View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14718_low_6 (Length: 346)

Name: NF14718_low_6
Description: NF14718
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14718_low_6
NF14718_low_6
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (197-337)||(14717605-14717745)
chr5 (197-333)||(30863257-30863393)
chr5 (197-333)||(33760471-33760607)
chr5 (197-337)||(6600137-6600277)
chr5 (197-333)||(6739956-6740092)
chr5 (197-333)||(8215904-8216040)
chr5 (197-333)||(26593281-26593417)
chr5 (197-333)||(30297750-30297886)
chr5 (201-333)||(39002030-39002162)
chr5 (197-333)||(11000729-11000865)
chr5 (197-337)||(14952324-14952464)
chr5 (197-333)||(16095961-16096096)
chr5 (197-333)||(19659502-19659638)
chr5 (197-337)||(20408533-20408673)
chr5 (197-345)||(23128914-23129062)
chr5 (197-333)||(35342184-35342320)
chr5 (197-333)||(38964115-38964250)
chr5 (201-333)||(40074954-40075086)
chr5 (197-333)||(41282346-41282482)
chr5 (197-333)||(3352003-3352139)
chr5 (197-333)||(6251976-6252112)
chr5 (197-333)||(27457198-27457334)
chr5 (197-333)||(31710286-31710422)
chr5 (197-333)||(39824560-39824696)
chr5 (197-333)||(4015875-4016011)
chr5 (197-333)||(11692148-11692284)
chr5 (197-337)||(19398194-19398334)
chr5 (197-333)||(20079259-20079395)
chr5 (201-333)||(42993522-42993654)
chr5 (201-333)||(43166274-43166406)
chr5 (201-329)||(1052541-1052669)
chr5 (197-333)||(8689576-8689712)
chr5 (197-337)||(27116100-27116240)
chr5 (197-333)||(28078406-28078542)
chr5 (197-333)||(30208403-30208539)
chr5 (235-333)||(6331381-6331479)
chr5 (217-333)||(16752120-16752236)
chr5 (201-333)||(8694870-8695002)
chr5 (197-333)||(11935450-11935585)
chr5 (217-333)||(26035367-26035483)
chr5 (217-329)||(444962-445074)
chr5 (197-333)||(27509982-27510111)
chr5 (19-78)||(15159863-15159921)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (197-333)||(33807781-33807917)
chr4 (197-333)||(8882014-8882150)
chr4 (197-333)||(42273806-42273942)
chr4 (197-333)||(55517186-55517322)
chr4 (197-332)||(49118616-49118751)
chr4 (197-333)||(26017427-26017563)
chr4 (197-333)||(28264647-28264783)
chr4 (197-337)||(32317953-32318093)
chr4 (197-333)||(40988637-40988773)
chr4 (197-333)||(4544986-4545122)
chr4 (197-333)||(12196473-12196609)
chr4 (197-337)||(23135007-23135147)
chr4 (197-333)||(31591080-31591215)
chr4 (197-333)||(31973595-31973731)
chr4 (197-337)||(48551765-48551905)
chr4 (197-333)||(48707734-48707870)
chr4 (197-332)||(44490324-44490459)
chr4 (197-331)||(32118720-32118854)
chr4 (197-333)||(5227394-5227530)
chr4 (197-333)||(11795155-11795291)
chr4 (197-333)||(17847097-17847232)
chr4 (197-333)||(28159954-28160090)
chr4 (197-333)||(28812288-28812423)
chr4 (197-337)||(30467004-30467144)
chr4 (201-333)||(19496107-19496239)
chr4 (197-333)||(24458632-24458768)
chr4 (197-333)||(30141109-30141245)
chr4 (197-333)||(33174021-33174157)
chr4 (197-333)||(35930044-35930179)
chr4 (197-333)||(48149503-48149639)
chr4 (197-332)||(39995168-39995303)
chr4 (197-335)||(25734224-25734362)
chr4 (197-333)||(2055282-2055418)
chr4 (197-333)||(14564800-14564936)
chr4 (197-333)||(23553069-23553204)
chr4 (197-333)||(15985014-15985150)
chr4 (197-333)||(17993018-17993154)
chr4 (197-333)||(37381850-37381986)
chr4 (197-333)||(50542355-50542491)
chr4 (198-333)||(10588584-10588719)
chr4 (197-333)||(50276139-50276272)
chr4 (197-333)||(9339124-9339263)
chr4 (197-333)||(22298521-22298658)
chr4 (217-333)||(24623152-24623268)
chr4 (197-305)||(31208776-31208884)
chr4 (197-333)||(33693334-33693470)
chr4 (197-333)||(39700049-39700185)
chr4 (197-333)||(51371048-51371184)
chr4 (217-333)||(19168816-19168932)
chr4 (197-337)||(25730240-25730380)
chr4 (256-333)||(56555200-56555277)
chr4 (197-277)||(20534225-20534305)
chr4 (217-321)||(42549643-42549747)
chr4 (197-226)||(56555166-56555195)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (197-337)||(37838297-37838437)
chr2 (197-333)||(16246194-16246330)
chr2 (197-333)||(27328588-27328724)
chr2 (197-333)||(40854613-40854749)
chr2 (197-333)||(921026-921162)
chr2 (197-333)||(28650427-28650563)
chr2 (197-333)||(34253146-34253282)
chr2 (202-333)||(771981-772112)
chr2 (197-333)||(11949427-11949563)
chr2 (197-333)||(41500503-41500639)
chr2 (197-332)||(33865268-33865403)
chr2 (197-333)||(1106560-1106696)
chr2 (197-333)||(7378967-7379103)
chr2 (197-333)||(9276578-9276714)
chr2 (197-333)||(17134233-17134369)
chr2 (197-337)||(17484551-17484691)
chr2 (197-333)||(7297235-7297371)
chr2 (201-333)||(2456014-2456146)
chr2 (201-333)||(36211050-36211182)
chr2 (197-333)||(36444229-36444365)
chr2 (197-333)||(38751052-38751188)
chr2 (197-332)||(19180427-19180561)
chr2 (203-333)||(3430631-3430761)
chr2 (197-333)||(2056930-2057066)
chr2 (201-333)||(2314980-2315112)
chr2 (197-325)||(33106970-33107098)
chr2 (197-329)||(42629970-42630102)
chr2 (197-333)||(43249413-43249549)
chr2 (197-333)||(2094411-2094547)
chr2 (197-333)||(8899686-8899821)
chr2 (197-333)||(12759751-12759886)
chr2 (201-333)||(25087801-25087933)
chr2 (201-333)||(29737752-29737884)
chr2 (197-333)||(37732194-37732330)
chr2 (197-333)||(45124123-45124259)
chr2 (217-333)||(8396572-8396688)
chr2 (233-337)||(37654108-37654212)
chr2 (236-333)||(41178059-41178156)
chr2 (217-333)||(19916008-19916124)
chr2 (197-333)||(9331760-9331896)
chr2 (197-288)||(14630663-14630754)
chr2 (197-286)||(23671812-23671901)
chr2 (281-333)||(23672958-23673010)
[»] chr1 (63 HSPs)
chr1 (197-333)||(46825535-46825671)
chr1 (197-337)||(49094712-49094852)
chr1 (197-333)||(12143076-12143212)
chr1 (197-333)||(23767415-23767551)
chr1 (197-333)||(41106020-41106156)
chr1 (197-333)||(7651666-7651802)
chr1 (197-333)||(19315644-19315780)
chr1 (197-333)||(25988272-25988408)
chr1 (197-333)||(28425364-28425500)
chr1 (197-333)||(36157679-36157814)
chr1 (197-333)||(38473627-38473763)
chr1 (197-333)||(7553017-7553153)
chr1 (197-337)||(8141487-8141627)
chr1 (197-333)||(49814304-49814440)
chr1 (197-333)||(7608767-7608903)
chr1 (197-337)||(9962751-9962891)
chr1 (197-333)||(18892333-18892469)
chr1 (197-333)||(19274563-19274699)
chr1 (197-333)||(26549392-26549528)
chr1 (197-333)||(33325731-33325867)
chr1 (197-333)||(33674021-33674157)
chr1 (197-333)||(46051454-46051590)
chr1 (197-337)||(48669397-48669537)
chr1 (197-335)||(45350718-45350854)
chr1 (197-337)||(45670487-45670627)
chr1 (197-333)||(23228195-23228331)
chr1 (197-333)||(26069896-26070032)
chr1 (197-337)||(34971080-34971220)
chr1 (197-337)||(37216896-37217036)
chr1 (197-333)||(48802332-48802468)
chr1 (199-333)||(24204474-24204608)
chr1 (198-335)||(41982237-41982374)
chr1 (197-337)||(9878785-9878925)
chr1 (197-337)||(21965065-21965205)
chr1 (197-333)||(36781173-36781309)
chr1 (197-333)||(46095076-46095212)
chr1 (197-333)||(50533387-50533523)
chr1 (197-333)||(50689947-50690083)
chr1 (197-333)||(52146997-52147133)
chr1 (197-332)||(5400876-5401010)
chr1 (197-333)||(16705874-16706010)
chr1 (197-333)||(52349925-52350061)
chr1 (197-333)||(17983899-17984035)
chr1 (197-337)||(18782090-18782230)
chr1 (197-333)||(43396679-43396815)
chr1 (217-337)||(48319067-48319187)
chr1 (197-333)||(52067652-52067788)
chr1 (233-333)||(12964650-12964750)
chr1 (197-332)||(18917529-18917664)
chr1 (216-337)||(9974842-9974963)
chr1 (197-333)||(40721346-40721483)
chr1 (197-333)||(6711444-6711580)
chr1 (217-333)||(33194672-33194788)
chr1 (197-337)||(21929521-21929666)
chr1 (217-333)||(16506809-16506925)
chr1 (197-337)||(25800644-25800781)
chr1 (197-337)||(33714362-33714500)
chr1 (217-333)||(30281635-30281751)
chr1 (197-297)||(44978769-44978868)
chr1 (259-333)||(50099224-50099298)
chr1 (289-333)||(44979281-44979325)
chr1 (293-333)||(32373650-32373690)
chr1 (293-333)||(17989864-17989904)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (197-337)||(37933642-37933782)
chr8 (197-332)||(15847117-15847252)
chr8 (197-337)||(38107099-38107239)
chr8 (197-333)||(513312-513447)
chr8 (197-333)||(2533276-2533412)
chr8 (197-337)||(259978-260117)
chr8 (197-337)||(655804-655943)
chr8 (197-337)||(841539-841678)
chr8 (197-333)||(3875912-3876048)
chr8 (197-333)||(35443315-35443451)
chr8 (197-333)||(36400071-36400207)
chr8 (197-333)||(1293490-1293626)
chr8 (201-333)||(9056343-9056475)
chr8 (197-333)||(28707447-28707583)
chr8 (197-333)||(35884431-35884567)
chr8 (197-333)||(43806534-43806670)
chr8 (197-322)||(41536528-41536653)
chr8 (197-337)||(440840-440980)
chr8 (197-333)||(22683989-22684125)
chr8 (197-333)||(38633711-38633847)
chr8 (197-337)||(40301894-40302034)
chr8 (197-335)||(38208754-38208893)
chr8 (197-328)||(13797098-13797228)
chr8 (197-332)||(28496356-28496490)
chr8 (197-337)||(4649150-4649290)
chr8 (197-333)||(24430572-24430708)
chr8 (197-333)||(33651845-33651981)
chr8 (201-333)||(12010553-12010688)
chr8 (217-333)||(7434890-7435006)
chr8 (217-333)||(23935237-23935353)
chr8 (197-321)||(23972296-23972420)
chr8 (201-332)||(39513344-39513475)
chr8 (217-333)||(6016209-6016325)
chr8 (197-333)||(42988228-42988363)
chr8 (197-333)||(36218782-36218917)
chr8 (217-333)||(29485291-29485406)
chr8 (259-333)||(24193356-24193429)
chr8 (197-261)||(24193131-24193195)
chr8 (272-331)||(8137180-8137239)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (197-333)||(1469494-1469630)
chr7 (197-333)||(47281125-47281261)
chr7 (197-337)||(33884319-33884459)
chr7 (197-333)||(38427564-38427700)
chr7 (197-333)||(44544413-44544549)
chr7 (197-333)||(47219149-47219285)
chr7 (197-333)||(47294292-47294428)
chr7 (201-333)||(8162717-8162849)
chr7 (197-333)||(31684135-31684271)
chr7 (197-333)||(35600123-35600259)
chr7 (197-337)||(37393999-37394139)
chr7 (197-333)||(47271985-47272121)
chr7 (201-337)||(4923216-4923352)
chr7 (197-337)||(11050262-11050402)
chr7 (197-333)||(11476557-11476693)
chr7 (197-333)||(23842309-23842445)
chr7 (197-333)||(30798369-30798505)
chr7 (197-333)||(30876263-30876399)
chr7 (197-333)||(40851278-40851414)
chr7 (197-324)||(2960641-2960768)
chr7 (197-333)||(43752777-43752913)
chr7 (197-333)||(27364340-27364476)
chr7 (197-333)||(41113381-41113517)
chr7 (197-333)||(42979339-42979475)
chr7 (197-333)||(43968260-43968396)
chr7 (197-333)||(45723492-45723628)
chr7 (197-333)||(48628809-48628945)
chr7 (197-314)||(221298-221415)
chr7 (197-332)||(7336065-7336199)
chr7 (197-332)||(29248347-29248482)
chr7 (197-333)||(41139409-41139549)
chr7 (201-336)||(44800415-44800550)
chr7 (217-335)||(37354284-37354402)
chr7 (197-333)||(30971942-30972078)
chr7 (201-333)||(47579091-47579224)
chr7 (217-333)||(3797544-3797660)
chr7 (197-337)||(18353144-18353284)
chr7 (197-333)||(47119995-47120133)
chr7 (217-333)||(27774112-27774228)
chr7 (248-333)||(40520922-40521007)
chr7 (277-333)||(39034066-39034122)
chr7 (197-246)||(42888940-42888989)
chr7 (294-330)||(43025119-43025155)
chr7 (286-325)||(12583313-12583352)
chr7 (288-333)||(29739785-29739829)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (197-333)||(1687655-1687791)
chr3 (197-337)||(35346472-35346612)
chr3 (197-333)||(1017048-1017184)
chr3 (197-337)||(10618481-10618621)
chr3 (197-333)||(20086315-20086451)
chr3 (197-333)||(20813442-20813578)
chr3 (197-333)||(21564500-21564636)
chr3 (197-333)||(33151700-33151836)
chr3 (197-333)||(21656522-21656658)
chr3 (197-337)||(21890170-21890310)
chr3 (201-333)||(36314977-36315109)
chr3 (197-333)||(38446480-38446616)
chr3 (197-333)||(50287570-50287706)
chr3 (197-332)||(20760072-20760207)
chr3 (197-332)||(42016878-42017013)
chr3 (197-333)||(31122666-31122802)
chr3 (197-337)||(32650821-32650961)
chr3 (197-331)||(26455588-26455722)
chr3 (197-333)||(3697150-3697286)
chr3 (201-333)||(19664545-19664677)
chr3 (201-333)||(41250890-41251022)
chr3 (197-333)||(42107100-42107236)
chr3 (197-333)||(47329176-47329312)
chr3 (197-333)||(51562166-51562302)
chr3 (202-333)||(22852000-22852131)
chr3 (197-332)||(35608132-35608267)
chr3 (204-333)||(12748395-12748524)
chr3 (197-333)||(20913755-20913891)
chr3 (197-333)||(20921873-20922009)
chr3 (197-333)||(29677480-29677616)
chr3 (197-333)||(37247960-37248096)
chr3 (197-337)||(40922166-40922306)
chr3 (197-333)||(44798272-44798407)
chr3 (197-333)||(52821050-52821186)
chr3 (233-333)||(19268525-19268625)
chr3 (197-333)||(48651252-48651388)
chr3 (197-333)||(53925980-53926116)
chr3 (197-333)||(1448736-1448869)
chr3 (197-333)||(27070740-27070876)
chr3 (197-333)||(53196018-53196154)
chr3 (201-333)||(55164120-55164252)
chr3 (197-333)||(45380261-45380397)
chr3 (217-333)||(50977868-50977984)
chr3 (217-333)||(51081000-51081116)
chr3 (217-333)||(51475267-51475383)
chr3 (197-333)||(39069730-39069866)
chr3 (237-333)||(28699689-28699785)
chr3 (197-333)||(33473240-33473376)
chr3 (217-333)||(50364908-50365024)
chr3 (201-322)||(38924003-38924124)
chr3 (260-333)||(44152704-44152777)
chr3 (217-333)||(34019464-34019580)
chr3 (273-333)||(47473234-47473294)
chr3 (233-306)||(42641215-42641288)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (197-333)||(118-254)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (197-333)||(6503722-6503858)
chr6 (197-337)||(17943036-17943176)
chr6 (197-337)||(30379017-30379157)
chr6 (201-333)||(1915348-1915480)
chr6 (197-333)||(3408193-3408329)
chr6 (197-333)||(10256241-10256377)
chr6 (197-337)||(26393010-26393150)
chr6 (197-333)||(2390269-2390405)
chr6 (197-333)||(2707463-2707599)
chr6 (197-333)||(8178250-8178386)
chr6 (197-333)||(12626640-12626776)
chr6 (197-337)||(17428273-17428413)
chr6 (197-333)||(29050276-29050412)
chr6 (197-333)||(9382523-9382659)
chr6 (197-333)||(11133877-11134014)
chr6 (197-333)||(1077241-1077377)
chr6 (197-333)||(26230933-26231069)
chr6 (197-331)||(3258808-3258942)
chr6 (197-326)||(2598100-2598229)
chr6 (197-337)||(16193310-16193450)
chr6 (216-337)||(35223919-35224040)
chr6 (197-335)||(26196322-26196460)
chr6 (217-332)||(26936612-26936727)
chr6 (197-322)||(6785102-6785224)
chr6 (197-335)||(25820550-25820688)
chr6 (197-337)||(10931149-10931292)
chr6 (197-283)||(31375971-31376057)
chr6 (197-254)||(12612972-12613029)
chr6 (197-275)||(12612849-12612927)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (197-333)||(218889-219026)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (197-335)||(5028-5166)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (197-333)||(5190-5325)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (197-333)||(252439-252575)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (197-332)||(47967-48102)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (197-337)||(13095-13235)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (197-337)||(59609-59749)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (197-335)||(11360-11498)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (217-333)||(1994-2110)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (197-277)||(599-679)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (197-277)||(1914-1994)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (197-277)||(3372-3452)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (197-277)||(1877-1957)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (284-333)||(289-338)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (287-333)||(19785-19831)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14717745 - 14717605
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
14717745 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 14717646  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14717645 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 14717605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30863393 - 30863257
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
30863393 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 30863294  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30863293 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 30863257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 33760471 - 33760607
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
33760471 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33760570  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
33760571 tagtcatctttttagtcatgacaaatggtggataatg 33760607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 6600137 - 6600277
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
6600137 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 6600236  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
6600237 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgttct 6600277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 6739956 - 6740092
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
6739956 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 6740055  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6740056 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 6740092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8216040 - 8215904
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
8216040 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 8215941  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
8215940 tagtcatctttttaggaatgacaaatggtggataatg 8215904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 26593281 - 26593417
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
26593281 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 26593380  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26593381 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26593417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 30297750 - 30297886
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
30297750 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttcaactcatctttggtaccaaatctggctcctagcacccacttaaaat 30297849  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30297850 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 30297886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Original strand, 39002030 - 39002162
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39002030 gtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 39002129  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
39002130 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 39002162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 11000729 - 11000865
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
11000729 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 11000828  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
11000829 tagtcatctttttaggcctggcaagtggtggataatg 11000865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14952464 - 14952324
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
14952464 aatcgtttcaaacaagtcttgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 14952365  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
14952364 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 14952324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 16095961 - 16096096
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
16095961 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctt-ggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 16096059  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
16096060 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 16096096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 19659502 - 19659638
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
19659502 aatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttttttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaat 19659601  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
19659602 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatg 19659638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20408673 - 20408533
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
20408673 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatatttggtaccaaatctagctcctaacacccgcttaaaat 20408574  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
20408573 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 20408533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 345
Target Start/End: Original strand, 23128914 - 23129062
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
23128914 aatcgtttcaaacaagtcatatcgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacaaccacttaaaat 23129013  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctctgctgct 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
23129014 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttgctgct 23129062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35342320 - 35342184
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
35342320 aatcgtttcaaacaagtctcattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 35342221  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35342220 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 35342184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 38964115 - 38964250
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
38964115 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 38964214  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
38964215 tagtcat-tttttaggcatgacaaatggtggataatg 38964250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40075086 - 40074954
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
40075086 gtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 40074987  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
40074986 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 40074954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41282482 - 41282346
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
41282482 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaat 41282383  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
41282382 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 41282346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 3352003 - 3352139
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
3352003 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 3352102  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
3352103 tagtcatctttttaggcatgacaaagggtggataatg 3352139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6252112 - 6251976
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
6252112 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaaat 6252013  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
6252012 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatg 6251976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 27457198 - 27457334
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
27457198 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccactttaaat 27457297  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
27457298 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 27457334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31710422 - 31710286
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
31710422 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaat 31710323  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31710322 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 31710286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 39824696 - 39824560
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
39824696 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 39824597  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39824596 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 39824560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 4015875 - 4016011
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
4015875 aatcgtttcaagcaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaat 4015974  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
4015975 tagtcatatttttaggcatgataaatggtggataatg 4016011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 11692148 - 11692284
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
11692148 aatcgtttcaaacaagtcatattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 11692247  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
11692248 tagtcatctttttaggcatcacaaatggtggataatg 11692284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 19398194 - 19398334
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
19398194 aatcatttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgtttctttgaactcatctttggtaccaaatctagcctctaacacccacttaaaat 19398293  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
19398294 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgttct 19398334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 20079259 - 20079395
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
20079259 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 20079358  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
20079359 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatg 20079395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42993654 - 42993522
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
42993654 gtttcaaacaattcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagt 42993555  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
42993554 catctttttaggcatggtaaatggtggataatg 42993522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Original strand, 43166274 - 43166406
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
43166274 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcataacacccacttaaaattagt 43166373  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
43166374 catctttttaggcatgacaaatgatggataatg 43166406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 201 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1052669 - 1052541
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
1052669 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattact 1052570  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggat 329  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||    
1052569 catctttttaagcatggcaaatggtggat 1052541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8689712 - 8689576
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
8689712 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgattccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 8689613  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
8689612 tagtcatctttttaggcatggcaaatagtggataatg 8689576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 27116100 - 27116240
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
27116100 aatcattttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacatccacttcaaat 27116199  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
27116200 tagtcatctttttaggcattacaaatcgtggataatgttct 27116240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 28078406 - 28078542
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
28078406 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 28078505  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||| | ||  |||||||||||||||||| |||||||    
28078506 tagtaaactaattaggcatgacaaatggtagataatg 28078542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 30208403 - 30208539
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
30208403 aatcatttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacctacttaaaat 30208502  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
30208503 taatcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 30208539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 235 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6331479 - 6331381
Alignment:
235 ggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
6331479 ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatg 6331381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16752236 - 16752120
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
16752236 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggatcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 16752137  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||| ||||||    
16752136 acaaatggtgaataatg 16752120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8695002 - 8694870
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
8695002 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgataattatttcattgaactcatctttagtaccaaatctggctcataatactcacttaaaattagt 8694903  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||| || |||||||||| |||||||||||||||    
8694902 catgttcttaggcatgataaatggtggataatg 8694870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11935585 - 11935450
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
11935585 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgtttccttgatctcatctttga-accaaatgtggctcctaacactcacttaaaat 11935487  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
11935486 tagccatctttttaggcataacaaatagtggataatg 11935450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Original strand, 26035367 - 26035483
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
26035367 attgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaatacccacttaaaatcagtcatctttttaggcacg 26035466  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||    
26035467 acaaatggtggataatg 26035483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 445074 - 444962
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
445074 attgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatatgactcctaaaacccacttaaaatcagtcgtctttttaggcgtg 444975  T
317 acaaatggtggat 329  Q
     ||||||||||||    
444974 gcaaatggtggat 444962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27510111 - 27509982
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||| |   |||||||||    
27510111 aatcgtttcaaacaagtcctattgtaataagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaa------aactaa-aaggacttaaaat 27510019  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27510018 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 27509982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Original strand, 15159863 - 15159921
Alignment:
19 gttatttgatcttagaattcctatttaaaatttgacaacatactttgatattaacttcat 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
15159863 gttatttgatcatagaattcctatttaaaatttgacaacatacttt-atattaacttcat 15159921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 33807781 - 33807917
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
33807781 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 33807880  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33807881 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 33807917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 8882014 - 8882150
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
8882014 aatcgtttcaaacaagtcctattctagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 8882113  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8882114 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 8882150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42273942 - 42273806
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
42273942 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 42273843  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42273842 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 42273806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 55517186 - 55517322
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
55517186 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 55517285  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55517286 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 55517322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 49118751 - 49118616
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
49118751 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 49118652  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49118651 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 49118616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26017563 - 26017427
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
26017563 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 26017464  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
26017463 tagtcatctttttaggcatgataaatagtggataatg 26017427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28264783 - 28264647
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
28264783 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaat 28264684  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28264683 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 28264647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 32318093 - 32317953
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
32318093 aatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgtctcctaacacccacttaaaat 32317994  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32317993 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 32317953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40988773 - 40988637
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
40988773 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 40988674  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
40988673 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatg 40988637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 4544986 - 4545122
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
4544986 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 4545085  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4545086 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 4545122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12196609 - 12196473
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
12196609 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 12196510  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12196509 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 12196473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 23135007 - 23135147
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
23135007 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 23135106  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
23135107 tagtcatttttttaggcatgccaaatggtggctaatgttct 23135147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31591215 - 31591080
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
31591215 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 31591116  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
31591115 tagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatg 31591080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31973731 - 31973595
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
31973731 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 31973632  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
31973631 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 31973595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 48551765 - 48551905
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
48551765 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatggttggtaattgctttcttgaactcatctttggtacaaaatctgactcctaacacccacttaaaat 48551864  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
48551865 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 48551905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 48707734 - 48707870
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
48707734 aatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaat 48707833  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48707834 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 48707870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44490459 - 44490324
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
44490459 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaagt 44490360  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44490359 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 44490324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32118854 - 32118720
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
32118854 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccccttaaaat 32118755  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 331  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
32118754 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 32118720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5227530 - 5227394
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||    
5227530 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctagtatccacttaaaat 5227431  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5227430 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 5227394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 11795155 - 11795291
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
11795155 aatcgtttcaaacaagtcatattctagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 11795254  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11795255 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 11795291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 17847097 - 17847232
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
17847097 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 17847196  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
17847197 tagtcatc-ttttaggcatggcaaatggtggataatg 17847232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 28159954 - 28160090
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
28159954 aatcatttcaaacaagtcttattgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 28160053  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28160054 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 28160090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 28812288 - 28812423
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
28812288 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaagtcatctttggtaccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaat 28812386  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
28812387 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 28812423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 30467004 - 30467144
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
30467004 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccatttaaaat 30467103  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
30467104 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 30467144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Original strand, 19496107 - 19496239
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
19496107 gtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggcgcctaacacccacttaaaattagt 19496206  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
19496207 catctttttaggcatgtcaaatggtggataatg 19496239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 24458632 - 24458768
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
24458632 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaat 24458731  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
24458732 tagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatg 24458768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 30141109 - 30141245
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
30141109 aatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaat 30141208  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
30141209 tagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatg 30141245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 33174021 - 33174157
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
33174021 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatttcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33174120  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
33174121 tagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatg 33174157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35930179 - 35930044
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
35930179 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 35930080  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
35930079 tagtcatctttttaggcatgacaaa-ggtggataatg 35930044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 48149639 - 48149503
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
48149639 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctgacacccacttaaaat 48149540  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48149539 tactcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 48149503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Original strand, 39995168 - 39995303
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
39995168 aatcgtttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaat 39995267  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
39995268 taatcatctttttaggcatggcaaatggtggataat 39995303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 197 - 335
Target Start/End: Original strand, 25734224 - 25734362
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
25734224 aatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttaattgaactcatctttcgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 25734323  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
25734324 tagtcatctttttaggcatgacaaacggtggataatgtt 25734362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2055418 - 2055282
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
2055418 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaagt 2055319  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2055318 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 2055282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14564936 - 14564800
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
14564936 aatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaat 14564837  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
14564836 tagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatg 14564800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23553204 - 23553069
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
23553204 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaat 23553106  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23553105 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 23553069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15985150 - 15985014
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
15985150 aatcgtttcaaacaagtcatattctagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaat 15985051  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
15985050 cagtaatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 15985014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 17993018 - 17993154
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||||||||    
17993018 aatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaat 17993117  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
17993118 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 17993154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37381986 - 37381850
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
37381986 aatcatttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatttttggtaccatatctggttcctaacacccacttaaaat 37381887  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
37381886 tagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatg 37381850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 50542355 - 50542491
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
50542355 aatcgttttaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 50542454  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
50542455 taatcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 50542491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 198 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 10588719 - 10588584
Alignment:
198 atcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaatt 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
10588719 atcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaact 10588620  T
298 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||    
10588619 agtcatctttttaggcatggtaaatggcagataatg 10588584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 50276139 - 50276272
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
50276139 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaat 50276238  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||   |||||||||||||| |||| |||||||||||    
50276239 tag---tctttttaggcatggcaaacggtggataatg 50276272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 9339124 - 9339263
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatc---tttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaa 293  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
9339124 aatcatttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaa 9339223  T
294 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
9339224 aattagtcatctttttatgcatgacaaatggtgaataatg 9339263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22298658 - 22298521
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
22298658 aatcgtttcaaacaagccctattgtagatagcataattggtaattgtttccttaaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 22298559  T
297 tagtcatct-ttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
22298558 tagtcatcttttttaggcatagcaaatggtggataatg 22298521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24623268 - 24623152
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
24623268 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagttatttttttaggcatg 24623169  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||    
24623168 acaaatggtggataatg 24623152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31208884 - 31208776
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
31208884 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcccaacacccacttaaaat 31208785  T
297 tagtcatct 305  Q
    |||||||||    
31208784 tagtcatct 31208776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 33693334 - 33693470
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
33693334 aatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaat 33693433  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| | |||||||    
33693434 tattcatctttttagacatggcaaatgatagataatg 33693470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 39700185 - 39700049
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
39700185 aatcgtttcaaacaagtcttattatagataacataattggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcttaacactcacttaaaat 39700086  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
39700085 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtgaataatg 39700049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 51371048 - 51371184
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
51371048 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaat 51371147  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
51371148 tagtcatttttttagacatggcaaatggtgaataatg 51371184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Original strand, 19168816 - 19168932
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
19168816 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatttgactcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 19168915  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||    
19168916 acaaatggtggataatg 19168932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25730380 - 25730240
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||| |||||||||||    
25730380 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcactaaatccgactcctaacatccacttaaaat 25730281  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
25730280 tagtcatctttttaggcatagcaaatagtggataatgttct 25730240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 333
Target Start/End: Original strand, 56555200 - 56555277
Alignment:
256 atctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
56555200 atctttggtaccaaatctggctcctgacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 56555277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20534305 - 20534225
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggct 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
20534305 aatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggct 20534225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 321
Target Start/End: Original strand, 42549643 - 42549747
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
42549643 attgtagataacatagttggtaattgcttcattgaacttatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaatcaatcatctttttaggcatg 42549742  T
317 acaaa 321  Q
    |||||    
42549743 acaaa 42549747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 226
Target Start/End: Original strand, 56555166 - 56555195
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagata 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
56555166 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagata 56555195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37838437 - 37838297
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
37838437 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 37838338  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
37838337 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgttct 37838297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 16246194 - 16246330
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
16246194 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 16246293  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
16246294 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatg 16246330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27328724 - 27328588
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
27328724 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 27328625  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27328624 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 27328588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40854749 - 40854613
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
40854749 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacatccacttaaaat 40854650  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40854649 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 40854613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 921162 - 921026
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
921162 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 921063  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
921062 tagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatg 921026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 28650427 - 28650563
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
28650427 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 28650526  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
28650527 tagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatg 28650563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34253282 - 34253146
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
34253282 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaatat 34253183  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34253182 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 34253146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 202 - 333
Target Start/End: Original strand, 771981 - 772112
Alignment:
202 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
771981 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtc 772080  T
302 atctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
772081 atctttttaggcatggcaaatggtggataatg 772112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 11949427 - 11949563
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
11949427 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaatat 11949526  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11949527 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 11949563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 41500503 - 41500639
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
41500503 aatcgtttcaaacaagtcctattgtacatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccgcttaaaat 41500602  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
41500603 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 41500639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Original strand, 33865268 - 33865403
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
33865268 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33865367  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
33865368 tagtcatttttttaggcatgacaaatggtggataat 33865403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 1106560 - 1106696
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
1106560 aatcatttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 1106659  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
1106660 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatg 1106696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7379103 - 7378967
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
7379103 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 7379004  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
7379003 tagtcctctttttaggcatgacaaatggtggataatg 7378967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9276714 - 9276578
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
9276714 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 9276615  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
9276614 tagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatg 9276578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 17134369 - 17134233
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
17134369 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaag 17134270  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
17134269 tagtcatctttttaggaatggcaaatgatggataatg 17134233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 17484551 - 17484691
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||    
17484551 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacaaccacttaaaat 17484650  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
17484651 tagtcatctttttaagcatggaaaatggtggataatgttct 17484691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 7297235 - 7297371
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattg-cttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaa 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
7297235 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgtcttc-ttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 7297333  T
296 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7297334 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 7297371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2456146 - 2456014
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
2456146 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttaactcctaacacccacttaaaattagt 2456047  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
2456046 catctttttaggcatgacaaatggtgaataatg 2456014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36211182 - 36211050
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
36211182 gtttcaaacaagtcctattctagataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagt 36211083  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
36211082 catctttttaggcatggcaaatggtggataatg 36211050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 36444229 - 36444365
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
36444229 aatcgtttcaaacaagtcctatagtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacctacttaaaat 36444328  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
36444329 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatg 36444365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 38751188 - 38751052
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
38751188 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatgtggctcctaacatccacttaaaat 38751089  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38751088 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 38751052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19180561 - 19180427
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
19180561 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagtatagttagtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctc-taacacccacttaaaat 19180463  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19180462 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 19180427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 203 - 333
Target Start/End: Original strand, 3430631 - 3430761
Alignment:
203 ttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtca 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
3430631 ttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaattagtca 3430730  T
303 tctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
3430731 tctttttaggcatggcaaatggtgtataatg 3430761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2057066 - 2056930
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
2057066 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatccagctcctaacacccacttaaaat 2056967  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
2056966 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 2056930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Original strand, 2314980 - 2315112
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
2314980 gtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaattagt 2315079  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
2315080 catctttttaggcatggtaaatggtggataatg 2315112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 325
Target Start/End: Original strand, 33106970 - 33107098
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
33106970 aatcgtttcaaacgagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaat 33107069  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
33107070 tagtcatctttttaggcatgaaaaatggt 33107098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42630102 - 42629970
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
42630102 aatcgtttcaaacaagtcctatcatagatagcataattgataattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 42630003  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
42630002 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggat 42629970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 43249413 - 43249549
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
43249413 aatcgtttcgaacaagtcctattgatgatagcatagttggtaattgtttccttgaatacatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 43249512  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43249513 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 43249549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 2094411 - 2094547
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||    
2094411 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttgatactaaatttggctccaaacacccacttaaaat 2094510  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
2094511 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatg 2094547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8899821 - 8899686
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
8899821 aatcgtttcaa-caagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaac 8899723  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
8899722 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 8899686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 12759751 - 12759886
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||||||||||||    
12759751 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatttgcctc-taacacccacttaaaat 12759849  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12759850 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 12759886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Original strand, 25087801 - 25087933
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||  ||| |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
25087801 gtttcaaacaagtcttattgtatataacatagttgataattgcttccttgaactcatctctggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 25087900  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
25087901 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 25087933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29737884 - 29737752
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
29737884 gtttcaaacaagtcctattgtcgatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaagatccatttaaaattagt 29737785  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
29737784 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 29737752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 37732194 - 37732330
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
37732194 aatcgtttcaaacaagtcttattgtaaataacatagttggtaattgctttcttgaactcatttttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaat 37732293  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
37732294 tagtcatctttttatgtatgacaaatggtggataatg 37732330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 45124259 - 45124123
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||    
45124259 aatcgtttcaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttaaactcatctttggtatcaaatcagactcttaacacccacttaaaat 45124160  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45124159 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 45124123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Original strand, 8396572 - 8396688
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
8396572 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaaaacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 8396671  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||    
8396672 acaaatggtggataatg 8396688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 233 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37654212 - 37654108
Alignment:
233 ttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
37654212 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaaatgatgaataat 37654113  T
333 gttct 337  Q
    |||||    
37654112 gttct 37654108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 333
Target Start/End: Original strand, 41178059 - 41178156
Alignment:
236 gtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
41178059 gtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatttttttaggcatggtaaatggtggataatg 41178156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Original strand, 19916008 - 19916124
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||    
19916008 attgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaatatcaatcatctttttaggcttg 19916107  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
    |||||| ||||||||||    
19916108 acaaattgtggataatg 19916124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9331896 - 9331760
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||   ||  | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
9331896 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtattgttggtaattgcttcccagatattatcttaggtaccaaatttggctcctaacacccacctaagat 9331797  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
9331796 tagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatg 9331760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14630754 - 14630663
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacaccca 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
14630754 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacaccca 14630663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 286
Target Start/End: Original strand, 23671812 - 23671901
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacc 286  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
23671812 aatcgtttcaaacaagtcttattatagataacatggttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacc 23671901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 333
Target Start/End: Original strand, 23672958 - 23673010
Alignment:
281 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
23672958 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggaaaatg 23673010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 63)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 46825671 - 46825535
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
46825671 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 46825572  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46825571 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 46825535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 49094712 - 49094852
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
49094712 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 49094811  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
49094812 tagtcatctttttaggcataacaaatggtggataatgttct 49094852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12143212 - 12143076
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
12143212 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 12143113  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12143112 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 12143076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 23767415 - 23767551
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
23767415 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 23767514  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23767515 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 23767551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41106156 - 41106020
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
41106156 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 41106057  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41106056 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 41106020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7651802 - 7651666
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
7651802 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttgataattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 7651703  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7651702 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 7651666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19315780 - 19315644
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
19315780 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 19315681  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19315680 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 19315644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 25988272 - 25988408
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
25988272 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 25988371  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25988372 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 25988408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 28425364 - 28425500
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
28425364 aatcgtttcaaacaagtcctattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 28425463  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28425464 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 28425500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 36157679 - 36157814
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
36157679 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgg-aattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 36157777  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36157778 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 36157814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 38473627 - 38473763
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
38473627 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaat 38473726  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38473727 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 38473763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 7553017 - 7553153
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
7553017 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 7553116  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
7553117 tagtcatctttttagccatgacaaatggtggataatg 7553153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 8141487 - 8141627
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||    
8141487 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataatttgtaattgcttctttgaactcatctttagtaccaaatctgacttgtaacacccacttaaaat 8141586  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8141587 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 8141627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 49814440 - 49814304
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
49814440 aatcgtttcaaataagtcatattctagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 49814341  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49814340 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 49814304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 7608767 - 7608903
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
7608767 aatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatcttttgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 7608866  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
7608867 tagtcatgtttttaggcatgacaaatggtggataatg 7608903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9962891 - 9962751
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
9962891 aatcgtttcaaacaagttctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagttcctaacacccacttaaaat 9962792  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
9962791 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgttct 9962751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18892469 - 18892333
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||    
18892469 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccactgaaaat 18892370  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
18892369 tagtcatccttttaggaatgacaaatggtggataatg 18892333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19274699 - 19274563
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
19274699 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagctggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 19274600  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
19274599 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 19274563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26549528 - 26549392
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
26549528 aatcgttttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggttcctaacacccacttaaaat 26549429  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
26549428 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 26549392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33325867 - 33325731
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
33325867 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttggtatcaaatctggcttctaagacccacttaaaat 33325768  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33325767 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 33325731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33674157 - 33674021
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
33674157 aatcgtgtcaaacaagtcctattgtagatagcatagctggtaattgcttccttgaactcatctttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33674058  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
33674057 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 33674021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 46051590 - 46051454
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
46051590 aatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaac 46051491  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
46051490 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 46051454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 48669397 - 48669537
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
48669397 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtgattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaat 48669496  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
48669497 tagtcatctttttaggcatgacaaataatggataatgttct 48669537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 335
Target Start/End: Original strand, 45350718 - 45350854
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
45350718 aatcgtttcaaacaa--cctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgatctcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 45350815  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45350816 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 45350854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 45670487 - 45670627
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcat-gcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
45670487 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacc-acttaaaa 45670585  T
296 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45670586 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 45670627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 23228195 - 23228331
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||    
23228195 aatcgtttcaaacaagtactattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccatttaaaat 23228294  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
23228295 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatg 23228331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26070032 - 26069896
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
26070032 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatttttggtatcaaatccggctcctaacacccacttaaaat 26069933  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26069932 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26069896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 34971220 - 34971080
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
34971220 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgtttctttgaactcatatttggtatcaaatctgactcctaacactcacttaaaat 34971121  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
34971120 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 34971080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37217036 - 37216896
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||    
37217036 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaactctagctcataacacccacttaaaat 37216937  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
37216936 tagtcatctttttagacatggcaaatggtggataatgttct 37216896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 48802332 - 48802468
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
48802332 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacctacttaaaat 48802431  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
48802432 tagtcatctttgtaggcatgataaatggtggataatg 48802468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 333
Target Start/End: Original strand, 24204474 - 24204608
Alignment:
199 tcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaatta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
24204474 tcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaatga 24204573  T
299 gtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
24204574 gtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 24204608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 198 - 335
Target Start/End: Original strand, 41982237 - 41982374
Alignment:
198 atcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaatt 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
41982237 atcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccatttaaaatt 41982336  T
298 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
41982337 agtcatatttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 41982374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 9878785 - 9878925
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| || ||||||||||||||||||||    
9878785 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccatatcgggttcctaacacccacttaaaat 9878884  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9878885 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 9878925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21965205 - 21965065
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
21965205 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattaaactcatctttggtaccaaatctgactccttacacccacttaaaat 21965106  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
21965105 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtgtataatgttct 21965065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 36781173 - 36781309
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
36781173 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaat 36781272  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
36781273 tagtcgtctttttgggcatggcaaatggtggataatg 36781309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 46095076 - 46095212
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||    
46095076 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttgatatcaaatctgtctcctaacatccacttaaaat 46095175  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
46095176 tagtcatctttttaaacatgacaaatggtggataatg 46095212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 50533523 - 50533387
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
50533523 aatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaat 50533424  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
50533423 tagtcatctttttaggcatgtcaaattttggataatg 50533387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 50690083 - 50689947
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
50690083 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 50689984  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
50689983 tagtcatctttttaggcatagcaaatgatggataatg 50689947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 52147133 - 52146997
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
52147133 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtatatagcatagtttgtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaat 52147034  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52147033 tattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 52146997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5401010 - 5400876
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||    
5401010 aatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggtttctaacatccacttaaaat 5400911  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
5400910 tagtcatctttttaggcatg-caaatggtggataat 5400876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16706010 - 16705874
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
16706010 aatcgtttcaaacaagtcttattttagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcgcctaaaacccacttaaaat 16705911  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
16705910 tagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatg 16705874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 52349925 - 52350061
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||||||||    
52349925 aatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaat 52350024  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
52350025 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 52350061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 17983899 - 17984035
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
17983899 aatcgtttcaaccaagtcctaatgtaaataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgattcataacacccacttaaaat 17983998  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
17983999 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatg 17984035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 18782090 - 18782230
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||    
18782090 aatcatttcaaacaagtcatattctagatagcatagttgataattgcttatttgaactcatctttggtacaaaatctggttcatagcacccacttaaaat 18782189  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
18782190 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 18782230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 43396815 - 43396679
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
43396815 aatcgtttcaaacaaatcctactgtagatagcagagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 43396716  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||    
43396715 tagtcatctttttaagcatagcaaatgatggataatg 43396679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 217 - 337
Target Start/End: Original strand, 48319067 - 48319187
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
48319067 attgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatt 48319166  T
317 acaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||    
48319167 acaaatggtggataatgttct 48319187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 52067652 - 52067788
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
52067652 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatggcataatttgtaattgcttccttgaactcatcgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 52067751  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
52067752 tattcatctttttagggatgacaaatggtggataatg 52067788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 233 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12964750 - 12964650
Alignment:
233 ttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
12964750 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatgttgtataat 12964651  T
333 g 333  Q
    |    
12964650 g 12964650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18917664 - 18917529
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
18917664 aatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcatatttaataattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaat 18917565  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
18917564 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataat 18917529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 216 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9974963 - 9974842
Alignment:
216 tattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 315  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9974963 tattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtactaaatatggctcgtaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 9974864  T
316 gacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |  |||||||||||||||||||    
9974863 ggtaaatggtggataatgttct 9974842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40721483 - 40721346
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacaccc-acttaaaa 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || |||||    
40721483 aatcgtttccaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgctttcttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaatacccaacctaaaa 40721384  T
296 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
40721383 ttaattatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 40721346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6711580 - 6711444
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
6711580 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagacattatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 6711481  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
6711480 tagccatctttttacacatggtaaatggtggataatg 6711444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Original strand, 33194672 - 33194788
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
33194672 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 33194771  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
     | |||||||| |||||    
33194772 gcgaatggtggttaatg 33194788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21929666 - 21929521
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatcttt-------ggtaacaaatctggctcctaacacccac 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||       |||| |||||||||||||||| ||||||    
21929666 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttcatctttggtaccaaatctggctcctaaaacccac 21929567  T
290 ttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
21929566 ttaaaattagtcatctttttag--atggcaaatggtggataatcttct 21929521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Original strand, 16506809 - 16506925
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
16506809 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagccatctttttaagcatg 16506908  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
     ||||||||||||||||    
16506909 gcaaatggtggataatg 16506925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25800781 - 25800644
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctt----tggtaacaaatctggctcctaacacccactta 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    ||||| |||||||      |||||||||||||    
25800781 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatg-ttggtaattgcttccttgaactcatcttaatttggtaccaaatct------taacacccactta 25800689  T
293 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
25800688 aaattagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgttct 25800644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 33714362 - 33714500
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||| | ||    
33714362 aatcgtttcaaacaaatcctattgtagataacatagttgataattgtttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaaca-ccactt-acat 33714459  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
33714460 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatattct 33714500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30281751 - 30281635
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
30281751 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaataccagttatctttttaggcatg 30281652  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
      |||||||||||||||    
30281651 taaaatggtggataatg 30281635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 297
Target Start/End: Original strand, 44978769 - 44978868
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
44978769 aatcgtttcaaacaagtcagaatgtagatagcataattgataattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaata-ccacttaaaat 44978867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 50099298 - 50099224
Alignment:
259 tttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||| ||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50099298 tttggtaccaaatatgacttttaacatccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 50099224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 333
Target Start/End: Original strand, 44979281 - 44979325
Alignment:
289 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44979281 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 44979325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 333
Target Start/End: Original strand, 32373650 - 32373690
Alignment:
293 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32373650 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 32373690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 333
Target Start/End: Original strand, 17989864 - 17989904
Alignment:
293 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
17989864 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtgaataatg 17989904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37933782 - 37933642
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
37933782 aatcgtttcaaacaagtcttatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 37933683  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37933682 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 37933642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15847252 - 15847117
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
15847252 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 15847153  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
15847152 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataat 15847117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 38107239 - 38107099
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
38107239 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 38107140  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
38107139 taatcatctttttaggcatgataaatggtggataatgttct 38107099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 513447 - 513312
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
513447 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 513348  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
513347 tagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatg 513312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2533412 - 2533276
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
2533412 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctccaaacacccacttaaaat 2533313  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2533312 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 2533276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 260117 - 259978
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
260117 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 260018  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
260017 tagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatgttct 259978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 655804 - 655943
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
655804 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 655903  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
655904 tagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatgttct 655943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 841539 - 841678
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
841539 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 841638  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
841639 tagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatgttct 841678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3876048 - 3875912
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||    
3876048 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactatatctggttcctaacacccacttaaaat 3875949  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3875948 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 3875912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35443451 - 35443315
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
35443451 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 35443352  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
35443351 tagttatctttttaggcatggcaaatagtggataatg 35443315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 36400071 - 36400207
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |    
36400071 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaact 36400170  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36400171 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 36400207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1293626 - 1293490
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
1293626 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggtttctaacacccacttaaaat 1293527  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1293526 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1293490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Original strand, 9056343 - 9056475
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
9056343 gtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacatccacttaaaattagt 9056442  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
9056443 catctttttaggcatgataaatggtggataatg 9056475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 28707447 - 28707583
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
28707447 aatcgtttcaaacaaatcctattgtagatatcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaat 28707546  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
28707547 tagtcatcttttaaggcatgacaaatggtggataatg 28707583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 35884431 - 35884567
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
35884431 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaat 35884530  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
35884531 tagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatg 35884567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 43806534 - 43806670
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
43806534 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacactcacttaaaat 43806633  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
43806634 tagtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 43806670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 197 - 322
Target Start/End: Original strand, 41536528 - 41536653
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
41536528 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 41536627  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
41536628 tagtcatctttttaggcatgacaaat 41536653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 440980 - 440840
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
440980 aatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 440881  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    || |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
440880 tactcatctttttagacatggcaaacggtggataatgttct 440840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 22683989 - 22684125
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22683989 aatcatttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 22684088  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
22684089 tagtcatctttttagccatgacaaatggtgaataatg 22684125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 38633711 - 38633847
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
38633711 aatcgtttcaaacaagttctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgatttctaacacccacttaaaat 38633810  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
38633811 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 38633847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 40301894 - 40302034
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
40301894 aatcgtttcaaaaaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaatttatctttggtaccaaatctagctcctaacactcacttaaaat 40301993  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40301994 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 40302034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38208893 - 38208754
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
38208893 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgctaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 38208794  T
297 tagtcat-ctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 335  Q
    ||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||    
38208793 tagtcatccattttagacatggcaaatggtggataatgtt 38208754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13797228 - 13797098
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
13797228 aatcgtttcaaacaaatcctattgtatatagcatagttggtaattgcttctttgaactcat-tttggtatcaaatctggctcctaacatccacataaaat 13797130  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtgga 328  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
13797129 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtgga 13797098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Original strand, 28496356 - 28496490
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||    
28496356 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctag-ttctaatacccacttaaaat 28496454  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
28496455 tagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataat 28496490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4649290 - 4649150
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||    
4649290 aatcgtttcaaacaagtccaattgtagatagcataattggtaattgtttccttgaactcgtctttggtaccaaatctgacttccaacatccacttaaaat 4649191  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
4649190 tagtcatttttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 4649150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 24430572 - 24430708
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
24430572 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttgataattgttttattgaactcatctttggtaccaaatctcactactaacacccacttaaaat 24430671  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
24430672 tagtcatctttttaggcatgacaaaaggtggataatg 24430708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33651981 - 33651845
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||    
33651981 aatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagtttgtaattgtttccttgaactcatctttcataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 33651882  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
33651881 tagtcatctttttagacatgacaaacggtggataatg 33651845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12010688 - 12010553
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtag---atagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaatt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
12010688 gtttcaaacaagtcctattgtagtagatagcatagttggtaattgttgccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaatt 12010589  T
298 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
12010588 agtcatctttttatgcatggcaaatggtggataatg 12010553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7435006 - 7434890
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
7435006 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttataggcttg 7434907  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||    
7434906 acaaatggtggataatg 7434890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23935353 - 23935237
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
23935353 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 23935254  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
     ||||||||||||||||    
23935253 gcaaatggtggataatg 23935237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 321
Target Start/End: Original strand, 23972296 - 23972420
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
23972296 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgactcctatcacccacttaaaat 23972395  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaa 321  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
23972396 tagtcatctttttagacatgacaaa 23972420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 201 - 332
Target Start/End: Original strand, 39513344 - 39513475
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
39513344 gtttcaaataagtcctaatgtagataacatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaattagt 39513443  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||    
39513444 catctttttaggcatggcatatggtggataat 39513475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6016325 - 6016209
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
6016325 attgtagatagcatagttggtaattgcttctttaaactcatctttgatactcaatttggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 6016226  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||    
6016225 acaaatggtggataatg 6016209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 42988228 - 42988363
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||| || |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
42988228 aatcgtttcaaa-aagtcctattgtagataatatagttgataattgcttcatttaacttatatttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaat 42988326  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
42988327 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatg 42988363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 36218782 - 36218917
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||  ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||    
36218782 aatcgtttcaaacaagtcatgatgtagataatatagttgataattgcttctt-gaactcatctttggtaccaaatctgacttctagcacccacttaaaat 36218880  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
36218881 tagccatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 36218917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29485406 - 29485291
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
29485406 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaatcagtcat-tttttaggcatg 29485308  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
     |||||| |||||||||    
29485307 gcaaatgatggataatg 29485291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 333
Target Start/End: Original strand, 24193356 - 24193429
Alignment:
259 tttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
24193356 tttggtaccaaatctggctcctaacacc-acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatg 24193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 261
Target Start/End: Original strand, 24193131 - 24193195
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatcttt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
24193131 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcttt 24193195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8137239 - 8137180
Alignment:
272 ctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
8137239 ctggctcctaacacctacttaaaattagtcatttttttaggcatagcaaatggtggataa 8137180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 1469494 - 1469630
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
1469494 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 1469593  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1469594 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1469630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 47281125 - 47281261
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
47281125 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 47281224  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47281225 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 47281261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33884459 - 33884319
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
33884459 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 33884360  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33884359 tagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 33884319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 38427564 - 38427700
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
38427564 aatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 38427663  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
38427664 tagtcatctttttaggcatgacaaatggcggataatg 38427700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44544549 - 44544413
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
44544549 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaat 44544450  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
44544449 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 44544413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47219285 - 47219149
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
47219285 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaat 47219186  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47219185 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 47219149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 47294292 - 47294428
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
47294292 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatcgttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttataat 47294391  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47294392 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 47294428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Original strand, 8162717 - 8162849
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8162717 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttatcaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 8162816  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
8162817 catctttttaggcatgacaaattgtggataatg 8162849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 31684135 - 31684271
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
31684135 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 31684234  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
31684235 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 31684271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 35600123 - 35600259
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
35600123 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaat 35600222  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
35600223 tagttatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 35600259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 37393999 - 37394139
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||    
37393999 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacacccagttaaaat 37394098  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37394099 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 37394139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47272121 - 47271985
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
47272121 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaat 47272022  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
47272021 tagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatg 47271985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 201 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4923352 - 4923216
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
4923352 gtttcaaacaagtcctattgtggatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaattagt 4923253  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
4923252 catctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 4923216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 11050262 - 11050402
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
11050262 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatatttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctgcctcctaatacccacttaaaat 11050361  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
11050362 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgttct 11050402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 11476557 - 11476693
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
11476557 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 11476656  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
11476657 tagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatg 11476693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23842445 - 23842309
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
23842445 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttcaaat 23842346  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
23842345 tagtcatctttttaggcatggcagatggtggataatg 23842309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 30798369 - 30798505
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
30798369 aatcgtttcaaacaaatcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 30798468  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
30798469 tagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatg 30798505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30876399 - 30876263
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
30876399 aatcgtttcaaacaagtgctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttggtaccaaattgggctcctaacacccacttaaaat 30876300  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30876299 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 30876263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40851414 - 40851278
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
40851414 aatcgtttcaaacaagtcctattgtaggtagaatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 40851315  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
40851314 tagtcatctttttaggcacgacaaatggtggataatg 40851278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 324
Target Start/End: Original strand, 2960641 - 2960768
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
2960641 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 2960740  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatgg 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
2960741 tagtcatctttttaggcatggcaaatgg 2960768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 43752777 - 43752913
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||    
43752777 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctgactcctaacatccacttaaaat 43752876  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
43752877 tagtcatcttttgaggcaggacaaatggtggataatg 43752913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 27364340 - 27364476
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
27364340 aatcgtttcaaacagatcctattgtagataacatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 27364439  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
27364440 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 27364476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41113517 - 41113381
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
41113517 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 41113418  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||    
41113417 tagtcatctttttagacatggcaaatgatgaataatg 41113381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 42979339 - 42979475
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||    
42979339 aatcgtttcaaacaagtcctactgtagataacatagttggtaattgcttcgttgaactcatctttgatatcaaatctgactcctaacatccacttaaaat 42979438  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
42979439 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 42979475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 43968260 - 43968396
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||||||||||||    
43968260 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcgtagttggtaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatttggctcataatacccacttaaaat 43968359  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
43968360 tagtcatctttataggcatgacaaatggtggataatg 43968396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 45723492 - 45723628
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
45723492 aatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcataattagtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 45723591  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45723592 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 45723628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 48628945 - 48628809
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
48628945 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcattttttgcaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 48628846  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48628845 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 48628809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 197 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 221415 - 221298
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
221415 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 221316  T
297 tagtcatctttttaggca 314  Q
    ||||| ||||||||||||    
221315 tagtcttctttttaggca 221298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7336199 - 7336065
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
7336199 aatcgtttcaaaca-gttctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatcattgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 7336101  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
7336100 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataat 7336065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29248482 - 29248347
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
29248482 aatcatttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcatcaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 29248383  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
29248382 tagtcatctttttaggcatggcaaattgtggataat 29248347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 41139409 - 41139549
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgc----ttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccactta 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
41139409 aatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatatatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccgctta 41139508  T
293 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
41139509 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatg 41139549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 201 - 336
Target Start/End: Original strand, 44800415 - 44800550
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
44800415 gtttcaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgtttcattgaactcatctttggtaccaaatatggttcctaacacccacttaaaattagt 44800514  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgttc 336  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
44800515 catctttttaggcatgatatatggtggataatgttc 44800550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 217 - 335
Target Start/End: Original strand, 37354284 - 37354402
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
37354284 attgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatttggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 37354383  T
317 acaaatggtggataatgtt 335  Q
     ||||||||||||||||||    
37354384 gcaaatggtggataatgtt 37354402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 30971942 - 30972078
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
30971942 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatggcatagttggtaattacttccttaaacccatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 30972041  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
30972042 tagtcatctttttaagcatgacaaattgtggataatg 30972078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Original strand, 47579091 - 47579224
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaatt-gcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattag 299  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
47579091 gtttcagacaagtcctattatagatagcataattggtaatttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaattaa 47579190  T
300 tcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
47579191 ccatctttttaggaatgacaaatggtggataatg 47579224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Original strand, 3797544 - 3797660
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
3797544 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 3797643  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
      |||||||||||||||    
3797644 ttaaatggtggataatg 3797660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18353284 - 18353144
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||    
18353284 aatcgtttcaaacaagtcctaaggtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacacctaattaaaat 18353185  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
18353184 tagtcatctttttagacatgataaatggtggataatgttct 18353144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47120133 - 47119995
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgc--ttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
47120133 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagagagcatatagttggtaattgctttcttgaactcatatttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaa 47120034  T
295 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
47120033 attagttatctttttaggcatgataaatggtggataatg 47119995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27774228 - 27774112
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
27774228 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaatcagccatctttttaggcatg 27774129  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
     ||||||||||||||||    
27774128 gcaaatggtggataatg 27774112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 248 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40521007 - 40520922
Alignment:
248 ttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
40521007 ttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttagccatggcaaatggtggataatg 40520922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 39034122 - 39034066
Alignment:
277 tcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39034122 tcctaacgcccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 39034066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42888989 - 42888940
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
42888989 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttc 42888940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43025155 - 43025119
Alignment:
294 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
43025155 aattagtcatctttttaggcatgacaaatgatggata 43025119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 286 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12583352 - 12583313
Alignment:
286 ccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
12583352 ccacttaaaattagtcatctttttacgcatgaaaaatggt 12583313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29739829 - 29739785
Alignment:
288 acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
29739829 acttaaaattagtcatc-ttttaggcatggtaaatggtggataatg 29739785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1687791 - 1687655
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
1687791 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 1687692  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1687691 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1687655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 35346472 - 35346612
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
35346472 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttaaaat 35346571  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35346572 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 35346612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1017184 - 1017048
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
1017184 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaat 1017085  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1017084 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1017048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 10618481 - 10618621
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
10618481 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaat 10618580  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10618581 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 10618621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 20086315 - 20086451
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
20086315 aatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatacttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 20086414  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
20086415 tagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatg 20086451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 20813442 - 20813578
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
20813442 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 20813541  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20813542 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 20813578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21564636 - 21564500
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
21564636 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacccacttaaaat 21564537  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
21564536 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 21564500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33151836 - 33151700
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
33151836 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33151737  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33151736 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 33151700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21656658 - 21656522
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
21656658 aatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 21656559  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
21656558 tagtcacctttttaggcatgataaatggtggataatg 21656522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21890310 - 21890170
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
21890310 aatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatatttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaat 21890211  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
21890210 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatattct 21890170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Original strand, 36314977 - 36315109
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
36314977 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaattagt 36315076  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
36315077 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 36315109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 38446616 - 38446480
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
38446616 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 38446517  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
38446516 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtagataatg 38446480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 50287706 - 50287570
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
50287706 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattaaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 50287607  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50287606 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 50287570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Original strand, 20760072 - 20760207
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
20760072 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaat 20760171  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20760172 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 20760207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 42017013 - 42016878
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
42017013 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 42016914  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
42016913 tagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataat 42016878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31122802 - 31122666
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
31122802 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaagacccgcttaaaat 31122703  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
31122702 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 31122666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 32650821 - 32650961
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
32650821 aatcatttcaaacaagttctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 32650920  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
32650921 tagtcatctttctaggcatggcaaatggtggataatgttct 32650961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 197 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26455722 - 26455588
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
26455722 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 26455623  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26455622 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 26455588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3697286 - 3697150
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
3697286 aatcctttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaattcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaat 3697187  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
3697186 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 3697150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19664677 - 19664545
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
19664677 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcataacatccacttaaaattagt 19664578  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
19664577 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 19664545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41251022 - 41250890
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
41251022 gtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaattagt 41250923  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
41250922 catctttttaggcatggcaaatggtggataatg 41250890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 42107100 - 42107236
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
42107100 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattacttccttgaactcatctttgacaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 42107199  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
42107200 tagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatg 42107236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 47329176 - 47329312
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
47329176 aatcgtttccaacaagtcatatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 47329275  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
47329276 tagtcatctttttaggtatggcaaatggtggataatg 47329312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 51562302 - 51562166
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
51562302 aatcgtttcaaacaagttctaatgtagataacatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 51562203  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51562202 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 51562166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 202 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22852131 - 22852000
Alignment:
202 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
22852131 tttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtc 22852032  T
302 atctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
22852031 atctgtttaggcatgacaaatggtggataatg 22852000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Original strand, 35608132 - 35608267
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |    
35608132 aatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatcggactcctaacacccacttaaact 35608231  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35608232 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 35608267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 204 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12748524 - 12748395
Alignment:
204 tcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
12748524 tcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgttttctaacacccacttaaaattagtcat 12748425  T
304 ctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
12748424 ctttttaggcatggcaaatggtggataatg 12748395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 20913755 - 20913891
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
20913755 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaat 20913854  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
20913855 tagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatg 20913891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 20921873 - 20922009
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
20921873 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaat 20921972  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
20921973 tagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatg 20922009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29677616 - 29677480
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
29677616 aatcgtttcaaacaggtcctatcgtagatatcatagtttgtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccatttaaaat 29677517  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29677516 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 29677480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37248096 - 37247960
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
37248096 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 37247997  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| || ||||||    
37247996 tagtcatcttttcatgcatgacaaatgatgaataatg 37247960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 40922166 - 40922306
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
40922166 aatcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaat 40922265  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
40922266 tagtaatttttttaggcatggaaaatggtggataatgttct 40922306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44798407 - 44798272
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
44798407 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaat 44798308  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
44798307 tactcat-tttttaggcatgtcaaatggtggataatg 44798272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 52821050 - 52821186
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
52821050 aatcgttttaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtagtaaaactggctcctaacacccacttaaaat 52821149  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
52821150 tagtcatctttttaggcataacaaatgatggataatg 52821186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 233 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19268625 - 19268525
Alignment:
233 ttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19268625 ttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 19268526  T
333 g 333  Q
    |    
19268525 g 19268525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 48651388 - 48651252
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
48651388 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 48651289  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
48651288 taatcgtctttttaggcatggcaaatggtggataatg 48651252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 53925980 - 53926116
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
53925980 aatcatttcaaataagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaat 53926079  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
53926080 tagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatg 53926116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 1448736 - 1448869
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   || |||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
1448736 aatcgtttcaaagaagtcctattgt---taccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 1448832  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
1448833 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 1448869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 27070740 - 27070876
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||    
27070740 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacactcacttaaaat 27070839  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
27070840 tagtcatcttttcagacattataaatggtggataatg 27070876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 53196154 - 53196018
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
53196154 aatcgtttcaaagaagtcttattgtagataacatagttggtaattatttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaat 53196055  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
53196054 tagttatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 53196018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Original strand, 55164120 - 55164252
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
55164120 gtttcaaataagtcatattgtagatagcatagttgctaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacctacttaaaattagt 55164219  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
55164220 catctttttaggcatgataaatagtggataatg 55164252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 45380261 - 45380397
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcat-gcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaa 295  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
45380261 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagtttgataattgcttctttaaactcatctttggtaccaaatctggctcataaca-ccacttaaaa 45380359  T
296 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
45380360 ttagtcatctttttatgcatggtaaatggtggataatg 45380397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 50977984 - 50977868
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
50977984 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatg 50977885  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||    
50977884 acaaatggtggataatg 50977868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 51081116 - 51081000
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
51081116 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatg 51081017  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||    
51081016 acaaatggtggataatg 51081000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Original strand, 51475267 - 51475383
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
51475267 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 51475366  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||    
51475367 acaaatggtggataatg 51475383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 39069866 - 39069730
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||| |||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
39069866 aatcgtttcaaacaagtcatattgttaatagcatagttgataattgtttcctttaacttatctttggtaccaaatctggctcttaacacccacttaaaat 39069767  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
39069766 tagtcatcttttcatgcatggcaaatggtggataatg 39069730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 237 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28699785 - 28699689
Alignment:
237 taattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
28699785 taattgcttccttgaactcatctttggcaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 28699689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 33473240 - 33473376
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||  | |||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
33473240 aatcgtttcaaacaagttttattgtagataacatagttggtaattgtttccttgattttatctttggtaccaaatctggtttctaacacgcacttaaaat 33473339  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
33473340 tagtcatctttttagtcatgataaatggtggataatg 33473376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Original strand, 50364908 - 50365024
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
50364908 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacactcacttaaaatcagtaatctttttaggcatg 50365007  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
     |||||||||| |||||    
50365008 gcaaatggtgggtaatg 50365024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 201 - 322
Target Start/End: Original strand, 38924003 - 38924124
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||| |    
38924003 gtttcaaacaagtcctatcgtagataaaatagttggtaattgcttcgttgaacttatctttggtaccaaattggactcctaacatccacttaaaattaat 38924102  T
301 catctttttaggcatgacaaat 322  Q
    ||||| |||| |||||||||||    
38924103 catctctttaagcatgacaaat 38924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44152777 - 44152704
Alignment:
260 ttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44152777 ttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 44152704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34019580 - 34019464
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
34019580 attgtagatagcatagttgataattgcttacttgaactcactgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagccatatttttaggcatg 34019481  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
     ||||||||||||||||    
34019480 tcaaatggtggataatg 34019464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 273 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47473294 - 47473234
Alignment:
273 tggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
47473294 tggctcctaacatccacttaaaattagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 47473234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 306
Target Start/End: Original strand, 42641215 - 42641288
Alignment:
233 ttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
42641215 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaagtctgcctcctaacacccacttaaaatcaatcatctt 42641288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 254 - 118
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
254 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagtcggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 155  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
154 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6503858 - 6503722
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
6503858 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaacccatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 6503759  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6503758 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 6503722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17943176 - 17943036
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
17943176 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcataattggtaattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 17943077  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
17943076 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgttct 17943036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30379157 - 30379017
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
30379157 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 30379058  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
30379057 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgttct 30379017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Original strand, 1915348 - 1915480
Alignment:
201 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
1915348 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaattaat 1915447  T
301 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
1915448 catctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1915480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3408329 - 3408193
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
3408329 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 3408230  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3408229 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 3408193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 10256377 - 10256241
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
10256377 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaat 10256278  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
10256277 tagtcatctttttaggcattgcaaatggtggataatg 10256241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 26393010 - 26393150
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
26393010 aatcgtttcaaaaaacttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaat 26393109  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26393110 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 26393150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2390405 - 2390269
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||    
2390405 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatagctcctaacacccacttataat 2390306  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2390305 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 2390269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2707599 - 2707463
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
2707599 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaat 2707500  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
2707499 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 2707463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 8178250 - 8178386
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
8178250 aatcgtttcaaacatgtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 8178349  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
8178350 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatg 8178386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12626776 - 12626640
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
12626776 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 12626677  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
12626676 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 12626640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 17428273 - 17428413
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
17428273 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaat 17428372  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
17428373 tagtcatctttttaggcatgacaaacggtgaataatgttct 17428413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29050412 - 29050276
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
29050412 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 29050313  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
29050312 tagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatg 29050276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9382659 - 9382523
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
9382659 aatcgtttcaaacaagtcctgatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 9382560  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
9382559 tagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatg 9382523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11134014 - 11133877
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttc-tttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
11134014 aatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagatggtaattgcttcctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11133915  T
296 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
11133914 ttagtcatctttttagacataacaaatgatggataatg 11133877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1077377 - 1077241
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
1077377 aatcgtttcaaataagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaat 1077278  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
1077277 taatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 1077241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 26230933 - 26231069
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
26230933 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtaaataacatagttggtagtttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaat 26231032  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26231033 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26231069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 331
Target Start/End: Original strand, 3258808 - 3258942
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcat-gcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaa 295  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
3258808 aatcgtttcaaacaagttctattgtagataccatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 3258906  T
296 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
3258907 ttagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataa 3258942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 197 - 326
Target Start/End: Original strand, 2598100 - 2598229
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
2598100 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgctttattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 2598199  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtg 326  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||    
2598200 tactcatctttttaggcatggcaaatggtg 2598229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16193450 - 16193310
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
16193450 aatcgtttcaaacaagttctaatgcagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 16193351  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
16193350 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttct 16193310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 216 - 337
Target Start/End: Original strand, 35223919 - 35224040
Alignment:
216 tattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 315  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35223919 tattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctagctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 35224018  T
316 gacaaatggtggataatgttct 337  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||    
35224019 gtcaaattgtgtatattgttct 35224040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 335
Target Start/End: Original strand, 26196322 - 26196460
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcat-gcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaa 295  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||    
26196322 aatcggttcaaccaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccgtgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacaac-acttaaaa 26196420  T
296 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26196421 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 26196460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 217 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26936727 - 26936612
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
26936727 attgtagatagcatagttgataattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatccggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 26936628  T
317 acaaatggtggataat 332  Q
    ||||||||||||||||    
26936627 acaaatggtggataat 26936612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 322
Target Start/End: Original strand, 6785102 - 6785224
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||   |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
6785102 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacataattggt---tgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 6785198  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaat 322  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||    
6785199 tagtcatctttttagtcatgtcaaat 6785224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 335
Target Start/End: Original strand, 25820550 - 25820688
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||    
25820550 aatcgtttcaaacaattcctatcgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatgtttggtaccaaatctaactcataacacccatttaaaat 25820649  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 335  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||  |||||||||||    
25820650 tagtcataattttagtcatgtcaaattatggataatgtt 25820688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 10931149 - 10931292
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||    
10931149 aatcgtatcaaacaagtcctaatgtggatagcatagttg-taattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctaacacccgcttaaaat 10931247  T
297 tagtcatctttttag----gcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    |||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||    
10931248 tagtcatctttttaggcatgcatgagaaatggtggataatgttct 10931292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31376057 - 31375971
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
31376057 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgttaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaac 31375971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 254
Target Start/End: Original strand, 12612972 - 12613029
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaact 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
12612972 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaact 12613029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 275
Target Start/End: Original strand, 12612849 - 12612927
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctgg 275  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
12612849 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcaaagttagtacttgcttcattgaactcatctttgctaccaaatctgg 12612927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 219026 - 218889
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaaca-cccacttaaaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
219026 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacaccccacttaaaa 218927  T
296 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
218926 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 218889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 197 - 335
Target Start/End: Original strand, 5028 - 5166
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
5028 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacaccctcttaaaat 5127  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
5128 tagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgtt 5166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5325 - 5190
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
5325 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaat 5227  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5226 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 5190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 252439 - 252575
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
252439 aatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaat 252538  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
252539 tagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatg 252575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48102 - 47967
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||  |||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
48102 aatcgttttaaacaagtccgattgtatatcacatagttggtaattgcttccttgaactcacctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaat 48003  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48002 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 47967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13235 - 13095
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||    
13235 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaat 13136  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
13135 tattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgttct 13095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 59609 - 59749
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||    
59609 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaat 59708  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttct 337  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
59709 tattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgttct 59749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 197 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11498 - 11360
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaat 296  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
11498 aatcgttttaaataagacctattgtaggtagcatagttggtaattgcttccttaaacttatctatggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 11399  T
297 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
11398 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgtt 11360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Original strand, 1994 - 2110
Alignment:
217 attgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatg 316  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
1994 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacctacttaaaatcagtcatcttattaggcatg 2093  T
317 acaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||    
2094 acaaatggtggataatg 2110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 679 - 599
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggct 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
679 aatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 277
Target Start/End: Original strand, 1914 - 1994
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggct 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
1914 aatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 277
Target Start/End: Original strand, 3372 - 3452
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggct 277  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
3372 aatcgtttcaaataagtcctaatgttgatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 3452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1957 - 1877
Alignment:
197 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatgcttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaacaaatctggct 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
1957 aatcgtttcaaacaagtcctaatgttgatagcatagttgataattgcttccttgacctcatctttggtaccaaatctggct 1877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 284 - 333
Target Start/End: Original strand, 289 - 338
Alignment:
284 acccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
289 acccacttaaaattattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19831 - 19785
Alignment:
287 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
19831 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 19785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University