View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF14713_high_6 (Length: 619)
Name: NF14713_high_6
Description: NF14713
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF14713_high_6 |
 | |
|
| [»] scaffold0257 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 503; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 8697899 - 8697318
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
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| T |
8697899 |
aggacaaactagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
8697800 |
T |
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| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
216 |
Q |
| |
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|
| T |
8697799 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatatatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
8697700 |
T |
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| Q |
217 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaannnnnnnncaacttgtcttatcatgtttcggttctcaannnnnnnnncaactcaattgaaaaacttcc |
316 |
Q |
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| T |
8697699 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaattttttttcaacttctcttatcatgcttcggttatcaatttttttttaaactcaattgaaaaacttcc |
8697600 |
T |
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| Q |
317 |
ctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttttcccaacattttttcaaaaacacttataatttcactat |
416 |
Q |
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| T |
8697599 |
ctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttttcccaacattttttcaaaaacacttataatttcactat |
8697500 |
T |
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| Q |
417 |
atataagagttaggtactcatttatcaaatttatattattcatgaagaacaaaattttgctatggatctcaatgcttttccatttgatttaaatgaagaa |
516 |
Q |
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| T |
8697499 |
atataagagttaggtactcatttatcaaatttatattattcatgaagaacaaaattttgctatggatctcaatgcttttccatttgatttaaatgaagaa |
8697400 |
T |
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| Q |
517 |
ccattgtttgatttaaatgaagagccactgtttgatttaaatcaagatctacatgatttaaatggtgaggaagaaaactttg |
598 |
Q |
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|
|
| T |
8697399 |
ccattgtttgatttaaatgaagagccactgtttgatttaaatcaagatctacatgatttaaatggtgaggaagaaaactttg |
8697318 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 297 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 41307720 - 41307419
Alignment:
| Q |
297 |
aactcaattgaaaaacttccctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttttcccaacattttttcaaa |
396 |
Q |
| |
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| T |
41307720 |
aactcaattgaaaaacttccctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttttcccaacattttttcaaa |
41307621 |
T |
|
| Q |
397 |
aacacttataatttcactatatataagagttaggtactcatttatcaaatttatattattcatgaagaacaaaattttgctatggatctcaatgcttttc |
496 |
Q |
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| T |
41307620 |
aacacttataatttcactatatataagagttaggtactcatttatcaaatttatattattcatgaagaacaaaattttgctatggatctcaatgcttttc |
41307521 |
T |
|
| Q |
497 |
catttgatttaaatgaagaaccattgtttgatttaaatgaagagccactgtttgatttaaatcaagatctacatgatttaaatggtgaggaagaaaactt |
596 |
Q |
| |
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|
| T |
41307520 |
catttgatttaaatgaagaaccattgtttgatttaaatgaagagccactgtttgatttaaatcaagatctacatgatttaaatggtgaggaagaaaactt |
41307421 |
T |
|
| Q |
597 |
tg |
598 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
41307420 |
tg |
41307419 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 17 - 380
Target Start/End: Original strand, 10646644 - 10647007
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
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|
|
| T |
10646644 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
10646743 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
216 |
Q |
| |
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|
|
| T |
10646744 |
aataccaaaattaattaaattgaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
10646843 |
T |
|
| Q |
217 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaannnnnnnncaacttgtcttatcatgtttcggttctcaannnnnnnnncaactcaattgaaaaacttcc |
316 |
Q |
| |
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| T |
10646844 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaattttttttcaacttctcttatcatgcttcggttatcaatttttttttaaactcaattgaaaaacttcc |
10646943 |
T |
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| Q |
317 |
ctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttttc |
380 |
Q |
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|
|
| T |
10646944 |
ctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttttc |
10647007 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45278702 - 45278341
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
45278702 |
aggacaagctaatttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
45278603 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
216 |
Q |
| |
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|
|
| T |
45278602 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatattggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttactgc |
45278503 |
T |
|
| Q |
217 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaannnnnnnncaacttgtcttatcatgtttcggttctcaannnnnnnnncaactcaattgaaaaacttcc |
316 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
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| T |
45278502 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatataattttttttcaacttctcttatcatgcttcggttatcaatttttttttaaactcaattgaaaaacttcc |
45278403 |
T |
|
| Q |
317 |
ctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttt |
378 |
Q |
| |
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|
|
| T |
45278402 |
ctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttcccaccaaagttaaattaaaatttgtttt |
45278341 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40486454 - 40486098
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
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|
|
| T |
40486454 |
aggacaagctaatttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
40486355 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
40486354 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgc--- |
40486258 |
T |
|
| Q |
217 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaannnnnnnncaacttgtcttatcatgtttcggttctcaannnnnnnnncaactcaattgaaaaacttcc |
316 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
40486257 |
--ttatgtattgaaaatagcatgccaatacaattttttttcaacttctcttatcatgcttcggttatcaatttttttttaaactcaattgaaaaacttcc |
40486160 |
T |
|
| Q |
317 |
ctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttt |
378 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40486159 |
ctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttt |
40486098 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41307962 - 41307731
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41307962 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
41307863 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
216 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41307862 |
aatatcaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactgacaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
41307763 |
T |
|
| Q |
217 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaa |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41307762 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaa |
41307731 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 494; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 601
Target Start/End: Original strand, 9588722 - 9589306
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9588722 |
aggacaatctattttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgattttctccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
9588821 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9588822 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
9588921 |
T |
|
| Q |
217 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaannnnnnnncaacttgtcttatcatgtttcggttctcaannnnnnnnncaactcaattgaaaaacttcc |
316 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9588922 |
ggttatatattgaaaatagcatgccaatacaattttttttcaacttctcttatcatgcttcggttatcaatttttttttaaactcaattgaaaaacttcc |
9589021 |
T |
|
| Q |
317 |
ctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttttcccaacattttttcaaaaacacttataatttcactat |
416 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9589022 |
ctccaaaatttatactttaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttttcccaacattttttcaaaaacacttataatttcactat |
9589121 |
T |
|
| Q |
417 |
atataagagttaggtactcatttatcaaatttatattattcatgaagaacaaaattttgctatggatctcaatgcttttccatttgatttaaatgaagaa |
516 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9589122 |
atataagagttaggtactcatttatcaaatttatattattcatgaagaacaaaattttgctatggatctcaatgcttttccatttgatttaaatgaagaa |
9589221 |
T |
|
| Q |
517 |
ccattgtttgatttaaatgaagagccactgtttgatttaaatcaagatctacatgatttaaatggtgaggaagaaaactttgcta |
601 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9589222 |
ccattgtttgatttaaatgaagagccactgtttgatttaaatcaagatctacatgatttaaatggtgaggaagaaaactttgcta |
9589306 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 3943112 - 3943473
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3943112 |
aggacaagctaatttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
3943211 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3943212 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttactgc |
3943311 |
T |
|
| Q |
217 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaannnnnnnncaacttgtcttatcatgtttcggttctcaannnnnnnnncaactcaattgaaaaacttcc |
316 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3943312 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatataattttttttcaacttctcttatcatgcttcggttatcaatttttttttaaactcaattgaaaaacttcc |
3943411 |
T |
|
| Q |
317 |
ctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttt |
378 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3943412 |
ctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttcccaccaaagttaaattaaaatttgtttt |
3943473 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13984992 - 13984761
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13984992 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
13984893 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13984892 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgttgt |
13984793 |
T |
|
| Q |
217 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaa |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13984792 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaa |
13984761 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 41959130 - 41959276
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41959130 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcatattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
41959229 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacata |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41959230 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacata |
41959276 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44228229 - 44228068
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
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| T |
44228229 |
aggacaagctagct-gacataaaagttcctattatacccttgttttttatttccttcattttacatttatttaccccatctaataatcacttccaatacc |
44228131 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatac |
179 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
44228130 |
aataccaaatttaattaaagtcaatcaaatggcaataccaatacataccggcaataccgatac |
44228068 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Original strand, 1168413 - 1168499
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataatta |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
1168413 |
aggacaagctattttgacacaaaagttcatagtttacccttgtctttgatttcctccatttt--atttatttaccccgtctcataatta |
1168499 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Original strand, 41959262 - 41959299
Alignment:
| Q |
168 |
caataccaatacatatggttcatctagtaaatcacatt |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41959262 |
caataccaatacatatggttcatctagtaaatcacatt |
41959299 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 569
Target Start/End: Original strand, 40931677 - 40932223
Alignment:
| Q |
20 |
acaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaataccaat |
119 |
Q |
| |
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|
|
| T |
40931677 |
acaagctagattaacacaaaagttcctattatactcttgtctttgatttcctccattttatgtttatttaccccatctcatagttactcccaataccaat |
40931776 |
T |
|
| Q |
120 |
accaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgcggt |
219 |
Q |
| |
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| T |
40931777 |
accaaaattaattaaagtcaat-atccttcaataccgatacatagtgacaataccaatacatacggttcatctagtaaatca-attgtttttgctgcggt |
40931874 |
T |
|
| Q |
220 |
tatgtattgaaaatagcatgccaatacaannnnnnnncaacttgtcttatcatgtttcggttctcaannnnnnnnncaactcaattgaaaaacttccctc |
319 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
40931875 |
tatgtattaaaaatagcatgccatcacaattttttttcaacttctcttatcatgcttcggttatcaatttttttttaaaatcaattgaaaaacttccctc |
40931974 |
T |
|
| Q |
320 |
caaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttttcccaacattttttcaaaaacacttataatttcactatata |
419 |
Q |
| |
|
|| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
40931975 |
cattatttatatt-taatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttttcccaccattttctcaaaaacgcttataatttcactatata |
40932073 |
T |
|
| Q |
420 |
taagagttaggtactcatttatcaaatttatattattcatgaagaacaaaattttgctatggatctcaatgcttttccatttgatttaaatgaagaacca |
519 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
40932074 |
taagagttaggtacttatttatcaaatttatattattaatgaagaacaaaattttgctatggatctcaatgcttttccatttgatttaaatgaagaacca |
40932173 |
T |
|
| Q |
520 |
ttgtttgatttaaatgaagagccactgtttgatttaaatcaagatctaca |
569 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40932174 |
ttgtttgatttaaatgaagagccaccgttggatttaaatcaagaactaca |
40932223 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 17 - 426
Target Start/End: Original strand, 12094634 - 12095043
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12094634 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctctattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
12094733 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
12094734 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacataccgacaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttattgc |
12094833 |
T |
|
| Q |
217 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaannnnnnnncaacttgtcttatcatgtttcggttctcaannnnnnnnncaactcaattgaaaaacttcc |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| |
|
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| T |
12094834 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaattttttttcaacttctcttgtcatgcttcggttatcaatttttttttaaattcaattgaaaaacttcc |
12094933 |
T |
|
| Q |
317 |
ctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttttcccaacattttttcaaaaacacttataatttcactat |
416 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12094934 |
ctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttttcccaacattttttcaaaaacacttataatttcactat |
12095033 |
T |
|
| Q |
417 |
atataagagt |
426 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
12095034 |
atataagagt |
12095043 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 44277456 - 44277187
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44277456 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgattttctccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
44277357 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44277356 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacatggtttttgctgc |
44277257 |
T |
|
| Q |
217 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaannnnnnnncaacttgtcttatcatgtttcggttctcaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
44277256 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatataattttttttcaacttctcttatcatgcttcggttatcaa |
44277187 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 408 - 601
Target Start/End: Original strand, 38805628 - 38805821
Alignment:
| Q |
408 |
tttcactatatataagagttaggtactcatttatcaaatttatattattcatgaagaacaaaattttgctatggatctcaatgcttttccatttgattta |
507 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38805628 |
tttcactatatataagagtcaggtactcatttatcaaatttatattattcatgaagaacaaaaatttgctatggatctcaatgcttttccatttgattta |
38805727 |
T |
|
| Q |
508 |
aatgaagaaccattgtttgatttaaatgaagagccactgtttgatttaaatcaagatctacatgatttaaatggtgaggaagaaaactttgcta |
601 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38805728 |
aatgaagaaccattgtttgatttaaatgaaaagccattgtttgatttaaatcaagatctacatgatttaaatggtgaggaagaaaactttgcta |
38805821 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 19911561 - 19911704
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19911561 |
aggacaagttagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttaccccacctcataattactcccaatacc |
19911660 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatac |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19911661 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatac |
19911704 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 19911693 - 19911831
Alignment:
| Q |
110 |
caataccaataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgttt |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19911693 |
caataccaataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctattaaatcacattgttt |
19911792 |
T |
|
| Q |
210 |
ttgctgcggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaa |
248 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19911793 |
ttgcttcggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaa |
19911831 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 414 - 594
Target Start/End: Original strand, 4236188 - 4236365
Alignment:
| Q |
414 |
tatatataagagttaggtactcatttatcaaatttatattattcatgaagaacaaaattttgctatggatctcaatgcttttccatttgatttaaatgaa |
513 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4236188 |
tatatataagagttagatactaatttatcaaatttatatta---atgtagaacaaaatttcgttgtggatctcaatgcttttccgcttgatttaaatgaa |
4236284 |
T |
|
| Q |
514 |
gaaccattgtttgatttaaatgaagagccactgtttgatttaaatcaagatctacatgatttaaatggtgaggaagaaaac |
594 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4236285 |
gaaccattgtttgatttaaatgaagagccgctatttgatttaaatcaagaactacatgatttaaatggtgaggaagaaaac |
4236365 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 158
Target Start/End: Original strand, 38805297 - 38805444
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactc------cc |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
38805297 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
38805396 |
T |
|
| Q |
111 |
aataccaataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaat |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38805397 |
aataccaataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaat |
38805444 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 414 - 594
Target Start/End: Original strand, 4227142 - 4227319
Alignment:
| Q |
414 |
tatatataagagttaggtactcatttatcaaatttatattattcatgaagaacaaaattttgctatggatctcaatgcttttccatttgatttaaatgaa |
513 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4227142 |
tatatacaagagttagatactaatttatcaaatttatatta---atgtagaacaaaatttcgttgcggatctcaatgcttttctgtttgatttaaatgaa |
4227238 |
T |
|
| Q |
514 |
gaaccattgtttgatttaaatgaagagccactgtttgatttaaatcaagatctacatgatttaaatggtgaggaagaaaac |
594 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4227239 |
gaaccattgtttgatttaaatgaagagccgctatttgatttaaatcaagaactacatgatttaaatggtgaggaagaaaac |
4227319 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 297 - 452
Target Start/End: Original strand, 4226992 - 4227146
Alignment:
| Q |
297 |
aactcaattgaaaaacttccctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttttcccaac-attttttcaa |
395 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
4226992 |
aactcaattgaaaaacttccctcccttagttatattctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttg--tatcccaccgtttttttcaa |
4227089 |
T |
|
| Q |
396 |
aaacacttataatttcactatatataagagttaggtactcatttatcaaatttatat |
452 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4227090 |
aaacacttataatttcagtatatataagagttagatactcatttatcaaatttatat |
4227146 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 297 - 452
Target Start/End: Original strand, 4236037 - 4236192
Alignment:
| Q |
297 |
aactcaattgaaaaacttccctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttttcccaacattttttcaaa |
396 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||| |
|
|
| T |
4236037 |
aactcaattgaaaaacttccctcccttagttatattctaatcttaaaatgtttaccaccaaagtgaaattaaaatttgtatcccaccgttttttttcaaa |
4236136 |
T |
|
| Q |
397 |
aacacttataatttcactatatataagagttaggtactcatttatcaaatttatat |
452 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4236137 |
aacacttataattccagtatatataagagttagattctcatttatgaaatttatat |
4236192 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Original strand, 4226758 - 4226856
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| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4226758 |
aggacaaactagtttgacacaaa-gttcctattatacccttgtgtttgatttcctccatttt--atttatttaccccatctcataattactctcaatacc |
4226854 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Original strand, 4235802 - 4235900
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| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4235802 |
aggacaagctagtttgatacaaa-gttcctattatacccttgtgtttgatttcctccatttt--atttatttacccaatctcataattactctcaatacc |
4235898 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 338
Target Start/End: Original strand, 38805520 - 38805561
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| Q |
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aactcaattgaaaaacttccctccaaaatttatactctaatc |
338 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38805520 |
aactcaattgaaaaacttccctccaaaatttatactctaatc |
38805561 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 327
Target Start/End: Original strand, 38805599 - 38805629
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| Q |
297 |
aactcaattgaaaaacttccctccaaaattt |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38805599 |
aactcaattgaaaaacttccctccaaaattt |
38805629 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 2911549 - 2911186
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| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
|
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|
| T |
2911549 |
aggacaagctaatttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
2911450 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
216 |
Q |
| |
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|
| T |
2911449 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
2911350 |
T |
|
| Q |
217 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaannnnnnnncaacttgtcttatcatgtttcggttctcaannnnnnnnncaactcaattgaaaaacttcc |
316 |
Q |
| |
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| T |
2911349 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatataattttttttcaacttctcttatcatgcttcggttatcaatttttttttaaactcaattgaaaaactttc |
2911250 |
T |
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| Q |
317 |
ctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttaccaccaaagttaaattaaaatttgtttttc |
380 |
Q |
| |
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| T |
2911249 |
ctccaaaatttatactctaatcttaaaatgtttcccaccaaagttaaattaaaatttgtttttc |
2911186 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25060134 - 25059865
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25060134 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttaccccatctcataattactctcaatacc |
25060035 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25060034 |
aataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactgacaataccaatacatatggttcatctagtaaatcacattgtttttgctgc |
25059935 |
T |
|
| Q |
217 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaannnnnnnncaacttgtcttatcatgtttcggttctcaa |
286 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25059934 |
ggttatgtattgaaaatagcatgccaatacaattttttttcaacttctcttatcatgcttcggttatcaa |
25059865 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 34224379 - 34224254
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34224379 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
34224280 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattcaatc |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34224279 |
aataccaaaattaattaaattcaatc |
34224254 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0257 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0257
Description:
Target: scaffold0257; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 139
Target Start/End: Original strand, 23519 - 23641
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23519 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
23618 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattca |
139 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23619 |
aataccaaaattaattaaattca |
23641 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19996716 - 19996594
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19996716 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacctttgtctttgatttcctccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaatacc |
19996617 |
T |
|
| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaattca |
139 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
19996616 |
aataccaaaattaattaaattca |
19996594 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15305214 - 15305094
Alignment:
| Q |
19 |
gacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaataccaa |
118 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15305214 |
gacaagcaagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcatccattttacatttatttaccccatctcataattactcccaataccaa |
15305115 |
T |
|
| Q |
119 |
taccaaaattaattaaattca |
139 |
Q |
| |
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| T |
15305114 |
taccaaaattaattaaattca |
15305094 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 179
Target Start/End: Original strand, 31485620 - 31485702
Alignment:
| Q |
97 |
tcataattactcccaataccaataccaaaattaattaaattcaatcatccttcaataccaatacatactggcaataccaatac |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
31485620 |
tcataattacttcgaataccaataccaaaattaattaaagtcaatcaaatggcaataccaatacataccggtaataccaatac |
31485702 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 135
Target Start/End: Original strand, 19361699 - 19361817
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaatacc |
116 |
Q |
| |
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| T |
19361699 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattatacccttgtctttgatttcctccattttatatttatttaccccatctaataattactcccaatacc |
19361798 |
T |
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| Q |
117 |
aataccaaaattaattaaa |
135 |
Q |
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| T |
19361799 |
aataccaaaattaattaaa |
19361817 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 143
Target Start/End: Original strand, 20541513 - 20541643
Alignment:
| Q |
17 |
aggacaagctagtttgacacaaaagttcctattataccctt----gtctttgatttcctccattttacatttatttacgccatctcataattactcccaa |
112 |
Q |
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| T |
20541513 |
aggacaaactagttcgacacaaaagttcctattatacccttacttgtctttgatttcctctgttttacatttatttacctcatctcataattactcctga |
20541612 |
T |
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| Q |
113 |
taccaataccaaaattaattaaattcaatca |
143 |
Q |
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| T |
20541613 |
taccaatatcaaaactaattaaagtcaatca |
20541643 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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