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Alignment Overview

Query: NF14735_high_1 (Length: 300)

Name: NF14735_high_1
Description: NF14735
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14735_high_1
NF14735_high_1
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (10-300)||(16744086-16744377)
chr3 (10-271)||(17912483-17912744)
chr3 (10-300)||(14842532-14842824)
chr3 (10-297)||(15858996-15859287)
chr3 (21-300)||(13838905-13839186)
chr3 (106-271)||(2449238-2449404)
chr3 (9-281)||(51158008-51158282)
chr3 (10-297)||(12030121-12030410)
chr3 (10-297)||(2049810-2050099)
chr3 (10-264)||(15936634-15936890)
chr3 (13-264)||(15938476-15938729)
chr3 (139-271)||(13975722-13975853)
chr3 (139-271)||(45860937-45861068)
chr3 (139-271)||(13954890-13955021)
chr3 (209-300)||(19231982-19232075)
chr3 (14-227)||(15614838-15615053)
chr3 (10-237)||(16821139-16821369)
chr3 (225-298)||(19260796-19260869)
chr3 (139-259)||(55316351-55316471)
chr3 (139-259)||(41270207-41270327)
chr3 (10-119)||(47984650-47984759)
chr3 (10-119)||(48003224-48003333)
chr3 (214-255)||(14080715-14080756)
chr3 (10-119)||(47993937-47994046)
chr3 (10-119)||(48012510-48012619)
chr3 (10-86)||(15468520-15468596)
chr3 (192-264)||(11986173-11986245)
chr3 (10-86)||(22275209-22275285)
chr3 (192-264)||(54651642-54651714)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (10-271)||(22907214-22907476)
chr8 (9-300)||(16193687-16193980)
chr8 (106-271)||(5238184-5238350)
chr8 (106-271)||(24661248-24661414)
chr8 (106-271)||(43685643-43685809)
chr8 (21-300)||(24928762-24929043)
chr8 (10-300)||(16404944-16405235)
chr8 (10-297)||(43373440-43373731)
chr8 (21-271)||(17345581-17345832)
chr8 (14-259)||(6774258-6774505)
chr8 (14-259)||(24548986-24549233)
chr8 (139-255)||(21844576-21844692)
chr8 (10-255)||(21851969-21852217)
chr8 (10-259)||(30120722-30120974)
chr8 (139-259)||(16674392-16674512)
chr8 (10-196)||(222754-222943)
chr8 (10-196)||(736377-736566)
chr8 (10-196)||(860272-860461)
chr8 (32-121)||(23837219-23837308)
chr8 (214-255)||(23149985-23150026)
chr8 (214-255)||(23226076-23226117)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (10-271)||(26680201-26680463)
chr4 (10-298)||(15675060-15675352)
chr4 (106-271)||(10488659-10488825)
chr4 (106-271)||(16327926-16328092)
chr4 (10-300)||(54118213-54118507)
chr4 (10-300)||(13246430-13246724)
chr4 (139-300)||(122020-122181)
chr4 (10-244)||(31115629-31115865)
chr4 (74-298)||(10104221-10104449)
chr4 (139-271)||(13048221-13048353)
chr4 (10-255)||(10644219-10644467)
chr4 (209-298)||(33240901-33240992)
chr4 (10-259)||(47357654-47357906)
chr4 (10-108)||(111395-111493)
chr4 (74-255)||(40885570-40885753)
chr4 (10-55)||(10104449-10104494)
chr4 (32-121)||(41166083-41166172)
chr4 (34-121)||(7185981-7186068)
chr4 (34-121)||(15044851-15044938)
chr4 (239-298)||(31132545-31132606)
chr4 (214-254)||(13809511-13809551)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (10-271)||(37066-37328)
[»] chr7 (21 HSPs)
chr7 (10-271)||(7293017-7293279)
chr7 (106-271)||(11516324-11516490)
chr7 (106-271)||(15441564-15441730)
chr7 (106-271)||(30262129-30262295)
chr7 (15-300)||(11580707-11580997)
chr7 (12-297)||(16211768-16212055)
chr7 (10-271)||(47481031-47481294)
chr7 (10-300)||(13036983-13037277)
chr7 (10-300)||(3059966-3060258)
chr7 (10-297)||(36052667-36052955)
chr7 (10-264)||(18253842-18254098)
chr7 (10-270)||(13321014-13321278)
chr7 (10-253)||(16478968-16479213)
chr7 (139-271)||(25292338-25292470)
chr7 (139-255)||(13572808-13572924)
chr7 (10-259)||(13911024-13911277)
chr7 (10-259)||(10989410-10989661)
chr7 (140-260)||(2437590-2437710)
chr7 (143-299)||(295936-296094)
chr7 (229-271)||(14113989-14114031)
chr7 (229-271)||(14423639-14423681)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (10-300)||(19206-19500)
scaffold0195 (10-271)||(21290-21553)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (10-297)||(19794676-19794967)
chr2 (10-300)||(36982410-36982704)
chr2 (106-271)||(19689401-19689567)
chr2 (106-271)||(23820168-23820334)
chr2 (106-271)||(14906440-14906606)
chr2 (15-300)||(462743-463030)
chr2 (106-271)||(20015108-20015274)
chr2 (10-298)||(24341360-24341652)
chr2 (10-300)||(8891242-8891536)
chr2 (10-300)||(43642926-43643220)
chr2 (10-300)||(20627284-20627576)
chr2 (10-271)||(25265390-25265653)
chr2 (139-271)||(17396653-17396784)
chr2 (10-221)||(7507894-7508107)
chr2 (10-259)||(19886661-19886913)
chr2 (32-88)||(19669279-19669335)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (10-300)||(1124-1416)
scaffold0266 (12-300)||(3553-3843)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (10-300)||(927-1218)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (106-271)||(20623066-20623232)
chr5 (106-271)||(21233528-21233694)
chr5 (10-297)||(23506965-23507254)
chr5 (109-271)||(37052844-37053007)
chr5 (10-298)||(18531038-18531330)
chr5 (106-271)||(16536294-16536460)
chr5 (10-298)||(22053804-22054096)
chr5 (10-300)||(27182516-27182810)
chr5 (106-269)||(25900408-25900571)
chr5 (21-271)||(34939289-34939540)
chr5 (139-259)||(29188284-29188404)
chr5 (10-259)||(4199985-4200237)
chr5 (10-259)||(22366481-22366733)
chr5 (10-259)||(25426628-25426880)
chr5 (10-256)||(18777995-18778244)
chr5 (141-255)||(27009975-27010089)
chr5 (10-259)||(12374-12626)
chr5 (10-256)||(43443398-43443647)
chr5 (10-259)||(19499899-19500151)
chr5 (10-259)||(21073595-21073847)
chr5 (14-58)||(29190478-29190522)
chr5 (34-121)||(19862232-19862319)
chr5 (34-121)||(23493942-23494029)
chr5 (214-255)||(21310709-21310750)
chr5 (214-255)||(23981516-23981557)
chr5 (10-86)||(17471768-17471844)
chr5 (192-264)||(32950879-32950951)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (10-300)||(48598-48890)
scaffold0023 (10-237)||(36093-36323)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (10-300)||(41394222-41394514)
chr1 (106-271)||(51452589-51452755)
chr1 (10-300)||(20931345-20931637)
chr1 (10-300)||(20445679-20445973)
chr1 (10-300)||(20531444-20531738)
chr1 (10-300)||(20913037-20913322)
chr1 (10-300)||(20893595-20893889)
chr1 (10-300)||(37844419-37844714)
chr1 (10-260)||(22227809-22228061)
chr1 (10-260)||(22232506-22232758)
chr1 (14-259)||(2116258-2116506)
chr1 (139-259)||(45051554-45051674)
chr1 (139-259)||(5072388-5072508)
chr1 (139-259)||(18601118-18601238)
chr1 (14-64)||(45051446-45051496)
chr1 (214-255)||(22143361-22143402)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (106-271)||(26892-27058)
scaffold0141 (106-264)||(22637-22796)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (106-271)||(1582-1748)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (10-300)||(6035-6326)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (10-297)||(12115-12403)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (21-300)||(171916-172197)
scaffold0001 (21-300)||(177619-177900)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (10-297)||(36885-37176)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (10-270)||(8849-9111)
scaffold0025 (10-297)||(148721-149012)
scaffold0025 (245-300)||(146838-146893)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (14-300)||(14626089-14626377)
chr6 (21-300)||(23153458-23153741)
chr6 (10-271)||(35009439-35009702)
chr6 (21-271)||(1657748-1657999)
chr6 (21-271)||(15862484-15862734)
chr6 (14-259)||(1650105-1650352)
chr6 (10-259)||(25175563-25175815)
chr6 (10-259)||(27653983-27654235)
chr6 (188-271)||(27751605-27751688)
chr6 (139-259)||(16825752-16825874)
chr6 (74-271)||(29665937-29666137)
chr6 (32-120)||(18381821-18381909)
chr6 (10-113)||(27740838-27740941)
chr6 (214-255)||(16887792-16887833)
chr6 (214-255)||(33324898-33324939)
chr6 (214-255)||(35136013-35136054)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (14-300)||(41733-42021)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (10-300)||(5031-5324)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (139-300)||(51153-51314)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (10-300)||(128140-128431)
scaffold0008 (10-237)||(31697-31928)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (10-264)||(48187-48443)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (10-300)||(123133-123427)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (16-300)||(272031-272317)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (10-300)||(26385-26678)
scaffold0162 (10-271)||(8180-8440)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (21-300)||(247411-247694)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (10-300)||(8878-9170)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (10-271)||(13506-13769)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (10-264)||(107747-108003)
scaffold0026 (139-255)||(64527-64648)
scaffold0026 (214-256)||(89863-89905)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (10-271)||(41648-41911)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (10-271)||(534-797)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (139-264)||(5660-5785)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (10-271)||(34460-34724)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (139-300)||(89423-89586)
scaffold0028 (220-300)||(107753-107835)
scaffold0028 (214-255)||(79745-79786)
scaffold0028 (32-88)||(79560-79616)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (14-260)||(2966-3215)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (14-237)||(9371-9596)
scaffold0215 (14-237)||(16269-16494)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (10-221)||(3722-3936)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (10-236)||(42997-43226)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (139-259)||(13325-13445)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (139-255)||(167-283)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (10-221)||(5254-5466)
scaffold0022 (214-254)||(102923-102963)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (10-108)||(9382-9480)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (139-259)||(1304-1424)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (10-260)||(21115-21367)
scaffold0139 (139-237)||(14083-14181)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (10-99)||(48514-48603)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (188-271)||(3370-3453)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (10-221)||(54416-54630)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (10-99)||(26-115)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (214-255)||(1546-1587)
scaffold0456 (214-255)||(8691-8732)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (214-255)||(8216-8257)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (146-264)||(56106-56226)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (214-255)||(70307-70348)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (217-255)||(1348-1386)
scaffold0409 (217-255)||(9603-9641)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (214-255)||(22422-22463)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (214-255)||(93773-93814)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744086
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16744377 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 16744278  T
110 caactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
16744277 caactataacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttatt 16744178  T
209 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16744177 atcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 16744086  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912483
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
17912744 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt 17912645  T
110 caactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||     
17912644 caactacaacatatcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 17912545  T
209 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
17912544 atcaattcatgcatacaaacatatcatc-aagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842532
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
14842824 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 14842725  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
14842724 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattat 14842625  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
14842624 cttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatt 14842532  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15858996
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
15859287 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 15859188  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
15859187 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 15859088  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||    
15859087 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaa 15858996  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839186
Alignment:
21 catgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 120  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||     
13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
121 tgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 218  Q
    |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
13839005 tagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcat 13839104  T
219 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
13839105 gcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 13839186  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2449404 - 2449238
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
2449404 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 2449305  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
2449304 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158008
Alignment:
9 acatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 108  Q
    ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
51158282 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 51158183  T
109 tcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
      ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
51158182 ctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 51158083  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 281  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
51158082 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaatt 51158008  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030121
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | | | ||||||||| |||||||||| |  |||| |    
12030410 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat 12030311  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
12030310 taacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 12030211  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaa 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
12030210 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaagtcatacaacatttgaaa 12030121  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050099
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | | ||||||||| |||| ||||| | ||||| |    
2049810 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat 2049909  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||| | ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
2049910 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 2050009  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaa 297  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
2050010 catcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattgatacaacatttgaaa 2050099  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936634
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
15936890 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 15936791  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
15936790 taacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 15936691  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 264  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
15936690 catcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938476
Alignment:
13 catcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaa 112  Q
    |||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||    
15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
113 ctacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattat 210  Q
    | ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||    
15938629 caacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 15938530  T
211 caattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 264  Q
    |||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||    
15938529 caattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13975853 - 13975722
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| |||||||||||    
13975853 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaa 13975755  T
239 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
13975754 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 271
Target Start/End: Original strand, 45860937 - 45861068
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| |||||||||||    
45860937 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaa 45861035  T
239 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
45861036 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13955021 - 13954890
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| |||||||||||    
13955021 gcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaa 13954923  T
239 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
13954922 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 300
Target Start/End: Original strand, 19231982 - 19232075
Alignment:
209 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
19231982 atcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 19232075  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615053
Alignment:
14 atcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 113  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||| | | ||| | |||    
15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
114 tacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 211  Q
     | ||| | |  ||||||| | |||  |||| || |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||    
15614938 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatc 15615037  T
212 aattcatgcatacaaa 227  Q
    ||||||||||||||||    
15615038 aattcatgcatacaaa 15615053  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821369
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |    
16821139 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 16821238  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
    |||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  ||||| |||  ||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
16821239 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16821338  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatca 237  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||    
16821339 tcatcaatttatgcatacaaacataacatca 16821369  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260796
Alignment:
225 aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa 298  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaa 19260796  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 55316351 - 55316471
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
55316351 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 55316450  T
239 agttggagcacgaatttagca 259  Q
    ||   ||||||||||||||||    
55316451 agcaagagcacgaatttagca 55316471  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 41270207 - 41270327
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| |||   |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
41270207 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 41270306  T
239 agttggagcacgaatttagca 259  Q
    ||   ||||||||||||||||    
41270307 agcaagagcacgaatttagca 41270327  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984759
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||     
47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
110 caactacaac 119  Q
    |||| |||||    
47984750 caacaacaac 47984759  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003333
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||     
48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
110 caactacaac 119  Q
    |||| |||||    
48003324 caacaacaac 48003333  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994046
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||     
47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
110 caactacaac 119  Q
    |||| |||||    
47994037 caacaacaac 47994046  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012619
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||     
48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
110 caactacaac 119  Q
    |||| |||||    
48012610 caacaacaac 48012619  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468520
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 86  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
15468596 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat 15468520  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11986245 - 11986173
Alignment:
192 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 264  Q
    ||||||||||| |||| || || ||||||| || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
11986245 acaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 11986173  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Original strand, 22275209 - 22275285
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 86  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
22275209 catcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat 22275285  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 264
Target Start/End: Original strand, 54651642 - 54651714
Alignment:
192 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 264  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||    
54651642 acaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaat 54651714  T

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Target: chr8 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907214
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22907476 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 22907377  T
110 caactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
22907376 caactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 22907277  T
209 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22907276 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193687
Alignment:
9 acatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 108  Q
    ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||| | |||||     
16193980 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa 16193881  T
109 tcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
    | ||| ||||  || |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |||    
16193880 ttaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatta 16193781  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
16193780 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaattcatacaatatttgaaaatt 16193687  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 5238184 - 5238350
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
5238184 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 5238283  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
5238284 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24661414 - 24661248
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
24661414 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 24661315  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
24661314 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 43685643 - 43685809
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
43685643 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 43685742  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
43685743 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928762
Alignment:
21 catgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 120  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || | | ||| ||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||     
24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
121 tgtc-aaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 218  Q
    |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
24928943 tagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 24928844  T
219 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24928843 gcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 24928762  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16404944
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
16405235 catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt 16405136  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
16405135 taac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 16405039  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
16405038 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 16404944  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373440
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | | | ||||||||| |||||||||| | ||||| |    
43373731 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 43373632  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| | ||||    
43373631 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataattat 43373532  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 297  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
43373531 catcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaa 43373440  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345832
Alignment:
21 catgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 120  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||| | | |||     
17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataact 17345679  T
121 tgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 218  Q
    |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
17345680 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 17345779  T
219 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
17345780 gcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774258
Alignment:
14 atcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 113  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| | |||    
6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
114 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 211  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
6774405 aataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 6774306  T
212 aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||    
6774305 aattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549233
Alignment:
14 atcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 113  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||| | | ||| | |||    
24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
114 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 211  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
24549086 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 24549185  T
212 aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||    
24549186 aattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21844692 - 21844576
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||     
21844692 gcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 21844593  T
239 agttggagcacgaattt 255  Q
    ||   ||||||||||||    
21844592 agcaagagcacgaattt 21844576  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851969
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
21852217 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat 21852118  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| | |    
21852117 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca 21852018  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
21852017 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21851969  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30120974
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |    
30120722 catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 30120821  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||    
30120822 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 30120921  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
      || |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
30120922 acataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16674512 - 16674392
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||| ||||||| |||||     
16674512 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatcac 16674413  T
239 agttggagcacgaatttagca 259  Q
    ||   ||||||||||||||||    
16674412 agaaagagcacgaatttagca 16674392  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222754
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
222943 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 222844  T
110 caactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 196  Q
     ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||    
222843 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 222754  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736377
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
736566 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 736467  T
110 caactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 196  Q
     ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||    
736466 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 736377  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860272
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
860461 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 860362  T
110 caactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 196  Q
     ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||    
860361 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 860272  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 121
Target Start/End: Original strand, 23837219 - 23837308
Alignment:
32 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 121  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||||    
23837219 atacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacat 23837308  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Original strand, 23149985 - 23150026
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
23149985 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 23150026  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23226117 - 23226076
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
23226117 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 23226076  T

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Target: chr4 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680463
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26680201 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 26680300  T
110 caactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
26680301 caactacaacatgtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 26680400  T
209 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
26680401 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675060
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
15675252 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 15675153  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaa 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| |||||||||||    
15675152 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaa 15675060  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 10488659 - 10488825
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
10488659 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 10488758  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
10488759 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16328092 - 16327926
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
16328092 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16327993  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16327992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118213
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || |||     
54118507 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc 54118408  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||| || | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
54118407 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 54118308  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
54118307 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 54118213  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246724
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
13246430 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 13246529  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
13246530 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 13246629  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
13246630 cattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 13246724  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 139 - 300
Target Start/End: Original strand, 122020 - 122181
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
122020 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 122119  T
239 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
122120 agttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatt 122181  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115865
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
110 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |  |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
31115729 caacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 31115828  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
31115829 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10104449 - 10104221
Alignment:
74 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatat 171  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||     
10104449 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataa 10104350  T
172 ttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca- 270  Q
    || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||     
10104349 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaa 10104250  T
271 -taatcaaaattcatacaacatttgaaaa 298  Q
     ||   ||||||||||| |||||||||||    
10104249 ttatgaaaaattcataccacatttgaaaa 10104221  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13048353 - 13048221
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||  |    
13048353 gcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgcatacaaacatatcattga 13048254  T
239 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
13048253 agttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 255
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644467
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |    
10644219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 10644318  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
    |||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||| |||    
10644319 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 10644418  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
10644419 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 10644467  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 298
Target Start/End: Original strand, 33240901 - 33240992
Alignment:
209 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| |||||||||||    
33240901 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaa 33240992  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357906
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
47357654 catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 47357753  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
47357754 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 47357853  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
      |||||| |||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
47357854 acatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111493
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 108  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
111395 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 111493  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40885753 - 40885570
Alignment:
74 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacata- 170  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  |||| |||| | |||  ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||     
40885753 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatac 40885655  T
171 tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
40885654 tttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 10104494 - 10104449
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaac 55  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
10104494 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaac 10104449  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 41166172 - 41166083
Alignment:
32 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || |  | ||||||||| |||||||    
41166172 atacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacat 41166083  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 7186068 - 7185981
Alignment:
34 acccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 121  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
7186068 acccaagccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 7185981  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 121
Target Start/End: Original strand, 15044851 - 15044938
Alignment:
34 acccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 121  Q
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15044851 acccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 15044938  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 298
Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132606
Alignment:
239 agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| |||||||||||    
31132545 agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaa 31132606  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13809551 - 13809511
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
13809551 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt 13809511  T

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Target: scaffold0078 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 37328 - 37066
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
37328 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc 37229  T
110 caactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
37228 caactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 37129  T
209 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
37128 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

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Target: chr7 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293279
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7293017 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 7293116  T
110 caactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
7293117 caacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 7293216  T
209 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
7293217 attaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 11516324 - 11516490
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
11516324 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 11516423  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
11516424 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15441730 - 15441564
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
15441730 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 15441631  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
15441630 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30262295 - 30262129
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
30262295 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 30262196  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
30262195 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580707
Alignment:
15 tcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaact 114  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||     
11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
115 acaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatca 212  Q
    ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||    
11580897 acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 11580798  T
213 attcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat---caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    |||||||||||||||||||||||||    
11580797 attcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattatgcaaaaaattcatacaacatttgaaaatt 11580707  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 297
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16212055
Alignment:
12 tcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattca 111  Q
    |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
16211768 tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta 16211867  T
112 actacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatta 209  Q
    || ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || ||||||| |||| |||| |    
16211868 acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatca 16211967  T
210 tcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
16211968 tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaattcatacaacatttgaaa 16212055  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481031
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
47481294 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 47481195  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||| |||    
47481194 caacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 47481096  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
47481095 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13036983
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||     
13037277 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc 13037178  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| ||||    
13037177 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattat 13037078  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
13037077 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 13036983  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060258
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||   | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
3059966 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 3060065  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| |||||||  || |||||||| || || |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||| |  |||| |||    
3060066 taacaacaacttaacaaaattca-ccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta 3060164  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
3060165 tcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatataacatttgaaaatt 3060258  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36052955
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
36052667 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 36052766  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| | ||||    
36052767 taac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataattat 36052863  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 297  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
36052864 catcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaa 36052955  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253842
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
18254098 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 18253999  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
18253998 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 18253899  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 264  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
18253898 catcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 270
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321278
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| ||||||  || | |||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
13321014 catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 13321113  T
110 caacta-caacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||| | |||| |  |||| |||| | |||  ||||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||| ||| | ||||||||||||||| |    
13321114 caacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt-cataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaat 13321212  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca 270  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
13321213 tatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478968
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| |    
16479213 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat 16479114  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||  | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
16479113 taaaaataacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 16479014  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaat 253  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||    
16479013 catcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaat 16478968  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25292470 - 25292338
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| |||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||||||||||||    
25292470 gcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatacatacaaacatatcatcaa 25292371  T
239 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
25292370 agttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 255
Target Start/End: Original strand, 13572808 - 13572924
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||     
13572808 gcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 13572907  T
239 agttggagcacgaattt 255  Q
    ||   ||||||||||||    
13572908 agcaagagcacgaattt 13572924  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13911024
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |    
13911277 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 13911178  T
110 caactacaacat---gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactt 205  Q
    |||| ||||| |   |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||||||||| ||    
13911177 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 13911078  T
206 attatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    ||||||||||||||||    
13911077 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 13911024  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989661
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
10989410 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 10989509  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     | | ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||    
10989510 ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 10989608  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
10989609 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 2437590 - 2437710
Alignment:
140 cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaa 239  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
2437590 cacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcaca 2437689  T
240 gttggagcacgaatttagcaa 260  Q
        |||||||||||||||||    
2437690 acaagagcacgaatttagcaa 2437710  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 296094 - 295936
Alignment:
143 aattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 242  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| ||| | |||||||||||||   |||| ||| ||||||||| ||||||||| || |  | ||    
296094 aatttttataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaatt 295995  T
243 ggagcacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaa-ttcatacaacatttgaaaat 299  Q
     || |||||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||  |||||||||    
295994 agaacacgaatttagcaacaattattcattatgcaaaatttcatacaaagtttgaaaat 295936  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14114031 - 14113989
Alignment:
229 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
14114031 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14113989  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14423681 - 14423639
Alignment:
229 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
14423681 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14423639  T

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Target: scaffold0195 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19500
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
19306 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 19405  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
19406 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 19500  T

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Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21553
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
21390 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 21489  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
21490 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

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Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794676
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |   || ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
19794967 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 19794868  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
19794867 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 19794768  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
19794767 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa 19794676  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982410
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
36982704 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 36982605  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| ||||| || |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||    
36982604 caacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaattat 36982505  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
36982504 catcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 36982410  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19689567 - 19689401
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
19689567 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 19689468  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19689467 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 23820168 - 23820334
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
23820168 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 23820267  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
23820268 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14906606 - 14906440
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
14906606 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 14906507  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
14906506 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 300
Target Start/End: Original strand, 462743 - 463030
Alignment:
15 tcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaact 114  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||     
462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
115 acaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 211  Q
    ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||    
462843 acaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc 462941  T
212 aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
462942 aattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatt 463030  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 20015108 - 20015274
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
20015108 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaat 20015207  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20015208 tattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341360
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||  ||| | ||||||||||||||| ||||    
24341552 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaattat 24341453  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaa 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| |||||||||||    
24341452 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaa 24341360  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891536
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
8891242 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 8891341  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| ||||    
8891342 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaattat 8891441  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
8891442 catcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 8891536  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642926
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |    
43643220 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat 43643121  T
110 caactacaac-atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||  ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
43643120 taataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 43643021  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   |||||||||||||||||||||||||    
43643020 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 43642926  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627284
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| || | | || |||||||| |||||||| | | ||||| |    
20627576 catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat 20627477  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||||| |||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
20627476 taacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 20627377  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
20627376 catcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataatcataattcatacaatatttgaaaatt 20627284  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265390
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |  ||  | |  ||||    
25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| |||||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
25265553 caacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 25265454  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
25265453 catcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17396784 - 17396653
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
17396784 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 17396686  T
239 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
17396685 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgca-caagaatcatagctcaat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||||||  | || |||||||| ||||||    
7508107 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 7508008  T
109 tcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactt 205  Q
    | ||| ||||| | | |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||    
7508007 t-aacaacaacttagccaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 7507910  T
206 attatcaattcatgca 221  Q
    || |||||||||||||    
7507909 atcatcaattcatgca 7507894  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886661
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
19886913 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19886814  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
19886813 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19886714  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
19886713 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 19669335 - 19669279
Alignment:
32 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 88  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
19669335 atacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattg 19669279  T

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Target: scaffold0266 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1416
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| | || ||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
1124 catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 1223  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
1224 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 1323  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
1324 tatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagaaaaattcatacaacatttgaaaatt 1416  T

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Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3553
Alignment:
12 tcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattca 111  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||  | |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| | |    
3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
112 actacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatta 209  Q
    || ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |    
3743 acaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3644  T
210 tcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
3643 tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataatcaaaattcatacaacttttgaaaatt 3553  T

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Target: scaffold0175 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 927
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| | | |||||||    
1218 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt 1119  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||||| |||  |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
1118 -aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 1020  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
1019 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatt 927  T

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Target: chr5 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 20623066 - 20623232
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
20623066 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 20623165  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20623166 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21233694 - 21233528
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
21233694 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 21233595  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
21233594 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507254
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
23506965 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 23507064  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
23507065 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 23507164  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaa 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
23507165 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaa 23507254  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 109 - 271
Target Start/End: Original strand, 37052844 - 37053007
Alignment:
109 tcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
37052844 tcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 37052943  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
37052944 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18531038
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
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18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
18531230 caacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18531132  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-attcatacaacatttgaaaa 298  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||| |||||||||||    
18531131 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaacattcataccacatttgaaaa 18531038  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 16536294 - 16536460
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
16536294 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16536393  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16536394 tattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053804
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | |||||||||||||||  |||    
22053996 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactat 22053897  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaa 298  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| |||||||||||    
22053896 catcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaa 22053804  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182516
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
27182810 catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 27182711  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| ||||    
27182710 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattat 27182611  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
27182610 catcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 27182516  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25900571 - 25900408
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |    
25900571 aattcaacaacaacatgtcaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaat 25900473  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc 269  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
25900472 tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939540
Alignment:
21 catgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 120  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||| | |  ||     
34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caatgact 34939387  T
121 tgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 218  Q
    |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
34939388 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 34939487  T
219 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
34939488 gcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29188404 - 29188284
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
29188404 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 29188305  T
239 agttggagcacgaatttagca 259  Q
    |||  |||||||||| |||||    
29188304 agtaagagcacgaatctagca 29188284  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4199985
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |    
4200237 catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 4200138  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
    |||| |||||||  |  ||||||| | |||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||    
4200137 caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 4200038  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| |    ||||||||||||||||    
4200037 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 4199985  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366481
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| |    
22366733 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat 22366634  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
22366633 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 22366534  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
22366533 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426880
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
25426628 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25426727  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
25426728 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25426827  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
25426828 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18777995
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | ||  ||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
18778244 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 18778145  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
18778144 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 18778045  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 256  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
18778044 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 18777995  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 255
Target Start/End: Original strand, 27009975 - 27010089
Alignment:
141 acaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaag 240  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
27009975 acaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacag 27010074  T
241 ttggagcacgaattt 255  Q
       ||||||||||||    
27010075 caagagcacgaattt 27010089  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12626
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
12374 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 12473  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
12474 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 12573  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
12574 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443398
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||| ||| | ||||| |    
43443647 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat 43443548  T
110 caactacaacatgtca--aattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
    |||| ||||| |   |  |||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||    
43443547 caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 43443448  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 256  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
43443447 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 43443398  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500151
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
19499899 catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19499998  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
19499999 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19500098  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
19500099 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073595
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
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21073847 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 21073748  T
110 caactacaacatgtca--aattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |   |  |||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
21073747 taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 21073648  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
      ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
21073647 acatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190478
Alignment:
14 atcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactat 58  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
29190522 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactat 29190478  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 121
Target Start/End: Original strand, 19862232 - 19862319
Alignment:
34 acccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 121  Q
    |||||||  |||| |||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| || || || | ||||||||| |||||||    
19862232 acccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacat 19862319  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 121
Target Start/End: Original strand, 23493942 - 23494029
Alignment:
34 acccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 121  Q
    |||||||| |||| |||||| | | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
23493942 acccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 23494029  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21310750 - 21310709
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
21310750 ttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 21310709  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23981557 - 23981516
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
23981557 ttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaattt 23981516  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17471844 - 17471768
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 86  Q
    |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
17471844 catcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat 17471768  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 264
Target Start/End: Original strand, 32950879 - 32950951
Alignment:
192 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 264  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||| || || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
32950879 acaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 32950951  T

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Target: scaffold0023 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48890
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
48598 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 48697  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     | | ||||| |  |||| |||| | | |  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
48698 tagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 48797  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
48798 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatt 48890  T

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Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36323
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||  ||| | || |||  | |||||| |||| ||| |||||| | ||||| |    
36093 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat 36192  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||| | |||||||||||||||  ||    
36193 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 36292  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatca 237  Q
      |||||||||| |||||||||||| |||||    
36293 acatcaattcatacatacaaacataacatca 36323  T

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Target: chr1 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394514
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||| |||||||||||  ||||||||| | |||||      
41394222 catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca 41394321  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||||| ||||    
41394322 taacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattat 41394421  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41394422 catcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 41394514  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 51452589 - 51452755
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
51452589 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 51452688  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
51452689 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931637
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
20931345 catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 20931444  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||  |  |||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
20931445 taacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 20931544  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
20931545 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaacttcatacaacaattgaaaatt 20931637  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20445973
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||||| | |||||    
20445679 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20445778  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
20445779 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 20445878  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
20445879 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 20445973  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531738
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||||| | |||||    
20531444 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20531543  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
20531544 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 20531643  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
20531644 catcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 20531738  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913322
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||| |||| || | | ||||||||||| ||||||||||      ||||    
20913037 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca------aatt 20913130  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
20913131 -aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 20913229  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
20913230 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaagcaaaattcatacaacaattgaaaatt 20913322  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893595
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| ||   | ||||||||||| ||||||||||||  |||||     
20893889 catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc 20893790  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| ||||    
20893789 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattat 20893690  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
20893689 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 20893595  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844419
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
37844714 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 37844615  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttca-taacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |||| |||||  |||  |||||||||||| ||  || |||||| | | || || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
37844614 taacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 37844515  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
37844514 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 37844419  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228061
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
22227809 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22227908  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||| ||||    
22227909 taacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattat 22228008  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 260  Q
     ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||    
22228009 catcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 22228061  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232758
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
22232506 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22232605  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||| ||||    
22232606 taacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattat 22232705  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 260  Q
     ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||    
22232706 catcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 22232758  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116506
Alignment:
14 atcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagc-tcaattcaa 112  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||| |   |||| | ||    
2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
113 ctacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattat 210  Q
    | | ||| |  |||| |||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||    
2116358 caataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 2116457  T
211 caattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||| |||||    
2116458 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagca 2116506  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 45051554 - 45051674
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||     
45051554 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcac 45051653  T
239 agttggagcacgaatttagca 259  Q
    |||  || ||||||| |||||    
45051654 agtaagaacacgaatctagca 45051674  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5072508 - 5072388
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||     
5072508 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcac 5072409  T
239 agttggagcacgaatttagca 259  Q
    ||   ||||||||||||||||    
5072408 agcaagagcacgaatttagca 5072388  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18601238 - 18601118
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
18601238 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 18601139  T
239 agttggagcacgaatttagca 259  Q
    ||   ||||| ||||||||||    
18601138 agcaagagcatgaatttagca 18601118  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Original strand, 45051446 - 45051496
Alignment:
14 atcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 64  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
45051446 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaataacatc 45051496  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22143402 - 22143361
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
22143402 ttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattt 22143361  T

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Target: scaffold0141 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Original strand, 26892 - 27058
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
26892 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 26991  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
26992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

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Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 264
Target Start/End: Original strand, 22637 - 22796
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
22637 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 22736  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22737 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1748 - 1582
Alignment:
106 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
1748 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 1649  T
205 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
1648 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

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Target: scaffold0413 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 6035
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||   |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||| | |||||||    
6326 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt 6227  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
6226 -aacaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 6128  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
6127 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatt 6035  T

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Target: scaffold0302 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12403
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | |||||||    
12115 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt 12214  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
      || ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||    
12215 --acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaattat 12312  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaa 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
12313 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaatttcatacagcatttgaaa 12403  T

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Target: scaffold0001 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172197
Alignment:
21 catgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 120  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||     
171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
121 tgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 218  Q
    |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
172016 tagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcat 172115  T
219 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
172116 ccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatt 172197  T

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Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177900
Alignment:
21 catgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 120  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||     
177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
121 tgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 218  Q
    |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
177719 tagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcat 177818  T
219 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
177819 ccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatt 177900  T

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Target: scaffold0077 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36885
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||     
37176 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc 37077  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||| | |||| ||||    
37076 caaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaattat 36977  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
36976 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa 36885  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 270
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9111
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | ||| ||||||||||| |||  ||||||| |||||||    
8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
8949 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 9048  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca 270  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
9049 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatcca 9111  T

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Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Original strand, 148721 - 149012
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| || | | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
148721 catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 148820  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
148821 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 148920  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||||||||    
148921 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa 149012  T

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Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Original strand, 146838 - 146893
Alignment:
245 agcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
146838 agcatgaatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatt 146893  T

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Target: chr6 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626089
Alignment:
14 atcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 113  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||| | ||||| | |||    
14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
114 tacaacatgtca-aattcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattat 210  Q
     ||||| |  || |||||| ||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||    
14626277 aacaacttagcataattca-ccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 14626179  T
211 caattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
14626178 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaattcaaacaacatttgagaatt 14626089  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153741
Alignment:
21 catgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 120  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||| || | | || |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||     
23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
121 tgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 218  Q
    |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
23153558 tagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 23153657  T
219 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
23153658 gcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 23153741  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009439
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |  ||  | |  ||||    
35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| |||||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
35009602 caacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 35009503  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
35009502 catcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657748
Alignment:
21 catgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 120  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||| | | |||     
1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataact 1657901  T
121 tgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 218  Q
    |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
1657900 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 1657801  T
219 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
1657800 gcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862734
Alignment:
21 catgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 120  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||| | | |||     
15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaattca-caataact 15862581  T
121 tgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 218  Q
    |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
15862582 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 15862681  T
219 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
15862682 gcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650105
Alignment:
14 atcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 113  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| | |||    
1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
114 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 211  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
1650252 cataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 1650153  T
212 aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||||||| |||||    
1650152 aattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagca 1650105  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175815
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
25175563 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25175662  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
25175663 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25175762  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||    
25175763 acatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca 25175815  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27653983
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||| | | |||||||||| | ||||| |    
27654235 catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat 27654136  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
27654135 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 27654036  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 259  Q
      |||||||||||||||||| |||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
27654035 acatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 271
Target Start/End: Original strand, 27751605 - 27751688
Alignment:
188 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| | ||||||    
27751605 accaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16825874 - 16825752
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatca--tacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc 236  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |  ||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
16825874 gcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatc 16825775  T
237 aaagttggagcacgaatttagca 259  Q
    | ||   ||||||||||||||||    
16825774 acagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 271
Target Start/End: Original strand, 29665937 - 29666137
Alignment:
74 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatat 171  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | ||||||| ||||||||  ||||| | ||||     
29665937 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatgcatac 29666035  T
172 tt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc 269  Q
    ||  ||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||  || ||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||    
29666036 tttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatcc 29666135  T
270 at 271  Q
    ||    
29666136 at 29666137  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 18381909 - 18381821
Alignment:
32 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 120  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| ||||||    
18381909 atacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca 18381821  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Original strand, 27740838 - 27740941
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||| || | ||||||   ||  | |||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||    
27740838 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 27740937  T
110 caac 113  Q
    ||||    
27740938 caac 27740941  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16887833 - 16887792
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
16887833 ttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattt 16887792  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Original strand, 33324898 - 33324939
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
33324898 ttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt 33324939  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35136054 - 35136013
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
35136054 ttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt 35136013  T

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Target: scaffold0106 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Original strand, 41733 - 42021
Alignment:
14 atcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 113  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| || | | | ||||||||| |||||||||||| ||||||  |||    
41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac 41832  T
114 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 211  Q
     ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||||| ||||||||| | |||| ||| | |||||||||   ||| |||| |||    
41833 aacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatc 41932  T
212 aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
41933 aattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatt 42021  T

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Target: scaffold0218 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 5031
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||| |     
5324 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 5225  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| | | | |||||||||| |||| ||||    
5224 taacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaattat 5125  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
5124 catcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatt 5031  T

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Target: scaffold0018 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 139 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 51314 - 51153
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
51314 gcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 51215  T
239 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
51214 agttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatt 51153  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128140
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||  | |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | |||||||    
128431 catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt 128332  T
110 caactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| |||||  ||  | |||| |||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
128331 -aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 128233  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
128232 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacttttgaaaatt 128140  T

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Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31697
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||  | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |    
31928 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 31829  T
110 caactacaacat---gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactt 205  Q
    |||| ||||| |   |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||| | |||||||||||||||  |    
31828 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact 31729  T
206 attatcaattcatgcatacaaacatatcatca 237  Q
    |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
31728 aacatcaattcatgcattcaaacataacatca 31697  T

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Target: scaffold0049 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 264
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48443
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
48187 catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 48286  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
48287 taacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 48386  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 264  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
48387 catcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

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Target: scaffold0011 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123133
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||| || |||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || |||     
123427 catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc 123328  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
123327 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 123228  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||    
123227 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgcaaatt 123133  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 300
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272317
Alignment:
16 caatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacta 115  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |    
272031 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca 272130  T
116 caacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaa 213  Q
    |||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||| |||| |||||    
272131 caacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaa 272230  T
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
272231 ttcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatt 272317  T

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Target: scaffold0162 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26385
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||| ||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||| |     
26678 catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 26579  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| | | | ||||| |||| |||| ||||    
26578 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaattat 26479  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
26478 catcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatt 26385  T

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Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8440 - 8180
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |  ||  | |  ||||    
8440 catcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 8341  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    ||||   |||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||| || ||| | ||||||||||||||| ||||    
8340 caac---aacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattat 8244  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
8243 caccaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247411
Alignment:
21 catgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 120  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||   | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||     
247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
121 tgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 218  Q
    |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | |||  |||||||||| |||| ||||||||||    
247594 tagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcat 247495  T
219 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
247494 gcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 247411  T

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Target: scaffold0498 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9170
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
8878 catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 8977  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| |||||| || |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
8978 taacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 9077  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
9078 catcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataagcaaaattcgtacaacttttgaaaatt 9170  T

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Target: scaffold0132 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Original strand, 13506 - 13769
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |  ||  | |  ||||    
13506 catcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 13605  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
    |||| |||||||  |||| |||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
13606 caacaacaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 13705  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
13706 catcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 264
Target Start/End: Original strand, 107747 - 108003
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
107747 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 107846  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||| | || |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
107847 taacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 107946  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 264  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
107947 catcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

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Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 64648 - 64527
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc-----aattcatgcatacaaacatatc 233  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || |||     |||||||||||| ||||||| |    
64648 gcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaatataattcatgcatataaacataac 64549  T
234 atcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    |||| ||   ||||||||||||    
64548 atcacagcaagagcacgaattt 64527  T

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Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

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Target: scaffold0125 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41911
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| || ||||||||||||||| ||| |  ||  | |  ||||    
41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
    |||| |||||||  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
41748 caacaacaacatagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 41846  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
41847 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

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Target: scaffold1542 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 534
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | | ||||||||||  |||||||||||| || |||     
797 catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc 698  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     |||   ||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||  |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
697 taacagtaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 598  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
597 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

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Target: scaffold0772 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Original strand, 5660 - 5785
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
5660 gcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaa 5759  T
239 agttggagcacgaatttagcaacaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
5760 agttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

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Target: scaffold0075 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34460
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgca-caagaatcatagctcaat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||||||  | || |||||||| ||||||    
34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
109 tcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
    ||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||||  |||| |||| | || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
34624 tcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 34525  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
34524 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

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Target: scaffold0028 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 139 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 89586 - 89423
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
89586 gcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 89487  T
239 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||    
89486 agttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatt 89423  T

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Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107753
Alignment:
220 catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 300  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 107753  T

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Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Original strand, 79745 - 79786
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
79745 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattt 79786  T

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Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 88
Target Start/End: Original strand, 79560 - 79616
Alignment:
32 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 88  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||    
79560 atacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattg 79616  T

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Target: scaffold0529 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3215
Alignment:
14 atcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgca-caagaatcatagctcaattcaa 112  Q
    |||||| |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||||||  | || |||||||| ||||||||||    
2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
113 ctacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattat 210  Q
    | ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||    
3066 caacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 3165  T
211 caattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 260  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||    
3166 caattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

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Target: scaffold0215 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9371
Alignment:
14 atcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 113  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||| |||  ||||||||| | ||||| | |||    
9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
114 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 211  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
9496 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 9397  T
212 aattcatgcatacaaacatatcatca 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
9396 aattcatgcatacaaacataacatca 9371  T

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Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16269
Alignment:
14 atcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 113  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||| |||  ||||||||| | ||||| | |||    
16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
114 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 211  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
16394 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 16295  T
212 aattcatgcatacaaacatatcatca 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
16294 aattcatgcatacaaacataacatca 16269  T

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Target: scaffold0369 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3936
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
3722 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 3821  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttct-acatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | ||| | |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
3822 taacaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 3921  T
207 ttatcaattcatgca 221  Q
    | |||||||||||||    
3922 tcatcaattcatgca 3936  T

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Target: scaffold0076 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43226
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |    
42997 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat 43096  T
110 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
43097 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43196  T
207 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatc 236  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||    
43197 tcatcaattcatgcatagaaacataacatc 43226  T

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Target: scaffold0420 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13445 - 13325
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
13445 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 13346  T
239 agttggagcacgaatttagca 259  Q
    | |  |||||||||| |||||    
13345 actaagagcacgaatctagca 13325  T

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Target: scaffold0116 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 255
Target Start/End: Original strand, 167 - 283
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||     
167 gcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 266  T
239 agttggagcacgaattt 255  Q
    ||   ||||||||||||    
267 agcaagagcacgaattt 283  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5254
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  | |||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
5466 catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 5368  T
110 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 206  Q
     ||| |||||    |||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
5367 taacaacaactcagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 5269  T
207 ttatcaattcatgca 221  Q
    | |||||||||||||    
5268 tcatcaattcatgca 5254  T

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Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 102963 - 102923
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
102963 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt 102923  T

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Target: scaffold0622 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9480
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 108  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
9382 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 9480  T

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Target: scaffold1711 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1304
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
1424 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 1325  T
239 agttggagcacgaatttagca 259  Q
    ||   ||||||||||||||||    
1324 agcaagagcacgaatttagca 1304  T

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Target: scaffold0139 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21115
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||| |||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||||||| | || |||  | ||||||||||| |||||||||  | ||||| |    
21367 catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat 21268  T
110 caactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 207  Q
     ||| ||||| | |  ||||||| | |||  || |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||| | ||||    
21267 taacaacaacttaggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataattat 21168  T
208 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 260  Q
     ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |    |||||||||||||||||    
21167 catcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 21115  T

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Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14181 - 14083
Alignment:
139 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 237  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
14181 gcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatca 14083  T

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Target: scaffold0104 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48603
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatca 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||| | |||||||| || ||||||||||    
48514 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatca 48603  T

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Target: scaffold0361 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 271
Target Start/End: Original strand, 3370 - 3453
Alignment:
188 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 271  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||| |||| ||||||    
3370 accaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

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Target: scaffold0066 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 54416 - 54630
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 109  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||| | || | ||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||| ||    
54416 catcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 54515  T
110 caactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactt 205  Q
    |||| ||||||| || ||||||| | |||  | |||| |||||||||||  ||||| ||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||    
54516 caacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatacaatt 54614  T
206 attatcaattcatgca 221  Q
    || |||||||||||||    
54615 atcatcaattcatgca 54630  T

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Target: scaffold1560 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 26
Alignment:
10 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatca 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  | || |||| ||| ||||||||||    
115 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatca 26  T

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Target: scaffold0456 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

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Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

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Target: scaffold0123 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Original strand, 8216 - 8257
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
8216 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

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Target: scaffold0084 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 56226 - 56106
Alignment:
146 tttcataacttctcatttctacatattt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 243  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||| ||| | | | ||||||||||| |||| ||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||     
56226 tttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagtta 56127  T
244 gagcacgaatttagcaacaat 264  Q
    ||||||||||||| |||||||    
56126 gagcacgaatttaacaacaat 56106  T

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Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

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Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1386 - 1348
Alignment:
217 atgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
1386 atgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1348  T

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Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9641 - 9603
Alignment:
217 atgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
9641 atgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 9603  T

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Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22463 - 22422
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
22463 ttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattt 22422  T

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Target: scaffold0032 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 93814 - 93773
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
93814 ttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaattt 93773  T

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Target: scaffold0970 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 88
Target Start/End: Original strand, 2476 - 2532
Alignment:
32 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 88  Q
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2476 atacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 2532  T

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Target: scaffold0389 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 254
Target Start/End: Original strand, 10868 - 10908
Alignment:
214 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt 254  Q
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10868 ttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaatt 10908  T

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