View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1467_low_9 (Length: 242)

Name: NF1467_low_9
Description: NF1467
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1467_low_9
NF1467_low_9
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (20-226)||(30630678-30630884)
chr1 (27-213)||(44290511-44290699)
chr1 (27-221)||(22077540-22077733)
chr1 (38-217)||(26661571-26661753)
chr1 (101-217)||(17294570-17294686)
chr1 (46-185)||(3537228-3537368)
chr1 (62-217)||(41157326-41157484)
chr1 (36-217)||(34364850-34365034)
chr1 (28-219)||(66134-66328)
chr1 (41-214)||(48588540-48588714)
chr1 (109-217)||(3550721-3550829)
chr1 (101-228)||(41156984-41157111)
chr1 (108-217)||(44290873-44290983)
chr1 (101-221)||(41142365-41142486)
chr1 (108-217)||(32594765-32594874)
chr1 (101-202)||(41184489-41184590)
chr1 (28-221)||(22077155-22077359)
chr1 (101-217)||(24600363-24600479)
chr1 (101-216)||(34364500-34364615)
chr1 (36-217)||(37556036-37556220)
chr1 (111-217)||(50052072-50052178)
chr1 (120-221)||(3537644-3537745)
chr1 (101-213)||(66525-66637)
chr1 (101-217)||(3875380-3875496)
chr1 (101-221)||(31767206-31767326)
chr1 (108-215)||(5320016-5320123)
chr1 (110-221)||(34649440-34649551)
chr1 (108-217)||(29798199-29798308)
chr1 (108-217)||(41759483-41759592)
chr1 (109-217)||(40082408-40082515)
chr1 (112-216)||(9955911-9956017)
chr1 (110-216)||(11977282-11977388)
chr1 (110-215)||(38804406-38804511)
chr1 (108-217)||(45494023-45494137)
chr1 (101-217)||(26661947-26662063)
chr1 (101-185)||(37850681-37850765)
chr1 (101-217)||(39066249-39066365)
chr1 (130-221)||(10351182-10351273)
chr1 (99-221)||(19283500-19283622)
chr1 (100-221)||(44685448-44685569)
chr1 (120-217)||(14318879-14318976)
chr1 (106-183)||(45084380-45084457)
chr1 (114-221)||(5575110-5575217)
chr1 (106-221)||(22077874-22077988)
chr1 (38-140)||(50051777-50051880)
chr1 (109-221)||(22793279-22793392)
chr1 (101-221)||(1188633-1188753)
chr1 (96-167)||(50469180-50469251)
chr1 (108-202)||(24132049-24132143)
chr1 (120-221)||(5528799-5528900)
chr1 (27-162)||(47379889-47380023)
chr1 (111-217)||(37555733-37555838)
chr1 (101-185)||(21378122-21378206)
chr1 (169-221)||(32168743-32168795)
chr1 (106-221)||(1187409-1187524)
chr1 (120-217)||(44043821-44043924)
chr1 (135-221)||(4956218-4956304)
chr1 (101-155)||(35154150-35154204)
chr1 (123-184)||(44091909-44091970)
chr1 (179-216)||(47380217-47380254)
chr1 (36-91)||(1188406-1188459)
chr1 (101-177)||(4878796-4878872)
chr1 (156-202)||(41184152-41184198)
chr1 (46-91)||(3537498-3537543)
chr1 (101-174)||(35530406-35530479)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (28-217)||(10074040-10074229)
chr6 (69-217)||(10074412-10074560)
chr6 (38-217)||(29518850-29519029)
chr6 (29-217)||(10073665-10073851)
chr6 (64-217)||(2578492-2578647)
chr6 (41-217)||(2378059-2378235)
chr6 (108-217)||(3409259-3409368)
chr6 (108-217)||(29518503-29518612)
chr6 (108-217)||(32741179-32741288)
chr6 (38-197)||(16107991-16108152)
chr6 (46-221)||(16454842-16455020)
chr6 (110-217)||(2377756-2377863)
chr6 (38-209)||(2579549-2579720)
chr6 (108-217)||(14748387-14748496)
chr6 (108-217)||(35210204-35210313)
chr6 (101-217)||(2579921-2580037)
chr6 (108-217)||(3058226-3058335)
chr6 (101-217)||(16107671-16107787)
chr6 (108-216)||(26544049-26544157)
chr6 (113-216)||(32460630-32460733)
chr6 (108-221)||(1127360-1127473)
chr6 (108-217)||(1846748-1846857)
chr6 (63-221)||(6071085-6071245)
chr6 (101-221)||(16454568-16454688)
chr6 (107-217)||(593758-593868)
chr6 (87-217)||(2578884-2579013)
chr6 (76-217)||(3409627-3409769)
chr6 (111-221)||(6999841-6999951)
chr6 (112-217)||(3415462-3415567)
chr6 (108-216)||(10911565-10911674)
chr6 (71-217)||(8481888-8482035)
chr6 (114-217)||(2843560-2843664)
chr6 (114-217)||(9062399-9062501)
chr6 (111-221)||(1950230-1950340)
chr6 (106-216)||(5958653-5958763)
chr6 (99-217)||(12092531-12092649)
chr6 (27-167)||(33605895-33606034)
chr6 (28-168)||(2579203-2579349)
chr6 (110-184)||(5832108-5832182)
chr6 (27-216)||(2975471-2975660)
chr6 (103-220)||(31714666-31714781)
chr6 (175-217)||(22605304-22605346)
[»] chr4 (76 HSPs)
chr4 (28-217)||(54108835-54109021)
chr4 (46-217)||(36629175-36629346)
chr4 (38-221)||(2741000-2741184)
chr4 (28-216)||(20826137-20826325)
chr4 (54-221)||(3244494-3244661)
chr4 (108-217)||(55933171-55933280)
chr4 (101-217)||(22028008-22028124)
chr4 (62-217)||(44620611-44620768)
chr4 (108-217)||(50630802-50630911)
chr4 (101-221)||(4955360-4955480)
chr4 (101-221)||(22183307-22183427)
chr4 (101-217)||(25483329-25483445)
chr4 (108-215)||(41370357-41370464)
chr4 (100-221)||(28034221-28034342)
chr4 (108-217)||(50002426-50002535)
chr4 (101-206)||(52884880-52884985)
chr4 (101-217)||(34646696-34646812)
chr4 (109-216)||(16888864-16888971)
chr4 (106-216)||(54017643-54017753)
chr4 (101-215)||(54741227-54741341)
chr4 (108-217)||(49880160-49880269)
chr4 (101-217)||(52884688-52884805)
chr4 (101-217)||(1731694-1731810)
chr4 (101-221)||(2740693-2740813)
chr4 (101-217)||(10245913-10246028)
chr4 (101-217)||(41707512-41707627)
chr4 (120-216)||(44620365-44620461)
chr4 (30-202)||(49076510-49076687)
chr4 (106-217)||(3340805-3340916)
chr4 (101-217)||(22028416-22028534)
chr4 (110-221)||(39404020-39404131)
chr4 (106-217)||(49302902-49303015)
chr4 (101-217)||(36608708-36608824)
chr4 (101-217)||(39792907-39793023)
chr4 (101-216)||(3341121-3341236)
chr4 (123-217)||(45496820-45496914)
chr4 (127-217)||(54936215-54936305)
chr4 (37-217)||(39404326-39404507)
chr4 (101-221)||(4390144-4390264)
chr4 (101-217)||(20825829-20825945)
chr4 (101-213)||(36572012-36572124)
chr4 (103-221)||(23556909-23557027)
chr4 (123-217)||(44621017-44621111)
chr4 (62-175)||(44621377-44621493)
chr4 (108-221)||(32941166-32941279)
chr4 (101-221)||(43174499-43174620)
chr4 (109-213)||(16889587-16889691)
chr4 (126-217)||(18932796-18932887)
chr4 (162-221)||(31691206-31691265)
chr4 (106-217)||(49076878-49076988)
chr4 (121-216)||(54017750-54017845)
chr4 (120-217)||(54343055-54343145)
chr4 (28-177)||(45489418-45489571)
chr4 (106-221)||(34004628-34004741)
chr4 (162-216)||(3271841-3271895)
chr4 (111-217)||(50459724-50459830)
chr4 (108-221)||(6975499-6975612)
chr4 (113-197)||(760194-760278)
chr4 (123-217)||(54108551-54108646)
chr4 (101-171)||(3700358-3700428)
chr4 (150-216)||(15841416-15841482)
chr4 (174-215)||(1868117-1868158)
chr4 (37-90)||(41707340-41707393)
chr4 (101-197)||(10246340-10246436)
chr4 (101-221)||(19504698-19504809)
chr4 (101-209)||(51768115-51768223)
chr4 (162-217)||(23817728-23817783)
chr4 (120-175)||(44620308-44620363)
chr4 (121-217)||(34544119-34544216)
chr4 (108-161)||(50788086-50788139)
chr4 (67-215)||(15841034-15841183)
chr4 (110-175)||(44620946-44621012)
chr4 (176-217)||(11197294-11197335)
chr4 (180-221)||(11706587-11706628)
chr4 (101-145)||(11706640-11706684)
chr4 (157-221)||(18879855-18879919)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (38-217)||(22304498-22304678)
chr3 (27-214)||(21832395-21832581)
chr3 (106-221)||(29644626-29644741)
chr3 (101-217)||(43346840-43346956)
chr3 (63-221)||(42342135-42342296)
chr3 (65-217)||(37990688-37990843)
chr3 (101-221)||(29644947-29645067)
chr3 (101-217)||(12114611-12114727)
chr3 (101-221)||(33803297-33803417)
chr3 (101-217)||(35946515-35946631)
chr3 (101-221)||(52634669-52634788)
chr3 (62-216)||(15773143-15773300)
chr3 (46-221)||(41359810-41359983)
chr3 (37-217)||(32462607-32462791)
chr3 (29-217)||(54017865-54018056)
chr3 (106-214)||(1634366-1634475)
chr3 (101-217)||(8327897-8328013)
chr3 (101-221)||(42342433-42342553)
chr3 (106-217)||(15772852-15772963)
chr3 (101-214)||(32589697-32589809)
chr3 (108-217)||(39389070-39389179)
chr3 (101-217)||(45901706-45901823)
chr3 (101-221)||(25739470-25739590)
chr3 (101-217)||(37991026-37991142)
chr3 (120-216)||(39935005-39935101)
chr3 (101-217)||(54018247-54018363)
chr3 (101-216)||(33175711-33175829)
chr3 (101-217)||(45395702-45395818)
chr3 (101-217)||(49336736-49336852)
chr3 (98-221)||(47964563-47964686)
chr3 (115-217)||(3135122-3135224)
chr3 (76-217)||(4823622-4823764)
chr3 (106-215)||(3384317-3384426)
chr3 (36-197)||(9240077-9240238)
chr3 (106-215)||(39336280-39336389)
chr3 (101-217)||(53577357-53577473)
chr3 (106-197)||(7767383-7767474)
chr3 (101-217)||(32462949-32463066)
chr3 (101-221)||(25755387-25755507)
chr3 (101-217)||(39914245-39914361)
chr3 (101-217)||(31190010-31190118)
chr3 (101-216)||(46546375-46546490)
chr3 (71-160)||(22304208-22304298)
chr3 (63-205)||(33809069-33809213)
chr3 (108-216)||(50612497-50612610)
chr3 (101-217)||(22304004-22304113)
chr3 (109-215)||(53118026-53118131)
chr3 (108-192)||(51886561-51886645)
chr3 (166-217)||(22303708-22303759)
chr3 (120-217)||(42584871-42584968)
chr3 (134-210)||(33362349-33362425)
chr3 (101-221)||(47964960-47965080)
chr3 (63-145)||(12747873-12747956)
chr3 (101-160)||(43346643-43346702)
chr3 (162-217)||(52634994-52635049)
chr3 (163-217)||(17731953-17732007)
chr3 (163-217)||(19033184-19033238)
chr3 (108-174)||(37726504-37726570)
chr3 (178-227)||(54017587-54017636)
chr3 (110-174)||(11661537-11661601)
chr3 (176-215)||(16143506-16143545)
chr3 (110-217)||(25991405-25991512)
chr3 (174-215)||(16871010-16871051)
chr3 (64-145)||(2299930-2300013)
chr3 (174-214)||(17735043-17735083)
chr3 (174-214)||(19036312-19036352)
chr3 (113-177)||(36986037-36986101)
chr3 (113-177)||(37011476-37011540)
[»] chr2 (61 HSPs)
chr2 (27-217)||(28531363-28531551)
chr2 (37-221)||(40679674-40679857)
chr2 (28-217)||(5542674-5542865)
chr2 (27-183)||(7598527-7598684)
chr2 (108-221)||(14745712-14745825)
chr2 (63-221)||(30323417-30323577)
chr2 (108-217)||(36178654-36178763)
chr2 (77-217)||(37106156-37106297)
chr2 (101-221)||(15880256-15880376)
chr2 (47-217)||(6422055-6422219)
chr2 (108-221)||(41283520-41283633)
chr2 (38-221)||(14745339-14745522)
chr2 (101-217)||(28254286-28254402)
chr2 (41-217)||(40733813-40733991)
chr2 (108-216)||(962598-962706)
chr2 (110-217)||(6421387-6421494)
chr2 (69-216)||(33561501-33561648)
chr2 (101-228)||(38796656-38796785)
chr2 (108-217)||(37105924-37106033)
chr2 (69-217)||(40733475-40733626)
chr2 (108-221)||(42514649-42514762)
chr2 (108-228)||(5543036-5543156)
chr2 (101-217)||(37632646-37632762)
chr2 (27-185)||(38796299-38796461)
chr2 (106-221)||(35580769-35580883)
chr2 (27-165)||(36785664-36785804)
chr2 (101-221)||(36005925-36006044)
chr2 (126-217)||(36178220-36178311)
chr2 (46-221)||(30313114-30313290)
chr2 (124-213)||(28254165-28254254)
chr2 (101-221)||(5367448-5367568)
chr2 (96-224)||(33953813-33953941)
chr2 (76-215)||(36178320-36178460)
chr2 (101-217)||(37895110-37895226)
chr2 (115-217)||(15511544-15511646)
chr2 (101-215)||(16542442-16542556)
chr2 (101-216)||(31468800-31468911)
chr2 (110-216)||(6712978-6713085)
chr2 (110-221)||(29874068-29874179)
chr2 (101-196)||(31899496-31899591)
chr2 (63-215)||(41678419-41678572)
chr2 (106-211)||(7598226-7598331)
chr2 (28-170)||(42514933-42515078)
chr2 (113-213)||(33731653-33731753)
chr2 (106-217)||(1769890-1770001)
chr2 (73-221)||(29873582-29873732)
chr2 (66-217)||(37894741-37894892)
chr2 (46-143)||(3673020-3673120)
chr2 (108-203)||(12529091-12529186)
chr2 (101-203)||(16590881-16590978)
chr2 (120-195)||(29676547-29676622)
chr2 (120-217)||(40163421-40163519)
chr2 (101-217)||(29676896-29677017)
chr2 (132-217)||(31259665-31259750)
chr2 (99-216)||(23346226-23346344)
chr2 (101-215)||(9231242-9231356)
chr2 (170-217)||(6421793-6421840)
chr2 (36-91)||(35580563-35580618)
chr2 (101-155)||(6421297-6421351)
chr2 (101-145)||(33954382-33954426)
chr2 (176-212)||(35580494-35580530)
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (27-221)||(40518501-40518695)
chr8 (38-216)||(1013921-1014100)
chr8 (38-217)||(3669989-3670169)
chr8 (65-217)||(34835165-34835318)
chr8 (101-218)||(3038338-3038455)
chr8 (111-221)||(147454-147564)
chr8 (28-221)||(8918809-8919004)
chr8 (37-221)||(45122559-45122737)
chr8 (105-221)||(45121955-45122071)
chr8 (64-217)||(34835427-34835584)
chr8 (64-217)||(34835693-34835850)
chr8 (106-217)||(45122106-45122217)
chr8 (108-217)||(3669687-3669796)
chr8 (27-212)||(45122922-45123108)
chr8 (41-217)||(30359539-30359718)
chr8 (101-221)||(41972151-41972274)
chr8 (101-217)||(9309348-9309464)
chr8 (101-221)||(9608738-9608858)
chr8 (100-221)||(4154711-4154832)
chr8 (101-217)||(30359264-30359380)
chr8 (101-217)||(34834869-34834985)
chr8 (110-216)||(25561865-25561972)
chr8 (108-217)||(1014294-1014403)
chr8 (101-217)||(6876911-6877028)
chr8 (62-217)||(6731857-6732004)
chr8 (46-173)||(18372349-18372477)
chr8 (108-217)||(30441081-30441194)
chr8 (101-217)||(33113416-33113532)
chr8 (101-221)||(40518062-40518184)
chr8 (115-221)||(70319-70425)
chr8 (46-212)||(18372988-18373153)
chr8 (37-217)||(147756-147929)
chr8 (108-221)||(5420651-5420764)
chr8 (133-217)||(9483236-9483320)
chr8 (110-217)||(1513964-1514071)
chr8 (110-217)||(37544539-37544646)
chr8 (110-228)||(40579544-40579662)
chr8 (120-217)||(18372043-18372140)
chr8 (75-216)||(4154331-4154473)
chr8 (100-213)||(9308969-9309084)
chr8 (101-217)||(5915865-5915976)
chr8 (62-216)||(45121706-45121862)
chr8 (115-217)||(9482653-9482755)
chr8 (110-216)||(18372656-18372758)
chr8 (57-180)||(18372785-18372908)
chr8 (121-217)||(20870622-20870718)
chr8 (111-223)||(43274822-43274934)
chr8 (147-226)||(9507821-9507900)
chr8 (46-152)||(18372485-18372592)
chr8 (131-221)||(9609108-9609198)
chr8 (111-221)||(32640577-32640682)
chr8 (115-185)||(41416252-41416322)
chr8 (112-217)||(18380066-18380171)
chr8 (120-181)||(25561729-25561790)
chr8 (112-220)||(43398114-43398225)
chr8 (101-197)||(9620745-9620841)
chr8 (46-217)||(18371710-18371877)
chr8 (134-221)||(32305503-32305590)
chr8 (101-214)||(8794104-8794217)
chr8 (169-217)||(6651555-6651603)
chr8 (121-197)||(3037777-3037853)
chr8 (101-165)||(20995502-20995566)
chr8 (106-216)||(5274773-5274883)
chr8 (101-187)||(33831971-33832057)
chr8 (113-221)||(2467507-2467613)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (28-221)||(13415805-13416000)
chr5 (36-217)||(26074537-26074721)
chr5 (28-217)||(6500742-6500931)
chr5 (82-217)||(26074195-26074330)
chr5 (64-221)||(24489251-24489406)
chr5 (53-221)||(26074826-26074998)
chr5 (110-218)||(18603168-18603276)
chr5 (109-228)||(299490-299609)
chr5 (106-217)||(40296364-40296475)
chr5 (101-221)||(26075206-26075327)
chr5 (101-217)||(12662701-12662817)
chr5 (108-216)||(32487394-32487501)
chr5 (114-217)||(41170640-41170743)
chr5 (28-217)||(3295064-3295256)
chr5 (100-221)||(1028562-1028683)
chr5 (108-217)||(36492266-36492375)
chr5 (101-217)||(6224189-6224305)
chr5 (101-221)||(36568612-36568732)
chr5 (39-217)||(624128-624305)
chr5 (69-216)||(36521946-36522093)
chr5 (99-217)||(41632773-41632891)
chr5 (108-217)||(6500451-6500559)
chr5 (101-217)||(15370092-15370208)
chr5 (106-217)||(35150005-35150115)
chr5 (111-217)||(25327938-25328044)
chr5 (108-217)||(9498703-9498812)
chr5 (115-216)||(11417027-11417128)
chr5 (120-221)||(34753070-34753171)
chr5 (27-221)||(38427475-38427660)
chr5 (46-195)||(31509559-31509710)
chr5 (108-217)||(27502085-27502194)
chr5 (108-221)||(29549300-29549413)
chr5 (120-217)||(33747783-33747880)
chr5 (28-144)||(13785731-13785847)
chr5 (101-217)||(42405645-42405761)
chr5 (121-216)||(3295395-3295489)
chr5 (108-213)||(5723844-5723949)
chr5 (108-221)||(26590955-26591068)
chr5 (108-217)||(623818-623927)
chr5 (111-215)||(2411010-2411114)
chr5 (69-217)||(36522286-36522434)
chr5 (134-221)||(15370428-15370515)
chr5 (110-185)||(26074320-26074395)
chr5 (101-203)||(42508605-42508707)
chr5 (111-217)||(35914852-35914958)
chr5 (110-183)||(7768852-7768925)
chr5 (29-104)||(9498411-9498487)
chr5 (110-181)||(300961-301032)
chr5 (101-216)||(35167888-35168003)
chr5 (101-143)||(35150740-35150782)
chr5 (101-143)||(35151031-35151073)
chr5 (176-217)||(13042607-13042648)
chr5 (174-211)||(14169000-14169037)
chr5 (122-195)||(31509745-31509818)
chr5 (101-174)||(39309677-39309750)
chr5 (111-215)||(41635242-41635346)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (101-221)||(1085661-1085781)
chr7 (38-217)||(7553953-7554134)
chr7 (54-217)||(30245020-30245186)
chr7 (46-216)||(45434573-45434744)
chr7 (101-217)||(7517573-7517689)
chr7 (38-217)||(14681438-14681619)
chr7 (46-217)||(30244205-30244379)
chr7 (108-217)||(22566711-22566820)
chr7 (101-221)||(24177428-24177548)
chr7 (28-217)||(1085297-1085492)
chr7 (110-217)||(6054562-6054669)
chr7 (76-209)||(37533067-37533201)
chr7 (108-217)||(29157565-29157674)
chr7 (101-217)||(23426-23542)
chr7 (101-221)||(40094819-40094939)
chr7 (108-217)||(22567088-22567196)
chr7 (101-221)||(118346-118466)
chr7 (101-217)||(8128490-8128606)
chr7 (101-217)||(36939782-36939898)
chr7 (28-221)||(37345836-37346031)
chr7 (101-217)||(45433234-45433350)
chr7 (115-217)||(11845198-11845300)
chr7 (108-214)||(16569196-16569302)
chr7 (108-214)||(16596360-16596466)
chr7 (101-217)||(34218083-34218199)
chr7 (101-221)||(36534829-36534949)
chr7 (106-213)||(36622958-36623065)
chr7 (111-217)||(37533413-37533519)
chr7 (25-155)||(40094505-40094634)
chr7 (120-217)||(19122744-19122840)
chr7 (111-212)||(20599317-20599418)
chr7 (100-196)||(28301613-28301709)
chr7 (28-174)||(30244618-30244767)
chr7 (101-209)||(43241488-43241596)
chr7 (101-217)||(45754709-45754824)
chr7 (106-209)||(40230348-40230451)
chr7 (110-217)||(47129097-47129204)
chr7 (113-216)||(30032572-30032675)
chr7 (162-217)||(30253546-30253601)
chr7 (63-217)||(4124137-4124293)
chr7 (101-174)||(30245487-30245560)
chr7 (101-174)||(30255332-30255405)
chr7 (101-197)||(41910663-41910759)
chr7 (111-221)||(24838746-24838857)
chr7 (106-221)||(41854633-41854747)
chr7 (111-217)||(9901648-9901752)
chr7 (157-221)||(28300298-28300363)
chr7 (101-174)||(36109009-36109082)
chr7 (28-104)||(48243242-48243318)
chr7 (38-127)||(45697841-45697929)
chr7 (177-216)||(23569052-23569091)
chr7 (174-221)||(40094458-40094505)
chr7 (37-102)||(28300365-28300431)
chr7 (101-151)||(36967344-36967394)
chr7 (167-217)||(37167840-37167890)
chr7 (176-217)||(21416190-21416231)
chr7 (30-74)||(47129395-47129439)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (28-217)||(5273-5466)
scaffold0078 (101-217)||(4975-5091)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (38-197)||(5705-5866)
scaffold0734 (101-217)||(5389-5506)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (110-217)||(563-670)
scaffold0702 (41-174)||(234-367)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (27-213)||(1159-1348)
scaffold0391 (37-155)||(3096-3217)
scaffold0391 (157-217)||(1740-1800)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (62-213)||(17507-17663)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (106-209)||(47358-47461)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (46-169)||(39775-39899)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (110-186)||(10191-10267)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30630884 - 30630678
Alignment:
Q  20 agtagcaacgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgat 119  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30630884 agtaacaacgatacaagcaagtaagtgcttcctcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagagggagtgttatgtgcaagtgtgat 30630785  T
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30630784 ttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtggggcg 30630685  T
Q  220 tccctat 226  Q
    |||||||    
T  30630684 tccctat 30630678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44290699 - 44290511
Alignment:
Q  27 acgatacaggcaa-gtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttata 124  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  44290699 acgatacaggcaaagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttata 44290600  T
Q  125 tgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagt 213  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  44290599 tgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 44290511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22077733 - 22077540
Alignment:
Q  27 acgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatg 126  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22077733 acgatacaagcaattaagagcttccgcttgatgg-ggagcatgatgaatacatggactcacacttgagggggagtgttgtgtgcaagtgtgagttatatg 22077635  T
Q  127 tcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22077634 tctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtc 22077540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26661753 - 26661571
Alignment:
Q  38 aagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacat 134  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |   || ||||||||| |||||||||||||||    
T  26661753 aagtaagagcttccgcttgaagggagagtatgatgaatagatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacat 26661654  T
Q  135 cggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26661653 cgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 26661571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 17294570 - 17294686
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  17294570 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 17294669  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  17294670 tttgggtaagagtgtgg 17294686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3537368 - 3537228
Alignment:
Q  46 gcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaa 144  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3537368 gcttccgcttgaagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 3537269  T
Q  145 attaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaac 185  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3537268 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 3537228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 217
Target Start/End: Original strand, 41157326 - 41157484
Alignment:
Q  62 ggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagt---gttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggac 158  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| |||| ||    
T  41157326 ggagcacgataaattgatggactcacacttaagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaac 41157425  T
Q  159 actttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  41157426 accttataagtaagaggacccataaacccattgcctttaggttttgagtaagagtgtgg 41157484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 217
Target Start/End: Original strand, 34364850 - 34365034
Alignment:
Q  36 gcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaatt-gatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtccca 131  Q
    ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||   ||||||||| ||||| || ||||||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||    
T  34364850 gcaagtaagagcttccgattgaggg-ggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcaca 34364948  T
Q  132 catcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  34364949 catcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34365034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 66328 - 66134
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaag-taagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttat-at 125  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||||||||||| | || ||    
T  66328 cgatacaagcaagataagagcttccgcttgatgggggaacatgatgaatagatggactcacacttgaggggaagtgttgtgtgcaagtgtgagtaatcat 66229  T
Q  126 gtcccacatcggataaaaaattaaaggttgga-cactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcg 219  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  66228 gtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctatggccttaaggttttgggtaagagtgtggcg 66134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48588714 - 48588540
Alignment:
Q  41 taagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggat 139  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||  | ||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  48588714 taagagcttccgcttgaaggggtagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttctatgtccgacatcggat 48588615  T
Q  140 aaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtg 214  Q
    |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48588614 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaaggttttgggtaagagtg 48588540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 217
Target Start/End: Original strand, 3550721 - 3550829
Alignment:
Q  109 gcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggta 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3550721 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaagttttgggta 3550820  T
Q  209 agagtgtgg 217  Q
    |||||||||    
T  3550821 agagtgtgg 3550829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 228
Target Start/End: Original strand, 41156984 - 41157111
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||    
T  41156984 tgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggt 41157083  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtccctattg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  41157084 tttgggtaagagtgtggtgtctctattg 41157111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44290983 - 44290873
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44290983 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 44290884  T
Q  208 -aagagtgtgg 217  Q
     ||||||||||    
T  44290883 aaagagtgtgg 44290873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 41142365 - 41142486
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||    
T  41142365 tgttctgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggt 41142464  T
Q  201 tttgggt-aagagtgtggcgtc 221  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  41142465 ttttggtaaagagtgtggcgtc 41142486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32594874 - 32594765
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  32594874 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggt 32594775  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  32594774 aagagtgtgg 32594765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41184590 - 41184489
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  41184590 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 41184491  T
Q  201 tt 202  Q
    ||    
T  41184490 tt 41184489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22077359 - 22077155
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgt 127  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | |||||  ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22077359 cgatacaagcaagtaagagctttcgcttgatagcg-agcatgatgaatagatggacacacacttgagggggagtgttgtgtgcaagtgtgagttatatgt 22077261  T
Q  128 cccacatcggataaaaaat------------taaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgt 215  Q
    ||||||||||||| |||||            ||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  22077260 cccacatcggatagaaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgt 22077161  T
Q  216 ggcgtc 221  Q
    | ||||    
T  22077160 gacgtc 22077155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24600479 - 24600363
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||    
T  24600479 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggt 24600380  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||| ||||||||||||    
T  24600379 tttgtgtaagagtgtgg 24600363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Original strand, 34364500 - 34364615
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||| ||    
T  34364500 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggt 34364599  T
Q  201 tttgggtaagagtgtg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  34364600 tttgggtaagagtgtg 34364615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 217
Target Start/End: Original strand, 37556036 - 37556220
Alignment:
Q  36 gcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccac 132  Q
    ||||||||| ||||   |||||||| || ||| ||| || |||||||||| ||||| || ||||||||| |   || ||||||||| |||||||||||||    
T  37556036 gcaagtaagagctttagcttgaagggggggcaggataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccac 37556135  T
Q  133 atcggataaaaa-attaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37556136 atcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagagga-ccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtgg 37556220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 50052178 - 50052072
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  50052178 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaagttttgggtaag 50052079  T
Q  211 agtgtgg 217  Q
    |||||||    
T  50052078 agtgtgg 50052072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3537745 - 3537644
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3537745 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaaggttttgggtaagagtgtggcg 3537646  T
Q  220 tc 221  Q
    ||    
T  3537645 tc 3537644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 66637 - 66525
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||    
T  66637 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggt 66538  T
Q  201 tttgggtaagagt 213  Q
    |||||||||||||    
T  66537 tttgggtaagagt 66525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3875496 - 3875380
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||    
T  3875496 tgttgtgtgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggt 3875397  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  3875396 tttaggtaagaatgtgg 3875380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31767326 - 31767206
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||  | |||||||| ||    
T  31767326 tgttgtgtgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggt 31767227  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  31767226 tttgggtaagagtgtgacgtc 31767206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5320016
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 5320024  T
Q  208 aagagtgt 215  Q
    ||||||||    
T  5320023 aagagtgt 5320016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 221
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649551
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  210 gagtgtggcgtc 221  Q
    ||||| ||||||    
T  34649540 gagtgaggcgtc 34649551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798308
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| || |||| |    
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggat 29798298  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  29798299 aagagtgtgg 29798308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 41759483 - 41759592
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||  | |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  41759483 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaaggttttgggt 41759582  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  41759583 aagagtgtgg 41759592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 217
Target Start/End: Original strand, 40082408 - 40082515
Alignment:
Q  109 gcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggta 208  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  40082408 gcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttttgggta 40082506  T
Q  209 agagtgtgg 217  Q
    |||||||||    
T  40082507 agagtgtgg 40082515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 216
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956017
Alignment:
Q  112 agtgtgatttatatgtcccacatcggat-aaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaaccca-taaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  210 gagtgtg 216  Q
    |||||||    
T  9956011 gagtgtg 9956017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 216
Target Start/End: Original strand, 11977282 - 11977388
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  11977282 caagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 11977381  T
Q  210 gagtgtg 216  Q
    |||||||    
T  11977382 gagtgtg 11977388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38804511 - 38804406
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  38804511 caagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttgggtaa 38804412  T
Q  210 gagtgt 215  Q
    ||||||    
T  38804411 gagtgt 38804406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45494137 - 45494023
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtga-tttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacac----tttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttt 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    | |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  45494137 tgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgccttaaagttt 45494038  T
Q  203 tgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||| |||||||||||    
T  45494037 tggataagagtgtgg 45494023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26662063 - 26661947
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||  ||||||||||  |||||||||| ||    
T  26662063 tgttgtgtacaagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggt 26661964  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  26661963 tttgggtaagagtgtgg 26661947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37850765 - 37850681
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaac 185  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37850765 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaac 37850681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39066365 - 39066249
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||  ||||| ||||| ||    
T  39066365 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggt 39066266  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||| |||||||||||    
T  39066265 tttggataagagtgtgg 39066249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 221
Target Start/End: Original strand, 10351182 - 10351273
Alignment:
Q  130 cacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||| |||| |||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10351182 cacatcagatagaaaaatagaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtc 10351273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19283622 - 19283500
Alignment:
Q  99 agtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |  ||||||  |||||| ||| | |||| || ||||||| ||| |||||||     
T  19283622 agtgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaag 19283523  T
Q  199 gttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  19283522 gttttggataagagtgtggcgtc 19283500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 221
Target Start/End: Original strand, 44685448 - 44685569
Alignment:
Q  100 gtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaagg-ttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaa 198  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||     
T  44685448 gtgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaat 44685547  T
Q  199 gttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    | ||||||||| |||||| ||||    
T  44685548 g-tttgggtaacagtgtgacgtc 44685569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Original strand, 14318879 - 14318976
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14318879 ttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 14318976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 45084380 - 45084457
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataa 183  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  45084380 tgtgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 45084457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 221
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575217
Alignment:
Q  114 tgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagt 213  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||  ||| || |||| ||||||| |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  214 gtggcgtc 221  Q
    ||||||||    
T  5575210 gtggcgtc 5575217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22077988 - 22077874
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||   | |||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |||| ||    
T  22077988 tgtgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcc-taaggtttggg 22077890  T
Q  206 gtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  22077889 gtaagagtgtggcgtc 22077874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 50051880 - 50051777
Alignment:
Q  38 aagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtt-atgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcg 136  Q
    ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50051880 aagtaagagcttctgcttgaagggggagcatgatgaattaatggactcacacttgagggggaatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 50051781  T
Q  137 gata 140  Q
    ||||    
T  50051780 gata 50051777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Original strand, 22793279 - 22793392
Alignment:
Q  109 gcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacaca-ttgccttaaagttttgggt 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||| | ||||||||||| |||| | |||||||| || ||||||||  |||||| ||    
T  22793279 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagt 22793378  T
Q  208 aagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||| ||||    
T  22793379 aagagtgtgacgtc 22793392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1188753 - 1188633
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||| |  |||||| | | ||||||||| |||  || ||||||| |||||| |||| ||    
T  1188753 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggt 1188654  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  1188653 tttgggtaaaagtgtggcgtc 1188633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 50469251 - 50469180
Alignment:
Q  96 gggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataa 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  50469251 gggagtgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24132143 - 24132049
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttt 202  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |||| | | |||||||| ||||||||||| ||||    
T  24132143 tgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaaggttt 24132049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5528900 - 5528799
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcg 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||| |||||| || ||||||| ||||  ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  5528900 ttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtggcg 5528801  T
Q  220 tc 221  Q
    ||    
T  5528800 tc 5528799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 47380023 - 47379889
Alignment:
Q  27 acgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatg 126  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||||  || || || |||||||||   ||||||||||| ||||||     
T  47380023 acgatacaagcaagtaagaacttccgcttgaggggggagcacgatgaattgttggacttacatttgagggggagtgttga-tgcaagtgtgagttatata 47379925  T
Q  127 tcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactt 162  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||| ||||||    
T  47379924 tcccacatcggatagaaaagtggaggttgaacactt 47379889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 217
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555838
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| | || ||||||||||||| | || ||||  | | ||||||| ||||||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagagga-ccttaaatccttagccttaaggttttgggtaag 37555831  T
Q  211 agtgtgg 217  Q
    |||||||    
T  37555832 agtgtgg 37555838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21378206 - 21378122
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaac 185  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || | ||||||||| | |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  21378206 tgttgtgtgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaac 21378122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32168795 - 32168743
Alignment:
Q  169 taagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32168795 taagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggtaagagtgtggcgtc 32168743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1187524 - 1187409
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |  |||||  ||| ||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||  |||||     
T  1187524 tgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttga 1187425  T
Q  206 gtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||| |||||| ||||    
T  1187424 gtaaaagtgtgacgtc 1187409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44043924 - 44043821
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaa----aat--taaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagt 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    |||  |||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  44043924 ttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagt 44043825  T
Q  214 gtgg 217  Q
    ||||    
T  44043824 gtgg 44043821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 221
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956304
Alignment:
Q  135 cggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtc 4956304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35154204 - 35154150
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttg 155  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  35154204 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 184
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44091970
Alignment:
Q  123 tatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaa 184  Q
    |||||| |||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaa 44091970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380217
Alignment:
Q  179 cataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 47380217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 1188459 - 1188406
Alignment:
Q  36 gcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcactt 91  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1188459 gcaagtaagagcttccacttgaagg--gagcatgatgaattgatggactcacactt 1188406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 177
Target Start/End: Original strand, 4878796 - 4878872
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaac 177  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||| ||| ||||||||| |||||||    
T  4878796 tgttgtgtgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagtgagagaac 4878872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41184198 - 41184152
Alignment:
Q  156 gacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttt 202  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||    
T  41184198 gacactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 3537543 - 3537498
Alignment:
Q  46 gcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcactt 91  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3537543 gcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacactt 3537498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35530479 - 35530406
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagag 174  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||    
T  35530479 tgttatgtgtaaatgtgtgttatatgtcccacgtcgaataaaaaaattaaggttgaacattttatatgtaagag 35530406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10074229 - 10074040
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgt 127  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |||||| |    
T  10074229 cgatacaagcaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatagactcgcacttgagggggagtgttgtgtgcaagggtgagttatatat 10074130  T
Q  128 cccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10074129 cccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaaagtgtgg 10074040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10074560 - 10074412
Alignment:
Q  69 gatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataag 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||    
T  10074560 gatgaattgatggactcacacttaagggggagtgttgtgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataag 10074461  T
Q  169 taagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10074460 taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 10074412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 29518850 - 29519029
Alignment:
Q  38 aagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcg 136  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29518850 aagtaagagcttccgcttgaggg-ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 29518948  T
Q  137 gataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  29518949 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtgg 29519029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10073851 - 10073665
Alignment:
Q  29 gatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtc 128  Q
    |||||| | |||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  10073851 gatacaagaaagtaagaccttccgcttgaagggggaacatgatgaattgatggactcacacttaagagggggtgttgtgtgcaagtgttagttatatgtc 10073752  T
Q  129 ccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  10073751 ccacatcgg--agaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattggcttaagattttgggtaagagtgtgg 10073665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2578647 - 2578492
Alignment:
Q  64 agcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacac 160  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| |   || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  2578647 agcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacac 2578549  T
Q  161 tttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2578548 tttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtgg 2578492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 2378059 - 2378235
Alignment:
Q  41 taagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggat 139  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||  | |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2378059 taagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttggg-gggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 2378157  T
Q  140 aaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| |||||    
T  2378158 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttaggtaagaatgtgg 2378235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 3409259 - 3409368
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3409259 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 3409358  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  3409359 aagagtgtgg 3409368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 29518503 - 29518612
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  29518503 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 29518602  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  29518603 aagagtgtgg 29518612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 32741179 - 32741288
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  32741179 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 32741278  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  32741279 aagagtgtgg 32741288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 16107991 - 16108152
Alignment:
Q  38 aagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacat 134  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |   || ||||||||| |||||||| ||||||    
T  16107991 aagtaagagcttccgcttgaagg-ggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacat 16108089  T
Q  135 cggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaa 197  Q
    | ||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16108090 cagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 16108152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 16454842 - 16455020
Alignment:
Q  46 gcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaa 142  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| || || || || ||||||||| |   || ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  16454842 gcttccgcttgaagggggagcatgctgaattgatggagtcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaaatgtgagttatgtgtcccacatcagataaa 16454941  T
Q  143 aaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    | | ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16454942 agagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtc 16455020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 217
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2377863
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 2377855  T
Q  210 gagtgtgg 217  Q
    ||||||||    
T  2377856 gagtgtgg 2377863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2579720 - 2579549
Alignment:
Q  38 aagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcgg 137  Q
    ||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||| || | ||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2579720 aagtaagagctttcgcttgaagggggaccatgatgaatagacggactcacacttgagggagagtgttgttagcaggtgtgagttatatgtcccacatcgg 2579621  T
Q  138 ataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    | |||||| ||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2579620 acaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 2579549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14748496 - 14748387
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  14748496 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaaggttttgggt 14748397  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  14748396 aagagtgtgg 14748387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 35210204 - 35210313
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  35210204 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaaggttttgggt 35210303  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  35210304 aagagtgtgg 35210313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2580037 - 2579921
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||    
T  2580037 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggt 2579938  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||| |||||    
T  2579937 tttgggtaagaatgtgg 2579921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 3058226 - 3058335
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3058226 tgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 3058325  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  3058326 aagagtgtgg 3058335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 16107671 - 16107787
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||    
T  16107671 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggt 16107770  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  16107771 tttgggtaagagtgtgg 16107787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Original strand, 26544049 - 26544157
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||||| ||    
T  26544049 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaaggttttgagt 26544148  T
Q  208 aagagtgtg 216  Q
    |||||||||    
T  26544149 aagagtgtg 26544157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  113 gtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagag 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  213 tgtg 216  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Original strand, 1127360 - 1127473
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  1127360 tgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttttgggt 1127459  T
Q  208 aagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||||||    
T  1127460 aagagtgtggcgtc 1127473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 1846748 - 1846857
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  1846748 tgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggttttggat 1846847  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  1846848 aagagtgtgg 1846857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 221
Target Start/End: Original strand, 6071085 - 6071245
Alignment:
Q  63 gagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggag--tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || || ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| |  |||||| ||||    
T  6071085 gagcatgatgaattgatggactcacatttgaggggaagattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtggaggttgaacac 6071184  T
Q  161 tttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  6071185 tttataagtgagatgatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggcgtc 6071245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 16454568 - 16454688
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |    
T  16454568 tgttgtgtacaagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagat 16454667  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  16454668 tttggataagagtgtggcgtc 16454688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 593868 - 593758
Alignment:
Q  107 gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttggg 206  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||  | |||||||| ||||||||    
T  593868 gtgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttggg 593769  T
Q  207 taagagtgtgg 217  Q
    ||| |||||||    
T  593768 taatagtgtgg 593758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2579013 - 2578884
Alignment:
Q  87 cacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaaca 186  Q
    ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| | || |||||| |||||| | ||||||||     
T  2579013 cacttgagggggagtgttgtgagcaagtgtgatttatatgtccctcatcggata-aaaagtaaatgttgaataccttataaataagaggatccataaact 2578915  T
Q  187 cattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  2578914 cattaccttaaggttttgggtaagagtgtgg 2578884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Original strand, 3409627 - 3409769
Alignment:
Q  76 tgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagag 174  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||| |||  |||||||||||||    
T  3409627 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagag 3409726  T
Q  175 aacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
     |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  3409727 gacccataaacccattgcctttattttttgggtaagagtgtgg 3409769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999841
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||| ||||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataag 6999852  T
Q  211 agtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||    
T  6999851 agtgtggcgtc 6999841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 217
Target Start/End: Original strand, 3415462 - 3415567
Alignment:
Q  112 agtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaaga 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  3415462 agtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaaga 3415561  T
Q  212 gtgtgg 217  Q
    ||||||    
T  3415562 gtgtgg 3415567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911674
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaat-taaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttggg 206  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||      
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaa 10911664  T
Q  207 taagagtgtg 216  Q
    ||||||||||    
T  10911665 taagagtgtg 10911674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 8481888 - 8482035
Alignment:
Q  71 tgaattgatggactcgcacttaagagggag--tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataag 168  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| |  |||||| |||||||||||     
T  8481888 tgaattgatggactcacacttgagggggagattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaa 8481986  T
Q  169 taagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    | |||  || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8481987 tgagatgactcataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtgg 8482035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 217
Target Start/End: Original strand, 2843560 - 2843664
Alignment:
Q  114 tgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaaccc-ataaacacattgccttaaagttttgggtaagag 212  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2843560 tgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 2843659  T
Q  213 tgtgg 217  Q
    |||||    
T  2843660 tgtgg 2843664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9062501 - 9062399
Alignment:
Q  114 tgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagt 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  9062501 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtctt-aagttttgggtaaaagt 9062403  T
Q  214 gtgg 217  Q
    ||||    
T  9062402 gtgg 9062399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950230
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||   | |||||||| |||||| |||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaag 1950241  T
Q  211 agtgtggcgtc 221  Q
    |||||| ||||    
T  1950240 agtgtgacgtc 1950230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5958763 - 5958653
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5958763 tgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttttgg 5958664  T
Q  206 gtaagagtgtg 216  Q
    |  ||||||||    
T  5958663 gatagagtgtg 5958653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12092649 - 12092531
Alignment:
Q  99 agtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaa 198  Q
    |||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||| |  ||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||     
T  12092649 agtgttgtgtgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaag 12092550  T
Q  199 gttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  12092549 gttttgagtaagactgtgg 12092531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 167
Target Start/End: Original strand, 33605895 - 33606034
Alignment:
Q  27 acgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatg 126  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| || ||||  || ||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||| | ||||||| ||| | |||||||    
T  33605895 acgatacaagcaagtaagagcttccgctcgaagaagg-gcacggtgaattgatggactcacacttgagggggagtgatgtgtgcaaatgtaagttatatg 33605993  T
Q  127 tcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataa 167  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||| |||||||||||    
T  33605994 tcccacatcgaatagaaaagtggaggttgaacactttataa 33606034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2579349 - 2579203
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagca---tgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgattt 121  Q
    |||||||  |||||||| |||||| |||||| | ||||||   |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| |   || ||||||| | ||    
T  2579349 cgatacaaacaagtaagagcttccgcttgaaaggggagcaacatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgttagtt 2579250  T
Q  122 atatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataag 168  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||    
T  2579249 atatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag 2579203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832108
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaa 184  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaa 5832108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 216
Target Start/End: Original strand, 2975471 - 2975660
Alignment:
Q  27 acgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttat-at 125  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||  | ||||||||| |||  |||||| | | || ||    
T  2975471 acgatacgagcaagtaagagcttccgcttaaagggggaacatgatgaatagatgcactcacacttggg-gggagtgttgtgtttaagtgtaagtaattat 2975569  T
Q  126 gtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||| |||| |||| ||||||| ||||  |||||||||  | ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  2975570 gtcccacatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaagatgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtg 2975660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Original strand, 31714666 - 31714781
Alignment:
Q  103 ttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttt 202  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |  |||||| ||  | ||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  31714666 ttatgtgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttt 31714763  T
Q  203 tgggtaagagtgtggcgt 220  Q
    || |||||||||||||||    
T  31714764 tgagtaagagtgtggcgt 31714781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22605346 - 22605304
Alignment:
Q  175 aacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22605346 aacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtgg 22605304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 76)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 54108835 - 54109021
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgt 127  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | |  |||||    
T  54108835 cgatacaagcaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattaatagactcacacttaagggggagtgttgtgtgcaagtgtcagt--tatgt 54108932  T
Q  128 cccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54108933 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aagttttgggtaagagtgtgg 54109021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 217
Target Start/End: Original strand, 36629175 - 36629346
Alignment:
Q  46 gcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaa 145  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36629175 gcttccgcttgaaggtggagcatgatgaattgatgggctcacacttgagggggagtgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaa 36629274  T
Q  146 ttaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
     |||| |||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36629275 gtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 36629346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Original strand, 2741000 - 2741184
Alignment:
Q  38 aagtaagtgcttcctcttgaaggcg-gagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcg 136  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  2741000 aagtaagagcttccgcttgaaggggagagcatgatgaattgatggactcacacttgaaggggagtgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatca 2741099  T
Q  137 gataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||| || | ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2741100 gatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtc 2741184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 216
Target Start/End: Original strand, 20826137 - 20826325
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgt 127  Q
    ||||||| ||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||||||    
T  20826137 cgatacaagcaagtaatagcgtccgcttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttatgtagaaatgtgagttatatgt 20826236  T
Q  128 cccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||||    
T  20826237 cccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagagaacccataaacccatagccttaacattttaggtaagagtgtg 20826325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3244661 - 3244494
Alignment:
Q  54 ttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggt 153  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  3244661 ttgaagggggaacatgatgaatagatggactcacgcttaagggagagtgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggt 3244562  T
Q  154 tggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3244561 tgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaagttttgggtaagaatgtgtcgtc 3244494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 55933280 - 55933171
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55933280 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaagttttgggt 55933181  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  55933180 aagagtgtgg 55933171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22028124 - 22028008
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  22028124 tgttgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacatattgccttaaggt 22028025  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22028024 tttgggtaagaatgtgg 22028008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 217
Target Start/End: Original strand, 44620611 - 44620768
Alignment:
Q  62 ggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgt---tatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggac 158  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || |||||| ||    
T  44620611 ggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggtggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaaatagtagaggttgaac 44620710  T
Q  159 actttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  44620711 actttataagtaagaggacccataaac-cataaccttaaggttttgggtaagagtgtgg 44620768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 50630911 - 50630802
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  50630911 tgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 50630812  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  50630811 aagagtgtgg 50630802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4955480 - 4955360
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||    
T  4955480 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggt 4955381  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4955380 tttgggtaagagtgtggcgtc 4955360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22183427 - 22183307
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||    
T  22183427 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggt 22183328  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  22183327 tttggataagagtgtggcgtc 22183307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 25483329 - 25483445
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||    
T  25483329 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggt 25483428  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  25483429 tttgggtaagagtgtgg 25483445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Original strand, 41370357 - 41370464
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| | || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41370357 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaagttttgggt 41370456  T
Q  208 aagagtgt 215  Q
    ||||||||    
T  41370457 aagagtgt 41370464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 221
Target Start/End: Original strand, 28034221 - 28034342
Alignment:
Q  100 gtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaag 199  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |    
T  28034221 gtgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaagg 28034320  T
Q  200 ttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  28034321 ttttaggtaagagtgtggcgtc 28034342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 50002426 - 50002535
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||||    
T  50002426 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 50002525  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  50002526 aagagtgtgg 50002535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 206
Target Start/End: Original strand, 52884880 - 52884985
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||    
T  52884880 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggt 52884979  T
Q  201 tttggg 206  Q
    ||||||    
T  52884980 tttggg 52884985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34646812 - 34646696
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||    
T  34646812 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggt 34646713  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  34646712 tttgggtaagagtgtgg 34646696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888864
Alignment:
Q  109 gcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggta 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  209 agagtgtg 216  Q
    ||||||||    
T  16888871 agagtgtg 16888864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54017753 - 54017643
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  54017753 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttag 54017654  T
Q  206 gtaagagtgtg 216  Q
    |||||||||||    
T  54017653 gtaagagtgtg 54017643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54741341 - 54741227
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  54741341 tgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggt 54741242  T
Q  201 tttgggtaagagtgt 215  Q
    ||||| |||||||||    
T  54741241 tttggataagagtgt 54741227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 49880160 - 49880269
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  49880160 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 49880259  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||| ||||    
T  49880260 aagagcgtgg 49880269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 52884688 - 52884805
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||| ||||||||||| ||    
T  52884688 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggt 52884787  T
Q  201 ttt-gggtaagagtgtgg 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  52884788 tttggggtaagagtgtgg 52884805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1731810 - 1731694
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||  |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| ||    
T  1731810 tgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggt 1731711  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  1731710 tttgggtaagagtgtgg 1731694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 2740693 - 2740813
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||    
T  2740693 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggt 2740792  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  2740793 tttacgtaagagtgtggcgtc 2740813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 10245913 - 10246028
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||  ||||||| ||    
T  10245913 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaacccaaagccttaaggt 10246011  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  10246012 tttgggtaagagtgtgg 10246028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41707627 - 41707512
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  41707627 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggt 41707528  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||| |||||||||||||    
T  41707527 ttt-ggtaagagtgtgg 41707512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 44620365 - 44620461
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44620365 ttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 49076687 - 49076510
Alignment:
Q  30 atacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaat--tgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttata 124  Q
    ||||| ||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||||||   |||||||||| ||||| ||  |||||||| |   |||||||||||| |||||    
T  49076687 atacaagcaagtaagagtttccgcttgaagggggaacatgatgaaaagtgatggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttata 49076588  T
Q  125 tgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttt 202  Q
    ||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  49076587 tgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccattgtcttaaagttt 49076510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 217
Target Start/End: Original strand, 3340805 - 3340916
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||    
T  3340805 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgg 3340904  T
Q  206 gtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||    
T  3340905 gtaagagtgtgg 3340916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22028534 - 22028416
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaat--taaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaa 198  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||     
T  22028534 tgttgtgtgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaat 22028435  T
Q  199 gttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22028434 gttttgggtaagagtgtgg 22028416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 221
Target Start/End: Original strand, 39404020 - 39404131
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  39404020 caagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaa 39404119  T
Q  210 gagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||||    
T  39404120 gagtgtggcgtc 39404131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 217
Target Start/End: Original strand, 49302902 - 49303015
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataa--gtaagagaacccataaacacattgccttaaagtttt 203  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||  ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  49302902 tgtgtaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 49303001  T
Q  204 gggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||||    
T  49303002 gggtaagagtgtgg 49303015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36608824 - 36608708
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||| | ||||||||||| | |||||||  ||||| ||||| ||    
T  36608824 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggt 36608725  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  36608724 tttgggtaagagtgtgg 36608708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39793023 - 39792907
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||| ||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||| ||    
T  39793023 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggt 39792924  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  39792923 tttgggtaagagtgtgg 39792907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Original strand, 3341121 - 3341236
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||  ||||  |    
T  3341121 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactttataagtaagaggacccataacatcattgttttaagat 3341220  T
Q  201 tttgggtaagagtgtg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  3341221 tttgggtaagagtgtg 3341236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496914
Alignment:
Q  123 tatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgg 45496914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 217
Target Start/End: Original strand, 54936215 - 54936305
Alignment:
Q  127 tcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54936215 tcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54936305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Original strand, 39404326 - 39404507
Alignment:
Q  37 caagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccaca 133  Q
    |||||||| |||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||| |   || ||||||||| ||||||||||||||    
T  39404326 caagtaagagcttccgcttgagggag-agcacgatgaattgatggacta-cacttgaggaggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca 39404423  T
Q  134 tcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    || ||||||| | ||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| |||| |||||    
T  39404424 tcagataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaaggttttgggcaagaatgtgg 39404507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4390264 - 4390144
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| | || | | |||||||| |||| ||    
T  4390264 tgttgtgtgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggt 4390165  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  4390164 tttgggtaagagtgtgacgtc 4390144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 20825829 - 20825945
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||   | ||||||| ||    
T  20825829 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggt 20825928  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  20825929 tttgggtaagagtgtgg 20825945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 213
Target Start/End: Original strand, 36572012 - 36572124
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||    
T  36572012 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggt 36572111  T
Q  201 tttgggtaagagt 213  Q
    ||||||| |||||    
T  36572112 tttgggttagagt 36572124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23557027 - 23556909
Alignment:
Q  103 ttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttt 202  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||| |||| |  |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  23557027 ttatgtgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttt 23556928  T
Q  203 tgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  23556927 tggataagagtgtgacgtc 23556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Original strand, 44621017 - 44621111
Alignment:
Q  123 tatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||  | ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44621017 tatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgg 44621111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 175
Target Start/End: Original strand, 44621377 - 44621493
Alignment:
Q  62 ggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgt---tatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggac 158  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||   | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||  ||    
T  44621377 ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaaacagtaaaggttaaac 44621476  T
Q  159 actttataagtaagaga 175  Q
    || ||||||||||||||    
T  44621477 accttataagtaagaga 44621493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941166
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||| | || | ||||||||| |||| |||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggt 32941180  T
Q  208 aagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||| ||||    
T  32941179 aagagtgtgacgtc 32941166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 43174499 - 43174620
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaa-attaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaag 199  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||  ||  ||||||||    
T  43174499 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacacataaacctatgaccttaaag 43174598  T
Q  200 ttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  43174599 tgttgggtaagagtgtggcgtc 43174620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889587
Alignment:
Q  109 gcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggta 208  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||| |  |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  209 agagt 213  Q
    |||||    
T  16889591 agagt 16889587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18932887 - 18932796
Alignment:
Q  126 gtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18932887 gtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtgg 18932796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 221
Target Start/End: Original strand, 31691206 - 31691265
Alignment:
Q  162 ttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31691206 ttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtc 31691265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 49076988 - 49076878
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| || || ||||| | ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  49076988 tgtgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgg 49076890  T
Q  206 gtaagagtgtgg 217  Q
    || |||||||||    
T  49076889 gttagagtgtgg 49076878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017750
Alignment:
Q  121 tatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 54343145 - 54343055
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54343145 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 45489571 - 45489418
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaatt-gatggactcgcacttaagaggg-agtgttat---gtgcaagtgtgattta 122  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||   ||||||||| ||||| || ||| |||||| |   || ||||||||| |||    
T  45489571 cgatacaagcaagtaagagcttccgcttgaaga-ggagcatgatgaaaacgatggactcacacttgaggggggagtgttgttgtgtacaagtgtgaatta 45489473  T
Q  123 tatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaac 177  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45489472 tatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaagagaac 45489418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34004741 - 34004628
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| |    
T  34004741 tgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaaact-aaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcg 34004644  T
Q  206 gtaagagtgtggcgtc 221  Q
     |||||||||| ||||    
T  34004643 ataagagtgtgccgtc 34004628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 216
Target Start/End: Original strand, 3271841 - 3271895
Alignment:
Q  162 ttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3271841 ttataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 3271895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 217
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459830
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  211 agtgtgg 217  Q
    || ||||    
T  50459824 agcgtgg 50459830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6975612 - 6975499
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| | |  ||||||||||||| || ||||||  ||||  |||||  ||||||||    
T  6975612 tgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaagattttgggt 6975513  T
Q  208 aagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||||||    
T  6975512 aagagtgtggcgtc 6975499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760278
Alignment:
Q  113 gtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaa 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||   ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaa 760278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Original strand, 54108551 - 54108646
Alignment:
Q  123 tatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaaca-cattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  54108551 tatgtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttggctaagagtgtgg 54108646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 171
Target Start/End: Original strand, 3700358 - 3700428
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaa 171  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||    
T  3700358 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaa 3700428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841416
Alignment:
Q  150 aggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 15841416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 215
Target Start/End: Original strand, 1868117 - 1868158
Alignment:
Q  174 gaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgt 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868117 gaacccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 41707393 - 41707340
Alignment:
Q  37 caagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcact 90  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41707393 caagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacact 41707340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 197
Target Start/End: Original strand, 10246340 - 10246436
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaa 197  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  10246340 tgttgtgtgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggacccataaacccatagccttaa 10246436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 19504698 - 19504809
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||         ||||| |||||||||   |||||||||||||    
T  19504698 tgttgtgtacaagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagt 19504788  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19504789 tttgggtaagagtgtggcgtc 19504809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 51768223 - 51768115
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||| | |||| ||| || | |||| |||| |||| |||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| ||    
T  51768223 tgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggt 51768124  T
Q  201 tttgggtaa 209  Q
    |||||||||    
T  51768123 tttgggtaa 51768115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817728
Alignment:
Q  162 ttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 23817728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 175
Target Start/End: Original strand, 44620308 - 44620363
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagaga 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44620308 ttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaga 44620363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 217
Target Start/End: Original strand, 34544119 - 34544216
Alignment:
Q  121 tatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaag-ttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||| || ||||||| ||| |||| |  ||||||  |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34544119 tatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggtaagagtgtgg 34544216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 50788139 - 50788086
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacact 161  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  50788139 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacact 50788086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15841183 - 15841034
Alignment:
Q  67 atgatgaattgatggactcgcacttaa-gagg-gagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacacttta 164  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | |||| ||  ||| ||| ||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| |  ||| || ||| ||||    
T  15841183 atgatgaattgatggagtcacacttgacgaggagatcgttgtgtacaaatgtgaattatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacatttta 15841084  T
Q  165 taagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgt 215  Q
    ||||| |||| | | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15841083 taagtgagaggatctataaacccattg-ctttaagttttgggtaagagtgt 15841034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 175
Target Start/End: Original strand, 44620946 - 44621012
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtccca-catcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagaga 175  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44620946 caagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagaga 44621012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 217
Target Start/End: Original strand, 11197294 - 11197335
Alignment:
Q  176 acccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11197294 acccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtgg 11197335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11706628 - 11706587
Alignment:
Q  180 ataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11706628 ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtc 11706587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11706684 - 11706640
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaa 145  Q
    |||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11706684 tgttgtgtgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaa 11706640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 221
Target Start/End: Original strand, 18879855 - 18879919
Alignment:
Q  157 acactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18879855 acaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtc 18879919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 22304498 - 22304678
Alignment:
Q  38 aagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcg 136  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22304498 aagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagctatatgtcccacatcg 22304597  T
Q  137 gataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22304598 gataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 22304678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21832581 - 21832395
Alignment:
Q  27 acgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatg 126  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21832581 acgatacaagcaagtatgagcttccatttgatgg-ggagcatgatgaatagatggactcacacttgaggcggagtgttatgtgcaagtgtgagttatatg 21832483  T
Q  127 tcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtg 214  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21832482 tcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagccttaaggttttgggtaagagtg 21832395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29644741 - 29644626
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29644741 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgg 29644642  T
Q  206 gtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  29644641 gtaagagtgtggcgtc 29644626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43346956 - 43346840
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  43346956 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggt 43346857  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  43346856 tttgggtaagagtgtgg 43346840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42342296 - 42342135
Alignment:
Q  63 gagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggaca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||  |      
T  42342296 gagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatg 42342197  T
Q  160 ctttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    | ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42342196 ccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtc 42342135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37990843 - 37990688
Alignment:
Q  65 gcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacact 161  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| |   || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| ||||     
T  37990843 gcatgatgaattgatggactcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacacc 37990744  T
Q  162 ttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37990743 ttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 37990688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29645067 - 29644947
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  29645067 tgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggt 29644968  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29644967 tttgggtaagagtgtggcgtc 29644947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12114727 - 12114611
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  12114727 tgttgtgtgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggt 12114628  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  12114627 tttgggtaagagtgtgg 12114611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33803417 - 33803297
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||    
T  33803417 tgttgtgtgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggt 33803318  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  33803317 attgggtaagagtgtggcgtc 33803297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 35946515 - 35946631
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||    
T  35946515 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggt 35946614  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||| |||||||    
T  35946615 tttgggtaaaagtgtgg 35946631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 52634669 - 52634788
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  52634669 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggt 52634767  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  52634768 tttgggtaagagtgtgacgtc 52634788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 216
Target Start/End: Original strand, 15773143 - 15773300
Alignment:
Q  62 ggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggac 158  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||||| || ||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| ||    
T  15773143 ggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaac 15773242  T
Q  159 actttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    |  ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773243 atcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 15773300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41359983 - 41359810
Alignment:
Q  46 gcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaa 142  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||| |   |||||||||||| ||||    ||||||||||||| |    
T  41359983 gcttccacttgaagggagagcatgatgaatagatg-actcacacttaagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttat----cccacatcggataca 41359889  T
Q  143 aaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    | | ||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41359888 atagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggcgtc 41359810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32462791 - 32462607
Alignment:
Q  37 caagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggag---tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccaca 133  Q
    |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||   |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  32462791 caagtaagagctttcgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca 32462692  T
Q  134 tcggat-aaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||| || ||| | | |||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  32462691 tcgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccataaacctattgctttaaggttttggataagagtgtgg 32462607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 54018056 - 54017865
Alignment:
Q  29 gatacaggcaagtaa-gtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagt---gttatgtgcaagtgtgatttata 124  Q
    |||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||| |||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||   ||| ||||||||||||| |||||    
T  54018056 gatacaagcaagtaaagagcttccgcttgaggg-ggaacatgatgaaaagatggactcacacttgagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttata 54017958  T
Q  125 tgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  54017957 tgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacctaacgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54017865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1634475 - 1634366
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggata-aaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttg 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1634475 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttg 1634376  T
Q  205 ggtaagagtg 214  Q
    ||||||||||    
T  1634375 ggtaagagtg 1634366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 8327897 - 8328013
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||    
T  8327897 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggt 8327996  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  8327997 tttgggtaagagtgtgg 8328013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42342553 - 42342433
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||    
T  42342553 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggt 42342454  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  42342453 tttgggtaagagtgtgacgtc 42342433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 217
Target Start/End: Original strand, 15772852 - 15772963
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  15772852 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgg 15772951  T
Q  206 gtaagagtgtgg 217  Q
     |||||||||||    
T  15772952 ataagagtgtgg 15772963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 214
Target Start/End: Original strand, 32589697 - 32589809
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  32589697 tgttgtgtgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 32589795  T
Q  201 tttgggtaagagtg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  32589796 tttgggtaagagtg 32589809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 39389070 - 39389179
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  39389070 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 39389169  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  39389170 aagagtgtgg 39389179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 45901706 - 45901823
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaa-aattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaag 199  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||    
T  45901706 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaag 45901805  T
Q  200 ttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||| |||||||||||||    
T  45901806 tttttggtaagagtgtgg 45901823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25739590 - 25739470
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||   |||||||||||| |||||||||| |||||| || | ||    
T  25739590 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggt 25739491  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  25739490 tttgggtaagagtgtgacgtc 25739470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37991142 - 37991026
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||    
T  37991142 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggt 37991043  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  37991042 tttgggtaagagtgtgg 37991026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39935101 - 39935005
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39935101 ttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaagttttgagtaagagtgtg 39935005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 54018363 - 54018247
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||| ||    
T  54018363 tgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggt 54018264  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  54018263 tttgggtaagagtgtgg 54018247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33175829 - 33175711
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaaccc---ataaacacattgccttaa 197  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||    
T  33175829 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaa 33175730  T
Q  198 agttttgggtaagagtgtg 216  Q
     ||||||||||||||||||    
T  33175729 ggttttgggtaagagtgtg 33175711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45395818 - 45395702
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||    
T  45395818 tgttgtgtgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgt 45395719  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  45395718 tttgggtaagagtgtgg 45395702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 49336852 - 49336736
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||    
T  49336852 tgttgtgtacaagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagt 49336753  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    | |||||||||||||||    
T  49336752 tctgggtaagagtgtgg 49336736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47964686 - 47964563
Alignment:
Q  98 gagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaa 197  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||  |  |||||| || || ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||    
T  47964686 gagtgttgtgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaacctattgccttaa 47964587  T
Q  198 agttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  47964586 ggttttgggtaagagtgtggcgtc 47964563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3135224 - 3135122
Alignment:
Q  115 gtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtg 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||    
T  3135224 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtg 3135125  T
Q  215 tgg 217  Q
    |||    
T  3135124 tgg 3135122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Original strand, 4823622 - 4823764
Alignment:
Q  76 tgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagag 174  Q
    |||||||||| ||||| |  |||||||||  | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| | |||| |||  |||| ||||||||| |||    
T  4823622 tgatggactcacacttgaaggggagtgttggtttgcaagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggag 4823721  T
Q  175 aacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
     |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4823722 gacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtgg 4823764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3384426 - 3384317
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| | || |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  3384426 tgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgccttaaagttttgg 3384327  T
Q  206 gtaagagtgt 215  Q
    ||||||||||    
T  3384326 gtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 197
Target Start/End: Original strand, 9240077 - 9240238
Alignment:
Q  36 gcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatc 135  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||  |||||| | |||| ||||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9240077 gcaagtaagagtttccgcttgaggggagagcataacgaatggatggactcacacttgaggaggagtgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatc 9240176  T
Q  136 ggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaa 197  Q
    ||||| | || |||| | || |||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  9240177 ggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattaccttaa 9240238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39336389 - 39336280
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| |||| |||||||    
T  39336389 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttgg 39336290  T
Q  206 gtaagagtgt 215  Q
     ||| |||||    
T  39336289 ataatagtgt 39336280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 53577357 - 53577473
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||  ||| || |||| | | ||||||||| |||||||||| ||    
T  53577357 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggt 53577456  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  53577457 cttgggtaagagtgtgg 53577473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7767474 - 7767383
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaa 197  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| |||||    
T  7767474 tgtgtaagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaa 7767383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32463066 - 32462949
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaa-ggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaag 199  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||| ||||| | || ||||||||||||  || ||||||| ||||||||||| |    
T  32463066 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaagg 32462967  T
Q  200 ttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  32462966 ttttgagtaagagtgtgg 32462949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 25755387 - 25755507
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||  ||||| | ||||||    
T  25755387 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagt 25755486  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    | ||||||| |||||||||||    
T  25755487 tgtgggtaaaagtgtggcgtc 25755507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 39914245 - 39914361
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | || |||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||  |    
T  39914245 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatat 39914344  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||| |||||||||||    
T  39914345 tttggataagagtgtgg 39914361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 31190010 - 31190118
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||        ||||||| ||    
T  31190010 tgttgtgtgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggt 31190101  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  31190102 tttgggtaagagtgtgg 31190118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46546490 - 46546375
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||  |||  |  |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  46546490 tgttgtgtgtaagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggt 46546391  T
Q  201 tttgggtaagagtgtg 216  Q
    |||| |||||||||||    
T  46546390 tttgtgtaagagtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 160
Target Start/End: Original strand, 22304208 - 22304298
Alignment:
Q  71 tgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacac 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  22304208 tgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 22304298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33809213 - 33809069
Alignment:
Q  63 gagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggag--tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||   |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||  |  ||| ||||    
T  33809213 gagcatgatgaattgatggactcacacttcagagagaaattgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaattgcatattgaacac 33809114  T
Q  161 tttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||| ||||||| |||  |||||| | ||| ||||| |||||||    
T  33809113 tttatgagtaagaaaactaataaactcgttgtcttaaggttttgg 33809069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50612610 - 50612497
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccata-----aacacattgccttaaagttt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||     |||| |||  ||||| ||||    
T  50612610 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatcttaaggttt 50612511  T
Q  203 tgggtaagagtgtg 216  Q
    ||||||||||||||    
T  50612510 tgggtaagagtgtg 50612497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22304113 - 22304004
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||        ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||    
T  22304113 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggtc-------ttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaggt 22304021  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||| |||||||||||    
T  22304020 tttggataagagtgtgg 22304004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53118131 - 53118026
Alignment:
Q  109 gcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggta 208  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||| |  || |||| |||||||||||  |||||||||    
T  53118131 gcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggta 53118033  T
Q  209 agagtgt 215  Q
    |||||||    
T  53118032 agagtgt 53118026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 192
Target Start/End: Original strand, 51886561 - 51886645
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgc 192  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||   |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51886561 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc 51886645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303708
Alignment:
Q  166 aagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 22303708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42584968 - 42584871
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||  ||||| | ||||||||||    
T  42584968 ttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33362425 - 33362349
Alignment:
Q  134 tcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||  |||||||||||    
T  33362425 tcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaag 33362349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47965080 - 47964960
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||| |  |||||  ||| | ||||||| ||||  | ||||| | |||||||||||  |    
T  47965080 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagat 47964981  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  47964980 tttgggtaagagtgtggcgtc 47964960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12747956 - 12747873
Alignment:
Q  63 gagcatgatgaattgatggactcgcacttaagaggg-agtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaa 145  Q
    |||||||||||||| | |||||| | ||| |||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12747956 gagcatgatgaatttacggactcacgcttgagaggatattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaa 12747873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 160
Target Start/End: Original strand, 43346643 - 43346702
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacac 160  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  43346643 tgttgtgtgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 43346702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Original strand, 52634994 - 52635049
Alignment:
Q  162 ttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  52634994 ttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtgg 52635049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731953
Alignment:
Q  163 tataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtgg 17731953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033184
Alignment:
Q  163 tataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtgg 19033184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 174
Target Start/End: Original strand, 37726504 - 37726570
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagag 174  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| | || |||||||||||||    
T  37726504 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagag 37726570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017587
Alignment:
Q  178 ccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtccctatt 227  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctatt 54017587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Original strand, 11661537 - 11661601
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagag 174  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||  |||||||||||||    
T  11661537 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagag 11661601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 215
Target Start/End: Original strand, 16143506 - 16143545
Alignment:
Q  176 acccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgt 215  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16143506 acccataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgt 16143545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 217
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991512
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||  ||||| || | || |||  ||| ||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  210 gagtgtgg 217  Q
     |||||||    
T  25991505 aagtgtgg 25991512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16871051 - 16871010
Alignment:
Q  174 gaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgt 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16871051 gaacccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgt 16871010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 2299930 - 2300013
Alignment:
Q  64 agcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggag--tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaa 145  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||   |||| ||||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||||    
T  2299930 agcatgataaattgatggactcacacttgagggggatattgttgtgtgcaagtgtgggttatatgtcccacgtcagatagaaaa 2300013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17735083 - 17735043
Alignment:
Q  174 gaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtg 214  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17735083 gaacccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtg 17735043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19036352 - 19036312
Alignment:
Q  174 gaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtg 214  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19036352 gaacccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtg 19036312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986037
Alignment:
Q  113 gtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaac 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||   ||||||||||| |||||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagagaac 36986037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011476
Alignment:
Q  113 gtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaac 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||   ||||||||||| |||||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagagaac 37011476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28531551 - 28531363
Alignment:
Q  27 acgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatg 126  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28531551 acgatacaagcaagtaatagcttccacttgaagg--gagcatgatgaactgatggactcacacttgagggggagtgttgtgtgcaagtgtgagttatatg 28531454  T
Q  127 tcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28531453 tcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagaggtcccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtgg 28531363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40679857 - 40679674
Alignment:
Q  37 caagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcg 136  Q
    |||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  40679857 caagcaagagcttccgcttgaggg-ggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcg 40679759  T
Q  137 gataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40679758 gatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtc 40679674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5542865 - 5542674
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaa-gtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||  | ||||||||||| ||||||    
T  5542865 cgatacaggcaaagttagagcttccgcttgaaggggaagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatat 5542766  T
Q  126 gtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||| |||| |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5542765 gtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggtttttggtaagagtgtgg 5542674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 183
Target Start/End: Original strand, 7598527 - 7598684
Alignment:
Q  27 acgatacaggcaagtaa-gtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttata 124  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  7598527 acgatacaagcaagtaaagagcttccgcttgaaggggg-gcatgatgaatagatggactcacacttgagagggagtgttggtgtgcaagtgtgagttata 7598625  T
Q  125 tgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataa 183  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7598626 tgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 7598684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14745825 - 14745712
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14745825 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 14745726  T
Q  208 aagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||||||    
T  14745725 aagagtgtggcgtc 14745712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 221
Target Start/End: Original strand, 30323417 - 30323577
Alignment:
Q  63 gagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggag--tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||||  |||||| ||||    
T  30323417 gagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagattgttgtgtgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagatagaaaattggaggttgaacac 30323516  T
Q  161 tttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30323517 tttagaagtgagaggacctataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtc 30323577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36178763 - 36178654
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36178763 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 36178664  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  36178663 aagagtgtgg 36178654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 217
Target Start/End: Original strand, 37106156 - 37106297
Alignment:
Q  77 gatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagaga 175  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||     
T  37106156 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 37106255  T
Q  176 acccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  37106256 acccataaacccatttccttaaggttttgggtaagagtgtgg 37106297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 15880256 - 15880376
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  15880256 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 15880355  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15880356 tttgggtaagagtgtggcgtc 15880376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Original strand, 6422055 - 6422219
Alignment:
Q  47 cttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaat 146  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| || ||||||| ||||||      |||||||||| |||||||||     
T  6422055 cttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtcttgtgtgcaaatgtgat------gtcccacatcagataaaaaag 6422148  T
Q  147 taaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6422149 taaaggttgaacacattataattaagaggacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtgg 6422219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41283633 - 41283520
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  41283633 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttaggt 41283534  T
Q  208 aagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||||||    
T  41283533 aagagtgtggcgtc 41283520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14745522 - 14745339
Alignment:
Q  38 aagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcg 136  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||| || |||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14745522 aagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatgtactcaaacttgag-gggagtgttggtttgcaactgtgagttatatgtcccacatcg 14745424  T
Q  137 gataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
     |||||| | ||| ||||| |||  || |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14745423 aataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtc 14745339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28254402 - 28254286
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  28254402 tgttgtgtgccagtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 28254303  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  28254302 tttgggtaagagtgtgg 28254286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 40733813 - 40733991
Alignment:
Q  41 taagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta---tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcgg 137  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  40733813 taagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcga 40733912  T
Q  138 ataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaac-acattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||| | ||||| ||  |||| |||||||||||||  | ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40733913 ataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagagggctcataacctaca--gccttaaagttttgggtaagagtgtgg 40733991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962706
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 962697  T
Q  208 aagagtgtg 216  Q
    |||||||||    
T  962698 aagagtgtg 962706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 217
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421494
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  210 gagtgtgg 217  Q
    ||||||||    
T  6421487 gagtgtgg 6421494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33561648 - 33561501
Alignment:
Q  69 gatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataag 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||| |  |||||  ||||||||||||    
T  33561648 gatgaattgatggacacgcacttgatggggaatgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataag 33561549  T
Q  169 taagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    | |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33561548 tgagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 33561501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38796785 - 38796656
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||    
T  38796785 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggt 38796686  T
Q  201 tttgggtaagag--tgtggcgtccctattg 228  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  38796685 tttgggtaagagtatgtggcgtctctattg 38796656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 37105924 - 37106033
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  37105924 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagattttgggt 37106023  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  37106024 aagagtgtgg 37106033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Original strand, 40733475 - 40733626
Alignment:
Q  69 gatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttat 165  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  40733475 gatgaattgatagactcacacttgaggggaagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttat 40733574  T
Q  166 aagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||| ||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  40733575 aagtaagaggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaagagtgtgg 40733626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514762
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggt 42514748  T
Q  208 aagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||||||    
T  42514749 aagagtgtggcgtc 42514762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5543156 - 5543036
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||  ||||||||    
T  5543156 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaagattttgggt 5543057  T
Q  208 aagagtgtggcgtccctattg 228  Q
    |||||||||| ||| ||||||    
T  5543056 aagagtgtggtgtctctattg 5543036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37632762 - 37632646
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | |||| ||    
T  37632762 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggt 37632663  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  37632662 tttgggtaagagtgtgg 37632646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 38796461 - 38796299
Alignment:
Q  27 acgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaatt-gatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgattta 122  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||| ||||| || ||||||||| |   |||||||||||| |||    
T  38796461 acgatacaagcaagtaagatcttccgcttgaagggggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagtta 38796362  T
Q  123 tatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaac 185  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  38796361 tatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacctataaac 38796299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35580883 - 35580769
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35580883 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagagga-ccataaacccattgccttaaggttttgg 35580785  T
Q  206 gtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||| ||||||    
T  35580784 gtaagagtgcggcgtc 35580769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36785804 - 36785664
Alignment:
Q  27 acgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttat 123  Q
    ||||||||  |||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |   |||||||||||| ||||    
T  36785804 acgatacaaccaagtaagagcttccgcttgaggg-ggagcatgatgaattgatggactcacactttagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttat 36785706  T
Q  124 atgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttat 165  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||    
T  36785705 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36006044 - 36005925
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  36006044 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaagtaaaag-ttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 36005946  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  36005945 tttgggtaaaagtgtggcgtc 36005925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178220
Alignment:
Q  126 gtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtgg 36178220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 30313114 - 30313290
Alignment:
Q  46 gcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggag--tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaa 143  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  30313114 gcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgttggactcacacttgaggggaagattgttgtgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaa 30313213  T
Q  144 aattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    || |  |||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30313214 aagtggaggttgaacactt-ataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtc 30313290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  124 atgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagt 213  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 5367448 - 5367568
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| ||||||||||||  | |||| |||||||  |||||| ||    
T  5367448 tgttgtgtacaagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggt 5367547  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5367548 tttgggtaagagtgtggcgtc 5367568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33953941 - 33953813
Alignment:
Q  96 gggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgcctt 195  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |  |||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||   |||||||    
T  33953941 gggagtgttgtgtgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctgttgcctt 33953842  T
Q  196 aaagttttgggtaagagtgtggcgtccct 224  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  33953841 aaaattttgggtaagagtgtgacgtccct 33953813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36178460 - 36178320
Alignment:
Q  76 tgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagag 174  Q
    |||||||||| ||||| || |||| ||||  | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||| ||||||||||| |    
T  36178460 tgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggg 36178361  T
Q  175 aacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgt 215  Q
     || ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36178360 gactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37895226 - 37895110
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | || ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  37895226 tgttgtgtgcgagtttgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggt 37895127  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  37895126 tttgggtaagagtgtgg 37895110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15511646 - 15511544
Alignment:
Q  115 gtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtg 214  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||    
T  15511646 gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtg 15511547  T
Q  215 tgg 217  Q
    |||    
T  15511546 tgg 15511544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 215
Target Start/End: Original strand, 16542442 - 16542556
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||| ||  |||||| |||||||||||  |    
T  16542442 tgttgtgtgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagat 16542541  T
Q  201 tttgggtaagagtgt 215  Q
    |||| ||||||||||    
T  16542542 tttgagtaagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31468911 - 31468800
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |  |||    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  31468911 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaactcattgccttaaggt 31468816  T
Q  201 tttgggtaagagtgtg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  31468815 tttgggtaagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 216
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713085
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaag-ttttgggta 208  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggta 6713077  T
Q  209 agagtgtg 216  Q
    ||||||||    
T  6713078 agagtgtg 6713085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29874179 - 29874068
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| |  |||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  29874179 caagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 29874080  T
Q  210 gagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||||    
T  29874079 gagtgtggcgtc 29874068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 31899591 - 31899496
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgcctta 196  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31899591 tgttgtgtgaaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41678572 - 41678419
Alignment:
Q  63 gagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtga--tttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacac 160  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||| |||| ||||    |||||  ||||    
T  41678572 gagcattatgaattgatggactcacacttgaaggggagtgttgtgtgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacac 41678473  T
Q  161 tttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgt 215  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41678472 tttataagtgagaggacccataaac-ctttgccttaaggttttgagtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 211
Target Start/End: Original strand, 7598226 - 7598331
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  7598226 tgtgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgg 7598325  T
Q  206 gtaaga 211  Q
    ||||||    
T  7598326 gtaaga 7598331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Original strand, 42514933 - 42515078
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgattta----t 123  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||| || || || ||||||||| |||||| |||||| |||    |    
T  42514933 cgatacaagcaagtaagagcttccgcttgagag-ggagcatgatgaatagatggactcacatttgagggggagtgttgtgtgcaggtgtgagttatatgt 42515031  T
Q  124 atgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagta 170  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  42515032 atgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 213
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731753
Alignment:
Q  113 gtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagag 212  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  213 t 213  Q
    |    
T  33731753 t 33731753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 217
Target Start/End: Original strand, 1769890 - 1770001
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||| || || ||| ||||     
T  1769890 tgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaagctttga 1769989  T
Q  206 gtaagagtgtgg 217  Q
     |||||||||||    
T  1769990 ataagagtgtgg 1770001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29873732 - 29873582
Alignment:
Q  73 aattgatggactcgcacttaagagggag--tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagta 170  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||| |||  ||| |||||||||||| |||| |||| |  |||||| ||| |||||||||     
T  29873732 aattgatggactcacacttgagggggagattgttgtgtgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtg 29873633  T
Q  171 agagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
     ||| || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  29873632 ggaggactcataaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtgacgtc 29873582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37894892 - 37894741
Alignment:
Q  66 catgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttat 165  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||||| |  | || ||||    
T  37894892 catgatgaatagatggactcatacttaagggggagtattgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttat 37894793  T
Q  166 aagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||  || ||||||  |||||||||||  |||||| ||| |||||||    
T  37894792 aagtaagaagactcataaatccattgccttaagattttggttaaaagtgtgg 37894741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 143
Target Start/End: Original strand, 3673020 - 3673120
Alignment:
Q  46 gcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggag---tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaa 142  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3673020 gcttccgcttgaagagggagcatgatgaattgatggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaa 3673119  T
Q  143 a 143  Q
    |    
T  3673120 a 3673120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529091
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagtttt 203  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| | ||||| ||| ||||  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagtttt 12529091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 203
Target Start/End: Original strand, 16590881 - 16590978
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaat-taaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaag 199  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||      ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16590881 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaagg 16590974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 29676547 - 29676622
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgcctt 195  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29676547 ttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcctt 29676622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40163519 - 40163421
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattg-ccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||  | || | |||| ||||||||||| |||||||    
T  40163519 ttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 29676896 - 29677017
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagag-----aacccataaacacattgcctt 195  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||| || ||||      |||||||||| |||||||||    
T  29676896 tgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgcctt 29676995  T
Q  196 aaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    || | |||  ||||||||||||    
T  29676996 aaggctttaagtaagagtgtgg 29677017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31259750 - 31259665
Alignment:
Q  132 catcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  31259750 catcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggtaagagtgtgg 31259665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Original strand, 23346226 - 23346344
Alignment:
Q  99 agtgttatgtgcaagtgtgatttatat--gtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgcctta 196  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||| ||| |||| ||||||||  |||| |||||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  23346226 agtgttgtgtgcgagtgtgagttatatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagcctta 23346324  T
Q  197 aagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  23346325 aggttttcggtaagagtgtg 23346344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 215
Target Start/End: Original strand, 9231242 - 9231356
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||||||| || ||| |||| |||| ||||||||| |||  |||||| |||||| | |||| ||| ||  ||||||||||    
T  9231242 tgttgtgtgtaagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagt 9231341  T
Q  201 tttgggtaagagtgt 215  Q
    ||||| |||||||||    
T  9231342 tttggttaagagtgt 9231356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 217
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421840
Alignment:
Q  170 aagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 6421840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 35580618 - 35580563
Alignment:
Q  36 gcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcactt 91  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35580618 gcaagtaaaagcttccccttgaaggaggagcatgatgaatagatggactcacactt 35580563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 155
Target Start/End: Original strand, 6421297 - 6421351
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttg 155  Q
    |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6421297 tgttgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttg 6421351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33954426 - 33954382
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaa 145  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  33954426 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaa 33954382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35580530 - 35580494
Alignment:
Q  176 acccataaacacattgccttaaagttttgggtaagag 212  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35580530 acccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 35580494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 221
Target Start/End: Original strand, 40518501 - 40518695
Alignment:
Q  27 acgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatg 126  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| || ||| ||||||||| |||||||    
T  40518501 acgatacaagcaagtaagagcttccacttgaggggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtattgtgttcaagtgtgagttatatg 40518600  T
Q  127 tcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40518601 tcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtc 40518695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1014100 - 1013921
Alignment:
Q  38 aagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcg 136  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1014100 aagtaagagcttccgcttgaagggggagtatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgttccacatcg 1014001  T
Q  137 gataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    ||||||| | |||| |||| ||||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1014000 gataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttagagttttgagtaagagtgtg 1013921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 3669989 - 3670169
Alignment:
Q  38 aagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcg 136  Q
    ||||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3669989 aagtaagagcttctgcttgaagggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 3670088  T
Q  137 gataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||| | ||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3670089 gataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgg 3670169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Original strand, 34835165 - 34835318
Alignment:
Q  65 gcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta---tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacact 161  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||    ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||     
T  34835165 gcatgatgaattgatggactc--acttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacacc 34835262  T
Q  162 ttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835263 ttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 34835318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 101 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3038455 - 3038338
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||    
T  3038455 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggt 3038356  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggc 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3038355 tttgggtaagagtgtggc 3038338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147564
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  211 agtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||    
T  147554 agtgtggcgtc 147564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8919004 - 8918809
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttata 124  Q
    ||||||| |||||| || |||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| |   |||||||||||| ||| |    
T  8919004 cgatacaagcaagttagagcttccgcttaaaggggga-catgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttaca 8918906  T
Q  125 tgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||| ||||  | | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8918905 tgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacctattgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtc 8918809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Original strand, 45122559 - 45122737
Alignment:
Q  37 caagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcg 136  Q
    |||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| || | |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||      ||||| ||| |||||    
T  45122559 caagtaagagcttccgctggaagggggagcatgatgaatagaagaactcacacttgagggggagtgttgtgtgcaagtg------atatggcccgcatcg 45122652  T
Q  137 gataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45122653 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtc 45122737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45122071 - 45121955
Alignment:
Q  105 atgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttg 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||    
T  45122071 atgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttg 45121972  T
Q  205 ggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||| |||||||||||    
T  45121971 ggtaacagtgtggcgtc 45121955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Original strand, 34835427 - 34835584
Alignment:
Q  64 agcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta---tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcg-gataaaaaattaaaggttggaca 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    ||| |||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||  |||    
T  34835427 agcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaaca 34835526  T
Q  160 ctttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835527 ccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 34835584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Original strand, 34835693 - 34835850
Alignment:
Q  64 agcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta---tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcg-gataaaaaattaaaggttggaca 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    ||| |||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||  |||    
T  34835693 agcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaaca 34835792  T
Q  160 ctttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835793 ccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 34835850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45122217 - 45122106
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  45122217 tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgg 45122118  T
Q  206 gtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||    
T  45122117 gtaagagtgtgg 45122106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 3669687 - 3669796
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3669687 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggt 3669786  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  3669787 aagagtgtgg 3669796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 212
Target Start/End: Original strand, 45122922 - 45123108
Alignment:
Q  27 acgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta---tgtgcaagtgtgatttat 123  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||| || |||||||||    ||||||||||||| ||||    
T  45122922 acgatacaagcaagtaagagcttccgcttgaagggggaacatgatgaatagatggacttacacttgagggggagtgttgctgtgtgcaagtgtgagttat 45123021  T
Q  124 atgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagag 212  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| |  |||||||||  ||||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||    
T  45123022 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaagatgacccataaacctattttcttaaggttttgggtaagag 45123108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 30359539 - 30359718
Alignment:
Q  41 taagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcgg 137  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||| |||| |   || ||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  30359539 taagagcttccgcttgaagggggagcatgataaattgatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcag 30359638  T
Q  138 ataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  30359639 ataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaagagtgtgg 30359718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 41972151 - 41972274
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||    
T  41972151 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagt 41972250  T
Q  201 t---ttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |   ||||||||||||||||||||    
T  41972251 tttgttgggtaagagtgtggcgtc 41972274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 9309348 - 9309464
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  9309348 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggt 9309447  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
     | ||||||||||||||    
T  9309448 gtcgggtaagagtgtgg 9309464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 9608738 - 9608858
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| |||  |||||| ||    
T  9608738 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggt 9608837  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  9608838 tttgggtatgagtgtggcgtc 9608858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4154832 - 4154711
Alignment:
Q  100 gtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaag 199  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |  |||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||  || |    
T  4154832 gtgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaagg 4154733  T
Q  200 ttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4154732 ttttgggtaagagtgtggcgtc 4154711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 30359264 - 30359380
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||    
T  30359264 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggt 30359363  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  30359364 tttgggtaagagtgtgg 30359380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 34834869 - 34834985
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||  || ||||||| ||||||||||| ||    
T  34834869 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggt 34834968  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  34834969 tttgggtaagagtgtgg 34834985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561865
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagtttt-gggta 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  209 agagtgtg 216  Q
    ||||||||    
T  25561872 agagtgtg 25561865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1014403 - 1014294
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||    
T  1014403 tgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaagttttgggt 1014304  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  1014303 aagagtgtgg 1014294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6877028 - 6876911
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatat-gtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaag 199  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||| || ||||| ||||  |    
T  6877028 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttaggg 6876929  T
Q  200 ttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6876928 ttttgggtaagagtgtgg 6876911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 217
Target Start/End: Original strand, 6731857 - 6732004
Alignment:
Q  62 ggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgt-gcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacac 160  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || || || ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||         
T  6731857 ggagcatgatgaatagatggactcacatttgagggggagtgttgttttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg----- 6731951  T
Q  161 tttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
         |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6731952 ----aaagtaagagaacccataaattcattgccttaaggttttgagtaagagtgtgg 6732004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18372477 - 18372349
Alignment:
Q  46 gcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat-gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaa 144  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  18372477 gcttccccttgaagggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaat 18372378  T
Q  145 attaaaggttggacactttataagtaaga 173  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18372377 agtaaaggttgaacaccttataagtaaga 18372349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 30441081 - 30441194
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacac----tttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagtttt 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||     |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30441081 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgccttaaggtttt 30441180  T
Q  204 gggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||||    
T  30441181 gggtaagagtgtgg 30441194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33113532 - 33113416
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |    
T  33113532 tgttgtgtacaagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagat 33113433  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  33113432 tttgggtaagagtgtgg 33113416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 40518062 - 40518184
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaat--taaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaa 198  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||| || ||||||||     
T  40518062 tgttgtgttcaagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaag 40518161  T
Q  199 gttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40518162 gttttgggtaagagtgtggcgtc 40518184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70319
Alignment:
Q  115 gtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtg 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  215 tggcgtc 221  Q
    || ||||    
T  70325 tgacgtc 70319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18373153 - 18372988
Alignment:
Q  46 gcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat-gtgca-agtgtgatttatatgtcccacatcggataaaa 143  Q
    |||||| ||||| || |||||| ||| || |||||||||| ||||| ||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18373153 gcttccccttgatgggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagatggagtgttgttgtgtacagtgtgatttatatgtcccacttcggataaaa 18373054  T
Q  144 aattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagag 212  Q
     | ||||||||| |||| |||||| |||||| || ||||||| |||||||   | ||||||||||||||    
T  18373053 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Original strand, 147756 - 147929
Alignment:
Q  37 caagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccaca 133  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  147756 caagtaagagcttccgcttaaagggggagc-tgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccaca 147854  T
Q  134 tcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    || ||||||||| |||| |||| |||   |||         |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  147855 tctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatat---------aacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 147929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Original strand, 5420651 - 5420764
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  5420651 tgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgt 5420750  T
Q  208 aagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||| ||||    
T  5420751 aagagtgtgacgtc 5420764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483236
Alignment:
Q  133 atcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgg 9483236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1514071 - 1513964
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  1514071 caagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaa 1513972  T
Q  210 gagtgtgg 217  Q
     |||||||    
T  1513971 aagtgtgg 1513964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544539
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||  |||| | |||| |||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  210 gagtgtgg 217  Q
    ||||||||    
T  37544546 gagtgtgg 37544539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40579662 - 40579544
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||||||| ||||||||  || || |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||||| |||||    
T  40579662 caagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggttttaggtaa 40579563  T
Q  210 gagtgtggcgtccctattg 228  Q
    |||||||| ||| ||||||    
T  40579562 gagtgtggtgtctctattg 40579544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18372140 - 18372043
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||| |||||||  |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18372140 ttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4154473 - 4154331
Alignment:
Q  75 ttgatggactcgcacttaagagggag--tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaag 172  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||   |||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| |||| |  |||||| ||||||||||||| ||    
T  4154473 ttgatggactcacacttgagggggaaattgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgag 4154374  T
Q  173 agaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  4154373 ag-acccataaactcattgccttaatattttgggtaagtgtgtg 4154331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 213
Target Start/End: Original strand, 9308969 - 9309084
Alignment:
Q  100 gtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcc--cacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaa 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| | |||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  9308969 gtgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaa 9309068  T
Q  198 agttttgggtaagagt 213  Q
     |||||||| ||||||    
T  9309069 ggttttgggcaagagt 9309084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 5915865 - 5915976
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||| |||  ||||||||    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  5915865 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaaggt 5915959  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  5915960 tttgggtaagagtgtgg 5915976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45121862 - 45121706
Alignment:
Q  62 ggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggac 158  Q
    |||||| ||| || |||||||||| |||||||| ||||||||| |   || ||||||||| || | ||||||||||||||||||| | |||||||||  |    
T  45121862 ggagcacgataaagtgatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttgt-tgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgatc 45121764  T
Q  159 actttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  45121763 accttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaagagtgtg 45121706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9482755 - 9482653
Alignment:
Q  115 gtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtg 214  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||  ||||||||    
T  9482755 gtgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaagattttgtataagagtg 9482656  T
Q  215 tgg 217  Q
    |||    
T  9482655 tgg 9482653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||   | |||||||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaacac-ttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  210 gagtgtg 216  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18372908 - 18372785
Alignment:
Q  57 aaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat-gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttg 155  Q
    |||| |||||| ||| || |||||||||| ||||| || | ||||||| | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  18372908 aagggggagcacgataaagtgatggactcacacttgag-gagagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttg 18372810  T
Q  156 gacactttataagtaagagaaccca 180  Q
     |||| ||||||||||||| |||||    
T  18372809 aacaccttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20870718 - 20870622
Alignment:
Q  121 tatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  20870718 tatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagattttggataagagtgtgg 20870622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274822
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||||||| | ||||||||| | |  ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  211 agtgtggcgtccc 223  Q
    ||||||| |||||    
T  43274834 agtgtggtgtccc 43274822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 226
Target Start/End: Original strand, 9507821 - 9507900
Alignment:
Q  147 taaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtccctat 226  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9507821 taaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctat 9507900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18372592 - 18372485
Alignment:
Q  46 gcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat-gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaa 144  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||| || |||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18372592 gcttccccttgaaggggaagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 18372493  T
Q  145 attaaagg 152  Q
    | ||||||    
T  18372492 agtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 221
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609198
Alignment:
Q  131 acatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtc 9609198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640577
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||     || ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  211 agtgtggcgtc 221  Q
    ||||| |||||    
T  32640587 agtgttgcgtc 32640577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41416322 - 41416252
Alignment:
Q  115 gtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaac 185  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  41416322 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaac 41416252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380066
Alignment:
Q  112 agtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaaga 211  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |  || |||||| || | |||||| |||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  212 gtgtgg 217  Q
    ||||||    
T  18380071 gtgtgg 18380066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25561790 - 25561729
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccat 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  25561790 ttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398114
Alignment:
Q  112 agtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaa---cccataaacacattgccttaaagttttgggta 208  Q
    ||||||| |||||| || || |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |||||| |   ||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  209 agagtgtggcgt 220  Q
    ||| ||||||||    
T  43398125 agaatgtggcgt 43398114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9620841 - 9620745
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaa 197  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||| || | ||||  |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  9620841 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaa 9620745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18371877 - 18371710
Alignment:
Q  46 gcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat-gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaa 144  Q
    |||||| |||||||| || ||| ||| || |||||||||| ||||| || ||||||| | | ||| |   |||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  18371877 gcttccgcttgaagggggggcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgctgttgtgtagaagtgagttatatgtcacacatcggataaaat 18371778  T
Q  145 attaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    | ||||||||| |||     |||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18371777 agtaaaggttgaaca----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 18371710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 221
Target Start/End: Original strand, 32305503 - 32305590
Alignment:
Q  134 tcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  32305503 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagattttggataagagtgtggcgtc 32305590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 214
Target Start/End: Original strand, 8794104 - 8794217
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||  ||||||||||||| || |||||||  | |  ||||| ||    
T  8794104 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggt 8794203  T
Q  201 tttgggtaagagtg 214  Q
    ||||||| ||||||    
T  8794204 tttgggtgagagtg 8794217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 217
Target Start/End: Original strand, 6651555 - 6651603
Alignment:
Q  169 taagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6651555 taagagaacccataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 6651603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3037853 - 3037777
Alignment:
Q  121 tatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaa 197  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||    
T  3037853 tatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaa 3037777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20995566 - 20995502
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttat 165  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  20995566 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 216
Target Start/End: Original strand, 5274773 - 5274883
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||| | ||||||||  | |||||| ||||||||||| |  ||  |||||||||  |||||||||||  |||||     
T  5274773 tgtgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttga 5274872  T
Q  206 gtaagagtgtg 216  Q
    |||||||||||    
T  5274873 gtaagagtgtg 5274883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 187
Target Start/End: Original strand, 33831971 - 33832057
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacac 187  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | | | | |||| || | |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33831971 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaacac 33832057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 221
Target Start/End: Original strand, 2467507 - 2467613
Alignment:
Q  113 gtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagag 212  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||| ||||| |||  || ||||| | ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||    
T  2467507 gtgtgagttatatgtctcacgtcggatagaaaattagaagttgaacactatat--gtgagagagcacataaactcgttgtcttaaagtttttggtaaaag 2467604  T
Q  213 tgtggcgtc 221  Q
    |||| ||||    
T  2467605 tgtgacgtc 2467613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13416000 - 13415805
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtg---ttatgtgcaagtgtgatttata 124  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |||||||   || ||||||||||||| |||||    
T  13416000 cgatacaagcaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgctgaatagatggactcacacttgag-gggagtgctgttgtgtgcaagtgtgagttata 13415902  T
Q  125 tgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13415901 tgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtc 13415805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 217
Target Start/End: Original strand, 26074537 - 26074721
Alignment:
Q  36 gcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccac 132  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |   || ||||||||| |||||||| |||     
T  26074537 gcaagtaagagcttccacttgaaggagtagcatgatcaattgatggactcacacttgagggggagtgtttttgtgtacaagtgtgagttatatgttccat 26074636  T
Q  133 atcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26074637 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 26074721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 6500742 - 6500931
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatg 126  Q
    ||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||  | ||||||||||| |||||||    
T  6500742 cgatacagcaaagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgatggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatg 6500841  T
Q  127 tcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6500842 tcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtgg 6500931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26074330 - 26074195
Alignment:
Q  82 actcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccat 181  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||    
T  26074330 actcacacttgagggggagtgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggacccat 26074231  T
Q  182 aaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26074230 gaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 26074195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24489406 - 24489251
Alignment:
Q  64 agcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacacttt 163  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||||||  |||| ||    
T  24489406 agcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacacctt 24489307  T
Q  164 ataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    || ||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  24489306 attagta--agaacccataaacccattgccttaagattttgcgtaagagtgtggcgtc 24489251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26074998 - 26074826
Alignment:
Q  53 cttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaa 149  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |   || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26074998 cttgaagggggagcttgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaa 26074899  T
Q  150 aggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt-aagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26074898 aggttgaacacaatataagtaggaggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaaagagtgtggcgtc 26074826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18603276 - 18603168
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18603276 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 18603177  T
Q  210 gagtgtggc 218  Q
    |||||||||    
T  18603176 gagtgtggc 18603168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Original strand, 299490 - 299609
Alignment:
Q  109 gcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggta 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  299490 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgta 299589  T
Q  209 agagtgtggcgtccctattg 228  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  299590 agagtgtggcgtctctattg 299609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40296475 - 40296364
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  40296475 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgg 40296376  T
Q  206 gtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||    
T  40296375 gtaagagtgtgg 40296364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26075327 - 26075206
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  26075327 tgttgtgtacaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 26075228  T
Q  201 tttgggt-aagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  26075227 tttgggtaaagagtgtgtcgtc 26075206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12662817 - 12662701
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||  |    
T  12662817 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtt 12662718  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  12662717 tttgggtaagagtgtgg 12662701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Original strand, 32487394 - 32487501
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32487394 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32487492  T
Q  208 aagagtgtg 216  Q
    |||||||||    
T  32487493 aagagtgtg 32487501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 217
Target Start/End: Original strand, 41170640 - 41170743
Alignment:
Q  114 tgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagt 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41170640 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 41170739  T
Q  214 gtgg 217  Q
    ||||    
T  41170740 gtgg 41170743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3295256 - 3295064
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat-----gtgcaagtgtgattta 122  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |||||| ||  || |||||||||| ||||| || ||||||||| |     |||||||||||| | |    
T  3295256 cgatacaagcaagtaagagcttccgctt-aagggggagcacgaaaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgtgcaagtgtgagt-a 3295159  T
Q  123 tatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  3295158 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggttttgggtatgagtgtgg 3295064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1028683 - 1028562
Alignment:
Q  100 gtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaag 199  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||| |    
T  1028683 gtgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaagg 1028584  T
Q  200 ttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  1028583 tttttggtaagagtgtggcgtc 1028562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36492375 - 36492266
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||||||| |    
T  36492375 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttttggat 36492276  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  36492275 aagagtgtgg 36492266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 6224189 - 6224305
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||    
T  6224189 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggt 6224288  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||| |||||||||||||    
T  6224289 ttttggtaagagtgtgg 6224305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36568732 - 36568612
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  36568732 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggt 36568633  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  36568632 ttttggtaagagtgtggcgtc 36568612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Original strand, 624128 - 624305
Alignment:
Q  39 agtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcgg 137  Q
    |||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| || || ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  624128 agtaagagcttccgcttaaagg-ggagcatgatgaatagatgga-tcacacttgaggggaagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgt 624225  T
Q  138 ataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  624226 ataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttgaggttttgggtaagagtgtgg 624305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36522093 - 36521946
Alignment:
Q  69 gatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataag 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |  |||||| ||||| | |||     
T  36522093 gatgaattgatggactcacacttgagggagagtgttgtgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaa 36521994  T
Q  169 taagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    | |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36521993 tgagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 36521946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 217
Target Start/End: Original strand, 41632773 - 41632891
Alignment:
Q  99 agtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||     
T  41632773 agtgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaag 41632872  T
Q  199 gttttgggtaagagtgtgg 217  Q
     ||||||||||||||||||    
T  41632873 attttgggtaagagtgtgg 41632891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 6500451 - 6500559
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6500451 tgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaaggttttgggt 6500549  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  6500550 aagagtgtgg 6500559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 15370092 - 15370208
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||  ||  ||||||| ||    
T  15370092 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggt 15370191  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  15370192 tttgggtaagagtgtgg 15370208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 217
Target Start/End: Original strand, 35150005 - 35150115
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  35150005 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaagag-acccataaatccattgtcttaaggttttgg 35150103  T
Q  206 gtaagagtgtgg 217  Q
    |||| |||||||    
T  35150104 gtaaaagtgtgg 35150115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 217
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328044
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  211 agtgtgg 217  Q
    |||||||    
T  25328038 agtgtgg 25328044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9498812 - 9498703
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  9498812 tgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttgggt 9498713  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  9498712 aagagtgtgg 9498703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11417128 - 11417027
Alignment:
Q  115 gtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtg 214  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11417128 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtg 11417029  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  11417028 tg 11417027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34753171 - 34753070
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcg 219  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34753171 ttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcg 34753072  T
Q  220 tc 221  Q
    ||    
T  34753071 tc 34753070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 221
Target Start/End: Original strand, 38427475 - 38427660
Alignment:
Q  27 acgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatg 126  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||        |||||| |||||||    
T  38427475 acgatacaagcaagtaagagcttcctcttgaaaggggtgcatcatgaatagatggactcacacttgagggggagtgtt--------gtgtgagttatatg 38427566  T
Q  127 tcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||  |||||||| |||| |||||| ||  ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  38427567 tcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagt-agaggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagagtgtgacgtc 38427660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Original strand, 31509559 - 31509710
Alignment:
Q  46 gcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggag--tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaa 143  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  31509559 gcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggagagattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaa 31509658  T
Q  144 aattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgcctt 195  Q
    || |  ||||||  |||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||    
T  31509659 aagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgcctt 31509710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27502194 - 27502085
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||| |||    
T  27502194 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaagatttttggt 27502095  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    || |||||||    
T  27502094 aaaagtgtgg 27502085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29549413 - 29549300
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| | |||||| || ||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  29549413 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttggat 29549314  T
Q  208 aagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||||||    
T  29549313 aagagtgtggcgtc 29549300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747880
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtgg 33747880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13785847 - 13785731
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgt 127  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | | |||||||||| ||| ||||| || || || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  13785847 cgatacaagcaagtaagagcttccgcttgaaggggaaacatgatgaatagatagactcacatttgagggggagtgttgtgtggaagtgtgagttatatgt 13785748  T
Q  128 cccacatcggataaaaa 144  Q
    |||| ||||||||||||    
T  13785747 cccaaatcggataaaaa 13785731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42405761 - 42405645
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||| || || |||||||  | |||||||| ||    
T  42405761 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggt 42405662  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  42405661 tttgggtaagagtgtgg 42405645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3295489 - 3295395
Alignment:
Q  121 tatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3295489 tatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaagagtgtg 3295395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5723949 - 5723844
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||   |||| ||||| ||||||||     
T  5723949 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaaggttttggga 5723850  T
Q  208 aagagt 213  Q
    ||||||    
T  5723849 aagagt 5723844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590955
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||  || |||||||| |||||| ||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  208 aagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtc 26590955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 623818 - 623927
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||   | ||||||||  || ||||||| |||||| ||    
T  623818 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaaggttttgagt 623917  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  623918 aagagtgtgg 623927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 215
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411114
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||| | || |||| |||| |||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  211 agtgt 215  Q
    |||||    
T  2411110 agtgt 2411114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36522434 - 36522286
Alignment:
Q  69 gatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataag 168  Q
    |||||||||||||| |  || || || ||||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| |  | |||| ||| ||||||||    
T  36522434 gatgaattgatggatttacaattgagggggagtgttgtatgaaagtgtgagttatatgtctcacattggatagaaaaatggaagttgaacattttataag 36522335  T
Q  169 taagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    | |||| ||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  36522334 tgagaggaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaagagtgtgg 36522286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 221
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370515
Alignment:
Q  134 tcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||| ||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtc 15370515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 185
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074395
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaac 185  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaac 26074395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 203
Target Start/End: Original strand, 42508605 - 42508707
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||  |||  | ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||    
T  42508605 tgttgtgtacaagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggt 42508704  T
Q  201 ttt 203  Q
    |||    
T  42508705 ttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 217
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35914958
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||  |||| ||||  ||||||| |||| | |||| ||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataag 35914951  T
Q  211 agtgtgg 217  Q
    | |||||    
T  35914952 aatgtgg 35914958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 183
Target Start/End: Original strand, 7768852 - 7768925
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataa 183  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||    
T  7768852 caagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 9498487 - 9498411
Alignment:
Q  29 gatacaggcaa-gtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtt 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  9498487 gatacaggcaaagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggtgtgtt 9498411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 181
Target Start/End: Original strand, 300961 - 301032
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccat 181  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  300961 caagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagagaatccat 301032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35168003 - 35167888
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||| | || |||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||   |||||||| | ||    
T  35168003 tgttgtgtacaagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgt 35167904  T
Q  201 tttgggtaagagtgtg 216  Q
    ||| ||||||||||||    
T  35167903 ttttggtaagagtgtg 35167888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Original strand, 35150740 - 35150782
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaa 143  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35150740 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaa 35150782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Original strand, 35151031 - 35151073
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaa 143  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35151031 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaa 35151073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 217
Target Start/End: Original strand, 13042607 - 13042648
Alignment:
Q  176 acccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13042607 acccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtgg 13042648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Original strand, 14169000 - 14169037
Alignment:
Q  174 gaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaaga 211  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14169000 gaacccataagctcattgccttaaagttttgggtaaga 14169037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 195
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509818
Alignment:
Q  122 atatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgcctt 195  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||  |||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgcctt 31509818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Original strand, 39309677 - 39309750
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagag 174  Q
    |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| |||| |||| |||||| ||||||    
T  39309677 tgttgtgtacaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagag 39309750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635242
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||| ||| ||||||||  | |||| ||||||| | |||| |||| |||| |||||| |||||| | |||||||  ||||| |||||| |||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  211 agtgt 215  Q
    |||||    
T  41635246 agtgt 41635242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1085781 - 1085661
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  1085781 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 1085682  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1085681 tttgggtaagagtgtggcgtc 1085661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 7553953 - 7554134
Alignment:
Q  38 aagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacat 134  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7553953 aagtaagagcttccgcttgaggg-ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 7554051  T
Q  135 cggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7554052 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtgg 7554134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 30245020 - 30245186
Alignment:
Q  54 ttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaa 150  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |   || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  30245020 ttgaagggggagcatgatgattagatggactcgcacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaa 30245119  T
Q  151 ggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30245120 ggttgaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 30245186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 216
Target Start/End: Original strand, 45434573 - 45434744
Alignment:
Q  46 gcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagt-gttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaa 144  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  | ||| || ||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  45434573 gcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgaaggactcacacttgggggggtgttgttgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaaa 45434672  T
Q  145 attaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45434673 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaaggttttgggtaagagtgtg 45434744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 7517573 - 7517689
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  7517573 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 7517672  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  7517673 tttgggtaagagtgtgg 7517689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 14681438 - 14681619
Alignment:
Q  38 aagtaagtgcttcctcttgaaggcgg-agcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatc 135  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||  | ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14681438 aagtaagagcttccgcttgaaggggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatc 14681537  T
Q  136 ggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
     ||||||| | ||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14681538 agataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgg 14681619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 217
Target Start/End: Original strand, 30244205 - 30244379
Alignment:
Q  46 gcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaa 142  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||| |   || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30244205 gcttccgcttgaagagggagcatgatgactagatgaactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 30244304  T
Q  143 aaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    | | ||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30244305 agagtaaaggttgaagaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 30244379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22566820 - 22566711
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22566820 tgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 22566721  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  22566720 aagagtgtgg 22566711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 24177428 - 24177548
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  24177428 tgttgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagt 24177527  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  24177528 ttttggtaagagtgtggcgtc 24177548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1085492 - 1085297
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggac--tcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtga-ttt 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||  || ||||| |  ||||||||| |   |||||||||||| |||    
T  1085492 cgatacaagcaagtaagagcttccccttgaaggggtagcatgatgaaaagatggacactcacacttgaaggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttt 1085393  T
Q  122 atatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
     ||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1085392 ttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 1085297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 217
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054669
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  210 gagtgtgg 217  Q
    ||||||||    
T  6054662 gagtgtgg 6054669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37533201 - 37533067
Alignment:
Q  76 tgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagag 174  Q
    |||||||||| | ||| || |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37533201 tgatggactcacgcttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 37533102  T
Q  175 aacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37533101 gacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 37533067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 29157565 - 29157674
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  29157565 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggttttgggt 29157664  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  29157665 aagagtgtgg 29157674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23542 - 23426
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||    
T  23542 tgttgtgtgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggt 23443  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  23442 tttgggtaagagtgtgg 23426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40094939 - 40094819
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| ||    
T  40094939 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggt 40094840  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40094839 tttgggtaagagtgtggcgtc 40094819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22567088
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggt 22567098  T
Q  208 aagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||    
T  22567097 aagagtgtgg 22567088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 118466 - 118346
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||||| |||| || ||| ||    
T  118466 tgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggt 118367  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  118366 tttgggtaagagtgtggcgtc 118346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8128606 - 8128490
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||  |||||| ||    
T  8128606 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggt 8128507  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8128506 tttggttaagagtgtgg 8128490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36939898 - 36939782
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||    
T  36939898 tgttctgtgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggt 36939799  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||| |||||||    
T  36939798 tttgggtaaaagtgtgg 36939782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Original strand, 37345836 - 37346031
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatat-- 125  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| ||||| || |||||| |||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||| ||||||      
T  37345836 cgatacaagcaagtaaaagcttccacttgacgggggagcacgatgaattgatgaactcacacttgaaggggagtgttgtgtgcaagtgtgagttatatat 37345935  T
Q  126 gtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||  | ||| |||| |||| |  |||||  ||| ||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37345936 gtcatatatctgatagaaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttgagtaagagtgtgacgtc 37346031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 45433234 - 45433350
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  |    
T  45433234 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagat 45433333  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  45433334 tttgggtaagagtgtgg 45433350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845300
Alignment:
Q  115 gtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtg 214  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  215 tgg 217  Q
    |||    
T  11845298 tgg 11845300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 214
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569302
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16569295  T
Q  208 aagagtg 214  Q
    |||||||    
T  16569296 aagagtg 16569302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596360
Alignment:
Q  108 tgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16596367  T
Q  208 aagagtg 214  Q
    |||||||    
T  16596366 aagagtg 16596360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34218199 - 34218083
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||| || ||||||| ||||| ||||| ||    
T  34218199 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggt 34218100  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  34218099 tttgggtaagagtgtgg 34218083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36534949 - 36534829
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  |  | ||||| ||    
T  36534949 tgttgtgtgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggt 36534850  T
Q  201 tttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36534849 tttgggtaagagtgtggcgtc 36534829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 36622958 - 36623065
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  36622958 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgg 36623057  T
Q  206 gtaagagt 213  Q
    ||| ||||    
T  36623058 gtaggagt 36623065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37533519 - 37533413
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||||||| |||||||| | |||| | |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  37533519 aagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggtaag 37533420  T
Q  211 agtgtgg 217  Q
    |||||||    
T  37533419 agtgtgg 37533413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 40094634 - 40094505
Alignment:
Q  25 caacgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttata 124  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40094634 caacgatacaagcaagtaagagcttccgcttgagggag-agcgtgatgaatagatggactcacactttaggaggagtgttgtgtgcaagtgtgagttata 40094536  T
Q  125 tgtcccacatcggataaaaaattaaaggttg 155  Q
    ||||| ||||| ||||||| | |||||||||    
T  40094535 tgtccaacatcagataaaagagtaaaggttg 40094505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Original strand, 19122744 - 19122840
Alignment:
Q  120 ttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19122744 ttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 19122840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 212
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599418
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaag 20599416  T
Q  211 ag 212  Q
    ||    
T  20599417 ag 20599418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28301709 - 28301613
Alignment:
Q  100 gtgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgcctta 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| | || |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28301709 gtgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Original strand, 30244618 - 30244767
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaatt-gatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttat 123  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||| || ||||||||| |   |||||||||||| ||||    
T  30244618 cgatacaagcaagtaagagcttccgcttcaagg-ggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttat 30244716  T
Q  124 atgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagag 174  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  30244717 atgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagag 30244767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 209
Target Start/End: Original strand, 43241488 - 43241596
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| || || |||||||  |||| ||||| ||    
T  43241488 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggt 43241587  T
Q  201 tttgggtaa 209  Q
    ||| |||||    
T  43241588 tttaggtaa 43241596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 45754709 - 45754824
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||| ||    
T  45754709 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggt 45754807  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  45754808 tttgggtaagagtgtgg 45754824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40230451 - 40230348
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||    
T  40230451 tgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgg 40230352  T
Q  206 gtaa 209  Q
    ||||    
T  40230351 gtaa 40230348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 217
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129204
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||| ||| || |||| ||||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  210 gagtgtgg 217  Q
    ||||||||    
T  47129197 gagtgtgg 47129204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 216
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032675
Alignment:
Q  113 gtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagag 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||  |||| |||| ||||||||||||| | ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  213 tgtg 216  Q
    ||||    
T  30032672 tgtg 30032675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Original strand, 30253546 - 30253601
Alignment:
Q  162 ttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30253546 ttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 30253601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4124293 - 4124137
Alignment:
Q  63 gagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagt--gttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacac 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |   | |||  ||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||  ||||| |||||    
T  4124293 gagcatgatgaattgatgggctcacacttgatgtgaagtttgttgtgtgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacac 4124194  T
Q  161 tttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||| ||| |||||||    
T  4124193 tttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggataaaagtgtgg 4124137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Original strand, 30245487 - 30245560
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagag 174  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30245487 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 30245560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Original strand, 30255332 - 30255405
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagag 174  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30255332 tgttgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 30255405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41910759 - 41910663
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaa 197  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || |||||| | |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  41910759 tgttgtgtgtaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaa 41910663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838746
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaag-agaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| || | |||||||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  210 gagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||| ||||    
T  24838757 gagtgtgacgtc 24838746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 221
Target Start/End: Original strand, 41854633 - 41854747
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||||  ||| ||||| | | |||||||| |||||||    
T  41854633 tgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgg 41854731  T
Q  206 gtaagagtgtggcgtc 221  Q
    ||||||||||| ||||    
T  41854732 gtaagagtgtgacgtc 41854747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 217
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901752
Alignment:
Q  111 aagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaag 210  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||  ||||| ||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 9901745  T
Q  211 agtgtgg 217  Q
    |||||||    
T  9901746 agtgtgg 9901752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28300363 - 28300298
Alignment:
Q  157 acactttataagtaagagaaccc-ataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28300363 acaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtc 28300298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36109082 - 36109009
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagag 174  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36109082 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 36109009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 48243318 - 48243242
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtt 104  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  48243318 cgatacaagcaagtaagaacttccacttgaagggggagcatgatgaattgatggattcacacttgagggggagtgtt 48243242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Original strand, 45697841 - 45697929
Alignment:
Q  38 aagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttatgtgcaagtgtgatttatatgt 127  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||  |||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45697841 aagtaagagcttccgcttgaagg-ggagcatgatgaatagataaactcacacttgaggaggagtgttgtgtgcaagtgtcatttatatgt 45697929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569052
Alignment:
Q  177 cccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 23569052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40094505 - 40094458
Alignment:
Q  174 gaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtggcgtc 221  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40094505 gaacccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtc 40094458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 28300431 - 28300365
Alignment:
Q  37 caagtaagtgcttcctcttgaa-ggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtg 102  Q
    |||| ||| |||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28300431 caagcaagggcttccgcttgaaaggaggagcatgatgaatagatggactcacacttgagagggagtg 28300365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 36967394 - 36967344
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaag 151  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36967394 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaag 36967344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 217
Target Start/End: Original strand, 37167840 - 37167890
Alignment:
Q  167 agtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37167840 agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtgg 37167890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21416231 - 21416190
Alignment:
Q  176 acccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21416231 acccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtgg 21416190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 47129395 - 47129439
Alignment:
Q  30 atacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaa 74  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47129395 atacaagcaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaa 47129439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 5273 - 5466
Alignment:
Q  28 cgatacaggcaa-gtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagt---gttatgtgcaagtgtgatttat 123  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| || | ||||   ||| ||||||||||||| ||||    
T  5273 cgatacaggcaaagtaagagcttccgcttgaagggggagcacgatgaactgatggactcacacttgagggagagttttgttgtgtgcaagtgtgagttat 5372  T
Q  124 atgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||| |||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  5373 atgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataagagtgtgg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 4975 - 5091
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || | ||||||||  | |  |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||  ||    
T  4975 tgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggt 5074  T
Q  201 tttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  5075 tttgggtaagagtgtgg 5091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 5705 - 5866
Alignment:
Q  38 aagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacat 134  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |   |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5705 aagtaagagcttccgcttgaggg-ggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcgcacat 5803  T
Q  135 cggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaa 197  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5804 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 5866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Original strand, 5389 - 5506
Alignment:
Q  101 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaag- 199  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||     
T  5389 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagt 5488  T
Q  200 ttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5489 ttttgggtaagagtgtgg 5506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 563
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaa 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 571  T
Q  210 gagtgtgg 217  Q
    ||||||||    
T  570 gagtgtgg 563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 367 - 234
Alignment:
Q  41 taagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggat 139  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||  | |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  367 taagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttggg-gggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 269  T
Q  140 aaaaaattaaaggttggacactttataagtaagag 174  Q
    |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  268 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1348 - 1159
Alignment:
Q  27 acgatacaggcaagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttat 123  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| || ||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||| || |||| |||| |   || ||||||||| ||||    
T  1348 acgatacaagcaagtaagagcttccgctcgaagggggagcatgatcaaaagatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttat 1249  T
Q  124 atgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||| || || || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1248 atgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3217 - 3096
Alignment:
Q  37 caagtaagtgcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggag---tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccaca 133  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3217 caagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgagttgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccaca 3118  T
Q  134 tcggataaaaaattaaaggttg 155  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  3117 tcggataaaagagtaaaggttg 3096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1800 - 1740
Alignment:
Q  157 acactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtgtgg 217  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1800 acaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtgg 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17663 - 17507
Alignment:
Q  62 ggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagtgttat---gtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggac 158  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| |   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  17663 ggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaac 17564  T
Q  159 actttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaag--ttttgggtaagagt 213  Q
    || || |||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  17563 accttgtaagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttttgggtaagagt 17507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Original strand, 47358 - 47461
Alignment:
Q  106 tgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgg 205  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  47358 tgtgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgg 47457  T
Q  206 gtaa 209  Q
    ||||    
T  47458 gtaa 47461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 169
Target Start/End: Original strand, 39775 - 39899
Alignment:
Q  46 gcttcctcttgaaggcggagcatgatgaattgatggactcgcacttaagagggagt-gttatgtgcaagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaa 144  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||||| || |||| | ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  39775 gcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgatgaactcacacttgagggggaattgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaa 39874  T
Q  145 attaaaggttggacactttataagt 169  Q
    | |   |||||||| ||||||||||    
T  39875 agtggtggttggactctttataagt 39899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10191
Alignment:
Q  110 caagtgtgatttatatgtcccacatcggataaaaaattaaaggttggacactttataagtaagagaacccataaaca 186  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaaca 10191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University