(12702617-12702678)
chr8 (256-353)||(7493210-7493314)
chr8 (86-161)||(35872477-35872553)
chr8 (154-202)||(40221869-40221917)
chr8 (282-341)||(26301011-26301070)
chr8 (2-44)||(33839077-33839120)
chr8 (2-79)||(3895957-3896035)
chr8 (2-36)||(31035204-31035238)
chr8 (148-198)||(37214264-37214314)
chr8 (154-214)||(1345354-1345415)
chr8 (154-214)||(3303653-3303714)
chr8 (2-54)||(11701102-11701155)
chr8 (153-198)||(14808051-14808096)
chr8 (5-41)||(26775342-26775378)
[»] chr6 (123 HSPs)
chr6 (134-381)||(10077194-10077439)
chr6 (134-379)||(18232670-18232913)
chr6 (1-198)||(5273216-5273414)
chr6 (1-198)||(11983029-11983227)
chr6 (135-381)||(31979336-31979580)
chr6 (1-198)||(14507176-14507373)
chr6 (1-198)||(4816231-4816429)
chr6 (1-198)||(12195515-12195713)
chr6 (1-198)||(26932562-26932760)
chr6 (134-353)||(22963550-22963767)
chr6 (134-353)||(23824626-23824843)
chr6 (1-198)||(20915356-20915554)
chr6 (10-198)||(14458767-14458956)
chr6 (1-198)||(19704567-19704767)
chr6 (1-198)||(26065099-26065295)
chr6 (1-198)||(26085068-26085264)
chr6 (134-377)||(5017498-5017742)
chr6 (1-198)||(28241321-28241519)
chr6 (1-198)||(1230249-1230447)
chr6 (1-198)||(30034603-30034801)
chr6 (1-198)||(30967317-30967515)
chr6 (1-198)||(2628886-2629083)
chr6 (135-377)||(31936414-31936654)
chr6 (134-375)||(5757507-5757744)
chr6 (16-198)||(33308988-33309170)
chr6 (135-381)||(4629784-4630021)
chr6 (16-198)||(29754709-29754892)
chr6 (16-198)||(33311257-33311439)
chr6 (16-198)||(26066124-26066307)
chr6 (1-198)||(9020042-9020240)
chr6 (134-375)||(21355867-21356104)
chr6 (135-381)||(21801374-21801622)
chr6 (134-379)||(31086502-31086734)
chr6 (1-198)||(13057310-13057509)
chr6 (16-198)||(26068395-26068578)
chr6 (1-188)||(32280112-32280301)
chr6 (5-198)||(1069718-1069913)
chr6 (1-198)||(30728824-30729026)
chr6 (1-198)||(3390495-3390694)
chr6 (1-198)||(13039870-13040069)
chr6 (1-190)||(3233738-3233928)
chr6 (1-198)||(3629865-3630062)
chr6 (1-198)||(3631939-3632136)
chr6 (1-198)||(16455424-16455624)
chr6 (1-155)||(15530166-15530320)
chr6 (248-381)||(5572737-5572870)
chr6 (1-161)||(15532718-15532879)
chr6 (134-335)||(22708888-22709086)
chr6 (1-198)||(25477390-25477596)
chr6 (1-116)||(15719758-15719873)
chr6 (1-198)||(15541140-15541338)
chr6 (1-93)||(19227514-19227606)
chr6 (1-163)||(3027888-3028052)
chr6 (1-198)||(12186071-12186271)
chr6 (8-116)||(22490763-22490871)
chr6 (1-198)||(15367147-15367346)
chr6 (134-246)||(5572270-5572381)
chr6 (2-194)||(14466440-14466634)
chr6 (138-373)||(5674803-5675036)
chr6 (17-198)||(13878727-13878908)
chr6 (17-198)||(16785919-16786100)
chr6 (1-198)||(26945259-26945460)
chr6 (2-198)||(22857952-22858152)
chr6 (135-381)||(24436001-24436240)
chr6 (17-198)||(13883475-13883656)
chr6 (1-198)||(12161558-12161755)
chr6 (1-188)||(24338458-24338645)
chr6 (1-116)||(17012156-17012271)
chr6 (20-198)||(17694852-17695030)
chr6 (17-198)||(26887227-26887406)
chr6 (17-198)||(35201327-35201508)
chr6 (2-198)||(19696556-19696756)
chr6 (60-198)||(15346522-15346661)
chr6 (17-175)||(31248739-31248896)
chr6 (135-238)||(27165647-27165750)
chr6 (2-159)||(20526922-20527081)
chr6 (20-198)||(22342801-22342980)
chr6 (20-175)||(22351876-22352031)
chr6 (20-198)||(33215830-33216009)
chr6 (135-300)||(31076971-31077134)
chr6 (17-79)||(3577636-3577696)
chr6 (20-79)||(17036058-17036116)
chr6 (23-198)||(25465899-25466075)
chr6 (25-189)||(5165822-5165989)
chr6 (20-130)||(26643179-26643286)
chr6 (20-130)||(26749145-26749252)
chr6 (2-77)||(11138423-11138499)
chr6 (80-198)||(25465590-25465710)
chr6 (24-79)||(12166267-12166321)
chr6 (3-116)||(28037813-28037927)
chr6 (138-237)||(33335963-33336063)
chr6 (20-77)||(19701985-19702041)
chr6 (23-79)||(25941650-25941704)
chr6 (230-354)||(33721683-33721804)
chr6 (2-120)||(7542461-7542581)
chr6 (20-79)||(13467585-13467642)
chr6 (138-202)||(14742457-14742520)
chr6 (138-202)||(22010718-22010781)
chr6 (138-237)||(6005381-6005481)
chr6 (17-173)||(12911471-12911629)
chr6 (138-237)||(16838708-16838808)
chr6 (140-202)||(28184506-28184567)
chr6 (138-237)||(33330466-33330566)
chr6 (138-203)||(6438501-6438565)
chr6 (154-214)||(16569146-16569207)
chr6 (138-203)||(28155590-28155654)
chr6 (138-202)||(11856975-11857038)
chr6 (138-202)||(14737597-14737660)
chr6 (289-341)||(26258181-26258233)
chr6 (17-162)||(12937229-12937376)
chr6 (2-116)||(25078641-25078755)
chr6 (144-198)||(10584256-10584310)
chr6 (25-187)||(11262596-11262763)
chr6 (104-198)||(22870102-22870196)
chr6 (110-198)||(25941759-25941851)
chr6 (154-214)||(33211168-33211229)
chr6 (154-213)||(9183015-9183075)
chr6 (141-222)||(14521652-14521735)
chr6 (61-189)||(30445699-30445831)
chr6 (154-201)||(603085-603132)
chr6 (110-198)||(17038324-17038416)
chr6 (291-361)||(27165545-27165616)
chr6 (111-189)||(7294021-7294101)
[»] chr2 (147 HSPs)
chr2 (134-381)||(20522043-20522288)
chr2 (134-381)||(17865026-17865271)
chr2 (134-379)||(16940238-16940481)
chr2 (134-379)||(17010903-17011146)
chr2 (1-198)||(27104855-27105052)
chr2 (134-395)||(10445473-10445734)
chr2 (134-381)||(33528650-33528895)
chr2 (1-198)||(35215586-35215784)
chr2 (1-198)||(35217963-35218161)
chr2 (135-362)||(31055884-31056111)
chr2 (134-366)||(33117974-33118204)
chr2 (1-198)||(19502011-19502209)
chr2 (1-198)||(23452237-23452435)
chr2 (1-198)||(42064572-42064770)
chr2 (1-198)||(19504346-19504543)
chr2 (1-198)||(45279984-45280182)
chr2 (133-379)||(34682362-34682607)
chr2 (134-379)||(8039884-8040128)
chr2 (1-198)||(42452838-42453035)
chr2 (1-198)||(13910045-13910242)
chr2 (1-198)||(43623580-43623778)
chr2 (134-381)||(21629774-21630011)
chr2 (16-198)||(36558864-36559047)
chr2 (16-198)||(36561141-36561324)
chr2 (1-198)||(5375346-5375543)
chr2 (134-377)||(34388686-34388926)
chr2 (134-379)||(8390179-8390425)
chr2 (134-377)||(13569155-13569396)
chr2 (16-198)||(45332181-45332364)
chr2 (134-377)||(23078499-23078742)
chr2 (1-198)||(21520693-21520891)
chr2 (134-377)||(42039698-42039939)
chr2 (134-377)||(14699036-14699268)
chr2 (138-377)||(36757795-36758031)
chr2 (1-198)||(19007697-19007895)
chr2 (1-198)||(24162223-24162410)
chr2 (134-380)||(39482759-39482999)
chr2 (134-377)||(10707281-10707523)
chr2 (1-198)||(22287336-22287534)
chr2 (1-198)||(42923509-42923707)
chr2 (1-174)||(45239001-45239175)
chr2 (134-375)||(28259206-28259445)
chr2 (1-198)||(6264148-6264347)
chr2 (1-198)||(28196694-28196890)
chr2 (1-198)||(40032053-40032256)
chr2 (1-198)||(6258817-6259013)
chr2 (1-166)||(11578140-11578307)
chr2 (1-198)||(11739559-11739758)
chr2 (1-198)||(17848501-17848695)
chr2 (1-108)||(15539566-15539673)
chr2 (2-189)||(20146616-20146806)
chr2 (134-356)||(25403480-25403701)
chr2 (134-356)||(3491600-3491818)
chr2 (1-116)||(18800397-18800512)
chr2 (134-356)||(25398342-25398563)
chr2 (1-198)||(14837330-14837523)
chr2 (1-198)||(34979577-34979777)
chr2 (1-174)||(17849174-17849348)
chr2 (58-198)||(22407454-22407595)
chr2 (1-198)||(44289067-44289266)
chr2 (135-304)||(2869723-2869892)
chr2 (1-198)||(3022220-3022427)
chr2 (4-116)||(28459273-28459385)
chr2 (70-195)||(7462950-7463077)
chr2 (2-198)||(17897245-17897443)
chr2 (1-188)||(40699430-40699621)
chr2 (134-341)||(40738704-40738910)
chr2 (20-188)||(17943540-17943707)
chr2 (17-198)||(2736205-2736386)
chr2 (1-186)||(22874187-22874374)
chr2 (1-198)||(31732776-31732963)
chr2 (135-395)||(35397323-35397579)
chr2 (17-198)||(17462436-17462617)
chr2 (17-198)||(39686983-39687164)
chr2 (17-198)||(20054765-20054947)
chr2 (20-188)||(27517649-27517818)
chr2 (17-188)||(2740941-2741112)
chr2 (1-86)||(38414194-38414278)
chr2 (20-188)||(12781231-12781400)
chr2 (17-116)||(20589763-20589863)
chr2 (1-116)||(27136208-27136324)
chr2 (17-198)||(39680045-39680226)
chr2 (20-142)||(17932637-17932757)
chr2 (20-198)||(30478997-30479176)
chr2 (2-78)||(35107351-35107427)
chr2 (2-133)||(43139432-43139564)
chr2 (138-373)||(11098960-11099196)
chr2 (17-198)||(20050021-20050204)
chr2 (17-79)||(22712637-22712698)
chr2 (17-79)||(22717346-22717407)
chr2 (17-79)||(45567409-45567470)
chr2 (136-214)||(1345572-1345652)
chr2 (2-79)||(17921754-17921833)
chr2 (245-394)||(40014738-40014886)
chr2 (20-175)||(37170777-37170931)
chr2 (154-214)||(14633808-14633869)
chr2 (1-110)||(37963028-37963137)
chr2 (135-199)||(2838060-2838124)
chr2 (3-55)||(27583483-27583535)
chr2 (151-308)||(3277898-3278053)
chr2 (80-198)||(22707751-22707872)
chr2 (17-79)||(28458949-28459011)
chr2 (154-214)||(723727-723788)
chr2 (1-77)||(26345661-26345738)
chr2 (154-214)||(34139753-34139814)
chr2 (155-214)||(11151574-11151634)
chr2 (138-202)||(14291489-14291552)
chr2 (154-217)||(17057349-17057413)
chr2 (154-217)||(17085332-17085396)
chr2 (114-198)||(22163022-22163106)
chr2 (79-174)||(23870951-23871047)
chr2 (154-225)||(36773686-36773758)
chr2 (17-65)||(38190997-38191045)
chr2 (138-202)||(44312645-44312708)
chr2 (133-188)||(27149322-27149377)
chr2 (110-198)||(45679813-45679904)
chr2 (1-116)||(15693958-15694076)
chr2 (154-214)||(11067429-11067490)
chr2 (244-381)||(27149001-27149138)
chr2 (110-198)||(33670967-33671059)
chr2 (1-101)||(38020259-38020349)
chr2 (138-202)||(9296434-9296497)
chr2 (154-217)||(38312364-38312428)
chr2 (154-202)||(39284960-39285008)
chr2 (138-202)||(39812009-39812072)
chr2 (2-79)||(34575230-34575308)
chr2 (16-77)||(10942634-10942696)
chr2 (16-77)||(10948503-10948565)
chr2 (138-180)||(32246810-32246852)
chr2 (2-77)||(7502975-7503052)
chr2 (138-203)||(19344421-19344485)
chr2 (138-203)||(19349279-19349343)
chr2 (134-171)||(25407653-25407690)
chr2 (154-214)||(33162433-33162494)
chr2 (245-304)||(28770912-28770972)
chr2 (2-107)||(30720703-30720811)
chr2 (257-373)||(9296554-9296670)
chr2 (2-77)||(35028632-35028707)
chr2 (26-79)||(27248021-27248075)
chr2 (154-214)||(29867993-29868054)
chr2 (338-379)||(32178419-32178460)
chr2 (20-53)||(33674551-33674584)
chr2 (154-214)||(36317992-36318053)
chr2 (256-288)||(5699702-5699734)
chr2 (251-306)||(12632454-12632510)
chr2 (1-41)||(22163106-22163145)
chr2 (230-301)||(39532835-39532906)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (1-198)||(1453-1650)
[»] chr5 (159 HSPs)
chr5 (1-198)||(4410104-4410301)
chr5 (1-198)||(15552326-15552524)
chr5 (135-381)||(28832083-28832326)
chr5 (1-198)||(31179371-31179569)
chr5 (134-381)||(19588569-19588814)
chr5 (1-198)||(2175000-2175197)
chr5 (1-198)||(38882187-38882384)
chr5 (135-394)||(42127440-42127696)
chr5 (134-381)||(17003989-17004234)
chr5 (1-198)||(6745149-6745347)
chr5 (1-198)||(31545161-31545359)
chr5 (1-198)||(18466765-18466963)
chr5 (1-198)||(27910531-27910729)
chr5 (1-189)||(4236710-4236899)
chr5 (16-198)||(3373137-3373320)
chr5 (134-377)||(14520056-14520298)
chr5 (1-198)||(31542816-31543013)
chr5 (1-198)||(6747386-6747583)
chr5 (1-198)||(10529099-10529297)
chr5 (1-198)||(25921473-25921671)
chr5 (1-198)||(27912617-27912815)
chr5 (1-198)||(21684452-21684649)
chr5 (16-198)||(10749796-10749979)
chr5 (1-198)||(16776239-16776436)
chr5 (1-198)||(39854564-39854762)
chr5 (1-198)||(34477053-34477252)
chr5 (1-198)||(21948107-21948305)
chr5 (135-349)||(24553537-24553748)
chr5 (134-379)||(3880127-3880367)
chr5 (1-195)||(25804106-25804300)
chr5 (1-198)||(39798128-39798326)
chr5 (1-198)||(34479418-34479617)
chr5 (1-198)||(10586913-10587111)
chr5 (135-389)||(11181862-11182116)
chr5 (1-189)||(18469092-18469279)
chr5 (133-377)||(11917000-11917245)
chr5 (1-198)||(658356-658551)
chr5 (134-356)||(9353361-9353579)
chr5 (16-198)||(10757273-10757455)
chr5 (16-198)||(15354575-15354757)
chr5 (134-356)||(15464380-15464600)
chr5 (1-198)||(20505843-20506039)
chr5 (16-198)||(23665140-23665322)
chr5 (16-198)||(23793265-23793447)
chr5 (1-198)||(18511212-18511410)
chr5 (16-198)||(15356851-15357033)
chr5 (16-198)||(38960132-38960314)
chr5 (2-198)||(2818335-2818532)
chr5 (2-198)||(24126938-24127135)
chr5 (1-198)||(40221603-40221802)
chr5 (134-381)||(36932379-36932623)
chr5 (1-198)||(695959-696157)
chr5 (1-198)||(26097814-26098010)
chr5 (1-198)||(2954498-2954695)
chr5 (23-198)||(23741859-23742034)
chr5 (135-378)||(31300626-31300867)
chr5 (1-198)||(18509318-18509516)
chr5 (1-197)||(18596726-18596924)
chr5 (1-198)||(25904184-25904382)
chr5 (1-198)||(41585744-41585942)
chr5 (1-198)||(1189607-1189807)
chr5 (134-307)||(12084204-12084376)
chr5 (1-174)||(16092223-16092398)
chr5 (1-198)||(10474323-10474521)
chr5 (1-198)||(17072964-17073163)
chr5 (1-198)||(17818492-17818688)
chr5 (1-198)||(37705780-37705978)
chr5 (1-198)||(6756575-6756771)
chr5 (1-188)||(39398003-39398191)
chr5 (1-198)||(31472612-31472811)
chr5 (3-198)||(2723985-2724172)
chr5 (1-189)||(9020299-9020490)
chr5 (1-116)||(34530749-34530864)
chr5 (1-174)||(36402352-36402526)
chr5 (134-356)||(38192020-38192241)
chr5 (134-356)||(38219245-38219466)
chr5 (1-137)||(31466040-31466176)
chr5 (1-189)||(6661193-6661384)
chr5 (1-198)||(21288851-21289040)
chr5 (17-198)||(1170811-1170992)
chr5 (2-187)||(17413176-17413365)
chr5 (17-198)||(35385452-35385634)
chr5 (135-389)||(33030970-33031227)
chr5 (1-198)||(36208656-36208855)
chr5 (16-198)||(23667415-23667597)
chr5 (134-219)||(10281733-10281819)
chr5 (1-82)||(20045091-20045172)
chr5 (22-198)||(25445501-25445678)
chr5 (135-389)||(24135663-24135915)
chr5 (138-271)||(6741784-6741916)
chr5 (20-198)||(22672837-22673016)
chr5 (20-198)||(25452498-25452677)
chr5 (1-195)||(12555926-12556121)
chr5 (1-78)||(20043131-20043208)
chr5 (2-186)||(15143547-15143735)
chr5 (1-198)||(20053924-20054116)
chr5 (134-356)||(35387511-35387730)
chr5 (17-188)||(2298011-2298183)
chr5 (20-198)||(17841249-17841428)
chr5 (20-198)||(28786407-28786586)
chr5 (17-175)||(1240428-1240586)
chr5 (91-268)||(28278379-28278553)
chr5 (154-268)||(38747129-38747241)
chr5 (46-116)||(42770936-42771006)
chr5 (2-161)||(2144599-2144763)
chr5 (20-198)||(4897828-4898010)
chr5 (325-395)||(42126625-42126695)
chr5 (20-130)||(11962505-11962612)
chr5 (154-214)||(32636948-32637009)
chr5 (154-214)||(8565930-8565990)
chr5 (154-217)||(19806487-19806551)
chr5 (138-202)||(30631407-30631470)
chr5 (154-217)||(30682903-30682966)
chr5 (138-202)||(31180215-31180278)
chr5 (5-88)||(42770853-42770934)
chr5 (138-202)||(43592280-43592343)
chr5 (17-175)||(10627364-10627524)
chr5 (17-189)||(31782464-31782639)
chr5 (23-163)||(40222769-40222909)
chr5 (138-237)||(2785339-2785439)
chr5 (1-55)||(26098395-26098449)
chr5 (138-237)||(31397014-31397114)
chr5 (138-237)||(31401871-31401971)
chr5 (2-79)||(4754235-4754312)
chr5 (17-78)||(16093413-16093473)
chr5 (114-198)||(26098288-26098373)
chr5 (138-203)||(28807593-28807657)
chr5 (138-203)||(37556643-37556707)
chr5 (138-203)||(37561465-37561529)
chr5 (138-202)||(1457183-1457246)
chr5 (338-394)||(10281672-10281728)
chr5 (138-202)||(15044687-15044750)
chr5 (138-202)||(27449815-27449878)
chr5 (230-394)||(28537429-28537600)
chr5 (154-217)||(28750635-28750699)
chr5 (55-198)||(42238298-42238442)
chr5 (138-237)||(33791280-33791380)
chr5 (2-55)||(34033714-34033768)
chr5 (154-215)||(42428412-42428474)
chr5 (138-180)||(43598746-43598788)
chr5 (138-180)||(43604238-43604280)
chr5 (138-180)||(43609730-43609772)
chr5 (154-214)||(5887417-5887478)
chr5 (154-214)||(31183095-31183156)
chr5 (138-203)||(33768179-33768243)
chr5 (230-354)||(34842454-34842577)
chr5 (154-202)||(533893-533941)
chr5 (138-202)||(27444971-27445034)
chr5 (154-217)||(39468529-39468593)
chr5 (134-304)||(2630127-2630299)
chr5 (16-74)||(29748443-29748502)
chr5 (2-79)||(35430259-35430338)
chr5 (154-211)||(538149-538207)
chr5 (154-214)||(16452204-16452265)
chr5 (154-214)||(33831804-33831865)
chr5 (134-198)||(36263812-36263877)
chr5 (154-202)||(13488327-13488375)
chr5 (90-211)||(15445253-15445376)
chr5 (154-217)||(42426215-42426279)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (1-198)||(2970-3167)
[»] scaffold0006 (5 HSPs)
scaffold0006 (134-379)||(2317-2560)
scaffold0006 (134-394)||(5490-5751)
scaffold0006 (134-381)||(133309-133554)
scaffold0006 (17-160)||(224819-224961)
scaffold0006 (154-214)||(149080-149141)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (1-198)||(69292-69489)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (1-198)||(131-329)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (1-198)||(6289-6487)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-198)||(41483-41681)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-198)||(79275-79473)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (135-379)||(10552-10796)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (1-198)||(14382-14580)
scaffold0131 (1-198)||(15109-15307)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (1-198)||(29261-29458)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-198)||(11473-11671)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (138-395)||(17075-17327)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (134-375)||(43990-44227)
scaffold0087 (134-377)||(36861-37102)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-198)||(183641-183838)
scaffold0005 (2-198)||(52102-52301)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (137-377)||(85512-85748)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (1-198)||(4086-4283)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (16-198)||(22221-22403)
scaffold0140 (16-198)||(24496-24678)
scaffold0140 (134-356)||(8448-8669)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (134-356)||(45103-45321)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (1-162)||(2131-2293)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-198)||(79950-80147)
scaffold0004 (17-79)||(188363-188424)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (1-198)||(1641-1841)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (1-198)||(15820-16020)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-174)||(85320-85495)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (2-116)||(16734-16848)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (5-91)||(35733-35819)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (134-356)||(17981-18201)
scaffold0188 (134-356)||(24074-24294)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (2-186)||(4901-5089)
[»] scaffold1805 (1 HSPs)
scaffold1805 (267-377)||(1234-1344)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (20-198)||(16328-16507)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (20-198)||(16986-17165)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (251-377)||(23357-23482)
scaffold0078 (288-377)||(43084-43173)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (138-203)||(363-427)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (138-202)||(9663-9726)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (154-217)||(20395-20459)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (110-198)||(3070-3161)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (138-203)||(14330-14394)
scaffold0197 (141-237)||(19189-19286)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (288-377)||(29671-29760)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (138-203)||(181985-182049)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (138-202)||(35083-35146)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (144-198)||(4679-4733)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (138-221)||(2272-2356)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (138-221)||(148977-149061)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 163)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 547
Target Start/End: Original strand, 16124545 - 16124960
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16124545 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 16124644  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16124645 tctttattgcttt-gattatgtttgtggtgttgctctacatttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggacacattttattcattgattacca 16124743  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaatactgttcacatacacaatgttgttatcaaagaagataa 433  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16124744 cttcctttgcttcacacatctttgttattcattggtgtgattttgtccggattcacgacaatactgttcacatacacaatgttgttatcaaagaagataa 16124843  T
Q  434 caaaacaattctgagtgta-nnnnnnngttgaatttcaattgatcactattgcatttacactattcac--atatatacattagatacacccttcgataca 530  Q
    |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16124844 caaaacaattctgagtgtattttttttgttgaatttcaattgatcactattgcatttacactattcacatatatatacattagatacacccttcgataca 16124943  T
Q  531 tcacatatgatacaact 547  Q
    |||||||||||||||||    
T  16124944 tcacatatgatacaact 16124960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 135 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 775739 - 775495
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  775739 tagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttgatgtgtttgttccttt-ctttcattgcttat 775641  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||    
T  775640 ctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattggttaccac 775542  T
Q  335 ttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  775541 ttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtcc 775495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16226248 - 16226446
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226248 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 16226347  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16226348 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16226446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 28840761 - 28840958
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840761 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 28840860  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  28840861 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 28840958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29651879 - 29651637
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29651879 atagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatcttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgctta 29651781  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  29651780 tctttattgc-tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaagtctgttttttgttgttgttgattatagacactttattcattgattacc 29651682  T
Q  333 acttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29651681 acttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgatttt 29651637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 135 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19072995 - 19072749
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt-ggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19072995 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgctta 19072897  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||     
T  19072896 tctttattg-ttttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgatttttgttgttgttgcttcgagacactttatctattgattact 19072798  T
Q  333 acttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19072797 acttcctttgttccacatatctttgttattcattggtgtgattttgtcc 19072749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 135 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19120885 - 19120639
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt-ggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19120885 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgctta 19120787  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||     
T  19120786 tctttattg-ttttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgatttttgttgttgttgcttcgagacactttatctattgattact 19120688  T
Q  333 acttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19120687 acttcctttgttccacatatctttgttattcattggtgtgattttgtcc 19120639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 134 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13598466 - 13598205
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13598466 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgctta 13598368  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgct---tggagacattttattcattgatta 330  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| || | | ||||||||    
T  13598367 tctttattgcttt-gattatgcttgtggtgtttctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgttgtttggagacacttaact-attgatta 13598270  T
Q  331 ccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtc-cagattcacgacaa 394  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13598269 ccacttcctttactccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtctcagattcacaacaa 13598205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 47179794 - 47179991
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179794 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 47179893  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47179894 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 47179991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 51750120 - 51750318
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750120 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 51750219  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  51750220 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 51750318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 46431907 - 46431708
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431907 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 46431808  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc--ccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  46431807 ccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 46431708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 135 - 374
Target Start/End: Original strand, 47098854 - 47099090
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  47098854 tagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tttctttgattgcttat 47098952  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  47098953 ctttattgc-tttgattatacttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctg-ttttgttgttgttacttggagacactttatctattgattaccac 47099050  T
Q  335 ttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgat 374  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  47099051 ttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgat 47099090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16231644 - 16231841
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231644 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 16231743  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16231744 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactg-gtcaacaa 16231841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27337139 - 27336942
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337139 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaac 27337040  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  27337039 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27336942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 51752446 - 51752642
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752446 gttgattcaccttgtgaaacactattag-attgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 51752544  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  51752545 ccattgatttctctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 51752642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9459617 - 9459419
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9459617 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaa 9459518  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9459517 cccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9459419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9463444 - 9463246
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9463444 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaa 9463345  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9463344 cccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9463246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31735721 - 31735523
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31735721 gttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaat 31735622  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  31735621 ccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 31735523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Original strand, 47703965 - 47704208
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  47703965 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgttttttcc-tttctttcattgctta 47704063  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  47704064 tctttattgc-tttgattaaacttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctattttttgttgttgctgcttggagacactttatctattgattacc 47704162  T
Q  333 acttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47704163 acttccttttgctccacacatctttgttattcattgatgtgatttt 47704208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 2617597 - 2617792
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2617597 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaac 2617696  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaa 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  2617697 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaa 2617792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10400028 - 10399830
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400028 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 10399929  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  10399928 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 10399830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 47177443 - 47177640
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47177443 gttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaa 47177542  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  47177543 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaa 47177640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 134 - 378
Target Start/End: Original strand, 27104401 - 27104640
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  27104401 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tttatttcattgctta 27104499  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  27104500 tctttattgc-tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtt----ttgttgttgcttggagacactttatctattgattacca 27104594  T
Q  334 cttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttg 378  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  27104595 cttccttttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgattttg 27104640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15295034 - 15294836
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15295034 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaac 15294935  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  15294934 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 15294836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757809
Alignment:
Q  12 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  112 tctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  51757723 tctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 51757809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 20302540 - 20302737
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302540 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 20302639  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  20302640 ccattgatttctctttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 20302737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 135 - 374
Target Start/End: Original strand, 47102871 - 47103107
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  47102871 tagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttggtgtgtttgttcc-tttctttgattgcttat 47102969  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  47102970 ctttattgc-tttgattatacttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctg-ttttgttgttgttgctttgagacactttatctattgattaccac 47103067  T
Q  335 ttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgat 374  Q
    ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  47103068 ttcatttgctccacacgtctttattattcattggtgtgat 47103107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6823095 - 6823293
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823095 gttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 6823194  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6823195 tcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6823293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 13761918 - 13762115
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761918 gttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 13762017  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  13762018 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaa 13762115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 20291538 - 20291735
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291538 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 20291637  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  20291638 ccattgatttctctttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctctcccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20291735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27339330 - 27339133
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27339330 gttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaac 27339231  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  27339230 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 27339133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786118
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 23786034  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 23786118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17324836 - 17324638
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324836 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 17324737  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  17324736 tcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 17324638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 47906351 - 47906549
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906351 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 47906450  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  47906451 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 47906549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 28842576 - 28842773
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842576 gttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 28842675  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||  ||||||||    
T  28842676 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaa 28842773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15823627 - 15823825
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823627 gttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 15823726  T
Q  101 ccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  15823727 ccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 15823825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12302705 - 12302507
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12302705 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataac 12302606  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  12302605 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 12302507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 24325744 - 24325942
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325744 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 24325843  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||||| ||||||||    
T  24325844 ccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaa 24325942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50307746 - 50307548
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307746 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 50307647  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  50307646 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 50307548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 138 - 376
Target Start/End: Original strand, 26644930 - 26645166
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatc 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26644930 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgcttatc 26645028  T
Q  236 tttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccact 335  Q
    |||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  26645029 ttt-gtgc-tttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctgcttttgttgttgttgcttaaagacactttacacattgattaccact 26645125  T
Q  336 tcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattt 376  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26645126 tcatttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattt 26645166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 39932154 - 39932353
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39932154 gttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaac 39932253  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc-tcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||||||  |||||||||| || ||||||||    
T  39932254 ccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaa 39932353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21948387 - 21948226
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948387 gttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 21948289  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21948288 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16428734 - 16428933
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16428734 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 16428833  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16428834 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaa 16428933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 133 - 377
Target Start/End: Original strand, 21536597 - 21536839
Alignment:
Q  133 tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagc 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21536597 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttccttt-ctttcatcgc 21536695  T
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    |||||||| | ||||| |  |||| |||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||    
T  21536696 ttatctttgt-gcttt-gtctatgcttgtggtgttgctctacagtaag-tctaggtctatttttgttgttgttgattggagacactttacacattgatta 21536792  T
Q  331 ccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  21536793 ccacttcctttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgatttt 21536839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 13215162 - 13215365
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215162 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 13215261  T
Q  101 ccattga----tttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtca 194  Q
    |||||||    |||||| |||||||    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||    
T  13215262 ccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtca 13215361  T
Q  195 acaa 198  Q
    ||||    
T  13215362 acaa 13215365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 39462600 - 39462798
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39462600 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaac 39462699  T
Q  101 ccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || ||||| ||||||| | || |  | ||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  39462700 cctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 39462798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2510524 - 2510327
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2510524 gttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaac 2510426  T
Q  101 ccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  2510425 ccattgatttctctcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 2510327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9476329 - 9476087
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  9476329 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgttta 9476231  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||  |||||||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |    
T  9476230 tcttttttgc-tttgattatgcttgtgatgtt-ttctacacttatatttatgtctg-ttttgttattgttgcttggagacactttatccattaattacta 9476134  T
Q  334 cttc-ctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||  |||| || |||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  9476133 cttcattttgctctacacatctttgtttttcattggtgtgattttgt 9476087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 41647001 - 41647199
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41647001 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaac 41647100  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||| || ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  41647101 tcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 41647199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 18839668 - 18839867
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839668 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 18839767  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |   |||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  18839768 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 18839867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 135 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32889506 - 32889266
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  32889506 tagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaatcttggtgtgtttgttcctctcttttcattgcttat 32889407  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||    
T  32889406 ctttattgc-tttggttatacttgtggtgttgctctacacttagatttagatctg-ttttgttgttattgcttggagacactttacacattgattatcac 32889309  T
Q  335 -ttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
     ||| |||| ||||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  32889308 tttcttttgctccacacatctttgtt-ttcattggtatgatttt 32889266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38925678 - 38925483
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38925678 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaac 38925579  T
Q  101 ccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||  |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38925578 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtaaaacggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaa 38925483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11457675 - 11457477
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11457675 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 11457576  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  11457575 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 11457477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 48665258 - 48665400
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-gggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665258 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 48665357  T
Q  100 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtgga 141  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  48665358 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 48665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 137 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3281773 - 3281537
Alignment:
Q  137 gtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3281773 gtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttttgatgtgtttgttcc-tttctttcattgcttat 3281675  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    ||||  ||| |||| ||||  |||||||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  3281674 cttt-gtgc-tttgtttattcttgtggtgttgctctacacaaag-tctatgtctttttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccac 3281578  T
Q  335 ttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||||||  ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3281577 ttcctttactc--cacatctttgttattcattggtgtgatttt 3281537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14098170 - 14097971
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14098170 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaac 14098071  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgt-aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  14098070 ccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 14097971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6995900 - 6995702
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6995900 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaac 6995801  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||  |||| ||| |||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  6995800 tcattgacatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 6995702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15669594 - 15669419
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669594 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 15669495  T
Q  101 ccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca 174  Q
    |||||||| ||||| | |||| |  |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15669494 ccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccgagactaggtca 15669419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429237
Alignment:
Q  5 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  105 tgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaa 16429237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 134 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069597
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| | |||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc-tttatttcgttgct 37069740  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg--tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    |||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |||| |||||  ||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  37069739 tatcttt-gtgc-tttgtttatgcttgtggtgttgctctaca-ttaagtctaagtctgtttttttttttttgttgcttggagacactttacacattgatt 37069643  T
Q  330 accacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatt 375  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  37069642 accacttcctttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgatt 37069597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50076872 - 50076674
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  50076872 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaat 50076773  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  50076772 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 50076674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2949431 - 2949234
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2949431 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 2949332  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  2949331 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 2949234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4131579 - 4131377
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4131579 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaac 4131481  T
Q  101 ccattgat----ttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtca 194  Q
    ||||||||    |||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||  ||||    
T  4131480 ccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtca 4131381  T
Q  195 acaa 198  Q
    ||||    
T  4131380 acaa 4131377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9241286 - 9241096
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9241286 gttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaac 9241187  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactg 189  Q
     ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||    
T  9241186 tcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactg 9241096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28998453 - 28998255
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28998453 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 28998354  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||  |||| |||| ||||  ||||||||||| ||| |   ||||| || ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  28998353 tcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 28998255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29004169 - 29003971
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29004169 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 29004070  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||  |||| |||| ||||  ||||||||||| ||| |   ||||| || ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  29004069 tcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 29003971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 18307190 - 18307388
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18307190 gttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgac 18307289  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  18307290 gcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaa 18307388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 50079021 - 50078834
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50079021 gttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaac 50078922  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaa 186  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  | |||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  50078921 ccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 50078834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 216 - 377
Target Start/End: Original strand, 40816842 - 40817003
Alignment:
Q  216 cttttctttcatagcttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttt-tgttgttgttgcttggagaca 314  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40816842 cttttctttcattacttatctttattgcttt-gattatgctcgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgcttggagaca 40816940  T
Q  315 ttttattcattgattaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
     |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  40816941 ctttatctattgattaccacttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgttttt 40817003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 42922311 - 42922511
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42922311 gttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaac 42922410  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||||| || ||||    
T  42922411 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaaca 42922510  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  42922511 a 42922511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17186328 - 17186141
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17186328 gttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaac 17186229  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaa 186  Q
    ||||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  17186228 ccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 17186141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14183792 - 14183592
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14183792 gttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaac 14183693  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||||    
T  14183692 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaaca 14183593  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  14183592 a 14183592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 25127953 - 25128152
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25127953 gttgattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaat 25128052  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||| || |  |||||||||||||||| |||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  25128053 tcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaa 25128152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25248752 - 25248553
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248752 gttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 25248653  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||| | ||||||| |  ||||| |||||| |||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  25248652 ccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 25248553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25251475 - 25251276
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25251475 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaac 25251376  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| | || ||||||| |  ||| |||| ||||||| |   ||||| |||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  25251375 ccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccccaatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 25251276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 31423073 - 31422958
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423073 gttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 31422974  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
    |||||||  |||||||    
T  31422973 ccattgacatctcttt 31422958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3579816 - 3579619
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3579816 gttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaac 3579717  T
Q  101 ccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| ||||| |  ||| |  |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  3579716 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tagtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3579619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816165
Alignment:
Q  61 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  160 ccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 23816165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6756609 - 6756807
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756609 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct--tgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 6756706  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct-cccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    | |||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| | ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||  ||||||    
T  6756707 ctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaaca 6756806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31425218 - 31425017
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt---ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 97  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31425218 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgt 31425119  T
Q  98 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaa 195  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||| |||||    
T  31425118 aactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 31425020  T
Q  196 caa 198  Q
    |||    
T  31425019 caa 31425017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 31489994 - 31490181
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31489994 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaac 31490093  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 188  Q
     ||||||| |||| ||||||| |  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  31490094 tcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-cccccagactaggtcaatttggactgaact 31490181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17324144 - 17324343
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324144 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaac 17324243  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  | |||||| ||||||| |  ||| ||||| |||||||||  || |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  17324244 ccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccccatgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 17324343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28207262 - 28207070
Alignment:
Q  5 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  28207262 attcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcat 28207163  T
Q  105 tgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||  |||| |||||||||  |||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  28207162 tgacatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 28207070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8347473 - 8347284
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8347473 gttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 8347374  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaac 187  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||| | |||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  8347373 ccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaac 8347284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Original strand, 13604652 - 13604897
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||  ||    
T  13604652 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc--ttctttcattact 13604749  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttt-tgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||    
T  13604750 tatctttattgc-tttgtatatgcttgtgatgttgctctatac-taga-ctatgtctgttttgctttgttgttgtttggagacactttacacattgatta 13604846  T
Q  331 ccacttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  13604847 tcacttccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgattttgtcc 13604897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6115303 - 6115104
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6115303 gttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaac 6115204  T
Q  101 ccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    | |||||| ||||||| ||||    ||||||||| |||||| |  |||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  6115203 caattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaa 6115104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 50248772 - 50248633
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50248772 gttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaac 50248673  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtg 139  Q
    |||||||  |||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  50248672 ccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtg 50248633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 40134025 - 40134210
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40134025 gttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaac 40134124  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccg 184  Q
     ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||    
T  40134125 acattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 40134210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16432475 - 16432675
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  16432475 gttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaac 16432574  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccc-agattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  || || |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  16432575 ccattgatatctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaca 16432674  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  16432675 a 16432675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Original strand, 47451747 - 47451919
Alignment:
Q  25 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||     
T  47451747 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgt 47451846  T
Q  124 aactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaac 196  Q
     ||||||||||||||| |  | | | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  47451847 tactcatcatatagtgaaacgaatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353372
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 21353430  T
Q  119 aacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21353429 aaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcat 21353372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 395
Target Start/End: Original strand, 50521165 - 50521391
Alignment:
Q  169 aggtcatattggaccgaactgagtcaacaa-tctt-ggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttg 266  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50521165 aggtcatattgaaccgaactgggttaccaaatctttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgtttctctttattgcttt-gattatgtttgtggtgttg 50521262  T
Q  267 ctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagaca--ttttattcattgattaccacttcctttgttccacacatctttcttattca 364  Q
     ||||||||  ||  ||||||| |||| |||||||||| ||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || |    
T  50521263 ttctacactaggacttaggtctatttt-gttgttgttgtttg-agactacttttactcattgattaccacttcctttactccacacatctttatttttta 50521360  T
Q  365 ttgatgtgattttgtccagattcacgacaat 395  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  50521361 ttgatgtgattttgtccgaattcacaacaat 50521391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 6823966 - 6824088
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt-------acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||       ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6823966 gttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattc 6824065  T
Q  94 ttgtaacccattgatttctcttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6824066 ttgtaacccattgatttctcttt 6824088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17318974 - 17319166
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17318974 gttgattcaccttgggaaaca------ggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 17319067  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
      |||||| |||| ||||| | |  |||||||| ||||||  |  ||||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  17319068 ttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 17319166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 49495411 - 49495296
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49495411 gttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaac 49495312  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
    |||||||| |||||||    
T  49495311 ccattgatatctcttt 49495296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Original strand, 19358872 - 19359095
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||  | |||    
T  19358872 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatatt-gactgaactgggtcaacaatcttttgatgtgtttgttc--ttccttttcttgct 19358968  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg----tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattga 327  Q
    ||||||  |||||||  ||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||    
T  19358969 tatcttggttgctttgtatt-tgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtatttttttgttgttgttgcttggagacactttacacataga 19359065  T
Q  328 ttaccacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19359066 ttaccacttccttttgctccacacatcttt 19359095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18800773 - 18800608
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18800773 gttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatc 18800674  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccca 164  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||  |||||||||||||||    
T  18800673 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctccccca 18800608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 396
Target Start/End: Original strand, 19361461 - 19361725
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||  || ||||  | |||    
T  19361461 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatatt-gactgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc--ttccttttcttgct 19361557  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-----tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattg 326  Q
    ||||||  |||||||  ||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||     ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  19361558 tatcttggttgctttgtatt-tgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttttttttttgttgttgcttggagacactttacacatag 19361654  T
Q  327 attaccacttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtga-ttttgtccagattcacgacaata 396  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| || | ||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  19361655 attaccacttccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccagattcacaacaata 19361725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 396
Target Start/End: Original strand, 19380101 - 19380365
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||  || ||||  | |||    
T  19380101 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatatt-gactgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc--ttccttttcttgct 19380197  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-----tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattg 326  Q
    ||||||  |||||||  ||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||     ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  19380198 tatcttggttgctttgtatt-tgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttttttttttgttgttgcttggagacactttacacatag 19380294  T
Q  327 attaccacttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtga-ttttgtccagattcacgacaata 396  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| || | ||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  19380295 attaccacttccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagttttaaccagattcacaacaata 19380365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155950
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 162  Q
    |  ||| | ||||||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  155888 cttttgttatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 155950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232772
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2232692  T
Q  116 tgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||||    | |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  2232693 tgtaaagaaactcat----tcgtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 2232772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8349248 - 8349052
Alignment:
Q  5 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  8349248 attcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcat 8349149  T
Q  105 tgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || | |||| ||||| | |  |||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||| ||| || |||| | || |||||||||| || |||||    
T  8349148 tggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctccccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaa 8349052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613240
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||  || | |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  101 ccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    || ||||| ||||||| | || |  ||| ||||| ||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  26613240 a 26613240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 395
Target Start/End: Original strand, 9023956 - 9024118
Alignment:
Q  230 cttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||| |  | ||||| ||||||||    
T  9023956 cttatctttattgcatt-gattatgcttgtggtgttgctatacacttagatttaggtatgttt--gttgttattgcttggggctactttatccattgatt 9024052  T
Q  330 accacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaat 395  Q
    ||||||| || || ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  9024053 accactttctctgctccacacttctttgtttttcattggtgtgattttgtctaaattcacaacaat 9024118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 27916576 - 27916765
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||||||| ||||||||   | ||||| |||||| ||||    
T  27916576 ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaac 27916675  T
Q  101 c--cattgatttctctttgtaacgaaactcatc-atatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaa 186  Q
    |  | ||||| ||||||||||| |  |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27916676 cttctttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 27916765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738638
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca---tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaact 188  Q
    || ||||| |||| ||||||| |  ||||||||   ||||||| |  |||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaact 30738638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30790601 - 30790411
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  30790601 gttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 30790503  T
Q  100 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactg 189  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  30790502 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactg 30790411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13125659 - 13125468
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  13125659 gttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 13125560  T
Q  100 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaact 188  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||  | ||||||| ||| ||||||||||    
T  13125559 ccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccccttactaggtcagtataggaccgaact 13125468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 373
Target Start/End: Original strand, 24202798 - 24203033
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc---ttggtgtgtttgttccttttctttcatagc 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||   |||||||||||||||  || ||||| | ||    
T  24202798 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc--ttcctttc-ttgc 24202893  T
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttg-ttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    |||||||  |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  24202894 ttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-tag-tttagggctg-ttttgttgttgtttgcttggagacactttacacatagatt 24202989  T
Q  330 accacttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtga 373  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  24202990 accactcccttttgctccacacatctttgtt-ttcattggtgtga 24203033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401221
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 2401305  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||   ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  2401304 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 2401221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526648
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttgt 9526564  T
Q  119 aacgaaact--catca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || ||||||   |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  9526565 aaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 9526648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16561547 - 16561748
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||  || |||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||    
T  16561547 gttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgtaa 16561646  T
Q  100 cccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaac 196  Q
    ||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||| | ||||||    |||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  16561647 ccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16561746  T
Q  197 aa 198  Q
    ||    
T  16561747 aa 16561748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 26520320 - 26520206
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg------gttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattc 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||    
T  26520320 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattc 26520221  T
Q  94 ttgtaacccattgat 108  Q
    |||||||||||||||    
T  26520220 ttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144683
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   | ||| | ||||||||||| ||   || | ||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagattgattcttgtaactca---atatatctt 4144770  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  4144769 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 4144683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Original strand, 13358779 - 13358852
Alignment:
Q  125 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  13358779 actcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 13358852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 130
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134181
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 25134169  T
Q  119 aacgaaactcat 130  Q
    || |||||||||    
T  25134170 aaagaaactcat 25134181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 356
Target Start/End: Original strand, 17345549 - 17345768
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || || |||| ||  ||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  17345549 tagtggattggagagctcctctttcccc-agagtaggtcatattagaccgaactgggttaataatcttttatgtttttgtt-catttctttcattgctta 17345646  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagaca-ttttattcattgattacc 332  Q
    ||||||| || |||||||||| || |||||||| |||||||| || |||  |  |   |||||||||||||||||  |  | ||||| |||||||||||     
T  17345647 tctttatggc-tttgattatgcttatggtgttgttctacactaag-tcttaggattactttgttgttgttgcttgaggctacttttactcattgattact 17345744  T
Q  333 acttcctttgttccacacatcttt 356  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  17345745 acttcctttgctccacacatcttt 17345768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521897
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  9521718 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttgt 9521813  T
Q  119 aacgaaact--catca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || ||||||   |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||||||| || |||||    
T  9521814 aaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcgtcattagaccgaactgggtaaacaa 9521897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2393461 - 2393292
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||    | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  2393461 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggac-ttgggtagaattagatttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 2393366  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactg 189  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  2393365 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactg 2393292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 77  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  || ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 28279346 - 28279424
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  28279346 ttgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattagg 28279424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 25445110 - 25445174
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  25445110 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 25445174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28265598 - 28265537
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28265598 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 28265537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39445564 - 39445500
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  39445564 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 39445500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 44023894 - 44023958
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  44023894 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 44023958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 3156989 - 3157053
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3156989 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 3157053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28220270 - 28220210
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28220270 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgt 28220210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  | | |||||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 348
Target Start/End: Original strand, 32737134 - 32737236
Alignment:
Q  245 tttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgtt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  |  | |||  |||||||| ||||||||||||| |    
T  32737134 tttgattatatttgtggtgttgcttcacacttagatctaagtctg-tttcgttgttgttgcttgaggctactttgctcattgatcaccacttcctttgct 32737232  T
Q  345 ccac 348  Q
    ||||    
T  32737233 ccac 32737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 834211 - 834150
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  834211 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 834150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 1055032 - 1055096
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  1055032 tggattggagagttgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 1055096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13138020 - 13137959
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  13138020 tctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtt 13137959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 198
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916671
Alignment:
Q  92 tcttgtaacccattgatttctctttg-taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtc-atattggaccgaact 188  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| |  |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  189 gagtcaacaa 198  Q
    | || |||||    
T  15916662 gggtaaacaa 15916671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 222
Target Start/End: Original strand, 41361040 - 41361108
Alignment:
Q  156 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca--atcttggtgtgtttgttccttttct 222  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  41361040 tctcccccatagtaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgtttcttttct 41361108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 24787397 - 24787460
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  24787397 tggattggagagctgctctcccccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 24787460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28223465 - 28223405
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgt 213  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28223465 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgt 28223405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 31659362 - 31659426
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31659362 tctctccctcagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttattcct 31659426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41390645 - 41390582
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||    
T  41390645 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgatctgggtcaacaatctt 41390582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41398300 - 41398237
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||    
T  41398300 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgacctgggtcaacaatctt 41398237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 44455284 - 44455348
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44455284 tctctcccccagattaggtcaagtttgaccgaactgggtcaacgatctttggtgtgtttgttcct 44455348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 49918474 - 49918538
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  49918474 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 49918538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45644396 - 45644337
Alignment:
Q  156 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  45644396 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgcttgtt 45644337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 294
Target Start/End: Original strand, 48382607 - 48382669
Alignment:
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttttt 294  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  48382607 ttatctttgttgcttta-attatgtttgtggtgttgcttcacacttagatctaggtctattttt 48382669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3847186 - 3847104
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||| | | | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  3847186 atagtggattggagagatccatctcttccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 3847104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 26332761 - 26332719
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 44  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26332761 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 292
Target Start/End: Original strand, 35109594 - 35109720
Alignment:
Q  163 cagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatctttattgcttttgattatgtttgtggt 262  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||||||  ||| || ||||   |  ||| ||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  35109594 cagattaggtcattttggaccaaactgagtaaacaatatcggtgtgttgtttctttctcttcttt--cttctctttgtttcttta-attatgtttgtggt 35109690  T
Q  263 gttgctctacacttagatctaggtctgttt 292  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  35109691 gttgttccgcacttagatctaggtctgttt 35109720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 189
Target Start/End: Original strand, 46783189 - 46783319
Alignment:
Q  62 actttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 159  Q
    ||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||   ||| |||| | ||||    
T  46783189 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctttttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgttatctc 46783288  T
Q  160 ccccagattaggtc-atattggaccgaactg 189  Q
    | ||||| || ||| |||||||| |||||||    
T  46783289 ctccagagtaagtcaatattggatcgaactg 46783319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 50167280 - 50167158
Alignment:
Q  91 ttcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactg 189  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||   |||||||||||||| | |   ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||     
T  50167280 ttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa--aaactcattg-atagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaagttggaccgaacta 50167184  T
Q  190 agtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
     |||||||||| ||||||||||||||    
T  50167183 ggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 50167158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4552681 - 4552620
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4552681 tctctccctcagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 4552620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37559912 - 37559847
Alignment:
Q  154 tctctccccc-agattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  37559912 tctctccccctagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 37559847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40122240 - 40122179
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  40122240 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 40122179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 79
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104318
Alignment:
Q  6 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||   ||  ||||||||||||||||||    
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattagg 43104318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 43988485 - 43988549
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| || ||||||||||    
T  43988485 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtaaacaatcttg 43988549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 50169254 - 50169193
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  50169254 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgtttgtt 50169193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22819494 - 22819273
Alignment:
Q  137 gtggattggagggctgctctctc-ccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg-gtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || || ||  || |||||| |||||||||||   |||||| | |  |||||    
T  22819494 gtggattggagggctactctctccccccagagtaggtcatattggaccaaattgggt-taccatcttgtgtgtgtttgttttctttcttgc-tttcttat 22819397  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt----ttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    | || |||  |||||||||| |||||||| || | |||| |||| | || | ||||||    |||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||    
T  22819396 c-ttgttg-atttgattatgcttgtggtgatgttttacatttagttttaagactgtttgttgttgttgttgttgcttaaggacactttatccattgatta 22819299  T
Q  331 ccacttcctttgttccacacatcttt 356  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||    
T  22819298 ccattttctttgctccacacatcttt 22819273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37503601 - 37503537
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  37503601 tctctcccccagattatgtcaagttggatcgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 37503537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959172
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 44  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggt 49959172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 196946 - 196893
Alignment:
Q  159 cccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgttt 211  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  196946 cccccagattaggtcaagttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgttt 196893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13659380 - 13659319
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  13659380 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtatttgtt 13659319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30476467 - 30476426
Alignment:
Q  177 ttggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  30476467 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 30476426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 36683804 - 36683865
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca-atcttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  36683804 tctctcccccagagtaggtcaagttagaccgaactgagtaaacatctcttggtgtgtttgtt 36683865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 46065042 - 46065103
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  46065042 tctctcccccagagtaggtcaagttggatcgaactgggtaaacaatctttggtgtgtttgtt 46065103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 183)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 10047447 - 10047202
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  10047447 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgttta 10047349  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10047348 tctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctatgtctatttttgttgttattgcttggagacactttatccattgattacca 10047250  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10047249 cttcctttgctccacacatttttgttattcattggtgtgattttgtcc 10047202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Original strand, 25862051 - 25862296
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  25862051 atagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttattccttt-ctttcattgctta 25862149  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  25862150 tctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattacca 25862248  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25862249 cttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtcc 25862296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 39246062 - 39245816
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39246062 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgctta 39245964  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  39245963 tctttattg-ttttgattatgcctgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgtttggagacactttatctattgattacc 39245865  T
Q  333 acttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||| || | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39245864 acttcattcgctccacacatctttattattcattggtgtgattttgtcc 39245816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 7941458 - 7941656
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941458 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 7941557  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  7941558 ccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 7941656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44600036 - 44599838
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600036 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 44599937  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44599936 ctcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 44599838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 9148388 - 9148585
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148388 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 9148487  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9148488 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9148585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22046883 - 22046686
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046883 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 22046784  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22046783 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 22046686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22132589 - 22132392
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132589 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 22132490  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22132489 ccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 22132392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 38409340 - 38409537
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38409340 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaac 38409439  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  38409440 ccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 38409537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8631617 - 8631419
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631617 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 8631518  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  8631517 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 8631419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16931987 - 16931789
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931987 gttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 16931888  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16931887 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16931789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16934341 - 16934143
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934341 gttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 16934242  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16934241 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16934143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18709361 - 18709164
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18709361 gttgattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 18709262  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18709261 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 18709164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37089569 - 37089372
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089569 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 37089470  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  37089469 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 37089372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 51015381 - 51015578
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015381 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 51015480  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  51015481 ccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 51015578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22780571 - 22780373
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780571 gttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 22780472  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22780471 cccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22780373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22782936 - 22782738
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782936 gttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 22782837  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  22782836 cccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaa 22782738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2485070 - 2484873
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2485070 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaac 2484971  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  2484970 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaa 2484873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22044588 - 22044391
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22044588 gttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 22044489  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22044488 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 22044391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31849796 - 31849599
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31849796 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaac 31849697  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  31849696 ccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaa 31849599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 134 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 54867251 - 54867006
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  54867251 atagttgattgaagggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgctta 54867154  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttttt--gttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  54867153 tctttattacttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctatgtctgtttttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattac 54867055  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtc 380  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  54867054 cacttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtc 54867006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6764979 - 6765177
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6764979 gttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 6765078  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6765079 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6765177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9176672 - 9176474
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176672 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 9176573  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  9176572 cccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaa 9176474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17662443 - 17662245
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662443 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 17662344  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  17662343 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 17662245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 24348353 - 24348551
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24348353 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaac 24348452  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  24348453 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 24348551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22134814 - 22134618
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134814 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 22134715  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22134714 ccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 22134618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11006435 - 11006247
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006435 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 11006336  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  11006335 cccattgatttctctttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 11006247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5143327 - 5143086
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5143327 atagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctcagtgtgtttgttccttt-ctttcattgctta 5143229  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  5143228 tctctattg-ttttgattatgtttgtggtgttgttctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgtttggagacactttacacattgattacca 5143130  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||| | |||||||    
T  5143129 cttcctttgctccacacatcattgttattcattggtttgatttt 5143086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 138 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5147741 - 5147504
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatctt 237  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  5147741 tggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctcggtgtgtttgttccttt-ctttcattgcttatctc 5147643  T
Q  238 tattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttc 337  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  5147642 tattg-ttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttattgttgttgtttcttggagacactttacacattgattaccacttc 5147544  T
Q  338 ctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  5147543 ctttgctccacacatcattgttattcattggtgtgatttt 5147504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 5269220 - 5269449
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  5269220 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttgttgtgtttgttcc-tttctttcatttctta 5269318  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt---ttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5269319 tatttattgc-tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtatatttttgttgttgttgttgcttggagacactttatccattgatta 5269417  T
Q  331 ccacttcctttgttccacacatctttcttatt 362  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5269418 ccacttcctttgctccacacatctttgttatt 5269449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 11435090 - 11435287
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435090 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 11435189  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  11435190 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 11435287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24333877 - 24333635
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  24333877 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaatcttggtgtgtttgtttc-tttctttcattgctta 24333779  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    |||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  24333778 tctttattgc-tttgattatgctt---gtgttgctctacacttagatctaggtctgttttttgttgttgttgtttggagacactttatctattgattacc 24333683  T
Q  333 acttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24333682 acttccttttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 24333635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26086174 - 26085977
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086174 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 26086075  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  26086074 ccattgttttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaa 26085977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Original strand, 16630709 - 16630950
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16630709 atagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaaccttggtgtgtttgttccttttctttcattgctta 16630808  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||| ||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  16630809 tctttgttc--tttgattatgcttgtggtgttgctttacacttagatctaggtttgtttttgttgttgctgcttggagacactttacacattgattacca 16630906  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
     |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16630907 gttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgatttt 16630950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11008764 - 11008568
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008764 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 11008665  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  11008664 cccattgatt--tctttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 11008568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 5198555 - 5198753
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198555 gttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5198654  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  5198655 ccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaa 5198753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 18847288 - 18847485
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847288 gttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 18847387  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  18847388 cccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 18847485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Original strand, 38152468 - 38152710
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  38152468 atagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgctta 38152566  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt--ttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||    
T  38152567 tcttt-gtgc-tttgattatgcttgtggtgttgctatacacttagatctaggtctgttttattgttgttgttgcttggaaacacttcatacattgattac 38152664  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||||| |||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38152665 cacttcatttgctctacacatctttgttattcattggtgtgatttt 38152710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 47210939 - 47210756
Alignment:
Q  12 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47210939 ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 47210840  T
Q  112 tc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtca 194  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  47210839 tcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 47868536 - 47868734
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868536 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 47868635  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  47868636 ccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaa 47868734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9174344 - 9174146
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9174344 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 9174245  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  9174244 ctcattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 9174146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22801060 - 22800862
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801060 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 22800961  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22800960 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 22800862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 24888931 - 24889129
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24888931 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaac 24889030  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  24889031 ccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 24889129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36921691 - 36921493
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36921691 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaat 36921592  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||| ||||||||    
T  36921591 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaa 36921493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 40637209 - 40637407
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637209 gttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 40637308  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  40637309 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 40637407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 135 - 394
Target Start/End: Original strand, 42599602 - 42599864
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctc--ccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctt 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42599602 tagtggattggagggttgctctctctcccccatattatgtcatattggactgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgctt 42599700  T
Q  233 atctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt---ttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  42599701 atctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacatttagatctaggtttgtttgttttgttgttgttgcttggagtcactttatctattgatt 42599799  T
Q  330 accacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaa 394  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||    
T  42599800 accacttcctttgcttcacacatctttattattcattagtgtgattttgtccgaattcacaacaa 42599864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22802932 - 22802734
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802932 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 22802833  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||  ||||||||    
T  22802832 ccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaa 22802734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36919782 - 36919584
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36919782 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaat 36919683  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  36919682 ccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 36919584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40091613 - 40091415
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091613 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 40091514  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  40091513 ccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 40091415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Original strand, 3796548 - 3796794
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttccttttctttcatagctt 232  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  3796548 atagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcc-tctctttcattgctt 3796646  T
Q  233 atctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||     
T  3796647 atctttattgc-tttgattatgcttgtgatgttactctacacttagatttaggtctgatttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattat 3796745  T
Q  332 cacttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3796746 cacttccttttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 3796794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 24879124 - 24879323
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879124 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 24879223  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgt-aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  24879224 ccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 24879323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 14633454 - 14633651
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633454 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 14633552  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  14633553 ccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 14633651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3777617 - 3777406
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3777617 atagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatctcggtgtgtttgttccttt-ctttcattgctta 3777519  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  3777518 tctttgt-gcttt-gattatgcttgtggttttgttctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattacca 3777421  T
Q  334 cttcctttgttccac 348  Q
    |||||||| ||||||    
T  3777420 cttcctttattccac 3777406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 47274861 - 47275058
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274861 gttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 47274960  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  47274961 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaa 47275058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 48486454 - 48486652
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486454 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 48486553  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  48486554 acattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaa 48486652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 24880586 - 24880785
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880586 gttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 24880685  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgt-aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||  || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  24880686 ccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 24880785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Original strand, 5396700 - 5396923
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  5396700 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttcttccttt-ctttcattgct 5396798  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacact---tagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgat 328  Q
    ||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  5396799 tatctttgt-gcttt-gtttatgcttgtggtgttgctctacactaattag-tctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgat 5396895  T
Q  329 taccacttcctttgttccacacatcttt 356  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5396896 taccacttcctttgctccacacatcttt 5396923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12396043 - 12395845
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12396043 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaac 12395944  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  12395943 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaa 12395845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38928375 - 38928177
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928375 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 38928276  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  38928275 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 38928177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 3824768 - 3824627
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824768 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 3824669  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtgga 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  3824668 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5637663 - 5637524
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5637663 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 5637564  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtg 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  5637563 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12401005 - 12400807
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12401005 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaac 12400906  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  12400905 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaa 12400807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Original strand, 6743444 - 6743694
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||    
T  6743444 atagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaac-atcttggtgtgtttgttcc-tttcttccatttctta 6743541  T
Q  234 tctttat-tgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacac------ttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattg 326  Q
    ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||      |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||    
T  6743542 tctctatatgc-tttgattatgcttgtggtgttgctctacactcagatttagatttaggtttg-ttttgttgttgttgtttggagacactttatctattg 6743639  T
Q  327 attaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  6743640 attaccacttcctttgctcgacacttctttgttattcattgctatgattttgtcc 6743694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 19322828 - 19323019
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19322828 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 19322927  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactg 189  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  19322928 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactg 19323019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33415686 - 33415491
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33415686 gttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 33415587  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaa 195  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||| |||||    
T  33415586 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcaggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 33415491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 19096018 - 19096216
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19096018 gttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaac 19096117  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  19096118 ccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaa 19096216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16455376 - 16455575
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455376 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 16455475  T
Q  101 ccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| ||||||| |||| |  |||| |||| |||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  16455476 tcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 16455575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 36378427 - 36378626
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36378427 gttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaac 36378526  T
Q  101 ccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| ||||| |||| | |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  36378527 tcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaa 36378626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 198
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437695
Alignment:
Q  60 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 11437656  T
Q  160 ccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  11437657 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 11437695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 16453444 - 16453634
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16453444 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaac 16453543  T
Q  101 ccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactg 189  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| |||||| |   || || |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  16453544 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactg 16453634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Original strand, 13544095 - 13544268
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544095 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 13544194  T
Q  102 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca 174  Q
    ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||  |||||||||  |||||| |||||||    
T  13544195 cattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtca 13544268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14787628 - 14787429
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  14787628 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaact 14787529  T
Q  102 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg--ctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  14787528 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaa 14787429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18537673 - 18537497
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537673 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 18537574  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18537573 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccataataggtcat 18537497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547477
Alignment:
Q  14 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  114 -tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 188  Q
     ||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaact 13547477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635476
Alignment:
Q  61 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  160 ccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5635476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37313264 - 37313080
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313264 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 37313165  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggacc 183  Q
    ||||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||    
T  37313164 ccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccccagactatgtcaatttggacc 37313080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 36380484 - 36380683
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36380484 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 36380583  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| | || ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| || |||||    
T  36380584 tcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtggaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaa 36380683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 198
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215639
Alignment:
Q  43 gttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtgga 141  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  142 ttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
      ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 4215639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38890424 - 38890224
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38890424 gttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaac 38890325  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || ||||    
T  38890324 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaaca 38890225  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  38890224 a 38890224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 53405264 - 53405466
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga------cttattct 94  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||      ||||||||    
T  53405264 gttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattct 53405363  T
Q  95 tgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtc 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||||  ||    
T  53405364 tgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagagagctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatc 53405461  T
Q  194 aacaa 198  Q
    |||||    
T  53405462 aacaa 53405466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891625
Alignment:
Q  8 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  108 tttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    | ||||||| |||| |  ||||||||| |||||| |   || | ||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaa 2891625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 377
Target Start/End: Original strand, 16624147 - 16624279
Alignment:
Q  245 tttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgtt 344  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  16624147 tttgattattcttgtggtgttgctctacacttaaatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattatcacttcctttgct 16624246  T
Q  345 ccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16624247 ccacacatctttgttattcattggtgtgatttt 16624279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 341
Target Start/End: Original strand, 31985663 - 31985866
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  || ||||| | |||    
T  31985663 atagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc--ttcctttc-ttgct 31985758  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    |||||||||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||    
T  31985759 tatctttattgc-tttgtatatgcttgtggagttgctctacac-taga-ctaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagatta 31985855  T
Q  331 ccacttccttt 341  Q
    |||||||||||    
T  31985856 ccacttccttt 31985866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 619645 - 619448
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  619645 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataac 619546  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  619545 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctccccta-actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 619448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 56030579 - 56030770
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56030579 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 56030678  T
Q  101 ccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtca 194  Q
     |||||  |||||| |||||||||  | ||||||||   || |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||    
T  56030679 tcattgacatttct-tttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18535031 - 18534858
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18535031 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 18534932  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggt 172  Q
    |||||||| |||| |||||||    |||||| | |||||||||  |||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  18534931 ccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctcccccccagactaggt 18534858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Original strand, 28468558 - 28468776
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  || ||||| | |||    
T  28468558 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc--ttcctttctt-gct 28468653  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||  |||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||    
T  28468654 tatcttggttgctttgtatt-tgcttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattac 28468750  T
Q  332 cacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||    
T  28468751 cacttccttttgctccacacatcttt 28468776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 155 - 377
Target Start/End: Original strand, 8689533 - 8689748
Alignment:
Q  155 ctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatctttattgcttttgatta 252  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||    
T  8689533 ctctcccccatattagatcatattggaccgaactggatcaacaatcttttggtgtgtttgttac-tttctttcattgcttatcttt-gtgc-tttgttta 8689629  T
Q  253 tgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgttccacacat 352  Q
    || ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||      ||||||||||||||||  |||||||||    
T  8689630 tgcttgtggtgttgctctgca-ttaagtctaggtctgtttttgttgttgttacttggagacacttta-----cgattaccacttcctttactccacacat 8689723  T
Q  353 ctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  8689724 ctttgttattcattggtgtgatttt 8689748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 36315258 - 36315467
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  36315258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgttta 36315356  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagaca--ttttattcattgattac 331  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||                    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||    
T  36315357 tctctattgc-tttgattatgcttgtggt-------------------aaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttttgtccattgattac 36315436  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttatt 362  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||| |||||    
T  36315437 cacttcctttactccacacatttttgttatt 36315467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 362
Target Start/End: Original strand, 36329467 - 36329676
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  36329467 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgttta 36329565  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagaca--ttttattcattgattac 331  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||                    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||    
T  36329566 tctctattgc-tttgattatgcttgtggt-------------------aaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttttgtccattgattac 36329645  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttatt 362  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||| |||||    
T  36329646 cacttcctttactccacacatttttgttatt 36329676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 16623322 - 16623426
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16623322 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcattgctta 16623421  T
Q  234 tcttt 238  Q
    |||||    
T  16623422 tcttt 16623426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102412
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  100 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaact 188  Q
    |||| |||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaact 12102412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 378
Target Start/End: Original strand, 34495853 - 34496093
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||   || |||||||||||||||||   |||||||||| |||| |    
T  34495853 tagtggattggagggctgctctctcccccagagtaagtcatgttggaccgaact-aggttaccatcttggtgtgtttgttttctttctttcattgcttgt 34495951  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt-ttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||||| | | || |||||| ||||||||||||||||  |  ||||| | |||||||||||     
T  34495952 -tttattgc-tttgattatgcttgtgttgatgctttacacttagttttgggactgtttgttgttgttgttgcttgaggctattttgtccattgattaccg 34496049  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttg 378  Q
    || |||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  34496050 ctacctttgctccacacatctttgtt-ttcattggtgtgattttg 34496093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 41997627 - 41997816
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41997627 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 41997726  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactg 189  Q
    || || || |||| ||||||| |  ||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  41997727 cctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctct-ccccagactaggttaatttggaccgaactg 41997816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8756451 - 8756276
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8756451 gttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaa 8756352  T
Q  100 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtc 173  Q
    | ||||||| |||| ||||||| |  ||| |||| |||||||||  ||| || |||||||||| ||||| ||||||    
T  8756351 ctcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctcctccagactaggtc 8756276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 28453818 - 28454017
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |    
T  28453818 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaac 28453917  T
Q  102 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
      ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||  || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||    
T  28453918 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaa 28454017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15032747 - 15032557
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||  | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15032747 gttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaac 15032648  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaact 188  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| || ||||||  | || |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  15032647 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaact 15032557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185834
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatctt 16185919  T
Q  116 tgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |  |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||    
T  16185918 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaa 16185834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 381
Target Start/End: Original strand, 1983330 - 1983572
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| || | || | ||||||||||||||   |||||| | |  |||||    
T  1983330 tagtggattggagagctgctatctcccccatagtaggtcatattggaccgaactgggttacca-tattggtgtgtttgttttctttcttgcttt-cttat 1983427  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt-ttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
     ||  ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||  |    
T  1983428 attg-ttg-ttttgattatgtttgtggtgatgctttacacttagatttaagtcagtttgttgttgttgttgcttgaacccactttatccattgattatta 1983525  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  1983526 cttcctttgctccacacatctttgtt-ttcatttgtgtgattttgtcc 1983572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853730
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 11853644  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  11853645 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 11853730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18409545 - 18409430
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18409545 gttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaac 18409446  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
    |||||||| |||||||    
T  18409445 ccattgatatctcttt 18409430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 52942643 - 52942542
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942643 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 52942557  T
Q  102 cattgatttctcttt 116  Q
    ||||||| |||||||    
T  52942556 cattgatatctcttt 52942542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 9863842 - 9864046
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| ||   | ||||| |||||||||||    
T  9863842 ttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaac 9863941  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatca----tatagtggattggagggctgctctct--cccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtc 193  Q
    |  ||||| ||||||||||| |  ||||||||    |||||||||  |||| ||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||     
T  9863942 cttttgatatctctttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggta 9864041  T
Q  194 aacaa 198  Q
    |||||    
T  9864042 aacaa 9864046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 6133007 - 6133090
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga 84  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  6133007 gttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529449
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttgt 8529365  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  8529366 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 8529449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587148
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||  ||||||| || ||   || |||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactggttcttgttactca---atatctctttgt 18587064  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  18587065 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 18587148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300605
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 31300522  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  31300523 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 31300605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3937407 - 3937314
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937407 gttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050281
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 7050344  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7050343 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcat 7050281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982186
Alignment:
Q  5 attcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||   | ||||| |||||||||||     
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  102 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaac 187  Q
    | ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaac 3982186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Original strand, 10113003 - 10113195
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-gggaagaggctgggactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||    
T  10113003 ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaa 10113102  T
Q  100 cc-cattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactg 189  Q
    ||   ||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  10113103 cctttttgatatctctttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactaggttagtattggaccgaactg 10113195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 30136684 - 30136799
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  30136684 gttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaagaaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgac 30136783  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
     ||| ||| |||||||    
T  30136784 tcatcgatatctcttt 30136799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983564
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  100 cccattgatttc-tctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 161  Q
    ||| ||||| || | |||||||    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 31983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831314
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  15831144 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgcgtagaattaggtttgaagactgattcttggaactca---atatctctttgt 15831239  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactg 189  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  15831240 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactg 15831314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357976
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg----gtagaatt-aggcgggagacttattcttg 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||     ||||||| ||   | |||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  97 taacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtc 193  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||| ||  |||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||     
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggta 25357971  T
Q  194 aacaa 198  Q
    |||||    
T  25357972 aacaa 25357976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150977
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  || || ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
    || ||||| |||||||    
T  47150992 cctttgatatctcttt 47150977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822445
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 55822360  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  55822361 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctct-ccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 55822445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558492
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 4558409  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  4558410 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagact-ggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 4558492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317139
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttgt 15317056  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  15317057 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 15317139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16688940
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 16689024  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||||| || | |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  16689023 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 16688940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570275
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 4570189  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  4570190 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagact-ggtcatcattagaccgaactgtgtaaacaa 4570275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 27499180 - 27499280
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  || | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27499180 gttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacgataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaac 27499279  T
Q  101 c 101  Q
    |    
T  27499280 c 27499280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 36769479 - 36769652
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  36769479 aaacactattaggatcgagtttcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 36769574  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactg 189  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  36769575 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactg 36769652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556084
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 4556143  T
Q  119 aacgaaactcat---catatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    || | |||||||     |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4556142 aaag-aactcatatgattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcat 4556084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24742004 - 24741769
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt---ggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||   ||||| |||||||  || ||||| | ||||||    
T  24742004 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttc--ttcctttctt-gcttat 24741910  T
Q  235 ctt-tattgcttttgattatgtttgtg--gtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggaga-cattttattcattgatta 330  Q
    ||| | ||||||| |  | | ||||||  || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  24741909 cttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacact-ag-tctagggctgtttttgttgttgttgcttggaaaccattttgttcattgatta 24741812  T
Q  331 ccact-tcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtga 373  Q
    ||||| ||  ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  24741811 ccactatctcttgctccacacatctttgtt-ttcattggtgtga 24741769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4885056
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtataatcaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 4884972  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||  ||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  4884973 aaaaaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 4885056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336788
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  | || ||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctctt 5336866  T
Q  116 tgt-aacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtc-atattggaccgaactga 190  Q
    ||| || |||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||| |||||||    
T  5336865 tgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactga 5336788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489493
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 16489447  T
Q  119 aacgaaactcat---catatagtggattggagggctgctctctccc 161  Q
    || |||||||||    ||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  16489448 aaagaaactcatatcaatatagtggaacggagagctgctctctccc 16489493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 198
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101261
Alignment:
Q  67 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 165  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    ||||||||||||||  |  ||||||||||| ||| ||||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatct-ccccag 5101228  T
Q  166 attaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  5101229 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5101261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 172
Target Start/End: Original strand, 9022438 - 9022613
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||||  || |||||||||| ||||||||   || |||| ||||||||||    
T  9022438 ttgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaa 9022537  T
Q  100 ccc--attgatttctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggt 172  Q
    ||   |||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  9022538 cctctattgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctcccccatattaggt 9022613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9927502 - 9927438
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9927502 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 9927438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Original strand, 15312319 - 15312488
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  15312319 cactattaggattgagtcgcttggtcacgggaagatgctgtgac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 15312414  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaact 188  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  15312415 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctggtctctcccccagactaggtcatcattagaccgaact 15312488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13072160 - 13072010
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  13072160 cactattatgattgagtctcttggtcactggaagaggctgtga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 13072065  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattag 170  Q
    || |||||||  |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13072064 aaagaaactcatatcattatagtagaatggagagctgctctctcccccatattag 13072010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 192
Target Start/End: Original strand, 39774335 - 39774392
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagt 192  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39774335 tagtggattggagagctgctctatcccccagagtaggtcatattggaccgaactgagt 39774392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 40999148 - 40999071
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  40999148 ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattagg 40999071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12739594 - 12739530
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12739594 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 12739530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26175680 - 26175616
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26175680 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 26175616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 79
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Original strand, 36771396 - 36771568
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  36771396 aaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagaggctgtgac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 36771491  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaact 188  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  36771492 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctacgccagactaggtcatcattagaccgaact 36771568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3814088 - 3814024
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  3814088 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 3814024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5732729 - 5732665
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  5732729 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 5732665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18855791 - 18855727
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  18855791 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 18855727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27417070 - 27416961
Alignment:
Q  91 ttcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactg 189  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||   |||||||||||||| | |   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27417070 ttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa--aaactcattg-atagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactg 27416974  T
Q  190 agtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||||||    
T  27416973 agtcaacaatctt 27416961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48893682 - 48893621
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  48893682 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 48893621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 9224428 - 9224491
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9224428 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 9224491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12743969 - 12743905
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12743969 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 12743905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12745358 - 12745294
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12745358 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 12745294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29760705 - 29760642
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  29760705 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 29760642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 51520521 - 51520458
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  51520521 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-cagaactgggtcaacaatctt 51520458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5112304 - 5112226
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||    
T  5112304 tagtggattggagagctgctctcacccccaaagtagatcatattggaccgaactgggt-taccatcttggtgtgtttgtt 5112226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18377426 - 18377223
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||| || | || ||||||||||||||||        |||     ||||    
T  18377426 tagtggaatggagggctgctctctcctccagagtaggtcatatagaactgaactgggttacca-tcttggtgtgtttgtt--------ttc-----ttat 18377341  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt-ttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
     ||| ||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| |    
T  18377340 ttttgttgcttt-gattatgcttgtggttatgctttacacttagttttaggactgtttgttgttgttgttgcttgaggacactttatccattgattacta 18377242  T
Q  334 cttcctttgttccacacat 352  Q
    |   ||||| |||||||||    
T  18377241 caaactttgctccacacat 18377223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 46147435 - 46147374
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  46147435 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 46147374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 52467398 - 52467337
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  52467398 tctctccccgagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 52467337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 5429803 - 5429867
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5429803 tctctcccccagattaggttaagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcct 5429867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 9229215 - 9229278
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||    
T  9229215 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggttaacaatctt 9229278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 29254618 - 29254682
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29254618 tctctctcccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 29254682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34570458 - 34570394
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  34570458 tctctcccccagattaggttaagttggatcgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 34570394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 36463433 - 36463385
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36463433 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctt 36463385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 45347838 - 45347901
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  45347838 tggattggagagctgctctctcccccagattaagccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 45347901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 45357317 - 45357380
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  45357317 tggattggagagctgctctctcccccagattatgccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 45357380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 212
Target Start/End: Original strand, 5871944 - 5872003
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5871944 tctctcccccagattaggtcaagtttgaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttg 5872003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 79
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagact-ggaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Original strand, 10114463 - 10114505
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 44  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10114463 ttgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 10114505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 180
Target Start/End: Original strand, 56146732 - 56146774
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgg 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56146732 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 56146774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5112151 - 5112068
Alignment:
Q  293 ttgttgttgttgcttggagacat-tttattcattgattaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  5112151 ttgttgttgttgcttg-agacttgtttactcattgattaccactccctttgctccacacatttttgtt-ttcattggtgtgatttt 5112068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16638973
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  || ||| ||||||||||| |||   | ||||| ||||||||||||| |  || ||||||    
T  16638827 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgggtagaatgaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tcaatatctctt 16638924  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctccc 161  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  16638925 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccc 16638973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37781836 - 37781716
Alignment:
Q  230 cttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt-ttgttgttgttgcttggagacattttattcattgat 328  Q
    ||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||  || | |||| ||||| ||    
T  37781836 cttatctttgttgcttt-gaatatgcttgtggtgttgcttcacacttagatctaggtctatttgttgatgttgttgattgatgatactttactcattaat 37781738  T
Q  329 taccacttcctttgttccacac 350  Q
     || ||||| |||| |||||||    
T  37781737 gactacttcttttgctccacac 37781716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 45687226 - 45687157
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttccttttct 222  Q
    ||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45687226 tctctcctccatattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttcttttct 45687157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47038455 - 47038394
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  47038455 tctctcccccagagtaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 47038394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 120
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906843
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |   |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54906821  T
Q  99 acccattgatttctctttgtaa 120  Q
    || | ||||| |||||||||||    
T  54906822 actctttgatatctctttgtaa 54906843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3578786 - 3578671
Alignment:
Q  84 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattgga 181  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| || |||| ||    
T  3578786 agactaattcttgtaacattttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattaga 3578688  T
Q  182 ccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| || |||||    
T  3578687 ccgaactgggtaaacaa 3578671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4956144 - 4956083
Alignment:
Q  245 tttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||    
T  4956144 tttgattatgtttgtggtgttgcttcacacttaaatctagatccg--tttgttgttgttgcttg 4956083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446678
Alignment:
Q  86 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 161  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 24446678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 29760554 - 29760470
Alignment:
Q  291 ttttgttgttgttgcttggaga-cattttattcattgattaccact-tcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtga 373  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  29760554 ttttgttgttgttgcttggaaaccattttgtttattgattaccactatctcttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga 29760470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 36994648 - 36994708
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  36994648 tctctcccccatattagatcaagttggaccgaactgggtcaacaattttggcgtgtttgtt 36994708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 37740749 - 37740813
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa-tcttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||    
T  37740749 tctctcccccagatttggtcaagttggaccgaactgtgtcaacaattttttgtgtgtttgttcct 37740813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 48053148 - 48053068
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagat-taggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||||  |||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  48053148 tggactggagagctgctctctcctccagacgtaggtcaatttggacagaactgggtaaacaatcttggtctgtttgttcct 48053068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 54199950 - 54199887
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa-tcttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  54199950 tctctcccccagattaggtcaagttgga-cgaactgggtcaacaatttttggtgtgtttgttcct 54199887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 188
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557909
Alignment:
Q  104 ttgatttctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaact 188  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  26557823 ttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaact 26557909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 314
Target Start/End: Original strand, 7816394 - 7816423
Alignment:
Q  285 gtctgtttttgttgttgttgcttggagaca 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7816394 gtctgtttttgttgttgttgcttggagaca 7816423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14789484 - 14789428
Alignment:
Q  144 ggagggctgctc--tctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  14789484 ggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 14789428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Original strand, 47563021 - 47563094
Alignment:
Q  125 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  47563021 actcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 47563094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 38270148 - 38270120
Alignment:
Q  61 gactttgggtagaattaggcgggagactt 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270148 gactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 168)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 135 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20284156 - 20283898
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  20284156 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcatttcttat 20284058  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  20284057 ctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgtttcttggagacactttatccattgattatcac 20283959  T
Q  335 ttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaat 395  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||| |||||    
T  20283958 ttcttttgctccacacatctttgttattcataggtgtgattttgtccgaattcacaacaat 20283898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1047122 - 1046925
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047122 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 1047023  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  1047022 ccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1046925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1049493 - 1049296
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049493 gttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 1049394  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  1049393 ccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1049296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29159871 - 29159627
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  29159871 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctct-ctttcattgctta 29159773  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  29159772 tctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattacca 29159674  T
Q  334 ctt-cctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29159673 cttccctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 29159627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40836940 - 40836743
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836940 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 40836841  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  40836840 ccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 40836743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7351850 - 7351652
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351850 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 7351751  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7351750 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 7351652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 38394077 - 38394275
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394077 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 38394176  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  38394177 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 38394275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7349471 - 7349285
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349471 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 7349372  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7349371 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 7349285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 20299551 - 20299749
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299551 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 20299650  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  20299651 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20299749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 135 - 381
Target Start/End: Original strand, 33332480 - 33332724
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33332480 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgcttat 33332578  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  33332579 ctttattgattt-gattatgcttatggtgttgctctacacttagatttaggtttgtttttgttgttgttgtttggatacactttatctattgattaccac 33332677  T
Q  335 ttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  33332678 ttcctttggtccacacatcttggttattcattggtgtgattttgtcc 33332724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Original strand, 4796696 - 4796944
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  4796696 atagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaatcttggtgtgtttgttcc-tttctctcattgctta 4796794  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg---tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||    
T  4796795 tctttattgc-tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttttttttgttgttgttgcttggagaaactttatctattgatta 4796893  T
Q  331 ccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4796894 ccacttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtcc 4796944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Original strand, 46516339 - 46516585
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  46516339 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgttta 46516437  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    ||| |||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  46516438 tctctattgc-tttgattatgcttttggtgttgctttacacttagatttaagtctgttttttgttgttgttgtttggagacactttatctattgattacc 46516536  T
Q  333 acttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  46516537 acttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtcc 46516585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 20626129 - 20626327
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20626129 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaac 20626228  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  20626229 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20626327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 20630020 - 20630218
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20630020 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaac 20630119  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  20630120 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20630218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 20642439 - 20642637
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20642439 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaac 20642538  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  20642539 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20642637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31156109 - 31155911
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156109 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 31156010  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31156009 cccattgatttctctttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31155911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 49091729 - 49091487
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  49091729 atagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatcttggtgcgtttgttccttt-ctttcattgctta 49091631  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  49091630 tctttgt-gcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttaaatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattacca 49091533  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  49091532 cttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 49091487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 135 - 378
Target Start/End: Original strand, 9190038 - 9190279
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  9190038 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tctctttcattgcttat 9190136  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  9190137 ctttattgc-tttgtttatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtttg-ttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccac 9190234  T
Q  335 ttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttg 378  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  9190235 ttccttttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgattttg 9190279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 3035812 - 3036013
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag---aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3035812 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgt 3035911  T
Q  98 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaac 196  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  3035912 aacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 3036011  T
Q  197 aa 198  Q
    ||    
T  3036012 aa 3036013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7470220 - 7470022
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470220 gttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 7470121  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  7470120 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 7470022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7472178 - 7471980
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7472178 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaac 7472079  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  7472078 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 7471980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 18345632 - 18345830
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345632 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 18345731  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  18345732 ccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaa 18345830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 135 - 381
Target Start/End: Original strand, 23403043 - 23403287
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23403043 tagtagattggagggctgctcactccctcagattaggtcatattagaccgaattgggtcaacaatcttagtgtgtttgttccttt-ctttcattgcttat 23403141  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||    
T  23403142 atttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttacatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggaaacactttatccattgattatcac 23403240  T
Q  335 ttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  23403241 ttcctttgctccacacatctttgttattcattggtatgattttgtcc 23403287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 44724670 - 44724868
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724670 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 44724769  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  44724770 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 44724868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Original strand, 48457748 - 48457942
Alignment:
Q  5 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457748 attcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 48457847  T
Q  105 tgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  48457848 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 48457942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 20297453 - 20297648
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20297453 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaac 20297552  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaa 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||    
T  20297553 ccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 20297648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 3878668 - 3878866
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878668 gttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 3878767  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||| ||||||||    
T  3878768 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaa 3878866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 38396726 - 38396923
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38396726 gttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 38396825  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  38396826 ccattgatttctctttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 38396923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 1850072 - 1850270
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850072 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 1850171  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  1850172 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1850270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Original strand, 2647725 - 2647946
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2647725 atagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatcttgatgtgtttgttcc-tttctttcattgctta 2647823  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  2647824 tctttattgc-tttgattatgcttgtggtgttgctctaaacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgtttggagatattttatctattgattacc 2647922  T
Q  333 acttcctttgttccacacatcttt 356  Q
    | |||||||| |||||||||||||    
T  2647923 atttcctttgctccacacatcttt 2647946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935557
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2935473  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 2935557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 35720 - 35918
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35720 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 35819  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  35820 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaa 35918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27306428 - 27306230
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  27306428 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaac 27306329  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  27306328 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaa 27306230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 40946419 - 40946617
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946419 gttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 40946518  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  40946519 ctattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 40946617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 155 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21988955 - 21988733
Alignment:
Q  155 ctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatctttattgcttttgattatg 254  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21988955 ctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctcggtgtgtttgttccttttctttcattgcttatctttattgc-tttgattatg 21988857  T
Q  255 tttgtggtgttgctctacacttagatctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgttccacacatc 353  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21988856 tttgtggtgttgctctacacccagatttaggtctggagtttgttgttgttgcttggtgacactttacacattgattaccacttcctttgctccacacatc 21988757  T
Q  354 tttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
     || || ||||||| |||||||||    
T  21988756 attatttttcattggtgtgatttt 21988733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 25542621 - 25542817
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25542621 gttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaac 25542719  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  25542720 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaa 25542817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21983352 - 21983109
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||||    
T  21983352 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctcggtgcatttgttccttttctttcgttgctta 21983253  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  21983252 tctctattgc-tttgattatgtttgtggtgttgctctacacccagatttaggtctggagtttgttgttgttgcttggagatactttacacattgattacc 21983154  T
Q  333 acttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||| |||| |||| ||||| || || ||||||| |||||||||    
T  21983153 acttcatttgctccatacatcattgtttttcattggtgtgatttt 21983109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 56015 - 55764
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  56015 atagtggattggagggctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttggtgtgtttgttcctttccttccattgctta 55917  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgt---------ttttgttgttgttgcttggagacattttattcat 324  Q
    |||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  55916 tcttt-gtgc-tttgattatgcttgtggtgttgctctatacttagatctaggtctgtttttttttattttattgttgttgcttggagacactttacacat 55819  T
Q  325 tgattaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  55818 tgattaccacttcctttacttcacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 55764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7092410 - 7092213
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092410 gttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 7092311  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  7092310 ccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 7092213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 135 - 395
Target Start/End: Original strand, 9185195 - 9185451
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  9185195 tagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatcttg--gtgtttgttcc-tctctttcattgcttat 9185291  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  9185292 ctttattgc-tttgtttatgcttgtggtgtttctctacacttagatctaggtctg-ttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccac 9185389  T
Q  335 ttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaat 395  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||  |||||| |||||    
T  9185390 ttccttttgctccacacatctttgtttttcattagtgtgattttgaccgaattcacaacaat 9185451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606668
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 1606584  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaa 1606668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7094658 - 7094463
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094658 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 7094559  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaa 195  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| |||||    
T  7094558 ccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaa 7094463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027194
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9027194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137366
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22137366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552393
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 40552393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43253715 - 43253520
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253715 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaac 43253616  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaa 195  Q
     |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||  || |||||||||| |||||    
T  43253615 tcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaa 43253520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 11757321 - 11757463
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757321 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 11757420  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 142  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11757421 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 11757463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 28487644 - 28487842
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487644 gttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 28487743  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  28487744 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaa 28487842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 135 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 2580457 - 2580197
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttc--cttttctttcatagctt 232  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || || |||||| ||||    
T  2580457 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctcttttttcattgctt 2580358  T
Q  233 atctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    ||||||||||| |||| ||||  |||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  2580357 atctttattgc-tttggttatacttgtggtgtatctctacacttagatttaggtctg-ttttgttgttgttgcttgaagacactttacacattgattacc 2580260  T
Q  333 acttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaat 395  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||  |||||| |||||    
T  2580259 acttccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgattttgtccgaattcacaacaat 2580197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 381
Target Start/End: Original strand, 9235634 - 9235831
Alignment:
Q  184 gaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatcta 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9235634 gaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcattt-ctttcattgcttatctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacatttagattta 9235731  T
Q  284 ggtctgtttt--tgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  9235732 ggtctgtttttttgttgttgttgcttggagacactttatccattgattaccacttcctttgctccacacatctttgttatttattggtgtgattttgtcc 9235831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108355
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22108355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31435245 - 31435046
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31435245 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaac 31435146  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  31435145 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaa 31435046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550115
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 40550115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 44655 - 44853
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44655 gttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaac 44754  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  44755 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 44853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35960884 - 35960641
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| || ||  ||||    
T  35960884 atagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaatcttggtgtgtttgtt-catttcattaatttctta 35960786  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt--ttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||    
T  35960785 tctttattgc-tttatttatgctggtggtgtttctctacacttagatttaggcctgttttgttgttgttgttgcttggaaacactttatctattgattac 35960687  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  35960686 cacttcctttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgatttt 35960641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 24748685 - 24748884
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24748685 gttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 24748784  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24748785 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaa 24748884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4296132 - 4295934
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296132 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 4296033  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   |||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  4296032 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaa 4295934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13099674 - 13099474
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13099674 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaac 13099575  T
Q  101 ccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    |||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  13099574 ccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 13099475  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  13099474 a 13099474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42331197 - 42330997
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac--gggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331197 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 42331098  T
Q  99 acccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |  |||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  42331097 acccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 42330998  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  42330997 a 42330997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20137307 - 20137109
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137307 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 20137208  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  20137207 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20137109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 9680911 - 9681099
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9680911 gttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaac 9681010  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 188  Q
     ||||||| | || ||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  9681011 tcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaact 9681099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37412325 - 37412134
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412325 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 37412226  T
Q  101 ccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactg 189  Q
     ||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||    
T  37412225 tcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactg 37412134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 443686 - 443885
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  443686 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaat 443785  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct-cccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  443786 ccattgatatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 443885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27832831 - 27832656
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27832831 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaac 27832732  T
Q  101 ccattgatttctctt-tgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca 174  Q
    |||||||| |||||| ||||| |  |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27832731 ccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtca 27832656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 11355349 - 11355547
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355349 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 11355448  T
Q  101 ccattgatttc-tctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| || | |||||||||   ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  11355449 tcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctcccctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 11355547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21592341 - 21592143
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21592341 gttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 21592242  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  21592241 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 21592143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 21990241 - 21990439
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21990241 gttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 21990340  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  21990341 tcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 21990439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 9679151 - 9679348
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679151 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 9679250  T
Q  102 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||  |||||||||  |||||| |||||||  |||||||  |||| ||||||||    
T  9679251 cattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaa 9679348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47263744 - 47263509
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| |  ||||| |||    
T  47263744 atagtggattggagagctgctctc--ccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtttcttat--ttcattgct 47263649  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  47263648 tatctttattc--tttgtttatgcttgtggtgttgctctacact-aga-ctaggtctatttttgtttttgttgcttggagacactttacacattgattac 47263553  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatt 375  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||    
T  47263552 cacttcctttgctccacgcatctttgtttttcattggtgtgatt 47263509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 134 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2479404 - 2479168
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||| |||    
T  2479404 atagtggatttgagagctgctctc-cccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtttctt--ctttcattgct 2479308  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| ||   ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  2479307 tatctttgttc--tttgtatatgcttgtggtgttgctctacact-aga-ctaggtctgtttttgttgttgttgcttagagacactttacacattgattac 2479212  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  2479211 cacttcctttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgatt 2479168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24813697 - 24813497
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813697 gttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtctcttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 24813598  T
Q  101 ccattgatttct-ctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    ||||| || ||| |||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||||    
T  24813597 ccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattatagtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaaca 24813498  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  24813497 a 24813497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 21680118 - 21680307
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21680118 gttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaac 21680217  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactg 189  Q
    ||| |||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  21680218 ccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactg 21680307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20091743 - 20091580
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20091743 gttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 20091644  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 165  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20091643 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtggaacggagggctgctctctcccccag 20091580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 28485657 - 28485854
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  28485657 gttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaat 28485756  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||  ||||| |||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  28485757 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctctct-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 28485854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 42223249 - 42223447
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  42223249 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaac 42223348  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    | |||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | |||||||  || || ||||||| ||||||||    
T  42223349 ctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaa 42223447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 375
Target Start/End: Original strand, 44848713 - 44848953
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||  ||||||||| |||    
T  44848713 atagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtatgttcc--ttctttcattgct 44848810  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg---tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgat 328  Q
    ||||||| ||   ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  44848811 tatctttgtt--ctttgtatatgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctgttttttttgttgttgttgcttggagacactttgcacattgat 44848906  T
Q  329 taccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatt 375  Q
    || |||| |||||| |||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  44848907 tagcactacctttgctccacacatccttgtttttcattggtgtgatt 44848953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 21678157 - 21678355
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21678157 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaac 21678256  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| | || ||||||| |  ||| ||||||||||| |   | |||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||| | ||||||    
T  21678257 ccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaa 21678355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24817552 - 24817362
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24817552 gttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 24817453  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaact 188  Q
     ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||    
T  24817452 tcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 26804663 - 26804765
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804663 gttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 26804762  T
Q  101 cca 103  Q
    |||    
T  26804763 cca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 25276232 - 25276347
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25276232 gttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaa 25276331  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
    |||||||| |||||||    
T  25276332 ccattgatatctcttt 25276347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39146185 - 39145986
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39146185 gttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 39146086  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  || |||||||||| | ||| | | |||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  39146085 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttccctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaa 39145986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18408827 - 18408613
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatc 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| | |||||||    
T  18408827 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc--tttctttctt-gcttatc 18408732  T
Q  236 tttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccact 335  Q
    ||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  18408731 ttgtttgctttgtatt-tgtttgtggtgttgctctacact-aga-ctacggctgtttttgttgttgttgcgtggagacactttacacatagattaccact 18408635  T
Q  336 tcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    ||| |||| |||||||||||||    
T  18408634 tccttttgctccacacatcttt 18408613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 133 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21639877 - 21639641
Alignment:
Q  133 tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt---ggtgtgtttgttccttttctttcatag 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||   |||||||||||||  || ||||| | |    
T  21639877 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc--ttcctttctt-g 21639782  T
Q  230 cttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    ||||||||  |||||||  ||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  21639781 cttatcttgtttgctttgtattctctt-gtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttactcatagatt 21639685  T
Q  330 accacttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtga 373  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| || | |||||||||||    
T  21639684 accactcccttttgctccacacatctttgtt-tacattgatgtga 21639641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 24258554 - 24258744
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24258554 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaac 24258653  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca----tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaa 186  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||||||||    
T  24258654 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaatttggaccgaa 24258744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18413707 - 18413506
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| | |||    
T  18413707 atagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc--tttctttctt-gct 18413613  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||  |||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||    
T  18413612 tatcttggttgctttgtatt-tgcttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattac 18413516  T
Q  332 cacttccttt 341  Q
    ||||||||||    
T  18413515 cacttccttt 18413506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22828815 - 22828716
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22828815 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 22828716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 381
Target Start/End: Original strand, 28617255 - 28617500
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||   || ||||| | ||||||    
T  28617255 tagtggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaatattggtgtgtttgttttcttcctttc-ttgcttat 28617353  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgc-tctacacttagatctaggtctgttt--ttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    |||| |||| ||||| |||| |||||||||||| | ||| || |||  ||||||| |||  ||||| ||||| ||||  |  | |||| |||||||||||    
T  28617354 ctttgttgc-tttgaatatgcttgtggtgttgcttttactctaagacttaggtctattttgttgttcttgtttcttgaggctactttactcattgattac 28617452  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||    
T  28617453 cacttcctttgctccacacatctttgt--ttgattaatgtgattttgtcc 28617500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351533
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25351448  T
Q  116 tgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  25351449 tgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 25351533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 7188630 - 7188796
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  7188630 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataac 7188729  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccag 165  Q
    |||||||| | || ||||||| |  | |||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||    
T  7188730 ccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctcttccccag 7188796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 275
Target Start/End: Original strand, 5817300 - 5817438
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  5817300 tagtggattggagagctgctctctcccc-agagtaggtcatattggaccgaactgagttaacaatctttggtgtgtttgttcc-tttcttacattgctta 5817397  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacact 275  Q
    || |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5817398 tcattattg-tgttgattatgcttgtggtgttgttctacact 5817438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2121057
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 97  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 2120979  T
Q  98 aacccattgatttctctttgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    ||| ||   || ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2120980 aactca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcat 2121057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320051
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 3320137  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  3320136 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 3320051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324799
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 3324885  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  3324884 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 3324799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405574
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 25405488  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  25405489 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 25405574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Original strand, 24465629 - 24465735
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||     
T  24465629 ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaact 24465728  T
Q  102 cattgat 108  Q
    |||||||    
T  24465729 cattgat 24465735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357227
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25357142  T
Q  116 tgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  25357143 tgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 25357227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21646074 - 21645855
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt---ggtgtgtttgttccttttctttcatagc 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||   |||||||||||||  || ||||| | ||    
T  21646074 atagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc--ttcctttctt-gc 21645979  T
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    |||||||  ||| |||  ||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  21645978 ttatcttgtttgttttgtattctctt-gtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttactcatagatta 21645882  T
Q  331 ccacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||    
T  21645881 ccactcccttttgctccacacatcttt 21645855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410312
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25410225  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  25410226 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 25410312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069961
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 7069875  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  7069876 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 7069961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 373
Target Start/End: Original strand, 1533477 - 1533709
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc---ttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||   |||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  1533477 tggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttattggtgtgtttgttc--tttctttc-ttgcttat 1533572  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
     ||  |||||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  1533573 attgtttgctttgtattctctttgtggtgttgctctacac-taga-ctggggctggttttgttgttgttgcttggaaacttttttctcattgattaccac 1533670  T
Q  335 t-tcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtga 373  Q
    | |  |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  1533671 tatattttgctccacacatctttgtt-ttcattggtgtga 1533709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22251723 - 22251641
Alignment:
Q  26 taggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251723 taggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 22251641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074957
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 7074882  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaac 187  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  7074883 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtcatcattagaccgaac 7074957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378504
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 8378591  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  8378590 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagttgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 8378504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15540996
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 15541082  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| || | || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  15541081 tgtaaagaaactcattcattatagtgtatcgtagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 15540996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006845
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || ||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctctt 42006758  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  | || ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  42006759 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgaagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaa 42006845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 6332311 - 6332511
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  6332311 ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaac 6332410  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    || || || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  6332411 cctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 6332510  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  6332511 a 6332511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297146
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 78  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 16297146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 198
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394012
Alignment:
Q  64 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||| || ||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  162 ccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    | ||| |||||||  ||||||| ||||| || |||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaa 22394012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 186
Target Start/End: Original strand, 6046641 - 6046772
Alignment:
Q  58 tgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  6046641 tgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctc 6046740  T
Q  156 tctcccccagattaggtca-tattggaccgaa 186  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6046741 tctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247128
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||  ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca---atatctctttgt 30247068  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30247069 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctatctcccccagactaggtcat 30247128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 199
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369825
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| |||||||   | ||||| |||| |||||| ||   || ||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctctt 21369737  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaat 199  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  21369738 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccgccatagtaggtcatcattggaccgaactgggtaaacaat 21369825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 22392552 - 22392606
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22392552 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22392606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 26295598 - 26295728
Alignment:
Q  61 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctct 158  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| |||||| |   || | |||||||||    
T  26295598 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctct 26295697  T
Q  159 cccccagattaggtcatattggaccgaactg 189  Q
    || ||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  26295698 cctccagactaggtcaatttggactgaactg 26295728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512526
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 44512609  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| ||||| |||  |||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  44512608 aaagaaactcatatcattataggggaacggagagctgctctct-ccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 44512526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 116
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6348988
Alignment:
Q  40 ttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 116  Q
    ||||| ||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttt 6348988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44010929 - 44010760
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||| ||| |||||||   ||||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  44010929 cactattaggattgagtctcttagtcatgagaagaggctgggac-ttgtgtaaaattaggtttggagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 44010834  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaact 188  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  44010833 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaact 44010760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 3047167 - 3047061
Alignment:
Q  288 tgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattc 387  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||||    
T  3047167 tgttattgttgttgttgcttgaggacactttactcattgattatcactttctttgctccacacatctttgtt-ttcattggtgtgattttgtccgaattc 3047069  T
Q  388 acgacaat 395  Q
    || |||||    
T  3047068 acaacaat 3047061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 11081598 - 11081800
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||| |||| ||| |||||||   | ||||| |||||||||||    
T  11081598 ttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaac 11081697  T
Q  101 cc--attgatttctctt-tgtaacgaaactcatc-atatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtc-atattggaccgaactgagtcaa 195  Q
    ||   ||||| |||||| ||||| |  |||||||  || | ||||  ||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  11081698 cctttttgatatctcttgtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaa 11081797  T
Q  196 caa 198  Q
    |||    
T  11081798 caa 11081800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Original strand, 30814560 - 30814637
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctt 232  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30814560 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaattttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgctt 30814637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281466
Alignment:
Q  5 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccca 103  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||| ||| ||||||||   | |||||||||||||||||||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  104 ttgattt 110  Q
    |||||||    
T  40281472 ttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | |||||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 262
Target Start/End: Original strand, 22270097 - 22270204
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa-tcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatctttattgcttttgatta 252  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  22270097 tctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatctcttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgtttatctttattgc-tttgatta 22270194  T
Q  253 tgtttgtggt 262  Q
    || |||||||    
T  22270195 tgattgtggt 22270204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 27347941 - 27348005
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27347941 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 27348005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143997
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546984
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 34546984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7464697 - 7464519
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||   | ||| | ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  7464697 cactattaggattgagtctctttgtcacggggagaggctgggac-ttgggta-aattaggtttgaagagtgattcttgtaactca---atatctctttgt 7464603  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  7464602 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 7464519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19992377 - 19992313
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  19992377 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 19992313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 24024347 - 24024411
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  24024347 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 24024411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41317478 - 41317417
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41317478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 41317417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2058029 - 2057966
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  2058029 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 2057966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4866794 - 4866731
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  4866794 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 4866731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 48489555 - 48489619
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  48489555 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtaaacaatctttggtgtgtttgttcct 48489619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210710
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 6048961 - 6049094
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||   || |||||||| ||||||||||   | |||| ||||||| |||    
T  6048961 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataa 6049060  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat 133  Q
    ||| ||||| || |||||||| |  |||||||||    
T  6049061 ccctttgatatccctttgtaaagttactcatcat 6049094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12097911 - 12097850
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  12097911 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 12097850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16880137 - 16880073
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  16880137 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 16880073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16884993 - 16884929
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  16884993 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 16884929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 24261344 - 24261408
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  24261344 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 24261408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 24266223 - 24266287
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  24266223 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 24266287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 31109604 - 31109668
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  31109604 tggattggagagctgctctctcccctagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 31109668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41649055 - 41648994
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41649055 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 41648994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12396975 - 12396912
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  12396975 tggattggagagctgttctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 12396912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14069877 - 14069817
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgt 213  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14069877 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgt 14069817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14379905 - 14379845
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgt 213  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14379905 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgt 14379845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 20357580 - 20357643
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  20357580 tggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 20357643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31733013 - 31732949
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31733013 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgagtttgttcct 31732949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 47676180 - 47676116
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  47676180 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgtttgttcct 47676116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 211
Target Start/End: Original strand, 8153466 - 8153524
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgttt 211  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8153466 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 8153524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 12310198 - 12310160
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12310198 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 12310160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 1113781 - 1113842
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1113781 tctctcccccatattaggtcaagtttgaccgaattgagtcaacaatctttggtgtgtttgtt 1113842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 21812259 - 21812323
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  21812259 tggattggaaagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 21812323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34546972 - 34546880
Alignment:
Q  110 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  34546972 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 34546880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36146452 - 36146391
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  36146452 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 36146391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6067373 - 6067198
Alignment:
Q  26 taggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt-aacga 123  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||| | ||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||| || |     
T  6067373 taggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagacttt-gatagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaagg 6067275  T
Q  124 aactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| ||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||| || |||||    
T  6067274 aactcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaa 6067198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 198
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759416
Alignment:
Q  146 agggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 11759416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12406395 - 12406332
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  12406395 tggattggagagctattctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 12406332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 18126768 - 18126832
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||||| |||||||  || |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18126768 tctctcccccagactaggtcaagtttgaccgacctgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 18126832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 217
Target Start/End: Original strand, 26417445 - 26417504
Alignment:
Q  160 ccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat--cttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26417445 ccccaggttaggtcaaattggaccaaactgggtcaacaatttcttggtgtgtttgttcct 26417504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 43864368 - 43864432
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat-cttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||    
T  43864368 tctctctcccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatagatggtgtgtttgttcct 43864432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2759241 - 2759183
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgttt 211  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  2759241 tctcttccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaatcattggtgtgttt 2759183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 44016840 - 44016685
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| ||| || |||||||||   | ||||  ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  44016840 cactattaggattgagtctcttagtcatgagaagaggctgggaattt-ggcagaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca---atatctctttgt 44016745  T
Q  119 aacgaaact--catca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    || ||||||  ||||| |||| ||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44016744 aaagaaactcacatcattataatggaacggcgagctgctctctcccccagactaggtcat 44016685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 47673982 - 47673924
Alignment:
Q  160 ccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||| |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  47673982 ccccatattaagtcaagttggaccgaactgaatcaacaatctttggtgtgtttgttcct 47673924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 198
Target Start/End: Original strand, 2075205 - 2075297
Alignment:
Q  110 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  2075205 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 2075297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24525546 - 24525485
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  24525546 tctctccccaagattaggtcaagttggacggaactgggtcaataatctttggtgtgtttgtt 24525485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38671262 - 38671205
Alignment:
Q  158 tcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||| | |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  38671262 tcccccaaaataggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 38671205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 380
Target Start/End: Original strand, 2647964 - 2648000
Alignment:
Q  344 tccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtc 380  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2647964 tccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtc 2648000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3047322 - 3047243
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctccccc-agattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||||   | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||    
T  3047322 tagtggattggataacggctctctccccccagagcaggtcatattggaccgaactgggt-tacgatcttggtgtgtttgtt 3047243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 4586285 - 4586349
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  4586285 tctctcccccatattatgtcaacttggaccgaactgggtcgacaatctttcgtgtgtttgttcct 4586349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 218)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 134 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 48438282 - 48438020
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  48438282 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaataatcttggtgtgtttgttccttt-ctgtcattgttta 48438184  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||    
T  48438183 tctttattg-ttttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagatactttatctattgattacca 48438085  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaatact 398  Q
     |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  48438084 tttcctttgctccacacatccttgttattcattgatgtgattttgtccgaattcacaacaatact 48438020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Original strand, 40592801 - 40593048
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40592801 atagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcattgctta 40592900  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40592901 tctatattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttatccattgattacca 40592999  T
Q  334 cttcctttgttccacacatct---ttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||||| |||||||||||   || |||||||||| |||||||||||    
T  40593000 cttcctttgctccacacatctttgttgttattcattggtgtgattttgt 40593048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4104091 - 4103894
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104091 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 4103992  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  4103991 ccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 4103894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 458345 - 458543
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458345 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 458444  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  458445 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaa 458543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6063642 - 6063444
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063642 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 6063543  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  6063542 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaa 6063444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5522822 - 5522625
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522822 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5522723  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  5522722 ccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5522625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 455968 - 456166
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455968 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 456067  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  456068 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaa 456166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28413228 - 28413042
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413228 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 28413129  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28413128 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 28413042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Original strand, 30709809 - 30710051
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30709809 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgct 30709907  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  30709908 tatctttgt-gcttt-gattatgcttatggtgttgctctaaacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattac 30710005  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30710006 cacttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgatttt 30710051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 50494060 - 50494258
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50494060 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaa 50494159  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  50494160 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 50494258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 1321540 - 1321738
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321540 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 1321639  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  1321640 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1321738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6065992 - 6065794
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6065992 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 6065893  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  6065892 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaa 6065794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Original strand, 8370505 - 8370747
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  8370505 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgct 8370603  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  8370604 tatctttgt-gcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattac 8370701  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    | ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8370702 ctcttcctttactccacacatctttatttttcattgatgtgatttt 8370747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10621726 - 10621528
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621726 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 10621627  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10621626 cccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaa 10621528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 43226146 - 43226344
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 43226245  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  43226246 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 43226344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 3859589 - 3859786
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859589 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 3859688  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  3859689 acattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3859786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7606783 - 7606586
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606783 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 7606684  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  7606683 acattgatttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 7606586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 134 - 397
Target Start/End: Original strand, 3716021 - 3716283
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  3716021 atagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctct-ctttcattgctta 3716119  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  3716120 tctttattg-ttgtgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttatgtctgtttttgttgttgttgcttgtagacactttatctattgattacca 3716218  T
Q  334 cttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaatac 397  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  3716219 cttccttttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtacaaattcacaacaatac 3716283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 746818 - 747016
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746818 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 746917  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  746918 cccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 747016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 38210431 - 38210629
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210431 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 38210530  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38210531 ctcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 38210629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 43228352 - 43228550
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43228352 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 43228451  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  43228452 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaa 43228550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 5191714 - 5191910
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5191714 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaac 5191813  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  5191814 ccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5191910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26299056 - 26298807
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||    
T  26299056 atagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tctctttcgttgctta 26298958  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt------ttgttgttgttgcttggagacattttattcattga 327  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  26298957 tctttattgc-tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgttgttgtttggagacactttatccattga 26298859  T
Q  328 ttaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26298858 ttaccacttcctttgatccacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 26298807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 135 - 382
Target Start/End: Original strand, 1417510 - 1417754
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  1417510 tagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tctctttcattgcttat 1417608  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||    
T  1417609 ctttattgc-tttgattatgcttgtgatgttactctacacttagatttatgtatg-ttttgttgttgttgcttgaagacactttatctattgattaccac 1417706  T
Q  335 ttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcca 382  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  1417707 ttcctttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgattttgtcca 1417754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4308477 - 4308279
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308477 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 4308378  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  4308377 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 4308279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 42990365 - 42990563
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990365 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 42990464  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  42990465 tcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 42990563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 40844719 - 40844476
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||    
T  40844719 atagtggatttgagggctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaatcttggtgtgttcgttcattt-ctttcattgctta 40844622  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  40844621 tctttattgcttt-gattatgcttgtagtgttgctctacacttagatttaggtttgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattacca 40844523  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    |||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  40844522 cttcttttactccacacatctttgttattcattg-tgtaattttgtcc 40844476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10084585 - 10084387
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10084585 gttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaac 10084486  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  10084485 ccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 10084387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18099366 - 18099168
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099366 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 18099267  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  18099266 ccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaa 18099168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 25533503 - 25533701
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533503 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 25533602  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  25533603 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaa 25533701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 38890101 - 38890299
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890101 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 38890200  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  38890201 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 38890299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 11170466 - 11170663
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170466 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 11170565  T
Q  102 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  11170566 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaa 11170663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 134 - 396
Target Start/End: Original strand, 6794732 - 6794991
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6794732 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgctta 6794830  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  6794831 tctctattgc-tttgattatgcttgtgatgctactctacacttagatttaggtctg-ttttgttgttgttgcttggagacactttttctattgattacca 6794928  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaata 396  Q
    ||||||||| |||||||||| || || ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||    
T  6794929 cttcctttgctccacacatcgttgtttttcattggtgtgattttgtccgaattcacaacaata 6794991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9604803 - 9604605
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604803 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 9604704  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||  ||||||||    
T  9604703 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaa 9604605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10956223 - 10956025
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956223 gttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 10956124  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  10956123 tcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 10956025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 25388967 - 25389164
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25388967 gttgattcaccttgg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaa 25389065  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  25389066 cccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 25389164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 30005902 - 30006100
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005902 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 30006001  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  30006002 tcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaa 30006100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 51727203 - 51727005
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727203 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 51727104  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  51727103 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 51727005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 45883000 - 45883199
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883000 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 45883099  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc-agattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  45883100 tcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 45883199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10958519 - 10958321
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958519 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 10958420  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  10958419 tcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 10958321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 53917860 - 53917662
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917860 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 53917761  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  53917760 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 53917662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886457
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtctttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5886457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899930
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  5899833 ccattgatttctctttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5899930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Original strand, 24695183 - 24695425
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||    
T  24695183 atagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttggtgtgtttgttcattt-ctttcattgttta 24695281  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  24695282 tctttattgcttt-gattatgcttgtg-tgttgctctatacttagatttagctctgtttttgttgttgttgcttgaagacattttatctattgattacca 24695379  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  24695380 cttcctttgctccacacatctttattattcatttgtgtgattttgt 24695425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16264418 - 16264174
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg--gtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| | |    
T  16264418 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttttgtgtgtttgttccttt-ctttcattgtt 16264320  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  16264319 tatctttgt-gcttt-gattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggattgtttttgttgttgtttcttggagacactttacacattgattac 16264222  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16264221 cacttctgttgctccacacgtctttgttattcattggtgtgattttgt 16264174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18097096 - 18096908
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097096 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 18096997  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 188  Q
    | ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||    
T  18096996 ctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaact 18096908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 1313470 - 1313668
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1313470 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaat 1313569  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  1313570 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1313668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 135 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 37466358 - 37466114
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  37466358 tagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatcttggtgtgtttgtt-catttctttcattgcttat 37466260  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||| || || ||  ||||||||| || || ||||||||||||     
T  37466259 ctttattgc-tttgattatgcttgtaatgttgctctacacttagattaatgtctgttttttttttttttttttggagacacttaatccattgattaccat 37466161  T
Q  335 ttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  37466160 ttcctttgctcctcacatctttgttatttattggtgtgattttgtcc 37466114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25688357 - 25688161
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688357 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 25688258  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgt-aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaa 195  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||  || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||    
T  25688257 ccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 25688161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36029161 - 36028932
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  36029161 atagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatctcggtgtgtttgttccttt-ctttcattgctta 36029063  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    |||||||             | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  36029062 tctttat-------------gcttgtggtgttgctctatacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattacca 36028976  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36028975 cttcatttgctccacacatctttgttattcattggtgtgatttt 36028932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21711291 - 21711064
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21711291 atagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgctta 21711193  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||    
T  21711192 tctctattgc-tttgattatgcctatggtgttgctctacatggtgatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctat---ttacca 21711097  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcatt 366  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21711096 cttcctttgctccacacatctttgttattcatt 21711064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168360
Alignment:
Q  4 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  104 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||  ||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaa 11168360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10191505 - 10191308
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10191505 gttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaac 10191407  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  10191406 ccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 10191308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22114501 - 22114303
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114501 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 22114402  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || || |||||| || ||||||||||| |  | || |  ||||||||||||| ||||||||    
T  22114401 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctctcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 22114303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27101377 - 27101179
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27101377 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 27101278  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  27101277 ccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaa 27101179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Original strand, 39040011 - 39040251
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  39040011 atagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgct 39040109  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| | ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  39040110 tatctttgt-gcttt-gtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctgtttt-gttgttgttgcttggagacactttacacattgattac 39040205  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  39040206 cacttcctttgttccacacatctttattatttattggtgtgatttt 39040251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 29956747 - 29956907
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956747 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 29956846  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 160  Q
     |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29956847 tcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 26720609 - 26720802
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26720609 gttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaac 26720707  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtca 194  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  26720708 cctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtca 26720802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 135 - 319
Target Start/End: Original strand, 3328376 - 3328558
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  3328376 tagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctct-ctttcattgcttat 3328474  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacatttta 319  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3328475 ctttattg-ttttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgtttcttggagacacttta 3328558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 134 - 293
Target Start/End: Original strand, 18552902 - 18553059
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||    
T  18552902 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtatttgttcc-tttctttcattgatta 18553000  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttt 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18553001 tctttattgc-tttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatttagttctgtttt 18553059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6484421 - 6484619
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6484421 gttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacgggaagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaac 6484520  T
Q  101 ccattgatttc-tctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6484521 ccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6484619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32264235 - 32264034
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32264235 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaac 32264136  T
Q  101 ccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    |||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||  ||||||    
T  32264135 ccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaaca 32264036  T
Q  198 at 199  Q
    ||    
T  32264035 at 32264034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 134 - 394
Target Start/End: Original strand, 33386685 - 33386943
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  | ||||||||| |||    
T  33386685 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttttggtgtgtttgtt--tcttctttcattgct 33386782  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  33386783 tatctttattg-ttttggttatacttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgatta 33386879  T
Q  331 ccacttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaa 394  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  33386880 ccacttccttttactccacacatctttgtt-tacattggtgtgagtttgtccggattcacaacaa 33386943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1626879 - 1626681
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1626879 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaac 1626780  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||||||||||  ||||||||    
T  1626779 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgcccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaa 1626681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 18162725 - 18162922
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18162725 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacc 18162824  T
Q  102 cattgat-ttctctttgt-aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||| ||   ||||| ||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  18162825 cattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaa 18162922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 43421611 - 43421413
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43421611 gttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaac 43421512  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  43421511 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 43421413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 43423659 - 43423461
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43423659 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaac 43423560  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  43423559 tcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccctgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 43423461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 53915692 - 53915494
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915692 gttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 53915593  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||| ||||||||    
T  53915592 ccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaa 53915494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 161 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35925524 - 35925309
Alignment:
Q  161 cccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatctttattgcttttgattatgtttg 258  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |   ||||||||||| |||    
T  35925524 cccaaattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc-ttttctttcattgctcatctttgtg--ttttgattatgcttg 35925428  T
Q  259 tggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgttccacacatctttct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| |    
T  35925427 tggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttacttggagacattttacacattgattaccacctgctttgctccacatatctttgt 35925328  T
Q  359 tattcattgatgtgatttt 377  Q
    | ||||||| |||| ||||    
T  35925327 ttttcattggtgtggtttt 35925309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32143389 - 32143170
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||  || ||||| | |||    
T  32143389 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc--ttcctttc-ttgct 32143293  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||    
T  32143292 tatctttattgctttgtatt-tgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattac 32143196  T
Q  332 cacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||    
T  32143195 cacttccttttgctccacacatcttt 32143170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 880647 - 880449
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  880647 gttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaac 880548  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  880547 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaa 880449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 3314745 - 3314944
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314745 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaac 3314844  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||    | |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  3314845 ccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3314944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5926960 - 5926762
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926960 gttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5926861  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| || | || ||||||| |  |||||||||||| || |  ||| | |||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  5926860 ccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5926762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 6561871 - 6562028
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6561871 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaat 6561970  T
Q  101 ccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctc 155  Q
    |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  6561971 ccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28102198 - 28102036
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102198 gttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 28102099  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 162  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  28102098 ccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctcccc 28102036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 51674962 - 51674764
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51674962 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaat 51674863  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  51674862 ccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctcccccataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 51674764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 51943432 - 51943629
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51943432 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaac 51943530  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  51943531 tcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 51943629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Original strand, 27986465 - 27986708
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||   ||||||| | |||    
T  27986465 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc--attctttc-ttgct 27986561  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||    
T  27986562 tatctttattgc-tttgtatatgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctatttttgttgttgttgcttgaagacactttacacatagattac 27986658  T
Q  332 cacttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||| || | ||||| ||||| |||||||    
T  27986659 cacttccttttgctccatacatctttgtt-tacattggtgtgagtttgtcc 27986708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6231862 - 6232059
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231862 gttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 6231960  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| || ||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6231961 ccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6232059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Original strand, 27974971 - 27975188
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  27974971 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc--ttctttcattgct 27975068  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| ||   |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||     
T  27975069 tatctttgtt--ctttatttatgcttgtggtgttgctctacac-tagat-taggtctg-ttttgctgttgttgcttggagacactttacacattgattat 27975163  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatcttt 356  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27975164 cacttcctttactccacatatcttt 27975188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 35918139 - 35917973
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  35918139 gttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaac 35918040  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccaga 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  35918039 ccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgctctctccctcaga 35917973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 36011888 - 36012086
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36011888 gttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaac 36011987  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||| |  |||| |||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  36011988 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttcttcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaa 36012086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 47149090 - 47148893
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149090 gttgattcaccttgg-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 47148992  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||  ||||||||    
T  47148991 ccattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaa 47148893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 889968 - 889780
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  889968 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga-gttggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaac 889870  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactg 189  Q
    ||| |||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||| |||| |||||||  |||||||||||||    
T  889869 ccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactg 889780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 53468651 - 53468451
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53468651 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacc 53468552  T
Q  102 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccag--attaggtcatattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||||||||  |||||||  | |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  53468551 cattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccccccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 53468452  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  53468451 a 53468451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 32219145 - 32219344
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  32219145 gttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaac 32219244  T
Q  101 ccattgatttc-tctttgt-aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| || | ||||| ||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| |||||| || | ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  32219245 ccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaa 32219344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 39715530 - 39715645
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39715530 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaac 39715629  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
    |||||||| |||||||    
T  39715630 ccattgatatctcttt 39715645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12268160 - 12267973
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268160 gttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 12268061  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
             ||| |||||||||  ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  12268060 ---------tct-tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaa 12267973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27026904 - 27026772
Alignment:
Q  245 tttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgtt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||| |    
T  27026904 tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttcttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccatttcatttgct 27026805  T
Q  345 ccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27026804 ccacacatctttgttattcattggtgtgatttt 27026772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28761625 - 28761425
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28761625 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 28761526  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtc-atattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||| || ||||    
T  28761525 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaaca 28761426  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  28761425 a 28761425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 31151406 - 31151579
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31151406 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaac 31151505  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactca-tcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca 174  Q
    ||  |||| |||| ||||||| |  ||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31151506 cc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 31151579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 13420382 - 13420267
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13420382 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 13420283  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
     ||||||| |||||||    
T  13420282 tcattgatatctcttt 13420267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15780932 - 15781138
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15780932 gttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 15781031  T
Q  101 ccattgat----ttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggc---tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgag 191  Q
    ||||||||    |||||||| |||| |  | | ||||| ||||||||  | |||||   |||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| |    
T  15781032 ccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactggg 15781131  T
Q  192 tcaacaa 198  Q
    |||||||    
T  15781132 tcaacaa 15781138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 24979768 - 24979967
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24979768 gttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 24979867  T
Q  101 ccattgatttc-tctttgt-aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
      ||| || || | ||||| ||||  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  24979868 aaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 24979967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 48361867 - 48361669
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  48361867 gttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaac 48361768  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||  |||| |||| ||||  |||||| |||||||  |  |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  48361767 tcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 48361669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Original strand, 1736324 - 1736447
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1736324 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatattggtgtgtttgttcc-tttctttcattgctta 1736422  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgt 259  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||    
T  1736423 tgtttattgc-tttgattatgcttgt 1736447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 222 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 8126682 - 8126516
Alignment:
Q  222 tttcatagcttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttatt 321  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  8126682 tttcattgcttatctttattgcttt-gattatgagtgtggtgttgctctacacttagatttaggtatgtttttgttgttgttggttggagacattgtatc 8126584  T
Q  322 cattgattaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcac 389  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||||||    
T  8126583 tattgaataccacttcctttgctccacacatctttgttatttattggtatgatattatccaaattcac 8126516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 53591245 - 53591443
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  53591245 gttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaat 53591344  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  | |||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||  |||||||||    
T  53591345 ccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctct-ccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaat 53591443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 135 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25795848 - 25795704
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  25795848 tagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt-catttctttcattgctta 25795750  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagat 280  Q
    | ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25795749 tttttattg-tttttattatgcttgtggtgttgctctacacttagat 25795704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Original strand, 23633528 - 23633677
Alignment:
Q  14 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  23633528 gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc 23633627  T
Q  114 tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 162  Q
    ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  23633628 tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctctcccc 23633677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 35777482 - 35777587
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777482 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 35777581  T
Q  100 cccatt 105  Q
    | ||||    
T  35777582 ctcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 4666575 - 4666773
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga--cttattcttgta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4666575 gttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgta 4666674  T
Q  99 acccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaac 196  Q
    | |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||||||||   ||||||| |||||||  |||||||||||||  |||||    
T  4666675 atccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaac 4666771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27038249 - 27038117
Alignment:
Q  245 tttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgtt 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||| |||| |    
T  27038249 tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctagatctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttacacattgattaccatttcatttgct 27038150  T
Q  345 ccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  27038149 ccacacatcttagttattcattggtgtgatttt 27038117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 36871497 - 36871307
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||    
T  36871497 ttgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaac 36871398  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactg 189  Q
    || ||| | ||||||||||| |  | |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36871397 cctttgttatctctttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactg 36871307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 256 - 376
Target Start/End: Original strand, 47924011 - 47924128
Alignment:
Q  256 ttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgttccacacatctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  47924011 ttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgt---tgttgcttggagacactttatccattgattaccacttcctttactccacacatctt 47924107  T
Q  356 tcttattcattgatgtgattt 376  Q
    | |||||||||| ||||||||    
T  47924108 tgttattcattggtgtgattt 47924128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1417232 - 1417089
Alignment:
Q  236 tttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccact 335  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  1417232 tttattgcttt-gattatgcttgtgatgctactctacacttagatttaggtctgtttt-gttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccact 1417135  T
Q  336 tcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1417134 tcctttactccacacatctttattattcattggtgtgattttgtcc 1417089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 17795319 - 17795494
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17795319 gttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 17795418  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca 174  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17795419 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtca 17795494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 19103759 - 19103934
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19103759 gttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 19103858  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca 174  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19103859 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtca 19103934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 561973 - 561783
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  561973 gttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaag 561874  T
Q  101 ccattgatttc-tctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc-ccagattaggtca-tattggaccgaac 187  Q
     ||||||| || | ||||||| |  |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||    
T  561873 tcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaac 561783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 108
Target Start/End: Original strand, 25635447 - 25635549
Alignment:
Q  6 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25635447 ttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccatt 25635546  T
Q  106 gat 108  Q
    |||    
T  25635547 gat 25635549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701669
Alignment:
Q  67 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  166 attaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||  ||||| |||||||  |||||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaa 47701669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 53597297 - 53597485
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  || || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53597297 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaac 53597396  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaa 186  Q
    || ||||| | || ||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||    
T  53597397 ccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctcccacaaactaggtcagtattggaccgaa 53597485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8477426 - 8477193
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa---tcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  8477426 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtgtttgttc--tttctttc-ttgcttat 8477331  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgctt-ggagacattttattcattgattacca 333  Q
    |||  |||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||    
T  8477330 cttgtttgctttgtattatctttgtggtgttgttctacac-tag-tctagggctggttttgttgttgttgcttgggaaactttttactctttgattacca 8477233  T
Q  334 ct-tcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtga 373  Q
    || || |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  8477232 ctatcttttgctccacacatctttgtt-ttcattggtgtga 8477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 23637084 - 23637199
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23637084 gttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 23637183  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
    |||||||| |||||||    
T  23637184 ccattgatatctcttt 23637199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913955
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 29914037  T
Q  119 aacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || ||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  29914036 aaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 29913955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1306015 - 1305798
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagctt 232  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  || ||||| | ||||    
T  1306015 tagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc--ttcctttctt-gctt 1305920  T
Q  233 atctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    |||||  |||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||    
T  1305919 atcttggttgctttgtatt-tgcttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattacc 1305823  T
Q  333 acttc-ctttgttccacacatcttt 356  Q
    |||||  |||| |||||||||||||    
T  1305822 acttctttttgctccacacatcttt 1305798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27635830 - 27635656
Alignment:
Q  13 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 112  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||            ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||    
T  27635830 tgggaaacaatattaagattgagtctcttggttacggg------------ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatct 27635743  T
Q  113 cttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  27635742 cttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27635656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 42992347 - 42992529
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||               |||||||||||||    
T  42992347 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagtgg-actttgggtag---------------ttattcttgtaac 42992430  T
Q  101 ccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  42992431 tcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 42992529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620446
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   | || ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || ||||| |||||||||||    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||  || |||||    
T  1620557 cctttgatatctctttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaacaa 1620458  T
Q  199 tcttggtgtgtt 210  Q
     ||| |||||||    
T  1620457 actttgtgtgtt 1620446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094075
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10094161  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  10094160 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 10094075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 306
Target Start/End: Original strand, 25929463 - 25929633
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttcct-tttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  | |||||| | |  ||||    
T  25929463 tagtggattggagggctgctctc-cccccagagtaggtcgtattggaccgaactgggttacca-tcttggtgtgtttgtttttctttcttgcttt-ctta 25929559  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt--ttgttgttgttgct 306  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  25929560 tctttgttgcttt-gattatgtttgtggtgttgctctacacttagatttaggtttgttttgttgttgttgttgct 25929633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Original strand, 1674034 - 1674140
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  1674034 ttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaacc 1674133  T
Q  102 cattgat 108  Q
    | |||||    
T  1674134 ctttgat 1674140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 28100237 - 28100143
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 95  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100237 gttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 54691770 - 54691608
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||      
T  54691770 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatt 54691671  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 162  Q
     ||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||  |  |||||||||||||||||||    
T  54691670 tcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctcccc 54691608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 274
Target Start/End: Original strand, 26928620 - 26928757
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  26928620 atagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc--tttctttc-tagct 26928715  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacac 274  Q
    |||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||    
T  26928716 tatctttattgctttgtatt-tgcttgtggtgttgctctacac 26928757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100092
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10100178  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  10100177 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 10100092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10200955
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10201041  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || || |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  10201040 tggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 10200955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 28181083 - 28181182
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181083 gttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897187
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 10897103  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  10897104 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 10897187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193408
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 54193324  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || ||||| |  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  54193325 aaagaaacccatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 54193408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 352
Target Start/End: Original strand, 4386950 - 4387166
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatct 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4386950 tggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatactgaactaaactgggtaaacaatctttgatgtgtttgttcc-tttctttcattgcttatct 4387048  T
Q  237 ttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtc---tgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    |||||| |||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||  ||||||   | ||||||||||||||||||   |  | |||| ||||||||||| |    
T  4387049 ttattg-ttttgattatgcatgtggcgttgttctacattaagacttaggtcttttttttttgttgttgttgcttatggctactttactcattgattacta 4387147  T
Q  334 cttcctttgttccacacat 352  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  4387148 ctttctttgctccacacat 4387166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27453026 - 27452915
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| | |||    
T  27453026 atagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttttggtgtgtttgttcc--ttctttc-ttgct 27452930  T
Q  232 tatctttattgcttt 246  Q
    |||||||||||||||    
T  27452929 tatctttattgcttt 27452915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208001
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10208087  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  10208086 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 10208001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 28137501 - 28137415
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagact 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137501 ttgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 290 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 47649655 - 47649565
Alignment:
Q  290 tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  47649655 tttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttccttttgttccacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 47649565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878171
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 47878255  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| || |||||    
T  47878254 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaa 47878171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22625984
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttgaaactcat---tatctctt 22626071  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  22626070 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 22625984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Original strand, 47923925 - 47924006
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttc 215  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47923925 atagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttc 47924006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303467
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtatagttaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 6303405  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6303406 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcat 6303467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3306937
Alignment:
Q  18 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||   |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttt 3306937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 54188512 - 54188690
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  54188512 cactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 54188607  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  54188608 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 54188690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858717
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  5858546 aaacactattaggattgagtct--tggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 5858639  T
Q  116 tgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactg 189  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  5858640 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactg 5858717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544454
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtggaac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 27544368  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  27544369 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccctcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 27544454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10612957 - 10612778
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||| |||| ||   || |||||||||    
T  10612957 cactattaagattgagtttcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctttgt 10612862  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  10612861 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 10612778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1309872 - 1309703
Alignment:
Q  184 gaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatc 281  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  || ||||| | |||||||||  |||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||| |    
T  1309872 gaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc--ttcctttctt-gcttatcttggttgctttgtatt-tgcttgtggtgttgctctacact-aga-c 1309779  T
Q  282 taggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1309778 tagggctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatcttt 1309703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 306 - 379
Target Start/End: Original strand, 3323752 - 3323825
Alignment:
Q  306 ttggagacattttattcattgattaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3323752 ttggagacactttatgcattgattaccacttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 3323825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079675
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  11079517 aaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggac-ttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 11079612  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11079613 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcat 11079675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 186
Target Start/End: Original strand, 24181498 - 24181629
Alignment:
Q  58 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctc 155  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||    
T  24181498 tgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctc 24181597  T
Q  156 tctcccccagattaggtca-tattggaccgaa 186  Q
    ||||| ||| | ||||||| | ||||||||||    
T  24181598 tctcctccaaactaggtcagttttggaccgaa 24181629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 268
Target Start/End: Original strand, 34491336 - 34491449
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatctttattgcttttgatta 252  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34491336 tctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt-catttctttcattgcttatctttattgc-tttgatta 34491433  T
Q  253 tgtttgtggtgttgct 268  Q
    || ||||||| |||||    
T  34491434 tgattgtggttttgct 34491449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 54884216 - 54884330
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  54884216 gttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaat 54884314  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
    | |||||| |||||||    
T  54884315 ctattgatatctcttt 54884330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595034
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||| |||| ||   || |||||||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctttgt 10595118  T
Q  119 aacgaaactca--tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || ||||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  10595117 aaagaaactcatgtcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 10595034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 381
Target Start/End: Original strand, 18554465 - 18554551
Alignment:
Q  295 gttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18554465 gttgttgttgtttggagatattttatctattaattaccactttctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtcc 18554551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949284
Alignment:
Q  21 actattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggaac-ttgggttgaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 10949343  T
Q  120 acgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    | |||||||  |||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10949342 aagaaactcatatcattataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcat 10949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 4560480 - 4560401
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 80  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  4560480 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634523
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  || |||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
    || ||||| |||||||    
T  14634538 cctttgatatctcttt 14634523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 198
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535797
Alignment:
Q  25 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||    
T  4535622 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgtaaaga 4535717  T
Q  124 aactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcc-cccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  4535718 aactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 4535797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27761986
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 27762070  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  ||||  | ||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  27762069 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagaaccgctctatcccccaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 27761986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 53894121 - 53894055
Alignment:
Q  132 atatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  53894121 atatattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 53894055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031439
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20031497 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 20031439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919113
Alignment:
Q  132 atatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 35919113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18656499 - 18656435
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  18656499 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 18656435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 38002869 - 38003051
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  38002869 aaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 38002964  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||   ||| | || |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  38002965 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagatgttctctccctcagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaa 38003051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Original strand, 41849245 - 41849318
Alignment:
Q  125 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  41849245 actcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 41849318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 2671619 - 2671682
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  2671619 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 2671682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7167308 - 7167245
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  7167308 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 7167245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 8739096 - 8739159
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  8739096 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 8739159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 9091334 - 9091397
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9091334 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 9091397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 22173216 - 22173279
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  22173216 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 22173279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 29813187 - 29813251
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29813187 tctctcccccagatttggtcatgttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcct 29813251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 40372828 - 40372891
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  40372828 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 40372891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 51398938 - 51399002
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  51398938 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 51399002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 24177337 - 24177380
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 44  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177337 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 214
Target Start/End: Original strand, 31314571 - 31314630
Alignment:
Q  156 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31314571 tctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgtt 31314630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32480407 - 32480341
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggt 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  32480407 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttggt 32480341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 2672952 - 2673052
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggt--gtgtttgttccttttctttcatagcttatc 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||  |||||| | |||||    
T  2672952 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatggtttatc 2673050  T
Q  236 tt 237  Q
    ||    
T  2673051 tt 2673052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 2677108 - 2677208
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggt--gtgtttgttccttttctttcatagcttatc 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||  |||||| | |||||    
T  2677108 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatggtttatc 2677206  T
Q  236 tt 237  Q
    ||    
T  2677207 tt 2677208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 3323710 - 3323756
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgga 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3323710 tagtggattggagggctgttctctctcccagattaggtcatattgga 3323756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9666531 - 9666449
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggct-gctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9666531 atagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 9666449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8512281 - 8512217
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  8512281 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 8512217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8517161 - 8517097
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  8517161 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 8517097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 55
Target Start/End: Original strand, 13419941 - 13419994
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  13419941 ttgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtctcttggtcacggaaagag 13419994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23391953 - 23391892
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23391953 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 23391892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29196430 - 29196369
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  29196430 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 29196369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32475549 - 32475485
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  32475549 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 32475485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32744476 - 32744419
Alignment:
Q  158 tcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  32744476 tcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 32744419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 203
Target Start/End: Original strand, 44331669 - 44331718
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44331669 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatcttg 44331718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 42
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768672
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 42  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 7768672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27452870 - 27452806
Alignment:
Q  293 ttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27452870 ttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatcttt 27452806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 28503897 - 28503960
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  28503897 tggattggagagctgctctcttccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 28503960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 40734622 - 40734686
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40734622 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggagtgtttgttcct 40734686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 40735507 - 40735571
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  40735507 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcagcaatctttggtgtatttgttcct 40735571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Original strand, 40913417 - 40913464
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatct 201  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  40913417 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatct 40913464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5236495 - 5236437
Alignment:
Q  160 ccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5236495 ccccagattaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 5236437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Original strand, 25633982 - 25634024
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 44  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25633982 ttgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 46966789 - 46966664
Alignment:
Q  59 gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||| ||||| ||    
T  46966789 gggactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccatttgatatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgccct 46966690  T
Q  157 ctcccccagattaggtc-atattggac 182  Q
    || ||||||| |||||| |||||||||    
T  46966689 ct-ccccagagtaggtcaatattggac 46966664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 31021341 - 31021300
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttg 42  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31021341 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15823763 - 15823659
Alignment:
Q  84 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtc-atattgga 181  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  | || ||||||||||| || ||| || ||| ||||||||    
T  15823763 agactaattcttgtaaccctttgacatctctttgtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaagagtaagtcaatattgga 15823664  T
Q  182 ccgaa 186  Q
    |||||    
T  15823663 ccgaa 15823659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 381
Target Start/End: Original strand, 25929635 - 25929687
Alignment:
Q  329 taccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||    
T  25929635 taccacttcctttattccacacatctttgttattagttgttgtgattttgtcc 25929687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39153405 - 39153357
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||    
T  39153405 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctt 39153357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 79
Target Start/End: Original strand, 3329896 - 3329954
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    ||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3329896 cactattaggattcagttagttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3329954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Original strand, 13893470 - 13893622
Alignment:
Q  25 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacga 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||| ||    
T  13893470 ttagaattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tcaatatctctttgtaaaga 13893567  T
Q  124 aactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    |||||  |||| |||||||||   ||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13893568 aactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagagtaggtcat 13893622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7167187 - 7167072
Alignment:
Q  257 tgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggaga-cattttattcattgattaccact-tcctttgttccacacatct 354  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||    
T  7167187 tgtggttttgctctacact-ag-tctagggctgtttt-gttgttgttgcttggaaaccattttgctcatagattaccactatctcttgctccacacatct 7167091  T
Q  355 ttcttattcattgatgtga 373  Q
    || || ||||||| |||||    
T  7167090 ttgtttttcattggtgtga 7167072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007633
Alignment:
Q  29 gattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 11007633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16996936
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  16996875 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattagg 16996936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 215
Target Start/End: Original strand, 29810992 - 29811054
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttc 215  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  29810992 tctctcccccagattaggtcaagttaaaccgaattgggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 29811054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 760971 - 761032
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||| || || ||||||| ||||||||||||||    
T  760971 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaaatgggttaacaatctttggtgtgtttgtt 761032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 379
Target Start/End: Original strand, 4387239 - 4387293
Alignment:
Q  323 attgattaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||    
T  4387239 attgattactacttcctttgctccacacatctttgt--ttcattgctgtgattttgt 4387293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 16499153 - 16499214
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  16499153 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtatttgtt 16499214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23410373 - 23410312
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  23410373 tctctcccccaaattaggtcaagttggaacgaattgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 23410312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29100127 - 29100026
Alignment:
Q  245 tttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagac-attttattcattgattaccacttcctttgt 343  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||  || ||||  |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||     
T  29100127 tttgaatatgtttgtggtgtttcttcacagttagatctatctcagttt--gttgttgttgcttg-agactattctactcattgattactacttcctttgc 29100031  T
Q  344 tccac 348  Q
    |||||    
T  29100030 tccac 29100026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 29682483 - 29682544
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  29682483 tctctcccctagattagatcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtatgtt 29682544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 199
Target Start/End: Original strand, 30236249 - 30236294
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat 199  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||    
T  30236249 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaat 30236294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 7606856 - 7606828
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattagg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606856 gttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 291 - 373
Target Start/End: Original strand, 28504040 - 28504124
Alignment:
Q  291 ttttgttgttgttgcttggaga-cattttattcattgattaccacttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtga 373  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||| |||| || |||| |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  28504040 ttttgttgttgttgcttggaaaccatttttctcatagattatcactaccttttgctccacacatcattgttattcattggtgtga 28504124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29100227 - 29100151
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtt 210  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||| | | | ||| || ||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  29100227 atagtggaatggagagctgctctcttccctatagtgggtaattttggaccgaactgggtaaacaatattggtgtgtt 29100151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 132)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Original strand, 4696625 - 4696877
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  4696625 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgtt-catttctttcattgctta 4696723  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttat------tc-attg 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      || ||||    
T  4696724 tctttattgc-tttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatttatgtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctagtatctattg 4696822  T
Q  327 attaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4696823 attaccacttcctttgttccacacatctttgttattcattgatgtgattttgtcc 4696877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 134 - 384
Target Start/End: Original strand, 5702512 - 5702760
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5702512 ataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctttcctt-catagctta 5702610  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5702611 tctctattgcttta-attatgcttgtggtgatgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgctaggagacactttattcattgattacca 5702709  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccaga 384  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5702710 cttcatttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtccaga 5702760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 43079739 - 43079937
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079739 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 43079838  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43079839 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43079937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 134 - 380
Target Start/End: Original strand, 9765848 - 9766093
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttccttttctttcatagctt 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  9765848 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcattggtgtgtttgttccctt-ctttcattgctt 9765946  T
Q  233 atctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |    
T  9765947 atctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtttgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattatc 9766045  T
Q  333 acttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtc 380  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9766046 acttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtc 9766093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 18810845 - 18811042
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810845 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 18810944  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  18810945 ccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaa 18811042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 27829434 - 27829631
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829434 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 27829533  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  27829534 ccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27829631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 43082110 - 43082308
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43082110 gttgattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaa 43082209  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43082210 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43082308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 18813019 - 18813216
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813019 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 18813118  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  18813119 ccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 18813216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Original strand, 26403259 - 26403505
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  26403259 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctcgt-tttcattgctta 26403357  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  26403358 tctttattgc-tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttattgcttggagacacattatctattgattacca 26403456  T
Q  334 cttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  26403457 cttccttttgctccacacatctttgttattcattggtgtggttttgtcc 26403505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 3874147 - 3874345
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874147 gttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 3874246  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  3874247 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3874345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 44720980 - 44721178
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720980 gttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 44721079  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  44721080 cccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 44721178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 27827123 - 27827320
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827123 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 27827222  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  27827223 ccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27827320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24873379 - 24873181
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873379 gttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 24873280  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24873279 ccgattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaa 24873181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22684854 - 22684653
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684854 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 22684755  T
Q  101 cc---attgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaac 196  Q
    ||   |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  22684754 ccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 22684655  T
Q  197 aa 198  Q
    ||    
T  22684654 aa 22684653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 608871 - 609069
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608871 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 608970  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  608971 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 609069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28251765 - 28251567
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28251765 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataac 28251666  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  28251665 ccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 28251567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 43530252 - 43530450
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43530252 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaac 43530351  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  43530352 ccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgtctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 43530450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 32339446 - 32339644
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339446 gttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 32339545  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  32339546 ccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaa 32339644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 14807888 - 14808051
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807888 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 14807987  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14807988 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 14808051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15809355 - 15809553
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809355 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 15809454  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  15809455 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 15809553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Original strand, 23799606 - 23799849
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23799606 atagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgctta 23799704  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| |    
T  23799705 tctctattgc-tttgattatgtttgtggtacttctctacacttagatctaggtctattttttgttgttgtttcttggagacactttatctattgattaac 23799803  T
Q  333 acttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||    
T  23799804 actttctttgctccacacatattt-tttttcattggtgtgattttgt 23799849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28283417 - 28283221
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  28283417 gttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaac 28283318  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  28283317 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 28283221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 135 - 377
Target Start/End: Original strand, 19752424 - 19752665
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  19752424 tagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tctctttcattacttat 19752522  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  19752523 ctctattgc-tttgattatgcttgtggtgttgcactacacttagatttaggtctg-ttttgttgttgttgcttggagacactttatatattgattaccac 19752620  T
Q  335 ttcc-tttgttccacacatcttt-cttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||| |||| |||||||||||||  || ||||||| |||||||||    
T  19752621 ttccttttgctccacacatctttgttttttcattggtgtgatttt 19752665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 4424155 - 4424353
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424155 gttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaac 4424254  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  4424255 ccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 4424353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30480701 - 30480503
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480701 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 30480602  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  30480601 ccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 30480503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6127289 - 6127043
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat-cttggtgtgtttgttccttttctttcatagctt 232  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | | |||||||| ||||    
T  6127289 atagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatatttgatgtgtttgtt-catctctttcattgctt 6127191  T
Q  233 atctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  6127190 atctttagtgc-tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttaaatttatatctgttttttgttgttgttgcttggagacacttaatctattgattac 6127092  T
Q  332 cacttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6127091 cacttccttttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 6127043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15072847 - 15073046
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15072847 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaa 15072946  T
Q  100 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  15072947 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 15073046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4456096 - 4455855
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  4456096 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtcagcaatcttttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgct 4455998  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  4455997 tatctttgt-gcttt-gtttatgcttgttgtgttgctctacactaag-tccaggtctgtttttgctgttgttgcttggagacactttacacattgattac 4455901  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  4455900 cacttcctttgctccacacatctttgatattcattggtgtgatttt 4455855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Original strand, 15068122 - 15068316
Alignment:
Q  5 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15068122 attcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 15068221  T
Q  105 tgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| | ||||||    
T  15068222 tgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaa 15068316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Original strand, 19175783 - 19176027
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19175783 atagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttttgtgtgtttgttcc-tttctttcattgct 19175881  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacatttt----attcattga 327  Q
    |||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    ||| |||||    
T  19175882 tatcttt-gtgc-tttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctg-ctttgttgttgttgcttggagacactttacacattaattga 19175977  T
Q  328 ttaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19175978 ttaccacttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgatttt 19176027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27107095 - 27106897
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107095 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 27106996  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||| ||| |||| ||||||  |  ||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  27106995 ccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcctccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaa 27106897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14419389 - 14419190
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419389 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 14419290  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| || | || ||||||| |  |||||||| ||||||| |   || ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  14419289 ccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 14419190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 27911151 - 27911345
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27911151 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaac 27911250  T
Q  101 ccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaa 195  Q
     ||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||| |||||    
T  27911251 tcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaa 27911345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 27957570 - 27957764
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27957570 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaac 27957669  T
Q  101 ccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaa 195  Q
     ||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||| |||||    
T  27957670 tcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaa 27957764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 1225303 - 1225502
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1225303 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaac 1225402  T
Q  101 ccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     |||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||| || | |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  1225403 tcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 1225502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15956094 - 15956293
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15956094 gttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 15956193  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  15956194 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtttctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaa 15956293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 41384881 - 41385079
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  41384881 gttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaac 41384980  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  41384981 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 41385079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Original strand, 31071258 - 31071478
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc---ttggtgtgtttgttccttttctttcatagc 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||  || ||||| | ||    
T  31071258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc--ttcctttc-ttgc 31071354  T
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    |||||||  |||||||  ||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||    
T  31071355 ttatcttggttgctttgtatt-tgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagatta 31071451  T
Q  331 ccacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||    
T  31071452 ccacttccttttgctccacacatcttt 31071478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 31162346 - 31162548
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31162346 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaac 31162445  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct--cccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaa 195  Q
     ||||||| |||| |||||||    |||||||| |||||||||   ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  31162446 tcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaa 31162545  T
Q  196 caa 198  Q
    |||    
T  31162546 caa 31162548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 21480639 - 21480829
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21480639 gttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaac 21480738  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactg 189  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||    
T  21480739 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactg 21480829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7412409 - 7412166
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa---tcttggtgtgtttgttccttttctttcatagc 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  7412409 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttcatggtgtgtttgttcc--ttctttcattgc 7412312  T
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-----tttttgttgttgttgcttggagacattttattcatt 325  Q
    |||||||| ||   ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||     ||||| || || ||||||||||||| ||||  ||||    
T  7412311 ttatctttgtt--ctttgtatatgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctgtttttttttttttttttttgcttggagacactttacacatt 7412216  T
Q  326 gattaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatt 375  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  7412215 cattaccacttcctttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgatt 7412166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 41382820 - 41382997
Alignment:
Q  22 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaa 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  41382820 ctattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaa 41382919  T
Q  121 cgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||  ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  41382920 cgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 41382997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3005829 - 3005630
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3005829 ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatc 3005730  T
Q  102 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||| |||| ||||||| |   ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| || |||||    
T  3005729 cattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaa 3005630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13858682 - 13858484
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  13858682 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagc 13858583  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| || |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| || |||||    
T  13858582 ccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaa 13858484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 21482447 - 21482646
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21482447 gttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaac 21482546  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||  | |  ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  21482547 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaa 21482646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5372372 - 5372179
Alignment:
Q  5 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5372372 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcat 5372273  T
Q  105 tgatttc-tctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct-cccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaa 195  Q
    |||| || | ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||| | |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  5372272 tgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaa 5372179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 14477413 - 14477520
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14477413 gttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaat 14477512  T
Q  101 ccattgat 108  Q
    ||||||||    
T  14477513 ccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 25952657 - 25952856
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25952657 gttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaac 25952756  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| |||| |||||||    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||  ||||||||    
T  25952757 tcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaa 25952856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 36865675 - 36865872
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865675 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttc---acgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 36865771  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccc-agattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    ||||| || |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| || ||||    
T  36865772 ccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 36865871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26287969 - 26287750
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt---ggtgtgtttgttccttttctttcatagc 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||   |||||||||||||  || ||||| | ||    
T  26287969 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc--ttcctttctt-gc 26287874  T
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    |||||||  |||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||    
T  26287873 ttatcttggttgctttgtatt-tgcttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagatta 26287777  T
Q  331 ccacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||    
T  26287776 ccacttccttttgctccacacatcttt 26287750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26313220 - 26313001
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt---ggtgtgtttgttccttttctttcatagc 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||   |||||||||||||  || ||||| | ||    
T  26313220 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc--ttcctttctt-gc 26313125  T
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    |||||||  |||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||    
T  26313124 ttatcttggttgctttgtatt-tgcttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagatta 26313028  T
Q  331 ccacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||    
T  26313027 ccacttccttttgctccacacatcttt 26313001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 181636 - 181772
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactatt-aggattgagtctcttggttacg--ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  181636 gttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgt 181735  T
Q  98 aacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  181736 aacccattgatatctctttgtaaagttactcatcata 181772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 31035254 - 31035456
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  31035254 gttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 31035353  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccaga--ttaggtca-tattggaccgaactgagtcaa 195  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  31035354 ccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggtaaa 31035453  T
Q  196 caa 198  Q
    |||    
T  31035454 caa 31035456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6813747 - 6813487
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatct 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  6813747 tggattggagagctgctctctcccctagtgtaggttatattggaccgaactgggttaacaatctttggtatgtttgttcc-tttctttcatttcttatct 6813649  T
Q  237 ttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt--ttgttgttgttgct--tggagac-attttattcattgattac 331  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||  || |||| |||  |||||||||||| |  | ||||| ||||| | ||||||||||    
T  6813648 ttattgc-tttgattatgcttgtgatgttgttctacactaagacttaagtctattttgttgttgttgttgttgattgagactattttgtccattgattac 6813550  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaat 395  Q
    ||||  ||||| || |||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||    
T  6813549 cactcactttgctcaacacatctttgtt-ttcattggtgtgattttgtccgaattcacaacaat 6813487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 373
Target Start/End: Original strand, 1261983 - 1262217
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt---ggtgtgtttgttccttttctttcatagc 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||   |||||||||||||  || ||||| || |    
T  1261983 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggtt-gaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc--ttcctttc-tatc 1262078  T
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    |||||||  |||||| | ||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  1262079 ttatcttgtttgcttgt-attctctt-gtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttactcatagatta 1262174  T
Q  331 ccacttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtga 373  Q
    ||||| || |||  ||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  1262175 ccactcccttttactccacacatctttgtt-ttcattggtgtga 1262217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757268
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 16757354  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  16757353 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 16757268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578276
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    |  ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  31578276 a 31578276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328089
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 28328003  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  28328004 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 28328089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021107
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 9021194  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  9021193 tgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 9021107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15185908 - 15185714
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct--tggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 98  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15185908 gttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagaga-------tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgta 15185816  T
Q  99 acccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaac 196  Q
    |||||||||| |||| ||| ||| |  |||||||| ||||||| |  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  15185815 acccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 15185716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895684
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| || ||   || ||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctt 28895597  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  28895598 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcctctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 28895684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812488
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 4812574  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  4812573 tgtaaagaaaatcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaa 4812488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752524
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 16752609  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  16752608 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 16752524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332812
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 28332726  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  28332727 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 28332812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 33541586 - 33541507
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 80  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  33541586 gttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggc 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 380
Target Start/End: Original strand, 5990596 - 5990830
Alignment:
Q  141 attggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttcctt-ttctttcatagcttatcttta 239  Q
    ||||||| || ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||  || | |||||||| |||| |||||  |  ||||| | | ||||||||||     
T  5990596 attggagagccgctctctcccccacaatatgtcatattggaccaaactt-gttaccaatcttgttgtgcttgtttttcattcttgctt-gcttatctttg 5990693  T
Q  240 ttgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcct 339  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||  |  | ||||| |||||||||| |||||||    
T  5990694 ttgcttttgaatatgcttgtggttttgttctacacttagatttaggtc--tatttgttgttgttgcttgatgctactttatccattgattactacttcct 5990791  T
Q  340 ttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtc 380  Q
    ||| ||| ||||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  5990792 ttgctccgcacatctttgt--tttattgatgtgattttgtc 5990830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554809
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |   | | ||||||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattatgtttgaatacttattcttggaactca---atatctctttgt 29554869  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    || |||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29554868 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcat 29554809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032812
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 33032752  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    || |||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||||||    
T  33032753 aaagaaactcatatcattatagtggaatggagagctgctctctctcctagactaggtcat 33032812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 31573924 - 31573847
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  31573924 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 31573847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 379
Target Start/End: Original strand, 9054867 - 9055106
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttg-ttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||| || |  |||||||||  ||||    
T  9054867 tagtggattagagagctgctctctcctccagagtaggtcatattggactgaacagagtaaataatattggtgtgtttgattgc--ttctttcatgactta 9054964  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagac-attttattcattgattacc 332  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||| || |||  || ||||  |||||||||||||  || ||||| | ||||| |||||||||      
T  9054965 tctttattgc-tttgattatacttgtggtgttattctacgctaagacttatgtct-attttgttgttgtt-ttttgagactactttatccattgattagt 9055061  T
Q  333 acttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    |||||||||  |||||||||| || |  |||||||||||||||||||    
T  9055062 acttcctttactccacacatcattgt--ttcattgatgtgattttgt 9055106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 25684646 - 25684824
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||||||    
T  25684646 cactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacagggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctttgt 25684741  T
Q  119 aacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  25684742 aaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 25684824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36979441 - 36979205
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt---ggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||   ||||| |||||||  || ||||| | ||||||    
T  36979441 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttc--ttcctttctt-gcttat 36979347  T
Q  235 ctt-tattgcttttgattatgtttgtg--gtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggaga-cattttattcattgatta 330  Q
    ||| | ||||||| |  | | ||||||  || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  36979346 cttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacact-ag-tctagggctgtttttgttgttgttgcttggaaaccattttgttcattgatta 36979249  T
Q  331 ccact-tcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtga 373  Q
    ||||| ||  ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  36979248 ccactatctcttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga 36979205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590967
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctttgt 590892  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactg 189  Q
    || |||||||  |||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  590893 aaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgttctctcccccagactaggacatcattagaccgaactg 590967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847846
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg--gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 98  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  99 acccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactg 189  Q
    | || ||||| |||| |||||    ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  17847761 a-cctttgatatctcttttgt----aaaatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccaaactg 17847846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468139
Alignment:
Q  70 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagat 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  168 taggtcatattggaccgaact 188  Q
    |||||||  |||||| |||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaact 2468139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23179740 - 23179561
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  23179740 cactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg-taaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 23179645  T
Q  119 aacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||||  ||| ||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  23179644 aaagaaactcatatcattatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 23179561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799424
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||   | ||||| |||||| |||| ||   || ||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgagtataattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctt 17799511  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  17799510 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 17799424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26301226 - 26301143
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc---ttggtgtgtttgttc 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  26301226 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 26301143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 130
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276454
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atgtctctttgt 3276442  T
Q  119 aacgaaactcat 130  Q
    || |||||||||    
T  3276443 aaagaaactcat 3276454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376325
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||  |||||||||||   | ||||| |||||||| |||  ||||| ||||||    
T  6376141 aaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctctt 6376240  T
Q  116 tgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |  |||||||| |||||||||   || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  6376241 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaa 6376325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 15212910 - 15212974
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15212910 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 15212974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 356
Target Start/End: Original strand, 33037839 - 33038059
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa---tcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||   ||||||||| |||||||   ||||||  | ||||||    
T  33037839 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttc---ttcttttcttgcttat 33037933  T
Q  235 ctt-tattgcttttgattatgtt--tgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt-ttgttgttgttgcttggaga-cattttattcattgatt 329  Q
    ||| | ||||||| |  | | ||  |||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  33037934 cttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacac-tag-tctagggctgtttattgttgttgttgcttggaaaccattttgttcattgatt 33038031  T
Q  330 accact-tcctttgttccacacatcttt 356  Q
    |||||| ||  ||| |||||||||||||    
T  33038032 accactatctcttgctccacacatcttt 33038059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 373
Target Start/End: Original strand, 4760229 - 4760345
Alignment:
Q  257 tgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggaga-cattttattcattgattaccact-tcctttgttccacacatct 354  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| ||  | | |||||||||||    
T  4760229 tgtggttttgctctacact-ag-tctagggctgtttttgttgttgttgcttggaaaccattttgctcattgattaccactatctctagctccacacatct 4760326  T
Q  355 ttcttattcattgatgtga 373  Q
    || || |||||||||||||    
T  4760327 ttgtttttcattgatgtga 4760345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985176
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 217
Target Start/End: Original strand, 4733809 - 4733894
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggct-gctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  4733809 atagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacagtctttggtgtgtttgttcct 4733894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 18853196 - 18853264
Alignment:
Q  133 tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  18853196 tatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 18853264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 18870590 - 18870658
Alignment:
Q  133 tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  18870590 tatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgga-tgaactgggtcaacaatctt 18870658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 39784843 - 39784907
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  39784843 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 39784907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6311361 - 6311298
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  6311361 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 6311298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 7289947 - 7290010
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  7289947 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 7290010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 10689176 - 10689239
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  10689176 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 10689239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 25328299 - 25328362
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  25328299 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 25328362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28307628 - 28307552
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgttt 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  28307628 tagtggattggagagctgctctcatccccagagtaggtcattttggaccgaactgggttaccaatcttggcgtgttt 28307552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 33352274 - 33352338
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  33352274 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcct 33352338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 43036547 - 43036611
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  43036547 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 43036611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 2468304 - 2468261
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468304 gttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 216
Target Start/End: Original strand, 27811402 - 27811465
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcc 216  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27811402 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttttttcc 27811465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30655708 - 30655647
Alignment:
Q  140 gattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  30655708 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 30655647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35745455 - 35745355
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggt--gtgtttgttccttttctttcatagcttatc 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||| || | |||||    
T  35745455 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcttttccttttatcgtttatc 35745357  T
Q  236 tt 237  Q
    ||    
T  35745356 tt 35745355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 217
Target Start/End: Original strand, 4731761 - 4731846
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggct-gctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4731761 atagtggattggagagatcgatctctcccccagattcggtcaagttggaccgaattgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 4731846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 10684285 - 10684349
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  10684285 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 10684349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19491741 - 19491673
Alignment:
Q  156 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca--atcttggtgtgtttgttccttttct 222  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  19491741 tctcccccatagtaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgtttcttttct 19491673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 21033870 - 21034051
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  21033870 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag-ggctgggac-ttgggtagaaataggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctt 21033964  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  ||||  ||||||| | ||||| | |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  21033965 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagatctgctcttttccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 21034051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 198
Target Start/End: Original strand, 28890855 - 28890947
Alignment:
Q  110 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  28890855 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 28890947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 40321204 - 40321265
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  40321204 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtt 40321265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 4760108 - 4760171
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  4760108 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 4760171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 30143464 - 30143528
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30143464 tctctcccccagataaggtcaagttgaactgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 30143528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 37214369 - 37214317
Alignment:
Q  30 attgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  37214369 attgagtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30655585 - 30655469
Alignment:
Q  257 tgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttttt-gttgttgttgcttggaga-cattttattcattgattaccact-tcctttgttccacacatc 353  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  30655585 tgtggttttgctctacact-ag-tctagggctgttttttgttgttgttgcttggaaaccattttgttcattgattaccactatctcttgctccacacatc 30655488  T
Q  354 tttcttattcattgatgtga 373  Q
    ||| || ||||||| |||||    
T  30655487 tttgtt-ttcattggtgtga 30655469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 5622936 - 5622882
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 55  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5622936 gttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagag 5622882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 211
Target Start/End: Original strand, 6599096 - 6599154
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgttt 211  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6599096 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 6599154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 211
Target Start/End: Original strand, 6674549 - 6674607
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgttt 211  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6674549 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 6674607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985933
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattag 78  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423274
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33541483 - 33541413
Alignment:
Q  125 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaa 195  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || |||||    
T  33541483 actcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaa 33541413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4743258 - 4743197
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4743258 tctctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 4743197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 5689395 - 5689456
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  5689395 tctctcccccagatttggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtt 5689456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10930243 - 10930198
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat 199  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  10930243 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaat 10930198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12702678 - 12702617
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12702678 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtatgtttgtt 12702617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 7493210 - 7493314
Alignment:
Q  256 ttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt-ttgttgttgttgct-----tggagac-attttattcattgattaccacttcctttgttccac 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||     | ||||| | ||||  |||||||||| |||||||||| |||||    
T  7493210 ttgtggtgttgctctacacttagatttagatctatttgttgttgttgttgctgctgcttgagactactttacacattgattactacttcctttgctccac 7493309  T
Q  349 acatc 353  Q
    |||||    
T  7493310 acatc 7493314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872477
Alignment:
Q  86 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 161  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 35872477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 202
Target Start/End: Original strand, 40221869 - 40221917
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40221869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaataatctt 40221917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26301070 - 26301011
Alignment:
Q  282 taggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttccttt 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  26301070 tagggctgtttttgttgttgttgcttgttgacactttacacatagattaccacttccttt 26301011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839077
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 44  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt 33839077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 3895957 - 3896035
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||| |||||||    
T  3895957 ttgattcactttggagaaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattagg 3896035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 36
Target Start/End: Original strand, 31035204 - 31035238
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 36  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035204 ttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37214314 - 37214264
Alignment:
Q  148 ggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  37214314 ggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 37214264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1345415 - 1345354
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||||| |||||||  || |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  1345415 tctctcccccagagtaggtcaagttagaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 1345354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3303714 - 3303653
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  3303714 tctctcccccacagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacaatctttggtgtgtttgtt 3303653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 11701155 - 11701102
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 54  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11701155 ttgattcaccttgaagaaacattattagaattgagtctcttggtcacgggaaga 11701102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Original strand, 14808051 - 14808096
Alignment:
Q  153 ctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  14808051 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 14808096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 41
Target Start/End: Original strand, 26775342 - 26775378
Alignment:
Q  5 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 41  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26775342 attcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 123)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Original strand, 10077194 - 10077439
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10077194 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgctta 10077292  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  10077293 tctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattacca 10077391  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||||| ||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||    
T  10077392 cttcctttgctccacacatcttcgctattcattagtgtgattttgtcc 10077439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18232913 - 18232670
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  18232913 atagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgatttgagtcaacaatcttggtgtgtttgttcctct-ctttcatcgctta 18232815  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18232814 tctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtttgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattacca 18232716  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18232715 cttcctttgcttcacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 18232670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5273414 - 5273216
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273414 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5273315  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  5273314 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5273216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11983227 - 11983029
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983227 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 11983128  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  11983127 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 11983029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 31979580 - 31979336
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  31979580 tagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctcta-tttcattgcttat 31979482  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||    
T  31979481 ctttattgcttt-gattatgcttgtgatgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttatctattgattaccac 31979383  T
Q  335 ttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||    
T  31979382 ttcctttgctccacacatctttgttatttagtggtgtgattttgtcc 31979336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14507373 - 14507176
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14507373 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 14507274  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  14507273 ccattgatttctctttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 14507176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4816429 - 4816231
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816429 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 4816330  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  4816329 ccattgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 4816231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12195713 - 12195515
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12195713 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaa 12195614  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12195613 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26932760 - 26932562
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932760 gttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26932661  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26932660 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 26932562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 134 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22963767 - 22963550
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22963767 atagtggattggagggctgctctctcccc-agatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcatagctta 22963670  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttttt-gttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22963669 tctctattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttattaattgattacc 22963571  T
Q  333 acttcctttgttccacacatc 353  Q
    |||||||| | ||||||||||    
T  22963570 acttccttagctccacacatc 22963550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 134 - 353
Target Start/End: Original strand, 23824626 - 23824843
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23824626 atagtggattggagggctgctctctcccc-agatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tttctttcatagctta 23824723  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23824724 tctctattgc-tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttattaattgattacc 23824822  T
Q  333 acttcctttgttccacacatc 353  Q
    |||||||| | ||||||||||    
T  23824823 acttccttagctccacacatc 23824843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20915554 - 20915356
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915554 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 20915455  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  20915454 cccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20915356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14458956 - 14458767
Alignment:
Q  10 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458956 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 14458857  T
Q  110 tctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  14458856 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 14458767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19704767 - 19704567
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704767 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 19704668  T
Q  100 cccattgattt--ctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  19704667 cccattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 19704568  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  19704567 a 19704567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26065099 - 26065295
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065099 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 26065198  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  26065199 ccattgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 26065295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26085068 - 26085264
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085068 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 26085167  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  26085168 ccattgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 26085264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Original strand, 5017498 - 5017742
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5017498 atagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgctta 5017596  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg----tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5017597 tcttt-gtgc-tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttttttttttttgttgttgcttggagacactttatccattgatt 5017694  T
Q  330 accacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  5017695 accacttcctttgctccacacatctttgttattcattagtgtgatttt 5017742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28241519 - 28241321
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28241519 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaac 28241420  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  28241419 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaa 28241321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1230447 - 1230249
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230447 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 1230348  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  1230347 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1230249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30034801 - 30034603
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034801 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 30034702  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  30034701 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctctctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 30034603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 30967317 - 30967515
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30967317 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 30967416  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  30967417 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 30967515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2629083 - 2628886
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||    
T  2629083 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaac 2628984  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||    
T  2628983 ccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaa 2628886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 135 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31936654 - 31936414
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  31936654 tagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tatctttcattgcttat 31936556  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  31936555 ctttattgc-tttgtttatgcttgtggtgttgctctacactttgattaaggtctg-ttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccac 31936458  T
Q  335 ttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  31936457 ttccttttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgatttt 31936414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 134 - 375
Target Start/End: Original strand, 5757507 - 5757744
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  5757507 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctt--ctttcattgct 5757604  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| ||   |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  5757605 tatctttgttc--tttgtttatgcttgtggtgttgctctacact-agat-taggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattac 5757700  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatt 375  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  5757701 cacttcctttgctccacacttctttgtttttcattggtgtgatt 5757744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309170
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 33309170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 135 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 4630021 - 4629784
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4630021 tagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctttgatgtgtttgttcc-tttctttcattgctta 4629923  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||         |||||||||||||||  |||||||||||    
T  4629922 tctttattgc-tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgt---------ttggagacattttatctattgattacca 4629833  T
Q  334 cttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4629832 cttccttttactccacacatctttattattcattggtgtgattttgtcc 4629784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754709
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 29754709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311439
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 33311439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066124
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26066208  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 26066124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 9020042 - 9020240
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020042 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 9020141  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  9020142 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 9020240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 134 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21356104 - 21355867
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||| |||    
T  21356104 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtttctt--ctttcattgct 21356007  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| ||   ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  21356006 tatctttgttc--tttgtatatgcttgtggtgttgctctacact-aga-ctaggtctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttacacattgattac 21355911  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  21355910 cacttcctttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgatt 21355867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 135 - 381
Target Start/End: Original strand, 21801374 - 21801622
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca-----atctt-ggtgtgtttgttccttttctttcata 228  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     ||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  21801374 tagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactg-gtcaacacttttatctttggtgtgtttgttccttt-ctttcatt 21801471  T
Q  229 gcttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattga 327  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  21801472 acttatctttattgcttt-gattatgattgtggtattgttctacacttagatttaggtctgatttttgttgttgttgcttggagacactttatctattga 21801570  T
Q  328 ttaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21801571 ttaccacttcctt--ctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtcc 21801622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Original strand, 31086502 - 31086734
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31086502 atagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgctta 31086600  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||| | |||||           ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31086601 tctttgt-gcttt-----------gtgatgttgctctacacttagatttatgtctgtttttgttgtttttgcttggagacactttatccattgattacca 31086688  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  31086689 cttcctttgctccacacatctttgttcttcattggtgtgattttgt 31086734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 13057310 - 13057509
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13057310 gttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 13057409  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||| | |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  13057410 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaa 13057509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068395
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 26068395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 32280112 - 32280301
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280112 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 32280211  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc-atatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 188  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||  ||||||  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  32280212 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 32280301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069718
Alignment:
Q  5 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  105 tgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||| | |  ||||||||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaa 1069718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30729026 - 30728824
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30729026 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 30728927  T
Q  101 ccattgat----ttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaa 195  Q
     |||||||    |||||||| |||| |  ||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  30728926 tcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaa 30728827  T
Q  196 caa 198  Q
    |||    
T  30728826 caa 30728824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 3390495 - 3390694
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390495 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 3390594  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| || |||| |  ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| || || ||||||||    
T  3390595 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaa 3390694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 13039870 - 13040069
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13039870 gttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 13039969  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  13039970 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 13040069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3233928 - 3233738
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3233928 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaac 3233829  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactga 190  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||||||    
T  3233828 tcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctcccccacactaggtcaattttgaccgaactga 3233738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3630062 - 3629865
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3630062 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaac 3629963  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||| || |||||||| |   |||||||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  3629962 ccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3629865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3632136 - 3631939
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3632136 gttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 3632037  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||| |  |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  3632036 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt--cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3631939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16455624 - 16455424
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16455624 gttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaac 16455525  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    || ||||| |||| |||||||    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16455524 cctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaaca 16455425  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  16455424 a 16455424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15530320 - 15530166
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15530320 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa- 15530222  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 155  Q
    |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15530221 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 248 - 381
Target Start/End: Original strand, 5572737 - 5572870
Alignment:
Q  248 gattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgttcca 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  5572737 gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttatgtctgtttttgctgttgttgcttggagacactttatctattgattaccacttcctttgctcca 5572836  T
Q  348 cacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5572837 cacatctttgttattcattggtgtgattttgtcc 5572870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15532879 - 15532718
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15532879 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaac 15532780  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 161  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||    
T  15532779 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctatccc 15532718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22709086 - 22708888
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa--tcttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||  || ||||| | |||    
T  22709086 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaattttttggtgtgtttgttc--ttcctttc-ttgct 22708990  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||    
T  22708989 tatctttattgctttgga-tacacttgtggtgttgctctaca-ttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattac 22708892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 25477390 - 25477596
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477390 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 25477489  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaa-------cgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgag 191  Q
    |||||||| |||| |||||||       ||  |||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| || |    
T  25477490 ccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatggg 25477589  T
Q  192 tcaacaa 198  Q
    |||||||    
T  25477590 tcaacaa 25477596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 15719758 - 15719873
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719758 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 15719857  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
    |||||||| |||||||    
T  15719858 ccattgatatctcttt 15719873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15541338 - 15541140
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15541338 gttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaac 15541239  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  | ||||||||||||| |   ||  |||||||||||| ||||| ||||| |  |||||| |||||| ||||||||    
T  15541238 ccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtgaaacagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaa 15541140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 19227606 - 19227514
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227606 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3028052 - 3027888
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  3028052 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaac 3027953  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccc 163  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  3027952 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccccc 3027888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186071
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  100 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    | ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || | || |||||||  ||| ||||||||| || ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  12186071 a 12186071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 116
Target Start/End: Original strand, 22490763 - 22490871
Alignment:
Q  8 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22490763 caccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattga 22490862  T
Q  108 tttctcttt 116  Q
    | |||||||    
T  22490863 tatctcttt 22490871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15367147 - 15367346
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  15367147 gttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaac 15367246  T
Q  101 ccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc-ccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||||||| |  ||| |||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  15367247 ccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaa 15367346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 246
Target Start/End: Original strand, 5572270 - 5572381
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||    
T  5572270 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgtt-catttctttcactgctta 5572368  T
Q  234 tctttattgcttt 246  Q
    | |||||||||||    
T  5572369 tatttattgcttt 5572381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Original strand, 14466440 - 14466634
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  14466440 ttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaact 14466539  T
Q  102 cattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtca 194  Q
    ||||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  ||| | ||||| | ||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||    
T  14466540 cattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtca 14466634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 138 - 373
Target Start/End: Original strand, 5674803 - 5675036
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc---ttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||   |||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  5674803 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctctttggtgtgtttgttc--tttctttc-ttgcttat 5674898  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgctt-ggagacattttattcattgattacca 333  Q
     ||  |||||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||    
T  5674899 attgtttgctttgtattctctttgtggtgttgctctacac-taga-ctagggctggttttgttgttgttgcttgggaaactttttactctttgattacca 5674996  T
Q  334 ct-tcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtga 373  Q
    || || |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  5674997 ctatcttttgctccacacatctttgtt-ttcattggtgtga 5675036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878908
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 13878822  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  13878823 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 13878908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786100
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 16786014  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  16786015 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 16786100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26945259 - 26945460
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  26945259 gttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgtaa 26945358  T
Q  100 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaac 196  Q
    | ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||| ||  | ||||| |||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||| || |||    
T  26945359 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaac 26945458  T
Q  197 aa 198  Q
    ||    
T  26945459 aa 26945460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22858152 - 22857952
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||| |||||| |||||   | ||||| |||||||||||    
T  22858152 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaac 22858053  T
Q  101 cc-attgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    ||  ||||| | ||||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  22858052 ccttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaaca 22857953  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  22857952 a 22857952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 381
Target Start/End: Original strand, 24436001 - 24436240
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||  || |||||||||||||||||   |||||| | |  |||||    
T  24436001 tagtggatcggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattggatcgaactgggt-taccatcttggtgtgtttgttttctttcttgc-tttcttat 24436098  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    |||| |||| |||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||| ||| ||  || || ||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||||     
T  24436099 ctttgttgc-tttgtttatgcttgttgtgt--ctctacacttagatttagatc--ttatttttgttgttgtttgtagacactttatctattgattaccat 24436193  T
Q  335 ttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    |||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  24436194 ttcccttactccacacatctttgttattcattggtgttattttgtcc 24436240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883656
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaattcat---tatctctt 13883570  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  13883571 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 13883656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12161755 - 12161558
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  12161755 gttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaac 12161656  T
Q  101 ccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||  | | ||||| |  |||||||||||||| |||||||    
T  12161655 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctctccctaa-actaggttaatttggaccgaactgaatcaacaa 12161558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24338645 - 24338458
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||  |  |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  24338645 gttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaac 24338546  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 188  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||||  |||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  24338545 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactatgtcaatttggaccgaact 24338458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 17012156 - 17012271
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17012156 gttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 17012255  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
     ||||||| |||||||    
T  17012256 tcattgatatctcttt 17012271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694852
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 17694935  T
Q  119 aacgaaact-catca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || ||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  17694934 aaagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 17694852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887227
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 26887311  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  26887310 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctg--ctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 26887227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201327
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 35201413  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || || |||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| || |||||    
T  35201412 tgaaaagaaactaattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaa 35201327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 19696556 - 19696756
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||  || |||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||     
T  19696556 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaat 19696655  T
Q  101 ccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    || ||||| ||||||| |||| |  | ||||||| ||||||||   ||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  19696656 cctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 19696755  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  19696756 a 19696756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 198
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346661
Alignment:
Q  60 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 158  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  | ||||||||||||| |  |||  ||||||||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctct 15346621  T
Q  159 cccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  15346622 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaa 15346661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248739
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 31248801  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| | | ||||||||    
T  31248800 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctctcccctatactaggtcat 31248739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27165750 - 27165647
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27165750 tagttgattggagggctactctgtcccccatagtaggtcatattggaccg-actgggtaaacaatctttggtgtggttgttccttttctttcattgctta 27165652  T
Q  234 tcttt 238  Q
    |||||    
T  27165651 tcttt 27165647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 20526922 - 20527081
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  |  |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  20526922 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 20527021  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 159  Q
    |  ||||| ||||||||||| |  | |||||| |||||||||  |||| |||||||||||    
T  20527022 cttttgatatctctttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342801
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 22342885  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  22342884 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 22342801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351876
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||| |||| |||||| ||   || |||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctctttgt 22351936  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22351935 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcat 22351876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 33215830 - 33216009
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  33215830 cactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggac-ttggatagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 33215925  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  33215926 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctatcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 33216009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 300
Target Start/End: Original strand, 31076971 - 31077134
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||   ||| |||||||||||||||  ||||  || | |||||||||| |||||||| | || ||||| | ||||||    
T  31076971 tagtggattggagagctgctatctcctagagagtaggtcatattggactaaactaggttaccaatcttggtatgtttgtttcatt-ctttc-tggcttat 31077068  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgtt 300  Q
     ||| ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  31077069 atttgttgcttttgattatgcttatgatgttgttctacacttagatttaagtctatttttgttgtt 31077134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 79
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25466075 - 25465899
Alignment:
Q  23 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 121  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||||     
T  25466075 tattaggattgagtctcttaatcacggaaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgtaaa 25465980  T
Q  122 gaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||| || |||||    
T  25465979 gaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggccatcattagaccgaactgggtaaacaa 25465899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165822
Alignment:
Q  25 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacga 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||| | ||||||||||||| |  || ||||||||||| ||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccc-tgaatatctctttgtaaaga 5165892  T
Q  124 aactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactg 189  Q
    |||||  |||| ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  5165891 aactcatatcattatagtggaatggagagttgctatctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactg 5165822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 130
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643286
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaactca---atatctctttgt 26643274  T
Q  119 aacgaaactcat 130  Q
    || |||||||||    
T  26643275 aaagaaactcat 26643286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 130
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749252
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaactca---atatctctttgt 26749240  T
Q  119 aacgaaactcat 130  Q
    || |||||||||    
T  26749241 aaagaaactcat 26749252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 77  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465590
Alignment:
Q  80 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tat 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| | || |||| |||    
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtat 25465611  T
Q  178 tggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  25465610 tggaccgaactgggtaaacaa 25465590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166267
Alignment:
Q  24 attaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037813
Alignment:
Q  3 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacc 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| || ||  || |||||||||||||||||||    | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  102 cattgatttctcttt 116  Q
    | ||||| |||||||    
T  28037827 ctttgatatctcttt 28037813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 33335963 - 33336063
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggt--gtgtttgttccttttctttcatagcttatc 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||  |||||| | |||||    
T  33335963 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatggtttatc 33336061  T
Q  236 tt 237  Q
    ||    
T  33336062 tt 33336063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701985
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941704
Alignment:
Q  23 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 25941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 354
Target Start/End: Original strand, 33721683 - 33721804
Alignment:
Q  230 cttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| || |  |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |   | |||| |||| ||||    
T  33721683 cttatctttgttgcttt-gaatatgtttgtggtgatgtttcacacttagatctagggatgttt--gttgttgttgcttgaaactactttactcatcgatt 33721779  T
Q  330 accacttcctttgttccacacatct 354  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  33721780 actacttcctttgttccacacatct 33721804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542461
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||   | ||||| ||| ||||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa 7542482  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaa 120  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  7542481 ccctttgatatctctttgtaa 7542461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467585
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  13467642 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattagg 13467585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 14742457 - 14742520
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  14742457 tggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 14742520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 22010718 - 22010781
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  22010718 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 22010781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6005481 - 6005381
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggt--gtgtttgttccttttctttcatagcttatc 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||| || | |||||    
T  6005481 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcttttccttttatcgtttatc 6005383  T
Q  236 tt 237  Q
    ||    
T  6005382 tt 6005381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12911629 - 12911471
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||  || ||  || |||||| |||||| |||||   || | || ||||||||||||  || || ||||||    
T  12911629 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12911530  T
Q  116 tgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtc 173  Q
    ||||| |  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12911529 tgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 12911471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16838808 - 16838708
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggt--gtgtttgttccttttctttcatagcttatc 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| | |||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||||| || | |||||    
T  16838808 tggattggagagctgctctctcccccagattaagccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgtttatc 16838710  T
Q  236 tt 237  Q
    ||    
T  16838709 tt 16838708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28184567 - 28184506
Alignment:
Q  140 gattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  28184567 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 28184506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 33330466 - 33330566
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggt--gtgtttgttccttttctttcatagcttatc 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||  |||||| | |||||    
T  33330466 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatggtttatc 33330564  T
Q  236 tt 237  Q
    ||    
T  33330565 tt 33330566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6438565 - 6438501
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||    
T  6438565 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggacaacaatcttg 6438501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 16569146 - 16569207
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16569146 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 16569207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 28155590 - 28155654
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  28155590 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 28155654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11857038 - 11856975
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  11857038 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 11856975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 14737597 - 14737660
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  14737597 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactggatcaacaatctt 14737660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 341
Target Start/End: Original strand, 26258181 - 26258233
Alignment:
Q  289 gtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttccttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26258181 gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattggttaccacttccttt 26258233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937229
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||  ||  ||||| ||||||||||||   || | || ||||||||||||  || || ||||||    
T  12937376 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12937277  T
Q  116 tgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccc 162  Q
    ||||| |  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12937276 tgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc 12937229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078641
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||  || || |||  |||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
    || ||||| |||||||    
T  25078656 cctttgatatctcttt 25078641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 198
Target Start/End: Original strand, 10584256 - 10584310
Alignment:
Q  144 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  10584256 ggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaa 10584310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 187
Target Start/End: Original strand, 11262596 - 11262763
Alignment:
Q  25 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaccca---ttgatttctctttgtaa 120  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  || || ||| ||||||||||||   || |||| |||||| |||||     ||||| |||||||||||    
T  11262596 ttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgaga-tttaggtagaattaggtttgaagactaattcttataacctccttttgatatctctttgtaa 11262694  T
Q  121 cgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaac 187  Q
     ||||||||||| |||| || |  ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11262695 agaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaac 11262763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22870196 - 22870102
Alignment:
Q  104 ttgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  22870196 ttgatatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggaacggagagcttctctctctcccag--taggtcagtattggaccgaactgggtgaacaa 22870102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 198
Target Start/End: Original strand, 25941759 - 25941851
Alignment:
Q  110 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  25941759 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 25941851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33211229 - 33211168
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  33211229 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtatgtttgtt 33211168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9183075 - 9183015
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgt 213  Q
    ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9183075 tctctcctccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgt 9183015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14521735 - 14521652
Alignment:
Q  141 attggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca--atcttggtgtgtttgttccttttct 222  Q
    ||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| || |||||||    
T  14521735 attggagaggtgctctctcctcgagagtaggtcatattggaccgaactaggtcaacattttcttggtgtgtttatttcttttct 14521652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 30445699 - 30445831
Alignment:
Q  61 gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctc 157  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||  ||||||||    
T  30445699 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctc 30445798  T
Q  158 tcccccagattaggtca-tattggaccgaactg 189  Q
    ||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||    
T  30445799 tccaccatactaggtcagtattggactgaactg 30445831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 603132 - 603085
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatct 201  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  603132 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatct 603085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 198
Target Start/End: Original strand, 17038324 - 17038416
Alignment:
Q  110 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  17038324 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagacttggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 17038416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27165616 - 27165545
Alignment:
Q  291 ttttgttgttgttgcttggagaca--ttttattcattgattaccacttcctttgttccacacatctttcttat 361  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27165616 ttttgttgttgttgcttg-agactacttttgctcattgattacgacttcctttgctccacacatctttgttat 27165545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 189
Target Start/End: Original strand, 7294021 - 7294101
Alignment:
Q  111 ctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactg 189  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||   ||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  7294021 ctctttgtatagaaactcatcattatagtggaacagagagttgctctctcccccagagtaggtcagtattggaccaaactg 7294101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 147)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 20522288 - 20522043
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  20522288 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcatttctta 20522190  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20522189 tctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctatgtctttttttgttgtttttgcttggagacactttatccattgattacca 20522091  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20522090 cttccttttctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtcc 20522043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 17865271 - 17865026
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||    
T  17865271 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatcttggtgtgattgttccttt-ctttcattgatta 17865173  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17865172 tctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtatgtttttgttgttgttggttggagacattttatccattgattacca 17865074  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17865073 cttccttttctccacacatttttgttattcattggtgtgattttgtcc 17865026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Original strand, 16940238 - 16940481
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16940238 atagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgctta 16940336  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  16940337 tctttattgcttt-gattatgcttttggtgtcgctctgcacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcatagagacactttattcattgattacca 16940435  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16940436 cttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 16940481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Original strand, 17010903 - 17011146
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17010903 atagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgctta 17011001  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  17011002 tctttattgcttt-gattatgcttttggtgtcgctctgcacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcatagagacactttattcattgattacca 17011100  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17011101 cttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 17011146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 27104855 - 27105052
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104855 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 27104954  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  27104955 ccattgatttctctttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27105052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 134 - 395
Target Start/End: Original strand, 10445473 - 10445734
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  10445473 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tctctttcattgctta 10445571  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10445572 tctttattgc-tttgattatgcttgtggttttgctctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttatccattgattacc 10445670  T
Q  333 acttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaat 395  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||    
T  10445671 acttccttttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgattttgtccgaattcacaacaat 10445734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Original strand, 33528650 - 33528895
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  33528650 atagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgttta 33528748  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  33528749 tctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacatttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggggacactttatccattgattacca 33528847  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  33528848 cttcctttgctccacacatctttgttattcattggtggaattttgtcc 33528895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35215784 - 35215586
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35215784 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 35215685  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35215684 ctcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35215586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35218161 - 35217963
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35218161 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 35218062  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35218061 cccgttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35217963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 135 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31056111 - 31055884
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt-ggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31056111 tagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgttccttttctttcattgctta 31056012  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  31056011 tctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattacca 31055913  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttatt 362  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31055912 cttcctttgctccacacatctttgttatt 31055884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33118204 - 33117974
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  33118204 atagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgctta 33118106  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  33118105 tctttattacttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgatgtttgaagacactttatctattgattacca 33118007  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcatt 366  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33118006 cttcctttgatccacacatctttgttattcatt 33117974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19502209 - 19502011
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502209 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 19502110  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  19502109 ccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 19502011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23452435 - 23452237
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23452435 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaac 23452336  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  23452335 ccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 23452237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 42064572 - 42064770
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064572 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaac 42064671  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcata-ttggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  42064672 ccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaa 42064770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19504543 - 19504346
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504543 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 19504445  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  19504444 ccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 19504346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 45280182 - 45279984
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280182 gttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 45280083  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  45280082 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaa 45279984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 133 - 379
Target Start/End: Original strand, 34682362 - 34682607
Alignment:
Q  133 tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctt 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  34682362 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tctctttcattgctt 34682460  T
Q  233 atctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    || ||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  34682461 atatttatt-tgtttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattacc 34682559  T
Q  333 ac-ttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    || ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  34682560 actttcttttgctccacacatctttgttattcattggtgtggttttgt 34682607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8040128 - 8039884
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| | ||| ||| |||||    
T  8040128 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttgatgtattttttcctctcctt-cattgctta 8040030  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  8040029 tctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttatctattgattacca 8039931  T
Q  334 cttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8039930 cttccttttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 8039884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 42452838 - 42453035
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452838 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 42452937  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  42452938 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 42453035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13910242 - 13910045
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910242 gttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 13910143  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  13910142 ccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 13910045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 43623778 - 43623580
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623778 gttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 43623679  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  43623678 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 43623580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21630011 - 21629774
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21630011 atagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgctta 21629914  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    |||||||||||||  |||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  21629913 tctttattgctttgaatt------gtggtgctgctctacacttagatctaggtctgtttt-gttgttgttgcttggagacactttatctattgattacca 21629821  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  21629820 cttcctttgctccacacatctttgtt-ttcattggtgtgattttgtcc 21629774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558864
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36558948  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 36558864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561141
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36561225  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 36561141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5375543 - 5375346
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5375543 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttattcttgtaac 5375445  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  5375444 ccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5375346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 34388926 - 34388686
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | |||    
T  34388926 atagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctcggtgtgtttgttccttt-ctttctttgttta 34388828  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||    
T  34388827 tctttgt-gcttt-gattttgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttacatattgattacca 34388730  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||    
T  34388729 cttcctttgctccacacatcttcgttatttattggtgtgatttt 34388686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Original strand, 8390179 - 8390425
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  8390179 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaattttggtgtgtttgtt-catttctttcatcgctta 8390277  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg----tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  8390278 tcttt-gtgc-tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctggtttttgttgttgttgttgtttggatacactttatccattgatt 8390375  T
Q  330 accacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  8390376 accacttcctttactccacacatctttatttttcattggtgtgattttgt 8390425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13569396 - 13569155
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | |||    
T  13569396 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttggtgtgtttattcc-tttctttcattgatta 13569298  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    |||||  ||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13569297 tcttt-gtgc-tttgattatgcttgtggtgtttctctatacttagatctaagcctgttttttgttgttgttgtttggagacactttacacattgattacc 13569200  T
Q  333 acttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13569199 acttcctttactccacacatctttgttattcattggtgtgatttt 13569155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332181
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctct 45332265  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 45332181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Original strand, 23078499 - 23078742
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||| |||    
T  23078499 atagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaacattcttttggtgtgtttgttccatt-ctttcattgct 23078597  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttt-tgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  23078598 tatctttgt-gcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtatgttttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgatta 23078695  T
Q  331 ccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  23078696 ccacttcctttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgatttt 23078742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21520891 - 21520693
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21520891 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaac 21520792  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  21520791 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaa 21520693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Original strand, 42039698 - 42039939
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  42039698 atagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaatcttttggtgtgcttgctccttt-ctttcattgct 42039796  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| | ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  42039797 tatctttgt-gcttt-gtttatgcttgtggtgttgctctacactta-atctaggtatgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattac 42039893  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  42039894 cacttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgatttt 42039939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Original strand, 14699036 - 14699268
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       
T  14699036 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgc--- 14699131  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg----tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
               |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  14699132 -----------tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgctttttgttgttgttgttgcttggagacactttatctattgatt 14699220  T
Q  330 accacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  14699221 accacttcctttgctccacacatcattgatattcattgatgtgttttt 14699268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 377
Target Start/End: Original strand, 36757795 - 36758031
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatc 235  Q
    |||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  36757795 tggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgcttatc 36757893  T
Q  236 tttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccact 335  Q
    ||| | ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  36757894 tttgt-gcttt-gtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctgtttt-gttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccact 36757989  T
Q  336 tcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36757990 tcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgatttt 36758031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 19007697 - 19007895
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19007697 gttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 19007796  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  19007797 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 19007895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24162410 - 24162223
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162410 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtt----------gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 24162321  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||||||| || ||||||||    
T  24162320 ccattgatttctctttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaa 24162223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 134 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 39482999 - 39482759
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||    
T  39482999 atagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tctctttcattgttta 39482901  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacc 332  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||      
T  39482900 tctttattgc-tttggttatgcttgtggtgttgttctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgtttggagacactttatctattg-tta-- 39482805  T
Q  333 acttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtc 380  Q
      ||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  39482804 --ttcatttgctccacacatctttgttattcatttgtgtgattttgtc 39482759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Original strand, 10707281 - 10707523
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| | |||||    
T  10707281 atagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctcggtgtgtttatt-catttctttctttgctta 10707379  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt--ttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    |||||  ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  10707380 tcttt-gtgc-tttgattatgcttgcagtgttgctctacacttagatctaggtatattttcttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattac 10707477  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  10707478 cacttcttttgctccacacatctttgttattcatgggtgtgatttt 10707523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22287534 - 22287336
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22287534 gttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaac 22287435  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22287434 ccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 22287336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42923707 - 42923509
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42923707 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaat 42923608  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  42923607 ccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 42923509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45239175 - 45239001
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  45239175 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaac 45239076  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca 174  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45239075 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 45239001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 134 - 375
Target Start/End: Original strand, 28259206 - 28259445
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  | ||||||||| |||    
T  28259206 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtt--tcttctttcattgct 28259303  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg--tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    ||||||| ||   ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  28259304 tatctttgtt--ctttgtatatgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctgtttttttgttattgttgcttggagacactttacacattgatt 28259399  T
Q  330 accacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatt 375  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  28259400 attacttcctttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgatt 28259445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6264347 - 6264148
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||  |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6264347 gttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaac 6264248  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6264247 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6264148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 28196694 - 28196890
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28196694 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaac 28196793  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |  | | ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  28196794 ccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctcccccagactaggtca-att-gaccgaactgggtcaacaa 28196890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40032256 - 40032053
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40032256 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaac 40032157  T
Q  101 ccattga----tttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtca 194  Q
    |||||||    |||||| |||| || |  |||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| ||||    
T  40032156 ccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 40032057  T
Q  195 acaa 198  Q
    ||||    
T  40032056 acaa 40032053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6259013 - 6258817
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6259013 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga--ttggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 6258916  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||| | ||||||| |  ||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6258915 ccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6258817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11578307 - 11578140
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11578307 gttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 11578208  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccaga 166  Q
     ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  11578207 tcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcccccaga 11578140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11739758 - 11739559
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  11739758 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaat 11739659  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||| || |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  11739658 ccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 11739559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17848501 - 17848695
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||   |||||||||||||||||||||||     
T  17848501 gttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa- 17848596  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  17848597 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaa 17848695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15539673 - 15539566
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539673 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 15539574  T
Q  101 ccattgat 108  Q
    ||||||||    
T  15539573 ccattgat 15539566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20146806 - 20146616
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20146806 ttgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaact 20146707  T
Q  102 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactg 189  Q
    | ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||    
T  20146706 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactg 20146616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25403701 - 25403480
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc---ttggtgtgtttgttccttttctttcatagc 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||||  || ||||| | ||    
T  25403701 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg-ctgaactgagtcaacaatctttttggtgtgtttgttc--ttcctttc-ttgc 25403606  T
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtt-tgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    |||||||  |||||||  ||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  25403605 ttatcttgtttgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacac-tag-tctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagatt 25403508  T
Q  330 accacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25403507 accacttccttttgctccacacatcttt 25403480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3491818 - 3491600
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  || ||||| | |||    
T  3491818 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc--ttcctttctt-gct 3491723  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||  |||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||    
T  3491722 tatcttggttgctttctatt-tgcttgtggtgttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattac 3491626  T
Q  332 cacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||    
T  3491625 cacttccttttgctccacacatcttt 3491600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18800512 - 18800397
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18800512 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaac 18800413  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
    |||||||| |||||||    
T  18800412 ccattgatatctcttt 18800397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25398563 - 25398342
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt---ggtgtgtttgttccttttctttcatagc 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||   |||||||||||||  || ||||| | ||    
T  25398563 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc--ttcctttctt-gc 25398468  T
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtt-tgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    |||||||  |||||||  ||| | || ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  25398467 ttatcttgtttgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacact-ag-tctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagatt 25398370  T
Q  330 accacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25398369 accacttccttttgctccacacatcttt 25398342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 14837330 - 14837523
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||  || ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14837330 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaac 14837423  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14837424 tcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaa 14837523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34979777 - 34979577
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34979777 gttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaat 34979678  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct-ctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    ||||| || |||| ||||||| |   ||||||| |||||||||  | |||||| |||| | |||||| | |||||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  34979677 ccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaaca 34979578  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  34979577 a 34979577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 17849174 - 17849348
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17849174 gttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 17849273  T
Q  101 ccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca 174  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||| || | |||||||    
T  17849274 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctctctcccacatactaggtca 17849348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22407595 - 22407454
Alignment:
Q  58 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 156  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  22407595 tgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 22407496  T
Q  157 ctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  22407495 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 22407454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44289266 - 44289067
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | || | |||||||||||||||    
T  44289266 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaac 44289167  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || ||||| |||| |||||||    |||||||| ||||||| |   || || |||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  44289166 ccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 44289067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 304
Target Start/End: Original strand, 2869723 - 2869892
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  || ||||  | ||||||    
T  2869723 tagtggattggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaatattggtgtgtttgttctcttcctttatttgcttat 2869822  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt-ttgttgttgttg 304  Q
    |||| |||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  2869823 ctttgttgc-tttgaatatgcttatggtgttgctctacacttagatttaggtctatttgttgttgttgttg 2869892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 3022220 - 3022427
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022220 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 3022319  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat----------atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactga 190  Q
    ||||| || ||||||| ||| |  |||||||||          ||| || |   || ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  3022320 ccattaatatctctttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgg 3022419  T
Q  191 gtcaacaa 198  Q
    ||||||||    
T  3022420 gtcaacaa 3022427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28459385 - 28459273
Alignment:
Q  4 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28459385 gattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaaccca 28459286  T
Q  104 ttgatttctcttt 116  Q
    ||||| |||||||    
T  28459285 ttgatatctcttt 28459273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  70 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagatt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  169 aggtc-atattggaccgaactgagtcaa 195  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17897443 - 17897245
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897443 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 17897344  T
Q  102 cattgatttct-ctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    | ||||| |||  ||||||| |  |||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||| || |||||    
T  17897343 ctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctct-ccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaa 17897245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 40699430 - 40699621
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  40699430 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 40699529  T
Q  100 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaact 188  Q
     || ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  40699530 tcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaact 40699621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40738910 - 40738704
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||||||||||  || ||||| |||||    
T  40738910 atagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc--ttcctttc-tagct 40738816  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacact----tagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattga 327  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||    ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||| ||||   || ||    
T  40738815 tatctttattgctttgtatt-tgcttgtggtgttgctctacactagactagatct-ggttttttgttgttgttgttgcttggagacactttacatataga 40738718  T
Q  328 ttaccacttccttt 341  Q
    ||||||||||||||    
T  40738717 ttaccacttccttt 40738704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943707
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttgt 17943635  T
Q  119 aacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaact 188  Q
    || ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  17943636 aaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaact 17943707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736386
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2736300  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  2736301 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 2736386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 22874187 - 22874374
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  || | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22874187 gttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaac 22874286  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaa 186  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |   ||| ||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||    
T  22874287 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaa 22874374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31732963 - 31732776
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31732963 gttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtt------------tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 31732876  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| || |||||    
T  31732875 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaa 31732776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 35397579 - 35397323
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagat-taggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||| | || ||||||| |||||    
T  35397579 tagtggattgaagagctgctatctcctccagatgtaggttagattgaaccgaactgggtaaacaatattggtgtgtttgtttcctt-ctttcattgctta 35397481  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    | || |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||| |    
T  35397480 tattgattgcttt-gattatgcttgtggttttgctctgcacatagatttaggtatatttt-gttgttgttgcttgaggtcatttcactcattgattacta 35397383  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaat 395  Q
    |||||| || ||| ||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||  |||||| |||||    
T  35397382 cttcctctgctccgcacatctttgt--ttcattggtgtgtttttgtccgaattcacaacaat 35397323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462617
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | ||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcct---tatctctt 17462531  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  17462532 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 17462617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687164
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 39687078  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  39687079 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 39687164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054765
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 20054852  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  20054851 tgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 20054765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517649
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 27517723  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaact 188  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  27517722 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaact 27517649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741112
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||     ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2741036  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaact 188  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  2741037 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaact 2741112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38414278 - 38414194
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38414278 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781231
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttggaactca---atatctctttgt 12781305  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaact 188  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  12781304 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaact 12781231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589863
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  116 t 116  Q
    |    
T  20589863 t 20589863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 27136324 - 27136208
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27136324 gttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 27136225  T
Q  100 cccattgatttctcttt 116  Q
    | ||||||| |||||||    
T  27136224 ctcattgatatctcttt 27136208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680226
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||| | ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagattgattcttgaaactcat---tatctctt 39680140  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  39680141 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 39680226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 142
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932757
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 17932732  T
Q  119 aacgaaactcatca-tatagtggat 142  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  17932733 aaagaaactcatcattatagtggat 17932757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479176
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  30478997 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttgt 30479092  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  30479093 aaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 30479176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Original strand, 35107351 - 35107427
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 78  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  35107351 ttgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattag 35107427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 43139432 - 43139564
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||| |||||||||||| |   ||||| ||| |||||||    
T  43139432 ttgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaac 43139531  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat 133  Q
    |  ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  43139532 cttttgatttctctttgtaaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 373
Target Start/End: Original strand, 11098960 - 11099196
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt---ggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||   ||||| |||||||  || ||||| |  |||||    
T  11098960 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgt-tttgttc--ttcctttcttc-cttat 11099054  T
Q  235 ctt-tattgcttttgattatgtttgtg--gtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggaga-cattttattcattgatta 330  Q
    ||| | ||||||| |  | | ||||||  || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  11099055 cttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacact-ag-tctagggctgtttttgttgttgttgcttggaaaccattttgttcattgatta 11099152  T
Q  331 ccact-tcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtga 373  Q
    ||||| ||  ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  11099153 ccactatctcttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga 11099196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20050021
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || || |||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggctaggactt-ggatataattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 20050109  T
Q  116 tgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctc-ccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  20050108 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 20050021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 214
Target Start/End: Original strand, 1345572 - 1345652
Alignment:
Q  136 agtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa--tcttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  1345572 agtggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgtgtttgtt 1345652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 40014886 - 40014738
Alignment:
Q  245 tttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt-ttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgt 343  Q
    |||||||||| |||||||| || | ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||| ||||||||||     
T  40014886 tttgattatgcttgtggtgatgttttacacttagttttaggactgtttgttgttgttgttgcttgaggacactttc--cattgattactacttcctttgc 40014789  T
Q  344 tccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaa 394  Q
    |||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||||  ||||| |||||    
T  40014788 tccatacatctttgtttgtcattggtgtgattttgtccgaattcatgacaa 40014738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170777
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || |||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctctttgt 37170836  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37170835 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtcat 37170777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14633869 - 14633808
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14633869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgtt 14633808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 37963137 - 37963028
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||| ||  ||||||  || | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  37963137 gttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaat 37963038  T
Q  101 ccattgattt 110  Q
    ||||||||||    
T  37963037 ccattgattt 37963028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 199
Target Start/End: Original strand, 2838060 - 2838124
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat 199  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2838060 tagtggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 2838124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583483
Alignment:
Q  3 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 55  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27583483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3278053 - 3277898
Alignment:
Q  151 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatctttattgcttttgat 250  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||| | ||||  ||  ||||||||| ||||||| ||     
T  3278053 tgctctctcctccatagtaggtcattttggacggaaatgagtaaacaatgttgatgtgttttttccctctctt--atttcttatcttttttgcttt-gaa 3277957  T
Q  251 tatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt-ttgttgttgttgcttg 308  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  3277956 tatgtttgtagtgttgcttcacacttagatctagatctatttgttgttgttgtttcttg 3277898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707751
Alignment:
Q  80 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg--ctctctcccccagattaggtcata 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |   ||||||||  |||||||| ||||| |||||||      
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  177 ttggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||| |||||  ||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaa 22707751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 723788 - 723727
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  723788 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 723727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaatta 77  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | | |||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34139814 - 34139753
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  34139814 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 34139753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11151634 - 11151574
Alignment:
Q  155 ctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11151634 ctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 11151574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14291552 - 14291489
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  14291552 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 14291489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057349
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 17057349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085332
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 17085332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22163106 - 22163022
Alignment:
Q  114 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  22163106 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 22163022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 174
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871047
Alignment:
Q  79 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtca 23871047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 225
Target Start/End: Original strand, 36773686 - 36773758
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttccttttctttc 225  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  36773686 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctcttctttc 36773758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191045
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 65  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 38191045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 44312645 - 44312708
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  44312645 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 44312708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 188
Target Start/End: Original strand, 27149322 - 27149377
Alignment:
Q  133 tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  27149322 tatagtggattggagagctgctctctcccccatagtaggtcatattggaccaaact 27149377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 198
Target Start/End: Original strand, 45679813 - 45679904
Alignment:
Q  110 tctctttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  45679813 tctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 45679904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694076
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 97  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  98 aacccattgatttctcttt 116  Q
    ||||  ||||| |||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttt 15694076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 11067429 - 11067490
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  11067429 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactcggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 11067490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 381
Target Start/End: Original strand, 27149001 - 27149138
Alignment:
Q  244 ttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtct--gtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttccttt 341  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||  |  | |||| |||||||||| ||||| ||||    
T  27149001 ttttgaatatgcttgtggtgttgctttacaaatagatttagatctatgttattgttgttgttgcttgatgctactttactcattgattatcactttcttt 27149100  T
Q  342 gttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    | ||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||    
T  27149101 gctccacacatctttgt--ttgattggtgtgattttgtcc 27149138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33671059 - 33670967
Alignment:
Q  110 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  33671059 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaa 33670967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 38020259 - 38020349
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |          ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38020259 gttgattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggtattg----------ggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 38020348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 9296434 - 9296497
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9296434 tggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 9296497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 38312364 - 38312428
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38312364 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcct 38312428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 202
Target Start/End: Original strand, 39284960 - 39285008
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39284960 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctt 39285008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 39812009 - 39812072
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  39812009 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactggttcaacaatctt 39812072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacggg-aagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaaagattc-gggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942634
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaatta 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  10942696 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948503
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaatta 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  10948565 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 32246852 - 32246810
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgg 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32246852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 32246810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgggactttgggtagaatta 77  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19344485 - 19344421
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  19344485 tggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 19344421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19349343 - 19349279
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  19349343 tggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 19349279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 25407690 - 25407653
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattagg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25407690 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33162494 - 33162433
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  33162494 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 33162433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 28770912 - 28770972
Alignment:
Q  245 tttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt-ttgttgttgttg 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  28770912 tttgattatgcttgtggtgttgcttcacacttagatctaggtctatttgttgtagttgttg 28770972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720703
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 98  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||  | | |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 30720712  T
Q  99 acccattga 107  Q
    |||| ||||    
T  30720711 accctttga 30720703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 373
Target Start/End: Original strand, 9296554 - 9296670
Alignment:
Q  257 tgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttg-ttgcttggaga-cattttattcattgattaccacttcc-tttgttccacacatc 353  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||  |||| |||||||||| || |||| ||||||||||    
T  9296554 tgtggttttgctctacact-aga-ctagggctgtttttgttgttgtttgcttggaaaccattttgctcatagattaccactaccttttgctccacacatc 9296651  T
Q  354 tttcttattcattgatgtga 373  Q
    ||| || ||||||| |||||    
T  9296652 tttgtt-ttcattggtgtga 9296670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Original strand, 35028632 - 35028707
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 77  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  35028632 ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 27248075 - 27248021
Alignment:
Q  26 taggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  27248075 taggattgagtctcttggtcacgggaagagatccaggactttgggtagaattagg 27248021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 29867993 - 29868054
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  29867993 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaataatctttgatgtgtttgtt 29868054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32178460 - 32178419
Alignment:
Q  338 ctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32178460 ctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 32178419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 33674584 - 33674551
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaag 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33674584 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 33674551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36318053 - 36317992
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36318053 tctctcccttagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 36317992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5699734 - 5699702
Alignment:
Q  256 ttgtggtgttgctctacacttagatctaggtct 288  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5699734 ttgtggtgttgctttacacttagatctaggtct 5699702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 251 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12632510 - 12632454
Alignment:
Q  251 tatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt-ttgttgttgttgct 306  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  12632510 tatgcttgtggtgttgcttgacacttatatctaggtctgtttgttattgttgttgct 12632454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 22163145 - 22163106
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 41  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22163145 gttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 39532906 - 39532835
Alignment:
Q  230 cttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt-ttgttgttg 301  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  39532906 cttatctttattgcttagg-ttatgtttgtggtgttgcttcgcacttagatttaggtctatttattgttgttg 39532835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1650 - 1453
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1650 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 1551  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  1550 ccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 159)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 4410104 - 4410301
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410104 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 4410203  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4410204 ctattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 4410301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15552326 - 15552524
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552326 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 15552425  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15552426 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15552524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 135 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 28832326 - 28832083
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||    
T  28832326 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatcttggtgtgtttgtttgttt-ctttcattgcttat 28832228  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  28832227 ctttattgattt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagat-taggtctgtttttgttgttgttgcttgaagacactttatccattgattaccac 28832130  T
Q  335 ttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  28832129 ttcctttgctccacacatctttgttattcattggtatgattttgtcc 28832083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31179569 - 31179371
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179569 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 31179470  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31179469 cccattcatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31179371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19588814 - 19588569
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19588814 atagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatctttgagtgtttgttccttt-ctttcattgctta 19588716  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  19588715 tctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctttttttgttgttgttgcttggagacgctttatctattgattacca 19588617  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19588616 cttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtcc 19588569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 2175000 - 2175197
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175000 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 2175099  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  2175100 ccattgatttctctttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 2175197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 38882187 - 38882384
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38882187 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 38882286  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  38882287 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 38882384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 135 - 394
Target Start/End: Original strand, 42127440 - 42127696
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42127440 tagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgcttat 42127538  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  42127539 ctttattg-ttttgattatgcttgtggtgttgctctacaattagatttaagtctg-ttttgttgttgttgcttggagacactttatccattgattaccac 42127636  T
Q  335 ttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaa 394  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||    
T  42127637 tttctttgctccacacatctttgttattcattagtgtgattttgtccgaattcacaacaa 42127696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Original strand, 17003989 - 17004234
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17003989 atagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tttctttcattgctta 17004087  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  17004088 tcttttttgc-tttgattatgcttgtggtgttgct-tacacttagatttaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattacca 17004185  T
Q  334 cttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  17004186 cttccttttgctccacacctctttgtttttcattggtgtgattttgtcc 17004234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6745149 - 6745347
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745149 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 6745248  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6745249 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6745347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 31545161 - 31545359
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545161 gttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 31545260  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31545261 cccattgatttctctttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31545359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 18466765 - 18466963
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466765 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 18466864  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  18466865 ccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 18466963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 27910531 - 27910729
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910531 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 27910630  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  27910631 ccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27910729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 4236710 - 4236899
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236710 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 4236809  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactg 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||    
T  4236810 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactg 4236899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373137
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3373221  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 3373137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14520298 - 14520056
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  14520298 atagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttccttt-ctttcagtgct 14520200  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  14520199 tatctttgt-gcttt-gtttatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattac 14520102  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14520101 cacttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgatttt 14520056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 31542816 - 31543013
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  31542816 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aa 31542914  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31542915 cccattgatttctctttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31543013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6747386 - 6747583
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747386 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 6747485  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6747486 tcattgatttctttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6747583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10529297 - 10529099
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529297 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 10529198  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  10529197 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 10529099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25921671 - 25921473
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25921671 gttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 25921572  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  25921571 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 25921473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 27912617 - 27912815
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912617 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 27912716  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  27912717 ccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27912815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21684649 - 21684452
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21684649 gttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 21684550  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  21684549 tcattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 21684452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749979
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10749895  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 10749979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16776239 - 16776436
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16776239 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa- 16776337  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  16776338 ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaa 16776436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 39854564 - 39854762
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854564 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 39854663  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||  ||||||||    
T  39854664 ccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaa 39854762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34477252 - 34477053
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  34477252 gttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgta 34477153  T
Q  99 acccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  34477152 acccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 34477053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 21948107 - 21948305
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948107 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaac 21948206  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  21948207 cccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaa 21948305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 135 - 349
Target Start/End: Original strand, 24553537 - 24553748
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24553537 tagtggagtggagg-ctgctctctcccatagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgcttat 24553634  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  24553635 ctttattgcttt-gattatgcttgtggtgtttctctacacttagatttaggtctgtttttgttgatgttgcttggagacactttatccattgattatcac 24553733  T
Q  335 ttcctttgttccaca 349  Q
    |||||||| ||||||    
T  24553734 ttcctttgctccaca 24553748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3880367 - 3880127
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  3880367 atagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaatcttggtgtg-ttgttcc-tttctttcattgctta 3880270  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  3880269 tctttattgc-tttgattatgcttgtggtgttgctttacacttagatttaggtctgttt---ttgttgttgattgaagacactttatctattgattacca 3880174  T
Q  334 cttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3880173 cttccttttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 3880127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 25804106 - 25804300
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804106 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 25804205  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaa 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||    
T  25804206 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 25804300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 39798128 - 39798326
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798128 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 39798227  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  39798228 ccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 39798326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34479617 - 34479418
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  34479617 gttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgta 34479518  T
Q  99 acccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  34479517 acccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 34479418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 10586913 - 10587111
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10586913 gttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaac 10587012  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct-cccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  10587013 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 10587111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 135 - 389
Target Start/End: Original strand, 11181862 - 11182116
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctccccc-agattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  || | || ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  11181862 tagtggattggagggttgctctctccccctagagtaggtcatattagaccgaactaggttacca-tcttggtgtgtttgttcattt-ctttcattgctta 11181959  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttt--tgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  11181960 tctttattgcttt-gattatgcttgtggtattgctctacacttagatttaagtctgtttttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattac 11182058  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcac 389  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  11182059 cacttactttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgttcaaattcac 11182116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 18469092 - 18469279
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18469092 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 18469191  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactg 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||  | || ||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||    
T  18469192 ccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctctct--cccagactaggtcaatttggaccgaactg 18469279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 133 - 377
Target Start/End: Original strand, 11917000 - 11917245
Alignment:
Q  133 tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctt 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  11917000 tatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctcggtgtgtttgttcc-tttctctcattgctt 11917098  T
Q  233 atctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtc---tgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    |||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||| || || ||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  11917099 atctttattgc-actgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagatctaggtctttttttttttttttttttgcttgaagacactttacacattgatt 11917197  T
Q  330 accacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11917198 accacttcctttgcttcacacatctttgttattcattggtgtgatttt 11917245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 658551 - 658356
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658551 gttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 658452  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||   ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  658451 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 658356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Original strand, 9353361 - 9353579
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  9353361 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc--ttctttcattgct 9353458  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| ||   ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||    
T  9353459 tatctttgtt--ctttgtatatgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgtttac 9353554  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatcttt 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  9353555 cacttcctttgctccacacatcttt 9353579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757455
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaa 10757455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354575
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15354575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15464600 - 15464380
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  | ||||||||| |||    
T  15464600 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtt--tcttctttcattgct 15464503  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  15464502 tatctttattg-ttttggttatacttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattac 15464406  T
Q  332 cacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||    
T  15464405 cacttccttttgctccacacatcttt 15464380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20506039 - 20505843
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506039 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 20505940  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  20505939 acattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20505843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665322
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 23665322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793265
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 23793265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18511410 - 18511212
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511410 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaac 18511311  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || ||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  18511310 ccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 18511212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356851
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15356851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960132
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 38960132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2818532 - 2818335
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  2818532 ttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 2818433  T
Q  102 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  2818432 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 2818335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 24126938 - 24127135
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  24126938 ttgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaact 24127037  T
Q  102 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  24127038 cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 24127135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 40221603 - 40221802
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40221603 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 40221702  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  40221703 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 40221802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Original strand, 36932379 - 36932623
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  36932379 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttccttt--tttcattgct 36932476  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    ||||||| ||   |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  36932477 tatctttgtt--ctttgtttatgcttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgatta 36932572  T
Q  331 ccacttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||| || | ||||| ||||| |||||||    
T  36932573 cctcttccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgagtttgtcc 36932623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 695959 - 696157
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  695959 gttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 696057  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  | |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  696058 ccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 696157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26097814 - 26098010
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097814 gttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 26097912  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  26097913 tcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggctgctctctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaa 26098010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 2954498 - 2954695
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2954498 gttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaac 2954597  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| | |||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  2954598 ccattgatatctctttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaactaggtcaattttgaccgaactgggtcaacaa 2954695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741859
Alignment:
Q  23 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 121  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctttgtaac 23741936  T
Q  122 gaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23741935 gttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 23741859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 378
Target Start/End: Original strand, 31300626 - 31300867
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  31300626 tagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-tctctttcattgcttat 31300724  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccac 334  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| | ||| |||||  |||||||||||     
T  31300725 ctttattg-ttttgattacacttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctg-ttttgttgtttttgcttgaaaacactttatctattgattaccag 31300822  T
Q  335 ttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttg 378  Q
    |||| |||| || | |||||||| || ||||||  ||||||||||    
T  31300823 ttccttttgctcaatacatctttatttttcattagtgtgattttg 31300867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18509516 - 18509318
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18509516 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaac 18509417  T
Q  101 ccattgatttct-ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     | ||||| |||  ||||||| |  ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||  ||||||||    
T  18509416 tcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaa 18509318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 18596726 - 18596924
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18596726 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 18596825  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
     ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  18596826 tcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 18596924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 25904184 - 25904382
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25904184 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaac 25904283  T
Q  101 ccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  25904284 acattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 25904382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41585942 - 41585744
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  41585942 gttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggagacttatttttgtaag 41585843  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  41585842 tcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 41585744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1189807 - 1189607
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1189807 gttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaat 1189708  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc-cccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||| | |||||||||  |||||| |||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  1189707 ccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctctctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 1189608  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  1189607 a 1189607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Original strand, 12084204 - 12084376
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  12084204 atagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaatattttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgct 12084302  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgctt 307  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12084303 tatctttgt-gcttt-gattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgtttttgttgctt 12084376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16092398 - 16092223
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092398 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 16092299  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca 174  Q
    |||||||  |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  16092298 ccattgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtca 16092223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10474521 - 10474323
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10474521 gttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 10474422  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  10474421 ccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 10474323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17072964 - 17073163
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17072964 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaac 17073063  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  17073064 tcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 17073163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17818688 - 17818492
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17818688 gttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaac 17818589  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||||| ||||||   |||||||  ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  17818588 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggct--tctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 17818492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37705978 - 37705780
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37705978 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaac 37705879  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | ||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  37705878 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 37705780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6756575 - 6756771
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6756575 gttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa- 6756673  T
Q  101 ccattgatttc-tctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||| || | ||||||| |  || ||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6756674 -cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagt-gaaacgagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaa 6756771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39398191 - 39398003
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  39398191 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaac 39398092  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 188  Q
    |||||||| |||| ||||| |||  ||  || |||||||  |  ||| |||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||    
T  39398091 ccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaact 39398003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31472811 - 31472612
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  31472811 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaac 31472712  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  31472711 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 31472612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 2723985 - 2724172
Alignment:
Q  3 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||         |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2723985 tgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcgggtgatttattcttgtaaccc 2724075  T
Q  103 attgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||| ||||||| ||||    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  2724076 attgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 2724172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 9020299 - 9020490
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9020299 gttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 9020398  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtc-atattggaccgaactg 189  Q
    |||||||| |||| |||||||    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||    
T  9020399 ccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgttttggaccgaactg 9020490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 34530864 - 34530749
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34530864 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaac 34530765  T
Q  101 ccattgatttctcttt 116  Q
     ||||||| |||||||    
T  34530764 tcattgatatctcttt 34530749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36402526 - 36402352
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||     
T  36402526 gttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaat 36402427  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca 174  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   || | ||||||||||||||||| |||||||    
T  36402426 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctctctcccccagactaggtca 36402352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38192241 - 38192020
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt---ggtgtgtttgttccttttctttcatagc 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||   |||||||||||||  || ||||| | ||    
T  38192241 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc--ttcctttctt-gc 38192146  T
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtt-tgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    |||||||  |||||||  ||| | || ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  38192145 ttatcttgtttgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacact-ag-tctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagatt 38192048  T
Q  330 accacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38192047 accacttccttttgctccacacatcttt 38192020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38219466 - 38219245
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt---ggtgtgtttgttccttttctttcatagc 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||   |||||||||||||  || ||||| | ||    
T  38219466 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc--ttcctttctt-gc 38219371  T
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtt-tgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    |||||||  |||||||  ||| | || ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  38219370 ttatcttgtttgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacact-ag-tctagggctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagatt 38219273  T
Q  330 accacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38219272 accacttccttttgctccacacatcttt 38219245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31466176 - 31466040
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31466176 gttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaac 31466078  T
Q  101 ccattgatttct-ctttgtaacgaaactcatcatatag 137  Q
    |||||||| |||  ||||||| |  |||||||||||||    
T  31466077 ccattgatatctattttgtaaagttactcatcatatag 31466040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6661384 - 6661193
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6661384 gttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaac 6661285  T
Q  101 ccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcata-ttggaccgaactg 189  Q
    |||||||| ||||||| |||| |   ||||| || ||||||||  ||| | |||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  6661284 ccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagactaggtcagatttggaccgaactg 6661193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 21288851 - 21289040
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  21288851 gttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaac 21288949  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||      ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  21288950 tca------tct-tttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 21289040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170992
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 1170906  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  1170907 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 1170992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17413365 - 17413176
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||| ||||||||||||   | | |||||||||||||||    
T  17413365 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaac 17413266  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaac 187  Q
    || ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  17413265 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcagtgttggaccgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385452
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 35385539  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  35385538 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 35385452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 389
Target Start/End: Original strand, 33030970 - 33031227
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| | |||    
T  33030970 tagtgaattggagagctgctctctcccccagagtatgtcatatttgaccgaactgaattaacaatctttgatgtgtttgttcctttattttcattggtta 33031069  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatcta----ggtctgtttttgttgttgttgcttggaga-cattttattcattgat 328  Q
    |||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| ||      | |||| ||||||||| ||||||  || || ||||| |||| ||    
T  33031070 tctttattgc-tttgattattctcgtggtattgctctacacttagatttatatttatttgttgttgttgttggtgcttgaggatcactttatccattaat 33031168  T
Q  329 taccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcac 389  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||| |  || |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  33031169 tactatttcctttgctccacacatctttat--tttattggtgtgtttttgtccaaattcac 33031227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208855
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaa 36208755  T
Q  100 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  || |||||||||| | ||||| | |||||||  ||||||||||||| || ||||    
T  36208756 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctct-ttccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 36208854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667597
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| | |||||  |||||||||||  |||||||||||  | ||| || |||| |||||||||||||||||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||    
T  23667514 ttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaa 23667597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10281819 - 10281733
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttccttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10281819 atagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttccttt 10281733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 20045091 - 20045172
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20045091 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445678
Alignment:
Q  22 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| || ||   || |||||||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttgtaa 25445596  T
Q  121 cgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     |||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  25445597 agaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 25445678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24135915 - 24135663
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa---tcttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||   |||||||||||||||||  || ||||  |||||    
T  24135915 tagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtgtttgttc--ttccttttctagct 24135819  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttg-ttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    ||||||  |||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||    
T  24135818 tatcttgtttgctttgtattat-cttgtggtgttgctctacac-tag-tctagggctg-ttttgttgttgtttgcttggagactctttactcatagatta 24135723  T
Q  331 ccacttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtga-ttttgtccagattcac 389  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  24135722 ccactcccttttgctccacacatctttatt-ttcattggtgtgagttttatccggattcac 24135663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6741916 - 6741784
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt-ggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatct 236  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  6741916 tggattggagagctgctctatcccccagagtatgtcatattgaaccgaactgtgttaataatctttggtgtgtttgttcattt-ctttcattgcttatct 6741818  T
Q  237 ttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctcta 271  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6741817 ttattgc-tttgattatgcttgtggtgttgttcta 6741784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22673016
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 22672932  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  22672933 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 22673016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452677
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| || ||   || |||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttgt 25452593  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  25452594 aaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagaataggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 25452677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12556121 - 12555926
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | | ||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||    
T  12556121 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaaga-gattggagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaac 12556023  T
Q  101 ccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaa 195  Q
     |||||  || ||| |||||||||  ||||||| || || | |  ||||||||||| ||||||||| | ||| |||  |||||| |||||| |||||    
T  12556022 tcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgctatctcccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaa 12555926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 20043131 - 20043208
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  20043131 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143735
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaa 186  Q
    || ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  || | |||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaa 15143735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 20053924 - 20054116
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20053924 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt-----tggagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 20054018  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    ||   ||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||| ||| | ||||||| | ||||||||||||| || ||||    
T  20054019 cc---gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaaca 20054115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35387730 - 35387511
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt---ggtgtgtttgttccttttctttcatagc 230  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||   |||||||||||||  || ||||| | ||    
T  35387730 atagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaattgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc--ttcctttctt-gc 35387635  T
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    ||||||   |||||||  ||| | || |||| ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||    
T  35387634 ttatctcgtttgctttgtattctctt-gtggagttgctctacact-aga-ctagggttgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagatta 35387538  T
Q  331 ccacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||    
T  35387537 tcacttccttttgctccacacatcttt 35387511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298011
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2298088  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaact 188  Q
    | ||| |||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  2298087 tataaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctcccccccagactaggtcatcattagaccgaact 2298011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17841428 - 17841249
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  17841428 cactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctggaac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 17841333  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  17841332 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 17841249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786586
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||   | ||| | ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  28786407 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggcagaattaggtttgaagattgattcttgtaactca---atatctctttgt 28786502  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||| ||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  28786503 aaagaaactcatatcattataatggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 28786586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 1240428 - 1240586
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  1240428 aaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 1240523  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  1240524 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccaaactaggtcat 1240586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 268
Target Start/End: Original strand, 28278379 - 28278553
Alignment:
Q  91 ttcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactg 189  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||   |||||||||||||| | |   ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  28278379 ttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa--aaactcattg-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactg 28278475  T
Q  190 agtcaacaat-cttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgct 268  Q
     || |||||| |||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  28278476 ggtgaacaattcttggtgtgtttctttcttt-ctttcattgcttatctttattgc-tttgattatgattgtggttttgct 28278553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 268
Target Start/End: Original strand, 38747129 - 38747241
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatctttattgcttttgattat 253  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  38747129 tctctccctcagatcaggtcaagttggaccaaactgggtcaataatcttggtggatttgttcc-tttctttaattgcttatctttattgc-tttgattat 38747226  T
Q  254 gtttgtggtgttgct 268  Q
    | ||||||| |||||    
T  38747227 gattgtggttttgct 38747241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 116
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771006
Alignment:
Q  46 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 116  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttt 42771006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2144763 - 2144599
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||    
T  2144763 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgta 2144664  T
Q  99 acc-cattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 161  Q
    |||   || || ||||||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2144663 accttttttatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4898010
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttg 117  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  118 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||| |  |||||||| ||||| |||   | |||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||| || |||||    
T  4897928 taaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaa 4898010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 395
Target Start/End: Original strand, 42126625 - 42126695
Alignment:
Q  325 tgattaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaat 395  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||||    
T  42126625 tgattaccacttcctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttatccgaattcacaacaat 42126695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962505
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 11962517  T
Q  119 aacgaaactcat 130  Q
    || |||||||||    
T  11962516 aaagaaactcat 11962505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 32636948 - 32637009
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  32636948 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 32637009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8565990 - 8565930
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8565990 tctctcacccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatcttggtgtgtttgtt 8565930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 19806487 - 19806551
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19806487 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggggtgtttgttcct 19806551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30631470 - 30631407
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  30631470 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgagtcaacaatctt 30631407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30682966 - 30682903
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  30682966 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactg-gtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 30682903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31180278 - 31180215
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  31180278 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 31180215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Original strand, 42770853 - 42770934
Alignment:
Q  5 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagact 88  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770853 attcaccatgggaaac--tattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43592343 - 43592280
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  43592343 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 43592280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627524
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| | |||||||||||||   | ||||| ||||||||||||| |  || ||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tgaatatctctt 10627461  T
Q  116 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat 175  Q
    |||||  ||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10627462 tgtaaataaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagagtaggtcat 10627524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782464
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||| |  || | ||||    
T  31782639 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccc-tcaatatttctt 31782542  T
Q  116 tgtaacgaaactca---tcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactg 189  Q
    ||||| ||||||||   |  |||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  31782541 tgtaaagaaactcatattattatagtagaatggagagttgctctctcccccagagtagatcatcattagaccgaactg 31782464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Original strand, 40222769 - 40222909
Alignment:
Q  23 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 121  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||||     
T  40222769 tattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctggaac-ttgggtagaattatgtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgtaaa 40222864  T
Q  122 gaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctccccc 163  Q
    |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  40222865 gaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccc 40222909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2785439 - 2785339
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggt--gtgtttgttccttttctttcatagcttatc 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||| || | |||||    
T  2785439 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcttttccttttatcgtttatc 2785341  T
Q  236 tt 237  Q
    ||    
T  2785340 tt 2785339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 26098449 - 26098395
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 55  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26098449 gttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagag 26098395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 31397014 - 31397114
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggt--gtgtttgttccttttctttcatagcttatc 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||| |  |||||||||  |||||||| || | |||||    
T  31397014 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgtttgttttcttttatcgtttatc 31397112  T
Q  236 tt 237  Q
    ||    
T  31397113 tt 31397114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 31401871 - 31401971
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggt--gtgtttgttccttttctttcatagcttatc 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||||| || | |||||    
T  31401871 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgtttatc 31401969  T
Q  236 tt 237  Q
    ||    
T  31401970 tt 31401971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 4754235 - 4754312
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||  || |||||||| ||||||||||    
T  4754235 ttgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 16093473 - 16093413
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || |||||||||||    
T  16093473 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggac-ttaggtagaattag 16093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26098373 - 26098288
Alignment:
Q  114 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc-ccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26098373 tttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaa 26098288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 28807593 - 28807657
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  28807593 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 28807657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 37556643 - 37556707
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  37556643 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 37556707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 37561465 - 37561529
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  37561465 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 37561529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 1457183 - 1457246
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  1457183 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 1457246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10281728 - 10281672
Alignment:
Q  338 ctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  10281728 ctttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtccaaattcacaacaa 10281672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15044750 - 15044687
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  15044750 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 15044687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27449878 - 27449815
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  27449878 tggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 27449815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28537600 - 28537429
Alignment:
Q  230 cttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt--------ttgttgttgttgcttggagac-attttat 320  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| || ||||||||        ||||||||||||||| ||||| | ||||     
T  28537600 cttatctttgttgattttgattatgtttgtggtgctgttttacacttagat-tatgtctgtttttttgttgttgttgttgttgctt-gagactactttac 28537503  T
Q  321 tcattgattaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaa 394  Q
    ||||||||||| || |  |||| |||| |||||||| | |||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||    
T  28537502 tcattgattactaccttttttgctccatacatctttgtaattcattggtatgattttgaccaaattcacaacaa 28537429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28750699 - 28750635
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28750699 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaattgggtcaataatctttggtgtgtttgttcct 28750635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 198
Target Start/End: Original strand, 42238298 - 42238442
Alignment:
Q  55 ggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggc 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||    
T  42238298 ggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagc 42238393  T
Q  151 tgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  42238394 tgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 42238442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33791380 - 33791280
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggt--gtgtttgttccttttctttcatagcttatc 235  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||| || | |||||    
T  33791380 tggattggagagctgctctttcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcttttccttttatcgtttatc 33791282  T
Q  236 tt 237  Q
    ||    
T  33791281 tt 33791280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 34033768 - 34033714
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 55  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  34033768 ttgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagag 34033714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42428474 - 42428412
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttc 215  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  42428474 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttagtgtgtttgttc 42428412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 43598788 - 43598746
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgg 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43598788 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 43598746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 43604280 - 43604238
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgg 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43604280 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 43604238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 43609772 - 43609730
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgg 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43609772 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 43609730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5887478 - 5887417
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  5887478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaattggatcaacaatctttggtgtgtttgtt 5887417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 31183095 - 31183156
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  31183095 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacattctttggtgtgtttgtt 31183156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33768243 - 33768179
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  33768243 tggattggagagctgctctcccccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 33768179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 34842577 - 34842454
Alignment:
Q  230 cttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt-ttgttgttgttgcttggagacattttattcattgat 328  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |  | |||| || |||||    
T  34842577 cttatctttgttgcttcggat-atgcttgtggtgttgcttcacacttagatctaggtttgtttattgttgttgctgcttgaggctactttactc-ttgat 34842480  T
Q  329 taccacttcctttgttccacacatct 354  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||    
T  34842479 tactacttcctttactccacacatct 34842454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 202
Target Start/End: Original strand, 533893 - 533941
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  533893 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctt 533941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27445034 - 27444971
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||| ||||||||||||    
T  27445034 tggattggagagctgctctctcccccagattaggctatatt-gcctgaactgggtcaacaatctt 27444971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39468593 - 39468529
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  39468593 tctctcccccatattaggttaaattggactgaactgggtcaacaatctttagtgtgtttgttcct 39468529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2630299 - 2630127
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttg-ttccttttctttcatagctt 232  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||| || |  ||||||||||||||||||||  || |||||| ||| || ||||| ||  || |||| | |  |||    
T  2630299 atagtggattgaagagctgctatctccctcaaagcaggtcatattggaccgaactaggttaacaatattgatgcgtttgttttattctcttcctt--ctt 2630202  T
Q  233 atctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctagg----tctgtttttgttgttgttg 304  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    | |||||||||||||||||    
T  2630201 atctctattgc-tttaaatatgcttgtggtgttgctctgcacttagatttaggcctatttgtttttgttgttgttg 2630127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 74
Target Start/End: Original strand, 29748443 - 29748502
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaa 74  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  29748443 gaaacactaataggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430338
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattagg 35430338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 211
Target Start/End: Original strand, 538149 - 538207
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgttt 211  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  538149 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgttt 538207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 16452204 - 16452265
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaaca-atcttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  16452204 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttcttggtgtgtttgtt 16452265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 33831804 - 33831865
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  33831804 tctctcccccatattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctttggtgtttttgtt 33831865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36263877 - 36263812
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccaga-ttaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||| || |||||    
T  36263877 atagtggattggagagctgctctctcccctagacataggtcatattgggccggactgggtaaacaa 36263812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 202
Target Start/End: Original strand, 13488327 - 13488375
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13488327 tctctccccgagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaataatctt 13488375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15445376 - 15445253
Alignment:
Q  90 attcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaa 186  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  | |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| |||    
T  15445376 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaa 15445278  T
Q  187 ctgagtcaacaatcttggtgtgttt 211  Q
    ||| || |||||  || ||||||||    
T  15445277 ctgggtaaacaaatttcgtgtgttt 15445253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42426279 - 42426215
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  42426279 tctctccccctgattaggtcaagttggactgaactaggtcaacaatcttttgtgtgtttgttcct 42426215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 2970 - 3167
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2970 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 3069  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3070 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatctccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaa 3167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 5)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 134 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2560 - 2317
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2560 atagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgctta 2462  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| | ||    
T  2461 tctttattgcttt-gattatgcttgtggtgttgttctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgatcaaca 2363  T
Q  334 cttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| | | |||||||||||    
T  2362 cttcctttgctccacacatctttgttattcttcggtgtgattttgt 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 134 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5751 - 5490
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagctta 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5751 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttccttt-ctttcattgctta 5653  T
Q  234 tctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgct---tggagacattttattcattgatta 330  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| || | | ||||||||    
T  5652 tctttattgcttt-gattatgcttgtggtgtttctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgttgtttggagacacttaact-attgatta 5555  T
Q  331 ccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtc-cagattcacgacaa 394  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5554 ccacttcctttactccacacatctttgttattcattggtgtgattttgtctcagattcacaacaa 5490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 381
Target Start/End: Original strand, 133309 - 133554
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||  ||    
T  133309 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc--ttctttcattact 133406  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttt-tgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||    
T  133407 tatctttattgc-tttgtatatgcttgtgatgttgctctatac-taga-ctatgtctgttttgctttgttgttgtttggagacactttacacattgatta 133503  T
Q  331 ccacttcc-tttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtcc 381  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  133504 tcacttccttttgctccacacatctttgtt-tacattggtgtgattttgtcc 133554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224961
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 224914  T
Q  116 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcc 160  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  224915 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcc 224961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 149141 - 149080
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 214  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  149141 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtatttgtt 149080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 69489 - 69292
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69489 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 69390  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  69389 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 69292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 131 - 329
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  131 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaa 230  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  231 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6289 - 6487
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6289 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaa 6388  T
Q  100 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6389 cccattgatttctctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaa 6487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41681 - 41483
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41681 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaac 41582  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  41581 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaa 41483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 79275 - 79473
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79275 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 79374  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  79375 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaa 79473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 135 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10796 - 10552
Alignment:
Q  135 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttat 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  10796 tagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttggtgtgtttgttcc-tctctttcattgcttat 10698  T
Q  235 ctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattacca 333  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||  || ||||||||    
T  10697 ctttattgc-tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgcttggagtaactttatctatcgattacca 10599  T
Q  334 cttc-ctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgt 379  Q
    ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10598 cttctttttgctccacacatctttgttattcattggtgtgattttgt 10552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14580 - 14382
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14580 gttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 14481  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  14480 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 14382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15109 - 15307
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15109 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaac 15208  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  15209 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaa 15307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 29261 - 29458
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29261 gttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 29360  T
Q  101 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  29361 tcattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 29458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11671 - 11473
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11671 gttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaac 11572  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  11571 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaa 11473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 138 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17327 - 17075
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatctt 237  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  17327 tggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaattttggtgtgtttgctccttt-ctttcatttcttatctt 17229  T
Q  238 tattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttc 337  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17228 tattgcttta-attatgcttgtggtgttgctctatacttagatttaggtatgtttttgttgttgtt---tggagacattttatctattgattaccacttc 17133  T
Q  338 ctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgattttgtccagattcacgacaat 395  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  17132 ctttgctccacacatctttgttattcattcatgtgattttgtccgaattcacaacaat 17075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 134 - 375
Target Start/End: Original strand, 43990 - 44227
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  43990 atagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctt--ctttcattgct 44087  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| ||   |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  44088 tatctttgttc--tttgtttatgcttgtggtgttgctctacact-agat-taggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattac 44183  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  44184 cacttcctttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgatt 44227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 134 - 377
Target Start/End: Original strand, 36861 - 37102
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt--ggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || |||    
T  36861 atagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttccttt-cttttattgct 36959  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| | ||||| | ||||  ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  36960 tatctttgt-gcttt-gtttatacttgtggtgttggtctacaccaag-tctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattac 37056  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | |||||||||    
T  37057 cacttcctttgctccacacatctttgtttttcatcggtgtgatttt 37102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 183838 - 183641
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183838 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 183740  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  183739 ccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 183641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 52102 - 52301
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  52102 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaact 52201  T
Q  102 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg--ctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  52202 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaa 52301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 137 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 85748 - 85512
Alignment:
Q  137 gtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttccttttctttcatagcttatct 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  85748 gtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatctagatgtgtttgtt-cttttctttcattgcttatct 85650  T
Q  237 ttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccactt 336  Q
    ||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  85649 tt-gtgc-tttggttatgcttgtgatgttgctctacacttagatctaggtctg-ttttattgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 85553  T
Q  337 cctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||||| || |||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  85552 cctttgctctacacatctttgtttttcattggtgtgatttt 85512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 4086 - 4283
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4086 gttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 4185  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  4186 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaa 4283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22403
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24678
Alignment:
Q  16 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  115 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 24678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8669
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  | ||||||||| |||    
T  8448 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtt--tcttctttcattgct 8545  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctg-tttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatta 330  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  8546 tatctttattg-ttttggttatacttgtggtgttgctctacac-taga-ctaggtctgttttttgttgttattgcttggagacactttacacattgatta 8642  T
Q  331 ccacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||    
T  8643 ccacttccttttgctccacacatcttt 8669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45321 - 45103
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc--ttggtgtgtttgttccttttctttcatagct 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  45321 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaatcttttggtgtgtttgttc--attctttcattgct 45224  T
Q  232 tatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattac 331  Q
    ||||||| ||   ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  45223 tatctttgtt--ctttgtatatgtttgtggtgttgctctacac-taga-cttggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattac 45128  T
Q  332 cacttcctttgttccacacatcttt 356  Q
    |||||| |||| |||||||||||||    
T  45127 cacttcatttgctccacacatcttt 45103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 2131 - 2293
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2131 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaac 2230  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 162  Q
    ||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  2231 ccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctactctctcccc 2293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 79950 - 80147
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  79950 gttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaac 80048  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| ||||||||    
T  80049 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaa 80147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  17 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1841 - 1641
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1841 gttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaac 1742  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||||| || ||||    
T  1741 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagtttttgaccgaactgggtaaaca 1642  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  1641 a 1641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16020 - 15820
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16020 gttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaac 15921  T
Q  101 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgagtcaaca 197  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||||| || ||||    
T  15920 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaaca 15821  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  15820 a 15820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 85320 - 85495
Alignment:
Q  1 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  85320 gttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaac 85419  T
Q  101 ccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca 174  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  85420 ccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtca 85495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16848 - 16734
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16848 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacc 16749  T
Q  102 cattgatttctcttt 116  Q
    ||||||| |||||||    
T  16748 cattgatatctcttt 16734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Original strand, 35733 - 35819
Alignment:
Q  5 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 91  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35733 attcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Original strand, 17981 - 18201
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc---ttggtgtgtttgttccttttctttcatagc 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||   |||||||||||||||  || ||||| | ||    
T  17981 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc--ttcctttc-ttgc 18076  T
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    |||||||  |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  18077 ttatcttgtttgctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-tag-tctagggctggtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagatt 18173  T
Q  330 accacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18174 accacttccttttgctccacacatcttt 18201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 356
Target Start/End: Original strand, 24074 - 24294
Alignment:
Q  134 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc---ttggtgtgtttgttccttttctttcatagc 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||   |||||||||||||||  || ||||| |  |    
T  24074 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc--ttcctttc-tttc 24169  T
Q  231 ttatctttattgcttttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgatt 329  Q
    |||||||  || ||||  ||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  24170 ttatcttgttttctttgtattct-cttgtggtgttgctctacac-tag-tctagggctggtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagatt 24266  T
Q  330 accacttcc-tttgttccacacatcttt 356  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24267 accacttccttttgctccacacatcttt 24294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 4901 - 5089
Alignment:
Q  2 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  ||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4901 ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 5000  T
Q  102 cattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaa 186  Q
    ||||||| ||||  ||||||| || |||||||| |||||||||    ||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5001 cattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccagactaggtcagtattggaccgaa 5089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1805 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1805
Description:

Target: scaffold1805; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 267 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1344 - 1234
Alignment:
Q  267 ctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgttccacacatcttt-cttattcat 365  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||    
T  1344 ctctacactaag-tctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccacttcctttgctccacacatctttgttttttcat 1246  T
Q  366 tgatgtgatttt 377  Q
    || |||||||||    
T  1245 tggtgtgatttt 1234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16507
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttggaactca---atatctctttgt 16423  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  16424 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 16507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 16986
Alignment:
Q  20 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||   ||  | |||||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaagctaggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaac---ttattatctctttgt 17070  T
Q  119 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    || |||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  17069 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 16986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23482 - 23357
Alignment:
Q  251 tatgtttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgttccacac 350  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||   ||| |||||||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  23482 tatgcttgtggtgttgctttacacttagttttataactg-ttttgttgttattgcttgaggatattttactcattgattaccacttcctttgctcaacac 23384  T
Q  351 atctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    ||||||  | || |||| |||||||||    
T  23383 atctttactttttattggtgtgatttt 23357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43173 - 43084
Alignment:
Q  288 tgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||| |||||||||||| |||  || | |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  43173 tgttgttgttgttgttggttgaggatactttactcattgattaccacttcctttgcttcacacatttttgtttttcattggtgtgatttt 43084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 427 - 363
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  427 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 9663 - 9726
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9663 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 9726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20395
Alignment:
Q  154 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa-tcttggtgtgtttgttcct 217  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  20459 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttttggtgtgtttgttcct 20395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3161 - 3070
Alignment:
Q  110 tctctttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcat-attggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  3161 tctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaa 3070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 14330 - 14394
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  14330 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 14394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 237
Target Start/End: Original strand, 19189 - 19286
Alignment:
Q  141 attggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggt--gtgtttgttccttttctttcatagcttatctt 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| | |||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||||| || | |||||||    
T  19189 attggagagctgctctctcccccagattaggccacaatgg-ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgtttatctt 19286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 377
Target Start/End: Original strand, 29671 - 29760
Alignment:
Q  288 tgtttttgttgttgttgcttggagacattttattcattgattaccacttcctttgttccacacatctttcttattcattgatgtgatttt 377  Q
    |||| |||||||||||| |||  || | |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  29671 tgttgttgttgttgttggttgaggatactttactcattgattaccacttcctttgcttcacacatttttgtttttcattggtgtgatttt 29760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 181985 - 182049
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  181985 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 182049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 35083 - 35146
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||    
T  35083 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggttaacaatctt 35146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4679
Alignment:
Q  144 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaa 4679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 221
Target Start/End: Original strand, 2272 - 2356
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggt--gtgtttgttccttttc 221  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||    
T  2272 tggattggagagctactctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttc 2356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 221
Target Start/End: Original strand, 148977 - 149061
Alignment:
Q  138 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggt--gtgtttgttccttttc 221  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||    
T  148977 tggattggagagctactctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttc 149061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University