View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14684_high_9 (Length: 512)

Name: NF14684_high_9
Description: NF14684
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14684_high_9
NF14684_high_9
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (19-506)||(703-1190)
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (19-506)||(16495402-16495889)
chr7 (338-506)||(34200786-34200954)
chr7 (338-506)||(28505251-28505419)
chr7 (338-506)||(11995980-11996148)
chr7 (326-506)||(15754827-15755008)
chr7 (341-506)||(67745-67911)
chr7 (341-502)||(44014182-44014342)
chr7 (341-506)||(16219670-16219835)
chr7 (341-502)||(18005650-18005813)
chr7 (341-502)||(811084-811248)
chr7 (327-506)||(13647325-13647508)
chr7 (341-506)||(47831807-47831975)
chr7 (341-487)||(16056347-16056495)
chr7 (341-506)||(22072913-22073083)
chr7 (391-487)||(2280125-2280221)
chr7 (327-490)||(20220127-20220293)
chr7 (436-506)||(27847881-27847951)
chr7 (391-503)||(3564370-3564482)
chr7 (429-506)||(16386292-16386369)
chr7 (435-504)||(40443393-40443462)
chr7 (391-506)||(38227481-38227595)
chr7 (327-506)||(19486681-19486865)
chr7 (429-506)||(12698831-12698907)
chr7 (327-506)||(18430709-18430891)
chr7 (405-506)||(10063838-10063939)
chr7 (434-506)||(9509189-9509260)
chr7 (391-503)||(18456419-18456530)
chr7 (327-503)||(456321-456500)
chr7 (327-503)||(11972496-11972675)
chr7 (327-503)||(14949105-14949284)
chr7 (327-503)||(15376696-15376875)
chr7 (327-503)||(16232520-16232699)
chr7 (327-503)||(20385106-20385285)
chr7 (327-503)||(21189578-21189757)
chr7 (327-503)||(24702238-24702417)
chr7 (327-503)||(32125491-32125670)
chr7 (327-503)||(41522917-41523096)
chr7 (327-503)||(41525379-41525558)
chr7 (327-502)||(11393270-11393448)
chr7 (327-503)||(17061898-17062077)
chr7 (429-506)||(10589039-10589115)
chr7 (341-487)||(12901342-12901492)
chr7 (327-503)||(18640272-18640451)
chr7 (327-503)||(24704688-24704864)
chr7 (327-503)||(27216860-27217039)
chr7 (327-503)||(44116509-44116688)
chr7 (429-506)||(26211995-26212072)
chr7 (327-487)||(1867932-1868097)
chr7 (391-503)||(48273392-48273504)
chr7 (415-484)||(12255821-12255892)
chr7 (327-490)||(15008436-15008604)
chr7 (327-503)||(16410059-16410238)
chr7 (435-487)||(14044765-14044817)
chr7 (435-487)||(14354795-14354847)
chr7 (444-503)||(3386333-3386391)
chr7 (444-503)||(16213684-16213742)
chr7 (453-503)||(13869346-13869396)
chr7 (453-503)||(20110556-20110606)
chr7 (391-487)||(24275187-24275282)
chr7 (443-487)||(15144096-15144139)
chr7 (434-490)||(48991196-48991252)
chr7 (435-478)||(14036282-14036325)
chr7 (435-478)||(14346312-14346355)
chr7 (453-503)||(13831373-13831423)
chr7 (437-487)||(18154894-18154943)
chr7 (437-491)||(9177718-9177772)
chr7 (453-487)||(38898489-38898523)
chr7 (327-368)||(12756654-12756695)
chr7 (453-502)||(19649557-19649606)
chr7 (453-505)||(2832509-2832561)
chr7 (340-400)||(14044857-14044917)
chr7 (340-400)||(14354887-14354947)
chr7 (327-367)||(15081932-15081972)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (19-506)||(14295184-14295672)
chr1 (19-438)||(51130632-51131052)
chr1 (329-487)||(20918623-20918782)
chr1 (338-502)||(20248283-20248447)
chr1 (327-453)||(22130848-22130975)
chr1 (329-506)||(33681010-33681188)
chr1 (341-502)||(22921823-22921986)
chr1 (329-506)||(22237630-22237808)
chr1 (329-506)||(52927922-52928088)
chr1 (327-490)||(35261018-35261183)
chr1 (327-506)||(45574825-45575008)
chr1 (354-487)||(21754064-21754198)
chr1 (327-490)||(21896193-21896361)
chr1 (430-506)||(38801433-38801508)
chr1 (330-490)||(21861510-21861675)
chr1 (415-487)||(16758668-16758742)
chr1 (435-506)||(20847205-20847275)
chr1 (391-505)||(50210219-50210333)
chr1 (429-506)||(27250774-27250850)
chr1 (429-503)||(34509783-34509856)
chr1 (429-506)||(21026680-21026756)
chr1 (327-503)||(13988866-13989045)
chr1 (327-503)||(21923274-21923453)
chr1 (327-487)||(22123050-22123214)
chr1 (391-490)||(50614121-50614222)
chr1 (391-490)||(50621949-50622050)
chr1 (327-504)||(21840766-21840946)
chr1 (327-503)||(21475070-21475249)
chr1 (327-503)||(29776688-29776867)
chr1 (391-490)||(16368291-16368391)
chr1 (429-506)||(22532269-22532345)
chr1 (437-505)||(20454606-20454673)
chr1 (331-490)||(50686627-50686792)
chr1 (327-503)||(433012-433190)
chr1 (327-503)||(29298137-29298315)
chr1 (327-503)||(31612313-31612492)
chr1 (391-490)||(41050040-41050141)
chr1 (453-506)||(13212974-13213027)
chr1 (390-502)||(21161720-21161831)
chr1 (453-509)||(21342090-21342146)
chr1 (327-503)||(23593717-23593897)
chr1 (453-503)||(21346961-21347011)
chr1 (453-503)||(21707167-21707217)
chr1 (453-503)||(21711709-21711759)
chr1 (341-488)||(16093836-16093988)
chr1 (453-509)||(15860121-15860177)
chr1 (435-490)||(26064954-26065009)
chr1 (455-505)||(16361915-16361965)
chr1 (453-502)||(21714546-21714595)
chr1 (437-505)||(22468749-22468816)
chr1 (453-503)||(16275476-16275526)
chr1 (461-491)||(21533948-21533978)
chr1 (327-367)||(13212844-13212884)
chr1 (340-372)||(20636985-20637017)
chr1 (327-367)||(21347101-21347141)
chr1 (453-505)||(24783160-24783212)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (19-379)||(36314678-36315040)
chr5 (338-506)||(19660788-19660956)
chr5 (337-502)||(22959484-22959649)
chr5 (329-506)||(19668898-19669076)
chr5 (329-502)||(21565546-21565723)
chr5 (405-506)||(36314577-36314678)
chr5 (341-506)||(21329450-21329618)
chr5 (343-487)||(26011990-26012137)
chr5 (341-506)||(21502109-21502277)
chr5 (332-490)||(20026883-20027046)
chr5 (429-506)||(21729109-21729185)
chr5 (429-506)||(21808434-21808510)
chr5 (435-506)||(21293020-21293090)
chr5 (391-490)||(22144065-22144164)
chr5 (327-506)||(40725853-40726037)
chr5 (429-506)||(8286888-8286964)
chr5 (429-506)||(21997579-21997655)
chr5 (434-499)||(37723910-37723975)
chr5 (391-506)||(24493569-24493683)
chr5 (429-506)||(23390541-23390617)
chr5 (429-506)||(25421532-25421608)
chr5 (391-506)||(1096467-1096582)
chr5 (327-503)||(264751-264930)
chr5 (391-506)||(13025311-13025425)
chr5 (391-506)||(13095495-13095609)
chr5 (327-503)||(20909012-20909191)
chr5 (327-503)||(29329934-29330113)
chr5 (327-503)||(39363384-39363563)
chr5 (429-503)||(24529223-24529296)
chr5 (434-506)||(9077952-9078023)
chr5 (331-490)||(22178161-22178326)
chr5 (327-503)||(10732923-10733102)
chr5 (327-503)||(42245348-42245527)
chr5 (429-506)||(22075018-22075095)
chr5 (329-503)||(11581184-11581361)
chr5 (391-503)||(22412187-22412298)
chr5 (327-503)||(29345980-29346159)
chr5 (327-503)||(36154766-36154942)
chr5 (327-487)||(20901991-20902155)
chr5 (429-486)||(25431414-25431470)
chr5 (444-503)||(20918052-20918110)
chr5 (327-503)||(29348453-29348632)
chr5 (327-503)||(29350926-29351105)
chr5 (444-503)||(39245136-39245194)
chr5 (453-503)||(2154726-2154776)
chr5 (453-503)||(38619434-38619484)
chr5 (453-502)||(23064512-23064561)
chr5 (455-503)||(10775790-10775838)
chr5 (327-503)||(32027393-32027572)
chr5 (437-491)||(15796434-15796487)
chr5 (436-490)||(26740697-26740750)
chr5 (453-503)||(31061068-31061118)
chr5 (436-485)||(26732884-26732932)
chr5 (453-500)||(18319146-18319193)
chr5 (453-503)||(20806854-20806904)
chr5 (437-491)||(23469818-23469871)
chr5 (453-487)||(26704090-26704124)
chr5 (453-487)||(26973823-26973857)
chr5 (460-490)||(27989004-27989034)
chr5 (327-367)||(2154596-2154636)
chr5 (341-397)||(21741486-21741541)
chr5 (418-502)||(22032323-22032406)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (19-367)||(30474-30824)
[»] chr3 (86 HSPs)
chr3 (19-503)||(28194693-28195175)
chr3 (338-506)||(13210280-13210448)
chr3 (338-502)||(12174212-12174376)
chr3 (341-506)||(15470927-15471092)
chr3 (329-502)||(16097332-16097509)
chr3 (329-502)||(16103784-16103960)
chr3 (341-506)||(14234487-14234655)
chr3 (403-502)||(49668094-49668193)
chr3 (381-502)||(9512924-9513044)
chr3 (381-502)||(9520899-9521019)
chr3 (354-487)||(32307696-32307830)
chr3 (327-506)||(43550461-43550644)
chr3 (329-490)||(52523666-52523834)
chr3 (327-506)||(24340660-24340844)
chr3 (391-506)||(12399209-12399324)
chr3 (327-506)||(37642202-37642386)
chr3 (391-506)||(14972854-14972969)
chr3 (391-506)||(18438534-18438649)
chr3 (383-506)||(11424758-11424880)
chr3 (416-503)||(27165250-27165337)
chr3 (405-487)||(23274706-23274788)
chr3 (429-506)||(20698480-20698556)
chr3 (327-502)||(37251105-37251283)
chr3 (415-503)||(53301581-53301669)
chr3 (327-503)||(7781330-7781509)
chr3 (429-506)||(13442274-13442350)
chr3 (429-506)||(23083406-23083482)
chr3 (327-503)||(9707590-9707769)
chr3 (327-503)||(17463178-17463357)
chr3 (327-503)||(34159326-34159505)
chr3 (327-503)||(45606890-45607069)
chr3 (327-503)||(55476491-55476670)
chr3 (391-490)||(43925974-43926075)
chr3 (327-501)||(16282794-16282971)
chr3 (429-506)||(17487856-17487932)
chr3 (429-506)||(17499338-17499414)
chr3 (429-506)||(26686887-26686963)
chr3 (327-504)||(13544024-13544204)
chr3 (411-487)||(14572608-14572683)
chr3 (393-490)||(22110358-22110457)
chr3 (391-503)||(24153215-24153326)
chr3 (327-503)||(6469117-6469296)
chr3 (327-503)||(8899094-8899273)
chr3 (327-487)||(12567576-12567739)
chr3 (327-503)||(16454264-16454443)
chr3 (327-503)||(17672626-17672805)
chr3 (327-503)||(28848594-28848773)
chr3 (324-503)||(29172562-29172745)
chr3 (327-487)||(38961874-38962037)
chr3 (327-487)||(50242838-50243001)
chr3 (338-506)||(22147474-22147646)
chr3 (327-490)||(53070636-53070802)
chr3 (327-503)||(13151773-13151953)
chr3 (327-503)||(13154238-13154418)
chr3 (391-506)||(25476391-25476506)
chr3 (391-503)||(36166598-36166708)
chr3 (327-503)||(10247706-10247885)
chr3 (429-487)||(42386429-42386486)
chr3 (437-490)||(606378-606431)
chr3 (391-489)||(12377938-12378038)
chr3 (429-506)||(43840932-43841008)
chr3 (327-501)||(41123892-41124066)
chr3 (404-487)||(1644693-1644775)
chr3 (444-503)||(15977515-15977573)
chr3 (327-503)||(17446638-17446816)
chr3 (444-503)||(17737236-17737294)
chr3 (444-503)||(55500942-55501000)
chr3 (453-503)||(8499518-8499568)
chr3 (453-503)||(10556985-10557035)
chr3 (453-503)||(15412429-15412479)
chr3 (453-503)||(45577950-45578000)
chr3 (391-503)||(40213727-40213838)
chr3 (329-397)||(49389570-49389639)
chr3 (391-487)||(21618465-21618559)
chr3 (453-503)||(12119837-12119887)
chr3 (453-503)||(44494809-44494859)
chr3 (434-487)||(14576882-14576934)
chr3 (435-491)||(13919344-13919399)
chr3 (437-502)||(856140-856204)
chr3 (340-397)||(1465363-1465419)
chr3 (453-502)||(15878119-15878168)
chr3 (437-502)||(23077530-23077594)
chr3 (327-367)||(12119707-12119747)
chr3 (453-505)||(14665398-14665450)
chr3 (453-505)||(14668554-14668606)
chr3 (327-367)||(17248224-17248264)
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (338-506)||(5866227-5866395)
chr8 (338-506)||(21490995-21491163)
chr8 (338-506)||(17140916-17141084)
chr8 (338-506)||(21249384-21249553)
chr8 (338-506)||(21255222-21255391)
chr8 (341-506)||(38855205-38855372)
chr8 (341-506)||(6520368-6520535)
chr8 (341-506)||(23760798-23760962)
chr8 (341-487)||(21285616-21285765)
chr8 (411-506)||(16199671-16199765)
chr8 (332-487)||(983348-983508)
chr8 (329-502)||(26355640-26355815)
chr8 (434-506)||(21396029-21396101)
chr8 (434-506)||(21790522-21790594)
chr8 (341-487)||(21673723-21673871)
chr8 (391-506)||(22626736-22626850)
chr8 (411-506)||(31971257-31971351)
chr8 (338-506)||(17612059-17612231)
chr8 (434-506)||(21389499-21389571)
chr8 (434-506)||(21778825-21778897)
chr8 (383-509)||(6759255-6759381)
chr8 (327-499)||(13508022-13508199)
chr8 (435-506)||(45131047-45131117)
chr8 (429-506)||(21919045-21919121)
chr8 (327-490)||(37116363-37116532)
chr8 (327-499)||(13597554-13597731)
chr8 (391-505)||(28649050-28649164)
chr8 (393-506)||(18818417-18818530)
chr8 (327-490)||(20498578-20498746)
chr8 (429-506)||(7372778-7372854)
chr8 (429-506)||(18879276-18879352)
chr8 (429-506)||(23406379-23406455)
chr8 (391-506)||(16092348-16092463)
chr8 (327-503)||(14409427-14409606)
chr8 (436-506)||(21923980-21924049)
chr8 (429-506)||(20536208-20536284)
chr8 (327-503)||(1484402-1484581)
chr8 (327-503)||(5853275-5853454)
chr8 (327-503)||(15203214-15203393)
chr8 (327-503)||(20403227-20403406)
chr8 (327-503)||(22001753-22001932)
chr8 (391-506)||(22875065-22875179)
chr8 (327-490)||(17266930-17267099)
chr8 (327-487)||(16413299-16413462)
chr8 (327-503)||(20046178-20046357)
chr8 (435-490)||(24353036-24353091)
chr8 (327-503)||(41598188-41598367)
chr8 (340-490)||(17439457-17439612)
chr8 (434-490)||(19154936-19154992)
chr8 (327-503)||(4483281-4483459)
chr8 (444-503)||(4542477-4542535)
chr8 (329-490)||(19801367-19801530)
chr8 (444-503)||(19896265-19896323)
chr8 (453-503)||(26225359-26225409)
chr8 (453-509)||(19937118-19937174)
chr8 (453-487)||(15070574-15070608)
chr8 (453-487)||(26219733-26219767)
chr8 (453-487)||(45290807-45290841)
chr8 (437-491)||(20502154-20502207)
chr8 (453-503)||(25484380-25484430)
chr8 (325-367)||(26224058-26224100)
chr8 (327-368)||(4542356-4542397)
chr8 (327-376)||(19896398-19896447)
chr8 (327-368)||(24486027-24486068)
chr8 (327-368)||(32810069-32810110)
chr8 (435-491)||(22525573-22525628)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (338-506)||(11292-11460)
scaffold0046 (338-506)||(1997-2165)
scaffold0046 (429-506)||(28414-28490)
scaffold0046 (450-506)||(4552-4608)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (338-506)||(15551817-15551985)
chr4 (338-468)||(16596686-16596816)
chr4 (341-506)||(39706242-39706409)
chr4 (341-487)||(12288162-12288312)
chr4 (354-502)||(12774011-12774160)
chr4 (327-490)||(13788-13956)
chr4 (434-506)||(17046487-17046559)
chr4 (403-502)||(8846360-8846459)
chr4 (391-487)||(52243200-52243298)
chr4 (429-506)||(3096293-3096369)
chr4 (429-506)||(12902757-12902833)
chr4 (429-506)||(7088877-7088953)
chr4 (429-506)||(7798774-7798850)
chr4 (429-506)||(52873412-52873488)
chr4 (391-503)||(16377529-16377639)
chr4 (329-487)||(43198492-43198657)
chr4 (411-506)||(14053328-14053422)
chr4 (327-503)||(18215257-18215436)
chr4 (391-506)||(6899891-6900005)
chr4 (327-503)||(15118335-15118514)
chr4 (411-506)||(16270262-16270356)
chr4 (327-503)||(44615288-44615467)
chr4 (327-503)||(44773070-44773249)
chr4 (327-503)||(52312510-52312689)
chr4 (429-499)||(23374404-23374473)
chr4 (429-506)||(7893703-7893779)
chr4 (327-505)||(19618155-19618336)
chr4 (338-503)||(44928873-44929042)
chr4 (327-490)||(46640393-46640561)
chr4 (331-503)||(12294-12469)
chr4 (327-503)||(1837492-1837671)
chr4 (391-506)||(16239976-16240090)
chr4 (437-504)||(22353835-22353901)
chr4 (327-503)||(51463851-51464030)
chr4 (429-506)||(44052829-44052905)
chr4 (437-489)||(6190479-6190531)
chr4 (436-504)||(22636437-22636504)
chr4 (327-490)||(53082089-53082257)
chr4 (327-503)||(3515007-3515186)
chr4 (329-399)||(8846482-8846553)
chr4 (327-503)||(18239402-18239581)
chr4 (327-503)||(23803248-23803427)
chr4 (327-503)||(50222322-50222501)
chr4 (391-503)||(14280316-14280427)
chr4 (391-503)||(54798760-54798872)
chr4 (391-487)||(8574875-8574969)
chr4 (429-501)||(14038653-14038724)
chr4 (453-509)||(19242693-19242749)
chr4 (444-503)||(7641286-7641344)
chr4 (444-503)||(12610950-12611008)
chr4 (453-503)||(44102214-44102264)
chr4 (327-487)||(15355307-15355471)
chr4 (453-506)||(15367690-15367743)
chr4 (453-506)||(15370018-15370071)
chr4 (453-506)||(15371202-15371255)
chr4 (453-506)||(15373483-15373536)
chr4 (453-506)||(15402703-15402756)
chr4 (453-506)||(16223532-16223585)
chr4 (327-487)||(14970690-14970853)
chr4 (455-490)||(21815699-21815734)
chr4 (327-368)||(7641175-7641216)
chr4 (340-397)||(15099461-15099517)
chr4 (340-397)||(15190428-15190484)
chr4 (435-491)||(17333292-17333347)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (338-503)||(15664-15829)
[»] chr6 (66 HSPs)
chr6 (338-506)||(28496424-28496592)
chr6 (338-506)||(29808835-29809003)
chr6 (326-506)||(1561303-1561484)
chr6 (329-502)||(19652199-19652374)
chr6 (405-506)||(27333238-27333339)
chr6 (405-506)||(27393978-27394079)
chr6 (341-506)||(23019408-23019574)
chr6 (340-487)||(19668390-19668541)
chr6 (341-487)||(9098466-9098616)
chr6 (393-506)||(20076700-20076812)
chr6 (434-506)||(16920679-16920751)
chr6 (434-506)||(35245586-35245658)
chr6 (327-506)||(8227448-8227632)
chr6 (429-506)||(16496244-16496320)
chr6 (438-506)||(22831503-22831571)
chr6 (391-506)||(29060540-29060655)
chr6 (391-506)||(19303547-19303661)
chr6 (327-503)||(22782227-22782406)
chr6 (329-487)||(20109157-20109322)
chr6 (429-487)||(25644339-25644397)
chr6 (390-483)||(4185826-4185919)
chr6 (327-505)||(30676693-30676874)
chr6 (411-506)||(17287822-17287917)
chr6 (327-503)||(1595549-1595728)
chr6 (327-503)||(2291163-2291342)
chr6 (327-503)||(12742317-12742496)
chr6 (327-503)||(18334575-18334754)
chr6 (391-505)||(18409833-18409947)
chr6 (327-503)||(19005046-19005225)
chr6 (327-503)||(19858902-19859081)
chr6 (327-503)||(24422547-24422726)
chr6 (327-503)||(25754809-25754988)
chr6 (327-503)||(33861794-33861973)
chr6 (327-503)||(33864278-33864457)
chr6 (429-506)||(20638328-20638404)
chr6 (327-503)||(8055029-8055208)
chr6 (443-494)||(11185517-11185568)
chr6 (327-503)||(26924623-26924802)
chr6 (327-490)||(18456732-18456898)
chr6 (390-483)||(4186390-4186483)
chr6 (437-506)||(20361013-20361081)
chr6 (391-506)||(20593773-20593888)
chr6 (327-503)||(20556877-20557054)
chr6 (441-503)||(25656629-25656690)
chr6 (444-506)||(25714417-25714478)
chr6 (453-506)||(22780295-22780348)
chr6 (435-488)||(23076748-23076801)
chr6 (453-506)||(25629423-25629476)
chr6 (327-505)||(34963371-34963552)
chr6 (435-488)||(35008166-35008219)
chr6 (327-503)||(1540894-1541073)
chr6 (459-506)||(22080799-22080846)
chr6 (444-490)||(18461892-18461937)
chr6 (444-490)||(18821904-18821949)
chr6 (434-491)||(33443062-33443118)
chr6 (444-503)||(3852121-3852179)
chr6 (390-451)||(4668216-4668277)
chr6 (390-451)||(4675063-4675124)
chr6 (442-487)||(25688518-25688562)
chr6 (403-447)||(22080756-22080800)
chr6 (453-500)||(16448639-16448686)
chr6 (440-491)||(18199473-18199523)
chr6 (343-479)||(31155354-31155491)
chr6 (453-502)||(19862978-19863027)
chr6 (453-502)||(19873120-19873169)
chr6 (327-367)||(19847932-19847972)
[»] chr2 (64 HSPs)
chr2 (338-506)||(23071902-23072070)
chr2 (329-506)||(19671830-19672010)
chr2 (341-502)||(25175854-25176017)
chr2 (341-501)||(28405981-28406144)
chr2 (343-502)||(7679589-7679750)
chr2 (324-503)||(22105412-22105595)
chr2 (340-487)||(18786854-18787005)
chr2 (434-506)||(20309108-20309180)
chr2 (411-506)||(38141-38235)
chr2 (428-506)||(23103439-23103516)
chr2 (403-505)||(22134225-22134326)
chr2 (429-503)||(298859-298933)
chr2 (429-506)||(23060513-23060589)
chr2 (429-506)||(23285865-23285941)
chr2 (341-490)||(7685-7838)
chr2 (327-503)||(6725995-6726174)
chr2 (429-506)||(23076442-23076518)
chr2 (329-487)||(23708558-23708721)
chr2 (327-490)||(23207293-23207461)
chr2 (411-506)||(23654412-23654507)
chr2 (327-503)||(18808943-18809122)
chr2 (327-503)||(23130862-23131041)
chr2 (327-503)||(23133329-23133508)
chr2 (391-506)||(23660023-23660137)
chr2 (327-503)||(23709515-23709694)
chr2 (327-503)||(23711996-23712175)
chr2 (327-503)||(26505379-26505558)
chr2 (327-503)||(26507857-26508036)
chr2 (327-503)||(34402505-34402684)
chr2 (327-503)||(39682313-39682492)
chr2 (436-506)||(22731286-22731355)
chr2 (429-506)||(8946657-8946733)
chr2 (434-506)||(22337115-22337186)
chr2 (442-506)||(23040247-23040310)
chr2 (327-503)||(571397-571576)
chr2 (327-503)||(23135590-23135769)
chr2 (327-487)||(24367790-24367953)
chr2 (327-503)||(28577099-28577278)
chr2 (327-505)||(32214904-32215085)
chr2 (327-490)||(20520130-20520298)
chr2 (327-500)||(21155043-21155219)
chr2 (327-490)||(23791289-23791458)
chr2 (327-503)||(24898178-24898358)
chr2 (327-503)||(24900661-24900841)
chr2 (327-503)||(24903138-24903318)
chr2 (327-503)||(24905615-24905795)
chr2 (327-503)||(24908090-24908270)
chr2 (327-490)||(22413073-22413243)
chr2 (327-503)||(32039481-32039660)
chr2 (453-506)||(22738247-22738300)
chr2 (437-489)||(32451981-32452033)
chr2 (435-490)||(23004764-23004819)
chr2 (435-490)||(25108903-25108958)
chr2 (453-503)||(38967374-38967424)
chr2 (453-503)||(45029966-45030016)
chr2 (444-501)||(43137301-43137357)
chr2 (435-491)||(23287378-23287433)
chr2 (444-500)||(24643054-24643109)
chr2 (436-491)||(26392397-26392451)
chr2 (453-503)||(24529641-24529691)
chr2 (435-490)||(24697657-24697712)
chr2 (327-368)||(22173812-22173853)
chr2 (327-368)||(24642839-24642880)
chr2 (327-367)||(24529511-24529551)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (338-506)||(34123-34291)
scaffold0175 (453-506)||(273-326)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (338-490)||(6828-6980)
scaffold0556 (341-397)||(8127-8183)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (329-502)||(45732-45909)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (329-506)||(10481-10659)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (341-506)||(6535-6702)
scaffold0621 (329-487)||(8485-8650)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (341-502)||(100378-100541)
scaffold0023 (341-502)||(40128-40291)
scaffold0023 (433-506)||(119875-119948)
scaffold0023 (425-502)||(101503-101580)
scaffold0023 (327-503)||(94411-94590)
scaffold0023 (327-487)||(17423-17586)
scaffold0023 (444-503)||(44454-44512)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (329-506)||(22610-22788)
scaffold0037 (327-503)||(82072-82251)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (329-502)||(133-310)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (329-502)||(160688-160864)
scaffold0001 (327-487)||(501100-501263)
scaffold0001 (453-503)||(85692-85742)
scaffold0001 (327-367)||(85562-85602)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (341-502)||(19268-19431)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (329-487)||(129924-130086)
scaffold0010 (391-490)||(60721-60821)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (343-459)||(29238-29354)
scaffold0218 (327-487)||(8011-8176)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (341-506)||(6076-6244)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (341-487)||(5662-5810)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (338-437)||(2395-2494)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (341-487)||(62217-62362)
scaffold0028 (381-502)||(132662-132786)
scaffold0028 (327-503)||(136680-136859)
scaffold0028 (327-503)||(139149-139328)
scaffold0028 (327-503)||(144087-144266)
scaffold0028 (327-503)||(134211-134390)
scaffold0028 (327-503)||(141618-141797)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (332-506)||(12766-12944)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (391-502)||(2812-2923)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (341-506)||(987-1155)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (341-506)||(6611-6779)
scaffold0333 (341-506)||(13991-14159)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (341-502)||(2599-2762)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (341-502)||(14651-14814)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (341-487)||(10546-10695)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (327-487)||(1101-1265)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (403-506)||(23901-24001)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (341-487)||(32555-32703)
scaffold0034 (437-489)||(51936-51987)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (341-506)||(12942-13107)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (403-506)||(15795-15898)
scaffold0020 (453-487)||(178913-178947)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (327-506)||(11464-11648)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (327-506)||(38193-38377)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (436-506)||(1289-1359)
scaffold0106 (434-506)||(7266-7338)
scaffold0106 (437-503)||(15291-15356)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (414-506)||(51582-51672)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (434-506)||(16282-16354)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (415-490)||(1048-1123)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (391-505)||(3192-3306)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (391-506)||(3157-3271)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (434-505)||(174767-174838)
scaffold0021 (341-490)||(136321-136474)
scaffold0021 (341-490)||(145029-145182)
scaffold0021 (436-506)||(121766-121835)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (327-490)||(53486-53654)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (391-490)||(13144-13243)
scaffold0357 (391-487)||(16106-16202)
scaffold0357 (435-490)||(2677-2732)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (327-490)||(12584-12751)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (327-506)||(17964-18148)
scaffold0247 (453-487)||(2241-2275)
scaffold0247 (327-367)||(2111-2151)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (436-506)||(46995-47065)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (414-506)||(1080-1170)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (381-502)||(32102-32226)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (434-506)||(10472-10544)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (391-506)||(4849-4964)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (391-487)||(27755-27851)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (327-487)||(25125-25289)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (327-490)||(128907-129075)
scaffold0022 (391-490)||(78338-78438)
scaffold0022 (453-503)||(116430-116480)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (440-503)||(5183-5246)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (411-506)||(13497-13591)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (411-506)||(15490-15584)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (435-506)||(32067-32137)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (429-506)||(1093-1169)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (429-506)||(1952-2028)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (429-506)||(4712-4788)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (391-504)||(39479-39591)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (391-499)||(26071-26179)
scaffold0122 (391-503)||(44713-44825)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (391-504)||(75221-75333)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (429-506)||(168023-168099)
scaffold0011 (429-506)||(51913-51989)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (327-490)||(6220-6389)
scaffold0420 (440-490)||(13793-13843)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (415-503)||(38732-38820)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (429-505)||(17262-17337)
scaffold0056 (327-490)||(79267-79433)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (391-506)||(38761-38875)
scaffold0145 (411-506)||(32942-33036)
scaffold0145 (444-508)||(9744-9807)
scaffold0145 (327-367)||(9889-9929)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (411-506)||(32983-33077)
scaffold0120 (411-506)||(45928-46022)
scaffold0120 (429-506)||(16113-16189)
scaffold0120 (444-506)||(17389-17450)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (429-506)||(13211-13287)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (429-506)||(1851-1927)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (327-490)||(97021-97190)
scaffold0006 (327-490)||(106299-106468)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (327-503)||(20747-20926)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (327-503)||(37821-38000)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (411-506)||(39913-40007)
scaffold0080 (391-490)||(19889-19990)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (411-506)||(25896-25990)
scaffold0026 (411-506)||(39858-39952)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (327-503)||(158433-158612)
scaffold0003 (411-503)||(339975-340065)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (391-490)||(8065-8166)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (411-506)||(8559-8650)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (429-506)||(3470-3546)
scaffold0292 (429-506)||(343-419)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (422-502)||(28806-28887)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (327-490)||(20363-20527)
scaffold0031 (452-506)||(128751-128805)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (341-448)||(2172-2281)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (429-506)||(6166-6245)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (327-504)||(10772-10952)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (327-487)||(4710-4873)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (327-503)||(13392-13571)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (327-503)||(13947-14126)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (391-490)||(566-666)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (393-506)||(16608-16721)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (429-487)||(24348-24405)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (429-506)||(8479-8555)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (429-506)||(11488-11564)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (429-506)||(20910-20987)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (327-490)||(267676-267844)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (327-503)||(106-285)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (439-506)||(4888-4954)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (327-503)||(16784-16963)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (341-487)||(103591-103733)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (327-505)||(12232-12413)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (434-483)||(38339-38388)
scaffold0139 (453-502)||(19980-20029)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (327-500)||(4300-4476)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (327-504)||(9241-9421)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (434-490)||(2691-2747)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (444-503)||(22886-22944)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (327-487)||(29948-30111)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (327-503)||(40400-40579)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (444-490)||(11979-12024)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (327-503)||(12064-12237)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (327-503)||(161072-161252)
scaffold0007 (327-367)||(164573-164613)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (430-485)||(4545-4599)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (327-486)||(11305-11467)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (390-451)||(9133-9194)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (453-502)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (453-502)||(36454-36503)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (455-503)||(4214-4262)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (434-506)||(4508-4578)
scaffold0228 (434-506)||(12090-12160)
scaffold0228 (434-506)||(22042-22112)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (453-500)||(1393-1440)
scaffold0101 (327-367)||(1263-1303)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (327-372)||(143-189)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (391-490)||(1802-1903)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (435-485)||(206575-206624)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (437-502)||(10575-10639)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (453-502)||(69794-69843)


Alignment Details
Target: scaffold0184 (Bit Score: 472; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 506
Target Start/End: Original strand, 703 - 1190
Alignment:
Q  19 ttaacaggctaatgatgctaatacattaatcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagttttttggatagagttgc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  703 ttaacaggctaatgatgctaatacattaatcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagttttttggatagatttgc 802  T
Q  119 tacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatatt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  803 tacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcatcgaatatt 902  T
Q  219 tgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgattt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  903 tgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgattt 1002  T
Q  319 tgttcataatttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1003 tgttcataatttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattat 1102  T
Q  419 atcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1103 atcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 472; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 16495889 - 16495402
Alignment:
Q  19 ttaacaggctaatgatgctaatacattaatcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagttttttggatagagttgc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16495889 ttaacaggctaatgatgctaatacattaatcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagttttttggatagatttgc 16495790  T
Q  119 tacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatatt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16495789 tacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcatcgaatatt 16495690  T
Q  219 tgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgattt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495689 tgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgattt 16495590  T
Q  319 tgttcataatttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16495589 tgttcataatttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattat 16495490  T
Q  419 atcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495489 atcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 34200954 - 34200786
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34200954 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 34200855  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200854 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Original strand, 28505251 - 28505419
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28505251 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgctgatttatatccgatattattatatcatgatggtttgcatac 28505350  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28505351 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Original strand, 11995980 - 11996148
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11995980 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgatatttgagttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatac 11996079  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11996080 tgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 326 - 506
Target Start/End: Original strand, 15754827 - 15755008
Alignment:
Q  326 aatttgatgttg-ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15754827 aatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcgatattattatatcatg 15754926  T
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15754927 atggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 67911 - 67745
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||   ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  67911 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 67814  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67813 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 341 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 44014342 - 44014182
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgc 440  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  44014342 taatggtatataactgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 44014244  T
Q  441 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  44014243 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Original strand, 16219670 - 16219835
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  || || |||||||   || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16219670 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 16219769  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  16219770 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 341 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18005813 - 18005650
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  18005813 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatac 18005715  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18005714 tgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 341 - 502
Target Start/End: Original strand, 811084 - 811248
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||  | |||| ||   || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  811084 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 811183  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  811184 tgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 327 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 13647508 - 13647325
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  13647508 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 13647409  T
Q  423 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13647408 tgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 47831975 - 47831807
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||  ||  | |||||||   || ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  47831975 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatac 47831876  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47831875 tgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 341 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 16056495 - 16056347
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||| |||||||||| || ||||||||     
T  16056495 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttgcataa 16056397  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056396 tgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22073083 - 22072913
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcat 435  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || ||||  |||||   ||||||| ||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  22073083 taatgttatataattgcatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 22072984  T
Q  436 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  22072983 agtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 391 - 487
Target Start/End: Original strand, 2280125 - 2280221
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280125 gttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2280221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 20220127 - 20220293
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatga 425  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| ||||||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  20220127 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 20220226  T
Q  426 --tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
      || |||   |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20220227 actgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatg 20220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 436 - 506
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847951
Alignment:
Q  436 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Original strand, 3564370 - 3564482
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3564370 gttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3564468  T
Q  490 gttgaagatgatga 503  Q
    | ||||||||||||    
T  3564469 gatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 16386292 - 16386369
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16386292 tttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 435 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 40443462 - 40443393
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 504  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443462 tactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 38227595 - 38227481
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  38227595 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtag 38227497  T
Q  491 ttgaagatgatgatgt 506  Q
     |||||||||||||||    
T  38227496 atgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 327 - 506
Target Start/End: Original strand, 19486681 - 19486865
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataatt---ga-gttgttgatttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||| |||||||||||    
T  19486681 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 19486780  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  19486781 atgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 12698907 - 12698831
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12698907 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 327 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 18430891 - 18430709
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  18430891 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18430792  T
Q  423 tgatggtttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||| |||   ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18430791 tgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 405 - 506
Target Start/End: Original strand, 10063838 - 10063939
Alignment:
Q  405 ttcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 504  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| || ||||    
T  10063838 ttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgat 10063937  T
Q  505 gt 506  Q
    ||    
T  10063938 gt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 9509260 - 9509189
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9509260 atactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Original strand, 18456419 - 18456530
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  491 ttgaagatgatga 503  Q
     | ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 456500 - 456321
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  456500 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 456401  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  456400 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11972675 - 11972496
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  11972675 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 11972576  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11972575 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 14949105 - 14949284
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  14949105 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 14949204  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14949205 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 15376696 - 15376875
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  15376696 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 15376795  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15376796 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16232699 - 16232520
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  16232699 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16232600  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16232599 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 20385106 - 20385285
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  20385106 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 20385205  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20385206 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 21189578 - 21189757
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  21189578 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 21189677  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21189678 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 24702417 - 24702238
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  24702417 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 24702318  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24702317 tgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 32125670 - 32125491
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  32125670 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 32125571  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32125570 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 41523096 - 41522917
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  41523096 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41522997  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41522996 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 41525558 - 41525379
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  41525558 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41525459  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41525458 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 502
Target Start/End: Original strand, 11393270 - 11393448
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  11393270 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 11393369  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  11393370 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17062077
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | | | ||||||||   ||| ||| || |||| || |||||||| |||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtca 17061997  T
Q  423 tgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || |  |||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17061998 tgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 10589115 - 10589039
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  10589115 tttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 341 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 12901492 - 12901342
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataat-tga-gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcata 436  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||  | ||| |||| || ||| |||| || ||| |||||||||||  |  |||| |||    
T  12901492 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtatgatgttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtata 12901393  T
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901392 ctgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18640451 - 18640272
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  18640451 attttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18640352  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18640351 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 24704864 - 24704688
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| ||     
T  24704864 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 24704765  T
Q  423 tgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || |  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24704764 tgtt--tttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 27217039 - 27216860
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  27217039 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 27216940  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  27216939 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116509
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| | ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 44116589  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44116588 tgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 26212072 - 26211995
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26212072 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Original strand, 1867932 - 1868097
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttg---atttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| || ||| ||||||||    
T  1867932 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatca 1868030  T
Q  423 tga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868031 tgagctgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 48273504 - 48273392
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  48273504 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 48273406  T
Q  490 gttgaagatgatga 503  Q
    | | ||||||||||    
T  48273405 gattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 484
Target Start/End: Original strand, 12255821 - 12255892
Alignment:
Q  415 ttatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 484  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255821 ttatatcatgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 15008436 - 15008604
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  15008436 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatca 15008534  T
Q  423 tga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||  || |||  ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15008535 tgaactgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 15008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16410238 - 16410059
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  16410238 atttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16410139  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16410138 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 435 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044765
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14044765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 435 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354795
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14354795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386333
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16213742 - 16213684
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16213742 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869346
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 24275282 - 24275187
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275282 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 487
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144139
Alignment:
Q  443 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15144139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 48991252 - 48991196
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48991252 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatg 48991196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 435 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 478  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 435 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 478  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13831423 - 13831373
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  13831423 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 487
Target Start/End: Original strand, 18154894 - 18154943
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18154894 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 18154943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 491
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177772
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 491  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgt 9177772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 487
Target Start/End: Original strand, 38898489 - 38898523
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38898489 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 38898523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 368
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756695
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattac 368  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac 12756695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 502
Target Start/End: Original strand, 19649557 - 19649606
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19649557 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 453 - 505
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 505  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14044917 - 14044857
Alignment:
Q  340 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| ||||||||    
T  14044917 ataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgatt 14044857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14354947 - 14354887
Alignment:
Q  340 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| ||||||||    
T  14354947 ataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgatt 14354887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Original strand, 15081932 - 15081972
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacatta 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  15081932 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 15081972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 469; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 506
Target Start/End: Original strand, 14295184 - 14295672
Alignment:
Q  19 ttaacaggctaatgatgctaatacattaatcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagtttt-ttggatagagttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14295184 ttaacaggctaatgatgctaatacattaatcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagtttttttggatagagttg 14295283  T
Q  118 ctacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295284 ctacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatat 14295383  T
Q  218 ttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgatt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295384 ttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgatt 14295483  T
Q  318 ttgttcataatttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattatta 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14295484 ttgttcataatttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattatta 14295583  T
Q  418 tatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295584 tatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 51131052 - 51130632
Alignment:
Q  19 ttaacaggctaatgatgctaatacattaatcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagtttttt-ggatagagttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51131052 ttaacaggctaatgatgctaatacattaatcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagtttttttggatagagttg 51130953  T
Q  118 ctacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51130952 ctacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatat 51130853  T
Q  218 ttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgatt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51130852 ttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgatt 51130753  T
Q  318 ttgttcataatttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattatta 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51130752 ttgttcataatttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattatta 51130653  T
Q  418 tatcatgatggtttgcatact 438  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  51130652 tatcatgatggtttgcatact 51130632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 20918782 - 20918623
Alignment:
Q  329 ttgatgttg-ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatg 427  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20918782 ttgatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg 20918683  T
Q  428 gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918682 gtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 338 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 20248447 - 20248283
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20248447 ttataatgatatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 20248348  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20248347 tgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 327 - 453
Target Start/End: Original strand, 22130848 - 22130975
Alignment:
Q  327 atttgatgttg-ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatga 425  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22130848 atttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatga 22130947  T
Q  426 tggtttgcatactgcctatgttgctgtt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22130948 tggtttggatactgcctatgttgctgtt 22130975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 329 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 33681188 - 33681010
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||||    || ||||||| ||| ||||||||||    
T  33681188 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatg 33681089  T
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681088 atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 341 - 502
Target Start/End: Original strand, 22921823 - 22921986
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||| ||||   ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22921823 taatgttatataattgtatatacattatatgaattttgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 22921921  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22921922 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 329 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22237808 - 22237630
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||| ||| ||||||||||    
T  22237808 ttgatgttgtttctaaagttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 22237709  T
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22237708 atgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 329 - 506
Target Start/End: Original strand, 52927922 - 52928088
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatg 427  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||         |||||| ||| |||||||||||||    
T  52927922 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg---------attcgatattgttatatcatgatg 52928012  T
Q  428 gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  52928013 atttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 35261018 - 35261183
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||| || ||| |  ||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||||    
T  35261018 atttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 35261117  T
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261118 ctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 327 - 506
Target Start/End: Original strand, 45574825 - 45575008
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | | | ||||||||   ||||||| || |||| |  |||||||| |||    
T  45574825 atttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtca 45574924  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45574925 tgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 354 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21754198 - 21754064
Alignment:
Q  354 ttgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat--ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctg 451  Q
    |||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||| ||||| |  || |||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21754198 ttgtatatacattaaatggattatgt-tgataattgagatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttg 21754100  T
Q  452 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754099 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21754064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 21896193 - 21896361
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | ||| |  ||||| |||||||   || |||| || ||| |||||||    
T  21896193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 21896292  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21896293 atgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 430 - 506
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801508
Alignment:
Q  430 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 330 - 490
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861675
Alignment:
Q  330 tgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||| |  ||||| |||||||   || |||| || ||| ||||||||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21861610 ctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaagatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 415 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 16758742 - 16758668
Alignment:
Q  415 ttatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16758742 ttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 435 - 506
Target Start/End: Original strand, 20847205 - 20847275
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20847205 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 391 - 505
Target Start/End: Original strand, 50210219 - 50210333
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50210219 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 50210317  T
Q  490 gttgaagatgatgatg 505  Q
    | ||||||||||||||    
T  50210318 gatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 27250774 - 27250850
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27250774 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 34509856 - 34509783
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  34509856 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 21026756 - 21026680
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21026756 tttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13989045 - 13988866
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  13989045 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 13988946  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13988945 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 21923274 - 21923453
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  21923274 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 21923373  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21923374 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Original strand, 22123050 - 22123214
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  22123050 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtca 22123149  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    || |  ||| | ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123150 tgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Original strand, 50614121 - 50614222
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 488  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614121 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 50614220  T
Q  489 tg 490  Q
    ||    
T  50614221 tg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Original strand, 50621949 - 50622050
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 488  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621949 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 50622048  T
Q  489 tg 490  Q
    ||    
T  50622049 tg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 21840946 - 21840766
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| | | |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  21840946 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 21840847  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 504  Q
    ||||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  21840846 tgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 21475070 - 21475249
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  21475070 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 21475169  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  21475170 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 29776867 - 29776688
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  29776867 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 29776768  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || |  ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29776767 tgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Original strand, 16368291 - 16368391
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 488  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368291 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 16368389  T
Q  489 tg 490  Q
    ||    
T  16368390 tg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22532345 - 22532269
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  22532345 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 505
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 505  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 331 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 50686792 - 50686627
Alignment:
Q  331 gatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgat 426  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||     
T  50686792 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaa 50686693  T
Q  427 ggtttgcat--actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
       ||  ||  |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50686692 ctattttatgaactgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatg 50686627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 433190 - 433012
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| || |||||||| ||    
T  433190 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 433091  T
Q  422 atgatg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
     |||||  |||| ||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  433090 ttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 29298315 - 29298137
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  29298315 atttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tca 29298217  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29298216 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 31612492 - 31612313
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||| ||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  31612492 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 31612393  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31612392 tgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Original strand, 41050040 - 41050141
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 488  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050040 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaaga 41050139  T
Q  489 tg 490  Q
    ||    
T  41050140 tg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213027
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21161831 - 21161720
Alignment:
Q  390 agttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    ||||| ||| || ||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| |    
T  21161831 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgttt-tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagtt 21161733  T
Q  490 gttgaagatgatg 502  Q
    | ||| |||||||    
T  21161732 gatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342090
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 23593717 - 23593897
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| ||    
T  23593717 atttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 23593816  T
Q  422 atgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23593817 atgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346961
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707167
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711709
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 488
Target Start/End: Original strand, 16093836 - 16093988
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttg----atttacattcgacattattatatcatga--tggtttgca 434  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||    |||| |||| || ||| |||||||||||  || |||  |    
T  16093836 taatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatgagctgttttcta 16093934  T
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 488  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16093935 tactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaaga 16093988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 509
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860177
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 435 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064954
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatg 26064954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361915
Alignment:
Q  455 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 453 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714546
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 505
Target Start/End: Original strand, 22468749 - 22468816
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 505  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  22468749 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Original strand, 16275476 - 16275526
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16275476 ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 491
Target Start/End: Original strand, 21533948 - 21533978
Alignment:
Q  461 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533948 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21533978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13212884
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacatta 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 13212884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 20637017 - 20636985
Alignment:
Q  340 ataatgttatataattgtatatacattacatga 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20637017 ataatgttatataattgtatatacattatatga 20636985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21347101
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacatta 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 21347101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 453 - 505
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 505  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 36315040 - 36314678
Alignment:
Q  19 ttaacaggctaatgatgctaatacattaatcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagtttttt--ggatagagtt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36315040 ttaacaggctaatgatgctaatacattaatcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagttttttttggatagagtt 36314941  T
Q  117 gctacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314940 gctacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaata 36314841  T
Q  217 tttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314840 tttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgat 36314741  T
Q  317 tttgttcataatttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314740 tttgttcataatttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagt 36314678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Original strand, 19660788 - 19660956
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  19660788 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttatattcgatatcattatatcaagatggtttgcatac 19660887  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660888 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 337 - 502
Target Start/End: Original strand, 22959484 - 22959649
Alignment:
Q  337 gttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcata 436  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22959484 gttaaaatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcata 22959583  T
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22959584 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 329 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 19669076 - 19668898
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatg 427  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  19669076 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacaggacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatg 19668977  T
Q  428 gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19668976 atttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 329 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21565723 - 21565546
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||  |||||||   || ||||||| ||| ||||||||||    
T  21565723 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 21565624  T
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21565623 atgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 405 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314577
Alignment:
Q  405 ttcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 36314579  T
Q  505 gt 506  Q
    ||    
T  36314578 gt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Original strand, 21329450 - 21329618
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||  | |||||||   ||  |||||| ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  21329450 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatac 21329549  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21329550 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 343 - 487
Target Start/End: Original strand, 26011990 - 26012137
Alignment:
Q  343 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactg 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||   ||||||||| ||||| || ||| |||||||||| || |||||||||||    
T  26011990 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactg 26012089  T
Q  440 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012090 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Original strand, 21502109 - 21502277
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  || || || ||||   || ||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||    
T  21502109 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatac 21502208  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21502209 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 332 - 490
Target Start/End: Original strand, 20026883 - 20027046
Alignment:
Q  332 atgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataat-tga-gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--t 426  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||  | ||| |||||||| || |||| || |||||||||||||||  |    
T  20026883 atgttgttgataatgctatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaact 20026982  T
Q  427 ggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026983 gttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 21729109 - 21729185
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21729109 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 21808434 - 21808510
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21808434 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 435 - 506
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293090
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22144164 - 22144065
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||||||||||| || | || ||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144164 gttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 327 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 40726037 - 40725853
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataatt---ga-gttgttgatttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||| |||||||||||    
T  40726037 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 40725938  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  40725937 atgatgctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 8286888 - 8286964
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8286888 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 21997579 - 21997655
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21997579 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 434 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 37723975 - 37723910
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 499  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37723975 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 24493683 - 24493569
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  24493683 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 24493585  T
Q  491 ttgaagatgatgatgt 506  Q
     |||||||||||||||    
T  24493584 atgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 23390541 - 23390617
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23390541 tttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 25421608 - 25421532
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25421608 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 1096582 - 1096467
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||| | ||| || ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1096582 gttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1096484  T
Q  490 gttgaagatgatgatgt 506  Q
    | |||||||| ||||||    
T  1096483 gatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 264751 - 264930
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  264751 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 264850  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  264851 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 13025425 - 13025311
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || || | ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  13025425 gttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 13025327  T
Q  491 ttgaagatgatgatgt 506  Q
     |||||||||||||||    
T  13025326 atgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 13095609 - 13095495
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || || | ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  13095609 gttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 13095511  T
Q  491 ttgaagatgatgatgt 506  Q
     |||||||||||||||    
T  13095510 atgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20909191 - 20909012
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  20909191 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 20909092  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20909091 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 29330113 - 29329934
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  29330113 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 29330014  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29330013 tgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 39363563 - 39363384
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  39363563 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 39363464  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39363463 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 429 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 24529296 - 24529223
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24529296 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 9078023 - 9077952
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  9078023 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 331 - 490
Target Start/End: Original strand, 22178161 - 22178326
Alignment:
Q  331 gatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatga- 425  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||| | |||||||||     
T  22178161 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgag 22178260  T
Q  426 -tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
     || |||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22178261 ctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 10732923 - 10733102
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  10732923 atttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 10733022  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10733023 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 42245348 - 42245527
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  42245348 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 42245447  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  42245448 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22075095 - 22075018
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 506  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22075095 tttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 329 - 503
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581361
Alignment:
Q  329 ttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    ||| ||||||||   || |||| || |||| || |||||||| |||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 11581283  T
Q  425 atggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
     || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11581284 ttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22412298 - 22412187
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T
Q  491 ttgaagatgatga 503  Q
     | ||||||||||    
T  22412199 attaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 29346159 - 29345980
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  29346159 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 29346060  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29346059 tgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154942
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 36154865  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||| | |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  36154866 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Original strand, 20901991 - 20902155
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga--taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatc 421  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||| |||  | |||  ||||||||   ||||||| || || | || |||||||| ||    
T  20901991 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 20902090  T
Q  422 atgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902091 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 25431470 - 25431414
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 486  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431470 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 503
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918110
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 29348632 - 29348453
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  29348632 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 29348533  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29348532 tgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 29351105 - 29350926
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  29351105 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 29351006  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29351005 tgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 39245194 - 39245136
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39245194 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154776
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 503
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775838
Alignment:
Q  455 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 32027572 - 32027393
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| ||  ||| || |||||||| |||    
T  32027572 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtca 32027473  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32027472 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796434
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 491  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 15796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740750
Alignment:
Q  436 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 26740750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 31061118 - 31061068
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31061118 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 436 - 485
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  436 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 485  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 500
Target Start/End: Original strand, 18319146 - 18319193
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  18319146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469818
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 491  Q
    |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatatt-aattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 23469818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704090
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973823
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26973823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 460 - 490
Target Start/End: Original strand, 27989004 - 27989034
Alignment:
Q  460 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989004 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 27989034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Original strand, 2154596 - 2154636
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacatta 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  2154596 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 2154636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 341 - 397
Target Start/End: Original strand, 21741486 - 21741541
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||    
T  21741486 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg 21741541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 418 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 22032406 - 22032323
Alignment:
Q  418 tatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  22032406 tatcatgattgtttgtaatctgcctatgttgctatt-gttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30824 - 30474
Alignment:
Q  19 ttaacaggctaatgatgctaatacattaatcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagtttttt-ggatagagttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  30824 ttaacaggctaatgatgctaatacattaatcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtattttttttggatagagttg 30725  T
Q  118 ctacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30724 ctacactagtaattatttacgtgtcgtggctaatttcaaataggttataaacttagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatat 30625  T
Q  218 ttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgatt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  30624 ttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttatgtgatt 30525  T
Q  318 ttgttcataatttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacatta 367  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30524 ttgttcatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 30474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 86)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 19 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28195175 - 28194693
Alignment:
Q  19 ttaacaggctaatgatgctaatacattaatcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagtt-ttttggatagagttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  28195175 ttaacaggctaatgatgctaatacattaatcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacactagtatttgttttggatagagttg 28195076  T
Q  118 ctacactagtaattatttacgtgtcttggctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28195075 ctacactagtaattatttacgtgtcgtggctaatttcaaataggttataaactgagtatacttctaaaggattatatgcatatgtatgagcaccgaatat 28194976  T
Q  218 ttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgatt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  28194975 ttgctgctattttggccgaaagaatatattaaaatt---------aatgtttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgttt 28194885  T
Q  318 ttgttcataatttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttg----ttgatttacattcgacat 412  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||  ||| |||  |   ||  || |||||    ||||||   ||| |||||    
T  28194884 ttgttcatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacat 28194785  T
Q  413 tattatatcatga-tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    | ||||||| |||   ||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28194784 tgttatatcttgagatgtttatgtgctgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Original strand, 13210280 - 13210448
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13210280 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 13210379  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210380 tgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 338 - 502
Target Start/End: Original strand, 12174212 - 12174376
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12174212 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgttttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 12174311  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12174312 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 15471092 - 15470927
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||| |||||||   || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15471092 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 15470993  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  15470992 tgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 329 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16097509 - 16097332
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||| ||| |||||| |||    
T  16097509 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatg 16097410  T
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16097409 atgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 329 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16103960 - 16103784
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat--ttacattcgacattattatatcatga 425  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||| |  || ||||||| ||| |||||||||||    
T  16103960 ttgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatga 16103861  T
Q  426 tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16103860 tgatttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 14234655 - 14234487
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||  | |||||||   || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14234655 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 14234556  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||||    
T  14234555 tgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 403 - 502
Target Start/End: Original strand, 49668094 - 49668193
Alignment:
Q  403 cattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49668094 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 381 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 9513044 - 9512924
Alignment:
Q  381 tgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 480  Q
    |||||| |||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9513044 tgataaatgagatgttgattg-cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcg 9512946  T
Q  481 gtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  9512945 gtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 381 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 9521019 - 9520899
Alignment:
Q  381 tgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 480  Q
    |||||| |||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9521019 tgataaatgagatgttgattg-cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcg 9520921  T
Q  481 gtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  9520920 gtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 354 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 32307830 - 32307696
Alignment:
Q  354 ttgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat--ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctg 451  Q
    |||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||| ||||| |  || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32307830 ttgtatatacattaaatggattatgt-tgataattgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 32307732  T
Q  452 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307731 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32307696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 327 - 506
Target Start/End: Original strand, 43550461 - 43550644
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  43550461 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 43550560  T
Q  423 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    || ||  |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43550561 tgttgtttttgcatactgcatatgttgctg-tcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 490
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523834
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcat 423  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| |  |||||   |||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  424 ga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523766 gaactgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 327 - 506
Target Start/End: Original strand, 24340660 - 24340844
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgatt---tacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||| ||||| ||   | | ||||| |||||||||||    
T  24340660 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 24340759  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340760 atgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 12399324 - 12399209
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12399324 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12399226  T
Q  490 gttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||    
T  12399225 gttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 327 - 506
Target Start/End: Original strand, 37642202 - 37642386
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataatt---ga-gttgttgatttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||| |||||||||||    
T  37642202 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 37642301  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  37642302 atgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 14972969 - 14972854
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14972969 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14972871  T
Q  490 gttgaagatgatgatgt 506  Q
    | |||||||||||||||    
T  14972870 gatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 18438649 - 18438534
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| || |||| || |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18438649 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 18438551  T
Q  490 gttgaagatgatgatgt 506  Q
    | |||||||||||||||    
T  18438550 gatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 383 - 506
Target Start/End: Original strand, 11424758 - 11424880
Alignment:
Q  383 ataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 482  Q
    ||||||||| ||||||||| |  | || ||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11424758 ataattgagatgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 11424856  T
Q  483 ctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||| || |||||||||||||||    
T  11424857 ctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 416 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 27165337 - 27165250
Alignment:
Q  416 tatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  27165337 tatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 405 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 23274788 - 23274706
Alignment:
Q  405 ttcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274788 ttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 20698480 - 20698556
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20698480 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 327 - 502
Target Start/End: Original strand, 37251105 - 37251283
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  37251105 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 37251203  T
Q  423 tga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37251204 tgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 415 - 503
Target Start/End: Original strand, 53301581 - 53301669
Alignment:
Q  415 ttatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53301581 ttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 7781330 - 7781509
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   |||||||||| |||| || |||||||| |||    
T  7781330 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 7781429  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7781430 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 13442350 - 13442274
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13442350 tttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 23083406 - 23083482
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23083406 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 9707590 - 9707769
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| ||  ||| || |||||||| |||    
T  9707590 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtca 9707689  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  9707690 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 17463357 - 17463178
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  17463357 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 17463258  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17463257 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 34159505 - 34159326
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  34159505 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 34159406  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34159405 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 45606890 - 45607069
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  45606890 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 45606989  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45606990 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 55476670 - 55476491
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  55476670 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 55476571  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  55476570 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 43926075 - 43925974
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 488  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926075 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 43925976  T
Q  489 tg 490  Q
    ||    
T  43925975 tg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 501
Target Start/End: Original strand, 16282794 - 16282971
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || ||||| | |||||||| |||    
T  16282794 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtca 16282893  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 501  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16282894 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 17487932 - 17487856
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17487932 tttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 17499414 - 17499338
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17499414 tttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 26686963 - 26686887
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  26686963 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 13544204 - 13544024
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  13544204 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 13544105  T
Q  423 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 504  Q
    |||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  13544104 tgatgtttttgtatattg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 411 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 14572683 - 14572608
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572683 attattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 14572608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 490
Target Start/End: Original strand, 22110358 - 22110457
Alignment:
Q  393 tgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||||||||| |||| || ||| |||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110358 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Original strand, 24153215 - 24153326
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  491 ttgaagatgatga 503  Q
     | ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 6469117 - 6469296
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| | | |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  6469117 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 6469216  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6469217 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 8899273 - 8899094
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  8899273 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 8899174  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  8899173 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 12567739 - 12567576
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  12567739 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 12567640  T
Q  423 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||  |||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567639 tgatgtttttgtatattg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12567576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 16454264 - 16454443
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  16454264 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16454363  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16454364 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672626
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||  ||| |||  | ||| ||||||||   |||||||||| |||| || |||||||| |||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 17672706  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17672705 tgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 28848594 - 28848773
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  28848594 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 28848693  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28848694 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 503
Target Start/End: Original strand, 29172562 - 29172745
Alignment:
Q  324 ataatttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgacattattat 418  Q
    |||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| || ||||||||    
T  29172562 ataatttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 29172661  T
Q  419 atcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
     ||||| ||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29172662 gtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Original strand, 38961874 - 38962037
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  38961874 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 38961973  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961974 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38962037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 50243001 - 50242838
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   |||||||||| |||| || |||||||| |||    
T  50243001 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 50242902  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    || || ||| | ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242901 tgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50242838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147646
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataatt---ga-gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgc 433  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 22147573  T
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  22147574 ataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070802
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| ||     
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 53070735  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    || || ||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070736 tgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53070802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 13151773 - 13151953
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  13151773 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 13151872  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13151873 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 13154238 - 13154418
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  13154238 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 13154337  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13154338 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Original strand, 25476391 - 25476506
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  25476391 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 25476489  T
Q  490 gttgaagatgatgatgt 506  Q
    | |||||||||||||||    
T  25476490 gatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 36166708 - 36166598
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36166708 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 36166611  T
Q  491 ttgaagatgatga 503  Q
     | ||||||||||    
T  36166610 attaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 10247706 - 10247885
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  10247706 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 10247805  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10247806 tgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 42386486 - 42386429
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386486 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 490
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606431
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatg 606431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 12378038 - 12377938
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 488  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12378038 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaaga 12377939  T
Q  489 t 489  Q
    |    
T  12377938 t 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 43841008 - 43840932
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||    
T  43841008 tttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 41124066 - 41123892
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  41124066 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41123967  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 501  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  41123966 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 487
Target Start/End: Original strand, 1644693 - 1644775
Alignment:
Q  404 attcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  1644693 attcgatattgttatataatgatgatttgcatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagcaacataagttggtctaag 1644775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15977573 - 15977515
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15977573 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 17446638 - 17446816
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| | |  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  17446638 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 17446737  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  17446738 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737236
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 55501000 - 55500942
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  55501000 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499518
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412429
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Original strand, 40213727 - 40213838
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| |||||||| || || ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  40213727 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 40213824  T
Q  490 gttgaagatgatga 503  Q
    | | ||||||||||    
T  40213825 gattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 397
Target Start/End: Original strand, 49389570 - 49389639
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttg 397  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||    
T  49389570 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatgaattatgtttgatagttgagatgttg 49389639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21618559 - 21618465
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618559 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21618465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Original strand, 12119837 - 12119887
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12119837 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494809
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 487
Target Start/End: Original strand, 14576882 - 14576934
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14576882 atactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgaatgagtcggtctaag 14576934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919344
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 491  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 13919344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 856204 - 856140
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  856204 ctgcctatgttgctatt-gttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 397
Target Start/End: Original strand, 1465363 - 1465419
Alignment:
Q  340 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttg 397  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||    
T  1465363 ataatgttatacaattgtatatacattacatgaattatgt-tgatatttgagatgttg 1465419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 502
Target Start/End: Original strand, 15878119 - 15878168
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15878119 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 502
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||| | |||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119747
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacatta 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 12119747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 453 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 505  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 453 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 505  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248264
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacatta 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 17248264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Original strand, 5866227 - 5866395
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5866227 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 5866326  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866327 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 21491163 - 21490995
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21491163 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatac 21491064  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491063 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 17141084 - 17140916
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17141084 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatac 17140985  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17140984 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 21249553 - 21249384
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  21249553 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatac 21249454  T
Q  438 tgcctatgttgct-gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249453 tgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 21255391 - 21255222
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  21255391 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatac 21255292  T
Q  438 tgcctatgttgct-gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21255291 tgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Original strand, 38855205 - 38855372
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38855205 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 38855303  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  38855304 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 6520535 - 6520368
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||  | |||||||   || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6520535 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgt-tgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 6520437  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6520436 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Original strand, 23760798 - 23760962
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   ||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  23760798 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttacatac 23760896  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760897 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 341 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21285765 - 21285616
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||  ||||   ||||||||||| |||| || ||| |||||||||| || |||||||||    
T  21285765 taatgatatataattgtatatacattacatgaactatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatac 21285666  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21285665 tgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaag 21285616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Original strand, 16199671 - 16199765
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199671 attattatgtcatgttg-tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 332 - 487
Target Start/End: Original strand, 983348 - 983508
Alignment:
Q  332 atgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataat-tga-gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--t 426  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| || ||||  | ||| |||||||| || |||| || ||| |||||||||||  |    
T  983348 atgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaact 983447  T
Q  427 ggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983448 tgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 329 - 502
Target Start/End: Original strand, 26355640 - 26355815
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat--ttacattcgacattattatatcatga 425  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   || || ||||   |||| ||||| |  || ||||||| ||| ||||||| |||    
T  26355640 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatggaatatgt-tgatggctgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcgtga 26355738  T
Q  426 tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26355739 tgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Original strand, 21396029 - 21396101
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396029 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Original strand, 21790522 - 21790594
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790522 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 341 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21673871 - 21673723
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||  | ||||| |||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||     
T  21673871 taatggtatataattgtatatacattaaataaattatat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataa 21673773  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaag 21673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22626850 - 22626736
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22626850 gttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22626752  T
Q  491 ttgaagatgatgatgt 506  Q
     |||||||||||||||    
T  22626751 atgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 31971351 - 31971257
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31971351 attattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612231
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataatt---ga-gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgc 433  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 17612158  T
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Original strand, 21389499 - 21389571
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389499 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Original strand, 21778825 - 21778897
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778825 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 383 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6759381 - 6759255
Alignment:
Q  383 ataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 481  Q
    ||||||||| |||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6759381 ataattgagatgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 6759283  T
Q  482 tctaagatgttgaagatgatgatgtcca 509  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||    
T  6759282 tctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 327 - 499
Target Start/End: Original strand, 13508022 - 13508199
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgatt---tacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||| ||||| ||   | | ||||| |||||||||||    
T  13508022 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13508121  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 499  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13508122 atgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 435 - 506
Target Start/End: Original strand, 45131047 - 45131117
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131047 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 21919045 - 21919121
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21919045 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 37116532 - 37116363
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  37116532 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 37116433  T
Q  423 tga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||  || |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116432 tgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 327 - 499
Target Start/End: Original strand, 13597554 - 13597731
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataatt---ga-gttgttgatttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||  |||   || |||||| | || | ||||| |||||||||||    
T  13597554 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13597653  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 499  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13597654 atgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 391 - 505
Target Start/End: Original strand, 28649050 - 28649164
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28649050 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28649148  T
Q  490 gttgaagatgatgatg 505  Q
    | ||||||||||||||    
T  28649149 gatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Original strand, 18818417 - 18818530
Alignment:
Q  393 tgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 491  Q
    |||||| ||||| | || |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  18818417 tgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18818515  T
Q  492 tgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||    
T  18818516 tgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 20498746 - 20498578
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||| |  ||||| |||||||   || |||| || ||| |||||||    
T  20498746 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 20498647  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20498646 atgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 7372854 - 7372778
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7372854 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 18879276 - 18879352
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18879276 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 23406455 - 23406379
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23406455 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Original strand, 16092348 - 16092463
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16092348 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16092446  T
Q  490 gttgaagatgatgatgt 506  Q
    | |||||||||||||||    
T  16092447 gatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 14409427 - 14409606
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  14409427 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 14409526  T
Q  423 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || ||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14409527 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 436 - 506
Target Start/End: Original strand, 21923980 - 21924049
Alignment:
Q  436 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21923980 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 20536284 - 20536208
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20536284 tttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 1484581 - 1484402
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  1484581 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 1484482  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1484481 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 5853275 - 5853454
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  5853275 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 5853374  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5853375 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 15203214 - 15203393
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| ||||||| || |||||||| |||    
T  15203214 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtca 15203313  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  15203314 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20403406 - 20403227
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  20403406 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 20403307  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20403306 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22001932 - 22001753
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  22001932 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 22001833  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22001832 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22875179 - 22875065
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22875179 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattg 22875081  T
Q  491 ttgaagatgatgatgt 506  Q
     |||||||||||||||    
T  22875080 atgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 17266930 - 17267099
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  17266930 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 17267029  T
Q  423 tgat--ggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||   | |||   |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267030 tgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Original strand, 16413299 - 16413462
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  16413299 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16413398  T
Q  423 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    || ||  |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413399 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16413462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 20046178 - 20046357
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | | | ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  20046178 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 20046277  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20046278 tgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 435 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598188
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41598268  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||| | | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41598267 tgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 490
Target Start/End: Original strand, 17439457 - 17439612
Alignment:
Q  340 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgca 434  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||| |||||||||||  || |||       
T  17439457 ataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatg 17439556  T
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatg 17439612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 490
Target Start/End: Original strand, 19154936 - 19154992
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19154936 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 19154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 4483459 - 4483281
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  4483459 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 4483360  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4483359 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 503
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542535
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 490
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801530
Alignment:
Q  329 ttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || | || || |||||||| |||||    
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatg 19801466  T
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
     || |||| ||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801467 ctgttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatg 19801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896265
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225409
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 509
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070574
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 26219767 - 26219733
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219767 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 26219733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 487
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290841
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 491
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502207
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 491  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgtt-gtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 20502207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484430
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 325 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26224100 - 26224058
Alignment:
Q  325 taatttgatgttgttataatgttatataattgtatatacatta 367  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  26224100 taatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 26224058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 368
Target Start/End: Original strand, 4542356 - 4542397
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattac 368  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  4542356 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattac 4542397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19896447 - 19896398
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgactta 376  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  19896447 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatta 19896398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 368
Target Start/End: Original strand, 24486027 - 24486068
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattac 368  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  24486027 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac 24486068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 32810110 - 32810069
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattac 368  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  32810110 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac 32810069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 435 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525573
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 491  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22525573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 11460 - 11292
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11460 ttataatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 11361  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11360 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 2165 - 1997
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2165 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 2066  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2065 tgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 28490 - 28414
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28490 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 450 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  450 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 15551985 - 15551817
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15551985 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggattgcatac 15551886  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551885 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 338 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16596816 - 16596686
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16596816 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgatgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 16596717  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 468  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596716 tacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Original strand, 39706242 - 39706409
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||  | |||| ||   || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39706242 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgt-tgatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 39706340  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706341 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 341 - 487
Target Start/End: Original strand, 12288162 - 12288312
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataat-tga-gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcata 436  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||  | ||| |||||||| || |||| || ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  12288162 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcata 12288261  T
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288262 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 354 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 12774160 - 12774011
Alignment:
Q  354 ttgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat--ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctg 451  Q
    |||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||| ||||| |  ||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12774160 ttgtatatacattaaatggattatgt-tgataattgagatgttgttgattgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 12774062  T
Q  452 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12774061 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 13788 - 13956
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||| || ||||| |||||||   || |||| || ||| |||||||    
T  13788 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 13887  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13888 atgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 17046559 - 17046487
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046559 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 403 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 8846459 - 8846360
Alignment:
Q  403 cattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||    
T  8846459 cattcgatattgttatctcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 391 - 487
Target Start/End: Original strand, 52243200 - 52243298
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||| || |||| || ||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243200 gttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 3096369 - 3096293
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3096369 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 12902833 - 12902757
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12902833 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 7088953 - 7088877
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7088953 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 7798850 - 7798774
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7798850 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 52873412 - 52873488
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52873412 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Original strand, 16377529 - 16377639
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16377529 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16377626  T
Q  491 ttgaagatgatga 503  Q
     ||||||| ||||    
T  16377627 atgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198657
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcat 423  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||| || ||||| | |||||   || |||| || ||  |||||||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  424 ga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||  || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Original strand, 14053328 - 14053422
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14053328 attattatgtcatgctg-tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 18215257 - 18215436
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  18215257 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18215356  T
Q  423 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || ||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18215357 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 6900005 - 6899891
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || ||||||||   ||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  6900005 gttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttg 6899907  T
Q  491 ttgaagatgatgatgt 506  Q
     |||||||||||||||    
T  6899906 atgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 15118335 - 15118514
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  15118335 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 15118434  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15118435 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Original strand, 16270262 - 16270356
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  16270262 attattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 44615467 - 44615288
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  44615467 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 44615368  T
Q  423 tgatgg-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || ||  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44615367 tgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 44773070 - 44773249
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  44773070 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 44773169  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44773170 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 52312689 - 52312510
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  52312689 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 52312590  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  52312589 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 429 - 499
Target Start/End: Original strand, 23374404 - 23374473
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 499  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23374404 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 7893779 - 7893703
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  7893779 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 505
Target Start/End: Original strand, 19618155 - 19618336
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||    ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  19618155 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 19618254  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 505  Q
    ||||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  19618255 tgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 503
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929042
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgtt---gatttacattcgacattattatatcatgatggttt-g 432  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| |||||||| ||||   || || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  433 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 46640393 - 46640561
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgtt---gatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| ||||   ||||| |||| || ||| ||||||||    
T  46640393 atttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg-ttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatca 46640491  T
Q  423 tga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||  || |||  |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640492 tgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 331 - 503
Target Start/End: Original strand, 12294 - 12469
Alignment:
Q  331 gatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgat 426  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| ||||| |    
T  12294 gatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 12393  T
Q  427 ggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    | ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12394 gtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 1837492 - 1837671
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| |  |||||||| |||    
T  1837492 atttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtca 1837591  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1837592 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Original strand, 16239976 - 16240090
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||    
T  16239976 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttg 16240074  T
Q  491 ttgaagatgatgatgt 506  Q
     |||||||||||||||    
T  16240075 atgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 437 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 22353901 - 22353835
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 504  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22353901 ctgcctatgctgctgtt-gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 51463851 - 51464030
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||  ||| |||  | ||| ||||||||   |||||||||| |||| || |||||||| |||    
T  51463851 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 51463950  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  51463951 tgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 44052905 - 44052829
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  44052905 tttgtatactgcctatgttgatgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190479
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 436 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 22636504 - 22636437
Alignment:
Q  436 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 504  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22636504 actgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 53082089 - 53082257
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgtt---gatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| ||||   ||||| | || || ||| ||||||||    
T  53082089 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcttt-gatattgttatatca 53082187  T
Q  423 tga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||  || |||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082188 tgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 3515186 - 3515007
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| ||     
T  3515186 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 3515087  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3515086 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 329 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8846553 - 8846482
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||    
T  8846553 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgat 8846482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 18239402 - 18239581
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  18239402 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18239501  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18239502 tgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 23803248 - 23803427
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||| ||   |||||||||| |||| || |||||||| |||    
T  23803248 attttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 23803347  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23803348 tgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 50222322 - 50222501
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  50222322 atttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 50222421  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  50222422 tgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14280427 - 14280316
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14280427 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14280330  T
Q  490 gttgaagatgatga 503  Q
    | | ||||||||||    
T  14280329 gattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Original strand, 54798760 - 54798872
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  54798760 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 54798858  T
Q  490 gttgaagatgatga 503  Q
    | | ||||||||||    
T  54798859 gattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 391 - 487
Target Start/End: Original strand, 8574875 - 8574969
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574875 gttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8574969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 14038724 - 14038653
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 501  Q
    |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  14038724 tttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19242749 - 19242693
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  19242749 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 503
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641344
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610950
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Original strand, 15355307 - 15355471
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgatttac----attcgacattattatatc 421  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||| |||  | ||| ||||||||  ||||||| ||    ||| || |||||||| ||    
T  15355307 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15355406  T
Q  422 atgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355407 atgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15355471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 15367743 - 15367690
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15367743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 15370071 - 15370018
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15370071 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 15371255 - 15371202
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 15373536 - 15373483
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 15402756 - 15402703
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15402756 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Original strand, 14970690 - 14970853
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  ||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  14970690 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 14970789  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    || || ||| | ||| ||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970790 tgctgtttttgtatattgc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 14970853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 490
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815734
Alignment:
Q  455 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatg 21815734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 368
Target Start/End: Original strand, 7641175 - 7641216
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattac 368  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  7641175 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac 7641216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 15099517 - 15099461
Alignment:
Q  340 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||    
T  15099517 ataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg 15099461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 15190484 - 15190428
Alignment:
Q  340 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||    
T  15190484 ataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttg 15190428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 435 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333292
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 491  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcagtctatgatgt 17333292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 338 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15829 - 15664
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15829 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgtatac 15730  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15729 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 66)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Original strand, 28496424 - 28496592
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28496424 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 28496523  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28496524 tgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Original strand, 29808835 - 29809003
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29808835 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 29808934  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29808935 tgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 326 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 1561484 - 1561303
Alignment:
Q  326 aatttgatgttg-ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1561484 aatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcgatattattatatcatg 1561385  T
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1561384 atggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 329 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 19652374 - 19652199
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat--ttacattcgacattattatatcatga 425  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| || ||||  ||||| ||||| |  || ||||||| ||| |||||||||||    
T  19652374 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatactttaaatggattatgt-tgatgtttgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatga 19652276  T
Q  426 tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19652275 tgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 405 - 506
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333339
Alignment:
Q  405 ttcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 504  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 27333337  T
Q  505 gt 506  Q
    ||    
T  27333338 gt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 405 - 506
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394079
Alignment:
Q  405 ttcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 504  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 27394077  T
Q  505 gt 506  Q
    ||    
T  27394078 gt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 23019574 - 23019408
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||   ||||||| || |||| || ||| |||||||||| || |||||||||    
T  23019574 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatac 23019475  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23019474 tgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 340 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 19668541 - 19668390
Alignment:
Q  340 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataat-tga-gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcat 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||  | ||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||  || |||||||    
T  19668541 ataatgttatatagttgtatatacattacatgaattacgtatgatgttgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcat 19668442  T
Q  436 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668441 actatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 341 - 487
Target Start/End: Original strand, 9098466 - 9098616
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataat-tga-gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcata 436  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||  | ||| ||||||||  | |||| || ||| |||||||||||  || ||||||||    
T  9098466 taatgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcata 9098565  T
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098566 ctgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076700
Alignment:
Q  393 tgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 492  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  493 gaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||    
T  20076713 gaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Original strand, 16920679 - 16920751
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16920679 atactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 35245658 - 35245586
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 327 - 506
Target Start/End: Original strand, 8227448 - 8227632
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataatt---ga-gttgttgatttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||| |||||||||||    
T  8227448 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 8227547  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8227548 atgatgttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 16496320 - 16496244
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16496320 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 438 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22831571 - 22831503
Alignment:
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 29060655 - 29060540
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29060655 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagct 29060557  T
Q  490 gttgaagatgatgatgt 506  Q
    | |||||||||||||||    
T  29060556 gatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Original strand, 19303547 - 19303661
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303547 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 19303645  T
Q  491 ttgaagatgatgatgt 506  Q
     |||||||||||||||    
T  19303646 atgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22782406 - 22782227
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  22782406 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 22782307  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22782306 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109157
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataat--tgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| |||  | ||| || ||||| |||||||   || |||| || ||| ||||||     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109222 atgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 25644397 - 25644339
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644397 tttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 483
Target Start/End: Original strand, 4185826 - 4185919
Alignment:
Q  390 agttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 483  Q
    ||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4185826 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 327 - 505
Target Start/End: Original strand, 30676693 - 30676874
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  30676693 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatca 30676792  T
Q  423 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 505  Q
    || ||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  30676793 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Original strand, 17287822 - 17287917
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17287822 attattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 1595728 - 1595549
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  1595728 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtca 1595629  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  1595628 tgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 2291163 - 2291342
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  2291163 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 2291262  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2291263 tgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 12742496 - 12742317
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  12742496 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 12742397  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12742396 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 18334575 - 18334754
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  18334575 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18334674  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18334675 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 391 - 505
Target Start/End: Original strand, 18409833 - 18409947
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18409833 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagtt 18409931  T
Q  490 gttgaagatgatgatg 505  Q
    | ||||||||||||||    
T  18409932 gatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 19005225 - 19005046
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  19005225 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 19005126  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19005125 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 19858902 - 19859081
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  19858902 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 19859001  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19859002 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 24422726 - 24422547
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  24422726 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 24422627  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24422626 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 25754988 - 25754809
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   |||||||||| |||| || |||||||| |||    
T  25754988 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 25754889  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25754888 tgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 33861973 - 33861794
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  33861973 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 33861874  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33861873 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 33864457 - 33864278
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  33864457 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 33864358  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33864357 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 20638328 - 20638404
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  20638328 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 8055208 - 8055029
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  8055208 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 8055109  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8055108 tgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185517
Alignment:
Q  443 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 494  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 26924623 - 26924802
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  26924623 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 26924722  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26924723 tgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456732
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18456799  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    || || ||| | |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456798 tgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18456732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 4186483 - 4186390
Alignment:
Q  390 agttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 483  Q
    ||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4186483 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4186390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 437 - 506
Target Start/End: Original strand, 20361013 - 20361081
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  20361013 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 20593888 - 20593773
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  20593888 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagtt 20593790  T
Q  490 gttgaagatgatgatgt 506  Q
    | |||||||||||||||    
T  20593789 gatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 20556877 - 20557054
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcat 423  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| |||||||   ||||||| || |||| || ||||||||  |||    
T  20556877 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga-aattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccat 20556975  T
Q  424 gatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  20556976 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 25656690 - 25656629
Alignment:
Q  441 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25656690 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 22780295 - 22780348
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  22780295 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 488  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 25629423 - 25629476
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25629423 ttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 34963552 - 34963371
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  34963552 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 34963453  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 505  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  34963452 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 488  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 1540894 - 1541073
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  1540894 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 1540993  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |  || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  1540994 tactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 506
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  459 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 444 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 18461937 - 18461892
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461937 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18461892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 444 - 490
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821949
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 33443118 - 33443062
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 491  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33443118 atactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 33443062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 503
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852179
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 451
Target Start/End: Original strand, 4668216 - 4668277
Alignment:
Q  390 agttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctg 451  Q
    ||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4668216 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4668277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 451
Target Start/End: Original strand, 4675063 - 4675124
Alignment:
Q  390 agttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctg 451  Q
    ||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4675063 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 25688562 - 25688518
Alignment:
Q  442 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688562 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 25688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 447
Target Start/End: Original strand, 22080756 - 22080800
Alignment:
Q  403 cattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtt 447  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22080756 cattcgatattgttatatcatgatgttttgcatactgcctatgtt 22080800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 500
Target Start/End: Original strand, 16448639 - 16448686
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16448639 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 491
Target Start/End: Original strand, 18199473 - 18199523
Alignment:
Q  440 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 491  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18199473 cctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 18199523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 479
Target Start/End: Original strand, 31155354 - 31155491
Alignment:
Q  343 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataat-tga-gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgc 440  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| || |||| || ||| |||| ||| || ||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||     
T  31155354 atgttatataaatgtataaacattgcatgatttatgt-tgatgatatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgacttgcatactgt 31155452  T
Q  441 ctatgttgctgttt-gttatttaactaagctgcatgagtc 479  Q
     || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31155453 tta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtc 31155491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 19873169 - 19873120
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19873169 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Original strand, 19847932 - 19847972
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacatta 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  19847932 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 19847972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 64)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Original strand, 23071902 - 23072070
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23071902 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgctgatttatattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 23072001  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23072002 tgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 329 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671830
Alignment:
Q  329 ttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatt---tacattcgacattattatatcatga 425  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||  |||||| ||||| ||   | | ||||| |||||||||||||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 19671911  T
Q  426 tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671910 tgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 341 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 25176017 - 25175854
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| || ||||| |||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25176017 taatgttatataattatatatacgttatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 25175919  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||    
T  25175918 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 341 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 28406144 - 28405981
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcata 436  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| |||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  28406144 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaagt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcata 28406046  T
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28406045 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 343 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 7679750 - 7679589
Alignment:
Q  343 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactg 439  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||  ||  | |||||||   ||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7679750 atgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactg 7679652  T
Q  440 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  7679651 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 324 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22105595 - 22105412
Alignment:
Q  324 ataatttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattg---agttgttgatttacattcgacattattata 419  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || |||||||   ||||||||| || |||| || ||||||||     
T  22105595 ataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatg 22105496  T
Q  420 tcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22105495 tcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 340 - 487
Target Start/End: Original strand, 18786854 - 18787005
Alignment:
Q  340 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataat-tga-gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcat 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||  | ||| |||||||| || |||| || ||| |||||||||||  ||||||||||    
T  18786854 ataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggtttgcat 18786953  T
Q  436 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786954 actacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 20309180 - 20309108
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Original strand, 38141 - 38235
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38141 attattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 428 - 506
Target Start/End: Original strand, 23103439 - 23103516
Alignment:
Q  428 gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103439 gtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 403 - 505
Target Start/End: Original strand, 22134225 - 22134326
Alignment:
Q  403 cattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  22134225 cattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatg 22134323  T
Q  503 atg 505  Q
    |||    
T  22134324 atg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 429 - 503
Target Start/End: Original strand, 298859 - 298933
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  298859 tttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 23060589 - 23060513
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23060589 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 23285941 - 23285865
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23285941 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 341 - 490
Target Start/End: Original strand, 7685 - 7838
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcata 436  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||| |  ||||| |||||||   || |||| || ||| |||||||||| || ||||||||    
T  7685 taatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcata 7784  T
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7785 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaagatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6726174 - 6725995
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| ||||||| || |||||||| |||    
T  6726174 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtca 6726075  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6726074 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 23076518 - 23076442
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  23076518 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 23708558 - 23708721
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgt---tgatttacattcgacattattatatcat 423  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| |  ||||| |||   |||||| || | || ||| |||||||||    
T  23708558 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcat 23708657  T
Q  424 gatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    | || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708658 gttgttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23207461 - 23207293
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgt---tgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | | ||  ||||| |||   |||||| |||| || ||| ||||||||    
T  23207461 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttataatg-ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatca 23207363  T
Q  423 tga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207362 tgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Original strand, 23654412 - 23654507
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatgg-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23654412 attattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18809122 - 18808943
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  18809122 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18809023  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18809022 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23131041 - 23130862
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  23131041 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 23130942  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23130941 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23133508 - 23133329
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  23133508 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 23133409  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23133408 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 23660137 - 23660023
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||| ||||  || || | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  23660137 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttg 23660039  T
Q  491 ttgaagatgatgatgt 506  Q
     |||||||||||||||    
T  23660038 atgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 23709515 - 23709694
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  23709515 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 23709614  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23709615 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 23711996 - 23712175
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  23711996 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 23712095  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23712096 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 26505558 - 26505379
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  26505558 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 26505459  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || |  ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26505458 tgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 26508036 - 26507857
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  26508036 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 26507937  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || |  ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26507936 tgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 34402505 - 34402684
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  34402505 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 34402604  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34402605 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 39682492 - 39682313
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  39682492 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 39682393  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39682392 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 436 - 506
Target Start/End: Original strand, 22731286 - 22731355
Alignment:
Q  436 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  22731286 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 8946733 - 8946657
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8946733 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22337186 - 22337115
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22337186 atacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 506
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  442 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 571576 - 571397
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgat-aattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||  |||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  571576 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 571477  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  571476 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23135769 - 23135590
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  23135769 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 23135670  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23135669 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 24367953 - 24367790
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  24367953 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 24367854  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367853 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24367790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28577278 - 28577099
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||  || |||| || ||||||||||||    
T  28577278 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatca 28577179  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28577178 tgctgtttttgtatactgt-tgcgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 505
Target Start/End: Original strand, 32214904 - 32215085
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  32214904 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 32215003  T
Q  423 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 505  Q
    || ||  |||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  32215004 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 20520130 - 20520298
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  20520130 atttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatca 20520228  T
Q  423 tga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||  || |||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520229 tgaactgttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 500
Target Start/End: Original strand, 21155043 - 21155219
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || || | || |||||||| |||    
T  21155043 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtca 21155142  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 500  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  21155143 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23791458 - 23791289
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | | ||  |||||   |||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  23791458 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatca 23791359  T
Q  423 tga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||  || |||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23791358 tgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 23791289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 24898178 - 24898358
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  24898178 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 24898277  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24898278 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 24900661 - 24900841
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  24900661 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 24900760  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24900761 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 24903138 - 24903318
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  24903138 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 24903237  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24903238 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 24905615 - 24905795
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  24905615 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 24905714  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24905715 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 24908090 - 24908270
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  24908090 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 24908189  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24908190 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 22413073 - 22413243
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacat--tattatat 420  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||  | ||||||    
T  22413073 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatat 22413171  T
Q  421 catga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||  || |||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22413172 catgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 32039481 - 32039660
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  32039481 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 32039580  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  32039581 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 22738247 - 22738300
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  22738247 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 489
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452033
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004764
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 23004764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108903
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 25108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Original strand, 45029966 - 45030016
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45029966 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 43137357 - 43137301
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 501  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43137357 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287378
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 491  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 23287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 500
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392397
Alignment:
Q  436 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 491  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 26392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Original strand, 24529641 - 24529691
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24529641 ttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 490
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697712
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatg 24697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 368
Target Start/End: Original strand, 22173812 - 22173853
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattac 368  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  22173812 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac 22173853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 368
Target Start/End: Original strand, 24642839 - 24642880
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattac 368  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  24642839 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac 24642880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Original strand, 24529511 - 24529551
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacatta 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  24529511 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 24529551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 338 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 34291 - 34123
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34291 ttataatgttatataattgtatatatattacttgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgtatac 34192  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34191 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 338 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 6980 - 6828
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6980 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatac 6881  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6880 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 8183 - 8127
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||| |||||    
T  8183 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttg 8127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 329 - 502
Target Start/End: Original strand, 45732 - 45909
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||||||||    
T  45732 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatg 45831  T
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45832 atgatttgcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 329 - 506
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10659
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||| ||| ||||||||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 10580  T
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  10581 atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 6702 - 6535
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6702 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 6604  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6603 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8485
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataat--tgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| |||  | ||| || ||||| |||||||   || |||| || ||| |||||||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 341 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 100541 - 100378
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || | ||| ||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  100541 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-taatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatac 100443  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  100442 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 341 - 502
Target Start/End: Original strand, 40128 - 40291
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  40128 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctac 40226  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  40227 tgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 433 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119875
Alignment:
Q  433 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 101580 - 101503
Alignment:
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  101580 atggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 94590 - 94411
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  94590 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 94491  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  94490 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Original strand, 17423 - 17586
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  17423 atttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 17522  T
Q  423 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    || ||  |||| |||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 44512 - 44454
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44512 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 329 - 506
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22788
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||| ||| ||||||||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 22709  T
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  22710 atgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 82251 - 82072
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   |||||||||| |||| || |||||||| |||    
T  82251 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 82152  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  82151 tgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 329 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 310 - 133
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  310 ttgatgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatg 211  T
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  210 atgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 329 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 160864 - 160688
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||   ||||||||||  |||| || ||| ||||||||||    
T  160864 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttgatatttgacatgttgttgattg-catttgatattgttatatcatg 160766  T
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  160765 atgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 501263 - 501100
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  501263 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 501164  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    || || ||| | ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501163 tgttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85742
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85602
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacatta 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 85602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 341 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 19431 - 19268
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19431 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 19333  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19332 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 130086 - 129924
Alignment:
Q  329 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatg 424  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||| ||| ||||||||||    
T  130086 ttgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 129987  T
Q  425 atggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  129986 atgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaag 129924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Original strand, 60721 - 60821
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 488  Q
    ||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  60721 gttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaaga 60819  T
Q  489 tg 490  Q
    ||    
T  60820 tg 60821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 343 - 459
Target Start/End: Original strand, 29238 - 29354
Alignment:
Q  343 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcct 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  29238 atgttatataattgtatatacagtacatgacttaagtttgataattgagttgctgatttacattcgatattattatatcatgatagtttgaatactacct 29337  T
Q  443 atgttgctgtttgttat 459  Q
    |||||||||||||||||    
T  29338 atgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8176
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataat-tga-gttgttgatttacattcgacattattatatcat 423  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  | ||| |||||||||||  ||| || ||| |||||||||    
T  8011 atttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcat 8110  T
Q  424 ga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8111 gaactggtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6244
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||  | |||| ||   || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6076 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 6175  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6176 tgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 341 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 5810 - 5662
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  5810 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatac 5712  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5711 tgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 338 - 437
Target Start/End: Original strand, 2395 - 2494
Alignment:
Q  338 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2395 ttataatgttatataattgtatatacattaaatgacttaagtttgataattgagttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 341 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 62362 - 62217
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  62362 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgtgcattcgatattattataccatgatgtttttcatactgc 62264  T
Q  441 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62263 ctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaag 62217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 132786 - 132662
Alignment:
Q  381 tgataattgagttgttgat--ttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 477  Q
    |||||||||||  ||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  132786 tgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgag 132687  T
Q  478 tcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  132686 tcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 136859 - 136680
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  136859 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 136760  T
Q  423 tgatgg-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || ||  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  136759 tgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 139328 - 139149
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  139328 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 139229  T
Q  423 tgatgg-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || ||  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  139228 tgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 144266 - 144087
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  144266 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 144167  T
Q  423 tgatgg-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || ||  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  144166 tgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 134390 - 134211
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  134390 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 134291  T
Q  423 tgatgg-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || ||  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  134290 tgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 141797 - 141618
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  141797 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 141698  T
Q  423 tgatgg-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || ||  |||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  141697 tgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 332 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 12944 - 12766
Alignment:
Q  332 atgttgttat-aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatg 427  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||  | |||||||   || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  12944 atgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 12845  T
Q  428 gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||    
T  12844 atttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 391 - 502
Target Start/End: Original strand, 2812 - 2923
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2812 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2911  T
Q  491 ttgaagatgatg 502  Q
     ||| |||||||    
T  2912 atgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Original strand, 987 - 1155
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||  | |||||||   || |||||||  || ||||||||||||| | |||||||    
T  987 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatac 1086  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1087 tacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 6779 - 6611
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||    || ||||   || ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  6779 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatac 6680  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6679 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 14159 - 13991
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||    || ||||   || ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  14159 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatac 14060  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14059 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 341 - 502
Target Start/End: Original strand, 2599 - 2762
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   |||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  2599 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatac 2697  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2698 tgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 341 - 502
Target Start/End: Original strand, 14651 - 14814
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||    
T  14651 taatggtatataatagtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttac 14749  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14750 tgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 341 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 10695 - 10546
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||  ||||| |||||||   || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10695 taatgtcatataattgtatatacattacatgaattatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 10596  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10595 tgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaag 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 1265 - 1101
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttat-aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttac---attcgacattattatatca 422  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||  ||||  |||||||   |   |||||| ||| ||||||||    
T  1265 atttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatgaattatgtttgatgtttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatca 1166  T
Q  423 tgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165 tgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 403 - 506
Target Start/End: Original strand, 23901 - 24001
Alignment:
Q  403 cattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23901 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatg 23997  T
Q  503 atgt 506  Q
    ||||    
T  23998 atgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 341 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 32703 - 32555
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat--ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatact 438  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||| ||||| |  || |||| || ||| |||||||||| || ||||||||||    
T  32703 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatact 32604  T
Q  439 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32603 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 489
Target Start/End: Original strand, 51936 - 51987
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51936 ctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 341 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 13107 - 12942
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||  ||  | |||||||   || ||||||| ||| |||||||||| || |||||||||    
T  13107 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatac 13008  T
Q  438 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  13007 tgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 403 - 506
Target Start/End: Original strand, 15795 - 15898
Alignment:
Q  403 cattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  15795 cattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15894  T
Q  503 atgt 506  Q
    ||||    
T  15895 atgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178913
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 178913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 327 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 11648 - 11464
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataatt---ga-gttgttgatttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||| |||||||||||    
T  11648 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 11549  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11548 atgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 327 - 506
Target Start/End: Original strand, 38193 - 38377
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataatt---ga-gttgttgatttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||| |||||||||||    
T  38193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 38292  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38293 atgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 436 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 1359 - 1289
Alignment:
Q  436 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1359 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 7338 - 7266
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7338 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 437 - 503
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 414 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 51672 - 51582
Alignment:
Q  414 attatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51672 attatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 16354 - 16282
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354 atactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 415 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 1123 - 1048
Alignment:
Q  415 ttatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1123 ttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 391 - 505
Target Start/End: Original strand, 3192 - 3306
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3192 gttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3290  T
Q  490 gttgaagatgatgatg 505  Q
    | ||||||||||||||    
T  3291 gatgaagatgatgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Original strand, 3157 - 3271
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3157 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 3255  T
Q  491 ttgaagatgatgatgt 506  Q
     |||||||||||||||    
T  3256 atgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 434 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 174838 - 174767
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  174838 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 341 - 490
Target Start/End: Original strand, 136321 - 136474
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataat-tga-gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcata 436  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||| || ||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||  || ||||  ||    
T  136321 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtacgatgatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgta 136420  T
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136421 ctgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 341 - 490
Target Start/End: Original strand, 145029 - 145182
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataat-tga-gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcata 436  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||| || ||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||  || ||||  ||    
T  145029 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtacgatgatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgta 145128  T
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145129 ctgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 436 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  436 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 53486 - 53654
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||| || ||||| |||||||   || |||| || ||| |||||||    
T  53486 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 53585  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53586 atgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaagatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 13243 - 13144
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13243 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 391 - 487
Target Start/End: Original strand, 16106 - 16202
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16106 gttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2677
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 12751 - 12584
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgat---ttacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | | | || ||||| |||||||   || |||| || ||| |||||||    
T  12751 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12653  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12652 atgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 327 - 506
Target Start/End: Original strand, 17964 - 18148
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgatt---tacattcgacattattatatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||| ||||| ||   | | ||||| |||||||||||    
T  17964 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 18063  T
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18064 atgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 487
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2275
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaag 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2151
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacatta 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 2151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 436 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 46995
Alignment:
Q  436 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 414 - 506
Target Start/End: Original strand, 1080 - 1170
Alignment:
Q  414 attatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1080 attatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 32226 - 32102
Alignment:
Q  381 tgataattgagttgttgat--ttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 477  Q
    |||||||||||  ||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32226 tgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgag 32127  T
Q  478 tcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  32126 tcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Original strand, 10472 - 10544
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10472 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 4964 - 4849
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4964 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagtt 4866  T
Q  490 gttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||||    
T  4865 gttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 391 - 487
Target Start/End: Original strand, 27755 - 27851
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27755 gttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 25289 - 25125
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcat 423  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||  |||||||||    
T  25289 atttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcat 25191  T
Q  424 ga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    ||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25190 gagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 128907 - 129075
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  128907 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 129006  T
Q  423 tga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||  || |||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  129007 tgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 78438 - 78338
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 488  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  78438 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaaga 78340  T
Q  489 tg 490  Q
    ||    
T  78339 tg 78338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 116480 - 116430
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  116480 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 440 - 503
Target Start/End: Original strand, 5183 - 5246
Alignment:
Q  440 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5183 cctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 13591 - 13497
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13591 attatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Original strand, 15490 - 15584
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15490 attattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctctt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 435 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 32137 - 32067
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32137 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 1093 - 1169
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1093 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 2028 - 1952
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2028 tttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 4788 - 4712
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4788 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 391 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 39591 - 39479
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39591 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 39493  T
Q  491 ttgaagatgatgat 504  Q
     |||||| ||||||    
T  39492 atgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 391 - 499
Target Start/End: Original strand, 26071 - 26179
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26071 gttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26169  T
Q  490 gttgaagatg 499  Q
    | ||||||||    
T  26170 gatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Original strand, 44713 - 44825
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 489  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  44713 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 44811  T
Q  490 gttgaagatgatga 503  Q
    | | ||||||||||    
T  44812 gattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 391 - 504
Target Start/End: Original strand, 75221 - 75333
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||| || |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  75221 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 75319  T
Q  491 ttgaagatgatgat 504  Q
     |||||| ||||||    
T  75320 atgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 168023 - 168099
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  168023 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 51989 - 51913
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  51989 tttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 6220 - 6389
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttat-aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||| | ||||||    
T  6220 atttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatca 6319  T
Q  423 tga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6320 tgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13843
Alignment:
Q  440 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 415 - 503
Target Start/End: Original strand, 38732 - 38820
Alignment:
Q  415 ttatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  38732 ttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 429 - 505
Target Start/End: Original strand, 17262 - 17337
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 505  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17262 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79433
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtca 79366  T
Q  423 tgatggtttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    || || |||   |||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79367 tgctgtttttatatactgtcg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 391 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 38875 - 38761
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||| |||| |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  38875 gttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttg 38777  T
Q  491 ttgaagatgatgatgt 506  Q
     |||||||||||||||    
T  38776 atgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 33036 - 32942
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  33036 attattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 9807 - 9744
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcc 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  9807 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9929 - 9889
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacatta 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  9929 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 9889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Original strand, 32983 - 33077
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32983 attattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 46022 - 45928
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46022 attattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 16189 - 16113
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16189 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 506
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 13287 - 13211
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  13287 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 1927 - 1851
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1927 tttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 97190 - 97021
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  97190 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 97091  T
Q  423 tga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||  || |||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97090 tgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 97021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 106468 - 106299
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  106468 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 106369  T
Q  423 tga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||  || |||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106368 tgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20926 - 20747
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  20926 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 20827  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20826 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 38000 - 37821
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  38000 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 37901  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  37900 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 40007 - 39913
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  40007 attattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Original strand, 19889 - 19990
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 488  Q
    |||||||| || |||| || ||| |||||||||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19889 gttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaaga 19988  T
Q  489 tg 490  Q
    ||    
T  19989 tg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 25990 - 25896
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  25990 attattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 39952 - 39858
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  39952 attattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158612
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 158532  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  158533 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 411 - 503
Target Start/End: Original strand, 339975 - 340065
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  339975 attattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Original strand, 8065 - 8166
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 488  Q
    |||||||| || |||| || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  8065 gttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtctatga 8164  T
Q  489 tg 490  Q
    ||    
T  8165 tg 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 411 - 506
Target Start/End: Original strand, 8559 - 8650
Alignment:
Q  411 attattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8559 attattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 3546 - 3470
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3546 tttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 419 - 343
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  419 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 422 - 502
Target Start/End: Original strand, 28806 - 28887
Alignment:
Q  422 atgatggtttgcatactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28806 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Original strand, 20363 - 20527
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  20363 atttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 20461  T
Q  423 tgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    || || |||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20462 tgttgttttgtatactg-atgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 452 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 128805 - 128751
Alignment:
Q  452 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || | |||||||||||||    
T  128805 tttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 448
Target Start/End: Original strand, 2172 - 2281
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatac 437  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||||   |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2172 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatac 2270  T
Q  438 tgcctatgttg 448  Q
    |||||||||||    
T  2271 tgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 6166 - 6245
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6166 tttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 10952 - 10772
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| | | |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  10952 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 10853  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 504  Q
    ||||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  10852 tgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 4873 - 4710
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  4873 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 4774  T
Q  423 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    || ||  |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773 tgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13571 - 13392
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  13571 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 13472  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13471 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14126 - 13947
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  14126 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 14027  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14026 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 666 - 566
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 488  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  666 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 568  T
Q  489 tg 490  Q
    ||    
T  567 tg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Original strand, 16608 - 16721
Alignment:
Q  393 tgttgatttacattcgacattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 491  Q
    |||||| || |||| || |||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  16608 tgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattga 16706  T
Q  492 tgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||||||||||    
T  16707 tgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 487
Target Start/End: Original strand, 24348 - 24405
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 8555 - 8479
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8555 tttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Original strand, 11488 - 11564
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  11488 tttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 20987 - 20910
Alignment:
Q  429 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  20987 tttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 267844 - 267676
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  267844 atttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg-ttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatca 267746  T
Q  423 tga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||  || |||  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267745 tgaactgttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 267676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 285 - 106
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   |||||||||| |||| || |||||||| |||    
T  285 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 186  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | |||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  185 tgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 506
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  439 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16784
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | | | ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16864  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16863 tgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 487
Target Start/End: Original strand, 103591 - 103733
Alignment:
Q  341 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcatact 438  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||      ||||||| ||| |||| || ||| |||||||||||  || |||  |||||    
T  103591 taatgttatgtagttgtatatacattacatgaattatgtatgat------gttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatact 103684  T
Q  439 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  103685 acctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 505
Target Start/End: Original strand, 12232 - 12413
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||| | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||| | |||    
T  12232 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtca 12331  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 505  Q
    || || ||| | || |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||    
T  12332 tgctgtttttgtattctgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 38388 - 38339
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38388 atactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4300
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgat-aattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | |||| |||||||   |||||||||| || | || |||||||| |||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtca 4377  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 500  Q
    || || ||| | ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  4376 tgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 9421 - 9241
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| | | |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  9421 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 9322  T
Q  423 tgatggtttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 504  Q
    ||||| |||   ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  9321 tgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 2747 - 2691
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2747 atactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22944 - 22886
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22944 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 30111 - 29948
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||  ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| ||||| | || |||||||| |||    
T  30111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtca 30012  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 487  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30011 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 40579 - 40400
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||   | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  40579 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 40480  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |  || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40479 tcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 444 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11979
Alignment:
Q  444 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 12237 - 12064
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  12237 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 12138  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || || ||| | ||||||| | |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12137 tgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgttt-------aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 503
Target Start/End: Original strand, 161072 - 161252
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgatttac----attcgacattattatatc 421  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||| |||  | ||| |||||||| |||||||| ||    ||| || |||||||| ||    
T  161072 atttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 161171  T
Q  422 atgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    || ||| ||| | ||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  161172 attatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164613
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacatta 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 164613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 430 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 4599 - 4545
Alignment:
Q  430 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 485  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4599 ttgcatactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 11467 - 11305
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgacattattatatca 422  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  11467 atttgattttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 11368  T
Q  423 tgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 486  Q
    || || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11367 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 9194 - 9133
Alignment:
Q  390 agttgttgatttacattcgacattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctg 451  Q
    ||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9194 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 9133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 453 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23843
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 453 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 455 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 4262 - 4214
Alignment:
Q  455 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 503  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4262 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 4578 - 4508
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  4578 atactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 12160 - 12090
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  12160 atactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22112 - 22042
Alignment:
Q  434 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 506  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  22112 atactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 500
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 500  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Original strand, 1263 - 1303
Alignment:
Q  327 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacatta 367  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  1263 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 1303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 143
Alignment:
Q  327 atttgatgttgtta-taatgttatataattgtatatacattacatga 372  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  189 atttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatga 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Original strand, 1802 - 1903
Alignment:
Q  391 gttgttgatttacattcgacattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 488  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||  |  |||  ||||| ||||||||  |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1802 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactacctatgttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtcggtctaaga 1901  T
Q  489 tg 490  Q
    ||    
T  1902 tg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 435 - 485
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  435 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 485  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 502
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  437 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 69843 - 69794
Alignment:
Q  453 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 502  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  69843 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University