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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF1469_low_16 (Length: 355)
Name: NF1469_low_16
Description: NF1469
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF1469_low_16 |
 |  |
|
| [»] scaffold0035 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0310 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0338 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0014 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1164 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0037 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0190 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0160 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0117 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0031 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0021 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1867 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0610 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0103 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0158 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0120 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0044 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0554 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0034 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0359 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0396 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0673 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0480 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0447 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0383 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0342 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0068 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0083 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0122 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0016 (6 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0740 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0876 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0589 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0816 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0091 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0150 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0456 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0234 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0032 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0010 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0686 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0706 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0597 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0251 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0184 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0507 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0465 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0574 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0080 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0039 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0833 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0004 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1295 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12349727 - 12349435
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12349727 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataacaacttctc |
12349629 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12349628 |
acactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataaatttatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttat |
12349529 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12349528 |
ggacaattaattaattcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
12349435 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 54424085 - 54424363
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54424085 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcaatttctcatactttgaacatgt |
54424184 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
54424185 |
aattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
54424284 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
54424285 |
tcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgaaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
54424363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 17100726 - 17101003
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17100726 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgt |
17100825 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
17100826 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaat |
17100925 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatacaataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17100926 |
tcaccc-aattaagcacttttcatacaaaaattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
17101003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 17101411 - 17101688
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17101411 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgt |
17101510 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
17101511 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaat |
17101610 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatacaataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17101611 |
tcaccc-aattaagcacttttcatacaaaaattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
17101688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 38 - 308
Target Start/End: Original strand, 8631871 - 8632141
Alignment:
| Q |
38 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaac |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8631871 |
atgaaacttatcacaatccaacaacaacaaagcataattcactaaataagcatattttcaacatataccaacttctcaaactttgaacatgtaattcaac |
8631970 |
T |
 |
| Q |
138 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaa |
237 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| || | |
|
|
| T |
8631971 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttaagaacaattaattaattcatcc-a |
8632069 |
T |
 |
| Q |
238 |
attaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8632070 |
attaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaatcctaacccccttacctt |
8632141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 50112238 - 50111947
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |
|
|
| T |
50112238 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttca |
50112140 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
50112139 |
tactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcatgaatttcatcatttatg |
50112040 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
50112039 |
aacaattaatcaattcatcc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
50111947 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Original strand, 14295499 - 14295789
Alignment:
| Q |
17 |
aacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14295499 |
aacaacaac-atcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctca |
14295597 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14295598 |
tactttgaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatg |
14295697 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14295698 |
aacaattaatcaattcaccc-attttagcacttttcatacaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
14295789 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Original strand, 14301126 - 14301416
Alignment:
| Q |
17 |
aacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14301126 |
aacaacaac-atcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctca |
14301224 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14301225 |
tactttgaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatg |
14301324 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14301325 |
aacaattaatcaattcaccc-attttagcacttttcatacaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
14301416 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 14298494 - 14298772
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | || | ||||||||||||| |
|
|
| T |
14298494 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactttgaacatgt |
14298593 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14298594 |
aattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
14298693 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14298694 |
tcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
14298772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 14304121 - 14304399
Alignment:
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30 |
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129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | || | ||||||||||||| |
|
|
| T |
14304121 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactttgaacatgt |
14304220 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14304221 |
aattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
14304320 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14304321 |
tcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
14304399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Original strand, 35123755 - 35124046
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |
|
|
| T |
35123755 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacc--cttttc |
35123851 |
T |
 |
| Q |
115 |
atact-ttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattta |
213 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| |
|
|
| T |
35123852 |
atacactttaacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccataatttcatacatccaaacacgtcatcataattaaagtacgaatttcatcattta |
35123951 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| |
|
|
| T |
35123952 |
tgaacaattaatcaattcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccctttacctt |
35124046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22144446 - 22144168
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacat |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22144446 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatacttcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacat |
22144348 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |
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|
| T |
22144347 |
gtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcagttatgaacagttaatca |
22144249 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22144248 |
attcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
22144168 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17523076 - 17522786
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |
|
|
| T |
17523076 |
caacaacaac-atcaattggtcatgaaacttatcacaattcatcaataacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccattttgtta |
17522978 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
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|
|
| T |
17522977 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccacatcttcatacatccaaaactgtcatcataattagagcacgaagttcatcatttatg |
17522878 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
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||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
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| T |
17522877 |
aacaaataatcaattcacccaaa-taagcacttctcatacaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
17522786 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 3578161 - 3578439
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| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
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| T |
3578161 |
aattgatcatgaaacttatcgcaattcaaccacaacatagcgtaattcaaccagttgagcatattttcaacatatactattttctcatactttgaacatg |
3578260 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3578261 |
aaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacat-tcaacatgtcatcataattagagaatgaatatcatcatttatgaacaattaatcaa |
3578359 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
3578360 |
tttaccc-aattaagcacttattcctacaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccgcttacctt |
3578439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34439513 - 34439238
Alignment:
| Q |
34 |
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133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
34439513 |
gatcatgaaacttatcataattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttaaacacatacccattttacatactttgaacatgtaatt |
34439414 |
T |
 |
| Q |
134 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatc-taaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattca |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34439413 |
caaccaacaacaattcatttatccataacttcatacctcataaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
34439314 |
T |
 |
| Q |
233 |
cccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
34439313 |
tcc-aattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaatctccttacctt |
34439238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 317682 - 317406
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
317682 |
aattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatttagcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatac |
317584 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
317583 |
aattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcatacttagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaat |
317484 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
317483 |
tcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
317406 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 304
Target Start/End: Original strand, 17938633 - 17938920
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17938633 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaaataaccacaatccaacaacaacaaagcataattcatcaattaagcatattttcaacatatatcaacttctc |
17938731 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
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| T |
17938732 |
atactttgaacatgcaattcaactaacaacaattcgcttaaccat-gctttatacatccaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcactcaa |
17938830 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctcctta |
304 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
17938831 |
gaacaattaattaattcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaaccctaaccccctta |
17938920 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 55441023 - 55440794
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| Q |
30 |
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128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55441023 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaaccacaacatagtataattcaaccagttgagcatattttcatcatatatcattttctcatactttgaacatg |
55440924 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
55440923 |
aaattccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaa |
55440824 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaat |
258 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
55440823 |
ttcaccc-aattaagcacttattcatacaat |
55440794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16996233 - 16995957
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| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16996233 |
aattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatac |
16996135 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||| |
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|
| T |
16996134 |
aattcaagtaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcaccacttatgaataattaatcaat |
16996035 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16996034 |
tcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
16995957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6154505 - 6154227
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| Q |
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aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacat |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6154505 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaataacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcataaactttgaacat |
6154407 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| | ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6154406 |
gtaattcaactaac-acaattcaactattcataatttcatacatctaaacatgtcattataattagaggacgaatttcatgacttatgaacaattaatca |
6154308 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcata-caataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6154307 |
attcatcc-aattaagcacttttcatagaaataattgaaaattataataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
6154227 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19570862 - 19570587
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aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatac-caacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
19570862 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttcca-catatactcattttcatacactttgaacatg |
19570764 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |
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|
| T |
19570763 |
taattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagcacaaatttcatcacatatgaaaaattaatcaa |
19570665 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
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|
| T |
19570664 |
ttcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacc-ccttacctt |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 13817585 - 13817861
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13817585 |
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13817682 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
13817683 |
gtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgtacaattaatca |
13817781 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13817782 |
attcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16182119 - 16181843
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| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacat |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16182119 |
aattgatcattaaacttatcacaattcatcaacgacaatgcataattcaccaatttggcatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacat |
16182022 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16182021 |
gtaatttaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatca |
16181923 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16181922 |
attcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
16181843 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19261012 - 19260839
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130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19261012 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgta |
19260913 |
T |
 |
| Q |
131 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaattt |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
19260912 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
19260839 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
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Target Start/End: Original strand, 38527841 - 38528078
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69 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
166 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
38527841 |
gcataattcaccaattgagcatattttcc-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttca |
38527937 |
T |
 |
| Q |
167 |
tacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaa |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
38527938 |
tacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatcc-aattaagcacttttcatacaaatagttgaa |
38528036 |
T |
 |
| Q |
266 |
aattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38528037 |
aattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
38528078 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 53898643 - 53898440
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15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || |
|
|
| T |
53898643 |
tcaacaacaac-attaattgatcatgaaacttatcacaatgcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tc |
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T |
 |
| Q |
115 |
atac--tttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattt |
212 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
53898545 |
atacactttgaacatttaatgcaactaaca-caattcaattattcataacttcatagatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcattt |
53898447 |
T |
 |
| Q |
213 |
atgaaca |
219 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
53898446 |
atgaaca |
53898440 |
T |
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Target: chr3; HSP #27
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Target Start/End: Complemental strand, 11061165 - 11060903
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143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
11061165 |
ttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacctgaaattcaactaacaa |
11061066 |
T |
 |
| Q |
144 |
caattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaag |
243 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || | |||| || ||||||| |
|
|
| T |
11061065 |
caatccaattattcataacttcatacatttaaaaat-tgatcataattagagcacgaatttcatcatccattaacaaataattaattatcc--aattaag |
11060969 |
T |
 |
| Q |
244 |
cactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
11060968 |
cacttattcatacaataattgaaaaattgcaat-tatgattatgatgaattccaacccccttacctt |
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T |
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Target: chr3; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 17139568 - 17139860
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114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
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|
| T |
17139568 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatattt-caacatataccattttctc |
17139665 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | || |||| |
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|
| T |
17139666 |
atagtttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattat |
17139765 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaata--aatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||| || || || |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17139766 |
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T |
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Target: chr3; HSP #29
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Target Start/End: Complemental strand, 6146920 - 6146764
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127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6146920 |
aattgaccatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatgattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacat |
6146822 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
186 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6146821 |
gtaattcaactaa-tacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatca |
6146764 |
T |
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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11329148 - 11328902
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11329148 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctc |
11329051 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||||| ||||| |||| | || |||| |
|
|
| T |
11329050 |
atactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattattaacaactttatgc-----aacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattat |
11328956 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt |
269 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11328955 |
gaacaattaatcaatt-actc-aattaagcacttattcatacaataattgaaaatt |
11328902 |
T |
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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
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Target Start/End: Complemental strand, 14528110 - 14527976
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Q |
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|
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|
|
| T |
14528110 |
aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca-cctaattaagcacttttcatacaataattgaaaaattgca |
14528012 |
T |
 |
| Q |
273 |
ataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14528011 |
ataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
14527976 |
T |
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Target: chr3; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 31 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12560409 - 12560132
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12560409 |
attgatcatgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccagttgggcatattttc-acatataccactttctcatactttgaacatga |
12560311 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12560310 |
aatttctctaacaaaaattcaagtatcaataacttcaagcattcaatcataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaat |
12560211 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
| || | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12560210 |
t-actc-aattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattttaacccccttacctt |
12560132 |
T |
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Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
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aacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatcca |
158 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11196456 |
aacaacaaatcataattcaaccaattaagcatattttcaacatataccattttctca--------acataaaattcaactaacaacaattcaattatcca |
11196365 |
T |
 |
| Q |
159 |
taacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacc |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11196364 |
taacttcatacattcaaacatatcatcattattagagcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcacc |
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T |
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aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataatt-caccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
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Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16880196 |
aattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttcacaaattgagcatattct-aacatataccactttctcatactttgaacatg |
16880294 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||| | || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16880295 |
aaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaattcaaacaattatgaacaattaatcaa |
16880394 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt |
269 |
Q |
| |
|
|| || | |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16880395 |
tt-actc-aattaaacacttgttcatacaacaattgaaaatt |
16880434 |
T |
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Target: chr3; HSP #35
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aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
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Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aattgaacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaaattgagcata-tttcaacatatgtcattttctcatactttgaacatg |
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T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | || | ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14059288 |
aaatttctctaaaaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattagtcaa |
14059189 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaat-aaatggttatgatgaa |
290 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14059188 |
ttagtc--aattaagcacttattcatacaataattgaaaattgcactaaaatgattatgatgaa |
14059127 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 39656599 - 39656877
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30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
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Q |
| |
|
|||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39656599 |
aattgaacatgaatcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatactttgaacatg |
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T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
39656698 |
aaatttcactaacaacaattcaattatcaccaatttcataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaacaattatgaacaattaatc-a |
39656796 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|| || | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
39656797 |
tttactc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattgcactaaatgattatgatcaattctaactcccttacctt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12488913 - 12488662
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Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
12488913 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctc |
12488816 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |||| | || |||| |
|
|
| T |
12488815 |
atactttgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatccaaacacaatatcataattagagcatgaattctaacaattat |
12488716 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt |
269 |
Q |
| |
|
||||||||| | || | || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12488715 |
gaacaattaattaa-tgactc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatt |
12488662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 348
Target Start/End: Original strand, 17191628 - 17191934
Alignment:
| Q |
44 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaaca |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| || |||| |
|
|
| T |
17191628 |
cttatcacaattcagcaacaacataacataattcatcaatttgagcataatt-caacataaatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaaca |
17191726 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaa |
242 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| || ||| || | |||||| |
|
|
| T |
17191727 |
acaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaattaatc-atttactc-aattaa |
17191824 |
T |
 |
| Q |
243 |
gcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaat-aaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttca |
338 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||| ||||| |||||| || | ||||| || ||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||| ||||| |
|
|
| T |
17191825 |
gcaattgttcatacaacaattgaaaaattacactaaaatgattgtgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttca |
17191924 |
T |
 |
| Q |
339 |
cttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |
|
|
| T |
17191925 |
ctttagctcc |
17191934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 348
Target Start/End: Original strand, 17204818 - 17205074
Alignment:
| Q |
94 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattat |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| | || ||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17204818 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattag |
17204917 |
T |
 |
| Q |
194 |
agcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaat-aaatggttatgat-ga |
289 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| |||||||||||| || ||| || | |||||||||||| ||| ||| | ||||| |||||| || | ||||| ||||||| || |
|
|
| T |
17204918 |
agcacgaattttatcatctatgaacaattaatc-atttactc-aattaagcacttgttcgtaccacaattgaaaaattacactaaaatgattatgatgga |
17205015 |
T |
 |
| Q |
290 |
aaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17205016 |
attctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcc |
17205074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 7854302 - 7854376
Alignment:
| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7854302 |
taaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcc |
7854376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6146769 - 6146665
Alignment:
| Q |
204 |
tcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaa-taattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctcct |
302 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
6146769 |
tcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaa-ttaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccct |
6146671 |
T |
 |
| Q |
303 |
tacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
6146670 |
tacctt |
6146665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3576598 - 3576298
Alignment:
| Q |
44 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaaca |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||| || ||| ||||| || ||||||||| ||||||||| ||| || |||| |
|
|
| T |
3576598 |
cttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatttgagcataatt-caatatatatcactttctcatacattgaacatgaaatttcaccaaca |
3576500 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaa |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||||| || || |||| | || | |||||||||| || ||| || | |||||| |
|
|
| T |
3576499 |
acaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc-aattaa |
3576402 |
T |
 |
| Q |
243 |
gcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaat-aaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttca |
338 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| ||||| |||||| || | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||| || | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
3576401 |
gcacttattcgtacaacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacaaattcctagcccaagcttca |
3576302 |
T |
 |
| Q |
339 |
cttt |
342 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
3576301 |
cttt |
3576298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 54038059 - 54037985
Alignment:
| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54038059 |
taaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcc |
54037985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 12349904 - 12349834
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12349904 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaactacgatgcataattcaccaattgagcatattatcaaca |
12349834 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 14528199 - 14528118
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttca |
97 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14528199 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatattttca |
14528118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Original strand, 30207289 - 30207527
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattga-gcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||||| | ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30207289 |
aattgaacttgaatcttatcacaattgaacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatg |
30207387 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | | |||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
30207388 |
aagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaccagtatgaataattaatcaa |
30207487 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt |
269 |
Q |
| |
|
|| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
30207488 |
tt-actc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatt |
30207527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 47784876 - 47784767
Alignment:
| Q |
94 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattat |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
47784876 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattag |
47784777 |
T |
 |
| Q |
194 |
agcacaaatt |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
| T |
47784776 |
agcacgaatt |
47784767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 3992624 - 3992684
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3992624 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
3992684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 38167988 - 38168048
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38167988 |
attgatcatgaaacttattacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata |
38168048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 230
Target Start/End: Original strand, 15876250 - 15876341
Alignment:
| Q |
139 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaatt |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| | ||| |||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15876250 |
aacaacaattcagttatcaacaacatcatgcatttaaacatattatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaatt |
15876341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 3992870 - 3992944
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| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3992870 |
taaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
3992944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 55513190 - 55513264
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| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55513190 |
taaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
55513264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 2844265 - 2844325
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2844265 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2844325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 16261527 - 16261587
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16261527 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
16261587 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 30153016 - 30153076
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30153016 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
30153076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 53771115 - 53771175
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53771115 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
53771175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
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Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54685482 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
54685422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 2844511 - 2844585
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| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2844511 |
taaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcc |
2844585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
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| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33341955 |
attgatcatgaaacatatcataattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
33342015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
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| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7854056 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgaacata |
7854116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 87
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| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag |
87 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17956165 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataatacaccaattgag |
17956109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 23492447 - 23492507
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23492447 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatccataattcaccatttgagcata |
23492507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 45581709 - 45581765
Alignment:
| Q |
35 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45581709 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
45581765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15857191 - 15857124
Alignment:
| Q |
281 |
ttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| || |||| | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15857191 |
ttatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcc |
15857124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 15517848 - 15517897
Alignment:
| Q |
174 |
aaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15517848 |
aaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatttatgaacaatta |
15517897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 38810943 - 38810870
Alignment:
| Q |
275 |
aaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38810943 |
aaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcc |
38810870 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16744058 - 16744002
Alignment:
| Q |
292 |
actaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16744058 |
actaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcc |
16744002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 348
Target Start/End: Original strand, 19232104 - 19232160
Alignment:
| Q |
292 |
actaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19232104 |
actaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcc |
19232160 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 54038301 - 54038245
Alignment:
| Q |
35 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
54038301 |
atcatgaaacatatcacatttcatcaacaaccatgcataattcaccaatttagcata |
54038245 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:
Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 118150 - 117858
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
118150 |
caacaacaac-atcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacatattttcaacatataccaacttctca |
118052 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
118051 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatg |
117952 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaataattg---aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
117951 |
aacaattaatcaattcagcc-aattaagcacttttcatacaataattgaaaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
117858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 109649 - 109357
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
109649 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaatttatcatattttcaatatataccaatttctca |
109551 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
109550 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatg |
109451 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaataattg---aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
109450 |
aacaattaatcaattcagcc-aattaagcacttttcatacaataattgaaaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
109357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 16732242 - 16732519
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16732242 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
16732341 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16732342 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
16732441 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatacaataatt-gaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16732442 |
tcaccc-aattaagcacttttcatacactaattaaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacctctttacctt |
16732519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12837373 - 12837097
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtg |
130 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12837373 |
attgaccatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgta |
12837274 |
T |
 |
| Q |
131 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaatt |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
12837273 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatatcatcatttatggacaattaatcaatt |
12837174 |
T |
 |
| Q |
231 |
cacccaaattaagcacttttcatacaataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12837173 |
caccc-aattaagcacttttcattcaaaaattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
12837097 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 45459043 - 45458769
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
45459043 |
tcaacaacaac-atcaattggtcatgaaacttatcacaattcaacaacagcaaagcataattcaccaattgaacatatctttaacatatacaaacttctc |
45458945 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
45458944 |
atattttgagcatgtaattcaactaacaacaattcaattatctatcacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttat |
45458845 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaa |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
45458844 |
gaacaattaatcaattcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaa |
45458769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21959650 - 21959360
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |
|
|
| T |
21959650 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttca |
21959552 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21959551 |
tactttgag-atgtaattcaatcaacaacaattcaaatatccataacttcatacatttaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatg |
21959453 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21959452 |
aacaatcaattaattcacccaaa-taagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
21959360 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 30457976 - 30458254
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30457976 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcgtaattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttacatactttgaacatgt |
30458075 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30458076 |
aattcaaccaacaacaatttaattatccataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
30458175 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30458176 |
tcatcc-aattaagcacttttcatacaaataattcaaaattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttacctt |
30458254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 44055988 - 44056265
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44055988 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatattcatttttcatactttgaacatgt |
44056087 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
44056088 |
aattcaactaacaacaattcaaa-attcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
44056186 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
44056187 |
tcatcc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
44056265 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 34395317 - 34395608
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |
|
|
| T |
34395317 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tca |
34395414 |
T |
 |
| Q |
116 |
tac--tttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattta |
213 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |
|
|
| T |
34395415 |
tacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcattacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcattta |
34395513 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
34395514 |
tgaacaattaatcagttcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgataatgatgaattctaacccccttacctt |
34395608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23270121 - 23269830
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | || ||| |
|
|
| T |
23270121 |
caacaacaac-atcaattgatcatgatacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcatcaattgagtatattttcaacacatacccattt-tca |
23270024 |
T |
 |
| Q |
116 |
tac--tttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattta |
213 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
23270023 |
tacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcactta |
23269925 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23269924 |
tgaacaattaatcaattcatcc-aattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
23269830 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 55376771 - 55376495
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30 |
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129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | || |||||||| |||||| |
|
|
| T |
55376771 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgagtatattttca-cacatacccatttttcatacttagaacatac |
55376673 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
55376672 |
aattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaat |
55376573 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
55376572 |
tcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaatttcaa-aagtgattatgatgaagactaacccccttacctt |
55376495 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 93 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20813658 - 20813443
Alignment:
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93 |
tttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataatta |
192 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20813658 |
tttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataatta |
20813559 |
T |
 |
| Q |
193 |
tagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaa |
291 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
20813558 |
gagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccc-aattaagcatttttcatacaaataatttaaaattgcaataagtgattatgatgaat |
20813460 |
T |
 |
| Q |
292 |
actaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20813459 |
tctaacccccttacctt |
20813443 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8872645 - 8872372
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8872645 |
aattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaacgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatac |
8872547 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8872546 |
aattcaactaacaacacttcaatcattcatagcttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaat |
8872447 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttac |
305 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
8872446 |
tcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttac |
8872372 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 308
Target Start/End: Original strand, 44346902 - 44347176
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32 |
ttgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactttgaacatgtg |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || || | ||||||||||||| |
|
|
| T |
44346902 |
ttgatcatgaaacatatcacaattcatgaacaacaatgtataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcttacactttgaacatgta |
44347000 |
T |
 |
| Q |
131 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaatt |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44347001 |
attcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaatt |
44347099 |
T |
 |
| Q |
231 |
cacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
44347100 |
catcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaactcccttacctt |
44347176 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 53704907 - 53704630
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30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
53704907 |
aattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatac |
53704809 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
53704808 |
aattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaat |
53704709 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| | | || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
53704708 |
tcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
53704630 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 820090 - 819827
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| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| | ||| |
|
|
| T |
820090 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacacattt-tcaca-----aac---- |
820001 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
820000 |
----caac-aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaat |
819906 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
819905 |
tcaccc-aattaagcatttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
819827 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 52265695 - 52265404
Alignment:
| Q |
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
52265695 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacattgcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctc |
52265598 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
52265597 |
atactttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacgaatttcatcatctat |
52265498 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
52265497 |
gaacaattaatcaatt-accc-aattaaacacttattcatacaataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
52265404 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13809697 - 13809406
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| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13809697 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaactaattgagcata-tttcaacatataccattttctc |
13809600 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| | || |||| |
|
|
| T |
13809599 |
atactttgaacatgaaatctcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattat |
13809500 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13809499 |
gaacaattaatcaatt-actc-aattaagcacttattcatacaataattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
13809406 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 53907873 - 53907681
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aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
53907873 |
aattgatcatgaaacatttcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgggcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatac |
53907775 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
53907774 |
aatccaactaataacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatta |
53907681 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 27961031 - 27961323
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttc-t |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
27961031 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaatcttataacaattcaacaacaatataacataattcaaccaatttagcatattt-caacatatacc-acttctt |
27961127 |
T |
 |
| Q |
114 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattta |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||| |
|
|
| T |
27961128 |
catactttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattattcataacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacggattctaacaatta |
27961227 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaata--aatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||| || || || |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27961228 |
tgaacaattaatcaatt-actc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaatttacactaacaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
27961323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30232669 - 30232392
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31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac--ttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
30232669 |
attgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatactttgatcatg |
30232572 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30232571 |
aagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaa |
30232473 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg--aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|| || | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
30232472 |
tt-acac-aattaagcacttattcataccataattgaaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccctcttacctt |
30232392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18494502 - 18494225
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30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactttgaacat |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18494502 |
aattgatcatgaatcttaacacaattcaacaacaacatagcatcatccaaccaattgagcacattt-caacatataccatttttctcatactttgatcat |
18494404 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | || |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18494403 |
gaagtttcaccaacaacaattcaattatc-ataacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattgatca |
18494305 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||| || ||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18494304 |
att-acacaa-ttaagcacctattcataccataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
18494225 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 15044888 - 15045180
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16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
15044888 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacatatatcactttctc |
15044985 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | || |||| |
|
|
| T |
15044986 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
15045085 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaa--taaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15045086 |
gaacaattaatcaatt-actc-aattaagcacttattcatacaacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttacctt |
15045180 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47535239 - 47535046
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
47535239 |
aattgaacatgattcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatactttgaacttg |
47535141 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47535140 |
aaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatta |
47535046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15109536 - 15109244
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||| || ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
15109536 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttatcaatttgagtataatt-caacatatatcactttctc |
15109439 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| |||| | | |||| |
|
|
| T |
15109438 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaactattat |
15109339 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaa--taaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15109338 |
gaataattaatcaatt-actc-aattaagcacttattcatacaacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttacctt |
15109244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41166133 - 41165947
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
41166133 |
caacaacaac-atcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctc |
41166036 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatt |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| || | ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41166035 |
atactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaatatattatcataattggagcacaaatt |
41165947 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7186031 - 7185701
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| | |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || || | ||| | || ||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
7186031 |
caacaacaac-atcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcatcatttagtgcacaatt-caacatatatcattttcac |
7185934 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||| |
|
|
| T |
7185933 |
atactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactat |
7185834 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgatt |
312 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || | |||||||||||| |||||||| || || |||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7185833 |
gaacaattaatcacttattc--aattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacctccttaccttaatt |
7185736 |
T |
 |
| Q |
313 |
atcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctc |
347 |
Q |
| |
|
| ||| || | |||| ||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
7185735 |
agcacaaattcctagcccaaacttcactttagctc |
7185701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 308
Target Start/End: Original strand, 14901319 - 14901583
Alignment:
| Q |
44 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcacca-attgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaaca |
142 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||| || |||| |
|
|
| T |
14901319 |
cttaccacaattcaataataacatatcataattcaacattttgagcata-tttaaacatatatcactttctcatacttcaaacatgaaatttcaccaaca |
14901417 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaa |
242 |
Q |
| |
|
|||| |||||| || | || ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| |||| | || |||||||||||| || ||| || | |||||| |
|
|
| T |
14901418 |
acaa-tcaattttcaacaatttcatacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataacaaatatgaacaattaatc-atttactc-aattaa |
14901514 |
T |
 |
| Q |
243 |
gcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaat-aaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14901515 |
gcacttattcatacaataattgaaaaattgcaataaaatgattatgatgaaatttaacccccttacctt |
14901583 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5682463 - 5682389
Alignment:
| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5682463 |
taaatgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttttgctcc |
5682389 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 14951836 - 14951896
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14951836 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
14951896 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 18276494 - 18276764
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||||||||||| ||||| | |||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
18276494 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcac |
18276591 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| | || ||| |
|
|
| T |
18276592 |
atgctttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaactat |
18276691 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgat |
287 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | || | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
18276692 |
gaacaattaatcacat-actc-aattaagcacttaatcatacaataattgaaaaatcgcactaaatgattatgat |
18276764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 54118196 - 54118130
Alignment:
| Q |
281 |
ttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctc |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
54118196 |
ttatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctc |
54118130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25119141 - 25119068
Alignment:
| Q |
275 |
aaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25119141 |
aaatgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
25119068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 5682704 - 5682648
Alignment:
| Q |
35 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5682704 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
5682648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15272493 - 15272433
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15272493 |
attgatcatggaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15272433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41256526 - 41256351
Alignment:
| Q |
47 |
atcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaaca |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || ||| |||||| |||||||| ||| || ||||||| |
|
|
| T |
41256526 |
atcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaaca |
41256428 |
T |
 |
| Q |
146 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
41256427 |
attcaattatcaccaatttcatgcat-tcaacatttcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaacaatta |
41256351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 25119388 - 25119328
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25119388 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaaaaaccatgcataattcaccaattgatcata |
25119328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 10104453 - 10104380
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagca |
89 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||| |||||| | |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10104453 |
tcaacaacaac-atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
10104380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 41165883 - 41165810
Alignment:
| Q |
275 |
aaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41165883 |
aaatgattatgatgaattctaacccccttacgttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcc |
41165810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 11287477 - 11287767
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11287477 |
caacaacaac-atcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
11287575 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11287576 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaacataatcagagcactaatttcatcatttatg |
11287675 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11287676 |
aacaattaatcaattcaccc-aattaaacacttttcatacaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
11287767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7284248 - 7283917
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7284248 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctc |
7284150 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| || |||| |
|
|
| T |
7284149 |
atactttgaacatacaattcaactaataacaattcaatcatccataacttcacacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcaccacttat |
7284050 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcata-caataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgatta |
313 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
7284049 |
gaacaattaatcaattcatcc-aattaagcacttatcatataaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaaaactaacccccttaccttaatta |
7283952 |
T |
 |
| Q |
314 |
tcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||| || || | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7283951 |
tcaccaattattaactcaagcttcacttttgctcc |
7283917 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12370027 - 12369736
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |
|
|
| T |
12370027 |
caacaacaac-atcaattaatcatgaaagttatcacaattcaacaacaacaaggcataattcaccaattgagcatattttcaacagatacccatttttca |
12369929 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
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| T |
12369928 |
tactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccgtaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttaatcatttatg |
12369829 |
T |
 |
| Q |
216 |
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308 |
Q |
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| T |
12369828 |
aacaattaattaattcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgataatgatgaaatctaacccccttacctt |
12369736 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
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Target Start/End: Complemental strand, 15822619 - 15822328
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Q |
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| T |
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tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccatttgagcatattttcaacatataccattttcat |
15822521 |
T |
 |
| Q |
115 |
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214 |
Q |
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| T |
15822520 |
acattttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatc-caacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttat |
15822422 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
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| T |
15822421 |
gaacaattaatcaattcaccc-aattaagcacttttcatacaaataactgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
15822328 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45452340 - 45452064
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30 |
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129 |
Q |
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| T |
45452340 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcatg--tcacaaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgt |
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T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
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| T |
45452242 |
aattcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaat |
45452143 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
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| T |
45452142 |
tcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26070451 - 26070162
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115 |
Q |
| |
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|
| T |
26070451 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagcatattttcaacatataccattttctca |
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T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
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| T |
26070352 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatg |
26070253 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
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| T |
26070252 |
aacaattaatcaatt-acac-aattaagcacttattcataccataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacc-ccttacctt |
26070162 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26094238 - 26093949
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
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| T |
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caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagcatattttcaacatataccattttctca |
26094140 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
26094139 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatg |
26094040 |
T |
 |
| Q |
216 |
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308 |
Q |
| |
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| T |
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aacaattaatcaatt-acac-aattaagcacttattcataccataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacc-ccttacctt |
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T |
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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 12759060 - 12759339
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129 |
Q |
| |
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| T |
12759060 |
aattgatcatgaaacttatcataattcaccaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccctttttcacattttgaacatgt |
12759159 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
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| T |
12759160 |
aattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattggagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
12759259 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
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| T |
12759260 |
tcaccc-aattaaacacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
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T |
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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 143712 - 143990
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Q |
| |
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| T |
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aattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacat |
143810 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
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| T |
143811 |
gtaattcaactaaca-caattcaattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatca |
143909 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
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| T |
143910 |
attcatcc-aattaagcactttttatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 308
Target Start/End: Original strand, 3895099 - 3895375
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtg |
130 |
Q |
| |
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| T |
3895099 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgca |
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T |
 |
| Q |
131 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaatt |
230 |
Q |
| |
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| T |
3895199 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatttcatcagaattagagcatgaatttcatcaattatgaacaattaatcaatt |
3895298 |
T |
 |
| Q |
231 |
cacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
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|
| T |
3895299 |
catcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12248294 - 12248016
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12248294 |
attgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatatactattttctcatactttaaacatga |
12248195 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
12248194 |
aattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaagtaatcaat |
12248095 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
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| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
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|
| T |
12248094 |
tatcc--aattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
12248016 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 44865303 - 44865581
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aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacat |
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Q |
| |
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| T |
44865303 |
aattaatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacat |
44865401 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
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| T |
44865402 |
gtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatca |
44865501 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
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| T |
44865502 |
attcatcc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatg-aatctaacccccttacctt |
44865581 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 313
Target Start/End: Original strand, 47289854 - 47290138
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aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacat |
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Q |
| |
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|
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| T |
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aattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacat |
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T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
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|
| T |
47289953 |
gtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatatatctaaacatggcatcataattagagctcgaatttcatcatttatgaacaattaatca |
47290051 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcatac-aataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgatta |
313 |
Q |
| |
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||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |
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|
| T |
47290052 |
attcatcc-aattaagcatttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttaatta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 16 - 308
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
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caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctc |
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T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
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| T |
16570094 |
atactttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttat |
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T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
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16569994 |
gagcaaataatcaattatcc--aattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattttaacccccttacctt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 16595469 - 16595760
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
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caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctc |
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T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
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| T |
16595568 |
atactttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttat |
16595667 |
T |
 |
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215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
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16595668 |
gagcaaataatcaattatcc--aattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattttaacccccttacctt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13863104 - 13862829
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
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Q |
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| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| || | |
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| T |
13863004 |
taattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcta |
13862905 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13862904 |
ttcaccc-aattaagc----ttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
13862829 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 308
Target Start/End: Original strand, 35094890 - 35095165
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129 |
Q |
| |
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|||||||||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || | ||||||||||||||| |
|
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| T |
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T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
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| T |
35094989 |
aattcaactaaca-caattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgttatcacaattagagcatgaatttcatcacatatgaacaattaatcaat |
35095087 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
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||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
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|
| T |
35095088 |
tcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39046797 - 39046524
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| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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aattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag-atattttca-catatactcatttttcaa---ttgaacatac |
39046703 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39046702 |
aattcaactaacaataattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaat |
39046603 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| | | || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
39046602 |
tcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
39046524 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 49047861 - 49047570
Alignment:
| Q |
16 |
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114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
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|
| T |
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caacaacaac-atcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcaaccaattgagcatattt-caacatataccactctctc |
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T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| | || || | |
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| T |
49047763 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatgtcattataattggagcacaaattctaacaattct |
49047664 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
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| T |
49047663 |
gaacaattaatcaatt-actc-aattaagcacttattcatataacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
49047570 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 13274847 - 13275128
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| Q |
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
13274847 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatat-----------accactttctc |
13274934 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
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|
| T |
13274935 |
atactttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattat |
13275034 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13275035 |
gaacaattaatcaatt-actc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
13275128 |
T |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 348
Target Start/End: Original strand, 13377589 - 13377922
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| Q |
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||| || ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
13377589 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagtataatt-caacatatatcactttctc |
13377686 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
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|
| T |
13377687 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
13377786 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt---gcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttga |
310 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| || | ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
13377787 |
gaacaattaatcgatt-actc-aatgaatcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaa |
13377884 |
T |
 |
| Q |
311 |
ttatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13377885 |
ttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcc |
13377922 |
T |
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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17224125 - 17223797
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| Q |
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114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| || ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
17224125 |
caacaacaac-atcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagtataatt-caacatatatcactttctc |
17224028 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| | || | | |
|
|
| T |
17224027 |
atactttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaacttt |
17223928 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgca--ataaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttg |
309 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| || | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17223927 |
gaacaattaat-tatttactc-aattaagcacttaatcataaaataattgaaaaattacactaaaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
17223830 |
T |
 |
| Q |
310 |
attatcaccaactagtagcacaagcttcacttt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17223829 |
attatcaccaattcttagcccaagcttcacttt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 111204 - 111130
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| Q |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
111204 |
taaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttgctcc |
111130 |
T |
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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16915115 - 16914866
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| | || ||||||| || ||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
16915115 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacgtttagagcataatt-caacatataacactttcac |
16915018 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || ||| |
|
|
| T |
16915017 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat |
16914918 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaa |
267 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || || | |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16914917 |
gaacaattaatcactt-actc-aattaagcacttaatcatacaataattgaaaa |
16914866 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 3049657 - 3049717
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| Q |
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3049657 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata |
3049717 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 9838939 - 9839145
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| Q |
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
9838939 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcac |
9839036 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || ||| |
|
|
| T |
9839037 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat |
9839136 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
9839137 |
gaacaatta |
9839145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 48356704 - 48356910
Alignment:
| Q |
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||| | || |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
48356704 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcac |
48356801 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||| |
|
|
| T |
48356802 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactat |
48356901 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
48356902 |
gaacaatta |
48356910 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattg--agcatattttcaacatataccaacttct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| || || |||||| || ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
9611367 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagaagcataatt-caacatataacactttca |
9611464 |
T |
 |
| Q |
114 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattta |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || || |
|
|
| T |
9611465 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta |
9611564 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
9611565 |
tgaacaatta |
9611574 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
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274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32493981 |
taaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
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T |
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Target: chr7; HSP #30
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
111450 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
111390 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
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Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
126489 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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Target: chr7; HSP #32
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274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgct |
346 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || | | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1936952 |
taaatgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgct |
1936880 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
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Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 2028995 - 2029055
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2028995 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
2029055 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 31 - 91
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| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2190367 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2190307 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 31 - 91
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| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42056470 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
42056410 |
T |
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Target: chr7; HSP #36
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Target Start/End: Complemental strand, 14272009 - 14271838
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| Q |
94 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattat |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| | || ||||| ||| |||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
14272009 |
ttcaacatatatcattttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcaccataattag |
14271910 |
T |
 |
| Q |
194 |
agcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaa |
267 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | || |||||||||||| || ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14271909 |
agcacgaatttga-caactatgaacaattaatc-atttactc-aattaagcacttattcatacaataattgaaaa |
14271838 |
T |
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Target: chr7; HSP #37
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| Q |
44 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16919646 |
cttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatattttgaacatg |
16919730 |
T |
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Target: chr7; HSP #38
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Alignment:
| Q |
35 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32494223 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
32494167 |
T |
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Target: chr7; HSP #39
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| Q |
47 |
atcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaaca |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || ||| |||||| |||||||| ||| || ||||||| |
|
|
| T |
28722200 |
atcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaaca |
28722298 |
T |
 |
| Q |
146 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaa |
220 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||| ||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
28722299 |
attcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttcaacaactatgaacaa |
28722373 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #40
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| Q |
281 |
ttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3060275 |
ttatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
3060342 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #41
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Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Original strand, 31501263 - 31501436
Alignment:
| Q |
47 |
atcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaaca |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| | |||| ||||| || ||| |||||| |||||||| ||| || || |||| |
|
|
| T |
31501263 |
atcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcat-tattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaataaca |
31501361 |
T |
 |
| Q |
146 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaa |
220 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31501362 |
attcaattatcaccaatttcatgtatttaaacatatcttcataattagatcactaatttcatcaactatgaacaa |
31501436 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34241317 - 34241188
Alignment:
| Q |
94 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattat |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34241317 |
ttcaacatatattactttcacatacttttaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataacatcataattat |
34241218 |
T |
 |
| Q |
194 |
agcacaaatttcatcatttatgaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
| ||| ||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34241217 |
aacacgaattttatcaactatgaacaatta |
34241188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:
Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6582 - 6265
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6582 |
aattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
6483 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
6482 |
atttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttatgaacagttaatcaat |
6383 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagc |
328 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || | |
|
|
| T |
6382 |
tcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcacccactattaac |
6285 |
T |
 |
| Q |
329 |
acaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6284 |
tcaagcttcacttttgctcc |
6265 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 302 - 1
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
302 |
tcaacaacaac-atcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaagcatattttcaacatataccaacttctc |
204 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
203 |
atactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttat |
104 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgatta |
313 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
103 |
taacatttaatcaattcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
6 |
T |
 |
| Q |
314 |
tcacc |
318 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
5 |
tcacc |
1 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 112732 - 112442
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| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
112732 |
caacaacaac-ataaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataattcactaattgagcatattttcaacatataccaatttctca |
112634 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
112633 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattgttcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatg |
112534 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
112533 |
aacaattaatcaattcacccaaa-taagtacttttcatacaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
112442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 103096 - 102858
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| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
103096 |
aattgaacatgaatgttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaaatttagcatattc-caccatataccactttctcatactttgaacatg |
102998 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
102997 |
aaatttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaa |
102898 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt |
269 |
Q |
| |
|
|| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
102897 |
tt-actc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatt |
102858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Original strand, 109650 - 109821
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
109650 |
caacaacaac-atcaactgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcaaaattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctc |
109747 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcata |
188 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||| |
|
|
| T |
109748 |
atactttaaacatgaaatttcattaacaacaattcaattatcaacaacttcatggattcaaacatatcatcata |
109821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9784249 - 9783960
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9784249 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaa---caacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctc |
9784154 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
9784153 |
atactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttat |
9784054 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcata-caataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9784053 |
gaacaatttatcaattcaccc-aattaagcacttttcataccaataattgaaaattgcagtaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
9783960 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 21718287 - 21718547
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| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
21718287 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttgaacacataccaatttctc |
21718385 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
21718386 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccat |
21718485 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaataattg-aaaattgcaataa |
276 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21718486 |
gaacaattaatcaattcaccc-aattaagcacttttcatacaataattgaaaaattgcaataa |
21718547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 308
Target Start/End: Original strand, 35054830 - 35055107
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtg |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35054830 |
attgatcatgaaacttatcacagttcatcaactacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgta |
35054929 |
T |
 |
| Q |
131 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaatt |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35054930 |
attcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaattaaatcatttatgaacaattaaccaatt |
35055029 |
T |
 |
| Q |
231 |
cacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35055030 |
caccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaatagaaataagtgattatgatgaattttaacccccttacctt |
35055107 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22403279 - 22403006
Alignment:
| Q |
35 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtgat |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
22403279 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
22403181 |
T |
 |
| Q |
133 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattca |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22403180 |
tcaactaaca-caatttaattattcataacttcatacatctagacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
22403082 |
T |
 |
| Q |
233 |
cccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22403081 |
ccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
22403006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 49967710 - 49968001
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || | | |
|
|
| T |
49967710 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacgtatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttta |
49967808 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
49967809 |
taatttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatgatttttg |
49967908 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
49967909 |
aacaattaatcaattcatcc-aattaagcacttttcatgcaaataattgaaaattacaataagtgattacgatgaattctaacccccttacctt |
49968001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Original strand, 41212145 - 41212403
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41212145 |
aattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacagtgcataattcactaattgagcatattttta-cacatacccatttttcatactttgaacatac |
41212243 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41212244 |
agttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacctctaaacaggtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
41212343 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaa |
290 |
Q |
| |
|
||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
41212344 |
tcatcc-aattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaa |
41212403 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 124 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35522432 - 35522248
Alignment:
| Q |
124 |
acatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35522432 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatta |
35522333 |
T |
 |
| Q |
224 |
ttcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35522332 |
atcaattcaccc-aattaagcccttttcatacaaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaactcccttacctt |
35522248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 51627851 - 51627559
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
51627851 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaccatatcataattcaaccaattgaacata-tttcaacatataccattttctc |
51627754 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||||| | | |||| |
|
|
| T |
51627753 |
atactttgaacatgaagtttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataattggagcacaaattctaacgattat |
51627654 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgca--ataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||| || | |||||||||||| ||||| ||| |||||||| || || | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
51627653 |
gaacaaataatcaatt-actc-aattaagcacttattcatgcaacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
51627559 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 348
Target Start/End: Original strand, 20177267 - 20177568
Alignment:
| Q |
49 |
cacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaat |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |
|
|
| T |
20177267 |
cacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaat |
20177365 |
T |
 |
| Q |
148 |
tcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcact |
247 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
20177366 |
tcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaa-ttaagcact |
20177463 |
T |
 |
| Q |
248 |
ttt-catacaataattgaaaa-ttgcaataaa-tggttatgat-gaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcactttt |
343 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| || || |||| || ||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20177464 |
taaacatacaataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaaccccattaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttta |
20177563 |
T |
 |
| Q |
344 |
gctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
20177564 |
gctcc |
20177568 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27329928 - 27329769
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac--ttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
27329928 |
attgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatactttgatcatg |
27329831 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataatt |
191 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27329830 |
aagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatatatacaaacatgtcatcataatt |
27329769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Original strand, 16645985 - 16646223
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16645985 |
aattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagaataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatg |
16646083 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
||| || |||| ||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16646084 |
aaattttaccaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaa |
16646183 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt |
269 |
Q |
| |
|
|| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16646184 |
tt-actc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatt |
16646223 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Original strand, 16656711 - 16656949
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16656711 |
aattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacacg |
16656809 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16656810 |
aagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaa |
16656909 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt |
269 |
Q |
| |
|
|| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16656910 |
tt-actc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatt |
16656949 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 35522507 - 35522432
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35522507 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
35522432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13376969 - 13376713
Alignment:
| Q |
94 |
ttcaacatataccaacttct-catactttgaacatgtgatt-caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataatt |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13376969 |
ttcaacatatacca-cttcttcatactttgaacatgaaatttcaacga-caacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataatt |
13376872 |
T |
 |
| Q |
192 |
atagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttt-tcatacaataattgaaaa-ttgcaataaa-tggttatgat- |
287 |
Q |
| |
|
| ||||| | | ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||| || ||||||| |
|
|
| T |
13376871 |
agagcacgattctcatcatctatgaacaattaatcaatta--ctaaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaaatgattatgatt |
13376774 |
T |
 |
| Q |
288 |
gaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13376773 |
gaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctcc |
13376713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 41218725 - 41218799
Alignment:
| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41218725 |
taaatgatcatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 308
Target Start/End: Original strand, 19603279 - 19603448
Alignment:
| Q |
139 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||||||| |||||| || | || |
|
|
| T |
19603279 |
aacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcaatt-actc-aa |
19603376 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttaagcactt-ttcatacaataattgaaaa-ttgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |
|
|
| T |
19603377 |
ttaagcacttattcatacaataattgaaaatttgcactaaatgattatgatgaattctagcccccttacctt |
19603448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37234047 - 37233722
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| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
37234047 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaccacaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatatatcactttcat |
37233950 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||| |||| | || ||| |
|
|
| T |
37233949 |
atactttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactaaagcacgaattctaacaactat |
37233850 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttgat |
311 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || || | |||||||||||| | |||||||||||| |||||| || |||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
37233849 |
taacaattactcactt-actc-aattaagcacttaataatacaataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat |
37233752 |
T |
 |
| Q |
312 |
tatcaccaactagtagcacaagcttcacttt |
342 |
Q |
| |
|
|| || ||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37233751 |
tagca-caattcctagcccaagcttcacttt |
37233722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44034906 - 44034832
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| Q |
274 |
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Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44034906 |
taaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
44034832 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 275 - 348
Target Start/End: Original strand, 21860332 - 21860405
Alignment:
| Q |
275 |
aaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21860332 |
aaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
21860405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15861607 - 15861547
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15861607 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15861547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 21860089 - 21860145
Alignment:
| Q |
35 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21860089 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21860145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 44035152 - 44035092
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44035152 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaaatgagcata |
44035092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20955480 - 20955335
Alignment:
| Q |
163 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataat |
261 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || ||| || | |||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
20955480 |
ttcatacattcaaacataacatcataattggagcacaaattctaacaattatgaacaattaatc-atttactc-aattaagcacttattcatacaacaat |
20955383 |
T |
 |
| Q |
262 |
tgaaaa-ttgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20955382 |
tgaaaatttgcactaaatgattatgatgaattataacccccttacctt |
20955335 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22143451 - 22143299
Alignment:
| Q |
114 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattta |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |
|
|
| T |
22143451 |
catactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta |
22143352 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaa |
267 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22143351 |
tgaacaattaatcatttatcc--aattaagcacttattcatacaataattgaaaa |
22143299 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22829493 - 22829324
Alignment:
| Q |
136 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcaccc |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | || ||||||| ||||| |||||| || | |
|
|
| T |
22829493 |
actaacaacaaatcaattatcaccagtttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaataattaatcaatt-actc |
22829395 |
T |
 |
| Q |
236 |
aaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttac |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
22829394 |
-aattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattgcactaaatgattatgatgaattctaacccccttac |
22829324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 22367093 - 22367152
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22367093 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcat-attcaccaattgagcata |
22367152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 9784288 - 9784238
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9784288 |
tcaacaacaac-atcaattgatcttgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
9784238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 348
Target Start/End: Original strand, 41394531 - 41394598
Alignment:
| Q |
281 |
ttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41394531 |
ttatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcc |
41394598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 203
Target Start/End: Original strand, 17609001 - 17609174
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17609001 |
aattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcatatactttgaacatg |
17609099 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatt |
203 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||| |||||||| || ||||| ||| ||| || |||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
17609100 |
caatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaatt |
17609174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8538000 - 8537908
Alignment:
| Q |
114 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttca |
206 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||||| |
|
|
| T |
8538000 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttca |
8537908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8603239 - 8603147
Alignment:
| Q |
114 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttca |
206 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||||| |
|
|
| T |
8603239 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttca |
8603147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27329722 - 27329662
Alignment:
| Q |
249 |
ttcatacaataattgaaaa-ttgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27329722 |
ttcataccataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
27329662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0338 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:
Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9338
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9047 |
caacaacaac-atcaagtgatcttgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
9145 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9146 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatg |
9245 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaataattg--aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9246 |
aaaaattaatcaattcactc-aattaagcacttttcatacaataattgaaaaaattgcaat-aatgattatgataaattctaacccccttacctt |
9338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 32898863 - 32899141
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32898863 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgt |
32898962 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32898963 |
aattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
32899062 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcata-caataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32899063 |
tca-ccaaattaagcacttttcataccaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
32899141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Original strand, 16086076 - 16086368
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | || || |
|
|
| T |
16086076 |
tcaacaacaac-atcaaatgatcatgaaacttatcataattcaacaacaacaaggtataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccatttttc |
16086174 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16086175 |
gtactttgaacatgtaattcaacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttat |
16086274 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaa-taattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16086275 |
gaacaattaattaattcaccc-aattaagcacttttcatacaattaattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
16086368 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Original strand, 16106575 - 16106867
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || || |
|
|
| T |
16106575 |
tcaacaacaac-atcaaatgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaggtataattcaccaattaagcatattttcaacacatactcatttttc |
16106673 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16106674 |
atactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttac |
16106773 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaa-taattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16106774 |
gaacaattaattaattcactc-aattaagcacttttcatacaattaattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
16106867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 18432716 - 18432993
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18432716 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatacacccatttttcatacttttaacatgt |
18432815 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
18432816 |
aattcaatcaacaacaattcaagtattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaaataatcaat |
18432915 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatacaataattgaaaa-ttgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18432916 |
tcaccc-aattaagctcttttcatacaataattgaaaatttgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
18432993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 308
Target Start/End: Original strand, 18570353 - 18570629
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtg |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570353 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgta |
18570452 |
T |
 |
| Q |
131 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaatt |
230 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18570453 |
atttaactaataacaattcaattatccataacatcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaatt |
18570552 |
T |
 |
| Q |
231 |
cacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18570553 |
catcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aattgattatgatgaattctaacccccttacctt |
18570629 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 31628327 - 31628548
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31628327 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctc |
31628425 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31628426 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatcaataacttcatacatctaaacatgtaatcataattcgaatacgaatttcatcatttat |
31628525 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaa |
237 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31628526 |
gaacaattaatcaattcacccaa |
31628548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Original strand, 18777220 - 18777412
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtg |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18777220 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgta |
18777319 |
T |
 |
| Q |
131 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18777320 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcttttatgaacaatta |
18777412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13014883 - 13014604
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
13014883 |
aattgatcttgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttccaactcatacccatttttcatacttc-aacatac |
13014785 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13014784 |
aattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattaaagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaat |
13014685 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcataca---ataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13014684 |
tcaccc-aatttagcacttttcatacaaacataattgaaaattacaataagtgattatgataaattctaacccccttacctt |
13014604 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 22441007 - 22441284
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22441007 |
aattgatcatgaaacttatcacaaatcatgaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactcatacccatttttcatacttttaacatgt |
22441106 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22441107 |
aattcaccccatcacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaat |
22441206 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22441207 |
tcactc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattgcaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
22441284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 18398998 - 18399289
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
18398998 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatactattttctc |
18399095 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | || |||| |
|
|
| T |
18399096 |
atactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
18399195 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaat-aaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18399196 |
gaacaattagtcaatt-actc-aattaagcacttattcatacaataattgaaatttacactaaaatgattatgaagaattctaacccccttacctt |
18399289 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 348
Target Start/End: Original strand, 21623255 - 21623561
Alignment:
| Q |
44 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaaca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
21623255 |
cttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcagcaaca |
21623353 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaa |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| || | |||||| |
|
|
| T |
21623354 |
acaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaattctaacatttatgaacaattaatcaatt-actc-aattaa |
21623451 |
T |
 |
| Q |
243 |
gcactt-ttcatacaataattga-aaattgcaat-aaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttca |
338 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||| ||||| || | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
21623452 |
gcacttattcatacaacaattgagaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttca |
21623551 |
T |
 |
| Q |
339 |
cttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |
|
|
| T |
21623552 |
ctttagctcc |
21623561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22361952 - 22361621
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||| || ||||| |
|
|
| T |
22361952 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacttatgtcactttctc |
22361855 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
22361854 |
atactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatcatctat |
22361755 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttgat |
311 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
22361754 |
gaacaattaatcattt--gctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattacta-aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat |
22361658 |
T |
 |
| Q |
312 |
tatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22361657 |
tatcaccaattcctaggccaagcttcactttagctcc |
22361621 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25367424 - 25367131
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
25367424 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagcata-tttcaacataaaccactttctc |
25367327 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc-cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattta |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | || ||| |
|
|
| T |
25367326 |
atactttgaacatgaaatttctctaacaacaattccattatcaaaaaacttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatta |
25367227 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaa-ttgcaat-aaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25367226 |
tgaacaattaatcaatt--gctcaattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
25367131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21411191 - 21410945
Alignment:
| Q |
62 |
caacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
161 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| | || |
|
|
| T |
21411191 |
caacatagcataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttatttaacaaccattcaattatcaacaa |
21411093 |
T |
 |
| Q |
162 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataa |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21411092 |
cttcatgcattcatacataacatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaattagtcaatt--cctcaattaagcacttattcatacaataa |
21410995 |
T |
 |
| Q |
261 |
ttgaaaa-ttgcaat-aaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||| || || | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21410994 |
ttgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
21410945 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18381870 - 18381684
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattga-gcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
18381870 |
caacaacaac-atcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatttaagcataatt-caacatatatcactttctc |
18381773 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatt |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| | |||||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18381772 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatcataattagagcacaaatt |
18381684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28195268 - 28195106
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaa-cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcacc-aattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacat |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| || |||||||||||| |||| || |||||||||| | ||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28195268 |
aattgatcataaaatctcatcacaattcaacaacatcatggcataattcaactaattgagcacattt-catcatataccattttctcatactatgaacat |
28195170 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataatt |
191 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28195169 |
gaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcatacattcaaacatatcatcataatt |
28195106 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 18583637 - 18583711
Alignment:
| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18583637 |
taaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcc |
18583711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 91
Target Start/End: Original strand, 18583376 - 18583451
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18583376 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
18583451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 26089809 - 26089869
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26089809 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
26089869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19983227 - 19983153
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| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19983227 |
taaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
19983153 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35015092 - 35015018
Alignment:
| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35015092 |
taaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
35015018 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15742401 - 15742341
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15742401 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15742341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 308
Target Start/End: Original strand, 18777408 - 18777480
Alignment:
| Q |
237 |
aattaagcacttttcatacaa-taattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18777408 |
aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattccaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
18777480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 23994997 - 23995057
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23994997 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
23995057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 35015338 - 35015278
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35015338 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
35015278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 156
Target Start/End: Original strand, 25651297 - 25651436
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
25651297 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcac |
25651394 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25651395 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
25651436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18002677 - 18002617
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18002677 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcatcaattgagcata |
18002617 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18629712 - 18629589
Alignment:
| Q |
100 |
atataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcaca |
199 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18629712 |
atataccactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacg |
18629613 |
T |
 |
| Q |
200 |
aatttcatcatttatgaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
18629612 |
aattttaacaactatgaacaatta |
18629589 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 308
Target Start/End: Original strand, 33324874 - 33325045
Alignment:
| Q |
139 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||| || ||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
33324874 |
aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaattatcc--aa |
33324971 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttaagcactt-ttcatacaataattgaa--aattgcaat-aaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||| |||||||| |||| || | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
33324972 |
ttaatcacttattcatacattaattgaaataattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
33325045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17557127 - 17557018
Alignment:
| Q |
94 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattat |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17557127 |
ttcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatc-aaacatatcatcataattag |
17557029 |
T |
 |
| Q |
194 |
agcacaaattt |
204 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
17557028 |
agcacgaattt |
17557018 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25744385 - 25744331
Alignment:
| Q |
32 |
ttgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattga |
86 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25744385 |
ttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccacttga |
25744331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 220
Target Start/End: Original strand, 29605607 - 29605712
Alignment:
| Q |
114 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattta |
213 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| || || |
|
|
| T |
29605607 |
catactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaa-ttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaacta |
29605705 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaa |
220 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
29605706 |
tgaacaa |
29605712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17083385 - 17083179
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||| | |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||| | ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
17083385 |
tcaacaacaac-atcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcaca-attcaacatatatcattttca |
17083288 |
T |
 |
| Q |
114 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattta |
213 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| || | ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| | | || || |
|
|
| T |
17083287 |
catactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattat-caccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatattaacaacta |
17083189 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
17083188 |
tgaacaatta |
17083179 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 85392 - 85682
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
85392 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattaagcatattttcaatatataccaatttctca |
85490 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
85491 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttata |
85590 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
85591 |
aacaattaatcaattcaccc-aattaagcacttttcatacaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
85682 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 159359 - 159650
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |
|
|
| T |
159359 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataatttcaactcatatcattttctc |
159457 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
159458 |
atactttgaacatgaaattcaactaacaacaatgccattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttat |
159557 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
159558 |
gaacaattaatcaattcaccc-aattaagcacttttcgtacaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
159650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 253163 - 252903
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
253163 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcatgattcaccaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaaaatgt |
253064 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
253063 |
aattcaactaacaacaattcaattatccctaacttcatacatccaaacatgtcatcataatcaaagcacgaattttatcatttatgcacaattaatcaat |
252964 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaa |
290 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
252963 |
tcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaa |
252903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Original strand, 5001 - 5235
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5001 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctca |
5099 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5100 |
tactgtgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatg |
5199 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttca |
252 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5200 |
aacaattaattaattcaccc-aattaagcacttttca |
5235 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20561805 - 20561527
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20561805 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgt |
20561706 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20561705 |
aattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
20561606 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20561605 |
tcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
20561527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20573380 - 20573088
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
20573380 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccttttcat |
20573282 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20573281 |
acactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttat |
20573182 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20573181 |
gaacaattaatcaattcaccc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
20573088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 41246718 - 41247008
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | || || |
|
|
| T |
41246718 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattaagcatattt-catcatatacccatttttcc |
41246815 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
41246816 |
tacttttaacatgtaattcaaccaacaacaatttaattattcataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatg |
41246915 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaa-taattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41246916 |
aaaaattaatcaattcatcc-aattaagcacttttcatacaactaattgaaaattacaataagtgattatgatgaactctaacccccttacctt |
41247008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 37611741 - 37612019
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30 |
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127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37611741 |
aattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacat |
37611839 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
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| T |
37611840 |
gtaattcaactaaca-caattcaattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatca |
37611938 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37611939 |
attca-tctaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattataataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
37612019 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 21681075 - 21681355
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| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21681075 |
aattgatcatgaaactaatcacaattcaacaacaacaaagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatatacccttctctcatactttaaacatg |
21681174 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
21681175 |
aaattcaactaacaataattcaattatccataaacttatacattcaaatatgtcatcataattagatcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa |
21681274 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21681275 |
ttca-acaaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
21681355 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 20481665 - 20481954
Alignment:
| Q |
16 |
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115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | || ||| |
|
|
| T |
20481665 |
caacaacaac-atcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagtataattcaccaattgagcatattatcaacacatatccatttttca |
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T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20481764 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatg |
20481863 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||| || |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20481864 |
aacaaataatcaattatcc--aattaagcacttattcatacattaattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattttaacccccttacctt |
20481954 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22234977 - 22234701
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| Q |
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127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||| ||| |
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|
| T |
22234977 |
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T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22234879 |
gtaattcaactaaca-caattaaattattcataacttcatacatctaaacacgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatca |
22234781 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22234780 |
attcattc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19993228 - 19992993
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| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacat |
127 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |||||||| |
|
|
| T |
19993228 |
aattgatgatgaaatttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacaa |
19993131 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19993130 |
gtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcgtacatctaaacatgtcatcataattagagtacggatttcatcatttatgaacaattaatca |
19993032 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaa |
266 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19993031 |
attcatcc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Original strand, 22981351 - 22981621
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133 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22981351 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatgaaatt |
22981449 |
T |
 |
| Q |
134 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcac |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
22981450 |
tctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacaaatttcatca--tctgaacaattaatcaatt-ac |
22981546 |
T |
 |
| Q |
234 |
ccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22981547 |
cc-aattaagcacttattcatacaa-aattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
22981621 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20654079 - 20653944
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30 |
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129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20654079 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaattaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgt |
20653980 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20653979 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
20653944 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21198339 - 21198007
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114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
21198339 |
caacaacaac-atcaattgaacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctc |
21198242 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
21198241 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatctat |
21198142 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaat-aaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgat |
311 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| || |
|
|
| T |
21198141 |
gaacaattaatcaatt-actc-aattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaaatgattataatgaattctaacccccttatcttaat |
21198044 |
T |
 |
| Q |
312 |
tatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21198043 |
tatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcc |
21198007 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 133 - 308
Target Start/End: Original strand, 25122618 - 25122792
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| Q |
133 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattca |
232 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25122618 |
tcaactagcaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattggagcacgaatttgatcatttatgaacaattaatcaattca |
25122717 |
T |
 |
| Q |
233 |
cccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25122718 |
tcc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattataat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
25122792 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20648003 - 20647882
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| Q |
30 |
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129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20648003 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgt |
20647904 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20647903 |
aattcaactaacaacaattcaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
23837258 |
caacaacaac-atcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatagtt-caacatatatcactttctc |
23837355 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
23837356 |
atactttgaacatgaaatttcaataacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctat |
23837455 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaat |
268 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23837456 |
gaacaattaatc-atttactc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaaat |
23837508 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39446953 - 39446661
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttct- |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
39446953 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcatattt-caacatataaca-cttctt |
39446857 |
T |
 |
| Q |
114 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattta |
213 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| | || ||| |
|
|
| T |
39446856 |
catactttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaatta |
39446757 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgca--ataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||||||| |||||||| || || | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
39446756 |
tgaacaattaatcaatt-actc-aattaagcatttattcatacaacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 16 - 262
Target Start/End: Original strand, 38533709 - 38533953
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38533709 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaataatttgagcatattt-caacatataccattttctc |
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T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| || || |||| | || |||| |
|
|
| T |
38533807 |
atactttgaacatgagatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaattctaacaattat |
38533906 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataatt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38533907 |
gaacaattagtcaatt--acttaattaagcacttattcatacaataatt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
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Target Start/End: Original strand, 17285341 - 17285598
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
17285341 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattgg |
17285440 |
T |
 |
| Q |
194 |
agcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt---gcaataaatggttatga-tg |
288 |
Q |
| |
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||||| |||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | ||||| |||||| || |
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|
| T |
17285441 |
agcacgaattctaacaattatgaacaattattcaattattc--aattaagcacttaatcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgattg |
17285538 |
T |
 |
| Q |
289 |
aaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17285539 |
aattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctaacccaagcttcactttagctcc |
17285598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 348
Target Start/End: Original strand, 5854674 - 5855005
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| || ||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
5854674 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcat |
5854771 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || ||| |
|
|
| T |
5854772 |
atactttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat |
5854871 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttgat |
311 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
5854872 |
gaacaattaatcactt-actc-aattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacctccttaccttaat |
5854969 |
T |
 |
| Q |
312 |
tatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|| || ||| | |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5854970 |
tagca-caattcctagcccaagcttcactttagctcc |
5855005 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 26011554 - 26011824
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| | |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
26011554 |
caacaacaac-atcaattcaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcac |
26011651 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || ||| |
|
|
| T |
26011652 |
atactttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat |
26011751 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgat |
287 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || || | |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| |
|
|
| T |
26011752 |
gaacaattaatcactt-actc-aattaaacacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaatgattatgat |
26011824 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 214 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20529843 - 20529749
Alignment:
| Q |
214 |
tgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaa-taattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20529843 |
tgaacaattaatcaattcacccaa-ttaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattataacccccttacctt |
20529749 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 15933358 - 15933628
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||| | || |||||| || || ||||||| || |||||| || || ||| | |
|
|
| T |
15933358 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataatt-caacatttaacactttcac |
15933455 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||| |
|
|
| T |
15933456 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactat |
15933555 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgat |
287 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| |
|
|
| T |
15933556 |
gaacaattaatcactt-actc-aattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaatgattatgat |
15933628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 39115595 - 39115669
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| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39115595 |
taaatgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgctcc |
39115669 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 274763 - 274837
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| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
274763 |
taaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
274837 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 641086 - 641012
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| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
641086 |
taaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
641012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 826892 - 826818
Alignment:
| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
826892 |
taaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
826818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24716797 - 24716723
Alignment:
| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24716797 |
taaatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
24716723 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
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Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
274517 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacata |
274577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 641332 - 641272
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
641332 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacata |
641272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 827138 - 827078
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
827138 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacata |
827078 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16039062 - 16039002
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16039062 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcata |
16039002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 41506990 - 41506930
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41506990 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
41506930 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16404928 - 16404861
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| Q |
281 |
ttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16404928 |
ttatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
16404861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23226141 - 23225934
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| Q |
139 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| | | || |
|
|
| T |
23226141 |
aacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattttaacatctatgaacaattaatcatt-----ccaa |
23226047 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttaagcac-ttttcatacaataattg-aaaattgcaat-aaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagct |
335 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| | ||||||| || | ||| || | |||| |||||| |
|
|
| T |
23226046 |
ttaaacactttttcatacaataattgaaaaattgcactaaaatgattatgatgaattctaacccctttaccttaatgagcacaaattcctagcccaagct |
23225947 |
T |
 |
| Q |
336 |
tcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |
|
|
| T |
23225946 |
tcactttagctcc |
23225934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 39115349 - 39115409
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| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39115349 |
attgatcatgaaacatatcacgattcatcaacaactatgcataattcaccaattgagcata |
39115409 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7000616 - 7000524
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| Q |
212 |
tatgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaa-taattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttac |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||| |||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7000616 |
tatgaacaattaatcaattcatccta-ttaagcacttatcatacaaataattgaaaattaaaa-aagtgattatgatgaaaactaacccccttac |
7000524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Original strand, 29306477 - 29306681
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| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| | |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
29306477 |
caacaacaac-atcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcattttcac |
29306574 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||| | | ||| ||| |
|
|
| T |
29306575 |
aaactttgaacatacaaattcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcatagttagagcacgaatattaacatctat |
29306674 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaat |
221 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
29306675 |
gaacaat |
29306681 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 308
Target Start/End: Original strand, 15970046 - 15970172
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| Q |
182 |
catcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatg |
279 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||||||| ||| || || ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15970046 |
catcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcattt-actcaa-ttaagcatttattcatacaataattgaaaaattgcactaaatg |
15970143 |
T |
 |
| Q |
280 |
gttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
15970144 |
attatgatgaattccaacccccttacctt |
15970172 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
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| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24717043 |
attgaacatgaaacaaatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
24716983 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
237 |
aattaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt-gcaataaa--tggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31194293 |
aattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttgcactaaaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctt |
31194218 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
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| Q |
139 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
33528607 |
aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacggaattcaacatctaagaacaatta |
33528691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Original strand, 271229 - 271520
Alignment:
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15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |
|
|
| T |
271229 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttcat |
271327 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
271328 |
acactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcttcatttat |
271427 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
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|
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| T |
271428 |
gaataattaatcaattcaccc-aattaagcacttttcatacaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
271520 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36890859 - 36890582
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36890859 |
aattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacatagcataattcaccaattaagcatattttcaacatattccattttctcatactttgaacatgt |
36890760 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36890759 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgccatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
36890660 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatacaataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36890659 |
tcacccaaa-taagcacttttcataccataattgaaaataacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
36890582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 25602084 - 25602376
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
25602084 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataactcaccaattgagcatattttcaacatatatcaatttctca |
25602182 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
25602183 |
tactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatccatg |
25602282 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25602283 |
aacaattaatcaattcaccc-aattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
25602376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 28974109 - 28974399
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28974109 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttaccacaattcatcaacaacatagcataattcgccaaatgagcatattttcaacatataccattttctca |
28974207 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28974208 |
tactttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatg |
28974307 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28974308 |
aacaattaatcaattca-ccaaattaagcacttttcatacaataattgaaaaattgaaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
28974399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4448321 - 4448029
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | ||| |
|
|
| T |
4448321 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcataattcaacaacaacaaagcatcattcaccaattgaacatattttcaacacaaacccatttcat |
4448223 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4448222 |
acactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttat |
4448123 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcata-caataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4448122 |
gaacaattaatcaattcactc-aattaagcacttttcatataaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
4448029 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 68 - 308
Target Start/End: Original strand, 27261915 - 27262155
Alignment:
| Q |
68 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
27261915 |
agcataattcaccaat-gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattgaactaacaacaattcaattatccataactttat |
27262013 |
T |
 |
| Q |
168 |
acatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aa |
265 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
27262014 |
acatccaaacatgtcatcataattagggcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcatcc-aattaagcacttattcatacaataattgaaa |
27262112 |
T |
 |
| Q |
266 |
aattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27262113 |
aattgcaataaatgattatgatgaattctaactcccttacctt |
27262155 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25876091 - 25875817
Alignment:
| Q |
32 |
ttgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25876091 |
ttgatcatgaagcatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgt |
25875994 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25875993 |
aattcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaat |
25875895 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25875894 |
tcatcc-aattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
25875817 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23836879 - 23836602
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacat |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23836879 |
aattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttttcacacataccca-ttttcatacactttgaacat |
23836781 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
23836780 |
gtaattccactaac-acaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatca |
23836682 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23836681 |
attca-tctaattaagcacttatcattcaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
23836602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 32465918 - 32466206
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | || ||| |
|
|
| T |
32465918 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatatccatttttca |
32466015 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
32466016 |
tactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatg |
32466115 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||| ||| || ||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32466116 |
aacaattaatcaattcattcaaa-taagcacttatcgtacaaataattaaaattttcaa-aagtgattatgatgaagactaacc-ccttacctt |
32466206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24571479 - 24571189
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
24571479 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattgagcatattt-caacatatatcattttctc |
24571382 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24571381 |
ataccttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaagtatccacaacttcatgcattcaaacgtgtcatcaaaattagagcacgaatttcatcatctat |
24571282 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaa-attgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
24571281 |
gaacaattaatcaatt-accc-aattaagcatttattcatacaataattgaaacattgcaat-aatgattatgatgaattctaaccccctaacctt |
24571189 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22580033 - 22579759
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactttgaacat |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
22580033 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaa---caacaaagcataattcaaccaattgagcatattt-caacatataacatttttctcataccttgatcat |
22579938 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22579937 |
aaagtttcaccaacaacaattcaattatc-ataacttcatacatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatca |
22579839 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22579838 |
att-acac-aattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaat-agtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
22579759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Original strand, 68052 - 68303
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
68052 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctc |
68149 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | || |||| |
|
|
| T |
68150 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
68249 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt |
269 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
68250 |
gaacaattaatctatt-actc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatt |
68303 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 348
Target Start/End: Original strand, 43645953 - 43646287
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
43645953 |
caacaacaac-atcaattgaacatgattcttaccacagttcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctc |
43646050 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| || ||||||||| |||||||| | |||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||| | || | | |
|
|
| T |
43646051 |
atactttaaacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaattataacaacttt |
43646150 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt---gcaataaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttg |
309 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| || | |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| | | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43646151 |
gaacaattaatc-atttactc-aattaaacacttattcatacaacaattggaaatttacactaaaaatgattatgactgaattctaacccccttacctta |
43646248 |
T |
 |
| Q |
310 |
attatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43646249 |
attatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcc |
43646287 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31146354 - 31146194
Alignment:
| Q |
30 |
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128 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31146354 |
aattgaacaggaatcttattacaattcaacaaca-catagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatactttgaacata |
31146257 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataatt |
191 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31146256 |
aaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataatt |
31146194 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Original strand, 6879510 - 6879577
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttca |
97 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6879510 |
aattgatcattaaacatatcacaattcatcaataacaatgcataattcaccaattgagtatattttca |
6879577 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 308
Target Start/End: Original strand, 722573 - 722741
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| Q |
139 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||||||| || ||| || | || |
|
|
| T |
722573 |
aacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataatatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatc-atttactc-aa |
722670 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||| |
|
|
| T |
722671 |
ttaagcacttattcatacaacaattgcaaattgcactaaatgattatgatgaattctaacccctttacctt |
722741 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
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Target Start/End: Complemental strand, 19794657 - 19794591
Alignment:
| Q |
281 |
ttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctc |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19794657 |
ttatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctc |
19794591 |
T |
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Target: chr2; HSP #18
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Target Start/End: Original strand, 22274796 - 22274856
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| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22274796 |
attgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
22274856 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 22284029 - 22284089
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| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22284029 |
attgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
22284089 |
T |
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Target: chr2; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 281 - 348
Target Start/End: Original strand, 15633541 - 15633608
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| Q |
281 |
ttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15633541 |
ttatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcc |
15633608 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23821704 - 23821535
Alignment:
| Q |
139 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||||| ||| || || | || |
|
|
| T |
23821704 |
aacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actc-aa |
23821607 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||| || |||||| |||| |||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23821606 |
ttaagcacttaagcatgcaataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttacctt |
23821535 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23830783 - 23830614
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| Q |
139 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||||| ||| || || | || |
|
|
| T |
23830783 |
aacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actc-aa |
23830686 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |||||| || |||||| |||| |||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23830685 |
ttaagcacttaagcatgcaataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttacctt |
23830614 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43642909 - 43642842
Alignment:
| Q |
281 |
ttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43642909 |
ttatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
43642842 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 22275042 - 22275116
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| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| || |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22275042 |
taaatgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
22275116 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 22284275 - 22284349
Alignment:
| Q |
274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22284275 |
taaatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcc |
22284349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22775379 - 22775218
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| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| || | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22775379 |
aattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctcatactttgaacatg |
22775281 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataatt |
191 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22775280 |
aagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataatt |
22775218 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22780757 - 22780596
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| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| || | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22780757 |
aattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctcatactttgaacatg |
22780659 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataatt |
191 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22780658 |
aagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataatt |
22780596 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 348
Target Start/End: Original strand, 19666806 - 19666919
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| Q |
237 |
aattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagc |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| || | |||| ||| | |
|
|
| T |
19666806 |
aattaagcatttattcatacaataattgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaaac |
19666905 |
T |
 |
| Q |
335 |
ttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |
|
|
| T |
19666906 |
ttcactttagctcc |
19666919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 21274230 - 21274174
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag |
87 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21274230 |
attgatcatgaaacatattacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
21274174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20627266 - 20627199
Alignment:
| Q |
281 |
ttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20627266 |
ttatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
20627199 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 9653077 - 9653021
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag |
87 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9653077 |
attgatcatgaaaaatatcgcaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
9653021 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 19433519 - 19433452
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt |
84 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19433519 |
caacaacaac-atcaattgaacatgattcttacaacaattcaataacaacatagcataattcaacaatt |
19433452 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 25305518 - 25305617
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataa-caacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacat |
127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25305518 |
aattgaacatgactcttaccacaattcaacaatcaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacacatatcactttctcatactttgaacat |
25305616 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11337373 - 11337082
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
11337373 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaaatgagcatattttcaacatttaccatattctca |
11337275 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11337274 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatg |
11337175 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11337174 |
aacaattaaccaattcatcc-aattaagcacttattcatacaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
11337082 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24183320 - 24183028
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24183320 |
tcaacaaca-ccatcaattgatcatgaaactcatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcat |
24183222 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24183221 |
acactttgaacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccatgacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttat |
24183122 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24183121 |
gaacaattaatcaattcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
24183028 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1168391 - 1168101
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
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|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
1168391 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcattttctca |
1168293 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
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|||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1168292 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaaccattctattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatg |
1168193 |
T |
 |
| Q |
216 |
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308 |
Q |
| |
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|
| T |
1168192 |
aacaattaatcaattca-ccaaaataagcatttttcatacaaataattgaaaattgcaataagt-gatatgatgaattctaacccccttacctt |
1168101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 19405610 - 19405890
Alignment:
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30 |
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128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
19405610 |
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19405709 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
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| T |
19405710 |
aaattcaactaacaataattcaattatccataacttcatacattcaaatatgtcatcataattagagcataaatttcatcatttatgaacaattaatcaa |
19405809 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19405810 |
ttcaccc-aattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
19405890 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 20712136 - 20712427
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
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|||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || ||| |
|
|
| T |
20712136 |
caacaacaac-atcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattatcaacacatacccatttttca |
20712234 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20712235 |
tactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcagttatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca-ttatg |
20712333 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaa-taattgaaaattgc-aataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20712334 |
aacaattaatcaattcactc-aattaagcacttttcatacaagtaattgaaaattgcaaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
20712427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 21397165 - 21397443
Alignment:
| Q |
30 |
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127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacat |
21397263 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
21397264 |
gtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatca |
21397362 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21397363 |
attcatcc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 4865336 - 4865612
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| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4865336 |
aattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaccacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaccc-atacccatttttcatactttgaacatac |
4865434 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4865435 |
aattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccatttatgaacaattaatcaat |
4865534 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
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||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4865535 |
tcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
4865612 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 348
Target Start/End: Original strand, 11584125 - 11584444
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaa---agcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacat |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| |
|
|
| T |
11584125 |
attgatcatgaaacatatcacaattcaacaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcatacacttgaaacat |
11584224 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||||| || | ||||||||||| | | |
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|
| T |
11584225 |
gaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaatatgtcatcataaatagagcacgaatttcaccactcatgaacaattaatta |
11584324 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagta |
326 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| || |
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|
| T |
11584325 |
attcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaactatta |
11584422 |
T |
 |
| Q |
327 |
gcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11584423 |
actcaagcttcacttttgctcc |
11584444 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 28261594 - 28261866
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30 |
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128 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28261594 |
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28261687 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28261688 |
caattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataactagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaa |
28261787 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28261788 |
ttcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
28261866 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21646913 - 21646637
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30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttca-acatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
21646913 |
aattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacgatacataattcaccaattgaacatattttcatacatac-ccattttcatacacttttaacatg |
21646815 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
21646814 |
taattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcacatatgaacatttaatcaa |
21646716 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21646715 |
ttcacccaaa-taagcacttttcatacaaataattg-aaattgcaataagtgattatgatgaattttaacccccttacctt |
21646637 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 287
Target Start/End: Original strand, 21906778 - 21907029
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116 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
21906778 |
aacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcatcaattgaacatattttca------------------t |
21906858 |
T |
 |
| Q |
117 |
actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatga |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21906859 |
actttgaacatgtaattcaaccaacatcaattcaattatccataacttcatatgtctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatga |
21906958 |
T |
 |
| Q |
217 |
acaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgat |
287 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21906959 |
acaattaattaattcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgtgataaatgattatgat |
21907029 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Original strand, 24475653 - 24475857
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30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacat |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24475653 |
aattgatcatgaaacata--acaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacat |
24475748 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24475749 |
gtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcacttatgaacaattaatca |
24475847 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaa |
237 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
| T |
24475848 |
attcatccaa |
24475857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 3673922 - 3674214
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3673922 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatataccactttctc |
3674019 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||| ||||||||||| ||||| |||| | || |||| |
|
|
| T |
3674020 |
atactttgatcatgaaatttccctaacaacaattcaattatcaacaacttaatgtattcaaacatatcatcataatttgagcacgaattctaacaattat |
3674119 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgca--ataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3674120 |
gaacaattaatcaatt-actc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaaattacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
3674214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 320
Target Start/End: Original strand, 19862296 - 19862574
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142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || |||| |
|
|
| T |
19862296 |
cttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaaca |
19862394 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaa |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||| || || ||| |||| |
|
|
| T |
19862395 |
acaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcactt-actcaa-ttaa |
19862492 |
T |
 |
| Q |
243 |
gcactt-ttcatacaataattgaaaa-ttgcaataaa-tggttatgat-gaaaactaacctccttaccttgattatcaccaa |
320 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| || |||||| || || |||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19862493 |
gcacttattcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaa |
19862574 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 16595581 - 16595859
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || | || ||||||| | ||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16595581 |
aattgaacatgaatctcaacataattcaacatcaacataacataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatga |
16595679 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16595680 |
aatttctctatcaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattagtcaat |
16595779 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaa-ttgcaat-aaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
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Q |
| |
|
| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16595780 |
t-actc-aattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
16595859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23981606 - 23981433
Alignment:
| Q |
114 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattta |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
23981606 |
catactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcactta |
23981507 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
23981506 |
tgaacaattaatcaatgca-ctaaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgat |
23981433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 432523 - 432814
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| |||| |||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
432523 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatcttaccacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatttgagcataatt-caacatatatcattttctc |
432620 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||| | || |||| |
|
|
| T |
432621 |
atactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactacatgcattcaaacatatcatcataattggagcgcgaattttaacaattat |
432720 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|| |||||| || ||| || | |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
432721 |
gatcaattaatc-atttactc-aattaagcacttattcatgcaacaattgaaaaattgcagtaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
432814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5451015 - 5450697
Alignment:
| Q |
32 |
ttgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtg |
130 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5451015 |
ttgaacatgaattttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaa |
5450917 |
T |
 |
| Q |
131 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaatt |
230 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5450916 |
atttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
5450817 |
T |
 |
| Q |
231 |
cacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt---gcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagta |
326 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||| || || || ||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||| | || |
|
|
| T |
5450816 |
-actc-aattaagcatttatttatgcaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattattatcaattccta |
5450719 |
T |
 |
| Q |
327 |
gcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5450718 |
gcccaagcttcactttagctcc |
5450697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 23493979 - 23494271
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | | || |
|
|
| T |
23493979 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttcgcatatct-caacatatacctattcttc |
23494076 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||| | || |||| |
|
|
| T |
23494077 |
atactttgaacataaaattccactaataacaattcaattttccacaacttcatgcattcgaacatgtcatcatagttggagcacgaattctaacaattat |
23494176 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgca--ataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||| || || | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23494177 |
gaacaattaattgatt-actc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgatttctaacccccttacctt |
23494271 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Original strand, 28902264 - 28902502
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
28902264 |
aattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacacg |
28902362 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28902363 |
aagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaa |
28902462 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt |
269 |
Q |
| |
|
|| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28902463 |
tt-actc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatt |
28902502 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Original strand, 28938659 - 28938897
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
28938659 |
aattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacacg |
28938757 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28938758 |
aagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaa |
28938857 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt |
269 |
Q |
| |
|
|| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28938858 |
tt-actc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatt |
28938897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21222795 - 21222464
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | || || ||||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
21222795 |
caacaacaac-attaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattaaacatttagagcata-attcaacatataacactttcat |
21222698 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| | || ||| |
|
|
| T |
21222697 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactat |
21222598 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttgat |
311 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| |||| |||||| || |||||| || |
|
|
| T |
21222597 |
gaacaattaatcaatactc---aattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaataattatgattgaactctaacccccataccttaat |
21222501 |
T |
 |
| Q |
312 |
tatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21222500 |
tatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcc |
21222464 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 156
Target Start/End: Original strand, 7728480 - 7728619
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
7728480 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc |
7728577 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7728578 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaaatcaattatc |
7728619 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 308
Target Start/End: Original strand, 23466558 - 23466786
Alignment:
| Q |
78 |
accaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
23466558 |
accaattgagcatattt-caacatacaccatttttctcatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatc-ataacttcttacatacaaa |
23466655 |
T |
 |
| Q |
177 |
catgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaata |
275 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23466656 |
catgttgccataattggagcacgaattctaataattatgaacaattaatcaatt-acacaa-ttaatcacttattcatacaataattgaaaattgcaata |
23466753 |
T |
 |
| Q |
276 |
aatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23466754 |
attgattatgatgaattctaacccccttacctt |
23466786 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 21650769 - 21650829
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21650769 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21650829 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 2031884 - 2031944
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2031884 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2031944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
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| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11342759 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
11342819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
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| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21205000 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21205060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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| Q |
94 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattat |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| || |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
21310819 |
ttcaacatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttag |
21310720 |
T |
 |
| Q |
194 |
agcacaaatttcatcatttatgaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21310719 |
agcacgaattttaacatttatgaacaatta |
21310690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 16 - 203
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| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| || | |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
21617076 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagaacaattcaacatttagagcatagtt-caacatataacactttcat |
21617173 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatt |
203 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
21617174 |
atacttggaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
21617262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaa |
58 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23466517 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaa |
23466558 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
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| Q |
94 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattat |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| || |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| | | |||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
21297285 |
ttcaacatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttag |
21297186 |
T |
 |
| Q |
194 |
agcacaaatttcatcatttatgaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
|| || ||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21297185 |
aggacgaattttaacatttatgaacaatta |
21297156 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
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Query Start/End: Original strand, 114 - 206
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114 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttca |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
22885799 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattaaagcacgaatttca |
22885891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1164 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:
Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 348
Target Start/End: Original strand, 1455 - 1771
Alignment:
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31 |
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130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1455 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaatcacataacataattcaacaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatata |
1554 |
T |
 |
| Q |
131 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaatt |
230 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1555 |
attcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacataggaacaattaatcaatt |
1654 |
T |
 |
| Q |
231 |
cacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagca |
329 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | |
|
|
| T |
1655 |
caccc-aattaagcacttatcatccaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaact |
1752 |
T |
 |
| Q |
330 |
caagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1753 |
caagcttcacttttgctcc |
1771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24901 - 24624
Alignment:
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31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtg |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24901 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatatgttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgta |
24802 |
T |
 |
| Q |
131 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaatt |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
24801 |
attcaactaacaacaatttaattatcaataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatggacaattaatcaatt |
24702 |
T |
 |
| Q |
231 |
cacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24701 |
ca-cctaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatttcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
24624 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 95049 - 95109
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31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
95049 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcata |
95109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 22751 - 23042
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |
|
|
| T |
22751 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttca |
22849 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22850 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcaaaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatg |
22949 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22950 |
aacaattaatcaattcatcc-aattaagcacttttgatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
23042 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0190 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:
Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Original strand, 9996 - 10288
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15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
9996 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacc--cttttc |
10092 |
T |
 |
| Q |
115 |
atact--ttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattt |
212 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
10093 |
atactctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcattt |
10192 |
T |
 |
| Q |
213 |
atgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa-ttgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10193 |
atgaacaattaatcaattcaccc-aattaagcacttttcatacaaagaattgaaaatttgcaat-aatgattattatgaattctaacccccttacctt |
10288 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 81 - 369
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
81 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacgtagcataattcacgaattgagcatattttcaacatataccaatttctca |
179 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
180 |
tactttgaacatgcaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatc---attagagcacgaatttcatcatttatg |
276 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
277 |
aacaattaattaattcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttacctt |
369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0117 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:
Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11756 - 11465
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | || || |
|
|
| T |
11756 |
tcaacaacaac-ataaattgatcatgaaactgatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccatttttc |
11658 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11657 |
atactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttat |
11558 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
11557 |
gaacaattaatcaattcaac--aattaaacacttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccatacctt |
11465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 70686 - 70963
Alignment:
| Q |
30 |
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128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70686 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcatattttcaacatattccattttctcatactttgaacatg |
70785 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| | || |
|
|
| T |
70786 |
a-attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttataaactattaattaa |
70884 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcacttttcatacaataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
70885 |
ttcaccc-aattaagcacttttcatacaataactgaaaattacaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
70963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Original strand, 31117 - 31376
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataa-ttcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31117 |
aattaatcatgaaacttatcacaattcaacaactacaaa-cataacttaacaaattgagcatattttcaacatataccattttcttatactttgaacatg |
31215 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
31216 |
a-attcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaaataatcaa |
31314 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcacttttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaa |
290 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
31315 |
ttcaccc-aattaagcacttttcatacaataattgaaaaattgcaatgaatgattatgatgaa |
31376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 97372 - 97060
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || |||| ||||||| | ||||| ||||||||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
97372 |
aattgaacatgaatctcatcataattcaacaccaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttgaacatg |
97274 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||||| || || || ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| | | || |||||||||||| || | |
|
|
| T |
97273 |
caattccaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatcttaacaactatgaacaattaatc-a |
97175 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcact-tttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagt |
325 |
Q |
| |
|
|||| | |||||| |||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| |||| || ||| | | |
|
|
| T |
97174 |
ctcactc-aattaaacactaaatcatacaataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttcattagca-caattcct |
97077 |
T |
 |
| Q |
326 |
agcacaagcttcacttt |
342 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
97076 |
agcccaagcttcacttt |
97060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Original strand, 88349 - 88631
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtg |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
88349 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgatcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgta |
88448 |
T |
 |
| Q |
131 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaatt |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
88449 |
attcaactaacaacattttaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaatt |
88548 |
T |
 |
| Q |
231 |
cacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgatta |
313 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
88549 |
caccc-aattaaacacttttcatacaaataattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctttatta |
88631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 132437 - 132145
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |
|
|
| T |
132437 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttca |
132339 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
132338 |
tactttgaacatataattcaacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatg |
132239 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcata-caataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
132238 |
aacaattaatcaattcaccc-aattaagcacttttcatagaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattccaacccccttacctt |
132145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 11747 - 12040
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |
|
|
| T |
11747 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatgttttcaactcatatctttttctc |
11845 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
11846 |
atactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattgaaacatgtcatcataattagagcacgaaattcatcatttat |
11945 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgca--ataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11946 |
gaacaattaatcaattgaccc-aattaagcacttattcatacaataattg-aaattgcaccaaaaatgattatgatgaattctaaccaccttacctt |
12040 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 80 - 308
Target Start/End: Original strand, 16022 - 16252
Alignment:
| Q |
80 |
caattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat |
179 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16022 |
caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacat |
16121 |
T |
 |
| Q |
180 |
gtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaac-aattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgca--ata |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | | |
|
|
| T |
16122 |
gtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcaccc-aattaagcacttgttcatacaataattg-aaattgcaccaaa |
16219 |
T |
 |
| Q |
276 |
aatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16220 |
aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
16252 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 80 - 308
Target Start/End: Original strand, 25553 - 25783
Alignment:
| Q |
80 |
caattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat |
179 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25553 |
caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattaaaacat |
25652 |
T |
 |
| Q |
180 |
gtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaac-aattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgca--ata |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | | |
|
|
| T |
25653 |
gtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcaccc-aattaagcacttgttcatacaataattg-aaattgcaccaaa |
25750 |
T |
 |
| Q |
276 |
aatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25751 |
aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
25783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Original strand, 60865 - 61158
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| | || || |
|
|
| T |
60865 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagtatatttttaacacatacccatttttc |
60963 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
60964 |
atactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacatcatacatctaaacatgttatcataattagagcacgaatttcatcatttat |
61063 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
61064 |
gaacaattaatcaattcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
61158 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 70793 - 70551
Alignment:
| Q |
33 |
tgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgat |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
70793 |
tgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacctacttttcatactttgaacatgtaat |
70694 |
T |
 |
| Q |
133 |
tcaactaacaacaattcaattatcca-taacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattc |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
70693 |
tcaactaacaataaatcaattattcattaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaactc |
70594 |
T |
 |
| Q |
232 |
acccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaat |
274 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
70593 |
atccaaa-taagcacttttcttacaaataattgaaaattacaat |
70551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 169 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 79925 - 79790
Alignment:
| Q |
169 |
catctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa |
267 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
79925 |
catctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatcc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaa |
79827 |
T |
 |
| Q |
268 |
ttgcaataaatggttatgatgaaaactaacctcctta |
304 |
Q |
| |
|
|| |||| | || ||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
79826 |
ttacaatgagtgattatgatcaattctaaccccctta |
79790 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1867 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:
Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Original strand, 203 - 495
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
203 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcat |
301 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
302 |
acacttgaaacatgaatttcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttat |
401 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
402 |
gaacaattaatcaattcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgattaattctaacccccttacctt |
495 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0610 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:
Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 763 - 472
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
763 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatataccattttctca |
665 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
664 |
tactttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataatttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatg |
565 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
564 |
aacaattaatcaattcaccc-aattaagcacttattcatacaataattgaaaaatagcaataaat-gatatgatgaattctaacccccttacctt |
472 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0103 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:
Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 33722 - 34013
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
33722 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctca |
33820 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
33821 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttacg |
33920 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
33921 |
aacaattaatcaattcatcc-aattaagcacttaatcatacagtaattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaatccccttacctt |
34013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:
Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 25284 - 25562
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |
|
|
| T |
25284 |
aattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatga |
25383 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25384 |
atttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
25483 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25484 |
tcatcc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttacctt |
25562 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 25031 - 25210
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |
|
|
| T |
25031 |
aattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatga |
25130 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatca |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25131 |
atttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatca |
25210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Original strand, 21590 - 21861
Alignment:
| Q |
35 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattc |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
21590 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattc |
21689 |
T |
 |
| Q |
135 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacc |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
21690 |
aactaacaacaatccaattat-cataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcc |
21788 |
T |
 |
| Q |
235 |
caaattaagcacttttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21789 |
c-aattaagcctttttcatacaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattataacccccttacctt |
21861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 31284 - 31560
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
31284 |
aattgataatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacattt |
31383 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31384 |
aattcaactaacaacaatccaattat-cataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
31482 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31483 |
tcgccc-aattaagcacttttcatacaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
31560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 47553 - 47446
Alignment:
| Q |
200 |
aatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47553 |
aatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaa-ttaagcacttttcatacaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacc |
47456 |
T |
 |
| Q |
299 |
tccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
47455 |
cccttacctt |
47446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 38371 - 38649
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
38371 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaattgagcatattttcaacatatacccatttctcttcctttgaacatgt |
38470 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
38471 |
aattcaaccaacaaaaattcaattattcataaattcataaatctaaacatgtcatcataattagagcgcgtatttcatcatttatgaacaattaattaat |
38570 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38571 |
tcaccc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
38649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0554 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:
Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 305
Target Start/End: Original strand, 1976 - 2263
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
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| T |
1976 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaatcttataacaaatcaacaaca-catagcataattcaaccaattgagcatattttcatcatataccattttcgc |
2073 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2074 |
atactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttat |
2173 |
T |
 |
| Q |
215 |
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305 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
2174 |
gagcaattaatcaattcaccc-aattaagcacttttcatacaataattgaaaaattgcaat-aatgattatgatgaattctaacccccttac |
2263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 46239 - 46498
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| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca--tactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
46239 |
attgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttca-cata-acccacttttcacatactttgatcatg |
46336 |
T |
 |
| Q |
129 |
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227 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
46337 |
aagtttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatca |
46436 |
T |
 |
| Q |
228 |
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290 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
46437 |
attcaccc-aattaagcacttttcatacaataattaaaaattgcaataaatgattatgatgaa |
46498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 308
Target Start/End: Original strand, 40732 - 41009
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| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca--tactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
40732 |
attgatcatgaaacttatcacaatgtaacaacaatatagcataattcaccaattgagcatattttca-cata-acccacttttcacatactttgatcatg |
40829 |
T |
 |
| Q |
129 |
t-gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
40830 |
aagtttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatca |
40929 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcatacaataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
40930 |
attcaccc-aattaagcactattcatacaataattaaaaattgcaataaatgattatgatgaattataacccccttacctt |
41009 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #3
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Target Start/End: Original strand, 80184 - 80258
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274 |
taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
80184 |
taaatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttgctcc |
80258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 79942 - 79998
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| Q |
35 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
79942 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
79998 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15645 - 15328
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| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc-atactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || | ||||||||||||| |
|
|
| T |
15645 |
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15547 |
T |
 |
| Q |
129 |
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228 |
Q |
| |
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| T |
15546 |
caattcaactaacaacaattcaattgtccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaa |
15447 |
T |
 |
| Q |
229 |
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327 |
Q |
| |
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| T |
15446 |
ttcatcc-aattaagcacttatcatacaaataatttaaaattacaa-aagtgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatctccaactattag |
15349 |
T |
 |
| Q |
328 |
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348 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15348 |
cccaagcttcacttttgctcc |
15328 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:
Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Original strand, 1376 - 1666
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15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | || || |
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|
| T |
1376 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcatcacatacccatttttc |
1474 |
T |
 |
| Q |
115 |
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214 |
Q |
| |
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| T |
1475 |
atactttgaacatgtaattcaaccaccaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcatgattagagcacgaatttcatcatttat |
1574 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
1575 |
acacaattaatcaattcattc-aattaaccacttttcatacaaataattg--aattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttgcctt |
1666 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11828 - 11549
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| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacat |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11828 |
aattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaatgcataattcactaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacat |
11730 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
|| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11729 |
gtaattcaaccaagaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatca |
11630 |
T |
 |
| Q |
228 |
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308 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11629 |
attcatcc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
11549 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11895 - 11608
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| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |
|
|
| T |
11895 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactaatacccatttttca |
11797 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11796 |
tactttgaacatgtaattcatccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacaaatttcatcacatatg |
11697 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctcctta |
304 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
11696 |
aacaattaatcaattcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
11608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:
Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 996 - 718
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| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
996 |
aattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaataacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactcatacccatttttcatactttgaacatgt |
897 |
T |
 |
| Q |
130 |
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229 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
896 |
aattcatctaacaacaatccaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatcaatcaat |
797 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
796 |
tcactc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
718 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7019 - 6759
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| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacat |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| | ||||||| |
|
|
| T |
7019 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacactctgaacat |
6922 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6921 |
gtaattcaaccaacaacaattcaactattcataacttcatacatctaaacatgtcctcgtaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatca |
6822 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaa |
290 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
6821 |
attcaccc-aattaagcactgatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaa |
6759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
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Target Start/End: Original strand, 7629 - 7921
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16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |
|
|
| T |
7629 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcataatttatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcatcatatacccatttttca |
7727 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat-gtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
7728 |
tactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatttataacttcatacatctaaacataggcatcataattagatcatgaatttcatcatttat |
7827 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7828 |
gaacaattaatcaattcatcc-aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttacctt |
7921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:
Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9069 - 8777
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| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
9069 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatatat-caacatatatcattttctc |
8972 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8971 |
atactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttat |
8872 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgca--ataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8871 |
gaacaattaatcaattttccc-aattaagcacttattcatacaataattg-aaattgcaccaaaaatgattatgatgaactctaacccccttacctt |
8777 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5433 - 5144
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| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||| |
|
|
| T |
5433 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcctaattcaccaattgagcatattttcg-cacatacctattt-tca |
5337 |
T |
 |
| Q |
116 |
tac--tttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattta |
213 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
5336 |
tacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatctcatcataataagagcacgaatttcatcactta |
5238 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5237 |
tgaacaattaatcaattcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattagaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
5144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
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Target: scaffold0049; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 60 - 348
Target Start/End: Original strand, 20275 - 20563
Alignment:
| Q |
60 |
aacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatcc |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20275 |
aacaacaaagcataattaaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattc |
20373 |
T |
 |
| Q |
158 |
ataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-a |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
20374 |
ataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatcc-aattaagcacttatcatacaa |
20472 |
T |
 |
| Q |
257 |
ataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20473 |
ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcc |
20563 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:
Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 4623 - 4912
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || || |
|
|
| T |
4623 |
caacaacaac-atcaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttc |
4721 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
4722 |
atactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatat |
4821 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4822 |
gaacaattaatcaattcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt---acaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
4912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 9237 - 9526
Alignment:
| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || || |
|
|
| T |
9237 |
caacaacaac-atcaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttc |
9335 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
9336 |
atactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatat |
9435 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9436 |
gaacaattaatcaattcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt---acaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
9526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 308
Target Start/End: Original strand, 7260 - 7521
Alignment:
| Q |
45 |
ttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaa |
143 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
7260 |
ttatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaa |
7359 |
T |
 |
| Q |
144 |
caattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaag |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
7360 |
caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatcc-aattaag |
7458 |
T |
 |
| Q |
244 |
cacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||| | || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7459 |
cacttatcatacaaataattgaaaatt---acaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
7521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0342
Description:
Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 6000 - 6261
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| Q |
16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ct |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
6000 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaaccacatagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatataccatttttct |
6098 |
T |
 |
| Q |
114 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattta |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6099 |
catactttgaacatgaaattctaccaacaacaatccaattatccataacttcatacattcaaacatgtcgtcataattagagcacgaatttcatcattta |
6198 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaataattg-aaaattgcaataa |
276 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6199 |
tgaacaattaatcaattca-ccaaattaagcacttttcatacaataattgaaaaattgcaataa |
6261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 632 - 572
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
632 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 380 - 313
Alignment:
| Q |
281 |
ttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||| || | ||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
380 |
ttatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcc |
313 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:
Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Original strand, 48220 - 48458
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
48220 |
aattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacataa |
48318 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48319 |
aattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaat |
48418 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaatt |
269 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
48419 |
tcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt |
48458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Original strand, 61668 - 61906
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
61668 |
aattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacataa |
61766 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
61767 |
aattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaat |
61866 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaatt |
269 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
61867 |
tcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt |
61906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 255002 - 254729
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || |
|
|
| T |
255002 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tc |
254905 |
T |
 |
| Q |
115 |
atac--tttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattt |
212 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
254904 |
atacactttgaacatgtaattcaacta-caacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatat |
254806 |
T |
 |
| Q |
213 |
atgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaa |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
254805 |
atgaacaattaatcaattcatcc-aattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaa |
254729 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 261608 - 261335
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || |
|
|
| T |
261608 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tc |
261511 |
T |
 |
| Q |
115 |
atac--tttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattt |
212 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
261510 |
atacactttgaacatgtaattcaacta-ctacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatat |
261412 |
T |
 |
| Q |
213 |
atgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaa |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
261411 |
atgaacaattaatcaattcatcc-aattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaa |
261335 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0083 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:
Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 14947 - 15223
Alignment:
| Q |
30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacat |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14947 |
aattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacat |
15044 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
|| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15045 |
gtaatctaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatca |
15143 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcataca-ataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15144 |
attcatcc-aattaagcacttatcatacatataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
15223 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:
Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 117 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20041 - 19811
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| Q |
117 |
actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatga |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20041 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
19942 |
T |
 |
| Q |
217 |
acaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatc |
315 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19941 |
acaattaatcaattcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
19844 |
T |
 |
| Q |
316 |
accaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19843 |
accaactattaactcaagcttcacttttgctcc |
19811 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 117 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24345 - 24115
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| Q |
117 |
actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatga |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24345 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
24246 |
T |
 |
| Q |
217 |
acaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatc |
315 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24245 |
acaattaatcaattcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
24148 |
T |
 |
| Q |
316 |
accaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24147 |
accaactattaactcaagcttcatttttgctcc |
24115 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 6)
Name: scaffold0016
Description:
Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 308
Target Start/End: Original strand, 164290 - 164564
Alignment:
| Q |
32 |
ttgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | || |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
164290 |
ttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatcttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgt |
164387 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
164388 |
aattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatgaaaaattaatcaat |
164486 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcacttttcatacaa-taattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
164487 |
tcatcc-aattaagcacttaccatacaattaattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
164564 |
T |
 |
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Target: scaffold0016; HSP #2
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281 |
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348 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
162106 |
ttatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
162039 |
T |
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Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 348
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| Q |
281 |
ttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
166192 |
ttatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
166125 |
T |
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Target: scaffold0016; HSP #4
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275 |
aaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
116485 |
aaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcc |
116412 |
T |
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Target: scaffold0016; HSP #5
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31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
162359 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata |
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T |
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Target: scaffold0016; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
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31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
166445 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata |
166385 |
T |
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Target: scaffold0740 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0740; HSP #1
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30 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacat |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4358 |
aattgatcataaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgaacatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacat |
4455 |
T |
 |
| Q |
128 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattca |
227 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
4456 |
gtaattcaactaaca-caattcaattattcataatttgatacatctaaacatgtcattataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatca |
4554 |
T |
 |
| Q |
228 |
attcacccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4555 |
attcatcc-aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-acgtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
4634 |
T |
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Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
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31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtg |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
146675 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgta |
146774 |
T |
 |
| Q |
131 |
attcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagca |
197 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
146775 |
attcaactaacaacagttcaattatacataacttcatacatctaaacatgtcatcataattaaagca |
146841 |
T |
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Target: scaffold0025; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Original strand, 53420 - 53703
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31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
129 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||| | || || ||||||| || ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
53420 |
attgaacatgaatctcatcacaattcatcaacaaaatagcataattgaacatttagagcataatt-caacatataacaccttcacatactttgaacatgc |
53518 |
T |
 |
| Q |
130 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaat |
229 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||| || |||| ||| |||||| ||||||| |||| |||| |||| | || |||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
53519 |
aatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcattattagagcatgaattctaacaactatgaacaattaatcact |
53618 |
T |
 |
| Q |
230 |
tcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttgatta |
313 |
Q |
| |
|
| || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
53619 |
t-actc-aattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
53703 |
T |
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Target: scaffold0025; HSP #3
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114 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattta |
213 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || || |
|
|
| T |
85690 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-taaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaacta |
85788 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
85789 |
tgaacaatta |
85798 |
T |
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Target: scaffold0092; HSP #1
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128 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3392 |
aattgatcatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattggaccaattgagcatattttca-catataccactttctcatactttgaacatt |
3490 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3491 |
aaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaa |
3590 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|| || | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3591 |
tt-actc-aattaagcacttattcatacaataattgtaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
3670 |
T |
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Name: scaffold0095
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Target: scaffold0095; HSP #1
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttct- |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
33915 |
caacaacaac-atcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcatattt-caacatataaca-cttctt |
33819 |
T |
 |
| Q |
114 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcattta |
213 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| | || ||| |
|
|
| T |
33818 |
catactttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaatta |
33719 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgca--ataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||||||| |||||||| || || | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
33718 |
tgaacaattaatcaatt-actc-aattaagcatttattcatacaacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
33623 |
T |
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Target: scaffold0876; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 1 - 164
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tcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatacaa-taattgaaaattgcaataaatggtt |
282 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| || || || |
|
|
| T |
1 |
tcataaatagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaa-ttaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgatt |
98 |
T |
 |
| Q |
283 |
atgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
99 |
atgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcc |
164 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0053; HSP #1
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16 |
caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| || ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
77034 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaacataatt-caacatatatcactttctc |
76937 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
76936 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatcatctat |
76837 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaat-aaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttga |
310 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||| || | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
76836 |
gaacaattactcaatt-actc-aattaagtacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaa |
76739 |
T |
 |
| Q |
311 |
ttatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
76738 |
ttatcagcaattcctagcccaagcttcactttagctcc |
76701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:
Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
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Target Start/End: Original strand, 7927 - 8156
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78 |
accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaac |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
7927 |
accaattgagcatattttca-catataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaac |
8025 |
T |
 |
| Q |
178 |
atgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaata |
275 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||| |||| | || |||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8026 |
ataacatcataattggagcacgaattctaacaaatatgaacaattaatcaatt-actc-aattaagcacttattcatacaataattgtaaaattgcaata |
8123 |
T |
 |
| Q |
276 |
aatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8124 |
aatgattacgatgaattctaacccccttacctt |
8156 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0816 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:
Target: scaffold0816; HSP #1
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157 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcacttttcatac- |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
3112 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatcc-aattaagcatttatcataca |
3014 |
T |
 |
| Q |
256 |
aataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3013 |
aataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
2962 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
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| Q |
17 |
aacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctca |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
2502 |
aacaacaac-atcaattgaacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacatatgtcactttctca |
2405 |
T |
 |
| Q |
116 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatg |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| | | ||||| |
|
|
| T |
2404 |
tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaataattatg |
2305 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaat-aaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2304 |
attaattaatcaatt-actc-aattaagcacttattcatacaacaattaaaaattgcactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
2212 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
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aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
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Q |
| |
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| T |
7199 |
aattgaacatgattcttatcacaatccaataacaacataacataattaaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatt |
7101 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| | || | |
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|
| T |
7100 |
aaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttgacaattatgaacaacaaatc-a |
7002 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaat-aaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactag |
324 |
Q |
| |
|
|| || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| || | ||||| |||| | |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
7001 |
tttactc-aattaagcacttattcatacaacgattgaaaaattacattaaaatgattataattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcc |
6903 |
T |
 |
| Q |
325 |
tagcacaagcttcacttt |
342 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6902 |
tagcccaagcttcacttt |
6885 |
T |
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104 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
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704 |
aacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatata |
618 |
T |
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Target: scaffold0483; HSP #1
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128 |
Q |
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|
|||||| ||||| |||| |||||||||| || | || ||||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
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6734 |
aattgaacatgactcttaccacaattcaacaatagcatagcataattcaacaatttgagcaaaatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatg |
6832 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatt |
203 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6833 |
aaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaatt |
6907 |
T |
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114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
2585 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcat |
2682 |
T |
 |
| Q |
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atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
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|
| T |
2683 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat |
2782 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaatta |
223 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
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2783 |
gaacaatta |
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T |
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aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35551 |
aattgaacatgactcttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatttgagtataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatg |
35649 |
T |
 |
| Q |
129 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaa |
228 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||| |||| | | | |||||||||| || |
|
|
| T |
35650 |
aaatttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaattataagaactttgaacaattaatc-t |
35748 |
T |
 |
| Q |
229 |
ttcacccaaattaagca-cttttcatacaataattg-aaaattgcaat-aaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactag |
324 |
Q |
| |
|
|| || | ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| || | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
35749 |
tttactc-aattaagcacctattcatacaacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcc |
35847 |
T |
 |
| Q |
325 |
tagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35848 |
tagcccaagcttcactttagctcc |
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T |
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
69517 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcac |
69614 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || ||| |
|
|
| T |
69615 |
atactttaaacatgcaatttcacctacaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat |
69714 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttgat |
311 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||| || |
|
|
| T |
69715 |
gaacaattaatcactt--tctcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttatcttaat |
69812 |
T |
 |
| Q |
312 |
tatcaccaactagtagcacaagcttcacttt |
342 |
Q |
| |
|
|| ||| || | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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tagcacaaattcctagcccaagcttcacttt |
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T |
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caacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| || | |||||| || || ||||||| || |||| |||| || ||| | |
|
|
| T |
197440 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacataggacaattcaacatttagagcataatt-caacttataacactttcac |
197343 |
T |
 |
| Q |
115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | || |||| ||| || |
|
|
| T |
197342 |
atactttgaacttgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaacatatcatcataattagagcccgaaattcaacatctaa |
197243 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttgat |
311 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || || |||||||||||| |||||||| || || |||||| || |||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
197242 |
gaacaattaatcacttatcc--aattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat |
197145 |
T |
 |
| Q |
312 |
tatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|| || ||| | |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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197109 |
T |
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Target: scaffold0091; HSP #1
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aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaa |
98 |
Q |
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|
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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32276 |
aattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa |
32344 |
T |
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aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaa |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42027 |
aattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa |
41959 |
T |
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Target: scaffold0028; HSP #1
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aacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagca |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89655 |
aacaacaac-atcaattgttcatgaaacttatcacaatttaacaacaacaaagcataattcaccaattgagca |
89584 |
T |
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Target: scaffold0150; HSP #1
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148 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |
|
|
| T |
28629 |
acaattcaacaacaacataccataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatataatttcaccaacaacaatt |
28727 |
T |
 |
| Q |
149 |
caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcac |
198 |
Q |
| |
|
|| ||||| | || ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28728 |
cagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcac |
28777 |
T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||| || || || |
|
|
| T |
1611 |
aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatcc--aa |
1514 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1513 |
ttaagcacttattcatacaataattgaaaatt |
1482 |
T |
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Target: scaffold0456; HSP #2
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139 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||| || || || |
|
|
| T |
8756 |
aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatcc--aa |
8659 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttaagcactt-ttcatacaataattgaaaatt |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8658 |
ttaagcacttattcatacaataattgaaaatt |
8627 |
T |
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17585 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
17525 |
T |
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Target: scaffold0032; HSP #1
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55655 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
55715 |
T |
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| | |||| || |
|
|
| T |
93893 |
ttgagcatattt-caacaaataccattttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattatcaaaaacttcatgcatacatacatatc |
93795 |
T |
 |
| Q |
183 |
atcataattatagcacaaatttc-atcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt |
248 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
93794 |
atcataattggagcacgaatttctaacagttatgaacaattaat-aatttaccc-aattaagcactt |
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T |
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aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaa |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || || || ||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||| | ||| |||||||||||| ||| || || ||| |
|
|
| T |
104688 |
aacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttagagcatgaattttaacatctatgaacaattaatcactt-actcaa- |
104591 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttaagcactt-ttcatacaataattgaaaa-ttgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagctt |
336 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||| ||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| || | |||| ||||||| |
|
|
| T |
104590 |
ttaagcaattattcatacaacaattgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacccacttaccttaattagcacaaattcttagcccaagctt |
104491 |
T |
 |
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337 |
cacttttgctcc |
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Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
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cactttagctcc |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||| || |||||||||||| || |||| |||| |||||| || || |||||| ||||||||||| || ||| | |
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|
| T |
31080 |
caacaacaac-atcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaagaacatagcacaattcaacatttaaagcata-attcaacatataacactttcac |
31177 |
T |
 |
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115 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacaaatttcatcatttat |
214 |
Q |
| |
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||||| |||||||| ||| || ||||||||| |||||||| || ||||| ||| ||| || |||||||||||| ||||| |||| | || ||| |
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| T |
31178 |
atactatgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaactat |
31277 |
T |
 |
| Q |
215 |
gaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatga-tgaaaactaacctccttaccttgat |
311 |
Q |
| |
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||||||||| ||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| || |
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| T |
31278 |
gaacaattaatcactt-actc-aattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat |
31375 |
T |
 |
| Q |
312 |
tatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
|| ||| || | |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
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31376 |
tagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcc |
31412 |
T |
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Target: scaffold0686; HSP #1
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Q |
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|||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
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5805 |
ttatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
5738 |
T |
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Target: scaffold0686; HSP #2
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281 |
ttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
348 |
Q |
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|||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
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6011 |
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T |
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
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Q |
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6264 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
6204 |
T |
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
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Q |
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attgatcatcaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
6664 |
T |
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
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Q |
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attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
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Q |
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|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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13567 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
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Q |
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21541 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21481 |
T |
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
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Q |
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|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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31461 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
31401 |
T |
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348 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
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|
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taaatgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
31141 |
T |
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
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Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15023 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15083 |
T |
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346 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||| |
|
|
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30414 |
taaatgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgct |
30486 |
T |
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
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Q |
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|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41383 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
41443 |
T |
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taaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
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Q |
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|
|||||| || |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
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|
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41629 |
taaatgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
41703 |
T |
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335 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| || |||||| | || |||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| | |||| |||||| |
|
|
| T |
1477 |
aattaagcacttattcatacaacaaatgaaaactacactaaatgattatgatgaattctaacccccttacctcaattatcaccaattcctagctcaagct |
1378 |
T |
 |
| Q |
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tcacttt |
342 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
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tcacttt |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |
|
|
| T |
8167 |
catactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta |
8266 |
T |
 |
| Q |
214 |
tgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaat-aaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| || || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
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tgaacaattaatcatttatcc--aattaatcacttattcatacaataattgaaaaattacattaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
8362 |
T |
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attgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt |
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Q |
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||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
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attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccaagcataattcgccaatt |
10094 |
T |
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Q |
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|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||||| |
|
|
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9688 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataagtcactaattgagcata |
9628 |
T |
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Q |
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|
|||||| |||||||| ||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
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aaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatcc--aattaagcacttattcatacaataattgaaaaattac |
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T |
 |
| Q |
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aataa-atggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
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Q |
| |
|
| ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
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actaatatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
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T |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
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aaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatcc--aattaagcacttattcatacaataattgaaaaattac |
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T |
 |
| Q |
272 |
aataa-atggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
| ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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actaatatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
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T |
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ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattat |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| || ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43908 |
ttcaacatatatcactttcatatcctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattag |
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T |
 |
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agcacaaatttcatcatttatgaacaattattcaattcacccaaattaagcactt-ttcatacaataattg-aaaattgcaataaatggttatga-tgaa |
290 |
Q |
| |
|
|||| ||||| | || |||||||||||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
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agcattaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actc-aattaagcacttaatcatacaacaattgaaaaattacactaaatgattatgattgaa |
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T |
 |
| Q |
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aactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagcttcacttttgctcc |
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||| ||| || | |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43710 |
ttctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcc |
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T |
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Q |
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|
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|
|
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taaatgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttttgctcc |
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Q |
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|
|
| T |
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atcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
12641 |
T |
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Q |
| |
|
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89929 |
aacaacaattcaagtatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttaa-catctatgaacaattaatcaattatcc--aa |
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T |
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239 |
ttaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaat-aaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
89832 |
ttaatcacttattcatacaataattgaaaattacactaaaaagattatgatgaattctaacccccttacctt |
89761 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0833 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:
Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 57
Target Start/End: Original strand, 3358 - 3399
Alignment:
| Q |
15 |
tcaacaacaaccatgaattgatcatgaaacttatcacaattca |
57 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3358 |
tcaacaacaac-atcaattgatcatgaaacttatcacaattca |
3399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:
Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 186706 - 186647
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaat-aacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
186706 |
attgatcatgaaacatatcacaat--aatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
186647 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 193668 - 193609
Alignment:
| Q |
31 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaat-aacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
193668 |
attgatcatgaaacatatcacaat--aatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
193609 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1295 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:
Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 348
Target Start/End: Original strand, 385 - 497
Alignment:
| Q |
237 |
aattaagcactt-ttcatacaataattgaaaattgcaataaatggttatgatgaaaactaacctccttaccttgattatcaccaactagtagcacaagct |
335 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| || |||||| | || |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||| |
|
|
| T |
385 |
aattaagcacttattcatacaacaaatgaaaactacactaaatgattacaatgaattctaacccccttacctcagttatcaccaattcctagctcaagct |
484 |
T |
 |
| Q |
336 |
tcacttttgctcc |
348 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |
|
|
| T |
485 |
tcactttagctcc |
497 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0058 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:
Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 70262 - 70202
Alignment:
| Q |
249 |
ttcatacaataattgaaaattgca-ataaatggttatgatgaaaactaacctccttacctt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
70262 |
ttcatacaataattgaaaatttcacaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
70202 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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