View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14713_high_37 (Length: 333)

Name: NF14713_high_37
Description: NF14713
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14713_high_37
NF14713_high_37
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (15-324)||(25078026-25078337)
chr5 (15-324)||(25135995-25136306)
chr5 (26-316)||(10593172-10593462)
chr5 (15-316)||(29751112-29751414)
chr5 (26-324)||(16546537-16546836)
chr5 (15-320)||(22536243-22536545)
chr5 (15-316)||(29720278-29720579)
chr5 (15-316)||(29722438-29722739)
chr5 (30-324)||(40379998-40380292)
chr5 (30-324)||(40382209-40382503)
chr5 (26-324)||(16544315-16544614)
chr5 (15-316)||(16409389-16409691)
chr5 (15-316)||(26177797-26178098)
chr5 (15-316)||(9789176-9789478)
chr5 (15-316)||(18441600-18441902)
chr5 (15-316)||(26170688-26170978)
chr5 (42-313)||(25412672-25412947)
chr5 (42-313)||(30182499-30182775)
chr5 (42-212)||(37439160-37439328)
chr5 (58-313)||(13342971-13343232)
chr5 (42-230)||(13239751-13239938)
chr5 (42-313)||(36074024-36074302)
chr5 (62-230)||(213465-213633)
chr5 (42-230)||(32636824-32637010)
chr5 (62-230)||(40147261-40147428)
chr5 (50-230)||(28278316-28278494)
chr5 (39-176)||(8565926-8566059)
chr5 (58-230)||(42428427-42428598)
chr5 (58-313)||(13488113-13488374)
chr5 (62-145)||(5058131-5058212)
chr5 (42-230)||(13695672-13695859)
chr5 (43-313)||(30682906-30683178)
chr5 (42-176)||(16452135-16452266)
chr5 (42-211)||(33831700-33831866)
chr5 (58-211)||(42426232-42426383)
chr5 (42-172)||(31183031-31183157)
chr5 (64-173)||(27637615-27637723)
chr5 (45-230)||(533769-533952)
chr5 (43-146)||(28750638-28750738)
chr5 (83-211)||(16640961-16641086)
chr5 (58-130)||(19806463-19806534)
chr5 (58-227)||(39468546-39468714)
chr5 (58-176)||(538080-538196)
chr5 (62-145)||(27015609-27015690)
chr5 (60-224)||(316769-316933)
chr5 (73-176)||(9049354-9049455)
chr5 (86-127)||(4160702-4160743)
chr5 (42-212)||(3075640-3075807)
chr5 (60-176)||(33906028-33906144)
chr5 (80-176)||(42309953-42310048)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (15-324)||(3617355-3617666)
chr3 (15-316)||(54635039-54635340)
chr3 (26-316)||(45282897-45283190)
chr3 (15-316)||(6716414-6716715)
chr3 (26-316)||(25637342-25637632)
chr3 (12-324)||(10056125-10056440)
chr3 (12-324)||(10058347-10058662)
chr3 (12-324)||(10060569-10060884)
chr3 (12-324)||(10062791-10063106)
chr3 (12-324)||(10065013-10065328)
chr3 (26-324)||(4598486-4598785)
chr3 (26-324)||(4600707-4601006)
chr3 (26-324)||(10211301-10211600)
chr3 (26-324)||(10209081-10209380)
chr3 (14-316)||(801005-801308)
chr3 (15-267)||(7779957-7780208)
chr3 (128-324)||(10067235-10067431)
chr3 (18-316)||(23200095-23200398)
chr3 (15-316)||(23197893-23198199)
chr3 (196-316)||(6718598-6718718)
chr3 (42-313)||(45095075-45095350)
chr3 (42-313)||(5258125-5258402)
chr3 (42-313)||(9636106-9636385)
chr3 (42-313)||(5260304-5260581)
chr3 (42-313)||(37408369-37408645)
chr3 (42-227)||(19683870-19684054)
chr3 (58-230)||(7762265-7762437)
chr3 (42-211)||(7764484-7764651)
chr3 (58-211)||(9581302-9581454)
chr3 (43-230)||(34491212-34491397)
chr3 (50-230)||(49199457-49199638)
chr3 (42-230)||(29196368-29196555)
chr3 (50-211)||(30236145-30236304)
chr3 (50-230)||(43401789-43401970)
chr3 (62-230)||(4569952-4570120)
chr3 (58-227)||(39153358-39153526)
chr3 (54-145)||(43403736-43403826)
chr3 (43-211)||(51398834-51398999)
chr3 (62-230)||(6095600-6095767)
chr3 (42-145)||(16499115-16499215)
chr3 (58-230)||(40734498-40734669)
chr3 (58-211)||(44331565-44331716)
chr3 (58-230)||(44700476-44700646)
chr3 (50-211)||(46173377-46173536)
chr3 (43-211)||(40735403-40735568)
chr3 (62-230)||(41819523-41819691)
chr3 (12-101)||(10067435-10067527)
chr3 (42-227)||(760850-761033)
chr3 (71-227)||(22835012-22835167)
chr3 (58-230)||(29813063-29813234)
chr3 (42-211)||(31314465-31314631)
chr3 (50-145)||(40913379-40913472)
chr3 (62-230)||(54593704-54593871)
chr3 (82-230)||(29810868-29811016)
chr3 (43-230)||(5236440-5236624)
chr3 (62-170)||(55301972-55302079)
chr3 (58-227)||(29682362-29682530)
chr3 (42-211)||(32744418-32744583)
chr3 (73-211)||(46860494-46860631)
chr3 (42-211)||(9666448-9666615)
chr3 (71-176)||(53921513-53921616)
chr3 (50-142)||(47304340-47304430)
chr3 (71-129)||(27305720-27305777)
chr3 (71-211)||(32891123-32891262)
chr3 (42-145)||(23391891-23391991)
chr3 (158-230)||(5433971-5434046)
chr3 (101-230)||(51352150-51352278)
chr3 (82-130)||(2075095-2075143)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (30-324)||(25421211-25421507)
chr6 (26-333)||(16653009-16653317)
chr6 (26-316)||(16554783-16555074)
chr6 (26-316)||(16631339-16631630)
chr6 (30-324)||(6027154-6027448)
chr6 (26-316)||(16578481-16578772)
chr6 (26-316)||(16616608-16616899)
chr6 (14-316)||(27647777-27648076)
chr6 (26-324)||(33342068-33342367)
chr6 (15-324)||(34166986-34167296)
chr6 (12-324)||(34164764-34165079)
chr6 (15-316)||(412016-412318)
chr6 (15-250)||(13153893-13154131)
chr6 (15-316)||(3072712-3073014)
chr6 (15-316)||(6097403-6097695)
chr6 (42-316)||(2171512-2171792)
chr6 (42-313)||(31404656-31404932)
chr6 (42-313)||(5406181-5406456)
chr6 (42-313)||(5410506-5410781)
chr6 (42-230)||(5413376-5413561)
chr6 (42-309)||(16452310-16452583)
chr6 (42-313)||(30834517-30834794)
chr6 (53-230)||(3808699-3808877)
chr6 (42-230)||(33160333-33160521)
chr6 (42-145)||(5409051-5409151)
chr6 (62-230)||(21588931-21589098)
chr6 (62-230)||(21593664-21593831)
chr6 (62-227)||(17758026-17758191)
chr6 (62-230)||(2972940-2973107)
chr6 (62-211)||(17763010-17763158)
chr6 (58-227)||(26954283-26954450)
chr6 (44-211)||(9183015-9183179)
chr6 (42-313)||(16568953-16569208)
chr6 (62-176)||(26830124-26830236)
chr6 (62-210)||(5043648-5043795)
chr6 (62-211)||(22424826-22424975)
chr6 (73-211)||(28137420-28137556)
chr6 (58-230)||(33211182-33211353)
chr6 (62-176)||(26800642-26800755)
chr6 (54-176)||(603081-603201)
chr6 (85-230)||(3038926-3039071)
chr6 (112-230)||(4045423-4045542)
chr6 (62-106)||(19643894-19643938)
chr6 (42-106)||(21356021-21356084)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (15-324)||(18392148-18392457)
chr7 (15-324)||(18388712-18389021)
chr7 (15-316)||(20343811-20344112)
chr7 (30-324)||(32060289-32060587)
chr7 (30-324)||(6594525-6594819)
chr7 (30-324)||(6592307-6592601)
chr7 (15-316)||(24789755-24790057)
chr7 (15-316)||(43504107-43504409)
chr7 (15-316)||(39731283-39731583)
chr7 (160-324)||(1562103-1562265)
chr7 (26-153)||(1560630-1560757)
chr7 (42-313)||(35853825-35854102)
chr7 (42-316)||(25766940-25767215)
chr7 (42-316)||(48408709-48408992)
chr7 (42-313)||(29990965-29991240)
chr7 (58-230)||(23555039-23555212)
chr7 (58-230)||(34310712-34310884)
chr7 (42-313)||(4178685-4178960)
chr7 (42-300)||(25615785-25616040)
chr7 (42-230)||(41317416-41317602)
chr7 (42-313)||(19502088-19502365)
chr7 (43-230)||(22269973-22270158)
chr7 (44-230)||(14069817-14070001)
chr7 (44-230)||(14379845-14380029)
chr7 (50-211)||(2390302-2390461)
chr7 (42-211)||(41648993-41649158)
chr7 (62-176)||(32358055-32358167)
chr7 (42-230)||(4253510-4253697)
chr7 (43-230)||(27347817-27348002)
chr7 (62-211)||(8359316-8359465)
chr7 (58-211)||(30024729-30024880)
chr7 (43-230)||(18126644-18126829)
chr7 (71-230)||(29608737-29608895)
chr7 (58-230)||(8153342-8153513)
chr7 (42-230)||(36146390-36146576)
chr7 (82-230)||(48491579-48491727)
chr7 (62-230)||(3258995-3259162)
chr7 (62-230)||(4508707-4508874)
chr7 (66-176)||(6432026-6432134)
chr7 (58-211)||(31732966-31733117)
chr7 (62-211)||(48599335-48599482)
chr7 (43-230)||(48489431-48489616)
chr7 (60-230)||(43864244-43864413)
chr7 (82-212)||(23565081-23565211)
chr7 (82-230)||(2360992-2361140)
chr7 (43-230)||(26417316-26417501)
chr7 (71-211)||(47673954-47674091)
chr7 (43-211)||(47676119-47676284)
chr7 (59-205)||(2759195-2759339)
chr7 (42-126)||(12097849-12097931)
chr7 (42-227)||(38671204-38671387)
chr7 (58-230)||(4586161-4586332)
chr7 (50-176)||(6359941-6360065)
chr7 (42-145)||(24525484-24525584)
chr7 (42-209)||(1113679-1113843)
chr7 (42-227)||(495965-496148)
chr7 (42-145)||(31518988-31519089)
chr7 (62-176)||(4510549-4510661)
chr7 (62-176)||(4512391-4512503)
chr7 (62-176)||(31105394-31105506)
chr7 (60-130)||(30814536-30814605)
chr7 (62-130)||(18396418-18396486)
chr7 (62-230)||(23343975-23344140)
chr7 (159-211)||(24525992-24526045)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (15-324)||(12647338-12647647)
chr2 (15-316)||(6266605-6266907)
chr2 (26-250)||(13655994-13656220)
chr2 (15-316)||(32289479-32289780)
chr2 (15-316)||(4484284-4484592)
chr2 (15-232)||(30833342-30833560)
chr2 (42-313)||(45099665-45099941)
chr2 (42-313)||(4503114-4503390)
chr2 (42-313)||(36205646-36205921)
chr2 (42-313)||(5723237-5723512)
chr2 (42-313)||(36988057-36988333)
chr2 (42-230)||(2334399-2334586)
chr2 (42-230)||(6594987-6595175)
chr2 (42-211)||(34139752-34139919)
chr2 (62-230)||(45726929-45727096)
chr2 (42-211)||(723726-723892)
chr2 (42-176)||(14633807-14633939)
chr2 (58-230)||(29867869-29868040)
chr2 (62-211)||(35446885-35447032)
chr2 (42-211)||(33162432-33162598)
chr2 (42-176)||(36773617-36773748)
chr2 (58-230)||(38312240-38312411)
chr2 (43-145)||(17057352-17057451)
chr2 (43-145)||(17085335-17085434)
chr2 (62-225)||(33648176-33648340)
chr2 (82-227)||(42362355-42362500)
chr2 (42-176)||(11067360-11067491)
chr2 (42-176)||(11151573-11151704)
chr2 (50-211)||(24398076-24398238)
chr2 (42-211)||(36317991-36318157)
chr2 (71-145)||(1631742-1631814)
chr2 (58-130)||(17450678-17450748)
chr2 (96-230)||(13121769-13121901)
chr2 (62-176)||(17490149-17490261)
chr2 (72-244)||(26353168-26353341)
chr2 (112-230)||(7815323-7815441)
chr2 (58-130)||(39284936-39285007)
chr2 (58-227)||(11690504-11690672)
chr2 (67-125)||(28672036-28672094)
chr2 (51-145)||(42288101-42288192)
chr2 (82-145)||(7451204-7451266)
chr2 (85-130)||(42412118-42412162)
chr2 (42-106)||(1345590-1345653)
[»] chr1 (66 HSPs)
chr1 (15-324)||(44203539-44203848)
chr1 (26-316)||(9036331-9036620)
chr1 (15-316)||(40282291-40282592)
chr1 (15-316)||(21053872-21054173)
chr1 (15-316)||(9987116-9987417)
chr1 (15-316)||(20622190-20622492)
chr1 (15-316)||(51765302-51765611)
chr1 (58-231)||(13316348-13316521)
chr1 (39-227)||(8550765-8550952)
chr1 (42-313)||(20762582-20762859)
chr1 (42-230)||(3189330-3189517)
chr1 (42-230)||(3198147-3198334)
chr1 (42-230)||(3206986-3207173)
chr1 (50-230)||(42297963-42298143)
chr1 (62-230)||(37168297-37168465)
chr1 (42-230)||(28265536-28265722)
chr1 (62-230)||(29136247-29136415)
chr1 (62-230)||(7482231-7482399)
chr1 (42-227)||(834149-834332)
chr1 (62-230)||(13547090-13547257)
chr1 (62-211)||(31925708-31925855)
chr1 (43-230)||(37503540-37503722)
chr1 (43-211)||(49918370-49918535)
chr1 (44-211)||(28220210-28220374)
chr1 (42-176)||(4552619-4552750)
chr1 (62-230)||(11348698-11348865)
chr1 (62-230)||(13549001-13549168)
chr1 (62-211)||(47255340-47255488)
chr1 (43-211)||(3156885-3157050)
chr1 (43-230)||(44455160-44455345)
chr1 (42-145)||(13659318-13659418)
chr1 (42-230)||(50167157-50167343)
chr1 (66-211)||(34603596-34603740)
chr1 (58-230)||(37033068-37033241)
chr1 (62-230)||(47115171-47115340)
chr1 (58-230)||(45644351-45644523)
chr1 (44-176)||(28223405-28223534)
chr1 (62-145)||(28242391-28242472)
chr1 (62-176)||(193666-193778)
chr1 (60-230)||(19754494-19754664)
chr1 (42-145)||(46065004-46065104)
chr1 (42-211)||(50169192-50169358)
chr1 (42-155)||(3847103-3847212)
chr1 (58-176)||(19752741-19752857)
chr1 (82-211)||(23555286-23555413)
chr1 (58-176)||(31659293-31659409)
chr1 (42-230)||(41360914-41361101)
chr1 (43-211)||(37559850-37560017)
chr1 (85-230)||(1833522-1833667)
chr1 (62-176)||(15820362-15820474)
chr1 (42-145)||(36683766-36683866)
chr1 (42-145)||(40122178-40122280)
chr1 (86-225)||(22079322-22079461)
chr1 (58-211)||(196904-197056)
chr1 (62-145)||(37876767-37876848)
chr1 (43-230)||(30476429-30476614)
chr1 (58-145)||(13137973-13138058)
chr1 (42-176)||(16455676-16455807)
chr1 (157-230)||(37879005-37879079)
chr1 (60-126)||(2926613-2926679)
chr1 (82-209)||(927996-928123)
chr1 (88-176)||(6808507-6808595)
chr1 (61-106)||(6995702-6995746)
chr1 (73-130)||(8871074-8871130)
chr1 (154-211)||(32736953-32737009)
chr1 (69-211)||(37282699-37282841)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (15-324)||(2556-2865)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (15-320)||(25689865-25690171)
chr8 (15-316)||(3439418-3439719)
chr8 (12-324)||(42575273-42575586)
chr8 (15-324)||(15290430-15290740)
chr8 (15-324)||(15470799-15471109)
chr8 (15-316)||(2627649-2627951)
chr8 (42-313)||(44303764-44304042)
chr8 (42-313)||(17982563-17982840)
chr8 (42-313)||(31218167-31218444)
chr8 (42-313)||(34254312-34254586)
chr8 (42-313)||(34256488-34256762)
chr8 (18-230)||(42498193-42498403)
chr8 (42-230)||(19945340-19945529)
chr8 (42-212)||(1746200-1746367)
chr8 (43-230)||(15212786-15212971)
chr8 (62-211)||(42434992-42435139)
chr8 (43-230)||(43036423-43036608)
chr8 (42-176)||(1345353-1345484)
chr8 (62-230)||(4283524-4283691)
chr8 (42-157)||(4743196-4743308)
chr8 (58-230)||(33352150-33352321)
chr8 (58-228)||(40321082-40321251)
chr8 (42-230)||(3303652-3303838)
chr8 (58-211)||(12702631-12702782)
chr8 (62-176)||(18655455-18655567)
chr8 (58-230)||(27811278-27811449)
chr8 (58-176)||(5689326-5689442)
chr8 (50-145)||(10930188-10930281)
chr8 (88-227)||(40328782-40328922)
chr8 (58-176)||(6599027-6599143)
chr8 (58-176)||(6674480-6674596)
chr8 (42-230)||(19491680-19491867)
chr8 (82-211)||(30143360-30143488)
chr8 (58-211)||(40221765-40221916)
chr8 (58-176)||(41366612-41366727)
chr8 (43-230)||(4731658-4731843)
chr8 (62-230)||(8965692-8965859)
chr8 (82-211)||(18141841-18141968)
chr8 (42-211)||(30291626-30291794)
chr8 (62-176)||(11384040-11384152)
chr8 (43-145)||(4733792-4733891)
chr8 (112-230)||(9765745-9765863)
chr8 (42-176)||(10015136-10015265)
chr8 (42-176)||(1292446-1292576)
chr8 (100-227)||(44353796-44353923)
chr8 (73-176)||(4162552-4162652)
chr8 (73-145)||(8153844-8153914)
chr8 (71-176)||(18106091-18106191)
chr8 (86-130)||(7597715-7597759)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (27-324)||(8395511-8395807)
chr4 (27-324)||(8393302-8393598)
chr4 (30-324)||(7124807-7125103)
chr4 (11-324)||(5138196-5138512)
chr4 (30-324)||(7122588-7122884)
chr4 (11-324)||(5135970-5136287)
chr4 (20-300)||(31495274-31495556)
chr4 (42-313)||(13992274-13992544)
chr4 (62-313)||(29999806-30000063)
chr4 (42-230)||(56178618-56178805)
chr4 (42-230)||(48143042-48143230)
chr4 (58-216)||(5370079-5370237)
chr4 (42-230)||(52095344-52095530)
chr4 (50-211)||(2209733-2209894)
chr4 (50-228)||(12119540-12119719)
chr4 (43-212)||(12743908-12744074)
chr4 (43-212)||(12745297-12745463)
chr4 (62-176)||(50673848-50673960)
chr4 (43-230)||(9927441-9927626)
chr4 (43-230)||(12739533-12739718)
chr4 (43-230)||(34570397-34570582)
chr4 (65-211)||(41964435-41964580)
chr4 (62-230)||(46703500-46703669)
chr4 (42-230)||(47038393-47038577)
chr4 (62-230)||(12073392-12073560)
chr4 (50-230)||(26364236-26364415)
chr4 (62-230)||(37229722-37229890)
chr4 (62-211)||(6655976-6656123)
chr4 (66-176)||(8665463-8665571)
chr4 (58-230)||(36463386-36463557)
chr4 (42-211)||(46147373-46147539)
chr4 (42-176)||(48893620-48893751)
chr4 (50-176)||(50262689-50262814)
chr4 (50-230)||(54883020-54883199)
chr4 (43-230)||(26175619-26175804)
chr4 (42-230)||(6542161-6542349)
chr4 (62-211)||(379400-379548)
chr4 (62-230)||(8648139-8648306)
chr4 (62-230)||(40632445-40632612)
chr4 (62-211)||(41639446-41639593)
chr4 (42-230)||(45687164-45687351)
chr4 (71-230)||(37740625-37740783)
chr4 (60-230)||(36994524-36994693)
chr4 (85-211)||(5207865-5207991)
chr4 (82-230)||(4587958-4588107)
chr4 (58-230)||(5429679-5429850)
chr4 (58-230)||(27416962-27417133)
chr4 (71-176)||(35662496-35662599)
chr4 (102-211)||(12744087-12744195)
chr4 (42-176)||(31474206-31474337)
chr4 (42-211)||(52467336-52467502)
chr4 (82-230)||(54199926-54200074)
chr4 (100-230)||(12747794-12747924)
chr4 (45-145)||(5871906-5872003)
chr4 (102-211)||(12745476-12745584)
chr4 (71-204)||(26699451-26699585)
chr4 (43-145)||(29254580-29254679)
chr4 (82-155)||(13009464-13009535)
chr4 (42-230)||(52082645-52082825)
chr4 (86-176)||(33989899-33989989)
chr4 (100-145)||(3913534-3913578)
chr4 (88-140)||(33089970-33090021)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (15-324)||(3678-3987)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (26-316)||(6188-6477)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (15-232)||(11115-11333)
scaffold0491 (15-232)||(8689-8907)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (42-230)||(11557-11745)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (42-313)||(434443-434720)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (58-313)||(827-1087)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (58-230)||(114602-114774)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (62-211)||(18004-18151)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (42-145)||(149079-149179)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (43-230)||(20398-20583)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (15-94)||(1-81)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (62-176)||(7382-7494)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (62-174)||(10546-10656)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (62-130)||(27442-27510)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25078337 - 25078026
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078337 cacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 25078238  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25078237 ctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 25078138  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078137 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 25078038  T
Q  313 agagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||    
T  25078037 agagcttcccct 25078026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25136306 - 25135995
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136306 cacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 25136207  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25136206 ctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 25136107  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136106 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 25136007  T
Q  313 agagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||    
T  25136006 agagcttcccct 25135995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10593462 - 10593172
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593462 aggagagggaagtagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 10593363  T
Q  126 atcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  10593362 atcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttctcccaatctc 10593263  T
Q  226 accaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593262 accaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 10593172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Original strand, 29751112 - 29751414
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaat-acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751112 cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 29751211  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  29751212 ctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 29751310  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751311 ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 29751410  T
Q  313 agag 316  Q
    ||||    
T  29751411 agag 29751414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16546836 - 16546537
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac 124  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16546836 aggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccac 16546737  T
Q  125 tatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaat 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16546736 tatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcctaat 16546637  T
Q  223 ctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttccc 322  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546636 ctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttccc 16546539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 320
Target Start/End: Original strand, 22536243 - 22536545
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536243 cacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 22536342  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctct 214  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  22536343 cccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctt 22536441  T
Q  215 ttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536442 ttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tgcagggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctag 22536539  T
Q  315 agcttc 320  Q
    ||||||    
T  22536540 agcttc 22536545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29720579 - 29720278
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29720579 cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactc 29720480  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctc 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||      
T  29720479 tccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccct 29720381  T
Q  214 tttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720380 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 29720281  T
Q  314 gag 316  Q
    |||    
T  29720280 gag 29720278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29722739 - 29722438
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722739 cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactc 29722640  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctc 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||      
T  29722639 tccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccct 29722541  T
Q  214 tttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722540 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 29722441  T
Q  314 gag 316  Q
    |||    
T  29722440 gag 29722438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40380292 - 40379998
Alignment:
Q  30 gagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40380292 gagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatc 40380193  T
Q  129 aaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40380192 aaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac 40380093  T
Q  228 caagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380092 caagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 40379998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40382503 - 40382209
Alignment:
Q  30 gagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40382503 gagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatc 40382404  T
Q  129 aaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40382403 aaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaacttctacccctttcccaatctcac 40382304  T
Q  228 caagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382303 caagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 40382209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16544614 - 16544315
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac 124  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16544614 aggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccac 16544515  T
Q  125 tatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaat 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16544514 tatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttatgagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaat 16544415  T
Q  223 ctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttccc 322  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544414 ctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttccc 16544317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16409691 - 16409389
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16409691 cacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaact 16409592  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  16409591 ctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 16409494  T
Q  212 tctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacc 310  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  16409493 ctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaacc 16409395  T
Q  311 ctagag 316  Q
    ||||||    
T  16409394 ctagag 16409389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26178098 - 26177797
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26178098 cacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaact 26177999  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  26177998 ctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 26177901  T
Q  212 tctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacc 310  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  26177900 -cttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaacc 26177803  T
Q  311 ctagag 316  Q
    ||||||    
T  26177802 ctagag 26177797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Original strand, 9789176 - 9789478
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9789176 cacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaact 9789275  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||    
T  9789276 ctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaac-aaccttaatttctacc 9789373  T
Q  212 tctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacc 310  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  9789374 ctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaacc 9789472  T
Q  311 ctagag 316  Q
    ||||||    
T  9789473 ctagag 9789478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Original strand, 18441600 - 18441902
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  18441600 cacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaact 18441699  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  18441700 ctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaac-aaccctaatttctacc 18441797  T
Q  212 tctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacc 310  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  18441798 ctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaacc 18441896  T
Q  311 ctagag 316  Q
    ||||||    
T  18441897 ctagag 18441902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26170978 - 26170688
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26170978 cacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaact 26170879  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||     
T  26170878 ctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaag----------agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctacc- 26170792  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccc 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||    
T  26170791 cttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctgtaatcaaag-actctaaaccc 26170693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25412947 - 25412672
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25412947 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 25412850  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac-------caaga 232  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  25412849 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaaga 25412752  T
Q  233 cactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25412751 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 25412672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30182775 - 30182499
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30182775 aaacaaacacaccaa-agattgttcatccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 30182679  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-tctttcccaatctcac-------caag 231  Q
    | |||| |||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||       ||||    
T  30182678 ccaaagagatagaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaag 30182580  T
Q  232 acactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30182579 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttgcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaatcccta 30182499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37439328 - 37439160
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37439328 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 37439231  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    | |||| ||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  37439230 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacct 37439160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13343232 - 13342971
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||| |    
T  13343232 agattgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--caaagagatacaaaa 13343136  T
Q  158 gg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcac-------caagacactcaataattct 246  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||       ||||||||||||| ||| |    
T  13343135 ggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 13343037  T
Q  247 ctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    | ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  13343036 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcagag-accctaaacccta 13342971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13239938 - 13239751
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13239938 aaacaaacacaccaaaa-attgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 13239841  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-tctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| ||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  13239840 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaa 13239751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 36074024 - 36074302
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  36074024 aaacaaacacaccaa-agattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 36074120  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc----tctttcccaatctcac-------c 228  Q
      |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||    | ||||||||||||||       |    
T  36074121 -caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaac 36074218  T
Q  229 aagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36074219 aagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36074302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 213633 - 213465
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  213633 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 213536  T
Q  161 tacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  213535 tacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 213465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32637010 - 32636824
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32637010 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 32636914  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  32636913 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 32636824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40147428 - 40147261
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||    
T  40147428 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 40147332  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  40147331 tacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28278494 - 28278316
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 149  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |    
T  28278494 acaccaaga-attgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac-aaagag 28278399  T
Q  150 atac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  28278398 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28278316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 176
Target Start/End: Original strand, 8565926 - 8566059
Alignment:
Q  39 agaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 138  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8565926 agaaaacaaacacaccaaga--ttgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc 8566021  T
Q  139 ttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt 176  Q
    |||| | |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  8566022 ttac-agagggatacaaatgggttacaagaaattagctt 8566059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Original strand, 42428427 - 42428598
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  42428427 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 42428523  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  42428524 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 42428598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13488374 - 13488113
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    ||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  13488374 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 13488278  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac-------caagacactcaataattctc 247  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||       ||||||||||||||||| ||    
T  13488277 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaatgaacaagacactcaataattttc 13488179  T
Q  248 tct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
     ||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13488178 actcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 13488113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5058212 - 5058131
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 145  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5058212 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 5058131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 13695672 - 13695859
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||||| || |||||||||     
T  13695672 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacctagtttggtccaag-ttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaa-tgagttcttt 13695768  T
Q  142 caaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcaccaa 230  Q
      |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||    
T  13695769 acaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttcccaatctctccaa 13695859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 313
Target Start/End: Original strand, 30682906 - 30683178
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag--ttctt 140  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  30682906 aacaaacacaccaa-agattgttgacc-agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtattctt 30683001  T
Q  141 acaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac-------caa 230  Q
    || ||||  |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||    ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||       |||    
T  30683002 ac-aaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcac----aaagaaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaa 30683096  T
Q  231 gacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30683097 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcgcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 30683178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16452266 - 16452135
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16452266 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactat-gaatgagttctta 16452170  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt 176  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  16452169 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 16452135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33831866 - 33831700
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  33831866 aaacaaaaacaccaa-agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctta 33831770  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  33831769 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacc 33831700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 211
Target Start/End: Original strand, 42426232 - 42426383
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  42426232 agattgttgacctagttcagtccaa-cttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 42426328  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
     |||| ||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  42426329 gggttgcaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 42426383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31183157 - 31183031
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31183157 aaacaaacacaccaa-agaatgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaa-tgagttctta 31183061  T
Q  142 caaaagggatacaagaggttacaagaaatta 172  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  31183060 caaa-gggatacaaatggttacaagaaatta 31183031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 173
Target Start/End: Original strand, 27637615 - 27637723
Alignment:
Q  64 ttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--ggtt 161  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||    
T  27637615 ttcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggtt 27637711  T
Q  162 acaagaaattag 173  Q
    ||||||||||||    
T  27637712 acaagaaattag 27637723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 533952 - 533769
Alignment:
Q  45 caaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaa 144  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  533952 caaagacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttcttac-a 533857  T
Q  145 aagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | | || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  533856 aagagatacaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaag-accaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 533769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 146
Target Start/End: Original strand, 28750638 - 28750738
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||| | |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28750638 aacaaacacaccaa-agattattgacccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 28750734  T
Q  143 aaaa 146  Q
    ||||    
T  28750735 aaaa 28750738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 211
Target Start/End: Original strand, 16640961 - 16641086
Alignment:
Q  83 acttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gaca 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    ||||||||| |||| ||||||| || ||||  |||||| |||||  |||    
T  16640961 acttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca----agttcttac-aaagagatacaaaagagttatcagaaatcagcttcaaca 16641055  T
Q  181 agttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    || |||| | |||||||| ||||||||||||    
T  16641056 agctcacaaagaacaaacactaatttctacc 16641086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19806534 - 19806463
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 130  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19806534 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 19806463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 39468546 - 39468714
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  39468546 agattgttgacccagttcagtccaat-ttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 39468642  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac 227  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  39468643 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 39468714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 538196 - 538080
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| | | |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  538196 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 538100  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt 176  Q
     |||||||||||||||||||    
T  538099 gggttacaagaaattagctt 538080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27015690 - 27015609
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 145  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27015690 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatc-aatgagttcttacaaa 27015609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 316933 - 316769
Alignment:
Q  60 attgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg 159  Q
    |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  | |||| ||||| |||| |||||||||||   |||| ||||||| |||    
T  316933 attgtttaccaagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatc-aatgagttctttacaaagagatacaaaagg 316835  T
Q  160 -ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatct 224  Q
     |||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  316834 attacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaa-cctaatttctacctttttctcaatct 316769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 9049354 - 9049455
Alignment:
Q  73 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaatt 171  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  9049354 ttcggtccaa-cttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatggttacaagaaatt 9049450  T
Q  172 agctt 176  Q
    |||||    
T  9049451 agctt 9049455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4160743 - 4160702
Alignment:
Q  86 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4160743 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 212
Target Start/End: Original strand, 3075640 - 3075807
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  3075640 aaacaaacacaccaagaaat-gttcacccaatttggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatc-aacgaattctta 3075736  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    |||||  ||||| ||  |||||||||||||||| || | |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  3075737 caaaa-agatacaaatgggttacaagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacct 3075807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 176
Target Start/End: Original strand, 33906028 - 33906144
Alignment:
Q  60 attgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg 159  Q
    |||||| ||| || |||||||||  |||||||||||| | | ||||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||   |||| ||||||| |||    
T  33906028 attgtttacccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatc-aatgagttctttacaaagagatacaaaagg 33906126  T
Q  160 -ttacaagaaattagctt 176  Q
     ||||||||| |||||||    
T  33906127 attacaagaagttagctt 33906144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 42309953 - 42310048
Alignment:
Q  80 caaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt 176  Q
    ||||||| | ||||| ||| ||||||||||  ||| | ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42309953 caaacttaatctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatc-aataagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 42310048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3617666 - 3617355
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617666 cacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 3617567  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3617566 ctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 3617467  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617466 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 3617367  T
Q  313 agagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||    
T  3617366 agagcttcccct 3617355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 54635340 - 54635039
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54635340 cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtact 54635241  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  54635240 ctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccct 54635142  T
Q  214 tttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635141 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 54635042  T
Q  314 gag 316  Q
    |||    
T  54635041 gag 54635039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45283190 - 45282897
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 125  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283190 aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 45283091  T
Q  126 atcaaatgagttcttacaaaa---gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  45283090 atcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaat 45282991  T
Q  223 ctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282990 ctcaccaagacactcaatgattctctctttgcaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 45282897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6716715 - 6716414
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6716715 cacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtact 6716616  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  6716615 ctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccct 6716517  T
Q  214 tttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716516 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 6716417  T
Q  314 gag 316  Q
    |||    
T  6716416 gag 6716414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25637632 - 25637342
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac 124  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637632 aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac 25637533  T
Q  125 tatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatc 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25637532 tatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatc 25637433  T
Q  224 tcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637432 tcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 25637342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10056440 - 10056125
Alignment:
Q  12 aaacacaagataag--aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 108  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10056440 aaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagttt 10056341  T
Q  109 gtactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaattt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10056340 gtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaattt 10056241  T
Q  207 ctacctctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaacccta 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10056240 ctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaacccta 10056143  T
Q  307 aaccctagagcttcccct 324  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  10056142 aactctagagcttcccct 10056125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10058662 - 10058347
Alignment:
Q  12 aaacacaagataag--aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 108  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10058662 aaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagttt 10058563  T
Q  109 gtactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaattt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10058562 gtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaattt 10058463  T
Q  207 ctacctctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaacccta 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10058462 ctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaacccta 10058365  T
Q  307 aaccctagagcttcccct 324  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  10058364 aactctagagcttcccct 10058347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10060884 - 10060569
Alignment:
Q  12 aaacacaagataag--aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 108  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10060884 aaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagttt 10060785  T
Q  109 gtactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaattt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10060784 gtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaattt 10060685  T
Q  207 ctacctctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaacccta 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10060684 ctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaacccta 10060587  T
Q  307 aaccctagagcttcccct 324  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  10060586 aactctagagcttcccct 10060569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10063106 - 10062791
Alignment:
Q  12 aaacacaagataag--aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 108  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10063106 aaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagttt 10063007  T
Q  109 gtactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaattt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10063006 gtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaattt 10062907  T
Q  207 ctacctctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaacccta 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10062906 ctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaacccta 10062809  T
Q  307 aaccctagagcttcccct 324  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  10062808 aactctagagcttcccct 10062791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10065328 - 10065013
Alignment:
Q  12 aaacacaagataag--aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 108  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10065328 aaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagttt 10065229  T
Q  109 gtactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaattt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10065228 gtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaattt 10065129  T
Q  207 ctacctctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaacccta 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10065128 ctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaacccta 10065031  T
Q  307 aaccctagagcttcccct 324  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  10065030 aactctagagcttcccct 10065013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Original strand, 4598486 - 4598785
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac 124  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4598486 aggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccac 4598585  T
Q  125 tatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaat 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4598586 tatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaat 4598685  T
Q  223 ctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttccc 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4598686 ctcaccaagacactcaatgattctctc--tacagggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttcc 4598783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Original strand, 4600707 - 4601006
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac 124  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4600707 aggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccac 4600806  T
Q  125 tatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaat 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4600807 tatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaat 4600906  T
Q  223 ctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttccc 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4600907 ctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttcc 4601004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10211600 - 10211301
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac 124  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10211600 aggagagggaagatgaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccac 10211501  T
Q  125 tatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaat 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10211500 tatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaat 10211401  T
Q  223 ctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttccc 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10211400 ctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttcc 10211303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10209380 - 10209081
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac 124  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10209380 aggagagggaagatgaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccac 10209281  T
Q  125 tatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10209280 tatcaaatgagttctttacaaaaggactacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaat 10209181  T
Q  223 ctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttccc 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10209180 ctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttcc 10209083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 801308 - 801005
Alignment:
Q  14 acacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  801308 acacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 801209  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  801208 ctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctac 801111  T
Q  211 ctctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaac 309  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  801110 ccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaac 801012  T
Q  310 cctagag 316  Q
    |||||||    
T  801011 cctagag 801005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 267
Target Start/End: Original strand, 7779957 - 7780208
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7779957 cacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactc 7780056  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctc 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||      
T  7780057 tccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctaccct 7780154  T
Q  214 tttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttccca 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  7780155 tttcccaatctcacgaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttccca 7780208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 128 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10067431 - 10067235
Alignment:
Q  128 caaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctc 225  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10067431 caaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 10067332  T
Q  226 accaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10067331 accaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccct 10067235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 316
Target Start/End: Original strand, 23200095 - 23200398
Alignment:
Q  18 aagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctcc 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23200095 aagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctcc 23200193  T
Q  118 aatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-tct 214  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||| | |    
T  23200194 aattcactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctaccattt 23200290  T
Q  215 ttcccaatctcac------caagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaa 307  Q
    |||||||||||||      ||||||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23200291 ttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaa 23200389  T
Q  308 accctagag 316  Q
    |||||||||    
T  23200390 accctagag 23200398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Original strand, 23197893 - 23198199
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23197893 cacaagataaaaggagagagaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactc 23197991  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc- 211  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||     
T  23197992 tccaattcactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaaaac-aactctaatttctacca 23198088  T
Q  212 tctttcccaatctcac------caagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccc 304  Q
    | ||||||||||||||      ||||||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23198089 tttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accc 23198187  T
Q  305 taaaccctagag 316  Q
    ||||||||||||    
T  23198188 taaaccctagag 23198199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 196 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6718718 - 6718598
Alignment:
Q  196 aaccctaatttctacctctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 295  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718718 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 6718619  T
Q  296 aaagaaccctaaaccctagag 316  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6718618 aaagaaccctaaaccctagag 6718598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45095350 - 45095075
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45095350 aaacaaatacgccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 45095253  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac-------caaga 232  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  45095252 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaaga 45095155  T
Q  233 cactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45095154 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45095075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 5258125 - 5258402
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  5258125 aaacaaacacaccaa-agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 5258221  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcac-------caa 230  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||       |||    
T  5258222 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaa 5258320  T
Q  231 gacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5258321 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5258402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 9636106 - 9636385
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9636106 aaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 9636204  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctc-------accaa 230  Q
    |||||  ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||       |||||    
T  9636205 caaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaa 9636302  T
Q  231 gacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||||| ||| || ||   |||||||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9636303 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaacccta 9636385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 5260304 - 5260581
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  5260304 aaacaaacacaccaa-agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 5260400  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctc-------accaa 230  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||       |||||    
T  5260401 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaa 5260499  T
Q  231 gacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5260500 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5260581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37408645 - 37408369
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37408645 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctta 37408548  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac-------caag 231  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||       ||||    
T  37408547 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaag 37408450  T
Q  232 acactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||||||| || ||    ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37408449 acactcaataattttcactcactaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accataaacccta 37408369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 227
Target Start/End: Original strand, 19683870 - 19684054
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19683870 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 19683967  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac 227  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  19683968 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 19684054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7762437 - 7762265
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  7762437 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaa 7762340  T
Q  158 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  7762339 gagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 7762265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7764651 - 7764484
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7764651 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatc-aatgagttctta 7764554  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    | |||| ||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  7764553 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 7764484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9581454 - 9581302
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||     
T  9581454 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaat 9581357  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
     ||||| |||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  9581356 gggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacc 9581302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34491397 - 34491212
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34491397 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 34491301  T
Q  143 aaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||| |||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  34491300 -aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34491212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 230
Target Start/End: Original strand, 49199457 - 49199638
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  49199457 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 49199554  T
Q  150 atacaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  49199555 atacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 49199638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 29196368 - 29196555
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29196368 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 29196464  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29196465 c-aaagagatacaaatgggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29196555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 30236304 - 30236145
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 149  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  30236304 acaccaagaaattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 30236208  T
Q  150 atac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  30236207 atacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 30236145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 230
Target Start/End: Original strand, 43401789 - 43401970
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  43401789 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 43401886  T
Q  150 atacaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||| || |   ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  43401887 ataaaaaatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43401970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4570120 - 4569952
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||    
T  4570120 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 4570023  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  4570022 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 39153358 - 39153526
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||      
T  39153358 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttctta-taaagggatacaaat 39153454  T
Q  158 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac 227  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  39153455 gagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 39153526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 145
Target Start/End: Original strand, 43403736 - 43403826
Alignment:
Q  54 caagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 145  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43403736 caagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 43403826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 51398999 - 51398834
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51398999 aacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 51398903  T
Q  143 aaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
     |||| |||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  51398902 -aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaac-aaccctaatttctacc 51398834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Original strand, 6095600 - 6095767
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  6095600 tgttcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 6095696  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||||||||| |||  | ||||| || | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  6095697 tacaagaaattaacttcaagaagtttacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 6095767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16499215 - 16499115
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16499215 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 16499119  T
Q  142 caaa 145  Q
    ||||    
T  16499118 caaa 16499115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40734669 - 40734498
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||      
T  40734669 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaat 40734573  T
Q  158 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | ||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  40734572 gtgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40734498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 44331716 - 44331565
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||      
T  44331716 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttcttac-aaagagatacaaat 44331620  T
Q  158 gg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    || |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44331619 ggcttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 44331565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Original strand, 44700476 - 44700646
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||     
T  44700476 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatgtgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaat 44700571  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  44700572 aggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44700646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 46173536 - 46173377
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 149  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |    
T  46173536 acaccaagaaattgttgatctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgaattcttac-aaagag 46173440  T
Q  150 atac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  46173439 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 46173377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 40735568 - 40735403
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40735568 aacaaatacaccaa-agattgctgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 40735472  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
     |||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  40735471 -aaagagatacaaactggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 40735403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Original strand, 41819523 - 41819691
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--gg 159  Q
    |||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |  ||    
T  41819523 tgttcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat--aatgagttcttac-aaagagatacaaaatggg 41819619  T
Q  160 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  41819620 ttacaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41819691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 10067527 - 10067435
Alignment:
Q  12 aaacacaagataag--aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggagg 101  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067527 aaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 761033 - 760850
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  761033 aaacaaacacaccaa-agattgttaacccatttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 760937  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac 227  Q
    | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  760936 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaga-cctaatttctacccattttcccaatctcac 760850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 22835012 - 22835167
Alignment:
Q  71 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  22835012 agttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaa 22835108  T
Q  170 ttagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac 227  Q
    |||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  22835109 ttagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 22835167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29813234 - 29813063
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||     
T  29813234 agattgttgacccagttcggtccaa-catgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttac-aaagagatgcaaat 29813138  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct-ctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  29813137 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaa 29813063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31314631 - 31314465
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31314631 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 31314535  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31314534 caaaa-agatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaac-aaccctaatttctacc 31314465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 40913472 - 40913379
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 145  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40913472 acaccaagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-gatgagttcttacaaa 40913379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 54593871 - 54593704
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  54593871 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 54593775  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  54593774 tacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaa 54593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29811016 - 29810868
Alignment:
Q  82 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gac 179  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  29811016 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 29810919  T
Q  180 aagttcactatgaacaaaccctaatttctacct-ctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  29810918 aagttcacaaagaac-aactctaatttctacatattttcctaatctcaccaa 29810868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 5236440 - 5236624
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  5236440 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagtttggtccaaa-ttgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaa-tgagttcttac 5236535  T
Q  143 aaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||| | |||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  5236536 aaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5236624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 170
Target Start/End: Original strand, 55301972 - 55302079
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| || ||||    
T  55301972 tgttcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgaattcttac-aaagagatacaaataggt 55302069  T
Q  161 tacaagaaat 170  Q
    ||||||||||    
T  55302070 tacaagaaat 55302079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29682530 - 29682362
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||     
T  29682530 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaat 29682434  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac 227  Q
     ||| |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  29682433 gggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cataatttctacccattttcccaatctcac 29682362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Original strand, 32744418 - 32744583
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32744418 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaa-gagttctta 32744514  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    | |||| |||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  ||||||||||||    
T  32744515 c-aaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa--ctaatttctacc 32744583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 46860631 - 46860494
Alignment:
Q  73 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaatt 171  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  46860631 ttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattac-aaagagatacaaatgggttacaagaaatt 46860534  T
Q  172 agctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  46860533 agcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacc 46860494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Original strand, 9666448 - 9666615
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9666448 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-ctttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaa-gaattctta 9666544  T
Q  142 caaa-agggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||| ||| ||| | || ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  ||||||||||||    
T  9666545 caaagaggtataaatga-gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacc 9666615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 176
Target Start/End: Original strand, 53921513 - 53921616
Alignment:
Q  71 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaa 169  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||    
T  53921513 agttcggtc-aaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-tgatacaaatgagttacaagaaa 53921609  T
Q  170 ttagctt 176  Q
    |||||||    
T  53921610 ttagctt 53921616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 47304430 - 47304340
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47304430 acaccaataaattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 47304340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 129
Target Start/End: Original strand, 27305720 - 27305777
Alignment:
Q  71 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatca 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27305720 agttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32891262 - 32891123
Alignment:
Q  71 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaa 169  Q
    |||||||||||| | |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||    
T  32891262 agttcggtccaa-catgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaa 32891166  T
Q  170 ttagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||||  ||||| |||| | ||||||| | |||||||||||    
T  32891165 ttagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacc 32891123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Original strand, 23391891 - 23391991
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  23391891 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaa-gagttcttg 23391987  T
Q  142 caaa 145  Q
    ||||    
T  23391988 caaa 23391991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 5433971 - 5434046
Alignment:
Q  158 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||    
T  5433971 ggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaa 5434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 230
Target Start/End: Original strand, 51352150 - 51352278
Alignment:
Q  101 gagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaacc 199  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| ||| | || | |||| |||||||||||    
T  51352150 gagagattgatctctcaaatccactctcaa-tgagttattacaaa-gaaatacaaatggttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaacc 51352247  T
Q  200 ctaatttctacctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||| ||||| |  ||||| |||||||||||    
T  51352248 ctaacttctatcattttcctaatctcaccaa 51352278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Original strand, 2075095 - 2075143
Alignment:
Q  82 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 130  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  2075095 aacttgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaa 2075143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25421507 - 25421211
Alignment:
Q  30 gagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421507 gagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc 25421408  T
Q  129 aaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25421407 aaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac 25421308  T
Q  228 caagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421307 caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 25421211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16653317 - 16653009
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16653317 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccac 16653218  T
Q  125 tatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatct 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16653217 tatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatct 16653118  T
Q  225 caccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  16653117 caccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccct 16653018  T
Q  325 atgcttctc 333  Q
     || |||||    
T  16653017 ttgattctc 16653009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16555074 - 16554783
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16555074 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccac 16554975  T
Q  125 tatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatct 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16554974 tatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatct 16554875  T
Q  225 caccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554874 caccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16554783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16631630 - 16631339
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16631630 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccac 16631531  T
Q  125 tatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatct 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16631530 tatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatct 16631431  T
Q  225 caccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631430 caccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16631339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6027448 - 6027154
Alignment:
Q  30 gagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027448 gagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatc 6027349  T
Q  129 aaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6027348 aaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac 6027249  T
Q  228 caagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027248 caagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 6027154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Original strand, 16578481 - 16578772
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16578481 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccac 16578580  T
Q  125 tatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatct 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16578581 tatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatct 16578680  T
Q  225 caccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578681 caccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16578772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16616899 - 16616608
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16616899 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccac 16616800  T
Q  125 tatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatct 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16616799 tatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatct 16616700  T
Q  225 caccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616699 caccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16616608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27648076 - 27647777
Alignment:
Q  14 acacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27648076 acacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtact 27647977  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  27647976 ctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccct 27647878  T
Q  214 tttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647877 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacatggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 27647780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Original strand, 33342068 - 33342367
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac 124  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33342068 aggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccac 33342167  T
Q  125 tatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33342168 tatcaaatgagttctttacaaaaggagtacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaat 33342267  T
Q  223 ctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttccc 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342268 ctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttccc 33342365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34167296 - 34166986
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34167296 cacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtact 34167197  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34167196 ctccaatccactatcaaataagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 34167097  T
Q  212 tctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccc 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  34167096 cctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactc 34166999  T
Q  312 tagagcttcccct 324  Q
    |||||||||||||    
T  34166998 tagagcttcccct 34166986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34165079 - 34164764
Alignment:
Q  12 aaacacaagataag--aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 108  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34165079 aaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagttt 34164980  T
Q  109 gtactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaattt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34164979 gtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaattt 34164880  T
Q  207 ctacctctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaacccta 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34164879 ctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaacccta 34164782  T
Q  307 aaccctagagcttcccct 324  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  34164781 aactctagagcttcccct 34164764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 412318 - 412016
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  412318 cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaact 412219  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg--ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac 210  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  412218 ctctaatccactatcaa-tgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgataagttcacaatgaacaa-ccctaatttctac 412121  T
Q  211 ctctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacc 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  412120 ctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaacc 412022  T
Q  311 ctagag 316  Q
    ||||||    
T  412021 ctagag 412016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13154131 - 13153893
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13154131 cacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtact 13154032  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154031 ctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 13153932  T
Q  212 tctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctct 250  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13153931 cctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 13153893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Original strand, 3072712 - 3073014
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3072712 cacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactc 3072811  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3072812 tccaattcactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacc 3072909  T
Q  212 tctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacc 310  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  3072910 attttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaacc 3073008  T
Q  311 ctagag 316  Q
    ||||||    
T  3073009 ctagag 3073014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Original strand, 6097403 - 6097695
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6097403 cacaagatacaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaact 6097502  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||     
T  6097503 ctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaag----------agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctacca 6097590  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccc 311  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||| ||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097591 tttttccaatctcaccaaaacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaaccaaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccc 6097690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 316
Target Start/End: Original strand, 2171512 - 2171792
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2171512 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 2171610  T
Q  142 caaaagggatacaagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-tctttcccaatctcac-------caaga 232  Q
    | |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||       |||||    
T  2171611 c-aaagagatacaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaaga 2171708  T
Q  233 cactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 316  Q
    |||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2171709 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 2171792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 31404656 - 31404932
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31404656 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 31404753  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac-------caaga 232  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  31404754 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcactgatgaacaaga 31404851  T
Q  233 cactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  31404852 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaagaccctaaacccta 31404932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 5406181 - 5406456
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5406181 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5406278  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac-------caaga 232  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  5406279 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaaga 5406376  T
Q  233 cactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5406377 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5406456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 5410506 - 5410781
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5410506 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5410603  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac-------caaga 232  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  5410604 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaaga 5410701  T
Q  233 cactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5410702 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5410781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 5413376 - 5413561
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5413376 aaacaaacacaccaa-agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5413472  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5413473 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 5413561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 309
Target Start/End: Original strand, 16452310 - 16452583
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16452310 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 16452406  T
Q  142 caaaagggata-caagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcac-------caa 230  Q
    | |||| ||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||       |||    
T  16452407 ccaaagagatatgaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaa 16452505  T
Q  231 gacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaac 309  Q
    |||||||||| ||| || ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16452506 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaac 16452583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 30834517 - 30834794
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30834517 aaacaaacacaccaa-agattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 30834613  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcac-------caa 230  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||       |||    
T  30834614 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaa 30834712  T
Q  231 gacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||||| ||| || ||   | |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30834713 gacactcaatgattttcactcaccgaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accataaacccta 30834794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 230
Target Start/End: Original strand, 3808699 - 3808877
Alignment:
Q  53 ccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggata 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  3808699 ccaagagattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagata 3808796  T
Q  153 caaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct-ctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||| |  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3808797 caaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 3808877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 33160333 - 33160521
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33160333 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatc-aatgagttctta 33160430  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  33160431 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 33160521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Original strand, 5409051 - 5409151
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5409051 aaacaaacacaccaa-agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5409147  T
Q  142 caaa 145  Q
    ||||    
T  5409148 caaa 5409151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21589098 - 21588931
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  21589098 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 21589002  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  21589001 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21588931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21593831 - 21593664
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  21593831 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 21593735  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  21593734 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17758191 - 17758026
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  17758191 tgttcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 17758094  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  17758093 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 17758026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Original strand, 2972940 - 2973107
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  2972940 tgttcacctagttcggtcgaa-cttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 2973036  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  2973037 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17763158 - 17763010
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||  | ||    
T  17763158 tgttcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatc-aatgagttcttccaaaa-agatacaaatgagt 17763061  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  17763060 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 17763010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 26954283 - 26954450
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||       
T  26954283 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacagat 26954379  T
Q  158 g-gttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac 227  Q
    | |||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  26954380 gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttataccaatttcccaatctcac 26954450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 211
Target Start/End: Original strand, 9183015 - 9183179
Alignment:
Q  44 acaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 143  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9183015 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 9183110  T
Q  144 aaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  9183111 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacc 9183179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16569208 - 16568953
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16569208 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 16569112  T
Q  142 caaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaagacactcaa 239  Q
    |||            ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||   ||||||||||||    
T  16569111 caa------------aggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct---caagacactcaa 16569027  T
Q  240 taattctctctt-tacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    | ||| || |||   |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16569026 tgattttcacttacccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 16568953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Original strand, 26830124 - 26830236
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg-t 160  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  || |    
T  26830124 tgttcacccagttcagtc-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatggat 26830220  T
Q  161 tacaagaaattagctt 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  26830221 tacaagaaattagctt 26830236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5043795 - 5043648
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 160  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||    
T  5043795 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 5043698  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac 210  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  5043697 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 5043648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Original strand, 22424826 - 22424975
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga---g 158  Q
    |||||||| ||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |   |    
T  22424826 tgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttac-aaagagatacaaaaatgg 22424922  T
Q  159 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  22424923 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 22424975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Original strand, 28137420 - 28137556
Alignment:
Q  73 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaatt 171  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| ||  ||||||||||||||    
T  28137420 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggttacaagaaatt 28137516  T
Q  172 agctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  28137517 agcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 28137556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Original strand, 33211182 - 33211353
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||      
T  33211182 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttcttacaaa-gagatacaaat 33211278  T
Q  158 g-gttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacctcttt-cccaatctcaccaa 230  Q
    | | |||||||||||| ||| | |||| |||| | |||||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  33211279 gagctacaagaaattaacttcatcaagctcacaaagaacaa-ccataatttctaccaattttcccaatctcaccaa 33211353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26800755 - 26800642
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag--g 159  Q
    |||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |   |    
T  26800755 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttacaaa-gagatacaaaattag 26800659  T
Q  160 ttacaagaaattagctt 176  Q
    |||||||||||||||||    
T  26800658 ttacaagaaattagctt 26800642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 176
Target Start/End: Original strand, 603081 - 603201
Alignment:
Q  54 caagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac 153  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||    
T  603081 caagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatac 603177  T
Q  154 -aagaggttacaagaaattagctt 176  Q
     ||  |||||||||||||||||||    
T  603178 aaatgggttacaagaaattagctt 603201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 230
Target Start/End: Original strand, 3038926 - 3039071
Alignment:
Q  85 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaag 182  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  | |||    
T  3038926 ttgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaag 3039023  T
Q  183 ttcactatgaacaaaccctaatttctacc-tctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3039024 ctcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 3039071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4045542 - 4045423
Alignment:
Q  112 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttcta 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||   |||| |||| || | | ||||||||||||||||| | |||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  4045542 ctctccaatccactatcaa-tgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttcta 4045444  T
Q  210 cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||  |||||||||||| ||||    
T  4045443 ccattttcccaatctctccaa 4045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 19643938 - 19643894
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 106  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19643938 tgtttaccaagttcggtccaaatttgacctactctgaaggagaga 19643894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 106
Target Start/End: Original strand, 21356021 - 21356084
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 106  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  21356021 aaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctggaggagaga 21356084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Original strand, 18392148 - 18392457
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392148 cacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 18392247  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18392248 ctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 18392347  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392348 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 18392445  T
Q  313 agagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||    
T  18392446 agagcttcccct 18392457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Original strand, 18388712 - 18389021
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388712 cacaagatacaaagagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 18388811  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18388812 ctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 18388911  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388912 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 18389009  T
Q  313 agagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||    
T  18389010 agagcttcccct 18389021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20344112 - 20343811
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20344112 cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgtact 20344014  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  20344013 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccct 20343914  T
Q  214 tttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343913 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 20343814  T
Q  314 gag 316  Q
    |||    
T  20343813 gag 20343811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Original strand, 32060289 - 32060587
Alignment:
Q  30 gagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060289 gagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc 32060388  T
Q  129 aaatgagttctt-acaaaa--gggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctc 225  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32060389 aaatgagttctttacaaaaaggggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 32060488  T
Q  226 accaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32060489 accaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttaccct 32060587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Original strand, 6594525 - 6594819
Alignment:
Q  30 gagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6594525 gagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatc 6594624  T
Q  129 aaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6594625 aaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac 6594724  T
Q  228 caagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594725 caagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 6594819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Original strand, 6592307 - 6592601
Alignment:
Q  30 gagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6592307 gagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatc 6592406  T
Q  129 aaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6592407 aaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcac 6592506  T
Q  228 caagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592507 caagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 6592601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24790057 - 24789755
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaa-caaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24790057 cacaagataaaaggagagggaagaagaaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatagtact 24789958  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  24789957 ctccaatccactatcaaa-gagtttttacaaaagggatacaaaatgttacaagaaattagctttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttaccc 24789859  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 312  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789858 ttttcccaatcttaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 24789759  T
Q  313 agag 316  Q
    ||||    
T  24789758 agag 24789755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Original strand, 43504107 - 43504409
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  43504107 cacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactc 43504206  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43504207 tccaattcactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacc 43504304  T
Q  212 tctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacc 310  Q
      |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  43504305 cttttcccaatctcaccaagacactcgatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaagccaagagaagctctaatcaaag-actctaaacc 43504403  T
Q  311 ctagag 316  Q
    ||||||    
T  43504404 ctagag 43504409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39731583 - 39731283
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39731583 cacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactc 39731485  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagct-tgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||     
T  39731484 tccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatctgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 39731387  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccc 311  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  39731386 tttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccc 39731288  T
Q  312 tagag 316  Q
    |||||    
T  39731287 tagag 39731283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 160 - 324
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562265
Alignment:
Q  160 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggt 1562200  T
Q  260 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562201 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 1562265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 153
Target Start/End: Original strand, 1560630 - 1560757
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560630 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggttacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 1560729  T
Q  126 atcaaatgagttcttacaaaagggatac 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560730 atcaaatgagttcttacaaaagggatac 1560757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35854102 - 35853825
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35854102 aaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 35854004  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac-------caag 231  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||       ||||    
T  35854003 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaag 35853906  T
Q  232 acactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  35853905 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actcaaatcaaag-accctaaacccta 35853825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 316
Target Start/End: Original strand, 25766940 - 25767215
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  25766940 aaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 25767037  T
Q  142 caaaagggatac--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctc----accaagac 233  Q
    |||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||    | ||||||    
T  25767038 caaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatctcaatgaacaagac 25767136  T
Q  234 actcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 316  Q
    ||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||    || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25767137 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttt---cccaaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 25767215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48408992 - 48408709
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  48408992 aaacaaacacaccaagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatc-aatgagttattt 48408894  T
Q  142 caaaagggatac--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac-------caa 230  Q
    |||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||||||       |||    
T  48408893 caaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaac-aacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaa 48408795  T
Q  231 gacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 316  Q
    |||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48408794 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 48408709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29991240 - 29990965
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  29991240 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttatta 29991143  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac-------caaga 232  Q
      |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||       |||||    
T  29991142 -gaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaataac-aaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaatgaacaaga 29991045  T
Q  233 cactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29991044 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 29990965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23555212 - 23555039
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |    
T  23555212 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagaggtacaaaa 23555115  T
Q  158 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  23555114 gtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaa 23555039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Original strand, 34310712 - 34310884
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||      
T  34310712 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaat 34310809  T
Q  158 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | ||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  34310810 gtgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34310884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4178960 - 4178685
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||     
T  4178960 aaacaaacacaccaa-agattgttcacctagtttggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatc-aatgagttctt- 4178864  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-tctttcccaatctcac-------caag 231  Q
      |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||       ||||    
T  4178863 -caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttcccaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaag 4178766  T
Q  232 acactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4178765 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 4178685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25616040 - 25615785
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25616040 aaacaaacacaccaa-agattgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctta 25615943  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaagacactca 238  Q
    |||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||  |||   ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||   |||||||||||    
T  25615942 caaaa-tgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatct---caagacactca 25615848  T
Q  239 ataattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 300  Q
    || ||| |||||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25615847 atgattttctctcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 25615785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 41317416 - 41317602
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41317416 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 41317512  T
Q  142 caaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-tctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  41317513 c-aaagggatacaaatggattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 41317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19502365 - 19502088
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19502365 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 19502268  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta--cctctttcccaatctcac-------caa 230  Q
    | |||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |||| |||||||||  | | |||| |||||||||       |||    
T  19502267 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaac-aaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaa 19502170  T
Q  231 gacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||||| |||||| ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19502169 gacactcaatgattctcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 19502088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22270158 - 22269973
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22270158 aacaaacacaccaagagat-gttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatcagttcttac 22270062  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  22270061 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 22269973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Original strand, 14069817 - 14070001
Alignment:
Q  44 acaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 143  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  14069817 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 14069912  T
Q  144 aaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14069913 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14070001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Original strand, 14379845 - 14380029
Alignment:
Q  44 acaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 143  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  14379845 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 14379940  T
Q  144 aaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14379941 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14380029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2390461 - 2390302
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 149  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |    
T  2390461 acaccaagagattattcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-atatgagttattac-aaagag 2390365  T
Q  150 atac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  2390364 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 2390302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Original strand, 41648993 - 41649158
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41648993 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 41649089  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    | |||||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  41649090 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagctaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacc 41649158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Original strand, 32358055 - 32358167
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  32358055 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 32358151  T
Q  161 tacaagaaattagctt 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  32358152 tacaagaaattagctt 32358167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 4253510 - 4253697
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||     
T  4253510 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacctagttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaa-tgagttcttt 4253606  T
Q  142 caaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| |||| || ||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  4253607 ccaaagagatataaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaa 4253697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27348002 - 27347817
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27348002 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttcttac 27347906  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  27347905 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27347817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Original strand, 8359316 - 8359465
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--gg 159  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |  ||    
T  8359316 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatggg 8359413  T
Q  160 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||| |||||||||||||||||    
T  8359414 ttacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacc 8359465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 211
Target Start/End: Original strand, 30024729 - 30024880
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||     
T  30024729 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaat 30024825  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30024826 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 30024880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18126829 - 18126644
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18126829 aacaaacacaccaa-agattgttgacccaggtcggtc-aaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatc-aatgagttcttac 18126733  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagcttg-acaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  18126732 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaa 18126644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29608895 - 29608737
Alignment:
Q  71 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaa 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||    
T  29608895 agttcggtccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaa 29608799  T
Q  170 ttagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29608798 ttagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29608737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8153513 - 8153342
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||      
T  8153513 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattac-aaagagatacaaat 8153417  T
Q  158 g-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||||||||||||||| |||||||  |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  8153416 gagttacaagaaattagctttgacaatctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 8153342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 36146390 - 36146576
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36146390 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaa-tgagttctta 36146486  T
Q  142 caaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacctcttt-cccaatctcaccaa 230  Q
    |||| | |||||||  || ||||| ||||||||||| | |||| |||| |  ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  36146487 caaa-gagatacaaatgggttaca-gaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36146576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491579
Alignment:
Q  82 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gac 179  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctttc-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 48491630  T
Q  180 aagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48491629 aagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48491579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3259162 - 3258995
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 160  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||  | ||    
T  3259162 tgttcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgggtttttac-aaagagatacaaatgagt 3259066  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  3259065 tacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 3258995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Original strand, 4508707 - 4508874
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  4508707 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 4508803  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  4508804 tacaagaaattagcttcaataagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 4508874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6432026
Alignment:
Q  66 cacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttaca 164  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| ||  |||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttaca 6432038  T
Q  165 agaaattagctt 176  Q
    ||||||||||||    
T  6432037 agaaattagctt 6432026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 211
Target Start/End: Original strand, 31732966 - 31733117
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  31732966 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 31733062  T
Q  157 aggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  31733063 gggttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 31733117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Original strand, 48599335 - 48599482
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||  | ||    
T  48599335 tgttcacccagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagctctt-ccaaagagatacaaatgagt 48599431  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  48599432 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 48599482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 48489616 - 48489431
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  48489616 aacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttattgc 48489520  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||  | | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48489519 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48489431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 43864413 - 43864244
Alignment:
Q  60 attgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagag 158  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| ||  |    
T  43864413 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aattagtttttac-aaagagatacaaatgg 43864317  T
Q  159 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  43864316 gttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaa 43864244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 212
Target Start/End: Original strand, 23565081 - 23565211
Alignment:
Q  82 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gac 179  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||  ||    
T  23565081 aacttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaac 23565178  T
Q  180 aagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    ||| |||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  23565179 aagctcacaaagaacaagacctaatttctacct 23565211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Original strand, 2360992 - 2361140
Alignment:
Q  82 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gac 179  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||||||||||  ||    
T  2360992 aacttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaac 2361089  T
Q  180 aagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  2361090 aagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2361140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26417501 - 26417316
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |||||||  ||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26417501 aacaaacacaccaagaaattgttgacccagtttggtccaat-ttgacctaacctgg-ggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac 26417405  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  26417404 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26417316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 211
Target Start/End: Original strand, 47673954 - 47674091
Alignment:
Q  71 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaa 169  Q
    |||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  47673954 agttcggtccaa-cttgacttaatatgg-ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaa 47674049  T
Q  170 ttagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  47674050 ttagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 47674091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Original strand, 47676119 - 47676284
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | | |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  47676119 aacaaacacaccaa-agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatc-attgagttcttac 47676215  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  47676216 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacc 47676284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 205
Target Start/End: Original strand, 2759195 - 2759339
Alignment:
Q  59 gattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag 158  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||  |    
T  2759195 gattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatataaatg 2759291  T
Q  159 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatt 205  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  2759292 agttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 126
Target Start/End: Original strand, 12097849 - 12097931
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccacta 126  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||    
T  12097849 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta 12097931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 227
Target Start/End: Original strand, 38671204 - 38671387
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  38671204 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtcc-aacttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatc-aatgagttctta 38671300  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac 227  Q
    | |||| |||||||  | ||||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  38671301 c-aaagtgatacaaatgtgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 38671387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4586332 - 4586161
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggat-acaag 156  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||     
T  4586332 agattgtcgacccagttcggtccaag-ttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagataaaaat 4586236  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  4586235 gggttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4586161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 176
Target Start/End: Original strand, 6359941 - 6360065
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 149  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  6359941 acaccaagaaattgttgacccagttcgatccaa-cttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatc-aatgagttcttac-aaagag 6360037  T
Q  150 atac-aagaggttacaagaaattagctt 176  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  6360038 atacaaatgggttacaagaaattagctt 6360065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Original strand, 24525484 - 24525584
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24525484 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagttccgtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 24525580  T
Q  142 caaa 145  Q
    ||||    
T  24525581 caaa 24525584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1113843 - 1113679
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||  | ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1113843 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcaattcggtc-aaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttctta 1113747  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 209  Q
    | |||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  1113746 c-aaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 1113679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 227
Target Start/End: Original strand, 495965 - 496148
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  495965 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccggttctgtccaa-cttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 496061  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac 227  Q
      |||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||  ||||| |||| | ||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  496062 -taaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-taccctaatttctacccattttcccaatctcac 496148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31519089 - 31518988
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggag-gagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 140  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| | | |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  31519089 aaacaaacacaccaagaaat-gtttatccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtc-aatgagttctt 31518993  T
Q  141 acaaa 145  Q
    |||||    
T  31518992 acaaa 31518988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Original strand, 4510549 - 4510661
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||  |||    
T  4510549 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatc-aatgagttctta-taaagagatacaaatgggt 4510645  T
Q  161 tacaagaaattagctt 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  4510646 tacaagaaattagctt 4510661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Original strand, 4512391 - 4512503
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||  |||    
T  4512391 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatc-aatgagttctta-taaagagatacaaatgggt 4512487  T
Q  161 tacaagaaattagctt 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  4512488 tacaagaaattagctt 4512503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Original strand, 31105394 - 31105506
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||  |||    
T  31105394 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaatgggt 31105490  T
Q  161 tacaagaaattagctt 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  31105491 tacaagaaattagctt 31105506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 30814605 - 30814536
Alignment:
Q  60 attgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 130  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30814605 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 30814536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18396486 - 18396418
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 130  Q
    |||| ||| |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  18396486 tgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaa 18396418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23344140 - 23343975
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg-t 160  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| |  |||| | ||| |    
T  23344140 tgtttaccttgttcggtccaa-cttgacctactctgg--gagagattaatttctccaatctattatcaa-tgagttctcacaaa-gatatactaaagggt 23344046  T
Q  161 tacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23344045 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaa 23343975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526045
Alignment:
Q  159 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacc 24526045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Original strand, 12647338 - 12647647
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647338 cacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 12647437  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12647438 ctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 12647537  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647538 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 12647635  T
Q  313 agagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||    
T  12647636 agagcttcccct 12647647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6266907 - 6266605
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaat-acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266907 cacaagataaacggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 6266808  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  6266807 ctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 6266709  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266708 ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 6266609  T
Q  313 agag 316  Q
    ||||    
T  6266608 agag 6266605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Original strand, 13655994 - 13656220
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatcca 123  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13655994 aggagagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatcca 13656093  T
Q  124 ctatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13656094 ctatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatc 13656193  T
Q  224 tcaccaagacactcaataattctctct 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13656194 tcaccaagacactcaatgattctctct 13656220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32289780 - 32289479
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  32289780 cacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaggacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatct 32289681  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||| |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  32289680 ctctaatttactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 32289583  T
Q  212 tctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacc 310  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||   |||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  32289582 -cttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttccaaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaacc 32289485  T
Q  311 ctagag 316  Q
    ||||||    
T  32289484 ctagag 32289479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Original strand, 4484284 - 4484592
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4484284 cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactc 4484382  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc- 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||     
T  4484383 tccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 4484480  T
Q  212 -tctttcccaatctcac------caagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaacc 303  Q
     | | ||||||| ||||      ||||||||||||| |||  | ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  4484481 ttttctcccaatttcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-acc 4484579  T
Q  304 ctaaaccctagag 316  Q
    |||||||||||||    
T  4484580 ctaaaccctagag 4484592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30833560 - 30833342
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30833560 cacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactc 30833462  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc- 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||     
T  30833461 tccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 30833364  T
Q  212 -tctttcccaatctcaccaaga 232  Q
     | | |||||||||||||||||    
T  30833363 ttttctcccaatctcaccaaga 30833342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45099941 - 45099665
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  45099941 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 45099845  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcac-------caa 230  Q
      |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||       |||    
T  45099844 -caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaa 45099747  T
Q  231 gacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45099746 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 4503114 - 4503390
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4503114 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 4503210  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctc-------accaa 230  Q
      |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||       | |||    
T  4503211 -caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaa 4503308  T
Q  231 gacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4503309 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaa-cctaaacccta 4503390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 36205646 - 36205921
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || || |||||||||||     
T  36205646 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtc-aatgagttctt- 36205742  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-tctttcccaatctcac-------caag 231  Q
      |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||       ||||    
T  36205743 -caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaag 36205840  T
Q  232 acactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||| ||| || ||   |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36205841 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36205921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 5723237 - 5723512
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5723237 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5723334  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac-------caaga 232  Q
    | |||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||  |||| |||||||||       |||||    
T  5723335 c-aaagagatacaaaaaggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaatgaacaaga 5723432  T
Q  233 cactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5723433 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accccaaacccta 5723512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 36988057 - 36988333
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36988057 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 36988154  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac-------caag 231  Q
    | |||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||||| ||||   |||| |||||||||||||| ||| ||| |||||| |||       ||||    
T  36988155 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagttttgacaagctcacatagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaag 36988252  T
Q  232 acactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36988253 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttactatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 36988333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 2334399 - 2334586
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2334399 aaacaaacacaccaa-agattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 2334496  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  2334497 c-aaagagatacaaaagagttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aacccttatttctacccattttcccaatctcaccaa 2334586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 6594987 - 6595175
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6594987 aaacaaacacaccaa-agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttctta 6595084  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  6595085 c-aaagagattcaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcctaatctcaccaa 6595175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Original strand, 34139752 - 34139919
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34139752 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 34139848  T
Q  142 caaaagggataca-agaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  34139849 caaaagggatacatatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 34139919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 45727096 - 45726929
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| || ||||    
T  45727096 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggt 45727000  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  45726999 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 45726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Original strand, 723726 - 723892
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  723726 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 723822  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  723823 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacc 723892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Original strand, 14633807 - 14633939
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14633807 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-tatgagttctta 14633903  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt 176  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  14633904 caaaagggatacaaatgggttacaagaaattagctt 14633939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29868040 - 29867869
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    ||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||     
T  29868040 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaat 29867944  T
Q  157 aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29867943 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29867869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Original strand, 35446885 - 35447032
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  35446885 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 35446981  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  35446982 tacaagaaattagattcaacaagatcacaaagaac-aaccctaatttctacc 35447032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Original strand, 33162432 - 33162598
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33162432 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctta 33162528  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    | | || ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  33162529 c-agagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 33162598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36773748 - 36773617
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36773748 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 36773652  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt 176  Q
    | |||| |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  36773651 c-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 36773617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38312411 - 38312240
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||     
T  38312411 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagatcttac-aaagagatacaaat 38312315  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  38312314 gggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 38312240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 145
Target Start/End: Original strand, 17057352 - 17057451
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17057352 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 17057448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 145
Target Start/End: Original strand, 17085335 - 17085434
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17085335 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 17085431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33648340 - 33648176
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggt 160  Q
    |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||  |||||| | |||    
T  33648340 tgtttacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatc-aatgagttctttacaaagaaatacaaaagggt 33648242  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctc 225  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  33648241 tacaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctc 33648176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362355
Alignment:
Q  82 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gac 179  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaac 42362403  T
Q  180 aagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac 227  Q
    ||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  42362402 aagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 42362355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11067491 - 11067360
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  11067491 aaacaaacacaccaa-agattgttgaccgagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattat-aaatgagttctta 11067395  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt 176  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  11067394 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 11067360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Original strand, 11151573 - 11151704
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11151573 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaa-gagttctta 11151669  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt 176  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  11151670 c-aaagtgatacaaatgggttacaagaaattagctt 11151704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24398238 - 24398076
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 149  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||   |||| |    
T  24398238 acaccaagtaattgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttctttacaaagag 24398140  T
Q  150 atacaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||    
T  24398139 atacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctacc 24398076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Original strand, 36317991 - 36318157
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36317991 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctta 36318087  T
Q  142 caaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||| | |||||||  || |||||| ||||||| || | |||| |||| | |||||| ||||||||||||||    
T  36318088 caaa-gagatacaaatgggttacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctacc 36318157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 145
Target Start/End: Original strand, 1631742 - 1631814
Alignment:
Q  71 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1631742 agttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 1631814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 17450748 - 17450678
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17450748 agattgttcacctagttcggtcc-aacttgacctactct-gtggagagattgatctctccaatccactatcaa 17450678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13121901 - 13121769
Alignment:
Q  96 tggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaac 194  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| | ||||    
T  13121901 tggaggagagattgatttcttcaatccactatcaa-tgagtttctacaaa-gagatacaa-aggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac 13121805  T
Q  195 aaaccctaatttctacctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  13121804 aaaccctaatttctaccattttcccagtctcaccaa 13121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Original strand, 17490149 - 17490261
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 160  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| || ||    
T  17490149 tgtttacccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagttacaaaagagt 17490245  T
Q  161 tacaagaaattagctt 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  17490246 tacaagaaattagctt 17490261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26353341 - 26353168
Alignment:
Q  72 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaat 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  26353341 gttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatc-aatgagtacttacaaaa-agatacaaaagtgttacaagaaat 26353245  T
Q  171 tagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcaccaa--gacactcaataatt 244  Q
    ||||||  ||||  |||| | ||||||||| ||||||||||   |||  ||||||||||||   |||||||||||||    
T  26353244 tagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacacttttttcaatctcaccaaagaacactcaataatt 26353168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 230
Target Start/End: Original strand, 7815323 - 7815441
Alignment:
Q  112 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||  ||||| |    | ||||||||||||||||| |    
T  7815323 ctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaaccctaatttcaa 7815420  T
Q  210 cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||| |||| ||||||||||||    
T  7815421 cctttttctcaatctcaccaa 7815441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 39285007 - 39284936
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 130  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39285007 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 39284936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11690672 - 11690504
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| | | |||||||||||| |||||| || | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||| ||     
T  11690672 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatc-aacgatttcttac-aaagggatacaaat 11690576  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac 227  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  11690575 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 11690504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28672094 - 28672036
Alignment:
Q  67 acctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 125  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28672094 acctaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccact 28672036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 145
Target Start/End: Original strand, 42288101 - 42288192
Alignment:
Q  51 caccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 145  Q
    |||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  42288101 caccaagaaattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgg-ggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagctcttacaaa 42288192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7451266 - 7451204
Alignment:
Q  82 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 145  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7451266 aacttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttattacaaa 7451204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 42412162 - 42412118
Alignment:
Q  85 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42412162 ttgacctactctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaa 42412118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 1345653 - 1345590
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 106  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  1345653 aaacaaacacaccaagaaattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctactctgggggagaga 1345590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 66)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44203848 - 44203539
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203848 cacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 44203749  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44203748 ctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 44203649  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203648 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 44203551  T
Q  313 agagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||    
T  44203550 agagcttcccct 44203539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9036620 - 9036331
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9036620 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccact 9036521  T
Q  126 atcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctc 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9036520 atcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 9036422  T
Q  226 accaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036421 accaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 9036331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40282592 - 40282291
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282592 cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 40282493  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctc 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||      
T  40282492 tccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccct 40282394  T
Q  214 tttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282393 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 40282294  T
Q  314 gag 316  Q
    |||    
T  40282293 gag 40282291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21054173 - 21053872
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21054173 cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactc 21054074  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctc 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  21054073 tccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacact 21053975  T
Q  214 tttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21053974 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattttttctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 21053875  T
Q  314 gag 316  Q
    |||    
T  21053874 gag 21053872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9987417 - 9987116
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaat-acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987417 cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 9987318  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  9987317 ctccaatccactatcaa-tgagttcttgcaaaagggatacaaaaggttgcaagaaattagattagacaagttcacaatgaacaa-ccctaatttctaccc 9987220  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987219 ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 9987120  T
Q  313 agag 316  Q
    ||||    
T  9987119 agag 9987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Original strand, 20622190 - 20622492
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622190 cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 20622289  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttac--aaaagggatacaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20622290 tccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacc 20622387  T
Q  212 tctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccc 311  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622388 cttttcccaatctcaccaagacagtcaatgattttccctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccc 20622487  T
Q  312 tagag 316  Q
    |||||    
T  20622488 tagag 20622492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 51765611 - 51765302
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51765611 cacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactc 51765513  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    ||||||||||||||||    
T  51765512 tccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacc 51765414  T
Q  212 --tctttcccaatctcac------caagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaacc 303  Q
      | | ||||||||  ||      ||||||||||||| |||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  51765413 cttttctcccaatcaaaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-acc 51765315  T
Q  304 ctaaaccctagag 316  Q
    |||||||||||||    
T  51765314 ctaaaccctagag 51765302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 231
Target Start/End: Original strand, 13316348 - 13316521
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| |    
T  13316348 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-ccaaagagatacaaaa 13316445  T
Q  158 -ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaag 231  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13316446 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaag 13316521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 227
Target Start/End: Original strand, 8550765 - 8550952
Alignment:
Q  39 agaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 138  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8550765 agaaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc 8550862  T
Q  139 ttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac 227  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  8550863 ttac-aaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 8550952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20762859 - 20762582
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20762859 aaacaaacacaccaa-agattggtcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 20762762  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcac-------caa 230  Q
    |  ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | |||| |||||||||       |||    
T  20762761 c-gaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaa 20762664  T
Q  231 gacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    || ||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20762663 gatactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 20762582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3189517 - 3189330
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3189517 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3189420  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||  ||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  3189419 caaaa-agatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3189330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3198334 - 3198147
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3198334 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3198237  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||  ||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  3198236 caaaa-agatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3198147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3207173 - 3206986
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3207173 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3207076  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||  ||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  3207075 caaaa-agatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3206986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 230
Target Start/End: Original strand, 42297963 - 42298143
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  42297963 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 42298060  T
Q  150 atacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-tctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  42298061 atacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 42298143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37168465 - 37168297
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--gg 159  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |  ||    
T  37168465 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatggg 37168369  T
Q  160 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  37168368 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37168297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 28265536 - 28265722
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28265536 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 28265632  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct-ctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  28265633 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaa 28265722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29136415 - 29136247
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||| ||  |||    
T  29136415 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatc-aatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggt 29136318  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29136317 tccaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29136247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Original strand, 7482231 - 7482399
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--gg 159  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |  ||    
T  7482231 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatggg 7482327  T
Q  160 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctcttt-cccaatctcaccaa 230  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  7482328 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaa 7482399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 227
Target Start/End: Original strand, 834149 - 834332
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  834149 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttctta 834245  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac 227  Q
    | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  834246 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcac 834332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Original strand, 13547090 - 13547257
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  13547090 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 13547186  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  13547187 tacaagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13547257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Original strand, 31925708 - 31925855
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  31925708 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 31925804  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  31925805 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-atccctaatttctacc 31925855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 37503540 - 37503722
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37503540 aacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcgatccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 37503636  T
Q  143 aaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||| ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  37503637 -aaagagataca--aggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 37503722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 49918535 - 49918370
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49918535 aacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 49918439  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  49918438 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 49918370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 211
Target Start/End: Original strand, 28220210 - 28220374
Alignment:
Q  44 acaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 143  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28220210 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 28220305  T
Q  144 aaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  28220306 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 28220374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Original strand, 4552619 - 4552750
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4552619 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttctta 4552715  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt 176  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4552716 c-aaagggatacaaaggggttacaagaaattagctt 4552750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11348865 - 11348698
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||  |||    
T  11348865 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta-gaaagagatacaaatgggt 11348769  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-tctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11348768 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 11348698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Original strand, 13549001 - 13549168
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  13549001 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 13549097  T
Q  161 tacaagaaatta-gcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||| ||||||| | || ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  13549098 tacatgaaattaggtttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13549168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Original strand, 47255340 - 47255488
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  47255340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 47255437  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  47255438 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 47255488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3157050 - 3156885
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3157050 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 3156954  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  3156953 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 3156885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44455345 - 44455160
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44455345 aacaaacacaccaa-agatcgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 44455249  T
Q  143 aaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||  |||||||  | ||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  44455248 aaaa-agatacaaatgagttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44455160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Original strand, 13659318 - 13659418
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13659318 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 13659414  T
Q  142 caaa 145  Q
    ||||    
T  13659415 caaa 13659418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 50167157 - 50167343
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  50167157 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttttta 50167253  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  50167254 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataac-aaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaa 50167343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 34603740 - 34603596
Alignment:
Q  66 cacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--ggttac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| || |  ||||||    
T  34603740 cacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaa-tgagttcttacaaa-gagataaaaaatgggttac 34603644  T
Q  164 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  34603643 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 34603596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Original strand, 37033068 - 37033241
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  37033068 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatgcaaaa 37033165  T
Q  158 --ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
      | |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  37033166 tggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37033241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47115340 - 47115171
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--gg 159  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||| |  ||    
T  47115340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatc-aatgggtttttac-aaagagatacaaaatggg 47115243  T
Q  160 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-tctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  47115242 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 47115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Original strand, 45644351 - 45644523
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||      
T  45644351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 45644447  T
Q  158 g-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  45644448 gagttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaa 45644523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 176
Target Start/End: Original strand, 28223405 - 28223534
Alignment:
Q  44 acaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 143  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28223405 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 28223500  T
Q  144 aaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt 176  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  28223501 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 28223534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28242472 - 28242391
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 145  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28242472 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttacaaa 28242391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 193778 - 193666
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||  | ||    
T  193778 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattac-aaagagatacaaatgagt 193682  T
Q  161 tacaagaaattagctt 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  193681 tacaagaaattagctt 193666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19754664 - 19754494
Alignment:
Q  60 attgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagag 158  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |    
T  19754664 attgttgacccacttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatcg 19754568  T
Q  159 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  19754567 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaa 19754494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 46065104 - 46065004
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46065104 aaacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttctta 46065008  T
Q  142 caaa 145  Q
    ||||    
T  46065007 caaa 46065004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Original strand, 50169192 - 50169358
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  50169192 aaacaaacacaccaa-agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagtactta 50169288  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    | |||| |||||||  | |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  50169289 c-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 50169358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 3847103 - 3847212
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3847103 aaacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3847199  T
Q  142 caaaagggatacaa 155  Q
    | ||||||||||||    
T  3847200 c-aaagggatacaa 3847212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19752857 - 19752741
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  19752857 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 19752761  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt 176  Q
     |||||||||||||||||||    
T  19752760 cggttacaagaaattagctt 19752741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 211
Target Start/End: Original strand, 23555286 - 23555413
Alignment:
Q  82 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gac 179  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | |||| |||||||||| ||  ||    
T  23555286 aacttgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttataagaaattagtttcaac 23555382  T
Q  180 aagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  23555383 aagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 23555413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31659409 - 31659293
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||     
T  31659409 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttcttac-aaagagatacaaat 31659313  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt 176  Q
     |||||||||||||||||||    
T  31659312 gggttacaagaaattagctt 31659293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41361101 - 41360914
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||| ||||  ||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  41361101 aaacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtcc-aatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatc-aacgagttctta 41361004  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  41361003 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41360914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Original strand, 37559850 - 37560017
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactct-ggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  37559850 aacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaac-gagttctta 37559946  T
Q  142 caaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagctt--gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||| | |||||||  || |||||||||||||||||   |||||||||| | |||| ||| ||||||||||||    
T  37559947 caaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacc 37560017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1833667 - 1833522
Alignment:
Q  85 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagcttgacaag- 182  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||| ||||||| |  ||     
T  1833667 ttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaataga 1833570  T
Q  183 ttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  1833569 ttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 1833522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15820474 - 15820362
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 160  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  | ||    
T  15820474 tgtttacctagttcgatccaa-cttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatc-aatgagttctta-aaaagagatacaaatgtgt 15820378  T
Q  161 tacaagaaattagctt 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  15820377 tacaagaaattagctt 15820362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 36683866 - 36683766
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36683866 aaacaaacacaccaagagat-gtttactcagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatc-aatgagttctta 36683770  T
Q  142 caaa 145  Q
    ||||    
T  36683769 caaa 36683766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Original strand, 40122178 - 40122280
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac--tatcaaatgagttct 139  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  40122178 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaa-gagttct 40122274  T
Q  140 tacaaa 145  Q
    ||||||    
T  40122275 tacaaa 40122280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079322
Alignment:
Q  86 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 183  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||   |||| ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||     
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatc-aatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagc 22079363  T
Q  184 tcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctc 225  Q
    |||| | ||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||    
T  22079362 tcacaaagaacaaa-cataatttctaccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 211
Target Start/End: Original strand, 196904 - 197056
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaag 156  Q
    |||||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  196904 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaa 197000  T
Q  157 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
     | |||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  197001 tgagttacaagaaattaacttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 197056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 37876767 - 37876848
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 145  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37876767 tgttcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttattacaaa 37876848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 30476429 - 30476614
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||  | ||| | ||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30476429 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtcc-aacttaacctcatatggggtagagattgatctgtccaatccagtatc-aatgagttcttac 30476525  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct-ctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||| ||||| ||  |||||||| |||||| |||  |||||||||  | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30476526 -aaagagatacaaatgggttacaataaattatcttcaacaagttcataaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 30476614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 145
Target Start/End: Original strand, 13137973 - 13138058
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 145  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13137973 agattgttgacccagttcggtccaatat-gacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatc-aatgtgttcttacaaa 13138058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16455807 - 16455676
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||  |||| |||||||  |||||| ||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16455807 aaacaaatacaccaagaaat-gtttacacagtttggtccaat-ttgaccgactatgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 16455711  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt 176  Q
    | | || ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  16455710 c-acagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 16455676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 37879005 - 37879079
Alignment:
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct-ctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37879005 aggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 37879079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 2926679 - 2926613
Alignment:
Q  60 attgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccacta 126  Q
    |||||| |||||||||||| |||   |||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||    
T  2926679 attgtttacctagttcggtgcaacaatgacctactctgcagaagagattgatctctccaatccacta 2926613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Original strand, 927996 - 928123
Alignment:
Q  82 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagcttga-c 179  Q
    ||||||||||||  ||| | |||| |||  ||||| |||||||||| || |||||| ||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||| | |    
T  927996 aacttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaa-tgagtttttacaaa-gagatccaaaagggttacaagaaattagcttcaac 928093  T
Q  180 aagttcactatgaacaaaccctaatttcta 209  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  928094 aagctcacaaagaacaaaccctaatttcta 928123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6808595 - 6808507
Alignment:
Q  88 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt 176  Q
    ||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||| || |||||||||| |||||||    
T  6808595 acctactctgaggaagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagctt 6808507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 106
Target Start/End: Original strand, 6995702 - 6995746
Alignment:
Q  61 ttgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6995702 ttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 6995746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 130
Target Start/End: Original strand, 8871074 - 8871130
Alignment:
Q  73 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 130  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8871074 ttcggtccaa-cttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 8871130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32737009 - 32736953
Alignment:
Q  154 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  32737009 aagaggttacaaaaaattagcttaa-aagttcataaagaacaaaccctaatttctacc 32736953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 211
Target Start/End: Original strand, 37282699 - 37282841
Alignment:
Q  69 ctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttacaaga 167  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||   |||| ||| ||| | |||||| | |    
T  37282699 ctagttcagtccaaa-ttgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccacta-ctaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccata 37282796  T
Q  168 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||| ||||    
T  37282797 aattagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttatacc 37282841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Original strand, 2556 - 2865
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2556 cacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 2655  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2656 ctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 2755  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2756 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 2853  T
Q  313 agagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||    
T  2854 agagcttcccct 2865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25690171 - 25689865
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtac 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25690171 cacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtac 25690072  T
Q  113 tctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25690071 tctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacct 25689973  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689972 ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 25689873  T
Q  313 agagcttc 320  Q
    ||||||||    
T  25689872 agagcttc 25689865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3439719 - 3439418
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439719 cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 3439620  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||      
T  3439619 ctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgccaagttcataatgaacaaaccctaatttctaccct 3439521  T
Q  214 tttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439520 tttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 3439421  T
Q  314 gag 316  Q
    |||    
T  3439420 gag 3439418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 324
Target Start/End: Original strand, 42575273 - 42575586
Alignment:
Q  12 aaacacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgt 110  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42575273 aaacacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgt 42575372  T
Q  111 actctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  42575373 actctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttct 42575472  T
Q  209 acctctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaa 308  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42575473 acccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaa 42575570  T
Q  309 ccctagagcttcccct 324  Q
    ||||||||||| ||||    
T  42575571 ccctagagctttccct 42575586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15290740 - 15290430
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15290740 cacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtact 15290641  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290640 ctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 15290541  T
Q  212 tctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccc 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15290540 cctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccc 15290443  T
Q  312 tagagcttcccct 324  Q
    |||||||| ||||    
T  15290442 tagagctttccct 15290430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15471109 - 15470799
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15471109 cacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtact 15471010  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471009 ctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 15470910  T
Q  212 tctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccc 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15470909 cctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccc 15470812  T
Q  312 tagagcttcccct 324  Q
    |||||||| ||||    
T  15470811 tagagctttccct 15470799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2627951 - 2627649
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2627951 cacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactc 2627852  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |   ||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2627851 tccaatccactatc-aatgagttcttacacaagagatacaaaaagagttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacc 2627754  T
Q  212 tctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacc 310  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  2627753 cttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaacc 2627655  T
Q  311 ctagag 316  Q
    ||||||    
T  2627654 ctagag 2627649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44304042 - 44303764
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44304042 aaacaaacacaccaa-agattgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 44303945  T
Q  142 caaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc---tctttcccaatctcac-------ca 229  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||   | ||||||||||||||       ||    
T  44303944 -aaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaaca 44303847  T
Q  230 agacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44303846 agacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 44303764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17982840 - 17982563
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  17982840 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 17982744  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcac-------caa 230  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||       |||    
T  17982743 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaa 17982645  T
Q  231 gacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17982644 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 17982563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31218444 - 31218167
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  31218444 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatc-aatgagttctt- 31218348  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcac-------caa 230  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||       |||    
T  31218347 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaa 31218249  T
Q  231 gacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31218248 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 31218167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 34254312 - 34254586
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34254312 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttctta 34254409  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac-------caaga 232  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  34254410 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaaga 34254507  T
Q  233 cactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||| ||| || ||   |||||||||| | |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34254508 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtctccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 34254586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 34256488 - 34256762
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34256488 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 34256585  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac-------caaga 232  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||       |||||    
T  34256586 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaatgaacaaga 34256683  T
Q  233 cactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||| ||| || |    |||||||||| | |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34256684 cactcaatgattttcacacaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagata-actctaatcaaag-accctaaacccta 34256762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42498403 - 42498193
Alignment:
Q  18 aagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctcc 117  Q
    ||||||| |||||||  |||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  42498403 aagataaaaggagag--aagagggaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctcc 42498307  T
Q  118 aatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tc 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||  |     
T  42498306 aatccactatc-aatgagttcttac-aaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttt 42498210  T
Q  214 tttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  42498209 tttcccaatctcaccaa 42498193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 19945340 - 19945529
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  19945340 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 19945436  T
Q  142 caaaagggatac--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  19945437 ccaaagagatacaaaagtggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaa 19945529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 212
Target Start/End: Original strand, 1746200 - 1746367
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1746200 aaacaaacacaccaac-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 1746296  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
      |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  1746297 -caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacct 1746367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15212971 - 15212786
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15212971 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttcttac 15212875  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  15212874 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 15212786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Original strand, 42434992 - 42435139
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  42434992 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 42435088  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  42435089 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 42435139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 43036608 - 43036423
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43036608 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaa-tgagttcttac 43036512  T
Q  143 aaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacctcttt-cccaatctcaccaa 230  Q
    ||| | |||||||  |  |||||||||||||| || | ||||||||| | |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  43036511 aaa-gagatacaaatgaattacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43036423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Original strand, 1345353 - 1345484
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  1345353 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatc-aatgagttcttt 1345449  T
Q  142 caaaagggataca-agaggttacaagaaattagctt 176  Q
    | |||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  1345450 c-aaagagatacatatgggttacaagaaattagctt 1345484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4283691 - 4283524
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  4283691 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 4283595  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  4283594 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 157
Target Start/End: Original strand, 4743196 - 4743308
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4743196 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 4743292  T
Q  142 caaaagggatacaaga 157  Q
    |||| ||| |||||||    
T  4743293 caaatgggttacaaga 4743308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33352321 - 33352150
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  33352321 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 33352225  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  33352224 gggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 33352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40321251 - 40321082
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||     
T  40321251 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagtttttac-aaagagatactaat 40321155  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcacc 228  Q
     ||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  40321154 gggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 40321082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 3303652 - 3303838
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3303652 aaacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctta 3303748  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| |||||||  | ||||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  3303749 c-aaagagatacaaatgagttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 3303838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 211
Target Start/End: Original strand, 12702631 - 12702782
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || |||| |    
T  12702631 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttcttac-aaagagacacaaaa 12702727  T
Q  158 -ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12702728 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12702782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18655567 - 18655455
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  18655567 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 18655471  T
Q  161 tacaagaaattagctt 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  18655470 tacaagaaattagctt 18655455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27811449 - 27811278
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||     
T  27811449 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgggttcttac-aaagagatacaaat 27811353  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  27811352 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27811278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5689442 - 5689326
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  5689442 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 5689346  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt 176  Q
     |||||||||||||||||||    
T  5689345 gggttacaagaaattagctt 5689326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 145
Target Start/End: Original strand, 10930188 - 10930281
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 145  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10930188 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgtgttcttacaaa 10930281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328782
Alignment:
Q  88 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagtt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |   ||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagct 40328825  T
Q  185 cactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcac 227  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  40328824 cacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 40328782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6599143 - 6599027
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||     
T  6599143 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-gtatacaaat 6599047  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt 176  Q
     |||||||||||||||||||    
T  6599046 gggttacaagaaattagctt 6599027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6674596 - 6674480
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||     
T  6674596 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-gtatacaaat 6674500  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt 176  Q
     |||||||||||||||||||    
T  6674499 gggttacaagaaattagctt 6674480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 19491680 - 19491867
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||| ||||  ||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  19491680 aaacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtcc-aatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatc-aacgagttctta 19491777  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  19491778 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 19491867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 30143488 - 30143360
Alignment:
Q  82 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gac 179  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  30143488 aacttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 30143391  T
Q  180 aagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  30143390 aagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 30143360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 40221916 - 40221765
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    ||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| ||     
T  40221916 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaat 40221820  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
     |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  40221819 gggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 40221765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Original strand, 41366612 - 41366727
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    ||||||||  || |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||     
T  41366612 agattgttgtcccagttcggtccaa-cttgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttac-aaagggatacaaat 41366707  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt 176  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  41366708 aggttaaaagaaattagctt 41366727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4731843 - 4731658
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4731843 aacaaacacaccaa-agattgttgacccaattcggtccaa-cttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 4731747  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | || | |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  4731746 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagc-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4731658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Original strand, 8965692 - 8965859
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg-t 160  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||||| || ||||||||| |||||||||||||| | |||| || ||| |    
T  8965692 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatataaaagggt 8965788  T
Q  161 tacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    || ||||||||| ||| | |||  |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8965789 tataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 8965859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18141968 - 18141841
Alignment:
Q  82 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gac 179  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  18141968 aacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 18141871  T
Q  180 aagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||| |||| | ||||||  |||||||||||||    
T  18141870 aagctcacaaagaacaa--cctaatttctacc 18141841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 30291794 - 30291626
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 140  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |   |||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||    
T  30291794 aaacaaacacaccaa-agattgttgattcagttcggtccaa-cttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gaattctt 30291698  T
Q  141 acaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    || |||| |||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  30291697 ac-aaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacc 30291626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11384152 - 11384040
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||  | ||    
T  11384152 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatc-aatgggttcttac-aaagagatacaaatgagt 11384056  T
Q  161 tacaagaaattagctt 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  11384055 tacaagaaattagctt 11384040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4733891 - 4733792
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4733891 aacaaacacaccaa-agactgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgaattcttac 4733795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9765863 - 9765745
Alignment:
Q  112 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  9765863 ctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 9765767  T
Q  210 -cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     ||  |||||||||||||||||    
T  9765766 cccattttcccaatctcaccaa 9765745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10015265 - 10015136
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||||||||||||| ||  || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  10015265 aaacaaatacaccaagaaatgatt-acccagttcggtccaa-cttgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatc-aatgagttcct- 10015171  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt 176  Q
     ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  10015170 -aaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 10015136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Original strand, 1292446 - 1292576
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||||| || |||  || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1292446 aaacaaacacaccaagaaat-gtttgcccagttcggtccaa-cttgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaa-tgagttctta 1292541  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt 176  Q
    |||| | |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  1292542 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagctt 1292576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353796
Alignment:
Q  100 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaa 197  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aa 44353827  T
Q  198 ccctaatttcta-cctctttcccaatctcac 227  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  44353826 ccctaatttctacccattttcccaatctcac 44353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4162652 - 4162552
Alignment:
Q  73 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaatt 171  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||||    
T  4162652 ttcggtccaa-cttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaatt 4162557  T
Q  172 agctt 176  Q
    |||||    
T  4162556 agctt 4162552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8153914 - 8153844
Alignment:
Q  73 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8153914 ttcggtccaa-cttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatc-aatgagttcttacaaa 8153844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 176
Target Start/End: Original strand, 18106091 - 18106191
Alignment:
Q  71 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||    
T  18106091 agttcggtccaa-cttgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaa-tgagttcttacaaaa--gatacaaatgagttacaagaaa 18106184  T
Q  170 ttagctt 176  Q
    |||||||    
T  18106185 ttagctt 18106191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 7597759 - 7597715
Alignment:
Q  86 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 130  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7597759 tgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 7597715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8395807 - 8395511
Alignment:
Q  27 ggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395807 ggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 8395708  T
Q  126 atcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8395707 atcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 8395608  T
Q  226 accaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395607 accaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 8395511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8393598 - 8393302
Alignment:
Q  27 ggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393598 ggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 8393499  T
Q  126 atcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8393498 atcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 8393399  T
Q  226 accaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8393398 accaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccataaaccctagagcttcccct 8393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7125103 - 7124807
Alignment:
Q  30 gagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125103 gagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc 7125004  T
Q  129 aaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac 227  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7125003 aaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac 7124904  T
Q  228 caagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124903 caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 7124807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5138512 - 5138196
Alignment:
Q  11 aaaacacaagataag--aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagat 107  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5138512 aaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtt 5138413  T
Q  108 tgtactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5138412 tgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatt 5138313  T
Q  206 tctacctctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccct 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138312 tctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtatttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccct 5138215  T
Q  306 aaaccctagagcttcccct 324  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5138214 aaaccctagagcttcccct 5138196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7122884 - 7122588
Alignment:
Q  30 gagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122884 gagggaagaagaaaacaataaacacaaagaaattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatc 7122785  T
Q  129 aaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac 227  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7122784 aaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac 7122685  T
Q  228 caagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122684 caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccct 7122588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5136287 - 5135970
Alignment:
Q  11 aaaacacaagataag--aggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagat 107  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5136287 aaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtt 5136188  T
Q  108 tgtactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5136187 tgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatt 5136088  T
Q  206 tctacctctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136087 tctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtatttcccatgtttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccc 5135990  T
Q  305 taaaccctagagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5135989 taaaccctagagcttcccct 5135970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 31495274 - 31495556
Alignment:
Q  20 gataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaa 119  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31495274 gataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaa 31495373  T
Q  120 tccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctcttt 216  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||  |||    
T  31495374 tcaactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aatcctaatttctaccctttt 31495471  T
Q  217 cccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  31495472 cccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaaga 31495556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Original strand, 13992274 - 13992544
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13992274 aaacaaacacaccaa-agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 13992371  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcaccaagacactc 237  Q
    |  ||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  13992372 c--aagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagacactc 13992468  T
Q  238 aataattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    ||| ||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13992469 aatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaacccta 13992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 313
Target Start/End: Original strand, 29999806 - 30000063
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||    
T  29999806 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagt 29999904  T
Q  161 tacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcac-------caagacactcaataattctctcttt 252  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||  ||| || ||      
T  29999905 tacaagaaattagctttgacatgttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactca 30000003  T
Q  253 acaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
     |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30000004 ccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 30000063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 56178618 - 56178805
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56178618 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 56178715  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  56178716 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 56178805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 48143230 - 48143042
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48143230 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 48143133  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcaccaa 230  Q
       ||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  48143132 -tgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 48143042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 216
Target Start/End: Original strand, 5370079 - 5370237
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  5370079 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaa 5370176  T
Q  158 -ggttacaagaaattagc--ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctcttt 216  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  5370177 gggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctcttt 5370237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 52095344 - 52095530
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  52095344 aaacaaacacaccaaaa-attgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gatttctta 52095440  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  52095441 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 52095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2209894 - 2209733
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  2209894 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 2209797  T
Q  150 atacaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||| |||||||||||||||||    
T  2209796 atacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacc 2209733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12119719 - 12119540
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |    
T  12119719 acaccaagaaattgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttctttacaaagag 12119622  T
Q  150 atacaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ctctttcccaatctcacc 228  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  12119621 atacaaaagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacc 12119540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Original strand, 12743908 - 12744074
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12743908 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 12744004  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
     |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  12744005 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacct 12744074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Original strand, 12745297 - 12745463
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12745297 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 12745393  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
     |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  12745394 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacct 12745463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Original strand, 50673848 - 50673960
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||    
T  50673848 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 50673944  T
Q  161 tacaagaaattagctt 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  50673945 tacaagaaattagctt 50673960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 9927441 - 9927626
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9927441 aacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 9927537  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  9927538 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 9927626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 12739533 - 12739718
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  12739533 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcatac 12739629  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||  ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12739630 -aaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12739718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 34570397 - 34570582
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34570397 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcgatccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 34570493  T
Q  143 aaaagggatacaa-gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct-ctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||| |||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34570494 -aaagagatacaattgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 34570582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964435
Alignment:
Q  65 tcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--ggtta 162  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaaatgggtta 41964484  T
Q  163 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  41964483 caataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 41964435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 46703669 - 46703500
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga--gg 159  Q
    |||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |  ||    
T  46703669 tgttcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttac-aaagagatacaaaatggg 46703572  T
Q  160 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  46703571 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 46703500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 47038393 - 47038577
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  47038393 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtcctta 47038489  T
Q  142 caaaagggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||  |||||||  | |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  47038490 c-aaacagatacaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccaatctcaccaa 47038577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12073560 - 12073392
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 160  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||    
T  12073560 tgttcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 12073463  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12073462 tacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 12073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26364415 - 26364236
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 149  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |    
T  26364415 acaccaagaaattgttgacccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-taatgagttcttac-aaagag 26364319  T
Q  150 atacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  26364318 atacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26364236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Original strand, 37229722 - 37229890
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa-agggatacaagaggt 160  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||  |||    
T  37229722 tgtttacctagttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaagagatataaaaagggt 37229819  T
Q  161 tacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||| ||||| |||| | |||| |||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37229820 tacaacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 37229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6656123 - 6655976
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 160  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||    
T  6656123 tgttcacccaattcggtccaa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 6656027  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||| |||||||||||    
T  6656026 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctacc 6655976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8665571 - 8665463
Alignment:
Q  66 cacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttaca 164  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||    
T  8665571 cacctagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttaca 8665475  T
Q  165 agaaattagctt 176  Q
    ||||||||||||    
T  8665474 agaaattagctt 8665463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Original strand, 36463386 - 36463557
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||| ||     
T  36463386 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaat 36463482  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36463483 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-agccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 36463557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Original strand, 46147373 - 46147539
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46147373 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaa-gagttctta 46147469  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    | |||| |||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  46147470 c-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 46147539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Original strand, 48893620 - 48893751
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48893620 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 48893716  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt 176  Q
    | |||| |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  48893717 c-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 48893751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 176
Target Start/End: Original strand, 50262689 - 50262814
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  50262689 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatc-aatgagttcttac-aaagag 50262786  T
Q  150 atac-aagaggttacaagaaattagctt 176  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  50262787 atacaaatgggttacaagaaattagctt 50262814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 54883199 - 54883020
Alignment:
Q  50 acaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 149  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  54883199 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 54883103  T
Q  150 atac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  54883102 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54883020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 26175619 - 26175804
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26175619 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 26175715  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttct-acctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  26175716 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaa 26175804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 6542161 - 6542349
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6542161 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttctta 6542257  T
Q  142 caaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  6542258 c-aaagagatacaaaaggctaacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctaccattttttcccaatctccccaa 6542349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 379548 - 379400
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  379548 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aattagttcttac-aaagcgatacaaatgggt 379451  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  379450 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacc 379400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8648306 - 8648139
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  8648306 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 8648210  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    || |||||||||||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  8648209 tataagaaattagcttcaacaaactcacaatgaac-aaccctaatttctatccattttcccattctcaccaa 8648139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40632612 - 40632445
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| || ||||    
T  40632612 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggt 40632516  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  40632515 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40632445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 41639593 - 41639446
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||||| ||  |||    
T  41639593 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-gatgagttcttac-aaatagatacaaatgggt 41639497  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  41639496 tacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 41639446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 45687164 - 45687351
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45687164 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaa-tgagttctta 45687260  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctcttt-cccaatctcaccaa 230  Q
    ||||  | ||||||  | |||| ||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  45687261 caaatag-atacaaatgagttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaa 45687351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37740783 - 37740625
Alignment:
Q  71 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  37740783 agttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaa 37740687  T
Q  170 ttagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  37740686 ttagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 37740625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36994693 - 36994524
Alignment:
Q  60 attgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagag 158  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  |    
T  36994693 attgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgg 36994597  T
Q  159 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36994596 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36994524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 211
Target Start/End: Original strand, 5207865 - 5207991
Alignment:
Q  85 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa-agggatacaagaggttacaagaaattagctt-gacaag 182  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||| ||||||||||  |||||    
T  5207865 ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttcttacaaatagatatacaag-ggttgcaataaattagcttcaacaag 5207962  T
Q  183 ttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5207963 ttcacaaagaacaaaccctaatttctacc 5207991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4588107 - 4587958
Alignment:
Q  82 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagctt-gac 179  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||  ||    
T  4588107 aacttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaac 4588010  T
Q  180 aagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-tctttcccaatctcaccaa 230  Q
    ||| | || | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  4588009 aagcttacaaagaacaaatcttaatttctaccttttttcccaatttcaccaa 4587958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5429850 - 5429679
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| ||     
T  5429850 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaatagatacaaat 5429754  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  5429753 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaa-taaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 5429679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Original strand, 27416962 - 27417133
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aag 156  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||     
T  27416962 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac-aaagagatacaaat 27417058  T
Q  157 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  27417059 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaa 27417133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35662599 - 35662496
Alignment:
Q  71 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||    
T  35662599 agttcggtccaa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaa 35662503  T
Q  170 ttagctt 176  Q
    |||||||    
T  35662502 ttagctt 35662496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 211
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744195
Alignment:
Q  102 agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaacc 199  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aacc 12744183  T
Q  200 ctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||    
T  12744184 ctaatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31474337 - 31474206
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31474337 aaacaaacacaccaagatat-gtttacccagttcggtccaa-cttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaa-tgagttctta 31474241  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagctt 176  Q
    |||| | |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  31474240 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagctt 31474206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Original strand, 52467336 - 52467502
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  52467336 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-aagttatta 52467432  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  52467433 c-aaagtgatacaaatgggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacc 52467502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Original strand, 54199926 - 54200074
Alignment:
Q  82 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gac 179  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  54199926 aacttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 54200023  T
Q  180 aagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  54200024 aagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54200074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 230
Target Start/End: Original strand, 12747794 - 12747924
Alignment:
Q  100 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaa 197  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||    
T  12747794 ggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcatacaaatag-atacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aa 12747890  T
Q  198 ccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12747891 ccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12747924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5872003 - 5871906
Alignment:
Q  45 caaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaa 144  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  5872003 caaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaa-gagttcttgcaa 5871907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 211
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745584
Alignment:
Q  102 agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaacc 199  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aacc 12745572  T
Q  200 ctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||    
T  12745573 ctaatttctacc 12745584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Original strand, 26699451 - 26699585
Alignment:
Q  71 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaagaaa 169  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||   |||| ||||||| || |||||||||||    
T  26699451 agttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaa 26699549  T
Q  170 ttagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaat 204  Q
    |||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  26699550 ttagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaat 26699585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29254679 - 29254580
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29254679 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac 29254583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Original strand, 13009464 - 13009535
Alignment:
Q  82 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaa 155  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13009464 aacttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaa 13009535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 52082645 - 52082825
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |       |||||||||||| || ||||||    
T  52082645 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatc-------tccactatcaaa-gatttctta 52082735  T
Q  142 caaaagggatac-aagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| ||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  52082736 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 52082825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989899
Alignment:
Q  86 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagagg-ttacaagaaattagctt 176  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||| ||   |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactat-taacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctt 33989899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3913578 - 3913534
Alignment:
Q  100 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 145  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3913578 ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 3913534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089970
Alignment:
Q  88 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctt 33089970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Original strand, 3678 - 3987
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtact 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3678 cacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaact 3777  T
Q  114 ctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3778 ctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 3877  T
Q  213 ctttcccaatctcaccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878 ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccct 3975  T
Q  313 agagcttcccct 324  Q
    ||||||||||||    
T  3976 agagcttcccct 3987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6477 - 6188
Alignment:
Q  26 aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 125  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6477 aggagagggaagaagaaaacaataacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccact 6378  T
Q  126 atcaaatgagttctt-acaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacctctttcccaatct 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6377 atcaaatgagttctttacaaaagggatacaagggcttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatct 6278  T
Q  225 caccaagacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6277 caccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 11115 - 11333
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11115 cacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactc 11213  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc- 211  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||     
T  11214 tccaatccactatc-aacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 11311  T
Q  212 -tctttcccaatctcaccaaga 232  Q
     | | |||||||||||||||||    
T  11312 ttttctcccaatctcaccaaga 11333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 8689 - 8907
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactc 114  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8689 cacaagataaaagaagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactc 8787  T
Q  115 tccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc- 211  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  || | |||||||| | |||| ||||||||||||||||     
T  8788 tccaatccactatc-aacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttataagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 8885  T
Q  212 -tctttcccaatctcaccaaga 232  Q
     | | |||||||||||||||||    
T  8886 ttttctcccaatctcaccaaga 8907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11745 - 11557
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11745 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 11647  T
Q  142 caaaagggatacaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-tctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11646 c-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 434720 - 434443
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  434720 aaacaaacacaccaa-atattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 434623  T
Q  142 caaaagggatacaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcac-------caa 230  Q
    | |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | || |||||||||||       |||    
T  434622 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaa 434525  T
Q  231 gacactcaataattctctctttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
    |||||||||| ||| || ||   |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  434524 gacactcaatgattttcactcaccaaggtatttaccatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 434443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1087 - 827
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||   |||| ||||||| |    
T  1087 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttgtt--caaagagatacaaaa 991  T
Q  158 -ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--tctttcccaatctcac------caagacactcaataattctc 247  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||      ||||||||||||| ||| ||    
T  990 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttc 892  T
Q  248 tctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 313  Q
     ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  891 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 114774 - 114602
Alignment:
Q  58 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga 157  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  114774 agattgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaa 114677  T
Q  158 g-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cctctttcccaatctcaccaa 230  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  114676 gcgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 114602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Original strand, 18004 - 18151
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gt 160  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||  | ||    
T  18004 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-ttac-aaagagatacaaatgagt 18100  T
Q  161 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 211  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18101 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 18151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Original strand, 149079 - 149179
Alignment:
Q  42 aaacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  149079 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 149175  T
Q  142 caaa 145  Q
    ||||    
T  149176 caaa 149179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 20398 - 20583
Alignment:
Q  43 aacaaatacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 142  Q
    |||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20398 aacaaacacaccaaaa-attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaa-gagttcttac 20494  T
Q  143 aaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ctctttcccaatctcaccaa 230  Q
     |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  20495 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaa-cctaatttctgctcattttcccaatctcaccaa 20583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 81 - 1
Alignment:
Q  15 cacaagataagaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctact 94  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  81 cacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7494 - 7382
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||    
T  7494 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 7398  T
Q  161 tacaagaaattagctt 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  7397 tacaagaaattagctt 7382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10656 - 10546
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaga-ggt 160  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| | |||    
T  10656 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaaatggt 10560  T
Q  161 tacaagaaattagc 174  Q
    ||||| ||||||||    
T  10559 tacaataaattagc 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 130
Target Start/End: Original strand, 27442 - 27510
Alignment:
Q  62 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27442 tgtttacctaattcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 27510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University