View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14726_low_5 (Length: 508)

Name: NF14726_low_5
Description: NF14726
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14726_low_5
NF14726_low_5
[»] chr2 (85 HSPs)
chr2 (13-314)||(23234997-23235297)
chr2 (13-313)||(30666979-30667278)
chr2 (13-307)||(20568567-20568860)
chr2 (13-306)||(22187920-22188212)
chr2 (13-314)||(9015181-9015478)
chr2 (13-287)||(25037096-25037369)
chr2 (13-287)||(25041203-25041476)
chr2 (29-302)||(38781405-38781675)
chr2 (13-315)||(22317583-22317886)
chr2 (13-305)||(21537067-21537358)
chr2 (13-252)||(13963850-13964088)
chr2 (13-255)||(25829124-25829363)
chr2 (13-306)||(10009569-10009860)
chr2 (13-316)||(24850474-24850776)
chr2 (13-269)||(19540406-19540659)
chr2 (4-255)||(30621197-30621447)
chr2 (4-255)||(30623818-30624068)
chr2 (13-255)||(18376775-18377016)
chr2 (13-312)||(40782467-40782757)
chr2 (317-488)||(2744275-2744442)
chr2 (13-285)||(24576025-24576295)
chr2 (49-303)||(22260432-22260683)
chr2 (13-255)||(24377091-24377332)
chr2 (41-255)||(20151905-20152117)
chr2 (13-316)||(33074216-33074517)
chr2 (13-316)||(28140443-28140729)
chr2 (24-255)||(6573993-6574223)
chr2 (13-305)||(22454809-22455100)
chr2 (13-255)||(39037511-39037752)
chr2 (24-316)||(22802461-22802749)
chr2 (13-316)||(35743811-35744110)
chr2 (13-206)||(24779333-24779525)
chr2 (101-279)||(7609039-7609215)
chr2 (13-316)||(28711521-28711808)
chr2 (13-269)||(23595427-23595677)
chr2 (29-277)||(34321784-34322030)
chr2 (13-269)||(41121577-41121829)
chr2 (13-239)||(31800774-31800997)
chr2 (30-316)||(28701037-28701322)
chr2 (41-279)||(45087028-45087266)
chr2 (30-315)||(22272139-22272420)
chr2 (317-453)||(45682364-45682496)
chr2 (367-488)||(28173825-28173946)
chr2 (24-316)||(6392634-6392911)
chr2 (16-255)||(25189391-25189629)
chr2 (24-277)||(31327813-31328065)
chr2 (24-277)||(31334534-31334786)
chr2 (29-277)||(30557167-30557415)
chr2 (29-316)||(22785474-22785749)
chr2 (24-196)||(26619030-26619200)
chr2 (13-255)||(28550799-28551028)
chr2 (317-450)||(11951996-11952125)
chr2 (397-488)||(28173719-28173810)
chr2 (13-108)||(44840424-44840519)
chr2 (13-108)||(22776303-22776398)
chr2 (13-108)||(22781681-22781776)
chr2 (259-316)||(22776139-22776196)
chr2 (259-316)||(22781517-22781574)
chr2 (29-269)||(44881173-44881409)
chr2 (24-108)||(1587048-1587132)
chr2 (13-81)||(23184346-23184414)
chr2 (13-105)||(31968061-31968153)
chr2 (30-109)||(3277037-3277116)
chr2 (33-108)||(14581525-14581600)
chr2 (13-108)||(40332077-40332172)
chr2 (29-247)||(19115089-19115305)
chr2 (258-316)||(44840639-44840697)
chr2 (259-316)||(28550752-28550809)
chr2 (259-316)||(40332297-40332354)
chr2 (259-303)||(3277240-3277284)
chr2 (258-316)||(31800711-31800769)
chr2 (264-316)||(30557113-30557165)
chr2 (260-316)||(31967877-31967933)
chr2 (145-255)||(1586913-1587021)
chr2 (259-306)||(24377322-24377369)
chr2 (64-122)||(1084047-1084105)
chr2 (258-303)||(18376741-18376786)
chr2 (13-53)||(22258191-22258231)
chr2 (41-85)||(23392706-23392750)
chr2 (259-307)||(25829338-25829386)
chr2 (229-307)||(23184147-23184225)
chr2 (274-313)||(30621437-30621476)
chr2 (274-313)||(30624058-30624097)
chr2 (206-255)||(1084188-1084237)
chr2 (29-118)||(18702744-18702833)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (15-316)||(18434-18734)
[»] chr1 (77 HSPs)
chr1 (13-307)||(20954265-20954558)
chr1 (13-307)||(22599974-22600267)
chr1 (13-307)||(33256145-33256436)
chr1 (13-307)||(33276317-33276608)
chr1 (13-316)||(38282562-38282863)
chr1 (13-316)||(22153852-22154154)
chr1 (13-306)||(19717519-19717809)
chr1 (30-306)||(35401821-35402094)
chr1 (2-255)||(28492248-28492500)
chr1 (13-307)||(2268526-2268815)
chr1 (13-285)||(48704199-48704468)
chr1 (13-306)||(22427151-22427442)
chr1 (13-255)||(1900340-1900581)
chr1 (13-269)||(1577862-1578115)
chr1 (41-306)||(23036322-23036584)
chr1 (30-255)||(32785782-32786005)
chr1 (13-316)||(12284418-12284736)
chr1 (13-269)||(36134185-36134438)
chr1 (13-234)||(22201601-22201821)
chr1 (13-255)||(10757416-10757656)
chr1 (29-255)||(16235142-16235365)
chr1 (24-255)||(39200838-39201066)
chr1 (29-316)||(22464591-22464878)
chr1 (13-255)||(29215792-29216031)
chr1 (29-269)||(2834701-2834938)
chr1 (317-488)||(411079-411246)
chr1 (30-234)||(2267101-2267302)
chr1 (13-316)||(48570016-48570316)
chr1 (13-284)||(25448380-25448651)
chr1 (41-269)||(7309842-7310068)
chr1 (13-316)||(21702809-21703109)
chr1 (16-255)||(30893090-30893327)
chr1 (13-316)||(35040161-35040447)
chr1 (3-306)||(46088974-46089266)
chr1 (13-255)||(21028788-21029029)
chr1 (16-316)||(21191663-21191947)
chr1 (13-253)||(44821393-44821630)
chr1 (13-255)||(26701973-26702214)
chr1 (29-277)||(2327262-2327509)
chr1 (41-255)||(17024811-17025021)
chr1 (13-202)||(12613713-12613899)
chr1 (24-316)||(10250992-10251272)
chr1 (24-187)||(14263362-14263525)
chr1 (24-239)||(30572203-30572414)
chr1 (336-453)||(11109830-11109943)
chr1 (13-105)||(21135153-21135245)
chr1 (29-122)||(7745066-7745159)
chr1 (13-105)||(21121057-21121149)
chr1 (29-105)||(21984607-21984683)
chr1 (245-315)||(12613580-12613649)
chr1 (206-316)||(19170132-19170245)
chr1 (32-105)||(42284642-42284715)
chr1 (13-105)||(37642243-37642335)
chr1 (24-91)||(21204930-21204997)
chr1 (261-316)||(26701927-26701981)
chr1 (259-316)||(37642463-37642521)
chr1 (259-316)||(23024984-23025041)
chr1 (259-308)||(42284842-42284891)
chr1 (259-315)||(2267296-2267352)
chr1 (264-316)||(2327208-2327260)
chr1 (30-118)||(18896577-18896665)
chr1 (229-316)||(19215792-19215880)
chr1 (13-105)||(23024783-23024875)
chr1 (206-284)||(17371211-17371290)
chr1 (259-306)||(21029019-21029066)
chr1 (259-314)||(21120873-21120928)
chr1 (260-314)||(21134969-21135023)
chr1 (259-297)||(21984811-21984849)
chr1 (266-316)||(25448333-25448383)
chr1 (258-316)||(34255312-34255370)
chr1 (13-82)||(19215607-19215676)
chr1 (209-316)||(21204714-21204823)
chr1 (271-316)||(30893314-30893359)
chr1 (258-306)||(17024774-17024822)
chr1 (258-297)||(17371279-17371319)
chr1 (258-305)||(10757645-10757692)
chr1 (269-308)||(44821352-44821391)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (13-305)||(377383-377674)
scaffold0004 (13-316)||(220234-220534)
scaffold0004 (13-316)||(211394-211693)
scaffold0004 (18-195)||(244219-244394)
scaffold0004 (228-315)||(244068-244152)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (41-316)||(4760-5034)
[»] chr8 (78 HSPs)
chr8 (13-315)||(39693523-39693824)
chr8 (13-307)||(16681175-16681466)
chr8 (13-312)||(17914447-17914745)
chr8 (13-278)||(16207294-16207558)
chr8 (13-307)||(29693303-29693596)
chr8 (13-297)||(24646326-24646609)
chr8 (41-307)||(33082873-33083136)
chr8 (16-253)||(12757687-12757923)
chr8 (24-305)||(19943234-19943516)
chr8 (13-314)||(16188972-16189270)
chr8 (13-316)||(19156184-19156472)
chr8 (14-316)||(20382257-20382556)
chr8 (16-306)||(17525600-17525889)
chr8 (31-316)||(23263474-23263757)
chr8 (13-314)||(21932871-21933172)
chr8 (16-269)||(17441716-17441967)
chr8 (13-255)||(602642-602883)
chr8 (14-316)||(17267463-17267761)
chr8 (49-268)||(18121018-18121236)
chr8 (13-316)||(17797410-17797711)
chr8 (16-269)||(18321067-18321319)
chr8 (133-306)||(22745594-22745767)
chr8 (13-255)||(23185150-23185389)
chr8 (13-278)||(17701733-17701997)
chr8 (81-316)||(20255429-20255660)
chr8 (14-255)||(30421352-30421591)
chr8 (13-316)||(18679803-18680089)
chr8 (13-316)||(40845250-40845550)
chr8 (13-255)||(18718989-18719228)
chr8 (24-285)||(15335981-15336240)
chr8 (24-285)||(15425046-15425305)
chr8 (24-285)||(15516350-15516609)
chr8 (16-306)||(19707497-19707783)
chr8 (13-305)||(22673766-22674056)
chr8 (24-316)||(9320567-9320859)
chr8 (13-285)||(36105183-36105453)
chr8 (30-253)||(24551279-24551499)
chr8 (13-239)||(45538379-45538602)
chr8 (29-284)||(1237641-1237894)
chr8 (29-275)||(22663120-22663364)
chr8 (24-221)||(18722602-18722798)
chr8 (24-221)||(18730947-18731143)
chr8 (24-221)||(18685353-18685549)
chr8 (13-113)||(43644884-43644984)
chr8 (24-316)||(43639782-43640063)
chr8 (148-316)||(3598208-3598375)
chr8 (13-109)||(14989518-14989614)
chr8 (41-250)||(24832985-24833192)
chr8 (13-239)||(6407714-6407927)
chr8 (13-109)||(18151713-18151809)
chr8 (13-89)||(25164058-25164134)
chr8 (24-122)||(45567955-45568053)
chr8 (41-158)||(19956360-19956476)
chr8 (31-196)||(22461620-22461783)
chr8 (259-314)||(18151544-18151599)
chr8 (317-401)||(21542381-21542461)
chr8 (259-316)||(13430513-13430570)
chr8 (24-105)||(13430699-13430780)
chr8 (259-316)||(14989337-14989394)
chr8 (213-308)||(43774053-43774150)
chr8 (260-316)||(6407934-6407990)
chr8 (244-306)||(18722502-18722564)
chr8 (244-306)||(18730847-18730909)
chr8 (259-316)||(1745368-1745425)
chr8 (259-316)||(21288611-21288668)
chr8 (259-316)||(24551521-24551578)
chr8 (269-314)||(12757640-12757685)
chr8 (259-316)||(21301230-21301287)
chr8 (206-255)||(21541125-21541174)
chr8 (269-314)||(24832935-24832980)
chr8 (29-85)||(21301026-21301082)
chr8 (66-122)||(21540985-21541041)
chr8 (41-105)||(33560295-33560359)
chr8 (30-85)||(21288408-21288463)
chr8 (271-314)||(22663375-22663418)
chr8 (142-255)||(14989384-14989495)
chr8 (260-306)||(18685282-18685328)
chr8 (273-306)||(18158707-18158740)
[»] chr7 (103 HSPs)
chr7 (13-315)||(10883038-10883339)
chr7 (13-315)||(13880096-13880397)
chr7 (16-316)||(11319400-11319699)
chr7 (13-316)||(22577887-22578187)
chr7 (29-314)||(15467924-15468208)
chr7 (14-255)||(15088513-15088753)
chr7 (24-307)||(28409042-28409323)
chr7 (13-306)||(16316433-16316723)
chr7 (13-316)||(9069554-9069857)
chr7 (13-255)||(2913533-2913774)
chr7 (13-245)||(13302802-13303033)
chr7 (13-255)||(44467056-44467298)
chr7 (13-305)||(11792899-11793191)
chr7 (13-248)||(13137827-13138061)
chr7 (24-285)||(21283270-21283528)
chr7 (13-316)||(12366614-12366914)
chr7 (13-269)||(29935272-29935524)
chr7 (13-315)||(30025897-30026184)
chr7 (13-255)||(2500030-2500271)
chr7 (13-255)||(21695393-21695634)
chr7 (13-255)||(33691637-33691878)
chr7 (24-252)||(23279887-23280113)
chr7 (13-255)||(9709729-9709968)
chr7 (13-239)||(21692279-21692504)
chr7 (13-255)||(13648721-13648960)
chr7 (42-307)||(13692372-13692625)
chr7 (24-255)||(24788144-24788372)
chr7 (15-306)||(13730566-13730839)
chr7 (30-255)||(30945285-30945505)
chr7 (13-255)||(48236829-48237068)
chr7 (13-234)||(30944271-30944489)
chr7 (41-255)||(33605705-33605917)
chr7 (13-307)||(13260498-13260781)
chr7 (13-316)||(4821466-4821766)
chr7 (13-255)||(331637-331877)
chr7 (24-308)||(35952560-35952843)
chr7 (24-224)||(14426550-14426747)
chr7 (22-255)||(19236969-19237200)
chr7 (41-255)||(28622283-28622494)
chr7 (16-255)||(39284490-39284727)
chr7 (41-316)||(12174205-12174479)
chr7 (13-266)||(13018421-13018671)
chr7 (13-239)||(16111827-16112050)
chr7 (16-213)||(5000788-5000985)
chr7 (189-307)||(14193241-14193359)
chr7 (13-122)||(16309964-16310073)
chr7 (47-255)||(16542947-16543152)
chr7 (47-255)||(16622510-16622715)
chr7 (15-151)||(14193108-14193243)
chr7 (24-255)||(2265446-2265674)
chr7 (24-292)||(19710900-19711168)
chr7 (13-308)||(8182922-8183214)
chr7 (13-242)||(41842212-41842439)
chr7 (13-306)||(48062704-48062986)
chr7 (41-306)||(13880608-13880875)
chr7 (227-306)||(13303043-13303122)
chr7 (66-236)||(15704445-15704612)
chr7 (24-221)||(13893958-13894153)
chr7 (150-234)||(4494634-4494718)
chr7 (24-108)||(1293033-1293117)
chr7 (41-118)||(9098307-9098384)
chr7 (101-192)||(13472568-13472658)
chr7 (40-290)||(13031975-13032211)
chr7 (24-105)||(14425450-14425531)
chr7 (29-105)||(19339324-19339400)
chr7 (66-153)||(16556665-16556751)
chr7 (66-153)||(16608911-16608997)
chr7 (259-316)||(1293185-1293242)
chr7 (259-316)||(7339764-7339821)
chr7 (13-105)||(27871710-27871803)
chr7 (259-316)||(30945253-30945310)
chr7 (259-307)||(2500261-2500309)
chr7 (260-316)||(14426752-14426808)
chr7 (246-316)||(5000719-5000789)
chr7 (245-315)||(9098110-9098179)
chr7 (259-316)||(5826185-5826242)
chr7 (245-306)||(19236886-19236947)
chr7 (259-316)||(19339139-19339196)
chr7 (259-312)||(21381321-21381374)
chr7 (13-105)||(24794788-24794881)
chr7 (259-306)||(21695624-21695671)
chr7 (259-306)||(27871931-27871978)
chr7 (258-316)||(48805737-48805796)
chr7 (264-306)||(15088748-15088790)
chr7 (261-315)||(16622707-16622761)
chr7 (259-305)||(44467288-44467334)
chr7 (259-307)||(13648935-13648983)
chr7 (29-105)||(48805953-48806029)
chr7 (210-284)||(4428984-4429059)
chr7 (29-72)||(4494585-4494628)
chr7 (161-235)||(7339821-7339893)
chr7 (269-308)||(16111772-16111811)
chr7 (259-306)||(24788347-24788394)
chr7 (258-297)||(13682726-13682767)
chr7 (267-313)||(14425666-14425712)
chr7 (338-426)||(15688602-15688682)
chr7 (338-426)||(15696195-15696275)
chr7 (338-426)||(15703175-15703255)
chr7 (264-314)||(32264608-32264658)
chr7 (283-316)||(13137788-13137821)
chr7 (143-238)||(14425559-14425651)
chr7 (258-307)||(24794631-24794680)
chr7 (259-316)||(30944220-30944277)
[»] chr6 (76 HSPs)
chr6 (15-316)||(9717841-9718141)
chr6 (13-306)||(13602168-13602460)
chr6 (29-312)||(13435544-13435826)
chr6 (17-316)||(23284564-23284861)
chr6 (13-255)||(32544261-32544502)
chr6 (30-307)||(21625114-21625386)
chr6 (29-307)||(15531484-15531761)
chr6 (13-315)||(26972079-26972379)
chr6 (13-316)||(24116824-24117126)
chr6 (41-308)||(18435580-18435847)
chr6 (98-306)||(25597560-25597767)
chr6 (14-252)||(20112614-20112852)
chr6 (13-255)||(12715333-12715573)
chr6 (13-255)||(15302196-15302435)
chr6 (24-234)||(14100373-14100582)
chr6 (317-488)||(29935391-29935558)
chr6 (13-316)||(19086154-19086431)
chr6 (24-254)||(29918024-29918250)
chr6 (13-269)||(19623975-19624228)
chr6 (16-221)||(15987232-15987437)
chr6 (24-289)||(21618251-21618514)
chr6 (29-255)||(22802153-22802376)
chr6 (41-234)||(19688790-19688980)
chr6 (24-255)||(20730618-20730846)
chr6 (13-291)||(22076284-22076560)
chr6 (13-255)||(16265064-16265303)
chr6 (13-196)||(18378310-18378492)
chr6 (47-240)||(34451595-34451787)
chr6 (24-253)||(15954710-15954936)
chr6 (24-314)||(20487771-20488060)
chr6 (13-277)||(16336123-16336381)
chr6 (24-253)||(19832948-19833175)
chr6 (24-255)||(16877220-16877448)
chr6 (30-316)||(19470683-19470964)
chr6 (24-239)||(12349000-12349211)
chr6 (24-307)||(26943583-26943851)
chr6 (29-255)||(21235137-21235348)
chr6 (30-202)||(10640384-10640555)
chr6 (24-193)||(12423268-12423435)
chr6 (13-104)||(25594064-25594155)
chr6 (250-315)||(10640289-10640353)
chr6 (13-105)||(19066079-19066171)
chr6 (258-316)||(19482993-19483051)
chr6 (259-316)||(12423446-12423503)
chr6 (13-94)||(17381517-17381598)
chr6 (259-316)||(19065894-19065951)
chr6 (259-316)||(22802366-22802423)
chr6 (259-316)||(33351796-33351853)
chr6 (206-316)||(22386972-22387084)
chr6 (261-316)||(19832869-19832924)
chr6 (13-84)||(33352008-33352079)
chr6 (258-316)||(17381653-17381711)
chr6 (258-316)||(26589847-26589905)
chr6 (259-316)||(17608190-17608247)
chr6 (206-297)||(21128396-21128490)
chr6 (259-316)||(139235-139292)
chr6 (259-316)||(147256-147313)
chr6 (206-255)||(17608237-17608286)
chr6 (24-105)||(19482759-19482840)
chr6 (259-304)||(19688974-19689019)
chr6 (259-316)||(21235338-21235395)
chr6 (18-122)||(14070107-14070210)
chr6 (317-400)||(29875131-29875211)
chr6 (258-316)||(20635946-20636005)
chr6 (259-314)||(32544492-32544547)
chr6 (260-307)||(34451545-34451592)
chr6 (258-296)||(12715306-12715344)
chr6 (24-122)||(14051426-14051523)
chr6 (259-297)||(16877438-16877476)
chr6 (209-255)||(19065941-19065987)
chr6 (268-306)||(20112574-20112612)
chr6 (13-82)||(17316609-17316678)
chr6 (13-85)||(26589595-26589668)
chr6 (271-307)||(15302422-15302458)
chr6 (223-255)||(18378504-18378536)
chr6 (29-113)||(25930485-25930568)
[»] chr3 (97 HSPs)
chr3 (13-306)||(49642634-49642926)
chr3 (13-316)||(20646149-20646452)
chr3 (16-314)||(13948334-13948631)
chr3 (13-316)||(6090727-6091029)
chr3 (13-316)||(31303381-31303686)
chr3 (15-316)||(28582103-28582404)
chr3 (16-312)||(15903196-15903492)
chr3 (13-316)||(14392868-14393168)
chr3 (41-316)||(52920429-52920702)
chr3 (13-255)||(37467328-37467567)
chr3 (13-315)||(29951302-29951602)
chr3 (13-315)||(30000456-30000756)
chr3 (13-255)||(2561183-2561424)
chr3 (29-316)||(18121483-18121770)
chr3 (29-255)||(38177566-38177791)
chr3 (13-196)||(41494994-41495176)
chr3 (24-255)||(47207712-47207941)
chr3 (32-255)||(14969341-14969563)
chr3 (13-314)||(12962965-12963249)
chr3 (16-255)||(17238847-17239083)
chr3 (13-255)||(40799869-40800108)
chr3 (13-255)||(47405346-47405585)
chr3 (13-255)||(16658541-16658782)
chr3 (42-316)||(46349707-46349979)
chr3 (29-255)||(18142677-18142900)
chr3 (29-269)||(49553400-49553637)
chr3 (41-213)||(13824092-13824263)
chr3 (13-186)||(13780576-13780748)
chr3 (13-242)||(12726166-12726394)
chr3 (13-316)||(53056590-53056891)
chr3 (24-255)||(11223569-11223797)
chr3 (24-285)||(14955433-14955692)
chr3 (13-255)||(20627356-20627595)
chr3 (13-306)||(25398147-25398419)
chr3 (13-224)||(24775490-24775698)
chr3 (29-285)||(2785075-2785330)
chr3 (13-255)||(19888869-19889107)
chr3 (13-316)||(29855404-29855706)
chr3 (13-221)||(16032520-16032726)
chr3 (24-303)||(20725093-20725368)
chr3 (29-316)||(21640878-21641162)
chr3 (13-153)||(22804048-22804187)
chr3 (41-279)||(33583252-33583490)
chr3 (229-315)||(41495184-41495270)
chr3 (29-316)||(49666278-49666553)
chr3 (13-255)||(22140759-22140996)
chr3 (24-234)||(5213583-5213789)
chr3 (80-269)||(11869130-11869317)
chr3 (338-485)||(29896333-29896476)
chr3 (14-206)||(12388845-12389035)
chr3 (13-314)||(21636544-21636834)
chr3 (13-316)||(21605526-21605818)
chr3 (42-206)||(19249385-19249547)
chr3 (252-316)||(13824265-13824329)
chr3 (31-159)||(23538185-23538312)
chr3 (229-306)||(22803972-22804049)
chr3 (259-316)||(30054104-30054161)
chr3 (13-85)||(11868264-11868336)
chr3 (30-122)||(11909079-11909171)
chr3 (245-307)||(12388729-12388791)
chr3 (24-118)||(12968312-12968406)
chr3 (41-168)||(50300246-50300372)
chr3 (260-316)||(40851184-40851240)
chr3 (210-316)||(1727888-1727995)
chr3 (245-316)||(16199674-16199744)
chr3 (51-122)||(45858804-45858875)
chr3 (13-108)||(46796436-46796531)
chr3 (206-316)||(50300387-50300498)
chr3 (259-316)||(46796255-46796312)
chr3 (261-316)||(11223789-11223844)
chr3 (258-316)||(37467541-37467599)
chr3 (259-316)||(2561414-2561471)
chr3 (259-316)||(18142645-18142702)
chr3 (259-316)||(33598105-33598162)
chr3 (13-85)||(30054309-30054381)
chr3 (41-105)||(40850991-40851055)
chr3 (66-122)||(51341051-51341107)
chr3 (64-122)||(12752683-12752741)
chr3 (24-118)||(26417738-26417832)
chr3 (142-255)||(46796302-46796412)
chr3 (262-307)||(14969556-14969601)
chr3 (259-308)||(24775388-24775437)
chr3 (259-315)||(9699943-9699999)
chr3 (13-105)||(9700108-9700200)
chr3 (317-364)||(10539963-10540010)
chr3 (13-63)||(1728129-1728179)
chr3 (259-316)||(10529552-10529610)
chr3 (259-316)||(13977941-13977999)
chr3 (259-316)||(15833612-15833670)
chr3 (258-296)||(19888842-19888880)
chr3 (206-279)||(51341189-51341263)
chr3 (258-292)||(51341257-51341291)
chr3 (317-426)||(10525584-10525689)
chr3 (64-108)||(15833442-15833486)
chr3 (64-108)||(15851048-15851092)
chr3 (260-316)||(17238816-17238871)
chr3 (210-281)||(49990426-49990498)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (16-314)||(474-771)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (13-307)||(17814960-17815251)
chr5 (13-285)||(7745569-7745838)
chr5 (13-308)||(19536153-19536446)
chr5 (13-255)||(21910548-21910787)
chr5 (13-255)||(41566338-41566579)
chr5 (13-255)||(6512337-6512573)
chr5 (13-269)||(21072131-21072385)
chr5 (13-306)||(23412843-23413119)
chr5 (13-255)||(89328-89567)
chr5 (13-255)||(33022656-33022895)
chr5 (13-306)||(20550887-20551162)
chr5 (13-255)||(26784346-26784587)
chr5 (13-303)||(23881059-23881347)
chr5 (24-316)||(42243683-42243974)
chr5 (29-231)||(13545448-13545641)
chr5 (13-316)||(29138252-29138551)
chr5 (29-316)||(642552-642836)
chr5 (13-306)||(21099558-21099849)
chr5 (13-253)||(11993880-11994117)
chr5 (13-255)||(4887014-4887253)
chr5 (13-234)||(31117869-31118088)
chr5 (24-285)||(30742983-30743242)
chr5 (24-253)||(15516972-15517198)
chr5 (29-285)||(26759157-26759411)
chr5 (13-256)||(6499231-6499471)
chr5 (13-253)||(14086445-14086684)
chr5 (24-255)||(3245348-3245575)
chr5 (13-108)||(12352845-12352940)
chr5 (24-206)||(25096777-25096960)
chr5 (24-206)||(25154747-25154930)
chr5 (13-269)||(21198896-21199148)
chr5 (13-255)||(9398649-9398879)
chr5 (24-292)||(32160769-32161036)
chr5 (13-178)||(33933259-33933424)
chr5 (227-306)||(12352671-12352750)
chr5 (13-156)||(28139599-28139741)
chr5 (13-109)||(9088961-9089057)
chr5 (24-164)||(26765501-26765640)
chr5 (13-122)||(30115873-30115982)
chr5 (24-108)||(28464389-28464473)
chr5 (13-109)||(25930205-25930301)
chr5 (13-105)||(35932059-35932151)
chr5 (13-108)||(10848765-10848860)
chr5 (259-306)||(30115745-30115792)
chr5 (210-316)||(35986085-35986192)
chr5 (245-307)||(25096661-25096723)
chr5 (245-307)||(25154631-25154693)
chr5 (259-315)||(3245302-3245358)
chr5 (259-307)||(26784577-26784625)
chr5 (258-316)||(23391473-23391531)
chr5 (206-297)||(23478536-23478629)
chr5 (259-316)||(33022885-33022942)
chr5 (260-316)||(5430106-5430162)
chr5 (29-113)||(16607520-16607603)
chr5 (259-307)||(21910762-21910810)
chr5 (260-316)||(35931873-35931929)
chr5 (260-315)||(89297-89352)
chr5 (130-255)||(5429991-5430115)
chr5 (258-297)||(6512309-6512348)
chr5 (269-316)||(28464208-28464255)
chr5 (24-114)||(11208030-11208119)
chr5 (142-239)||(25930087-25930182)
chr5 (266-307)||(4887250-4887291)
chr5 (259-316)||(10848985-10849042)
chr5 (260-316)||(28139809-28139865)
chr5 (260-308)||(33933523-33933571)
chr5 (269-316)||(14086396-14086443)
chr5 (138-255)||(9089076-9089190)
chr5 (259-316)||(21660439-21660497)
chr5 (190-255)||(30115782-30115845)
chr5 (24-105)||(23391656-23391737)
chr5 (258-307)||(17447041-17447092)
chr5 (29-85)||(21660220-21660276)
chr5 (146-253)||(28464257-28464361)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (13-307)||(12205-12498)
[»] chr4 (90 HSPs)
chr4 (24-307)||(45833395-45833677)
chr4 (13-306)||(12811007-12811296)
chr4 (24-316)||(14604727-14605017)
chr4 (13-269)||(29680410-29680665)
chr4 (13-312)||(16632430-16632726)
chr4 (13-285)||(37435387-37435656)
chr4 (22-307)||(12601100-12601382)
chr4 (13-255)||(19884692-19884932)
chr4 (13-273)||(3395580-3395840)
chr4 (13-307)||(40846089-40846382)
chr4 (317-488)||(6736143-6736310)
chr4 (13-255)||(13575996-13576235)
chr4 (41-255)||(3483739-3483952)
chr4 (13-219)||(19666362-19666567)
chr4 (13-222)||(37985525-37985733)
chr4 (13-251)||(10072925-10073161)
chr4 (13-209)||(9140902-9141097)
chr4 (24-255)||(22675402-22675630)
chr4 (13-255)||(55380280-55380519)
chr4 (28-255)||(56034579-56034803)
chr4 (13-255)||(14904236-14904477)
chr4 (24-307)||(17247245-17247525)
chr4 (76-307)||(14833449-14833674)
chr4 (13-234)||(19620962-19621182)
chr4 (13-315)||(10692841-10693126)
chr4 (13-315)||(10906607-10906892)
chr4 (13-315)||(6641674-6641971)
chr4 (13-255)||(19911760-19912002)
chr4 (29-255)||(413008-413231)
chr4 (316-488)||(2464807-2464979)
chr4 (24-255)||(54679931-54680157)
chr4 (15-318)||(29121362-29121667)
chr4 (126-265)||(23123533-23123672)
chr4 (13-255)||(6517475-6517714)
chr4 (13-262)||(23750512-23750758)
chr4 (126-306)||(15139329-15139510)
chr4 (79-316)||(55731836-55732069)
chr4 (169-306)||(22089733-22089869)
chr4 (24-168)||(8105638-8105782)
chr4 (13-234)||(3105323-3105540)
chr4 (13-122)||(16853493-16853602)
chr4 (33-181)||(16940026-16940172)
chr4 (13-239)||(17398582-17398795)
chr4 (24-178)||(56533018-56533172)
chr4 (24-166)||(25651073-25651214)
chr4 (43-196)||(11915720-11915871)
chr4 (259-316)||(14571243-14571300)
chr4 (259-308)||(22191057-22191106)
chr4 (13-105)||(22190836-22190928)
chr4 (209-316)||(40860841-40860949)
chr4 (13-91)||(38513868-38513946)
chr4 (258-318)||(3499481-3499541)
chr4 (260-316)||(8105889-8105945)
chr4 (13-105)||(40860657-40860749)
chr4 (259-306)||(17398529-17398576)
chr4 (259-305)||(6517704-6517750)
chr4 (259-316)||(9751383-9751441)
chr4 (258-316)||(56034792-56034850)
chr4 (259-316)||(413221-413278)
chr4 (259-316)||(3105272-3105329)
chr4 (259-316)||(14904155-14904212)
chr4 (259-316)||(16940196-16940253)
chr4 (259-316)||(20977648-20977705)
chr4 (13-105)||(9751569-9751661)
chr4 (210-316)||(17700631-17700736)
chr4 (13-105)||(20977447-20977539)
chr4 (41-104)||(3499682-3499745)
chr4 (29-68)||(8685509-8685548)
chr4 (24-83)||(17540396-17540455)
chr4 (259-306)||(55380494-55380541)
chr4 (259-316)||(15474986-15475044)
chr4 (258-307)||(9141095-9141144)
chr4 (29-113)||(17788067-17788152)
chr4 (29-85)||(1672395-1672451)
chr4 (29-85)||(1674870-1674926)
chr4 (13-112)||(14154015-14154115)
chr4 (259-315)||(27188502-27188558)
chr4 (260-308)||(39419587-39419635)
chr4 (13-81)||(39419787-39419855)
chr4 (29-113)||(41114791-41114875)
chr4 (273-316)||(3486351-3486394)
chr4 (273-316)||(19620912-19620955)
chr4 (190-251)||(3793289-3793348)
chr4 (259-316)||(19884922-19884980)
chr4 (259-316)||(25650978-25651035)
chr4 (24-105)||(27188667-27188748)
chr4 (40-112)||(11901204-11901276)
chr4 (227-255)||(14153884-14153912)
chr4 (29-85)||(15475192-15475248)
chr4 (64-108)||(33378444-33378488)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (13-316)||(5505-5805)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (16-306)||(25798-26087)
scaffold0083 (50-181)||(44652-44782)
[»] scaffold0084 (4 HSPs)
scaffold0084 (13-270)||(49328-49584)
scaffold0084 (13-255)||(32481-32722)
scaffold0084 (24-292)||(182-449)
scaffold0084 (259-307)||(32712-32760)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (24-316)||(212361-212651)
scaffold0005 (76-307)||(6025-6250)
scaffold0005 (259-316)||(246076-246133)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (13-305)||(36599-36890)
scaffold0120 (13-305)||(42115-42406)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (13-316)||(20784-21086)
[»] scaffold0026 (5 HSPs)
scaffold0026 (13-307)||(60012-60303)
scaffold0026 (13-255)||(7922-8161)
scaffold0026 (205-316)||(115708-115817)
scaffold0026 (229-305)||(151714-151788)
scaffold0026 (271-307)||(8148-8184)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (13-297)||(22672-22956)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (16-316)||(19288-19584)
scaffold0035 (13-273)||(99065-99320)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (13-285)||(14644-14913)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (22-255)||(7708-7940)
scaffold0251 (259-316)||(7930-7987)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (13-316)||(1686-2001)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (86-307)||(610-828)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (24-316)||(215311-215601)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (16-255)||(9981-10220)
scaffold0161 (16-84)||(14816-14884)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (47-315)||(9825-10090)
[»] scaffold0217 (4 HSPs)
scaffold0217 (13-253)||(19027-19266)
scaffold0217 (13-285)||(21976-22246)
scaffold0217 (24-316)||(9567-9841)
scaffold0217 (271-316)||(21930-21975)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (16-255)||(15116-15352)
scaffold0146 (260-316)||(15328-15383)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (13-315)||(27259-27544)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (13-255)||(1656-1895)
scaffold0210 (259-303)||(1870-1914)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (30-269)||(103585-103821)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (13-255)||(89931-90170)
scaffold0003 (259-316)||(89884-89941)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (13-306)||(9965-10241)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (76-307)||(30283-30508)
scaffold0047 (13-269)||(9899-10151)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (58-255)||(143129-143325)
scaffold0007 (259-308)||(143315-143364)
[»] scaffold0426 (2 HSPs)
scaffold0426 (13-188)||(13567-13741)
scaffold0426 (258-307)||(13850-13899)
[»] scaffold0022 (7 HSPs)
scaffold0022 (80-255)||(39488-39662)
scaffold0022 (80-255)||(137548-137722)
scaffold0022 (13-305)||(159051-159356)
scaffold0022 (29-78)||(37414-37463)
scaffold0022 (259-316)||(39652-39709)
scaffold0022 (29-78)||(135474-135523)
scaffold0022 (259-316)||(137712-137769)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (317-488)||(19324-19491)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (2-277)||(6593-6866)
scaffold0439 (264-316)||(6539-6591)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (3-316)||(15779-16077)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (41-255)||(78242-78453)
scaffold0043 (261-316)||(78195-78250)
[»] scaffold1359 (4 HSPs)
scaffold1359 (24-224)||(562-759)
scaffold1359 (24-105)||(1778-1859)
scaffold1359 (260-316)||(501-557)
scaffold1359 (142-238)||(1658-1751)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (13-307)||(9952-10243)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (24-316)||(6970-7260)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (24-253)||(60810-61036)
scaffold0015 (269-308)||(61038-61077)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (134-306)||(4816-4988)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (13-285)||(3300-3570)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (13-314)||(5418-5717)
[»] scaffold0056 (5 HSPs)
scaffold0056 (31-315)||(36002-36281)
scaffold0056 (206-316)||(25488-25599)
scaffold0056 (259-316)||(34642-34699)
scaffold0056 (13-105)||(34827-34919)
scaffold0056 (24-105)||(25688-25769)
[»] scaffold1331 (2 HSPs)
scaffold1331 (41-224)||(1606-1786)
scaffold1331 (259-315)||(441-497)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (30-253)||(9168-9387)
[»] scaffold0364 (2 HSPs)
scaffold0364 (13-224)||(6003-6212)
scaffold0364 (258-316)||(6230-6287)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (24-315)||(43719-44023)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (199-305)||(13357-13462)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (134-255)||(5813-5935)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (71-255)||(144350-144530)
scaffold0011 (24-122)||(164952-165050)
scaffold0011 (71-255)||(65305-65485)
[»] scaffold0485 (2 HSPs)
scaffold0485 (198-285)||(9252-9337)
scaffold0485 (271-314)||(9208-9251)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (30-196)||(1455-1619)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (33-96)||(2027-2090)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (24-284)||(5634-5895)
[»] scaffold0527 (3 HSPs)
scaffold0527 (48-239)||(7963-8150)
scaffold0527 (263-316)||(97-150)
scaffold0527 (273-316)||(8170-8213)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (24-123)||(15627-15726)
scaffold0211 (258-292)||(15455-15489)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (24-110)||(1324-1410)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (24-110)||(1-87)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (24-122)||(38091-38189)
scaffold0132 (206-279)||(37935-38009)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (199-269)||(60729-60799)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (13-118)||(74577-74682)
scaffold0025 (169-277)||(74718-74824)
scaffold0025 (258-307)||(74820-74869)
[»] scaffold0608 (1 HSPs)
scaffold0608 (336-453)||(5267-5380)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (30-122)||(1803-1895)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (13-108)||(17785-17880)
scaffold0249 (259-316)||(17604-17661)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (13-135)||(25393-25514)
scaffold0247 (142-255)||(23439-23549)
scaffold0247 (259-316)||(23392-23449)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (13-158)||(2702-2845)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (24-221)||(40644-40839)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (262-316)||(8511-8565)
[»] scaffold0387 (2 HSPs)
scaffold0387 (24-85)||(7388-7449)
scaffold0387 (209-296)||(7561-7649)
[»] scaffold0473 (2 HSPs)
scaffold0473 (259-306)||(2551-2598)
scaffold0473 (13-81)||(2738-2806)
[»] scaffold0352 (2 HSPs)
scaffold0352 (24-103)||(846-925)
scaffold0352 (259-294)||(681-716)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (13-91)||(87637-87715)
scaffold0045 (258-316)||(87425-87483)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (258-316)||(937-995)
scaffold0016 (24-105)||(731-812)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (259-316)||(35442-35499)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (258-316)||(11615-11673)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (24-85)||(3938-3999)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (264-316)||(11975-12027)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (352-426)||(40785-40856)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (206-285)||(1521-1603)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (258-297)||(15286-15327)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (258-316)||(3204-3264)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (24-85)||(7292-7353)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 85)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Original strand, 23234997 - 23235297
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  23234997 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaa 23235096  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23235097 ttctttcaaa-atagtcgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatc 23235195  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23235196 tcatgatgaactagagcttctggtgattttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgactt 23235295  T
Q  313 ca 314  Q
    ||    
T  23235296 ca 23235297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 313
Target Start/End: Original strand, 30666979 - 30667278
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30666979 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgccttcaaa 30667078  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  30667079 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcattcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaattcttgcatc 30667177  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30667178 tcctgatgaactacaacttctgatattcttcagcttctgatgagatgcttctgacgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgactt 30667277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20568860 - 20568567
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20568860 agcagatacacaaactgagtagtggggatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20568761  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20568760 tcctttcaaa-attgttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtcttgcatc 20568662  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20568661 tcctgatgaactacagcttctggtgatcttgaacttcttatgagatgcttctgatgaacttgcttcaaatgacgtcatcacctcatgagcacttt 20568567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22188212 - 22187920
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22188212 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgttaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22188113  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||  |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  22188112 tctattcaaa-atagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatg 22188014  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22188013 tcctgatgaacttcaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 22187920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9015478 - 9015181
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  9015478 agcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac--cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 9015381  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9015380 tcctttcaaa-atagttgttgtttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 9015282  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  9015281 tcctgatgaactttagtttctgg-gatcttctgcttctgatgagttgtttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggatcacttttactt 9015183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25037369 - 25037096
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  25037369 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25037270  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  25037269 tcctttcaaatt-agtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 25037171  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgt 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25037170 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgt 25037096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25041476 - 25041203
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  25041476 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25041377  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  25041376 tcctttcaaatt-agtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 25041278  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgt 287  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25041277 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgt 25041203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 302
Target Start/End: Original strand, 38781405 - 38781675
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  38781405 gagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcattcaatgccttcaaatcctttcaaa-atagt 38781503  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||   | |     
T  38781504 tgttgcttcacttttccagtcttctacattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcctctgatga--gacat 38781601  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  38781602 cttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagc 38781675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Original strand, 22317583 - 22317886
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  22317583 agcagagataaaaactgaatagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 22317682  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22317683 tcctttcaaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttatgcaatgcttagatgagattaaatccaatgaaaagcctttgaagctttaagtcttgcatc 22317782  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  22317783 tcttgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatgtacttgcttatgatgaacttgcttatgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtct 22317882  T
Q  312 tcag 315  Q
    ||||    
T  22317883 tcag 22317886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21537358 - 21537067
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  21537358 agcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgcctccaaa 21537259  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21537258 acctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgtttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 21537160  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcact 305  Q
    ||||||||||||  | ||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  21537159 tcctgatgaacttcatcttctagtgatctttaacttctgatgaggtgcttctggtgagcttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcact 21537067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13964088 - 13963850
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13964088 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13963989  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  13963988 ttctttcaaa-atagtcgttgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatc 13963890  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctga 252  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  13963889 tactgatgaactagagcttctagtgatctttaacttctga 13963850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 25829124 - 25829363
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25829124 agcagagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 25829223  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  25829224 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtcttgcatc 25829322  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25829323 tcctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatga 25829363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10009860 - 10009569
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10009860 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 10009761  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttc-cagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||| ||   ||||| | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10009760 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactcctcttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcat 10009662  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10009661 ctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--tcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 10009569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24850776 - 24850474
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  24850776 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttgaaa 24850677  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  24850676 tcctttcaaa-atattcgttgcttcactcttctggtcttcagcaatgcgtagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcat 24850578  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    ||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  24850577 ctcctgatgtacttcagcatctggtgatctttagcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgacgacgtcattacttcaggagcac-ttgact 24850479  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  24850478 tcagg 24850474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Original strand, 19540406 - 19540659
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19540406 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaataccttcaaa 19540505  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
     |||||| || | || |||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  19540506 acctttcgaa-atagccgttgcttcactctcctagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 19540604  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  19540605 tcatgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgaggtgcttctgatga 19540659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 30621197 - 30621447
Alignment:
Q  4 ttgtgtaggagcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaat 103  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  30621197 ttgtgttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaat 30621296  T
Q  104 gccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaag 203  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||     
T  30621297 gccttcaaatcctttcaaa-atagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaat 30621395  T
Q  204 tcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30621396 tcttgcatctcctgatgcactacaacttctagtgatattcagcttctgatga 30621447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 30623818 - 30624068
Alignment:
Q  4 ttgtgtaggagcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaat 103  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  30623818 ttgtgttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaat 30623917  T
Q  104 gccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaag 203  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||     
T  30623918 gccttcaaatcctttcaaa-atagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaat 30624016  T
Q  204 tcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30624017 tcttgcatctcctgatgcactacaacttctagtgatattcagcttctgatga 30624068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18377016 - 18376775
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18377016 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 18376917  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||| |||||| ||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  18376916 tcctttcaaa-atagtagttgattcactattaaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtctctcatc 18376818  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    | |  |||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18376817 ttcaaatgaacttcaacttctggtgatcttctgcttctgatga 18376775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 312
Target Start/End: Original strand, 40782467 - 40782757
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  40782467 agcagagacacaaactaagtattggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 40782566  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| | ||||| || ||||||||| |||||||||||     |||  || | |||||||||||||    
T  40782567 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaa----attt--agctctaagtcttgcatc 40782659  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40782660 tcctgatgaaatttagcttctggtgatctt--gcttctgatgaaatgcttctggtgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgactt 40782757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 317 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 2744442 - 2744275
Alignment:
Q  317 tgtcacgacccaatttcaggtcatgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttaca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2744442 tgtcacgacccaatttcaggtcatgaccggcgcacaggctaacactaa----ctcatgatatatttagcctggcaagcctaataaactataacacttaca 2744347  T
Q  417 cctttctaaactactaaaattttggtaatgactcacaagctttcacgacatttcaagatacaagtttattat 488  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2744346 cctttctaaaatactaaaattttggtaatgactcataagctttcacgacatttaaagatacaagtttattat 2744275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 285
Target Start/End: Original strand, 24576025 - 24576295
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |  |||||||||| |||    
T  24576025 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaacgaacaaacaaccaatgcctttaaa 24576124  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgaga-ttaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  24576125 tcctttcaaa-atagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagatttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtattgcat 24576223  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24576224 ctcctaatgaactttagcttctggtgatctt--gcttatgatgatatgcttctgatgaactagcttctgatgac 24576295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 303
Target Start/End: Original strand, 22260432 - 22260683
Alignment:
Q  49 gtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagt 148  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| | | | ||||||||||| |||||||    
T  22260432 gtacacttcttacaattgtactatgtcaaagctcttcaaagaacaagcatccagttccttcaaatccttccaaa-atatttgttgcttcacttttccagt 22260530  T
Q  149 cttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagctt 248  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  |||    
T  22260531 cttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttaacttctggtgatcttc--ctt 22260628  T
Q  249 ctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagca 303  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22260629 ctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagca 22260683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 24377091 - 24377332
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||    
T  24377091 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctctcaaa 24377190  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  24377191 acctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ctaggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcat 24377288  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24377289 ctcttgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatga 24377332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20152117 - 20151905
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  20152117 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaac-taaccgttgcttcact 20152019  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 240  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||||     
T  20152018 tttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaa-tgttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtgatt 20151920  T
Q  241 ttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||||||||    
T  20151919 ttcagcttctgatga 20151905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 33074216 - 33074517
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||| ||||| |||| || ||||||||| ||    
T  33074216 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtattatgtcaacgttttttgaagaataagcatctaatgccttccaa 33074315  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||  | |||| | ||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  33074316 tctgtccaaa-atagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagttttaagt--tgcatc 33074412  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  33074413 tcctgatgaactacaacttctagtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtct 33074512  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  33074513 tcagg 33074517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28140729 - 28140443
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  28140729 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtgatggtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgttttcaaa 28140630  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||      |||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28140629 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactccaatgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatc 28140531  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcac-tttgact 311  Q
    ||| ||||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28140530 tcccgatgaa-----------------cttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgact 28140448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6574223 - 6573993
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaatt-gtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6574223 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 6574124  T
Q  123 cacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatg-tttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatga 221  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  | |||||||| |||||||    
T  6574123 c-tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcattagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatcttctgatga 6574027  T
Q  222 actagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||  | ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6574026 actgcaacttctagtgattttcagcttctgatga 6573993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22455100 - 22454809
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||     
T  22455100 agcagagacacaaactgagtagtggaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 22455001  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagccttt-gaagttttaagtcttgcat 211  Q
    | | ||  ||   | | |||||||||||||||  ||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||    
T  22455000 ttcatttgaattaact-gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgttggg-cgtgattaaatccattgaacacccttttgaagctttaagtctctcat 22454903  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcact 305  Q
    || |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||    
T  22454902 cttctgaagaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgagcttgcttctgacgacgttatcacttcaagagcact 22454809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39037752 - 39037511
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||     
T  39037752 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatctaatgccttcaac 39037653  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | | ||  ||   || |||||||||||| | | | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  39037652 ttcatttgaa-ttagccgttgcttcactttcctaatcttctgcaatgcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtctctcatc 39037554  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    | ||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  39037553 ttctgatcaactttaacttccggtgatcttcagcttctgatga 39037511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 22802461 - 22802749
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||     
T  22802461 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaactctctttgaagaataagcatcatatgccttcaaatcctttcaaa- 22802559  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | || | |||||| ||  ||| |||||||| |||| |||||||||| || |||||||| || ||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  22802560 atagccattgctttacctttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaatagcttttgaatctttaag--ttgcatctcctgatgaac 22802657  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |  || ||||| | | |||  |||||||||| |  | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22802658 tgcaggttctgataaactt--gcttctgatgaattttcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 22802749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35744110 - 35743811
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||    
T  35744110 agcagagacaaaaactgagtagtggagatagtagttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcattcaatgccttcaaa 35744011  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||| |||| | ||||||||||  ||| ||||| | |||| |||| ||||||||   || | ||  || |||| | ||||| | |||||||  ||||||    
T  35744010 tccttccaaa-atagtcgttgctatacttttccaatattctgcaatctttagacgt--ttgagtctgttaaacaacttttgacgctttaagt--tgcatc 35743916  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| ||    
T  35743915 tcctgatgaactacagcttctggtgattttcagcttccgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcactttaagagcactttgtct 35743816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 24779333 - 24779525
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  24779333 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcatacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaaacatccgatgctttcaaa 24779432  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtct 206  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  24779433 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcctctggtctttttcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttcaagtct 24779525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 101 - 279
Target Start/End: Original strand, 7609039 - 7609215
Alignment:
Q  101 aatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccag-tcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||  | |||| |  |||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  7609039 aatgccttcaaatcctttcaaa-ataggtgttgcttcactcctcttggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctt 7609137  T
Q  200 taagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttct 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7609138 taagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttct 7609215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28711808 - 28711521
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28711808 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28711709  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | | ||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||| |||||| |||||||  |||||  |||||||    
T  28711708 ttcattcgaa-atagtcgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacaaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatc 28711612  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
     | | |||||||  ||||||||||||| ||  |             ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  28711611 ccattatgaactgcagcttctggtgattttttg-------------gcttctgataaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtctt 28711525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23595677 - 23595427
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  23595677 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacg--cttcagagaacaagaatccaatgccttcaaa 23595580  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | | ||  ||   |||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||  | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||    
T  23595579 ttcatttgaa-ttagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ctaggtgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctttcatc 23595482  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    | ||||||| ||  |||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  23595481 ttctgatgatcttcagcttctggtgaactt--gcttctgatgaggtgcttctgatga 23595427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34322030 - 34321784
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||  |||||||||||| | |||    
T  34322030 gagtagtgaagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagaatccaatgcctttcaatcctttcaaa-atagt 34321932  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||| |||| |||||||||| || ||||| || |||||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  34321931 cgttgctatacttttccaggcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcctgatgaattacag 34321834  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgctt 277  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  34321833 cttctagtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgctt 34321784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41121829 - 41121577
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||   |||||||||||||||    
T  41121829 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgcacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagagcaataatccaatgccttcaaa 41121730  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||||  ||   |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  || |    
T  41121729 tccttttgaa-ttagtctttgcttcactcatccaatcttctgcaatg-ctaggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaattctcacagc 41121632  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    | ||||||| ||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  41121631 ttctgatgatcttcagcttctggtgatgtt--gcttctgatgaggtgcatctgatga 41121577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31800997 - 31800774
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||||    
T  31800997 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgctctttgaagatcaaacatccaatgctttcaaa 31800898  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||| ||||   |||||||| ||  ||||| | | |||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  31800897 tcctttcaaa-atagttgttgtttcacttttccagtcttctgcaataaatagacgagtttggatccactaagcagcttttgaagctttaag--ttgcatc 31800801  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgat 239  Q
     | |||||||||  || ||||||||||    
T  31800800 ccatgatgaactgcagtttctggtgat 31800774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28701322 - 28701037
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtc 129  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |       
T  28701322 agtagtggaggtaatggttgtacacttcgtacaaacttactttgtcaacgccctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atatct 28701224  T
Q  130 gttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 229  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||| || ||||||| || |||| ||| |||||| |||||||  |||||  ||||||| | |||||||||  |||    
T  28701223 gttgctttacttttccagtcttctgcaatcttaagacgaggttgaatctattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagc 28701126  T
Q  230 ttctggtga-tcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||| | ||  |||||||||  |  || ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  28701125 ttctggtgattttttggcttctgataaacttgtttctgatgaactcacttctgatgatgtcaccacttcaggagcactttgtcttcagg 28701037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45087266 - 45087028
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45087266 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgagaataagcatctaatgcattcaaatcctttcaaa-atagtcgttgcttcact 45087168  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaat-ccattgaacagc-ctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga 238  Q
     |||||||||||| ||||  ||||||||| || ||| ||||| |||| |  ||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||  ||||||| ||||    
T  45087167 tttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaactttttgaagctttaag--ttgcatcctctgatgaactgtagcttctagtga 45087070  T
Q  239 tcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttct 279  Q
    | || ||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||    
T  45087069 tatttagcttctgataaacttgcttcttatgaacttgcttct 45087028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 315
Target Start/End: Original strand, 22272139 - 22272420
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaa-gcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||  || ||| || || |||||||||||||||||| ||  ||   |||    
T  22272139 agtagtggagatagtggttgtacacttcttacaattttcctttttcaactctctccaacgaaaaaagcatccaatgccttcaaatccatttgaatt-agt 22272237  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||  ||||||| ||||||||  |  || |||  || || ||||||| ||  ||    
T  22272238 cattgcttcattcttccagtcttctgcaatgat-agacgtgattaaatcatttgaacaacctttgaaactccaattctctcagcttctgatgatcttcag 22272336  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  22272337 cttctggtgatgtt--gcttctgatgaggtgtttctgatgaacttgtttctaatgacgtcatcacttcaggagta-tttgacttcag 22272420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 317 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 45682496 - 45682364
Alignment:
Q  317 tgtcacgacccaatttcaggtcatgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttaca 416  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| ||| |    
T  45682496 tgtcacgacccaatctcaggtcatgaccggcgtacaggctaacactaa----ctcatgataaatttaacctggcaagcctagtaaactacaacaattaga 45682401  T
Q  417 cctttctaaactactaaaattttggtaatgactcaca 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45682400 cctttctaaaatactaaaattttggtaacgactcaca 45682364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 367 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 28173946 - 28173825
Alignment:
Q  367 aactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttacacctttctaaactactaaaattttggtaatgactcacaagctttcacgaca 466  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28173946 aactcatgataaatttagcccggcaagcctaataaactataacacttacaccttttttaaataccgaaattttggtaatgactcacaaactttcaagaca 28173847  T
Q  467 tttcaagatacaagtttattat 488  Q
    |||||| || ||||||||||||    
T  28173846 tttcaaaatgcaagtttattat 28173825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 6392634 - 6392911
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaag-aacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6392634 aaacagagtagtggaggtagtggttgcgcacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa 6392733  T
Q  123 cacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatc-cattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatga 221  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| || |||| |||| |||||| |||||||  |||||   ||||||  |||||||    
T  6392734 -atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcacattaaacagcttttgaagccttaaga--tgcatcctctgatga 6392830  T
Q  222 actagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||  | ||| ||||||| || |||||||||| |              |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6392831 actgcaacttatggtgatttttagcttctgataa--------------acttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 6392911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 25189391 - 25189629
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||| | |    
T  25189391 agagacacaaattgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttc 25189490  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcc 215  Q
     ||  ||   |||| |||||||||||| |  ||||||| |||||  |||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| |    
T  25189491 atttgaa-ttagtcattgcttcactctcctggtcttctgcaatg-ctaggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttc 25189588  T
Q  216 tgatgaac-tagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    | || ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25189589 taataaacttttagcttcaggtgatcttcagcttctgatga 25189629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31328065 - 31327813
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||     
T  31328065 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaa- 31327967  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagc-ctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaa 222  Q
    | |||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||| |||| || ||||| ||||||| |  ||||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  31327966 atagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaa 31327869  T
Q  223 ctagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgctt 277  Q
    ||  |||||||||||||   |||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||    
T  31327868 ctgcagcttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgaactagctt 31327813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31334786 - 31334534
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||     
T  31334786 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaa- 31334688  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagc-ctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaa 222  Q
    | |||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||| |||| || ||||| ||||||| |  ||||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  31334687 atagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaa 31334590  T
Q  223 ctagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgctt 277  Q
    ||  |||||||||||||   |||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||    
T  31334589 ctgcagcttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgaactagctt 31334534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30557415 - 30557167
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacag 127  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||| |||||||| | ||    
T  30557415 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgtgttcaaattctttcaaa-atag 30557317  T
Q  128 tcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaat-ccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactag 226  Q
    ||| ||||||||| || ||||| ||| ||||  ||||||||| || ||| ||||| ||||   |||||||  |||||  |||||||  ||||||||||      
T  30557316 tcgatgcttcactttttcagtcctctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaatttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgc 30557219  T
Q  227 agcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgctt 277  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  30557218 agcttctggtgatatttagcttctgatgaacttgcttctgatgaactcgctt 30557167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22785749 - 22785474
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||         ||||| | |||    
T  22785749 gagtagtggagatagtggttatacactttgtacaaaagtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt---------tcaaa-atagt 22785660  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    |||||||  ||  ||||||| |||| |||| ||||| |||| || ||  | |  || ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||    
T  22785659 cgttgctatacatttccagttttctgcaat-tttaggcgagtttgaaatcttgaaatagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgtag 22785563  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||   |||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22785562 cttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttttgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaagagcactttgtcttcagg 22785474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26619200 - 26619030
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||||| |||| | |||||||||||||| ||||  ||     
T  26619200 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaa- 26619102  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaag 196  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||  ||||||| |||||||||    
T  26619101 atagttgttgcttcattcttccagtcttctgcaatg-ataggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaag 26619030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28551028 - 28550799
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||            
T  28551028 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 28550937  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
     ||||||||| | ||| ||| ||  ||| |||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||| |  |||||| ||||| |||||||   |||||||    
T  28550936 -cctttcaaa-atagttgtttctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggttttaa--attgcatc 28550842  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||    
T  28550841 tcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatga 28550799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 317 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11952125 - 11951996
Alignment:
Q  317 tgtcacgacccaatttcaggtcatgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttaca 416  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  11952125 tgtcacgacccaatttcaggccatgatccgcgcataggctaatactaa----ctcataatatatatagcctggcaagcctaataaactataacacttata 11952030  T
Q  417 cctttctaaactactaaaattttggtaatgactc 450  Q
    | |||  ||| || | ||||||||||||||||||    
T  11952029 cattttcaaaatattgaaattttggtaatgactc 11951996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 397 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 28173810 - 28173719
Alignment:
Q  397 aataaactataacacttacacctttctaaactactaaaattttggtaatgactcacaagctttcacgacatttcaagatacaagtttattat 488  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| || ||| ||||||||    
T  28173810 aataaactataacacttaaacctttctaaaataccaaaattttggtaatgactcacaaacttccaagacatttcaaaatgcaaatttattat 28173719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Original strand, 44840424 - 44840519
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgcctt 108  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  44840424 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 44840519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22776398 - 22776303
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgcctt 108  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  22776398 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22776303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22781776 - 22781681
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgcctt 108  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  22781776 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22781681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22776196 - 22776139
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22776196 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 22776139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22781574 - 22781517
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22781574 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 22781517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 269
Target Start/End: Original strand, 44881173 - 44881409
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||  || || | ||||||||||||||| || ||  ||   ||     
T  44881173 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaaacatccaatgccttcaaacccatttgaa-ttagc 44881271  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
     | ||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| || || | |  || || ||||||| ||  ||    
T  44881272 tgctgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaagtcatttgaacagcctttgaagcttcaattatctcagcttctgatgatcttcag 44881370  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    ||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  44881371 cttttggtgatgtt--gcttctgatgaggtgcttctgatga 44881409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1587132 - 1587048
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgcctt 108  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||    
T  1587132 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgcctt 1587048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23184414 - 23184346
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 81  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23184414 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 23184346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 31968153 - 31968061
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  31968153 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 31968061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 109
Target Start/End: Original strand, 3277037 - 3277116
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttc 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  3277037 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 3277116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Original strand, 14581525 - 14581600
Alignment:
Q  33 agtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgcctt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  14581525 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 14581600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Original strand, 40332077 - 40332172
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgcctt 108  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  40332077 agcagagacaaaaacagagtaatggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 40332172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 247
Target Start/End: Original strand, 19115089 - 19115305
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  || ||| | || |||| || ||||| ||||  ||  |   |||    
T  19115089 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatcc-atctgaattagt 19115187  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||| || || |||| || || ||||||| ||  ||    
T  19115188 tgttgcttcattcttccagtcttctgcaat-agtaggcgagattaaattctttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcag 19115286  T
Q  229 cttctggtgatcttcagct 247  Q
    |  ||| ||||||||||||    
T  19115287 cacctgatgatcttcagct 19115305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 44840639 - 44840697
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  44840639 tgcttctgatgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 44840697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28550809 - 28550752
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28550809 gcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 28550752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 40332297 - 40332354
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40332297 gcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 40332354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 303
Target Start/End: Original strand, 3277240 - 3277284
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagca 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3277240 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagca 3277284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31800769 - 31800711
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31800769 tgcttctgataaacttgcttctgatgacgccatcacttcaggagcactttgtcttcagg 31800711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30557165 - 30557113
Alignment:
Q  264 tgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  30557165 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcaattcaggagcactttgtcttcagg 30557113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31967933 - 31967877
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31967933 cttcttatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 31967877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1587021 - 1586913
Alignment:
Q  145 cagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttca 244  Q
    ||||||||| |||| || ||| ||| || ||||| || |||| | ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||    
T  1587021 cagtcttctgcaatcttcagatgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagt--tccatctcctgatgaactccagcttctggtgattctca 1586924  T
Q  245 gcttctgatga 255  Q
    |||||||||||    
T  1586923 gcttctgatga 1586913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 306
Target Start/End: Original strand, 24377322 - 24377369
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24377322 gcttctgatgaactttcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 24377369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Original strand, 1084047 - 1084105
Alignment:
Q  64 ttgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  1084047 ttgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatctaatgccttcaattcctttcaaa 1084105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18376786 - 18376741
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagca 303  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18376786 tgcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttcaggagca 18376741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 22258191 - 22258231
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtaca 53  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22258191 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 22258231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23392750 - 23392706
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt 85  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  23392750 tagtggttgtacacttcgtacagttgtactaggtcaacgctcttt 23392706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 307
Target Start/End: Original strand, 25829338 - 25829386
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25829338 gcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 25829386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23184225 - 23184147
Alignment:
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23184225 cttctgatgatcttcagcttctggtgaacttgcttctgatgaggt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 23184147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 313
Target Start/End: Original strand, 30621437 - 30621476
Alignment:
Q  274 gcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttc 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30621437 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttc 30621476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 313
Target Start/End: Original strand, 30624058 - 30624097
Alignment:
Q  274 gcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttc 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30624058 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttc 30624097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 255
Target Start/End: Original strand, 1084188 - 1084237
Alignment:
Q  206 ttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||    
T  1084188 ttgcatcttctgatgaactacagtttctggtgatatacagcttctgatga 1084237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Original strand, 18702744 - 18702833
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatccttt 118  Q
    |||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||| ||||  ||||| |||  |||||  |||| || ||||||||||||| ||||    
T  18702744 gagtagtggagatagttgttgcatacttcgtacaattgtccttttccaacgttctccaaagagtaagcatctaatgccttcaaattcttt 18702833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18734 - 18434
Alignment:
Q  15 cagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatc 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18734 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatccaatgccttcaaatc 18635  T
Q  115 ctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctc 214  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||    
T  18634 ctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgtgtctc 18536  T
Q  215 ctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 314  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18535 ctgatgaactgcagcttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 18436  T
Q  315 gg 316  Q
    ||    
T  18435 gg 18434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 77)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20954558 - 20954265
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20954558 agcagagaaacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcctccaatgctttcaaa 20954459  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| |  | | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20954458 tcctttcaaa-atggccattgcttcactcttcctgtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 20954360  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20954359 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgaatctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 20954265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22600267 - 22599974
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22600267 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22600168  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22600167 tcctttcaaa-atagtcgttgttttactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatc 22600069  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  22600068 tcctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcacttt 22599974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33256436 - 33256145
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33256436 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33256337  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33256336 tccttttaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 33256238  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  33256237 tcctgttgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgataatgtcatcacttcaggagcacttt 33256145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33276608 - 33276317
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33276608 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33276509  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33276508 tccttttaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 33276410  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  33276409 tcctggtgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgataatgtcatcacttcaggagcacttt 33276317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 38282562 - 38282863
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||    
T  38282562 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 38282660  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38282661 tcctttcaaa-atacccgttgcttcactcttccagtcttctgcgatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 38282759  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| |||    
T  38282760 tcctgatgaactagagcttttggtgatctttagcatctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgaggtcattacttcaggagcactttgtctt 38282859  T
Q  313 cagg 316  Q
    ||||    
T  38282860 cagg 38282863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 22153852 - 22154154
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  22153852 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 22153951  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22153952 tcctttcaaatt-agttgttgcttcactattctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatc 22154050  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||    
T  22154051 tcctgatgaacttcagcttctggtgatcttctacttcttatgagatgcttctaaggaacttgcttctaatgacgtcatcactttaggaacacttttactt 22154150  T
Q  313 cagg 316  Q
    ||||    
T  22154151 cagg 22154154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 19717519 - 19717809
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19717519 agcagagacacaaactgatttgtggagttagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccgatgccttcaaa 19717618  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19717619 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcctctgcaatgcttcgacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 19717717  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||  |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19717718 tccatatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcactt 19717809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 30 - 306
Target Start/End: Original strand, 35401821 - 35402094
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtc 129  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  35401821 agtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atagtc 35401919  T
Q  130 gttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||   | |||    
T  35401920 gttgcttcacttttccagtcttctgtattgtttaaacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagc 35402017  T
Q  230 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  35402018 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgaggtcatcacttcaggagcactt 35402094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28492500 - 28492248
Alignment:
Q  2 tcttgtgtaggagcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctcca 101  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  28492500 tcttgtctagtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaagcatcca 28492401  T
Q  102 atgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagtttta 201  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28492400 atgccttcaaatcctttcaaa-atagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagcttta 28492302  T
Q  202 agtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  28492301 agtcttgcatctcctgatgaactacaacttctgaagatcttcagcttctgatga 28492248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Original strand, 2268526 - 2268815
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||    
T  2268526 agcagagacaaaaacagagtagtcgaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgacgaacaagcattcaatgccttcaaa 2268625  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    || |||||||     | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  2268626 tcatttcaaaa----tagttgcttaactcttccagtcttctacaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttaagtcttgcatc 2268721  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||| |||||||  ||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2268722 tcctaatgaactttagcttctagtgat-tgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 2268815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 285
Target Start/End: Original strand, 48704199 - 48704468
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48704199 agcagagacataaattgagtagtggagacattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaa 48704298  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  48704299 tcctttcaaa-atagttgttgtttcactcttccagtcttctgcattgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 48704397  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  48704398 ttctgatgaactttagcttctggtgatct--agcttctgatgagatgcttctgatgaactagcttctgatgac 48704468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22427442 - 22427151
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22427442 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttttaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22427343  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  | |||||||    
T  22427342 tcctttcaaac-tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacagtctttgaagcttta--tgttgcatc 22427246  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |  |||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  22427245 tcctgatgaactggagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctggtagacttgcttctgatgacatcaccacttcaggagcactt 22427151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 1900340 - 1900581
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||    
T  1900340 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcttacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 1900439  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  1900440 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagctttaagtcttgcatc 1900538  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1900539 tcctgatgaactagatcttctggcgatctttagcttctgatga 1900581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Original strand, 1577862 - 1578115
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1577862 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattatactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 1577961  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  1577962 ttctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatc 1578060  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    ||||||| ||||  ||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  1578061 tcctgataaactttagcttcttgtgatctt--gcttctgacgagatgtttctgatga 1578115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23036584 - 23036322
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  23036584 tagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgttgacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaa-atagttgttgtttcact 23036486  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 240  Q
     ||  |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||    
T  23036485 tttttagtcttctgcattatttagacgagattaaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgag--acagcttctggtgatc 23036388  T
Q  241 ttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23036387 ttcagcttctgatgagatgcttctgatgaaattgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactt 23036322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 32786005 - 32785782
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtc 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  32786005 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaac-tagtc 32785907  T
Q  130 gttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  32785906 gttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcatgatgaactacaac 32785808  T
Q  230 ttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||    
T  32785807 ttctagtgattttcagcttctaatga 32785782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 12284418 - 12284736
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12284418 agcagagacacaaactgattagtggagatagtgtttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 12284517  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  12284518 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatc 12284616  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgat---------------cttcagcttctgatga-gatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttc 296  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||               |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12284617 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 12284716  T
Q  297 atgagcactttgacttcagg 316  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  12284717 agaagcactttgacttcagg 12284736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Original strand, 36134185 - 36134438
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  36134185 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatg-cttcaaa 36134283  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||    
T  36134284 tcctttcaaa-atagttgttgctccacttttccagtcttctgcattgtttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatc 36134382  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatga 269  Q
    | |||||||   | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36134383 ttctgatga--gacagcttctggtgatcttcagcttctggtggagatgcttctgatga 36134438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22201821 - 22201601
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  22201821 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgccttcaaa 22201722  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  | |||||||||||||||    
T  22201721 tcctttcaaa-atagttgttgctttactttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatgcattgagcagcctttgtcgctttaagtcttgcatc 22201623  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctg 234  Q
    ||||||||| ||  ||||||||    
T  22201622 tcctgatgagctttagcttctg 22201601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 10757416 - 10757656
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  10757416 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 10757515  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||   | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  10757516 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactcttctgattttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcat 10757614  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||  |||||||||||    
T  10757615 ctcctgatgaacttcagcttttgatgatctt--gcttctgatga 10757656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16235365 - 16235142
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16235365 gagtagtggaggtagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttggagaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaa-atagt 16235267  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||   | |     
T  16235266 cgttgcttcacttttccagtcttctgcattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagttttaaatcttgcatcttatgatga--gacaa 16235169  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16235168 cttctggtgatcttcagcttctgatga 16235142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39201066 - 39200838
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39201066 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaac 39200967  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
      || ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||    
T  39200966 -tagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttacatgagattaaatccattgaacagcttttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaac 39200870  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |  ||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  39200869 tgcagcttttggtgattttcagcttttgatga 39200838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22464878 - 22464591
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||    
T  22464878 gagtagtggaggtagtggatgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaa-ttagt 22464780  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactaga 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||  | || ||||||||||||||||  |    
T  22464779 cgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccgttgaacaaccttttgaagcttta--tgttacatctcctgatgaactgta 22464682  T
Q  228 gcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatc-acttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||| || |||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  22464681 gcatctggtgattttcagcttcttatgaacttgcttctggtggacttgcttctgatgacgtcacctaattcatgagcactttgtcttcagg 22464591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 29215792 - 29216031
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29215792 agcagagacaaaaacagagtagtggagctagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgttatcgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29215891  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||||  || |||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  29215892 tcctttcaaac-tagccgttgcttcacttttctagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaag--ttgcatc 29215988  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29215989 tcctgatgaattgcaacttctggtgattttcagcttctgatga 29216031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 269
Target Start/End: Original strand, 2834701 - 2834938
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||     
T  2834701 gagtagtggaggcagtggttgtacaattcgtacaatcgtactttgtcaacgttctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa-ttagc 2834799  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||  |||||||||| ||||||||  ||    
T  2834800 cgttgcttcactttttcagtcttcaacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaactttggaagctttaag--ttgcatctcccgatgaactgcag 2834897  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  2834898 cttctggtgattttcagcttctaatgacttgcttctgatga 2834938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 317 - 488
Target Start/End: Original strand, 411079 - 411246
Alignment:
Q  317 tgtcacgacccaatttcaggtcatgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttaca 416  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  411079 tgtcacgacccaatttcaggccatgaccggcgcacaggctaacactaa----ctcatgatatatttagcctgacaagcctaataaactataacacttgca 411174  T
Q  417 cctttctaaactactaaaattttggtaatgactcacaagctttcacgacatttcaagatacaagtttattat 488  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  411175 cgtttctaaaatactgaaattttggtaatgactcacaaaatttcaggacatttcaaaatacaagtttattat 411246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Original strand, 2267101 - 2267302
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtc 129  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||     
T  2267101 agtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgcactttgacaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattctttcaaac-tagtt 2267199  T
Q  130 gttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||  |||    
T  2267200 gttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgtagc 2267297  T
Q  230 ttctg 234  Q
    |||||    
T  2267298 ttctg 2267302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48570316 - 48570016
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||    
T  48570316 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttttaa 48570217  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||| |||| | |||||||| |  ||| ||| |||||||| ||||  ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||  ||||||  |||||||    
T  48570216 tccttccaaa-atagtcgttgttatacttttctagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatc 48570121  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaga-tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| | | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  48570120 tcctgatgaattacagcttctggtgattctcagcttctgataaaattgcttatgatgaacttgtttctgatgacgtcatcatttcaggagcactttgtct 48570021  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  48570020 tcagg 48570016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25448651 - 25448380
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  25448651 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 25448552  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  25448551 tcctttcaaa-atagtcgctgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatc 25448455  T
Q  213 tcctgatgaact--agagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatga 284  Q
    | ||||||||||    ||||||| |||||  ||||||||||||  |  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25448454 ttctgatgaactgcgcagcttctagtgattctcagcttctgataaacttgcttttgatgaactggcttctaatga 25448380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 269
Target Start/End: Original strand, 7309842 - 7310068
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||   |  ||||||||||||    
T  7309842 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactacgttaacgct-tttgaagaacgagcatccaatgccttcaaatccctacaaaatgac-cgttgcttcact 7309939  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 240  Q
    |||  |||||||| ||||  |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  7309940 cttatagtcttctgcaatccttagacgacactgaatccattgaacagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagcttatggtgatc 7310039  T
Q  241 ttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7310040 ttcagcttctgatgagatgtttctgatga 7310068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 21702809 - 21703109
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| |  ||    
T  21702809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgcccttcaa 21702908  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | || |||||||  ||| ||| |||||||| ||||  ||||||||| || ||||| |  ||||   ||||||| ||||||  |||||||    
T  21702909 tcctttcaaa-atagccgttgctatacttttcaagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaaattttgaagctttaag--ttgcatc 21703004  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  21703005 tcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgtacttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgtct 21703104  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  21703105 tcagg 21703109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 30893090 - 30893327
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||| || | ||| |||||||||    
T  30893090 agagacacaaacttagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcagcgctattcaaagaacaagcatctagtgctttcaaatcc 30893189  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcatctc 214  Q
    ||||||| | || | ||||||||||| ||   |||| | ||||| || ||||||||| |||||| |||||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  30893190 tttcaaa-atagcctttgcttcactcctctgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccaatgaacaaccttttgaaactttaagtcttgcatctc 30893288  T
Q  215 ctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  30893289 ctgatgaactttagcttttggtgatctt--gcttctgatga 30893327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 35040161 - 35040447
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  35040161 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagatcaagcatccaatgctttcaaa 35040260  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||  ||||||| |||| | |||||||  |||||  |||||||    
T  35040261 tcctttcaaa-atagtcgttgctttacttttctagtcttctgcaatctttagacgaggttggatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatc 35040357  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
     | ||||||| |  |||||||||||||       || ||       ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  35040358 ccatgatgaattgcagcttctggtgat-------ttttg-------gcttctgataaacttgcttctgatgacgtcaccacttcatgagcactttgtctt 35040443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 306
Target Start/End: Original strand, 46088974 - 46089266
Alignment:
Q  3 cttgtgtaggagcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaa 102  Q
    ||||| ||| |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  46088974 cttgtctagtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaa 46089073  T
Q  103 tgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaa 202  Q
    ||         ||||||||| | |||||||||   ||| |||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||| |  |||||| ||||||| |||||    
T  46089074 tg---------cctttcaaa-atagtcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaa 46089163  T
Q  203 gtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgag 301  Q
    |  ||||||||| |||||||||  |||||||||||||   || ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  46089164 g--ttgcatctcatgatgaactgcagcttctggtgatacacaacttatgatgaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggag 46089261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 21028788 - 21029029
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||     
T  21028788 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggctgtacacttcatacaattgtactttgtcagcgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 21028887  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | | ||  ||   ||||||||||||||||||   ||||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||| | | ||||| |||||||||  |||     
T  21028888 ttcatttgaa-ttagtcgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgcttggatgagattaaattcattgaacaacatatgaagctttaagtctctcata 21028986  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    | || ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21028987 ttctaatgatattcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 21029029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21191947 - 21191663
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21191947 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 21191848  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcc 215  Q
    |||  ||   ||  |||||||||||||||  ||||||| ||||| || |  | |||||||| | ||||||| ||||||||| |||||       || ||     
T  21191847 ttttgaa-ttagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttgggtgtgattaaatactttgaacaacctttgaagctttaa-------atgtc- 21191758  T
Q  216 tgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
       ||||||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  21191757 ---tgaacttcagcttcttgtgatatt--gtttctgatgagatgcttcagatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggaggac-ttgacttcag 21191664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44821630 - 44821393
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||| |||| | ||| |||||||||    
T  44821630 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatacaaagccttcaaa 44821531  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||| |||| | ||||||||||  ||| || |||||||||||||   ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||| ||||||  |||||||    
T  44821530 tccttccaaa-atagtcgttgctatactttttcagtcttctacaaaccttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatc 44821434  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat 253  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  44821433 tcctgatgaactacagcttatggtgattctcagcttctgat 44821393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26702214 - 26701973
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||  ||||||||||||||     
T  26702214 agcagagacacatactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcatcactcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaac 26702115  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | | ||  ||   | | ||||||||||||| |  ||||||| ||||| | | |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  26702114 ttcatttgaattaatt-gttgcttcactctcctggtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccatataacagcctttgaagctttaagtctcccatc 26702016  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26702015 ttctgatgaactttagcttctggtgatcttcagtttctgatga 26701973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2327509 - 2327262
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacag 127  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  2327509 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcgaatcctttcaaa-atag 2327411  T
Q  128 tcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactaga 227  Q
    |  |||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||| || |||| ||| |||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  |    
T  2327410 tttttgcttcactttttcagtcatctgcaatctttagacgagtttgaatctattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgca 2327313  T
Q  228 gcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgctt 277  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||  |  ||||||||||||||| ||||    
T  2327312 gcttctggtgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaactcgctt 2327262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17025021 - 17024811
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||    
T  17025021 tagtggttgtacacttcgtacaattgtcatttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaa-ttagtcgttgcttcact 17024923  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 240  Q
    |||   ||||| | ||||| |||  || |||||||||| |||||||| | |||||| ||||| |||  || || ||||||| ||  |||||||||||||     
T  17024922 cttatggtcttttgcaatg-ttatgcgtgattaaatcctttgaacagacattgaagctttaattctctcagcttctgatgatcttcagcttctggtgatg 17024824  T
Q  241 ttcagcttctgatga 255  Q
    ||  |||||||||||    
T  17024823 tt--gcttctgatga 17024811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12613899 - 12613713
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  12613899 agcagagacacaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcaaccaatgctttcaaa 12613800  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaa 202  Q
    || ||| ||    || ||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||| || |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  12613799 tcttttgaa--ttagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ctaggcgtgattaaatcttttgaacaacctttgaagctttaa 12613713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 10250992 - 10251272
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||    ||         
T  10250992 aaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaaaactctttgaagaataagcatccaatgccttccaaa---tt----- 10251083  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
      || ||||| |  ||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||||| || |||| | ||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  10251084 --agccgttgttatacttttccagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaac 10251178  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |  |||||||||||||    ||||||||||||  | ||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10251179 tgcagcttctggtgattcatagcttctgatgaacttgctttcgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcatgagcattttgtcttcagg 10251272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14263525 - 14263362
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  14263525 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgctttgccaacgctctttgaggaacaagtatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 14263427  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatcc-attgaacag 187  Q
    | |||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  14263426 atagtcgttgttttgcttctccagtcttctgcaatccttagacgggatttaatccaattgaacag 14263362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Original strand, 30572203 - 30572414
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || | |||||||| ||  ||||||||||||     
T  30572203 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctcttctaagaataaacatccaatgcttttcaatcctttcaaa- 30572301  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | || |||||||  ||| |||||||||||| ||||  | ||||||| || ||||| |  ||||||  |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  30572302 atagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-ctcagacgagtttgaatccttgaaacagctattgaagctttaag--ttgtatctcctgatgaac 30572398  T
Q  224 tagagcttctggtgat 239  Q
    |  | |||||||||||    
T  30572399 tgcaacttctggtgat 30572414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 11109943 - 11109830
Alignment:
Q  336 gtcatgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttacacctttctaaactactaaaa 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||| | || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || | |||    
T  11109943 gtcatgaccggcgtacaggctaacac----aaactcatgaaaaatatagtctagcaagcctaggaaactataacacttacacctttccaaaataatgaaa 11109848  T
Q  436 ttttggtaatgactcaca 453  Q
    |||| |||||||||||||    
T  11109847 tttttgtaatgactcaca 11109830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21135245 - 21135153
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  21135245 agcagagacaaaaacagagtagtggatttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 21135153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7745159 - 7745066
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  7745159 gagtagtggaggtagtggttgtacactttgtataaacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatcaaatgcattcaaatcctttcaaa 7745066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21121149 - 21121057
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  21121149 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacgtcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21121057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 105
Target Start/End: Original strand, 21984607 - 21984683
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  21984607 gagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21984683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12613649 - 12613580
Alignment:
Q  245 gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12613649 gcttctgatgaggtggttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-ttgacttcag 12613580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19170245 - 19170132
Alignment:
Q  206 ttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaac--ttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagc 302  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||   ||    
T  19170245 ttgcatcttctgatgaactgtagcttctggtgatataaagcttctgatgaacttgcttctgatgaacttttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggc 19170146  T
Q  303 actttgacttcagg 316  Q
    |||||| |||||||    
T  19170145 actttgtcttcagg 19170132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 105
Target Start/End: Original strand, 42284642 - 42284715
Alignment:
Q  32 tagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  42284642 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaaaagcatccaatgc 42284715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 37642243 - 37642335
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  37642243 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgc 37642335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21204997 - 21204930
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaa 91  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  21204997 aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 21204930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26701981 - 26701927
Alignment:
Q  261 ttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26701981 ttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcatgagcac-ttgacttcagg 26701927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 37642463 - 37642521
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaactt-gcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  37642463 gcttctgatgaactttgcttctaatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcagg 37642521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 23024984 - 23025041
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  23024984 gcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcagg 23025041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 308
Target Start/End: Original strand, 42284842 - 42284891
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  42284842 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 42284891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 315
Target Start/End: Original strand, 2267296 - 2267352
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||    
T  2267296 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcactacttcaggagcactatgtcttcag 2267352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2327260 - 2327208
Alignment:
Q  264 tgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  2327260 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcagg 2327208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18896665 - 18896577
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatccttt 118  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||  |||||  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  18896665 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtccttttccaacgttctccaaagactaagcatccaatgccttcaaattcttt 18896577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 316
Target Start/End: Original strand, 19215792 - 19215880
Alignment:
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||  | |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  19215792 cttctgatgatctgcagcttctggtgaatttgcttctgatgaatttgcttctgatgacgacatcacttcagaagcactttgtcttcagg 19215880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 23024783 - 23024875
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| || | ||| |||| ||||||||    
T  23024783 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 23024875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 284
Target Start/End: Original strand, 17371211 - 17371290
Alignment:
Q  206 ttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatga 284  Q
    ||||||||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17371211 ttgcatcttttgatgaactgtagcttctggtgatatgcagcttctgatagacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 17371290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 306
Target Start/End: Original strand, 21029019 - 21029066
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21029019 gcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactt 21029066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21120928 - 21120873
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 314  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  21120928 gcttctgatgaatttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttca 21120873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21135023 - 21134969
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 314  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  21135023 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcatttcagaagcactttgtcttca 21134969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 297
Target Start/End: Original strand, 21984811 - 21984849
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttca 297  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21984811 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 21984849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25448383 - 25448333
Alignment:
Q  266 atgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  25448383 atgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagtactttgtcttcagg 25448333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34255370 - 34255312
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||| |||||||    
T  34255370 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactttgtcttcagg 34255312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Original strand, 19215607 - 19215676
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 82  Q
    |||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  19215607 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaatcacactatgtcaacgctc 19215676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21204823 - 21204714
Alignment:
Q  209 catctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaactt-gcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||   || ||||||||||  | |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| |    
T  21204823 catctcttgatgaactgcagcttctggtgatacacaacttctgatgaacttgcttctgacgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacgt 21204724  T
Q  307 tgacttcagg 316  Q
    || |||||||    
T  21204723 tgtcttcagg 21204714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 316
Target Start/End: Original strand, 30893314 - 30893359
Alignment:
Q  271 cttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30893314 cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagtactttgacttcagg 30893359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17024822 - 17024774
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  17024822 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgttatcacttcagaagcactt 17024774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 297
Target Start/End: Original strand, 17371279 - 17371319
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaactt-gcttctaatgacgtcatcacttca 297  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17371279 tgcttctgatgaactttgcttctaatgacgtcatcacttca 17371319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 305
Target Start/End: Original strand, 10757645 - 10757692
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcact 305  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||    
T  10757645 tgcttctgatgaacttgctcctgatgacgtcatcactttaggagcact 10757692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44821391 - 44821352
Alignment:
Q  269 aacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44821391 aacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 44821352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 377674 - 377383
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  377674 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 377575  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  377574 tcctttcaat-atagtcgttgcttcactcttccggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattcaacaacatttgaagttttaagtcttgcatc 377476  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcact 305  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  377475 tcctgatgaactataacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 377383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 220234 - 220534
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  220234 agcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgc-ttcaaa 220332  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | | ||  ||   || |||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  220333 ttcatttgaatt-agccgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaaaccaatgaacagcctttgaagctttaagtctctcatc 220431  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  220432 tcctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcac-ttgactt 220530  T
Q  313 cagg 316  Q
    ||||    
T  220531 cagg 220534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 211394 - 211693
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| || ||||| || |||    
T  211394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtatacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcattaaaa 211493  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||| |||| | ||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| || |||| | ||||||| ||||||   ||||||    
T  211494 tccttacaaa-atagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatc 211590  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | | |||  |||||||||| |  ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  211591 tcctgatgagctacagcttctgataaactt--gcttctgatgaacttgcgtctgaggaccttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactttgtct 211688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 244394 - 244219
Alignment:
Q  18 agaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctt 117  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  244394 agaaacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctt 244295  T
Q  118 tcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaa 195  Q
    |  ||   ||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |   || || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  244294 ttgaa-ttagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaacg-ccaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaa 244219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 244152 - 244068
Alignment:
Q  228 gcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  244152 gcttctggtgatgtt--gcttctgatgaggtacttttgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcatgagcac-ttgacttcag 244068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 41 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5034 - 4760
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  5034 tagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctataaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atagtcgtcgcttcact 4936  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 240  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4935 ctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactagagcttctggtgatc 4836  T
Q  241 ttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4835 ttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactttgacttcagg 4760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 78)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Original strand, 39693523 - 39693824
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39693523 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 39693622  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  39693623 tcctttcaaa-atagtcattgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 39693721  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39693722 tcctgatgagctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgacatgcttttgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcaggtgcactttgactt 39693821  T
Q  313 cag 315  Q
    |||    
T  39693822 cag 39693824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16681466 - 16681175
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  16681466 agcagagacacaaactgagtactagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 16681367  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16681366 tcctttcaaact-agacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatc 16681268  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16681267 tcctgatgaactttagcttctagtgatctt--gcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcacttt 16681175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 312
Target Start/End: Original strand, 17914447 - 17914745
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  17914447 agcagagaaacaaattgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 17914546  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| |    
T  17914547 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaactcttgcaac 17914645  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    |||| |||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17914646 tcctaatgagctacaacttctagtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcattacttcaagagcactttgactt 17914745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 16207294 - 16207558
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16207294 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16207393  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16207394 tcctttcaaa-atagtagttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatc 16207492  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16207493 tcctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctaatgagatgcttctgataaacttgcttc 16207558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Original strand, 29693303 - 29693596
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||    
T  29693303 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctcttcaaagaacaagcatacaatgctttcaaa 29693402  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  29693403 tcctttcaaa-atagtggttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattaaacagtctttggagctttaagtcttgcatc 29693501  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29693502 tcctaatgaactacaacttatggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 29693596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 297
Target Start/End: Original strand, 24646326 - 24646609
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  24646326 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgcctgcaaa 24646425  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||  |||||| |||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  24646426 tcctttcaaa-atagctgttgctacactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatc 24646524  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttca 297  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24646525 tcttgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgataagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 24646609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Original strand, 33082873 - 33083136
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33082873 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atagtcgttgcttcact 33082971  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 240  Q
    ||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33082972 cttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatc 33083071  T
Q  241 ttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33083072 tt--gcttctgatgagttgcttcagatgaacttgtttctaatgacgtcatcacttcaagagcacttt 33083136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12757923 - 12757687
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12757923 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 12757824  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcc 215  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12757823 tttcaaa-atagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttaaagttttaagtcttgcatctcc 12757725  T
Q  216 tgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12757724 tgatgaactagagctactggtgatcttcagcttctgat 12757687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 305
Target Start/End: Original strand, 19943234 - 19943516
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaag-aacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19943234 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctttttaaaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 19943333  T
Q  123 cacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagccttt-gaagttttaagtcttgcatctcctgatga 221  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19943334 -atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 19943432  T
Q  222 actagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcact 305  Q
    |||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  19943433 acttcagcttctagtgatctttagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttccgatgtcgtcatcacttcaggagcact 19943516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Original strand, 16188972 - 16189270
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  16188972 agcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttagaagaataagcatccaatgccttcaaa 16189071  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16189072 tcatttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatggttggacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 16189170  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    |||| |||||||   |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||| ||||    
T  16189171 tcctaatgaacttcggcttctggtgatctt--gcttctaatgagatacttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcactctaggagcacttttactt 16189268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 19156184 - 19156472
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19156184 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 19156283  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19156284 tcctttcaaatt-agtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaattcttgcatc 19156382  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19156383 tcttgatgaactacaacttctggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgactt 19156468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20382556 - 20382257
Alignment:
Q  14 gcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaat 113  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||| | | |||||||    
T  20382556 gcagagacacaaactgattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccactactttcaaat 20382457  T
Q  114 cctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatct 213  Q
    ||||||| | | || ||||||||||||| || |||||| | |||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20382456 cctttcaga-atagccgttgcttcactcctctagtcttttgcaatgcatggacgagattgaatccattgaacagcctttgaagctttaagacttgcatct 20382358  T
Q  214 cctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttc 313  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20382357 cctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttc 20382260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17525889 - 17525600
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  17525889 agagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcc 17525790  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcatctc 214  Q
    ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  17525789 tttcaaa-atagttgttgtttcactcttccagtcttctgcagtgcttagacgatattaaatccattgaacaaccttttgaagatttaagtcttgcatctc 17525691  T
Q  215 ctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtc-atcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  17525690 ctgatgaactacagtttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgacgaacttgcttctgatgatgtcaatcacttcaggagcactt 17525600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23263757 - 23263474
Alignment:
Q  31 gtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcg 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  23263757 gtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atagtca 23263659  T
Q  131 ttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagtt-ttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 229  Q
    ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  23263658 ttgtttcactcttctagtcttctgcattgtttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttcttaagttttgcatctcctgatgaacttcagc 23263559  T
Q  230 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  23263558 ttctgatgatctt--gcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcgcttttacttcagg 23263474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Original strand, 21932871 - 21933172
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||| |||    
T  21932871 agcagagacaaacactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctctttgaaaaacaagcatacaatgcctttaaa 21932970  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21932971 tcctttcaaa-atagccgttgtttcactctttcagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 21933069  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  21933070 tcctgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgataaacttccttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtct 21933169  T
Q  312 tca 314  Q
    |||    
T  21933170 tca 21933172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17441967 - 17441716
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  17441967 agagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgc-ttcaaatcc 17441869  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcc 215  Q
    ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17441868 tttcaaa-atagtcgttgctttagtcttccagtcttctgcaatgcttagaggagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcc 17441770  T
Q  216 tgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17441769 tgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgattagatgcttctgatga 17441716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 602883 - 602642
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  602883 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 602784  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  602783 tcctttcaaa-atagtcattgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatt 602685  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  602684 tcctgatgaactttagcttcttgtgatctttagcttttgatga 602642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 17267463 - 17267761
Alignment:
Q  14 gcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaat 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  17267463 gcagagacaaaaactgagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaat 17267562  T
Q  114 cctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatct 213  Q
    ||||||||| | ||  |||||||||||| | | ||||| | ||||| || ||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17267563 cctttcaaa-atagctgttgcttcactcctgcggtcttttgcaatgcttggacgagattgaa-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 17267660  T
Q  214 cctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttc 313  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17267661 cttgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctaataacgtcatcacttcagaagcactttgacttc 17267758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18121236 - 18121018
Alignment:
Q  49 gtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||    
T  18121236 gtacacttcgtacaattgtactttgttaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatcctttcaaa-atagcagttgcttcactcttctagt 18121138  T
Q  149 cttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagctt 248  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18121137 cttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagctt 18121038  T
Q  249 ctgatgagatgcttctgatg 268  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18121037 ctgatgagatgcttctgatg 18121018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 17797410 - 17797711
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  17797410 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaat 17797509  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||||||  |||||||    
T  17797510 tcctttcaaac-tagccgttgcatcacttttccagtcttctgtaatggttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaggctttaag--ttgcatc 17797606  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||| |||||||||| ||    
T  17797607 tcctgatgagctgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgaatttgcttctgatgacgtcaccatttcaggagcactttgtct 17797706  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  17797707 tcagg 17797711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18321319 - 18321067
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18321319 agagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccctcaaatcc 18321220  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcc 215  Q
    ||| ||| | ||  ||||||||||||||   ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18321219 tttgaaa-atagctgttgcttcactcttttggtctcatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcc 18321121  T
Q  216 tgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18321120 tgatgaacttcagcttctggtgatcttctacttctgatgagatgcttctgatga 18321067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 133 - 306
Target Start/End: Original strand, 22745594 - 22745767
Alignment:
Q  133 gcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttc 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22745594 gcttcacacttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttc 22745693  T
Q  233 tggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22745694 tggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgacgacgtcatcacttcatgagcactt 22745767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23185389 - 23185150
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  23185389 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 23185290  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||||||    
T  23185289 tcctttcaaac-tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatc 23185193  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23185192 tcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 23185150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 17701733 - 17701997
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||  ||| |||||||||||||||    
T  17701733 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattatactttgccaacgctcttaaaggaattagcatccaatgccttcaaa 17701832  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||    
T  17701833 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatc 17701931  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttc 278  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17701932 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcatctgcttctgaagaggtgcttctgatgaacttgcttc 17701997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 81 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20255660 - 20255429
Alignment:
Q  81 tctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccat 180  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  20255660 tcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtaatgcttagacgagattaaatccat 20255562  T
Q  181 tgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttcta 280  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||   || |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |     
T  20255561 tgaacagcctttgacgctttaagtcttgcat---ctaatgagctttatcttctggtgatcttcagcttctgatgagatacttctgatgaacttccttatg 20255465  T
Q  281 atgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20255464 atgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcagg 20255429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30421591 - 30421352
Alignment:
Q  14 gcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt--aaagaacaagcctccaatgccttcaa 111  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30421591 gcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaat-gtactttgtcaacgctctttgaaaagaacaagcatccaatgccttcaa 30421493  T
Q  112 atcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||    
T  30421492 atccattcaaact-agtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcat 30421396  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  30421395 cttctgatgaactgcagcttctggtgattttgagcttctgatga 30421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 18679803 - 18680089
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18679803 agcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 18679902  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| |||| ||  ||||| | ||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||    
T  18679903 tcctatcaaa-atagtcgttgctttactcctctggtcttttgcaatgcttagacgagattgaatccactgaactacctttgaagctctaagtcttgcatc 18680001  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    | |||||||| |  ||||||| |||||||                |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18680002 ttctgatgaaatgaagcttctagtgatct----------------tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgactt 18680085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40845550 - 40845250
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||    
T  40845550 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttccaa 40845451  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||| |||| | ||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| || |||| | ||||||| ||||||   ||||||    
T  40845450 tccttccaaa-atagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcc-ttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatc 40845355  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtga-tcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgac 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  40845354 tcctgatgaactatagcttctggtgagtctt-agcttctgataaacttgcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtc 40845256  T
Q  311 ttcagg 316  Q
    ||||||    
T  40845255 ttcagg 40845250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 18718989 - 18719228
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18718989 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 18719088  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| | ||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18719089 tcctatcaaa-atagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttgaacgagattgaatccactgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatc 18719187  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    | |||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18719188 ttctgaagaacttaagcttctggtgatctt--gcttctgatga 18719228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15336240 - 15335981
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  15336240 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 15336142  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||||||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||| || | |||||| |||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  15336141 atagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 15336044  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||||| |||||    
T  15336043 tacagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgactttgcttctgatgac 15335981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15425305 - 15425046
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  15425305 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 15425207  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||||||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||| || | |||||| |||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  15425206 atagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 15425109  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||||| |||||    
T  15425108 tacagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgactttgcttctgatgac 15425046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15516609 - 15516350
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  15516609 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 15516511  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||||||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||| || | |||||| |||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  15516510 atagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 15516413  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||||| |||||    
T  15516412 tacagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgactttgcttctgatgac 15516350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 19707497 - 19707783
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||||| |    
T  19707497 agagacacaaactgagtagaggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaaccattcaatgccttcaaattc 19707596  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcc 215  Q
     ||  ||   || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||   |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |    
T  19707597 atttgaatt-agccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgttaggaat-gattaagtcctttgaacagcctttgaagctttaattctttcatcttc 19707694  T
Q  216 tgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||| ||  ||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  19707695 tgatgatcttcagcttctggcgatctt--gcttctaatgaggtgcttctaatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactt 19707783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Original strand, 22673766 - 22674056
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||    
T  22673766 agcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaa 22673865  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||| |||| | ||  ||||||  ||| ||| |||||||| |||| |  ||||||| || ||||| || |||| | ||||||| ||||||  |||||||    
T  22673866 tccttccaaa-atagatgttgctatacttttctagtcttctgcaatctccagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatc 22673962  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcact 305  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22673963 tccggatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 22674056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 9320567 - 9320859
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9320567 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaatatactttgtcaacgctcttttgaagaataagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa 9320666  T
Q  123 cacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatcc-attgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatga 221  Q
     | | | ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||  |||||  |||||||  |||||||    
T  9320667 -ataattgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccaattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatga 9320763  T
Q  222 actagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||  ||||||||||||| || ||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||    
T  9320764 actgcagcttctggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgacgtcaccactacagaagcactttgtcttcagg 9320859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 285
Target Start/End: Original strand, 36105183 - 36105453
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  36105183 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaa 36105282  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||| |||| | || ||||| |  ||| ||||| |||||| |||| |||||||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  36105283 tccttccaaa-atagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatc 36105379  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  36105380 tcctgatgaactatagcttctggtgattttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 36105453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Original strand, 24551279 - 24551499
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtc 129  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  24551279 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaa-atagtc 24551377  T
Q  130 gttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||| | |||||||  |||||  ||||||| | |||||||||  |||    
T  24551378 gttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagc 24551475  T
Q  230 ttctggtgatcttcagcttctgat 253  Q
    |||||||||| ||  |||||||||    
T  24551476 ttctggtgatttttggcttctgat 24551499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 45538602 - 45538379
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  45538602 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgatttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaa 45538503  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||| | |||||||  |||||  |||||||    
T  45538502 tcctttcaaa-atagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatc 45538406  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgat 239  Q
     | |||||||||  |||||||||||||    
T  45538405 ccatgatgaactgcagcttctggtgat 45538379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 284
Target Start/End: Original strand, 1237641 - 1237894
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  1237641 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgcacaaaagtactttgtcaacgctctttgaagaacaaatatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atagt 1237739  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||| |||||||  |||||  ||||||| | ||||||| |  ||    
T  1237740 cgttgcttcacttttccggtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaattgcag 1237837  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatga 284  Q
    |||||||| || ||  |||||||||  |  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1237838 cttctggtaatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatga 1237894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 275
Target Start/End: Original strand, 22663120 - 22663364
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||| ||||| || | |||    
T  22663120 gagtagtggagatattggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaat-ctttccaaaatagt 22663218  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
     ||||||  | | |||||||||||| |||| || ||||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| |     
T  22663219 tgttgctatatttttccagtcttctgcaatcttcagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctaatgaactacaa 22663316  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgc 275  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||    
T  22663317 cttctagtgatcttcagcttctaataaacttgcttctgatgaacttgc 22663364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18722798 - 18722602
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| || ||||||||||||| ||||||||     
T  18722798 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaa- 18722700  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttc-tacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatga 221  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||| | |||||  ||| || |||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||| ||||| |||||||    
T  18722699 atagtcgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatg-ctagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatga 18722602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18731143 - 18730947
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| || ||||||||||||| ||||||||     
T  18731143 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaa- 18731045  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttc-tacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatga 221  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||| | |||||  ||| || |||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||| ||||| |||||||    
T  18731044 atagtcgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatg-ctagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatga 18730947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18685549 - 18685353
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| || ||||||||||||| ||||||||     
T  18685549 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaa- 18685451  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttc-tacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatga 221  Q
    | ||| |||||||||||||||  |||||| | |||||  |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||  |||| ||||  |||| |||||||    
T  18685450 atagttgttgcttcactcttctggtcttcttgcaatg-ctagacgtgattatatcctttgaacagtctttgaagcattaactcttttatcttctgatga 18685353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Original strand, 43644884 - 43644984
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43644884 agcagagacacaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttattaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 43644983  T
Q  113 t 113  Q
    |    
T  43644984 t 43644984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 43639782 - 43640063
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||   |||||||||||||| || || |||| | |||||||||         |||||     
T  43639782 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaaacgtaacatgtcaacgctctttgaaaaataagcattcaatgcctt---------tcaaa- 43639871  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||||||||    ||| |||||||||| | |||| ||||| |||| || ||||| |  |||| | ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||    
T  43639872 atagtcgttgtcatacttttccagtcttttgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcatgatgaac 43639969  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |  | |||||||||||   |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43639970 tgcatcttctggtgatacacagcttctgatgattttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttgtcttcagg 43640063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3598375 - 3598208
Alignment:
Q  148 tcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagct 247  Q
    |||||| |||| |||||||||| || ||||  || |||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||    
T  3598375 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagct 3598278  T
Q  248 tctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||  | |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3598277 tctgatgaacttgcttatgatgaccttgcttctgacgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 3598208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 14989614 - 14989518
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttc 109  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  14989614 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 14989518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24833192 - 24832985
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcac 139  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||   || | |||||||||    
T  24833192 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcccttcaaa-gtagccattgcttcac 24833094  T
Q  140 tcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaat-ccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga 238  Q
    | || ||||||||| ||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||| |||||||  |||||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  24833093 t-tttcagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtga 24832997  T
Q  239 tcttcagcttct 250  Q
    | || |||||||    
T  24832996 tttttagcttct 24832985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Original strand, 6407714 - 6407927
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||       
T  6407714 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtagaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttc--- 6407810  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
          |||| | || |||||    ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  6407811 ------caaa-atagccgttgtaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatc 6407900  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgat 239  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||    
T  6407901 tcctgatgaactgcagcttctggtgat 6407927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18151809 - 18151713
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttc 109  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  18151809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaatgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 18151713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Original strand, 25164058 - 25164134
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaag 89  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  25164058 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacactcttcaaag 25164134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 45568053 - 45567955
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||||||||    
T  45568053 aaacagagtagtgaaggtagtggtcgtacacttcgtacagaagtactttgtcaacgctctttgaaggataatcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 45567955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19956476 - 19956360
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||    
T  19956476 tagtggttgtacaattagtacaattgtcctttttcaacgctcttcaatgaaaaagtatccaatgccttcaaatccttt-agaattagtcgttgcttcact 19956378  T
Q  141 cttccagtcttctacaat 158  Q
    ||||   |||||||||||    
T  19956377 cttctgatcttctacaat 19956360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22461783 - 22461620
Alignment:
Q  31 gtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcg 130  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||  || ||| |||| |||||||||||||||||| ||  ||   |||||    
T  22461783 gtagtggagatagtggttgtgcactccgtacaattgtcctttttcaactctctccaacgaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaa-ttagtcg 22461685  T
Q  131 ttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaag 196  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||  ||  | ||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  22461684 ttgcttcattcttctagtcttctgcaatg-atatgctagattaaatccttcgaacaacctttgaag 22461620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18151599 - 18151544
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18151599 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttca 18151544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 317 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21542461 - 21542381
Alignment:
Q  317 tgtcacgacccaatttcaggtcatgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataa 401  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21542461 tgtcacgacccaatctcagatcatgaccggcgcacaggctaacac----tgactcatcatataattagcctggcaagcctaataa 21542381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13430570 - 13430513
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13430570 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttgtcttcagg 13430513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 13430780 - 13430699
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  13430780 aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 13430699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14989394 - 14989337
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  14989394 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactttaggagcactttgtcttcagg 14989337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 308
Target Start/End: Original strand, 43774053 - 43774150
Alignment:
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaactt-gcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  43774053 tcctgatgaactacagcttctggtgatacatagcttctgatgaacttgcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 43774150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Original strand, 6407934 - 6407990
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6407934 cttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 6407990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18722564 - 18722502
Alignment:
Q  244 agcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  18722564 agcttctgatgaagtgcttctgatcaacttgcttctaatgacgtgatcatttcatgagaactt 18722502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18730909 - 18730847
Alignment:
Q  244 agcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  18730909 agcttctgatgaagtgcttctgatcaacttgcttctgatgacgtcatcatttcatgagaactt 18730847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 1745368 - 1745425
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  1745368 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcagg 1745425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 21288611 - 21288668
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||    
T  21288611 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttttcttcagg 21288668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 24551521 - 24551578
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24551521 gcttatgatgaactcgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 24551578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12757685 - 12757640
Alignment:
Q  269 aacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12757685 aacttgcttctgatgacgtcatcattttatgagcactttgacttca 12757640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 21301230 - 21301287
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  21301230 gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcactttaaaagcactttgtcttcagg 21301287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 255
Target Start/End: Original strand, 21541125 - 21541174
Alignment:
Q  206 ttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||    
T  21541125 ttgcatctcctgatgaactatagtttctggtgatatacagcttctgatga 21541174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24832980 - 24832935
Alignment:
Q  269 aacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24832980 aacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttca 24832935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 85
Target Start/End: Original strand, 21301026 - 21301082
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt 85  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21301026 gagtagtggaagtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt 21301082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 122
Target Start/End: Original strand, 21540985 - 21541041
Alignment:
Q  66 gtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  21540985 gtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttctattcctttcaaa 21541041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 33560359 - 33560295
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  33560359 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgc 33560295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 85
Target Start/End: Original strand, 21288408 - 21288463
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt 85  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  21288408 agtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctcttt 21288463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 314
Target Start/End: Original strand, 22663375 - 22663418
Alignment:
Q  271 cttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22663375 cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttca 22663418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14989495 - 14989384
Alignment:
Q  142 ttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatct 241  Q
    ||||| |||||  |||| || ||||||| || ||||| || ||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||      
T  14989495 ttccaatcttcagcaatcttcagacgagtttgaatcctttaaacggcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaattgcagcttctggtgattc 14989398  T
Q  242 tcagcttctgatga 255  Q
     |||||||||||||    
T  14989397 acagcttctgatga 14989384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18685328 - 18685282
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  18685328 cttctgatcaacttgcttctgatgacgtcatcatttcatgagaactt 18685282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 306
Target Start/End: Original strand, 18158707 - 18158740
Alignment:
Q  273 tgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18158707 tgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactt 18158740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 103)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10883339 - 10883038
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  10883339 agcagagacgcaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaggcatccaatgccttcaaa 10883240  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  10883239 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgaaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatc 10883141  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10883140 tcctgatgaactacagcttctggtgatcttcagcttctgatgggatgcttctgatgaacttgcttctgacgacgtcgtcacttcaggagcactttgactt 10883041  T
Q  313 cag 315  Q
    |||    
T  10883040 cag 10883038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Original strand, 13880096 - 13880397
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  13880096 agcagagacacaaagtgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatctaatgccttcaaa 13880195  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  13880196 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcgtcgagtcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacagcctttgaagctttatgtcttgcaat 13880294  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13880295 tcctgatgaactagagcttctcatgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgactt 13880394  T
Q  313 cag 315  Q
    |||    
T  13880395 cag 13880397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Original strand, 11319400 - 11319699
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  11319400 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaattgtaatttgtcaacgctcttcaaaaaacacgcatccaatgcattcaaatcc 11319499  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcc 215  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||     
T  11319500 tttcaaa-atagttgttacttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacatcctttgaagcttgaagtcttgcatctct 11319598  T
Q  216 tgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11319599 tgatgacctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttttaatgacgtcatcacttcaggagcactttggcttcag 11319698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22578187 - 22577887
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||    
T  22578187 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaatcattcaatgccttcaaa 22578088  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22578087 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatc 22577989  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22577988 tcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcctctgatgagatgcttctgatgaccttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcacttttactt 22577891  T
Q  313 cagg 316  Q
    ||||    
T  22577890 cagg 22577887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 314
Target Start/End: Original strand, 15467924 - 15468208
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  15467924 gagtagtggaggtaatggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaa-atagt 15468022  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15468023 cgttgattcactcttccagtcttctgcattgcctagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 15468122  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 314  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15468123 cttctggtaatcttcagcatctgatgagatgcatatgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactttgtcttca 15468208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Original strand, 15088513 - 15088753
Alignment:
Q  14 gcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaat 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15088513 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgtcttcaaat 15088612  T
Q  114 cctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatct 213  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15088613 cctttcaaa-atagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgcatct 15088711  T
Q  214 cctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15088712 cctgatgaattagagcttctggtgatcttcagcttatgatga 15088753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 307
Target Start/End: Original strand, 28409042 - 28409323
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  28409042 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 28409140  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | | | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  28409141 ataattgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttatgtcttgcatctcttgatgaac 28409240  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |  |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28409241 tttagcttctggtga-ctgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 28409323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16316723 - 16316433
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16316723 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 16316624  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16316623 tcctttcaaa-atagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 16316525  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
     |||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16316524 ccctgatgaacttcaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactt 16316433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 9069554 - 9069857
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| | ||||||||| |||    
T  9069554 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctccttgaagaacaagcatacaatgcctttaaa 9069653  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  9069654 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagctttaagttttgcatc 9069752  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||    
T  9069753 tcctgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgtttctgataaacttgcttctgatgacgtcaccacttcagaagcactttgtct 9069852  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  9069853 tcagg 9069857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2913774 - 2913533
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2913774 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 2913675  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2913674 tcctttcaaa-atagtcgttgctccacttttctagtcttctgcattgtttagatgagattaaattcattgaacagcctttgaagatttaagtcttgcatc 2913576  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2913575 tcctgatgaactacagtttctggtgatcttcatcttctgatga 2913533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Original strand, 13302802 - 13303033
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  13302802 agcagagacacaaactgagtagtggtgatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 13302901  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  13302902 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttctagtcttctacaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 13303000  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcag 245  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13303001 tcctaatgaactacagcttctggtgatcttcag 13303033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 44467056 - 44467298
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44467056 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 44467155  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  44467156 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcat 44467254  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44467255 ctcctgatgaacttcagcttttggtgatcttcagcttctgatga 44467298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Original strand, 11792899 - 11793191
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  11792899 agcagagacacaaactaagtggtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgctttcaaa 11792998  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||   |||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  11792999 tgctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttatggtctttcgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatc 11793097  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgc-ttctaatgacgtcatcacttcatgagcact 305  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  11793098 tcctgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgtttatgatgaacttgctttttaatgacgtcatcactttaggagcact 11793191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13138061 - 13137827
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13138061 agcagagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13137962  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    || ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||    
T  13137961 tcttttcaaa-atagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgattaacctttgaagctttaagtcttgcatc 13137863  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagctt 248  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13137862 tccttatgaactagagcttctggtgatcttcagctt 13137827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21283528 - 21283270
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  21283528 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 21283430  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    |  | |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21283429 atggacgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctgatgaac 21283330  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    |  | ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  21283329 ttcaacttctggtgatctt--gcttctgatgagattcttctgatgaacttgattctgatgac 21283270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12366914 - 12366614
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||    
T  12366914 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacagacatccaatgctttcaaa 12366815  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |    
T  12366814 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacc 12366716  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||| | ||    
T  12366715 tcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctgatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtcatcacttcaggagcactttaaatt 12366618  T
Q  313 cagg 316  Q
    ||||    
T  12366617 cagg 12366614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29935524 - 29935272
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29935524 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 29935425  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||  | ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29935424 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgttaag-tgtgattaaatatattgaacaacctttgaaattttaagtcttgcatc 29935327  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29935326 tcctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatga 29935272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Original strand, 30025897 - 30026184
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||     
T  30025897 agcagagacacaaactgagtagtagagatattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatcgaatgccttcaat 30025996  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    || ||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30025997 tcttttcaaa-atagccgttgcttcactctttcagtcttctgcgatgcttatacgagactaaatccattgaccagcgtttgaagctttaagtcttgcatc 30026095  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30026096 tcttgatgaactagagcttctggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttactt 30026181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 2500030 - 2500271
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||||| ||||||    
T  2500030 agcagagacacaaactgagtagtggagaaagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaaggataagcatccaatgctttcaaa 2500129  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  2500130 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 2500228  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2500229 tcctgaaaaacaagagcttctggtgatcctcagcttctgatga 2500271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 21695393 - 21695634
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21695393 agcagagacacaaactgagtagttgaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21695492  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    || |||  || | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  21695493 tcattttgaa-atagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatc 21695591  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21695592 tcttgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 21695634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33691878 - 33691637
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| |||    
T  33691878 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaacgcctttaaa 33691779  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33691778 ttctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatttaacagcctttgaagctttatgtcttgcatc 33691680  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  33691679 tcctgatgaactagagcttctggtgattttcaacttctaatga 33691637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23280113 - 23279887
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23280113 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaac 23280014  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
      || ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23280013 -tagccgttgctccacttttccagtcttctacaatgcttagacaagattaaatcca-tgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 23279916  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctga 252  Q
    || | ||||||||||| |||| |||||||    
T  23279915 tacaacttctggtgattttcaccttctga 23279887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9709968 - 9709729
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  9709968 agcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaa 9709869  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||    
T  9709868 tcctttcaaac-taggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatc 9709772  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9709771 tcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 9709729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Original strand, 21692279 - 21692504
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21692279 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21692378  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||| | | ||||||| |||||||||||||||    
T  21692379 tcctttcaaa-acagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagaagagattaaaatcattgaataacttttgaagctttaagtcttgcatc 21692477  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgat 239  Q
    |||| |||||||  |||||||| ||||    
T  21692478 tcctaatgaacttcagcttctgatgat 21692504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 13648721 - 13648960
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||    
T  13648721 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgtctttaaa 13648820  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||    
T  13648821 tcctttcaaa-atagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgcgattaaatccattgaacatcttttgaagctttaagtctcgcatc 13648919  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  13648920 tcctgatgagctttagcttctgttgatctt--gcttctgatga 13648960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 307
Target Start/End: Original strand, 13692372 - 13692625
Alignment:
Q  42 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| |||         ||||| | ||| ||||||||||||    
T  13692372 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctataaagatcaagcatccaatgtctt---------tcaaa-atagttgttgcttcactc 13692461  T
Q  142 ttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatct 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  13692462 ttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatcttctgatgagctttagcttctggtgatct 13692561  T
Q  242 tcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  13692562 t--gcttctgaagagatgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcacttt 13692625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Original strand, 24788144 - 24788372
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  24788144 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaattctctttgaagaacaagcacccaatgccttcaaatcctttcaaa- 24788242  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24788243 atattcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagatgatattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaac 24788342  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24788343 ttcagcttctggtgatctt--gcttctgatga 24788372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13730839 - 13730566
Alignment:
Q  15 cagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatc 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13730839 cagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcattcaaatc 13730740  T
Q  115 ctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctc 214  Q
     ||||||| | || |||||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13730739 ttttcaaa-atagccgttgcttcactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagccttgcatctc 13730641  T
Q  215 ctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
                     ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13730640 -----------------ctggtgagctttagcttatgatgagatgcttctaatgaacttgtttatgatgacgtcatcacttcaggagcactt 13730566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30945505 - 30945285
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtc 129  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  30945505 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atagtt 30945407  T
Q  130 gttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  30945406 gttgcttcacttttccaatcttctacaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagc 30945309  T
Q  230 ttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||| ||| |||  |||||||||||    
T  30945308 ttctgatgaactt--gcttctgatga 30945285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 48237068 - 48236829
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||    
T  48237068 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatctgatgccttcaaa 48236969  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||||   |||||||||||||  || ||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||||    
T  48236968 tcctttcaaac-ttgtcgttgcttcaccttttcagtcttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatc 48236872  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48236871 tcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 48236829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30944489 - 30944271
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  30944489 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 30944390  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  30944389 tcctttcaaa-atagttgttgcttcacttttccaatcttctgcaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatc 30944293  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctg 234  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  30944292 tcctgatgaactgcagcttctg 30944271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 255
Target Start/End: Original strand, 33605705 - 33605917
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |    
T  33605705 tagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atagtcattgcttcaat 33605803  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgat 239  Q
     |||||||| ||| || || |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33605804 tttccagtcatctgcattgcttagacgagattaaatccgttgaaaagccttttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 33605901  T
Q  240 cttcagcttctgatga 255  Q
     |||||||||||||||    
T  33605902 tttcagcttctgatga 33605917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13260781 - 13260498
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||||| |||||||| |||| |    
T  13260781 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatctcaatgctcttccaagaacaagcatccaatgctttcata 13260682  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
            |  | ||| ||||||| |||| ||  ||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  13260681 --------agaatagttgttgctttactcctctggtcttccgcaatgcttggacgagattaaatccatt-aacagtctttggagctttaagtcttgcatc 13260591  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13260590 tcctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctaatgagatgcttatgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcacttt 13260498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 4821466 - 4821766
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4821466 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 4821565  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | |||||||| | || ||||||| |||| ||| ||||||||  ||| |||||||||| || |||   || |||||| ||||||| ||||||  ||| |||    
T  4821566 t-ctttcaaa-atagccgttgctccacttttctagtcttctgtaatctttagacgagtttgaatttgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgtatc 4821661  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  4821662 tccggatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgacgaacttgcttctgatgaccttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtct 4821761  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  4821762 tcagg 4821766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 331637 - 331877
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |  || |||| ||||||||||||| |    
T  331637 agcagagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgct-tttgagcaataagcatccaatgccttcaga 331735  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  || |||||||  |||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  331736 tcctttcaaaaatagctgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgaccttgaatccataaaacaacctttgaagctttaagtc-cgcatc 331834  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  331835 tcctgatggacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 331877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35952843 - 35952560
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  35952843 aaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgatgaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 35952745  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaat-ccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaa 222  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||| |||||||  |||||  |||||||  ||||||||    
T  35952744 atagtcgttgcttcacttttccagtcttcttcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaa 35952647  T
Q  223 ctagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    ||  | ||||||||||| || ||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||    
T  35952646 ctgcaacttctggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatgaatttgcttctgatgtcgtcatcacttcaggaacactttg 35952560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Original strand, 14426550 - 14426747
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  14426550 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 14426648  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||| |||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  14426649 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccattaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 14426746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19237200 - 19236969
Alignment:
Q  22 acaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaa 121  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19237200 acaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtagtttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaa 19237101  T
Q  122 acacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatga 221  Q
    |   || ||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||| | |    
T  19237100 a-gtagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ctagacgagattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaactctctcatcttctggtaa 19237003  T
Q  222 actagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
     ||  |||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  19237002 tcttcagctcctaatgatcttcagcttctgatga 19236969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28622494 - 28622283
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  28622494 tagtggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgccctttgaaaaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa-ttagccgttgcttcact 28622396  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 240  Q
     ||| ||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  28622395 tttctagtattctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatt 28622298  T
Q  241 ttcagcttctgatga 255  Q
    || ||||| ||||||    
T  28622297 tttagcttatgatga 28622283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39284727 - 39284490
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  39284727 agagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaattc 39284628  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcc 215  Q
     ||  ||   |||||||| ||||||||||  ||||||  |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||  ||||| |    
T  39284627 atttgaa-ttagtcgttgtttcactcttctggtcttcagcaatg-ctaggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttgattctctcatcttc 39284530  T
Q  216 tgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39284529 tgatgatcttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 39284490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12174479 - 12174205
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcac 139  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12174479 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa-atagtcgttgcttcac 12174381  T
Q  140 tcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaat-ccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga 238  Q
    | |||||||||||| ||||  ||||||||| || ||| ||||  |||||| |||||||  |||||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  12174380 ttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaag-cttaag--ttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtga 12174284  T
Q  239 tcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    | || ||||||||||  |  ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  12174283 tttttagcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactatgtcttcagg 12174205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13018671 - 13018421
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||     
T  13018671 agcacagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaatccagcatccaatgccttcaac 13018572  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    | | || ||| | ||||||||||||||||| | |||||||| ||||   | | || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  | |    
T  13018571 ttcatttaaa-atagtcgttgcttcactctcctagtcttctgcaat-actgggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtct--cgt 13018476  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctga 266  Q
    || |  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13018475 cttcatatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgaggtgcttctga 13018421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16112050 - 16111827
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  16112050 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaat 16111951  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | ||| |||| | ||||||||||||||| || | ||||||| || | |||||||||| || |||||||  |||| | ||||||| ||||||  |||||||    
T  16111950 ttcttccaaa-aaagtcgttgcttcactttttccgtcttctgcactctttagacgaggttgaatccataaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatc 16111854  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgat 239  Q
      ||||| ||||  |||||||||||||    
T  16111853 ctctgatcaactgcagcttctggtgat 16111827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5000985 - 5000788
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  5000985 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcattcaatgctttcaaatcc 5000886  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcac-tcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatct 213  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||    ||||| | ||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  5000885 tttcaaa-atagtcgttgcttcacttctcttggtcttttgcaatgcttgggcgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 5000788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 307
Target Start/End: Original strand, 14193241 - 14193359
Alignment:
Q  189 ctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtc 288  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14193241 ctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactagagcttatggtgatcttctgcttctgataagatgcttatgatgaacttgcttctgatgacgtc 14193340  T
Q  289 atcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  14193341 atcacttcaggagcacttt 14193359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16310073 - 16309964
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16310073 agcagagacacaaactgagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16309974  T
Q  113 tcctttcaaa 122  Q
    ||||||||||    
T  16309973 tcctttcaaa 16309964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16543152 - 16542947
Alignment:
Q  47 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttcca 146  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  16543152 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaa-atagtcgttgcttcacttttcca 16543054  T
Q  147 gtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagc 246  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |||  | |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||     
T  16543053 gtcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttatggtgattttcagt 16542956  T
Q  247 ttctgatga 255  Q
    |||||||||    
T  16542955 ttctgatga 16542947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 255
Target Start/End: Original strand, 16622510 - 16622715
Alignment:
Q  47 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttcca 146  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  16622510 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaa-atagtcgttgcttcacttttcca 16622608  T
Q  147 gtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagc 246  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||  |||  | |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||     
T  16622609 gtcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttatggtgattttcagt 16622706  T
Q  247 ttctgatga 255  Q
    |||||||||    
T  16622707 ttctgatga 16622715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 14193108 - 14193243
Alignment:
Q  15 cagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatc 114  Q
    |||||| | |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  14193108 cagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttcaaatc 14193207  T
Q  115 ctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtctt 151  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14193208 ctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtctt 14193243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2265674 - 2265446
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |  ||| ||||||||||||| ||||     
T  2265674 aaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattaaataccttcaaatccttccaaa- 2265576  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | || |||||||  ||| || ||||||||| |||| |||||||||| || ||||  || |||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  2265575 atagccgttgctatactttttcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 2265478  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  2265477 tacaacttctggtgattctcagcttctgatga 2265446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19711168 - 19710900
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  19711168 aaacagagtagtggaaatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 19711070  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttc--cagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagc-ctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatg 220  Q
      |||||||||  | || |||  |||||||  ||  | |||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||  |||| |  |||||||| ||||||    
T  19711069 ttagtcgttgccac-cttttcttcagtctttcactctctttagacgagtttgaatccattaaacagctatttgaaactttagg--ttgcatcttctgatg 19710973  T
Q  221 aactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatca 292  Q
    ||||| || |||||||||| | ||| ||||||||| || |||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  19710972 aactacagtttctggtgatatacagtttctgatgaaatagcttctgatagacttgcttctgatgacgtcatca 19710900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Original strand, 8182922 - 8183214
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||| ||||| |||| || | || |||  ||    
T  8182922 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaagtgtctttcaa 8183021  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||||||  ||| |||||||||||| |||| || ||||||| || || |  ||  ||| | ||| ||| ||| |||  ||||||    
T  8183022 tcctttcaaa-atagttgttgctatacttttccagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaaacttttatacaactttttaagctttgagt--tgcatc 8183117  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||   |||||| ||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8183118 tcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttttgatgaacttgcttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 8183214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41842439 - 41842212
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||     
T  41842439 agcagagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactctgtcaacgcactttaaaaaacaagtatccaatgtcttcaac 41842340  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | | ||  ||   ||||||||||||||||| |   |||| | || || ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||  ||||||||  ||||    
T  41842339 ttcatttgaa-ttagtcgttgcttcactctcctgatcttatgcagtgcttagacgagatcaaatcaaatgaacaacctttgaag-cttaagtctctcatc 41842242  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatctt 242  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41842241 ttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 41842212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 48062986 - 48062704
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||        
T  48062986 agcagagacagaaacagagtaatggagatagtggttgtacgcttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt---- 48062891  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
         ||||| | |||||||||   ||| ||||||||||| ||||| | ||| |||| || ||| | |  |||| | ||||||| |||||||  ||||||    
T  48062890 -----tcaaa-atagtcgttgccatacttttccagtcttcgacaatttctaggcgagtttgaattcttgaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatc 48062799  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    || |||||||||  |||||||||||||   |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  48062798 tcttgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatggacttgcttctgatgaacttgcttctgatggcgtcatcacttcaggagcactt 48062704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 306
Target Start/End: Original strand, 13880608 - 13880875
Alignment:
Q  41 tagtggttgtac-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcac 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||    
T  13880608 tagtggttgtaccacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatccttttgaatt-agtcgttgcttcac 13880706  T
Q  140 tcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctc--ctgatgaactagagcttctggtg 237  Q
    ||||| |||||||| ||||| | || || |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||  |  |||  |||||||  |  | || ||| ||    
T  13880707 tcttctagtcttctgcaatgct-aggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctttaattctctctcctcttctgatgatgttcaactcctgatg 13880805  T
Q  238 atcttcagcttctgatga-gatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |    | ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13880806 aaaaactgcttctagtgatgttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 13880875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 306
Target Start/End: Original strand, 13303043 - 13303122
Alignment:
Q  227 agcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13303043 agcttctgatgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaagttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactt 13303122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15704612 - 15704445
Alignment:
Q  66 gtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttaga 165  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  15704612 gtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaa-atagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttaga 15704514  T
Q  166 cgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggt 236  Q
    |||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  15704513 cgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--tttcatcttctgatgaactacaacttctggt 15704445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13894153 - 13893958
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||  ||     
T  13894153 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacgttgtacaattgtcctttttcaatgctttttaaagaacaaacattcaatgccttcaaatccttttgaa- 13894055  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatga 221  Q
      || ||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  13894054 ttagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ctaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtatttcatcttctgatga 13893958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Original strand, 4494634 - 4494718
Alignment:
Q  150 ttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctg 234  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4494634 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 4494718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Original strand, 1293033 - 1293117
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgcctt 108  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  1293033 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 1293117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 9098384 - 9098307
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatccttt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  9098384 tagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaaacatctaatgcattcaaatccttt 9098307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13472658 - 13472568
Alignment:
Q  101 aatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagccttt 192  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13472658 aatgccatcaaatcctttcaaa-atagttgttgcttcactcttatgatcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttt 13472568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13032211 - 13031975
Alignment:
Q  40 atagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcac 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||| || |||| |||||| | | ||  || | ||| ||||||||||    
T  13032211 atagtggttgtacacttcgtacaattatactttgtcaacgctcttcaaaaagccagcatctaatgtcttcaacttcatttgaa-atagttgttgcttcac 13032113  T
Q  140 tcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga 238  Q
    ||| |  ||||||| ||||   ||| || |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| |           ||||| ||||||    
T  13032112 tctcctggtcttctgcaat-actaggcgtgattaaatccattgaacaaccatttgaagctttaagtct--catcttc-----------agcttatggtga 13032027  T
Q  239 tcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcat 290  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  13032026 tcttctgcttctgatgaggtgtttctagtgaacttgcttctgatgacgtcat 13031975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 14425450 - 14425531
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  14425450 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 14425531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19339400 - 19339324
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  19339400 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19339324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16556751 - 16556665
Alignment:
Q  66 gtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttct 153  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||    
T  16556751 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaa-atagccgttgcttcacttttccagtcttct 16556665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Original strand, 16608911 - 16608997
Alignment:
Q  66 gtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttct 153  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||    
T  16608911 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaa-atagccgttgcttcacttttccagtcttct 16608997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 1293185 - 1293242
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1293185 gcttctgatgaacttgcttctgataacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 1293242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7339821 - 7339764
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  7339821 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcagg 7339764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 27871710 - 27871803
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  27871710 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaagaataagcatccaatgc 27871803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30945310 - 30945253
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  30945310 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcagg 30945253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 307
Target Start/End: Original strand, 2500261 - 2500309
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  2500261 gcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcatgagcacttt 2500309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Original strand, 14426752 - 14426808
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  14426752 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcagg 14426808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5000789 - 5000719
Alignment:
Q  246 cttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5000789 cttctggtgagatgcttctgacaatcttgcttctgatgacatcgtcacttcaggagcactttgacttcagg 5000719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9098179 - 9098110
Alignment:
Q  245 gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  9098179 gcttttgatgaggtgcttctaatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcac-ttgacttcag 9098110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 5826185 - 5826242
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  5826185 gcttctgatgaacttgcttctgatgacttcattacttcaggagcactttgtcttcagg 5826242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19236947 - 19236886
Alignment:
Q  245 gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  19236947 gcttctgatgaggtggttctgacgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19236886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19339196 - 19339139
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  19339196 gcttctgatgaacttgcttctgaggacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcagg 19339139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21381374 - 21381321
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21381374 gcttctgatgaactagcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgactt 21381321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24794881 - 24794788
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||    
T  24794881 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaggaataagcatccaatgc 24794788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 306
Target Start/End: Original strand, 21695624 - 21695671
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21695624 gcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaagagcactt 21695671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 306
Target Start/End: Original strand, 27871931 - 27871978
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  27871931 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactt 27871978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48805796 - 48805737
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaactt-gcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  48805796 tgcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcagg 48805737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 306
Target Start/End: Original strand, 15088748 - 15088790
Alignment:
Q  264 tgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15088748 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 15088790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 315
Target Start/End: Original strand, 16622707 - 16622761
Alignment:
Q  261 ttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  16622707 ttctgatgaactttcttctgatgacgtcaccacttcaagagcactttgtcttcag 16622761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 305
Target Start/End: Original strand, 44467288 - 44467334
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcact 305  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  44467288 gcttctgatgaacttgcttctgatggcgtcatcacttcaggagcact 44467334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 307
Target Start/End: Original strand, 13648935 - 13648983
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13648935 gcttctgttgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 13648983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 48806029 - 48805953
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  48806029 gagtagtggaagtagtggttgtacactttgtacgaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaatagcatccaatgc 48805953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4429059 - 4428984
Alignment:
Q  210 atctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatga 284  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4429059 atctccagatgaactgcagcttctggtgataaacagcttctgatgaatttgcttctgatgaacttgcttctgatga 4428984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 72
Target Start/End: Original strand, 4494585 - 4494628
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttt 72  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4494585 gagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaattgtacttt 4494628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7339893 - 7339821
Alignment:
Q  161 ttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctgg 235  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7339893 ttagacgagtttaaatccattaaacaatttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctgg 7339821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16111811 - 16111772
Alignment:
Q  269 aacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16111811 aacttgcttctgatgacgtcatcacttcacgagcactttg 16111772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 306
Target Start/End: Original strand, 24788347 - 24788394
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24788347 gcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 24788394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 297
Target Start/End: Original strand, 13682726 - 13682767
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaactt--gcttctaatgacgtcatcacttca 297  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13682726 tgcttctgatgaacttctgcttctaatgacgtcatcacttca 13682767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 313
Target Start/End: Original strand, 14425666 - 14425712
Alignment:
Q  267 tgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttc 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  14425666 tgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttc 14425712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15688682 - 15688602
Alignment:
Q  338 catgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttacacctttctaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||    
T  15688682 catgaccggcgcacaggctaatac----taactcacgataaatatagcctggcaagcctaata----ataacacttacacctttataaa 15688602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15696275 - 15696195
Alignment:
Q  338 catgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttacacctttctaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||    
T  15696275 catgaccggcgcacaggctaatac----taactcacgataaatatagcctggcaagcctaata----ataacacttacacctttataaa 15696195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15703255 - 15703175
Alignment:
Q  338 catgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttacacctttctaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||    
T  15703255 catgaccggcgcacaggctaatac----taactcacgataaatatagcctggcaagcctaata----ataacacttacacctttataaa 15703175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32264658 - 32264608
Alignment:
Q  264 tgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 314  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32264658 tgatgatctttcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttca 32264608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13137821 - 13137788
Alignment:
Q  283 gacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13137821 gacgtcatcacttcaggagcactttgacttcagg 13137788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Original strand, 14425559 - 14425651
Alignment:
Q  143 tccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga 238  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||| || ||||| |  |||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14425559 tccagtcttctgcaatgtt-aggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactntagcttctggtga 14425651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24794680 - 24794631
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  24794680 tgcttctgataaactagcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 24794631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30944277 - 30944220
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  30944277 gcttctgatgaacgtgcttctgatggcttcaccacttcaggagcactttgtcttcagg 30944220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 76)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Original strand, 9717841 - 9718141
Alignment:
Q  15 cagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatc 114  Q
    |||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||    
T  9717841 cagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatc 9717940  T
Q  115 ctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctc 214  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9717941 ctttcaaa-atagttgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctc 9718039  T
Q  215 ctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9718040 ctgatgaactagagcttctagtgatctttaacttctgatgggatgcttatgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactttgtcttca 9718139  T
Q  315 gg 316  Q
    ||    
T  9718140 gg 9718141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 13602168 - 13602460
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||     
T  13602168 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcttacaattgtattttgtcaacgttcttcaaagaataagcatccaatgccttcaat 13602267  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    || ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  13602268 tcatttcaaa-atagtggttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 13602366  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13602367 tcctgatgaactatagcttcttgtgatcttcggcttttgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 13602460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 312
Target Start/End: Original strand, 13435544 - 13435826
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| | |||    
T  13435544 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaatcattcaatgctttcaaatcctttcaaa-atagt 13435642  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13435643 cgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaaaatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 13435742  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13435743 cttatggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttactt 13435826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 316
Target Start/End: Original strand, 23284564 - 23284861
Alignment:
Q  17 gagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcct 116  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||    
T  23284564 gagacacaaactgagtagtggagataatggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaggaacaagcattcaatgccttcaaatcct 23284663  T
Q  117 ttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcct 216  Q
    |||||| | || |||||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23284664 ttcaaa-ataggcgttgcttcacttttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 23284762  T
Q  217 gatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23284763 gatgaacttcagcttctagcgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcagaagcac-ttgacttcagg 23284861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 32544261 - 32544502
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||    
T  32544261 agcagagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgcctttaaa 32544360  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32544361 tcctttcaaa-atagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 32544459  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32544460 tcctgatgaactagagcttatggtgattttcagcttctgatga 32544502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 307
Target Start/End: Original strand, 21625114 - 21625386
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtc 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||  | || |    
T  21625114 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatgcaatgccttcaaatgctttcaa--atagcc 21625211  T
Q  130 gttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 229  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||   | | |    
T  21625212 gttgctttactcttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgtaagtcttgcatctcctgatga--gacaac 21625309  T
Q  230 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21625310 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttatgatgaacttgcctctgatg-cgtcatcacttcaggagcacttt 21625386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15531761 - 15531484
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |      
T  15531761 gagtagtggaggtagtggttgtacgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa-ataac 15531663  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    ||||| || ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  15531662 cgttgttttactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttcaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactacaa 15531563  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||    
T  15531562 cttctggtgatcttatgattctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgattatgtcatcacttcaggatcacttt 15531484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26972379 - 26972079
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||    
T  26972379 agcagagacaaatactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcg--caattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgcctttaaa 26972282  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  26972281 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 26972183  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| |||| ||    
T  26972182 tcctgatgaaatagagcttctggtgattttctgcttctgatgaacttgcttctaataaacttgcttctgatgacgtcaccatttcaggagcaatttgtct 26972083  T
Q  312 tcag 315  Q
    ||||    
T  26972082 tcag 26972079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 24116824 - 24117126
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24116824 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 24116923  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    |||||||||| | |  || | |||||||| ||  ||||| | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24116924 tcctttcaaa-ataaccgctacttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcat 24117022  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctga-tgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgac 310  Q
    || ||||||||||  | ||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24117023 cttctgatgaacttcatcttctggtgatctt--gcttctaaccgagatgcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgac 24117120  T
Q  311 ttcagg 316  Q
    ||||||    
T  24117121 ttcagg 24117126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 18435580 - 18435847
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18435580 tagtggttgtacactttgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atagtcgttgcttcact 18435678  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 240  Q
     ||| |||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18435679 tttctagtcttttgaaattcttagacgagattaaatccattgaataaccttcaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctagtgatc 18435778  T
Q  241 ttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    |||||||||||||| |  |||||||  || ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18435779 ttcagcttctgatgaacttgcttctagtggactagcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttg 18435847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 98 - 306
Target Start/End: Original strand, 25597560 - 25597767
Alignment:
Q  98 tccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  25597560 tccaatgccttcaaatcctttcgaa-atagccgtcgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagc 25597658  T
Q  198 tttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttca 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25597659 tttaagtcttgcatgtcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttcagatgacgtcatcacttca 25597758  T
Q  298 tgagcactt 306  Q
     ||||||||    
T  25597759 ggagcactt 25597767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20112852 - 20112614
Alignment:
Q  14 gcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaat 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20112852 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaat 20112753  T
Q  114 cctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||    
T  20112752 cctttcaaa-atagtcgttgcttcattcttccggtcttctgcaatgcttagaagagattaaatccattgaacaacctttttaagctttaagtcttgcatc 20112654  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctga 252  Q
    || |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||    
T  20112653 tcttgatgaacttcagcttcaggtgatctttagcttctga 20112614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12715573 - 12715333
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || | |||||| ||||||    
T  12715573 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataggcatacaatgctttcaaa 12715474  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12715473 tcatttcaaa-atagtcgttgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcat 12715375  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  12715374 ctcctgatgaactacaacttctagtgatctt--gcttctgatga 12715333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 15302196 - 15302435
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15302196 agcagagacactaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtacaatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctttaaa 15302295  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  15302296 tcctttcaaa-atagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatc 15302394  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||| |||| ||  ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  15302395 tcctaatgagctttagcttttggtgatctt--gcttctgatga 15302435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14100582 - 14100373
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  14100582 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtactttgtcaacgctctttaaagaagaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 14100484  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14100483 atagttgtttcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacatcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaac 14100384  T
Q  224 tagagcttctg 234  Q
    |  ||||||||    
T  14100383 ttcagcttctg 14100373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 317 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 29935558 - 29935391
Alignment:
Q  317 tgtcacgacccaatttcaggtcatgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttaca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29935558 tgtcacgacccaatttcaggtcatgaccggcgcataggctaacactaa----ctcatgatatatttagcctggcaagcctaataaactataacacttaca 29935463  T
Q  417 cctttctaaactactaaaattttggtaatgactcacaagctttcacgacatttcaagatacaagtttattat 488  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29935462 cctttctaaaatactaaaattttggtaatgactcaaaagctttcacgacatttaaagatacaagtttattat 29935391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 19086154 - 19086431
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19086154 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 19086253  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaa-cagcctttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
               | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  19086254 -----------atagtcgttgcttcactctcccagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaatcagcccttg-agctttaagtcttgcat 19086341  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19086342 ctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagc---------------tctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgact 19086426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 254
Target Start/End: Original strand, 29918024 - 29918250
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  29918024 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctgatgccttcaaatcttttcaaac 29918123  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
      ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29918124 -tagtcgttgcttcacttttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 29918221  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatg 254  Q
    || |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  29918222 tacagcttctgatgaactt--gcttctgatg 29918250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Original strand, 19623975 - 19624228
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactt-tgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaa 111  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||| | |||||||| |||||    
T  19623975 agcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactagtgt-aacgctctccaaagaacaatcatccaatgctttcaa 19624073  T
Q  112 atcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| ||  ||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  19624074 atcctttcaga-atagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagacttgcat 19624172  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  19624173 ctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gtttctgatgagatgcttctgatga 19624228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Original strand, 15987232 - 15987437
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15987232 agagacacaaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 15987331  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcc 215  Q
     ||  || | |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||| |    
T  15987332 cttttaaaatagtcattgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtctctcatcttc 15987431  T
Q  216 tgatga 221  Q
    ||||||    
T  15987432 tgatga 15987437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 289
Target Start/End: Original strand, 21618251 - 21618514
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  21618251 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaa- 21618349  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| || |||| | ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||    
T  21618350 atagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatctttagaagagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcttctgatgaac 21618447  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtca 289  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21618448 tacagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtca 21618514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 255
Target Start/End: Original strand, 22802153 - 22802376
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||   ||    
T  22802153 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaattctttcaaac-ttgt 22802251  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |     
T  22802252 cgttgtttcacttttccagtcgtctgcaatgcttagacaatattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactacaa 22802349  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22802350 cttctggtgattttcagcttctgatga 22802376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 234
Target Start/End: Original strand, 19688790 - 19688980
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  19688790 tagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atagtccttgcttcact 19688888  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctg 234  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  19688889 cttccagttttctacaatgcttggacgagaataaatccattgaacaacctttgaagctttaagtc--gcatctcctgatgaacttcagcttctg 19688980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20730846 - 20730618
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20730846 aaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaac 20730747  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||   | || |||||||||||||||    
T  20730746 -tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatacttagatgagattaaatcccttgaacagcctttgaagcttt--ttgttacatctcctgatgaac 20730650  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |  ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  20730649 tgcagcttctagtgattttcagcttatgatga 20730618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22076560 - 22076284
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||| ||    
T  22076560 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgctttccaa 22076461  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||| |||| | ||||||||||  ||| ||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||| ||| ||| ||||||  |||||||    
T  22076460 tccttccaaa-atagtcgttgctatacttttcgagtcttctgcaatctttagacgagtttaaatcctttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatc 22076364  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatc 291  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||   |||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22076363 tcctgatgaactacatcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatc 22076284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16265303 - 16265064
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  16265303 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttctcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcattcaaa 16265204  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
     |||||||| |  | ||||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  | |||||||    
T  16265203 acctttcaatc-tactcgttgcttcacttttccagtcctgtgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttcaagcttta--tgttgcatc 16265107  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    || ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16265106 tcttgacgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 16265064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 18378310 - 18378492
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  18378310 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttatcaacgctcttcaaagaacatgcatccaatgccttcaaa 18378409  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaag 196  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  18378410 tcctttcaaa-atagttgttgcttgactcttccagtcttttgcaatacttagacgagatttaatccattgaacaaccgttgaag 18378492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34451787 - 34451595
Alignment:
Q  47 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttcca 146  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| | || | |||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||    
T  34451787 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcctctcaaatt-agtcgttgcttcactctttca 34451689  T
Q  147 gtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 240  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34451688 gtcttctgcaatgcttagacgatactgaatccattgaacagcctttgaatctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 34451595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Original strand, 15954710 - 15954936
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  15954710 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaa- 15954808  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
      ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| ||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  15954809 ttagtcgttgcttcatttttccagtcttctgcaatctttagaagagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcttgatgaac 15954906  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgat 253  Q
    || |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  15954907 tacagcttctggtaattctcagcttctgat 15954936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20488060 - 20487771
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  20488060 aaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 20487962  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagatt-aaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaa 222  Q
    | || |||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||| || ||  ||||| |||| | |||||||  |||||  |||||||  ||||||||    
T  20487961 atagccgttgcttcacttttacagtcttctgcaatctttagacgaggttgaaccccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaa 20487864  T
Q  223 ctagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 314  Q
    ||  | ||||| ||||| || ||||||||||  |  |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20487863 ctgcaacttctagtgatttttagcttctgataaacttgcttctgattaactcgtttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttca 20487771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 277
Target Start/End: Original strand, 16336123 - 16336381
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||    
T  16336123 agcagagacaaaaacagagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttctaa 16336222  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||| |||| | ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || |||| | ||||||| || |||  |||||||    
T  16336223 tccttccaaa-atagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttcaag--ttgcatc 16336319  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgctt 277  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||   |  ||||||||||||||||||    
T  16336320 tcctgatgatctacaacttctggtgattctcagcttctgat---aaacttctgatgaacttgctt 16336381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19833175 - 19832948
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaag-aacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19833175 aaacagagtagtggaggtagtgcttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa 19833076  T
Q  123 cacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaa 222  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||| || ||||| || |||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  19833075 -atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaa 19832979  T
Q  223 ctagagcttctggtgatcttcagcttctgat 253  Q
    ||| | |||||||||||  ||||||||||||    
T  19832978 ctacatcttctggtgattctcagcttctgat 19832948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Original strand, 16877220 - 16877448
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||| ||||||||||||||  ||     
T  16877220 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaggaattagcatccaattccttcaaatccttt-taag 16877318  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||||||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  16877319 atagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 16877416  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    || | ||| |||||||   |||||||||||||    
T  16877417 tacaacttttggtgattcacagcttctgatga 16877448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 316
Target Start/End: Original strand, 19470683 - 19470964
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtc 129  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||   ||||    
T  19470683 agtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattgtcctttttccacgctctgcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaa-ttagtc 19470781  T
Q  130 gttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 229  Q
    ||||||||| |||||  ||||| | |||||  ||| || |||||||||  ||||||| ||||||||| || |  |||  |||||  |||||| ||  | |    
T  19470782 gttgcttcattcttctggtcttgtgcaatg-ctaggcgtgattaaatctgttgaacaacctttgaagcttcagttctctcatcttttgatgatcttcaac 19470880  T
Q  230 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  19470881 ttcttgtgatgtt--gcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactttaggagcac-ttgacttcagg 19470964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Original strand, 12349000 - 12349211
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||     
T  12349000 aaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctttcaatcctttcaaa- 12349098  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| || ||||| |  |||||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||    
T  12349099 atagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctctaag--ttgcatctcctgatgaac 12349195  T
Q  224 tagagcttctggtgat 239  Q
    |  |||||||| ||||    
T  12349196 tgcagcttctgatgat 12349211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 307
Target Start/End: Original strand, 26943583 - 26943851
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||     
T  26943583 aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaattgtacttcgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttctaatcctattgaa- 26943681  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||  ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||||||           ||||||||||| ||| |||  ||||  ||||||| |    
T  26943682 atagcggttgcttcactcttctagtcttctgcaatg-ctagacatgattaaat-----------cctttgaagttataattctctcatcatctgatgatc 26943769  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |  ||||| | ||||| ||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26943770 ttcagcttttagtgatgtt--gcttctaatgaggtgcttctgacgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 26943851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 255
Target Start/End: Original strand, 21235137 - 21235348
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||   ||      
T  21235137 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcgaatgccttcaaatgctttcaagtcca-- 21235234  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
      |||           ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||  ||    
T  21235235 --ttg---------aacagccttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttaaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcag 21235321  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21235322 cttctagtgattttcagcttctgatga 21235348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10640555 - 10640384
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt-caacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||   |||    
T  10640555 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatccttttgaa-ttagt 10640457  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaa 202  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  10640456 cgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ctaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaa 10640384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Original strand, 12423268 - 12423435
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||     
T  12423268 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaaggtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatacaatgccttccaatcctttcaaa- 12423366  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttg 193  Q
    | ||||||||||  ||| |||||||||||| | ||  ||||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  12423367 atagtcgttgctatacttttccagtcttctgc-attcttagacgagtttgaatccattaaacagcttttg 12423435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 25594064 - 25594155
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatg 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  25594064 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgcgcttcaaagaacaagcatccaatg 25594155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10640353 - 10640289
Alignment:
Q  250 tgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10640353 tgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-ttgacttcag 10640289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19066171 - 19066079
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  19066171 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19066079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 19482993 - 19483051
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  19482993 tgcttctgacgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcagg 19483051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 12423446 - 12423503
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12423446 gcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactttgtcttcagg 12423503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Original strand, 17381517 - 17381598
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaa 94  Q
    |||||||| | |||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17381517 agcagagacaaaaacagaatagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaa 17381598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19065951 - 19065894
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  19065951 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcagg 19065894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 22802366 - 22802423
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||    
T  22802366 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcactacttcaggagcactttgtcttcagg 22802423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33351853 - 33351796
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33351853 gcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaagagcactttgtcttcagg 33351796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 316
Target Start/End: Original strand, 22386972 - 22387084
Alignment:
Q  206 ttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaactt-gcttctaatgacgtcatcacttcatgagca 303  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||   |||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||    
T  22386972 ttgcatcttctgatgaactgtagcttctggtgatacacagcttatgatgaacttgcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcaaaggca 22387071  T
Q  304 ctttgacttcagg 316  Q
    ||||| |||||||    
T  22387072 ctttgtcttcagg 22387084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19832924 - 19832869
Alignment:
Q  261 ttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19832924 ttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 19832869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 33352079 - 33352008
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 84  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  33352079 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtgattgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 33352008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 17381653 - 17381711
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  17381653 tgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcagg 17381711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 26589847 - 26589905
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  26589847 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactttgtcttcagg 26589905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17608247 - 17608190
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  17608247 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcagg 17608190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 297
Target Start/End: Original strand, 21128396 - 21128490
Alignment:
Q  206 ttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaac--ttgcttctaatgacgtcatcacttca 297  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  21128396 ttgcatcttctgatgaactgtagcttctggtgatataaagcttctgatgaactcgcttctgatgagcttttgcttctgatgacgtcatcacttca 21128490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 139292 - 139235
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  139292 gcttctgataaacttgcttctgatgatgtcatcatttcaggagcactttgtcttcagg 139235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 147313 - 147256
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  147313 gcttctgataaacttgcttctgatgatgtcatcatttcaggagcactttgtcttcagg 147256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17608286 - 17608237
Alignment:
Q  206 ttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17608286 ttgcatcttctgatgaactatagcttctggtgatatacagcttctgatga 17608237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 19482759 - 19482840
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| || | ||| |||| ||||||||    
T  19482759 aaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 19482840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 304
Target Start/End: Original strand, 19688974 - 19689019
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcac 304  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  19688974 gcttctgatgaacttgcttctgacgacgtcatcacttcaggagcac 19689019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 21235338 - 21235395
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||    
T  21235338 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcgctacttcaggagcactttgtcttcagg 21235395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14070210 - 14070107
Alignment:
Q  18 agaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctt 117  Q
    ||||| |||| ||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| | |||| ||||||| |||||||| | |    
T  14070210 agaaaaaaacagagtagtggaggaagtggctgtacgcttcgtacaat-gtactttgtcgactctctttgaaggataagcatccaatgacttcaaattcct 14070112  T
Q  118 tcaaa 122  Q
    |||||    
T  14070111 tcaaa 14070107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 29875211 - 29875131
Alignment:
Q  317 tgtcacgacccaatttcaggtcatgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaata 400  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  29875211 tgtcacgacccaatctcagatcatgaccggcgcacagactaacagta--taaatca-cataaatttagcctaacaagcctaata 29875131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 20635946 - 20636005
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaactt-gcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  20635946 tgcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcagg 20636005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Original strand, 32544492 - 32544547
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 314  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  32544492 gcttctgatgaacttgcatctgatgacatcaccacttcaggagcactttgtcttca 32544547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34451592 - 34451545
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  34451592 cttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 34451545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12715344 - 12715306
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttc 296  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12715344 tgcttctgatgaacttccttctgatgacgtcatcacttc 12715306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14051523 - 14051426
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||| ||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| | |||| ||||||| |||||||| | ||||||    
T  14051523 aaacagagtagtggaggaagtggctgtacgcttcgtacaat-gtactttgtcgactctctttgaaggataagcatccaatgacttcaaattccttcaaa 14051426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 297
Target Start/End: Original strand, 16877438 - 16877476
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttca 297  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16877438 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttca 16877476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19065987 - 19065941
Alignment:
Q  209 catctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19065987 catctcctgatgaactgcagcttctggtgatatacagcttctgatga 19065941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20112612 - 20112574
Alignment:
Q  268 gaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20112612 gaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgaacactt 20112574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 17316678 - 17316609
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 82  Q
    |||||||| | ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  17316678 agcagagacaaaaacatagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 17316609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 26589595 - 26589668
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacac-ttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt 85  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  26589595 agcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttcgtacagacgtactatgtcaacgctcttt 26589668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 307
Target Start/End: Original strand, 15302422 - 15302458
Alignment:
Q  271 cttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15302422 cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 15302458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 255
Target Start/End: Original strand, 18378504 - 18378536
Alignment:
Q  223 ctagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18378504 ctagagcttctggtgatctttagcttctgatga 18378536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 113
Target Start/End: Original strand, 25930485 - 25930568
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaat 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| | ||||  |||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  25930485 gagtagtggagatagtggttgtacaatt-gtactattatccttttccaacgctcttcaaggaataagcatccaatgacttcaaat 25930568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 97)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 49642926 - 49642634
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  49642926 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaatcatccaatgccttcaaa 49642827  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  49642826 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 49642728  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  49642727 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaccttgcttctgattgcgtcatcacttcaggagcactt 49642634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 20646149 - 20646452
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20646149 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 20646248  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaa-gttttaagtcttgcat 211  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  20646249 tcctttcaaa-atagacgttgcttcactcttctggtcttctacaatgcttggacgagatgaaatacattgaacagccttttaaagctttaagtcttgcat 20646347  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20646348 ctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgaacactttgact 20646447  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  20646448 tcagg 20646452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 314
Target Start/End: Original strand, 13948334 - 13948631
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13948334 agagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 13948433  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcc 215  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13948434 tttcaaa-atagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcc 13948532  T
Q  216 tgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 314  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13948533 tgatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcattttgacttca 13948631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 6090727 - 6091029
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6090727 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctttttaaagaacaagcattcaatgccttcaaa 6090826  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||||||||   ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6090827 tcctttcaaatt-agatgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagttttaagtcttgcatc 6090925  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6090926 tcctgatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcataacttcatgagcactttaactt 6091025  T
Q  313 cagg 316  Q
    ||||    
T  6091026 cagg 6091029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 31303381 - 31303686
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||| |||||||    
T  31303381 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatcaaatgtcttcaaa 31303480  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  31303481 tcctttcaaa-atagttgttccttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttaaagctttaagtctttcatc 31303579  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttc---taatgacgtcatcacttcatgagcactttga 309  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31303580 tcctgagtaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgatgacgtcatcacttcaggagcactttga 31303679  T
Q  310 cttcagg 316  Q
    |||||||    
T  31303680 cttcagg 31303686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Original strand, 28582103 - 28582404
Alignment:
Q  15 cagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatc 114  Q
    |||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||    
T  28582103 cagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccattaaatc 28582202  T
Q  115 ctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctc 214  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28582203 ctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctc 28582301  T
Q  215 ctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttc 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  28582302 ctgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctaatgtacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttc 28582401  T
Q  314 agg 316  Q
    |||    
T  28582402 agg 28582404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 312
Target Start/End: Original strand, 15903196 - 15903492
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaa-gcctccaatgccttcaaatc 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | |||||| ||||||||    
T  15903196 agagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaaagcatgcaatgctttcaaatc 15903295  T
Q  115 ctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctc 214  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15903296 ctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttctagtcttctgtaatgcttagacgagattgaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctc 15903394  T
Q  215 ctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15903395 ctgataaattacagcttttggtgatcttcagcttctgatgagatggttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgactt 15903492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14393168 - 14392868
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14393168 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 14393069  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||    
T  14393068 tcctttcaaa-atagtcgttgtttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatc 14392970  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    |||| |||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14392969 tcctaatgaacttcagcttctagtgatctt--gcttttgatgagatgcttatgatgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttaactt 14392872  T
Q  313 cagg 316  Q
    ||||    
T  14392871 cagg 14392868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 41 - 316
Target Start/End: Original strand, 52920429 - 52920702
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||  |  || |||||||||||    
T  52920429 tagtggttgtatacttcgtacaattttaatttgtcaacgctctttaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatactttaaatta--gttgttgcttcact 52920526  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 240  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  52920527 cttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatc 52920626  T
Q  241 ttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  52920627 ttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcagg 52920702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 37467328 - 37467567
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  37467328 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37467427  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  37467428 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacaagctttgaagatttaagttttgcatc 37467526  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||    
T  37467527 tcctgatgaactactgcttctggtgatctt--gcttctgatga 37467567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29951602 - 29951302
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29951602 agcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29951503  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  | ||    
T  29951502 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtc 29951404  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29951403 ttctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgataaggtgcttctgatgaacttgcttctgaagacgtcatcacttcaggagcac-ttgactt 29951305  T
Q  313 cag 315  Q
    |||    
T  29951304 cag 29951302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30000756 - 30000456
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30000756 agcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 30000657  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  | ||    
T  30000656 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtc 30000558  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30000557 ttctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgataaggtgcttctgatgaacttgcttctgaagacgtcatcacttcaggagcac-ttgactt 30000459  T
Q  313 cag 315  Q
    |||    
T  30000458 cag 30000456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 2561183 - 2561424
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  2561183 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaagcatccaatttcttcaaa 2561282  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2561283 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 2561381  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2561382 tcctgatgaactagagcttctggtgattctcagcttctgatga 2561424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18121770 - 18121483
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  18121770 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaa-atagt 18121672  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18121671 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagag 18121572  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  18121571 cttctggtgatctttagcttatgatgaacttgcttttgatgaacttgcttctgatgatgtcaccacgtcaggagcactttgtcttcagg 18121483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38177791 - 38177566
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  38177791 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atagt 38177693  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
     ||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  38177692 tgttgcttcactcttccaatcttctgcattgctcagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaataaactagag 38177593  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  38177592 cttctgatgatcttctgcttctgatga 38177566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 41494994 - 41495176
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41494994 agcagatacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 41495093  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaag 196  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41495094 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaag 41495176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Original strand, 47207712 - 47207941
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47207712 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaac 47207811  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatg-tttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaa 222  Q
      || |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  47207812 -tagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgctttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagtttta--tgttgcatctcctgatgaa 47207908  T
Q  223 ctagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47207909 ctgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 47207941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 14969341 - 14969563
Alignment:
Q  32 tagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgt 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||    
T  14969341 tagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaatgtactttgtcaacgctatttgaagaataagcatccaatgccatcaaatcctttcaaa-atagttgt 14969439  T
Q  132 tgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagctt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14969440 tgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctcatgaactagagctt 14969539  T
Q  232 ctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  14969540 ctggtgatcttcagcatctgatga 14969563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12963249 - 12962965
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12963249 agcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 12963150  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
     ||||  ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||| || || |||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  12963149 accttctaaa-atagttgttgcttcactctcccagtcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagctttaagtcttgcatc 12963051  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||                |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12963050 tcctgatgaactacaacttctggtgatct----------------tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactttgactt 12962967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17239083 - 17238847
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  17239083 agagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcc 17238984  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcc 215  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17238983 tttcaaa-atagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 17238885  T
Q  216 tgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    | ||| |||  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  17238884 ttatgcacttcatcttctggtgatctt--gcttctgatga 17238847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 40799869 - 40800108
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  40799869 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagtatccaattccttcaaa 40799968  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||||    
T  40799969 tactttcaaac-tagtcgttgcttcgcttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgatgcatc 40800065  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    || |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40800066 tcttgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 40800108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 47405585 - 47405346
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||||||||||||    
T  47405585 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttgaagaacaaacatcaaatgccttcaaa 47405486  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||    
T  47405485 tcctttcaaac-tagttgttgcttcatttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatc 47405389  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    || |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47405388 tcgtgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 47405346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16658782 - 16658541
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  16658782 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 16658683  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||  ||  ||||| |  |||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16658682 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactgctctggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatcaattgaacaacctttgaagtttcaagtcttgcatc 16658584  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16658583 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 16658541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 46349979 - 46349707
Alignment:
Q  42 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||     
T  46349979 agtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaatgttctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa-ttagtcgttgcttcactt 46349881  T
Q  142 ttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatct 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |    
T  46349880 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattggatcaattgaacaacttttgaagtcttaag--ttgcttctcctgatgaactgcaacttctggtgattt 46349783  T
Q  242 tcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  46349782 tcagcttctaatgaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcagg 46349707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18142900 - 18142677
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  18142900 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaa-atagt 18142802  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18142801 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagag 18142702  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||| ||| |||  |||||||||||    
T  18142701 cttctgatgaactt--gcttctgatga 18142677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 49553637 - 49553400
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  49553637 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atagt 49553539  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    |  |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |    
T  49553538 cactgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcgg 49553439  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  49553438 cttctggtgatctt--acttctgatgagatgcttctaatga 49553400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 213
Target Start/End: Original strand, 13824092 - 13824263
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  13824092 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcatttcaaa-atagttgttgcttcact 13824190  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatct 213  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13824191 cttccagtcttcttcattgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13824263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13780748 - 13780576
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13780748 agcagagacacaaactgagtcgtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgccttcaaa 13780649  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaaca 186  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13780648 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaaca 13780576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12726394 - 12726166
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||    
T  12726394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctctttaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 12726295  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  12726294 tcctttcaaa-atagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgaatc 12726196  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatctt 242  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  12726195 tcctgatgaacttcaacttcttgtgatctt 12726166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 53056891 - 53056590
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  53056891 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 53056792  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||| |||||| ||||||   |||||  |||||||    
T  53056791 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgatgttgaatccattaaacagcttttgaaaccttaag--ttgcatc 53056695  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
     | |||||||||  ||||||| ||||| ||  |||||||||  |  || || |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  53056694 ccatgatgaactgcagcttctagtgatttttggcttctgataaacttgtttttgatgaactaacttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtct 53056595  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  53056594 tcagg 53056590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Original strand, 11223569 - 11223797
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  11223569 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 11223667  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |  |||  ||| ||||||||||||||    
T  11223668 atagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatgcatagacgagattgaacccattgaacagcttttgaagctcaaag--ttgtatctcctgatgaac 11223765  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |   |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11223766 tgctgcttctggtgattttcagattctgatga 11223797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 285
Target Start/End: Original strand, 14955433 - 14955692
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  14955433 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatactttcaaa- 14955531  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||| ||||||| ||  |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||| ||  || |||||||||||||||    
T  14955532 atagttgttgctttacctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttacatctcctgatgaac 14955629  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    |  | |||||||||||  ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14955630 tgcaacttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 14955692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20627595 - 20627356
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||    
T  20627595 agcagagataaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgataaacaagcatccaatgccttcaaa 20627496  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||| |||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| || |||||||| |||| | ||||||| ||||||  |||||||    
T  20627495 tccattcaaa-atagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttgaatccattaaacatcttttgaagctttaag--ttgcatc 20627399  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20627398 tcctgatgaactgcaacttctggtgattttcagcttctgatga 20627356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25398419 - 25398147
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||   | |||||||||||||    
T  25398419 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtgctttgtcaacgctctttgaagagcaaatatgcaatgccttcaaa 25398320  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||                  || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  25398319 tcctttcaaa-atagtcgttgctt------------------cattgtttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 25398239  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |  ||||||   | | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  25398238 ttatgatga--gacaacttctgatgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcgtcacttcaggagcactt 25398147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24775698 - 24775490
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24775698 agcagagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaaagctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaa 24775599  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  24775598 tcctttcaaa-atagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatc 24775502  T
Q  213 tcctgatgaact 224  Q
    ||||||||||||    
T  24775501 tcctgatgaact 24775490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 285
Target Start/End: Original strand, 2785075 - 2785330
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacag 127  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  2785075 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa-atag 2785173  T
Q  128 tcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactaga 227  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| || |||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  2785174 ttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactaca 2785271  T
Q  228 gcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
     |||||||||||  ||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2785272 acttctggtgattctcagcttctaataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 2785330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19889107 - 19888869
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19889107 agcagagacacaaactgag--gtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtaatatgtcaatcctattcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 19889010  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacag-cctttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| | ||||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||    
T  19889009 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcatctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagtctttttaagctttaagtcttgcat 19888911  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  19888910 ctcttgatgaactttagcttctagtgatctt--gcttctgatga 19888869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 29855404 - 29855706
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29855404 agcagagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactctgtcaacgctttttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29855503  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcac-tcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    | |||||||||  || ||||||||||| | ||  |||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||    
T  29855504 ttctttcaaac-tagccgttgcttcactttttttagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagtcttaag--ttgcat 29855600  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgac 310  Q
    | | |||||||||  || || ||||||| ||  ||||| |||  |  ||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||  ||||||||| |    
T  29855601 cccatgatgaactgcaggttttggtgatttttggcttccgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgacgtaaccacttcagaagcactttgtc 29855700  T
Q  311 ttcagg 316  Q
    ||||||    
T  29855701 ttcagg 29855706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 16032520 - 16032726
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16032520 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16032619  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||| | |||||| |  ||||||| || ||  ||| |  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  ||||    
T  16032620 tcctttcaaa-atagtcgttgatacactctcctggtcttctgcagtg-ataggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatc 16032717  T
Q  213 tcctgatga 221  Q
    | |||||||    
T  16032718 ttctgatga 16032726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 303
Target Start/End: Original strand, 20725093 - 20725368
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||     
T  20725093 aaacagagtagtggagatagttattgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaagaaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaat 20725192  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
      |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||  || ||  |||||| |    
T  20725193 t-agtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct-agacgtgattagatcttttgaacagcctttgaagctttaattctctcagcttatgatgatc 20725290  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagca 303  Q
    |  ||||||||||||| ||   ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  20725291 ttcagcttctggtgatgttt--cttttgatgaggtgcttatgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaagagca 20725368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Original strand, 21640878 - 21641162
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||| ||  ||||||| |||| | ||     
T  21640878 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgcttttcaatccttccaaa-atagc 21640976  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| |||| || ||||| |  |||||| ||||| | ||||||  |||||||||||||||||||  |     
T  21640977 cgttgctatacttttccagtcttctacaat-cttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaa 21641073  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||   |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21641074 cttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttatgctgaacttgcttctgatgatgtcatcactttatgagcactttgtcttcagg 21641162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22804187 - 22804048
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||     
T  22804187 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatcgaatgccttcaag 22804088  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttct 153  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||    
T  22804087 tcctttcaaa-atagccgttgcttcactcttctggtcttct 22804048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 279
Target Start/End: Original strand, 33583252 - 33583490
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcac 139  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  33583252 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa-atagccgttgcttcac 33583350  T
Q  140 tcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaat-ccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga 238  Q
    | |||||||||||||||||  |||||| || || ||| ||||  |||| | |||||||  |||||  |||||||  ||||||||||| | ||| ||||||    
T  33583351 ttttccagtcttctacaatccttagacaaggttgaatcccataaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactacaacttttggtga 33583448  T
Q  239 tcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttct 279  Q
    | || |||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||    
T  33583449 tttttagcttctgatagacttgcttctgatgaactcgcttct 33583490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 229 - 315
Target Start/End: Original strand, 41495184 - 41495270
Alignment:
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41495184 cttctggtgatcttcagtttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcatgagcactttgacttcag 41495270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 49666553 - 49666278
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| ||||||| ||||| |         || |||  |||||||||||| | |||    
T  49666553 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaatgctctttgaagaata---------tgtctttcaatcctttcaaa-atagt 49666464  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    ||||| |  ||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||||| |  |||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||    
T  49666463 cgttgttatacttttccagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcag 49666367  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||   || ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  49666366 cttctggtgattcacaacttatgatgaaattgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 49666278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 22140759 - 22140996
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  22140759 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgttttcaaa 22140858  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
     || |||||| | |||||||| ||||||  || |||||||| ||||  |||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||  ||||||  |||||||    
T  22140859 acccttcaaa-atagtcgttggttcacttatctagtcttctgcaatccttaggcgagtttgaatccgttgaacagcttttgaaactttaag--ttgcatc 22140955  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| ||  ||||||||||||    
T  22140956 tcctgatgaactgtagcttctgatgaact--agcttctgatga 22140996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 5213583 - 5213789
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||| || || |||| || ||||||||||||||||| ||||     
T  5213583 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactacgtcaacgct-tttgaataataagcatctaatgccttcaaatccttccaaa- 5213680  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||| ||||||  ||| |||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  5213681 atagttgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttatacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 5213778  T
Q  224 tagagcttctg 234  Q
    || ||||||||    
T  5213779 tacagcttctg 5213789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 269
Target Start/End: Original strand, 11869130 - 11869317
Alignment:
Q  80 ctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatcca 179  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||  | |  |||||||||||| ||| ||    
T  11869130 ctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaac-tagacgttgcttcacttttccagtcttctgtatttcttagacgagattgaattca 11869228  T
Q  180 ttgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaga-tgcttctgatga 269  Q
    || ||||   |||||||  |||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11869229 ttaaacaaattttgaagccttaag--ttgcatcccctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaaattgcttctgatga 11869317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 338 - 485
Target Start/End: Original strand, 29896333 - 29896476
Alignment:
Q  338 catgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttacacctttctaaactactaaaatt 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| |||| |||||    
T  29896333 catgaccggcgcacaggctaacactaa----ctcatgataaatttagcctggcaagcctagtaaactataacttttgcacctttctaaaatactgaaatt 29896428  T
Q  438 ttggtaatgactcacaagctttcacgacatttcaagatacaagtttat 485  Q
    ||||||||||||||||| | | ||  ||||||||| || |||||||||    
T  29896429 ttggtaatgactcacaaacctccataacatttcaaaatgcaagtttat 29896476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12389035 - 12388845
Alignment:
Q  14 gcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaat 113  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  12389035 gcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttgccaacgctcttcaaagaagaagcatccaatgccttaaaat 12388936  T
Q  114 cctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtct 206  Q
     ||||  ||   |||||| |||||||| |||   |||||| |||| | |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  12388935 tcttttgaa-ttagtcgtagcttcactgttctgatcttctgcaat-tctagacatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 12388845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21636834 - 21636544
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||            
T  21636834 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 21636743  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
     | ||||||| | |||||||||   ||| |||||||||||| |||| | ||| |||| |  | ||| |  |||||| ||||||| ||||||  || || |    
T  21636742 -catttcaaa-atagtcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttccaac 21636647  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    ||||||||||||    |||||||||||   |||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  21636646 tcctgatgaactgccacttctggtgatacacagcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtct 21636547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21605818 - 21605526
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||            
T  21605818 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 21605727  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
     | ||||||| | ||||||||    ||| |||||||||||| |||| | ||| |||| |  | ||| |  |||| | ||||||| ||||||  || ||||    
T  21605726 -catttcaaa-atagtcgttgtcatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttccatc 21605631  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||   || ||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21605630 tcctgatgaactgcaacttctggtgatacacaacttctgatgaacttgcttatgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcctgagcactttgtct 21605531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19249547 - 19249385
Alignment:
Q  42 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactc 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||   ||  ||||||||||||    
T  19249547 agtggttgtacacttcgtacaattgtcctatttcagcgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatccttttgaa-ttagctgttgcttcactc 19249449  T
Q  142 ttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtct 206  Q
    |||  ||||||| |||||  ||| || |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19249448 ttctggtcttctgcaatg-ctaggcgtgattaaatcgtttgaacaacctttgaagctttaagtct 19249385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 316
Target Start/End: Original strand, 13824265 - 13824329
Alignment:
Q  252 atgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13824265 atgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcagg 13824329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23538312 - 23538185
Alignment:
Q  31 gtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcg 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||  || | |  ||    
T  23538312 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctctaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaa-ataaccg 23538214  T
Q  131 ttgcttcactcttccagtcttctacaatg 159  Q
    ||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  23538213 ttgtttcattcttccagtcttctgcaatg 23538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22804049 - 22803972
Alignment:
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  22804049 cttctgatgaacttcagcttctgatgagatgcttctgaggaacttgcttttgatgacgtcatcactttaggagcactt 22803972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30054161 - 30054104
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30054161 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttgtcttcagg 30054104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 11868264 - 11868336
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt 85  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11868264 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctcttt 11868336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11909171 - 11909079
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11909171 agtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtaaagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 11909079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12388791 - 12388729
Alignment:
Q  245 gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12388791 gcttctgatgaggtgcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 12388729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 118
Target Start/End: Original strand, 12968312 - 12968406
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatccttt 118  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  12968312 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtataattgtccttttccaacgttcttcaaagaataagtatccaatgccttcaaattcttt 12968406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 168
Target Start/End: Original strand, 50300246 - 50300372
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaag-aacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcac 139  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||  | |||||||| ||||||||| |||||| |  |  ||||||||||    
T  50300246 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacatacatccaatgcgttcaaatcccttcaaata--gcagttgcttcac 50300343  T
Q  140 tcttccagtcttctacaatgtttagacga 168  Q
    | |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  50300344 ttttccagtcttctgcaatccttagacga 50300372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Original strand, 40851184 - 40851240
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40851184 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 40851240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1727995 - 1727888
Alignment:
Q  210 atctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  1727995 atctcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatgaacttgcttttgatgaactagcttctgatgacgtcatcactttagaagcactttg 1727896  T
Q  309 acttcagg 316  Q
     |||||||    
T  1727895 tcttcagg 1727888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16199744 - 16199674
Alignment:
Q  245 gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  16199744 gcttctgatgaggtgcttcttatgaacttgcttctgatgacgtcatcagttcaggagcac-ttgacttcagg 16199674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 45858875 - 45858804
Alignment:
Q  51 acacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45858875 acacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 45858804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 46796531 - 46796436
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgcctt 108  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||  || ||||||||    
T  46796531 agcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagtatctaatgcctt 46796436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 316
Target Start/End: Original strand, 50300387 - 50300498
Alignment:
Q  206 ttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcac 304  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||| || | ||| |||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  50300387 ttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgatttttaacttatgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcac 50300486  T
Q  305 tttgacttcagg 316  Q
    |||| |||||||    
T  50300487 tttgtcttcagg 50300498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 46796312 - 46796255
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  46796312 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactctgtcttcagg 46796255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Original strand, 11223789 - 11223844
Alignment:
Q  261 ttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  11223789 ttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcagg 11223844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 37467541 - 37467599
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37467541 tgcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagctctttgacttcagg 37467599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 2561414 - 2561471
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  2561414 gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcaccacttcaagagcactttgtcttcagg 2561471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18142702 - 18142645
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||    
T  18142702 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggaacactttgtcttcagg 18142645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 33598105 - 33598162
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33598105 gcttctgacgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 33598162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 30054381 - 30054309
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt 85  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  30054381 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttt 30054309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 105
Target Start/End: Original strand, 40850991 - 40851055
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  40850991 tagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40851055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 122
Target Start/End: Original strand, 51341051 - 51341107
Alignment:
Q  66 gtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  51341051 gtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaattcctttcaaa 51341107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 12752741 - 12752683
Alignment:
Q  64 ttgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  12752741 ttgtactttgtcaacgctctttgaaggataagtatccaatgccttcaattcctttcaaa 12752683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 26417832 - 26417738
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatccttt 118  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||| |||  ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  26417832 aaacagagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtcattttccaacgttctccaaagaatgagcatccaatgccttcaaattcttt 26417738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 46796412 - 46796302
Alignment:
Q  142 ttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatct 241  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||| || ||||| || |||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||      
T  46796412 ttccagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttcttgtgattc 46796316  T
Q  242 tcagcttctgatga 255  Q
     |||||||||||||    
T  46796315 acagcttctgatga 46796302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 307
Target Start/End: Original strand, 14969556 - 14969601
Alignment:
Q  262 tctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14969556 tctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 14969601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24775437 - 24775388
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  24775437 gcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcagaagcactttg 24775388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9699999 - 9699943
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  9699999 gcttctggtgaacttgcttctgatgacgtcaacacttcagaagcactttgtcttcag 9699943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 9700200 - 9700108
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||| | |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| || | ||| |||| ||||||||    
T  9700200 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 9700108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10540010 - 10539963
Alignment:
Q  317 tgtcacgacccaatttcaggtcatgaccggcgcacaggctaacactaa 364  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10540010 tgtcacgacccaattttaggccatgaccggcgcataggctaaccctaa 10539963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 1728179 - 1728129
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaa 63  Q
    |||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1728179 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaa 1728129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 10529552 - 10529610
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaactt-gcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  10529552 gcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcagg 10529610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 13977941 - 13977999
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaactt-gcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  13977941 gcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcagg 13977999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 15833612 - 15833670
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaactt-gcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  15833612 gcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcagg 15833670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19888880 - 19888842
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttc 296  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19888880 tgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttc 19888842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 279
Target Start/End: Original strand, 51341189 - 51341263
Alignment:
Q  206 ttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttct 279  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||    
T  51341189 ttgcatcttctgatgaactacagtttctagtgatatacagcttctgatgaaatagcttctgatagacttgcttct 51341263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 292
Target Start/End: Original strand, 51341257 - 51341291
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatca 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51341257 tgcttctgataaacttgcttctaatgacgtcatca 51341291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 10525689 - 10525584
Alignment:
Q  317 tgtcacgacccaatttcaggtcatgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttaca 416  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |    |||||||| ||| ||||| || ||||||  ||||| | |||||||| ||||    
T  10525689 tgtcacgattcaattttaggtcatgaccggcgcatcggctaaccc----taactcatcatacatttacccaagcaagattaatacattataacacataca 10525594  T
Q  417 cctttctaaa 426  Q
    ||||| ||||    
T  10525593 cctttataaa 10525584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Original strand, 15833442 - 15833486
Alignment:
Q  64 ttgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgcctt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  15833442 ttgtactttgtcaactctctttgaaggacaagcatccaatgcctt 15833486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Original strand, 15851048 - 15851092
Alignment:
Q  64 ttgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgcctt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  15851048 ttgtactttgtcaactctctttgaaggacaagcatccaatgcctt 15851092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17238871 - 17238816
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  17238871 cttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac-ttgacttcagg 17238816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 210 - 281
Target Start/End: Original strand, 49990426 - 49990498
Alignment:
Q  210 atctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaa 281  Q
    |||| ||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  49990426 atcttctgatgatctacagtttctggtgatatacagcttctgatgaaatagcttctgatagacttgcttctaa 49990498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 314
Target Start/End: Original strand, 474 - 771
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  474 agagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 573  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcc 215  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  574 tttcaaa-atagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcc 672  T
Q  216 tgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 314  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  673 tgatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcattttgacttca 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Original strand, 17814960 - 17815251
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  17814960 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactccgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaa 17815059  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17815060 tcctttcaga-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatc 17815158  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    || ||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17815159 tcttgatgaaatttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgctactgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 17815251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7745838 - 7745569
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  7745838 agcagagacaaaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 7745739  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  7745738 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactcttctagtcttctccaatgcttggatgcgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatc 7745640  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  7745639 tcctgatgtacttcagcttcttgtgatctt--gcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttcttatgac 7745569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19536446 - 19536153
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  19536446 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 19536347  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcact-cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||| |||   ||||| | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19536346 tccattcaaa-aaagtcgttgcttcactccttttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcat 19536248  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    |||||||||||||   |||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19536247 ctcctgatgaacttctgcttcttgcgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 19536153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 21910548 - 21910787
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21910548 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21910647  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21910648 tcctttcaaa-ataatcgttgcttcacttttccagtcttttgtaatgcttagacgagattaaatcaattcaacagcctttgacgctttaagtcttgcatc 21910746  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21910747 tcctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatga 21910787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41566579 - 41566338
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  41566579 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatatcaacgctcttcaaagaataaacatccaatgccttcaaa 41566480  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41566479 tcctttcaaa-atagacgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagcttttgaagctttaagtcttgcatc 41566381  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  41566380 tcctgatgaactacaacttctgatgatcttcagcttctgatga 41566338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6512573 - 6512337
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  6512573 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcc---aatgccttcaaa 6512477  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6512476 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttcagcaatgcttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 6512378  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  6512377 tcctgatgaactacaacttctagtgatctt--gcttctgatga 6512337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21072385 - 21072131
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21072385 agcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 21072286  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| |  || | |||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  21072285 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctgtga-gtgattaaatccatagaacaaccttttaagctttaagtcttgcatc 21072188  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21072187 tcctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 21072131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23413119 - 23412843
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  23413119 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgctttcaaa 23413020  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  23413019 tcctttcaaa-ataatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttggatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 23412921  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||                |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23412920 tcctgatgaacttcagcttctggtgatct----------------tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 23412843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 89567 - 89328
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||    
T  89567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatgcaatgctttcaaa 89468  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||    
T  89467 ttctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttttgcatc 89369  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  89368 tcctgatgaactacaacttctggtgatctt--gcttctgatga 89328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 33022656 - 33022895
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  33022656 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaa 33022755  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||    
T  33022756 tcctttcaaac-tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatc 33022852  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  33022853 tcctgatgaactgcaaattctggtgattttcagcttctgatga 33022895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 20550887 - 20551162
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20550887 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-tttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20550985  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  20550986 tcttttcaaa-atagtcgttgcttcactcttctagttttctgcaatgcttagacgagattaaaaccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcat 20551084  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20551085 ctcctgatgaa-----------------cttcagcttctgatgagatgcttctaatgagcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 20551162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 26784346 - 26784587
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| | | | ||||    
T  26784346 agcagacacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccagttcttccaaa 26784445  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||  ||  ||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  26784446 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcctttaaagctttaaatcttgcatc 26784544  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26784545 tcctgctgaactacagcttctggtgatcttcagcttctgatga 26784587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 303
Target Start/End: Original strand, 23881059 - 23881347
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||     
T  23881059 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgcactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 23881158  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagccttt-gaagttttaagtcttgcat 211  Q
    | | ||  ||   ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| | || || ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||  |||    
T  23881159 ttcatttgaatt-agtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgct-aggcgtgattaaatccattaaacaaccttttgaagcttta-gtctctcat 23881255  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagca 303  Q
    || ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  23881256 cttctgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgaccttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagca 23881347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 42243683 - 42243974
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaag-aacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| |||||||||||||||||    
T  42243683 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgctcttttaaggaacaaacatcaaatgtcttcaaatcctttcaaa 42243782  T
Q  123 cacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaa 222  Q
     | ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  42243783 -atagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaa 42243879  T
Q  223 ctagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||| |||||||||||||  |||| || ||||  |  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  42243880 ctacagcttctggtgattctcagtttttgataaatttgcttctgatgaccttgcatctgatgacgtcatcacttcaggagcattttgtcttcagg 42243974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13545641 - 13545448
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||    
T  13545641 gagtagtggaggtggtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa-gtagt 13545543  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
     ||||||||||        |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13545542 tgttgcttcac--------tcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 13545451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29138551 - 29138252
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||    
T  29138551 agcagagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgacaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaa 29138452  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||| |||| | ||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||  ||||||||  || ||||  || |||||| ||||||  ||||||  |||||||    
T  29138451 tccttccaaa-atagttgttgctatact-ttccagtcttctgcaat-cttagacgattttgaatctgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatc 29138357  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgact 311  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  29138356 tcctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactacaggagcactttgtct 29138257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 642836 - 642552
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |   ||  ||   ||     
T  642836 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgccttcaactttatttgaatt-agc 642738  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    ||||| |||||||| |   ||||||  |||| | ||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||  |     
T  642737 cgttgtttcactctcctgatcttctgtaatgct-aggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaactgcaa 642639  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  642638 tttctggtgatcttcagcatctcatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac-ttgacttcagg 642552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21099849 - 21099558
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||   ||||| |||||||||||||      
T  21099849 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgttcttcaaaaggcaagcatccaatgccttcagc 21099750  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | | ||  ||   ||| |||||||||||||    ||||| |  |||| | || |  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||    
T  21099749 ttcatttgaatt-agttgttgcttcactctcttggtcttttgtaatgct-aggcatgattaaatccatttaacagcctttgaagctttaagtctctgatc 21099652  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21099651 ttctgatgaactttagcttctggtgattttcagcttctgatgaggtgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 21099558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 11993880 - 11994117
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  11993880 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacatacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaa 11993979  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||| ||||||   || |||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||  ||||||  |||||||    
T  11993980 tcccttcaaa-ttagccgttgcttcactattccagtcttctgcaatccttagacgagtttgaatccgttgaacatcttttgaaactttaag--ttgcatc 11994076  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  11994077 tcctgatgaactacagcttctggtgattcacagcttctgat 11994117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 4887014 - 4887253
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4887014 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 4887113  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    || ||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||| | |||| || |||| || |||||||||||||||| | ||||||| ||||||  ||||||     
T  4887114 tcttttcaaa-atagtcgttgctatacttttccagtcttttgcaatcttaagacaagtttaaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcata 4887210  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    || |||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  4887211 tcttgatgaactgcagcttctggtgattctcagcttctaatga 4887253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 31117869 - 31118088
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  31117869 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggatgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacactctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 31117968  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || |||| || ||||||| ||||  | ||||||    
T  31117969 ttctttcaaa-ttagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagtttaaatccgttaaacaaccttttgaagcttta--tgttgcat 31118065  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctg 234  Q
    |||||||||||||  ||||||||    
T  31118066 ctcctgatgaactgcagcttctg 31118088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 285
Target Start/End: Original strand, 30742983 - 30743242
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||     
T  30742983 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 30743081  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | | |||||||||  |  |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  30743082 ataatcgttgctttgcctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 30743179  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    |  | ||||| || ||  ||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30743180 tgcaacttctcgtaattctcagcttatgataaatttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 30743242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Original strand, 15516972 - 15517198
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  15516972 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaaagtactatgccaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaa- 15517070  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | || |||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||    
T  15517071 atagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcttctgatgaac 15517168  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgat 253  Q
    || | |||||||||||  ||| ||||||||    
T  15517169 tacaacttctggtgattctcaacttctgat 15517198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 285
Target Start/End: Original strand, 26759157 - 26759411
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| | ||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  26759157 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacttactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaa-atagt 26759255  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    ||||| |  ||| |||||||||||| |||| ||||| |||  || ||||| || |||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |     
T  26759256 cgttgttatacttttccagtcttctgcaatctttaggcgaatttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaa 26759353  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26759354 cttctggtgattctcagcttctgataaatttgcttctgatgaatttgcttctgatgac 26759411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 256
Target Start/End: Original strand, 6499231 - 6499471
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||     
T  6499231 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccgatgccttcaac 6499330  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    | | ||  || | ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||||   | |  | |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||    
T  6499331 ttcatttgaa-atagatgttgcttcactctcctggtcttctgcaat-actgggtgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtct--cat 6499426  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgag 256  Q
    || |  |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6499427 cttcatatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgag 6499471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14086684 - 14086445
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tttaaagaacaagcctccaatgccttcaa 111  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  14086684 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcattcaa 14086585  T
Q  112 atcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaat-ccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgca 210  Q
    |||  |||||| | || |||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||| |||||||  |||||  |||||    
T  14086584 atcacttcaaa-atagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgca 14086488  T
Q  211 tctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat 253  Q
    ||  ||||||||||  |||||||||| || || ||||| ||||    
T  14086487 tcctctgatgaactgcagcttctggtaatttttagcttttgat 14086445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3245575 - 3245348
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||  ||| ||||||||     
T  3245575 aaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcctttcaattctttcaaa- 3245477  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | || |||||||  ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| || ||||| |  |||||  || |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  3245476 atagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagttttggaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 3245380  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |  |||||||||||||   |||||||||||||    
T  3245379 tgcagcttctggtgattcacagcttctgatga 3245348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12352940 - 12352845
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgcctt 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||    
T  12352940 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaatgcaagcatccaatgcctt 12352845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25096960 - 25096777
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt---caacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttca 120  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||      
T  25096960 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttg 25096861  T
Q  121 aacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtct 206  Q
    ||   | |||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  25096860 aa-ttaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ctaggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25096777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25154930 - 25154747
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt---caacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttca 120  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||      
T  25154930 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttg 25154831  T
Q  121 aacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtct 206  Q
    ||   | |||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  25154830 aa-ttaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ctaggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25154747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21199148 - 21198896
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21199148 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctttccaaagaacgagcatccaatgccttcaaa 21199049  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | | ||  ||   || |||||| ||| | |||  ||||||| || |   ||| || |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  ||||    
T  21199048 ttcatttgaa-ttagccgttgc-tcatttttctggtcttctgcagt-actaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatc 21198952  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgag-atgcttctgatga 269  Q
    | ||||||||||  |||| |||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||    
T  21198951 ttctgatgaacttcagctcctggtgatatt--gcttctgatgagtttgcttctgatga 21198896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9398879 - 9398649
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| | ||||||||||||     
T  9398879 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagtaagcattcaatgccttcaac 9398780  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | | ||  ||   |||||||||| |||||| |   ||           ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||  ||||    
T  9398779 ttcatttgaa-ttagtcgttgctccactctcctgatc-----------ttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaacctttaagtctctcatc 9398692  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    | ||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  9398691 ttctgatgaacttcaacttctggtgatcttgagcttctgatga 9398649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 292
Target Start/End: Original strand, 32160769 - 32161036
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  32160769 aaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatacgttctttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 32160867  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagc-ctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaa 222  Q
      ||  |||||| |  |  | |||||||   |  | |||||||||| || |||||||| |||| |  ||||||  |||| |  |||||||| ||||||||    
T  32160868 ttagctgttgctactatacttcagtctttcgctttctttagacgagtttgaatccattaaacaactatttgaaactttagg--ttgcatcttctgatgaa 32160965  T
Q  223 ctagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatca 292  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32160966 ctacagtttctggtgatatacagcttctgatagacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 32161036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 33933259 - 33933424
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tttaaagaacaagcctccaatgccttcaa 111  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || ||    
T  33933259 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgtttaa 33933358  T
Q  112 atcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatcc 178  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||| || |||||    
T  33933359 atcctttcaaa-atagttgttgcttcacttttccagtcttttgcaatccttagacgaggttgaatcc 33933424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12352750 - 12352671
Alignment:
Q  227 agcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  |||||| ||||||||    
T  12352750 agcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttttgatgacgtcagtacttcaggagcactt 12352671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 156
Target Start/End: Original strand, 28139599 - 28139741
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||  ||    
T  28139599 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctatgaagaataagcatccaatgtctttcaa 28139698  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctaca 156  Q
    |||||||||| | ||||||||||  ||| || ||||||||||||    
T  28139699 tcctttcaaa-atagtcgttgctatactttttcagtcttctaca 28139741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 109
Target Start/End: Original strand, 9088961 - 9089057
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttc 109  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  9088961 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttc 9089057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 164
Target Start/End: Original strand, 26765501 - 26765640
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  26765501 aaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaa- 26765599  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttag 164  Q
    | ||| ||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  26765600 atagttgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttag 26765640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 30115982 - 30115873
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| || |||||| |  ||    
T  30115982 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcccttcaa 30115883  T
Q  113 tcctttcaaa 122  Q
    ||||||||||    
T  30115882 tcctttcaaa 30115873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 28464473 - 28464389
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgcctt 108  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  28464473 aaacagagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 28464389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 25930301 - 25930205
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttc 109  Q
    |||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  25930301 agcagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgccttc 25930205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 35932151 - 35932059
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  35932151 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 35932059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Original strand, 10848765 - 10848860
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgcctt 108  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||    
T  10848765 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatctaatgcctt 10848860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30115792 - 30115745
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30115792 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactt 30115745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35986192 - 35986085
Alignment:
Q  210 atctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||   |||||||||||||  | |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  35986192 atctcctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgaattagcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 35986093  T
Q  309 acttcagg 316  Q
     |||||||    
T  35986092 tcttcagg 35986085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25096723 - 25096661
Alignment:
Q  245 gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25096723 gcttctgacggggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 25096661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25154693 - 25154631
Alignment:
Q  245 gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25154693 gcttctgacggggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 25154631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3245358 - 3245302
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  3245358 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcactttagaagcactttgtcttcag 3245302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 307
Target Start/End: Original strand, 26784577 - 26784625
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26784577 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatgacttcatgagcacttt 26784625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23391531 - 23391473
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  23391531 tgcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcagg 23391473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 297
Target Start/End: Original strand, 23478536 - 23478629
Alignment:
Q  206 ttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaac-ttgcttctaatgacgtcatcacttca 297  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  23478536 ttgcatcttctgatgaactgtagcttctggtgatatacagcttctgatgaacttgcttctgttgaactttgcttctgataacgtcatcacttca 23478629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 33022885 - 33022942
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
T  33022885 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaaaagcactttgtcttcagg 33022942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Original strand, 5430106 - 5430162
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
T  5430106 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcagaagcactttgtcttcagg 5430162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 113
Target Start/End: Original strand, 16607520 - 16607603
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16607520 gagtagtggagatagtggttgtacactt-gtactattgtccttttccaacgttctccaaagaataagcttccaatgccttcaaat 16607603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 307
Target Start/End: Original strand, 21910762 - 21910810
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21910762 gcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcacttt 21910810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35931929 - 35931873
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  35931929 cttctgatgaactagcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcagg 35931873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 89352 - 89297
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  89352 cttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcagtagcactttgacttcag 89297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 5429991 - 5430115
Alignment:
Q  130 gttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatcc-attgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||  ||| ||||| || ||||| ||  |||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||  ||    
T  5429991 gttgcttcactttttcagtcttctgcaatccttaaacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagccttaagt--tgcatctcctgatgaactgcag 5430088  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||    
T  5430089 cttctggtgatttttaccttctgatga 5430115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6512348 - 6512309
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttca 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6512348 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 6512309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28464255 - 28464208
Alignment:
Q  269 aacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28464255 aacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 28464208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11208119 - 11208030
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatc 114  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    ||| |||||||| ||||||||    
T  11208119 aaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtac-atagtactttgtcaacgctctttgaaggctgagcatccaatgcattcaaatc 11208030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25930182 - 25930087
Alignment:
Q  142 ttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgat 239  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||| || ||||| || |||| | ||||||| |||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  25930182 ttccagtcttatgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaattgcagcttctggtgat 25930087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 307
Target Start/End: Original strand, 4887250 - 4887291
Alignment:
Q  266 atgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4887250 atgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 4887291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 10848985 - 10849042
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10848985 gcttatgatgaacttgcttttgatgatgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 10849042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Original strand, 28139809 - 28139865
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||    
T  28139809 cttctgatgaacttggttctgatgacgtcatcacttcaggagcagtttatcttcagg 28139865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 308
Target Start/End: Original strand, 33933523 - 33933571
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  33933523 cttctgatgaacttgcttctgatgacgttatcacttgaggagcactttg 33933571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14086443 - 14086396
Alignment:
Q  269 aacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14086443 aacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 14086396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 255
Target Start/End: Original strand, 9089076 - 9089190
Alignment:
Q  138 actcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtg 237  Q
    ||| |||||||||||| ||||  | ||||||| || | ||| || |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9089076 acttttccagtcttcttcaatcat-agacgagtttgattcctttaaacagcttttgaaactttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtg 9089172  T
Q  238 atcttcagcttctgatga 255  Q
    ||   |||||||||||||    
T  9089173 attcacagcttctgatga 9089190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 21660439 - 21660497
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaactt-gcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  21660439 gcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactttgtcttcagg 21660497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30115845 - 30115782
Alignment:
Q  190 tttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||    
T  30115845 tttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatga 30115782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23391737 - 23391656
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| || | ||| |||| ||||||||    
T  23391737 aaacagagtagtgcagatagtgattgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 23391656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 307
Target Start/End: Original strand, 17447041 - 17447092
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaactt--gcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  17447041 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 17447092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 85
Target Start/End: Original strand, 21660220 - 21660276
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt 85  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| |||||    
T  21660220 gagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgatcttt 21660276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28464361 - 28464257
Alignment:
Q  146 agtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcag 245  Q
    |||||||| |||| || ||||||| || ||||| |  |||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||   |||    
T  28464361 agtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagt--tgtatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacag 28464265  T
Q  246 cttctgat 253  Q
    ||||||||    
T  28464264 cttctgat 28464257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Original strand, 12205 - 12498
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  12205 agcagagacacaatctgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 12304  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  12305 ttctttcaaa-atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagctttaagtcttgtgtc 12403  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  12404 tcctgatgaactagagcttctggtgatcctcaacttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcagctcaggagcacttt 12498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 90)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 24 - 307
Target Start/End: Original strand, 45833395 - 45833677
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||     
T  45833395 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaaaaagcatccaatgcattcaaatactttcaaa- 45833493  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45833494 atagaagttgcttaactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 45833593  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  45833594 tagagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttatgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcacttt 45833677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12811296 - 12811007
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  12811296 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctatt---agaacaagcatccaatgccttcaaa 12811200  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12811199 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgaaactaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 12811101  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||  |||||||    
T  12811100 tcctaatgaactagagcttctggtgatcttctactactgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatgacgttatcacttcagaagcactt 12811007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14605017 - 14604727
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||     
T  14605017 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatccttttaaaa 14604918  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  14604917 atagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctgatgaag 14604818  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14604817 tttagcttctgatgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttgacttcagg 14604727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29680665 - 29680410
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29680665 agcagagacacatactgagtagtggagataatgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 29680566  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  29680565 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttggagctttaagtcttgcatc 29680467  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29680466 tcctggtaaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 29680410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 312
Target Start/End: Original strand, 16632430 - 16632726
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  16632430 agcagagacacaaactgattggtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagaatccaatgccttcaaa 16632529  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16632530 tcttttcaaa-atagtcgttgattcactcttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 16632628  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16632629 tcctgatgaactttagcttctagtgatctt--gcttctgatgagatgcttttgatgaccttgcttctgatggtgtcatcacttcagaagcactttgactt 16632726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37435656 - 37435387
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  37435656 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatagtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37435557  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  37435556 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 37435458  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37435457 tcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcctctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 37435387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 307
Target Start/End: Original strand, 12601100 - 12601382
Alignment:
Q  22 acaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12601100 acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaa 12601199  T
Q  122 acacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatga 221  Q
    | | |||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  12601200 a-atagtcgttgattcactattcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctcgagatga 12601298  T
Q  222 actagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
     ||  | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12601299 gctttaacttctagtgatctt--gcttctgatgagatgcttcttatgaaaatgcttttgatgacatcatcacttcaggagcacttt 12601382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 19884692 - 19884932
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19884692 agcagagacaaaaacagattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 19884791  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19884792 tcctttcaaac-tagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 19884889  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19884890 tcctgatgaactacagcttctggtgattgtcagcttctgatga 19884932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Original strand, 3395580 - 3395840
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  3395580 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaactagcatccaatgctttcaaa 3395679  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  3395680 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactttttcagttttctgcaatgcttagacgatatttaatccattgaacaacttttgaagatttaagtcttgcatc 3395778  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaactt 273  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  3395779 tcctgatgaactatagcttctagtgatcttcaacttctgataaacttgcttctgatgaactt 3395840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Original strand, 40846089 - 40846382
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |||||     
T  40846089 agcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgctttcaac 40846188  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagccttt-gaagttttaagtcttgcat 211  Q
    | | ||  ||   ||||||||||||||| | |  ||||||| ||||| | || || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  40846189 ttcatttgaatt-agtcgttgcttcactttcctggtcttctgcaatgct-aggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtctctcat 40846286  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    || ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40846287 cttctgatgaacttcagcttccggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 40846382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 317 - 488
Target Start/End: Original strand, 6736143 - 6736310
Alignment:
Q  317 tgtcacgacccaatttcaggtcatgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttaca 416  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6736143 tgtcacgacccaatttcaagtcatgaccggcgcacaggctaacactaa----ctcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttaca 6736238  T
Q  417 cctttctaaactactaaaattttggtaatgactcacaagctttcacgacatttcaagatacaagtttattat 488  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6736239 cctttctaaaatactaaaattttggtaatgactcacaagctttcacgacatttcgagatacaagtttattat 6736310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13576235 - 13575996
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  13576235 agcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaa 13576136  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||    
T  13576135 tcctttcaaac-taggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatc 13576039  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13576038 tcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 13575996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 255
Target Start/End: Original strand, 3483739 - 3483952
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3483739 tagtggttgtgcgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atagtcgttgcttcact 3483837  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 240  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  3483838 tttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagtttttgaagctttaagtcttgcatctcttaatgaactataacttctggtgatc 3483937  T
Q  241 ttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||||||||    
T  3483938 ttcagcttctgatga 3483952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 19666362 - 19666567
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||| ||||||    
T  19666362 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaagaacaagtattcaatgctttcaaa 19666461  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||    
T  19666462 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttcaagctttaagtcttgcatc 19666560  T
Q  213 tcctgat 219  Q
    |||||||    
T  19666561 tcctgat 19666567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37985733 - 37985525
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  37985733 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37985634  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  37985633 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactttttcagtcttctgcgatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 37985535  T
Q  213 tcctgatgaa 222  Q
    || |||||||    
T  37985534 tcatgatgaa 37985525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Original strand, 10072925 - 10073161
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10072925 agcagagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcctccaatgccttcaaa 10073024  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10073025 tcctttcaaac-tagcagttgcttcacttttccagtcttctgctatgcttaaacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 10073122  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctg 251  Q
    |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  10073123 tcctgatgaactactgcttctggtaattttcagcttctg 10073161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 9140902 - 9141097
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9140902 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 9141001  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgc 209  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  9141002 tcctttcaaa-atagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacccttgaagctttaagtcttgc 9141097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22675630 - 22675402
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22675630 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaac 22675531  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
      ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||    
T  22675530 -tagtcgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaac 22675434  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |  ||||||||| ||| ||  |||||||||||    
T  22675433 tgcagcttctggggattttttgcttctgatga 22675402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 55380280 - 55380519
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  55380280 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 55380379  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  55380380 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggcatgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcat 55380477  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||| |||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  55380478 ctcctaatgaacttcagcttctgatgatctt--gcttctgatga 55380519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 255
Target Start/End: Original strand, 56034579 - 56034803
Alignment:
Q  28 tgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacag 127  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| | ||    
T  56034579 tgagtagtggagatagtagttgtacattttagacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattatttcaaa-atag 56034677  T
Q  128 tcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  56034678 tcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaacttca 56034777  T
Q  228 gcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||    
T  56034778 gcttctggtgatctt--gcttctgatga 56034803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14904477 - 14904236
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||    
T  14904477 agcagagacacaaactgagtggtggagataatggttgtttacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgtcttcaaa 14904378  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| |  | |||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  14904377 tcctttcaaa-atggacgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcctagacgagattaaatcctttgaatagcttttgaagctttaggtcttgcatc 14904279  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||    
T  14904278 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagattttgatga 14904236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 307
Target Start/End: Original strand, 17247245 - 17247525
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||     
T  17247245 aaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgttctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaa- 17247343  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
      ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||   | |||||||||||||||    
T  17247344 ttagtcgttgcttcact-ttccaatcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--attcatctcctgatgaac 17247440  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  17247441 tgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgacatcaccacttcaggagcacttt 17247525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 307
Target Start/End: Original strand, 14833449 - 14833674
Alignment:
Q  76 aacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaa 175  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  14833449 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaa 14833547  T
Q  176 tccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgc 275  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||     ||||||||| |||||| |||    
T  14833548 tctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttct-----gatgcttcttatgaacctgc 14833642  T
Q  276 ttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||| ||||| | ||||||||| |||||||||    
T  14833643 ttctgatgactttatcacttcaggagcacttt 14833674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19621182 - 19620962
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  19621182 agcagagacacaaactgaatagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgctttcaaa 19621083  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||  ||  ||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  19621082 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcacttctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatc 19620984  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctg 234  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  19620983 tcctgatgaacttcagcttctg 19620962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Original strand, 10692841 - 10693126
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10692841 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10692940  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| || |||| | ||||||| ||||||  |||||||    
T  10692941 tcctttcaaa-atagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatc 10693037  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||              ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10693038 tcctgatgaactacagcttctggtgattctca--------------gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtctt 10693123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Original strand, 10906607 - 10906892
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10906607 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10906706  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| || |||| | ||||||| ||||||  |||||||    
T  10906707 tcctttcaaa-atagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatc 10906803  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||              ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10906804 tcctgatgaactacagcttctggtgattctca--------------gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtctt 10906889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Original strand, 6641674 - 6641971
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  6641674 agcagagacataaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatcaaatgccttcaaa 6641773  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||||  ||   || ||||| ||||||||||   ||||||||||||  ||| |  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||    
T  6641774 tccttttgaa-ttagccgttgtttcactcttctgatcttctacaatg-ctaggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatc 6641871  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    | |||||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6641872 ttctgatgaaattcagcttctggtgatatt--gcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcac-ttgactt 6641968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19912002 - 19911760
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt-aaagaacaagcctccaatgccttcaa 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||    
T  19912002 agcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattatactatgtcaacgctctttcaaagaataagcatccaatgctttcaa 19911903  T
Q  112 atcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||  ||  ||||| | ||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  19911902 atcctttcaaa-atagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatctattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcat 19911804  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19911803 ctcctgatgaactacaacttctgatgatcttcagcttctgatga 19911760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 255
Target Start/End: Original strand, 413008 - 413231
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagt 128  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||   ||     
T  413008 gagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaa-ttagc 413106  T
Q  129 cgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 228  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||  ||    
T  413107 cgttgcttcacttttcgagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgaatctcctgatgaactgcag 413204  T
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  413205 cttctggtgattttcagcttctgatga 413231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 316 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 2464979 - 2464807
Alignment:
Q  316 gtgtcacgacccaatttcaggtcatgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttac 415  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2464979 gtgtcacgacccaattttaggtcatgaccggcgcacaggctaacactaa----ctcatgatatatttagcctggcaagcctaataaactataacacttac 2464884  T
Q  416 ----acctttctaaactactaaaattttggtaatgactcacaagctttcacgacatttcaagatacaagtttattat 488  Q
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2464883 ttacacctttctaaaatactaaaattttggtaatgactcgcaagctttcaggacatttcaagatgcaagtatattat 2464807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Original strand, 54679931 - 54680157
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  54679931 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 54680029  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| || |  ||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  54680030 atagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttga--ccattaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 54680125  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54680126 tgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 54680157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 318
Target Start/End: Original strand, 29121362 - 29121667
Alignment:
Q  15 cagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatc 114  Q
    |||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29121362 cagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccagtgccttcaaatc 29121461  T
Q  115 ctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctc 214  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||| |||||||  ||||||  |||||||     
T  29121462 ctttcaaa-atagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagt--tgcatcta 29121558  T
Q  215 c------tgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |      || |||  |  || ||||| | | |||  |||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  29121559 caacttctggtgatttttagattctgataaactt--gcttctgatgaactcgcttctgatgaacttgctactgatgacgccatcacttcaagagcacttt 29121656  T
Q  308 gacttcaggtg 318  Q
    | |||||||||    
T  29121657 gtcttcaggtg 29121667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Original strand, 23123533 - 23123672
Alignment:
Q  126 agtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaacta 225  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  23123533 agtcattgcttcactctttcagtcttctacaatacttagacgagattaaattcattgaacaatctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactt 23123632  T
Q  226 gagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctg 265  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23123633 cagcttctggtgatcttctgcttctgatgagatgcttctg 23123672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 6517475 - 6517714
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||  |||| ||| ||    
T  6517475 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatctcatgctttccaa 6517574  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||| |||| | ||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||||||  |||||||    
T  6517575 tccttccaaa-atagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaataacttttgaagctttaag--ttgcatc 6517671  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  6517672 tcctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctgatga 6517714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Original strand, 23750512 - 23750758
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttta-aagaacaagcctccaatgccttcaa 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| | || ||||||| || |||||||| ||    
T  23750512 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttg---acgcacttcataaaaacaagcatcaaatgcctttaa 23750608  T
Q  112 atcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagccttt-gaagttttaagtcttgca 210  Q
     | | ||  ||  |||||||||||||||||| |  ||||||| || || | || || |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  23750609 cttcatttgaag-cagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcagtgct-aggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgca 23750706  T
Q  211 tctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgctt 262  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  23750707 tctcctgatgaacttcagcttctggttatctttaacttctgatgagatgctt 23750758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Original strand, 15139329 - 15139510
Alignment:
Q  126 agtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac-t 224  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| |    
T  15139329 agtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaatctttaagtctatcatcttctgatgaactt 15139428  T
Q  225 agagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||  ||||||||    
T  15139429 ttagcttctggtgatcttcagcttctgacgaggtgcttctaatgaacttgcttccgaagacatcatcacttctagagcactt 15139510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 316
Target Start/End: Original strand, 55731836 - 55732069
Alignment:
Q  79 gctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatcc 178  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||   ||||||||| | ||||  ||||||||| || |||||    
T  55731836 gctctttgaagaataagcatccaat-ccttcaaatcctttcaaa-atagtcgttgatttacctctccagtcttttgcaattgttagacgagtttgaatcc 55731933  T
Q  179 attgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttc 278  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||| |  |  || ||||||||| ||||||||    
T  55731934 attaaacaacttttgaagttttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttccggtgattctcagcttctaaaaacttgtttctgatgaccttgcttc 55732031  T
Q  279 taatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    | ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  55732032 tgatggcatcatcacttcaggagcactttatcttcagg 55732069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 306
Target Start/End: Original strand, 22089733 - 22089869
Alignment:
Q  169 gattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatg 268  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| || || |||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  22089733 gattaaatcctttgaacaacctttgaagctt-aattctttcatcttctgatgatctttagcttctggtgatcttcaacttctgatgaggtacttctgatg 22089831  T
Q  269 aacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22089832 cacttgcttcgaatgacgttatcacttcaggagcactt 22089869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 168
Target Start/End: Original strand, 8105638 - 8105782
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8105638 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa 8105737  T
Q  123 cacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacga 168  Q
     | || |||||||||| | |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  8105738 -atagccgttgcttcaattttccagtcttctgcaatccttagacga 8105782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3105540 - 3105323
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| ||||| || | |||||| | ||  ||    
T  3105540 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataaccatccaatacttttcaa 3105441  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | || |||||    ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| || ||||| |  |||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  3105440 tcctttcaaa-atagccgttggaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatc 3105345  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctg 234  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  3105344 tcctgatgaactgcagcttctg 3105323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 16853493 - 16853602
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||    
T  16853493 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacagatgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgctttcaaa 16853592  T
Q  113 tcctttcaaa 122  Q
    ||| ||||||    
T  16853593 tcccttcaaa 16853602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 181
Target Start/End: Original strand, 16940026 - 16940172
Alignment:
Q  33 agtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgtt 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  16940026 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctccttgaagaataagcattcaatgcctttcaatcctttcaaa-atagtcgtt 16940124  T
Q  133 gcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccatt 181  Q
    |||  ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| || ||||||||    
T  16940125 gctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccatt 16940172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17398795 - 17398582
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||            
T  17398795 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 17398704  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
     ||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||| |  |||| | ||||||| ||||||  |||||||    
T  17398703 -cctttcaaa-atagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatc 17398609  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgat 239  Q
    |||||||||||   |||||||||||||    
T  17398608 tcctgatgaaccgcagcttctggtgat 17398582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 56533172 - 56533018
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  56533172 aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaaacatctaatgcattcaaatcctttcaaa 56533073  T
Q  123 cacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatcc 178  Q
     | || |||||||||| | || ||||||||| ||||  ||||||||| || |||||    
T  56533072 -atagccgttgcttcattttttcagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcc 56533018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 25651214 - 25651073
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||     
T  25651214 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactacgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaatccttccaaa- 25651116  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagac 166  Q
    | || |||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||    
T  25651115 atagccgttgcttcacttttcaagtcttctgcgatctttagac 25651073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 196
Target Start/End: Original strand, 11915720 - 11915871
Alignment:
Q  43 gtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactct 142  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||    
T  11915720 gtggttgtacactttgtacaattgtccttttccaacgctcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaa-atagtcgttgcttcactct 11915818  T
Q  143 tccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaag 196  Q
    |  |||||||| |||||  | | || |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  11915819 tttagtcttctgcaatg-atgggcgtgattaaatcatttgagcagcctttgaag 11915871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 14571243 - 14571300
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14571243 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 14571300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 308
Target Start/End: Original strand, 22191057 - 22191106
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22191057 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttg 22191106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 22190836 - 22190928
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  22190836 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaatcagcatccaatgc 22190928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 316
Target Start/End: Original strand, 40860841 - 40860949
Alignment:
Q  209 catctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaga-tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  40860841 catctcctgatgaactgtagcttctggtgatacacaacttctgatgaacctgcttatgatgaactagcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 40860940  T
Q  308 gacttcagg 316  Q
    | |||||||    
T  40860941 gtcttcagg 40860949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Original strand, 38513868 - 38513946
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaa 91  Q
    |||||||| | |||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  38513868 agcagagacaaaaacagagtagtgaaagtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaa 38513946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3499541 - 3499481
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcaggtg 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  3499541 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcagaagcactttgtcttcaggtg 3499481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Original strand, 8105889 - 8105945
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8105889 cttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 8105945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 40860657 - 40860749
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  40860657 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacatcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40860749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17398576 - 17398529
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17398576 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactt 17398529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 305
Target Start/End: Original strand, 6517704 - 6517750
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcact 305  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  6517704 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcact 6517750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9751441 - 9751383
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaactt-gcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9751441 gcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcataagcactttgtcttcagg 9751383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 56034792 - 56034850
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  56034792 tgcttctgatgaacttgcttctgattacgtcatcacttcagaagcacttttacttcagg 56034850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 413221 - 413278
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  413221 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcactacttcatgaacactttgtcttcagg 413278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3105329 - 3105272
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  3105329 gcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcaccttgtcttcagg 3105272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14904212 - 14904155
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  14904212 gcttctgatgaacttgcttctgaagacgtcatcacttcaatagcactttgtcttcagg 14904155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 16940196 - 16940253
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16940196 gcttctgataaacttgcttctgattacgtcatcacttcaagagcactttaacttcagg 16940253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 20977648 - 20977705
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  20977648 gcttctggtgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcagg 20977705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 9751661 - 9751569
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  9751661 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtgcaaacatactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgc 9751569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17700736 - 17700631
Alignment:
Q  210 atctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||| |||  |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  17700736 atcttctgatgatctgcagcttctggtgaactt--gcttctgatgaacttgcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcactttagaagcactttg 17700639  T
Q  309 acttcagg 316  Q
     |||||||    
T  17700638 tcttcagg 17700631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 20977447 - 20977539
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| || | ||| |||| ||||||||    
T  20977447 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 20977539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 3499745 - 3499682
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||  ||| |||||||    
T  3499745 tagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctcattgaagaaatagcatccaatg 3499682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8685548 - 8685509
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgta 68  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8685548 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgta 8685509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Original strand, 17540396 - 17540455
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 83  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  17540396 aaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactct 17540455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 306
Target Start/End: Original strand, 55380494 - 55380541
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  55380494 gcttctgatgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 55380541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15475044 - 15474986
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaactt-gcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15475044 gcttttgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcataagcactttgtcttcagg 15474986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 307
Target Start/End: Original strand, 9141095 - 9141144
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9141095 tgcttctgaagaacttgcatctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 9141144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 17788152 - 17788067
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt-caacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| |||  |||||| |||| || |||||||| ||||    
T  17788152 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattgtcctttttccaacgttctccaaagaataagcatctaatgcctttaaat 17788067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 85
Target Start/End: Original strand, 1672395 - 1672451
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt 85  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  1672395 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgttcttt 1672451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 85
Target Start/End: Original strand, 1674870 - 1674926
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt 85  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  1674870 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgttcttt 1674926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14154115 - 14154015
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaa-ttgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaa 111  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||| ||| | |||| |||||||| |||||    
T  14154115 agcagagacaaaaacagagtagtggagaaggtggttgtacacttcgtacaagttgtacaatatcaacgttctttgaagtataagcatccaatgctttcaa 14154016  T
Q  112 a 112  Q
    |    
T  14154015 a 14154015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27188558 - 27188502
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  27188558 gcttctggtgaacttgcttctgatgacgtcaacacttcagaagcactttgtcttcag 27188502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39419635 - 39419587
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  39419635 cttctgatgaactagcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 39419587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 39419855 - 39419787
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 81  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  39419855 agcagagacaaaaacagagtaatggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 39419787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 41114875 - 41114791
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaat 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||||  ||  || |||| ||||||||||||||||    
T  41114875 gagtggtggaaatagtggttgtacacgacgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaagcatccaatgccttcaaat 41114791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 316
Target Start/End: Original strand, 3486351 - 3486394
Alignment:
Q  273 tgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3486351 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 3486394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19620955 - 19620912
Alignment:
Q  273 tgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19620955 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggatcactttgacttcagg 19620912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 251
Target Start/End: Original strand, 3793289 - 3793348
Alignment:
Q  190 tttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctg 251  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||    
T  3793289 tttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctagtgattttcagcttctg 3793348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 19884922 - 19884980
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcac-ttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  19884922 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcgccactttcaagagcactttgtcttcagg 19884980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25651035 - 25650978
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| || ||||||  |||||||    
T  25651035 gcttctgatgaacttgcttatgatgatgtcatcacttcaggaacactttatcttcagg 25650978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27188748 - 27188667
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| || | ||| |||| ||||||||    
T  27188748 aaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 27188667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 112
Target Start/End: Original strand, 11901204 - 11901276
Alignment:
Q  40 atagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||  | |||| |||| |||||||||||||||    
T  11901204 atagtgattgtacacttcgtacaattgtccttttctaacgttctccagagaataagcatccaatgccttcaaa 11901276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14153912 - 14153884
Alignment:
Q  227 agcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14153912 agcttctggtgatcttcagcttctgatga 14153884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15475248 - 15475192
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt 85  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  15475248 gagtagtggaagtattggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgctcttt 15475192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Original strand, 33378444 - 33378488
Alignment:
Q  64 ttgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgcctt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  33378444 ttgtactttgtcaactctctttgaaggacaagcatccaatgcctt 33378488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5805 - 5505
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  5805 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgccttcata 5706  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||  |||||| |||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  5705 tcctttcaaa-atagatgttgctccactcttccaatcttctacaatacttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatc 5607  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5606 tcctgatgaacttcagcttcaggtgatctt--gcttctagtgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttactt 5509  T
Q  313 cagg 316  Q
    ||||    
T  5508 cagg 5505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26087 - 25798
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26087 agagacacaaactgagtagtcgagatagtggttgtacacttcatacaattgtactatgtcaaccctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 25988  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcc 215  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25987 tttcaaa-atagtcgttgcttcacttttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcc 25889  T
Q  216 tgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25888 tgatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgtttttcatgaacgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 25798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 44782 - 44652
Alignment:
Q  50 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtc 149  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||    
T  44782 tacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaa-atagacgttgcttcacttttccagtc 44684  T
Q  150 ttctacaatgtttagacgagattaaatccatt 181  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44683 ttctacaatacttagacgagattaaatccatt 44652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 4)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 270
Target Start/End: Original strand, 49328 - 49584
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  49328 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 49427  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||    
T  49428 tcctttcaaa-atagtagttgcttcactcttcaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagctttaagacttgcatc 49526  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaa 270  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49527 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaa 49584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 32481 - 32722
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  32481 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcattcaaa 32580  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32581 tcctttcaaa-atagtcgttacttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatc 32679  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||| |  || |||||||||| ||||||||||||    
T  32680 tcctgatgaactacaagttgtggtgatctttagcttctgatga 32722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 449 - 182
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  449 aaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 351  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagc-ctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaa 222  Q
      || ||||||| |  |  |  ||||||   |  | |||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||  |||| |  |||||||| ||||||||    
T  350 ttagccgttgctactttactttagtctttcgctctctttagacgagtttgaatccattaaacagctatttgaaactttagg--ttgcatcttctgatgaa 253  T
Q  223 ctagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatca 292  Q
     || || |||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  252 gtacagtttctggtgatatacagcttctgatagacttgcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatca 182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 307
Target Start/End: Original strand, 32712 - 32760
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32712 gcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 32760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 212361 - 212651
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||     
T  212361 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatccttttaaaa 212460  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  212461 atagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctgatgaag 212560  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  212561 tttagcttctgatgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttgacttcagg 212651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6250 - 6025
Alignment:
Q  76 aacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaa 175  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  6250 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaa 6152  T
Q  176 tccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgc 275  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||     ||||||||| |||||| |||    
T  6151 tctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttct-----gatgcttcttatgaacctgc 6057  T
Q  276 ttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||| ||||| | ||||||||| |||||||||    
T  6056 ttctgatgactttatcacttcaggagcacttt 6025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 246133 - 246076
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  246133 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 246076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36890 - 36599
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36890 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 36791  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  36790 tcctttcaaatt-agtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatc 36692  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcact 305  Q
    || |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  36691 tcttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 36599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Original strand, 42115 - 42406
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42115 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 42214  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  42215 tcctttcaaatt-agtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatc 42313  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcact 305  Q
    || |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  42314 tcttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 42406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21086 - 20784
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  21086 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttggtcgacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 20987  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||||||||   |  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20986 tcctttcaaaatgac-cgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 20888  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    || |||||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  20887 tcttgatgaacttcaacttttggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcaggagcactattactt 20788  T
Q  313 cagg 316  Q
    ||||    
T  20787 cagg 20784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 5)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Original strand, 60012 - 60303
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  60012 agcagagacacaaactgagtagaagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 60111  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  60112 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaattcttggacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 60210  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  60211 ttctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttcttatgagatgcttctaatgaacttgcatctgatgacgtcatcacatcaggagcacttt 60303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 7922 - 8161
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  7922 agcagagacacaaacttcgtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgaattcaaa 8021  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  8022 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcacttttacagtcttctacaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagttttgcatc 8120  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||    
T  8121 tcctgatgaactttagcttctggttatctt--gcttctgatga 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 205 - 316
Target Start/End: Original strand, 115708 - 115817
Alignment:
Q  205 cttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcac 304  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  115708 cttgcatctcctgatgaacatcagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcac 115805  T
Q  305 tttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||    
T  115806 tttgacttcagg 115817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 151788 - 151714
Alignment:
Q  229 cttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcact 305  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  151788 cttctggtgatctt--gcttctcatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 151714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 307
Target Start/End: Original strand, 8148 - 8184
Alignment:
Q  271 cttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8148 cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 8184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 297
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22956
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  22672 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcatacaattgtactttgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 22771  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22772 tcctttcaaa-atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 22870  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttca 297  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22871 tcctgatgaactacagcctctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctggtggacttgattctgatgacgtcatcacttca 22956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19584 - 19288
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  19584 agagacacaaactgagtagtgaatatagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcttttaaatcc 19485  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcc 215  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19484 tttcaaa-atagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaattcttaggcgaaattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcc 19386  T
Q  216 tgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19385 tcatgaactacaacttctggtgatctt--gcttcttatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgttatcacttcaggagcac-ttgacttcag 19289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 99320 - 99065
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  || |||| ||||| |||| |||||||||||  ||    
T  99320 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtca--gcgctttgaagaataagcatccaatgccttgtaa 99223  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||| |||| | ||||||||||  ||| |||| ||| ||| |||  |||||||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||  |||||      
T  99222 tccttccaaa-atagtcgttgctatacttttccggtcatctgcaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcact 99127  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaactt 273  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  99126 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaactt 99065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 285
Target Start/End: Original strand, 14644 - 14913
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  14644 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 14743  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  14744 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatt 14842  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    |||| ||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||    
T  14843 tcctaatgatttttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctaatgaactagcttctgatgac 14913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 255
Target Start/End: Original strand, 7708 - 7940
Alignment:
Q  22 acaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaa 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||||| |||||||| |||    
T  7708 acaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatacaatgcctttaaatccttccaa 7807  T
Q  122 acacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatga 221  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7808 a-atagtcgtggcttcactcttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 7906  T
Q  222 actagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7907 aatagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 7940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 7930 - 7987
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||    
T  7930 gcttctgatgaacttgcttttaatgacgtcaccacctcgggagcactttgtcttcagg 7987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Original strand, 1686 - 2001
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  1686 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 1785  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  1786 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactcctccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatt 1884  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat---------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttca 297  Q
    |||| ||||  |  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||               ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1885 tcctaatgatttttagcttctagtgatctt--gcttctgatgagatgtttctaatgaactagcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttca 1982  T
Q  298 tgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1983 tgagcactttgacttcagg 2001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 828 - 610
Alignment:
Q  86 aaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaac 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  828 aaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atagtcagtgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaac 730  T
Q  186 agcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  729 agtctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 632  T
Q  286 gtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  631 gtcatcacttcaggagcacttt 610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 215601 - 215311
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  215601 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 215503  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | || |||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  215502 atagccgttgcttcacttttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatctcctgataaac 215405  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |  ||||||||||||| ||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  215404 tgcagcttctggtgattttcggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtctccacttcatgagcactttggcttcagg 215311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10220 - 9981
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10220 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaaaaacaagcatccaatgccttcaaatcc 10121  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcatctc 214  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  10120 tttcaaa-atagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaaagcttagatgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctc 10022  T
Q  215 ctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10021 ctgatgaacttcagcttctggtgattttcagtttctgatga 9981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14884 - 14816
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 84  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14884 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 14816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 47 - 315
Target Start/End: Original strand, 9825 - 10090
Alignment:
Q  47 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttcca 146  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||       
T  9825 ttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagcacaagcatccaatgctttcaagtcctttcaaa-atagtcgttacttcactcttttg 9923  T
Q  147 gtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagc 246  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||    
T  9924 gtcttctataatgcttagacgagattaaatccattaaacaaaccttgaagctttaaatcttgcatctccagatgaacttcagcttctggtgatctt--gc 10021  T
Q  247 ttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10022 ttatgatgagatgcttctgattaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcag 10090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 19027 - 19266
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||    
T  19027 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaa 19126  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  19127 tccttccaaa-atagccgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaacagcctttcaagctttaagtcttgtatc 19225  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat 253  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19226 acctgatgaaatagagcttctggtgatcttcaacttctgat 19266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22246 - 21976
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||    
T  22246 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctcattgaagaataagcatccaatgccttccaa 22147  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||| |||||| | ||||||||||  |||  ||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| || |||| | ||||||  ||||||  |||||||    
T  22146 tcc-ttcaaagatagtcgttgctatacttctccagtcttctgcaatctttagacgagttttaatcctttaaacaacttttgaacctttaag--ttgcatc 22050  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    | || |||||||| | |||||||||||   |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22049 ttctaatgaactacaacttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 21976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 9567 - 9841
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||  |||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||     
T  9567 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagtcgtactatgtcaacgctgtttgtagaataagcatccaatgcccttcaatcctttcaaa- 9665  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||||||||||  ||| | |||||||||| ||||  |||||| || || ||||| |  |||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  9666 atagtcgttgctatactttcccagtcttctgcaat-cttagacaagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 9762  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |  |||||||||||||   ||              |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9763 tgcagcttctggtgattcaca--------------gcttatgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcatgagcactttgtcttcagg 9841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21975 - 21930
Alignment:
Q  271 cttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  21975 cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggtgcactttgtcttcagg 21930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 15116 - 15352
Alignment:
Q  16 agagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcc 115  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  15116 agagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcc 15215  T
Q  116 tttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcc 215  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15216 tttcaaa-atagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 15314  T
Q  216 tgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    | ||| |||  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  15315 ttatgcacttcatcttctggtgatctt--gcttctgatga 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Original strand, 15328 - 15383
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  15328 cttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac-ttgacttcagg 15383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27544 - 27259
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||    
T  27544 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatggtactttgtcaacgctctttgaagagcaagcatccaatgccttcgaa 27445  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||| ||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27444 tcctatcaaa-atagctgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 27346  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgactt 312  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||                |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  27345 tcctgatgaacttcagcatctggtgatct----------------tgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgcctt 27262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 1656 - 1895
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||    
T  1656 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcctacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 1755  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1756 tcctttcaaa-atagtcgttgtttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 1854  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1855 tcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatga 1895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 303
Target Start/End: Original strand, 1870 - 1914
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagca 303  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1870 gcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagca 1914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Original strand, 103585 - 103821
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtc 129  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| | || |    
T  103585 agtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttaatatcatttcaaa-atagcc 103683  T
Q  130 gttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  103684 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacaaaattaaattcatttaacaacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 103783  T
Q  230 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    ||||||||  |||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  103784 ttctggtgtcctt--gcttctgatgagatacttctgatga 103821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 90170 - 89931
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  90170 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtaggggttgtacacttcgtacacttgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 90071  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||  |||||||    
T  90070 tcctttcaaa-atagccgttggttcactcttccagtcttctgtaatacttagacgagattaaatacattgatcaacctttgaagctttaag--ttgcatc 89974  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  89973 tcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 89931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 89941 - 89884
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  89941 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcagg 89884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 9965 - 10241
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||    
T  9965 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtgaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 10064  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10065 tcctttcaaa-atagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatc 10163  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||||  | ||||| |||||||                |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10164 tcctgatgaacttcaacttcttgtgatct----------------tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 10241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 307
Target Start/End: Original strand, 30283 - 30508
Alignment:
Q  76 aacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaa 175  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  30283 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaa 30381  T
Q  176 tccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgc 275  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||     ||||||||| |||||| |||    
T  30382 tctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttct-----gatgcttcttatgaacctgc 30476  T
Q  276 ttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||| ||||| | ||||||||| |||||||||    
T  30477 ttctgatgactttatcacttcaggagcacttt 30508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Original strand, 9899 - 10151
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  9899 agcagagacacaaacatagtagtggaggtagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 9998  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | | ||  ||   |||||||| | ||||||||   |||||| |||||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |  ||||    
T  9999 ttcatttgaa-ttagtcgttgttgcactcttctgatcttctgcaatg-ctagacgtgattaaatccttagaacagcctttgaagctttaagtttctcatc 10096  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  10097 ttctgatgaacttcagcttctggtgatatt--gcttctaatgaggtgcttctgatga 10151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 255
Target Start/End: Original strand, 143129 - 143325
Alignment:
Q  58 gtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaa 157  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  143129 gtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatccttccaaa-atagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaa 143227  T
Q  158 tgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  143228 tgctttgacgagattaaatccattgaatagcctttcaagctttgagtcttgcatctcgtgatgaaatagagcttctagtgatcttcagcttctgatga 143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 308
Target Start/End: Original strand, 143315 - 143364
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  143315 gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcagcacttcaggagcactttg 143364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Original strand, 13567 - 13741
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  13567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 13666  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagc 188  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13667 tcctttcaaa-atagttgttgcttcactattccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagc 13741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 307
Target Start/End: Original strand, 13850 - 13899
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  13850 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacatcattacttcaggagcacttt 13899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 7)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 255
Target Start/End: Original strand, 39488 - 39662
Alignment:
Q  80 ctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatcca 179  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||||||||||||||    
T  39488 ctctttaaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaatt-agttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatcca 39586  T
Q  180 ttgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39587 ttgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 39662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 255
Target Start/End: Original strand, 137548 - 137722
Alignment:
Q  80 ctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatcca 179  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||||||||||||||    
T  137548 ctctttaaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaatt-agttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatcca 137646  T
Q  180 ttgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  137647 ttgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 137722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Original strand, 159051 - 159356
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  159051 agcagagacacaaacaaagtagtagaggtagtggttttacacttcatacaattgtcctttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatataatgccttcaaa 159150  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    | | ||  ||   || ||||||||||||||||   |||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||  ||||    
T  159151 ttcatttgaa-ttagccgttgcttcactcttctgatcttttgcaatg-ttagacgtgattaaatcctttgaacatcctttgaagctctaagtctctcatc 159248  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtga---------tctt------cagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttca 297  Q
    |  |||||  ||  |||||||| |||         ||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  159249 ttttgatggtcttcagcttctgatgaaaaactgcttcttgtgatgttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttca 159348  T
Q  298 tgagcact 305  Q
     |||||||    
T  159349 ggagcact 159356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Original strand, 37414 - 37463
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaac 78  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37414 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 37463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 39652 - 39709
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  39652 gcttctgatgaacttgcttctgatgtcgttatgacttcaagagcactttgacttcagg 39709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Original strand, 135474 - 135523
Alignment:
Q  29 gagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaac 78  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  135474 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 135523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 137712 - 137769
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  137712 gcttctgatgaacttgcttctgatgtcgttatgacttcaagagcactttgacttcagg 137769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 317 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 19491 - 19324
Alignment:
Q  317 tgtcacgacccaatttcaggtcatgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttaca 416  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  19491 tgtcacgacccaatttcaggccatgaccggcgcacaggctaacactaa----ctcatgatatatttagcctgacaagcctaataaactataacacttgca 19396  T
Q  417 cctttctaaactactaaaattttggtaatgactcacaagctttcacgacatttcaagatacaagtttattat 488  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19395 cgtttctaaaatactgaaattttggtaatgactcacaaaatttcaggacatttcaaaatacaagtttattat 19324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6866 - 6593
Alignment:
Q  2 tcttgtgtaggagcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctcca 101  Q
    |||||||| | |||||||| | |||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  6866 tcttgtgttgtagcagagacaaaaatagagtactggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaagcatcca 6767  T
Q  102 atgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagtttta 201  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  6766 atgccttcaaatcttttcaaa-atagtcggtgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacaagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttta 6668  T
Q  202 agtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgctt 277  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||    
T  6667 ag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaactagctt 6593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6591 - 6539
Alignment:
Q  264 tgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  6591 tgatgaacttgctcctgatgacgtcatcacttcaggagcattttgtcttcagg 6539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 15779 - 16077
Alignment:
Q  3 cttgtgtaggagcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaatt-gtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctcca 101  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15779 cttgtctagtagcagagacacaaactgagtagtagagatggtggttgtacacttcgtacaatttgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcca 15878  T
Q  102 atgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaac-agcctttgaagtttt 200  Q
    |||||||||| |||||||||| | | | | |||||||||| ||  ||||| | ||||  || ||||||||| |||||||||||| | | ||||||| |||    
T  15879 atgccttcaagtcctttcaaa-ataattggtgcttcactcctctggtcttttgcaattcttggacgagattgaatccattgaacaatcttttgaagcttt 15977  T
Q  201 aagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||                 ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15978 aagtcttgcatctcctgatgaa-----------------ctttagcttctgatgagatggttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcatga 16060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 78453 - 78242
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  78453 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa-atagtcgttgcttcact 78355  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 240  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||  | || ||| ||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  78354 tttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgataaatagcttttgaagctttaag--ctgcatctcatgatgaactacagcttctggtgatt 78257  T
Q  241 ttcagcttctgatga 255  Q
     |||| |||||||||    
T  78256 ctcagattctgatga 78242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 78250 - 78195
Alignment:
Q  261 ttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  78250 ttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 78195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 759 - 562
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  759 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa- 661  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||  |||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  660 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccatcaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 1859 - 1778
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  1859 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 1778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 557 - 501
Alignment:
Q  260 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  557 cttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcagg 501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1751 - 1658
Alignment:
Q  142 ttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga 238  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||| || ||||| |  |||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1751 ttccagtcttctgcaatgtt-aggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgtagcttctggtga 1658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Original strand, 9952 - 10243
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  9952 agcagcgacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcgaatgccttcaaa 10051  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcc-tttgaagttttaagtcttgcat 211  Q
    | | ||  ||   || |||||||||||||||   ||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||    
T  10052 ttcatttgaa-ttagccgttgcttcactcttatggtcttctgcaatg-ctaggcgtgattaaatccattgaacagccatttgaagctttaagtctcttat 10149  T
Q  212 ctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    || ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10150 cttctgatgaacttcagcttctggtgaactttagcttcttatatggtgc-tctgatgaacttg-atctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 10243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7260 - 6970
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| | ||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||     
T  7260 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgttgtttgaagaataagcatccaatgctttccaatccttccaaa- 7162  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||||||||||  ||| |||||||||||| |||| || ||||| | || ||||| |  |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  7161 atagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatcttcagacgggtttgaatccttcaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 7064  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    || |||||||||||||   |||||||||||| |  |||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7063 tacagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgataacattgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 6970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Original strand, 60810 - 61036
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||     
T  60810 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttccaatccttccaaa- 60908  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | || |||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  60909 atagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttaaatcctttaaacaacttttgaagttttaag--ttgcatctcctgatgaac 61006  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttcagcttctgat 253  Q
    || | |||||||||||  ||| ||||||||    
T  61007 tacaacttctggtgattctcaacttctgat 61036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 308
Target Start/End: Original strand, 61038 - 61077
Alignment:
Q  269 aacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  61038 aacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 61077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4988 - 4816
Alignment:
Q  134 cttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttct 233  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||| |    
T  4988 cttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaattaaaactttt 4889  T
Q  234 ggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4888 ggtgatctccagcttctaataagatgcttttgatgaacttgcttttgatgacgttatcacttcaggagcactt 4816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 285
Target Start/End: Original strand, 3300 - 3570
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  3300 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaa 3399  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||| |||| | || ||||| |  ||| ||||| |||||| |||| |||||||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  3400 tccttccaaa-atagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatc 3496  T
Q  213 tcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3497 tcctgatgaactatagcttctggtgattttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 3570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5717 - 5418
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||    
T  5717 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatataaatgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgccttcaaa 5618  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||| | ||||||  |||||   |||||||    
T  5617 tcctttcaaa-atagttgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaatctttaa--attgcatc 5521  T
Q  213 tcctgatgaac--tag-agcttctggtgatcttcagcttctgat-gagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttg 308  Q
    | |||||||||   || |||||||||||||  ||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5520 ttctgatgaacagcagcagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaccttgcttc---tgatgtcatcacttcaggagcactttg 5424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 5)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 36281 - 36002
Alignment:
Q  31 gtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcg 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||  || ||| |||| ||||||||||| ||| || ||  || | ||| |    
T  36281 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccattttcaactctctccaacgaaaaagcatccaatgcctttaaaaccatttgaa-atagttg 36183  T
Q  131 ttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagct 230  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || || | |  ||  | ||||||| ||  ||||    
T  36182 ttgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaaatcaattgaacaacctttgaagcttcaattttctcagattctgatgatcttcagct 36084  T
Q  231 tctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    | ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36083 tatggtgatgtt--gcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagca-tttgacttcag 36002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25599 - 25488
Alignment:
Q  206 ttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga-gatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcac 304  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25599 ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttctgatgaagttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac 25500  T
Q  305 tttgacttcagg 316  Q
    |||| |||||||    
T  25499 tttgtcttcagg 25488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34699 - 34642
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  34699 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 34642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 34919 - 34827
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  34919 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 34827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 25769 - 25688
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||    
T  25769 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctttttgaagaataagcatccaatgc 25688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1786 - 1606
Alignment:
Q  41 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcact 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1786 tagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcatccagtgccttcaaatcctttcaaa-atagtcgttgcttcact 1688  T
Q  141 cttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaact 224  Q
     ||| |||||||| |||| |||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  1687 tttcaagtcttctgcaatatttaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttgcatctcctgatgaact 1606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 497 - 441
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcag 315  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||    
T  497 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttaaggagcactttgtcttcag 441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Original strand, 9168 - 9387
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtc 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||||    
T  9168 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaatccttccaaa-atagtc 9266  T
Q  130 gttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 229  Q
    ||||||  ||| ||||| |||||| |||| ||| || ||| || ||||| || |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |    
T  9267 gttgctatacttttccaatcttctgcaatcttt-gatgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaac 9363  T
Q  230 ttctggtgatcttcagcttctgat 253  Q
    ||||||||||  ||||||||||||    
T  9364 ttctggtgattctcagcttctgat 9387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 6003 - 6212
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  6003 agcagagacacaaatagagtagtagaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 6102  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatc 212  Q
    ||||||  ||   ||| ||||||||  |||||  ||||||| |||||  ||| || |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||  ||||    
T  6103 tccttttgaa-ttagttgttgcttcggtcttctggtcttctgcaatg-ctaggcgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagctttaaatctctcatc 6200  T
Q  213 tcctgatgaact 224  Q
    | ||||||||||    
T  6201 ttctgatgaact 6212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 6230 - 6287
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6230 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggaacac-ttgacttcagg 6287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 44023 - 43719
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||  ||     
T  44023 aaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaatgtcctttttcaacgctcttcaaggaacaggcatccaatgccttcaaatctttttgaat 43924  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtct----------------- 206  Q
      || | ||||||||||||||   |||||| ||||||| || || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||                     
T  43923 t-agcctttgcttcactcttctgatcttctgcaatgtt-aggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagttttaagtctctcatcttctgatgatc 43826  T
Q  207 tgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    | ||||||||||||||  |  |||||||||||| ||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43825 ttcatctcctgatgaaaaactgcttctggtgatgtt--gcttctgattaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactt 43728  T
Q  307 tgacttcag 315  Q
      |||||||    
T  43727 gaacttcag 43719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 199 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13462 - 13357
Alignment:
Q  199 ttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcat 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||     
T  13462 ttaagtcttgcatctc-tgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacatgcttttaatgacatcatcacttcag 13364  T
Q  299 gagcact 305  Q
    |||||||    
T  13363 gagcact 13357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5935 - 5813
Alignment:
Q  134 cttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagccttt-gaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttc 232  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  5935 cttcactcttatggtcttctgcaatgcttaaacgagatgaaatccattgaacatccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttc 5836  T
Q  233 tggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  5835 tggtgatctttagcttctgatga 5813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 144530 - 144350
Alignment:
Q  71 ttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgaga 170  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| || |||||||     
T  144530 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaa-acagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctt-agacgagt 144433  T
Q  171 ttaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    || ||||| |  || ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||    
T  144432 ttgaatccttgaaatagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatga 144350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 165050 - 164952
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  165050 aaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 164952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 65485 - 65305
Alignment:
Q  71 ttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgaga 170  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||| | ||||||| ||  ||| |||||||||||| |||| || |||||||     
T  65485 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaa-atagtcgtttctatacttttccagtcttctgcaatctt-agacgagt 65388  T
Q  171 ttaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 255  Q
    || ||||| |  || ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||    
T  65387 ttgaatccttgaaatagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatga 65305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 198 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9337 - 9252
Alignment:
Q  198 tttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9337 tttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgagatgcttctgatgaactttcttctgatgac 9252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9251 - 9208
Alignment:
Q  271 cttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttca 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9251 cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttca 9208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1619 - 1455
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtc 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||||||  || | ||||    
T  1619 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttccaacgttcttcaaagaataaacgtccaatgccttcaaatccttttgaa-atagtc 1521  T
Q  130 gttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaag 196  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||||  | | || |||||||||  ||||||| |||||||||    
T  1520 gttgcttcactcctatagtcttctgcaatg-atgggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaag 1455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 2090 - 2027
Alignment:
Q  33 agtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagc 96  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2090 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagc 2027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 284
Target Start/End: Original strand, 5634 - 5895
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||| | ||  ||     
T  5634 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-ttttccaacgttctccaaagaataagcatccaatgccttcaaattcatttgaa- 5731  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 223  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||  ||| |  ||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||| || || ||||||| |    
T  5732 atagtcgttgcttcattcttctagtcttctggaatg-ataggcatgattaaaacatttgaacagcctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatc 5830  T
Q  224 tagagcttctggtgatcttc--agcttctgatgagat--gcttctgatgaacttgcttctaatga 284  Q
    |  | || ||| ||||||||  ||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5831 ttcaactcctgatgatcttcagagcttctgatgatgtcagcttctggtgaacttgcttctgatga 5895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 239
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8150
Alignment:
Q  48 tgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccag 147  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| || |||||  |  |||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||    
T  7963 tgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcgaatgcaattcaatcctttcaaa-atagtcgttgctatacttttccag 8061  T
Q  148 tcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgat 239  Q
    |||||| ||||  ||||||||| || ||||| |  |||||| ||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  8062 tcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttacatcttctgatgaactgcagcttctggtgat 8150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 263 - 316
Target Start/End: Original strand, 97 - 150
Alignment:
Q  263 ctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  97 ctgatgtacgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 316
Target Start/End: Original strand, 8170 - 8213
Alignment:
Q  273 tgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8170 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 8213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15726 - 15627
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15726 aaacagagtagtggagatagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaatgctctttgaaagataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaac 15627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15489 - 15455
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatca 292  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15489 tgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca 15455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Original strand, 1324 - 1410
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttca 110  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| || ||||||||||    
T  1324 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttca 1410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 87 - 1
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttca 110  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| || ||||||||||    
T  87 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 38189 - 38091
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38189 aaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacggacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 38091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38009 - 37935
Alignment:
Q  206 ttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagat-gcttctgatgaacttgcttct 279  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||    
T  38009 ttgcatctcctgatgaactatagtttctggtgatatacagcttccgatgaaatagcttctgatagacttgcttct 37935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 60799 - 60729
Alignment:
Q  199 ttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 269  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  60799 ttaagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttgtggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatga 60729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Original strand, 74577 - 74682
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  74577 agcagagatacaaacaaagtagtagaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaatgcttttcaaagagcaagcatctaattccttcaaa 74676  T
Q  113 tccttt 118  Q
    ||||||    
T  74677 tccttt 74682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 277
Target Start/End: Original strand, 74718 - 74824
Alignment:
Q  169 gattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatg 268  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||  || || |||||||  |  ||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||| |||||    
T  74718 gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctcacagcttctgatgatgttcagcttctggtgatgtt--gtttctgatgaggtgcttatgatg 74815  T
Q  269 aacttgctt 277  Q
    |||||||||    
T  74816 aacttgctt 74824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 307
Target Start/End: Original strand, 74820 - 74869
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcacttt 307  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  74820 tgcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcaacacttcaggagcacttt 74869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0608 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0608
Description:

Target: scaffold0608; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5380 - 5267
Alignment:
Q  336 gtcatgaccggcgcacaggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttacacctttctaaactactaaaa 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||| | || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || | |||    
T  5380 gtcatgaccggcgtacaggctaacac----aaactcatgaaaaatatagtctagcaagcctaggaaactataacacttacacctttccaaaataatgaaa 5285  T
Q  436 ttttggtaatgactcaca 453  Q
    |||| |||||||||||||    
T  5284 tttttgtaatgactcaca 5267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1895 - 1803
Alignment:
Q  30 agtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaa 122  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1895 agtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtatagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 17880 - 17785
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgcctt 108  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||    
T  17880 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgcctt 17785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17661 - 17604
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  17661 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggatcactttgtcttcagg 17604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 25514 - 25393
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||| ||   ||||||||| |  ||    
T  25514 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataactatccaatgcccttcaa 25415  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgct 135  Q
    |||||||||| | ||||||||||    
T  25414 tcctttcaaa-atagtcgttgct 25393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23549 - 23439
Alignment:
Q  142 ttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatct 241  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||| || ||||| |  |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||      
T  23549 ttccagtcttctgcaatctt-agacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattc 23453  T
Q  242 tcagcttctgatga 255  Q
     |||||||||||||    
T  23452 acagcttctgatga 23439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23449 - 23392
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23449 gcttctgatgaacttgcttttgatgacgttatcacttcaggagcactttgtcttcagg 23392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 2845 - 2702
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||| | || |||||||| ||| ||    
T  2845 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaatacgcatccaatgctttccaa 2746  T
Q  113 tcctttcaaacacagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaat 158  Q
     |||| |||| | |||||||||   ||| |||||||||||| ||||    
T  2745 -ccttccaaa-atagtcgttgcaatacttttccagtcttctgcaat 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 221
Target Start/End: Original strand, 40644 - 40839
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaac 123  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | | ||  |||||||||||| ||||  ||     
T  40644 aaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcttacaattgttctttttcaacgctcttcaaagaaccaccatcatatgccttcaaattcttttgaa- 40742  T
Q  124 acagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatga 221  Q
      || ||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||  | |||||||||  ||||||||||||||||| || || |||  ||||| |||||||    
T  40743 ttagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ctaggtgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagcttcaattctctcatcttctgatga 40839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 316
Target Start/End: Original strand, 8511 - 8565
Alignment:
Q  262 tctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8511 tctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagg 8565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 85
Target Start/End: Original strand, 7388 - 7449
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt 85  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7388 aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctcttt 7449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 296
Target Start/End: Original strand, 7561 - 7649
Alignment:
Q  209 catctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttc 296  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||    ||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||    
T  7561 catctcttgatgaactaaagcttctggtgatacatagcttctgatgaacttgcttctgatgaactaacttctgataacgtcattacttc 7649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2598 - 2551
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2598 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 2551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 2806 - 2738
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 81  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  2806 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgct 2738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 925 - 846
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaat 103  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  925 aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaat 846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 716 - 681
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcact 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  716 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcact 681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 87715 - 87637
Alignment:
Q  13 agcagagaaacaaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaa 91  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||    
T  87715 agcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacagacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 87637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 87483 - 87425
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  87483 tgcttatgatgaactagcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcagg 87425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 937 - 995
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  937 tgcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcagg 995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 731 - 812
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcctccaatgc 105  Q
    |||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| || | ||| |||| ||||||||    
T  731 aaacagagtagtgcagatagtgattgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Original strand, 35442 - 35499
Alignment:
Q  259 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  35442 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcagg 35499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 11615 - 11673
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  11615 tgcttctgatgaactagcttctgatgacgtcattacttcagaagcactttgtcttcagg 11673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3999 - 3938
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt 85  Q
    |||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3999 aaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagatgtactttgtcaacgctcttt 3938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Original strand, 11975 - 12027
Alignment:
Q  264 tgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  11975 tgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcagg 12027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 426
Target Start/End: Original strand, 40785 - 40856
Alignment:
Q  352 aggctaacactaattaactcatgatatatttagcctagcaagcctaataaactataacacttacacctttctaaa 426  Q
    |||||||||||||   |||||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  40785 aggctaacactaa---actcatcataattttagcctaacaagcctaatacactataacacatacacccttctaaa 40856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1603 - 1521
Alignment:
Q  206 ttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga--gatgcttctgatgaac-ttgcttctaatgac 285  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1603 ttgcatcttctgatgaactatagcttctggtgatacacagcttctgatgaactttgcttctgatgaactttgcttctgatgac 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 297
Target Start/End: Original strand, 15286 - 15327
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaactt--gcttctaatgacgtcatcacttca 297  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15286 tgcttctgatgaacttctgcttctaatgacgtcatcacttca 15327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Original strand, 3204 - 3264
Alignment:
Q  258 tgcttctgatgaactt--gcttctaatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||    
T  3204 tgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttcaacttcagg 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 85
Target Start/End: Original strand, 7292 - 7353
Alignment:
Q  24 aaactgagtagtggatatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt 85  Q
    |||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  7292 aaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatatgtactttgtcaacactcttt 7353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University