View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF14715_low_1 (Length: 732)
Name: NF14715_low_1
Description: NF14715
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF14715_low_1 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 716; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 716; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 12899277 - 12898562
Alignment:
| Q |
1 |
atgtagatagttatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttacatgtttcctac |
100 |
Q |
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| T |
12899277 |
atgtagatagttatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttacatgtttcctac |
12899178 |
T |
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| Q |
101 |
ccttgatagggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatttgcgttgcatttccaaatacaccatt |
200 |
Q |
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| T |
12899177 |
ccttgatagggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatttgcgttgcatttccaaatacaccatt |
12899078 |
T |
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| Q |
201 |
tgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgattt |
300 |
Q |
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| T |
12899077 |
tgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgattt |
12898978 |
T |
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| Q |
301 |
cttgaaaagtctaaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaaagaatatattctatgcttg |
400 |
Q |
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| T |
12898977 |
cttgaaaagtctaaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaaagaatatattctatgcttg |
12898878 |
T |
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| Q |
401 |
tacattcaccaatttctatcggaatatcaccagatagatgattcccagagacatctaatcctttaatattttttaacatacccacttctcttggtaaagt |
500 |
Q |
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| T |
12898877 |
tacattcaccaatttctatcggaatatcaccagatagatgattcccagagacatctaatcctttaatattttttaacatacccacttctcttggtaaagt |
12898778 |
T |
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| Q |
501 |
accgctcaaagagttatgtgacaagttcaataacattgataaagaaaaaagatttaaaacctctgcaggtatggttcctctaagcttattatgagaaaga |
600 |
Q |
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| T |
12898777 |
accgctcaaagagttatgtgacaagttcaataacattgataaagaaaaaagatttaaaacctctgcaggtatggttcctctaagcttattatgagaaaga |
12898678 |
T |
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| Q |
601 |
tctagatattgtaaatgtagacagtttccaatgcttggaggaatacttccttgaaacatattatgatttaattgtaatttaaacaactgactgagattgc |
700 |
Q |
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| T |
12898677 |
tctagatattgtaaatgtagacagtttccaatgcttggaggaatacttccttgaaacatattatgatttaattgtaatttaaacaactgactgagattgc |
12898578 |
T |
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| Q |
701 |
ctatgaagggtggaat |
716 |
Q |
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| T |
12898577 |
ctatgaagggtggaat |
12898562 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 12906897 - 12906182
Alignment:
| Q |
1 |
atgtagatagttatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttacatgtttcctac |
100 |
Q |
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| T |
12906897 |
atgtagatagttatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatgactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctac |
12906798 |
T |
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| Q |
101 |
ccttgatagggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatttgcgttgcatttccaaatacaccatt |
200 |
Q |
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| T |
12906797 |
ccttgatagagcatggtggtagatgcaggtgggaaatgcctccacaaagctttttgtttccaatcaattctatttgggttgaatttccaaataaaccttt |
12906698 |
T |
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| Q |
201 |
tgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgattt |
300 |
Q |
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| T |
12906697 |
tgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgattt |
12906598 |
T |
|
| Q |
301 |
cttgaaaagtctaaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaaagaatatattctatgcttg |
400 |
Q |
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| T |
12906597 |
cttgaaaggtctaaatatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttccgttaaaggagttcctttgcaaatgaatatattctaagcttg |
12906498 |
T |
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| Q |
401 |
tacattcaccaatttctatcggaatatcaccagatagatgattcccagagacatctaatcctttaatattttttaacatacccacttctcttggtaaagt |
500 |
Q |
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| T |
12906497 |
tacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaattctgcaatattttttaacatacccacttctcttggtaaagt |
12906398 |
T |
|
| Q |
501 |
accgctcaaagagttatgtgacaagttcaataacattgataaagaaaaaagatttaaaacctctgcaggtatggttcctctaagcttattatgagaaaga |
600 |
Q |
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| T |
12906397 |
accgctcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaacagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaagcttattatgagacaga |
12906298 |
T |
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| Q |
601 |
tctagatattgtaaatgtagacagtttccaatgcttggaggaatacttccttgaaacatattatgatttaattgtaatttaaacaactgactgagattgc |
700 |
Q |
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| T |
12906297 |
tctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaatactaatttaaacaattgactgagattgc |
12906198 |
T |
|
| Q |
701 |
ctatgaagggtggaat |
716 |
Q |
| |
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| T |
12906197 |
ctatgaagggtggaat |
12906182 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 12931986 - 12931271
Alignment:
| Q |
1 |
atgtagatagttatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttacatgtttcctac |
100 |
Q |
| |
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| T |
12931986 |
atgtagatagttatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactagcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctac |
12931887 |
T |
|
| Q |
101 |
ccttgatagggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatttgcgttgcatttccaaatacaccatt |
200 |
Q |
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| T |
12931886 |
ccttgatagggcatggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcaagtctatttgggttgcatttccaaatacaccatt |
12931787 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgattt |
300 |
Q |
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| T |
12931786 |
tgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaacattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgattt |
12931687 |
T |
|
| Q |
301 |
cttgaaaagtctaaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaaagaatatattctatgcttg |
400 |
Q |
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| T |
12931686 |
cttgaaaggtctaaatatcgaagacctttgagaaaagtcaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaatgaatatattctaagcttg |
12931587 |
T |
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| Q |
401 |
tacattcaccaatttctatcggaatatcaccagatagatgattcccagagacatctaatcctttaatattttttaacatacccacttctcttggtaaagt |
500 |
Q |
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| T |
12931586 |
tacattcaccaatttctctaggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaatgcttcaatattttttaacatacccacttctcttggtaagct |
12931487 |
T |
|
| Q |
501 |
accgctcaaagagttatgtgacaagttcaataacattgataaagaaaaaagatttaaaacctctgcaggtatggttcctctaagcttattatgagaaaga |
600 |
Q |
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| T |
12931486 |
accacttaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaagcttattatgagaaaga |
12931387 |
T |
|
| Q |
601 |
tctagatattgtaaatgtagacagtttccaatgcttggaggaatacttccttgaaacatattatgatttaattgtaatttaaacaactgactgagattgc |
700 |
Q |
| |
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| T |
12931386 |
tcaagagattgtaaattttgacagtttcctatgcttggaggaatacttccttgaaacatattatgatttaattctaaataatacaattgactgagattgc |
12931287 |
T |
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| Q |
701 |
ctatgaagggtggaat |
716 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
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| T |
12931286 |
ctatgaagggtggaat |
12931271 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 12948351 - 12947636
Alignment:
| Q |
1 |
atgtagatagttatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttacatgtttcctac |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12948351 |
atgtagatagttatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatccctgctatcaacctgaacttttgttgctttgcatgtttcctac |
12948252 |
T |
|
| Q |
101 |
ccttgatagggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatttgcgttgcatttccaaatacaccatt |
200 |
Q |
| |
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| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12948251 |
cattgatagggcatggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacatagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatt |
12948152 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgattt |
300 |
Q |
| |
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|
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| T |
12948151 |
tgtcggtatctctcctaccaacatgttaaaagaaacattcaaatactctaaaacagagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgattt |
12948052 |
T |
|
| Q |
301 |
cttgaaaagtctaaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaaagaatatattctatgcttg |
400 |
Q |
| |
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|
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| T |
12948051 |
cttgaaaggtctaaatatcgaagacctttgagaaaagtcaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaatgaatatattctaagcttg |
12947952 |
T |
|
| Q |
401 |
tacattcaccaatttctatcggaatatcaccagatagatgattcccagagacatctaatcctttaatattttttaacatacccacttctcttggtaaagt |
500 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
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| T |
12947951 |
tacattcaccaatttctctaggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaatgcttcaatattttttaacatacccacttctcttggtaagct |
12947852 |
T |
|
| Q |
501 |
accgctcaaagagttatgtgacaagttcaataacattgataaagaaaaaagatttaaaacctctgcaggtatggttcctctaagcttattatgagaaaga |
600 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
12947851 |
accactcaaagagttatgtgacaagttcaatatctttgataaagaaaaaatatttaaaacttcaacaggtatggttcctctaagcttattatgagaaaga |
12947752 |
T |
|
| Q |
601 |
tctagatattgtaaatgtagacagtttccaatgcttggaggaatacttccttgaaacatattatgatttaattgtaatttaaacaactgactgagattgc |
700 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
12947751 |
taaagagattgtaaattttgacagtttcctatgcttggaggaatacttccttgaaacatattatgatttaattctaaatcaaacaattgactgagattgc |
12947652 |
T |
|
| Q |
701 |
ctatgaagggtggaat |
716 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
12947651 |
ctatgaagggtggaat |
12947636 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 12957785 - 12957073
Alignment:
| Q |
1 |
atgtagatagttatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttacatgtttcctac |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12957785 |
atgtagatagttatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccgcactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgctttgcatgtttcctac |
12957686 |
T |
|
| Q |
101 |
ccttgatagggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatttgcgttgcatttccaaatacaccatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12957685 |
ccttgatagggcatggtggtagatgcagatgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttggcttgcatttccaaatacaccatt |
12957586 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgattt |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12957585 |
tgtcggtacctctccttccaatatgttaaaagaaacattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgattt |
12957486 |
T |
|
| Q |
301 |
cttgaaaagtctaaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaaagaatatattctatgcttg |
400 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |
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|
| T |
12957485 |
cttgaaacgtctaaatattgaagacctttgagagaagctaaagaggacggtattgttccattgaagatgttcctttgcaaacgaatatattctaagattg |
12957386 |
T |
|
| Q |
401 |
tacattcaccaatttctatcggaatatcaccagatagatgattcccagagacatctaatcctttaatattttttaacatacccacttctcttggtaaagt |
500 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
12957385 |
tacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaaatcttcaatattttttaacatacccacttctgttggtaaggt |
12957286 |
T |
|
| Q |
501 |
accgctcaaagagttatgtgacaagttcaataacattgataaagaaaaaagatttaaaacctctgcaggtatggttcctctaagcttattatgagaaaga |
600 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||| | | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12957285 |
accgctcaaagagttatgtgacaggt---ctaatactaataatgaaaaaatatttaaaacctctacaggtatggttcctctaagcttattatgataaaga |
12957189 |
T |
|
| Q |
601 |
tctagatattgtaaatgtagacagtttccaatgcttggaggaatacttccttgaaacatattatgatttaattgtaatttaaacaactgactgagattgc |
700 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
12957188 |
tttagatattgtaaattttgacagtttcctatgcttggaggaatacttccttgaaacatgttatgatctaattctaatttaaacaattgactgagattcc |
12957089 |
T |
|
| Q |
701 |
ctatgaagggtggaat |
716 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12957088 |
ctatgaacggtggaat |
12957073 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 584; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 716
Target Start/End: Original strand, 17923905 - 17924620
Alignment:
| Q |
1 |
atgtagatagttatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttacatgtttcctac |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17923905 |
atgtagatagtgatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctac |
17924004 |
T |
|
| Q |
101 |
ccttgatagggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatttgcgttgcatttccaaatacaccatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17924005 |
ccttgatagggcatggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatt |
17924104 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgattt |
300 |
Q |
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17924204 |
T |
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400 |
Q |
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17924304 |
T |
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| Q |
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500 |
Q |
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17924404 |
T |
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501 |
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600 |
Q |
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17924504 |
T |
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700 |
Q |
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| T |
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17924604 |
T |
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| Q |
701 |
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716 |
Q |
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17924605 |
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17924620 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 10564732 - 10564022
Alignment:
| Q |
3 |
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102 |
Q |
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T |
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| Q |
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202 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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302 |
Q |
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303 |
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402 |
Q |
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| T |
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10564333 |
T |
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| Q |
403 |
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502 |
Q |
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T |
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| Q |
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602 |
Q |
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T |
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702 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
703 |
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Q |
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| T |
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10564022 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 713
Target Start/End: Original strand, 10763637 - 10764346
Alignment:
| Q |
3 |
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102 |
Q |
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T |
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| Q |
103 |
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202 |
Q |
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| T |
10763737 |
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T |
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| Q |
203 |
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302 |
Q |
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402 |
Q |
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10763937 |
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T |
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| Q |
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502 |
Q |
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| Q |
503 |
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601 |
Q |
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10764234 |
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| Q |
602 |
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701 |
Q |
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T |
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| Q |
702 |
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Q |
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10764335 |
tatgaagggtgg |
10764346 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 713
Target Start/End: Original strand, 10747520 - 10748229
Alignment:
| Q |
4 |
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103 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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203 |
Q |
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10747620 |
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T |
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| Q |
204 |
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303 |
Q |
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10747720 |
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10747819 |
T |
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304 |
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403 |
Q |
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10747820 |
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10747919 |
T |
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503 |
Q |
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504 |
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603 |
Q |
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10748020 |
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10748119 |
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703 |
Q |
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10748219 |
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| Q |
704 |
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713 |
Q |
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10748220 |
tgaagggtgg |
10748229 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 3 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 10611415 - 10610705
Alignment:
| Q |
3 |
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102 |
Q |
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10611415 |
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T |
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103 |
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202 |
Q |
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10611216 |
T |
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| Q |
203 |
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302 |
Q |
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10611215 |
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10611116 |
T |
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| Q |
303 |
tgaaaagtctaaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaaagaatatattctatgcttgta |
402 |
Q |
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10611016 |
T |
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| Q |
403 |
cattcaccaatttctatcggaatatcaccagatagatgattcccagagacatctaatcctttaatattttttaacatacccacttctcttggtaaagtac |
502 |
Q |
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cattcaccaactgttctaggaagataagaagatagttgattctcagatacatctagcatattaatattttttagcatacccacttctcttggtaagctac |
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T |
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| Q |
503 |
cgctcaaagagttatgtgacaagttcaataacattgataaagaaaaaagatttaaaacctctgcaggtatggttcctctaagcttattatgagaaagatc |
602 |
Q |
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10610816 |
T |
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| Q |
603 |
tagatattgtaaatgtagacagtttccaatgcttggaggaatacttccttgaaacatattatgatttaattgtaatttaaacaactgactgagattgcct |
702 |
Q |
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| T |
10610815 |
taggtattgtaacttttgacaatttcctatgcttggaggaatatttccttgaaacatgttactgtgtacagccaacctaaacaattgactgagattgcct |
10610716 |
T |
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| Q |
703 |
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713 |
Q |
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| T |
10610715 |
atgaagggtgg |
10610705 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 713
Target Start/End: Original strand, 10741218 - 10741913
Alignment:
| Q |
18 |
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117 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
118 |
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217 |
Q |
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ggtagatgcaactctgaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgagatacatttccaaatacaccatttgttggtacctctcctt |
10741417 |
T |
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| Q |
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T |
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ttgaagacctttgagagaagccatagaggatggtattgttccgctgaaggagttcccttgcaattgaaggtattctaaggttgtgcattcaccaattgtt |
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T |
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atcggaatatcaccagatagatgattcccagagacatctaatcctttaatattttttaacatacccacttctcttggtaaagtaccgctcaaagagttat |
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ctaggaatatcaccagatagacgattctcagatagatctagcatgtcaatattttttaacatacccacttctcttggtatgctaccactcaaagtgttat |
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T |
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| Q |
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gtgacaagttcaataacattgataaagaaaaaagatttaaaacctctgcaggtatggttcctctaagcttattatgagaaagatctagatattgtaaatg |
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| T |
10741718 |
gtgacaagtccaataagtttgataaagaagaaagactaaaaacctctagaggtatggatccattaaatttattataagaaagatctagtacttgtaaatt |
10741817 |
T |
|
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618 |
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713 |
Q |
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| T |
10741818 |
ttgacaatttcctatggtaggaggaatattcccttgaaacatattaaaatttaattccaaatcaaacaattgactaagatttcctataaagggtgg |
10741913 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 667
Target Start/End: Original strand, 10217256 - 10217914
Alignment:
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6 |
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103 |
Q |
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| T |
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gataattataataaatgaaagtatgataagaaaagaaaccacactaactatctcactgatatcaacctggaattatagtttgttgcatgtttcctaccgt |
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T |
|
| Q |
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tgatagggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatttgcgttgcatttccaaatacaccatttgt |
203 |
Q |
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| T |
10217356 |
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10217453 |
T |
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| Q |
204 |
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303 |
Q |
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| T |
10217454 |
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10217553 |
T |
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| Q |
304 |
gaaaagtctaaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaaagaatatattctatgcttgtac |
403 |
Q |
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| T |
10217554 |
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10217653 |
T |
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| Q |
404 |
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503 |
Q |
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| T |
10217654 |
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10217750 |
T |
|
| Q |
504 |
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603 |
Q |
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| T |
10217751 |
gctcaaaaaattatgtgacaactccaataaaattgataaggaaaaaagattaaaaatctctaagggtatgattcctctaagcttattttgagctagattt |
10217850 |
T |
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| Q |
604 |
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667 |
Q |
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| T |
10217851 |
agatattgtagatgttggcagtttcctatgcttggaggaatacttccttcaaacatattatgat |
10217914 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 385
Target Start/End: Original strand, 11049164 - 11049543
Alignment:
| Q |
6 |
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105 |
Q |
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| T |
11049164 |
gataattataataaatgaaagtatgataagaaaagaaaccacactaactatcactgataccaacctgaaattatggtttgttgcatgttttctacctttg |
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T |
|
| Q |
106 |
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205 |
Q |
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| T |
11049264 |
atagggcatgatggtagatgcaaatctgaaatacctccacaaagcttattgtttcctatcattgctacatgggttgcatttccaaagacaccgtttgttg |
11049363 |
T |
|
| Q |
206 |
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305 |
Q |
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| T |
11049364 |
gtacctcgccttccaacaggttaaaagaaacattcaagtgttttaaaccaaagatattctgtataacatttggaattgatccataaaattgatttctaga |
11049463 |
T |
|
| Q |
306 |
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385 |
Q |
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| T |
11049464 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 10604456 - 10603963
Alignment:
| Q |
4 |
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103 |
Q |
| |
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| T |
10604456 |
tagatagctatgataactgaaagtatgaaaagaaaagacaccacaccaactatcactgctatcaacctgggaaaatgattttttgtgtgcttccaacgct |
10604357 |
T |
|
| Q |
104 |
tgatagggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatttgcgttgcatttccaaatacaccatttgt |
203 |
Q |
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| T |
10604356 |
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10604257 |
T |
|
| Q |
204 |
cggtacctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttctt |
303 |
Q |
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| T |
10604256 |
tggcacctcaccttccaacatgttaaaggaaacattcaagtgttctaagctagagatattctgcaaaacatcaggaattggtccatacaattgatttctt |
10604157 |
T |
|
| Q |
304 |
gaaaagtctaaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaaagaatatattctatgcttgtac |
403 |
Q |
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| T |
10604156 |
gaaatatctaaatattgtagacctttgagagaagcaaaagaggatggtattgttccgttgaatgagttcccttgcaaacgaaggtattctaagcttatgc |
10604057 |
T |
|
| Q |
404 |
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497 |
Q |
| |
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| T |
10604056 |
attcaccaatagttccaggaatctccccacacaaatgattttcagagacatctaaccaatcaatattttttagcatacccacttcttttggtaa |
10603963 |
T |
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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 465 - 713
Target Start/End: Original strand, 10717864 - 10718112
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| Q |
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564 |
Q |
| |
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|
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| T |
10717864 |
aatattttttaacatactcacttctcttggtaagctaccactcaaagagttatgtgacaagtccaatatttttgataaataaaaaagattaaaaacctct |
10717963 |
T |
|
| Q |
565 |
gcaggtatggttcctctaagcttattatgagaaagatctagatattgtaaatgtagacagtttccaatgcttggaggaatacttccttgaaacatattat |
664 |
Q |
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| T |
10717964 |
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10718063 |
T |
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| Q |
665 |
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713 |
Q |
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| T |
10718064 |
gttctaatcgtaaatcaaacaattgactgagatttcctataaagggtgg |
10718112 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10580695 - 10580340
Alignment:
| Q |
4 |
tagatagttatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttacatgtttcctaccct |
103 |
Q |
| |
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| T |
10580695 |
tagatagctataataaatgaaagtatgagaagaaaagaaaccacactgactatcatagctatcaacttgaaattatggttttttatatgtttcctaccct |
10580596 |
T |
|
| Q |
104 |
tgatagggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatttgcgttgcatttccaaatacaccatttgt |
203 |
Q |
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| T |
10580595 |
tgaaagggcatggtggtagatgtaactctgaaataccaccacaaagtttattgtttccaattattgctactctggttgcatttccaaagacaccatctgt |
10580496 |
T |
|
| Q |
204 |
cggtacctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttctt |
303 |
Q |
| |
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| T |
10580495 |
tggtacctcaccttccaacatgttaaaagaaacatctaagtattctaaattagagatattttgcataacatcgggatttggtccaaacaatttatttctt |
10580396 |
T |
|
| Q |
304 |
gaaaagtctaaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttcc |
359 |
Q |
| |
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|
| T |
10580395 |
gaaatatctaaataccgtagacctttgagagaagcaaaagaggatggtcttgttcc |
10580340 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 413
Target Start/End: Original strand, 10717459 - 10717854
Alignment:
| Q |
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117 |
Q |
| |
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||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||| || |||| |||| || || ||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
10717459 |
aaatgaaagtatgagcaaaaaaaaaatcacactaaatatcactgctatcaacttgaaattatgtttttttgcactcttactacccttgatagggcatgat |
10717558 |
T |
|
| Q |
118 |
ggtagatgcaggtgggaaatacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatttgcgttgcatttccaaatacaccatttgtcggtacctctcctt |
217 |
Q |
| |
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| T |
10717559 |
ggtagatgcaactctgaaatacctccacaaagcttatagtttccaatcatgtctatatgggatgcatttgcaaaaacaccatctgttggtacctcacctt |
10717658 |
T |
|
| Q |
218 |
ccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaaaagtctaaata |
317 |
Q |
| |
|
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| T |
10717659 |
ccaacatgttaaaagaaacattcaagtgttctaaaccatagattttctgcataacatcaggaattggtccgtacaattgatttcttgaaaggtctaaata |
10717758 |
T |
|
| Q |
318 |
ttgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaaagaatatattctatgcttgtacattcaccaat |
413 |
Q |
| |
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| | | | || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||| ||| |||||| | ||| | ||||||||||| |
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| T |
10717759 |
tcttaaagccttgagagaagccaaagaggatggtattgttccattgatggagttcccttccaaatgaagatattccaagctcatgcattcaccaat |
10717854 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 182 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 7192531 - 7192129
Alignment:
| Q |
182 |
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281 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7192531 |
catttccaaagacaccttctgttggtacctcgccttccaacatgttgaaagaaacattcaagtgttctaaaactgatatattctgtagaacattaggaat |
7192432 |
T |
|
| Q |
282 |
tgatccagacaattgatttcttgaaaagtctaaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaa |
381 |
Q |
| |
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| T |
7192431 |
tggtccatacaaccgatttcttgacaggtctaaatattgaagacttttaactgaagccaatgaggatggtatggttccgttgaaggagtttccttgcaaa |
7192332 |
T |
|
| Q |
382 |
agaatatattctatgcttgtacattcaccaatttctatcggaatatcaccagatagatgattcccagagacatctaatcctttaatattttttaacatac |
481 |
Q |
| |
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| | ||||||| || | | ||||| ||||| || | ||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| |||||| ||||| |
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| T |
7192331 |
aagaggtattctaagcgtatgcattcgccaatggctctaggaatgtcaccagatagaagattctccgagacatctagcttgttgatactttttagcatac |
7192232 |
T |
|
| Q |
482 |
ccacttctcttggtaaagtaccgctcaaagagttatgtgacaagttcaataacattgataaagaaaaaagatttaaaacctctgcaggtatggttcctct |
581 |
Q |
| |
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| T |
7192231 |
ccacttctcttggtaggctaccactcaatgagtttcttgacaagttcagtaagtttgataacgaagaaagactgaaaacttctaagggtatggttcctct |
7192132 |
T |
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| Q |
582 |
aag |
584 |
Q |
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| T |
7192131 |
aag |
7192129 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 413
Target Start/End: Original strand, 19606476 - 19606779
Alignment:
| Q |
110 |
ggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatttgcgttgcatttccaaatacaccatttgtcggtac |
209 |
Q |
| |
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|||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | | ||||||||||| ||||| | | | || || |
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| T |
19606476 |
ggcatggtggtaggtgcagatgcgaaatacctccacaaagcttattgttcccggtcactgctaatgcactagcatttccaaagacaccttctttaggaac |
19606575 |
T |
|
| Q |
210 |
ctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaaaag |
309 |
Q |
| |
|
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| T |
19606576 |
ctctccatccaacatgttaaaagaaacattcaagtattctaaaacagaaatattttgcagaacactaggaattgatccagtcaaccgatttcttgatagg |
19606675 |
T |
|
| Q |
310 |
tctaaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaaagaatatattctatgcttgtacattcac |
409 |
Q |
| |
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| T |
19606676 |
tctaaatatcgaagacctctaagagaagctaaagaggatggtatgattccgtgaaaggagttcccttgaaaataaagatattctaagcttatgcattcac |
19606775 |
T |
|
| Q |
410 |
caat |
413 |
Q |
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| T |
19606776 |
caat |
19606779 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 183 - 529
Target Start/End: Original strand, 10652883 - 10653229
Alignment:
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atttccaaatacaccatttgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaatt |
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Q |
| |
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|
| T |
10652883 |
atttccaaagacaccttctttcggtacttctccttccaacatgttgaaagaaacattcaagtgttctaaaactgatatactttgtagaacatttggaatt |
10652982 |
T |
|
| Q |
283 |
gatccagacaattgatttcttgaaaagtctaaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaaa |
382 |
Q |
| |
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| T |
10652983 |
ggtccatacaaccgatttcttgacaagtctaaatattgaagacctttaagtgaagccaatgtggatggaatggttccgttgaacgagttcccttgcaaag |
10653082 |
T |
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| Q |
383 |
gaatatattctatgcttgtacattcaccaatttctatcggaatatcaccagatagatgattcccagagacatctaatcctttaatattttttaacatacc |
482 |
Q |
| |
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|| ||||||| | | | ||||||||||| | | ||||| ||||| ||||||| ||| | |||| |||||| | || |||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
10653083 |
aaaggtattctaagactatgcattcaccaatggttctaggaatctcacctgatagataattatcggagatatctaactcattgatatttcttagcatacc |
10653182 |
T |
|
| Q |
483 |
cacttctcttggtaaagtaccgctcaaagagttatgtgacaagttca |
529 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||| ||||| | ||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
10653183 |
cacttctctcggtaagctaccactcaatgtgttatttgacaaattca |
10653229 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Original strand, 10660694 - 10660967
Alignment:
| Q |
108 |
agggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatt-tgcgttgcatttccaaatacaccatttgtcgg |
206 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||| || |||||||||| ||||| | | || |
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|
| T |
10660694 |
agggcatggttgtagatgaagctctgaaatacctccacaaagcttattgtttccagtcacaactaacctgc-ttacatttccaaagacaccttccattgg |
10660792 |
T |
|
| Q |
207 |
tacctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaa |
306 |
Q |
| |
|
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|
| T |
10660793 |
tacctcgccttccaacatgttgaaagatacattcaagtgttttaaaactgatatattctgtagaacatttggaatcggtccagacaatcgatttcctgac |
10660892 |
T |
|
| Q |
307 |
aagtctaaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaa |
381 |
Q |
| |
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|
|
| T |
10660893 |
aagtctagatattgaagacctttaagtgaagccaatgaggatggtatggttccgttgaaagagttcccttgcaaa |
10660967 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10601436 - 10601150
Alignment:
| Q |
115 |
ggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatttgcgttgcatttccaaatacaccatttgtcggtacctctc |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| | |||||||||| | ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| |
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|
| T |
10601436 |
ggtggtagatgcaactgtgaaattcctccacaaagcttgtaatttccaatcaatgctactctggttgcatttccaaagacaccgtttgttggcacctctc |
10601337 |
T |
|
| Q |
215 |
cttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaaaagtctaa |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||| ||| || ||||| | |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10601336 |
cttccaacatgttcaag------------tattctaaaccagatatattctccataacaccaggaattggtccatacaattgatttcttgaaatatctaa |
10601249 |
T |
|
| Q |
315 |
atattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgttgaaggagttcctttgcaaaagaatatattctatgcttgtacattcaccaat |
413 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| |
|
|
| T |
10601248 |
atattgtagacctttgagagcagccaaagaggatggtattgttccgttgaaagaattctcttgcaaatgaaggtattctaagcttacatattcaccaat |
10601150 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 457
Target Start/End: Original strand, 9836866 - 9837286
Alignment:
| Q |
37 |
aaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttacatgtttcctacccttgatagggcacggtggtagatgcaggtgggaaa |
136 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||| | | |||| || |||| ||||||||| | ||||||||| | ||| |
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|
| T |
9836866 |
aaagaaatcacactaattaatactgctatcaacctaaaattgtggtgttgtgtaggttttataaagttgacagggcacggagatagatgcagctctaaaa |
9836965 |
T |
|
| Q |
137 |
tacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatttgcgttgcatttccaaatacaccatttgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaac |
236 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| | |
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|
| T |
9836966 |
ttcctccacagagcttgttgtttccagtcactgataaaccgcttgcatttttaaagacaccattgattggaacctcaccttccaacatgttgaaagatgc |
9837065 |
T |
|
| Q |
237 |
attaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaaaagtctaaatattgaagacctttaagagaa |
336 |
Q |
| |
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||| || ||||| | || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| |||| ||||| |
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| T |
9837066 |
attgaagtattctaggaaaacaatattttggagaccttcaggaattgatccagacaactgatttctagacatgtctaaatattgaagaactttgagagat |
9837165 |
T |
|
| Q |
337 |
gccaaagaggacggtattgttccgttgaag-gagttcctttgcaaaagaatatattctatgcttgtacattcaccaatttctatcggaatatcaccagat |
435 |
Q |
| |
|
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| T |
9837166 |
gccaaagtggaaggtatggttccg-tgaagagagttcccctgtaagtgaaggtattctaaacttatgcattcaccaattgttattggaatgtcacccgac |
9837264 |
T |
|
| Q |
436 |
agatgattcccagagacatcta |
457 |
Q |
| |
|
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|
| T |
9837265 |
agatgattttcagagacatcta |
9837286 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 360
Target Start/End: Original strand, 10588974 - 10589288
Alignment:
| Q |
46 |
acactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttacatgtttcctacccttgatagggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccac |
145 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||| | |||||| | |||||| | |||| || | ||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||| |
|
|
| T |
10588974 |
acactaattatcactgctaccaacttcaacttgaggtgttttgtaggttttataactttgatagggcatggcggtagatgcagctctaaaactcctccac |
10589073 |
T |
|
| Q |
146 |
agagctttttgtttccaatcacttctatt-tgcgttgcatttccaaatacaccatttgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaat |
244 |
Q |
| |
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| ||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||||||| ||| ||||| || | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || | |
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|
| T |
10589074 |
aaagcttattgtttccaatcattgctaacctgc-ttgcattttgaaagacacctttcattggaacctcaccttccaacatgttgaaagatacattgaagt |
10589172 |
T |
|
| Q |
245 |
attccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaaaagtctaaatattgaagacctttaagagaagccaaaga |
344 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
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|
| T |
10589173 |
attctaggaaaacaatattctgcaaacttgtaggaattgatccagacaactgatttcttgacatgtctaaatattgaagacctttgagagatgccaaagt |
10589272 |
T |
|
| Q |
345 |
ggacggtattgttccg |
360 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||| |
|
|
| T |
10589273 |
gaaaggtattgttccg |
10589288 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10558420 - 10558275
Alignment:
| Q |
208 |
acctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaaa |
307 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| ||||| || || | ||| ||| || |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
10558420 |
acctctccatccaacatgttaaatgaaacgttcaagtgttctaaacgagaaatattttgcagaatgttaggaattgatccagacaattgatttcttgaca |
10558321 |
T |
|
| Q |
308 |
agtctaaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtat |
353 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| | | | ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10558320 |
tgtctaaatatcgaagacctcttatataagccaaagaggaaggtat |
10558275 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 10601549 - 10601484
Alignment:
| Q |
4 |
tagatagttatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaac |
69 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10601549 |
tagatagctatgataattgaaagtatgagaagagaagacaccacaccaactatcactgccatcaac |
10601484 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 31467667 - 31467737
Alignment:
| Q |
4 |
tagatagttatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaa |
74 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
31467667 |
tagatagttaggataaatagaagtataagaagaaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacttgaa |
31467737 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 338
Target Start/End: Original strand, 31467868 - 31468001
Alignment:
| Q |
205 |
ggtacctctccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttcttg |
304 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| | || || |||||||| | ||| | |||||||||||||||||| || |||| || |
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| T |
31467868 |
ggtacctcgccttccaacatgttaaaagatacattgaagtattgtaggaaagaaatattttgtagacctttaggaattgatccagacaagtggtttcgtg |
31467967 |
T |
|
| Q |
305 |
aaaagtctaaatattgaagacctttaagagaagc |
338 |
Q |
| |
|
| | |||||||| |||||| ||||| || ||||| |
|
|
| T |
31467968 |
ataggtctaaatgttgaaggcctttcagtgaagc |
31468001 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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