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Alignment Overview

Query: NF14664_low_22 (Length: 425)

Name: NF14664_low_22
Description: NF14664
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14664_low_22
NF14664_low_22
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (9-322)||(4582981-4583294)
chr5 (9-322)||(4920688-4921001)
chr5 (9-322)||(5908602-5908915)
chr5 (9-322)||(17853207-17853518)
chr5 (9-322)||(40517668-40517981)
chr5 (9-321)||(29245866-29246178)
chr5 (9-216)||(35311685-35311891)
chr5 (9-237)||(28045517-28045745)
chr5 (9-247)||(12834563-12834802)
chr5 (15-244)||(42987471-42987700)
chr5 (9-247)||(12866540-12866779)
chr5 (9-322)||(13401918-13402229)
chr5 (9-247)||(22694891-22695128)
chr5 (9-245)||(15890069-15890304)
chr5 (9-201)||(1218619-1218809)
chr5 (25-195)||(6092559-6092729)
chr5 (3-322)||(20973410-20973718)
chr5 (9-322)||(30996459-30996770)
chr5 (9-190)||(3564773-3564954)
chr5 (9-247)||(6155909-6156145)
chr5 (9-225)||(27302746-27302959)
chr5 (9-211)||(35194014-35194215)
chr5 (9-235)||(2985010-2985235)
chr5 (17-250)||(6369566-6369798)
chr5 (9-173)||(27088415-27088577)
chr5 (9-235)||(38006470-38006695)
chr5 (9-250)||(2412712-2412952)
chr5 (9-166)||(3573087-3573243)
chr5 (16-201)||(12447251-12447435)
chr5 (9-189)||(30115346-30115525)
chr5 (9-216)||(8453393-8453598)
chr5 (9-322)||(18206880-18207193)
chr5 (161-322)||(33727915-33728076)
chr5 (124-247)||(10127058-10127174)
chr5 (41-150)||(33862270-33862378)
chr5 (9-92)||(10126970-10127053)
chr5 (157-316)||(16311213-16311372)
chr5 (88-193)||(15564577-15564682)
chr5 (156-247)||(28569010-28569101)
chr5 (265-326)||(6810264-6810325)
chr5 (265-322)||(35311931-35311988)
chr5 (41-125)||(42717742-42717826)
chr5 (48-119)||(2681096-2681166)
chr5 (130-249)||(27900388-27900507)
chr5 (67-129)||(33420437-33420498)
chr5 (138-247)||(38972913-38973022)
chr5 (122-247)||(40187646-40187770)
chr5 (43-119)||(20634055-20634130)
chr5 (43-119)||(20650169-20650244)
chr5 (265-321)||(22694817-22694873)
chr5 (130-193)||(29664954-29665017)
chr5 (48-119)||(34259140-34259210)
chr5 (122-195)||(7350448-7350521)
chr5 (265-322)||(12447486-12447543)
chr5 (278-322)||(6155834-6155878)
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (9-322)||(22535754-22536067)
chr3 (9-322)||(34025816-34026129)
chr3 (9-322)||(44953348-44953661)
chr3 (9-322)||(52572471-52572784)
chr3 (9-250)||(29842170-29842410)
chr3 (38-327)||(44639165-44639454)
chr3 (9-322)||(49579926-49580239)
chr3 (9-329)||(39655179-39655499)
chr3 (9-322)||(43582440-43582752)
chr3 (9-247)||(44172488-44172726)
chr3 (9-247)||(44179188-44179426)
chr3 (9-247)||(20086871-20087097)
chr3 (17-247)||(23580698-23580927)
chr3 (9-247)||(44252609-44252847)
chr3 (9-247)||(48390805-48391042)
chr3 (14-322)||(7469691-7469999)
chr3 (9-247)||(34154280-34154514)
chr3 (9-322)||(29284198-29284511)
chr3 (9-247)||(52198016-52198255)
chr3 (9-247)||(39728533-39728771)
chr3 (9-322)||(6738318-6738620)
chr3 (15-247)||(44106781-44107012)
chr3 (9-243)||(17146142-17146376)
chr3 (9-235)||(49025543-49025768)
chr3 (9-322)||(53631767-53632079)
chr3 (52-325)||(23153975-23154246)
chr3 (16-235)||(10823696-10823912)
chr3 (9-247)||(4557293-4557530)
chr3 (9-322)||(4015957-4016269)
chr3 (9-250)||(34119521-34119759)
chr3 (41-322)||(54317039-54317319)
chr3 (41-247)||(42758269-42758474)
chr3 (3-121)||(48306650-48306768)
chr3 (9-250)||(19111598-19111837)
chr3 (9-172)||(30682684-30682846)
chr3 (9-201)||(31126829-31127020)
chr3 (116-247)||(48305629-48305760)
chr3 (9-138)||(23547069-23547198)
chr3 (9-215)||(830872-831076)
chr3 (122-235)||(23546942-23547055)
chr3 (124-237)||(30616279-30616392)
chr3 (12-163)||(41937074-41937224)
chr3 (94-151)||(23910328-23910385)
chr3 (128-247)||(10043270-10043389)
chr3 (143-193)||(31271299-31271349)
chr3 (265-322)||(12369112-12369169)
chr3 (39-124)||(14208294-14208377)
chr3 (264-316)||(831119-831171)
chr3 (208-247)||(2490366-2490405)
chr3 (266-327)||(10823610-10823671)
chr3 (277-322)||(29858488-29858533)
chr3 (265-322)||(42758492-42758549)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (9-322)||(31752324-31752637)
chr4 (9-250)||(47239371-47239612)
chr4 (15-247)||(47550342-47550574)
chr4 (9-322)||(48459349-48459662)
chr4 (9-247)||(6382261-6382500)
chr4 (16-322)||(21423736-21424042)
chr4 (15-322)||(11122783-11123090)
chr4 (9-243)||(7608838-7609072)
chr4 (9-322)||(43893096-43893408)
chr4 (9-237)||(39046821-39047048)
chr4 (9-235)||(5902615-5902841)
chr4 (9-327)||(32585356-32585669)
chr4 (15-247)||(44317408-44317641)
chr4 (16-243)||(11027947-11028175)
chr4 (9-322)||(31918472-31918786)
chr4 (9-235)||(19534324-19534549)
chr4 (46-247)||(55826612-55826814)
chr4 (9-247)||(26564700-26564937)
chr4 (9-157)||(42774629-42774777)
chr4 (9-250)||(6482021-6482262)
chr4 (9-226)||(32596194-32596410)
chr4 (9-237)||(1724309-1724536)
chr4 (9-237)||(42299659-42299884)
chr4 (9-226)||(12825471-12825687)
chr4 (21-322)||(15987176-15987455)
chr4 (9-220)||(37107280-37107490)
chr4 (9-322)||(37348992-37349293)
chr4 (9-157)||(4766395-4766540)
chr4 (16-168)||(7985189-7985341)
chr4 (326-404)||(35804587-35804665)
chr4 (9-134)||(425692-425816)
chr4 (39-184)||(28695194-28695338)
chr4 (46-160)||(13015327-13015446)
chr4 (43-244)||(39375182-39375381)
chr4 (128-250)||(10302071-10302193)
chr4 (9-183)||(13770508-13770681)
chr4 (105-195)||(53906346-53906436)
chr4 (9-134)||(39188384-39188507)
chr4 (16-86)||(53906431-53906501)
chr4 (148-245)||(15733517-15733614)
chr4 (266-326)||(44887669-44887729)
chr4 (264-322)||(53906252-53906310)
chr4 (53-117)||(9230199-9230262)
chr4 (124-247)||(43309468-43309589)
chr4 (127-226)||(3737767-3737861)
chr4 (264-322)||(5902534-5902592)
chr4 (268-322)||(47239318-47239372)
chr4 (130-322)||(19882970-19883162)
chr4 (156-244)||(14605917-14606005)
chr4 (264-322)||(7334111-7334169)
chr4 (156-226)||(29527827-29527897)
chr4 (130-211)||(33516097-33516178)
chr4 (130-231)||(42907875-42907976)
chr4 (156-237)||(47103753-47103834)
chr4 (266-322)||(1724184-1724240)
chr4 (156-244)||(4741208-4741296)
chr4 (265-321)||(6481950-6482006)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (13-322)||(27932279-27932589)
chr8 (9-237)||(45235927-45236155)
chr8 (9-247)||(29108810-29109048)
chr8 (9-322)||(32302922-32303236)
chr8 (17-322)||(24927819-24928124)
chr8 (15-243)||(24870016-24870243)
chr8 (16-247)||(1063376-1063607)
chr8 (9-244)||(17220579-17220809)
chr8 (9-245)||(39445566-39445793)
chr8 (24-235)||(34776943-34777154)
chr8 (9-247)||(4230718-4230945)
chr8 (9-160)||(2075909-2076060)
chr8 (12-247)||(20399457-20399692)
chr8 (9-215)||(11255028-11255230)
chr8 (9-235)||(17469118-17469343)
chr8 (105-247)||(40248359-40248501)
chr8 (16-151)||(28977198-28977333)
chr8 (9-250)||(24568802-24569041)
chr8 (9-250)||(1012480-1012721)
chr8 (16-226)||(43113635-43113844)
chr8 (9-247)||(34139310-34139546)
chr8 (27-235)||(14186205-14186408)
chr8 (89-235)||(36131917-36132062)
chr8 (124-235)||(9642351-9642462)
chr8 (9-86)||(40248496-40248573)
chr8 (9-126)||(34021341-34021456)
chr8 (137-245)||(37960952-37961060)
chr8 (9-117)||(35215367-35215474)
chr8 (128-247)||(27056543-27056662)
chr8 (43-124)||(29089606-29089685)
chr8 (9-82)||(31325127-31325199)
chr8 (130-226)||(8545358-8545454)
chr8 (265-327)||(2075742-2075804)
chr8 (160-216)||(35215549-35215605)
chr8 (264-327)||(1063630-1063693)
chr8 (131-226)||(17084116-17084211)
chr8 (123-250)||(30481406-30481533)
chr8 (156-201)||(2075867-2075912)
chr8 (181-250)||(5858637-5858706)
chr8 (276-316)||(34139581-34139621)
chr8 (48-119)||(4594274-4594344)
chr8 (268-322)||(36131842-36131896)
chr8 (130-182)||(29918590-29918642)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (9-247)||(7314636-7314874)
chr2 (9-248)||(13705348-13705587)
chr2 (15-237)||(37999352-37999574)
chr2 (9-322)||(37106562-37106868)
chr2 (9-321)||(24414046-24414358)
chr2 (15-322)||(10208344-10208650)
chr2 (9-244)||(8915929-8916163)
chr2 (9-322)||(30846808-30847122)
chr2 (16-247)||(45256693-45256924)
chr2 (9-316)||(13830599-13830905)
chr2 (9-322)||(9632249-9632562)
chr2 (9-247)||(45115421-45115661)
chr2 (9-247)||(12193815-12194053)
chr2 (9-212)||(42798011-42798215)
chr2 (16-247)||(36128094-36128326)
chr2 (9-235)||(6027889-6028115)
chr2 (15-188)||(10920514-10920687)
chr2 (9-321)||(44746023-44746335)
chr2 (9-228)||(14540649-14540863)
chr2 (16-144)||(18106181-18106309)
chr2 (9-247)||(31942173-31942411)
chr2 (9-110)||(37472854-37472955)
chr2 (9-250)||(19104822-19105066)
chr2 (124-237)||(22900772-22900885)
chr2 (156-321)||(37472673-37472838)
chr2 (156-250)||(38342504-38342598)
chr2 (16-123)||(16226839-16226945)
chr2 (264-322)||(12341718-12341776)
chr2 (127-236)||(15546725-15546834)
chr2 (131-250)||(35248370-35248489)
chr2 (264-322)||(37999595-37999653)
chr2 (264-322)||(42797914-42797972)
chr2 (156-236)||(6164472-6164552)
chr2 (282-322)||(29977466-29977506)
chr2 (130-198)||(30696908-30696976)
chr2 (156-244)||(43371563-43371651)
chr2 (48-119)||(38342657-38342727)
chr2 (264-322)||(6027814-6027872)
chr2 (9-79)||(16105481-16105551)
chr2 (47-117)||(30978804-30978873)
chr2 (136-226)||(35510452-35510542)
chr2 (130-235)||(35965319-35965423)
chr2 (265-322)||(36128019-36128076)
chr2 (278-322)||(10920770-10920814)
chr2 (207-247)||(18106107-18106147)
chr2 (47-119)||(26755631-26755703)
[»] chr1 (61 HSPs)
chr1 (9-322)||(17134810-17135123)
chr1 (9-322)||(18353993-18354306)
chr1 (17-322)||(24236674-24236979)
chr1 (9-322)||(40087377-40087689)
chr1 (9-322)||(19572425-19572737)
chr1 (9-322)||(5180908-5181215)
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[»] chr7 (72 HSPs)
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[»] chr6 (40 HSPs)
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[»] scaffold0095 (1 HSPs)
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[»] scaffold0198 (1 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 4582981 - 4583294
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
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T  4582981 aatatgctcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 4583080  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
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T  4583081 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 4583180  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||             |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4583181 tttgaaatcggggaaaacccatacccatatccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgtggatatgag 4583280  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  4583281 ttttgttgccatgc 4583294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 4920688 - 4921001
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4920688 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 4920787  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  4920788 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtggatacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 4920887  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  4920888 tttgagatcggggaaaacccatacccataaccaaacccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatggg 4920987  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  4920988 ttttgttgccatgc 4921001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5908915 - 5908602
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5908915 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 5908816  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  5908815 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggtttggggtgtgtacatatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 5908716  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||             |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||      
T  5908715 ttcgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccaatcaaaatggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcggataaccacgggtatgga 5908616  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  5908615 ttttgttgccatgc 5908602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17853518 - 17853207
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17853518 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 17853419  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||| |     
T  17853418 at-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtatctatatatccgttacccgtcccatacccgtg- 17853321  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||             |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||| |||| |    
T  17853320 tttgaaatcggggaaaacccatatccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattaggtttggttcaggtgggtaaccgcgggtatgcg 17853221  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  17853220 ttttgttgccatgc 17853207  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 40517668 - 40517981
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40517668 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 40517767  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||| ||| ||    
T  40517768 ataacatatcaacataaaataattttttacctttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtaactatatacccgttacccatcccatacccgtgt 40517867  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||              |||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |    
T  40517868 tttgggatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaatccgtcaaattgaatttggttcaggcgggtaaccacgggtatggg 40517967  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  40517968 ttttgttgccatgc 40517981  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29246178 - 29245866
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29246178 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttaattgattcattaaatatcaatggtagtgtttattaacataacaattatcaaacaaaataac 29246079  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||  |||| |||| ||| ||    
T  29246078 atgacataccaacataaaataattttttacatttgggatgggtatgggtatgggtttggggtgggtacctatatacatgttattcgtcccatacccgtgt 29245979  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| | ||             ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  29245978 tttgaaatcggagaaaactcatacccatacccaaacctagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatggg 29245879  T
Q  309 ttttgttgccatg 321  Q
    |||||||| ||||    
T  29245878 ttttgttgtcatg 29245866  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 35311685 - 35311891
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  35311685 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 35311784  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||    
T  35311785 at-acatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggagtgggtacctatatatctgttacccgtcccatacccgtgt 35311883  T
Q  209 tttgaaat 216  Q
    ||||||||    
T  35311884 tttgaaat 35311891  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 28045517 - 28045745
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttatt-aacataacaattatcaatcaaaataa 107  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  28045517 aatatgttcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttatttaacataacaattataaaacaaaataa 28045616  T
Q  108 catgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  28045617 catgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttc-gggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatattcgtg 28045715  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccata 237  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||||||||||    
T  28045716 ttttgaattagggaaaaacccatacccata 28045745  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12834802 - 12834563
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12834802 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaacgatttaattgatcattcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 12834703  T
Q  109 at-gacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||| ||  |    
T  12834702 atagacatatcaacataaattaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtaggtacctatatacctgttacccgtcccatatccatg 12834603  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  12834602 ttttgaaattggagaaaacccatacccatacccaaaccca 12834563  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 42987700 - 42987471
Alignment:
Q  15 ctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgaca 114  Q
    |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  42987700 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataaca 42987601  T
Q  115 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||||||     
T  42987600 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatccgttacacgtcccatacccgtgttttgag 42987501  T
Q  215 attggggaaaactcatacccatatccaaac 244  Q
    || ||||||||  ||||||| || ||||||    
T  42987500 atcggggaaaatccatacccgtacccaaac 42987471  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12866779 - 12866540
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12866779 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaacaatttaattgatcattcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 12866680  T
Q  109 at-gacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||  |    
T  12866679 atagacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgcggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccatg 12866580  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12866579 ttttgaaatcggagaaaactcatacccatacccaaaccca 12866540  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13402229 - 13401918
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13402229 aatatgctcattttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 13402130  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||| ||    
T  13402129 at-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatcggt-tgggttcggagtgggtacctaaatacccgttacccgttccatacccgtgt 13402032  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | ||              ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  13402031 ttgaaaatcgggaaaaactcatacccatacccaaacctagtcaaaacggaaaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatggg 13401932  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  13401931 ttttgttgccatgc 13401918  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22695128 - 22694891
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22695128 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatatagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 22695029  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  |||| |||| |||  |    
T  22695028 attacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctctatacccgttagtcgtcccatacccgtat 22694929  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||| || |||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  22694928 tttgagatcgggg-aaacccatacccatacccaaaccca 22694891  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Original strand, 15890069 - 15890304
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||    
T  15890069 aatatgttcactttaacatttgttagacgtaattatttaattgatccttcaaatatcaatggtagttttcattaatatgacaattatcaaataaaataac 15890168  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  15890169 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttc-gggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 15890267  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacc 245  Q
    |||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||    
T  15890268 tttgaaatcggagaaaacccatacacatagccaaacc 15890304  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 1218619 - 1218809
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1218619 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagttttt-ttaacatgacaattatcaaacaaaataac 1218717  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcata 201  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1218718 at-acaaatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttacctgtcccata 1218809  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6092729 - 6092559
Alignment:
Q  25 tatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacata 124  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6092729 tatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacata 6092630  T
Q  125 aaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgt 195  Q
    || |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6092629 aagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgt 6092559  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20973718 - 20973410
Alignment:
Q  3 tcgaagaatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaa 102  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20973718 tcgaacaatacgctcactttaatattttttagacggaatgatttagttgatactttacatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 20973619  T
Q  103 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatag 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||     
T  20973618 aataccatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgg-----------gtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccatcccatac 20973530  T
Q  203 ccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcgga 302  Q
    ||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||             ||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||     
T  20973529 ccgtgtttgaaaatcggggaaaacccatacccataaccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcagaatgggtttggttcgggcgggtaaccgcggg 20973430  T
Q  303 tatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  20973429 tatgggttttgttgccatgc 20973410  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 30996459 - 30996770
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30996459 aatacgctcactttaacatt-gttagacggaatgatttatttgatcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 30996557  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||  || ||    
T  30996558 atggcatatcaacttaaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtgtgtgttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatactcgtgt 30996657  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||| |||| || |||||| ||||| |||| ||||||||| ||             || ||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||||| |    
T  30996658 tttaaaatcggagaaaacccatactcatacccaaacccagtcaaaacgggaaaatcc-gtcaaattgggtttggttcggacggataaccgtagatatggg 30996756  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  30996757 ttttgttgccatgc 30996770  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3564954 - 3564773
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3564954 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 3564855  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggt-gggaacctatatacccgtta 190  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||| ||||||||||| ||||    
T  3564854 at-acatatcaacataaagtaattttttacatttggaacgggtatggatatgggttcggagtagggtacctatatacctgtta 3564773  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6156145 - 6155909
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  6156145 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttatttgctcctttaaatatcaatgatattttttattaccatgacaattatcaaacaaaataac 6156046  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||  ||||| |||  ||| ||| ||    
T  6156045 atgtcatataaacataaagtaattttcaacatttgtgacggttttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacc--ttacctgtcctatacccgtgt 6155948  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||| ||||||||| || || |||| |||||||||    
T  6155947 tttgaaatcggggaaaacccaaacacatacccaaaccca 6155909  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27302959 - 27302746
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |   | |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27302959 aatatgatcactttaacatttgttagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtacgt---agtaacatgacaattatcaaacaaaataac 27302863  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||   |||| |||||||||| ||| ||    
T  27302862 atgacatattaacataaagtaattttttacgtttgggacgtgtatgactatggattcggggtgggtacctatatatttgttatccgtctcatatccgtgt 27302763  T
Q  209 tttgaaattggggaaaa 225  Q
    |||||||| ||||||||    
T  27302762 tttgaaatcggggaaaa 27302746  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35194215 - 35194014
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  35194215 aatatgttcactttaacattttttagaccaattgatttagtttattctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacagcaattatcaaacaaaataac 35194117  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||  ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  35194116 atagcatattaacataaagtaattttctacattcgggacgggtttgagtatgagtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 35194017  T
Q  209 ttt 211  Q
    |||    
T  35194016 ttt 35194014  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 2985010 - 2985235
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  2985010 aatatgctcactttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacacaacaattatcaaataaaataac 2985108  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||| | | || |||||  |||||| || | |||||||||||||||||||||| || | ||  ||    
T  2985109 atgacatatcaatataaaataattttctatattcgagacagatttgggtatggtttcgggatgagtacctatatacccgttacccgtcccaaacccatgt 2985208  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
     ||||||| || ||||||||| |||||    
T  2985209 cttgaaatcggagaaaactcaaaccca 2985235  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 6369566 - 6369798
Alignment:
Q  17 cactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacata 116  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||  |    
T  6369566 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaacatcaacggtagttttcattaacatgataattatcaaacaaaataacacgacgca 6369665  T
Q  117 tcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaat 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| || ||||  ||  |||||||||    
T  6369666 tcaacataaagtaattttttacattttggacgggttaaagtatgggttcggggtgggtacatatatacacgttaccc-tcccatactcgtattttgaaat 6369764  T
Q  217 tggggaaaactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
      ||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  6369765 cagggaaaactcatacccatgcccaaactcaatc 6369798  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 27088577 - 27088415
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27088577 aatatgcttactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacataacaattatcaaacaaaataac 27088479  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtggg 173  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  27088478 at-acatatcaacataaaataattttctacattcgagacgggtttgggtatgggttcggggtggg 27088415  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38006695 - 38006470
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||  ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || |  || |||||||| |||||||||    
T  38006695 aatatgctcgttttaacaattgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 38006597  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||| |||  |    
T  38006596 atgacatattaacataaattaattttcaacattcgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatatctgttacgcgtcccatacccgtat 38006497  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    |||||||||||||||||| || |||||    
T  38006496 tttgaaattggggaaaacccaaaccca 38006470  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2412952 - 2412712
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||    
T  2412952 aatatgctcactttaatatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaattgtagtttttatga-cacaacaattatcaaacaaaataac 2412854  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | |||  |||||| || || ||||  |||| || |||| || |||||||||||||    || |||| ||| ||    
T  2412853 atgacatatcaatataaagtaattttctgcatacgggacgagtttgggtattggttcaggatgggtacatatatacccgttatttatcccatacccgtgt 2412754  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||    
T  2412753 tttgaaattgggaaaaattcaaacccatacccaaactcaatc 2412712  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 166
Target Start/End: Original strand, 3573087 - 3573243
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||    
T  3573087 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttgaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacagaataac 3573185  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| |||||    
T  3573186 atgacatatcaacataaaataattttctacattcgggaggggtttgagtatgggttcg 3573243  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Original strand, 12447251 - 12447435
Alignment:
Q  16 tcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacat 115  Q
    ||||||||| ||||| ||||   | |||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12447251 tcactttaacatttgttagatcgattgatttaactgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgacat 12447349  T
Q  116 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcata 201  Q
    || |||||||| || |||| || ||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  12447350 attaacataaagtagttttctatatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccattacctgtcccata 12447435  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Original strand, 30115346 - 30115525
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |  |||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||| ||||   |||||||||| |||||||||    
T  30115346 aatatgctcactttaacatttgttagactgatcgatttagttgctcctttaaatataaatggtggtttttat-aacacggcaattatcaaacaaaataac 30115444  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgtt 189  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  30115445 atagcatatcaacataaaataattttatgcattcgggacgggtttgaatatgggttcgggatgggtaccaatatacccgtt 30115525  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8453598 - 8453393
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  8453598 aatatgctcattttaacatttgtttgaccgaatgatttagttactcctttaaatatcaatggtaattttta-taacatgacaattattaaacaaaataac 8453500  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacg-ggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
      ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| || |||||| | ||||||||| | ||||||| || |||| ||| |    
T  8453499 --gacatattaacataaactaattttctacatttgggacgagttttgagtatgactttggggtgtgtacctatatatctgttacccatcccatacccgtg 8453402  T
Q  208 ttttgaaat 216  Q
    |||||||||    
T  8453401 ttttgaaat 8453393  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 18206880 - 18207193
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaa-ttatcaatcaaaataa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||   ||| |||| || ||||||||    
T  18206880 aatatgcccactttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattagtagtttttat-aacacggcaaattattaaacaaaataa 18206978  T
Q  108 catgacatatcaacataaaa-taattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgc 206  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||  ||     
T  18206979 catggcatatcaacatagaagtaattttctacattcgggacgggtttgaatatgggttcggg-tgggtacctatatacctgttacctgtcccatacacga 18207077  T
Q  207 gttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatg 306  Q
    |||||||||| | ||||||| || || |||  ||||||||| ||             | |||||||||  |||||||| ||| || ||||| ||| ||||    
T  18207078 gttttgaaatcgaggaaaacccaaactcatgcccaaacccagtcaaaacgggaaaaacacgtcaaattgggtttggtttgggtgggtaaccacgggtatg 18207177  T
Q  307 agttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||||    
T  18207178 agttttgttgccatgc 18207193  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33728076 - 33727915
Alignment:
Q  161 agttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnn 260  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||              
T  33728076 agtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaatccatacccatatccaaacccaatcaaaacgggga 33727977  T
Q  261 nnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
        ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  33727976 aaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgc 33727915  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 247
Target Start/End: Original strand, 10127058 - 10127174
Alignment:
Q  124 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||    
T  10127058 aaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctata-------tacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 10127150  T
Q  224 aactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||| |||||||||| |||||||||    
T  10127151 aacccatacccatacccaaaccca 10127174  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33862378 - 33862270
Alignment:
Q  41 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 140  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||    
T  33862378 tgatttagttggtcatttaaatatcaatcgtagtttttac-aacatgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaaatagttttctgcat 33862280  T
Q  141 ttgggacggg 150  Q
    | ||||||||    
T  33862279 tcgggacggg 33862270  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 92
Target Start/End: Original strand, 10126970 - 10127053
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaat 92  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10126970 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaat 10127053  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16311372 - 16311213
Alignment:
Q  157 tatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnn 256  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||| ||  || |||||||||| ||  |||||||| || |||||||||||||||||          
T  16311372 tatgggttcggggtgggtacctatatccctgttatccgtctcgtactcgtgttttgaaatcggaaaaaactcaaactcatatccaaacccaatcaaagcg 16311273  T
Q  257 nnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttg 316  Q
            ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16311272 ggaaaaaaccgtcaaattaggtttggttcaggcgggtacccgcggatatgagttttgttg 16311213  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 15564577 - 15564682
Alignment:
Q  88 acaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccg 187  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||| ||   ||  |||||||||    
T  15564577 acaattttcaaaaaaaataacatgacatatcaatgtaaagtaattttctacattcgggacgagtttgagtatgagttcgggatgaatacagatatacccg 15564676  T
Q  188 ttaccc 193  Q
    ||||||    
T  15564677 ttaccc 15564682  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28569101 - 28569010
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||  || || |||| |||||||||    
T  28569101 gtatgggttcggggtgggtacctatatccccgttacccgtcccgtacccgcattttgaaatcggggaaaatccaaactcatacccaaaccca 28569010  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 326
Target Start/End: Original strand, 6810264 - 6810325
Alignment:
Q  265 ccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgcttaa 326  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6810264 ccgtcaaattgagtttggttcggacgggtatccacggatatgggttttgttgccatgcttaa 6810325  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 322
Target Start/End: Original strand, 35311931 - 35311988
Alignment:
Q  265 ccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35311931 ccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcggatatgagttttattgtcatgc 35311988  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 42717826 - 42717742
Alignment:
Q  41 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatc-aatcaaaataacatgacatatcaacataa 125  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| || ||||||| |||| ||| |||||||||    
T  42717826 tgatttagtttctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacacgacaattatcaaaacaaaatatcatggcatgtcaacataa 42717742  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 119
Target Start/End: Original strand, 2681096 - 2681166
Alignment:
Q  48 gttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatca 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2681096 gttgatcctttaactatcaatgaaagttcttattt-catgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 2681166  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27900507 - 27900388
Alignment:
Q  130 attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactca 229  Q
    ||||| |||||| ||| ||| | || ||||| ||||| | |||| |||||||| | | ||||||||| |||| ||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  27900507 attttatacattcggggcggatttgggtatgggttcgagatgggtacctatatccacattacccgtcccatacccatgttttgaaatcgggaaaaactca 27900408  T
Q  230 tacccatatccaaacccaat 249  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  27900407 aacctatatccaaacccaat 27900388  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 33420498 - 33420437
Alignment:
Q  67 atgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaata 129  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33420498 atgatagtttttat-aacacgacaattatcaaataaaataacatgacatatcaatataaaata 33420437  T

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Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 247
Target Start/End: Original strand, 38972913 - 38973022
Alignment:
Q  138 catttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccata 237  Q
    |||||| || |||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||| ||  |||||||||| ||| ||||| || || ||||    
T  38972913 catttgagatgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatattcccgttacctatcccatacccatgttttgaaatcgggaaaaacccaaactcata 38973012  T
Q  238 tccaaaccca 247  Q
     | |||||||    
T  38973013 cctaaaccca 38973022  T

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Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40187770 - 40187646
Alignment:
Q  122 ataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattgggg 221  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||||| || || ||||||||| ||| ||   ||||||||  ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  40187770 ataaattaattttctatattcgggacgagtttgggtatgagtttggg-tgaatacctatatctccgttacccgtctcgcacccgtgttttgaaattgggg 40187672  T
Q  222 aaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||| || || ||| ||||||||||    
T  40187671 aaaacccaaactcatttccaaaccca 40187646  T

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Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 119
Target Start/End: Original strand, 20634055 - 20634130
Alignment:
Q  43 atttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatca 119  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||| |||| |||| | ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20634055 atttggttgttcctttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 20634130  T

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Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 119
Target Start/End: Original strand, 20650169 - 20650244
Alignment:
Q  43 atttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatca 119  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||| |||| |||| | ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20650169 atttggttgttcctttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 20650244  T

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Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22694873 - 22694817
Alignment:
Q  265 ccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatg 321  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  22694873 ccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 22694817  T

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Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 193
Target Start/End: Original strand, 29664954 - 29665017
Alignment:
Q  130 attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttaccc 193  Q
    ||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  29664954 attttgtacattcgggacgggtttgggtatgagttcgaagtgggtacctatatccccgttaccc 29665017  T

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Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 119
Target Start/End: Original strand, 34259140 - 34259210
Alignment:
Q  48 gttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatca 119  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| |||| | ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34259140 gttgttcctttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 34259210  T

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Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7350521 - 7350448
Alignment:
Q  122 ataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgt 195  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||   ||||||| ||| ||||||||    
T  7350521 ataaattaattttctacatttgagacgggtttaagtatgggttcggggtggatgcctatatccccattacccgt 7350448  T

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Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 322
Target Start/End: Original strand, 12447486 - 12447543
Alignment:
Q  265 ccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||  |||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  12447486 ccgtcaaattgggtttggttcgggtgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgc 12447543  T

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Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6155878 - 6155834
Alignment:
Q  278 tttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6155878 tttggtacgggtggataaccgcaggtatgagttttgttgccatgc 6155834  T

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Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22536067 - 22535754
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22536067 aatatgctcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 22535968  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  22535967 atgacatatcaacataaaataattttttacatttaggacgagtatgtgtatgggttcggggtgggtgcctgtatacccgttacccgtcccatatccgtgt 22535868  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||             ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  22535867 tttgaaattggggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccatcaaattgagtttggttcgggcggataaccgcgggtatggg 22535768  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  22535767 ttttgttgccatgc 22535754  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 34025816 - 34026129
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34025816 aatatgctccctttaacatttgatagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 34025915  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||    
T  34025916 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtggaaacctatatactcgttacccgtcccatacctgtgt 34026015  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||              ||||||||||   ||||||||||| || ||||||||| |||| |    
T  34026016 tttgaaatcggggaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacgggaaaaaaccgtcaaattggttttggttcgggagggtaaccgcgggtatggg 34026115  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  34026116 ttttgttgccatgc 34026129  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 44953661 - 44953348
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44953661 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 44953562  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  44953561 ataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgagtatgagttcggggtgagtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 44953462  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||             |||||||||||  |||||||||| |||| ||||| ||| |||||     
T  44953461 tttgagatcggggaaaacccatacccaaacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgagcgggtaaccacgggtatgaa 44953362  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  44953361 ttttgttgccatgc 44953348  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 52572471 - 52572784
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  52572471 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatactttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 52572570  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  52572571 ataacatattaacataaagtaattttttacatttgggacgggcttgagtatggattcggggtgggtccctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 52572670  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| ||             || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  52572671 tttgagatcgaggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacctgtcaaattgagtttggttcgggcggataaccacgggtatggg 52572770  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  52572771 ttttgttgccatgc 52572784  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Original strand, 29842170 - 29842410
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29842170 aatatgctcacttcaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 29842269  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| ||| ||    
T  29842270 atgacaaatcaacataaagtaattttttacatttgagacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatattcccgttaccagtcccatacccgtgt 29842369  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    ||| ||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  29842370 ttt-aaaatcgggaaaacccatacctatacccaaacccaatc 29842410  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 327
Target Start/End: Original strand, 44639165 - 44639454
Alignment:
Q  38 aaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataatttttta 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44639165 aaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataatttttta 44639264  T
Q  138 catttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccata 237  Q
    ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  44639265 catttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatatgggaaaacccatacccata 44639364  T
Q  238 tccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgcttaaa 327  Q
     ||||||||| ||             || ||||||||  |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44639365 cccaaacccagtcaaaatggggaaaaccagtcaaattgggtttcgttcggacgggtaaccacggatatgagttttgttgccatgcctaaa 44639454  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 49579926 - 49580239
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  49579926 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaatcatcaaacaaaataac 49580025  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||    
T  49580026 ataacatatcaatataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcgaggtgggtacctatatactcgttacccgtcccatacccgtgt 49580125  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  49580126 tttgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggttcgggcggataaccacgggtatggg 49580225  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||| |||||    
T  49580226 ttttgttgtcatgc 49580239  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39655499 - 39655179
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39655499 aataagctcactttcacatttgttagagaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 39655400  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||    
T  39655399 ataacatatcaacataaagtagttttttacatttgagacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgt 39655300  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  39655299 tttgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatggg 39655200  T
Q  309 ttttgttgccatgcttaaact 329  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  39655199 ttttgttgccatgcctaaact 39655179  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 43582440 - 43582752
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||    
T  43582440 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatccgttaaatatcaatggtagtttttatttacatgataattatcaaacaaaataac 43582539  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  43582540 atgacatatcaatataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatgggttcggg-tgggtacctacatacacgttacccgtctcatacccgtgt 43582638  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| |              ||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  43582639 tttgaaatcggggaaaactcatacacatactcaaacccagtaaaaacggagaaaacccatcaaattggatttggttcgggcgggtaaccgcggatatggg 43582738  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||| ||||    
T  43582739 ttttgttgcaatgc 43582752  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 44172488 - 44172726
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44172488 aatacgctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 44172587  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  44172588 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 44172687  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  44172688 tttgagatcggggaaaacccatacccatactcaaaccca 44172726  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 44179188 - 44179426
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44179188 aatacgctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 44179287  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  44179288 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 44179387  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  44179388 tttgagatcggggaaaacccatacccatactcaaaccca 44179426  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 20086871 - 20087097
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20086871 aatatgcccactttaacatttgttagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaagcaaaataac 20086970  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||           ||    
T  20086971 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagta-gggttcggggtgggtacctatatacccattacccgt-----------gt 20087058  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20087059 tttgaaatcggggaaaacccatacccatatccaaaccca 20087097  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Original strand, 23580698 - 23580927
Alignment:
Q  17 cactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacata 116  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23580698 cactttaacatttgttatacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acata 23580796  T
Q  117 tcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||    
T  23580797 tcaacataaaataattttttacatttgggataagtgtgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttacccgtttcatactcgtgttttgaaat 23580896  T
Q  217 tggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23580897 tggggaaaactcatacccatacccaaaccca 23580927  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 44252609 - 44252847
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44252609 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 44252708  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||    
T  44252709 ataacatatcaacataaagtagttttttatatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacacgtcccatacccgtgt 44252808  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    || || || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44252809 ttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaaccca 44252847  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48391042 - 48390805
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  48391042 aatatgttcacttcaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagttttt-ttaacatgacaattatcaaacaaaataac 48390944  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| || |||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||    
T  48390943 atgacatatcaacataaagtaattttttacgttcgggacgggtatgggtatgggttcaggatgggtacctatattcccgttacccgtcccatacccgtgt 48390844  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48390843 tttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaaccca 48390805  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 7469999 - 7469691
Alignment:
Q  14 gctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgac 113  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7469999 gctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataac 7469900  T
Q  114 atatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttga 213  Q
    ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||    
T  7469899 atatccacataaagtagtgttttacatttgggacgggtttgtgtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcga 7469800  T
Q  214 aattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttg 313  Q
     ||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||    
T  7469799 gatcagggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttg 7469700  T
Q  314 ttgccatgc 322  Q
    |||||||||    
T  7469699 ttgccatgc 7469691  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 34154280 - 34154514
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||      
T  34154280 aatatgttcactttaatatttgttagacataatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata-- 34154377  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
       ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| ||  |    
T  34154378 ---acatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatattcttgttacccgtttcatacccatg 34154474  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34154475 ttttgaaatcggggaaaacacatacccatatccaaaccca 34154514  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 29284198 - 29284511
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| || || |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29284198 aataagctcactttcacatttgttaaacaaaattatttagttgatcttttaaatattaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 29284297  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  29284298 ataacatatcaacataaagtagttttttacatctgggacgggtttgggtatgggttcgggctgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 29284397  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    || || || ||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  29284398 ttcgagatcgggaaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgag 29284497  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  29284498 ttttgttgccatgc 29284511  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 52198016 - 52198255
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataa- 107  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  52198016 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataaa 52198115  T
Q  108 catgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | | |    
T  52198116 catagcatatcaacgtaaagtaattttttacatttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacctgtg 52198215  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  52198216 ttttgagatcgggaaaaacccatacccatacccaaaccca 52198255  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 39728533 - 39728771
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39728533 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttaatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacagaacaattatcaaacaaaataac 39728632  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| || |||| |||  |    
T  39728633 attacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccatcccatacccgtat 39728732  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||| || | |||||||  |||| |||| |||||||||    
T  39728733 tttgagatcgaggaaaacctatactcatacccaaaccca 39728771  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6738620 - 6738318
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| || || |||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  6738620 aatatgctcactttaacatctgttagacataatgatttaattgatccttccaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataac 6738521  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||           ||    
T  6738520 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatggatttggggtgggtacctatatacccgttacccgt-----------gt 6738432  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||             || ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  6738431 tttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaacctgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatggg 6738332  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    |||| |||||||||    
T  6738331 ttttattgccatgc 6738318  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44107012 - 44106781
Alignment:
Q  15 ctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgaca 114  Q
    |||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44107012 ctcactttcacatttgtaagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataaca 44106913  T
Q  115 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaa 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||||| |     
T  44106912 tattaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtagatacctatatatccgttacgcgtcccatacccgtgttttaag 44106813  T
Q  215 attggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  44106812 attggggaaaac-catactcatacccaaaccca 44106781  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17146376 - 17146142
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17146376 aataagctgactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 17146277  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||  ||||||||| | |||||||||  |||| ||  ||    
T  17146276 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggaagggtttgtgtatgggttcggggtggatacctatataactgttacccgttccatacccatgt 17146177  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaa 243  Q
    ||||| |||||  ||||| |||||||||| |||||    
T  17146176 tttgagattggaaaaaacccatacccatacccaaa 17146142  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 49025543 - 49025768
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49025543 aataagctcactttcacatttattagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacataacaattatcaaacaaaataac 49025642  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| || || | ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||    
T  49025643 ataacatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttc-ggatgtgtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgt 49025741  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    ||||| || ||||||||| || |||||    
T  49025742 tttgagatcggggaaaacccaaaccca 49025768  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 53631767 - 53632079
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||    
T  53631767 aatatgctcactttatcatttgttagaccgatcgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacggcaattatcaaacaaaataac 53631865  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| || ||| |||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  53631866 atggcatatcaacataaagtaattttctagattcgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacacgtgt 53631965  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||| ||             |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||| ||||||    
T  53631966 tttaaaatttgggaaaactcaaacccatacctatacccattcaaaacgaggaaaacccgtcaaattaagtttggttcgaacgagtaaccacgggtatgag 53632065  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    |||| |||||||||    
T  53632066 ttttattgccatgc 53632079  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23154246 - 23153975
Alignment:
Q  52 atcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggt 151  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  23154246 atcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggataggt 23154148  T
Q  152 atgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcn 251  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  |||| ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |      
T  23154147 atgagtatgggttcggagtgggtacctatatactcgttacccgttccatacccgtg-tttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaactcagtta 23154049  T
Q  252 nnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgctta 325  Q
                |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23154048 aaacgggaaaaacccgtcaaattggggttggttccggcgggtaaccgcggatatggattttgttgccatgctta 23153975  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10823912 - 10823696
Alignment:
Q  16 tcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacat 115  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10823912 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 10823813  T
Q  116 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaa 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||   ||| || ||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||| |    
T  10823812 atcaacataaagtaattttttacatttgggagaggtttgggtatgggttcgg---gggtacttatatacccgttatcaatctcatacccgtgttttgaga 10823716  T
Q  216 ttggggaaaactcataccca 235  Q
    | || |||||| ||||||||    
T  10823715 tcggagaaaacccataccca 10823696  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4557530 - 4557293
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  | | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  4557530 aatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacatcaattatcaaacaaaataac 4557432  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||  | | || ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||    
T  4557431 atgacatatcaacataaagtaattttctgcattcgggatagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatactcgttacccgtcccatacccatgt 4557332  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||  ||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  4557331 tttgaaaacggggaaaacccaaacccatacccaaaccca 4557293  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4016269 - 4015957
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  | | ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  4016269 aatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcgatagtagtttttat-aacacatcaattatcaaacaaaataac 4016171  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||  || |||| | |||| |||||| || || ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||    
T  4016170 atgacatatcaacataaggtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttatccgtcccatacccatgt 4016071  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| | ||             ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| |||| |    
T  4016070 tttgaaatcggggaaaacccaaacccatacccaaacctagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgagtttcgttcgggtgggtaaccacgggtatggg 4015971  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  4015970 ttttgttgccatgc 4015957  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Original strand, 34119521 - 34119759
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||     
T  34119521 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcatttcaatatcaatgttagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataa- 34119618  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
     || |||||||||| ||| || |||| | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||    
T  34119619 -tggcatatcaacacaaagtagttttctgcatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttatccgtctcatacccgtgt 34119717  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    ||| |||| ||| |||||||| || |||| ||||||||||||    
T  34119718 tttaaaatcgggaaaaactcaaactcatacccaaacccaatc 34119759  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 322
Target Start/End: Original strand, 54317039 - 54317319
Alignment:
Q  41 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | | |    
T  54317039 tgatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtaattttcttcgt 54317137  T
Q  141 ttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatcc 240  Q
    ||||||||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||   | |||||||||| |||||||||||| || ||||  |    
T  54317138 ttgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcctatacttgtgttttgaaatcggggaaaactcaaacacatactc 54317237  T
Q  241 aaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||| ||             |||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  54317238 aaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggttcgggcgggtaaccacggatatggattttgttgccatgc 54317319  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 247
Target Start/End: Original strand, 42758269 - 42758474
Alignment:
Q  41 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 140  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | | |    
T  42758269 tgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagtttttat-aacatggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtaattttcttcgt 42758367  T
Q  141 ttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatcc 240  Q
    | ||||||||| || ||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||| |||| |||| || || |||| ||    
T  42758368 tcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgcatacctatatacctgttacccgtcccatacctgtgttttgaaatcgggggaaacccaaactcataccc 42758467  T
Q  241 aaaccca 247  Q
    |||||||    
T  42758468 aaaccca 42758474  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 48306768 - 48306650
Alignment:
Q  3 tcgaagaatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaa 102  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  48306768 tcgaacaatacgctcactttaatatttgttagacggaatgatttagttgatactttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 48306669  T
Q  103 aataacatgacatatcaac 121  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  48306668 attaacatgacaaatcaac 48306650  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Original strand, 19111598 - 19111837
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| || || || ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  19111598 aatatgatcactttaacatttgttataccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgaaaattatcaaacaaaataac 19111696  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||||| || | ||| |||  ||||||| || ||||||||||||| || || | || ||| ||    
T  19111697 atgacatat-aacataaagtaattttctacattttgtacgggtttgggcatgggtttagggtgggtacttatatacccgttatccatcccgtacccgtgt 19111795  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |||| ||||||||||||    
T  19111796 tttgaaatcgggaaaaactcaaactcatacccaaacccaatc 19111837  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Original strand, 30682684 - 30682846
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  30682684 aatatgttcactttaacatttgttagaacgaatgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagtttttat-aacatgaccattatcaaacaaaataac 30682782  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgg 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  30682783 atgacatatcaacataaagtaattttctacattcaggacgggtttgagtataggttcgaggtgg 30682846  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31127020 - 31126829
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||    
T  31127020 aatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttat-aatacgacaattatcaaacaaaataac 31126922  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcata 201  Q
    ||| |||||||||| ||  || |||| | ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||    
T  31126921 atggcatatcaacacaatgtagttttctgcatttgggacgagtttgggtatgagttcggggtggatacctatatacatgttacccgtcccata 31126829  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48305760 - 48305629
Alignment:
Q  116 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaa 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |||| ||| |||||||||    
T  48305760 atcaacataaagtaattttttacatttggaacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccgatactcgttccatacccgtgttttgaaa 48305661  T
Q  216 ttggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48305660 ttggggaaaactcatacccataaccaaaccca 48305629  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23547198 - 23547069
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23547198 aataagctcactttcacatttgttaaacaaaattatttagttgatcctttaaatataaatgctagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 23547099  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttac 138  Q
    || |||||| |||||||| || ||||||||    
T  23547098 ataacatattaacataaagtagttttttac 23547069  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 215
Target Start/End: Original strand, 830872 - 831076
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    ||||||||||| |||| ||||  ||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || |   |||||||||| |||||||||    
T  830872 aatatgctcacgttaacattttttagaccaattgatttagtttctccttaaaatatcaatgatagtttttat-aagacggcaattatcaaacaaaataac 830970  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||  ||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||  | || ||||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||| ||    
T  830971 atagcatattaacataaagtaattttctgcattcgggacgaatttgggtatgggttcagggtgggtacc-atatactcgttatccgtctcatacccgtgt 831069  T
Q  209 tttgaaa 215  Q
    |||||||    
T  831070 tttgaaa 831076  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23547055 - 23546942
Alignment:
Q  122 ataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattgggg 221  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| || || ||||    
T  23547055 ataaagtagttttttacatttgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcgggg 23546956  T
Q  222 aaaactcataccca 235  Q
    ||||| ||||||||    
T  23546955 aaaacccataccca 23546942  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30616392 - 30616279
Alignment:
Q  124 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaa 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |  ||||  | ||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  30616392 aaaataattttttacgtttgggacgggtatgggtatgggttcggggtggttatatataacctcgttacccgtcccatatccgtgttttgaaatcggggaa 30616293  T
Q  224 aactcatacccata 237  Q
    ||| || |||||||    
T  30616292 aacccaaacccata 30616279  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41937224 - 41937074
Alignment:
Q  12 atgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatg 111  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||| |||    
T  41937224 atgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcatttcaatatcaatgttagtcttta-taacacgacaattatcaaacaaaataatatg 41937126  T
Q  112 acatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagt 163  Q
    |||| |||||| ||| || |||| | |||||| |||| || || ||||||||    
T  41937125 acatgtcaacacaaagtagttttctgcatttgagacgagtttgggtatgagt 41937074  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23910385 - 23910328
Alignment:
Q  94 atcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggt 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  23910385 atcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttctacattcgggacgggt 23910328  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10043389 - 10043270
Alignment:
Q  128 taattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaact 227  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||  | ||||  ||||||||||||| |||| ||  |||||||||   ||||||||     
T  10043389 taattttttatattcgggatgggtatgggtatgggttcggggtgggtgcatataaccccgttacccgtcccatacccatgttttgaaaccagggaaaacc 10043290  T
Q  228 catacccatatccaaaccca 247  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  10043289 caaacccatacccaaaccca 10043270  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31271349 - 31271299
Alignment:
Q  143 gggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttaccc 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  31271349 gggacgggtttgagtatgagttcggggtgggtacctatatcccagttaccc 31271299  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 322
Target Start/End: Original strand, 12369112 - 12369169
Alignment:
Q  265 ccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  12369112 ccgtcaaattgagtttggttcgggtgaataaccacgggtatgggttttgttgccatgc 12369169  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Original strand, 14208294 - 14208377
Alignment:
Q  39 aatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacata 124  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||   |||||||||||    
T  14208294 aatgattttgttgctcctttaaatatcaatgaca-ttttta-taacatgacaattatcaaaccaaataacatagtatatcaacata 14208377  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Original strand, 831119 - 831171
Alignment:
Q  264 cccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttg 316  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  831119 cccgtcaaatttggtttggtttgggcgggtaaccacggatatgagttttgttg 831171  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 247
Target Start/End: Original strand, 2490366 - 2490405
Alignment:
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2490366 ttttgaaatcggggaaaactcaaacccatatccaaaccca 2490405  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10823671 - 10823610
Alignment:
Q  266 cgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgcttaaa 327  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10823671 cgtcaaattgaatttggtttgggcgggtaacgacgggtatgagttttgttgccatgcctaaa 10823610  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29858533 - 29858488
Alignment:
Q  277 gtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  29858533 gtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgc 29858488  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 322
Target Start/End: Original strand, 42758492 - 42758549
Alignment:
Q  265 ccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  42758492 ccgtcaaattgggtttggatcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgc 42758549  T

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Target: chr4 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 31752324 - 31752637
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31752324 aatatgctcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcattgttagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 31752423  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||    
T  31752424 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggaacctatatactcgttactcgtctcatacccgtgt 31752523  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||             |||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||| |||| |    
T  31752524 tttgaaatcggggaaaacccatacccatatccaaacccaatcaaaacggtaaaaacccgtcaaattggatttgattcgggcgggtaaccgcgggtatggg 31752623  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||| |||||    
T  31752624 ttttgttgtcatgc 31752637  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 47239612 - 47239371
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  47239612 aatatgctcactttaacatttgataaatgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 47239513  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  47239512 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacaggtatgggtatgggttcagggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 47239413  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    ||| |||| ||  ||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  47239412 tttaaaatcggaaaaaatccatacccatatccaaatccaatc 47239371  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 47550574 - 47550342
Alignment:
Q  15 ctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgaca 114  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  47550574 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataaca 47550475  T
Q  115 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||     
T  47550474 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgag 47550375  T
Q  215 attggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47550374 atcggggaaaactcatacctatacccaaaccca 47550342  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 48459349 - 48459662
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  48459349 aatatgctcactttaacattttttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 48459448  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||  ||    
T  48459449 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgttccatacccatgt 48459548  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||  |||| ||||||             ||| |||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||      
T  48459549 tttgaaatcggggaaaacccatatccatactcaaatccaatcaaaatgggaaaaacccatcaaatttggtttgattcggacgggtaaccgcggatatgga 48459648  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  48459649 ttttgttgccatgc 48459662  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6382500 - 6382261
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6382500 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 6382401  T
Q  109 atgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  6382400 ataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtg 6382301  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  6382300 ttttgagatcggagaaaacccatacccatacccaaaccca 6382261  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Original strand, 21423736 - 21424042
Alignment:
Q  16 tcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacat 115  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  21423736 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatataacat 21423835  T
Q  116 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaa 215  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |    
T  21423836 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgtgtatgggtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacccgtgtttcgaga 21423935  T
Q  216 ttggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgtt 315  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||              ||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||    
T  21423936 ttggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaatccgtcaaattggatttggttcgggcgggtaaccacgggtatgagttttatt 21424035  T
Q  316 gccatgc 322  Q
    |||||||    
T  21424036 gccatgc 21424042  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 11123090 - 11122783
Alignment:
Q  15 ctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgaca 114  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||    
T  11123090 ctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtactttttattaacatgacaattataaaacaaaataacaaaaca 11122991  T
Q  115 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaa 214  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||     
T  11122990 tatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgag 11122891  T
Q  215 attggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgt 314  Q
    || || |||||| |||||||||| |||||| || ||              |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  11122890 atcggagaaaacccatacccatacccaaactcagtcaaaacggaaaaaatccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgagttttgt 11122791  T
Q  315 tgccatgc 322  Q
    ||||||||    
T  11122790 tgccatgc 11122783  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Original strand, 7608838 - 7609072
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7608838 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatgacagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 7608937  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  7608938 ataacatatcaacatagagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 7609037  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaa 243  Q
    || || || ||||||||| |||||||||| |||||    
T  7609038 ttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaa 7609072  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 43893096 - 43893408
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43893096 aataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 43893195  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  43893196 ataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgaattcggggtggatacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 43893295  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    || || || |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||| |    
T  43893296 ttcgagatcgggg-aaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggctcgggcgggtaaccacgggtatggg 43893394  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  43893395 ttttgttgccatgc 43893408  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 39046821 - 39047048
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39046821 aatatgctcattttaacatttgttagacggaatgatttagttaatcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 39046920  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||| ||    
T  39046921 at-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggagtgggtacctatatacccgttacatgtcccatacccgtgt 39047019  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccata 237  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39047020 ttggaaattggggaaaacccatacccata 39047048  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5902841 - 5902615
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  5902841 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataag 5902742  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  5902741 ataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 5902642  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    || || || ||||||||| ||||||||    
T  5902641 ttcgagatcggggaaaacccataccca 5902615  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 327
Target Start/End: Original strand, 32585356 - 32585669
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgat-agtttttattaacataacaattatcaatcaaaataa 107  Q
    |||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32585356 aatacgctcactttaacaattgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgattagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataa 32585455  T
Q  108 catgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    || ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| |    
T  32585456 caagacatataaacataaagtaagtttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatacccgtg 32585555  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatga 307  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||      ||||||||| ||             || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32585556 ttttgaaatcggagaaaattcatac------ccaaacccagtcaaaaaggggaaaaccggtcaaattgggtttggtttgggcggataaccgcgggtatga 32585649  T
Q  308 gttttgttgccatgcttaaa 327  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  32585650 gttttgttgccatgcataaa 32585669  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Original strand, 44317408 - 44317641
Alignment:
Q  15 ctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgaca 114  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44317408 ctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatcgtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataaca 44317507  T
Q  115 tatcaacataaaata-attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttga 213  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||    
T  44317508 tatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcga 44317607  T
Q  214 aattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
     || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44317608 gatcggggaaaacccatacccatacccaaaccca 44317641  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Original strand, 11027947 - 11028175
Alignment:
Q  16 tcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacat 115  Q
    ||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11027947 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatataaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 11028046  T
Q  116 atcaacataaaataa-ttttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaa 214  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||     
T  11028047 atcaatataaagtaatttttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgag 11028146  T
Q  215 attggggaaaactcatacccatatccaaa 243  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||    
T  11028147 atcggggaaaacccatacccatacccaaa 11028175  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31918786 - 31918472
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31918786 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 31918687  T
Q  109 atgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| |||| |||| ||| |    
T  31918686 ataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtaactatatacccattactcgtcccatacccgtg 31918587  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatga 307  Q
    ||| || || ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||     
T  31918586 tttcgagatcggggaaaacccatactcatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcaggtaaccacggatatgg 31918487  T
Q  308 gttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||||||||    
T  31918486 gttttgttgccatgc 31918472  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 19534324 - 19534549
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  19534324 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttagatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 19534422  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||   |    
T  19534423 atgacatatcaacataaaataattttctacattcgtgacgggtttgggtatgagttcgaggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccagat 19534522  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||    
T  19534523 tttaaaatcggagaaaactcataccca 19534549  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 55826814 - 55826612
Alignment:
Q  46 tagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaata-attttttacatttgg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  55826814 tagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacgtgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgg 55826715  T
Q  145 gacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaac 244  Q
    ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | | |||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  55826714 gacgggtttggatatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacctgtgtttcgagatcggggaaaacccatactcatatccaaac 55826615  T
Q  245 cca 247  Q
    |||    
T  55826614 cca 55826612  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 26564700 - 26564937
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||   || ||||||| |||| ||||    
T  26564700 aatatgttcactttaacatttgtttgaccgattgatttagttgttccgttaaatatcaatgatagtttttat-aacacggcagttatcaaacaaactaac 26564798  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26564799 atgacatatcaacataaagtagttttctgcatttgggacgggtttgggtatggtttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgcgt 26564898  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||| ||||||| |||| || |||| |||||||||    
T  26564899 tttgaaatcggggaaagctcaaactcatacccaaaccca 26564937  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 157
Target Start/End: Original strand, 42774629 - 42774777
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42774629 aatatgttcattttaacatttgttagaaggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 42774728  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42774729 atgacatatcaacataaagtaattttttacattttggacgggtatgagt 42774777  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6482262 - 6482021
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  6482262 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgttagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 6482164  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataatttttta-catttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||||||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||| ||| |    
T  6482163 atggcatatcaatataaattagtttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatataccctttactcgtcccatacccgtg 6482064  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  6482063 tttttaaattggggaaaacccaaacccatacccaaacccaatc 6482021  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32596410 - 32596194
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||    
T  32596410 aatatgctcactttaaaatttgttagacttaatgatttagttgttccttcaaatattaatgctagtttttat-aacatgacaattatcaaaccaaatgac 32596312  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||||| | |||  || || ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  32596311 atggtatatcaacataaaataattttctacattcgagacaagtttgggtatgagtttgaggtggggacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 32596212  T
Q  209 tttgaaattggggaaaac 226  Q
    |||||||| |||||||||    
T  32596211 tttgaaatcggggaaaac 32596194  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1724536 - 1724309
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  | | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||    
T  1724536 aatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacatcaattatctaacaaaataac 1724438  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||    
T  1724437 atgacatatcaacataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatataaccgttacccgtcccatacccatgt 1724338  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccata 237  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  1724337 tttgaaatcggggaaaacccaaacccata 1724309  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 42299659 - 42299884
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||    |||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  42299659 aatatgttcactttaacatttgttagagaggatgatttagttgctcatttaaatatcaacagtagtttttattaacaagacaattatcaaacaaaataac 42299758  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  42299759 atggcatatcaacataaagt-actttttatatttgggacgtgtttgagtatgggttcagggtgggtacctatatacccgttacccgtc-cata-ccgtgt 42299855  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccata 237  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  42299856 tttgaaatcggggaaaatccatacccata 42299884  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12825687 - 12825471
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  12825687 aatatcctcactttaatatttattagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaattttagtttttat-aacacgataattatcaaacaaaataac 12825589  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| | || | ||||| ||| || ||||  |||| ||||||| || |||||| |||||||||||| |||| ||| ||    
T  12825588 atgatatatcaacataaagtaattttctgcactcgggacaggtttgggtataggttcagggtgggtacgtatatatccgttacccgtcccatacccgtgt 12825489  T
Q  209 tttgaaattggggaaaac 226  Q
    |||||||| |||||||||    
T  12825488 tttgaaatcggggaaaac 12825471  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15987455 - 15987176
Alignment:
Q  21 ttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaa 120  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||                      
T  15987455 ttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa------------------ 15987374  T
Q  121 cataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggg 220  Q
        ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||  ||    
T  15987373 ----aaataattttttatatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacccgttacccatcccatacccgtgttttaaaatctgg 15987278  T
Q  221 gaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccat 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||             |||||||||||  |||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||    
T  15987277 gaaaactcatacccatacccaaacccaatcaaaatggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggtgggtaaccgcgaatgtgggttttgttgccat 15987178  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 37107280 - 37107490
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||  | ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  37107280 aatatgctcattttaatatttgtcagaccgattgatttagttgcttctttaaataccaatggtagtttttat-aacatggcaattatcaaacaaaataac 37107378  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||    | |  |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  37107379 atgacatatcaacataaagtaattttctgcattcgggatatattttggtataaattcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 37107478  T
Q  209 tttgaaattggg 220  Q
    ||||||||||||    
T  37107479 tttgaaattggg 37107490  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 37348992 - 37349293
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||   | ||||||||| |||||||||    
T  37348992 aatatgctcactttaagatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaacggtagtttttat-aacgcgagaattatcaaacaaaataac 37349090  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||  |||||||||||| ||||||||           ||    
T  37349091 atggcatatcaacataaaataattttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtggatacctatatacccattacccgt-----------gt 37349179  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||| ||             || ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  37349180 tttgaaatcggggaaaactcaaactcatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacctgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatggg 37349279  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  37349280 ttttgttgccatgc 37349293  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4766540 - 4766395
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagt-ttttattaacataacaattatcaatcaaaataa 107  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  4766540 aatatgtttactttaacatttgttagaggtaatgatttagtttatcctttaaatatcaatgatagttttttattaacatgacaattatcaaataaaataa 4766441  T
Q  108 catgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagt 157  Q
    ||| ||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||    
T  4766440 cataacatatcaacataaagta----tttacatttgggacgggtatgagt 4766395  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7985341 - 7985189
Alignment:
Q  16 tcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacat 115  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  7985341 tcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcatttaaatatcaacggtagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgactt 7985242  T
Q  116 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggg 168  Q
    |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  7985241 atcaacataaaatacttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggg 7985189  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 326 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 35804665 - 35804587
Alignment:
Q  326 aactcattcaataagagggtatgagagtcctttaactaacaaactacttttctttactaactaacaaacttcttgaatt 404  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35804665 aactcattcaataagagcttatgagagtcctttaactaacaaactacttttctttactaactaacaaacttctttaatt 35804587  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 425692 - 425816
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  425692 aatatgttcactttaagatttgttagaccgattgatttagttgttcttttaaatatcaatggtagtttttat-aacatgacaattatcaaacaaaataac 425790  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataatttt 134  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||    
T  425791 atggcatatcaacataaagtaatttt 425816  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28695338 - 28695194
Alignment:
Q  39 aatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttac 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||     
T  28695338 aatgatttagttgctcctttaaatattaatgatagtttttat-aacgtgacaattatcaaataaaataacattgcatatcaacataaagcaatttcctat 28695240  T
Q  139 atttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatac 184  Q
    ||||| |||| || || |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28695239 atttgagacgagtttgggtatgagttcggggtgagtacctatatac 28695194  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13015446 - 13015327
Alignment:
Q  46 tagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttatta-----acataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |     | || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13015446 tagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacatgaaaatgaaaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 13015347  T
Q  141 ttgggacgggtatgagtatg 160  Q
    | | ||||||| ||||||||    
T  13015346 tcgagacgggtttgagtatg 13015327  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 244
Target Start/End: Original strand, 39375182 - 39375381
Alignment:
Q  43 atttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataatttttta-catt 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||  || |    
T  39375182 atttagttgttcctttaaatattagtggtagtttttat-aacacggcaattatcaaacaaaataacatgacat--caacgtaaagtaatttttttgcaat 39375278  T
Q  142 tgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatcca 241  Q
    |||||||||| |||||||| | | |||||||  | ||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||| ||||||||  || || ||||||||    
T  39375279 tgggacgggtttgagtatgtgattggggtggatatctatatacccgttacccgtcctatacccgtattttgaaatcggggaaaagccaaactcatatcca 39375378  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 250
Target Start/End: Original strand, 10302071 - 10302193
Alignment:
Q  128 taattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaact 227  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||     
T  10302071 taattttttacatttgggacggatatgggtatgggttcggggtgggtacatataaccccgttacccgtctcatacccgtactttgaaatcggggaaaacc 10302170  T
Q  228 catacccatatccaaacccaatc 250  Q
     | ||||||| ||||||||||||    
T  10302171 taaacccatacccaaacccaatc 10302193  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13770681 - 13770508
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |||  | ||||||||||| ||||| |||||| |||| | |||||||| ||||    ||||||||| |||||||||    
T  13770681 aatatgttcactttaacatttgtttgaccgattgatttagttgctccttcaaatattaatggtcgtttttat-aacacggtaattatcaaacaaaataac 13770583  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatata 183  Q
    ||| | ||| ||||||||||| |||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13770582 atggcttattaacataaaatagttttatgcattcgggacgggtttgagtatgagttcggggtgggaccgtatata 13770508  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 53906436 - 53906346
Alignment:
Q  105 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgt 195  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |   |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  53906436 taacatgacatatcaacatgaagtaattttttacatttgggacgagtttagatatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgt 53906346  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 39188384 - 39188507
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||   | ||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||  |||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  39188384 aatatgttcactttaacatttgttagaacgattgatttagttttttctttaaatataaatggtagttttt--taacacgacagttatcaaacaaaataac 39188481  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataatttt 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  39188482 atgacatatcaacataaaacaatttt 39188507  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 53906501 - 53906431
Alignment:
Q  16 tcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacat 86  Q
    ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  53906501 tcactttaacatttgttagaaggaatgatttagttgatccattaaatatcaatagtagtttttattaacat 53906431  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15733614 - 15733517
Alignment:
Q  148 gggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacc 245  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||| || |||  ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||    
T  15733614 gggtttgagtacgagttcggggtgggtacatatatctccgttacccgtctcgtacccgtattttgaaatcgaggaaaactcatatccatacccaaacc 15733517  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 326
Target Start/End: Original strand, 44887669 - 44887729
Alignment:
Q  266 cgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgcttaa 326  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  44887669 cgtcaaattgggtttggttcgggcggataaccgtgggtatgagttttgttgtcatgcttaa 44887729  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 53906310 - 53906252
Alignment:
Q  264 cccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  53906310 cccgtcaaattgggtttggttcgggcggataaccgtgggtatgggttttgttgccatgc 53906252  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 117
Target Start/End: Original strand, 9230199 - 9230262
Alignment:
Q  53 tcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatat 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9230199 tcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatat 9230262  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 247
Target Start/End: Original strand, 43309468 - 43309589
Alignment:
Q  124 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaa 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||   ||||| || ||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||    
T  43309468 aaaataattttttacatttgagacaggtatgggtatgggttc--agtgggcacatataaccccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaa 43309565  T
Q  224 aactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||| || || ||||  ||||||||    
T  43309566 aacccaaactcatactcaaaccca 43309589  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 226
Target Start/End: Original strand, 3737767 - 3737861
Alignment:
Q  127 ataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||     ||||| ||||||| |||| || ||||  | ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  3737767 ataattttttacatttgggacggg-----gtatgggttcgggatgggtacatataacctcgttacccgtcccatacccgtgttttgaaattgggaaaaac 3737861  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5902592 - 5902534
Alignment:
Q  264 cccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||    
T  5902592 cccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacgggtataggttttgttgccatgc 5902534  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 47239372 - 47239318
Alignment:
Q  268 tcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47239372 tcaaattgagtttggtttggacggataaccgcgagtatgagttttgttgccatgc 47239318  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19883162 - 19882970
Alignment:
Q  130 attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactca 229  Q
    ||||| |||||| |||||| || || ||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| || | || ||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  19883162 attttatacattcgggacgagtttgtgtatcggttcggggtggatacctatatccccgttacccttcccgtatccgtgttttaaaatcggggaaaaccca 19883063  T
Q  230 tacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
     || ||||  |||||||||||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||  |||| |||||||||||||||    
T  19883062 aactcatactcaaacccaatcaaagcgggaaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtattcgcgagtatgggttttgttgccatgc 19882970  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14606005 - 14605917
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaac 244  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||| || |||  ||||||||| || |||||| || ||||||| ||||||    
T  14606005 gtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtctcgtacccgtattttgaaatcggagaaaacccaaacccatacccaaac 14605917  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 7334169 - 7334111
Alignment:
Q  264 cccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||    
T  7334169 cccgtcaaattaggtttggttcaggcggatacccgcaagtatgggttttgttgccatgc 7334111  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 29527827 - 29527897
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaac 226  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | || |||  ||||||||| |||||||||    
T  29527827 gtatgggttcggggtgggtacatatatccccgttacccgtcacgtacccgtattttgaaatcggggaaaac 29527897  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33516178 - 33516097
Alignment:
Q  130 attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgtttt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||| || ||||| || ||||||| |||| || ||| |||||    
T  33516178 attttttacatttgagacgggtttgggtataggttcggggtgggtacttatatccctgttacccatctcgtacccgtgtttt 33516097  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 231
Target Start/End: Original strand, 42907875 - 42907976
Alignment:
Q  130 attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactca 229  Q
    ||||| |||||| |||||| || || ||||| | |||||||||| |||||||| ||| |||| |||| | || ||| |||||||| | || |||||||||    
T  42907875 attttctacattcgggacgagtttgggtatgggctcggggtgggtacctatatccccattactcgtcccgtatccgtgttttgaattcggagaaaactca 42907974  T
Q  230 ta 231  Q
    ||    
T  42907975 ta 42907976  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 237
Target Start/End: Original strand, 47103753 - 47103834
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccata 237  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||| | | || |||  ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  47103753 gtatgggttcggggtgggtacatatatccgcgttacccgccccgtacccgtattttgaaattggggaaaacccaaacccata 47103834  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1724240 - 1724184
Alignment:
Q  266 cgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  1724240 cgtcaaattgagtttggttcgggtgggtaaacacgggtatgagttttgttaccatgc 1724184  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4741296 - 4741208
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaac 244  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||||| |||| ||  ||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  4741296 gtatgggttcggggtgggtacttatatccctgttatccgtcccatacccatgttttaaaatcgaggaaaactcaaactcatatccaaac 4741208  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6482006 - 6481950
Alignment:
Q  265 ccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatg 321  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  6482006 ccgtcaaattgagtttgattcgggtggataaccacgggtataggttttgttgccatg 6481950  T

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Target: chr8 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 322
Target Start/End: Original strand, 27932279 - 27932589
Alignment:
Q  13 tgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatga 112  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27932279 tgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatga 27932378  T
Q  113 catatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||    
T  27932379 catatcaacataaaataattttttacatttgggacggatatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatacccgtgttttg 27932478  T
Q  213 aaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataa-ccgcggatatgagttt 311  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  27932479 aaatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaacccgcgggtatgagttt 27932578  T
Q  312 tgttgccatgc 322  Q
    ||||| |||||    
T  27932579 tgttgtcatgc 27932589  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 45235927 - 45236155
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  45235927 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 45236026  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  45236027 ataacatatcaacataaattaattttttacatttgggacgggtatggatatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccatacccgtgt 45236126  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccata 237  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45236127 tttgaaatcagggaaaactcatacccata 45236155  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29109048 - 29108810
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  29109048 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataat 29108949  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||  ||    
T  29108948 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacatatatacccgttacccgtcccatacccatgt 29108849  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  29108848 tttaaaatcgggaaaaacccatacccatacccaaaccca 29108810  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 32302922 - 32303236
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32302922 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 32303021  T
Q  109 atgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  32303022 ataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtg 32303121  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatga 307  Q
    ||| || || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||     
T  32303122 tttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttgtttcgggcgggtaaccacgggtatgg 32303221  T
Q  308 gttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||||||||    
T  32303222 gttttgttgccatgc 32303236  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 322
Target Start/End: Original strand, 24927819 - 24928124
Alignment:
Q  17 cactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacata 116  Q
    |||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24927819 cactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacata 24927918  T
Q  117 tcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaat 216  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||    
T  24927919 tccacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacccgtgtttcgagat 24928018  T
Q  217 tggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttg 316  Q
      |||||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  24928019 cagggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttgttg 24928118  T
Q  317 ccatgc 322  Q
    ||||||    
T  24928119 ccatgc 24928124  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24870243 - 24870016
Alignment:
Q  15 ctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgaca 114  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24870243 ctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttt-attaacatgacaattatcaaacaaattaacatgaca 24870145  T
Q  115 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaa 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  24870144 tatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggctcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcacatacccgtgttttaaa 24870045  T
Q  215 attggggaaaactcatacccatatccaaa 243  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  24870044 atcggggaaaactcatagccatacccaaa 24870016  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Original strand, 1063376 - 1063607
Alignment:
Q  16 tcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacat 115  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1063376 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcgtttaaatatcaatggtaatttttatcaacatgacaattatcaaacaaaataacaagacat 1063475  T
Q  116 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaa 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| || | || |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  1063476 atcaacataaagtaattttttacacttgggatggatttgggtatgagttcggggtgggtacttatatacccgttaaccgtcccatacccgtgttttgaaa 1063575  T
Q  216 ttggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    | ||| ||||| |||||||||| ||| |||||    
T  1063576 tcgggaaaaacccatacccatacccacaccca 1063607  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 244
Target Start/End: Original strand, 17220579 - 17220809
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17220579 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 17220678  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     | |||||||||||| ||||||||| || | | || || |||| ||| ||    
T  17220679 atgacatatcaacataaagtaatcttttacatttgggacgggtatg-----gggttcggggtgggtacctatataaccatcatccatcccatacccgtgt 17220773  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaac 244  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  17220774 tttgaaatcggggaaaatccatacccatacccaaac 17220809  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39445793 - 39445566
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39445793 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttaattgatcatt-aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 39445695  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||    
T  39445694 atgacatatctacat--------tttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctataaacccgttacctgtcccatacccgtgt 39445603  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacc 245  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  39445602 tttgaaatcgggaaaaacccatacccatacccaaacc 39445566  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 34776943 - 34777154
Alignment:
Q  24 atatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacat 123  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  34776943 atatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 34777042  T
Q  124 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | || ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||  |||| ||| ||||||| || ||| ||    
T  34777043 aaaataattttttacatttgggatggatttgggtatgggttcggggtgggtacctaaatacctgttactcgttccatacccgtgttttgagatcgggaaa 34777142  T
Q  224 aactcataccca 235  Q
    ||| ||||||||    
T  34777143 aacccataccca 34777154  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4230945 - 4230718
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4230945 aataagctcacttttacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 4230846  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||           |||| ||||||||||||||||| |||| |||| | | ||    
T  4230845 ataatgtatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggta-----------tgggtacctatatacccgttactcgtcccatacctgtgt 4230757  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4230756 tttgagatcggggaaaacccatacccatacccaaaccca 4230718  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2076060 - 2075909
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2076060 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 2075961  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatg 160  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2075960 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatg 2075909  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 20399457 - 20399692
Alignment:
Q  12 atgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatc-aatcaaaataacat 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||  | |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||  ||  ||||||||||    
T  20399457 atgctcactttaacatttgttagaccgattgatttggttggtcctttaaatatcaatgctagtttttat-aacacgacaattatataaaaaaaataacat 20399555  T
Q  111 gacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttt 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  20399556 ggtatatcaacataaaataattttttgcattcgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtatctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttt 20399655  T
Q  211 tgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||| || |||||| || ||||||| |||||||||    
T  20399656 tgaaatcggagaaaacccaaacccatacccaaaccca 20399692  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11255230 - 11255028
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |   | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  11255230 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatgac---ggtagtttttattaatatgacaattatcaaacaaaataac 11255134  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||    
T  11255133 at-acatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctatatacctgttatccgtcccatacccgtgt 11255035  T
Q  209 tttgaaa 215  Q
    || ||||    
T  11255034 ttggaaa 11255028  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 17469118 - 17469343
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||   |||||||||| |||||||||    
T  17469118 aatatgttcactttaaaattttttagacccattgatttagtttctcctttaaatatcaatggtagcttttat-aacaaggcaattatcaaacaaaataac 17469216  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||| |||||||||||||| || |||| | || ||||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  17469217 atggcatatcaacataaagtagttttctgcagttgggacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 17469316  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||    
T  17469317 tttgaaatcggggaaaacccaaaccca 17469343  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40248501 - 40248359
Alignment:
Q  105 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  40248501 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatatgggtatgggttcgggatgggtacctatatacccgttatccgtctcataccc 40248402  T
Q  205 gcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    | |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  40248401 gtgttttgaaatcggggaaaacatatacccatacccaaaccca 40248359  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28977333 - 28977198
Alignment:
Q  16 tcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacat 115  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28977333 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 28977234  T
Q  116 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggt 151  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28977233 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggt 28977198  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Original strand, 24568802 - 24569041
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  | | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  24568802 aatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacatcaattatcaaacaaaataac 24568900  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
     ||||||||||||||||| || |||| | |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| ||  ||    
T  24568901 -tgacatatcaacataaagtagttttctccattcgggacggatttgagtatgggttcggggtggatacctatatacccgctacctgtcccatacccatgt 24568999  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    | |||||| ||| ||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  24569000 tgtgaaatcgggaaaaatccatacccatacctaaacccaatc 24569041  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Original strand, 1012480 - 1012721
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  1012480 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtacttttta-taacacagcaattatcaaacaaaataac 1012578  T
Q  109 atgacatatcaacataaaata--attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgc 206  Q
    ||| |||||||||||||| ||   |||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |      
T  1012579 atggcatatcaacataaagtagttttttttgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccatactcat 1012678  T
Q  207 gttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    ||||| |||| ||||||||| || || |||| |||||| |||||    
T  1012679 gtttt-aaatcggggaaaacccaaactcatacccaaactcaatc 1012721  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43113844 - 43113635
Alignment:
Q  16 tcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacat 115  Q
    ||||||||| ||||| || ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  43113844 tcactttaacatttgttataccgattgatttagttgctccttcaaatatcaatgatagtttttat-aacacgacaattatctaacaaaataacataacat 43113746  T
Q  116 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaa 215  Q
    |||||||| || || |||| | |||| | ||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||    
T  43113745 atcaacatgaagtagttttctgcattcgagacggatttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatgcccgtgttttgaaa 43113646  T
Q  216 ttggggaaaac 226  Q
    | ||| |||||    
T  43113645 tcgggaaaaac 43113635  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 34139310 - 34139546
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  34139310 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttgtttactcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 34139408  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    |||   |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||  ||| ||| |    
T  34139409 atggtctatcaacataaagtaatttttttgcattcgggacgggtttgggtatg-gttcggggtgggtacctatatacctgttacatgtcctatatccgtg 34139507  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||| |||| ||||||||| || || |||| |||||||||    
T  34139508 tttttaaatcggggaaaac-caaacacatacccaaaccca 34139546  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 14186205 - 14186408
Alignment:
Q  27 tttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaa 126  Q
    |||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||     ||||  ||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14186205 tttgttagaccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagttt-----aacacgactgttatcaaacaaaataacatggcatattaacataaa 14186299  T
Q  127 ataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaac 226  Q
     ||||||| ||||||  |||||||| || ||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||||||||| | | |||||    
T  14186300 ttaattttctacattcaggacgggtttgggtatgggttcagggtgagtacctatatatccgttacccatcccatacccgtgttttgaaatcgagaaaaac 14186399  T
Q  227 tcataccca 235  Q
    ||| |||||    
T  14186400 tcaaaccca 14186408  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36132062 - 36131917
Alignment:
Q  89 caattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgt 188  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||| ||||||| | || |||||||||||||||||  |||| ||| ||| |    
T  36132062 caattatcaaacaaaataacatgacatat-aacataaaataactttctgcattcgggacggatttgtgtatgagttcggggtggatacctgtatgccctt 36131964  T
Q  189 tacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    ||||| || ||||  || |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36131963 tacccatcccatactcgtgttttgaaataggggaaaactcaaaccca 36131917  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9642462 - 9642351
Alignment:
Q  124 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |  ||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  9642462 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcgggatggatatatataaccccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaa 9642363  T
Q  224 aactcataccca 235  Q
    ||| || |||||    
T  9642362 aacccaaaccca 9642351  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 40248573 - 40248496
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacat 86  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40248573 aatattctcactttaacatttgttagactgaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacat 40248496  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Original strand, 34021341 - 34021456
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||  || ||||||||||| |||||||||    
T  34021341 aatatgctcactttaacatttgttagattaattgatttcgttgctcctttaaatatcaatagtagttttta-tataatgacaattatcaaacaaaataac 34021439  T
Q  109 atgacatatcaacataaa 126  Q
    || |||||||||||||||    
T  34021440 at-acatatcaacataaa 34021456  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37961060 - 37960952
Alignment:
Q  137 acatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccat 236  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||| || || |||    
T  37961060 acatttgggacgggtttgggtatgagttcggggtgtgtacctatatacctgttacctgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaacccaaactcat 37960961  T
Q  237 atccaaacc 245  Q
    | |||||||    
T  37960960 acccaaacc 37960952  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 117
Target Start/End: Original strand, 35215367 - 35215474
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||    
T  35215367 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctccattaaatatcaagggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataac 35215465  T
Q  109 atgacatat 117  Q
    ||| |||||    
T  35215466 atggcatat 35215474  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27056662 - 27056543
Alignment:
Q  128 taattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaact 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||| |||| | |   |||||||| ||| |||||     
T  27056662 taattttttacatttgggacgagtatgtgtatgggttcggggtgggtagatataaccccgttacccgtcccatacctgtactttgaaatcgggaaaaacc 27056563  T
Q  228 catacccatatccaaaccca 247  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  27056562 caaacccataaccaaaccca 27056543  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 124
Target Start/End: Original strand, 29089606 - 29089685
Alignment:
Q  43 atttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacata 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  29089606 atttagttgctcctttaaatatcaatgatag-ttttaataacacaataattatcaaacaaaataacat-acataccaacata 29089685  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 82
Target Start/End: Original strand, 31325127 - 31325199
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttatta 82  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31325127 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat-ctttaaatatcaatggtagtttttatta 31325199  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8545454 - 8545358
Alignment:
Q  130 attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaac 226  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||  |||| ||| |||||||||| || ||||||    
T  8545454 attttctacatttgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtatctatatccccgttactcgttccatacccgtgttttgaaatcggagaaaac 8545358  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2075804 - 2075742
Alignment:
Q  265 ccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgcttaaa 327  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2075804 ccgtcaaattgggtttggttcaggcgggtaaccacggatatgagttttgttgccatgcctaaa 2075742  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Original strand, 35215549 - 35215605
Alignment:
Q  160 gagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaat 216  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35215549 gagtttggggtgggtacctatatactcgttacccgtctcatacccgtgttttgaaat 35215605  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 327
Target Start/End: Original strand, 1063630 - 1063693
Alignment:
Q  264 cccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgcttaaa 327  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1063630 cccgtcaaatcgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgagttttgttgccatgcctaaa 1063693  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17084211 - 17084116
Alignment:
Q  131 ttttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaac 226  Q
    ||||||||||| | || |||| ||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||||||    
T  17084211 ttttttacattcgtgatgggtttggatatgagttcggggtgggtatctatatccccgttacccgtctcgtacccgtgttttaaaatcggagaaaac 17084116  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30481533 - 30481406
Alignment:
Q  123 taaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattgggga 222  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||| | | |||| |||||||||  ||  |||||||||  || |    
T  30481533 taaattaattttttacattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatcctcattactcgtctcatactcgtattttgaaatcaggaa 30481434  T
Q  223 aaactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    |||| || || ||||  |||||||||||    
T  30481433 aaacccaaactcatactcaaacccaatc 30481406  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 201
Target Start/End: Original strand, 2075867 - 2075912
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcata 201  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2075867 gtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccata 2075912  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5858706 - 5858637
Alignment:
Q  181 atacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||| ||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  5858706 atacccgttacccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggaaaaacccaaacccatacccaaacccaatc 5858637  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 316
Target Start/End: Original strand, 34139581 - 34139621
Alignment:
Q  276 agtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttg 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34139581 agtttggttcgggcggataaccacgggtatgagttttgttg 34139621  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 4594344 - 4594274
Alignment:
Q  48 gttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatca 119  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| |||| | ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4594344 gttgctcctttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 4594274  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36131896 - 36131842
Alignment:
Q  268 tcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  36131896 tcaaattaggtttggttcgggtgggtaaccacggatatgaattttgttgtcatgc 36131842  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 182
Target Start/End: Original strand, 29918590 - 29918642
Alignment:
Q  130 attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatat 182  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| || |||||    
T  29918590 attttttacatttgggacgggtttgtgtatggtttcggggtgggtacatatat 29918642  T

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Target: chr2 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7314874 - 7314636
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  7314874 aatatgcccactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgatatttatcaaacaaaataac 7314775  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |    
T  7314774 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtgtgggtatgggttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatactcgtat 7314675  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7314674 tttaaaatcggggaaaacccatacccatatccaaaccca 7314636  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13705587 - 13705348
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13705587 aatacgctcactttaacatttgttatacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 13705488  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  13705487 atgacatatcaacataaagtaatttttcacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtctcatacccgtgt 13705388  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaa 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13705387 tttgaaatcggggaaaactcatacccatacccatacccaa 13705348  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 37999352 - 37999574
Alignment:
Q  15 ctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgaca 114  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  37999352 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgattctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataaca 37999451  T
Q  115 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaa 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  37999452 tatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgagttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtctcatacccgtgttttgag 37999551  T
Q  215 attggggaaaactcatacccata 237  Q
    || ||||||||| ||||||||||    
T  37999552 atcggggaaaacccatacccata 37999574  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 37106562 - 37106868
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37106562 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 37106661  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  37106662 at-atatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgg------gtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 37106754  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || ||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  37106755 tttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaactcagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgagtatgag 37106854  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||| |||||    
T  37106855 ttttgttgtcatgc 37106868  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24414358 - 24414046
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24414358 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 24414259  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||    
T  24414258 ataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgt 24414159  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||||| || |||||||||  ||||||||| ||||||||||||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | | |||| |    
T  24414158 tttgagatcggggaaaaccgatacccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacaggtatggg 24414059  T
Q  309 ttttgttgccatg 321  Q
    |||||||||||||    
T  24414058 ttttgttgccatg 24414046  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10208650 - 10208344
Alignment:
Q  15 ctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgaca 114  Q
    |||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  10208650 ctcactttcacatttgtaagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataaca 10208551  T
Q  115 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaa 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||||| |||| ||| ||||| |     
T  10208550 tattaacataaagtaattttttacatttgggactggtttgagtatgggttcggggtaggtacctatatatccattacccgtcccatacccgtgttttaag 10208451  T
Q  215 attggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgt 314  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||              |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  10208450 attggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaa-ccgtcaaattaactttggttcgggcggataatcacgggtatgagttttgt 10208352  T
Q  315 tgccatgc 322  Q
    ||||||||    
T  10208351 tgccatgc 10208344  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8916163 - 8915929
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8916163 aataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttaatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 8916064  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||    
T  8916063 ataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgt 8915964  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaac 244  Q
    ||||| | | | |||||| |||||||||||||||||    
T  8915963 tttgaga-tcgagaaaacccatacccatatccaaac 8915929  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 30846808 - 30847122
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30846808 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 30846907  T
Q  109 atgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    || ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  30846908 ataacatatcaacataaagtagtttttttacaattgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtg 30847007  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatga 307  Q
    ||| || || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||||     
T  30847008 tttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgg 30847107  T
Q  308 gttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||||||||    
T  30847108 gttttgttgccatgc 30847122  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Original strand, 45256693 - 45256924
Alignment:
Q  16 tcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacat 115  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  45256693 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagacat 45256792  T
Q  116 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaa 215  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  45256793 atcaaaataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattaaccgtctcatacccgtgttttgaaa 45256892  T
Q  216 ttggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45256893 tcggggaaaactcatactcatatccacaccca 45256924  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 13830599 - 13830905
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  13830599 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttatttacatgacaattatcaaacaaaataac 13830698  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||    
T  13830699 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacaggtttgagtatgggttcggggtgggtacttatatacccgtta-ccgtcccatacccgtgt 13830797  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||||| || | ||||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  13830798 tttgagatcgaggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatggg 13830897  T
Q  309 ttttgttg 316  Q
    ||||||||    
T  13830898 ttttgttg 13830905  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 9632249 - 9632562
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  9632249 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaaaataac 9632348  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  9632349 ataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtggatacctatatacccattacccgtcccatacccgtgt 9632448  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    || || || ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||             ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  9632449 ttcgagatcggggaaaacccatacccatactcaaacccattcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacgggtatggg 9632548  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  9632549 ttttgttgccatgc 9632562  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 45115421 - 45115661
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45115421 aatacgctcactttaacatttattagacaaaatgatttaattgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 45115520  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  45115521 atgacatatcaacataatgtaattttttacatttgggatgggtttaactatgggttcgggatgggtacctatatacctgttacccgtctcatacccgtgt 45115620  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactc--atacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  45115621 tttgaaatcgaggaaaactcatatacccatacccaaaccca 45115661  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12194053 - 12193815
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  12194053 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatgtagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 12193954  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||| | |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  12193953 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatggatatggattcgaggtgggtatctatatacccattacccgtcccatacccgtgt 12193854  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    | |||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  12193853 tctgaaatcgggaaaaacacatactcatacccaaaccca 12193815  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42798215 - 42798011
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42798215 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 42798116  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  42798115 ataacatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacaggtttgtgtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtctcatacccgtg 42798016  T
Q  208 ttttg 212  Q
    |||||    
T  42798015 ttttg 42798011  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36128326 - 36128094
Alignment:
Q  16 tcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacat 115  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36128326 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 36128227  T
Q  116 atcaacataaaata-attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaa 214  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| ||     
T  36128226 atcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgagtacctatatacccgttacccatcccatacccgtgtttcgag 36128127  T
Q  215 attggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    || ||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  36128126 atcggggaaaccacatacccatacccaaaccca 36128094  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6028115 - 6027889
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||    
T  6028115 aatattctcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataac 6028016  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  6028015 atggcttatcaacataaaatacttttctgcattcaggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtctcatacccatgt 6027916  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    ||| |||| ||||||||| || |||||    
T  6027915 tttaaaatcggggaaaacccaaaccca 6027889  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 10920514 - 10920687
Alignment:
Q  15 ctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgaca 114  Q
    |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  10920514 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataaca 10920613  T
Q  115 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgt 188  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  10920614 tatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtggatacctatatatccgt 10920687  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 44746335 - 44746023
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  44746335 aatatgctcactctaacatttgttagacggaataatttatttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataaccattacaatgatcaaataaaataac 44746236  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||  || ||    
T  44746235 atggcatatcaagataaagtgattttctacatttgggacgggtttgagtatgagtttgaagtgggtacatatatacccattacccgtcccatattcgtgt 44746136  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| ||||||||| || | ||||| |||||| |||||             |||||||||||  ||||||| |||| || |||||| |||||||||    
T  44746135 tttgaaatcggggaaaacccaaatccatacccaaactcaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggtacgggtgggtaaccgtggatatgag 44746036  T
Q  309 ttttgttgccatg 321  Q
    |||||||||||||    
T  44746035 ttttgttgccatg 44746023  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 14540649 - 14540863
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||     |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  14540649 aatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttaaatatcg----tagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 14540743  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| | ||||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  14540744 atgacatatcaacataaagtaattttctacgttcgggacggatttgagtatggattccgagtgggtgcctatatacccgttacctgtctcatacccgtgt 14540843  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactc 228  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  14540844 tttgaaatcggggaaaactc 14540863  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18106309 - 18106181
Alignment:
Q  16 tcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacat 115  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |    
T  18106309 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttaattgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataatgt 18106210  T
Q  116 atcaacataaaataattttttacatttgg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106209 atcaacataaaataattttttacatttgg 18106181  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31942411 - 31942173
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  31942411 aatatgttcactttaacatttgttagaccgactgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 31942313  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg- 207  Q
    ||| ||||||| |||||| || |||| | |||||| ||| ||| ||  |||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| |     
T  31942312 atggcatatcagcataaagtagttttctgcatttgtgacaggtttggttatgggtttggggtgggtacttatatacctgttacccgtctcatacccgtgt 31942213  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  31942212 ttttgaaatcgaggataacccaaacccatatccaaaccca 31942173  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 37472955 - 37472854
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37472955 aatatgctcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 37472856  T
Q  109 at 110  Q
    ||    
T  37472855 at 37472854  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19105066 - 19104822
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |  |||||||||| || |||||||||| ||  |||||||||| ||||   ||||||| || |||||||||    
T  19105066 aatatgctcactttaacatttgttagaccgatcgatttagttgctcttttaaatatcgatagtagtttttat-aacacggcaattattaaacaaaataac 19104968  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcata----gcc 204  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||  ||||||||||||||||| | || ||||     ||    
T  19104967 atgacacgtcaacataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgagtatggattcgaggtggatacctatatacccgttacacatcccatacaggccc 19104868  T
Q  205 gcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    | |||| ||||| ||||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  19104867 gtgtttggaaatcggggaaaacccaaactcatacccaaacccaatc 19104822  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 237
Target Start/End: Original strand, 22900772 - 22900885
Alignment:
Q  124 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaa 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||| |||| ||| |||||||||| ||| ||    
T  22900772 aaaataattttttacgtttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtatatataaccccgttactcgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaa 22900871  T
Q  224 aactcatacccata 237  Q
    ||| || |||||||    
T  22900872 aacccaaacccata 22900885  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 37472838 - 37472673
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnn 255  Q
    ||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||| ||         
T  37472838 gtatgggttcgaagtgggtacctaaatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaatccatactcatacccaaacccagtcaaaac 37472739  T
Q  256 nnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatg 321  Q
            ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||||    
T  37472738 ggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaactgcgggtatgggttttgttaccatg 37472673  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 38342598 - 38342504
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | || |||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38342598 gtatgggttcggggtgggtacatatatccccgttacccgtcccgtatccgtattttaaaatcggggaaaactcaaacccatatccaaacccaatc 38342504  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16226945 - 16226839
Alignment:
Q  16 tcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacat 115  Q
    ||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||     
T  16226945 tcactttaacatttcttagaccaattgatttagttgctaatttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaataaaataacatgacaa 16226847  T
Q  116 atcaacat 123  Q
    ||||||||    
T  16226846 atcaacat 16226839  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 322
Target Start/End: Original strand, 12341718 - 12341776
Alignment:
Q  264 cccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12341718 cccgtcaaattgggtttggttcggacggataaccgcgggtatgagttttgttgccatgc 12341776  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 236
Target Start/End: Original strand, 15546725 - 15546834
Alignment:
Q  127 ataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaac 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||||  |  |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  15546725 ataattttttacatttgggaagggtatgggtatgggttcagggtgggtatatataaccatgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaac 15546824  T
Q  227 tcatacccat 236  Q
     || ||||||    
T  15546825 ccaaacccat 15546834  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35248489 - 35248370
Alignment:
Q  131 ttttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcat 230  Q
    |||| ||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||| | ||||||| ||     
T  35248489 ttttctacattcaggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctttatcccctttacccgtcccatacccgtgttttgtaatcgtggaaaacccaa 35248390  T
Q  231 acccatatccaaacccaatc 250  Q
    |||| || |||||| |||||    
T  35248389 acccgtacccaaactcaatc 35248370  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 322
Target Start/End: Original strand, 37999595 - 37999653
Alignment:
Q  264 cccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37999595 cccgtcaaattgaatttggttcgggcgactaaccacggatatgggttttgttgccatgc 37999653  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 42797972 - 42797914
Alignment:
Q  264 cccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  42797972 cccgtcaaattagatttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgc 42797914  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6164552 - 6164472
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccat 236  Q
    |||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||| | || ||   ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  6164552 gtatgagttcggggtgggtacatatatcaccgttacccgtcccgtacccaaattttgaaattggggaaaacccaaacccat 6164472  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29977506 - 29977466
Alignment:
Q  282 gttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29977506 gttcgggcgggtaaccgcggatatgagttttgttgtcatgc 29977466  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Original strand, 30696908 - 30696976
Alignment:
Q  130 attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctc 198  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||    
T  30696908 attttttacatttgggataggtttgggtatgagttcggggtgggtacatatatctctgttacccgtctc 30696976  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Original strand, 43371563 - 43371651
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaac 244  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| | || |||  |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  43371563 gtatgagtttggggtgggtacatatatccccgttacccgtcccgtacccgtattttaaaatcggggaaaactcaaaccaatacccaaac 43371651  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 38342727 - 38342657
Alignment:
Q  48 gttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatca 119  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| |||| | ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38342727 gttgctcctttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 38342657  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6027872 - 6027814
Alignment:
Q  264 cccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  6027872 cccgtcaaattgggtttggttcgggcggataaccacgagtatgggttttgttgtcatgc 6027814  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 16105481 - 16105551
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagttttta 79  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||||    
T  16105481 aatacgctcactttaacatttgttagacataatgatttagttgatctgtgaaatatcaatggtaattttta 16105551  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 117
Target Start/End: Original strand, 30978804 - 30978873
Alignment:
Q  47 agttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatat 117  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| | ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30978804 agttgctcctttaactatcaatgaaagttcttat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatat 30978873  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35510542 - 35510452
Alignment:
Q  136 tacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaac 226  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||  |||||||| | | ||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||    
T  35510542 tacattcgggacggatttgagtatgaattcgaggtggatacctatatcctcattacccgtcttgtatctgtgttttgaaattggggaaaac 35510452  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 235
Target Start/End: Original strand, 35965319 - 35965423
Alignment:
Q  130 attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactca 229  Q
    ||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||| ||||| || | ||| ||| |||| | || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  35965319 attttctacattcgggacgggtttgggtatgggttcggagtgggtacatgtatccccattacacatc-catacccgtgttttgaaatcggggaaaactca 35965417  T
Q  230 taccca 235  Q
     |||||    
T  35965418 aaccca 35965423  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36128076 - 36128019
Alignment:
Q  265 ccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  36128076 ccgtcaaattaggtttggttcggacgagtaaccacgggtatgggttttgttgccatgc 36128019  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 322
Target Start/End: Original strand, 10920770 - 10920814
Alignment:
Q  278 tttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  10920770 tttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgc 10920814  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18106147 - 18106107
Alignment:
Q  207 gttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18106147 gttttgagatcggggaaaacccatacccatatccaaaccca 18106107  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 119
Target Start/End: Original strand, 26755631 - 26755703
Alignment:
Q  47 agttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatca 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||  || ||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  26755631 agttgctcctttaactatcaatgaaagttctttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatggcatatca 26755703  T

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Target: chr1 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 61)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 17134810 - 17135123
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17134810 aatatgttcactttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 17134909  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17134910 atgacatatcaacataaagtaattttttacatatgggacgagtatgggtatgggttcggggatggtacctatatacccgttacccgtctcatacccgtgt 17135009  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||              ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  17135010 tttgaaatcggggaaaacccatacccacacccaaacccagtcaaaacagagaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatggg 17135109  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  17135110 ttttgttgccatgc 17135123  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18354306 - 18353993
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18354306 aatatgttcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 18354207  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||    
T  18354206 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgagtatgggtatcggttcggggtgggaacttatatacccgttacccgtcccatacccatgt 18354107  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||             ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| || | |    
T  18354106 tttgaaatcggggaaaacccatacccatattcaaatccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgggtaatcgcgggtacggg 18354007  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  18354006 ttttgttgccatgc 18353993  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24236979 - 24236674
Alignment:
Q  17 cactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacata 116  Q
    |||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24236979 cactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacata 24236880  T
Q  117 tcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||| ||    
T  24236879 tcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttccccgttccatacccgtgttttgagat 24236780  T
Q  217 tggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttg 316  Q
     ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||             ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  24236779 cggggaaaacccatacccatacctaaacccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccatgggtatgagttttgttg 24236680  T
Q  317 ccatgc 322  Q
    ||||||    
T  24236679 ccatgc 24236674  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 40087689 - 40087377
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40087689 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 40087590  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |||| | | ||    
T  40087589 atgatatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggtacctatattcccgttactcatcccatacctgtgt 40087490  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||              |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  40087489 tttg-aatcggggaaaactcatacccatacccaaactcagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattgaatttggttcagacggataaccgcgggtatgag 40087391  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  40087390 ttttgttgccatgc 40087377  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19572737 - 19572425
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  19572737 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaa-tatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataac 19572639  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||    
T  19572638 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatacccgtgt 19572539  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |   |||| |    
T  19572538 tttgaaatcgggaaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattaggtttggttcgggcgggtaaccacaagtatggg 19572439  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  19572438 ttttgttgccatgc 19572425  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 5180908 - 5181215
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5180908 aatatgctcactttaaaatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 5181007  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||  |    
T  5181008 atgacatatcaacataaaataattttttacatttggaacgg------gtatgggtttggggtgggtgcctatatacccgttacccgtcccatacccgtat 5181101  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||             ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  5181102 tttgaaatcggggaaaacccatacccatacctaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgggtaaccgcgggtatggg 5181201  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  5181202 ttttgttgccatgc 5181215  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36187440 - 36187133
Alignment:
Q  15 ctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgaca 114  Q
    |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  36187440 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataaca 36187341  T
Q  115 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaa 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||     
T  36187340 tatcaacataaaataactttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgag 36187241  T
Q  215 attggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgt 314  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||| |||||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||||||    
T  36187240 atcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgccaaattgagtttggttcgggcgggtaacgacgggtatgggttttgt 36187141  T
Q  315 tgccatgc 322  Q
    ||||||||    
T  36187140 tgccatgc 36187133  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45866411 - 45866175
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  45866411 aatatgttcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 45866312  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||    
T  45866311 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgagtttggggtgggtacctatatactcattacctgtctcatacccgtgt 45866212  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacc 245  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45866211 tttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaacc 45866175  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50426881 - 50426648
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  50426881 aatatgctcactttaacatttgtaagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 50426782  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  50426781 atgacatatcaacataaagtaaatttttacatttgggacggg------tatgggttcggggtgggtacctatatacccgttatccgtctcatacccgtgt 50426688  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaa 248  Q
    ||||||||  |||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  50426687 tttgaaatcagggaaagcccatacccaaacccaaacccaa 50426648  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17092185 - 17091950
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17092185 aatatgttcactttaacatttattagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 17092086  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||| | | ||    
T  17092085 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggcatgggttcggggtgagtgcctatatacccgttacgcgtcccatacctgtgt 17091986  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaac 244  Q
    | | |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17091985 tataaaatcggggaaaactcatactcatatccaaac 17091950  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 28297796 - 28298035
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28297796 aataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 28297895  T
Q  109 atgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  28297896 ataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtg 28297995  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  28297996 tttcgagatcggggaaaactcatacccatacccataccca 28298035  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 49250999 - 49250686
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  49250999 aataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatcaacatgacaattatcaaacaaaatagc 49250900  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  49250899 ataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtggatacctatatacccattacccgtcccatacccgtgt 49250800  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||             ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  49250799 tttgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcggataaccacgggtatgaa 49250700  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||| |||||    
T  49250699 ttttgttgtcatgc 49250686  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 29936279 - 29936507
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  29936279 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaaaataac 29936378  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  |    
T  29936379 attacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtat 29936478  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccata 237  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  29936479 tttgagatcggggaaaacccatacccata 29936507  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3628213 - 3627985
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  3628213 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatccgttaaatattaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 3628114  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataa--ttttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgc 206  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||     
T  3628113 atgacatatcaacataaagtaattttttttacatttgggactggaatgagtatgggttcggggtgggtacctacatacccgttacccgtcccatacccgt 3628014  T
Q  207 gttttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  3628013 gttttgaaatcggggaaaacctataccca 3627985  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 42439896 - 42439661
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42439896 aataagctcactttaacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 42439797  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||    
T  42439796 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgagtttggatatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatacccatgt 42439697  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaac 244  Q
    ||||| || ||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  42439696 tttgagatcggaaaaaattcatacccatacccaaac 42439661  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 42708056 - 42707825
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42708056 aatatgctcactttaacatctgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 42707957  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| |||| ||||| | || ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||    
T  42707956 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggg------tatgggttc-gggtgagtacttatattcccgttacccgtcccatacccgtgt 42707864  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  42707863 tttgaaatcggagaaaactcatactcatacccaaaccca 42707825  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 51421721 - 51421959
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  51421721 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatagcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataac 51421820  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || |||||||  |||||||||| |||| ||| ||    
T  51421821 ataacatatcaacatagagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacatgttacccgtcccatacccgtgt 51421920  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  51421921 tttgagatcgggaaaaacccatacccatacccaaaccca 51421959  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 16408826 - 16409043
Alignment:
Q  26 atttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataa 125  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||    
T  16408826 atttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacat----acataa 16408921  T
Q  126 aataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaa 225  Q
    | |||||||||||||||||  ||||| |   |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16408922 agtaattttttacatttggagcgggtttagctatgggttcggggtcggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaattggggaaaa 16409021  T
Q  226 ctcatacccatatccaaaccca 247  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  16409022 cccatacccatacccaaaccca 16409043  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 192
Target Start/End: Original strand, 23966735 - 23966919
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23966735 aatatgctcactttaacatttgttagatggaatgatttagttgatactttaaatatcaatagtagtttttataaacatgacaattatcaaacaaaataac 23966834  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacc 192  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23966835 ataacatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacc 23966919  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 24710721 - 24710948
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24710721 aataagctcattttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 24710820  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||           |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  24710821 ataatgtatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagta-----------tgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 24710909  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24710910 tttgagatcggggaaaacccatactcatatccaaaccca 24710948  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34060245 - 34060025
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34060245 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggttgtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 34060146  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||      ||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| |    
T  34060145 at-acatatcaacataaagtaatttttttacaattgggacgg------gtatgggttcggagtgggtacctatatacctgttatccgtctcatacccgtg 34060053  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34060052 ttttgaaatcgaggaaaactcataccca 34060025  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Original strand, 34610936 - 34611170
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  34610936 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataat 34611035  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||  ||| |||| ||| ||    
T  34611036 ataacatatcaacataaagtagtattttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgagtacctatatacacgttacatgtcccatacccgtgt 34611135  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaa 243  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||    
T  34611136 tttgagatcgggaaaaacccatacccatacccaaa 34611170  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29871510 - 29871276
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||  | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||| |||||||||    
T  29871510 aatatgctcattttaatatttgttagaccgattgatgtagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacatgggaattatcaaacaaaataac 29871412  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||  ||    
T  29871411 atgacatatcaacataaaataattttctacattcgggacgggtttgggtatgagttcagggtgggtacctatataccagttacctgtcccatacccatgt 29871312  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaac 244  Q
    |||||||| || |||||| || || |||| ||||||    
T  29871311 tttgaaatcggagaaaacccaaactcatacccaaac 29871276  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 39616166 - 39616469
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| || || |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||    
T  39616166 aatatgctcactttaacatctgttagacggaatgatttaactgatcatttaaatatcaatggtaatttttattaacatgataattagcaaacaaaataac 39616265  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||    |||||||||  ||||||||||  ||| ||| ||    
T  39616266 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgggtat-------gggtg----cctatatacttgttacccgtcctatacccgtgt 39616354  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgc-ggatatga 307  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| || ||             | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  39616355 tttgaaataggggaaaacccatactcatacccaaactcagtcaaaacggggaaaactcgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccgcggggtatga 39616454  T
Q  308 gttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||| |||||    
T  39616455 gttttgttgtcatgc 39616469  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16433386 - 16433167
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |     ||||||||||| |||||||||    
T  16433386 aatatgctcactttaatatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataat----acaattatcaaacaaaataac 16433291  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||| || ||||| ||||||   ||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||    
T  16433290 atgacatatcaacataaagtaattttctgcatttggggtgggtttgggtatgggttcgg---gggtacctatatatccgttacccgtcccatacccgtgt 16433194  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||    
T  16433193 tttgaaatcggagaaaactcaaaccca 16433167  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9983115 - 9982878
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||    
T  9983115 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattaatttagttgctcctttgaatatcaatggtagttttgat-aacatgagaattatcaaacaaaataac 9983017  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| | |||| |||| |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||| ||    
T  9983016 atgatatattaacataaagtaattttctgcattcgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatactcgttacccatcccattcccgtgt 9982917  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||    
T  9982916 tttgaaattggggaaaattcaaactcatacccaaaccca 9982878  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34673475 - 34673270
Alignment:
Q  41 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||| | | |    
T  34673475 tgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtagttttcttcgt 34673377  T
Q  141 ttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatcc 240  Q
    | || || ||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||    
T  34673376 tcggaacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttaccagtctcatacccgtgttttgaaattgggaaaaacccaaacccataccc 34673277  T
Q  241 aaaccca 247  Q
    |||||||    
T  34673276 aaaccca 34673270  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44615701 - 44615463
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  44615701 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 44615603  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttac-atttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||||||   ||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |    
T  44615602 atggcatatcaagataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtg 44615503  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||| ||||  |||||||| || || |||| |||||||||    
T  44615502 tttttaaatcagggaaaacccaaactcatacccaaaccca 44615463  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 44792868 - 44793106
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  44792868 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 44792966  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttac-atttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||||||   ||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |    
T  44792967 atggcatatcaagataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtg 44793066  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||| ||||  |||||||| || || |||| |||||||||    
T  44793067 tttttaaatcagggaaaacccaaactcatacccaaaccca 44793106  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23490918 - 23490759
Alignment:
Q  88 acaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccg 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23490918 acaattatcaaacaaaataacataacatatccacataaattagttttttacatttgggacgggttttggtatgggttcggggtgggtacctatatacccg 23490819  T
Q  188 ttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23490818 ttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaaccca 23490759  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 188
Target Start/End: Original strand, 13390355 - 13390455
Alignment:
Q  88 acaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccg 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13390355 acaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctatatacccg 13390454  T
Q  188 t 188  Q
    |    
T  13390455 t 13390455  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 20774495 - 20774647
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20774495 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaataaaagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 20774594  T
Q  109 atgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacgggtatgagtatg 160  Q
    || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20774595 ataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatg 20774647  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 12494874 - 12495111
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  |   ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||   ||||||| || |||||||||    
T  12494874 aatatgttcactttaacatttgttagaccgataaatttagttgctcctttaaatatcagtggtagtttttat-aacacgccaattataaaacaaaataac 12494972  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||| ||| |||||||| | || |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||    
T  12494973 atgtcatgtcaacatatagtagttttctacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtacctatatacccgttacacgtcccatatccgtgt 12495072  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||| | |||||||    
T  12495073 tttgaaatcgggaaaaaccaaaacccataccgaaaccca 12495111  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 49741232 - 49741054
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| || ||  | | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  49741232 aatatgttcactttaacatttgttaaaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttat-aacacatcaattatcaaacaaaataac 49741134  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgt 188  Q
    || |||||| |||||||| || |||| | |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  49741133 ataacatattaacataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgt 49741054  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 35937042 - 35936911
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||    ||||||||| |||||||||    
T  35937042 aatatgctcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagttttt-gtaacacggaaattatcaaacaaaataac 35936944  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatt 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35936943 atgacatatcaacataaagtaattttctacatt 35936911  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 13020559 - 13020648
Alignment:
Q  17 cactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaata 106  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13020559 cactttaatatttgttagacggaatgatttagttgatactttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 13020648  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 44632367 - 44632250
Alignment:
Q  3 tcgaagaatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||    
T  44632367 tcgaacaatatgatcactttaacatttgttagacctattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttta-taacacgacaattgtcaaacaa 44632269  T
Q  103 aataacatgacatatcaac 121  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  44632268 aataatatggcatatcaac 44632250  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10778671 - 10778555
Alignment:
Q  131 ttttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcat 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| |||||| |     
T  10778671 ttttttacatttgagacgggtatgagtatgggttcggggtggatatctataaccccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacttaa 10778572  T
Q  231 acccatatccaaaccca 247  Q
    || |||| |||||||||    
T  10778571 actcatacccaaaccca 10778555  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 247
Target Start/End: Original strand, 34085213 - 34085336
Alignment:
Q  124 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||| || ||||  || |||||||||| ||| ||    
T  34085213 aaaataattttttacatttaggacgagtatgggtatgggttcggggtgggtacatataaccccgttacccatcccatactcgtgttttgaaatcgggaaa 34085312  T
Q  224 aactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||| || || ||||||| ||||||    
T  34085313 aacccaaactcatatcctaaccca 34085336  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 247
Target Start/End: Original strand, 23058476 - 23058567
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||  ||||||||    
T  23058476 gtatgggttcggggtgggtacctatatccccgttacccgtctcgtactcgcattttgaaatcggagaaaactcaaacccatactcaaaccca 23058567  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 322
Target Start/End: Original strand, 23968621 - 23968755
Alignment:
Q  188 ttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgg 287  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||              ||||||||||  |||||||||||    
T  23968621 ttacccgtcccatacccgtgttttgaaaccggggaaaacccatacccatacccaaacccaatcaaaatggggaaaatccgtcaaattgggtttggttcgg 23968720  T
Q  288 gcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23968721 gcgggtaaccgcgggtatgggttttgttgccatgc 23968755  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 147
Target Start/End: Original strand, 2514677 - 2514769
Alignment:
Q  55 ctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacat-atcaacataaaataattttttacatttgggac 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  2514677 ctttaaatatcaatggtagtttttatt-acacggcaattatcaaacaaaataacatgacatgttcaacataaaataattttatgcattcgggac 2514769  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 192
Target Start/End: Original strand, 16903508 - 16903569
Alignment:
Q  131 ttttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacc 192  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  16903508 ttttttacattcgggacgggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatatccccattacc 16903569  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 52
Target Start/End: Original strand, 13390312 - 13390355
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttga 52  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13390312 aatatgctcactttaacatttgttagacgaaatgatttagttga 13390355  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 42439638 - 42439583
Alignment:
Q  267 gtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  42439638 gtcaaattgagtttggttcgggcggataaccacgaatatggattttgttgccatgc 42439583  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3627964 - 3627910
Alignment:
Q  268 tcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  3627964 tcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccgcgtgtatgagttttgttgtcatgc 3627910  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 322
Target Start/End: Original strand, 13390514 - 13390572
Alignment:
Q  264 cccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||    
T  13390514 cccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgtgggtatgggttttgttgccatgc 13390572  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34059119 - 34059061
Alignment:
Q  264 cccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  34059119 cccgtcaaattgaatttggttcggacggataaccgtgggtatgggttttgttgccatgc 34059061  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23493562 - 23493497
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagt 74  Q
    |||| ||||||||  | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23493562 aataagctcacttccacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagt 23493497  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35069976 - 35069881
Alignment:
Q  148 gggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaa 243  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||  || |||  || |||||| |||||||||||| || |||| |||||    
T  35069976 gggtttgagtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtcttgtacccgtattatgaaatcggggaaaactcaaactcatacccaaa 35069881  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35936898 - 35936819
Alignment:
Q  166 ggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacc 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  || | |||||||| ||||||||| || || |||| |||||||    
T  35936898 ggggtgggtacctatatacccgttatccgtcccatactcgtgatttgaaatcggggaaaacccaaactcatacccaaacc 35936819  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 322
Target Start/End: Original strand, 28298064 - 28298122
Alignment:
Q  264 cccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  28298064 cccgtcaaattggatttggttcgggtgggtaaccacggatatgagttttgttgacatgc 28298122  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 322
Target Start/End: Original strand, 29936540 - 29936598
Alignment:
Q  264 cccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  29936540 cccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgtcatgc 29936598  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33293590 - 33293516
Alignment:
Q  176 cctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||| || || |||| ||||||||||||    
T  33293590 cctatatccccattacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaaactcatacccaaacccaatc 33293516  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 120
Target Start/End: Original strand, 38733864 - 38733965
Alignment:
Q  18 actttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatat 117  Q
    ||||||| |||| || ||| | ||||| | |||| | |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||  |||||    
T  38733864 actttaacatttcattgaccagatgatatggttgcttctttaaatatcaatgacaatttttat-aacatgacaattatcaaaccaaataacatagcatat 38733962  T
Q  118 caa 120  Q
    |||    
T  38733963 caa 38733965  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 45866157 - 45866099
Alignment:
Q  264 cccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  45866157 cccgtcaatttaggtttggctcgggcgggtaaccgcgagtatgggttttgttgccatgc 45866099  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 322
Target Start/End: Original strand, 20774685 - 20774742
Alignment:
Q  265 ccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  20774685 ccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgagtatgggttttgttgccatgc 20774742  T

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Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24160058 - 24159994
Alignment:
Q  59 aaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacata 124  Q
    |||||||||||| | ||||||| || || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  24160058 aaatatcaatgacaatttttat-aatatgacaattatcaaatcaaataacatgacatatcaacata 24159994  T

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Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 124
Target Start/End: Original strand, 36616796 - 36616864
Alignment:
Q  55 ctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacata 124  Q
    ||||||||||||| || | ||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  36616796 ctttaaatatcaacgacaatttttat-aacttgacaattatcaaaccaaataacatgacataacaacata 36616864  T

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Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 8679752 - 8679688
Alignment:
Q  16 tcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttat 80  Q
    ||||||||| ||||  | ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8679752 tcactttaacatttccttgactaaatgatttgattgctcctttaaatatcaatgataatttttat 8679688  T

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Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 48576165 - 48576105
Alignment:
Q  188 ttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaa 248  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  48576165 ttacccgtctcatacctgtgttttgagattggggaaaactctaacccatacccatacccaa 48576105  T

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Target: chr7 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 17885332 - 17885645
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  17885332 aatatgttcactttaacatttgatagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattgacatgacaattatcaaacaaaataac 17885431  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||    
T  17885432 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggttggaacctatatacccgttacccgtcccatacccatgt 17885531  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||| |||| |    
T  17885532 tttaaaatcggggaaaacccatacccatattcaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcaggtaaccacgggtatggg 17885631  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  17885632 ttttgttgccatgc 17885645  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 16866036 - 16866349
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  16866036 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttaatcatttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataac 16866135  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||    
T  16866136 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatacccgtgt 16866235  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16866236 tttgagatcggggaaaacccatacccataaccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacggatatgag 16866335  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  16866336 ttttgttgccatgc 16866349  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 39316862 - 39317175
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39316862 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaatcgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 39316961  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || |||  || |||||||||| |||||||| |||| ||| ||    
T  39316962 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgagacggatatgggtatgagttcaggatggatacatatatacccgctacccgtcccatacccgtgt 39317061  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  39317062 tttgaaatcgaggaaaactcatactcatatccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcggataaccgcgagtatgaa 39317161  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  39317162 ttttgttgccatgc 39317175  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Original strand, 30650504 - 30650811
Alignment:
Q  15 ctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgaca 114  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||    
T  30650504 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataaca 30650603  T
Q  115 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaa 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||     
T  30650604 tatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgag 30650703  T
Q  215 attggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  30650704 attggggaaaactcatacccatacctaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgagttttgt 30650803  T
Q  315 tgccatgc 322  Q
    || |||||    
T  30650804 tgacatgc 30650811  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 38140019 - 38139700
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38140019 aatacgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 38139920  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataatt-ttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| || ||||||| | ||||||||| ||||  || |    
T  38139919 atgacatatcaatataaaataatttttttacatttgagacgggtttggttatgggttcggggtgggtacttatatactcattacccgtcccatactcgtg 38139820  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatga 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||              || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  38139819 ttttgaaattggggaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacggggaaaatccatcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcggatatgg 38139720  T
Q  308 gttttgttgccatgcttaaa 327  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
T  38139719 gttttcttgccatgcctaaa 38139700  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 37182142 - 37182451
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37182142 aatatgttcactttaacatttgttagacacaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 37182241  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || || | ||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||    
T  37182242 atgacatatcaacataagataattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttc-ggatgagtacctatatacccgctacccgtcccatacccgtgt 37182340  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||| | || |||||| ||||| |||| ||||||||| ||             ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  37182341 tttgaattcggagaaaacccatactcatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttgattcgggcgggtaaccgcggatatggg 37182440  T
Q  309 ttttgttgcca 319  Q
    |||||||||||    
T  37182441 ttttgttgcca 37182451  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 44734583 - 44734272
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  44734583 aatatgctcgctttaatatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaataaaataac 44734484  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||    
T  44734483 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatatgtgtatgggttcggggtgggtacctatatacccattaccggtcccatacccgtgt 44734384  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    |||||||| | | ||||| ||||| |||  ||||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  44734383 tttgaaatcgagaaaaacacatacacattcccaaacccagtc--aaaagggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgagtatgag 44734286  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  44734285 ttttgttgccatgc 44734272  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 45379973 - 45380212
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45379973 aatacgctcactttaacatttgttagacgaactgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 45380072  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataa-ttttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||      
T  45380073 atgacatgtcaacataaagtaatttttttacatttgggacgagtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgta 45380172  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45380173 ttttgaaatcgggaaaaacccatacccatatccaaaccca 45380212  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Original strand, 7779881 - 7780188
Alignment:
Q  15 ctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgaca 114  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  7779881 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataaca 7779980  T
Q  115 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaa 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||     
T  7779981 tatcaacataaaataaatttttacatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccattatccgtcccatacccgtgttttgag 7780080  T
Q  215 attggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgt 314  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||              |||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||| |||| |||||||    
T  7780081 atcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattgagtttggttcggatgggtaaccacgggtatgggttttgt 7780180  T
Q  315 tgccatgc 322  Q
    ||||||||    
T  7780181 tgccatgc 7780188  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 21702526 - 21702839
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21702526 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatataaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 21702625  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  21702626 ataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggttggggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 21702725  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    || || || ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||              ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  21702726 ttcgagatcggggaaaacccatactcatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacggatatggg 21702825  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  21702826 ttttgttgccatgc 21702839  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45885991 - 45885753
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  45885991 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgattaagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataac 45885892  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||| ||    
T  45885891 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggattttggtatgggttcggggtgggtacctatatacttgttacccgtcccatacccgtgt 45885792  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45885791 tttgagatcggggaaaactcatacccatacccaaaccca 45885753  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 35074336 - 35074650
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  35074336 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 35074435  T
Q  109 atgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  35074436 ataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgggttgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtg 35074535  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatga 307  Q
    |||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||||     
T  35074536 ttttaagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtctaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgg 35074635  T
Q  308 gttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||||||||    
T  35074636 gttttgttgccatgc 35074650  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39456239 - 39456003
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| || ||||||||| |||  |||||||||| |||||||||    
T  39456239 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttccaatatcaatggtaatttttattaccatggcaattatcaaacaaaataac 39456140  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  ||    
T  39456139 atgacatatcaacataaagtaa-tttttacatttgggacgggtatgagtatg-gttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccatgt 39456042  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  39456041 tttgaaatcggggaaaacccatatccatacccaaaccca 39456003  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41741675 - 41741442
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  41741675 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccgttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataac 41741576  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  41741575 atgacatatcagtataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatgggttc-gggtgggtacctacatacccgttatccgtctcatacccgtgt 41741477  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaa 243  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||    
T  41741476 tttgaaatcggggaaaacccatactcatacccaaa 41741442  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 25905495 - 25905733
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| |||||| || | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25905495 aataagctcaccttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 25905594  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacg-ggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||| | | |    
T  25905595 ataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgatgtttgggtatgagttcggggt-ggtacctatgtacccgttacccgtcccatacctgtg 25905693  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25905694 ttttgagattggggaaaacccatacccatacccaaaccca 25905733  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18125454 - 18125216
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18125454 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgattctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 18125355  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  18125354 ataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgcgttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 18125255  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    || || || ||| ||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  18125254 ttcgagatcgggaaaaacccatactcatacacaaaccca 18125216  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 247
Target Start/End: Original strand, 17851750 - 17851957
Alignment:
Q  38 aaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataatttttta 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  17851750 aaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttta 17851849  T
Q  138 catttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccata 237  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||  | ||| || | || ||||||||| ||||||||||    
T  17851850 catttgggatgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatccgttacccgtcccata--cccgtgttaagatcggggaaaacccatacccata 17851947  T
Q  238 tccaaaccca 247  Q
     |||||||||    
T  17851948 cccaaaccca 17851957  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 43507300 - 43507550
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaa----- 103  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||         
T  43507300 aatatgctcactttaaaatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaatatgacaattatcaaacaaaataac 43507399  T
Q  104 -------ataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtc 196  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43507400 atacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgagtataggtatgggttcagggtgggtgcctatatacccgttacccgtc 43507499  T
Q  197 tcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||    
T  43507500 tcatacccatgttttgaaatcggggaaaacccatacttatacccaaaccca 43507550  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 41103528 - 41103749
Alignment:
Q  17 cactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatca---atgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgac 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||     
T  41103528 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcatcaatggtaatttgtattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagag 41103627  T
Q  114 atatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  41103628 atatcaacataaaataattttttacatttaggacgggtttatgtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttaaccgtcccatacccgtgttttga 41103727  T
Q  214 aattggggaaaactcataccca 235  Q
    ||| ||||||||| ||||||||    
T  41103728 aatcggggaaaacccataccca 41103749  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44794253 - 44794051
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44794253 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaagtatcaatggtagtttttagtaacatgacaattatcaaacaaaataac 44794154  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  44794153 ataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacct-tatactcgttacccgtctcatacccgtgt 44794055  T
Q  209 tttg 212  Q
    ||||    
T  44794054 tttg 44794051  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 321
Target Start/End: Original strand, 12980244 - 12980556
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  12980244 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttat-aacacgaaaattatcaaacaaaataac 12980342  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataatttttta-catttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||| |    
T  12980343 atggcatatcaacataaaatattttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattacccgtcccatacccgtg 12980442  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatga 307  Q
    ||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||| ||             ||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||| ||| |||||    
T  12980443 ttttgaaatcggggaaaaccaaaacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgttaaattgagtttggttctagcgggtaaccacgggtatga 12980542  T
Q  308 gttttgttgccatg 321  Q
    ||||||||||||||    
T  12980543 gttttgttgccatg 12980556  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25980135 - 25979921
Alignment:
Q  17 cactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacata 116  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||     
T  25980135 cactttaacatttgttagacggaatgatttatttaatcctttaaatatcaatgtaagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatt 25980036  T
Q  117 tcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || | || ||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  25980035 tcaacataaaataattttttacatttggaaaggatttgggtatgagtttggggtgggtacatatatatccgttacccgtctcatacctgtgttttgaaat 25979936  T
Q  217 tggggaaaactcata 231  Q
     ||||||||| ||||    
T  25979935 cggggaaaacccata 25979921  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3227108 - 3226944
Alignment:
Q  73 gtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgg 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  3227108 gtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggatgtgtatgagtatgggttcggggtgg 3227009  T
Q  173 gaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccata 237  Q
    | |||||||| || |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3227008 gtacctatattcctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccata 3226944  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 24753043 - 24753343
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24753043 aataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatc-tttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 24753141  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||           |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  24753142 ataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggt-----------acctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 24753230  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||              |||||||||| | |||||||||| ||| ||||| ||| |||| |    
T  24753231 tttgagatcggg-aaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacggagaaaatccgtcaaattgaatttggttcggacgggtaaccacgggtatggg 24753329  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  24753330 ttttgttgccatgc 24753343  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27850519 - 27850245
Alignment:
Q  41 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||    
T  27850519 tgatttagttgctcctttaaatatcaatgaaagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcatcgtaaagtaattttctacat 27850421  T
Q  141 ttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatcc 240  Q
    | ||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||      ||||||| ||    
T  27850420 tcgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatacacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaa------acccataccc 27850327  T
Q  241 aaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||              ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27850326 aaacccaatcaaaacggggaaaaaccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacggatatgagttttgttgccatgc 27850245  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Original strand, 10072429 - 10072646
Alignment:
Q  105 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  10072429 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgttccataccc 10072528  T
Q  205 gcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggata 304  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10072529 gtgttttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggta 10072628  T
Q  305 tgagttttgttgccatgc 322  Q
    || |||||||||||||||    
T  10072629 tgggttttgttgccatgc 10072646  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45709088 - 45708867
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| ||||||||     
T  45709088 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaatatgacaattatcaaacaaaataat 45708989  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||    
T  45708988 ataacatatcaacataaagta---ttttacattttggacgggtttaggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtccaatacccgtgt 45708892  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacc 233  Q
    ||||| || || |||||| ||||||    
T  45708891 tttgagatcggagaaaacccatacc 45708867  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44986124 - 44985978
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44986124 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 44986025  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagt 157  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44986024 at-acatatcaacat-aaataattttttacatttgggacgggtatgagt 44985978  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18826097 - 18825872
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  18826097 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcttttatatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 18825999  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  18825998 atggcatatcaacgtaaaataattttctgtatttgggatgggtttgggtacgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 18825899  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||    
T  18825898 tttgaaatcggggaaaacccaaaccca 18825872  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 38152769 - 38152992
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||               ||||||||| |||||||||    
T  38152769 aatacgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttagatatcaatggtagt---------------aattatcaaacaaaataac 38152853  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  |||| ||  ||    
T  38152854 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatagccgttatccgttccatacccatgt 38152953  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38152954 tttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaaccca 38152992  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37196224 - 37196041
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  37196224 aatacgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttatatatcaatggtagtttttattaacatgacagttatcaaacaaaataac 37196125  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacc 192  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  37196124 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttatgacgggtttgggtatggattcggggtgggtagctatatacccattacc 37196041  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44658639 - 44658496
Alignment:
Q  45 ttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44658639 ttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaatatttttttacatttgg 44658540  T
Q  145 gacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgt 188  Q
     |||||| || ||||| ||||||| | || ||||||||||||||    
T  44658539 tacgggtttgggtatgggttcgggataggtacctatatacccgt 44658496  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 3920406 - 3920631
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||||  | | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  3920406 aatacgctcattttaacatttgttagaccgattcatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacatggcaattatcaaacaaaataac 3920504  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | | || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| | | ||    
T  3920505 atggcatatcaacataaaataattttctacattcgggacagttttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttatccgtcccataccagtgt 3920604  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||    
T  3920605 tttgaaatcggggaaaacccaaaccca 3920631  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 16811635 - 16811812
Alignment:
Q  47 agttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttggga 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16811635 agttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataatatatcaacataaagtaattttttacatttggga 16811734  T
Q  147 cgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaa 225  Q
    ||| | || ||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  16811735 cggctttgggtatgggttc-gggtgggtatctatatacccattatccgtctcatacccgtgttttgagatcggggaaaa 16811812  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2630799 - 2630562
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || |   |||||||||| |||||||||    
T  2630799 aatatgttcactttaacatttgatagaccgattgatttagttgctcatttaaatatcaatggtagtttttat-aatacggcaattatcaaacaaaataac 2630701  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataatttttta-catttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||| ||  |    
T  2630700 atggcatatcaacataaagtagtttttttgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacccgtcacccgtcccatacccatg 2630601  T
Q  208 ttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||| |||| ||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  2630600 tttt-aaatcggggaaaacccaaacccatacccaaaccca 2630562  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Original strand, 26622851 - 26623044
Alignment:
Q  41 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 140  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  26622851 tgatttaattgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacaacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaaataattttttgcat 26622949  T
Q  141 ttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    | |  ||| || || ||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||||||  |||||||| || |||||    
T  26622950 tcgaaacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattacccatcccatacccgtgttttgaaatcagggaaaacccaaaccca 26623044  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 5376953 - 5377169
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||  | ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||    
T  5376953 aatatgctcattttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaattac 5377051  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | | || ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| | | ||    
T  5377052 atgatatatcaacataaagtaattttctgcattcgggacagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatataccctttacccgtcccatacctgtgt 5377151  T
Q  209 tttgaaattggggaaaac 226  Q
    |||||||| |||||||||    
T  5377152 tttgaaatcggggaaaac 5377169  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 37579130 - 37579313
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37579130 aatatgctcactttaacatttgttagatggattgatttagttgctcatttaaatatcaatgataatttttat-aacatgacaattatcaaacaaaataac 37579228  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttaccc 193  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||| | | || ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37579229 atggcatagcaacataaagtaattttctgcatttgagacagctttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccgttaccc 37579313  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 46127402 - 46127217
Alignment:
Q  12 atgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatg 111  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  46127402 atgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagttattat-aacacgacaatgatcaaacaaaataacatg 46127304  T
Q  112 acatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcata 201  Q
    ||||||||   |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  46127303 acatatca---taaaataattttctgcatttgggacgggtttgagtatgagatcggtgtgggtacctatacacctgttatccgtcccata 46127217  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25783128 - 25782931
Alignment:
Q  13 tgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatga 112  Q
    |||||||||||||||||  || ||  | ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||| ||||    
T  25783128 tgctcactttaatatttattataccgattgatttagttgctcctttaaatattgatgatagtttttat-aacactgcaattatcaaacaaaataatatga 25783030  T
Q  113 catatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgtttt 211  Q
     |||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||| | |  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||    
T  25783029 gatattaacataaagtaattttctgcattcgggacggattttggtatgagttcggggtgggtacctatatacccattatccgtctcatacccgtgtttt 25782931  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 24425249 - 24425454
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | ||||||||| || ||||||    
T  24425249 aatatgctcactttaacatttgttagaccggttgatttatttg-tcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgataattatcaaacagaataac 24425346  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||||| ||   ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  24425347 atggcatatcaacatatagtaattttatgcatttggaacgggtttggaaatggggtcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 24425446  T
Q  209 tttgaaat 216  Q
    ||||||||    
T  24425447 tttgaaat 24425454  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26004665 - 26004474
Alignment:
Q  41 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 140  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||    
T  26004665 tgatttagtcgctcctttaaatatcaatgatagtttttat-aagaagacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtaattttctgcat 26004567  T
Q  141 ttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    | ||| || || || ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||| | ||||||| || |||||    
T  26004566 tcggggcgagt-tg-gtatgggttcggggtgggtatctatatacctgttacccgtcccatacccaagttttgaaatcgaggaaaacccaaaccca 26004474  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 16078881 - 16079097
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  16078881 aatatgttcactttaacattttttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaagggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 16078979  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||| |  |||   |||| || || ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  16078980 atggcatatcaacgtaaagtaattttctgtattcatgacgagtttgggtataggtttggggtgggcacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 16079079  T
Q  209 tttgaaattggggaaaac 226  Q
    ||||| || || ||||||    
T  16079080 tttgagatcggagaaaac 16079097  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27896586 - 27896460
Alignment:
Q  124 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||  ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||  |||||    
T  27896586 aaaataattttttatattcgggacgggtatgggtatgagttcggggttggtgcatataaccccgttacccgtcccatacccatgttttgaaataagggaa 27896487  T
Q  224 aactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  27896486 aacccaaacccatacccaaacccaatc 27896460  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3227769 - 3227696
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttatta 82  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3227769 aatatgctcacttcaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttatta 3227696  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Original strand, 23328477 - 23328641
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||| |||||||||    
T  23328477 aatatgctcactttagcatttattagaccgattgatttagttattcctttaaatatcaatgataattttta-tagcacgacaattatcaaacaaaataac 23328575  T
Q  109 atgacatatcaacat-aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtggg 173  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| || ||||  | ||||||||||    
T  23328576 aagacatgtcaacataaaaataattttctccattcgggacgggtttgggtataggatcggggtggg 23328641  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8906700 - 8906574
Alignment:
Q  124 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||| || ||||  |||||||  |||||||||  || |||||||||| || |||    
T  8906700 aaaataattttttacatttggaacaggtatggatatgggttcggggtgggtacatataaccccgttattcgtctcatactcgtgttttgaaatcggagaa 8906601  T
Q  224 aactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  8906600 aactcaaacccatacccaaatccaatc 8906574  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 229
Target Start/End: Original strand, 33841071 - 33841165
Alignment:
Q  135 ttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactca 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||  |  |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  33841071 ttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgagtacatataaccatgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaactca 33841165  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Original strand, 10072357 - 10072434
Alignment:
Q  10 atatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatag-tttttattaacat 86  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  10072357 atatgctcactttaacatttgttaggcggaatgatttagttgatcatttaattatcaatggtagttttttattaacat 10072434  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 26004746 - 26004673
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttatta 82  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26004746 aatatgctcattttaacatttgttagaccgattgatttagtcgctcctttaaatatcaatggtagtttttatta 26004673  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10995934 - 10995843
Alignment:
Q  135 ttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaac 226  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||  || |||||||||| |||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  10995934 ttacatttggaacgggtatgggtatgggttcggggtgggtatatataaccctgttacccgtcccatacccgtgtcttgaaatcggggaaaac 10995843  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26004453 - 26004399
Alignment:
Q  268 tcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26004453 tcaaattgtgtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgagttttgttgccatgc 26004399  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 226
Target Start/End: Original strand, 42005887 - 42005988
Alignment:
Q  124 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||| | || ||||  ||||| ||||||| ||||  || |||||||||||| ||||    
T  42005887 aaaataattttttacatttgggacgggaatggttatg-gtttggggtgagtacatataaccccgtaacccgtcccatacacgtgttttgaaattgaggaa 42005985  T
Q  224 aac 226  Q
    |||    
T  42005986 aac 42005988  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 245
Target Start/End: Original strand, 3157081 - 3157186
Alignment:
Q  140 tttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatc 239  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||   ||||||||| |||||||||  | ||||||| |    
T  3157081 tttgggacgggtttgggtataggttcggtgtgggtacctatatccccgttatccgtcccatacccatattttgaaatcggggaaaacctaaacccatacc 3157180  T
Q  240 caaacc 245  Q
    ||||||    
T  3157181 caaacc 3157186  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3274810 - 3274763
Alignment:
Q  104 ataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  3274810 ataacatgacatatcaacataatgtaattttctacattcgggacgggt 3274763  T

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Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5565414 - 5565299
Alignment:
Q  128 taattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaact 227  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||| || ||||  |||||||||| || |||| |||   ||||||||  ||||||||     
T  5565414 taattttttacatttgggatgtgtatgggtatgggttaggggtgggtacatataaccccgttacccatcccatatccgtactttgaaatcagggaaaacc 5565315  T
Q  228 catacccatatccaaa 243  Q
    || ||| ||| |||||    
T  5565314 caaacctataaccaaa 5565299  T

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Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 235
Target Start/End: Original strand, 24903399 - 24903509
Alignment:
Q  124 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaa 223  Q
    |||||| |||| |||||  |||| |||| || ||||||||| ||| |||| |||||||||||   |||| |||||||| ||  ||||||||||| || ||    
T  24903399 aaaatagttttctacatccgggatgggtttgtgtatgagtttggg-tgggtacctatatacctactacctgtctcataaccttgttttgaaatttggaaa 24903497  T
Q  224 aactcataccca 235  Q
    ||||||||||||    
T  24903498 aactcataccca 24903509  T

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Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 247
Target Start/End: Original strand, 27063348 - 27063439
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | || |||  || | |||| |||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  27063348 gtatgagttcggggtgggtacatatattcccgttacccgtcccgtacccgtattattaaatcggggaaaaccgagacccatacccaaaccca 27063439  T

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Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 247
Target Start/End: Original strand, 31426022 - 31426113
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||| || ||| ||| | |||||||    
T  31426022 gtatgcgttcggggtggatacatatatccccgttacccgtctcatacccgtatttttaaatcggggaaaacccaaaccaataccaaaaccca 31426113  T

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Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 21750796 - 21750866
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaac 226  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||    
T  21750796 gtatgagttcgaggtgggtacatatatccccgtcacccgtctcatatccgtattttgaaatcgggaaaaac 21750866  T

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Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 41741417 - 41741363
Alignment:
Q  268 tcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  41741417 tcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcaaatatgggttttgttgccatgc 41741363  T

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Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 321
Target Start/End: Original strand, 3774196 - 3774249
Alignment:
Q  268 tcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatg 321  Q
    |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3774196 tcaaattaggtttggttcgggtggttacccgcggatatgggttctgttgccatg 3774249  T

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Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Original strand, 21750660 - 21750740
Alignment:
Q  38 aaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatca 119  Q
    |||| ||||||||| || ||||| ||||||||| ||||  ||| | ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21750660 aaataatttagttggtcttttaactatcaatgaaagttcatat-atcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatatca 21750740  T

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Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 322
Target Start/End: Original strand, 24425491 - 24425548
Alignment:
Q  265 ccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  24425491 ccgtcaaattgggtttggttcgggctggtaaccacgtgtatgagttttgttgccatgc 24425548  T

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Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37195979 - 37195922
Alignment:
Q  265 ccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||    
T  37195979 ccgtcaaattgagtttggtttgggcggataaccacgggtatggattttgttgtcatgc 37195922  T

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Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 322
Target Start/End: Original strand, 38153009 - 38153066
Alignment:
Q  265 ccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||   ||||||||||||||    
T  38153009 ccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccgtgggtatagtttttgttgccatgc 38153066  T

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Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Original strand, 3774057 - 3774125
Alignment:
Q  130 attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctc 198  Q
    ||||| || ||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  3774057 attttctaaattcgggacggatttgagtatgggttcagggtgggtacctatatcctcgttacccgtctc 3774125  T

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Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19440114 - 19440010
Alignment:
Q  131 ttttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcat 230  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||  ||||| || ||||| ||| |||||| || || | ||| ||||| ||||  |||||||||||     
T  19440114 ttttttacattcgggacgggtttgggtatgggttcgaagtgggtacatatatccccattacccatcccaaacccgtgttttcaaatcagggaaaactcaa 19440015  T
Q  231 accca 235  Q
    |||||    
T  19440014 accca 19440010  T

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Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23475367 - 23475263
Alignment:
Q  131 ttttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcat 230  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||  ||||| || ||||| ||| |||||| || || | ||| |||||||||| ||| ||||| ||     
T  23475367 ttttttacattcgggacgggtttgggtatgggttcgaagtgggtacatatatccccattacccatcccaaacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaa 23475268  T
Q  231 accca 235  Q
    |||||    
T  23475267 accca 23475263  T

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Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 247
Target Start/End: Original strand, 27063127 - 27063243
Alignment:
Q  131 ttttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcat 230  Q
    |||| |||||| |||  |||| || |||||||||||||||| | || ||||| ||||||| |||||   || |||  ||||||||| | ||||||||||     
T  27063127 ttttctacattcgggtagggtttgggtatgagttcggggtgagtacatatatccccgttatccgtcctgtacccgtattttgaaatcgaggaaaactcaa 27063226  T
Q  231 acccatatccaaaccca 247  Q
    || |||| |||||||||    
T  27063227 actcatacccaaaccca 27063243  T

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Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44658495 - 44658455
Alignment:
Q  207 gttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  44658495 gttttgaaatcgggaaaaactcatacccatacccaaaccca 44658455  T

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Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 45708828 - 45708784
Alignment:
Q  278 tttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  45708828 tttgattcgggcggataatcacgtatatgagttttgttgccatgc 45708784  T

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Target: chr6 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 321
Target Start/End: Original strand, 32853706 - 32854018
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  32853706 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataac 32853805  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  32853806 ataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 32853905  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |    
T  32853906 tttgagatcggggaaaacccatacccataaccaaacccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcggtcggataaccacgggtatggg 32854005  T
Q  309 ttttgttgccatg 321  Q
    |||||||||||||    
T  32854006 ttttgttgccatg 32854018  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Original strand, 27534553 - 27534859
Alignment:
Q  16 tcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacat 115  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27534553 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgattctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacat 27534652  T
Q  116 atcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaa 215  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| || |    
T  27534653 atcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatggattcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgaga 27534752  T
Q  216 ttggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgtt 315  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||             ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  27534753 tcggggaaaactcatacccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcggacggttaaccacgggtatgggttttgtt 27534852  T
Q  316 gccatgc 322  Q
    |||||||    
T  27534853 gccatgc 27534859  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10142738 - 10142506
Alignment:
Q  15 ctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgaca 114  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  10142738 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataaca 10142639  T
Q  115 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||     
T  10142638 tatcaacataaaataattttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatacccgttttttgag 10142539  T
Q  215 attggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10142538 atcggggaaaacccatacccatacccaaaccca 10142506  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 328
Target Start/End: Original strand, 2367188 - 2367507
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2367188 aataagctcactttaacatttgttagacaaaatgatttagtttatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 2367287  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  2367288 ataacatatccacataaagtaattttttccatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatacccgtgt 2367387  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||             ||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |    
T  2367388 tttgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacctagtcaaaacgggaaaaacccatcaaattgggtttggttcggacgggtaaccacggatatggg 2367487  T
Q  309 ttttgttgccatgcttaaac 328  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  2367488 ttttgttgccatgcctaaac 2367507  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Original strand, 12141253 - 12141485
Alignment:
Q  15 ctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgaca 114  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  12141253 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgttagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacg 12141352  T
Q  115 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||     
T  12141353 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgtcacccgtcccatatccgtgttttgag 12141452  T
Q  215 attggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  12141453 attggggaaaacccatacccgtacccaaaccca 12141485  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 24225560 - 24225799
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24225560 aataagctgactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 24225659  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  24225660 ataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggcatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatatccgtgt 24225759  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaa 248  Q
    ||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  24225760 tttgagatcggggaaaatccatacccatacccaaacccaa 24225799  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5863603 - 5863298
Alignment:
Q  15 ctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgaca 114  Q
    |||||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||    
T  5863603 ctcactttcacattttttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacataaca 5863504  T
Q  115 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaa 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  5863503 tatcaacataaaatatttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtatctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaa 5863404  T
Q  215 attggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgt 314  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||    
T  5863403 atcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcaggtaaccacgggtatgggttttgt 5863304  T
Q  315 tgccat 320  Q
    ||||||    
T  5863303 tgccat 5863298  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10188299 - 10187993
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  10188299 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcgaacaaaataac 10188200  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||       ||||| |||| ||| ||    
T  10188199 ataatatatcaacataaaataattttttacatttgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatac-------ccgtcccatacccgtgt 10188107  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaagtttggttcgggcggataaccgcggatatgag 308  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||             |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  10188106 tttgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatggg 10188007  T
Q  309 ttttgttgccatgc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  10188006 ttttgttgccatgc 10187993  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 247
Target Start/End: Original strand, 27738664 - 27738872
Alignment:
Q  39 aatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttac 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27738664 aatgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcatacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttac 27738763  T
Q  139 atttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatat 238  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || |||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  27738764 atttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatatctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccatac 27738863  T
Q  239 ccaaaccca 247  Q
    | |||||||    
T  27738864 ctaaaccca 27738872  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3484149 - 3483911
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||    
T  3484149 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatgaaacaaaataac 3484050  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||| ||    
T  3484049 ataacatatccacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccatcccatacccgtgt 3483950  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    || || || ||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  3483949 ttcgagatcggggaaaacccatacacatacccaaaccca 3483911  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 12309441 - 12309673
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||       || || ||||||||||| |||||||||    
T  12309441 aatatgtttactttaacatttgttagacgaaatgatttaattgcccctttaaatatcaatgatagt-------aatatgacaattatcaaacaaaataac 12309533  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| || |||||||| |||||||||  |||| ||| ||    
T  12309534 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatcggttcggggtgggtacatatatacctgttacccgttccatacccgtgt 12309633  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaa 248  Q
    ||||||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  12309634 tttgaaatcagggaatacccatacccatacccaaacccaa 12309673  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 170
Target Start/End: Original strand, 14032419 - 14032579
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  14032419 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttat-aacacaacaattatcaaacaaaataac 14032517  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  14032518 atgacatatcaacataaagtaattttatgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggt 14032579  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Original strand, 32532498 - 32532642
Alignment:
Q  105 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  32532498 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccataccc 32532597  T
Q  205 gcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaat 249  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  32532598 gtgttttgaaatcggggaaaacccatactcatactcaaacccaat 32532642  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12678287 - 12678082
Alignment:
Q  41 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  12678287 tgatttagttgctcctttaaatatcaatgataatttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaatataaaataattttctcaat 12678189  T
Q  141 ttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatcc 240  Q
    | ||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| | | || ||||||| ||||||||| || || |||| ||    
T  12678188 tcgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatataccctttacccgtcccatacctgtgtcttgaaatcggggaaaacgcaaactcataccc 12678089  T
Q  241 aaaccca 247  Q
    |||||||    
T  12678088 aaaccca 12678082  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 14505949 - 14506174
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  14505949 aatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataac 14506047  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
     ||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||| | | ||    
T  14506048 gtgacatatcaacacaaagtagttttctgcatttgggacgggtttaagtatgggttcggggtgggtacctaaatacttgttacccgtcccatacctgtgt 14506147  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||    
T  14506148 tttgaaatcggggaaaacccaaaccca 14506174  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 235
Target Start/End: Original strand, 32053000 - 32053176
Alignment:
Q  59 aaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagta 158  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| || |||    
T  32053000 aaatatcattgtaagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtatttttttacattttggacgggtttgggta 32053099  T
Q  159 tgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32053100 tgggtttggggtgggtacatatatacccgttacccgtcccatatccatgttttgaaatcggggaaaacccataccca 32053176  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24603081 - 24602856
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||    
T  24603081 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgtcaattatcaaacaaaataac 24602983  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||| |||||| | || |||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||  ||    
T  24602982 atggcacatcaacataaagtaattttctacattcgtgatgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacctgttacccgtcacatacccatgt 24602883  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||    
T  24602882 tttgaaatctgggaaaacccaaaccca 24602856  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 247
Target Start/End: Original strand, 11762342 - 11762545
Alignment:
Q  43 atttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacattt 142  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11762342 atttagttgctcctataaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatataacaaaataacatggcatatcaacataaagtaattttctacattt 11762440  T
Q  143 gggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaa 242  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||    
T  11762441 gggatgggtttgggtatgagttcggggtggacacctatatacccgttacccgtcccatacccttgtttagaaatcgggaaaaacctaaatccatatccaa 11762540  T
Q  243 accca 247  Q
    |||||    
T  11762541 accca 11762545  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 30816128 - 30816361
Alignment:
Q  17 cactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacata 116  Q
    |||||||| ||||| |||||  | |||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||| ||||   |||||||| | ||||||||||| |||||    
T  30816128 cactttaacatttgttagaccgattgatttaggtgctcctttaaatgtcaatggtagtttttat-aacacggcaattatccaacaaaataacatcacata 30816226  T
Q  117 tcaacataaaataatttttta---catttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttga 213  Q
    |||||||||| || ||||||    |||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| || |||| ||| ||||  |    
T  30816227 tcaacataaagtagtttttttttgcattcgggacgggtttggatatgggttcggggtgggttcctatatacccattacccatcccatacccgtgttt--a 30816324  T
Q  214 aattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30816325 aaatggggaaaactcaaacccatatccaaacccaatc 30816361  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7394112 - 7393897
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    ||||||||| ||||||||     
T  7394112 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatgttagtttttat-aacacggtaattatcaaacaaaataat 7394014  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||  ||| | || |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| ||  || ||    
T  7394013 atgatataccaacataaaataaatttatgcattcaggatgagtttgagtatgggttcggggtggatacctatatacccattatccgtctcttactcgtgt 7393914  T
Q  209 tttgaaattggggaaaa 225  Q
    |||||||| ||||||||    
T  7393913 tttgaaatcggggaaaa 7393897  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 14254821 - 14255057
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| | ||||||| ||||  |||||  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||| |||||||||    
T  14254821 aatatgttgactttaacatttattagaccgaatgatttaatcgctcctttaaatatcaatgatagtttttat-aacacatcaaatttcaaacaaaataac 14254919  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||  | || ||||| ||||  |||||| ||||||||  ||||||| |||| |||| ||| |     
T  14254920 atgacatatcaacataaagttattatttgcatttgggacgaatttgggtatgggttcatggtgggtacctatatttccgttacacgtcccatacccgtg- 14255018  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14255019 tttgaaatcagagaaaactcaaacccatacccaaaccca 14255057  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 247
Target Start/End: Original strand, 15498309 - 15498424
Alignment:
Q  132 tttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcata 231  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  15498309 tttttacatttgggacgggtttgggtgtgggttcgggatgggtacctatatacccattacctgtctcatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccata 15498408  T
Q  232 cccatatccaaaccca 247  Q
     ||||| |||||||||    
T  15498409 tccatacccaaaccca 15498424  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 32532426 - 32532503
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacat 86  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32532426 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttggtcctttaaatatcattggtagtttttattaacat 32532503  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 225
Target Start/End: Original strand, 20349039 - 20349142
Alignment:
Q  122 ataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattgggg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||||||| ||||    
T  20349039 ataaattaattttttacatttgcaacggatttgggtatgagttcggggtgggtacctatatccccgttactcgtcccatacccgtgttttgaaatcgggg 20349138  T
Q  222 aaaa 225  Q
    ||||    
T  20349139 aaaa 20349142  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 327
Target Start/End: Original strand, 30986284 - 30986433
Alignment:
Q  178 tatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaag 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||| || ||             ||||||||||| ||    
T  30986284 tatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccatacccaaactcagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgag 30986383  T
Q  278 tttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgcttaaa 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  30986384 tttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaaa 30986433  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14410946 - 14410861
Alignment:
Q  144 ggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactca 229  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  14410946 ggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatctgggaaaactca 14410861  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14411058 - 14410954
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||    
T  14411058 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgatggttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataac 14410960  T
Q  109 atgaca 114  Q
    | ||||    
T  14410959 acgaca 14410954  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 256597 - 256483
Alignment:
Q  130 attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactca 229  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| || ||||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  256597 attttctacatttaggaggggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatatgcccattacccgtctcgtacccatgttttgaaatcggggaaaactca 256498  T
Q  230 tacccatatccaaac 244  Q
     || |||| ||||||    
T  256497 aactcatacccaaac 256483  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 250
Target Start/End: Original strand, 29341233 - 29341359
Alignment:
Q  124 aaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaa 223  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||  ||||  |||| ||| ||    
T  29341233 aaaatgattttctacattcgggacgggtttgggtatgagtttgggatgggtacctatatctccgttacccgtctcatgcccatgtttgaaaatcgggaaa 29341332  T
Q  224 aactcatacccatatccaaacccaatc 250  Q
    ||| || || |||||||||||||||||    
T  29341333 aacccaaactcatatccaaacccaatc 29341359  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 114
Target Start/End: Original strand, 14245110 - 14245214
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||    
T  14245110 aatatgttcactttaacatttattagaccgaatgatttagtcgctcctttaaatattaatggtagttttta-taacacgacaattttcaaacaaaataac 14245208  T
Q  109 atgaca 114  Q
    ||||||    
T  14245209 atgaca 14245214  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28079775 - 28079687
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaac 244  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | || ||  |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||    
T  28079775 gtatgggttcggggtgggtacctatatccccgttacccgtcccgtacccatgttttgaaatcggggaaaacccaaacccatacccaaac 28079687  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 245
Target Start/End: Original strand, 9442445 - 9442528
Alignment:
Q  162 gttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacc 245  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  9442445 gttcggagtgggtacctctatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaatcccatacccatacccaaacc 9442528  T

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Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 244
Target Start/End: Original strand, 19366988 - 19367106
Alignment:
Q  126 aataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaa 225  Q
    ||||||||| ||||||   || |||| || ||||| ||| | |||||| | |||||| |  ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  19366988 aataattttctacattcaagaagggtttgggtatgggtttgaggtgggcaactatattcatgttacccgtctcatacccgtgttttaaaattggggaaaa 19367087  T
Q  226 ctcatacccatatccaaac 244  Q
      |||||||||||||||||    
T  19367088 tccatacccatatccaaac 19367106  T

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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 322
Target Start/End: Original strand, 31496464 - 31496609
Alignment:
Q  177 ctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaa 276  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| ||  |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||             ||||||||||| |    
T  31496464 ctatatacccgtcccccgtcccatacccatgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattga 31496563  T
Q  277 gtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||| || ||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  31496564 gtttggtttggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgc 31496609  T

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Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 322
Target Start/End: Original strand, 31501850 - 31501995
Alignment:
Q  177 ctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaacccaatcnnnnnnnnnnnnncccgtcaaattaa 276  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| ||  |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||             ||||||||||| |    
T  31501850 ctatatacccgtcccccgtcccatacccatgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattga 31501949  T
Q  277 gtttggttcgggcggataaccgcggatatgagttttgttgccatgc 322  Q
    |||||||| || ||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  31501950 gtttggtttggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgc 31501995  T

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Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 235
Target Start/End: Original strand, 14034521 - 14034590
Alignment:
Q  166 ggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | || || |||| |||||||||||| |||||    
T  14034521 ggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacttgtgtcttaaaatcggggaaaactcaaaccca 14034590  T

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Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 32052927 - 32052988
Alignment:
Q  17 cactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagttttt 78  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  32052927 cactttaacatttgttagacggaatgatttatttaatcctttaaatatcaatgtaagttttt 32052988  T

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Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 247
Target Start/End: Original strand, 9458672 - 9458763
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaaccca 247  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||| ||||||| | ||| | || |||  ||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||    
T  9458672 gtatgagttcgaggtgggtacatatatccccgttatctgtcccgtacccgtattttgaaattggggaaatctcaaactcatacccaaaccca 9458763  T

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Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 235
Target Start/End: Original strand, 32959869 - 32959948
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||  | || ||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  32959869 gtatgggttcggggtggatacctatatccccgttacccgttccgtacccgtgttttgaaattagggaaaacccaaaccca 32959948  T

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Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 247
Target Start/End: Original strand, 13769055 - 13769172
Alignment:
Q  130 attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactca 229  Q
    ||||| ||||||  |||||||| ||  |||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||  |||||||| | |||||||||  |    
T  13769055 attttctacattcaggacgggtttggatatgggttctgggtgggtacctatatgtccgttacccgtcccatacccatgttttgaagtcggggaaaaccga 13769154  T
Q  230 tacccatatccaaaccca 247  Q
     ||||||| | |||||||    
T  13769155 aacccatacctaaaccca 13769172  T

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Target: scaffold0189 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 4119 - 4327
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4119 aatatgttcactttaacatttgttagatggaatgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 4218  T
Q  109 atgacatatcaacataaaata-attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcg 207  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||| ||| |  ||||| ||  |||||| ||||||| |||||||| ||| |    
T  4219 atgacatatcaacataaagtattttttttacatttgggacgagtttgggtatgggtttgaagtgggtacaaatatactcgttaccagtctcatacccgtg 4318  T
Q  208 ttttgaaat 216  Q
    |||||||||    
T  4319 ttttgaaat 4327  T

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Target: scaffold0036 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 248
Target Start/End: Original strand, 33288 - 33494
Alignment:
Q  41 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| | |||    
T  33288 tgatttagttgttcctttaaatatcaatcgtagtttttat-aacacaacaattaccaaacaaaataacatggcatgtcaacataaagtagttttctgcat 33386  T
Q  141 ttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatcc 240  Q
    | |||||| || || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||    
T  33387 tcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccaaacccataccc 33486  T
Q  241 aaacccaa 248  Q
    ||||||||    
T  33487 aaacccaa 33494  T

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Target: scaffold0519 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 215
Target Start/End: Original strand, 10163 - 10365
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |   | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  10163 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatgac---ggtagtttttattaatatgacaattatcaaacaaaataac 10259  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||    
T  10260 at-acatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctatatacctgttatccgtcccatacccgtgt 10358  T
Q  209 tttgaaa 215  Q
    || ||||    
T  10359 ttggaaa 10365  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 90460 - 90685
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| || |||| | ||||||| || |||||||||    
T  90460 aatatactcactttaatatttgttagaccgattgatttatttgctcctttaaatatcaatggttgttttaat-aacacatcaattattaaacaaaataac 90558  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgt 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||  |||||  | || ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  90559 atggcatatcaacataaaataattttctgcattcaggacgaatttgtgtatgggttcggggagggtaccaatatacccgttaaccgtctcatacccgtgt 90658  T
Q  209 tttgaaattggggaaaactcataccca 235  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  90659 tttgaaatcggggaaaacccataccca 90685  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 197549 - 197333
Alignment:
Q  12 atgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatg 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    ||||||||| ||||||||||||    
T  197549 atgctcactttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacaaggtaattatcaaacaaaataacatg 197451  T
Q  112 acatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgtttt 211  Q
     |||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| || ||||   |||||  |||| |||||||| || |||||  |||||||| ||| |||||    
T  197450 gcatatcaacataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgggtatagattcggtttgggtacctatatgcctgttacttgtctcatatccgtgtttt 197351  T
Q  212 gaaattggggaaaactca 229  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  197350 gaaatagggaaaaactca 197333  T

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Target: scaffold0294 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 14638 - 14824
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||     
T  14638 aatatgctcactttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttac-aacacaataattatcaaacaaaataat 14736  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtc 196  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  14737 atatcatatcaacattaaataattttctacatttgggacgagtttgggtatgtgttcaaggtgggtacctatatacccattatccgtc 14824  T

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Target: scaffold0095 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 32755 - 32642
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| ||    
T  32755 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttaattgatcatt-aaatatcactggtagtttttattaccatgaccattatcactcaaaatcac 32657  T
Q  109 atgacatatcaacat 123  Q
    ||||| |||| ||||    
T  32656 atgacctatctacat 32642  T

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Target: scaffold0027 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 151
Target Start/End: Original strand, 6269 - 6410
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataac 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||   | ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||| | ||  |||| |||||| |||||||||    
T  6269 aatatgttcactttaacatttgttagatcgattgatttagttgctcctttaaatttcaatggtaatttttat-agcacgacaactatcaaacaaaataac 6367  T
Q  109 atgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggt 151  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||    
T  6368 atggcatatcaacataaagtaactttctgcatttgagacgggt 6410  T

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Target: scaffold1630 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1630
Description:

Target: scaffold1630; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Original strand, 1485 - 1545
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatg 69  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1485 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatg 1545  T

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Target: scaffold0097 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 184
Target Start/End: Original strand, 33446 - 33624
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatc-aatca---aaa 104  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||| |||||   |||    
T  33446 aatatgttcactttaatatttgttacaccgactgatttaattgcttctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgaaaattatcaaatcaaataaa 33544  T
Q  105 taacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatac 184  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || |||| | |||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||| | || |||||||    
T  33545 taacatggcatatcatcataaagtagttttctgcatttgtgacgggtttggttatgggtttggggtgaggacttatatac 33624  T

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Target: scaffold0135 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 117
Target Start/End: Original strand, 36065 - 36128
Alignment:
Q  53 tcctttaaatatcaatgatagtttttattaacataacaattatcaatcaaaataacatgacatat 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36065 tcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatat 36128  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14370 - 14299
Alignment:
Q  9 aatatgctcactttaatatttgatagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttat 80  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||  | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14370 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttaattgttcctttaaatatcaatggtagtttttat 14299  T

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Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14300 - 14268
Alignment:
Q  104 ataacatgacatatcaacataaaataatttttt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14300 ataacatgacatatcaacataaaatagtttttt 14268  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Original strand, 211373 - 211461
Alignment:
Q  156 gtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaactcatacccatatccaaac 244  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||| || |||  ||||||||| || |||||| || ||||||| ||||||    
T  211373 gtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtctcgtacccgtattttgaaatcggagaaaacccaaacccatacccaaac 211461  T

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Target: scaffold0198 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20844 - 20749
Alignment:
Q  130 attttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtctcatagccgcgttttgaaattggggaaaa 225  Q
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T  20844 attttttacattcggaacgggtttgagtatgggttcgaggtggatatttatatccccattacccgtctcatactcgagttttgaaatcgggaaaaa 20749  T

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