View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14702_high_29 (Length: 240)

Name: NF14702_high_29
Description: NF14702
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14702_high_29
NF14702_high_29
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (7-215)||(31541434-31541642)
chr7 (1-221)||(33304768-33304993)
chr7 (1-221)||(31572443-31572663)
chr7 (1-221)||(31532771-31532991)
chr7 (4-221)||(31614940-31615160)
chr7 (4-221)||(31605072-31605292)
chr7 (1-221)||(31576406-31576629)
chr7 (1-221)||(31595463-31595686)
chr7 (1-217)||(31608670-31608889)
chr7 (8-221)||(31585816-31586032)
chr7 (1-221)||(31438616-31438839)
chr7 (7-221)||(31618676-31618893)
chr7 (13-199)||(32351735-32351921)
chr7 (118-199)||(32355802-32355883)
chr7 (23-221)||(21897908-21898106)
chr7 (13-137)||(31574240-31574364)
chr7 (13-92)||(32355715-32355794)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (4-221)||(52173913-52174133)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (7-221)||(15062969-15063186)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31541642 - 31541434
Alignment:
Q  7 cgagataaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtccaagggaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  31541642 cgagataaattaggtcaaggaggatatggtgttgtttacaaagcaaacttacctgatggtcgtcaagtagcagtgaaaattataaatgagtctaagggaa 31541543  T
Q  107 atggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatgagaacaaaagagcact 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31541542 atggagaagatttcataaatgaagttgctagcattagtagaacatcacatgtgaacattgtctcacttttgggattttgttatgagaacaaaagagcact 31541443  T
Q  207 aatatatga 215  Q
    |||||||||    
T  31541442 aatatatga 31541434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 33304768 - 33304993
Alignment:
Q  1 tcattccgagataaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtcca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||    
T  33304768 tcatttcgagataaattaggtcaaggaggatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacctgatggtcgtcaagtggcagtgaaagtaataaaagagtcca 33304867  T
Q  101 agggaaatggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcac-----atatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatgagaac 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33304868 agggaaatggagaagaatttataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacgtcacatgtgaacattgtctcacttttgggtttttgttatgagaac 33304967  T
Q  196 aaaagagcactaatatatgaattcat 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||    
T  33304968 aaaagagctctgatatatgaattcat 33304993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 31572443 - 31572663
Alignment:
Q  1 tcattccgagataaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtcca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || || ||| | |||||||| || |    
T  31572443 tcatttcgagataaattaggttaaggaggatatggtgtcgtgtacaaagcaagtttacctgatggttgtcaagtggcggttaaagtaataaacgaatcta 31572542  T
Q  101 agggaaatggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatgagaacaaaag 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31572543 agggagatggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacatcacatgtgaacattgtctcacttttgggtttctgttatgagaacaaaag 31572642  T
Q  201 agcactaatatatgaattcat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31572643 agcactaatatatgaattcat 31572663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31532991 - 31532771
Alignment:
Q  1 tcattccgagataaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtcca 100  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||| |||| || |||||| | ||||||||||| |    
T  31532991 tcatttcgagacagattgggtcaaggaggatatggtatggtttacaaagcaaacttacctgatggtcgtgaagtggcggtgaaagtaataaacgagtcaa 31532892  T
Q  101 agggaaatggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatgagaacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31532891 agggaaatagagaagaattcacaaatgaagttgcaagcattagtagaacatcacatgtgaacatcgtttcacttttgggtttttgctatgagaacaaaag 31532792  T
Q  201 agcactaatatatgaattcat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31532791 agcactaatatatgaattcat 31532771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31615160 - 31614940
Alignment:
Q  4 ttccgagataaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtccaagg 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| || || |||||| |  |||| ||||| ||||    
T  31615160 ttccgagataaattaggccaaggaggatatggtgttgtgtacaaagcaagtttaattgatggtcgtcatgtggcggtgaaagtactaaatgagtcaaagg 31615061  T
Q  104 gaaatggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatga---gaacaaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||   |||||||||    
T  31615060 gaaatggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtcgaacattacacatgaacattgtatcccttttaggcttttgttatgaggtgaacaaaag 31614961  T
Q  201 agcactaatatatgaattcat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31614960 agcactaatatatgaattcat 31614940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31605292 - 31605072
Alignment:
Q  4 ttccgagataaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtccaagg 103  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||| | ||||| || ||||| |    
T  31605292 ttccgagttaaattaggccaaggaggatatggtgttgtttacaaagcaagtttaattgatggtcgtcaagtggcggtgaaagtaataaatgaatccaaag 31605193  T
Q  104 gaaatggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatga---gaacaaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||   | |||||||    
T  31605192 gaaatggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtcgaacatcacacatgaacattgtgtcccttttaggcttttgttatgaggtggacaaaag 31605093  T
Q  201 agcactaatatatgaattcat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31605092 agcactaatatatgaattcat 31605072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31576629 - 31576406
Alignment:
Q  1 tcattccgagataaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtcca 100  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||| | ||||| || ||||    
T  31576629 tcatttcgggataaattaggccaaggaggatatggtgttgtttacaaagcaagtttaattgatggtcgtcaagtggcggtgaaagtaataaatgaatcca 31576530  T
Q  101 agggaaatggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatga---gaacaa 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||   | ||||    
T  31576529 aaggaaatggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtcgaacatcacacatgaacattgtgtcccttttaggcttttgttatgaggtggacaa 31576430  T
Q  198 aagagcactaatatatgaattcat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31576429 aagagcactaatatatgaattcat 31576406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31595686 - 31595463
Alignment:
Q  1 tcattccgagataaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtcca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |    
T  31595686 tcattccgtgataaattaggccacggaggatatggtgttgtgtacaaagcaagtttaacggatggtcgtcaagtggcagtgaaagtaataaacgagtcaa 31595587  T
Q  101 agggaaatggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatgag---aacaa 197  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || | |||||| |||   || ||    
T  31595586 aaggaaatggggaagagttcataaatgaagttgctagcatcagtagaacatcacacatgaacattgtgtcacttttaggttattgttacgaggcaaataa 31595487  T
Q  198 aagagcactaatatatgaattcat 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  31595486 aagagcactaatatatgagttcat 31595463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31608889 - 31608670
Alignment:
Q  1 tcattccgagataaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtcca 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |    
T  31608889 tcatttcgagataaattaggccatggaggatatggtgttgtgtacaaagcaagtttaacggatggtcgtcaagtggcagtgaaagtaataaacgagtcaa 31608790  T
Q  101 agggaaatggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatga---gaacaa 197  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| || ||||| || || |||||||||||   ||| ||    
T  31608789 aaggaaatggggaagagttcataaatgaagttgctagcatcagtagaacatcacacctgaacattgtgtcactcttaggtttttgttatgaggtgaataa 31608690  T
Q  198 aagagcactaatatatgaat 217  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  31608689 aagagcgctaatatatgaat 31608670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31586032 - 31585816
Alignment:
Q  8 gagataaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtccaagggaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||   ||||||||||| || || |||||| | ||||| ||  | ||||||||    
T  31586032 gagataaattaggtcaaggaggatatggtgttgtgtacaaagcatgtttaagtgatggtcgtcatgtggcggtgaaagtaataaatgaaactaagggaaa 31585933  T
Q  108 tggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatga---gaacaaaagagca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| || ||||| |||||   |||||||||||||    
T  31585932 tggagaagaattcataaatgaagtttctagcattagtagaacatcacacatcaacattgtatcacttttaggcttttgctatgaggtgaacaaaagagca 31585833  T
Q  205 ctaatatatgaattcat 221  Q
     | ||||||||||||||    
T  31585832 ttgatatatgaattcat 31585816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 31438616 - 31438839
Alignment:
Q  1 tcattccgagataaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtcca 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| | ||||  |||| ||    
T  31438616 tcatttcgagataagttgggtcaaggaggatatggtgttgtgtacaaagcaagtttacctgatggccgtcatgttgcggtgaaagtaataagtgagtgca 31438715  T
Q  101 agggaaatggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatg---agaacaa 197  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||   |||||||    
T  31438716 agggagacggagaagaatttataaatgaagttgcaagcataagtaaaacatcacatgtgaacattgtctcacttttgggtttttgttatgaaaagaacaa 31438815  T
Q  198 aagagcactaatatatgaattcat 221  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||    
T  31438816 aagtgcattgatatatgaattcat 31438839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31618893 - 31618676
Alignment:
Q  7 cgagataaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtccaagggaa 106  Q
    ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    || |||||||||| ||||||||| | |||| |||| | |||||||    
T  31618893 cgagaaaagttaggccaaggagggtatggtgttgtctacaaagcaagtttatataatagtcgtcaagtggcagtgaaagtaataagcgagacaaagggaa 31618794  T
Q  107 atggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgtt---atgagaacaaaagagc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||| |||||   | ||||||||||||||    
T  31618793 atggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtaggacatcacatatgaacattgtgtcgcttttaggatattgttacgaagagaacaaaagagc 31618694  T
Q  204 actaatatatgaattcat 221  Q
     |||||||||||||||||    
T  31618693 gctaatatatgaattcat 31618676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32351921 - 32351735
Alignment:
Q  13 aaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtccaagggaaatggag 112  Q
    ||||||||| ||||| ||| | | |||||||||||   ||||||||  ||| ||| ||||||||  |||||||| ||||| || || |||||| |||||     
T  32351921 aaattaggtaaaggaggatttagggttgtgtacaatataagcttacgtgatagtcatcaagtagaggtgaaaataataaatgattcaaagggagatggaa 32351822  T
Q  113 aagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatgagaacaaaa 199  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32351821 aagatttcataaatgaagtagatagaattactagaacctcacatgtgaacattgtttcacttttgggtttttgttatgagaacaaaa 32351735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Original strand, 32355802 - 32355883
Alignment:
Q  118 ttcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatgagaacaaaa 199  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32355802 ttcataaatgaagtagatagaattggtaaaacctcacatatgaacattgtttcacttttgggtttttgttatgagaacaaaa 32355883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 21897908 - 21898106
Alignment:
Q  23 aaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtccaagggaaatggagaagaattcat 122  Q
    ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||    |||| | ||||| |||| || ||    
T  21897908 aaggaggatttgctgttgtctacaaagcaagcttaccagatggtcgtccagtagctgtgaagataataaatgatggaaaggcagatggacaagattttat 21898007  T
Q  123 aaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatgagaacaaaagagcactaatatatgaattcat 221  Q
     |||||| | |  || |||||||||||  | ||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |  ||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  21898008 gaatgaactagacagtattagtagaaccgcccatgtgaacattgtgtcacttttggggttttgctgcgagcacaaaatagcactcatttatgaattcat 21898106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31574364 - 31574240
Alignment:
Q  13 aaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtccaagggaaatggag 112  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||||| || |  |||| | | |||     
T  31574364 aaattaggtaaaggaggatttgatgttatgtacaaataaagcttacctgattgtcgtcaagtagttgtgaaaataataaatgattgaaaggaagaaggac 31574265  T
Q  113 aagaattcataaatgaagttgctag 137  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||    
T  31574264 aagatttcataaatggagtagctag 31574240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 32355715 - 32355794
Alignment:
Q  13 aaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaa 92  Q
    ||||||||| ||||| |||   ||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32355715 aaattaggtaaaggaggattcagtgatgtgtacaattcaagcttacgtgatggtcgtcaagtagcggtgaaaataataaa 32355794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Original strand, 52173913 - 52174133
Alignment:
Q  4 ttccgagataaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtccaagg 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||| | ||||||||||  ||||    
T  52173913 ttccgagataaattaggccaaggaggatatggtgttgtatacaaagcaagtttacctgatggtcgtcaagtggctgttaaagtaataaacgagttaaagg 52174012  T
Q  104 gaaatggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatga---gaacaaaag 200  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||| || | |||||||||   |||||||||    
T  52174013 gggatggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacatcacacgtgaacattgtgtcacttttaggctattgttatgaggtgaacaaaag 52174112  T
Q  201 agcactaatatatgaattcat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  52174113 agcactaatatatgaattcat 52174133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 15062969 - 15063186
Alignment:
Q  7 cgagataaattaggtcaaggacgatatggtgttgtgtacaaagcaagcttacccgatggtcgtcaagtagcagtgaaaatgataaacgagtccaagggaa 106  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  15062969 cgagataagttgggccaaggaggatatggtgttgtttacaaagccagtttacctgatggccgtcatgtagcggtgaaagtgataagcgagtgcaagggaa 15063068  T
Q  107 atggagaagaattcataaatgaagttgctagcattagtagaacgtcacatatgaacatcgtctcacttttgggattttgttatg---agaacaaaagagc 203  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  | ||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  15063069 acggagaagaatttataaatgaagttgcaagcataacaaaaacatcacatatgaacgttgtttcacttttgggtttttgttatgagaagaacaaaagagc 15063168  T
Q  204 actaatatatgaattcat 221  Q
    | | ||||||||||||||    
T  15063169 attgatatatgaattcat 15063186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University