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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF14667_low_6 (Length: 373)
Name: NF14667_low_6
Description: NF14667
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF14667_low_6 |
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| [»] scaffold0635 (1 HSPs) |
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Alignment Details
Target: scaffold0635 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:
Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 3162 - 3489
Alignment:
| Q |
1 |
tttataaaataaaatgagaatagttgagtgaaatgaaacatagatcagactctatattctatnnnnnnnnttatggtgaaattttaatgaaaaatagtat |
100 |
Q |
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| T |
3162 |
tttataaaatagaatgagcatagttgagtgaaatgaaacatagatcagactct-tctttta----ataaattatggtgaaattttaatgaaaaatagtat |
3256 |
T |
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| Q |
101 |
gagatggaataatgtcatcacttccattctattacataannnnnnnaaaatattcgaacaattgaatatcacatcatttcattatatggtttgataggaa |
200 |
Q |
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| T |
3257 |
gagatggaataatgtcatcatttccattctattacataatttttt-aaaatattcaaacagttgaatatcacatcatttcattatatggtttgataggaa |
3355 |
T |
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| Q |
201 |
ttacatgatattataagtgaatcatgcatatggtgcttcacacctaaagaacacatgtatcttatgaaattttaacatttatgaaatgagaataaccaaa |
300 |
Q |
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| T |
3356 |
ttacatgatattataagtgaatcatgcatatggtgcttcacacctaaagaacacatgtatcttatgaaattttaacatttatgaaatgagaataaccaaa |
3455 |
T |
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| Q |
301 |
gttgaaagaagcaactcttatttttcccttcttt |
334 |
Q |
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| T |
3456 |
gttgaaagaagcaattcttatttttcccttcttt |
3489 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10043908 - 10043581
Alignment:
| Q |
1 |
tttataaaataaaatgagaatagttgagtgaaatgaaacatagatcagactctatattctatnnnnnnnnttatggtgaaattttaatgaaaaatagtat |
100 |
Q |
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| T |
10043908 |
tttataaaatagaatgagcatagttgagtgaaatgaaacatagatcagactct-tctttta----ataaattatggtgaaattttaatgaaaaatagtat |
10043814 |
T |
|
| Q |
101 |
gagatggaataatgtcatcacttccattctattacataannnnnnnaaaatattcgaacaattgaatatcacatcatttcattatatggtttgataggaa |
200 |
Q |
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| T |
10043813 |
gagatggaataatgtcatcatttccattctattacataatttttt-aaaatattcaaacagttgaatatcacatcatttcattatatggtttgataggaa |
10043715 |
T |
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| Q |
201 |
ttacatgatattataagtgaatcatgcatatggtgcttcacacctaaagaacacatgtatcttatgaaattttaacatttatgaaatgagaataaccaaa |
300 |
Q |
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| T |
10043714 |
ttacatgatattataagtgaatcatgcatatggtgcttcacacctaaagaacacatgtatcttatgaaattttaacatttatgaaatgagaataaccaaa |
10043615 |
T |
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| Q |
301 |
gttgaaagaagcaactcttatttttcccttcttt |
334 |
Q |
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| T |
10043614 |
gttgaaagaagcaattcttatttttcccttcttt |
10043581 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10105622 - 10105295
Alignment:
| Q |
1 |
tttataaaataaaatgagaatagttgagtgaaatgaaacatagatcagactctatattctatnnnnnnnnttatggtgaaattttaatgaaaaatagtat |
100 |
Q |
| |
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|
| T |
10105622 |
tttataaaatagaatgagcatagttgagtgaaatgaaacatagatcagactct-tctttta----ataaattatggtgaaattttaatgaaaaatagtat |
10105528 |
T |
|
| Q |
101 |
gagatggaataatgtcatcacttccattctattacataannnnnnnaaaatattcgaacaattgaatatcacatcatttcattatatggtttgataggaa |
200 |
Q |
| |
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| T |
10105527 |
gagatggaataatgtcatcatttccattctattacataatttttt-aaaatattcaaacagttgaatatcacatcatttcattatatggtttgataggaa |
10105429 |
T |
|
| Q |
201 |
ttacatgatattataagtgaatcatgcatatggtgcttcacacctaaagaacacatgtatcttatgaaattttaacatttatgaaatgagaataaccaaa |
300 |
Q |
| |
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|
| T |
10105428 |
ttacatgatattataagtgaatcatgcatatggtgcttcacacctaaagaacacatgtatcttatgaaattttaacatttatgaaatgagaataaccaaa |
10105329 |
T |
|
| Q |
301 |
gttgaaagaagcaactcttatttttcccttcttt |
334 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
10105328 |
gttgaaagaagcaattcttatttttcccttcttt |
10105295 |
T |
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