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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14677_low_6 (Length: 343)

Name: NF14677_low_6
Description: NF14677
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14677_low_6
NF14677_low_6
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (23-323)||(24470833-24471138)
chr4 (23-323)||(24420488-24420794)
chr4 (50-323)||(24420392-24420665)
chr4 (48-323)||(24470959-24471234)
chr4 (77-321)||(24470605-24470849)
chr4 (53-321)||(24420778-24421046)
chr4 (27-323)||(24420872-24421168)
chr4 (73-321)||(24421210-24421458)
chr4 (20-307)||(24470302-24470595)
chr4 (27-300)||(24420751-24421024)
chr4 (50-318)||(24421021-24421289)
chr4 (248-323)||(24406527-24406602)
chr4 (48-318)||(24421165-24421435)
chr4 (77-302)||(24470413-24470638)
chr4 (56-312)||(24470488-24470744)
chr4 (20-276)||(24420967-24421229)
chr4 (128-323)||(24476790-24476976)
chr4 (73-323)||(24470265-24470515)
chr4 (171-267)||(24476885-24476981)
chr4 (20-276)||(24421159-24421421)
chr4 (48-302)||(24470528-24470782)
chr4 (20-294)||(24477374-24477654)
chr4 (167-323)||(24406425-24406587)
chr4 (48-318)||(24420637-24420907)
chr4 (48-318)||(24470720-24470989)
chr4 (48-321)||(24470288-24470561)
chr4 (48-292)||(24420327-24420571)
chr4 (56-312)||(24420979-24421235)
chr4 (48-323)||(24420584-24420859)
chr4 (110-302)||(24421277-24421469)
chr4 (167-307)||(24421320-24421460)
chr4 (73-321)||(24477491-24477739)
chr4 (110-302)||(24470254-24470446)
chr4 (167-307)||(24470263-24470403)
chr4 (194-285)||(24477065-24477156)
chr4 (77-302)||(24477462-24477687)
chr4 (48-142)||(24477064-24477158)
chr4 (167-278)||(24477630-24477741)
chr4 (135-267)||(24471142-24471274)
chr4 (254-322)||(24482187-24482255)
chr4 (308-343)||(24406384-24406419)
chr4 (308-343)||(24406486-24406521)
chr4 (95-178)||(24481477-24481559)
chr4 (92-207)||(24406499-24406614)
chr4 (92-198)||(24471147-24471253)
chr4 (73-105)||(24421495-24421527)
chr4 (73-105)||(24470196-24470228)
chr4 (254-294)||(24476729-24476769)
chr4 (250-302)||(24477291-24477343)
[»] scaffold0879 (7 HSPs)
scaffold0879 (77-294)||(4464-4681)
scaffold0879 (50-318)||(4485-4753)
scaffold0879 (20-276)||(4545-4807)
scaffold0879 (53-312)||(4536-4795)
scaffold0879 (27-285)||(4606-4864)
scaffold0879 (167-318)||(4458-4609)
scaffold0879 (182-321)||(4425-4564)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (110-300)||(41899872-41900062)
chr2 (56-294)||(41899830-41900068)
chr2 (20-285)||(41900127-41900398)
chr2 (53-250)||(41899826-41900023)
chr2 (113-302)||(41900302-41900491)
chr2 (110-277)||(41900279-41900446)
chr2 (48-202)||(41899826-41899980)
chr2 (50-275)||(41900089-41900314)
chr2 (254-321)||(41900571-41900638)
chr2 (167-285)||(41900511-41900629)
chr2 (27-302)||(41900158-41900433)
chr2 (110-237)||(41900511-41900638)
chr2 (62-218)||(41900290-41900446)
chr2 (48-156)||(41899824-41899932)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (62-201)||(11879442-11879581)
chr1 (110-213)||(11879442-11879545)
chr1 (65-201)||(11882303-11882439)
chr1 (65-201)||(11891537-11891673)
chr1 (158-282)||(11879442-11879566)
chr1 (110-282)||(11902038-11902210)
chr1 (62-198)||(11902038-11902174)
chr1 (230-299)||(11879349-11879418)
chr1 (77-201)||(11882411-11882535)
chr1 (77-201)||(11891645-11891769)
chr1 (109-154)||(11902373-11902418)
chr1 (61-213)||(11904952-11905104)
chr1 (89-177)||(11879661-11879749)
chr1 (50-201)||(11902074-11902225)
chr1 (228-318)||(11879464-11879554)
chr1 (231-321)||(11902063-11902153)
chr1 (61-183)||(11905000-11905122)
chr1 (48-126)||(52821569-52821647)
chr1 (20-150)||(11879490-11879626)
chr1 (254-294)||(11881952-11881992)
chr1 (254-294)||(11891186-11891226)
chr1 (158-318)||(11902038-11902198)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 323
Target Start/End: Original strand, 24470833 - 24471138
Alignment:
Q  23 aagtcaccaccacctccatctccctctcctcc-----atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtc 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24470833 aagtcaccacctcctccatctccctctcctccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtc 24470932  T
Q  118 tcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccct 217  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24470933 acctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccct 24471032  T
Q  218 cttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccac 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||    
T  24471033 cctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccac 24471132  T
Q  318 ctcctt 323  Q
    ||||||    
T  24471133 ctcctt 24471138  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24420794 - 24420488
Alignment:
Q  23 aagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagt 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24420794 aagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaat 24420695  T
Q  117 ctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccc 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24420694 ctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccc 24420595  T
Q  217 tcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgcca 316  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  24420594 tcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctcca 24420495  T
Q  317 cctcctt 323  Q
    |||||||    
T  24420494 cctcctt 24420488  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24420665 - 24420392
Alignment:
Q  50 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 149  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  24420665 cctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctc 24420566  T
Q  150 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 249  Q
    ||||| | ||||  || || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24420565 catatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccata 24420466  T
Q  250 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 323  Q
        |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  24420465 ctactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctcctt 24420392  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 323
Target Start/End: Original strand, 24470959 - 24471234
Alignment:
Q  48 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 147  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  24470959 ctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcc 24471058  T
Q  148 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 247  Q
    ||||||| | ||||  || || || |||||||| |||||||| || || || |||||| ||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  24471059 tccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctcca 24471158  T
Q  248 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 323  Q
    ||    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  24471159 tactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctcctt 24471234  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 77 - 321
Target Start/End: Original strand, 24470605 - 24470849
Alignment:
Q  77 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 176  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||| || | ||| |||||||| |    
T  24470605 ccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctc 24470704  T
Q  177 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 276  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24470705 catctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatc 24470804  T
Q  277 tccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 321  Q
     |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || |||||    
T  24470805 accttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccacctcctcc 24470849  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24421046 - 24420778
Alignment:
Q  53 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 152  Q
    |||||||| || || |||| ||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  24421046 ccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccat 24420947  T
Q  153 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 252  Q
    || ||||||  || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24420946 atgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgt 24420847  T
Q  253 ttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 321  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | | |||||| || ||||||||    
T  24420846 ttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctcc 24420778  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24421168 - 24420872
Alignment:
Q  27 caccaccacctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 126  Q
    |||||||| | ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||||| || || || |||||  | |||||||||||||||||    
T  24421168 caccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctcc 24421069  T
Q  127 gccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctcct 226  Q
     ||||| || || || || || |||||| | || |  ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || | ||| ||     
T  24421068 accatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccacca 24420969  T
Q  227 tctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 323  Q
    || || || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  24420968 tccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctcctt 24420872  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24421458 - 24421210
Alignment:
Q  73 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccacca 172  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||     
T  24421458 acctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacct 24421359  T
Q  173 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccac 272  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  24421358 cctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccac 24421259  T
Q  273 catctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 321  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  24421258 catcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctcc 24421210  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Original strand, 24470302 - 24470595
Alignment:
Q  20 tacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttaca 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||| |||||| || || || || || || || ||||| || || |    
T  24470302 tacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctata 24470401  T
Q  114 agtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 213  Q
    ||  ||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| || || |||||| | || ||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  24470402 agagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtc 24470501  T
Q  214 ccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaag 307  Q
     || |  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  24470502 accaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataag 24470595  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24421024 - 24420751
Alignment:
Q  27 caccaccacctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 126  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||    
T  24421024 cacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccaccccc 24420925  T
Q  127 gccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctcct 226  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||||| | || | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |  || ||     
T  24420924 accatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccacca 24420825  T
Q  227 tctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgt 300  Q
    || ||||| || ||||| || ||| |||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  24420824 tcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgt 24420751  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24421289 - 24421021
Alignment:
Q  50 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 149  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || || || || || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||    
T  24421289 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctc 24421190  T
Q  150 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 249  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| |  || || || || ||||||||||| |||||    
T  24421189 catatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccata 24421090  T
Q  250 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 318  Q
    | | ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| |||||    
T  24421089 tatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacc 24421021  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 248 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24406602 - 24406527
Alignment:
Q  248 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24406602 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctcctt 24406527  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24421435 - 24421165
Alignment:
Q  48 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 147  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | ||| || || ||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  24421435 ctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctccccc 24421336  T
Q  148 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 247  Q
     |||||| |||| | |   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || || || ||||| || || ||     
T  24421335 accatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccacct 24421236  T
Q  248 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 318  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||    
T  24421235 tatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccacc 24421165  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 302
Target Start/End: Original strand, 24470413 - 24470638
Alignment:
Q  77 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 176  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | || ||||| || || || ||| | |||| |||||||||||| |    
T  24470413 ccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctc 24470512  T
Q  177 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 276  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||   |||||| ||||| ||    
T  24470513 cttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctc 24470612  T
Q  277 tccttcacctcctccaccttatgtct 302  Q
    ||| ||||| || || || |||||||    
T  24470613 tccatcaccaccacctccatatgtct 24470638  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 312
Target Start/End: Original strand, 24470488 - 24470744
Alignment:
Q  56 tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatata 155  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| || || || || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||     
T  24470488 tatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatg 24470587  T
Q  156 tctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 255  Q
    |||| | |   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || || ||||| || || || || ||| ||||    
T  24470588 tctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatattta 24470687  T
Q  256 caaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcacc 312  Q
     || || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||    
T  24470688 taagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcacc 24470744  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24421229 - 24420967
Alignment:
Q  20 tacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttaca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||      |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  24421229 tacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttaca 24421130  T
Q  114 agtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 213  Q
    |||| || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24421129 agtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatc 24421030  T
Q  214 ccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 276  Q
     || |  || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  24421029 accaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatc 24420967  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24476976 - 24476790
Alignment:
Q  128 ccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctcctt 227  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || || || |  || |||||| |||| ||||||||||||||||| || || |             
T  24476976 ccatccccttcaccaccccctccatatgtctatatgtcccctcctcctcattctccttcatcacctcctccatatgtctataattctccac--------- 24476886  T
Q  228 ctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  24476885 ctccttcaccccctcctccatatgtttatgaatctccacccccaccatctccttcacctcccccatcctatgtctataagtcacatccacctcctt 24476790  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 323
Target Start/End: Original strand, 24470265 - 24470515
Alignment:
Q  73 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccacca 172  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||     
T  24470265 acctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacct 24470364  T
Q  173 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccac 272  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  24470365 cctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccac 24470464  T
Q  273 catctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 323  Q
    || | || |||||||| || || ||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  24470465 caacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctcctt 24470515  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24476981 - 24476885
Alignment:
Q  171 caccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||    
T  24476981 caccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctatatgtcccctcctcctcattctccttcatcacctcctccatatgtctataattctccacc 24476885  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24421421 - 24421159
Alignment:
Q  20 tacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttaca 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || || || ||||| || || |    
T  24421421 tacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctata 24421322  T
Q  114 agtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 213  Q
    ||  ||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| || || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  24421321 agagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtc 24421222  T
Q  214 ccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 276  Q
     || |  ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  24421221 accaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatc 24421159  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 302
Target Start/End: Original strand, 24470528 - 24470782
Alignment:
Q  48 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 147  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || || || ||||| || || |||  ||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  24470528 ctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacc 24470627  T
Q  148 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 247  Q
    ||||||| |||||| ||| || || |||||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||||| || |  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24470628 tccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctcca 24470727  T
Q  248 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 302  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||    
T  24470728 tatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtct 24470782  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24477654 - 24477374
Alignment:
Q  20 tacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttaca 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||      | |||| ||||| |||| |||||| || ||||| | ||| || || ||||| || || |    
T  24477654 tacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctata 24477555  T
Q  114 agtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 213  Q
    ||  ||| || || |||||||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||      
T  24477554 agagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagag 24477455  T
Q  214 ccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 294  Q
     |||| ||  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  || ||||||||||    
T  24477454 tcctcctctaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcacccccaactcctccacc 24477374  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24406587 - 24406425
Alignment:
Q  167 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaa------at 260  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||| |||||| || |  |||||||| |||||||| || ||||| ||| | |||||      |     
T  24406587 ccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgccacctccttatatctacaagactccac 24406488  T
Q  261 ctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 323  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24406487 ctccacctccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctcctt 24406425  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24420907 - 24420637
Alignment:
Q  48 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 147  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||    
T  24420907 ctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctcc 24420808  T
Q  148 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 247  Q
     || ||||| || | ||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| || | ||| || ||||| || || || ||||||    
T  24420807 accctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctcca 24420708  T
Q  248 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 318  Q
    || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||| |||  |||||||| |||||    
T  24420707 tacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccacc 24420637  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Original strand, 24470720 - 24470989
Alignment:
Q  48 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 147  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||    
T  24470720 ctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctcc 24470819  T
Q  148 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 247  Q
     |||||| | || | ||||||||| || ||||| || || ||  |||| |||||||| || ||||| || | ||| || ||||| || || || ||||||    
T  24470820 accatatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcc-tccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctcca 24470918  T
Q  248 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 318  Q
    || ||||| || || || || ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  |||||||| |||||    
T  24470919 tacgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccacc 24470989  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 321
Target Start/End: Original strand, 24470288 - 24470561
Alignment:
Q  48 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 147  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | ||| || || ||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  24470288 ctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctccccc 24470387  T
Q  148 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 247  Q
     |||||| |||| | |   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||  | || ||||| || || ||     
T  24470388 accatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccc 24470487  T
Q  248 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 321  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||  |||||||| || |||||    
T  24470488 tatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctcc 24470561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24420571 - 24420327
Alignment:
Q  48 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 147  Q
    ||||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || || || || || || || ||||| ||||| || || ||  |||||||||||||    
T  24420571 ctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcc 24420472  T
Q  148 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 247  Q
    ||||||   |||||  || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||| ||||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||     
T  24420471 tccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctcct 24420372  T
Q  248 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctcca 292  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24420371 tatatttacaagtctccacctccaccatctccatcacctcctcca 24420327  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24421235 - 24420979
Alignment:
Q  56 tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatata 155  Q
    |||||||||||||||| ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  24421235 tatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatata 24421136  T
Q  156 tctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 255  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| | || ||||| |||| ||| || || || || || || || |||||||| ||    
T  24421135 tttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtata 24421036  T
Q  256 caaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcacc 312  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  24421035 taaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcacc 24420979  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24420859 - 24420584
Alignment:
Q  48 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 147  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || || || || || || || ||  |||| ||||| || || || |||||||| || || || ||    
T  24420859 ctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctccccc 24420760  T
Q  148 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 247  Q
     |||||| | |||| ||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| || |||| ||| || ||||||||||| || ||||||    
T  24420759 accatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctcca 24420660  T
Q  248 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 323  Q
    ||| | ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||| |||||| || || |||||||    
T  24420659 tatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctcctt 24420584  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24421469 - 24421277
Alignment:
Q  110 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 209  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |    
T  24421469 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctaca 24421370  T
Q  210 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 302  Q
    |||| || | |||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||   |||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  24421369 agtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtct 24421277  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24421460 - 24421320
Alignment:
Q  167 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 266  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24421460 ccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccac 24421361  T
Q  267 ccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaag 307  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  24421360 ctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataag 24421320  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24477739 - 24477491
Alignment:
Q  73 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccacca 172  Q
    ||||||||  || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  24477739 acctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccacca 24477640  T
Q  173 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccac 272  Q
    || ||||| |  || || || |||||| ||||||| || || || | |||||| |||||||  || || || |||||||| || ||   |||||| ||||    
T  24477639 cctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccac 24477540  T
Q  273 catctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 321  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||  |||||||| || |||||    
T  24477539 catctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctcc 24477491  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 302
Target Start/End: Original strand, 24470254 - 24470446
Alignment:
Q  110 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 209  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |    
T  24470254 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctaca 24470353  T
Q  210 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 302  Q
    |||| || | |||||| || |||||||| || || |||||||| || ||   |||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  24470354 agtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtct 24470446  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 307
Target Start/End: Original strand, 24470263 - 24470403
Alignment:
Q  167 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 266  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24470263 ccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccac 24470362  T
Q  267 ccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaag 307  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  24470363 ctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataag 24470403  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24477156 - 24477065
Alignment:
Q  194 cctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacc 285  Q
    |||||||||||||||||| | || | |||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24477156 cctccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccatcccctccacc 24477065  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24477687 - 24477462
Alignment:
Q  77 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 176  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || || |||||||  || || || |||||| || ||||||  |||||||| || |    
T  24477687 ccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctc 24477588  T
Q  177 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 276  Q
    | || ||||  || ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  24477587 cgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatc 24477488  T
Q  277 tccttcacctcctccaccttatgtct 302  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||    
T  24477487 tccttcacctcccccaccatatgtct 24477462  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24477158 - 24477064
Alignment:
Q  48 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcacca 142  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||| |||||    
T  24477158 ctcctccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccatcccctccacca 24477064  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24477741 - 24477630
Alignment:
Q  167 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 266  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||  || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24477741 ccacctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccac 24477642  T
Q  267 ccccaccatctc 278  Q
    | || |||||||    
T  24477641 cacctccatctc 24477630  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 267
Target Start/End: Original strand, 24471142 - 24471274
Alignment:
Q  135 cttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttc 234  Q
    |||||||||||||||||||   |||||  || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||| ||| || |  |||||||| |||||    
T  24471142 cttcaccacctcctccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttc 24471241  T
Q  235 accccctcctccatatgtttacaaatctccacc 267  Q
    ||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  24471242 accaccgcctccttatatttacaagtctccacc 24471274  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24482255 - 24482187
Alignment:
Q  254 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcct 322  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  24482255 tacaaatctccaccaccaccatctccatcaccaccacctccttatgtctataaatcaccaccacctcct 24482187  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24406419 - 24406384
Alignment:
Q  308 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacct 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24406419 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacct 24406384  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24406521 - 24406486
Alignment:
Q  308 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacct 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24406521 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacct 24406486  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24481559 - 24481477
Alignment:
Q  95 ccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccacca 178  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||| ||| ||||| ||||||    
T  24481559 ccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctccatcaccacc-ccaccatatgtatacaagtcgccacctccacca 24481477  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24406614 - 24406499
Alignment:
Q  92 ccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccac 191  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||| |||  | |||||||||||| || || |||||||| |    
T  24406614 ccaccaccaccgtatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgc 24406515  T
Q  192 cccctccatatgtcta 207  Q
    | ||||| ||| ||||    
T  24406514 cacctccttatatcta 24406499  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 198
Target Start/End: Original strand, 24471147 - 24471253
Alignment:
Q  92 ccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccac 191  Q
    ||||| |||||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| | |||||| ||||| || || ||||||||||    
T  24471147 ccacctcctccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttcaccac 24471246  T
Q  192 cccctcc 198  Q
    | |||||    
T  24471247 cgcctcc 24471253  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24421527 - 24421495
Alignment:
Q  73 acctccaccttctccatccccaccacctccata 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24421527 acctccaccttctccatcgccaccacctccata 24421495  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 105
Target Start/End: Original strand, 24470196 - 24470228
Alignment:
Q  73 acctccaccttctccatccccaccacctccata 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24470196 acctccaccttctccatcgccaccacctccata 24470228  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24476769 - 24476729
Alignment:
Q  254 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 294  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24476769 tacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccacc 24476729  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24477343 - 24477291
Alignment:
Q  250 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 302  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  24477343 tgtttacaaatcaccaccacctccatccccttcccctccttcaccttatgtct 24477291  T

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Target: scaffold0879 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 7)
Name: scaffold0879
Description:

Target: scaffold0879; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 4464 - 4681
Alignment:
Q  77 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 176  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||| | |||| |||||||||||| |    
T  4464 ccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctc 4563  T
Q  177 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 276  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  || || || || || || || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||    
T  4564 catccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatc 4663  T
Q  277 tccttcacctcctccacc 294  Q
     || ||||| ||||||||    
T  4664 cccatcaccccctccacc 4681  T

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Target: scaffold0879; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 318
Target Start/End: Original strand, 4485 - 4753
Alignment:
Q  50 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 149  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || || || || || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||    
T  4485 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctc 4584  T
Q  150 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 249  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| |  || || || || ||||||||||| |||||    
T  4585 catatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccata 4684  T
Q  250 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 318  Q
    | | ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| |||||    
T  4685 tatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacc 4753  T

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Target: scaffold0879; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 276
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4807
Alignment:
Q  20 tacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttaca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||      |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  4545 tacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttaca 4644  T
Q  114 agtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 213  Q
    |||| || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  4645 agtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatc 4744  T
Q  214 ccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 276  Q
     || |  || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  4745 accaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatc 4807  T

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Target: scaffold0879; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 312
Target Start/End: Original strand, 4536 - 4795
Alignment:
Q  53 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  4536 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccat 4635  T
Q  153 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 252  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| | || ||||| |||| ||| || || || || || || || ||||||||    
T  4636 atatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgt 4735  T
Q  253 ttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcacc 312  Q
     || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  4736 atataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcacc 4795  T

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Target: scaffold0879; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 285
Target Start/End: Original strand, 4606 - 4864
Alignment:
Q  27 caccaccacctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 126  Q
    |||||||| | ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||||| || || || |||||  | |||||||||||||||||    
T  4606 caccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctcc 4705  T
Q  127 gccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctcct 226  Q
     ||||| || || || || || |||||| | || |  ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || | ||| ||     
T  4706 accatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccacca 4805  T
Q  227 tctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacc 285  Q
    || || || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4806 tccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcacc 4864  T

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Target: scaffold0879; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 318
Target Start/End: Original strand, 4458 - 4609
Alignment:
Q  167 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 266  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||    
T  4458 ccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccac 4557  T
Q  267 ccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 318  Q
    | || ||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||    
T  4558 cacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccacc 4609  T

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Target: scaffold0879; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 321
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4564
Alignment:
Q  182 ccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctcctt 281  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |    
T  4425 ccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccct 4524  T
Q  282 cacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 321  Q
    ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||    
T  4525 cacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctcc 4564  T

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Target: chr2 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41900062 - 41899872
Alignment:
Q  110 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 209  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  41900062 tacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttaca 41899963  T
Q  210 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgt 300  Q
    ||||||| |  || ||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  41899962 agtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgt 41899872  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41900068 - 41899830
Alignment:
Q  56 tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatata 155  Q
    ||||| ||||| || | |||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || || || || || ||||||||||||||||||     
T  41900068 tatgtctacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatg 41899969  T
Q  156 tctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 255  Q
    | |||| ||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  || ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  41899968 tttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgttta 41899869  T
Q  256 caaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 294  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41899868 caagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccacc 41899830  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41900398 - 41900127
Alignment:
Q  20 tacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttaca 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||      ||| |||||||| ||||| || |  || || || ||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  41900398 tacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctaca 41900299  T
Q  114 agtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 213  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||| ||| | | | || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||  | |||||    
T  41900298 agtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgcacaagtc 41900199  T
Q  214 ccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacc 285  Q
     || |  | ||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||    
T  41900198 accaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcacc 41900127  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41900023 - 41899826
Alignment:
Q  53 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 152  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  41900023 ccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccat 41899924  T
Q  153 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatat 250  Q
    ||   |||| ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || | ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  41899923 atgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccaccatat 41899826  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41900491 - 41900302
Alignment:
Q  113 aagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagt 212  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||| ||| | | | || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||| | || ||||    
T  41900491 aagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagt 41900392  T
Q  213 cccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 302  Q
    | || |  ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || || |||||||    
T  41900391 caccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtct 41900302  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41900446 - 41900279
Alignment:
Q  110 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 209  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| || || |||||||  || || ||||||||||| |    
T  41900446 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctaca 41900347  T
Q  210 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatct 277  Q
    | || ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  41900346 aatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatct 41900279  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41899980 - 41899826
Alignment:
Q  48 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 147  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || || || || |||||||| |  |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  41899980 ctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcc 41899881  T
Q  148 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatat 202  Q
    ||||||| | |||| ||| ||||| ||||| ||  ||||||| || || ||||||    
T  41899880 tccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccaccatat 41899826  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41900314 - 41900089
Alignment:
Q  50 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 149  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||| |||| | ||| | | | ||| | |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |    
T  41900314 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgc 41900215  T
Q  150 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 249  Q
    | ||| |  ||| |||||||||||  || || || ||||| || || || |||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  41900214 cttatgtgcacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccata 41900115  T
Q  250 tgtttacaaatctccacccccaccat 275  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  41900114 tgtttacaaatctcctccaccaccat 41900089  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41900638 - 41900571
Alignment:
Q  254 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 321  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  41900638 tacaaatctccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctcc 41900571  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41900629 - 41900511
Alignment:
Q  167 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | |||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  41900629 ccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctacaaatctcctc 41900530  T
Q  267 ccccaccatctccttcacc 285  Q
    | || || ||||| |||||    
T  41900529 cacctccctctccatcacc 41900511  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41900433 - 41900158
Alignment:
Q  27 caccaccacctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 126  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||| || ||| |||||||||||| ||| || |||||||| || |  || || ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  41900433 caccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacc 41900334  T
Q  127 gccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctcct 226  Q
     || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || || ||||||||  | |||| ||||| | | ||  |||| |||||||| |  || ||     
T  41900333 tccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccacca 41900234  T
Q  227 tctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 302  Q
    || || ||||| ||||| || |||||  |||| || ||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41900233 tccccatcaccacctccgccttatgtgcacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtct 41900158  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41900638 - 41900511
Alignment:
Q  110 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 209  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| |    
T  41900638 tacaaatctccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctaca 41900539  T
Q  210 agtcccctcttcctccttctccttcacc 237  Q
    | || ||||  ||||| ||||| |||||    
T  41900538 aatctcctccacctccctctccatcacc 41900511  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41900446 - 41900290
Alignment:
Q  62 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctaca 161  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||| || || ||  |||||||||| || || || || ||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  41900446 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctaca 41900347  T
Q  162 tgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctc 218  Q
      || || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  41900346 aatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctc 41900290  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41899932 - 41899824
Alignment:
Q  48 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 147  Q
    ||||||||||||  |||||||| |  || ||||| || || || || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||    
T  41899932 ctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctcc 41899833  T
Q  148 tccatatat 156  Q
     ||||||||    
T  41899832 accatatat 41899824  T

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Target: chr1 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 201
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879581
Alignment:
Q  62 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctaca 161  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  162 tgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 201  Q
     ||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  11879542 agtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccata 11879581  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879545
Alignment:
Q  110 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 209  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  210 agtc 213  Q
    ||||    
T  11879542 agtc 11879545  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 201
Target Start/End: Original strand, 11882303 - 11882439
Alignment:
Q  65 aagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatg 163  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||      
T  11882303 aagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactat-tacaaa 11882401  T
Q  164 tcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 201  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  11882402 tcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccata 11882439  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 201
Target Start/End: Original strand, 11891537 - 11891673
Alignment:
Q  65 aagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatg 163  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||      
T  11891537 aagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactat-tacaaa 11891635  T
Q  164 tcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 201  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  11891636 tcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccata 11891673  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 282
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879566
Alignment:
Q  158 tacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  258 aatctccacccccaccatctccttc 282  Q
    | || ||||| ||||| || |||||    
T  11879542 agtcaccaccaccaccctcaccttc 11879566  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 282
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902210
Alignment:
Q  110 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 209  Q
    |||||||| || || || ||| || |||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||| || |    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  210 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttc 282  Q
    |||| || |  ||||| || || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttc 11902210  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 198
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902174
Alignment:
Q  62 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctaca 161  Q
    |||||||||| ||| |||||  || | || ||||||||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  162 tgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctcc 198  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctcc 11902174  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 299
Target Start/End: Original strand, 11879349 - 11879418
Alignment:
Q  230 ccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatg 299  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  11879349 ccttcaccaccacctccttatgtttacaaatcgccacctcctccatccccatcacctccaccaccttatg 11879418  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 201
Target Start/End: Original strand, 11882411 - 11882535
Alignment:
Q  77 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatgtcaccaccacca 175  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||  ||||| ||||||    
T  11882411 ccaccatcaccatcacctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccttactat-tacaaatcacctccacca 11882509  T
Q  176 ccatccccttcaccaccccctccata 201  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11882510 ccatccccatcaccaccacctccata 11882535  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 201
Target Start/End: Original strand, 11891645 - 11891769
Alignment:
Q  77 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatgtcaccaccacca 175  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||  ||||| ||||||    
T  11891645 ccaccatcaccatcacctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccttactat-tacaaatcacctccacca 11891743  T
Q  176 ccatccccttcaccaccccctccata 201  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11891744 ccatccccatcaccaccacctccata 11891769  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 154
Target Start/End: Original strand, 11902373 - 11902418
Alignment:
Q  109 ttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatat 154  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11902373 ttacaagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatat 11902418  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Original strand, 11904952 - 11905104
Alignment:
Q  61 ttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatcta 159  Q
    ||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||  ||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| ||    
T  11904952 ttacaagtccccccctccaccatcaccatctccaccaccaccatactattacaagtcaccacctccaccatctccatctcctcctccaccatactat-ta 11905050  T
Q  160 catgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 213  Q
     | ||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||  |||||||||    
T  11905051 taagtcaccacctccaccatccccatcccctcctccaccatattactataagtc 11905104  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 177
Target Start/End: Original strand, 11879661 - 11879749
Alignment:
Q  89 tccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccacc 177  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||  ||||| ||| || ||||||||    
T  11879661 tccccaccaccaccatactattacaagtctcctccaccaccatctccctcacctccaccaccatattactacaagtctcccccaccacc 11879749  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Original strand, 11902074 - 11902225
Alignment:
Q  50 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 149  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || ||  ||||||| || || |||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||    
T  11902074 cctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctccatccccatcacccccacctc 11902173  T
Q  150 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 201  Q
    | ||  | |||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  11902174 cttacgtgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttccccgcccccaccata 11902225  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 318
Target Start/End: Original strand, 11879464 - 11879554
Alignment:
Q  228 ctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 318  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| |  |||||||| |||||    
T  11879464 ctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccacc 11879554  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 321
Target Start/End: Original strand, 11902063 - 11902153
Alignment:
Q  231 cttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 321  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||  | || |||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  11902063 cttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctcc 11902153  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 183
Target Start/End: Original strand, 11905000 - 11905122
Alignment:
Q  61 ttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctac 160  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || || || ||||||  ||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||  |||     
T  11905000 ttacaagtcaccacctccaccatctccatctcctcctccaccatactattataagtcaccacctccaccatccccatcccctcctccaccatattactat 11905099  T
Q  161 atgtcaccaccaccaccatcccc 183  Q
    | ||||||| | |||||||||||    
T  11905100 aagtcaccagctccaccatcccc 11905122  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 52821647 - 52821569
Alignment:
Q  48 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 126  Q
    |||| |||||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||    
T  52821647 ctccaccatatgagtacaagtctccacctccaccttccccatcccctccacctccttatgtatacaagtcaccacctcc 52821569  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 150
Target Start/End: Original strand, 11879490 - 11879626
Alignment:
Q  20 tacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcca------tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttaca 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || || |||      ||||| |||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||| ||||||   ||||    
T  11879490 tacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccatactactaca 11879589  T
Q  114 agtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctcc 150  Q
    ||  |||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  11879590 agagtcctccaccaccttctccttcacctccacctcc 11879626  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 294
Target Start/End: Original strand, 11881952 - 11881992
Alignment:
Q  254 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 294  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11881952 tacaagtcaccacccccaccatctccatcacctcctccacc 11881992  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 294
Target Start/End: Original strand, 11891186 - 11891226
Alignment:
Q  254 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 294  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11891186 tacaagtcaccacccccaccatctccatcacctcctccacc 11891226  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 318
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902198
Alignment:
Q  158 tacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttaca 257  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |  || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  258 aatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 318  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| || |  |||||||| |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtacaagtcaccaccacc 11902198  T

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