View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14695_low_2 (Length: 672)

Name: NF14695_low_2
Description: NF14695
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14695_low_2
NF14695_low_2
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (18-654)||(15517487-15518123)
chr2 (18-404)||(15534000-15534383)
chr2 (33-315)||(15493676-15493958)
chr2 (407-654)||(15534691-15534938)
chr2 (414-654)||(15494096-15494336)
chr2 (414-654)||(15625482-15625722)
chr2 (414-654)||(15655029-15655272)
chr2 (414-654)||(15645877-15646120)
chr2 (14-346)||(15654449-15654781)
chr2 (14-327)||(15645397-15645710)
chr2 (43-324)||(15601209-15601490)
chr2 (14-340)||(15624772-15625098)
chr2 (470-654)||(15605601-15605788)
chr2 (346-402)||(15534437-15534495)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 568; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 654
Target Start/End: Original strand, 15517487 - 15518123
Alignment:
Q  18 atgaacgcagatgcatctgatattgcaaacaccaaaaatgatggtttcttcaaaaagtttggttttcctgtgtcatcgataccacctggtaaagtaacgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  15517487 atgaacgcagatgcatctgatattgcaaaccccaaaaatgatggtttcttcaaaaagtttggttttcctgtgttatcgataccacctggtaaagtaactg 15517586  T
Q  118 cagcagcgaacactccggttgcaatgactgttgaaattagcatacacgactccgcagnnnnnnncatccaagactctgcatctttccttagtttttcatg 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15517587 cagcagcgaacactccggtagcaatgactgttgaaattagcatacacgactccgcagtttttttcatccaagactctgcatcttcccttagtttttcatg 15517686  T
Q  218 ctcatttgagaacagttcttctgcagtcacgcctttggagtttttcgacttaatctgtgctggcagcattatcttctttacattctatcatatgaaaatg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15517687 ctcatttgagaacagttcttctgcagtcacgcctttggagtttttcgacttaatctgtgcgggcagcattatcttctttacattctatcatatgaaaatg 15517786  T
Q  318 tatatatgttcgataaaatatagaaatgtaaaaataaattagttaaatttattaagtacagtaggataattgtgtatgcacacaagggatgcactatacc 417  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15517787 tatatatgttagataaaatatagaaatgtaaaaataaattagttaaatttattaaggacggtaggataattgtgtatgcacacaagggatgcactatacc 15517886  T
Q  418 tcaaaccataataactcaacacacatttgaaaagctgcaccagaaaccaattcaagttgaccttgtggtgctaattttccagctaagtgcaataaattgt 517  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15517887 tcaaaccataataactcgacacacatttgaaaagctgcaccagaaaccaattcaagttgaccttgtggtgctaattttccagctaagtgcaataaactgt 15517986  T
Q  518 ttccttcatcgtcttcaaatgtcactatgatatcctttatatgccctatttgatgtacgacattgaagatactggcatgccgatgcaaaacagctatgtg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15517987 ttccttcatcgtcttcaaatgtcactatgatatcctttatatgccctatttgatgtatgacattgaagatactggcatgccgatgcaaaacagctatgtg 15518086  T
Q  618 taatatagttcgattttcgcaatccacctcccatatc 654  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15518087 taatatagttcgattttcgcaatccacctcccatatc 15518123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 404
Target Start/End: Original strand, 15534000 - 15534383
Alignment:
Q  18 atgaacgcagatgcatctgatattgcaaacaccaaaaatgatggtttcttcaaaaagtttggttttcctgtgtcatcgataccacctggtaaagtaacgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15534000 atgaatgcagatgcatctgatgttgcaaataccaagaatggtgttttcgtcaactagtttggttttccggtgtcatcggtaccacctggtaaagtaactg 15534099  T
Q  118 cagcagcgaacactccggttgcaatgactgttgaaattagcatacacgactccgcagnnnnnnncatccaagactctgcatctttccttagtttttcatg 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  15534100 cagcagcgaacactccggtagcaatgactgttgaaattagcatacatgactccgcagtttttttcatccaagactctgcatcctcccttagttttgcatg 15534199  T
Q  218 ctcatttgagaacagttcttctgcagtcacgcctttggagtttttcgacttaatctgtgctggcagcattatcttctttacattctatcatatgaaaatg 317  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| || ||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534200 ctcatttgagaataactcttgtgcagtcaagcgttcagagtttttcaactttatttgtgctggcaacattatcttctttacattctatcatatgaaaatg 15534299  T
Q  318 tatatatgttcgataaaatatagaaatgtaaaaataaatt--agttaaatttattaagtacagtaggataattgtgtatgcacacaagg 404  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534300 tatatatgttagataaaatatagataagtaaaaataaattagagttaaatttatta-----agtaggataattgtgtatgcacacaagg 15534383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 33 - 315
Target Start/End: Original strand, 15493676 - 15493958
Alignment:
Q  33 tctgatattgcaaacaccaaaaatgatggtttcttcaaaaagtttggttttcctgtgtcatcgataccacctggtaaagtaacggcagcagcgaacactc 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15493676 tctgatattgcaaacaccaagaatgatggtttcttcaagtagtttggttttcctgtgtcatcggtaccacctggtaaagtagttgcagcagcgaacactc 15493775  T
Q  133 cggttgcaatgactgttgaaattagcatacacgactccgcagnnnnnnncatccaagactctgcatctttccttagtttttcatgctcatttgagaacag 232  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15493776 cagtagcaatgactgttgaaattagcatacaagactcggcagtttttttcatccaagactctgcatcttcccttagtttttcatgctcattcgagaacag 15493875  T
Q  233 ttcttctgcagtcacgcctttggagtttttcgacttaatctgtgctggcagcattatcttctttacattctatcatatgaaaa 315  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15493876 ttcttctgcagtcatgtctttggagttttttgacttaatttgtgctggcaacattatcttctttactttctatcatacgaaaa 15493958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 407 - 654
Target Start/End: Original strand, 15534691 - 15534938
Alignment:
Q  407 tgcactatacctcaaaccataataactcaacacacatttgaaaagctgcaccagaaaccaattcaagttgaccttgtggtgctaattttccagctaagtg 506  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  15534691 tgcattatacctcaaaccataataactcaaggcacatttgaaaagctgctccagaaaccaattcaagttgacctcgtggtgctaattttgcagccaagtg 15534790  T
Q  507 caataaattgtttccttcatcgtcttcaaatgtcactatgatatcctttatatgccctatttgatgtacgacattgaagatactggcatgccgatgcaaa 606  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15534791 caataaagtgtttcctttatcatcaacatatgtcgctatgatatcctttatgtgccctatttgatgtacgacattgaagatactagcatgccgatgcaaa 15534890  T
Q  607 acagctatgtgtaatatagttcgattttcgcaatccacctcccatatc 654  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15534891 acagctatgtgtaatatcgttcgattttcgccatccacctcccatatc 15534938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 414 - 654
Target Start/End: Original strand, 15494096 - 15494336
Alignment:
Q  414 tacctcaaaccataataactcaacacacatttgaaaagctgcaccagaaaccaattcaagttgaccttgtggtgctaattttccagctaagtgcaataaa 513  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  15494096 tacctcaaaccatactaactcgacacacatttgaaaagctgctccagaaaccaattcaagttgacctcgtcgtgctaattttgcagccaagtgtaatata 15494195  T
Q  514 ttgtttccttcatcgtcttcaaatgtcactatgatatcctttatatgccctatttgatgtacgacattgaagatactggcatgccgatgcaaaacagcta 613  Q
     ||||||  || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15494196 gtgtttctgtcttcatcttcaaatgtcactatgacatcctttatatgccctatttgatgtacgagattgaatatactagcatgccgatgcaaaacagcta 15494295  T
Q  614 tgtgtaatatagttcgattttcgcaatccacctcccatatc 654  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  15494296 tgtgtaatatagttcgatttttgctatccatctcccatatc 15494336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 414 - 654
Target Start/End: Original strand, 15625482 - 15625722
Alignment:
Q  414 tacctcaaaccataataactcaacacacatttgaaaagctgcaccagaaaccaattcaagttgaccttgtggtgctaattttccagctaagtgcaataaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15625482 tacctcaaaccataataactcaaggcacatttgaaaagctgacccagaaaccaattcaagttgaacttgtggtgctaattttgcagccaagtgcaataaa 15625581  T
Q  514 ttgtttccttcatcgtcttcaaatgtcactatgatatcctttatatgccctatttgatgtacgacattgaagatactggcatgccgatgcaaaacagcta 613  Q
     ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    ||| ||||||||| |||||||    
T  15625582 gtgtttctgtcatcatcttcaaatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtataacattgtagatagcaacataccgatgcaatacagcta 15625681  T
Q  614 tgtgtaatatagttcgattttcgcaatccacctcccatatc 654  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  15625682 tgtgtaatatagttcgatttttgctatccacatcccatatc 15625722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 414 - 654
Target Start/End: Original strand, 15655029 - 15655272
Alignment:
Q  414 tacctcaaaccataataactcaacacacatttgaaaagctgcaccagaaaccaattcaagttgaccttgtggtgctaattttccagctaagtgcaataaa 513  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15655029 tacctcaaaccatactaactcgacgcacatttgaaaagcagctccagaaaccaattcaagttgacttcgtggtgctaattttgcagccaagtgcaataaa 15655128  T
Q  514 ttgtttccttcat---cgtcttcaaatgtcactatgatatcctttatatgccctatttgatgtacgacattgaagatactggcatgccgatgcaaaacag 610  Q
     ||||||  ||||   | |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15655129 gtgtttctgtcattatcatcttcatatgttactatgatacccttaatatgccctatttgatgtacgagattgaagatactagcatgccgatgcaaaacag 15655228  T
Q  611 ctatgtgtaatatagttcgattttcgcaatccacctcccatatc 654  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||    
T  15655229 ctatgtgtaatatagtttgatttttgctatccacatcccatatc 15655272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 414 - 654
Target Start/End: Original strand, 15645877 - 15646120
Alignment:
Q  414 tacctcaaaccataataactcaacacacatttgaaaagctgcaccagaaaccaattcaagttgaccttgtggtgctaattttccagctaagtgcaataaa 513  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||||      
T  15645877 tacctcaaaccatagtaactcgacgcacatttgaaaagcagctccagaaaccaattcaagttgatttcgtggtgctaattttgcagccaagtgcaatagt 15645976  T
Q  514 ttgtttccttcatcgtc---ttcaaatgtcactatgatatcctttatatgccctatttgatgtacgacattgaagatactggcatgccgatgcaaaacag 610  Q
     ||||||  ||||| ||   |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15645977 gtgtttctgtcatcatcattttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaagatactagcatgccgatgcaaaacag 15646076  T
Q  611 ctatgtgtaatatagttcgattttcgcaatccacctcccatatc 654  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||    
T  15646077 ctatgtgtaatatagttcggtttttgctatccacatcccatatc 15646120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 15654449 - 15654781
Alignment:
Q  14 tgagatgaacgcagatgcatctgatattgcaaacaccaaaaatgatggtttcttcaaaaagtttggttttcctgtgtcatcgataccacctggtaaagta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  15654449 tgagatgaatgcagatgcatctgatattgcaaacaccaagaatgatgttttattcaaatagtgtggttttccagagtcatcggtaccgcctggtaaagta 15654548  T
Q  114 acggcagcagcgaacactccggttgcaatgactgttgaaattagcatacacgactccgcagnnnnnnncatccaagactctgcatctttccttagttttt 213  Q
       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||       |||||| |||||||||| ||  |||||| |||    
T  15654549 gttgcagcagcaaacactccggtagcaatgacagttgaaattagcatgcaagactcggcagtttttttcatccacgactctgcattttctcttagtgttt 15654648  T
Q  214 catgctcatttgagaacagttcttctgcagtcacgcctttggagtttttcgacttaatctgtgctggcagcattatcttctttacattctatcatatgaa 313  Q
    |||||||| ||||||| || |||| |||||| | |||||  |||||| ||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  15654649 catgctcaattgagaatagctcttgtgcagtaaagccttcagagtttctcatctttatctgtgcaggcaacattatcttctttactttctgtcacatgaa 15654748  T
Q  314 aatgtatatatgttcgataaaatatagaaatgt 346  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||| ||||    
T  15654749 aatgtatatacgttaagtaaaatatagatatgt 15654781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Original strand, 15645397 - 15645710
Alignment:
Q  14 tgagatgaacgcagatgcatctgatattgcaaacaccaaaaatgatggtttcttcaaaaagtttggttttcctgtgtcatcgataccacctggtaaagta 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  15645397 tgagatgaatgcagatgcatctgatattgcaaacaccaagaatgatgttttattcaaatagtgtggttttccagagtcatcggtaccgcctggtaaagta 15645496  T
Q  114 acggcagcagcgaacactccggttgcaatgactgttgaaattagcatacacgactccgcagnnnnnnncatccaagactctgcatctttccttagttttt 213  Q
       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |       |||||| |||||||||| ||  |||||| |||    
T  15645497 gttgcagcagcaaacactccggtagcaatgacagttgaaattagcatgcaagactcggccgtttttttcatccacgactctgcattttctcttagtgttt 15645596  T
Q  214 catgctcatttgagaacagttcttctgcagtcacgcctttggagtttttcgacttaatctgtgctggcagcattatcttctttacattctatcatatgaa 313  Q
    |||||||| ||||||| || |||| |||||| | |||||  |||||| ||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  15645597 catgctcaattgagaatagctcttgtgcagtaaagccttcagagtttctcatctttatctgtgcaggcaacattatcttctttactttctgtcacatgaa 15645696  T
Q  314 aatgtatatatgtt 327  Q
    ||||||||||||||    
T  15645697 aatgtatatatgtt 15645710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 324
Target Start/End: Original strand, 15601209 - 15601490
Alignment:
Q  43 caaacaccaaaaatgatggtttcttcaaaaagtttggttttcctgtgtcatcgataccacctggtaaagtaacggcagcagcgaacactccggttgcaat 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| |||||    
T  15601209 caaacaccaaaaatgatggtttcttcaaataatttggttttcctgtgtcatcgataccgcctggtacagtagttgcagcagcaaacactccggtagcaat 15601308  T
Q  143 gactgttgaaattagcatacacgactccgcagnnnnnnncatccaagactctgcatctttccttagtttttcatgctcatttgagaacagttcttctgca 242  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| || |       |||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||||    
T  15601309 gacggctgaaattagcatacaagactctgcggttttcttcatccatgactctgcattttctcttagtttttgatgctcttttgagaagacttcttgtgca 15601408  T
Q  243 gtcacgcctttggagtttttcgacttaatctgtgctggcagcattatcttctttacattctatcatatgaaaatgtatatat 324  Q
    || | |||||  |||||| ||   || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15601409 gtaaggccttcagagtttctcatgtttatttgtgctggcagcattatcttctttactttctatcatatgaaaatgtttatat 15601490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 15624772 - 15625098
Alignment:
Q  14 tgagatgaacgcagatgcatctgatattgcaaacaccaaaaatgatggtttcttcaaaaagtttggttttcctgtgtcatcgataccacctggtaaagta 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||    
T  15624772 tgagatgaatgcaaatgcatctgatattgcaaacaccaagaatgatgttttattcaaatagtgtggttttccagaatcatcggtaccgcctggtaaagta 15624871  T
Q  114 acggcagcagcgaacactccggttgcaatgactgttgaaattagcatacacgactccgcagnnnnnnncatccaagactctgcatctttccttagttttt 213  Q
       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||       |||||| |||||||| | ||  |||||| |||    
T  15624872 gttgcagcagcaaacactccggtagcaatgacagttgaaattagcatgcaagactcggcagtttttttcatccacgactctgcgttttctcttagtgttt 15624971  T
Q  214 catgctcatttgagaacagttcttctgcagtcacgcctttggagtttttcgacttaatctgtgctggcagcattatcttctttacattctatcatatgaa 313  Q
    |||||||| ||||||| || |||| ||| || | |||||  |||||| ||  ||| |||||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  15624972 catgctcaattgagaatagctcttgtgctgtaaagccttcagagtttctcatctttatctgtccaggcaacattatcttctttactttctgtcacatgaa 15625071  T
Q  314 aatgtatatatgttcgataaaatatag 340  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||    
T  15625072 aatgtatatatgttaagtaaaatatag 15625098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 470 - 654
Target Start/End: Original strand, 15605601 - 15605788
Alignment:
Q  470 caagttgaccttgtggtgctaattttccagctaagtgcaataaattgtttc---cttcatcgtcttcaaatgtcactatgatatcctttatatgccctat 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||   ||||||| | |||| |||||| ||||| | ||||||||||||| ||    
T  15605601 caagttgaacttgtggtgctaattttgcagccaagtgcaataaagtgtttctgtcttcatcattttcatatgtcaatatgaaaccctttatatgccccat 15605700  T
Q  567 ttgatgtacgacattgaagatactggcatgccgatgcaaaacagctatgtgtaatatagttcgattttcgcaatccacctcccatatc 654  Q
    |||||||| || ||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15605701 ttgatgtatgaaattgaagatactataatgccgattcaagacagctatgtgtaatatagttcgatttttgcaatccacatcccatatc 15605788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 402
Target Start/End: Original strand, 15534437 - 15534495
Alignment:
Q  346 taaaaataaattagt--taaatttattaagtacagtaggataattgtgtatgcacacaa 402  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  15534437 taaaaataaattagagataaatttattaagtaaagtaggataattctgtatgcaaacaa 15534495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University