View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14715_high_7 (Length: 391)

Name: NF14715_high_7
Description: NF14715
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14715_high_7
NF14715_high_7
[»] scaffold0038 (5 HSPs)
scaffold0038 (23-375)||(44102-44454)
scaffold0038 (23-261)||(28595-28833)
scaffold0038 (98-297)||(40739-40934)
scaffold0038 (23-115)||(35872-35964)
scaffold0038 (201-261)||(28893-28953)
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (23-375)||(28243940-28244292)
chr6 (23-375)||(28326623-28326975)
chr6 (23-375)||(28504259-28504611)
chr6 (23-375)||(28186539-28186891)
chr6 (23-375)||(28296425-28296777)
chr6 (23-375)||(28515296-28515648)
chr6 (23-261)||(28228097-28228335)
chr6 (101-376)||(28182341-28182607)
chr6 (99-351)||(28140756-28141008)
chr6 (99-309)||(29842743-29842953)
chr6 (98-297)||(28240577-28240772)
chr6 (99-309)||(29827207-29827417)
chr6 (110-353)||(27680182-27680425)
chr6 (110-353)||(27704961-27705204)
chr6 (99-324)||(28097179-28097404)
chr6 (110-315)||(27609865-27610070)
chr6 (114-311)||(31285795-31285992)
chr6 (110-274)||(26624503-26624667)
chr6 (110-274)||(26730480-26730644)
chr6 (23-354)||(26803591-26803922)
chr6 (110-261)||(26950975-26951126)
chr6 (99-354)||(28787459-28787714)
chr6 (101-267)||(26812751-26812917)
chr6 (110-311)||(26647711-26647912)
chr6 (110-311)||(26753679-26753880)
chr6 (110-310)||(27697336-27697536)
chr6 (23-115)||(28235710-28235802)
chr6 (110-354)||(28793591-28793835)
chr6 (110-261)||(27664013-27664164)
chr6 (110-354)||(26885299-26885543)
chr6 (110-354)||(27603410-27603654)
chr6 (110-261)||(26978612-26978763)
chr6 (108-355)||(27426317-27426564)
chr6 (110-317)||(27717242-27717449)
chr6 (110-260)||(26960357-26960507)
chr6 (110-261)||(25075099-25075250)
chr6 (110-261)||(26636878-26637029)
chr6 (110-261)||(26742844-26742995)
chr6 (110-213)||(26849944-26850047)
chr6 (110-309)||(25492070-25492269)
chr6 (110-261)||(26862812-26862963)
chr6 (110-317)||(29469444-29469651)
chr6 (110-355)||(27676325-27676570)
chr6 (113-213)||(26938264-26938364)
chr6 (110-274)||(27591807-27591971)
chr6 (110-273)||(26657194-26657357)
chr6 (110-273)||(26763165-26763328)
chr6 (110-261)||(26825051-26825202)
chr6 (107-354)||(27215681-27215928)
chr6 (189-355)||(27530009-27530175)
chr6 (116-352)||(2186064-2186300)
chr6 (201-261)||(28228395-28228455)
chr6 (101-163)||(29476962-29477024)
chr6 (107-354)||(25512120-25512367)
chr6 (23-61)||(27592020-27592058)
chr6 (23-61)||(27676619-27676657)
chr6 (217-354)||(25484398-25484535)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (23-376)||(56978-57331)
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (101-315)||(3280882-3281096)
chr2 (110-261)||(17992014-17992165)
chr2 (99-306)||(17662492-17662699)
chr2 (99-306)||(17713518-17713725)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (38-313)||(16692027-16692302)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (110-354)||(28126381-28126625)
chr1 (99-313)||(267087-267301)
chr1 (110-261)||(26137120-26137271)
chr1 (135-273)||(28132288-28132426)
chr1 (111-313)||(5922216-5922418)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (104-314)||(5089696-5089906)
chr4 (110-261)||(18678355-18678506)
chr4 (110-260)||(18722881-18723031)
chr4 (110-261)||(18654272-18654423)
chr4 (110-261)||(18698195-18698346)
chr4 (110-261)||(18730299-18730450)
chr4 (110-261)||(18688421-18688572)
chr4 (108-355)||(18074991-18075238)
[»] scaffold1870 (1 HSPs)
scaffold1870 (110-354)||(1-245)
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (99-302)||(35984520-35984723)
chr8 (99-297)||(31906275-31906473)
chr8 (24-261)||(29272637-29272874)
chr8 (109-160)||(16353855-16353906)
chr8 (217-355)||(16353660-16353798)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (110-354)||(8719-8963)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (110-354)||(12381-12625)
scaffold0277 (110-311)||(3461-3662)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (110-317)||(2282-2489)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (108-355)||(60799-61046)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (245-355)||(615163-615273)
chr3 (236-306)||(5916586-5916656)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (230-355)||(67665-67790)


Alignment Details
Target: scaffold0038 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 5)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Original strand, 44102 - 44454
Alignment:
Q  23 gaagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaataacaaggtcgattcaaatttcgatggtgttttgcgttgtgcagtaacttatgcttctggcc 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44102 gaagctcttgaattgttgaggtggaattctttcaaaaataacaaggtggattcaaatttcgatggtgttttacggtgtgcagtaacttatgcttctggcc 44201  T
Q  123 ttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattccgattaaaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  44202 ttccattggctttagaagtagtgggttcaaacttatttggaaataatataggagaatggaaatctgcattagatcggtatagaaggattccgattaaaaa 44301  T
Q  223 gatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggatataaattgaaa 322  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44302 gatacaggagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaaaggatataatttgaaa 44401  T
Q  323 gaacttgaagatatactgcatgctcattatggtaactccatgaagcatcaaat 375  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  44402 gaacttgaagatatactttatgctcattatggtaactgcatgaaatatcaaat 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Original strand, 28595 - 28833
Alignment:
Q  23 gaagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaataacaaggtcgattcaaatttcgatggtgttttgcgttgtgcagtaacttatgcttctggcc 122  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||     
T  28595 gaagctcttgaattgatgaggtggaacgctttcaaatataacatggtcgattcaaatttcgaccgtgttttgcggtgtgcagtaactttttcttttggca 28694  T
Q  123 ttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattccgattaaaga 222  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| |||||| |    
T  28695 ttccattggttttagaagtagtgggttcaaacttgtttgggaagaatattgaagaatggaaatctgcattaaatcaggaagaaaggattcccattaaaaa 28794  T
Q  223 gatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
     |||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28795 tatcatagagatacttaaaataagctttgatactttgga 28833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 297
Target Start/End: Original strand, 40739 - 40934
Alignment:
Q  98 tgtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatc 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| ||| ||||  ||||||| |    
T  40739 tgtgcaataacttatgcttctggcctaccattagctttagaagtagttggttccaacttgtttggattagatataggagaatgggaatccacattagacc 40838  T
Q  198 ggtatgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttg 297  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  40839 agtatgaaaggattccaaataaagagatccaaaagatacttaaagt----tttgatgctttggagaaagatgagcaaagtgtttttctcgacattgcttg 40934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 115
Target Start/End: Original strand, 35872 - 35964
Alignment:
Q  23 gaagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaataacaaggtcgattcaaatttcgatggtgttttgcgttgtgcagtaacttatgct 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35872 gaagctcttgaattgttgaggtggaaggctttaaaatataacaaggtcgattcaaatttcaacggtgttttgaggtgtgcagtaacttatgct 35964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 261
Target Start/End: Original strand, 28893 - 28953
Alignment:
Q  201 atgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28893 atgaaaggattcccattaaaaatatcacagagatacttaaaataagctttgatgctttgga 28953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Original strand, 28243940 - 28244292
Alignment:
Q  23 gaagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaataacaaggtcgattcaaatttcgatggtgttttgcgttgtgcagtaacttatgcttctggcc 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28243940 gaagctcttgaattgttgaggtggaattctttcaaaaataacaaggtggattcaaatttcgatggtgttttacggtgtgcagtaacttatgcttctggcc 28244039  T
Q  123 ttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattccgattaaaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  28244040 ttccattggctttagaagtagtgggttcaaacttatttggaaataatataggagaatggaaatctgcattagatcggtatagaaggattccgattaaaaa 28244139  T
Q  223 gatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggatataaattgaaa 322  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28244140 gatacaggagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaaaggatataatttgaaa 28244239  T
Q  323 gaacttgaagatatactgcatgctcattatggtaactccatgaagcatcaaat 375  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  28244240 gaacttgaagatatactttatgctcattatggtaactgcatgaaatatcaaat 28244292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Original strand, 28326623 - 28326975
Alignment:
Q  23 gaagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaataacaaggtcgattcaaatttcgatggtgttttgcgttgtgcagtaacttatgcttctggcc 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  ||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  28326623 gaagctcttgaattgttgaggtggaatactttcaaaaataacaaagtcgattcaaattttgacggcattttatactgtgcagtaacttatgcttctggcc 28326722  T
Q  123 ttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattccgattaaaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  28326723 ttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatagtagaatgtaaatctgcattatatcagtatgaaaggattcccattaaaaa 28326822  T
Q  223 gatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggatataaattgaaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  28326823 gatccaagcgatacttaaagtaagctttgatgctttggatgaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaatggatatgaattgaaa 28326922  T
Q  323 gaacttgaagatatactgcatgctcattatggtaactccatgaagcatcaaat 375  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28326923 gaacttgaagatatacttcatgctcattatggtaactccatgaagtatcaaat 28326975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Original strand, 28504259 - 28504611
Alignment:
Q  23 gaagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaataacaaggtcgattcaaatttcgatggtgttttgcgttgtgcagtaacttatgcttctggcc 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  ||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  28504259 gaagctcttgaattgttgaggtggaatactttcaaaaataacaaagtcgattcaaattttgacggcattttatactgtgcagtaacttatgcttctggcc 28504358  T
Q  123 ttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattccgattaaaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  28504359 ttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatagtagaatgtaaatctgcattatatcagtatgaaaggattcccattaaaaa 28504458  T
Q  223 gatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggatataaattgaaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  28504459 gatccaagcgatacttaaagtaagctttgatgctttggatgaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaatggatatgaattgaaa 28504558  T
Q  323 gaacttgaagatatactgcatgctcattatggtaactccatgaagcatcaaat 375  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28504559 gaacttgaagatatacttcatgctcattatggtaactccatgaagtatcaaat 28504611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Original strand, 28186539 - 28186891
Alignment:
Q  23 gaagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaataacaaggtcgattcaaatttcgatggtgttttgcgttgtgcagtaacttatgcttctggcc 122  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||  | ||||| |    |||||||||||||||||||||||    
T  28186539 gaagctcttgaattgttgacgtggaaggctttaaaaaataacaaagttgatacaaatttcgacagcgttttacaccatgcagtaacttatgcttctggcc 28186638  T
Q  123 ttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattccgattaaaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |||| |    
T  28186639 ttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatataggagaatggaaatctgcattaaatcagtatgaaaggattcccgataaaaa 28186738  T
Q  223 gatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggatataaattgaaa 322  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||  || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28186739 gatccaagagatactcaaagtaagctttgatgctttgggggaagcagaacaaaatgtttttctcgacatcgcttgctgcttcaaaggatatgaattgaaa 28186838  T
Q  323 gaacttgaagatatactgcatgctcattatggtaactccatgaagcatcaaat 375  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  28186839 gaacttgaagatgtacttcatgctcattatggtaactgcatgaaatatcaaat 28186891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28296777 - 28296425
Alignment:
Q  23 gaagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaataacaaggtcgattcaaatttcgatggtgttttgcgttgtgcagtaacttatgcttctggcc 122  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |   |||| |     || |||||||||||||||||||    
T  28296777 gaagctcttgaattgttgagatggaatgctttcaaaaataacaaagtcgatacaaattttgacgacattttacaccaggctgtaacttatgcttctggcc 28296678  T
Q  123 ttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattccgattaaaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||||  || |||| | |    
T  28296677 ttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatataagagaatggaaatctgcattaagtcagtatgaaaggagacccattagaaa 28296578  T
Q  223 gatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggatataaattgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28296577 gatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaagatgagaaaaatgtttttcttgacatcgcttgctgcttcaaaggatatgaattgaaa 28296478  T
Q  323 gaacttgaagatatactgcatgctcattatggtaactccatgaagcatcaaat 375  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  28296477 gaacttgaaaatatacttcatgctcattatggtaactgcatgaattatcaaat 28296425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Original strand, 28515296 - 28515648
Alignment:
Q  23 gaagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaataacaaggtcgattcaaatttcgatggtgttttgcgttgtgcagtaacttatgcttctggcc 122  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |   |||| |     || |||||||||||||||||||    
T  28515296 gaagctcttgaattgttgagatggaatgctttcaaaaataacaaagtcgatacaaattttgacgacattttacaccaggctgtaacttatgcttctggcc 28515395  T
Q  123 ttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattccgattaaaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||||  || |||| | |    
T  28515396 ttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatataagagaatggaaatctgcattaagtcagtatgaaaggagacccattagaaa 28515495  T
Q  223 gatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggatataaattgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28515496 gatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaagatgagaaaaatgtttttcttgacatcgcttgctgcttcaaaggatatgaattgaaa 28515595  T
Q  323 gaacttgaagatatactgcatgctcattatggtaactccatgaagcatcaaat 375  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  28515596 gaacttgaaaatatacttcatgctcattatggtaactgcatgaattatcaaat 28515648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Original strand, 28228097 - 28228335
Alignment:
Q  23 gaagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaataacaaggtcgattcaaatttcgatggtgttttgcgttgtgcagtaacttatgcttctggcc 122  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||     
T  28228097 gaagctcttgaattgatgaggtggaacgctttcaaatataacatggtcgattcaaatttcgaccgtgttttgcggtgtgcagtaactttttcttttggca 28228196  T
Q  123 ttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattccgattaaaga 222  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| |||||| |    
T  28228197 ttccattggttttagaagtagtgggttcaaacttgtttgggaagaatattgaagaatggaaatctgcattaaatcaggaagaaaggattcccattaaaaa 28228296  T
Q  223 gatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
     |||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28228297 tatcatagagatacttaaaataagctttgatactttgga 28228335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 376
Target Start/End: Original strand, 28182341 - 28182607
Alignment:
Q  101 gcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggt 200  Q
    |||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||           
T  28182341 gcagtaacttttgcatcagtccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatgagagaatcgaaatctgcattaac----- 28182435  T
Q  201 atgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgctt 300  Q
        ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||  |||| ||    
T  28182436 ----aaggattcccatgaaaaagatccaagagatacttaaagttagctatgatgctctggaggatgatgagcagaatgtttttctggacatttcttgttt 28182531  T
Q  301 cttcaaaggatataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatggtaactccatgaagcatcaaatt 376  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  28182532 cttaaaaggatatgatttgaaagaagttgaagatatatttcatgctcattatggtagctgcatgaaacatcaaatt 28182607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 351
Target Start/End: Original strand, 28140756 - 28141008
Alignment:
Q  99 gtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcg 198  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  28140756 gtgcagttacttatgcctctggccttccattggctttagaagtagttggttctagcttgtttggaaagcataaagatgagtggaaatctacattagatcg 28140855  T
Q  199 gtatgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgc 298  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||     
T  28140856 gtatgaaaggattcctcataaagaggtcctgaagatacttaaagtgagctttgatagtttggagaaagatgagcaaagtgtttttctcgacattgcttgt 28140955  T
Q  299 ttcttcaaaggatataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcatta 351  Q
    |  |||| |||||||| |||   |||  |||||||||| ||  ||||||||||    
T  28140956 tgtttcagaggatatatattagcagaggttgaagatattctctatgctcatta 28141008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29842953 - 29842743
Alignment:
Q  99 gtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaactt-gtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatc 197  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||     
T  29842953 gtgcaatagcttatgcttctggccttccgttggttttagaattagtaggt-ccagctttgtttggaaagaatatagaagaatggaaatctacattagata 29842855  T
Q  198 ggtatgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttg 297  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || | ||||||||||||||| |||||    
T  29842854 ggtatgaaaggattcctaataaagagatccacaatatacttaaaataagctttgatgctttggaggaagacgaacaaggtgtttttctcgacattgcttg 29842755  T
Q  298 cttcttcaaagg 309  Q
     | |||||||||    
T  29842754 ttgcttcaaagg 29842743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 297
Target Start/End: Original strand, 28240577 - 28240772
Alignment:
Q  98 tgtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatc 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| ||| ||||  ||||||| |    
T  28240577 tgtgcaataacttatgcttctggcctaccattagctttagaagtagttggttccaacttgtttggattagatataggagaatgggaatccacattagacc 28240676  T
Q  198 ggtatgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttg 297  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  28240677 agtatgaaaggattccaaataaagagatccaaaagatacttaaagt----tttgatgctttggagaaagatgagcaaagtgtttttctcgacattgcttg 28240772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 309
Target Start/End: Original strand, 29827207 - 29827417
Alignment:
Q  99 gtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcg 198  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |    
T  29827207 gtgcaatagcttatgcttctggccttccgttggttttagaattagtaggtcccgcgttgtttggaaagaatatagaagaatggaaatctatattagatag 29827306  T
Q  199 gtatgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgc 298  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||     
T  29827307 atatgaaaggattcctaataaagagatccaaaatatacttaaaataagttttgatgctttggaggaagatgaacaaggtgtttttctcgacattgcttgt 29827406  T
Q  299 ttcttcaaagg 309  Q
    | |||||||||    
T  29827407 tgcttcaaagg 29827417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 353
Target Start/End: Original strand, 27680182 - 27680425
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| ||| |||||   | |||||||| ||||||| ||||    
T  27680182 tatgcttttggccttccgttagttttagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagcatagaagattggaagcatacattagatgggtatgacagga 27680281  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||  |||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27680282 ttcccaataaagagatccaaaagatacttaaggtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttcttgacatcgcttgctgcttcaaagg 27680381  T
Q  310 atataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatg 353  Q
    |||| ||| ||| ||  | |||||||||||   |||||||||||    
T  27680382 atatcaatggaaggagttcgaagatatactttgtgctcattatg 27680425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27705204 - 27704961
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||   | |||||||| ||||||| ||||    
T  27705204 tatgcttctggccttccgttagttttagaagtaatgggttctaacttgtttggcaagaacatagaagaatggaagaatacattagatgggtatgacagga 27705105  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| | ||| |||||    
T  27705104 ttcccaataaagagatccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttcttgacattgcttgttgcttaaaagg 27705005  T
Q  310 atataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatg 353  Q
     |||| ||||| |||  ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  27705004 gtatagattgacagaggttgaaaatatacttcattctcattatg 27704961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28097404 - 28097179
Alignment:
Q  99 gtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcg 198  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||   || |||||    
T  28097404 gtgcaataaattatgctgctggccttccattggccttggaaatattaggttccaacttgtatggaaagcatatagaagaatggaattctttgttggatcg 28097305  T
Q  199 gtatgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcagga-tgtttttctcgacatcgcttg 297  Q
     |||||||| ||||| | | ||||||| ||| | ||||||   || || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  28097304 atatgaaagaattcctagtgaagagattcaaaaaatacttcgtgtgagttttgatgctttggaggaagatgag-aggagtgtttttctcgacattgcttg 28097206  T
Q  298 cttcttcaaaggatataaattgaaaga 324  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||    
T  28097205 ttgcttcaaagggtataaattgaaaga 28097179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27610070 - 27609865
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| | | |||||||| ||||||| ||||    
T  27610070 tatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaggaatggaagtatacattagatgggtatgacagga 27609971  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||| |||||   ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  27609970 ttcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgattctttggaagaagaggagcaaagtgtctttctggacattgcttgttgcttcaaagg 27609871  T
Q  310 atataa 315  Q
    ||||||    
T  27609870 atataa 27609865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 311
Target Start/End: Original strand, 31285795 - 31285992
Alignment:
Q  114 cttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattcc 213  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| | | |||||   | |||||||| ||||||| | ||||||    
T  31285795 cttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaaaatggaagagtacattagatgggtatgacaagattcc 31285894  T
Q  214 gattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggat 311  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  31285895 caataaagagatccaaaagatacttaaagtaagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttctggacattgcttgttgcttcaaaggat 31285992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 274
Target Start/End: Original strand, 26624503 - 26624667
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||| | || ||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| | | |||||||| ||||||| ||||    
T  26624503 tatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagtatacattagatgggtatgacagga 26624602  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcag 274  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  26624603 ttcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcag 26624667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 274
Target Start/End: Original strand, 26730480 - 26730644
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||| | || ||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| | | |||||||| ||||||| ||||    
T  26730480 tatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagtatacattagatgggtatgacagga 26730579  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcag 274  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  26730580 ttcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcag 26730644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 354
Target Start/End: Original strand, 26803591 - 26803922
Alignment:
Q  23 gaagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaataacaaggtcgattcaaatttcgatggtgttttgcgttgtgcagtaacttatgcttctggcc 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||   ||||| ||  || |   ||||   | |||||||  | |||||||| || |    
T  26803591 gaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataacaaagtaccttcaagttatgaagacattttaaatcgtgcagtttcatatgcttcaggtc 26803690  T
Q  123 ttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattccgattaaaga 222  Q
    |||| || | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||   | |||||||| | ||||||| |||||| | |||| |    
T  26803691 ttcccttagttttagagatagtgggttccaacttgtttggaaagagcataaaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaa 26803790  T
Q  223 gatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggatataaattgaaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||  ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||| |  || | |     
T  26803791 gatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggatgtggatgggag 26803890  T
Q  323 gaacttgaagatatactgcatgctcattatgg 354  Q
    ||  ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26803891 gagtttgaagatatacttcatgttcattatgg 26803922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Original strand, 26950975 - 26951126
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||  | |||  |||||||  ||||||||| |    
T  26950975 tatgctgctggccttccattagctttagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagactatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgaaagaa 26951074  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    ||||   | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26951075 ttccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 26951126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 354
Target Start/End: Original strand, 28787459 - 28787714
Alignment:
Q  99 gtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcg 198  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||   | | |||||| |    
T  28787459 gtgcagtttcttatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtactttagatgg 28787558  T
Q  199 gtatgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgc 298  Q
     ||||||| |||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||   ||||||||| ||||| || ||     
T  28787559 atatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcaacaaagtgtttttctagacattgcatgt 28787658  T
Q  299 ttcttcaaaggatataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatgg 354  Q
    | ||||||||||| | | | | | ||  ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28787659 tgcttcaaaggatgtgagtgggaggagtttgaagatatacttcgtgctcattatgg 28787714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 267
Target Start/End: Original strand, 26812751 - 26812917
Alignment:
Q  101 gcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggt 200  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||  ||    
T  26812751 gcagtaaaatatacttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtattgaagagtgggaatctacattagataagt 26812850  T
Q  201 atgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaaga 267  Q
    |||||||||  ||   | |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26812851 atgaaaggacgccacctgaagatatccaaaatatattcaaagtaagctttgatgctttggacaaaga 26812917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 311
Target Start/End: Original strand, 26647711 - 26647912
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||  |||| ||| |||||   | |||||||| | ||||||| ||    
T  26647711 tatgcttcaggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttatatggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaaga 26647810  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||  ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  26647811 ttcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagg 26647910  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  26647911 at 26647912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 311
Target Start/End: Original strand, 26753679 - 26753880
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||  |||| ||| |||||   | |||||||| | ||||||| ||    
T  26753679 tatgcttcaggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttatatggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaaga 26753778  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||  ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  26753779 ttcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagg 26753878  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  26753879 at 26753880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27697536 - 27697336
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||| |||||||||||| || | | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |  ||||||| ||||||| ||||    
T  27697536 tatgtttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatggaagtatatattagatgggtatgacagga 27697437  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||| |||||   ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  27697436 ttcccaataaagagatccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcaaagtgtctttctggacattgcttgttgcttcaaagg 27697337  T
Q  310 a 310  Q
    |    
T  27697336 a 27697336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 115
Target Start/End: Original strand, 28235710 - 28235802
Alignment:
Q  23 gaagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaataacaaggtcgattcaaatttcgatggtgttttgcgttgtgcagtaacttatgct 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28235710 gaagctcttgaattgttgaggtggaaggctttaaaatataacaaggtcgattcaaatttcaacggtgttttgaggtgtgcagtaacttatgct 28235802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 354
Target Start/End: Original strand, 28793591 - 28793835
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||   | | |||||| | ||||||| ||    
T  28793591 tatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtactttagatggatatgaaaaga 28793690  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||   ||||||||| ||||| || || | |||||||||    
T  28793691 ttcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcaacaaagtgtttttctagacattgcatgttgcttcaaagg 28793790  T
Q  310 atataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatgg 354  Q
    || | | | | | ||  ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28793791 atgtgagtgggaggagtttgaagatatacttcgtgctcattatgg 28793835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27664164 - 27664013
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  | ||  | ||||||  ||||||||| |    
T  27664164 tatgcttctggccttccattagctttaaaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagcagattgtgagtcaaccttagataagtatgaaagaa 27664065  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    ||||   | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27664064 ttccacctgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatactttgga 27664013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 354
Target Start/End: Original strand, 26885299 - 26885543
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||| |||||||| || | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||| |   |||||   | || ||||| | ||||||| ||    
T  26885299 tatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaacatggaagagtacactagatggatatgaaaaga 26885398  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||   ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  26885399 ttcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagg 26885498  T
Q  310 atataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatgg 354  Q
     | ||||| || |||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26885499 gtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 26885543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 27603654 - 27603410
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||| || ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||   | | |||||  | ||||| | ||    
T  27603654 tatgcttcaggacttcccttagttttggaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaggatagaagaatggaagggtacgttagaaggatatgagaaga 27603555  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||  ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  27603554 ttcccaataaaaagatccacgagattcttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagg 27603455  T
Q  310 atataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatgg 354  Q
    || |  |||| |||   ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27603454 atgtggattggaagtggttgaagatatacttcgtgctcattatgg 27603410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Original strand, 26978612 - 26978763
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||  | |||  |||||||  ||||| ||| |    
T  26978612 tatgcttctggtcttccattagctttagaagtagtgggttcaagcttgtttggaaagagtatagcagagtgtgagtctatattagataagtatggaagaa 26978711  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    ||||   | || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26978712 ttccacctgaacatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 26978763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27426564 - 27426317
Alignment:
Q  108 cttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaag 207  Q
    |||||||||||||||||||  | | | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||   | |||||||| |||||||||     
T  27426564 cttatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgcaagaatacattagattggtatgaaaa 27426465  T
Q  208 gattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaa 307  Q
    |||||| | |||||||||||||   ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||   ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  27426464 gattcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaa 27426365  T
Q  308 ggatataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatggt 355  Q
    || | ||||| | || |  |  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  27426364 ggttgtaaatgggaaaaggtcaaagaaatacttcatgctcattatggt 27426317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27717449 - 27717242
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||| |||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||  || |||||   | |||||||| ||||||| ||||    
T  27717449 tatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttatctggaaagaacatagaggaatggaagaatacattagatgggtatgacagga 27717350  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||   ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||| |    
T  27717349 ttcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaag 27717250  T
Q  310 atataaat 317  Q
    || |||||    
T  27717249 atgtaaat 27717242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 260
Target Start/End: Original strand, 26960357 - 26960507
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||  | |||  |||||||  |||||| || |    
T  26960357 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaa 26960456  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgg 260  Q
    ||||   | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26960457 ttccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctatgacgctttgg 26960507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Original strand, 25075099 - 25075250
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || || |  ||| ||  | ||| ||||||||  ||||||||| |    
T  25075099 tatgcttctggccttccattagctttagaagttgtgggttccaacttgtttggaatgagtacaacagaatgcgagtctacattagataagtatgaaagaa 25075198  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    ||||   | |||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25075199 ttccacctgaagatatccaaaaaatacttaaagtaagctttgacgctttgga 25075250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Original strand, 26636878 - 26637029
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  | |||  |||||||  |||||| || |    
T  26636878 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaa 26636977  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    ||||   | |||| |||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  26636978 ttccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgga 26637029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Original strand, 26742844 - 26742995
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  | |||  |||||||  |||||| || |    
T  26742844 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacagaa 26742943  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    ||||   | |||| |||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  26742944 ttccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttgga 26742995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 26849944 - 26850047
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  | ||| ||||||||  ||||||||| |    
T  26849944 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagaagaatgcgagtctacattagataagtatgaaagaa 26850043  T
Q  210 ttcc 213  Q
    ||||    
T  26850044 ttcc 26850047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 25492269 - 25492070
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| || || ||||||||||| |  |||| ||| ||||| | | ||||||||  |||||||| ||    
T  25492269 tatgcttctggccttccattagctttagtaataatagggtcaaatttgtttggaaatagcatagaagaatggaagtgtacattagatgagtatgaaaaga 25492170  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    ||   | ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || | ||||||  | | ||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  25492169 ttttcaataaagagatccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaggaaaaggagcagagtatctttctagacatgacttgtttcttcaaagg 25492070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Original strand, 26862812 - 26862963
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||| |||||||| || | | | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||  || | ||| ||| |||   |||||||| ||||||||| ||    
T  26862812 tatgcttccggccttccgttagttctcgaaatagtgggttctaacttgtttggaaagagcatggaagaatggcaatgcacattagatgggtatgaaaaga 26862911  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26862912 ttcccaataaagagatccaaaggatacttaaagtaagctatgatgctttgga 26862963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 317
Target Start/End: Original strand, 29469444 - 29469651
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||  |||| |||   ||||  || | | | || |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29469444 tatgcttctggccttccactggctttggaagtcataggttctcacttttttaataagacaattgaacaatgtaaatatgcattagatcgttatgaaagga 29469543  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    ||||   |||| ||||||||  ||||||  || | ||||||||||||||| || |||| ||| ||  ||||||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  29469544 ttcctgataaaaagatccaaacgatactacaacttagctttgatgctttgcaggaagaagagaagtctgtttttcttgacattgcctgctgcttcaaagg 29469643  T
Q  310 atataaat 317  Q
    ||||||||    
T  29469644 atataaat 29469651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27676570 - 27676325
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | ||| ||  | ||| ||||||||  ||||| ||| |    
T  27676570 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 27676471  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    ||||   |||||| |||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||||  |||| ||||||  ||| ||| | || || ||||| | | |||||||    
T  27676470 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactgagctatgatgctttggacgaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 27676371  T
Q  310 atataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatggt 355  Q
    || || |||| ||||| | ||| | ||||| |||  ||||||||||    
T  27676370 atgtagattggaagaagtcgaacagatacttcatcatcattatggt 27676325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 213
Target Start/End: Original strand, 26938264 - 26938364
Alignment:
Q  113 gcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattc 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  26938264 gcttctggccttccattagctttagaagttgtaggttcccatttgtttggaaagtgtatagcagaatgggaatctacattagctaagtatgaaaggattc 26938363  T
Q  213 c 213  Q
    |    
T  26938364 c 26938364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27591971 - 27591807
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | ||| ||  | ||| ||||||||  ||||| ||| |    
T  27591971 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 27591872  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcag 274  Q
    ||||   |||||| |||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  27591871 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcag 27591807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 273
Target Start/End: Original strand, 26657194 - 26657357
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||| || ||||| || | | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||  || | | | |||||   | |||||||| | ||||||| ||    
T  26657194 tatgcttcaggacttcccttagttatagaagtagtggcttcaaacttgtttggaaagagcatcgaaaaatggaagagtacattagatggatatgaaaaga 26657293  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagca 273  Q
    |||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||    
T  26657294 ttcccaataaaaagattcaagagatacttaaagtaagctatgatgatttggaggaagaggagca 26657357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 273
Target Start/End: Original strand, 26763165 - 26763328
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||| || ||||| || | | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||  || | | | |||||   | |||||||| | ||||||| ||    
T  26763165 tatgcttcaggacttcccttagttatagaagtagtggcttcaaacttgtttggaaagagcatcgaaaaatggaagagtacattagatggatatgaaaaga 26763264  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagca 273  Q
    |||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||    
T  26763265 ttcccaataaaaagattcaagagatacttaaagtaagctatgatgatttggaggaagaggagca 26763328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Original strand, 26825051 - 26825202
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||| |||||||| || |  |||||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||  |   |||||   |||||||||| | ||||||||||    
T  26825051 tatgcttcgggccttcccttagtattagaaatagtgggttccaatttgtttggaaagagcatacaaatatggaagggtgcattagatggatatgaaagga 26825150  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    ||||    ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26825151 ttcctgacaaaaagatccaagagatacttagagtaagctatgatgctttgga 26825202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 354
Target Start/End: Original strand, 27215681 - 27215928
Alignment:
Q  107 acttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaa 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |  | |||| ||||| |||||||||| || | ||| ||| ||| ||  |  |||||||  ||||||||    
T  27215681 acttatgtttctggccttccattagctatagtaacaatagggtccaatttgtttggaaggagtgtagaagattgggaacgtatattagatgagtatgaaa 27215780  T
Q  207 ggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaa 306  Q
     |||||| | |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| ||||| || | ||| ||  ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  27215781 agattcccaataaagagatccaaaggatacttaaagtcagctatgatgctctggaggaaaaggagaagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaa 27215880  T
Q  307 aggatataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatgg 354  Q
    ||| | ||||| || | |  |  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  27215881 agggtgtaaatggacaaaggtcaaagatatacttcatgcccattatgg 27215928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27530175 - 27530009
Alignment:
Q  189 cattagatcggtatgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcga 288  Q
    |||||||| ||||||||   ||||| | |||||||||||||   ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||   ||| ||||| ||    
T  27530175 cattagatgggtatgaagaaattcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggagaaagaagagcaaagtgtctttctaga 27530076  T
Q  289 catcgcttgcttcttcaaaggatataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatggt 355  Q
    ||| ||||| | ||||||||| | ||||| |  |||  |  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  27530075 cattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggccagaggtcaaagaaatacttcatgctcattatggt 27530009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 352
Target Start/End: Original strand, 2186064 - 2186300
Alignment:
Q  116 tctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattccga 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||  || ||  || ||||  ||| |||| | ||| |||||||||| |        
T  2186064 tctggccttccattagctttagaagtagtgggttctgacttgtctggaaagtctaaagacgaatggagttctacattggctcgatatgaaaggactgttc 2186163  T
Q  216 ttaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggatataa 315  Q
     |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || | || ||  ||  | | ||||||||||| ||||| || |||||||||| ||     
T  2186164 ctaaaaacatccaacagatacttaaagtcagctttgatgctttgcaggaggaagataagagtctctttctcgacattgcttgttttttcaaaggatgtag 2186263  T
Q  316 attgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattat 352  Q
    | || ||||  |  ||||||||||  |||||||||||    
T  2186264 actggaagagttccaagatatacttgatgctcattat 2186300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 261
Target Start/End: Original strand, 28228395 - 28228455
Alignment:
Q  201 atgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28228395 atgaaaggattcccattaaaaatatcacagagatacttaaaataagctttgatgctttgga 28228455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29477024 - 29476962
Alignment:
Q  101 gcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttgga 163  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  29477024 gcagtaacttatgcttccgggcttccattggccttggaagtaataggttcaagcttgtttgga 29476962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 354
Target Start/End: Original strand, 25512120 - 25512367
Alignment:
Q  107 acttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||| |  | ||||  |||| |||||||||| |||  ||| ||| |||||   | ||||||||  ||||||||    
T  25512120 acttatgcatctggccttccgttagctatagtaacaataggggccaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatgagtatgaaa 25512219  T
Q  207 ggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaa 306  Q
      |||||   |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| || || | || |||  ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  25512220 atattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttacttcaa 25512319  T
Q  307 aggatataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatgg 354  Q
    ||| ||||||| || | || |  || | ||||| ||||||||||||||    
T  25512320 agggtataaatggacaaaagtaaaaaaaatacttcatgctcattatgg 25512367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 27592058 - 27592020
Alignment:
Q  23 gaagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaat 61  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27592058 gaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaat 27592020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 27676657 - 27676619
Alignment:
Q  23 gaagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaat 61  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27676657 gaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaat 27676619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 354
Target Start/End: Original strand, 25484398 - 25484535
Alignment:
Q  217 taaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggatataaa 316  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| || || | || |||  ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  25484398 taaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttacttcaaagggtataaa 25484497  T
Q  317 ttgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatgg 354  Q
    | || | || |  || | ||||| ||||||||||||||    
T  25484498 tggacaaaagtaaaaaaaatacttcatgctcattatgg 25484535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 57331 - 56978
Alignment:
Q  23 gaagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaataacaaggtcgattcaaatttcgatggtgttttgcgttgtgcagtaacttatgcttctggcc 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    ||||| |    |||||||||||||||||| ||||    
T  57331 gaagctcttgaattgttgaggtggaatgctttcaaaaataacaaagtcaatccaaatttcgacaacgttttacaccttgcagtaacttatgcttcaggcc 57232  T
Q  123 ttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattccgattaaaga 222  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  57231 ttccattggccttagaagtagtgggttcgaacttgtttggaaagaatataggagaatggaaatctgcattaaatcagtatgaaaggattcccattaaaaa 57132  T
Q  223 gatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggatataaattgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| | | || |||    
T  57131 gatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaagatgagaagaatgtttttctcgacatttcttgtttcttagaaggatgtgatttaaaa 57032  T
Q  323 gaacttgaagatatactgcatgctcattatggtaactccatgaagcatcaaatt 376  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  57031 gaagttgaagatatacttcatgctcattatggtagctgcatgaaacatcaaatt 56978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 101 - 315
Target Start/End: Original strand, 3280882 - 3281096
Alignment:
Q  101 gcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||   || ||||| |    
T  3280882 gcagtaaattatgcttctggccttccattggcattagaagtattaggttccaacttgtttggaaagaatataaaagagtggaattctttgttggatcgat 3280981  T
Q  201 atgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgctt 300  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||| |     
T  3280982 atgaaaggattcctaataaagagattcagaagatacttaaagtgagttttgatgctttggaggaagacgagcaaagtgtttttctcgacattgcttgttg 3281081  T
Q  301 cttcaaaggatataa 315  Q
    ||| ||||| |||||    
T  3281082 ctttaaagggtataa 3281096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 17992165 - 17992014
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||| ||||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  17992165 tatgctgctggcctcccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagtgtttagcagattggaaatgtgcattggataagtatgaaagga 17992066  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    | ||   | |||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  17992065 taccacctgaagatatccaaaatatactaaaaataagctttgatgctctgga 17992014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Original strand, 17662492 - 17662699
Alignment:
Q  99 gtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcg 198  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| || | | |||  |  ||||||||| ||||||||      
T  17662492 gtgcagtttcttatgcttctggccttccattggctttggaagtaataggttctcacttgtttggcaaaagtttagatgtatggaaatcttcattagataa 17662591  T
Q  199 gtatgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgc 298  Q
     ||||||||  |||     |||||||| || || || |||||||| |||| ||||| ||||||  | ||| || ||| | ||||||| |||||||||||     
T  17662592 atatgaaagagttcttcacaaagagattcatgaaattcttaaagttagctatgatgatttggatgatgatcagaagggtatttttcttgacatcgcttgt 17662691  T
Q  299 ttcttcaa 306  Q
    ||||||||    
T  17662692 ttcttcaa 17662699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Original strand, 17713518 - 17713725
Alignment:
Q  99 gtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcg 198  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| || | | |||  |  ||||||||| ||||||||      
T  17713518 gtgcagtttcttatgcttctggccttccattggctttggaagtaataggttctcacttgtttggcaaaagtttagatgtatggaaatcttcattagataa 17713617  T
Q  199 gtatgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgc 298  Q
     ||||||||  |||     |||||||| || || || |||||||| |||| ||||| ||||||  | ||| || ||| | ||||||| |||||||||||     
T  17713618 atatgaaagagttcttcacaaagagattcatgaaattcttaaagttagctatgatgatttggatgatgatcagaagggtatttttcttgacatcgcttgt 17713717  T
Q  299 ttcttcaa 306  Q
    ||||||||    
T  17713718 ttcttcaa 17713725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 313
Target Start/End: Original strand, 16692027 - 16692302
Alignment:
Q  38 ttgaggtggaaggctttcaaaaataacaaggtcgattcaaatttcgatggtgttttgcgttgtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttag 137  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||    | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16692027 ttgaggtggaagacttttaaaaataacaaagtcgattcaagtttcgagtacattttaaaatatgttgtaacttatgcttctggccttccattagctttag 16692126  T
Q  138 aagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattccgattaaagagatccaagagatact 237  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||   ||||   || ||  | |||||    
T  16692127 aagtagtaggatctaacttgtttggaaagaatatagaagaatggaaatctacatttgatcgatatgaatggattcctggtaaacgaattcacaaaatact 16692226  T
Q  238 taaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggatat 313  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||  ||  ||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  16692227 taaagtaagttttgatagtttggaggaagatgaaaagagtgtttttttggacattgcttgttgcttcaaaggatat 16692302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 110 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28126625 - 28126381
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||| |||||||| || | | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||   | |||||||| | ||||||| ||    
T  28126625 tatgcttcaggccttcccttagttatagaaatagtgggttccaacttatttggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaaga 28126526  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  28126525 ttccaaataaaaagatccaagagatatttaaactaagctatgatgctttggaggaagatgagcaaagtgtctttctcgatatagcttgctgcttcaaagg 28126426  T
Q  310 atataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatgg 354  Q
     |||| ||||| |||  ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  28126425 gtatagattgacagaggttgaaaagatacttcatgctcattatgg 28126381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 267301 - 267087
Alignment:
Q  99 gtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcg 198  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||  |||| ||| |||||   | |||||||| |    
T  267301 gtgcagttgcttatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttctaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagatgg 267202  T
Q  199 gtatgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgc 298  Q
    |||||| | |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||  |||| ||||||  ||| ||| | ||||| |||||     
T  267201 gtatgataagattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgatggtttggaagaagaggagcagagtgtctttttagacattgcttgt 267102  T
Q  299 ttcttcaaaggatat 313  Q
    | |||||||||||||    
T  267101 tgcttcaaaggatat 267087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Original strand, 26137120 - 26137271
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  || |  ||| ||| ||||| ||||| |   |||||||||||    
T  26137120 tatgcttctggccttccgttagctttagaagtagtgggttccagcttgtttggaaagtgtacaacagaatgggaatctacattacagaagtatgaaagga 26137219  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    ||||   | |||| |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26137220 ttccacatgaagatatccaaaacatacttagagtaagctatgatgctttgga 26137271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28132426 - 28132288
Alignment:
Q  135 tagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattccgattaaagagatccaagagat 234  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||  |||| ||| ||||| | | |||||||| | ||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||    
T  28132426 tagaaatagtgggttcaaacttatttggaaagagcatagaagaatggaagtgtacattagatggatatgaaaagattcctaataaaaagatccatgagat 28132327  T
Q  235 acttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagca 273  Q
    | |||||||||| |  |||||||||||| |||| |||||    
T  28132326 atttaaagtaagttacgatgctttggaggaagaggagca 28132288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5922418 - 5922216
Alignment:
Q  111 atgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggat 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| |||   || |   ||| | | || |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5922418 atgcttctggccttcctttggctttagaagtaataggttctcacttatttcataaaacagtagaacaatgtaaatctacattagatcgttatgaaaggat 5922319  T
Q  211 tccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagga 310  Q
    |||   |||| |||| |||  | | || ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |   ||||||||| || || ||||| | ||||||||||    
T  5922318 tcctgataaaaagatgcaaacgttgctaaaagtgagctttgatgctttggaagaagaagagaaaagtgtttttcttgatattgcttgttgcttcaaagga 5922219  T
Q  311 tat 313  Q
    |||    
T  5922218 tat 5922216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5089906 - 5089696
Alignment:
Q  104 gtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||| | | |||||||||  | |||||  |||||    
T  5089906 gtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagttgtgggttccaatttgtttggaaaggatatagaaaaatggaaatctttactagatgagtatg 5089807  T
Q  204 aaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttctt 303  Q
    |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| ||  ||| |   || ||||||||  |||||| |||||||| ||||| |  ||    
T  5089806 aaaggattcctaataaagaaatccaaaagatacttatagtgagctttaataatttaggtgaatatgagcagagtgttttcctcgacattgcttgttgttt 5089707  T
Q  304 caaaggatata 314  Q
    |||||||||||    
T  5089706 caaaggatata 5089696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18678506 - 18678355
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||  | ||| ||||||||  ||||||||| |    
T  18678506 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatttcagaatgtgagtctacattagataagtatgaaagaa 18678407  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    ||||   | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18678406 ttccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 18678355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18723031 - 18722881
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  | ||| ||||||||  ||||||||| |    
T  18723031 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagatatgtatgaaagaa 18722932  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgg 260  Q
    ||||   | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18722931 ttccagatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgg 18722881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18654423 - 18654272
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||| ||||||||  ||||||||| |    
T  18654423 tatgcttctggccttccattagctatagaagtcgtgggttccaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgaatctacattagataagtatgaaagaa 18654324  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    ||||   | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18654323 ttccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagttttgatgctttgga 18654272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18698346 - 18698195
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | | ||| ||  | ||| ||||||||  ||||||||| |    
T  18698346 tatgcttctggccttccattagctctagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagttttgcagaatgtgactctacattagataagtatgaaagaa 18698247  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    ||||   | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18698246 ttccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 18698195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18730450 - 18730299
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | | ||| ||  | ||| ||||||||  ||||||||| |    
T  18730450 tatgcttctggccttccattagctctagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagttttgcagaatgtgattctacattagataagtatgaaagaa 18730351  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    ||||   | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18730350 ttccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 18730299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18688572 - 18688421
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||| ||  | ||| ||||||||  |||| |||| |    
T  18688572 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaa 18688473  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    |||| |   |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18688472 ttccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 18688421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 355
Target Start/End: Original strand, 18074991 - 18075238
Alignment:
Q  108 cttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaag 207  Q
    |||||||||||||||||||  | | | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||   | |||||||| |||||||||     
T  18074991 cttatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgcaagaatacattagattggtatgaaaa 18075090  T
Q  208 gattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaa 307  Q
    |||||| | |||||||||||||   ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||   ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  18075091 gattcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaa 18075190  T
Q  308 ggatataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatggt 355  Q
    || | ||||| | || |  |  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  18075191 ggttgtaaatgggaaaaggtcaaagaaatacttcatgctcattatggt 18075238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1870
Description:

Target: scaffold1870; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 354
Target Start/End: Original strand, 1 - 245
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||   | |||||||| | ||||||| ||    
T  1 tatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaaga 100  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||   ||||||||| ||||| || || | |||||||||    
T  101 ttcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaagg 200  T
Q  310 atataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatgg 354  Q
    || |  || ||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  201 atgtggatggaaggagtttgaagatatactacgtgctcattatgg 245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 302
Target Start/End: Original strand, 35984520 - 35984723
Alignment:
Q  99 gtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcg 198  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||| || ||||||||||   ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  35984520 gtgcagtagcatatgcttctggacttccattggctttgatagtaataggttccaatttatttggaaagacagtacaagagtgggaatctgcattacaccg 35984619  T
Q  199 gtatgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgc 298  Q
    ||||||||  ||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||| |||||     
T  35984620 gtatgaaaccattcctaataaagacatccaaaagatacttaaagtaagttttgatgctttagaggaagatgagcaaagtgtttttcttgacattgcttgt 35984719  T
Q  299 ttct 302  Q
    ||||    
T  35984720 ttct 35984723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 297
Target Start/End: Original strand, 31906275 - 31906473
Alignment:
Q  99 gtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcg 198  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||   |||  | |||||||| || |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  31906275 gtgcagtaggttatgcttctggacttccattggctttgatagttattggttccaatttatttggaaagaatatacaagaatgggaatctgcattacatcg 31906374  T
Q  199 gtatgaaaggattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttg 297  Q
     |||||||  ||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||    
T  31906375 atatgaaatcattccaaataaagagatccaaaatatactcaaagtaagttttgatgctttggaggaagatgagaaaagtgtttttcttgacatggcttg 31906473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29272874 - 29272637
Alignment:
Q  24 aagctcttaaattgttgaggtggaaggctttcaaaaataacaaggtcgattcaaatttcgatggtgttttgcgttgtgcagtaacttatgcttctggcct 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||   ||||| ||  || |  |||||   | |||||||  | |||||||| |||||    
T  29272874 aagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaatttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggcct 29272775  T
Q  124 tccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaaggattccgattaaagag 223  Q
    ||| || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||   | |||||||| | ||||||| |||||| | ||||  |    
T  29272774 tcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagaggatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaagg 29272675  T
Q  224 atccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttgga 261  Q
    |||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29272674 atccaccagatacttaaagtaagttatgatgctttgga 29272637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16353906 - 16353855
Alignment:
Q  109 ttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgttt 160  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16353906 ttatgcttccaggcttccattggctttggaagtaataggttccaacttgttt 16353855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16353798 - 16353660
Alignment:
Q  217 taaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggatataaa 316  Q
    |||||||||| | || || ||||||||||||| || | | |||||  |||||||| || | |||||||| ||||| |||||||  ||| |||||| ||||    
T  16353798 taaagagatcgatgacattcttaaagtaagctatgtttccttggatgaagatgagaagaaagtttttcttgacattgcttgctgtttcgaaggatgtaaa 16353699  T
Q  317 ttgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatggt 355  Q
    |||   ||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  16353698 ttgtctgatgttgaaaatatactacatgctcatcatggt 16353660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 354
Target Start/End: Original strand, 8719 - 8963
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||   | |||||||| | ||||||| ||    
T  8719 tatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaaga 8818  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||   ||||||||| ||||| || || | |||||||||    
T  8819 ttcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaagg 8918  T
Q  310 atataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatgg 354  Q
    || |  || ||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8919 atgtggatggaaggagtttgaagatatactacgtgctcattatgg 8963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12625 - 12381
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||   | |||||||| | ||||||| ||    
T  12625 tatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaaga 12526  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||   ||||||||| ||||| || || | |||||||||    
T  12525 ttcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaagg 12426  T
Q  310 atataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatgg 354  Q
    || |  || ||| ||  ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  12425 atgtggatggaaggagtttgaatatatacttcgtgctcattatgg 12381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3662 - 3461
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||   | |||||||| | ||||||| ||    
T  3662 tatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaaga 3563  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | |||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||   ||||||||| ||||| || || | |||||||||    
T  3562 ttcccaataaaaagatccaccagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaagg 3463  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  3462 at 3461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2489 - 2282
Alignment:
Q  110 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaagga 209  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||| |||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||  || |||||   | |||||||| ||||||| ||||    
T  2489 tatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttatctggaaagaacatagaggaatggaagaatacattagatgggtatgacagga 2390  T
Q  210 ttccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaagg 309  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||   ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||| |    
T  2389 ttcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaag 2290  T
Q  310 atataaat 317  Q
    || |||||    
T  2289 atgtaaat 2282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 355
Target Start/End: Original strand, 60799 - 61046
Alignment:
Q  108 cttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtaggttccaacttgtttggaaagaatataggagagtggaaatctgcattagatcggtatgaaag 207  Q
    |||||||||||||||||||  | | | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||   | |||||||| |||||||||     
T  60799 cttatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgcaagaatacattagattggtatgaaaa 60898  T
Q  208 gattccgattaaagagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaa 307  Q
    |||||| | |||||||||||||   ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||   ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  60899 gattcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaa 60998  T
Q  308 ggatataaattgaaagaacttgaagatatactgcatgctcattatggt 355  Q
    || | ||||| | || |  |  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  60999 ggttgtaaatgggaaaaggtcaaagaaatacttcatgctcattatggt 61046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 355
Target Start/End: Original strand, 615163 - 615273
Alignment:
Q  245 agctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggatataaattgaaagaacttgaagatatactgcatg 344  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||  ||  ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||  ||||||| |    ||||||| ||||| ||||    
T  615163 agctttgatgccttgcagaaagaagaaaagtttgtttttcttgacattgcttgttgcttcaaaggatggaaattgacaagggttgaagaaatacttcatg 615262  T
Q  345 ctcattatggt 355  Q
    |||||||||||    
T  615263 ctcattatggt 615273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5916656 - 5916586
Alignment:
Q  236 cttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaa 306  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5916656 cttaaagttagctatgatgatttggatgaagatgagaagggtatttttctagacatcgcttgtttcttcaa 5916586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 355
Target Start/End: Original strand, 67665 - 67790
Alignment:
Q  230 gagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcaggatgtttttctcgacatcgcttgcttcttcaaaggatataaattgaaagaacttg 329  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||| |||||   |||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||   ||| ||||| |      
T  67665 gagattcttaaagtgagcttcgatgatttggtccaagatgataaagatgtttttcttgacatagcttgtttcttcaaaggacattgtttggaagaagtca 67764  T
Q  330 aagatatactgcatgctcattatggt 355  Q
    || | ||||| |||||||||||||||    
T  67765 aaaaaatacttcatgctcattatggt 67790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University