View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14734_high_8 (Length: 320)

Name: NF14734_high_8
Description: NF14734
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14734_high_8
NF14734_high_8
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (18-310)||(7151899-7152187)
chr4 (112-308)||(6864265-6864461)
chr4 (151-308)||(7703739-7703896)
chr4 (151-308)||(36493513-36493670)
chr4 (111-308)||(19440432-19440629)
chr4 (113-305)||(25184346-25184538)
chr4 (151-310)||(25700880-25701039)
chr4 (113-308)||(34361277-34361473)
chr4 (113-308)||(35020817-35021016)
chr4 (152-308)||(1815531-1815687)
chr4 (152-308)||(33341628-33341784)
chr4 (151-303)||(55240929-55241081)
chr4 (151-308)||(28002810-28002967)
chr4 (151-308)||(30002465-30002622)
chr4 (155-308)||(34947923-34948076)
chr4 (151-308)||(39400238-39400395)
chr4 (151-308)||(46887982-46888139)
chr4 (151-308)||(47253970-47254127)
chr4 (111-308)||(32579676-32579873)
chr4 (152-308)||(37775888-37776044)
chr4 (152-308)||(50764950-50765106)
chr4 (152-308)||(55477716-55477872)
chr4 (113-308)||(33816302-33816497)
chr4 (151-308)||(37287958-37288116)
chr4 (151-308)||(23761301-23761458)
chr4 (152-308)||(879373-879529)
chr4 (151-303)||(32592319-32592471)
chr4 (113-308)||(32912365-32912561)
chr4 (154-308)||(37663568-37663722)
chr4 (113-308)||(49376197-49376392)
chr4 (151-308)||(50697471-50697629)
chr4 (113-306)||(4205216-4205409)
chr4 (152-308)||(4598212-4598368)
chr4 (111-308)||(19089237-19089434)
chr4 (151-308)||(3042849-3043006)
chr4 (151-308)||(29584024-29584181)
chr4 (153-302)||(9139465-9139612)
chr4 (151-308)||(17167943-17168100)
chr4 (151-308)||(17173520-17173677)
chr4 (151-308)||(17272194-17272351)
chr4 (152-308)||(27396846-27397000)
chr4 (151-276)||(35025391-35025515)
chr4 (151-267)||(23431826-23431942)
chr4 (151-297)||(46883938-46884080)
chr4 (112-308)||(5047751-5047947)
chr4 (152-305)||(26896320-26896474)
chr4 (151-308)||(42199959-42200117)
chr4 (151-231)||(38012569-38012649)
chr4 (155-308)||(4934040-4934183)
chr4 (223-308)||(38012084-38012169)
chr4 (234-297)||(56050171-56050234)
chr4 (262-308)||(35025531-35025577)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (113-308)||(29173728-29173922)
chr7 (151-308)||(37703297-37703454)
chr7 (151-308)||(9355625-9355782)
chr7 (152-308)||(18797532-18797688)
chr7 (153-308)||(17842385-17842540)
chr7 (151-308)||(31520540-31520697)
chr7 (151-308)||(37347226-37347383)
chr7 (152-308)||(32820853-32821009)
chr7 (151-306)||(10359013-10359168)
chr7 (153-308)||(37110079-37110234)
chr7 (109-308)||(6546724-6546923)
chr7 (109-308)||(15612516-15612715)
chr7 (110-308)||(24211946-24212145)
chr7 (157-308)||(44411345-44411496)
chr7 (170-308)||(37704387-37704525)
chr7 (151-308)||(31578863-31579020)
chr7 (114-308)||(32432657-32432851)
chr7 (116-308)||(23111397-23111589)
chr7 (112-308)||(35353313-35353509)
chr7 (151-281)||(22687463-22687593)
chr7 (154-308)||(30055732-30055886)
chr7 (151-308)||(8861490-8861647)
chr7 (151-308)||(26980511-26980668)
chr7 (151-308)||(41764877-41765034)
chr7 (152-308)||(48928097-48928253)
chr7 (182-308)||(12165948-12166074)
chr7 (151-289)||(26587891-26588029)
chr7 (151-308)||(43925306-43925457)
chr7 (151-308)||(46480928-46481085)
chr7 (158-305)||(27283952-27284100)
chr7 (151-308)||(5657279-5657437)
chr7 (129-308)||(10481810-10481989)
chr7 (151-308)||(15672558-15672718)
chr7 (153-308)||(12390450-12390605)
chr7 (151-300)||(34361975-34362126)
chr7 (113-308)||(4583124-4583319)
chr7 (170-308)||(11071411-11071546)
chr7 (152-308)||(25691344-25691500)
chr7 (151-296)||(7335010-7335155)
chr7 (151-308)||(21991841-21991989)
chr7 (151-308)||(32593006-32593162)
chr7 (112-225)||(38258867-38258980)
chr7 (151-308)||(44598871-44599028)
chr7 (207-308)||(33688117-33688218)
chr7 (223-308)||(38053666-38053751)
chr7 (223-308)||(43686245-43686330)
chr7 (246-308)||(38258750-38258812)
chr7 (262-308)||(48928474-48928520)
chr7 (152-187)||(12166215-12166250)
chr7 (194-270)||(27421207-27421283)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (113-308)||(32216281-32216476)
chr1 (112-308)||(2959974-2960170)
chr1 (153-308)||(16415872-16416027)
chr1 (113-308)||(48353768-48353963)
chr1 (151-308)||(37451511-37451668)
chr1 (111-308)||(7078816-7079013)
chr1 (113-308)||(10922953-10923148)
chr1 (113-308)||(14758258-14758453)
chr1 (151-308)||(47279415-47279572)
chr1 (152-308)||(3535149-3535305)
chr1 (108-308)||(8222354-8222554)
chr1 (111-308)||(34012135-34012332)
chr1 (153-308)||(27266995-27267150)
chr1 (153-308)||(27227280-27227435)
chr1 (152-306)||(30254651-30254805)
chr1 (151-308)||(11742161-11742318)
chr1 (151-308)||(15168322-15168479)
chr1 (110-308)||(27532734-27532931)
chr1 (151-308)||(28564576-28564733)
chr1 (107-308)||(46931635-46931837)
chr1 (151-308)||(3309379-3309537)
chr1 (153-307)||(27563700-27563854)
chr1 (113-308)||(32267260-32267455)
chr1 (151-308)||(238306-238463)
chr1 (152-308)||(23999573-23999730)
chr1 (151-308)||(28769879-28770036)
chr1 (151-305)||(27763103-27763258)
chr1 (108-308)||(47682244-47682444)
chr1 (153-308)||(19899563-19899719)
chr1 (152-308)||(38823440-38823596)
chr1 (151-308)||(51129085-51129240)
chr1 (151-308)||(9902847-9903004)
chr1 (152-308)||(25160858-25161015)
chr1 (153-308)||(4330507-4330662)
chr1 (113-308)||(15383159-15383355)
chr1 (152-303)||(39393615-39393766)
chr1 (151-289)||(1547516-1547654)
chr1 (109-308)||(22170937-22171136)
chr1 (167-308)||(1359744-1359885)
chr1 (153-305)||(21289829-21289981)
chr1 (153-308)||(10181802-10181958)
chr1 (111-308)||(15752255-15752452)
chr1 (153-308)||(41926383-41926537)
chr1 (158-308)||(30326751-30326902)
chr1 (186-308)||(37618729-37618851)
chr1 (151-297)||(31962853-31963000)
chr1 (151-288)||(31621341-31621479)
chr1 (152-308)||(42721265-42721418)
chr1 (169-308)||(40885039-40885178)
chr1 (172-308)||(18422877-18423006)
chr1 (113-308)||(33725366-33725550)
chr1 (113-207)||(48620916-48621010)
chr1 (221-308)||(38759759-38759846)
chr1 (256-308)||(48620854-48620906)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (151-310)||(1953792-1953951)
chr8 (113-308)||(16446641-16446836)
chr8 (151-307)||(12587812-12587968)
chr8 (113-305)||(43643361-43643553)
chr8 (155-308)||(466061-466214)
chr8 (151-308)||(23854235-23854392)
chr8 (113-305)||(1149398-1149590)
chr8 (153-308)||(4132492-4132647)
chr8 (108-308)||(35859163-35859363)
chr8 (151-308)||(7890761-7890918)
chr8 (151-308)||(27082642-27082799)
chr8 (151-308)||(37970323-37970480)
chr8 (152-308)||(11727253-11727409)
chr8 (152-308)||(34895191-34895347)
chr8 (152-308)||(39098924-39099080)
chr8 (112-308)||(38644207-38644403)
chr8 (151-308)||(34951861-34952018)
chr8 (152-308)||(1205156-1205312)
chr8 (151-297)||(5299750-5299896)
chr8 (151-308)||(8803620-8803778)
chr8 (152-289)||(24823199-24823336)
chr8 (151-308)||(35459515-35459672)
chr8 (151-308)||(44869726-44869883)
chr8 (152-308)||(16223092-16223248)
chr8 (113-308)||(33906441-33906634)
chr8 (154-308)||(6098320-6098479)
chr8 (151-308)||(36694770-36694927)
chr8 (151-281)||(33198058-33198188)
chr8 (183-308)||(1149756-1149881)
chr8 (112-308)||(12876339-12876535)
chr8 (151-305)||(40862651-40862806)
chr8 (152-308)||(10555010-10555165)
chr8 (151-308)||(31933690-31933847)
chr8 (113-308)||(30654349-30654544)
chr8 (176-308)||(9864377-9864509)
chr8 (151-295)||(18259321-18259465)
chr8 (151-236)||(41362723-41362808)
chr8 (152-237)||(43025974-43026059)
chr8 (223-308)||(13307852-13307936)
chr8 (216-307)||(34463704-34463792)
chr8 (253-308)||(41910895-41910949)
chr8 (151-185)||(13307931-13307965)
chr8 (267-308)||(43025931-43025972)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (108-308)||(22255412-22255612)
chr5 (152-308)||(35826275-35826431)
chr5 (153-308)||(699380-699535)
chr5 (152-308)||(22981023-22981179)
chr5 (151-302)||(15992328-15992479)
chr5 (108-308)||(42342951-42343151)
chr5 (151-308)||(24886317-24886474)
chr5 (151-308)||(31786434-31786591)
chr5 (117-308)||(2888199-2888390)
chr5 (113-308)||(35511232-35511427)
chr5 (151-308)||(25669806-25669963)
chr5 (151-308)||(31705400-31705557)
chr5 (153-308)||(5830122-5830278)
chr5 (153-308)||(25889600-25889755)
chr5 (113-308)||(38527987-38528182)
chr5 (151-308)||(9200454-9200611)
chr5 (152-305)||(22973871-22974024)
chr5 (151-303)||(8741673-8741825)
chr5 (151-305)||(8437198-8437352)
chr5 (113-304)||(33908467-33908657)
chr5 (151-289)||(39573060-39573198)
chr5 (113-308)||(40133615-40133810)
chr5 (151-308)||(19120089-19120246)
chr5 (151-308)||(22019853-22020010)
chr5 (152-304)||(7208653-7208805)
chr5 (152-303)||(7693456-7693607)
chr5 (151-308)||(5837785-5837942)
chr5 (113-308)||(14409091-14409286)
chr5 (107-290)||(25500670-25500853)
chr5 (151-305)||(35504598-35504752)
chr5 (113-308)||(36866992-36867187)
chr5 (111-305)||(17157779-17157973)
chr5 (151-308)||(27330534-27330691)
chr5 (152-308)||(36860654-36860810)
chr5 (153-308)||(12910585-12910740)
chr5 (151-281)||(28416339-28416469)
chr5 (151-308)||(15724718-15724875)
chr5 (151-308)||(32563370-32563527)
chr5 (151-308)||(35934126-35934283)
chr5 (115-308)||(13956116-13956307)
chr5 (151-308)||(43308448-43308605)
chr5 (151-308)||(23116018-23116167)
chr5 (152-308)||(30969113-30969269)
chr5 (152-308)||(27318277-27318432)
chr5 (152-308)||(21088558-21088711)
chr5 (152-276)||(8466988-8467112)
chr5 (187-308)||(1428983-1429107)
chr5 (153-239)||(43254154-43254240)
chr5 (151-278)||(26269069-26269196)
chr5 (113-308)||(23954552-23954734)
chr5 (151-308)||(14919327-14919473)
chr5 (211-303)||(6824329-6824420)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (112-308)||(41961070-41961266)
chr2 (151-308)||(7006754-7006911)
chr2 (108-308)||(44913894-44914097)
chr2 (113-301)||(18494059-18494247)
chr2 (113-308)||(33660155-33660350)
chr2 (152-297)||(26357818-26357963)
chr2 (113-308)||(11366158-11366354)
chr2 (151-308)||(33709048-33709205)
chr2 (151-308)||(43770664-43770821)
chr2 (152-308)||(4763861-4764017)
chr2 (113-308)||(2325156-2325351)
chr2 (113-308)||(4167152-4167347)
chr2 (151-297)||(5881770-5881916)
chr2 (113-308)||(41465731-41465926)
chr2 (151-308)||(19289139-19289296)
chr2 (176-302)||(27349789-27349915)
chr2 (151-308)||(43648061-43648218)
chr2 (152-308)||(31570551-31570707)
chr2 (151-308)||(35959126-35959279)
chr2 (151-308)||(39167185-39167342)
chr2 (159-305)||(19500739-19500885)
chr2 (151-308)||(13711689-13711846)
chr2 (151-308)||(31862082-31862239)
chr2 (115-308)||(3177169-3177362)
chr2 (110-267)||(19424417-19424574)
chr2 (186-308)||(4478595-4478717)
chr2 (151-296)||(41051116-41051260)
chr2 (152-308)||(33550800-33550960)
chr2 (151-308)||(37905940-37906098)
chr2 (204-308)||(44286179-44286283)
chr2 (153-308)||(29241963-29242111)
chr2 (185-308)||(4263926-4264049)
chr2 (152-257)||(41463407-41463512)
chr2 (152-231)||(33902321-33902400)
chr2 (199-308)||(19314074-19314186)
chr2 (151-250)||(18257354-18257453)
chr2 (230-303)||(36642223-36642296)
chr2 (233-308)||(45327950-45328025)
chr2 (113-200)||(45328028-45328114)
chr2 (246-308)||(17071648-17071710)
chr2 (245-308)||(18258197-18258260)
chr2 (167-209)||(17053963-17054005)
chr2 (246-308)||(17054007-17054069)
chr2 (167-209)||(17071604-17071646)
chr2 (264-308)||(41463779-41463823)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (113-308)||(46297522-46297717)
chr3 (153-308)||(11357181-11357336)
chr3 (113-308)||(26941020-26941215)
chr3 (152-310)||(1089913-1090070)
chr3 (113-308)||(40552019-40552214)
chr3 (112-297)||(4015691-4015876)
chr3 (153-308)||(53228952-53229107)
chr3 (113-308)||(22622478-22622673)
chr3 (112-307)||(33378544-33378739)
chr3 (151-308)||(48355162-48355319)
chr3 (151-303)||(33698379-33698531)
chr3 (151-308)||(24707913-24708070)
chr3 (151-308)||(29099567-29099724)
chr3 (151-308)||(44186315-44186472)
chr3 (153-308)||(52040722-52040877)
chr3 (114-308)||(39282873-39283067)
chr3 (152-308)||(7327281-7327437)
chr3 (113-297)||(43975652-43975836)
chr3 (154-308)||(42505876-42506030)
chr3 (153-310)||(3362474-3362631)
chr3 (151-308)||(14586478-14586634)
chr3 (151-308)||(22451189-22451346)
chr3 (111-308)||(21193828-21194025)
chr3 (152-308)||(24488761-24488917)
chr3 (152-308)||(44891718-44891874)
chr3 (112-308)||(51212536-51212726)
chr3 (110-308)||(21009558-21009757)
chr3 (151-308)||(54506028-54506186)
chr3 (115-308)||(47481743-47481937)
chr3 (113-297)||(37157940-37158124)
chr3 (113-297)||(37203300-37203484)
chr3 (151-308)||(2008153-2008317)
chr3 (151-303)||(40936199-40936351)
chr3 (153-308)||(22445865-22446020)
chr3 (113-308)||(11356918-11357105)
chr3 (152-308)||(25579960-25580116)
chr3 (176-308)||(34133156-34133288)
chr3 (113-297)||(36012371-36012556)
chr3 (152-308)||(29164030-29164179)
chr3 (113-308)||(32373691-32373885)
chr3 (152-308)||(4761447-4761603)
chr3 (176-308)||(38591919-38592051)
chr3 (182-308)||(46994490-46994616)
chr3 (151-308)||(50475032-50475196)
chr3 (151-308)||(3654997-3655157)
chr3 (151-230)||(20373061-20373140)
chr3 (214-308)||(45174727-45174821)
chr3 (198-308)||(54828546-54828656)
chr3 (159-297)||(27480164-27480306)
chr3 (113-308)||(11467045-11467226)
chr3 (214-276)||(11835494-11835556)
chr3 (246-308)||(20373137-20373199)
chr3 (223-308)||(43348478-43348563)
chr3 (216-295)||(53811597-53811676)
chr3 (151-199)||(35844577-35844625)
chr3 (151-187)||(43348556-43348592)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (113-308)||(3879698-3879893)
chr6 (113-308)||(6090941-6091136)
chr6 (152-308)||(1946064-1946221)
chr6 (110-308)||(20768312-20768510)
chr6 (151-308)||(33892809-33892966)
chr6 (151-308)||(7234829-7234989)
chr6 (113-308)||(5627621-5627817)
chr6 (158-308)||(4318626-4318776)
chr6 (152-308)||(21016916-21017066)
chr6 (151-308)||(8513458-8513608)
chr6 (151-308)||(29182394-29182548)
chr6 (152-308)||(33619055-33619219)
chr6 (151-278)||(7054569-7054697)
chr6 (151-308)||(6089133-6089283)
chr6 (157-212)||(33724062-33724117)
chr6 (252-308)||(30353256-30353312)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (151-308)||(408227-408384)
scaffold0002 (151-308)||(364-515)
scaffold0002 (152-308)||(93900-94055)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (152-308)||(12139-12294)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (154-308)||(8117-8271)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (107-308)||(145769-145971)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (151-308)||(44186-44343)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (151-308)||(154444-154601)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (151-308)||(267515-267663)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (193-259)||(100994-101058)
scaffold0009 (271-308)||(100957-100994)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 7151899 - 7152187
Alignment:
Q  18 tcaactaaactaaggaaaaagaggtaacaagccaaattttgaatatcgttaggcataaatctgaccattacccaatcatgttagaattctaaaatgggag 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7151899 tcaactaaactaaggaaaaagaggtaacaagccaaactttgaatattgttaggcataaatctgaccattacccaatcatgttagaattctaaaatgggag 7151998  T
Q  118 cttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaa 217  Q
    ||||||| || |||    ||||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7151999 cttatacagtgcag----aaaactgacttttttgaaaaagttatttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaa 7152094  T
Q  218 tagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgatgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7152095 tagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgt 7152187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 112 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6864461 - 6864265
Alignment:
Q  112 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 211  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6864461 tgggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 6864362  T
Q  212 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6864361 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 6864265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7703896 - 7703739
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7703896 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 7703797  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  7703796 cgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgat 7703739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 36493513 - 36493670
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  36493513 gaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatctt 36493612  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36493613 agacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 36493670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 111 - 308
Target Start/End: Original strand, 19440432 - 19440629
Alignment:
Q  111 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 210  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19440432 atgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaa 19440531  T
Q  211 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19440532 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 19440629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 113 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25184538 - 25184346
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25184538 gggagcttctatggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatg 25184439  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 305  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  25184438 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgat 25184346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 25700880 - 25701039
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25700880 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaaaatctt 25700979  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgatgt 310  Q
     || |||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25700980 agatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgt 25701039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 34361277 - 34361473
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34361277 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 34361376  T
Q  213 atcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34361377 atcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 34361473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 35020817 - 35021016
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35020817 gggagcttctacggtgtagtcagaaaactgactcttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatg 35020916  T
Q  213 atcaata----gtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35020917 atcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 35021016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1815687 - 1815531
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  1815687 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 1815588  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1815587 gatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 1815531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33341784 - 33341628
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  33341784 aaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttg 33341685  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33341684 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgat 33341628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 151 - 303
Target Start/End: Original strand, 55240929 - 55241081
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  55240929 gaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaatttatctagtaatgtttgcaacatctt 55241028  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 303  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55241029 ggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttg 55241081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 28002810 - 28002967
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||    
T  28002810 gaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatctt 28002909  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28002910 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 28002967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 30002465 - 30002622
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  30002465 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 30002564  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     |||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30002565 agacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgat 30002622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 155 - 308
Target Start/End: Original strand, 34947923 - 34948076
Alignment:
Q  155 aagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggac 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34947923 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 34948022  T
Q  255 ttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34948023 ttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgat 34948076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39400395 - 39400238
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39400395 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtcattcatctagtaatgcttgcaacatctt 39400296  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    | ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39400295 gaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 39400238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 46887982 - 46888139
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  46887982 gaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatctt 46888081  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  46888082 ggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgat 46888139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 47254127 - 47253970
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  47254127 gaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 47254028  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47254027 agacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 47253970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 111 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32579873 - 32579676
Alignment:
Q  111 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 210  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||       |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  32579873 atgggagtttctacggtgcagttagaaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattgctgattaa 32579774  T
Q  211 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32579773 tgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgat 32579676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37776044 - 37775888
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  37776044 aaaaagttaatttcaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 37775945  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37775944 gacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgat 37775888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 50765106 - 50764950
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  50765106 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 50765007  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  50765006 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgat 50764950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 55477716 - 55477872
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  55477716 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 55477815  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  55477816 gacttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 55477872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 33816302 - 33816497
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33816302 gggagcttctacgatgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatg 33816401  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33816402 atcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 33816497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37288116 - 37287958
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttca-tcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatct 249  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37288116 gaaaaagttaattttaaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgctcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatct 37288017  T
Q  250 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||    
T  37288016 tggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgat 37287958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23761458 - 23761301
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23761458 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 23761359  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||    
T  23761358 ggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgat 23761301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 879373 - 879529
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  879373 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacttattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 879472  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  879473 gacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 879529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32592471 - 32592319
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  32592471 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacatctt 32592372  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 303  Q
    | |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  32592371 gaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttg 32592319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 32912365 - 32912561
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32912365 gggagcttttacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattcattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 32912464  T
Q  213 atcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||||    
T  32912465 atcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgat 32912561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 308
Target Start/End: Original strand, 37663568 - 37663722
Alignment:
Q  154 aaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgga 253  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  37663568 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 37663667  T
Q  254 cttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||    
T  37663668 cttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgat 37663722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 49376392 - 49376197
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49376392 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattcttgattactgattaatg 49376293  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  49376292 atcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgat 49376197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 50697629 - 50697471
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  50697629 gaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatctt 50697530  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaaca-tgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  50697529 ggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgat 50697471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4205409 - 4205216
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||       |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||    
T  4205409 gggagcttctacggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatg 4205310  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatg 306  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4205309 ataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4598368 - 4598212
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4598368 aaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattaatctaataatgcttgcaacatcttg 4598269  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    || ||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4598268 gatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgat 4598212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 308
Target Start/End: Original strand, 19089237 - 19089434
Alignment:
Q  111 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 210  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||       || |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19089237 atgggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaa 19089336  T
Q  211 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||| ||||  |||||||||    
T  19089337 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgat 19089434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3043006 - 3042849
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  3043006 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatgtt 3042907  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3042906 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgat 3042849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 29584024 - 29584181
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29584024 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 29584123  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29584124 ggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgat 29584181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 153 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9139612 - 9139465
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  9139612 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaatta--gattattgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaatgcttgcaacatcttgg 9139515  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagtt 302  Q
    |||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9139514 acttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 9139465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17168100 - 17167943
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  17168100 gaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactaattaatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatctt 17168001  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17168000 agacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 17167943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17173677 - 17173520
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  17173677 gaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatctt 17173578  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17173577 agacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 17173520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17272351 - 17272194
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17272351 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 17272252  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  17272251 ggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgat 17272194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27397000 - 27396846
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  27397000 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 27396903  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||| || ||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  27396902 gacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgat 27396846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 276
Target Start/End: Original strand, 35025391 - 35025515
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35025391 gaaaaagttaattttgat-ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 35025489  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgtt 276  Q
    |||||||||  |||||||||||||||    
T  35025490 ggacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23431942 - 23431826
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23431942 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctactaatgcttgcaacatctt 23431843  T
Q  251 ggacttacagatactat 267  Q
    |||||||||| ||||||    
T  23431842 ggacttacaggtactat 23431826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 297
Target Start/End: Original strand, 46883938 - 46884080
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||      
T  46883938 gaaaaaattaatttttattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc-- 46884035  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 297  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  46884036 ggacttac--atactattttatctttggaatttttaacatgcaaaca 46884080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 308
Target Start/End: Original strand, 5047751 - 5047947
Alignment:
Q  112 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 211  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||| ||       |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  5047751 tgggagcttttacggtgcagtcaggaaacagacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgtttattgttgattact 5047850  T
Q  212 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  5047851 gatcaataataatttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgat 5047947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26896474 - 26896320
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || ||    
T  26896474 aaaaagttaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgtttgcaacatttt 26896375  T
Q  251 -ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 305  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||    
T  26896374 cggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgat 26896320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 42200117 - 42199959
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatct 249  Q
    ||||||||||||||  || || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42200117 gaaaaagttaatttg-attttgatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtatattcatctagtaatgcttgcaacatct 42200019  T
Q  250 tggacttac-agatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  42200018 tggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgat 42199959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38012649 - 38012569
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatcta 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012649 gaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatcta 38012569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 308
Target Start/End: Original strand, 4934040 - 4934183
Alignment:
Q  155 aagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaa-ttgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgga 253  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||          
T  4934040 aagttaattttgatcttaatgtttaatttatttttaaaatttttgattactgattaatgattaatagaaattcatctattaatgcgtgcaacat------ 4934133  T
Q  254 cttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
         || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4934134 -----aggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 4934183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38012084
Alignment:
Q  223 attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgat 38012084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050171
Alignment:
Q  234 aatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaaca 56050171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 308
Target Start/End: Original strand, 35025531 - 35025577
Alignment:
Q  262 tactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35025531 tactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 35025577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29173922 - 29173728
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  29173922 gggagcttctacgatgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatg 29173823  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29173822 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgat 29173728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 37703297 - 37703454
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  37703297 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 37703396  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37703397 ggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 37703454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 9355625 - 9355782
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  9355625 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 9355724  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9355725 ggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 9355782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18797688 - 18797532
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18797688 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 18797589  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18797588 gacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 18797532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 17842385 - 17842540
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17842385 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgg 17842484  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17842485 acttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 17842540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 31520540 - 31520697
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  31520540 gaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaacatctt 31520639  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31520640 ggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 31520697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37347383 - 37347226
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  37347383 gaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatctt 37347284  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37347283 ggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 37347226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 32820853 - 32821009
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  32820853 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 32820952  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32820953 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 32821009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 151 - 306
Target Start/End: Original strand, 10359013 - 10359168
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  10359013 gaaaaagttaattttgatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgcaaaatctt 10359112  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatg 306  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10359113 ggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatg 10359168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37110234 - 37110079
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  37110234 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 37110135  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37110134 acttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 37110079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 109 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6546923 - 6546724
Alignment:
Q  109 aaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatt 208  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6546923 aaatgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgatt 6546824  T
Q  209 aatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  6546823 aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgat 6546724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 109 - 308
Target Start/End: Original strand, 15612516 - 15612715
Alignment:
Q  109 aaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatt 208  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||        |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15612516 aaatgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgatt 15612615  T
Q  209 aatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15612616 aatgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 15612715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 110 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24212145 - 24211946
Alignment:
Q  110 aatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta 209  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24212145 aatgagagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 24212046  T
Q  210 atgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||    
T  24212045 atgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgat 24211946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 157 - 308
Target Start/End: Original strand, 44411345 - 44411496
Alignment:
Q  157 gttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggactt 256  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  44411345 gttaattatgatcttaatgtttcattcatttttaaattgttgattactgattaatggtcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 44411444  T
Q  257 acagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44411445 acagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 44411496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37704525 - 37704387
Alignment:
Q  170 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattt 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37704525 ttaatgtttgattcatttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattt 37704426  T
Q  270 tatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  37704425 tatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 31578863 - 31579020
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31578863 gaaaaagttaattttgattttattgtttgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 31578962  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||    
T  31578963 ggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgat 31579020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32432851 - 32432657
Alignment:
Q  114 ggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatga 213  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||        ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32432851 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattcatga 32432752  T
Q  214 tcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  32432751 ttaataataattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgat 32432657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 116 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23111589 - 23111397
Alignment:
Q  116 agcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatc 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23111589 agcttctacggtacagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaactttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatc 23111490  T
Q  216 aatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23111489 aatagtaattcttctagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgat 23111397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 112 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35353509 - 35353313
Alignment:
Q  112 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 211  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35353509 tgggagcttctaaggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaat 35353410  T
Q  212 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  35353409 gatcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgat 35353313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 151 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22687593 - 22687463
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22687593 gaaaaagttaattttaatcttaatgtatgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaacatctt 22687494  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcat 281  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22687493 ggacttacatgtactattttatcgttggcat 22687463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30055886 - 30055732
Alignment:
Q  154 aaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgga 253  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30055886 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 30055787  T
Q  254 cttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||    
T  30055786 cttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgat 30055732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8861647 - 8861490
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||    
T  8861647 gaaaaagttaattttaatcttagtgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtaatgcatgcaacatctt 8861548  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8861547 agacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgat 8861490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26980668 - 26980511
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  26980668 gaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaataattcatctagtaatacttgcaacatctt 26980569  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26980568 agacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgat 26980511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 41764877 - 41765034
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41764877 gaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataataattcatccagtaatgcttgcaaaatctt 41764976  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41764977 ggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 41765034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 48928097 - 48928253
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  48928097 aaaaaattaattttgatctaaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 48928196  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48928197 gacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgat 48928253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 182 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165948
Alignment:
Q  182 tcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcat 12165975  T
Q  282 atttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12165974 ctttaacatgcaaacagagttgctgat 12165948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 151 - 289
Target Start/End: Original strand, 26587891 - 26588029
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  26587891 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcctgcaacatctt 26587990  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaaca 289  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  26587991 ggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaaca 26588029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43925457 - 43925306
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43925457 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 43925358  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||       || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43925357 ggac------gtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 43925306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 46480928 - 46481085
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  46480928 gaaaaagttaattatgatcttaatgttttatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 46481027  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  46481028 agacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgat 46481085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 158 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27284100 - 27283952
Alignment:
Q  158 ttaattttcatcttaatgtttgattc-atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggactt 256  Q
    |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27284100 ttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 27284001  T
Q  257 acagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 305  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  27284000 acaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgat 27283952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 5657279 - 5657437
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatctt-aatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatct 249  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5657279 gaaaaagttaattttaatctttaatgatttattcatttttaaatttttgattactcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatct 5657378  T
Q  250 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5657379 tagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgat 5657437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 129 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10481989 - 10481810
Alignment:
Q  129 cagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcat 228  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10481989 cagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttaatttatttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagtaattcat 10481890  T
Q  229 ctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10481889 ctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgat 10481810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 15672558 - 15672718
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  15672558 gaaaaaattaattttaaccttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 15672657  T
Q  251 ggacttacagatac---tattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  15672658 ggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgat 15672718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 12390450 - 12390605
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  12390450 aaaagttaattttgatcttaatgtttatttcatttttaaattgtcaattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatcttgg 12390549  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  12390550 acttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgat 12390605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 151 - 300
Target Start/End: Original strand, 34361975 - 34362126
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttca-tctt-aatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatc 248  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  34361975 gaaaaagttaattttaaatctttaatgtttgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgtttgcaatatc 34362074  T
Q  249 ttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  34362075 ttggacttacagatactattttatcgttgatatttttaacatgcaaacagag 34362126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4583319 - 4583124
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  4583319 gggagcttctacggtgcagccagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatgactgattcatg 4583220  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  4583219 attaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgat 4583124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 170 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11071546 - 11071411
Alignment:
Q  170 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  11071546 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtattattt 11071447  T
Q  270 tatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||   | |||||||||| |||| ||||||||||    
T  11071446 tatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgat 11071411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 25691344 - 25691500
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  25691344 aaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttg 25691443  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     |||||||  |  ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  25691444 aacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgat 25691500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 151 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7335155 - 7335010
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7335155 gaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattattgatttctgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 7335056  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaac 296  Q
    ||| |||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  7335055 ggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaac 7335010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21991989 - 21991841
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||     ||||||||| |||||    
T  21991989 gaaaaggttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgat----gatcaatagtaattcatct-----tgcttgcaacatctt 21991899  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21991898 ggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgat 21991841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 32593006 - 32593162
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| || |||||    
T  32593006 gaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttt-aaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatatttgtaacatctt 32593104  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32593105 ggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 32593162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38258980 - 38258867
Alignment:
Q  112 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 211  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38258980 tgggagcttctacggtgcagtcagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 38258881  T
Q  212 gatcaatagtaatt 225  Q
    ||||||||||||||    
T  38258880 gatcaatagtaatt 38258867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44599028 - 44598871
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattatt---gattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaat 247  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || ||    
T  44599028 gaaaaaattaattttaatcttaacgattgattcatttt-aaattgttgattattattgattaatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttgtaacat 44598932  T
Q  248 cttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||| ||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44598931 cttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgat 44598871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 207 - 308
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688218
Alignment:
Q  207 ttaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  33688217 at 33688218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053666
Alignment:
Q  223 attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgat 38053666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686245
Alignment:
Q  223 attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgat 43686245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38258812 - 38258750
Alignment:
Q  246 atcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38258812 atcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 38258750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 308
Target Start/End: Original strand, 48928474 - 48928520
Alignment:
Q  262 tactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48928474 tactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgat 48928520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12166250 - 12166215
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcattt 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12166250 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattt 12166215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 270
Target Start/End: Original strand, 27421207 - 27421283
Alignment:
Q  194 tgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactatttt 270  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||  |||   |||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  27421207 tgttgatcattaattaatgatcaatattatttcatcttgtaacatttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 27421283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32216476 - 32216281
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32216476 gggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 32216377  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  32216376 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgat 32216281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 112 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2960170 - 2959974
Alignment:
Q  112 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 211  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2960170 tgggatcttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 2960071  T
Q  212 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  2960070 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgat 2959974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16416027 - 16415872
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16416027 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgg 16415928  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16415927 acttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 16415872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48353963 - 48353768
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48353963 gggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 48353864  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48353863 atcaataataattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgat 48353768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37451668 - 37451511
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  37451668 gaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 37451569  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37451568 ggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 37451511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 111 - 308
Target Start/End: Original strand, 7078816 - 7079013
Alignment:
Q  111 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 210  Q
    ||||||| || |||||||||||||  |||||||       ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7078816 atgggagtttttacggtacagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaa 7078915  T
Q  211 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7078916 tgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgat 7079013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10923148 - 10922953
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10923148 gggagcttctatggtgcagtcagaaaactgactcttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 10923049  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10923048 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 10922953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14758453 - 14758258
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14758453 gggagcttctacggtgcagtcacgaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatg 14758354  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14758353 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 14758258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 47279572 - 47279415
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  47279572 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaacatctt 47279473  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  47279472 ggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgat 47279415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3535305 - 3535149
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3535305 aaaaagttagttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 3535206  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3535205 gacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 3535149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 108 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8222554 - 8222354
Alignment:
Q  108 aaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattattga 206  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8222554 aaaaggggagcttctacggtacagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactga 8222455  T
Q  207 ttaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatg 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8222454 ttaatgatcaata-taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatg 8222356  T
Q  307 at 308  Q
    ||    
T  8222355 at 8222354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 111 - 308
Target Start/End: Original strand, 34012135 - 34012332
Alignment:
Q  111 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 210  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||        |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34012135 atgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 34012234  T
Q  211 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34012235 tgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgat 34012332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 27266995 - 27267150
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  27266995 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattattgattattgattaattatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttag 27267094  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27267095 acttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgat 27267150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 27227280 - 27227435
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27227280 aaaagttaattttgatattaatgtttaattcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 27227379  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27227380 acttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 27227435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30254805 - 30254651
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30254805 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 30254706  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatg 306  Q
    ||||||||  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  30254705 gacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatg 30254651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 11742161 - 11742318
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11742161 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 11742260  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  11742261 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgat 11742318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15168479 - 15168322
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15168479 gaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatctt 15168380  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15168379 gtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 15168322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 110 - 308
Target Start/End: Original strand, 27532734 - 27532931
Alignment:
Q  110 aatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta 209  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27532734 aatgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaa-ttgttgattactgatta 27532832  T
Q  210 atgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||    
T  27532833 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgat 27532931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 28564576 - 28564733
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  28564576 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 28564675  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  || |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28564676 ggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 28564733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 107 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 46931837 - 46931635
Alignment:
Q  107 taaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattga 206  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46931837 taaaatgggagcttctacggtgcagtaaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactga 46931738  T
Q  207 ttaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 305  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  46931737 ttaatgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgat 46931638  T
Q  306 gat 308  Q
    |||    
T  46931637 gat 46931635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3309537 - 3309379
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttca-tcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatct 249  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3309537 gaaaaagttaattttaaatctaaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatct 3309438  T
Q  250 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  3309437 tggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgat 3309379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 153 - 307
Target Start/End: Original strand, 27563700 - 27563854
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  27563700 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaacatcttgg 27563799  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 307  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27563800 acttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatga 27563854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32267455 - 32267260
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||| |||       |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32267455 gggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 32267356  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32267355 ttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgat 32267260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 238306 - 238463
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  238306 gaaaaagttgattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 238405  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  238406 ggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgat 238463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23999730 - 23999573
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23999730 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 23999631  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23999630 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 23999573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28770036 - 28769879
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||    
T  28770036 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaacatctt 28769937  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||    
T  28769936 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgat 28769879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 151 - 305
Target Start/End: Original strand, 27763103 - 27763258
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatct 249  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  27763103 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatatttatctagtaatgcttgcaacatct 27763202  T
Q  250 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 305  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  27763203 tgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgat 27763258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 108 - 308
Target Start/End: Original strand, 47682244 - 47682444
Alignment:
Q  108 aaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgat 207  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||       ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  47682244 aaaatgggagcttctatggtgcagtcagtaaactgacttttttgaacaagttaattttaatcttaatgtttaattcttttttaaattgttaattactgat 47682343  T
Q  208 taatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 307  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  47682344 taatgatcaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatga 47682443  T
Q  308 t 308  Q
    |    
T  47682444 t 47682444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 19899563 - 19899719
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19899563 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 19899662  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19899663 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgat 19899719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38823596 - 38823440
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||     
T  38823596 aaaaagttaattttaatcttaatatttgtttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttta 38823497  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  38823496 gacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgat 38823440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 51129240 - 51129085
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  51129240 gaaaaagttaattt--attttaatacttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 51129143  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  51129142 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 51129085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 9902847 - 9903004
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||    
T  9902847 gaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtagtgcttgcagcatctt 9902946  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  9902947 ggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgat 9903004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25161015 - 25160858
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  25161015 aaaaggttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatctt 25160916  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25160915 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 25160858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4330662 - 4330507
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  4330662 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttatattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaacatattgg 4330563  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4330562 acttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgat 4330507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15383355 - 15383159
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattattgattaat 211  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||| |||       ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15383355 gggagcttctacggttcagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattgctgattaat 15383256  T
Q  212 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15383255 aatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgat 15383159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39393766 - 39393615
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  39393766 aaaaagttaattttaattttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 39393667  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 303  Q
    || |||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  39393666 gatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttg 39393615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 151 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1547654 - 1547516
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1547654 gaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 1547555  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaaca 289  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  1547554 ggacttacatgtactattttatcgttggtatctttaaca 1547516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22171136 - 22170937
Alignment:
Q  109 aaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatt 208  Q
    |||||||||||| |||||| || | ||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  22171136 aaatgggagcttctacggtgcaattagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactaatt 22171037  T
Q  209 aatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||   | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22171036 aatgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgat 22170937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 167 - 308
Target Start/End: Original strand, 1359744 - 1359885
Alignment:
Q  167 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatacta 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  1359744 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtacta 1359843  T
Q  267 ttttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1359844 ttttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgat 1359885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21289981 - 21289829
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  21289981 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtttgcaacatcttgg 21289882  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 305  Q
    ||||| |  |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21289881 acttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagagttgat 21289829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 10181802 - 10181958
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  10181802 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttgg 10181901  T
Q  253 acttac-agatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||| || ||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  10181902 acttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgat 10181958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 111 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15752452 - 15752255
Alignment:
Q  111 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 210  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||        ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15752452 atgggagcttctacggtgcagtcagaaaattgattttttaaaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaa 15752353  T
Q  211 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||  |||||||||||||  || |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  15752352 tgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgat 15752255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41926537 - 41926383
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  41926537 aaaaattaattatgattttaatgtttgattcaattttaaatcattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttgg 41926439  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41926438 acttacaagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 41926383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 158 - 308
Target Start/End: Original strand, 30326751 - 30326902
Alignment:
Q  158 ttaattttcatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggactt 256  Q
    |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30326751 ttaattttgattttaatatttgatttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 30326850  T
Q  257 acagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    | |  || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30326851 aaatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgat 30326902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 308
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37618851
Alignment:
Q  186 ttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatattt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||| || |||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatcttt 37618828  T
Q  286 aacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37618829 aacatgcaaacagagttgatgat 37618851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31963000 - 31962853
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaa-ttgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatct 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31963000 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtagttcatctaataatgcttgcaacatct 31962901  T
Q  250 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 297  Q
    |  ||||||| ||| |||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  31962900 taaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaaca 31962853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Original strand, 31621341 - 31621479
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttt-taaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatct 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |    
T  31621341 gaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcattttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaatgcttgcaacatat 31621440  T
Q  250 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaac 288  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31621441 tgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaac 31621479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 42721418 - 42721265
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||    
T  42721418 aaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatctagtaataattgcaacatcttg 42721319  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  || |||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  42721318 gacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgat 42721265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 40885178 - 40885039
Alignment:
Q  169 cttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactatt 268  Q
    |||||| || ||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  40885178 cttaatattcgattcatttttgaattattgattgctaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatt 40885079  T
Q  269 ttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40885078 ttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 40885039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18423006 - 18422877
Alignment:
Q  172 aatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactatttta 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  | || |||||    
T  18423006 aatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgctttttta 18422914  T
Q  272 tcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||    
T  18422913 tcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtgatgat 18422877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 33725366 - 33725550
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcattttta-aattgttgattattgattaat 211  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||       ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  33725366 gggagcttatacgttgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagtttattttgatcttaatgttcgattcatttttttaattgttgattgctgattaat 33725465  T
Q  212 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||            ||||| |||||| || |||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33725466 gatcaatag------------taatgtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 33725550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 48621010 - 48620916
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgat 207  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  48621010 gggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattaatgat 48620916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759759
Alignment:
Q  221 taattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgat 38759759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48620906 - 48620854
Alignment:
Q  256 tacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48620906 tacaggtactatttattcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 48620854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 1953792 - 1953951
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1953792 gaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 1953891  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgatgt 310  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1953892 ggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgt 1953951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 16446641 - 16446836
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16446641 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgttagattcatttttaaattgttgattactgattaatg 16446740  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16446741 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgat 16446836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 151 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12587968 - 12587812
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12587968 gaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatctt 12587869  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 307  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12587868 tgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 113 - 305
Target Start/End: Original strand, 43643361 - 43643553
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  43643361 gggagcttctatggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatg 43643460  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 305  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  43643461 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgat 43643553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 155 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 466214 - 466061
Alignment:
Q  155 aagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggac 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  466214 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagac 466115  T
Q  255 ttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  466114 ttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 466061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 23854235 - 23854392
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23854235 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 23854334  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||    
T  23854335 ggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgat 23854392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 305
Target Start/End: Original strand, 1149398 - 1149590
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||| |||       |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1149398 gggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatg 1149497  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 305  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  1149498 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgat 1149590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 4132492 - 4132647
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4132492 aaaagttaattttgatcttaatgtgtaattcatttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 4132591  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4132592 acttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 4132647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35859363 - 35859163
Alignment:
Q  108 aaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgat 207  Q
    |||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35859363 aaaaagggagtttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat 35859264  T
Q  208 taatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 307  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35859263 taatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatga 35859164  T
Q  308 t 308  Q
    |    
T  35859163 t 35859163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 7890761 - 7890918
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  7890761 gaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 7890860  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  7890861 agacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgat 7890918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 27082642 - 27082799
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27082642 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 27082741  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  27082742 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgat 27082799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 37970323 - 37970480
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37970323 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 37970422  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37970423 ggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgat 37970480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11727409 - 11727253
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  11727409 aaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 11727310  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  11727309 gacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgat 11727253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34895347 - 34895191
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  34895347 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttg 34895248  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34895247 aacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgat 34895191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 39098924 - 39099080
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  39098924 aaaaaattaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 39099023  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39099024 gacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgat 39099080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 112 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38644403 - 38644207
Alignment:
Q  112 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 211  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38644403 tgggagcttttacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaatttttgattactgattaat 38644304  T
Q  212 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  38644303 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgat 38644207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 34951861 - 34952018
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||    
T  34951861 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatgtagtaagacttgcaacatctt 34951960  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34951961 agacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgat 34952018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1205312 - 1205156
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  1205312 aaaaagttaattttgatcttgttgtttgattcatttttaaattgctgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttg 1205213  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1205212 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 1205156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 151 - 297
Target Start/End: Original strand, 5299750 - 5299896
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5299750 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 5299849  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 297  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  5299850 ggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaaca 5299896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 8803620 - 8803778
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatct 249  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  8803620 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtatattcatctggtaatgcttgcaacatct 8803719  T
Q  250 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8803720 tggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 8803778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 289
Target Start/End: Original strand, 24823199 - 24823336
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24823199 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 24823298  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaaca 289  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24823299 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 24823336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 35459515 - 35459672
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||    
T  35459515 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatttt 35459614  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  35459615 ggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgat 35459672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44869883 - 44869726
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  44869883 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatctt 44869784  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  44869783 ggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgat 44869726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16223248 - 16223092
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  16223248 aaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 16223149  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16223148 gacttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgat 16223092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33906634 - 33906441
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||  |||||||||    
T  33906634 gggagcttctacagtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttactattcgattcatttttaaatt--tgattgctgattaatg 33906537  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33906536 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 33906441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 308
Target Start/End: Original strand, 6098320 - 6098479
Alignment:
Q  154 aaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgga 253  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6098320 aaagttaatcatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 6098419  T
Q  254 cttacagatac-----tattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||  |||     |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6098420 cttacaagtactattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 6098479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 36694770 - 36694927
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  36694770 gaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatctt 36694869  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36694870 ggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 36694927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 151 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33198188 - 33198058
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||    
T  33198188 gaaaaagttaatcttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatttt 33198089  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcat 281  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33198088 agacttacatgtactattttatcgttggcat 33198058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 308
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149881
Alignment:
Q  183 catttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcata 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||     
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatc 1149855  T
Q  283 tttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1149856 tttaacatgcaaacaaagttgatgat 1149881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 112 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12876535 - 12876339
Alignment:
Q  112 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 211  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||        ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||| ||    
T  12876535 tgggagcttatacggtataatcaggaaactgacttttttaaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaactgttgattacttattcat 12876436  T
Q  212 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12876435 gataaatagtaattcatctagtaatgcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgat 12876339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40862806 - 40862651
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcattttt-aaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatct 249  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40862806 gaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatct 40862707  T
Q  250 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 305  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  40862706 tggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgat 40862651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 10555010 - 10555165
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagt--aattcatctaataatgcttgcaaaatct 249  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10555010 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattact---taatgatcaatagtgtaattcatctagtaatgcttgcaatatct 10555106  T
Q  250 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10555107 tggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 10555165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 31933690 - 31933847
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||    
T  31933690 gaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtctgcaatatctt 31933789  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||  ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  31933790 agacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgat 31933847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 30654349 - 30654544
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    ||||| || |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  30654349 gggagtttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttt-aaattgttaattactgattaatg 30654447  T
Q  213 atcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||| || |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  30654448 atcaataatatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgat 30654544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9864509 - 9864377
Alignment:
Q  176 tttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9864509 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgt 9864410  T
Q  276 tggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  9864409 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgat 9864377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 151 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18259465 - 18259321
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18259465 gaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 18259366  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaa 295  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18259365 agacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaa 18259321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41362808 - 41362723
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataat 236  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41362808 gaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagtaattcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43026059 - 43025974
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatg 237  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43026059 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatcactgattcatgatcaatagtaatttatctaataatg 43025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307852
Alignment:
Q  223 attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgat 13307852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34463792 - 34463704
Alignment:
Q  216 aatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 307  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||   ||||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  34463792 aatagtaattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 308
Target Start/End: Original strand, 41910895 - 41910949
Alignment:
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41910895 acttacaggtaatattttatcgttg-catctttaacatgcaaacagagttggtgat 41910949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13307965 - 13307931
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcat 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13307965 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcat 13307931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43025972 - 43025931
Alignment:
Q  267 ttttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  43025972 ttttatcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgat 43025931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22255612 - 22255412
Alignment:
Q  108 aaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgat 207  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||        |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22255612 aaaaagggagcttctacggtacagtcaggaaactgactttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat 22255513  T
Q  208 taatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22255512 taatgatcaatagtaattcatctagtaaggcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatga 22255413  T
Q  308 t 308  Q
    |    
T  22255412 t 22255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 35826275 - 35826431
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  35826275 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 35826374  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35826375 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 35826431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 699535 - 699380
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  699535 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 699436  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  699435 acttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 699380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22981179 - 22981023
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  22981179 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgattgcaacatcttg 22981080  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22981079 gacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgat 22981023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 151 - 302
Target Start/End: Original strand, 15992328 - 15992479
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15992328 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 15992427  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagtt 302  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15992428 ggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 15992479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 42343151 - 42342951
Alignment:
Q  108 aaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgat 207  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42343151 aaaatgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat 42343052  T
Q  208 taatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42343051 taatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatga 42342952  T
Q  308 t 308  Q
    |    
T  42342951 t 42342951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24886474 - 24886317
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24886474 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 24886375  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24886374 ggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 24886317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 31786434 - 31786591
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31786434 gaaaaagttaattttgatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 31786533  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31786534 ggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgat 31786591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 117 - 308
Target Start/End: Original strand, 2888199 - 2888390
Alignment:
Q  117 gcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatca 216  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2888199 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatca 2888298  T
Q  217 atagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  2888299 atagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgat 2888390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 35511232 - 35511427
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||        |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35511232 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 35511331  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35511332 atcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgat 35511427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25669963 - 25669806
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  25669963 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttt 25669864  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25669863 agacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgat 25669806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 31705400 - 31705557
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31705400 gaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 31705499  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||| |  |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31705500 ggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 31705557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5830278 - 5830122
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  5830278 aaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 5830179  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5830178 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 5830122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25889755 - 25889600
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  25889755 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctttcaacatcttgg 25889656  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25889655 atttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgat 25889600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 38527987 - 38528182
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38527987 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 38528086  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  38528087 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgat 38528182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9200611 - 9200454
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  9200611 gaaaaaattaattttaattttaaattttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 9200512  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9200511 agacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 9200454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 305
Target Start/End: Original strand, 22973871 - 22974024
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22973871 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 22973970  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 305  Q
    ||||||||  ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||    
T  22973971 gacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgat 22974024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 303
Target Start/End: Original strand, 8741673 - 8741825
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || ||    
T  8741673 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtgatgcttgcaacatttt 8741772  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 303  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8741773 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttg 8741825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8437352 - 8437198
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  8437352 gaaaaagttaattttgattttaatatttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacatctt 8437253  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8437252 ggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgat 8437198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33908657 - 33908467
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||| | |||||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33908657 gggagcatctacggtgcagttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatg 33908558  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttga 304  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  33908557 atcaatagtaatt-atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttga 33908467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 39573198 - 39573060
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39573198 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 39573099  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaaca 289  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  39573098 ggacttacatgtactattttatcattggcatctttaaca 39573060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 40133810 - 40133615
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  40133810 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatg 40133711  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  40133710 attaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgat 40133615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19120246 - 19120089
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19120246 gaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 19120147  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     |||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  19120146 agactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgat 19120089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22020010 - 22019853
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  22020010 gaaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatctt 22019911  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22019910 agacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgat 22019853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 304
Target Start/End: Original strand, 7208653 - 7208805
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  7208653 aaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttg 7208752  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttga 304  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  7208753 aacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttga 7208805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7693607 - 7693456
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  7693607 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 7693508  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 303  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7693507 gacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttg 7693456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5837942 - 5837785
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5837942 gaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 5837843  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5837842 ggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgat 5837785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 14409091 - 14409286
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  14409091 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaatttaattttaattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgaataatg 14409190  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14409191 atcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 14409286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 290
Target Start/End: Original strand, 25500670 - 25500853
Alignment:
Q  107 taaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattga 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25500670 taaaatgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttagtatttgattcatttttaaattgttaattactga 25500769  T
Q  207 ttaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacat 290  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25500770 ttaatgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacat 25500853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 151 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35504752 - 35504598
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  35504752 gaaaaagtcaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatctt 35504653  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 305  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  35504652 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgat 35504598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36867187 - 36866992
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  36867187 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatg 36867088  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    || |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  36867087 attaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgat 36866992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 305
Target Start/End: Original strand, 17157779 - 17157973
Alignment:
Q  111 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||| |||       |||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17157779 atgggagcttctacggtacagtcaagaaattgacttttttgaaaaagtcaagtttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 17157878  T
Q  211 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 305  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  17157879 tgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgat 17157973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27330691 - 27330534
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27330691 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 27330592  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27330591 ggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgat 27330534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36860810 - 36860654
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  36860810 aaaaagttaattttaatcttaatgcttgattcatttttaaattgttgattactaattcatgattaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttg 36860711  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  36860710 gacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgat 36860654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12910740 - 12910585
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12910740 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 12910641  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||  || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  12910640 acttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgat 12910585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 281
Target Start/End: Original strand, 28416339 - 28416469
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  28416339 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgcttgcaacatctt 28416438  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcat 281  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  28416439 ggacttaaaagtactattttatcgttggcat 28416469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15724875 - 15724718
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||    
T  15724875 gaaaaagttaattttaactttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaatatttt 15724776  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  15724775 ggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgat 15724718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32563527 - 32563370
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| |||||    
T  32563527 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataataatttatctagtaattcttgcaacatctt 32563428  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  32563427 agacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgat 32563370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35934283 - 35934126
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  35934283 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgaatcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaacatctt 35934184  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  35934183 ggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgat 35934126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 115 - 308
Target Start/End: Original strand, 13956116 - 13956307
Alignment:
Q  115 gagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 214  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||       ||||| ||||||||| || |||||||||||   | ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  13956116 gagcttctacggtgcagtcagaaagctgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgaaaaagtt--aaattgttgattactgattaatgat 13956213  T
Q  215 caatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  13956214 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgat 13956307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 43308448 - 43308605
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43308448 gaaaaagttaattttgattttagtatttgattcgtttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 43308547  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  43308548 cgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgat 43308605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 23116018 - 23116167
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         | |||||||||||| |||||    
T  23116018 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt--------cagtaatgcttgcaacatctt 23116109  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23116110 ggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgat 23116167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 30969113 - 30969269
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||    
T  30969113 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcagcatcttg 30969212  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30969213 aacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgat 30969269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 27318277 - 27318432
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaa-ttgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  27318277 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatctt 27318376  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
      ||||  |  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27318377 aaactt--atgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 27318432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 21088558 - 21088711
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  21088558 aaaaaattaactttaatcttaatgtttgattcatttttaaattg---attatttattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttg 21088654  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  21088655 gatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgat 21088711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8467112 - 8466988
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  8467112 aaaaagttaattttatttttaatgtttgattcatttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 8467013  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgtt 276  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||    
T  8467012 gacttacaaataatattttatcgtt 8466988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 187 - 308
Target Start/End: Original strand, 1428983 - 1429107
Alignment:
Q  187 tttaaattgttgattatt---gattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatat 283  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  1428983 tttaaattgttgaatattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatct 1429082  T
Q  284 ttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||| | |||| |||||    
T  1429083 ttaacatgcaaataaagtttatgat 1429107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43254240 - 43254154
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgct 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43254240 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26269196 - 26269069
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| |||||    
T  26269196 gaaaaagttaattttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtattgcttacaacatctt 26269097  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttgg 278  Q
      |||||||| |||||||||||| ||||    
T  26269096 aaacttacaggtactattttatccttgg 26269069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 23954552 - 23954734
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||||       ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||    
T  23954552 gggagcttctatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatta-------atg 23954644  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |      |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23954645 atcaatagtaattcatcaagtaatgttc-----atcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgat 23954734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 14919327 - 14919473
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||      || |||||| |||||    
T  14919327 gaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattttagatttctgattaatgatcaat-gtaattcatc------tgattgcaatatctt 14919419  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||    |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14919420 ggactt----atacaattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 14919473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 303
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824420
Alignment:
Q  211 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 303  Q
    ||||||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||  || | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttg 6824420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 112 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41961266 - 41961070
Alignment:
Q  112 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 211  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41961266 tgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgaattttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 41961167  T
Q  212 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  41961166 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgat 41961070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 7006754 - 7006911
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7006754 gaaaaagttaattttaatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 7006853  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7006854 ggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 7006911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 108 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44914097 - 44913894
Alignment:
Q  108 aaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgat 207  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||        ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44914097 aaaatgagagcttctacggtgcagtcagcaaactggtttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat 44913998  T
Q  208 taatgatcaatagtaattcat---ctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttga 304  Q
    | ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44913997 tcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttga 44913898  T
Q  305 tgat 308  Q
    ||||    
T  44913897 tgat 44913894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 113 - 301
Target Start/End: Original strand, 18494059 - 18494247
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18494059 gggagcttatacggtgtagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 18494158  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagt 301  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18494159 atcaatagcaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagt 18494247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 33660155 - 33660350
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33660155 gggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 33660254  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33660255 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgat 33660350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26357963 - 26357818
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26357963 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 26357864  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 297  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26357863 gacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaca 26357818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 11366158 - 11366354
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11366158 gggagcatctacggtgcagtcagaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 11366257  T
Q  213 atcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11366258 atcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 11366354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 33709048 - 33709205
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  33709048 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 33709147  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||| |||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33709148 ggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgat 33709205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 43770664 - 43770821
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43770664 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 43770763  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43770764 gaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 43770821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4764017 - 4763861
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  4764017 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttg 4763918  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4763917 gacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgat 4763861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 2325156 - 2325351
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2325156 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgattttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaata 2325255  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||||||    
T  2325256 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgat 2325351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4167347 - 4167152
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4167347 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatg 4167248  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  4167247 attaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgat 4167152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 151 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5881916 - 5881770
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5881916 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 5881817  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 297  Q
     ||||||||  ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  5881816 agacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaaca 5881770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41465926 - 41465731
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  41465926 gggagtttatatggtgcagttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcaattttaaattgttgattgctgattaatg 41465827  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  41465826 atcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgat 41465731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 19289139 - 19289296
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19289139 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatctt 19289238  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19289239 ggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgat 19289296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 176 - 302
Target Start/End: Original strand, 27349789 - 27349915
Alignment:
Q  176 tttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27349789 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgt 27349888  T
Q  276 tggcatatttaacatgcaaacagagtt 302  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||    
T  27349889 tggaatctttaacttgcaaacagagtt 27349915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 43648061 - 43648218
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||    
T  43648061 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcgacatctt 43648160  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43648161 ggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgat 43648218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 31570551 - 31570707
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||     
T  31570551 aaaaagttaattttcattttaatgattgattcatttttaaatatttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatctta 31570650  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31570651 aacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgat 31570707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35959279 - 35959126
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35959279 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 35959180  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||    |||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35959179 gg----acatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgat 35959126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 39167185 - 39167342
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||    
T  39167185 gaaaaagttaattttaatcttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattcataattaatagtaattcatctagtaatgctagcaacaattt 39167284  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39167285 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgat 39167342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 305
Target Start/End: Original strand, 19500739 - 19500885
Alignment:
Q  159 taattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttac 258  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||    
T  19500739 taattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattac 19500838  T
Q  259 agatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 305  Q
    |  |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  19500839 atgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgat 19500885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13711846 - 13711689
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||    
T  13711846 gaaaaaattaattttaatttaaatgattgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtattgtttgcaacatctt 13711747  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13711746 agacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgat 13711689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31862239 - 31862082
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||    
T  31862239 gaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtctacaatatctt 31862140  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  ||||||||||| || || ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  31862139 ggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgat 31862082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 115 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3177362 - 3177169
Alignment:
Q  115 gagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 214  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||       |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||    
T  3177362 gagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaattgttgattacttattcatgat 3177263  T
Q  215 caatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3177262 aaatagtaattcatctagtaatgcttgtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 3177169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 267
Target Start/End: Original strand, 19424417 - 19424574
Alignment:
Q  110 aatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta 209  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19424417 aatgggagcttctacggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgatta 19424516  T
Q  210 atgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactat 267  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  19424517 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcaggtactat 19424574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478595
Alignment:
Q  186 ttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatattt 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  286 aacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||| ||||||||||| ||||    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgat 4478595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 151 - 296
Target Start/End: Original strand, 41051116 - 41051260
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  41051116 gaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaacatctt 41051215  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaac 296  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41051216 gaacttacaggtactattttatccttggcat-tttaacatgcaaac 41051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 33550800 - 33550960
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatga----tcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaat 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  33550800 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactggttaataaataatcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacat 33550899  T
Q  248 cttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     |||||||| ||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33550900 attggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgat 33550960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37906098 - 37905940
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatct 249  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||    
T  37906098 gaaaaaattaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaattcttgcaacatct 37905999  T
Q  250 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||  |  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  37905998 tggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgat 37905940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 204 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44286283 - 44286179
Alignment:
Q  204 tgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  44286283 tgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttg 44286184  T
Q  304 atgat 308  Q
     ||||    
T  44286183 ttgat 44286179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 29241963 - 29242111
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |       |||||||    
T  29241963 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaattc-------atcttgg 29242055  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  29242056 acttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgat 29242111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 185 - 308
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264049
Alignment:
Q  185 tttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatt 284  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  285 taacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgat 4264049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 257
Target Start/End: Original strand, 41463407 - 41463512
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||     
T  41463407 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaacatctta 41463506  T
Q  252 gactta 257  Q
    ||||||    
T  41463507 gactta 41463512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33902400 - 33902321
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatcta 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33902400 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattacagattaataatcaataataattcatcta 33902321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19314186 - 19314074
Alignment:
Q  199 attattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggactt---acagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaa 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||   |||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  19314186 attactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaa 19314087  T
Q  296 cagagttgatgat 308  Q
    || ||||| ||||    
T  19314086 catagttgctgat 19314074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 250
Target Start/End: Original strand, 18257354 - 18257453
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||  || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18257354 gaaaaagttaattttaatattaataatttattcattttaaaattgtcgattactgattaatgataaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36642296 - 36642223
Alignment:
Q  230 taataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 303  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  36642296 taataatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttg 36642223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327950
Alignment:
Q  233 taatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgat 45327950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 45328114 - 45328028
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 200  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45328114 gggagcttctacggtgcagtcagaaa-ctgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 45328028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 308
Target Start/End: Original strand, 17071648 - 17071710
Alignment:
Q  246 atcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||    
T  17071648 atcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgat 17071710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 308
Target Start/End: Original strand, 18258197 - 18258260
Alignment:
Q  245 aatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18258197 aatcttagacttgcagttactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgat 18258260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 17053963 - 17054005
Alignment:
Q  167 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17053963 atcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 308
Target Start/End: Original strand, 17054007 - 17054069
Alignment:
Q  246 atcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  17054007 atcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgat 17054069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 17071604 - 17071646
Alignment:
Q  167 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17071604 atcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 308
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41463823
Alignment:
Q  264 ctattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgat 41463823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 46297522 - 46297717
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  46297522 gggagcttctacggtgcagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatg 46297621  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  46297622 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 46297717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 11357181 - 11357336
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11357181 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 11357280  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11357281 acttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgat 11357336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 26941020 - 26941215
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26941020 gggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaacgcttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 26941119  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26941120 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 26941215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1090070 - 1089913
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1090070 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttg 1089971  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgatgt 310  Q
    || ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1089970 gattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgt 1089913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 40552019 - 40552214
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||| | |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  40552019 gggagcttctacggtgcagtctggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaata 40552118  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  40552119 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 40552214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 112 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4015876 - 4015691
Alignment:
Q  112 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 211  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4015876 tgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 4015777  T
Q  212 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 297  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4015776 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaaca 4015691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 53228952 - 53229107
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  53228952 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttga 53229051  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  53229052 acttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 53229107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 22622478 - 22622673
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22622478 gggagcttttacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaatagttgattactgattaatg 22622577  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  22622578 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgat 22622673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 112 - 307
Target Start/End: Original strand, 33378544 - 33378739
Alignment:
Q  112 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 211  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||       |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33378544 tgggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttgattattgattaat 33378643  T
Q  212 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatga 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33378644 gatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatga 33378739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48355319 - 48355162
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  48355319 gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatctt 48355220  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  48355219 ggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 48355162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 151 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33698531 - 33698379
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  33698531 gaaaaagttaattttaatcttaatgactgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaatatctt 33698432  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 303  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33698431 agacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttg 33698379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 24707913 - 24708070
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  24707913 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaatttatctaataatgcttgcaacttctt 24708012  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  24708013 ggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgat 24708070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29099724 - 29099567
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29099724 gaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 29099625  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29099624 ggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 29099567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 44186315 - 44186472
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  44186315 gaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 44186414  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44186415 agacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgat 44186472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 52040722 - 52040877
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  52040722 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatcattcatctagtaatgtttgcaacatcttgg 52040821  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52040822 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgat 52040877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39283067 - 39282873
Alignment:
Q  114 ggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatga 213  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39283067 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 39282968  T
Q  214 tcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| | ||||||||    
T  39282967 ttaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgat 39282873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 7327281 - 7327437
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  7327281 aaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 7327380  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7327381 gacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgat 7327437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 297
Target Start/End: Original strand, 43975652 - 43975836
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||       |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43975652 gggagtttctacggtgcagtcagaaaactgactcttttgaaaaaattaatcttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatg 43975751  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 297  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43975752 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaaca 43975836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 308
Target Start/End: Original strand, 42505876 - 42506030
Alignment:
Q  154 aaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgga 253  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  42505876 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 42505975  T
Q  254 cttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||    
T  42505976 cttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgat 42506030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3362631 - 3362474
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||    
T  3362631 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatattgg 3362532  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgatgt 310  Q
    ||||  |  ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3362531 acttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgt 3362474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 14586478 - 14586634
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  14586478 gaaaaaattaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 14586577  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14586578 ggacttaccg-tactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgat 14586634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22451346 - 22451189
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22451346 gaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 22451247  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22451246 ggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgat 22451189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21194025 - 21193828
Alignment:
Q  111 atgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 210  Q
    |||||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21194025 atgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 21193926  T
Q  211 tgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    | |||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21193925 taatcaatagtaattcatttagtaatggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgat 21193828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 24488761 - 24488917
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24488761 aaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctagtaatgcttgcaacatcttg 24488860  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24488861 aacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 24488917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44891874 - 44891718
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  44891874 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 44891775  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  44891774 gacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgat 44891718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 308
Target Start/End: Original strand, 51212536 - 51212726
Alignment:
Q  112 tgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 211  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  51212536 tgggagcttctatggtgcagtcagaaaactgacatttttgaaaaagttaattttgatcttaat------ttcatttttaaattgttgatttttaattaat 51212629  T
Q  212 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  51212630 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 51212726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 308
Target Start/End: Original strand, 21009558 - 21009757
Alignment:
Q  110 aatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta 209  Q
    |||||||| || |||||| ||||||| |||||||        ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21009558 aatgggagtttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 21009657  T
Q  210 atgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  |||||||||    
T  21009658 atgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgat 21009757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 54506186 - 54506028
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatct 249  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |    
T  54506186 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacattt 54506087  T
Q  250 tggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||    
T  54506086 tggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgat 54506028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 115 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 47481937 - 47481743
Alignment:
Q  115 gagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47481937 gagcttctacggtacagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgat 47481838  T
Q  215 caatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||  || ||||| ||||||| |||||| |||||    
T  47481837 caatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgat 47481743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37158124 - 37157940
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  37158124 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatg 37158025  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 297  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  37158024 atcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgacatattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaaca 37157940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37203484 - 37203300
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  37203484 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatg 37203385  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 297  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  37203384 atcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgatatattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaaca 37203300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2008317 - 2008153
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta-------atgatcaatagtaattcatctaataatgcttgca 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  2008317 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgca 2008218  T
Q  244 aaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2008217 acatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 2008153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 151 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40936351 - 40936199
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  40936351 gaaaaagttaatttcaatcttaatgattgatttatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 40936252  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttg 303  Q
     ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40936251 agacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttg 40936199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 22445865 - 22446020
Alignment:
Q  153 aaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgg 252  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| || ||||    
T  22445865 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatatttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatacttgcaacattttgg 22445964  T
Q  253 acttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  22445965 acttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgat 22446020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 11356918 - 11357105
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||| | |||||| |||||||| ||||||       ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11356918 gggagcatctacggtgcagtcagacaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttggattcatttttaaattgttgattactaattaatg 11357017  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    || |||||||||        |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11357018 atgaatagtaat--------taatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgat 11357105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25580116 - 25579960
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  25580116 aaaaagttaatcttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatctta 25580017  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    || ||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25580016 gatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 25579960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 176 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34133288 - 34133156
Alignment:
Q  176 tttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34133288 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 34133189  T
Q  276 tggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  34133188 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgat 34133156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36012556 - 36012371
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaa-ttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaat 211  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||       ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36012556 gggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaat 36012457  T
Q  212 gatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 297  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36012456 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaaca 36012371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29164179 - 29164030
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||     
T  29164179 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatctta 29164087  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29164086 gacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 29164030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32373885 - 32373691
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||       ||||||||||||||| |||||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32373885 gggagcttctacggtacagtcgtgaaactgaattttttgaaaaagttaattttaatcttattgatgaattcatttt-aaattgttgattactgattaatg 32373787  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32373786 atcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgat 32373691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 4761447 - 4761603
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| || |||    
T  4761447 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgcaacattttg 4761546  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||| | ||||||||||    
T  4761547 gacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgat 4761603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38592051 - 38591919
Alignment:
Q  176 tttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  38592051 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgt 38591952  T
Q  276 tggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    || ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  38591951 tgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgat 38591919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 182 - 308
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994616
Alignment:
Q  182 tcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcat 281  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || ||    
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaat 46994589  T
Q  282 atttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     |||| |||||||||| | ||||||||    
T  46994590 ctttagcatgcaaacataattgatgat 46994616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 50475196 - 50475032
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgat-------caatagtaattcatctaataatgcttgca 243  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||       ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  50475196 gaaaaatttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgca 50475097  T
Q  244 aaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    | ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  50475096 acatcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgat 50475032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 3654997 - 3655157
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattc-atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattc--atctaataatgcttgcaaaat 247  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||    
T  3654997 gaaaatgttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatctagtaatgcttgcaacat 3655096  T
Q  248 cttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||| |  |  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  3655097 cttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgat 3655157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 230
Target Start/End: Original strand, 20373061 - 20373140
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatct 230  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20373061 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatct 20373140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 214 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174727
Alignment:
Q  214 tcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgat 45174727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 198 - 308
Target Start/End: Original strand, 54828546 - 54828656
Alignment:
Q  198 gattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  54828546 gattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaaca 54828645  T
Q  298 gagttgatgat 308  Q
     ||||||||||    
T  54828646 tagttgatgat 54828656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 297
Target Start/End: Original strand, 27480164 - 27480306
Alignment:
Q  159 taattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttg----caaaatcttggac 254  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||     || || ||||||    
T  27480164 taattttgttcttaatgttcgattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaattaacattttggac 27480263  T
Q  255 ttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaaca 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27480264 ttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaca 27480306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11467226 - 11467045
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||       |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  11467226 gggagcttctacggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaagttaattttattcttaatgattgattcatttttaaattgttg-------attaatg 11467134  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||       |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  11467133 atcaatagtaattcatcta-------ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgat 11467045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 276
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835556
Alignment:
Q  214 tcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgtt 276  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgtt 11835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 308
Target Start/End: Original strand, 20373137 - 20373199
Alignment:
Q  246 atcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20373137 atcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 20373199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348478
Alignment:
Q  223 attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgat 43348478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 295
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811676
Alignment:
Q  216 aatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaa 295  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||   || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaaa 53811676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 35844625 - 35844577
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttga 199  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35844625 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttga 35844577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43348592 - 43348556
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcattt 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43348592 gaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcattt 43348556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 3879698 - 3879893
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||| ||| |||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3879698 gggaccttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatg 3879797  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3879798 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgat 3879893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 6090941 - 6091136
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6090941 gggagcttctacggtgcagtcagaaaacttacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 6091040  T
Q  213 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6091041 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgat 6091136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1946221 - 1946064
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  1946221 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctaataatgcttgtaacatctt 1946122  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1946121 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 1946064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 110 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20768510 - 20768312
Alignment:
Q  110 aatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatta 209  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||       ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20768510 aatgggagcttctacggtgcagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttttaaattgttgattactgatta 20768411  T
Q  210 atgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  20768410 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgat 20768312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 33892809 - 33892966
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  33892809 gaaaaagttaattttaaccttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatctt 33892908  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  33892909 ggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgat 33892966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 7234829 - 7234989
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattg---attaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaat 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  7234829 gaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacat 7234928  T
Q  248 cttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7234929 cttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgat 7234989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5627817 - 5627621
Alignment:
Q  113 gggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||        ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5627817 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttaaaaaaattaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 5627718  T
Q  213 atcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5627717 atcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 5627621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 158 - 308
Target Start/End: Original strand, 4318626 - 4318776
Alignment:
Q  158 ttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggactta 257  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  4318626 ttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttt 4318725  T
Q  258 cagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |   |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4318726 cccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgat 4318776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 21016916 - 21017066
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  21016916 aaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 21017015  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21017016 gac------gtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgat 21017066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8513608 - 8513458
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  8513608 gaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaagatttt 8513516  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8513515 ggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgat 8513458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29182548 - 29182394
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  29182548 gaaaaagttaattttagtcttaatgattgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatca---gtaattcatctagtaatacttgcaacatctt 29182452  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||    
T  29182451 agacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgat 29182394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33619219 - 33619055
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgat---taatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatc 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  33619219 aaaaagttaattttaatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacata 33619120  T
Q  249 ttggacttacagatactattttatcgttggcat-----atttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||     | |||||||||||||| ||||||||||    
T  33619119 ttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgat 33619055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 278
Target Start/End: Original strand, 7054569 - 7054697
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatct 249  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| ||||    
T  7054569 gaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtttgcaacatct 7054668  T
Q  250 tggacttacagatactattttatcgttgg 278  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7054669 tggacttacagttactattttatcgttgg 7054697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6089283 - 6089133
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||    
T  6089283 gaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatttt 6089191  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6089190 ggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgat 6089133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 212
Target Start/End: Original strand, 33724062 - 33724117
Alignment:
Q  157 gttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33724062 gttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttaatgattaatg 33724117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 308
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353312
Alignment:
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgat 30353312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 408227 - 408384
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  408227 gaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 408326  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  408327 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 408384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 515 - 364
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  515 gaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 416  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  415 ggac------gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgat 364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 93900 - 94055
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  93900 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 93998  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  93999 gacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaatttgatgat 94055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12294 - 12139
Alignment:
Q  152 aaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  12294 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 12196  T
Q  252 gacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12195 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgat 12139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 154 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8271 - 8117
Alignment:
Q  154 aaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttgga 253  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8271 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 8172  T
Q  254 cttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||    
T  8171 cttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgat 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 107 - 308
Target Start/End: Original strand, 145769 - 145971
Alignment:
Q  107 taaaatgggagcttatacggtacagtcagaaaactgannnnnnngaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattga 206  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| |||       ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  145769 taaaaagggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttaattcatttttaaattttttattactga 145868  T
Q  207 ttaatgatcaatagta-attcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgat 305  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  145869 ttaatgatcaattgtatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgat 145968  T
Q  306 gat 308  Q
    |||    
T  145969 gat 145971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44343 - 44186
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||    
T  44343 gaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaactt 44244  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44243 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 44186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 154444 - 154601
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||    
T  154444 gaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaactt 154543  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  154544 ggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 154601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 267663 - 267515
Alignment:
Q  151 gaaaaagttaattttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatctt 250  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |         ||||||||||| |||| ||||||  |||||    
T  267663 gaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattggt---------taattcatctagtaattcttgcagcatctt 267573  T
Q  251 ggacttacagatactattttatcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  267572 ggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 267515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 101058 - 100994
Alignment:
Q  193 ttgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttaca 259  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  101058 ttgttgattactgattaatgatc--tagtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttaca 100994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 100994 - 100957
Alignment:
Q  271 atcgttggcatatttaacatgcaaacagagttgatgat 308  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  100994 atcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 100957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University