View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14741_low_3 (Length: 487)

Name: NF14741_low_3
Description: NF14741
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14741_low_3
NF14741_low_3
[»] chr3 (98 HSPs)
chr3 (19-479)||(4569852-4570312)
chr3 (132-479)||(54593606-54593951)
chr3 (130-479)||(6095521-6095866)
chr3 (129-477)||(30236028-30236373)
chr3 (211-479)||(34491114-34491379)
chr3 (129-470)||(46860382-46860722)
chr3 (129-479)||(49199385-49199737)
chr3 (129-473)||(47304158-47304505)
chr3 (129-474)||(41819442-41819786)
chr3 (129-443)||(43401717-43402033)
chr3 (211-425)||(44331499-44331712)
chr3 (129-435)||(46173311-46173606)
chr3 (211-425)||(40734452-40734665)
chr3 (129-443)||(43403660-43403976)
chr3 (211-425)||(7762220-7762433)
chr3 (211-425)||(19683889-19684103)
chr3 (211-436)||(29196387-29196612)
chr3 (211-436)||(44700480-44700703)
chr3 (164-479)||(36018752-36019062)
chr3 (211-425)||(5236458-5236670)
chr3 (211-425)||(9581237-9581450)
chr3 (211-425)||(45095119-45095331)
chr3 (200-436)||(53921493-53921727)
chr3 (211-425)||(39153362-39153575)
chr3 (211-425)||(51398768-51398981)
chr3 (218-425)||(22835010-22835216)
chr3 (214-425)||(40735337-40735547)
chr3 (211-425)||(31314399-31314612)
chr3 (200-425)||(32891057-32891282)
chr3 (211-425)||(37408413-37408626)
chr3 (211-425)||(5258144-5258358)
chr3 (211-425)||(7764422-7764632)
chr3 (211-425)||(16498984-16499196)
chr3 (211-425)||(29682313-29682526)
chr3 (211-437)||(9666467-9666693)
chr3 (231-421)||(760805-760995)
chr3 (211-425)||(23200138-23200350)
chr3 (231-425)||(29810822-29811016)
chr3 (278-468)||(31340268-31340457)
chr3 (211-425)||(5260323-5260537)
chr3 (211-425)||(23197939-23198151)
chr3 (211-425)||(29813017-29813230)
chr3 (211-425)||(9636126-9636340)
chr3 (129-479)||(55301892-55302232)
chr3 (211-425)||(23391910-23392123)
chr3 (237-479)||(5433908-5434145)
chr3 (211-379)||(801091-801260)
chr3 (211-436)||(23410330-23410553)
chr3 (211-376)||(7780004-7780168)
chr3 (211-425)||(32744437-32744640)
chr3 (129-320)||(40913352-40913544)
chr3 (211-379)||(6716500-6716667)
chr3 (211-379)||(54635125-54635292)
chr3 (252-474)||(35138746-35138968)
chr3 (251-399)||(51352151-51352298)
chr3 (219-379)||(45282983-45283146)
chr3 (262-479)||(26323124-26323343)
chr3 (329-422)||(26386599-26386692)
chr3 (211-379)||(3617449-3617618)
chr3 (260-412)||(5373198-5373353)
chr3 (216-379)||(25637426-25637590)
chr3 (129-227)||(31340142-31340240)
chr3 (404-478)||(40913241-40913315)
chr3 (216-379)||(4598528-4598693)
chr3 (216-379)||(4600749-4600914)
chr3 (216-379)||(10056217-10056382)
chr3 (216-379)||(10058439-10058604)
chr3 (216-379)||(10060661-10060826)
chr3 (216-379)||(10062883-10063048)
chr3 (216-379)||(10065105-10065270)
chr3 (216-379)||(10211393-10211558)
chr3 (216-379)||(10209173-10209338)
chr3 (237-479)||(39127447-39127691)
chr3 (200-334)||(33191877-33192009)
chr3 (258-374)||(4055810-4055926)
chr3 (254-367)||(20937668-20937781)
chr3 (309-436)||(2075156-2075281)
chr3 (262-359)||(54739004-54739102)
chr3 (200-278)||(27305700-27305777)
chr3 (200-285)||(2075065-2075149)
chr3 (258-357)||(25491014-25491114)
chr3 (271-438)||(8166516-8166685)
chr3 (252-320)||(4075511-4075581)
chr3 (290-359)||(28253346-28253416)
chr3 (59-121)||(6095390-6095448)
chr3 (59-103)||(54594042-54594086)
chr3 (259-435)||(1313852-1314029)
chr3 (59-121)||(55301758-55301818)
chr3 (426-479)||(1683388-1683440)
chr3 (276-309)||(31340242-31340275)
chr3 (59-121)||(43403530-43403588)
chr3 (291-365)||(4386868-4386941)
chr3 (258-373)||(1683483-1683597)
chr3 (271-360)||(24635276-24635366)
chr3 (307-379)||(10067327-10067399)
chr3 (216-249)||(10067436-10067469)
chr3 (271-327)||(41510314-41510371)
chr3 (272-327)||(40519258-40519313)
[»] chr8 (69 HSPs)
chr8 (119-479)||(42434901-42435258)
chr8 (129-479)||(18655302-18655650)
chr8 (129-479)||(4283425-4283771)
chr8 (129-479)||(40221646-40221992)
chr8 (129-479)||(11383887-11384232)
chr8 (129-437)||(10930118-10930424)
chr8 (129-479)||(40328680-40329023)
chr8 (251-479)||(44353693-44353921)
chr8 (211-436)||(27811222-27811445)
chr8 (211-425)||(43036377-43036590)
chr8 (211-425)||(15212740-15212953)
chr8 (211-425)||(33352104-33352317)
chr8 (211-425)||(4731612-4731825)
chr8 (200-419)||(1292454-1292671)
chr8 (211-438)||(40321022-40321247)
chr8 (211-424)||(42498149-42498362)
chr8 (126-411)||(3772160-3772442)
chr8 (211-425)||(1345372-1345585)
chr8 (211-425)||(3303671-3303884)
chr8 (211-425)||(34254331-34254543)
chr8 (211-436)||(18141764-18141987)
chr8 (211-425)||(17982607-17982821)
chr8 (211-425)||(5689225-5689438)
chr8 (211-425)||(34256507-34256719)
chr8 (251-425)||(30143296-30143468)
chr8 (211-425)||(31218211-31218425)
chr8 (251-436)||(30291549-30291735)
chr8 (211-425)||(6598926-6599139)
chr8 (211-425)||(6674379-6674592)
chr8 (211-425)||(44303808-44304023)
chr8 (206-436)||(4162444-4162668)
chr8 (211-425)||(19945359-19945574)
chr8 (211-425)||(1746219-1746432)
chr8 (211-425)||(12702635-12702852)
chr8 (211-422)||(19491700-19491909)
chr8 (261-425)||(9765703-9765863)
chr8 (213-425)||(18106084-18106292)
chr8 (208-430)||(8965689-8965910)
chr8 (211-425)||(41366616-41366828)
chr8 (216-379)||(2627735-2627899)
chr8 (211-425)||(4743215-4743417)
chr8 (260-425)||(10929753-10929907)
chr8 (200-436)||(8153705-8153936)
chr8 (200-338)||(10015122-10015257)
chr8 (290-425)||(41364926-41365061)
chr8 (211-379)||(25689955-25690122)
chr8 (218-379)||(3439504-3439664)
chr8 (251-424)||(11712040-11712214)
chr8 (211-301)||(4733784-4733873)
chr8 (206-319)||(3073870-3073981)
chr8 (216-379)||(15290522-15290687)
chr8 (216-379)||(15470891-15471056)
chr8 (216-379)||(42575329-42575494)
chr8 (237-435)||(7597559-7597757)
chr8 (237-364)||(32902199-32902327)
chr8 (251-357)||(1822313-1822421)
chr8 (251-357)||(1856758-1856866)
chr8 (270-476)||(10240061-10240264)
chr8 (124-228)||(2999718-2999820)
chr8 (259-334)||(30909413-30909487)
chr8 (59-121)||(42434779-42434839)
chr8 (275-438)||(3231859-3232023)
chr8 (208-436)||(29796317-29796547)
chr8 (381-479)||(33655474-33655572)
chr8 (386-435)||(1872084-1872133)
chr8 (252-288)||(38863949-38863985)
chr8 (271-424)||(41266924-41267078)
chr8 (59-121)||(11384304-11384366)
chr8 (262-327)||(11137077-11137146)
[»] chr4 (101 HSPs)
chr4 (119-479)||(50673757-50674113)
chr4 (133-479)||(54882921-54883265)
chr4 (121-467)||(8665320-8665663)
chr4 (129-479)||(12073293-12073640)
chr4 (129-472)||(40632353-40632692)
chr4 (129-479)||(6655857-6656203)
chr4 (121-467)||(8648051-8648394)
chr4 (129-474)||(35662346-35662688)
chr4 (119-461)||(41639345-41639683)
chr4 (129-479)||(379279-379628)
chr4 (129-479)||(41964316-41964661)
chr4 (129-479)||(2209614-2209966)
chr4 (164-479)||(46703400-46703715)
chr4 (129-479)||(27416886-27417228)
chr4 (119-392)||(26364223-26364494)
chr4 (125-479)||(50262613-50262965)
chr4 (211-425)||(26175637-26175850)
chr4 (211-425)||(56178637-56178850)
chr4 (211-425)||(48893639-48893856)
chr4 (200-425)||(52095352-52095576)
chr4 (211-438)||(36463390-36463615)
chr4 (211-425)||(5429633-5429846)
chr4 (211-425)||(36994478-36994691)
chr4 (211-425)||(48142996-48143211)
chr4 (211-425)||(9927459-9927671)
chr4 (211-425)||(34570415-34570628)
chr4 (211-421)||(47038412-47038619)
chr4 (200-425)||(54199897-54200120)
chr4 (130-472)||(12119445-12119791)
chr4 (200-425)||(31474104-31474329)
chr4 (129-479)||(26699362-26699713)
chr4 (253-436)||(24969055-24969238)
chr4 (211-425)||(12739551-12739764)
chr4 (209-425)||(29999804-30000019)
chr4 (211-436)||(52467355-52467579)
chr4 (211-425)||(5871774-5871987)
chr4 (211-425)||(37740580-37740792)
chr4 (251-423)||(12745476-12745648)
chr4 (288-479)||(55085442-55085632)
chr4 (200-425)||(4587912-4588137)
chr4 (211-395)||(46147392-46147575)
chr4 (200-425)||(6542169-6542395)
chr4 (203-436)||(37229714-37229947)
chr4 (251-425)||(12747796-12747970)
chr4 (194-442)||(21688186-21688434)
chr4 (211-425)||(29254448-29254661)
chr4 (251-419)||(3913408-3913576)
chr4 (211-425)||(45687183-45687397)
chr4 (219-425)||(5370091-5370300)
chr4 (211-425)||(13992293-13992499)
chr4 (223-425)||(52082676-52082871)
chr4 (129-479)||(33989762-33990093)
chr4 (200-436)||(51337008-51337242)
chr4 (200-435)||(5207832-5208066)
chr4 (211-366)||(12743926-12744080)
chr4 (211-366)||(12745315-12745469)
chr4 (211-379)||(31495316-31495485)
chr4 (211-425)||(13009445-13009645)
chr4 (251-359)||(12744087-12744195)
chr4 (291-429)||(41639214-41639351)
chr4 (211-379)||(8393394-8393562)
chr4 (211-379)||(8395603-8395771)
chr4 (199-479)||(22882740-22883021)
chr4 (199-479)||(22934404-22934685)
chr4 (129-479)||(33089788-33090128)
chr4 (251-438)||(48142415-48142605)
chr4 (200-436)||(29056301-29056537)
chr4 (275-479)||(32091379-32091583)
chr4 (251-479)||(35369485-35369708)
chr4 (216-379)||(5136063-5136228)
chr4 (216-379)||(5138288-5138453)
chr4 (257-409)||(53345187-53345340)
chr4 (200-365)||(5349924-5350087)
chr4 (200-430)||(44967818-44968048)
chr4 (129-208)||(55085362-55085439)
chr4 (252-436)||(6677412-6677597)
chr4 (423-479)||(26364166-26364222)
chr4 (258-446)||(52065530-52065719)
chr4 (258-334)||(34112862-34112939)
chr4 (422-479)||(41961311-41961368)
chr4 (211-379)||(7124901-7125070)
chr4 (287-359)||(34788851-34788923)
chr4 (258-359)||(16422653-16422755)
chr4 (204-333)||(21703829-21703958)
chr4 (199-379)||(7122682-7122864)
chr4 (57-121)||(2210038-2210098)
chr4 (59-121)||(40632765-40632825)
chr4 (273-359)||(44570427-44570514)
chr4 (258-358)||(22628938-22629042)
chr4 (121-178)||(46703748-46703804)
chr4 (59-121)||(50262487-50262544)
chr4 (259-327)||(40975057-40975125)
chr4 (200-247)||(24969797-24969843)
chr4 (237-326)||(37754986-37755076)
chr4 (434-479)||(3785990-3786034)
chr4 (381-430)||(5349855-5349904)
chr4 (59-121)||(21688562-21688620)
chr4 (423-464)||(25723433-25723474)
chr4 (312-420)||(35370449-35370557)
chr4 (59-121)||(41639744-41639801)
chr4 (390-438)||(3677403-3677451)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (119-479)||(5057948-5058303)
chr5 (130-464)||(213381-213715)
chr5 (129-479)||(40147162-40147508)
chr5 (200-479)||(28278217-28278494)
chr5 (129-463)||(27637533-27637865)
chr5 (119-479)||(27015433-27015779)
chr5 (213-479)||(38746906-38747170)
chr5 (213-436)||(13488147-13488368)
chr5 (211-425)||(42428431-42428644)
chr5 (200-425)||(13239706-13239930)
chr5 (211-425)||(533723-533936)
chr5 (211-425)||(25412716-25412928)
chr5 (211-425)||(32636778-32636991)
chr5 (185-479)||(16640915-16641208)
chr5 (211-425)||(39468550-39468763)
chr5 (211-436)||(33831624-33831847)
chr5 (211-422)||(537982-538192)
chr5 (211-425)||(42426236-42426449)
chr5 (200-425)||(16452035-16452258)
chr5 (213-425)||(28750658-28750869)
chr5 (211-425)||(8565947-8566160)
chr5 (211-425)||(13343015-13343228)
chr5 (218-425)||(30182543-30182749)
chr5 (218-425)||(36074050-36074258)
chr5 (200-425)||(31182927-31183149)
chr5 (211-425)||(37439088-37439309)
chr5 (200-425)||(3075648-3075872)
chr5 (200-434)||(13695680-13695914)
chr5 (218-425)||(30682930-30683134)
chr5 (211-422)||(16409440-16409643)
chr5 (211-422)||(26177848-26178050)
chr5 (229-436)||(42309953-42310159)
chr5 (211-420)||(9789224-9789425)
chr5 (211-420)||(18441648-18441849)
chr5 (200-435)||(9049332-9049565)
chr5 (196-479)||(316663-316946)
chr5 (282-425)||(5887487-5887630)
chr5 (211-379)||(29751160-29751328)
chr5 (211-379)||(22536290-22536457)
chr5 (211-379)||(29720364-29720532)
chr5 (211-379)||(29722524-29722692)
chr5 (211-425)||(19806338-19806530)
chr5 (211-379)||(10593258-10593426)
chr5 (211-422)||(26170739-26170930)
chr5 (211-379)||(25078120-25078289)
chr5 (211-379)||(25136089-25136258)
chr5 (211-379)||(40380090-40380259)
chr5 (211-379)||(40382301-40382470)
chr5 (271-467)||(35616082-35616278)
chr5 (200-309)||(42926961-42927069)
chr5 (364-425)||(42926847-42926908)
chr5 (205-364)||(33906024-33906184)
chr5 (216-379)||(16546629-16546794)
chr5 (340-478)||(4160534-4160670)
chr5 (216-379)||(16544407-16544572)
chr5 (278-327)||(42926919-42926968)
chr5 (129-276)||(4160702-4160847)
chr5 (255-430)||(3325863-3326038)
chr5 (255-364)||(10054860-10054969)
chr5 (258-458)||(10700695-10700896)
chr5 (261-366)||(22097877-22097981)
chr5 (58-121)||(38747296-38747354)
chr5 (251-327)||(8445767-8445844)
chr5 (422-479)||(14689622-14689678)
chr5 (258-334)||(32579269-32579346)
chr5 (287-365)||(14689503-14689581)
chr5 (402-479)||(21205842-21205920)
chr5 (74-121)||(28278607-28278650)
chr5 (274-327)||(32609587-32609641)
chr5 (394-446)||(32576481-32576533)
[»] chr1 (95 HSPs)
chr1 (129-479)||(11348599-11348948)
chr1 (119-479)||(37168198-37168555)
chr1 (130-479)||(13548922-13549267)
chr1 (139-479)||(13547020-13547356)
chr1 (129-479)||(47255257-47255607)
chr1 (140-479)||(193512-193849)
chr1 (129-479)||(29136148-29136495)
chr1 (119-474)||(7482141-7482494)
chr1 (129-479)||(31925627-31925973)
chr1 (129-479)||(47115072-47115420)
chr1 (117-479)||(42297879-42298242)
chr1 (133-479)||(19754395-19754737)
chr1 (119-479)||(34603476-34603820)
chr1 (211-479)||(37033072-37033340)
chr1 (211-425)||(8550787-8551001)
chr1 (211-425)||(28265555-28265768)
chr1 (212-425)||(44455114-44455326)
chr1 (211-425)||(28220227-28220440)
chr1 (211-425)||(31659192-31659405)
chr1 (129-479)||(19752586-19752930)
chr1 (211-425)||(834168-834381)
chr1 (211-420)||(49918309-49918517)
chr1 (237-425)||(1833476-1833664)
chr1 (211-425)||(3156820-3157032)
chr1 (211-418)||(28223422-28223628)
chr1 (211-434)||(46064864-46065085)
chr1 (211-425)||(3189285-3189498)
chr1 (211-425)||(3198102-3198315)
chr1 (211-425)||(3206941-3207154)
chr1 (211-425)||(4552638-4552851)
chr1 (211-425)||(50169211-50169424)
chr1 (201-425)||(23555257-23555479)
chr1 (211-425)||(3847122-3847335)
chr1 (211-425)||(13659337-13659550)
chr1 (200-438)||(15820249-15820485)
chr1 (211-425)||(50167176-50167389)
chr1 (211-425)||(37503558-37503768)
chr1 (211-425)||(196908-197122)
chr1 (211-425)||(10925177-10925393)
chr1 (211-436)||(45644355-45644579)
chr1 (307-479)||(37879007-37879178)
chr1 (220-425)||(20762626-20762831)
chr1 (211-425)||(37559868-37560083)
chr1 (211-422)||(41360872-41361081)
chr1 (211-425)||(13137977-13138188)
chr1 (211-379)||(13316352-13316520)
chr1 (211-425)||(30476447-30476662)
chr1 (200-436)||(927966-928202)
chr1 (200-416)||(16455585-16455799)
chr1 (211-425)||(40122197-40122412)
chr1 (211-425)||(51765349-51765565)
chr1 (211-379)||(9987202-9987369)
chr1 (211-379)||(20622237-20622406)
chr1 (211-379)||(40282377-40282545)
chr1 (129-310)||(37876687-37876865)
chr1 (164-302)||(28242382-28242518)
chr1 (211-379)||(9036417-9036584)
chr1 (196-468)||(6808358-6808636)
chr1 (201-436)||(37282682-37282916)
chr1 (201-437)||(44650153-44650389)
chr1 (216-379)||(21053958-21054121)
chr1 (196-374)||(22079322-22079501)
chr1 (200-375)||(36683694-36683858)
chr1 (383-479)||(28242289-28242385)
chr1 (211-379)||(44203631-44203800)
chr1 (162-411)||(12318475-12318722)
chr1 (271-447)||(25652018-25652195)
chr1 (307-424)||(8871144-8871259)
chr1 (255-367)||(3460707-3460821)
chr1 (59-121)||(13548792-13548852)
chr1 (274-478)||(41135721-41135926)
chr1 (251-327)||(9109459-9109536)
chr1 (253-336)||(2263016-2263100)
chr1 (432-479)||(34602560-34602607)
chr1 (258-359)||(4535527-4535629)
chr1 (258-374)||(13938143-13938259)
chr1 (261-362)||(32471478-32471579)
chr1 (251-327)||(5459958-5460034)
chr1 (162-320)||(2926567-2926726)
chr1 (59-121)||(11349020-11349080)
chr1 (271-446)||(1050503-1050678)
chr1 (271-374)||(16914234-16914338)
chr1 (362-437)||(44646935-44647010)
chr1 (202-279)||(8871054-8871130)
chr1 (422-479)||(22079222-22079278)
chr1 (78-121)||(37876573-37876614)
chr1 (75-121)||(13546901-13546945)
chr1 (61-119)||(37032860-37032915)
chr1 (261-374)||(6398652-6398764)
chr1 (59-101)||(19752991-19753032)
chr1 (291-324)||(22819502-22819535)
chr1 (201-282)||(44646795-44646875)
chr1 (285-334)||(44760624-44760672)
chr1 (390-430)||(1485952-1485992)
chr1 (295-361)||(35109492-35109557)
[»] chr6 (53 HSPs)
chr6 (129-479)||(26830041-26830391)
chr6 (121-479)||(5043528-5043883)
chr6 (185-474)||(21593570-21593857)
chr6 (129-479)||(17762890-17763239)
chr6 (189-479)||(2972918-2973206)
chr6 (129-394)||(21588916-21589178)
chr6 (133-479)||(3808628-3808975)
chr6 (164-474)||(22424780-22425089)
chr6 (129-407)||(17757995-17758272)
chr6 (129-479)||(603005-603347)
chr6 (202-425)||(28137400-28137622)
chr6 (211-425)||(9183032-9183245)
chr6 (211-425)||(5406200-5406412)
chr6 (211-425)||(5410525-5410737)
chr6 (211-425)||(33211186-33211399)
chr6 (211-425)||(2171532-2171744)
chr6 (211-436)||(31404675-31404897)
chr6 (237-425)||(3038929-3039117)
chr6 (218-425)||(5413401-5413606)
chr6 (211-425)||(26954287-26954499)
chr6 (216-425)||(30834541-30834750)
chr6 (211-425)||(16452329-16452543)
chr6 (211-425)||(33160352-33160567)
chr6 (236-438)||(4045364-4045567)
chr6 (211-379)||(412101-412270)
chr6 (211-379)||(3072759-3072928)
chr6 (129-336)||(26800630-26800835)
chr6 (251-478)||(25073469-25073697)
chr6 (211-425)||(16568997-16569189)
chr6 (211-422)||(6097451-6097643)
chr6 (211-379)||(27647861-27648028)
chr6 (218-303)||(5409076-5409161)
chr6 (211-379)||(16554869-16555037)
chr6 (211-379)||(16578518-16578686)
chr6 (211-379)||(16616694-16616862)
chr6 (211-379)||(16631425-16631593)
chr6 (211-379)||(16653112-16653280)
chr6 (211-379)||(25421305-25421474)
chr6 (211-379)||(6027246-6027415)
chr6 (216-379)||(13153913-13154078)
chr6 (216-379)||(33342110-33342275)
chr6 (216-379)||(34164856-34165021)
chr6 (211-379)||(34167078-34167248)
chr6 (311-425)||(16567160-16567265)
chr6 (391-479)||(5740970-5741058)
chr6 (187-302)||(9572667-9572784)
chr6 (59-121)||(26829909-26829969)
chr6 (59-121)||(17758344-17758402)
chr6 (59-121)||(21589250-21589308)
chr6 (252-334)||(2908503-2908586)
chr6 (59-121)||(17763311-17763369)
chr6 (412-479)||(11660508-11660574)
chr6 (266-327)||(26310412-26310472)
[»] chr2 (61 HSPs)
chr2 (119-479)||(35446795-35447151)
chr2 (119-479)||(1631645-1631999)
chr2 (130-479)||(45726830-45727173)
chr2 (129-479)||(42288031-42288377)
chr2 (217-425)||(2334424-2334631)
chr2 (211-425)||(17057370-17057583)
chr2 (211-425)||(17085353-17085566)
chr2 (211-425)||(36773516-36773729)
chr2 (211-425)||(36318010-36318223)
chr2 (213-425)||(29867823-29868034)
chr2 (211-425)||(723745-723958)
chr2 (211-425)||(38312194-38312407)
chr2 (211-425)||(34139771-34139985)
chr2 (211-422)||(36988076-36988286)
chr2 (129-479)||(17450491-17450824)
chr2 (211-438)||(33162451-33162676)
chr2 (211-425)||(45099709-45099922)
chr2 (231-425)||(42362306-42362500)
chr2 (211-425)||(14633826-14634040)
chr2 (211-425)||(5723256-5723468)
chr2 (211-425)||(11151592-11151805)
chr2 (211-425)||(4503133-4503346)
chr2 (211-425)||(11690455-11690668)
chr2 (211-422)||(36205665-36205874)
chr2 (211-425)||(11067259-11067472)
chr2 (194-474)||(24397962-24398244)
chr2 (211-425)||(4484330-4484544)
chr2 (219-426)||(6595014-6595221)
chr2 (211-425)||(30833300-30833514)
chr2 (129-459)||(33648089-33648420)
chr2 (205-438)||(17490143-17490368)
chr2 (245-436)||(13121712-13121901)
chr2 (200-436)||(11049493-11049732)
chr2 (211-422)||(32289530-32289732)
chr2 (251-430)||(7815313-7815492)
chr2 (277-425)||(24885615-24885763)
chr2 (251-425)||(14202452-14202621)
chr2 (211-379)||(6266691-6266859)
chr2 (129-327)||(7451170-7451366)
chr2 (208-425)||(26353143-26353354)
chr2 (216-379)||(13656037-13656200)
chr2 (343-425)||(39284839-39284921)
chr2 (211-379)||(12647386-12647555)
chr2 (271-436)||(12123644-12123809)
chr2 (143-420)||(30217979-30218254)
chr2 (211-285)||(39284930-39285003)
chr2 (200-325)||(42019859-42019987)
chr2 (251-358)||(42261525-42261633)
chr2 (271-359)||(34811281-34811370)
chr2 (237-320)||(28671989-28672073)
chr2 (258-359)||(41454254-41454356)
chr2 (60-121)||(45727247-45727305)
chr2 (237-416)||(7597038-7597217)
chr2 (211-322)||(24197955-24198064)
chr2 (59-121)||(35446677-35446736)
chr2 (291-365)||(2869643-2869717)
chr2 (259-327)||(3897042-3897111)
chr2 (237-280)||(42412117-42412159)
chr2 (259-359)||(41446159-41446260)
chr2 (287-327)||(4561140-4561180)
chr2 (261-319)||(16605654-16605711)
[»] chr7 (87 HSPs)
chr7 (129-479)||(34310635-34310983)
chr7 (119-479)||(48599245-48599601)
chr7 (129-479)||(4508627-4508973)
chr7 (134-473)||(3258901-3259237)
chr7 (129-479)||(29608637-29608985)
chr7 (200-476)||(22269877-22270151)
chr7 (126-479)||(4512308-4512657)
chr7 (129-479)||(8359236-8359585)
chr7 (213-479)||(2360975-2361238)
chr7 (126-479)||(4510466-4510815)
chr7 (136-479)||(2390183-2390526)
chr7 (216-479)||(6431872-6432133)
chr7 (211-424)||(30024733-30024945)
chr7 (211-425)||(27347771-27347984)
chr7 (211-425)||(14069834-14070047)
chr7 (211-425)||(14379862-14380075)
chr7 (211-425)||(31732970-31733183)
chr7 (211-425)||(35853869-35854082)
chr7 (251-436)||(47673983-47674167)
chr7 (211-438)||(23554982-23555208)
chr7 (211-425)||(8153296-8153509)
chr7 (231-425)||(48491533-48491727)
chr7 (202-425)||(31105385-31105607)
chr7 (211-425)||(18126598-18126811)
chr7 (211-425)||(41317435-41317648)
chr7 (211-425)||(43864198-43864411)
chr7 (251-425)||(4586115-4586289)
chr7 (200-425)||(26417270-26417494)
chr7 (133-347)||(32357979-32358190)
chr7 (211-436)||(36146409-36146633)
chr7 (211-425)||(47676137-47676350)
chr7 (211-425)||(495984-496197)
chr7 (211-425)||(1113611-1113824)
chr7 (211-425)||(29991009-29991221)
chr7 (211-425)||(38671223-38671436)
chr7 (211-425)||(48489385-48489598)
chr7 (129-479)||(22328310-22328666)
chr7 (129-345)||(6359870-6360087)
chr7 (211-425)||(41649012-41649224)
chr7 (269-436)||(31518739-31518905)
chr7 (217-436)||(25615807-25616015)
chr7 (211-425)||(19502132-19502346)
chr7 (200-436)||(4253518-4253754)
chr7 (211-425)||(12097868-12098073)
chr7 (211-425)||(25766960-25767171)
chr7 (211-425)||(4178729-4178941)
chr7 (211-425)||(39731331-39731537)
chr7 (200-425)||(48408757-48408984)
chr7 (200-432)||(23565052-23565282)
chr7 (200-371)||(31518911-31519081)
chr7 (211-353)||(2759198-2759339)
chr7 (200-420)||(23343934-23344151)
chr7 (211-379)||(43504154-43504323)
chr7 (204-436)||(36574510-36574740)
chr7 (298-426)||(4538627-4538755)
chr7 (300-425)||(24525985-24526111)
chr7 (211-379)||(20343897-20344064)
chr7 (218-430)||(3904624-3904836)
chr7 (211-379)||(24789841-24790009)
chr7 (372-479)||(6360073-6360179)
chr7 (211-379)||(6592340-6592509)
chr7 (211-379)||(18388760-18388929)
chr7 (211-379)||(18392196-18392365)
chr7 (213-307)||(24525505-24525598)
chr7 (211-379)||(6594558-6594727)
chr7 (348-425)||(2761439-2761516)
chr7 (211-379)||(32060322-32060493)
chr7 (216-293)||(1560671-1560749)
chr7 (286-479)||(1360226-1360422)
chr7 (209-303)||(18396393-18396488)
chr7 (362-425)||(24514912-24514974)
chr7 (211-285)||(30814530-30814603)
chr7 (271-418)||(27073778-27073925)
chr7 (271-418)||(27204388-27204535)
chr7 (251-358)||(5116625-5116733)
chr7 (315-436)||(5514113-5514234)
chr7 (204-299)||(5513661-5513755)
chr7 (258-359)||(43363518-43363622)
chr7 (59-121)||(4510339-4510396)
chr7 (59-121)||(4512181-4512238)
chr7 (408-479)||(23794023-23794093)
chr7 (308-379)||(1562103-1562173)
chr7 (58-101)||(41317237-41317279)
chr7 (368-430)||(30843389-30843451)
chr7 (129-178)||(2360897-2360945)
chr7 (298-365)||(3047335-3047401)
chr7 (59-121)||(30814713-30814770)
[»] scaffold0466 (2 HSPs)
scaffold0466 (129-479)||(7229-7574)
scaffold0466 (59-121)||(7644-7703)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (133-479)||(17927-18268)
scaffold0176 (59-101)||(17793-17835)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (211-479)||(11459-11725)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (218-425)||(114557-114763)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (266-479)||(80338-80550)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (211-425)||(149098-149311)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (211-436)||(434477-434701)
scaffold0002 (251-358)||(490360-490468)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (200-425)||(20405-20629)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (211-425)||(871-1083)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (211-425)||(11161-11375)
scaffold0491 (211-425)||(8735-8949)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (126-401)||(10468-10740)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (208-438)||(27439-27670)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (211-379)||(2604-2773)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (216-379)||(3731-3895)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (216-379)||(6272-6436)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (258-430)||(25002-25175)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (409-472)||(1594-1657)
[»] scaffold0129 (1 HSPs)
scaffold0129 (389-436)||(19117-19163)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 98)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 4570312 - 4569852
Alignment:
Q  19 aaggacaacatcagaatcacttaattgagttagaatcacctgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4570312 aaggacaacatcagaatcacttaattgagttagaatcacctgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaattatatatgatgtgtggagca 4570213  T
Q  119 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4570212 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacc 4570113  T
Q  219 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4570112 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 4570013  T
Q  319 tagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4570012 tagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 4569913  T
Q  419 ttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4569912 ttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 4569852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 132 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 54593951 - 54593606
Alignment:
Q  132 gtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggag-caaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtcca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  54593951 gtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagagagactaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagtttggtcca 54593852  T
Q  231 aacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataa 330  Q
    | ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  54593851 a-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaattagcttcaacaa 54593753  T
Q  331 gctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttt 430  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54593752 gctcacaaagaacaaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 54593654  T
Q  431 tccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54593653 cccaactctagaatctaacccccaaaagagaa-caacccttagcctttg 54593606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 130 - 479
Target Start/End: Original strand, 6095521 - 6095866
Alignment:
Q  130 aagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtcc 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6095521 aagtgtatagcaaaaccacaatccaac-caaggcataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacacagttcggtcc 6095618  T
Q  230 aaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaata 329  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  6095619 aa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattaacttcaaga 6095717  T
Q  330 agctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtt 429  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6095718 agtttacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaataagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtt 6095816  T
Q  430 ttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6095817 tcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcatttg 6095866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 129 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 30236373 - 30236028
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaat-gttgacccagttcggt 227  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30236373 caagtgcataacaaaaacacaatccaac-caaggtataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaattgttgacctagttcggt 30236276  T
Q  228 ccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30236275 ccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaa 30236177  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30236176 caagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcatcaatgaacaagacactc-atgattttcactatcccaaggtgtttacaattg 30236078  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctt 477  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  30236077 tttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcattagcctt 30236028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 211 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 34491379 - 34491114
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491379 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 34491281  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  || |||||||| ||    
T  34491280 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataacacactca--gaatttcactctcc 34491183  T
Q  411 caaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491182 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 34491114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 129 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 46860722 - 46860382
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||    
T  46860722 caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaaaaaatgttcatccaattcggtc 46860625  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    |||   | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  46860624 caacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 46860525  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatg-attttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46860524 aagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgaattttcactctcccaaggtgtttacaattg 46860425  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccct 470  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46860424 tttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 46860382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Original strand, 49199385 - 49199737
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaat--ataacaacaccaaga-aatgttgacccagttcg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  49199385 caagtgcatagcaaaaccacaat-ctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcg 49199483  T
Q  226 gtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgagttacaagaaattagctt 324  Q
    |||||| | | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  49199484 gtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagctt 49199583  T
Q  325 caataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 424  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  49199584 caacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaacgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaa 49199682  T
Q  425 ttgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49199683 ttgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttg 49199737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 129 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 47304505 - 47304158
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaata-----taacaacaccaagaaat-gttgacccagt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |     |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  47304505 caagtgcatagcaaaaccacaatccaact-aaggaataaacaagataaagaaagcaaaagaaaagaaaagataacaacaccaataaattgttgacccagt 47304407  T
Q  223 tcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagc 322  Q
    |||||| |||||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| |    
T  47304406 tcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacagatgggttacaagatattaac 47304308  T
Q  323 ttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 422  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||     
T  47304307 ttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccagggtgtttaa 47304209  T
Q  423 aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttag 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47304208 aattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttag 47304158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 129 - 474
Target Start/End: Original strand, 41819442 - 41819786
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||  || | |  |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  41819442 caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaagga-taaacaagataaagaaagtagagaaaaaaataacaacaccaataaatgttcacccagtttggtc 41819540  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||   | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |    
T  41819541 caacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaga 41819639  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  41819640 caagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaggtgtttacaatta 41819739  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 474  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  41819740 tttcccaactctagaatctaaccgctaaaagagaaccaacccttagc 41819786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 129 - 443
Target Start/End: Original strand, 43401717 - 43402033
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaat--ataacaacaccaaga-aatgttgacccagttcg 225  Q
    |||||||||||||||| |||||| | || ||| | ||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  43401717 caagtgcatagcaaaatcacaat-ctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcg 43401815  T
Q  226 gtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat-acaaatgagttacaagaaattagctt 324  Q
    |||||| | | ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  43401816 gtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgcgttacaagaaattagctt 43401915  T
Q  325 caataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 424  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43401916 caacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaa 43402014  T
Q  425 ttgttttccaactctagaa 443  Q
    | |||| ||||||||||||    
T  43402015 tcgtttcccaactctagaa 43402033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 44331712 - 44331499
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44331712 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatggctta 44331614  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44331613 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 44331514  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  44331513 caaggtgtttacaat 44331499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 129 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 46173606 - 46173311
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaat-gttgacccagttcggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  46173606 caagtgcatagcaaaaccacaatccaact-aagaaataaacaagataaagaaagcaaaagaaaagataacaacaccaagaaattgttgatctagttcggt 46173508  T
Q  228 ccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46173507 ccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaa 46173409  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||         ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46173408 caagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaatttt---------accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattg 46173319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 40734665 - 40734452
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40734665 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgtgtta 40734567  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40734566 caagaaattaggttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 40734467  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  40734466 caaggtgtttacaat 40734452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 129 - 443
Target Start/End: Original strand, 43403660 - 43403976
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatata--acaacaccaagaaat-gttgacccagttcg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||| |||   |  |||||| |  |||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  43403660 caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaagga-taaacaagataaagagagtggagaaaaataaacaacaacatcaagagattgttcacccagttcg 43403758  T
Q  226 gtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa-atgagttacaagaaattagctt 324  Q
    |||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  43403759 gtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaacatgagttacaagaaatgagctt 43403858  T
Q  325 caataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 424  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43403859 caacaagctcacaaagaacaagcctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaa 43403957  T
Q  425 ttgttttccaactctagaa 443  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  43403958 ttgtttcccaactttagaa 43403976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7762433 - 7762220
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7762433 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 7762334  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  7762333 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactca-c 7762235  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||| |||||    
T  7762234 caaggtgttcacaat 7762220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 19683889 - 19684103
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19683889 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 19683988  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19683989 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcacc 19684088  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  19684089 caaggtgtttacaat 19684103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 211 - 436
Target Start/End: Original strand, 29196387 - 29196612
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  29196387 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttc 29196485  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29196486 caagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 29196585  T
Q  410 ccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29196586 ccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 29196612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 211 - 436
Target Start/End: Original strand, 44700480 - 44700703
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  44700480 tgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatgtgggg-agagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaataggtta 44700577  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44700578 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 44700677  T
Q  411 caaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||    
T  44700678 caaggtgtttacaaatgtttcccaac 44700703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 164 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 36019062 - 36018752
Alignment:
Q  164 ataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctc 263  Q
    ||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    ||   |  |||| | ||||||||| |||    
T  36019062 ataaacaagataaagagagtagaa-aaaagataacaacaccaaaaaatgttcatccagttcggtccaa----caaacatactgggggagagattgacctc 36018968  T
Q  264 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccat 362  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36018967 tccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcaacccat 36018869  T
Q  363 tttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaa 462  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||  |||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36018868 tttcccaatttcaccaatgaacaagtcactcgttaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaaccccaaaagagaa 36018769  T
Q  463 ccaacccttagcctttg 479  Q
    |||| || |||||||||    
T  36018768 ccaatccatagcctttg 36018752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 5236458 - 5236670
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| | | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5236458 tgttgacccagtttggtccaaa-ttgacctaatctggggaa-agattgatctctcgaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 5236555  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5236556 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 5236655  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  5236656 caaggtgtttacaat 5236670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9581450 - 9581237
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9581450 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 9581351  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
     ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9581350 aaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccca-tttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 9581252  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  9581251 caaggtgtttacaat 9581237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 45095331 - 45095119
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  45095331 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 45095232  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  45095231 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 45095134  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  45095133 caaggtgtttacaat 45095119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 200 - 436
Target Start/End: Original strand, 53921493 - 53921727
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| | |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  53921493 acactaagaaatgtttatccagttcggtc-aaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaatgata 53921591  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  53921592 caaatgagttacaagaaattagctttaacaagctcacaaacaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 53921691  T
Q  400 tttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  53921692 tttcactcacccaaggtttttacaa-tgttttccaac 53921727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 39153362 - 39153575
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  39153362 tgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttataaagggatacaaatgagtta 39153460  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39153461 caagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacacatgaacaagacactcaatgattttcattcacc 39153560  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  39153561 caaggtgtttacaat 39153575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 51398981 - 51398768
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51398981 tgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 51398883  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  51398882 caagaaattagcttcaacaagttcactaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattttcactcatc 51398783  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  51398782 caaggtgtttacaat 51398768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 218 - 425
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835216
Alignment:
Q  218 ccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaa 317  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaa 22835108  T
Q  318 ttagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtg 417  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22835109 ttagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 22835208  T
Q  418 tttacaat 425  Q
     |||||||    
T  22835209 attacaat 22835216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 214 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 40735547 - 40735337
Alignment:
Q  214 tgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaa 313  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  40735547 tgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaactggttacaa 40735449  T
Q  314 gaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaa 413  Q
     ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||    
T  40735448 taaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacttttccaa 40735349  T
Q  414 ggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||    
T  40735348 ggtgtttacaat 40735337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31314612 - 31314399
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31314612 tgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaagatacaaatgggtta 31314514  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31314513 caagaaattagcttcaacaagatcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 31314414  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    ||| |||||||||||    
T  31314413 caaagtgtttacaat 31314399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 32891282 - 32891057
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| | | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32891282 acaccaagaaatgattatccagttcggtccaa-catgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagata 32891184  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32891183 caaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccgaagaacaagacactcaatga 32891084  T
Q  399 ttttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32891083 tttttactcacccaaggtgtttacaat 32891057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 37408626 - 37408413
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  37408626 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 37408527  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  37408526 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactca-c 37408428  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
     ||||||||||||||    
T  37408427 taaggtgtttacaat 37408413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 5258144 - 5258358
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  5258144 tgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 5258243  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  5258244 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 5258342  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  5258343 ccaaggtgtttacaat 5258358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7764632 - 7764422
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7764632 tgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 7764533  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7764532 caagaaattagctttaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttccc--tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 7764437  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  7764436 caaggtgtttacaat 7764422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16499196 - 16498984
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  16499196 tgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaa 16499098  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  16499097 caagaaattagcttcaacaagcttacaa-aaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccc 16498999  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  16498998 caaggtgtttacaat 16498984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29682526 - 29682313
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  29682526 tgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtga 29682428  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29682427 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttcactcacc 29682328  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  29682327 caaggtgtttacaat 29682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 211 - 437
Target Start/End: Original strand, 9666467 - 9666693
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||    
T  9666467 tgttgacccagttcggtccaa-ctttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagaggtataaatgagtta 9666565  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9666566 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 9666665  T
Q  410 ccaaggtgtttacaattgttttccaact 437  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9666666 ccaaggtgtttacaaatgtttcccaact 9666693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 231 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 760995 - 760805
Alignment:
Q  231 aacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataa 330  Q
    ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  760995 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaa 760896  T
Q  331 gctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 421  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  760895 gctcacaaagaacagacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgttta 760805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 23200138 - 23200350
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  23200138 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggtta 23200237  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  23200238 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcacc-aagaacaagacactcaatgattttcactca-c 23200335  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  23200336 caaggtgtttacaat 23200350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 231 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29811016 - 29810822
Alignment:
Q  231 aacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataa 330  Q
    ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29811016 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 29810917  T
Q  331 gctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29810916 gttcacaaagaacaactctaatttctacatattttcctaatctcaccaatgaataagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 29810822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 278 - 468
Target Start/End: Original strand, 31340268 - 31340457
Alignment:
Q  278 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  31340268 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacctcaatttctaccaattttcccaatctcacc 31340367  T
Q  378 aaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacc 468  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||    
T  31340368 aatgaacaaaacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagggcaccaacc 31340457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 5260323 - 5260537
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  5260323 tgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 5260422  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||     
T  5260423 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactca- 5260521  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  5260522 ccaaggtgtttacaat 5260537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 23197939 - 23198151
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  23197939 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggtta 23198038  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||  |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  23198039 caagaaattagctttgacaagttcacaaaaaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcacc-aagaacaagacactcaatgattttcactca-c 23198136  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  23198137 caaggtgtttacaat 23198151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29813230 - 29813017
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29813230 tgttgacccagttcggtccaa-catgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatgcaaatgggtta 29813132  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||    
T  29813131 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaattaacaagcccctcaatgattttcactcacc 29813032  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    ||| |||||||||||    
T  29813031 caatgtgtttacaat 29813017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 9636126 - 9636340
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  9636126 tgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggtta 9636225  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||| ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||     
T  9636226 caagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactca- 9636324  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  9636325 ccaaggtgtttacaat 9636340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Original strand, 55301892 - 55302232
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  55301892 caagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacactaagaaatgttcaccaagttcggtc 55301989  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat---------gagttacaagaaatt 319  Q
    |||   | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         ||  |||||||||||    
T  55301990 caacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaataggttacaagaaatacaagaaatt 55302089  T
Q  320 agcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 419  Q
    |||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||                | |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  55302090 agcttcaacaaacttacaaagaacaaccctaatttctacccat----------------atgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtatt 55302172  T
Q  420 tacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  55302173 tacaattgtttcccaactctataatctaacctacaaaagagaaccaacccctagcctttg 55302232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 23391910 - 23392123
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  23391910 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgatacaaatgggtta 23392008  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  23392009 caagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctactcattttcccaaactcaccaatgaaaaagacactaaatgattttcactcacc 23392108  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  23392109 caaggtgtttacaat 23392123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 479
Target Start/End: Original strand, 5433908 - 5434145
Alignment:
Q  237 acctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctca 335  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||||    
T  5433908 acctactatggaggagagattgatctctccaatccaccg-------gttctttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagctttaacaagctca 5434000  T
Q  336 caatgaacaa-ccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttcc 433  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5434001 caaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaattgtttccc 5434099  T
Q  434 aactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||| |||||    
T  5434100 aactctataatctaacccccaaaagagaatcaatctttagtctttg 5434145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 801260 - 801091
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgagt 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  801260 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 801161  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  801160 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 801091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 211 - 436
Target Start/End: Original strand, 23410330 - 23410553
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||| ||||| | ||| | ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23410330 tgttgacccaattcgttccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctccaatccattatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggtta 23410428  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
     | ||||||||||| || |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23410429 tacgaaattagcttaaacaagctcacaaagaataaacataatttctacccattttccaaatttcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcact 23410528  T
Q  411 caaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  23410529 caaggtgtttacaa-tgttttccaac 23410553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 211 - 376
Target Start/End: Original strand, 7780004 - 7780168
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  7780004 tgttcacccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaag-gtt 7780102  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac 376  Q
    |||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7780103 acaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 7780168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 32744437 - 32744640
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | | ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32744437 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagtta 32744535  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||        |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  32744536 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaa-actaatttctacccattttttcaatctc--------acaaaatactcaatgattttcactca-c 32744625  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    ||| |||||||||||    
T  32744626 caatgtgtttacaat 32744640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 129 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 40913544 - 40913352
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatata--acaacaccaagaaat-gttgacccagttcg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||| ||  | |  |||||| |  | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  40913544 caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaagga-taaacaagataaagagattagagaaaaatagacaataacaccaagagattgttgacccagttcg 40913446  T
Q  226 gtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 320  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40913445 gtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6716667 - 6716500
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  6716667 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 6716569  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6716568 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 6716500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 54635292 - 54635125
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  54635292 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 54635194  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54635193 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 54635125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 252 - 474
Target Start/End: Original strand, 35138746 - 35138968
Alignment:
Q  252 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaacccta 350  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||| | |||||| | ||    
T  35138746 gagattgttctcttccatccactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttgcaagaaattaacttcaacaaactcaccaagaacaaacata 35138845  T
Q  351 atttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt-acaattgttttccaactctagaatctaa 448  Q
    ||||||||||| |||| |||||||   | | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||    
T  35138846 atttctaccca-tttctcaatctctttccatgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttcacaattg-tttccaactttaaaatttaa 35138943  T
Q  449 ccaccaaaagagaaccaacccttagc 474  Q
    || |||||||||||  ||||||||||    
T  35138944 cc-ccaaaagagaattaacccttagc 35138968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 251 - 399
Target Start/End: Original strand, 51352151 - 51352298
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccct 349  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  51352151 agagattgatctctcaaatccactctcaatgagttattacaaagaaatacaaatg-gttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccct 51352249  T
Q  350 aatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 399  Q
    || |||||  |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  51352250 aacttcta-tcattttcctaatctcaccaataaacaagacactcaatgat 51352298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 45283146 - 45282983
Alignment:
Q  219 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaaga----gatacaaatgagttacaa 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    |||||||| | |||||||    
T  45283146 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaaag-gttacaa 45283048  T
Q  314 gaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45283047 gaaattagcttgac-aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 45282983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 479
Target Start/End: Original strand, 26323124 - 26323343
Alignment:
Q  262 tctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc 360  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || || |||| |||||||   ||||||||||||||||||||| || |||   |  ||||| |||||||| |||||    
T  26323124 tctccacttcactatcaatgagttttttaccaagatatacaaaaaggttacaagaaattagcttcaacaaactcttcaaaaacaaacctaatttttaccc 26323223  T
Q  361 attttcccaatctca-ccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaag 458  Q
     ||||| |||||||| || | |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||    
T  26323224 -ttttctcaatctcatcccatgaacaagacacttaatgatgttcactcactcaaggtgtttcccaattgtttcccaactctaaaatctaaccctcaaaag 26323322  T
Q  459 agaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  26323323 agaaccaacccttagcttttg 26323343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 329 - 422
Target Start/End: Original strand, 26386599 - 26386692
Alignment:
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 422  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26386599 aagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtatttac 26386692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3617618 - 3617449
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |    
T  3617618 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-g 3617520  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3617519 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 3617449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 5373353 - 5373198
Alignment:
Q  260 tctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttcta 357  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| || |||||||||||    
T  5373353 tctctccaatccattggcaatgagttccttacaaagagatataaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcaaaaagaacaaagcctaatttcta 5373254  T
Q  358 ccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccca 412  Q
    |||  |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5373253 cccttttttcccaatctcttcaatgaacaagacactcaatgattttccctcaccca 5373198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25637590 - 25637426
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||||    
T  25637590 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttaca 25637492  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25637491 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25637426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 227
Target Start/End: Original strand, 31340142 - 31340240
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaag-aaatgttgacccagttcggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31340142 caagtgcatagcaaaaccacaatccaact-aaggaataaacaagataaagaaagcaaaagaaaagataacaacaccaagaaaatgttgacccagttcggt 31340240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 40913315 - 40913241
Alignment:
Q  404 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagccttt 478  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  40913315 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttaaccttt 40913241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Original strand, 4598528 - 4598693
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  4598528 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 4598626  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4598627 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 4598693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Original strand, 4600749 - 4600914
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||| | ||||||    
T  4600749 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaaag-gttaca 4600847  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4600848 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 4600914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10056382 - 10056217
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  10056382 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 10056284  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10056283 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10056217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10058604 - 10058439
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  10058604 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 10058506  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10058505 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10058439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10060826 - 10060661
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  10060826 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 10060728  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10060727 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10060661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10063048 - 10062883
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  10063048 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 10062950  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10062949 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10062883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10065270 - 10065105
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  10065270 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 10065172  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10065171 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10065105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10211558 - 10211393
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  10211558 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 10211460  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10211459 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10211393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10209338 - 10209173
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaagaga-tacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||  | ||||||    
T  10209338 acccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggactacaagag-gttaca 10209240  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10209239 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10209173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 39127691 - 39127447
Alignment:
Q  237 acctactctggagtagagattgatctctccaatccact-atcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctc 334  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| || |||||| | ||||||||||| || || || |||||||||  |  || |||||||||||||||| ||||||    
T  39127691 acctgctctggaggagagattgatctttcaaatccatttatcaatgagttatttacgaaaagatacaaaaaaactataagaaattagcttcaacaagctc 39127592  T
Q  335 acaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaa-gaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttc 432  Q
    || | |||||| | |||||| |||  |||| | |||||||  |  | ||| || || |||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||| |    
T  39127591 accaagaacaaacataatttatacttattt-ctcaatctcttctcatgaataagacgctcaatgattttcactcttccaaggtattttccaattgtttcc 39127493  T
Q  433 caactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  39127492 aaactctagaatttaaccac-aaaagagaactaacccttagcctttg 39127447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33192009 - 33191877
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagat 298  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||   | |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  33192009 acaccaaaaaatgtttaccaagttttgtccaacaatgacctcctctggag-agagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacaaagacat 33191911  T
Q  299 acaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctc 334  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33191910 a-aaatg-gttacaagaacttagcttcaacaagctc 33191877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 374
Target Start/End: Original strand, 4055810 - 4055926
Alignment:
Q  258 gatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatga-gttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttc 355  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | ||| || | | |||||| |||||||||    
T  4055810 gatctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctccaagaacaa-cctaatttc 4055908  T
Q  356 tacccattttcccaatctc 374  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  4055909 taccca-tttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20937781 - 20937668
Alignment:
Q  254 gattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-caaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaat 352  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| | |  ||||| | ||||    
T  20937781 gattgatctctccaatcta-tatcaatgagttcttttcaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaagctctccaaaaacaaacataat 20937683  T
Q  353 ttctacccattttcc 367  Q
    ||||||| |||||||    
T  20937682 ttctacctattttcc 20937668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 309 - 436
Target Start/End: Original strand, 2075156 - 2075281
Alignment:
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactc 407  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||| ||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2075156 tacaataaattagcttaaa--agctcacaaagaaccaactctaattactaccatttttcccaatatcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 2075253  T
Q  408 acccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    |  ||||||||||| || ||||| |||||    
T  2075254 a-gcaaggtgtttataaatgtttcccaac 2075281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 359
Target Start/End: Original strand, 54739004 - 54739102
Alignment:
Q  262 tctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  54739004 tctccaatccactatcaatgagttctttacagagagatataaaagagttac-ataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctacc 54739102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 278
Target Start/End: Original strand, 27305700 - 27305777
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatca 278  Q
    |||| |||||||||  || |||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27305700 acacaaagaaatgtatacacagttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 285
Target Start/End: Original strand, 2075065 - 2075149
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 285  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2075065 acacccagaaatgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaattagtt 2075149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 357
Target Start/End: Original strand, 25491014 - 25491114
Alignment:
Q  258 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttct 356  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |   || ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  25491014 gatctctccacttcactatcaatgatttctttacaaagagatacaaaaggagtataagaaatcagcttcaacaagctctcaaagaacaaacctaatttct 25491113  T
Q  357 a 357  Q
    |    
T  25491114 a 25491114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 438
Target Start/End: Original strand, 8166516 - 8166685
Alignment:
Q  271 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttccca 369  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||   |||| |||| |||| |||||| || ||| | | |||||| |||||||||||| |||||  | |    
T  8166516 cactatcaacaagttctttacaaagagatacaaaaaggttataagatattaacttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttctactcatttatc-a 8166614  T
Q  370 atctcaccaaagaacaaaacac--tcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactc 438  Q
    |||||  | | |||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  8166615 atctcttccatgaacaagacacactcaatgattttcacccacccaatgtgtttacaaatgtttttcaactc 8166685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 320
Target Start/End: Original strand, 4075511 - 4075581
Alignment:
Q  252 gagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatga-gttacaagaaatta 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  4075511 gagagtgatctctccaatccactatcaaagagtttcttacaaagtgatacaaaagaggttacaagaaatta 4075581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 359
Target Start/End: Original strand, 28253346 - 28253416
Alignment:
Q  290 caaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 359  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28253346 caaagaaatacaaaatcgttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacgaaccctaatttctacc 28253416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Original strand, 6095390 - 6095448
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  6095390 tgttgtgaattcgggactcaaatttcacaccaatacaaac----tatgatgtgtggagcaagt 6095448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 54594086 - 54594042
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatat 103  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54594086 tgttgtgaattcgggactcaaatttcacaccaatacaaactatat 54594042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 435
Target Start/End: Original strand, 1313852 - 1314029
Alignment:
Q  259 atctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttct 356  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| |  || |||||||||||||| || |||||| | | |||| || | |||||| |    
T  1313852 atctctctaatccaatatcaatgagttcttttcaaagatatacaaaaggcttgcaagaaattagctttaacaagctctccaagaacaaaacataattttt 1313951  T
Q  357 acccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaa 435  Q
    |||| ||||| |||||||  |  ||||| || | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1313952 accc-ttttctcaatctcttctcaagaataagagactcaat-aatttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaa 1314029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Original strand, 55301758 - 55301818
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  55301758 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaa--ttatatgaggtgtggagcaagt 55301818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 426 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 1683440 - 1683388
Alignment:
Q  426 tgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1683440 tgtttcccaactctagattctaacc-ccaaaagataaccaacccttagcctttg 1683388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 309
Target Start/End: Original strand, 31340242 - 31340275
Alignment:
Q  276 tcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340242 tcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 31340275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Original strand, 43403530 - 43403588
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  43403530 tgttgtgaattccggactaaaatttcacaccaatacaaac----tatgatgtgtggagcaagt 43403588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4386941 - 4386868
Alignment:
Q  291 aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccatttt 365  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||    
T  4386941 aaagtgatacaaatgggttacaagaaattagctt--aaaagctcacaaagaacaaaacctaatttctactcatttt 4386868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1683597 - 1683483
Alignment:
Q  258 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagat-acaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttc 355  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| | | |||| | | |||||||    
T  1683597 gatctctccacttcactataaatgagttctttacaaagagattaaaaacga--tacaagaaattagcatcaataagctctcgaagaacgaacttaatttc 1683500  T
Q  356 tacccattttcccaatct 373  Q
    || |||||||| ||||||    
T  1683499 ta-ccattttctcaatct 1683483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24635366 - 24635276
Alignment:
Q  271 cactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc 360  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||| | | |||||| | ||||||||||||    
T  24635366 cactatcaatgaattgattataaagagatacaaaatagttacaaaaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaacttaatttctaccc 24635276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10067399 - 10067327
Alignment:
Q  307 gttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10067399 gttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10067327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10067469 - 10067436
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggag 249  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10067469 acccagttcggtccaaacttgacctactctggag 10067436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 41510371 - 41510314
Alignment:
Q  271 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||||||||| |||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41510371 cactatcaattagttatttataaaaagatacaaacgagttacaagaaattagcttcaa 41510314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 327
Target Start/End: Original strand, 40519258 - 40519313
Alignment:
Q  272 actatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  40519258 actatcaatgagttctttacaaagagatacaaaata-ttacaagaaattaacttcaa 40519313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 69)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 119 - 479
Target Start/End: Original strand, 42434901 - 42435258
Alignment:
Q  119 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  42434901 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagaaagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacc 42434999  T
Q  219 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 318  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42435000 cagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaat 42435098  T
Q  319 tagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  42435099 tagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaagtgt 42435197  T
Q  419 ttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  42435198 ttacaattgtttaccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcctttg 42435258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 18655650 - 18655302
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagca-aaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18655650 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagagagagtaaagaaaagataacaacaccaaaaaatgttcacccagttcggt 18655551  T
Q  228 ccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18655550 ccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaa 18655452  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18655451 caagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaaaacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattg 18655353  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||| | || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18655352 tttcctaagtctagaatctaacc-ccaaaagagtatcaacccttagcctttg 18655302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 4283771 - 4283425
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4283771 caagtgcatagcaaaaccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtc 4283674  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||| ||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  4283673 caa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 4283575  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4283574 aagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcctaaggtgtttacaattgt 4283476  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283475 ttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 4283425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 40221992 - 40221646
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||  | | ||||||||||||||||    
T  40221992 caagtgcatagcaaaaccacaatccaac-caaagaatgaacaagataaagagagtaaa-gacaagataacaacaccaaagattattgacccagttcggtc 40221895  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  40221894 caa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaac 40221796  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40221795 aagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaaagaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgt 40221697  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40221696 ttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcctttg 40221646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 11384232 - 11383887
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11384232 caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaagaaaaataga-caacaccaaaaaatgttcacccagttcggtc 11384135  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11384134 caa-cttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaac 11384036  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  11384035 aaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctca-taatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattat 11383938  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11383937 ttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 11383887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 129 - 437
Target Start/End: Original strand, 10930118 - 10930424
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaat-gttgacccagttcggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10930118 caagtgcatagcaaaaccacaatccaacaaaag-aataaacaagataaagggagcaaaagaaaagataacaacaccaagaaattgttgacccagttcggt 10930216  T
Q  228 ccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10930217 ccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatataaatgggttacaagaaattagcttcaa 10930315  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
      ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  10930316 cgagctcacaaagagcaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccgatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaaatgtttacaattg 10930414  T
Q  428 ttttccaact 437  Q
    ||| ||||||    
T  10930415 tttcccaact 10930424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 40329023 - 40328680
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||| || | ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  40329023 caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaagga-taaacaagaaaaggagagtaga-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcactcagttccgtc 40328926  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||||     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  40328925 caaac-----ctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaa 40328831  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  40328830 caagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattc-atgattttcactctcccaagatgtttacaattg 40328732  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  40328731 tttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcatagcctttg 40328680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 251 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 44353921 - 44353693
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaacccta 350  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  44353921 agagattgatcttttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaacccta 44353822  T
Q  351 atttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44353821 atttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagatactcaatgatttttactcacccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacc 44353722  T
Q  451 accaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44353721 cccaaaagagaaccaacccttagcctttg 44353693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 211 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 27811445 - 27811222
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27811445 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgggtta 27811347  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27811346 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 27811247  T
Q  411 caaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  27811246 caaggtgtttacaa-tgttttccaac 27811222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 43036590 - 43036377
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43036590 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 43036492  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43036491 caagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 43036392  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  43036391 caaggtgtttacaat 43036377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15212953 - 15212740
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15212953 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 15212855  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15212854 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcacc 15212755  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  15212754 caaggtgtttacaat 15212740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 33352317 - 33352104
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33352317 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 33352219  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33352218 caagaaattaggttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacc 33352119  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  33352118 caaggtgtttacaat 33352104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4731825 - 4731612
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||| | ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4731825 tgttgacccaattcggtccaa-cttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 4731727  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4731726 caagaaattaggttcaacaagctcacaaagagcaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 4731627  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  4731626 caaggtgtttacaat 4731612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 200 - 419
Target Start/End: Original strand, 1292454 - 1292671
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1292454 acaccaagaaatgtttgcccagttcggtccaa-cttgacctactctgggg-agagatttatttctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 1292551  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1292552 caaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccaaagaacaagacactcaataat 1292651  T
Q  400 tttcactcacccaaggtgtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1292652 tttcactcacccaaggtgtt 1292671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 211 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 40321247 - 40321022
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  40321247 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagtttttacaaagagatactaatgggtta 40321149  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  40321148 caagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcagtcact 40321049  T
Q  411 caaggtgtttacaattgttttccaactc 438  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  40321048 caaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 40321022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 42498362 - 42498149
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  42498362 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaaagggtta 42498263  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  42498262 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 42498164  T
Q  410 ccaaggtgtttacaa 424  Q
    |||||||||||||||    
T  42498163 ccaaggtgtttacaa 42498149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 126 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3772442 - 3772160
Alignment:
Q  126 aatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| ||||||||||| || | |||||| |    
T  3772442 aatcaagtgcatagcaaaaccacaatctaac-caaagaataaacaagataaagagagtaga-gaaaagataacaccaccaagaaatatttatccagtttg 3772345  T
Q  226 gtccaaacttcacctactctg-gagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 324  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3772344 gtccaa-cttgacctactctgagag-atagattgatctctccaatccactatcaataaattcttacaaagatatacaaatgagttacaagaaattagctt 3772247  T
Q  325 caataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccc 411  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3772246 aaataagctcacaaagaacaaacctaatttctatcaattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatcattttcactcaccc 3772160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 1345372 - 1345585
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  1345372 tgttgacctagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacatatgggtta 1345470  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1345471 caagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccctaatttctacacattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcacc 1345570  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  1345571 caaggtgtttacaat 1345585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 3303671 - 3303884
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3303671 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 3303769  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||     
T  3303770 caagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcaccaataaacaagatactcaatgattttcactcact 3303869  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  3303870 caaggtgtttacaat 3303884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 34254331 - 34254543
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  34254331 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagggtta 34254430  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||| |||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  34254431 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 34254528  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  34254529 caaggtgtttacaat 34254543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 18141987 - 18141764
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18141987 tgttggcccagtttggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgggtta 18141889  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18141888 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-cctaatttctacccattttcacaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcgcc 18141790  T
Q  411 caaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||    
T  18141789 caaggtgtttacaaatgtttcccaac 18141764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17982821 - 17982607
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  17982821 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 17982722  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    |||||||||| |||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  17982721 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 17982623  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  17982622 ccaaggtgtttacaat 17982607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5689438 - 5689225
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5689438 tgttgacccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 5689340  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5689339 caagaaattagctttgacaagctcacaaagcaccaccttaatttctacccatttttccaatctcattaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 5689240  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  5689239 caaggtgtttacaat 5689225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 34256507 - 34256719
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  34256507 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 34256606  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||| |||  | ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |    
T  34256607 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacaca-c 34256704  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  34256705 caaggtgtttacaat 34256719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 251 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30143468 - 30143296
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaacccta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30143468 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacccta 30143369  T
Q  351 atttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30143368 atttctacccattttcccaatctggccaatgaacaagaca--caatgattttcactcacccaatgtgtttacaat 30143296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31218425 - 31218211
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  31218425 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 31218326  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  31218325 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 31218227  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  31218226 ccaaggtgtttacaat 31218211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 30291735 - 30291549
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccct 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||    
T  30291735 agagattgatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacct 30291636  T
Q  350 aatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  30291635 aatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 30291549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 6599139 - 6598926
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  6599139 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggtta 6599041  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  6599040 caagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcact 6598941  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  6598940 caaggtgtttacaat 6598926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 6674592 - 6674379
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  6674592 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggtta 6674494  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  6674493 caagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcact 6674394  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  6674393 caaggtgtttacaat 6674379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 44304023 - 44303808
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||    
T  44304023 tgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaaggatta 44303924  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc--attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactca 408  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44303923 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 44303824  T
Q  409 cccaaggtgtttacaat 425  Q
     ||||||||||||||||    
T  44303823 -ccaaggtgtttacaat 44303808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 206 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 4162668 - 4162444
Alignment:
Q  206 agaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 305  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4162668 agaaatgtttacccaattcggtccaa-cttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 4162571  T
Q  306 agttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcac 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||| ||||| |||||||||||||||   |||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  4162570 agttacaagaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaacctaacttctacccattttcc---tctcactaatgaacaagacactcaatgattttcac 4162474  T
Q  406 tcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    || | |||||||||||||| |||||||||||    
T  4162473 tcgctcaaggtgtttacaa-tgttttccaac 4162444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 19945359 - 19945574
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg-agtt 309  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  19945359 tgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagtggtt 19945458  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactca 408  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19945459 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 19945558  T
Q  409 cccaaggtgtttacaat 425  Q
     ||||||||||||||||    
T  19945559 -ccaaggtgtttacaat 19945574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 1746219 - 1746432
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  1746219 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggtta 1746317  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||   ||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  1746318 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 1746416  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  1746417 ccaaggtgtttacaat 1746432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 12702635 - 12702852
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  12702635 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagacacaaaagggtta 12702733  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc-----attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcac 405  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  12702734 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcac 12702833  T
Q  406 tcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  12702834 tca-ccaaggtgtttacaat 12702852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 422
Target Start/End: Original strand, 19491700 - 19491909
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| ||||||||||||  |  ||||||| ||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19491700 tgttgacctagttcggtccaatatg-acctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 19491798  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19491799 caagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat-attttcactcacc 19491897  T
Q  411 caaggtgtttac 422  Q
    |||| |||||||    
T  19491898 caagatgtttac 19491909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9765863 - 9765703
Alignment:
Q  261 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9765863 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccc 9765764  T
Q  361 attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9765763 attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaa----tttcactcacccaaggtgtttacaat 9765703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 425
Target Start/End: Original strand, 18106084 - 18106292
Alignment:
Q  213 ttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18106084 ttgacccagttcggtccaa-cttgacctattctgggg-agagattgatctctccaaac-actatcaatgagttcttacaaa-agatacaaatgagttaca 18106179  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccca 412  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  || |||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  18106180 agaaattagcttcaacaagctcgcaaagaacaactatagtttctatccatttttccaatctcaccgatgaacaagacactcaacaattttcactcaccca 18106279  T
Q  413 aggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||    
T  18106280 aggtgtttacaat 18106292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 208 - 430
Target Start/End: Original strand, 8965689 - 8965910
Alignment:
Q  208 aaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgag 307  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  8965689 aaatgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaatgagttcttacaaagagatataaaaggg 8965787  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcact 406  Q
    ||| ||||||||| |||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8965788 ttataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacct-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 8965886  T
Q  407 cacccaaggtgtttacaattgttt 430  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  8965887 cacccaaggtgtttacaaatgttt 8965910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 41366616 - 41366828
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  41366616 tgttgtcccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggg-agagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagggatacaaataggtta 41366713  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
     ||||||||||||| || ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||     |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41366714 aaagaaattagcttaaacaagcttacaaagaacaaacataatttctacccattttctcaatctcagtcttgaacaagacactcaatgattttcactcacc 41366813  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  41366814 caaggtgtttacaat 41366828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2627899 - 2627735
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca-aagagatac-aaatgagttacaa 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||    
T  2627899 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacacaagagatacaaaaagagttgcaa 2627800  T
Q  314 gaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2627799 gaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 2627735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 4743215 - 4743417
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || ||||    
T  4743215 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa----------tgggtta 4743303  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||  |||||||||| || | ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4743304 caagattttagcttcaacaaacacacaaagaacaaacctaatt-ctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcgctcacc 4743402  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  4743403 caaggtgtttacaat 4743417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 260 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10929907 - 10929753
Alignment:
Q  260 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  10929907 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag-----------ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacc 10929819  T
Q  360 cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10929818 cattttccatatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactaatccaaggtgtttacaat 10929753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 8153936 - 8153705
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||| |||| || | ||| |||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  8153936 acaccaaaaaatatttatccatttcggtccaa-cttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagatata 8153838  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaa-taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaaca--aaacactcaat 396  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |      |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  | |||||||||    
T  8153837 caaaagagttacacgaatttagcttcaacaaagctcaga------aaccctaatttcta-ccattttctcaatctcaccaatgaacatgacacactcaat 8153745  T
Q  397 gattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8153744 gattttcactcatccaaggtgtatacaaatgtttcccaac 8153705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10015257 - 10015122
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10015257 acaccaagaaatgattacccagttcggtccaa-cttgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatcaatgagttccta-aaagagata 10015161  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaa 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10015160 caaatgagttacaagaaattagcttcaacaagcacacaa 10015122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 290 - 425
Target Start/End: Original strand, 41364926 - 41365061
Alignment:
Q  290 caaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaac 389  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     |||||| ||    
T  41364926 caaagggatacaaatgtgttacaagaaattagcttaaacaaactcacaaagaacaaacctaatttctaccaattttcccaatctcagtcttgaacaagac 41365025  T
Q  390 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41365026 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 41365061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25690122 - 25689955
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  25690122 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 25690024  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25690023 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cctttttcccaatctcaccaa 25689955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 218 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3439664 - 3439504
Alignment:
Q  218 ccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaa 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  3439664 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 3439566  T
Q  317 attagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3439565 attagctt-gccaagttcataatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 3439504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 251 - 424
Target Start/End: Original strand, 11712040 - 11712214
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaac-cc 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||    
T  11712040 agagattgatctcttcaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaagggtttcaagaaattagcttcaacaagctctcaaggaacaaaacc 11712139  T
Q  349 taatttctacccattttcccaatctca-ccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 424  Q
    |||||| ||   |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  11712140 taatttatatt-attttctcaatctcttccaaagaacaaaagactcaatga-tttcactcatccaagatgtttacaa 11712214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4733873 - 4733784
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataca 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagataca 4733784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 206 - 319
Target Start/End: Original strand, 3073870 - 3073981
Alignment:
Q  206 agaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 305  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  3073870 agaaatgtttacccagttcggcccaa-cttgacctactatgggg-agagattgatctctccaagccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaa 3073967  T
Q  306 agttacaagaaatt 319  Q
     |||||||||||||    
T  3073968 tgttacaagaaatt 3073981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15290687 - 15290522
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  15290687 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 15290589  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15290588 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 15290522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15471056 - 15470891
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  15471056 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 15470958  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15470957 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 15470891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Original strand, 42575329 - 42575494
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  42575329 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 42575427  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42575428 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 42575494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7597757 - 7597559
Alignment:
Q  237 acctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctca 335  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||     
T  7597757 acctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataagaaattagcttcaacaagctct 7597658  T
Q  336 caatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttcc 433  Q
    | | |||| || ||| |||| | | | |||| ||||||||  || |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||    
T  7597657 ccaagaacaaaacctgatttattctc-tttttccaatctcttcccaagaacaaaagactcaatga--ttcactcactcaaggtatttacaaatgtttccc 7597561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 364
Target Start/End: Original strand, 32902199 - 32902327
Alignment:
Q  237 acctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctca 335  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |   ||     
T  32902199 acctactcagggggagagattgatctctcaaattcactatcaatgaattctttagaaagagatacaaaaaagttacaagaaattagcttcaacagagtct 32902298  T
Q  336 caatgaacaaccctaatttctacccattt 364  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||    
T  32902299 ccatgaacaaacataatttctacccattt 32902327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1822421 - 1822313
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccc 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||     
T  1822421 agagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacca 1822322  T
Q  349 taatttcta 357  Q
    |||||||||    
T  1822321 taatttcta 1822313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1856866 - 1856758
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccc 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||     
T  1856866 agagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacca 1856767  T
Q  349 taatttcta 357  Q
    |||||||||    
T  1856766 taatttcta 1856758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 270 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 10240264 - 10240061
Alignment:
Q  270 ccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaa-atgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttc 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||  | || ||    
T  10240264 ccactatcaatgagttctttacaaagagatccaacatg-gttacaagaaattagattcaacaagctcacaaagaacaaacccaaatttcta-tctttgtc 10240167  T
Q  367 ccaatct-caccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt-acaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaacc 464  Q
    ||||||| | || |||||||| | |||| |    |||| |||||| ||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  10240166 ccaatctcctcccaagaacaagagactcga----tttcgctcacctaagatgtttctcaattgtttcccaaatctagaatctaac--cccaaagagaacc 10240073  T
Q  465 aacccttagcct 476  Q
    ||| ||||||||    
T  10240072 aactcttagcct 10240061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 228
Target Start/End: Original strand, 2999718 - 2999820
Alignment:
Q  124 ataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagtt 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| ||||||||||||||||| |||  | |||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  2999718 ataatcaagtgcatagcaaaatcacaat-ctaaccaaagaataaacaagataaagagag-tagagaaaagatatcaacatcaagaaatgtttactcagtt 2999815  T
Q  224 cggtc 228  Q
    |||||    
T  2999816 cggtc 2999820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30909487 - 30909413
Alignment:
Q  259 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctc 334  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  30909487 atctctccaattcactatcaacgagtcattacaaagagatacaaa-gagttacaagaaattagtttaaacaagctc 30909413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Original strand, 42434779 - 42434839
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  42434779 tgttgtgaatttggaactcaaatttcacaccaatacaaac--tatatgatgtgaggagcaagt 42434839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 438
Target Start/End: Original strand, 3231859 - 3232023
Alignment:
Q  275 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatc 372  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||   |||| || ||||||||||||| |||||||| | |||| || ||||||||||| |  ||||| |||||    
T  3231859 atcaataagttctttacaaagagatacaaaatggttaaaaaaaattagcttcaacaagctcacgaagaacaaagcctaatttcta-catttttctcaatc 3231957  T
Q  373 tc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactc 438  Q
    ||  || |||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  3231958 tcttcctaagaacaagagactcaatga-attcacccacccaaggtgtttactaatgtttcccaactc 3232023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 436
Target Start/End: Original strand, 29796317 - 29796547
Alignment:
Q  208 aaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgag--ttcttacaaagagatacaaatg 305  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||   | ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||| || ||||||      
T  29796317 aaatgtttaccaagttcggtccaacaatgacctacattgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagtttttttacaaataggtacaaaaa 29796416  T
Q  306 agttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttc 403  Q
     |||||||||||| |||||||| ||| || | | |||| |||| | |||||||| | |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||  |||    
T  29796417 tgttacaagaaatcagcttcaacaagttctccaagaacaaaccttgatttctactc-ttttcccaatctcttctcaagaacaagagactcaatga-attc 29796514  T
Q  404 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    |||| |||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  29796515 actcgcccaagatatttacaaatgtttcccaac 29796547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 381 - 479
Target Start/End: Original strand, 33655474 - 33655572
Alignment:
Q  381 gaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-ttgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||    |||||||||||||||||| ||||||    
T  33655474 gaacaagacactcaatgattt-cactcatccaagatgttttcaaattattttccaactctaaaatttaacccttgaaagagaaccaacccttaacctttg 33655572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 386 - 435
Target Start/End: Original strand, 1872084 - 1872133
Alignment:
Q  386 aaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaa 435  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||    
T  1872084 aaacactcaatgattttcactcagccaatgtatttacaaatgttttccaa 1872133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38863985 - 38863949
Alignment:
Q  252 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38863985 gagattgatctctccaatccactatcaacgagttctt 38863949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 41267078 - 41266924
Alignment:
Q  271 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttccc 368  Q
    |||||||||  ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  41267078 cactatcaagaagttctttagaaagaaatacaaaagagttacaagaaattagtctcaacaagttctctaagaacaaaacctaatttcta-ccattttctc 41266980  T
Q  369 aatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 424  Q
    || |||  || |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  41266979 aaactcttcctaagaacaagagactcaatga-tttcactcacccaaagtatttacaa 41266924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11384366 - 11384304
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||| ||||    
T  11384366 tgttgtgaactctggactcaaatttcacaccaatatacaaattatatgatgtgtggagtaagt 11384304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11137146 - 11137077
Alignment:
Q  262 tctccaatccactatcaatgagttctt----acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  11137146 tctccaattcactatcaatgagtttttttttacaaagagatacaaaacggttataagaaattagcttcaa 11137077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 101)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 119 - 479
Target Start/End: Original strand, 50673757 - 50674113
Alignment:
Q  119 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  50673757 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacc 50673855  T
Q  219 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 318  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50673856 tagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 50673954  T
Q  319 tagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 418  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  50673955 tagcttcaacaagctcacaaag-acaatcctaatttctactcattttctcaatctcacaaatgaacacgacactc-atgattttcactctcccaaggtgt 50674052  T
Q  419 ttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50674053 ttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 50674113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 133 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 54883265 - 54882921
Alignment:
Q  133 tgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaat-gttgacccagttcggtccaa 231  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54883265 tgcagagcaaaaccacaattcaac-caaagaataaataagataaagagagtaaagaaaaagataacaacaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa 54883167  T
Q  232 acttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataag 331  Q
     ||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  54883166 -cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaag 54883068  T
Q  332 ctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtttt 431  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  54883067 ctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttc 54882969  T
Q  432 ccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54882968 ccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 54882921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 121 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 8665663 - 8665320
Alignment:
Q  121 tctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgaccca 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |    
T  8665663 tctataatcaaatgcatagcaaaaccacaatccaac-caaggaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgtacaccta 8665566  T
Q  221 gttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 320  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8665565 gtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatta 8665467  T
Q  321 gcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 420  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||  |||||||||||    
T  8665466 gcttcaacaagctctcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgttt 8665367  T
Q  421 acaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaac 467  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8665366 acaattgtttcccaactccagaatctaacccccaaaagaaaaccaac 8665320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12073640 - 12073293
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12073640 caagtgcataacaaaaccacaatctaac-caaagaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacctagttcggtc 12073543  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    |||   | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  12073542 caacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaataaattagcttcaac 12073443  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12073442 aagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaataagcaagacactc-atgattttcacactcccaaggtgtttacaattgt 12073344  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12073343 ttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcatttg 12073293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 129 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 40632692 - 40632353
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40632692 caagtgcatggcaaaaccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaaa-aaaagataacaacaccaagaaatgtttacccagttcggtc 40632595  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||| ||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  40632594 caa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaac 40632496  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40632495 aagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgt 40632397  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccctta 472  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40632396 ttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 40632353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 6656203 - 6655857
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6656203 caagtgcatagcaaaaccacaatccaacaaaagga-taaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccaattcggtc 6656106  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6656105 caa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaac 6656007  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6656006 aagttcacaaagaacaaccttaatttctacccattttttcaatctcacaagtgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgt 6655908  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6655907 ttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacctttagcctttg 6655857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 121 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 8648394 - 8648051
Alignment:
Q  121 tctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgaccca 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8648394 tctataatcaaatgcatagcaaaaccacaatccaac-caaggaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcaccca 8648297  T
Q  221 gttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 320  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8648296 gtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttataagaaatta 8648198  T
Q  321 gcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 420  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||  |||||||||||    
T  8648197 gcttcaacaaactcacaatgaacaaccctaatttctatccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgttt 8648098  T
Q  421 acaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaac 467  Q
    ||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8648097 acagttgtttcctaactccagaatctaacccccaaaagagaaccaac 8648051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 129 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 35662688 - 35662346
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||    
T  35662688 caagtgcatagcaaaaccacaatccaac-caaggaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaaaaaatgttcattcagttcggtc 35662591  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||| ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35662590 caa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaac 35662492  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatga-ttttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  35662491 aaactcataaagaacaaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttttcacactctcaaggtgtttacaattg 35662393  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 474  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35662392 tttcccaactctagaatctaacacccaaaagagaaccaacccttagc 35662346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 119 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 41639683 - 41639345
Alignment:
Q  119 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||     
T  41639683 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaa-gaaacgataacaacaccaagaaatgttcact 41639586  T
Q  219 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 318  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41639585 cagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaatagatacaaatgggttacaagaaat 41639487  T
Q  319 tagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 418  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  41639486 tagcttcaaaaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagacactc-gtgattttcactctcctaaggtgt 41639388  T
Q  419 ttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagaga 461  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41639387 ttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagaga 41639345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 379628 - 379279
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  379628 caagtgcataacaaaaccacaatctaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcatccagttcggtc 379531  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    |||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  379530 caacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagcgatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 379431  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatg-attttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  379430 aagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagatactaattgaattttcactctcccaaggtgtttacaattg 379331  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  379330 tttcccaactctagaatctaacccacaaaagagaaccaacccttagcctttg 379279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 41964661 - 41964316
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||| || |    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41964661 caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaagga-taaacaagatagagagt---aaagaaaagataacaacaccaagaaatgctcacccagttcggtc 41964566  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| ||    
T  41964565 caa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaaatgggttacaataaattagcttaaa 41964467  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41964466 caagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaacgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattg 41964367  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41964366 tttcccaactctagaatctaacc-ccaaaagagaaccaacccttagcctttg 41964316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 2209966 - 2209614
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatata--acaacaccaagaaat-gttgacccagttcg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   || || |||||||||||||| ||| | |  |||||| |  |||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  2209966 caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaatga-taaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcg 2209868  T
Q  226 gtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgagttacaagaaattagctt 324  Q
    |||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2209867 gtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagctt 2209768  T
Q  325 caataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 424  Q
    ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2209767 caacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaacaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaa 2209669  T
Q  425 ttgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2209668 ttatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccatagcctttg 2209614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 164 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 46703715 - 46703400
Alignment:
Q  164 ataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctc 263  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  46703715 ataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctc 46703617  T
Q  264 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccat 362  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  46703616 tccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctactcat 46703517  T
Q  363 tttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaa 462  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  46703516 tttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaacactataatctaacccccaaaagagaa 46703417  T
Q  463 ccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||  ||||||||||    
T  46703416 ccaacttttagcctttg 46703400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Original strand, 27416886 - 27417228
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||    
T  27416886 caagtgcatggcaaaaccacaatccaac-caaagaataaacaagataaagagagtaaa-gacaagataacaacaccaaagattgttgactcagttcggtc 27416983  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  27416984 caa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 27417082  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||    |||||||||||||    
T  27417083 aagctcacaaagaacaaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc----tgtttacaattgt 27417177  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27417178 ttcaaaactcaagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagtctttg 27417228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 119 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26364494 - 26364223
Alignment:
Q  119 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaat-gttgac 217  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26364494 agtctataattaagtgtatagcaaaaccacaatccaa-gcaaggaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaattgttgac 26364397  T
Q  218 ccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26364396 ccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaa 26364298  T
Q  318 ttagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacact 392  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26364297 ttagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact 26364223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 125 - 479
Target Start/End: Original strand, 50262613 - 50262965
Alignment:
Q  125 taatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatata--acaacaccaagaaat-gttgacccag 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| | |  |||||| |  |||||||||||| || ||| ||||||    
T  50262613 taatcaagtgcatggcaaaaccacaatccaa-gtaaggaataaacaagataaaaagagtagagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccag 50262711  T
Q  222 ttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattag 321  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50262712 ttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag 50262811  T
Q  322 cttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 421  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||   |||  ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  50262812 cttcaacaagctcacaaagaacaaccgtaatttcgatccattttcccaatct---caataaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtattta 50262907  T
Q  422 caattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50262908 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttg 50262965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 26175637 - 26175850
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26175637 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 26175735  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26175736 caagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 26175835  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  26175836 caaggtgtttacaat 26175850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 56178637 - 56178850
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  56178637 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 56178736  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  56178737 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 56178835  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  56178836 caaggtgtttacaat 56178850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 48893639 - 48893856
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48893639 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagtta 48893737  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctc----acaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcact 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  48893738 caagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 48893837  T
Q  407 cacccaaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||||||    
T  48893838 cacccaaggtgtttacaat 48893856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 200 - 425
Target Start/End: Original strand, 52095352 - 52095576
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  52095352 acaccaaaaattgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaagatttcttacaaagagata 52095450  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 399  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  52095451 caaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 52095550  T
Q  400 tttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  52095551 tttcactcacccaaggtgtttacaat 52095576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 211 - 438
Target Start/End: Original strand, 36463390 - 36463615
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36463390 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtta 36463488  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  36463489 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacagccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgaatttcactcacc 36463588  T
Q  411 caaggtgtttacaattgttttccaactc 438  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36463589 caaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 36463615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5429846 - 5429633
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5429846 tgttgacccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgggtta 5429748  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5429747 caagaaattagcttcaacaagctcacgaagaataaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 5429648  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  5429647 caaggtgtttacaat 5429633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36994691 - 36994478
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36994691 tgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 36994593  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36994592 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 36994493  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  36994492 caaggtgtttacaat 36994478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48143211 - 48142996
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  48143211 tgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttatgaagagatacaaaagggtta 48143112  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48143111 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 48143012  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  48143011 ccaaggtgtttacaat 48142996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 9927459 - 9927671
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9927459 tgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 9927557  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| |    
T  9927558 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcagtgattttcactca-c 9927656  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  9927657 caaggtgtttacaat 9927671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 34570415 - 34570628
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  34570415 tgttgacccagttcgatccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaattgggtta 34570513  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34570514 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 34570613  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||| ||||| ||||    
T  34570614 caagatgttttcaat 34570628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 421
Target Start/End: Original strand, 47038412 - 47038619
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  47038412 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtccttacaaacagatacaaatga-tta 47038509  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47038510 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt-ccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 47038608  T
Q  411 caaggtgttta 421  Q
    |||||||||||    
T  47038609 caaggtgttta 47038619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 200 - 425
Target Start/End: Original strand, 54199897 - 54200120
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54199897 acaccaaaaattgttgacccagttcg-tccaa-cttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaatgagttcttacaaagagata 54199994  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 399  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  54199995 caaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 54200094  T
Q  400 tttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  54200095 tttcactcacccaatgtgtttacaat 54200120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 130 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 12119791 - 12119445
Alignment:
Q  130 aagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagca---aaagaaaatataacaacaccaagaaat-gttgacccagttcg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||  |  ||| || |||||||||||||| ||| |   ||| || | || ||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  12119791 aagtgcatagcaaaaccacaatcggac-caaagactaaacaagataaagagagtagagaaaaaatagatgacaacaccaagaaattgttcacctagttcg 12119693  T
Q  226 gtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 324  Q
    ||||||   | ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  12119692 gtccaacaatgacctactcttggg-agagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctt 12119594  T
Q  325 caataagctcacaatgaacaaccc-taatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttaca 423  Q
    ||| ||| |||||| |||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12119593 caaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacctatgaacaagacactcattgattttcactctcccaaggtatttaca 12119494  T
Q  424 attgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccctta 472  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12119493 attgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 12119445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 200 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31474329 - 31474104
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31474329 acaccaagatatgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagata 31474231  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31474230 caaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatga 31474131  T
Q  399 ttttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31474130 ttttcactcacccaaagtgtttacaat 31474104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Original strand, 26699362 - 26699713
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||    
T  26699362 caagtgcatagcaaaaccataattgaac-caaagaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacggcactaagaaatttttacccagttcggtc 26699459  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||   | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26699460 caacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaa 26699559  T
Q  328 taagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccatt-ttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
     |||||||||| |||||| ||||||| | ||||| || |||  |||||| | ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26699560 caagctcacaaagaacaaaccctaatctataccctttcttctgaatctctctaataaacaagacattcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaat 26699659  T
Q  426 tgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26699660 tgtttcccaactttataatctaacccctaaaagagaaccaacctttaacctttg 26699713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 253 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24969238 - 24969055
Alignment:
Q  253 agattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaat 352  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||    
T  24969238 agatttatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaatctaat 24969139  T
Q  353 ttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24969138 ttctacccatttttccaatctcaccaaagaacaagactctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 24969055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 12739551 - 12739764
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  12739551 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggtta 12739649  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12739650 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacc 12739749  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
     ||||||||||||||    
T  12739750 taaggtgtttacaat 12739764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 209 - 425
Target Start/End: Original strand, 29999804 - 30000019
Alignment:
Q  209 aatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgag 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  29999804 aatgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagag 29999903  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactc 407  Q
    |||||||||||||||||  | | | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  29999904 ttacaagaaattagctttgacatgttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactc 30000002  T
Q  408 acccaaggtgtttacaat 425  Q
    | ||||||||||||||||    
T  30000003 a-ccaaggtgtttacaat 30000019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 436
Target Start/End: Original strand, 52467355 - 52467579
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  52467355 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaaaagttattacaaagtgatacaaatgggtta 52467453  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52467454 caagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaacctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 52467553  T
Q  411 caaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||    
T  52467554 caaggtgtttacaaatgtttcccaac 52467579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5871987 - 5871774
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  5871987 tgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgataaaaatgggtta 5871889  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5871888 caagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 5871789  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  5871788 caaggtgtttacaat 5871774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 37740792 - 37740580
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37740792 tgttgacacagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 37740694  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  37740693 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactca-c 37740595  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  37740594 caaggtgtttacaat 37740580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 251 - 423
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745648
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaacccta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | ||| |||||| |||||||||||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaacccta 12745575  T
Q  351 atttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttaca 423  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745576 atttctacccattttcctaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttaca 12745648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 288 - 479
Target Start/End: Original strand, 55085442 - 55085632
Alignment:
Q  288 tacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaa 387  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||     
T  55085442 tacaaagagatacaaatggtttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacctattttcc-aatctcaccaatgaacaag 55085540  T
Q  388 acactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  55085541 acagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtttccgaactctagaatctaacccccaaaggagaatcaacccttagcctttg 55085632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 200 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4588137 - 4587912
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588137 acaccatgaaatgtttacccagtttggtccaa-cttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 4588039  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatga 398  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| || | |||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  4588038 caaaagggttacaagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaatcttaatttctaccttttttcccaatttcaccaatgaacatgacactcaatga 4587939  T
Q  399 ttttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4587938 ttttcactcacccaaggtgtttacaat 4587912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 211 - 395
Target Start/End: Original strand, 46147392 - 46147575
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46147392 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagtta 46147490  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaa 395  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||||    
T  46147491 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccgatgaacaagacaatcaa 46147575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 200 - 425
Target Start/End: Original strand, 6542169 - 6542395
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6542169 acaccaagaaatgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagata 6542267  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatg 397  Q
    |||| |  | |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||     
T  6542268 caaaaggctaacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctaccattttttcccaatctccccaatgaacaagacactcaata 6542367  T
Q  398 attttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6542368 attttcactcacccaaggtgtttacaat 6542395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 203 - 436
Target Start/End: Original strand, 37229714 - 37229947
Alignment:
Q  203 ccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 302  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  37229714 ccaagaaatgtttacctagttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatataa 37229812  T
Q  303 at-gagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaaca-accctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatt 400  Q
    |  | ||||||| ||||| |||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  37229813 aaagggttacaacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctacc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcattgatt 37229911  T
Q  401 ttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37229912 ttcactcacccaaggtgtttacaaatgttttccaac 37229947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 251 - 425
Target Start/End: Original strand, 12747796 - 12747970
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaacccta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||    
T  12747796 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaacccta 12747895  T
Q  351 atttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12747896 atttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaat 12747970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 194 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21688434 - 21688186
Alignment:
Q  194 ataacaacaccaagaaat-gttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaa 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || ||| ||||| ||| | | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |    
T  21688434 ataacaacaccaagaaattgttgactcaattcggtctaa-cttgacctaatctaggggagggattgatctctccaattcattatcaatgagttcttccga 21688336  T
Q  293 agagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccca-ttttcccaatctcaccaaagaacaaaacac 391  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  21688335 agagatacaaatgagttacaaaaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccgatgaacaagacac 21688236  T
Q  392 tcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctaga 442  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21688235 tc-atgattttcactcccccaaggtgtttagaattgtttcccaactctaga 21688186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29254661 - 29254448
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  29254661 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagacacaaatgggttg 29254563  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  29254562 caagaaattaacttcaacaagctcataaaaaacaactctaatttctacccaatttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcattcacc 29254463  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    ||| |||||||||||    
T  29254462 caatgtgtttacaat 29254448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 251 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3913576 - 3913408
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaacccta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||    
T  3913576 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagatatacaaatgggttaaaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacagctcta 3913477  T
Q  351 atttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3913476 atttctactcattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 3913408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 45687183 - 45687397
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45687183 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgagtta 45687281  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
     |||||||||||||  | |||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  | ||||||||||    
T  45687282 taagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacaatcaaaaaatttcactcac 45687381  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  45687382 ccaaggtgtttacaat 45687397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 219 - 425
Target Start/End: Original strand, 5370091 - 5370300
Alignment:
Q  219 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 318  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5370091 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaat 5370190  T
Q  319 tagc-ttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc---cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaag 414  Q
    |||| ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  5370191 tagcttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctcttttttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaa 5370289  T
Q  415 gtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||    
T  5370290 gtgtttacaat 5370300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 13992293 - 13992499
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13992293 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aagagatacaaaagagtta 13992391  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||| ||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||     
T  13992392 caagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca- 13992483  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  13992484 ccaaggtgtttacaat 13992499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 223 - 425
Target Start/End: Original strand, 52082676 - 52082871
Alignment:
Q  223 tcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagc 322  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||       ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  52082676 tcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatctc-------cactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagt 52082768  T
Q  323 ttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 422  Q
    ||  | ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52082769 tttgacaagttcacaaagaacaaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 52082868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 33990093 - 33989762
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||  ||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  33990093 caagtgcatagcaaatccagaattgaac-caaagaataaacaagataaagagagtagaa-aaaatataataacaccaagaaatgtttacccagttcaatc 33989996  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||   | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  33989995 caagaatgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactattaacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagcttcaa 33989896  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
     || ||| | | |||||| |||| ||||| |||||                  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  33989895 caaactctctaagaacaaacctagtttcttcccat------------------gaacaaaacactcaataatttttactcaaccaaggtgtttacagttg 33989814  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  33989813 tttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaacaaatccttagcctttg 33989762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 51337242 - 51337008
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||  | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51337242 acaccacgaaatgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatgtgtgggagagattgatctctctaatacactatcaatgagttcttaaaaagagata 51337144  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa--ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatg 397  Q
    |||| | |||| || |||||| ||| ||  ||||||||| ||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  51337143 caaaagggttataataaattatcttaaa--agctcacaaagaacaaatccgtaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaacaggacactcaatg 51337046  T
Q  398 attttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51337045 attttcactcacccaaggtgtttacaa-tgttttccaac 51337008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 435
Target Start/End: Original strand, 5207832 - 5208066
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5207832 acaccaataaatgtttacccaattcagtccaaa-ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaatagata 5207930  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatga 398  Q
     | | | ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||  |||| |||||    
T  5207931 tacaagggttgcaataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccc-tttttccaatcactccaatgaacaagtcactaaatga 5208029  T
Q  399 ttttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaa 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5208030 ttttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaa 5208066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 211 - 366
Target Start/End: Original strand, 12743926 - 12744080
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12743926 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 12744024  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttc 366  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12744025 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttc 12744080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 211 - 366
Target Start/End: Original strand, 12745315 - 12745469
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12745315 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 12745413  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttc 366  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12745414 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttc 12745469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 31495316 - 31495485
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgagt 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  31495316 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 31495415  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31495416 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaatcctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 31495485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 13009445 - 13009645
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| ||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  13009445 tgttgacacagttcggtctaa-cttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgtttta 13009543  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||             |||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13009544 caagaaa-------------gctcacgaagaacaaacctaatttctacccattttcacaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 13009630  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  13009631 caaggtgtttacaat 13009645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 251 - 359
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744195
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaacccta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaacccta 12744186  T
Q  351 atttctacc 359  Q
    |||||||||    
T  12744187 atttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 291 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 41639351 - 41639214
Alignment:
Q  291 aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaaca 390  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||    
T  41639351 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagaca 41639252  T
Q  391 ctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtt 429  Q
    |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41639251 ctc-gtgattttcactctcctaaggtgtttacaattgtt 41639214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8393562 - 8393394
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||    
T  8393562 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 8393464  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||||||  | | | |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8393463 tacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 8393394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8395771 - 8395603
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||    
T  8395771 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 8395673  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||||||  | | | |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8395672 tacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 8395603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 479
Target Start/End: Original strand, 22882740 - 22883021
Alignment:
Q  199 aacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagaga 297  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||   | |||||||| || |  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  22882740 aacaccaagaaatgtttatccagttcggtccaacaatgacctactccgggg--gagattgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagaga 22882837  T
Q  298 tacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaat 396  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| | | |||||| |||||||| || |||||||  |||||||   | | ||||||  ||||||||    
T  22882838 tacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttt-tcaatctctttccatgaacaaggcactcaat 22882936  T
Q  397 gattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaa-ccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||||  | ||| | |||  | ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22882937 gattttcactttctcaaagcgttacctaattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaaccattatcctttg 22883021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 479
Target Start/End: Original strand, 22934404 - 22934685
Alignment:
Q  199 aacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagaga 297  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||   | |||||||| || |  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  22934404 aacaccaagaaatgtttatccagttcggtccaacaatgacctactccgggg--gagattgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagaga 22934501  T
Q  298 tacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaat 396  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| | | |||||| |||||||| || |||||||  |||||||   | | ||||||  ||||||||    
T  22934502 tacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttt-tcaatctctttccatgaacaaggcactcaat 22934600  T
Q  397 gattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaa-ccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||||  | ||| | |||  | ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22934601 gattttcactttctcaaagcgttacctaattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaaccattatcctttg 22934685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 33090128 - 33089788
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaa-gaaatgttgacccagttcggt 227  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||| ||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||| | | ||| ||||    
T  33090128 caagtgtaaagcaaaaccacaatcgaac-caaaaaataaacaagataaagagagcaga-gaaaagagaacaacttcaaagaattgtttatctagtccggt 33090031  T
Q  228 ccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttca 326  Q
    ||||   | ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||    
T  33090030 ccaacaataacctactctagaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagcttca 33089931  T
Q  327 ataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    | |||||| | | |||||| | |||||||||  || | || |||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||              
T  33089930 acaagctctccaagaacaaacataatttctattca-tctctcaatctcttcccatgaacaagacactcaatgattttcactcttccaagg---------- 33089842  T
Q  426 tgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33089841 tgtttcccaactctataatctaacctccaaaagagaaccaacctttagcctttg 33089788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 251 - 438
Target Start/End: Original strand, 48142415 - 48142605
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactat--caatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-c 346  Q
    |||||||||||| || |||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  48142415 agagattgatctttcaaatctactatatcaatgagttctttacaaagagatatacaagggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaaac 48142514  T
Q  347 cctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactc 438  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||||    
T  48142515 cctaatttctatc-atgttcccaatctcatcaatgggcaagacactcaatgattttcactcacccgaagtgtttaaaaatgtttcccaactc 48142605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 29056537 - 29056301
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagat 298  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||| ||| |  |||||| ||||   |||||| | |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  29056537 acaccaagaagtgtttacacagttcggtcaaaa-tggacctacactgggtgagagataggtctctctaatccattatcaatgaggttgttacaaagagat 29056439  T
Q  299 acaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaacc-ctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatg 397  Q
    | ||| |  || ||||||||||| |  || |||| ||||| |||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  29056438 ataaaaggattgcaagaaattagttctaacaagcacacaaagaacaaactctaattcctacc-attttcccaatctctctaatgaacaaaacactcaatg 29056340  T
Q  398 attttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  29056339 atttttactcacccaaggtgtttccaaatgtttcccaac 29056301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 32091583 - 32091379
Alignment:
Q  275 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatc- 372  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| | | |||||| |||||||||||  |||||||||||||     
T  32091583 atcaatgtgttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttcta-gcattttcccaatct 32091485  T
Q  373 tcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt-acaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccctt 471  Q
    || || | |||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||    
T  32091484 tctcccatgaacaagagactcaatga-tttcgctcacccaatgtgtttctcaattgtttccaaactttagaatcttacc-ccaaaaaagaaccaacactt 32091387  T
Q  472 agcctttg 479  Q
     |||||||    
T  32091386 tgcctttg 32091379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 251 - 479
Target Start/End: Original strand, 35369485 - 35369708
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccct 349  Q
    |||||| || |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||     |||||  |||||||||| ||||  |||||||| | |||||| |||    
T  35369485 agagatcgacctcttcaattcaccatcaatgagttctttacaaagagata-----gagttttaagaaattagtttcatcaagctcaccaagaacaaacct 35369579  T
Q  350 aatttctacccattttcccaatctcac-caaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatcta 447  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||| |||| |||| |||| |    
T  35369580 aatttctactcattt-cccaatgtcttgcaatgaacaagacactcaatgattttcactctac-aaggtgtttcccaattgtttcccaattctataatcca 35369677  T
Q  448 accaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35369678 acc-ccaaaagagaaccaacccttagcctttg 35369708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5136228 - 5136063
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  5136228 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 5136130  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5136129 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 5136063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5138453 - 5138288
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  5138453 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 5138355  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5138354 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 5138288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 53345340 - 53345187
Alignment:
Q  257 tgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaa-caaccctaattt 354  Q
    ||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  53345340 tgatccctacaatccaatattaatgagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaatcaaccttaattt 53345241  T
Q  355 ctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    |||  ||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53345240 cta-tcattttctcaatctctccgataaacaagacactcaatgattttcactcac 53345187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5350087 - 5349924
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagat 298  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||   | ||||||||||| | |||||  |||||||||  | || |||||| |||||||| ||||||||||    
T  5350087 acaccaataaatgtttacccaattcagtccaacaatgacctactctgggg-agaga--gatctctccgcttcattatcaacgagttctttacaaagagat 5349991  T
Q  299 acaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatttt 365  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5349990 acaaacgagctacaaggaattagcttcgacaagttcacaaagaacaaacctaatttctacccatttt 5349924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 430
Target Start/End: Original strand, 44967818 - 44968048
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagat 298  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||   | || || ||||| | ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||| || ||||||||||    
T  44967818 acacaaagaaatgtttacccaggtcggtccaacagtgacttattctgggggagagattgatccctctaatctactctcaacgagttttttacaaagagat 44967917  T
Q  299 acaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaat 396  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| | | || | || ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |  ||||||    
T  44967918 acaaatg-gttacaagaaattggcttcagcaagctctccaagagcaaaacctaatttcta-ccattttcccaatctcttcccaagaacaacaggctcaat 44968015  T
Q  397 gattttcactcacccaaggtgtttacaattgttt 430  Q
    || ||||||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  44968016 ga-tttcactcaaccaatttgtttacaaatgttt 44968048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Original strand, 55085362 - 55085439
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaaga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  55085362 caagtgcatagcaaaaccacaatcc-aaccaaggaataaacaagataaagagag-taaagaaaagataacaacaccaaga 55085439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 6677597 - 6677412
Alignment:
Q  252 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatg--aacaaccc 348  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| | | |  || || ||    
T  6677597 gagattgatctctcaaatccattatcaaagacttctttacaaagatatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaaaaaaaacc 6677498  T
Q  349 taatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||  || |||||||| | ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  6677497 taatttcta-ccatttt-ccaatttcttcccaagaacaagagactcaatta-tttcactcatccaatgtgtttacaaatgtttcccaac 6677412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 26364222 - 26364166
Alignment:
Q  423 aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26364222 aattgtttcccaactctaaaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcatttg 26364166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 52065719 - 52065530
Alignment:
Q  258 gatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatac-aaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttc 355  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||  ||| |||||||||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  52065719 gatctctccacttcactatcaatgagtttctaacaaagagatacaaaaggggttacagaaaaatagcttcaataagctctctaagaacaa-cctaatttc 52065621  T
Q  356 tacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatct 446  Q
    || ||  ||||||||| ||  ||   || ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||||    
T  52065620 ta-cctgtttcccaatatcttccgttgatcaagagactcgatgattttcactcacccaaggggttcacaattgtttcccaacccaagaatct 52065530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34112939 - 34112862
Alignment:
Q  258 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctc 334  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34112939 gatctctccacttcactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctc 34112862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 41961368 - 41961311
Alignment:
Q  422 caattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41961368 caattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcttttg 41961311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7125070 - 7124901
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||    ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | |    
T  7125070 tgttcacccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-g 7124972  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||| ||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7124971 ttacaagaaattag-tttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 7124901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 359
Target Start/End: Original strand, 34788851 - 34788923
Alignment:
Q  287 ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc 359  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| | | || ||| |||||||||||||    
T  34788851 ttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaacaagctctccaagagcaatcctaatttctacc 34788923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 359
Target Start/End: Original strand, 16422653 - 16422755
Alignment:
Q  258 gatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttct 356  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||| |||  ||||| | ||||||||    
T  16422653 gatctctccacttcactatccatgagttcattacaaagatatacaaaagggtttctagaaattagcttcaaaaagctctcaaaaaacaaacataatttct 16422752  T
Q  357 acc 359  Q
    |||    
T  16422753 acc 16422755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 333
Target Start/End: Original strand, 21703829 - 21703958
Alignment:
Q  204 caagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaa 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||||| ||| | | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21703829 caagaaatgtttacccagttcggtcaaacaatgacctactatgggg-atagattgatatctccaatccactgtcaatgagttctttacaaaaagatacaa 21703927  T
Q  303 atgagttacaagaaattagcttcaataagct 333  Q
    |   | |||||||||| | |||||| |||||    
T  21703928 aaagggtacaagaaatcatcttcaacaagct 21703958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7122864 - 7122682
Alignment:
Q  199 aacaccaagaaat-gttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaag 294  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    ||| ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  7122864 aacacaaagaaattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaag 7122765  T
Q  295 agatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
      ||||||  | ||||||||||||||| ||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7122764 gaatacaagag-gttacaagaaattag-tttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 7122682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2210098 - 2210038
Alignment:
Q  57 cctgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  2210098 cctgttgttaattccggactcaaatttcacaccaatacaaac----tatgatgtgtggagcaagt 2210038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 40632825 - 40632765
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  40632825 tgttgtgaattccggactcaaattacacaccaatacaaact--atatgatgtgtagagcaagt 40632765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 359
Target Start/End: Original strand, 44570427 - 44570514
Alignment:
Q  273 ctatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc 359  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||| | |  ||||| | |||||||||||    
T  44570427 ctatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattagtttcaacaagctctccaacaacaaacataatttctacc 44570514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 358
Target Start/End: Original strand, 22628938 - 22629042
Alignment:
Q  258 gatctctccaa-tccactatcaatgagttctt-acaaagagata--caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatt 353  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| |  |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | | || ||| |||||||    
T  22628938 gatctctccaactccagtatcaatgagttctttactaagagagatgcaaaagagttataagaaattaacttcaataagctctccaagagcaatcctaatt 22629037  T
Q  354 tctac 358  Q
    |||||    
T  22629038 tctac 22629042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 46703804 - 46703748
Alignment:
Q  121 tctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaag 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||    
T  46703804 tctataatcaagtgcatagcaaaaccacaat-ctaaccaaaggataaacaagataaag 46703748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Original strand, 50262487 - 50262544
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  50262487 tgttgtgaattcaga-ctcaaatttcacaccaatacaaac----tatgatgtgtggagcaagt 50262544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 327
Target Start/End: Original strand, 40975057 - 40975125
Alignment:
Q  259 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  40975057 atctctctaatctactatcaaagagtcattacaaagagatacaatagagttaccagaaattaacttcaa 40975125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24969843 - 24969797
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctgg 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24969843 acaccaagaaatgtttacccagttcggtcc-aacttgacctactctgg 24969797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 326
Target Start/End: Original strand, 37754986 - 37755076
Alignment:
Q  237 acctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttca 326  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||| |||   |||||||||||||| |||||    
T  37754986 acctactatgggggagagattgatctcttcaaaccattatcaatgagttttttagaaagagataaaaaaaggttacaagaaattatcttca 37755076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 3786034 - 3785990
Alignment:
Q  434 aactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3786034 aactctagaatctaccc-ccaaaagagaaccaactcttagcctttg 3785990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 5349904 - 5349855
Alignment:
Q  381 gaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttt 430  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  5349904 gaacaagacactcaaagattttcaatcatccaaggtgtttacaaatgttt 5349855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 21688620 - 21688562
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  21688620 tgttgtgaatttcgaactcaaattttacactaatacaaac----tatgatgtgtggagcaagt 21688562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 464
Target Start/End: Original strand, 25723433 - 25723474
Alignment:
Q  423 aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaacc 464  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25723433 aattgttttccatctctagaatctaacacccaaaagagaacc 25723474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 420
Target Start/End: Original strand, 35370449 - 35370557
Alignment:
Q  312 aagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| | |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||   ||| |||||| ||||||||| ||||||||||       
T  35370449 aagaaattagtttcatcaagctcaccaagaacaaacctaatttctactca-tttcccaatgtcttgcaatgaacaagacactcaataattttcactctta 35370547  T
Q  411 caaggtgttt 420  Q
    ||||||||||    
T  35370548 caaggtgttt 35370557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 41639801 - 41639744
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  41639801 tgttgtgaattcaga-ctcaaatttcacatcaatacaaac----tatgatgtgtggagcaagt 41639744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 3677451 - 3677403
Alignment:
Q  390 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactc 438  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3677451 actcaatgattttctctcatacaaggtgtttataattgtttcccaactc 3677403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 119 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 5058303 - 5057948
Alignment:
Q  119 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacc 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  5058303 agtctataatcaagtgcatagtaaaaccataatccaaagcaaggaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacc 5058205  T
Q  219 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 318  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  5058204 cagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggatacaagaaaa 5058106  T
Q  319 tagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 418  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  5058105 tagcttcaacaagctcaca--gaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactcttccaaggtgt 5058009  T
Q  419 ttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5058008 ttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 5057948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 130 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 213715 - 213381
Alignment:
Q  130 aagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagca-aaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  213715 aagtgcatagcaaaaccacaatcaaaagcaaggaataaacaagataaagagagagtaaaggaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtc 213616  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  213615 caaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttaac 213516  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  213515 aagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgt 213417  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaacc 464  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  213416 ttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaacc 213381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 40147508 - 40147162
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||| |||| ||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  40147508 caagtgcataacaaaaccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaatagagtaaa-gaaaagataaaaacacaaaaaaatgttcacccagttcggtc 40147411  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40147410 caa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaac 40147312  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40147311 aagctcacgaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttccactctcccaaggtgtttacaattgt 40147213  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147212 ttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 40147162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 200 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 28278494 - 28278217
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28278494 acaccaagaattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagata 28278396  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 399  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  28278395 caaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgat 28278297  T
Q  400 tttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  28278296 tttcactctcccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagagagccaacccttagcatttg 28278217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 129 - 463
Target Start/End: Original strand, 27637533 - 27637865
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27637533 caagtgcatagcaaaaccacaatccaact-aaggaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatattcacccagttcggtc 27637630  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||   | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||    
T  27637631 caacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttaaa 27637729  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  27637730 caagctcataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgttcacaattg 27637829  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaac 463  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27637830 tttcccaactctagcatctaacccccaaaagagaac 27637865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 119 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 27015779 - 27015433
Alignment:
Q  119 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacc 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||||| |||    
T  27015779 agtctataatcaagtgcatatcaaaaccacaattcaac-caaagcataaacaagataaagagagtaaa-gaaaaaataaca-caccaaaaaatgttcacc 27015683  T
Q  219 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 318  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||    
T  27015682 cagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt--------at 27015592  T
Q  319 tagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 418  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  27015591 tagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaccaaa-cactca-tgattttcactctcccaagatgt 27015494  T
Q  419 ttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015493 ttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 27015433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 213 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 38747170 - 38746906
Alignment:
Q  213 ttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  38747170 ttgacccagtttggtccaa-cttgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatcaatgagtttttccaaagagatacaaatgggttaca 38747072  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccca 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  38747071 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcattaatgaacaagatactc-atgattttcactctccca 38746973  T
Q  413 aggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38746972 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 38746906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 213 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 13488368 - 13488147
Alignment:
Q  213 ttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13488368 ttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 13488270  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccca 412  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  13488269 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaatgaacaagacactcaataattttcactcaccca 13488170  T
Q  413 aggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  13488169 aggtgtttacaa-tgttttccaac 13488147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 42428431 - 42428644
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42428431 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 42428529  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42428530 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 42428629  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  42428630 caaggtgtttacaat 42428644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 200 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13239930 - 13239706
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13239930 acaccaaaaattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 13239831  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 399  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13239830 caaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 13239731  T
Q  400 tttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13239730 tttcactca-ccaaggtgtttacaat 13239706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 533936 - 533723
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  533936 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 533838  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  533837 caaaaaattagcttcaacaagctcacaaagaccaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcactcacc 533738  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  533737 caaggtgtttacaat 533723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25412928 - 25412716
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25412928 tgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 25412829  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  25412828 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 25412731  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  25412730 caaggtgtttacaat 25412716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 32636991 - 32636778
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32636991 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtta 32636893  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32636892 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 32636793  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  32636792 caaggtgtttacaat 32636778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 185 - 479
Target Start/End: Original strand, 16640915 - 16641208
Alignment:
Q  185 aaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagt 284  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  16640915 aaagaaaagataacaacaccaagaaatgtttacccagttcggcccta-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa---gt 16641010  T
Q  285 tcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaacc-ctaatttctacccatttt--cccaatctcaccaaag 381  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||  | ||||||| |||| |    
T  16641011 tcttacaaagagatacaaaagagttatcagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctaccatttttttctcaatctcgccaatg 16641110  T
Q  382 aacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16641111 aacaagacacttaatgaatttcactcactcaaggtgtttacaaatgttccccaactctagaatctaatccccaaaagagaaccaacctttagcctttg 16641208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 39468550 - 39468763
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39468550 tgttgacccagttcagtccaat-ttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 39468648  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  39468649 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcact 39468748  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  39468749 caaggtgtttacaat 39468763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 211 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 33831847 - 33831624
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33831847 tgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 33831749  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33831748 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 33831649  T
Q  411 caaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  33831648 caaggtgtttacaa-tgttttccaac 33831624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 211 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 538192 - 537982
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  538192 tgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 538094  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  538093 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagagcaaccttaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacacgcaatgattttcactcacc 537994  T
Q  411 caaggtgtttac 422  Q
    ||||||||||||    
T  537993 caaggtgtttac 537982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 42426236 - 42426449
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||| ||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  42426236 tgttgacctagttcagtccaa-cttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttg 42426334  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42426335 caagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactcacc 42426434  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  42426435 caaggtgtttacaat 42426449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16452258 - 16452035
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16452258 acaccaagaaatgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagata 16452160  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 399  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  16452159 caaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaacttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgat 16452060  T
Q  400 tttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||    
T  16452059 tgtcactta-ccaaggtgtttacaat 16452035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 213 - 425
Target Start/End: Original strand, 28750658 - 28750869
Alignment:
Q  213 ttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28750658 ttgacccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttaca 28750756  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccca 412  Q
     ||||||| |||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28750757 ggaaattaacttcaacaatttcataaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 28750856  T
Q  413 aggtgtttacaat 425  Q
    |||||||| ||||    
T  28750857 aggtgttttcaat 28750869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 8565947 - 8566160
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  8565947 tgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacagagggatacaaatgggtta 8566045  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8566046 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaagttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 8566145  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  8566146 caaggtgtttacaat 8566160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13343228 - 13343015
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  13343228 tgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaaggatta 13343130  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  13343129 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 13343031  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  13343030 ccaaggtgtttacaat 13343015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 218 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30182749 - 30182543
Alignment:
Q  218 ccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaa 317  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  30182749 ccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatagaaaagggttacaagaaa 30182650  T
Q  318 ttagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtg 417  Q
    |||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30182649 ttagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtg 30182551  T
Q  418 tttacaat 425  Q
    ||| ||||    
T  30182550 tttgcaat 30182543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 218 - 425
Target Start/End: Original strand, 36074050 - 36074258
Alignment:
Q  218 ccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaa 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  36074050 ccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaa 36074148  T
Q  318 ttagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc---attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaag 414  Q
    |||||||  | ||| || ||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  36074149 ttagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaag 36074247  T
Q  415 gtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||    
T  36074248 gtgtttacaat 36074258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31183149 - 31182927
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31183149 acaccaaagaatgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagggata 31183051  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 399  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  31183050 caaatg-gttacaagaaattaacttaaacaaactcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcc-aatctcacaaatgaacaagacactcaatgat 31182953  T
Q  400 tttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31182952 tttcactcacctaaggtgtttacaat 31182927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 37439309 - 37439088
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37439309 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 37439210  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatt--------ttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 402  Q
    |||||||||| |||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||        |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  37439209 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccttttatttttccttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttt 37439110  T
Q  403 cactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    |||||| |||| |||||||||||    
T  37439109 cactca-ccaaagtgtttacaat 37439088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 425
Target Start/End: Original strand, 3075648 - 3075872
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||    
T  3075648 acaccaagaaatgttcacccaatttggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaacgaattcttacaaaaagata 3075746  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 399  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||| | ||||||||||||    
T  3075747 caaatgggttacaagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttctcaatctcacaaatgaacgagacactcaatgat 3075846  T
Q  400 tttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||    
T  3075847 tttcactcatcaaaggtgtttacaat 3075872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 434
Target Start/End: Original strand, 13695680 - 13695914
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagat 298  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||  || ||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13695680 acaccaagaaatgtttacctagtttggtccaag-ttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagat 13695778  T
Q  299 acaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatg 397  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||    
T  13695779 acaaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttgtaccc-ttttcccaatctctccaaagaaaaagatactcaatg 13695877  T
Q  398 attttcactcacccaaggtgtttacaattgttttcca 434  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13695878 attttcactcacacaaggtgtttacaaatgttttcca 13695914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 218 - 425
Target Start/End: Original strand, 30682930 - 30683134
Alignment:
Q  218 ccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagt--tcttacaaagagatacaaatgagttacaaga 315  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  30682930 ccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtattcttacaaagaaatacaaaagggttacaaga 30683028  T
Q  316 aattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaagg 415  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30683029 aattagcttcaacaagttcacaaagaac---cctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaagg 30683124  T
Q  416 tgtttacaat 425  Q
    ||||||||||    
T  30683125 tgtttacaat 30683134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 211 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16409643 - 16409440
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16409643 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 16409544  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    |||||||||||| ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||     
T  16409543 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-tttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca- 16409453  T
Q  410 ccaaggtgtttac 422  Q
    |||||||||||||    
T  16409452 ccaaggtgtttac 16409440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 211 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26178050 - 26177848
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26178050 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 26177951  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    |||||||||||| ||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||     
T  26177950 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc--ttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca- 26177861  T
Q  410 ccaaggtgtttac 422  Q
    |||||||||||||    
T  26177860 ccaaggtgtttac 26177848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 229 - 436
Target Start/End: Original strand, 42309953 - 42310159
Alignment:
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  42309953 caaacttaatctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaac 42310052  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    |||||||||| || ||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||    
T  42310053 aagctcacaaagatcaaacttgatttctacccaatttctcaatctcaccaatgagcaagacactcaatgattttcacttacccaaaatgtttacaa-tgt 42310151  T
Q  429 tttccaac 436  Q
    ||||||||    
T  42310152 tttccaac 42310159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 211 - 420
Target Start/End: Original strand, 9789224 - 9789425
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9789224 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 9789323  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    |||||||||||| ||  | ||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||     
T  9789324 acaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccttaatttctaccc-tttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca- 9789414  T
Q  410 ccaaggtgttt 420  Q
    |||||||||||    
T  9789415 ccaaggtgttt 9789425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 211 - 420
Target Start/End: Original strand, 18441648 - 18441849
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18441648 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 18441747  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    |||||||||||| ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||     
T  18441748 acaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccctaatttctaccc-tttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca- 18441838  T
Q  410 ccaaggtgttt 420  Q
    |||||||||||    
T  18441839 ccaaggtgttt 18441849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 435
Target Start/End: Original strand, 9049332 - 9049565
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9049332 acaccaaaaaatgtttatccatttcggtccaa-cttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagata 9049430  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 399  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||| ||||    
T  9049431 caaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaacaaacactaatttcta-tcattttcccaaactcactaatcaacaagacactcagtgat 9049529  T
Q  400 tttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaa 435  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  9049530 ttttactcacccaaagtgtttacaaatgtttcccaa 9049565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 196 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 316946 - 316663
Alignment:
Q  196 aacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaag 294  Q
    |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||   | ||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  316946 aacaacacaaagaattgtttaccaagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaatgagttctttacaaag 316847  T
Q  295 agatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatc---tcaccaaagaacaaaacac 391  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| ||||||||||| || ||||| |||||   || || |  ||||| | ||    
T  316846 agatacaaaaggattacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaacctaatttcta-cctttttctcaatcttttccccta--aacaagagac 316750  T
Q  392 tcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
     |||||| |||||||||||| || | ||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  316749 ccaatga-tttcactcacccgagtttttcccaattgttttccaactttaaaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 316663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 282 - 425
Target Start/End: Original strand, 5887487 - 5887630
Alignment:
Q  282 agttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaag 381  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||| || |    
T  5887487 agttcttacaaagtgatacaaatgggttgcaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctatccattttctcaatctcacaaatg 5887586  T
Q  382 aacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5887587 aacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 5887630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 29751160 - 29751328
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  29751160 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 29751258  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29751259 acaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 29751328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 22536290 - 22536457
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  22536290 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 22536388  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22536389 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 22536457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29720532 - 29720364
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  29720532 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 29720434  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29720433 acaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 29720364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29722692 - 29722524
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  29722692 tgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 29722594  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29722593 acaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 29722524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19806530 - 19806338
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                   |||    
T  19806530 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaggagttctt-------------------tta 19806451  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
     |||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19806450 gaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacc-taatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatga-tttcactcacc 19806353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10593426 - 10593258
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||    
T  10593426 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 10593328  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  10593327 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttctcccaatctcaccaa 10593258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26170930 - 26170739
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          |||| ||||||    
T  26170930 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctta----------caaaagagtta 26170841  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||| ||  | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26170840 caagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttctaccc--ttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca-c 26170751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25078289 - 25078120
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |    
T  25078289 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-g 25078191  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25078190 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25078120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25136258 - 25136089
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |    
T  25136258 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-g 25136160  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25136159 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25136089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40380259 - 40380090
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |    
T  40380259 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-g 40380161  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||| || |  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40380160 ttacaagaaattagtttgac-aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 40380090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40382470 - 40382301
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |    
T  40382470 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-g 40382372  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  40382371 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaacttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 40382301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 35616278 - 35616082
Alignment:
Q  271 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttccca 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||  ||||| | | |||||| |||||||||||| ||||| | ||    
T  35616278 cactatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattaacttaaacgagctctccaagaacaaacctaatttctactcattt-ctca 35616180  T
Q  370 atctca-ccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaac 467  Q
    |||||  ||   |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  35616179 atctcttcccgtgaacaagagactcaatgattt-cactcacccaaggtgtttcctaattgtttccaaactctagaatctaacca-caaaagagaatcaac 35616082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 42927069 - 42926961
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctg-gagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42927069 acaccaagaaatgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactatgagag-agagatttatttcttcaatccactgtcaatgagttcttacaaagagat 42926972  T
Q  299 acaaatgagtt 309  Q
    |||||||||||    
T  42926971 acaaatgagtt 42926961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 364 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 42926908 - 42926847
Alignment:
Q  364 ttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42926908 ttcccaatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 42926847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 364
Target Start/End: Original strand, 33906024 - 33906184
Alignment:
Q  205 aagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa 303  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||  || ||||||||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33906024 aagaattgtttacccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaa 33906123  T
Q  304 tgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattt 364  Q
     |  ||||||||| |||||||| | |||||| | | | || | |||||||| |||||||||    
T  33906124 aggattacaagaagttagcttcgacaagctctccaagcactaacctaatttatacccattt 33906184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16546794 - 16546629
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||||    
T  16546794 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttaca 16546696  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  16546695 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcctaatctcaccaa 16546629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 340 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 4160670 - 4160534
Alignment:
Q  340 gaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaa-gaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactc 438  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  |  | || ||||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  4160670 gaacaaacctaatttctacc-attttccaaatctcctctcatgagcaaaacattcattgattt-cactcaaccaatgtgtttacaattgtttctcaactc 4160573  T
Q  439 tagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagccttt 478  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4160572 t-gaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 4160534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16544572 - 16544407
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||  | ||||      
T  16544572 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-gttatg 16544474  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16544473 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 16544407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 42926968 - 42926919
Alignment:
Q  278 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42926968 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 42926919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4160847 - 4160702
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||| | |||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||||| |||||||||| || |||| || |||||||| ||||    
T  4160847 caagtgtaaagcaaaaccataatcgaac-caaagaataaacaagataatgagaacata-gaaaagataacaacactaataaatatttacccagtttggtc 4160750  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactat 276  Q
    |||   | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4160749 caacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 3326038 - 3325863
Alignment:
Q  255 attgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagataca-aatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaat 352  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||||  |||||    
T  3326038 attgatctctctaatccaccatcattgagttctttacaaagagatacacaatg-gttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaacaaaactaat 3325940  T
Q  353 ttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttt 430  Q
    ||||| || ||||  |||| ||  || |||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3325939 ttcta-cctttttttcaatttcttcctaagaacaagatacccaatg-gtttcactcacccaaggtgtttacaaatgttt 3325863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 364
Target Start/End: Original strand, 10054860 - 10054969
Alignment:
Q  255 attgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatt 353  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| || |||   | |||||| | |||||    
T  10054860 attgatatctccaatacactatcaatgagttcattacaaagagatacaaaag-gttataagaaattagcttcaacaaactcttcaagaacaaacataatt 10054958  T
Q  354 tctacccattt 364  Q
    |||||||||||    
T  10054959 tctacccattt 10054969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 458
Target Start/End: Original strand, 10700695 - 10700896
Alignment:
Q  258 gatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttct 356  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||   |||| ||||| |||||||||| |||||| | | |||||| ||||||||||    
T  10700695 gatctctccacttcactatcaatgagttctttttaaagagatacaaaaatgttataagaa-ttagcttcaacaagctctctaagaacaaacctaatttct 10700793  T
Q  357 acccattttcccaatct-caccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaaccacca 454  Q
    | || |||| |||||||      | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||  | ||||||||| || |||    
T  10700794 a-ccttttttccaatctattttcatgaacaaaatactcaatgattttcacgcacccaaggtgtttcctaattgtttcccatttttagaatctagccccca 10700892  T
Q  455 aaag 458  Q
    ||||    
T  10700893 aaag 10700896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22097981 - 22097877
Alignment:
Q  261 ctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc 359  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  | |||| ||||||||| |||||| ||  || | | ||||||||||||||||||||    
T  22097981 ctctctaatccactatcaatgagttttttacaaatagatacaa--gggttataagaaattaacttcaacaaattctccaagaacaaccctaatttctacc 22097884  T
Q  360 cattttc 366  Q
    | |||||    
T  22097883 ctttttc 22097877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 38747354 - 38747296
Alignment:
Q  58 ctgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  38747354 ctgttgtgaatt-tggactcaaatttcacaccaatacaaac----tatgatgtgtggagcaagt 38747296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8445844 - 8445767
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    ||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8445844 agagattcatctttctaatctactatcaattagttctttataaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaa 8445767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 422 - 479
Target Start/End: Original strand, 14689622 - 14689678
Alignment:
Q  422 caattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14689622 caattgtttcacaactctagaatctatcc-ccaaaagagaaccaacccctagcctttg 14689678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32579346 - 32579269
Alignment:
Q  258 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctc 334  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32579346 gatcactccacttcactttcaatgagttatttacaaagacatacataagagttacaagaaattagtttcaataagctc 32579269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 365
Target Start/End: Original strand, 14689503 - 14689581
Alignment:
Q  287 ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatttt 365  Q
    |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||| | ||||||||||| |||||    
T  14689503 ttacaaagagatacaaaaatattacaaaaaattagcttcaacaagcactccatgaacaaacataatttctaccaatttt 14689581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 479
Target Start/End: Original strand, 21205842 - 21205920
Alignment:
Q  402 tcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||| |||||||||| | |||| | ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||    
T  21205842 tcactcactcaaggtgtttcccaattatattccaactccataatctaaccctcaaaagagaaccaatccttagtctttg 21205920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 28278650 - 28278607
Alignment:
Q  74 actcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  28278650 actcaaatttcacaccaatacaaa----atatgatgtgtggagcaagt 28278607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 32609641 - 32609587
Alignment:
Q  274 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  32609641 tatcaataagttctttacaaagaaatacaaaagagttacaagaaattaacttcaa 32609587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 394 - 446
Target Start/End: Original strand, 32576481 - 32576533
Alignment:
Q  394 aatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatct 446  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  32576481 aatgattttcactcatcttaggtgtttacaattgtttcccaacccaagaatct 32576533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 95)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 11348948 - 11348599
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagca-aaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  11348948 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagagagagtaaagaaaagataacaacatcaagaaatgttcactcagttcggt 11348849  T
Q  228 ccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11348848 ccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttagaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaa 11348750  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11348749 caagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattg 11348651  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348650 tttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 11348599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 119 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 37168555 - 37168198
Alignment:
Q  119 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  37168555 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatc-aaaccaaggaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacc 37168458  T
Q  219 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgagttacaagaaa 317  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37168457 cagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaa 37168359  T
Q  318 ttagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtg 417  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  37168358 ttagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctctcaaggtg 37168260  T
Q  418 tttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37168259 tttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaatcaacctttagcctttg 37168198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 130 - 479
Target Start/End: Original strand, 13548922 - 13549267
Alignment:
Q  130 aagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtcc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13548922 aagtgcatagcaaaaccacaatccaac-caaagaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtcc 13549019  T
Q  230 aaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaata 329  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || || |    
T  13549020 aa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacatgaaattaggtttaaca 13549118  T
Q  330 agctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtt 429  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13549119 agctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtt 13549217  T
Q  430 ttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549218 tcccaaatctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 13549267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 139 - 479
Target Start/End: Original strand, 13547020 - 13547356
Alignment:
Q  139 gcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcac 238  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  13547020 gcaaaaccacaatccaac-caaagaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaa-cttgac 13547116  T
Q  239 ctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaa 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13547117 ctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaaatagcttcaacaagctcacaa 13547216  T
Q  339 tgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactc 438  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  13547217 agaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaatc 13547315  T
Q  439 tagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547316 tagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 13547356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Original strand, 47255257 - 47255607
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaata--taacaacaccaagaaatgttgacccagttcgg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47255257 caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaaagaaaaaaaataacaacaccaagaaatgttcacccagttcgg 47255355  T
Q  227 tccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttca 326  Q
    |||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47255356 tccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttca 47255455  T
Q  327 ataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatt 426  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  47255456 acaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggcatttacaatt 47255554  T
Q  427 gttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  47255555 atttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagtctttg 47255607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 140 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 193849 - 193512
Alignment:
Q  140 caaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataac-aacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcac 238  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  193849 caaaaccacaatccaac-caaggaataaacaagataaataaagcaaaagagaagataacgaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaa-cttgac 193752  T
Q  239 ctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaa 338  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  193751 atactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctaataa 193652  T
Q  339 tgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactc 438  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  193651 agaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcaccctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 193553  T
Q  439 tagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  193552 tagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 193512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 29136495 - 29136148
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||| ||| | |  |||||| | || |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29136495 caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaagga-taaacaagataaagagagtagagaaaaataga-cagcaccaagaaatgttcacctagttcggtc 29136398  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  29136397 caaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttccaagaaattagcttcaac 29136298  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29136297 aagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgt 29136199  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  29136198 ttcacaactctagaatctaacccccaaaagagaactaacccttagcctttg 29136148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 119 - 474
Target Start/End: Original strand, 7482141 - 7482494
Alignment:
Q  119 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || |||| |||| |||||||| |||    
T  7482141 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaac-caaggaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagatgacaataccatgaaatgttcacc 7482238  T
Q  219 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgagttacaagaaa 317  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7482239 tagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaa 7482337  T
Q  318 ttagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtg 417  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||  |||||||||    
T  7482338 ttagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaatgaacaatacactcatgaattttcactttcccaaggtg 7482437  T
Q  418 tttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 474  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7482438 tttacaattgcttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagc 7482494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Original strand, 31925627 - 31925973
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataa-acaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31925627 caagtgcatagcaaaaccacaatccaac-caaagaataatacaagataacgagagtaaa-gaaaaaataacaacaccaagaaatgttcacctagttcggt 31925724  T
Q  228 ccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31925725 ccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaa 31925823  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31925824 caagctcacaatgaacatccctaatttctacccatttttccactctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaactg 31925922  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31925923 -cttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttg 31925973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 47115420 - 47115072
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  47115420 caagtgcataacaaaaccacaatctaacaaaagga-taaacaagataaaaagagcaga-gaaaagataacaacatcaagaaatgttcacccagttcggtc 47115323  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||   | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  47115322 caacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaa 47115223  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  47115222 caagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaagatgtttacaattg 47115124  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47115123 tttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 47115072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 117 - 479
Target Start/End: Original strand, 42297879 - 42298242
Alignment:
Q  117 caagtctataatc-aagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatata--acaacaccaagaaat-g 212  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||| | || |||  |||||| |  |||||||||||| || |    
T  42297879 caagtctataaaccaagtgcatagcaaaatcacaatccaac-caaataataaacaagataaaag-agtaaagaaaaatagacaacaacaccaagagattg 42297976  T
Q  213 ttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    || |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42297977 ttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttaca 42298076  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccca 412  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||| ||||    
T  42298077 agaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttttactctccca 42298175  T
Q  413 aggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42298176 aggtgtttacaattgtttcacaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcctttg 42298242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 133 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19754737 - 19754395
Alignment:
Q  133 tgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaa 232  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||     
T  19754737 tgcatagcaaaaccacaatccaacaaaagga-taaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataaca-caccaaaaattgttgacccacttcggtccaa- 19754642  T
Q  233 cttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagc 332  Q
    ||| ||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19754641 cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggttacaagaaattagcttcaacaagc 19754542  T
Q  333 tcacaatgaacaaccctaatttctaccca-ttttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtttt 431  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||     
T  19754541 tcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctctcaaggtgtttacgaatgtttc 19754443  T
Q  432 ccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19754442 ccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattatcctttg 19754395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 119 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 34603820 - 34603476
Alignment:
Q  119 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||               
T  34603820 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaac-caaggaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacacctag----------- 34603734  T
Q  219 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgagttacaagaaa 317  Q
       |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  34603733 ---ttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgggttacaagaaa 34603638  T
Q  318 ttagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtg 417  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||  |||||||||    
T  34603637 ttagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtg 34603538  T
Q  418 tttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34603537 tttacaattgtttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaaccaacccttagcctttg 34603476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 211 - 479
Target Start/End: Original strand, 37033072 - 37033340
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||    
T  37033072 tgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatgcaaaatggatt 37033171  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  37033172 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 37033270  T
Q  410 ccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  37033271 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaccaacccatagcctttg 37033340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 8550787 - 8551001
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8550787 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagtta 8550886  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8550887 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 8550986  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    ||| |||||||||||    
T  8550987 caatgtgtttacaat 8551001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 28265555 - 28265768
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28265555 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtta 28265653  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28265654 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 28265753  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  28265754 caaggtgtttacaat 28265768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 44455326 - 44455114
Alignment:
Q  212 gttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44455326 gttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgagttac 44455228  T
Q  312 aagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccc 411  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44455227 aagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatggttttcactcaccc 44455128  T
Q  412 aaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||    
T  44455127 aaggtgtttacaat 44455114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 28220227 - 28220440
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28220227 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 28220325  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28220326 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 28220425  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||| ||||    
T  28220426 caaggtgttttcaat 28220440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31659405 - 31659192
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31659405 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatgggtta 31659307  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31659306 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacagccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 31659207  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  31659206 caaggtgtttacaat 31659192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19752930 - 19752586
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||   | ||  | |||||||| |||||||||    
T  19752930 caagtgcatagtaaaaccacaatccaacaaaagga-taaacaagataaagagagtaaat-aaaagataaca---caaaagattgttgacctagttcggtc 19752836  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||| ||| ||||| | |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  19752835 caa-cttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggttacaagaaattagcttcaac 19752737  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatttt-cccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||     
T  19752736 aagctcgcaaagaacaaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctctcaaggtgtttacgatta 19752638  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19752637 tttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcattagcctttg 19752586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 834168 - 834381
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  834168 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 834266  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  834267 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacgcacc 834366  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  834367 caaggtgtttacaat 834381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 211 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 49918517 - 49918309
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49918517 tgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 49918419  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49918418 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 49918319  T
Q  411 caaggtgttt 420  Q
    ||||||||||    
T  49918318 caaggtgttt 49918309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 237 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1833664 - 1833476
Alignment:
Q  237 acctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcac 336  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||    
T  1833664 acctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatagattcac 1833565  T
Q  337 aatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1833564 aaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 1833476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3157032 - 3156820
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3157032 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 3156934  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  3156933 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 3156835  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    || ||||||||||||    
T  3156834 cagggtgtttacaat 3156820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 418
Target Start/End: Original strand, 28223422 - 28223628
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28223422 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 28223520  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28223521 caagaaattagcttcaacaagttcagaaagatcaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 28223620  T
Q  411 caaggtgt 418  Q
    ||||||||    
T  28223621 caaggtgt 28223628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 46065085 - 46064864
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46065085 tgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacacatgagtta 46064987  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46064986 caagaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaacctaatttttatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 46064887  T
Q  411 caaggtgtttacaattgttttcca 434  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  46064886 caaggtgtttacaa-tgttttcca 46064864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3189498 - 3189285
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3189498 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagtta 3189399  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  3189398 caggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactca-c 3189300  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  3189299 caaggtgtttacaat 3189285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3198315 - 3198102
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3198315 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagtta 3198216  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  3198215 caggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactca-c 3198117  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  3198116 caaggtgtttacaat 3198102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3207154 - 3206941
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3207154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagtta 3207055  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  3207054 caggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactca-c 3206956  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  3206955 caaggtgtttacaat 3206941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 4552638 - 4552851
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  4552638 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagggatacaaaggggtta 4552736  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4552737 caagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttccctcacc 4552836  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  4552837 caaggtgtttacaat 4552851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 50169211 - 50169424
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50169211 tgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagtacttacaaagagatacaaatgagtta 50169309  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50169310 caagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 50169409  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||| ||||||||    
T  50169410 caaggtatttacaat 50169424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 201 - 425
Target Start/End: Original strand, 23555257 - 23555479
Alignment:
Q  201 caccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac 300  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555257 caccaagaaatgtttactcagttcgatccaa-cttgacctactatgggg-agagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac 23555354  T
Q  301 aaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatt 400  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  23555355 aaatgagttataagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaaagaataagacactcaataatt 23555454  T
Q  401 ttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  23555455 ttcattcacccaaggtgtttacaat 23555479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 3847122 - 3847335
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3847122 tgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 3847220  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||| || ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3847221 caaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 3847320  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  3847321 caaggtgtttacaat 3847335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 13659337 - 13659550
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  13659337 tgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaa 13659435  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  13659436 caagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccc 13659535  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  13659536 caaggtgtttacaat 13659550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15820485 - 15820249
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15820485 acaccaataaatgtttacctagttcgatccaa-cttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatcaatgagttcttaaaaagagata 15820387  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 399  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15820386 caaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttttacccatctttccaatatcaccaaagaacaagacactcaatgat 15820287  T
Q  400 tttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactc 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15820286 tttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 15820249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 50167176 - 50167389
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  50167176 tgttgacctagttcggtccaa-cttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggtta 50167274  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50167275 caagaaattagctttgacaagctcacaaataacaaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 50167374  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  50167375 caaggtgtttacaat 50167389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 37503558 - 37503768
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||| || || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  37503558 tgttgacctagttcgatccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaag---gtta 37503653  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37503654 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 37503753  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  37503754 caaggtgtttacaat 37503768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 196908 - 197122
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagt-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  196908 tgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagtt 197006  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  197007 acaagaaattaacttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 197106  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  197107 ccaaggtgtttacaat 197122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10925393 - 10925177
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt---acaaagagatacaaatgag 307  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  10925393 tgttgacccagttcgatccaa-ctttacctaatctaggggagagattgatttctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaagagatacaaatgag 10925295  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactc 407  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10925294 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctatccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 10925195  T
Q  408 acccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10925194 acccaaggtgtttacaat 10925177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 211 - 436
Target Start/End: Original strand, 45644355 - 45644579
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45644355 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttg 45644453  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45644454 caagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcactcac 45644553  T
Q  410 ccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  45644554 ccaagatgtttacaa-tgttttccaac 45644579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 37879007 - 37879178
Alignment:
Q  307 gttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcact 406  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  37879007 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcact 37879105  T
Q  407 cacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37879106 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatccttagcctttg 37879178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 220 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20762831 - 20762626
Alignment:
Q  220 agttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatt 319  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  20762831 agttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacaaaagggttacaagaaatt 20762732  T
Q  320 agcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 418  Q
    |||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20762731 agctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactca-ccaaggtgt 20762633  T
Q  419 ttacaat 425  Q
    |||||||    
T  20762632 ttacaat 20762626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 37559868 - 37560083
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactct-ggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37559868 tgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 37559966  T
Q  310 acaagaaattagctt-caataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactca 408  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37559967 acaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 37560066  T
Q  409 cccaaggtgtttacaat 425  Q
    || || |||||||||||    
T  37560067 cctaatgtgtttacaat 37560083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41361081 - 41360872
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| ||||||||||||  |  ||||||| ||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41361081 tgttgacctagttcggtccaatatg-acctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 41360983  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41360982 caagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat-attttcactcacc 41360884  T
Q  411 caaggtgtttac 422  Q
    |||| |||||||    
T  41360883 caagatgtttac 41360872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 13137977 - 13138188
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||||||||||||||||  |  ||||||||| | | |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13137977 tgttgacccagttcggtccaatatg-acctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatgcaaatgggtta 13138075  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13138076 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacga-cctaatttctatccatttt-tcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 13138173  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  13138174 caaggtgtttacaat 13138188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 13316352 - 13316520
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  13316352 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 13316451  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13316452 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 13316520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 30476447 - 30476662
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30476447 tgttgacccagttcggtccaa-cttaacctcatatggggtagagattgatctgtccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 30476545  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa---agaacaaaacactcaatgattttcactc 407  Q
    ||| |||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||||| |    
T  30476546 caataaattatcttcaacaagttcataaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatattgaacaaga-actcaatgattttcaccc 30476644  T
Q  408 acccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30476645 acccaaggtgtttacaat 30476662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 436
Target Start/End: Original strand, 927966 - 928202
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||  ||| | |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  927966 acacaaagaaatgtttacccagttcggtctaa-cttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaatgagtttttacaaagagatc 928064  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatga 398  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  928065 caaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcattttttccaatatcaccaaagaacaagacactcattga 928164  T
Q  399 ttttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  928165 ttttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 928202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16455799 - 16455585
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||  || ||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16455799 acaccaagaaatgtttacacagtttggtccaat-ttgaccgactatgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacacagagata 16455701  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 399  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16455700 caaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacta-gaaaaaatctaatttctcaccattttaccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 16455602  T
Q  400 tttcactcacccaaggt 416  Q
    |||||||||||||||||    
T  16455601 tttcactcacccaaggt 16455585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 40122197 - 40122412
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactat--caatgagttcttacaaagagatacaaatgagt 308  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40122197 tgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagt 40122295  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactca 408  Q
    || ||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  40122296 tataagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttcgacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgatttttactca 40122395  T
Q  409 cccaaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||||    
T  40122396 cccaaggtgtttacaat 40122412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 51765565 - 51765349
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgagt 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||    
T  51765565 tgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggt 51765466  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcac-aatgaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcact 406  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  51765465 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaacc-aagaacaagacactcaatgatttacact 51765367  T
Q  407 cacccaaggtgtttacaat 425  Q
    || ||||||||||||||||    
T  51765366 ca-ccaaggtgtttacaat 51765349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9987369 - 9987202
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||    
T  9987369 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttgcaaaagggatacaaaag-gtt 9987271  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
     ||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9987270 gcaagaaattagattagacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 9987202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 20622237 - 20622406
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac---aaagagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||| | |    
T  20622237 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaaagggatacaaaag-g 20622335  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20622336 ttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 20622406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40282545 - 40282377
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  40282545 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 40282447  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40282446 acaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 40282377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 129 - 310
Target Start/End: Original strand, 37876687 - 37876865
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | || |||   ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  37876687 caagtgcatagaaaaaccacaattc-aaccaaatgataaacaagataaagagag-taaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtt 37876784  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    | ||||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37876785 c-aacttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggtta 37876865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28242518 - 28242382
Alignment:
Q  164 ataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctc 263  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28242518 ataaacaagataaagagagtaga-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctc 28242420  T
Q  264 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28242419 tccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaa 28242382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9036584 - 9036417
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  9036584 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 9036486  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9036485 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 9036417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 196 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6808636 - 6808358
Alignment:
Q  196 aacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaag 294  Q
    |||||| ||||||||| || | | ||||||| ||||   | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6808636 aacaactccaagaaatatttatctagttcggaccaacaataacctactctgaggaagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaag 6808537  T
Q  295 agatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac------aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaa 387  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||      || ||||||||||| |||||| || |||||| ||  | ||||||     
T  6808536 agatacaaaagagttacaagaagttagcttcaacaagctctccaagaacaaacctaatcctaatttcta-ccatttccctaatctctactcatgaacaag 6808438  T
Q  388 acactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacc 468  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | | |||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  6808437 acactcaataattttcactctcccaaagtgtttcccaatgtttctcaactctagaatctaacc-tcgaaagagaaccaacc 6808358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 201 - 436
Target Start/End: Original strand, 37282682 - 37282916
Alignment:
Q  201 caccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagata 299  Q
    |||||| ||||||| | | ||||| ||||||| || ||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||     
T  37282682 caccaaaaaatgtttatctagttcagtccaaa-ttgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccactactaatgagttctttacaaagagatg 37282780  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatga 398  Q
    |||| | ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||     
T  37282781 caaaagggttaccataaattagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttataccatttttc--aatctctccaatgaacaagacactcaatgg 37282878  T
Q  399 ttttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  37282879 ttttcactcatacaaggtgtttaaaaaagttttccaac 37282916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 201 - 437
Target Start/End: Original strand, 44650153 - 44650389
Alignment:
Q  201 caccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagata 299  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||||||| || ||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  44650153 caccaaaaaatatttacctagttcggtccaaa-ttgacctacttttgggaagagattgatctcttcaatccactattaatgaattatttacaaagagata 44650251  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccc-taatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatga 398  Q
     ||| || |||||| |||||||| | || || ||||||| |||||| || |||||| |||   ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| |    
T  44650252 taaaagatttacaataaattagcgttaacaaactcacaaagaacaaaccataatttttacat-ttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataa 44650350  T
Q  399 ttttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaact 437  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44650351 ttttcactcacccaaagtgtttacaaatgttttccaact 44650389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21054121 - 21053958
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaag 314  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||    
T  21054121 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttgcaag 21054023  T
Q  315 aaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21054022 aaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacac-ttttcccaatctcaccaa 21053958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22079501 - 22079322
Alignment:
Q  196 aacaacaccaa-gaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaa 293  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||    | ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22079501 aacaacaccaaagaaatgtttaccaagtttggtccagcaatgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaa 22079402  T
Q  294 gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 374  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22079401 gagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaacataatttcta-ccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36683858 - 36683694
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||          
T  36683858 acaccaagagatgtttactcagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatcaatgagttcttacaaa------ 36683766  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctca 375  Q
        |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36683765 ----tgagttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaataaacctaatttctacctattttcccaatctca 36683694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 383 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 28242385 - 28242289
Alignment:
Q  383 acaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  28242385 acaagacactcaagaattttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccctaaaagagaaccaacccatagcctttg 28242289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44203800 - 44203631
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |    
T  44203800 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-g 44203702  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44203701 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 44203631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 411
Target Start/End: Original strand, 12318475 - 12318722
Alignment:
Q  162 gaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaat-gttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgat 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||   | | ||||| ||| | |||||  |||    
T  12318475 gaataaacaagataaagggagtaaa-gaaaagagaacaacaccaaaaaattgtttacctagttcggtccaataatgaactactatgggggagaga--gat 12318571  T
Q  261 ctctccaatccactatcaatgagttcttaca-aagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc 359  Q
    |||||   | || |||||||||||||||| | |||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  12318572 ctctctgcttcagtatcaatgagttcttaaagaagacatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaacctaatttctacc 12318671  T
Q  360 cattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccc 411  Q
    || ||||| |||||| ||| | |||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  12318672 ca-tttccaaatctctacccatgaacaagaaactcaatga-tttcactcaccc 12318722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25652195 - 25652018
Alignment:
Q  271 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttccca 369  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||  | ||||||||||| |||| | ||    
T  25652195 cactatcaaagagttctttacaaagagatacaagagagttacaagaaattagcttcaacaaactctcaaataacacacttaatttctaccaattt-ctca 25652097  T
Q  370 atctcaccaaa-gaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatcta 447  Q
    || |   |  | |||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25652096 atattttctcatgaacaaaatactcaatgattttcacacacttaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatcta 25652018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 307 - 424
Target Start/End: Original strand, 8871144 - 8871259
Alignment:
Q  307 gttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcac 405  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| |    
T  8871144 gttacaagaaattagcttcaacgaactcacaaagaacaaaccctaatttcta-ccattttccaaatctcacaaaagaacaagacact--atgattttcgc 8871240  T
Q  406 tcacccaaggtgtttacaa 424  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  8871241 tcatccaaggtgtttacaa 8871259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 255 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3460821 - 3460707
Alignment:
Q  255 attgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaat 352  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||    
T  3460821 attgatctctccaatcgactatcaatatgttctttacaaagatatacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaat 3460722  T
Q  353 ttctacccattttcc 367  Q
    |||||||| ||||||    
T  3460721 ttctaccctttttcc 3460707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Original strand, 13548792 - 13548852
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13548792 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaac--tatatgatgtgtggagcaagt 13548852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 41135926 - 41135721
Alignment:
Q  274 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatc 372  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||| ||   | ||||||  ||||||||||||| |||||  | ||    
T  41135926 tatcaacgagttctttacaaatagatacaaaaggtttacaagaaattaacttcaaaaagttcttcaagaacaaatctaatttctaccctttttct-attc 41135828  T
Q  373 tcaccaaag-aacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta-caattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccct 470  Q
    ||  || || ||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  41135827 tcctcacaggaacaagagactcaatgatttcc-ctcacccaaggtgtttttcaaatgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcct 41135729  T
Q  471 tagccttt 478  Q
    ||||||||    
T  41135728 tagccttt 41135721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 327
Target Start/End: Original strand, 9109459 - 9109536
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  9109459 agagattgatctctccaatacactatcaacgtgttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaa 9109536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 336
Target Start/End: Original strand, 2263016 - 2263100
Alignment:
Q  253 agattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcac 336  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2263016 agattgatctcttcaatccactatcaataagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattatcttcaacaagctcac 2263100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 479
Target Start/End: Original strand, 34602560 - 34602607
Alignment:
Q  432 ccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34602560 ccaactctagaatctaacctccaaaagagaaccaacccttagcctttg 34602607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 359
Target Start/End: Original strand, 4535527 - 4535629
Alignment:
Q  258 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttct 356  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||| | | |||||| | ||||||||    
T  4535527 gatctctccacttaactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattgacttcaataagctctccaagaacaaacttaatttct 4535626  T
Q  357 acc 359  Q
    |||    
T  4535627 acc 4535629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13938259 - 13938143
Alignment:
Q  258 gatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatga-gttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||  | ||| || | | |||||| |||||||||    
T  13938259 gatctctccaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaaaaggttacaagaaattatattttacaagttctccaagaacaa-cctaatttc 13938161  T
Q  356 tacccattttcccaatctc 374  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  13938160 taccca-tttcccaatctc 13938143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32471579 - 32471478
Alignment:
Q  261 ctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc 359  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||  || || ||| |||||| |||||||| ||||    
T  32471579 ctctcgaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagagttgcaataaattaacttcaa-cagttctcaaagaacaaacctaatttatacc 32471481  T
Q  360 cat 362  Q
    |||    
T  32471480 cat 32471478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5460034 - 5459958
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||    
T  5460034 agagattgatctctccaatctactatcaatgagttctttacaaagaaatataaa-atgttacaagaaattagcttcaa 5459958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2926726 - 2926567
Alignment:
Q  162 gaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaa-gaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgat 260  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||| | ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||   | |||||||||| || ||||||||||    
T  2926726 gaataaacaagataaagagagtagagtaaaa-agaacaacaccaaagaattgtttacctagttcggtgcaacaatgacctactctgcagaagagattgat 2926628  T
Q  261 ctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 320  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||   ||||||| ||||||    
T  2926627 ctctccaatccactaccaatgaattcgtttcaaagagatgcaaaaaggttacaataaatta 2926567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11349080 - 11349020
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11349080 tgttgtgaattcgggactcaaattttacaccaatacaaact--atatgatgtgtggagcaagt 11349020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 446
Target Start/End: Original strand, 1050503 - 1050678
Alignment:
Q  271 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttccca 369  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||  ||||||||  ||||| |||||||    
T  1050503 cactatcaacgagttatttacaaagagacacaaaaatgttacaagaaattagcttcaataagctctcgaagaacacacctaattttcaccca-tttccca 1050601  T
Q  370 atctcacca-aagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatct 446  Q
    |||||  || | |||||| | ||||||| | |||||||||  ||| |||| ||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  1050602 atctcttcacatgaacaagagactcaat-aatttcactcattcaatgtgtgtacaaatgtttcccaacccaagaatct 1050678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Original strand, 16914234 - 16914338
Alignment:
Q  271 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaa-ttagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttccc 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||| | |||| | | |||||| | |||||| |||||| ||||||    
T  16914234 cactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttagaagaaacttagcttcaacaggctctccaagaacaaacataatttttaccca-tttccc 16914332  T
Q  369 aatctc 374  Q
    ||||||    
T  16914333 aatctc 16914338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 362 - 437
Target Start/End: Original strand, 44646935 - 44647010
Alignment:
Q  362 ttttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaact 437  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||    
T  44646935 ttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcactcatccaaagtatttacaaatattttccaact 44647010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 279
Target Start/End: Original strand, 8871054 - 8871130
Alignment:
Q  202 accaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa 279  Q
    ||||| ||||||| || || |||||||||| |||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8871054 accaataaatgtttactcaattcggtccaa-cttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 8871130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 422 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22079278 - 22079222
Alignment:
Q  422 caattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22079278 caattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaa-caatccttagcctttg 22079222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 121
Target Start/End: Original strand, 37876573 - 37876614
Alignment:
Q  78 aaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37876573 aaatttcacaccaatacaaac--tatatgatgtgtggagcaagt 37876614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 121
Target Start/End: Original strand, 13546901 - 13546945
Alignment:
Q  75 ctcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13546901 ctcaaatttctcaccaatacaaactatata--atgtgtggagcaagt 13546945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 119
Target Start/End: Original strand, 37032860 - 37032915
Alignment:
Q  61 ttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaa 119  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37032860 ttgtgaattc-gatctcaaatttcacaacaatacaaac--tatatgatgtgtggagcaa 37032915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6398764 - 6398652
Alignment:
Q  261 ctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||  | ||| ||||| | |||||||| || | | |||||| ||||||||||||     
T  6398764 ctctccaattcactatcaatgagtttcttacaaagatatactaaagagaaaaaagtaattaacctcaataagttctccaagaacaa-cctaatttctact 6398666  T
Q  360 cattttcccaatctc 374  Q
    || ||||||||||||    
T  6398665 ca-tttcccaatctc 6398652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19753032 - 19752991
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactat 101  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19753032 tgttgtgaattcaga-ctcaaatttcacaccaatacaaactat 19752991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 324
Target Start/End: Original strand, 22819502 - 22819535
Alignment:
Q  291 aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 324  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22819502 aaagtgatacaaatgagttacaagaaattagctt 22819535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 282
Target Start/End: Original strand, 44646795 - 44646875
Alignment:
Q  201 caccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatga 282  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||||||| || ||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44646795 caccaaaaaatatttacctagttcggtccaaa-ttgacctacttttgggaagagattgatctcttcaatccactattaatga 44646875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44760672 - 44760624
Alignment:
Q  285 tcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctc 334  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44760672 tcttacaaaaagatacaaat-agttacaaaaaattagcttccataagctc 44760624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 430
Target Start/End: Original strand, 1485952 - 1485992
Alignment:
Q  390 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttt 430  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  1485952 actcaatgattttcactcacttaatgtgtttacaattgttt 1485992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 35109557 - 35109492
Alignment:
Q  295 agatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctaccca 361  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  35109557 agatacaaataggttacaagaaattagctt--aaaagctcacaaagaacaaaccttaatttctaccca 35109492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Original strand, 26830041 - 26830391
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagca-aaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26830041 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcagt 26830140  T
Q  228 ccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26830141 c-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggattacaagaaattagcttcaa 26830239  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctca-ccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatt 426  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26830240 caagctcacaaagaacaactctaatttctacccatttttccaatctcacccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaatt 26830338  T
Q  427 gttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830339 gttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 26830391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 121 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 5043883 - 5043528
Alignment:
Q  121 tctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgaccca 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5043883 tctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaac-caagaaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcaccca 5043786  T
Q  221 gttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 320  Q
    |||||||||||   | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5043785 gttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 5043686  T
Q  321 gcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 420  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  5043685 gcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttctcaatctcacgaatgaacaagacactc-atgattttcactctcacaaggtgttt 5043587  T
Q  421 acaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5043586 acaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcctttg 5043528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 185 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21593857 - 21593570
Alignment:
Q  185 aaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagt 284  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593857 aaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagt 21593759  T
Q  285 tcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaac 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21593758 tcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaac 21593659  T
Q  385 aaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 474  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21593658 aagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagc 21593570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17763239 - 17762890
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17763239 caagtgcatagcaaaactacaatctaaccaaagga-tgaacaagataaagagagtaaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacctagttcggtc 17763141  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17763140 caaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatcaatgagttcttccaaaaagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaac 17763041  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  17763040 aagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctctcaaagtgtttacaattgt 17762941  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17762940 ttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 17762890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 189 - 479
Target Start/End: Original strand, 2972918 - 2973206
Alignment:
Q  189 aaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 288  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2972918 aaaaaataacaacaccaagaaatgttcacctagttcggtcgaa-cttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 2973016  T
Q  289 acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaa 388  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  2973017 acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacacga 2973116  T
Q  389 cactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2973117 cact-tatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaatccctaaaagagaaccaacccttagcctttg 2973206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 129 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21589178 - 21588916
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21589178 caagtgcatagcaaaaccacaatccaact-aaggaataaacaagataaggaaagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtc 21589081  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  21589080 caa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 21588982  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactca 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21588981 aagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 21588916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 133 - 479
Target Start/End: Original strand, 3808628 - 3808975
Alignment:
Q  133 tgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaat--ataacaacaccaaga-aatgttgacccagttcggtcc 229  Q
    ||||||||||||||| ||| | || ||| | ||||||||||||||| ||| | |  |||||  | |||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  3808628 tgcatagcaaaaccataat-ctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaaccccaagagattgttcacctagttcggtcc 3808726  T
Q  230 aaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    || | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||     
T  3808727 aatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttcaac 3808826  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3808827 aagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacact-tgtgattttcactctcccaaggtgtttacaattgt 3808925  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3808926 ttcccaactctagaatctaacccccaaaa-agaaccaacccttagcctttg 3808975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 164 - 474
Target Start/End: Original strand, 22424780 - 22425089
Alignment:
Q  164 ataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctc 263  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   | |||||||||| || |||||||||||||    
T  22424780 ataaacaagataaagagagtaga-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctc 22424878  T
Q  264 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccca 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22424879 tccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 22424977  T
Q  362 ttttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagaga 461  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22424978 tttttccaatctcaccaacgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacc-ccaaaagaga 22425076  T
Q  462 accaacccttagc 474  Q
    |||||||||||||    
T  22425077 accaacccttagc 22425089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 129 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17758272 - 17757995
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||| | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17758272 caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaagga-taaacaagataaagagcgtaaaaggaaagataacaacaccaagaaatgttcacctagttcggtc 17758174  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||||||| | ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  17758173 caaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 17758074  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactc 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||   ||||||||||    
T  17758073 aagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaagaagacactcatgaattttcactc 17757995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Original strand, 603005 - 603347
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaat--ataacaacaccaaga-aatgttgacccagttcg 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  603005 caagtgcatagtaaaaccacaatcc-aaccaaggcataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacatcaagagattgttgacccagttcg 603103  T
Q  226 gtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttc 325  Q
    |||| ||||| ||||| ||| | | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  603104 gtcc-aacttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttc 603202  T
Q  326 aataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    || |||||||||| ||||||| | ||||||||        |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  603203 aacaagctcacaaagaacaacacaaatttcta--------cccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactatcccaaggtgtttacaat 603293  T
Q  426 tgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  603294 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttg 603347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 202 - 425
Target Start/End: Original strand, 28137400 - 28137622
Alignment:
Q  202 accaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataca 301  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28137400 accaagaaatgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaataca 28137498  T
Q  302 aatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 401  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28137499 aatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 28137598  T
Q  402 tcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  28137599 tcactcacccaaggtgtttacaat 28137622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 9183032 - 9183245
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9183032 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 9183130  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9183131 caagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 9183230  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  9183231 caaggtgtttacaat 9183245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 5406200 - 5406412
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  5406200 tgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 5406299  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5406300 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 5406397  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  5406398 caaggtgtttacaat 5406412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 5410525 - 5410737
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  5410525 tgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 5410624  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5410625 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 5410722  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  5410723 caaggtgtttacaat 5410737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 33211186 - 33211399
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33211186 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgagcta 33211284  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  33211285 caagaaattaacttcatcaagctcacaaagaacaaccataatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcagtgacc 33211384  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  33211385 caaggtgtttacaat 33211399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 2171532 - 2171744
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  2171532 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-gggtta 2171630  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  2171631 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 2171729  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  2171730 caaggtgtttacaat 2171744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 211 - 436
Target Start/End: Original strand, 31404675 - 31404897
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  31404675 tgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 31404774  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  31404775 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 31404872  T
Q  411 caaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  31404873 caaggtgtttacaa-tgttttccaac 31404897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 237 - 425
Target Start/End: Original strand, 3038929 - 3039117
Alignment:
Q  237 acctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcac 336  Q
    ||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3038929 acctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagctcac 3039028  T
Q  337 aatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3039029 aatgaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaat 3039117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 218 - 425
Target Start/End: Original strand, 5413401 - 5413606
Alignment:
Q  218 ccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaa 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5413401 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaa 5413500  T
Q  318 ttagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtg 417  Q
    |||||||  | ||| || ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  5413501 ttagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttcta-cctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaatgtg 5413598  T
Q  418 tttacaat 425  Q
    ||||||||    
T  5413599 tttacaat 5413606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 26954287 - 26954499
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26954287 tgttgacctagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacagatgagtta 26954385  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  26954386 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttata-ccaatttcccaatctcacatatgaacaagacactcaatgattttcactcccc 26954484  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
     ||||||||||||||    
T  26954485 aaaggtgtttacaat 26954499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 216 - 425
Target Start/End: Original strand, 30834541 - 30834750
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaga 315  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  30834541 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaaga 30834640  T
Q  316 aattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaag 414  Q
    |||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  30834641 aattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccgag 30834739  T
Q  415 gtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||    
T  30834740 gtgtttacaat 30834750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 16452329 - 16452543
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || | ||||    
T  16452329 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatatgaaagggtta 16452428  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  16452429 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 16452527  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  16452528 ccaaggtgtttacaat 16452543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 33160352 - 33160567
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33160352 tgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 33160451  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatga-ttttcactca 408  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  33160452 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttttcactca 33160551  T
Q  409 cccaaggtgtttacaat 425  Q
     ||||||||||||||||    
T  33160552 -ccaaggtgtttacaat 33160567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4045567 - 4045364
Alignment:
Q  236 cacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaa-tgagttacaagaaattagcttcaataagct 333  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4045567 cacctactttggggtagaaattgatctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatga-ttacaagaaattagcttcaacaagct 4045469  T
Q  334 cacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttc 432  Q
    || || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  4045468 cataaagaacaaaccctaatttctacc-attttcccaatctctccaataaacaagacactcaatgattttcactcaccctaggtgtttacaaatgtttcc 4045370  T
Q  433 caactc 438  Q
    ||||||    
T  4045369 caactc 4045364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 412270 - 412101
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgagt 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  412270 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 412171  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  412170 tacaagaaattagatttgataagttcacaatgaacaaccctaatttcta-cctttttcccaatctcaccaa 412101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 3072759 - 3072928
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgagt 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  3072759 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 3072858  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3072859 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaa 3072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 129 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26800835 - 26800630
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   || || |||||||||||||  ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26800835 caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaaga-taaacaagataaaaagagtaga-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcatccagttcggtc 26800738  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  26800737 caacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaattagttacaagaaattagcttcaa 26800639  T
Q  328 taagctcac 336  Q
     ||||||||    
T  26800638 caagctcac 26800630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 251 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 25073697 - 25073469
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccct 349  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||| |||||| || |||||||| | ||| ||  ||    
T  25073697 agagattgatttctctaatccactatcaatgagttctttacatagagatacaaaagggttacaataaaatagctttaacaagctcacgaagaataaatct 25073598  T
Q  350 aatttctacccattttcccaatctca-ccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatcta 447  Q
    |||||||||| |||||  |||||||  || | |||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  25073597 aatttctacc-attttttcaatctcctcccatgaacaagatactcaatgattt-cactcacccaagatgtttcccaattgtttcccaactctagaatcta 25073500  T
Q  448 accaccaaaagagaaccaacccttagccttt 478  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25073499 acccccaaaagagaatcaacccttagccttt 25073469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16569189 - 16568997
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||    
T  16569189 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaag------------gtta 16569103  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||          ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16569102 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct----------caagacactcaatgattttcacttac 16569013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 211 - 422
Target Start/End: Original strand, 6097451 - 6097643
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||          |||||| ||||||    
T  6097451 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttct----------tacaaaagagtta 6097540  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||| ||  | ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |    
T  6097541 caagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttcta-ccatttttccaatctcac-------caaaacactcaatgattttcactca-c 6097631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27648028 - 27647861
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  27648028 tgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 27647930  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27647929 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 27647861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 218 - 303
Target Start/End: Original strand, 5409076 - 5409161
Alignment:
Q  218 ccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5409076 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 5409161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16555037 - 16554869
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||    
T  16555037 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 16554939  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16554938 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16554869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 16578518 - 16578686
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||    
T  16578518 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 16578616  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16578617 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16578686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16616862 - 16616694
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||    
T  16616862 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 16616764  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16616763 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16616694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16631593 - 16631425
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||    
T  16631593 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 16631495  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16631494 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16631425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16653280 - 16653112
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||    
T  16653280 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 16653182  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16653181 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttaccc-ttttcccaatctcaccaa 16653112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25421474 - 25421305
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |    
T  25421474 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-g 25421376  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25421375 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25421305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6027415 - 6027246
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |    
T  6027415 tgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-g 6027317  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6027316 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 6027246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13154078 - 13153913
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  13154078 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 13153980  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13153979 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 13153913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Original strand, 33342110 - 33342275
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaagaga-tacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||  | ||||||    
T  33342110 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggagtacaagag-gttaca 33342208  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33342209 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 33342275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34165021 - 34164856
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  34165021 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 34164923  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34164922 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 34164856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34167248 - 34167078
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||  ||||||  | |    
T  34167248 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataagttctttacaaaaggaatacaagag-g 34167150  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34167149 ttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 34167078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16567265 - 16567160
Alignment:
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaac-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||          | ||||||||||||||||||||||    
T  16567265 caagaaattagcttaaacaagctcacaaaaaacaaaacctaatttctaaccattttcccaatctca----------agacactcaatgattttcactcac 16567176  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  16567175 ccaaggtgtttacaat 16567160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 479
Target Start/End: Original strand, 5740970 - 5741058
Alignment:
Q  391 ctcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||    
T  5740970 ctcaatgattt-cactcaccgaaggtgttttccaattgttttccaactttagaatctaaccccccaaaagtaaccaacccttagcctttg 5741058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9572784 - 9572667
Alignment:
Q  187 agaaaatataacaacaccaagaaatgttg-acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 285  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||  |||||||||| | |||   | |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  9572784 agaaaagataacaacatcaagaaatattttacccagttcgtttcaatgatgacctactctaaagtagagattgatctctgcaatccactatcaatgggtt 9572685  T
Q  286 ctt-acaaagagatacaa 302  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  9572684 cttaacaaagagttacaa 9572667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Original strand, 26829909 - 26829969
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26829909 tgttgtgaattcggggctcaaatttcacaccaatacaaac--tatatgatgtgtggagcaagt 26829969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 17758402 - 17758344
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  17758402 tgttgtgaattcgggactcaaatttcacaccaatacaaac----tatgatgtgtggagcaagt 17758344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 21589308 - 21589250
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||    
T  21589308 tgttgtgaattctggactcaaatttcacaccaatataaac----tatgatgtgtggagcaagt 21589250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2908586 - 2908503
Alignment:
Q  252 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctc 334  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||  || |||||| |||||| ||||||    
T  2908586 gagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctttacaataagatacaaaagagttgtaaaaaattatcttcaacaagctc 2908503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 17763369 - 17763311
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||    
T  17763369 tgttgtgaattcgggactcaaatttcacaccaatataaac----tatgatgtgtggagcaagt 17763311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 412 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 11660574 - 11660508
Alignment:
Q  412 aaggtgtttacaa-ttgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11660574 aaggtgtttacaaattgtttccgaactctagaatctaacc-ccaaaat-gaaccaacccttagcctttg 11660508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 327
Target Start/End: Original strand, 26310412 - 26310472
Alignment:
Q  266 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26310412 caatccactatgaataagtcttta-aaagagatacaaagaagttacaagaaattagcttcaa 26310472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 119 - 479
Target Start/End: Original strand, 35446795 - 35447151
Alignment:
Q  119 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  35446795 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaattcaac-caaagcataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacc 35446892  T
Q  219 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 318  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35446893 cagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaat 35446991  T
Q  319 tagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 418  Q
    ||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  35446992 tagattcaacaagatcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttaccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgt 35447090  T
Q  419 ttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35447091 ttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 35447151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 119 - 479
Target Start/End: Original strand, 1631645 - 1631999
Alignment:
Q  119 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacc 218  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||||| || ||     
T  1631645 agtctgtaatcaagtgtatagcaaaaccacaatccaaa---aggaataaacaagataaagagagcaag-gaaaagataacaacactaagaaatattcact 1631740  T
Q  219 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 318  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1631741 cagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagatat 1631839  T
Q  319 tagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  1631840 tagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctctcaaggtgt 1631938  T
Q  419 ttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631939 ttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 1631999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 130 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 45727173 - 45726830
Alignment:
Q  130 aagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtcc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  45727173 aagtgcatagcaaaaccacaatccaac-caaagaataaa--agataaagagagtaaa-gaaaagataacaacactaaaaaatgttcacccagttcggtcc 45727078  T
Q  230 aaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaata 329  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  45727077 aa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaaca 45726979  T
Q  330 agctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtt 429  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45726978 agctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtt 45726880  T
Q  430 ttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45726879 tcctaaccctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 45726830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Original strand, 42288031 - 42288377
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatg-ttgacccagttcggt 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | | ||| ||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  42288031 caagtgcatagaaaaaccacaatccaac-caaggaataaacaagttaaagagggtaaa-gaaaagataacagcaccaagaaattattgacccagttcggt 42288128  T
Q  228 ccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42288129 ccaa-cttgacctaatctgggg-agagattgatctctccaatccattatcaatgagctcttacaaagaaatacaaatgggttacaataaattagcttcaa 42288226  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42288227 caagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaatgcacaagacactc-gtgattttcactctcccaaggtgtttacaattg 42288325  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  42288326 tttcccaactctagaatctaaacccgaaaagagaaccaacccttagcctttg 42288377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 217 - 425
Target Start/End: Original strand, 2334424 - 2334631
Alignment:
Q  217 cccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaa 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2334424 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttactagaa 2334523  T
Q  317 attagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggt 416  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2334524 attagcttcaacaagttcacaaagaacaacccttatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggt 2334622  T
Q  417 gtttacaat 425  Q
    |||||||||    
T  2334623 gtttacaat 2334631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 17057370 - 17057583
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17057370 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 17057468  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||| ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17057469 caaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 17057568  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  17057569 caaggtgtttacaat 17057583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 17085353 - 17085566
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17085353 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 17085451  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||| ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17085452 caaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 17085551  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  17085552 caaggtgtttacaat 17085566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36773729 - 36773516
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36773729 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagtta 36773631  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36773630 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 36773531  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  36773530 caaggtgtttacaat 36773516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 36318010 - 36318223
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36318010 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 36318108  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36318109 caataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 36318208  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  36318209 caaggtgtttacaat 36318223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 213 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29868034 - 29867823
Alignment:
Q  213 ttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29868034 ttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttaca 29867936  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccca 412  Q
    ||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29867935 agaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 29867836  T
Q  413 aggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||    
T  29867835 aggtgtttacaat 29867823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 723745 - 723958
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  723745 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 723843  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  723844 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccagttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 723943  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  723944 caaggtgtttacaat 723958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 38312407 - 38312194
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38312407 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggtta 38312309  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  38312308 caagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaca 38312209  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||| ||||||    
T  38312208 caaggtgtatacaat 38312194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 34139771 - 34139985
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgagtt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||    
T  34139771 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatgggtt 34139869  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34139870 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 34139969  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  34139970 ccaaggtgtttacaat 34139985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 422
Target Start/End: Original strand, 36988076 - 36988286
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36988076 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 36988175  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  36988176 caagaaattagttttgacaagctcacatagaacaaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 36988274  T
Q  411 caaggtgtttac 422  Q
    ||||||||||||    
T  36988275 caaggtgtttac 36988286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17450824 - 17450491
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||||||  | |||| ||| |||||||||    
T  17450824 caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaca-gaaaagataacaacaccaaagattgttcacctagttcggtc 17450727  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  17450726 caa-cttgacctactctgtgg-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttc------------acaaatgggttacaa-aaattagcttcaac 17450642  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17450641 aagctcacaaagaacaagcctaatctctacccatttttcaaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttgcaaatgt 17450542  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    || |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17450541 ttgccaactctagaatccaacccccaatagagaatcaacccttagcctttg 17450491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 211 - 438
Target Start/End: Original strand, 33162451 - 33162676
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33162451 tgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacagagagatacaaatgggtta 33162549  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  33162550 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcctaatttcaccaatgaacaagacactcgatgattttcaatcacc 33162649  T
Q  411 caaggtgtttacaattgttttccaactc 438  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  33162650 caaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 33162676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 45099922 - 45099709
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45099922 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtta 45099824  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  45099823 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 45099725  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  45099724 ccaaggtgtttacaat 45099709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 231 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362306
Alignment:
Q  231 aacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataa 330  Q
    ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaa 42362401  T
Q  331 gctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42362400 gctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 42362306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 14633826 - 14634040
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgagtt 309  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  14633826 tgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatctatgagttcttacaaaagggatacaaatgggtt 14633924  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14633925 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttaccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 14634024  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  14634025 ccaaggtgtttacaat 14634040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 5723256 - 5723468
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  5723256 tgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaaggtta 5723355  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5723356 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaagcctaatttctaccc-ttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 5723453  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  5723454 caaggtgtttacaat 5723468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 11151592 - 11151805
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11151592 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggtta 11151690  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11151691 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcacc 11151790  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  11151791 caaggtgtttacaat 11151805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 4503133 - 4503346
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4503133 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtta 4503231  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  4503232 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 4503330  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  4503331 ccaaggtgtttacaat 4503346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11690668 - 11690455
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| || || | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11690668 tgttgatccagttcggtccaa-cttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaacgatttcttacaaagggatacaaatgggtta 11690570  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11690569 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 11690470  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  11690469 caaggtgtttacaat 11690455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 211 - 422
Target Start/End: Original strand, 36205665 - 36205874
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36205665 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtta 36205763  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  36205764 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 36205862  T
Q  411 caaggtgtttac 422  Q
    ||||||||||||    
T  36205863 caaggtgtttac 36205874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11067472 - 11067259
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11067472 tgttgaccgagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 11067374  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11067373 caagaaattagctttgacaagctcacaaagtacaacactaatttctacccatttttccaatttcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 11067274  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  11067273 caaggtgtttacaat 11067259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 194 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 24398244 - 24397962
Alignment:
Q  194 ataacaacaccaagaaat-gttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-aca 291  Q
    |||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||   | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  24398244 ataacaacaccaagtaattgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttctttaca 24398145  T
Q  292 aagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccatt-ttcccaatctcaccaaagaacaaaac 389  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| |||||||| || ||| |||||||||||| |||||| ||    
T  24398144 aagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaatgaacaagac 24398045  T
Q  390 actcaatgattttcactc-acccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 474  Q
    ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  24398044 actcattgattttcactcttccaaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaa---agaaccaacccttagc 24397962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 4484330 - 4484544
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  4484330 tgttcacccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 4484429  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactca 408  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4484430 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatttcacc-aagaacaagacactcaatgatttacactca 4484528  T
Q  409 cccaaggtgtttacaat 425  Q
     ||||||||||||||||    
T  4484529 -ccaaggtgtttacaat 4484544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 219 - 426
Target Start/End: Original strand, 6595014 - 6595221
Alignment:
Q  219 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 318  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  6595014 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagattcaaaagggttacaagaaat 6595113  T
Q  319 tagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtg 417  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||  |||| |||    
T  6595114 tagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcctaatctcaccaatgaacaagacacccaatgattctcactc-tccaaagtg 6595212  T
Q  418 tttacaatt 426  Q
    |||||||||    
T  6595213 tttacaatt 6595221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30833514 - 30833300
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  30833514 tgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 30833415  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactca 408  Q
    ||||||||||| |||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30833414 acaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcacc-aagaacaagacactcaatgatttacactca 30833316  T
Q  409 cccaaggtgtttacaat 425  Q
     |||| |||||||||||    
T  30833315 -ccaaagtgtttacaat 30833300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 129 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 33648420 - 33648089
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||  || ||||||||||||||||| ||| | | ||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33648420 caagtgcatagcaaaatcacaatt-aaactaaagaataaacaagataaagagagtaga-gaaaagacaacaacaccaataaatgtttacccagttcggtc 33648323  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||   | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  33648322 caacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaggaaattagcttcaa 33648223  T
Q  328 taagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatct-caccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtg-tttacaa 424  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | |  | | |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||      
T  33648222 caagctcacaaagaacaaaccctaattttta-ccattttctcaatctcctctcatgtacaagacactcaattattttcactctcccaagatgttttacgg 33648124  T
Q  425 ttgttttccaactctagaatctaaccaccaaaaga 459  Q
    || | | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33648123 ttatgtcccaactctagaatctaacccccaaaaga 33648089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 205 - 438
Target Start/End: Original strand, 17490143 - 17490368
Alignment:
Q  205 aagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  17490143 aagaaatgtttacccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatcaatgagttcttacaaagagttacaaaa 17490241  T
Q  305 gagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttca 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  17490242 gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataa----aatttcta-ccatttt-ccaatctcaacaatgaacaagacattcaatgattttca 17490335  T
Q  405 ctcacccaaggtgtttacaattgttttccaactc 438  Q
    | ||||||  |||||| ||| |||||||||||||    
T  17490336 cccacccactgtgtttgcaa-tgttttccaactc 17490368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 13121901 - 13121712
Alignment:
Q  245 tggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaaca 344  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  13121901 tggaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagtttctacaaagagatacaaagg--ttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaaca 13121804  T
Q  345 a-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  13121803 aaccctaatttctacc-attttcccagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaaatgtttcccaac 13121712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 11049732 - 11049493
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || ||||| | || || |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11049732 acacaaagaaatgtttacccagttcagtccaat-ttgacctattatgaaggagagattgatcttttcaatctactatcaatgagttcttacaaagagata 11049634  T
Q  300 c-aaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaa---tgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactca 394  Q
    | ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  11049633 ctaaaagggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaattagaacaaaccctaatttata-ccattttcctaatctcaccaaaaaacaagacactca 11049535  T
Q  395 atgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11049534 atgattttcacttacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 11049493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 211 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32289732 - 32289530
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  32289732 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 32289633  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    |||||||||||| ||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||     
T  32289632 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc--ttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca- 32289543  T
Q  410 ccaaggtgtttac 422  Q
    |||||||||||||    
T  32289542 ccaaggtgtttac 32289530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 251 - 430
Target Start/End: Original strand, 7815313 - 7815492
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccct 349  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   || |||| ||||||    
T  7815313 agagattaatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaaccct 7815412  T
Q  350 aatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttt 430  Q
    |||||| | || ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  7815413 aatttc-aacctttttctcaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcacccacctaaggtgtttacaaatgttt 7815492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24885763 - 24885615
Alignment:
Q  277 caatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac 376  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  24885763 caatgagttcttacagaggggtacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttcccaattttac 24885664  T
Q  377 caaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
     || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24885663 aaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 24885615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 251 - 425
Target Start/End: Original strand, 14202452 - 14202621
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaacccta 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||    
T  14202452 agagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagg-------atgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacata 14202544  T
Q  351 atttctacccattttcccaatctcaccaaagaaca--aaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14202545 atttctacccattttcccaatctcagaaatgaaaaagacacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaat 14202621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6266859 - 6266691
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  6266859 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 6266761  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6266760 acaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 6266691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7451366 - 7451170
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaa-agaaaatata-acaacaccaagaaatgttgacccagttcgg 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||   | |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  7451366 caagtgcataacaaaaccacaatcgaac-caaagaataaacaagataaagagagagtagagaaaa-atagacaacaccaataaatgttcacccagttcg- 7451270  T
Q  227 tccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttca 326  Q
    ||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7451269 tccaa-cttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagcttca 7451171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 208 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26353354 - 26353143
Alignment:
Q  208 aaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgag 307  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |    
T  26353354 aaatgtttacccggttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaaagatacaaaagtg 26353256  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcact 406  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||     |||||||||| |||||||||    
T  26353255 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacac-ttttttcaatctcaccaaag-----aacactcaataattttcact 26353162  T
Q  407 cacccaaggtgtttacaat 425  Q
    |||| |  |||||||||||    
T  26353161 caccgagagtgtttacaat 26353143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Original strand, 13656037 - 13656200
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaa 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||    
T  13656037 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagag-gttacaa 13656135  T
Q  314 gaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13656136 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 13656200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 343 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 39284921 - 39284839
Alignment:
Q  343 caaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39284921 caaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 39284839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 12647386 - 12647555
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |    
T  12647386 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-g 12647484  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12647485 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 12647555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 271 - 436
Target Start/End: Original strand, 12123644 - 12123809
Alignment:
Q  271 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttccca 369  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  12123644 cactatcattgagttctttacaaaatgatacaaaagagttacaagaaataagcttcaacaaaatcataaagaacaactctaatttatactcattttcc-a 12123742  T
Q  370 atctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||| | || |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  12123743 atctctcaaatgaacaagacactcgatgattttcactcatccaaggtgtttataaatgtttcccaac 12123809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 420
Target Start/End: Original strand, 30217979 - 30218254
Alignment:
Q  143 aaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctac 242  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| | | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||   | || |||    
T  30217979 aaccacaatc-aaaccaaagaataaacaagataaagagagtaga-gaaaa-agagctacaccaaaaaatgtttaccgagttcagtccaacaatgacttac 30218075  T
Q  243 tctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatga 341  Q
    ||||| | || ||||||||| | ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  30218076 tctgggggagtgattgatcttttcaacccactatcaatgaattatttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaataagctctccaaga 30218175  T
Q  342 acaaccctaatttctacccattttcccaatct-caccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 420  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||||| |  | | |||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||||    
T  30218176 acaaacctaacttctaccca-tttctcaatctccttccatgaacaagacactcaatgatttccactctgtcaaggtgttt 30218254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39285003 - 39284930
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 285  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39285003 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 39284930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 325
Target Start/End: Original strand, 42019859 - 42019987
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt---acaaagag 296  Q
    |||||||||| |||| | ||| || |||||||   | ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  42019859 acaccaagaagtgtttatccaatttggtccaacaataacctactatggggaagagattgatctctcaaattcactatcaatgagttttttttacaaagag 42019958  T
Q  297 atacaaatgagttacaagaaattagcttc 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42019959 atacaaaagagttacaagaaattagcttc 42019987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 358
Target Start/End: Original strand, 42261525 - 42261633
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccct 349  Q
    ||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| | |    
T  42261525 agagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaactt 42261624  T
Q  350 aatttctac 358  Q
    |||||||||    
T  42261625 aatttctac 42261633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 359
Target Start/End: Original strand, 34811281 - 34811370
Alignment:
Q  271 cactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc 359  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | | || ||| | |||||||||||    
T  34811281 cactatcaatgagtttcttacaaagagatataaaagagttacaataaattagcttcaacaagctctctaagagcaatcttaatttctacc 34811370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28672073 - 28671989
Alignment:
Q  237 acctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 320  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||   || |||||||||||    
T  28672073 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactgtcagtgagttctttgtaaagagatacaaaacggtaacaagaaatta 28671989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41454356 - 41454254
Alignment:
Q  258 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttct 356  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| |||  |||||  |||||||||    
T  41454356 gatctgtccacttcactatcaatgagttctttacaaatatatacaaaagagttgctagaaattagcttcaacaagctctcaaaaaacaaatctaatttct 41454257  T
Q  357 acc 359  Q
    |||    
T  41454256 acc 41454254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 45727305 - 45727247
Alignment:
Q  60 gttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45727305 gttgtgaattcaga-ctcaaatttcacaccaatacaaact--atatgatgtgtggagcaagt 45727247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 416
Target Start/End: Original strand, 7597038 - 7597217
Alignment:
Q  237 acctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctca 335  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||  || || |||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||| |||    
T  7597038 acctactctgaaggagaga--gatctctccgttctacaatcaatgagttctttacaaaaagatacaaaagacttacaagaaattagtttcgacaagttca 7597135  T
Q  336 caatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggt 416  Q
     || |||| || |||||||||||  || |||| |||||||  || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  7597136 taaggaacaaaacctaatttctattca-tttctcaatctcttcccatgaacaagacactgagtgattttcactcacctaaggt 7597217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24198064 - 24197955
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctac-tctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatgagt 308  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | |||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||  | ||    
T  24198064 tgtttacccagttcggcccaaacgtgacctacgtctggagaagata--gatctctccaatccattatcaaagagtttcttgcaaagagatacaa--gggt 24197969  T
Q  309 tacaagaaattagc 322  Q
    ||||||||||||||    
T  24197968 tacaagaaattagc 24197955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Original strand, 35446677 - 35446736
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  35446677 tgttgtgaattctga-ctcaaatttcacatcaatataaac--tatatgatgtgtggagcaagt 35446736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2869717 - 2869643
Alignment:
Q  291 aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac--aaccctaatttctacccatttt 365  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||    
T  2869717 aaagtgatacaaaggagttacaagaaattagctt--aaaagctcacaaagaacaaaaacctaatttctacccatttt 2869643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3897111 - 3897042
Alignment:
Q  259 atctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3897111 atctctctaatccactttcaatgagttctttacaaaattatacaaaagagttacaaaaaattagcttcaa 3897042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 42412159 - 42412117
Alignment:
Q  237 acctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaat 280  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42412159 acctactctgggg-agagattgatctctccaatccactatcaat 42412117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41446260 - 41446159
Alignment:
Q  259 atctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttcta 357  Q
    ||||||||| | |||| ||||  ||||||| | ||||||||||||| | |||||   ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |||||||||    
T  41446260 atctctccacttcactgtcaaccagttctttataaagagatacaaaagggttacttaaaattagcttcaacaagctctcaaagaacaaacataatttcta 41446161  T
Q  358 cc 359  Q
    ||    
T  41446160 cc 41446159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4561180 - 4561140
Alignment:
Q  287 ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  4561180 ttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattagcttcaa 4561140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16605711 - 16605654
Alignment:
Q  261 ctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatt 319  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  16605711 ctctccaatccattatcaatgagtttcttataaagatatacaa--gagttacaagaaatt 16605654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 87)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Original strand, 34310635 - 34310983
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||  | |||| |||||||||||||    
T  34310635 caagtgcatagcaaaaccacaattcaaccaaaggaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaaagattgttcacccagttcggtc 34310733  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  34310734 caaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaac 34310833  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  34310834 aatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattat 34310932  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34310933 ttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcctttg 34310983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 119 - 479
Target Start/End: Original strand, 48599245 - 48599601
Alignment:
Q  119 agtctataatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacc 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  48599245 agtctataatcaagtgcacagcaaaactacaatccaac-caaggaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacatcaagaaatgttcacc 48599342  T
Q  219 cagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 318  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48599343 cagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagctcttccaaagagatacaaatgagttacaagaaat 48599441  T
Q  319 tagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||    
T  48599442 tagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaatgaacaagacaatc-atgattttcactcctccaaggtgt 48599540  T
Q  419 ttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48599541 ttacaattgtttcccaactctagaatataacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 48599601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Original strand, 4508627 - 4508973
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4508627 caagtgcatagcaaaaccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaa-gaaaatataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtc 4508724  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4508725 caa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaat 4508823  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4508824 aagctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatcaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgt 4508922  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4508923 ttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatccttagcctttg 4508973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 134 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3259237 - 3258901
Alignment:
Q  134 gcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaac 233  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |    
T  3259237 gcatagcaaaaccacaatccaac-caaggaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaggaaatgttcacccagttcggttcaa-c 3259141  T
Q  234 ttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagct 333  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  3259140 ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaatgagttacaataaattagcttaaacaagct 3259041  T
Q  334 cacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttcc 433  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  3259040 cacaaagaacaaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgtttccc 3258941  T
Q  434 aactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttag 473  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3258940 aactctagaatctaacccccaaatgagaaccaacccttag 3258901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 29608985 - 29608637
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaa-ccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggt 227  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  29608985 caagtgcatatcaaaaaccacaatctaa-gcaaaggataaacaagataaagagagtaga-gaaaagataacaacaccaagaaatattcactcagttcggt 29608888  T
Q  228 ccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29608887 ccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 29608789  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  29608788 caagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaagacactcatgaagtttcgctctctcaaggtgtttacaattg 29608689  T
Q  428 ttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29608688 tttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 29608637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 200 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22270151 - 22269877
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22270151 acaccaagagatgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatcagttcttacaaagagata 22270053  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 399  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||    
T  22270052 caaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaat 22269953  T
Q  400 tttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcct 476  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22269952 tttcactctcccaaggtgtttagaattg-tttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccatagcct 22269877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 126 - 479
Target Start/End: Original strand, 4512308 - 4512657
Alignment:
Q  126 aatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcg 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||  || | ||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  4512308 aatcaagtgcatagcaaaaacacaattc-aactaatggataaacaagatcaagagag-taaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagtacg 4512405  T
Q  226 gtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttc 325  Q
    |||| ||||| |||||||||  || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4512406 gtcc-aacttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttc 4512504  T
Q  326 aataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4512505 aataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaatcaacaaggcactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 4512603  T
Q  426 tgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4512604 tgtttcccaactctagaatataacccccaaaagagaactaacccttagcctttg 4512657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Original strand, 8359236 - 8359585
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||| | ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8359236 caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaagga-taaacaagataatgagagtaga-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtc 8359333  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||    
T  8359334 caacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttaaa 8359433  T
Q  328 taagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 427  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8359434 caagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaatgaacaagacactc-atgattttcactctctcaaggtgtttacaattg 8359532  T
Q  428 ttttccaactctagaatct-aaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||||||| |||||||||||    
T  8359533 ttttccaactcaagaatctaaacccccaaaaaataaccaactcttagcctttg 8359585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 213 - 479
Target Start/End: Original strand, 2360975 - 2361238
Alignment:
Q  213 ttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2360975 ttgacccagttcggttcaa-cttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttaca 2361073  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccca 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  2361074 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccca 2361172  T
Q  413 aggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2361173 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacc-tcaaaagagaaccaacccttagcctttg 2361238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 126 - 479
Target Start/End: Original strand, 4510466 - 4510815
Alignment:
Q  126 aatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcg 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||  || | ||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  4510466 aatcaagtgcatagcaaaaacacaattc-aactaatggataaacaagatcaagagag-taaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagtacg 4510563  T
Q  226 gtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttc 325  Q
    |||| ||||| |||||||||  || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4510564 gtcc-aacttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttc 4510662  T
Q  326 aataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4510663 aataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaatcaacaaggcactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 4510761  T
Q  426 tgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||    
T  4510762 tgtttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatcgttagcctttg 4510815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 136 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 2390526 - 2390183
Alignment:
Q  136 atagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaat--ataacaacaccaaga-aatgttgacccagttcggtccaaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||||||||||| | | || ||| |||||||||| ||    
T  2390526 atagcaaaaccacaatccaacaaaagg-ataaacaagataaagagagtagagaaaaataaacaacaacaccaagagattattcacctagttcggtcc-aa 2390429  T
Q  233 cttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagc 332  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2390428 cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatatatgagttattacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 2390329  T
Q  333 tcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttc 432  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2390328 tcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttcgaatttcaccaatgaacaagacact-tatgattttcgctctcccaaggtgtttacaattgtttcc 2390230  T
Q  433 caactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390229 caactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 2390183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 216 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 6432133 - 6431872
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaga 315  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6432133 acccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaga 6432035  T
Q  316 aattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaagg 415  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  6432034 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaatg 6431936  T
Q  416 tgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6431935 tgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcatttg 6431872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 211 - 424
Target Start/End: Original strand, 30024733 - 30024945
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30024733 tgttgatccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtta 30024831  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30024832 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 30024931  T
Q  411 caaggtgtttacaa 424  Q
    ||||||||||||||    
T  30024932 caaggtgtttacaa 30024945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27347984 - 27347771
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27347984 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 27347886  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27347885 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 27347786  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    ||| |||||||||||    
T  27347785 caatgtgtttacaat 27347771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 14069834 - 14070047
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14069834 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 14069932  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14069933 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 14070032  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  14070033 caaggtgtttacaat 14070047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 14379862 - 14380075
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14379862 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 14379960  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14379961 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 14380060  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  14380061 caaggtgtttacaat 14380075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 31732970 - 31733183
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31732970 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 31733068  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31733069 caagaaattagcttcaccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 31733168  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  31733169 caaggtgtttacaat 31733183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 35854082 - 35853869
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  35854082 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 35853983  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  35853982 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 35853884  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  35853883 caaggtgtttacaat 35853869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Original strand, 47673983 - 47674167
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaacccta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  47673983 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaacccta 47674082  T
Q  351 atttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47674083 atttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgttttccaac 47674167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 211 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23555208 - 23554982
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  23555208 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaggtacaaaagtgtta 23555109  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  23555108 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 23555010  T
Q  410 ccaaggtgtttacaattgttttccaactc 438  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23555009 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 23554982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 8153509 - 8153296
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8153509 tgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagtta 8153411  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8153410 caagaaattagctttgacaatctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 8153311  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    ||| |||||||||||    
T  8153310 caatgtgtttacaat 8153296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 231 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491533
Alignment:
Q  231 aacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataa 330  Q
    ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 48491628  T
Q  331 gctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48491627 gttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaat 48491533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 202 - 425
Target Start/End: Original strand, 31105385 - 31105607
Alignment:
Q  202 accaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataca 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31105385 accaagaaatgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaaagataca 31105483  T
Q  302 aatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 401  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  31105484 aatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaatctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattt 31105583  T
Q  402 tcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31105584 tcactcacccaaggtgtttacaat 31105607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 18126811 - 18126598
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18126811 tgttgacccaggtcggtc-aaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 18126713  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18126712 caagaaattagcttgaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcactcacc 18126613  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||| ||||||||||    
T  18126612 caagttgtttacaat 18126598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 41317435 - 41317648
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  41317435 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatggatta 41317533  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  41317534 caagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcatc 41317633  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  41317634 caaggtgtttacaat 41317648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 43864411 - 43864198
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43864411 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaattagtttttacaaagagatacaaatgggtta 43864313  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43864312 caggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 43864213  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  43864212 caaggtgtttacaat 43864198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 251 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4586289 - 4586115
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaacccta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  4586289 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaacccta 4586190  T
Q  351 atttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4586189 atttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttacactcacccaaggtgtttacaat 4586115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26417494 - 26417270
Alignment:
Q  200 acaccaagaaat-gttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  || |||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26417494 acaccaagaaattgttgacccagtttggtccaat-ttgacctaacctgggg-agagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagat 26417397  T
Q  299 acaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatga 398  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  26417396 acaaatgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatga 26417297  T
Q  399 ttttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||    
T  26417296 ttttcacccgctcaaggtgtttacaat 26417270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 133 - 347
Target Start/End: Original strand, 32357979 - 32358190
Alignment:
Q  133 tgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaa 232  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  32357979 tgcataacaaaaccacaattcaa-gcaaggaataaacaagttaaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaa- 32358075  T
Q  233 cttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagc 332  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32358076 cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagc 32358175  T
Q  333 tcacaatgaacaacc 347  Q
    |||||| | ||||||    
T  32358176 tcacaaagcacaacc 32358190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 436
Target Start/End: Original strand, 36146409 - 36146633
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36146409 tgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 36146507  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaacc-ctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36146508 ca-gaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 36146606  T
Q  410 ccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  36146607 ccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 36146633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 47676137 - 47676350
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47676137 tgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatcattgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 47676235  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  47676236 caagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcacc 47676335  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  47676336 caaggtgtttacaat 47676350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 495984 - 496197
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  495984 tgttgacccggttctgtccaa-cttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttg 496082  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  496083 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaactaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaattaacaaaacactaaatgattttcactcacc 496182  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||| ||||||||    
T  496183 caaggtttttacaat 496197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1113824 - 1113611
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1113824 tgttgactcaattcggtc-aaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 1113726  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1113725 taagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 1113626  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||| ||||||||||    
T  1113625 caagttgtttacaat 1113611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29991221 - 29991009
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||    
T  29991221 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattagaaagagatacaaaagggtta 29991122  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  29991121 caagaaattagctttgacaagttcacaaataacaaccctaatttctatcc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 29991024  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  29991023 caaggtgtttacaat 29991009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 38671223 - 38671436
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38671223 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagtgatacaaatgtgtta 38671321  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38671322 caataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcgctcacc 38671421  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  38671422 caaggtgtttacaat 38671436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48489598 - 48489385
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  48489598 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttattgcaaagagatacaaatgggtta 48489500  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  48489499 caagaaattagcttcaacaagttttcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacatttaatgattttcactcacc 48489400  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  48489399 caaggtgtttacaat 48489385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Original strand, 22328310 - 22328666
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  22328310 caagtgcataacaaaaccacaatcgaacaaaag-aataaacaagataaagagagtaga-gaaaagataacaacaccaaaaaatatttacccagttcggtc 22328407  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||   | ||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22328408 caacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaa 22328507  T
Q  328 taagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccatt-ttcccaatctcaccaaagaacaaa----acactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 421  Q
     |||||||||| |||| ||| |||||||||| || || ||||||||||| | || |||||||    ||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  22328508 caagctcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctctctaatgaacaaacaagacactcaatgattttcattccctcaaggtgttta 22328607  T
Q  422 caattgttttccaactctagaatctaa-ccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22328608 caattgtttcccaactttaggatctaaccccccaaaagagaaccaacccttagcttttg 22328666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 129 - 345
Target Start/End: Original strand, 6359870 - 6360087
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaat-gttgacccagttcggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  6359870 caagtgcatagcaaaaccacaatccaacttaaggaataaacaagataaagaaagcaaatgaaaagataacaacaccaagaaattgttgacccagttcgat 6359969  T
Q  228 ccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaa 327  Q
    |||| ||| ||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6359970 ccaa-cttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaa 6360068  T
Q  328 taagctca-caatgaacaa 345  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  6360069 caagctcaccaatgaacaa 6360087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 41649012 - 41649224
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41649012 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 41649110  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41649111 caagaaattagc-taaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccaatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacttacc 41649209  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  41649210 caaggtgtttacaat 41649224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 269 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518739
Alignment:
Q  269 tccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttccc 368  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccc 31518806  T
Q  369 aatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31518805 aatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaaggtgtttacga-tgttttccaac 31518739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 217 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25616015 - 25615807
Alignment:
Q  217 cccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaa 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  25616015 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgggttacaagaa 25615916  T
Q  317 attagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggt 416  Q
    |||||||| || |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||          ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25615915 attagcttaaacaagcgcacatagaacaaacctaatttctacccattttcccaatct----------caagacactcaatgattttctctcacccaaggt 25615826  T
Q  417 gtttacaattgttttccaac 436  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  25615825 gtttacaa-tgttttccaac 25615807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19502346 - 19502132
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19502346 tgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 19502247  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttct-acccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||     
T  19502246 caagaaattagctttgacaagctcacaaaaaacaaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctcactca- 19502148  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  19502147 ccaaggtgtttacaat 19502132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 200 - 436
Target Start/End: Original strand, 4253518 - 4253754
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagat 298  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  4253518 acaccaagaaatgtttacctagttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaatgagttctttccaaagagat 4253616  T
Q  299 acaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatg 397  Q
    | ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||    
T  4253617 ataaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacc-attttaccaatttcaccaatgaacaagaaactcaatg 4253715  T
Q  398 attttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4253716 attttcactcacctaaggtgtttacaaatgttttccaac 4253754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 12097868 - 12098073
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||       ||||||||||||| ||||    
T  12097868 tgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta-caaagagtt-------agagatacaaatgggtta 12097958  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12097959 caagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 12098058  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||| ||||||||||    
T  12098059 caagatgtttacaat 12098073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 25766960 - 25767171
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgagtt 309  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||    
T  25766960 tgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttcaaaagagatacaaaaggggtt 25767059  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  25767060 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccaatct---caatgaacaagacactcaatgattttcactca- 25767155  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  25767156 ccaaggtgtttacaat 25767171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4178941 - 4178729
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| ||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  4178941 tgttcacctagtttggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggtta 4178843  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||    ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4178842 caagaaattagctttcccaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 4178744  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  4178743 caaggtgtttacaat 4178729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 39731537 - 39731331
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39731537 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 39731438  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    |||||||||||| |   | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||     
T  39731437 acaagaaattagatctgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-tttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca- 39731347  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  39731346 ccaaggtgtttacaat 39731331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48408984 - 48408757
Alignment:
Q  200 acaccaagaaat-gttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gaga 297  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  48408984 acaccaagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagaga 48408885  T
Q  298 tacaaatgag-ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaat 396  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||  | ||| | |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  48408884 tacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaacaacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat 48408785  T
Q  397 gattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48408784 gattttcactca-ccaaggtgtttacaat 48408757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 432
Target Start/End: Original strand, 23565052 - 23565282
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactct-ggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 298  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23565052 acaccaagaaatgattacc-agttcagtccaa-cttgacctactctaggag-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 23565148  T
Q  299 acaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-ccctaatttctaccca--ttttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaa 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||| |||||       
T  23565149 acaaaagagttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacctattttttcctaatctcaccaatgaacaagacact--- 23565245  T
Q  396 tgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttc 432  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23565246 tcatgttcactcacccaaggtgtttacaaatgttttc 23565282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31519081 - 31518911
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagt-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 298  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31519081 acaccaagaaatgtttatccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagat 31518983  T
Q  299 acaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaat 371  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  31518982 acaaatgagttacaag-aactagcttcaataagctcacagagaacaaacctaatttctacctattttcccaat 31518911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 211 - 353
Target Start/End: Original strand, 2759198 - 2759339
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2759198 tgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgagtta 2759296  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatt 353  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  2759297 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 23344151 - 23343934
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||    
T  23344151 acaccaagaaatgtttaccttgttcggtccaa-cttgacctactctggg--agagattaatttctccaatctattatcaatgagttctcacaaagatata 23344055  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaa-caaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatga 398  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||    
T  23344054 ctaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctaccc-ttttccaaatctcaccaatgaactagacattcaatga 23343956  T
Q  399 ttttcactcacccaaggtgttt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23343955 ttttcactcacccaaggtgttt 23343934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 43504154 - 43504323
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgagt 308  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  43504154 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 43504253  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43504254 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 43504323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 204 - 436
Target Start/End: Original strand, 36574510 - 36574740
Alignment:
Q  204 caagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaa 302  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| | |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  36574510 caagaaatgtttacccagtttggtccaaa-ttgacctactctagggatg-gattgatctctccaaaccactatcaatgagttctttacaaagagatataa 36574607  T
Q  303 atgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccct-aatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 401  Q
    | | ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  || ||||||||||  ||| ||||||||| ||||  ||||| |||||| || ||||    
T  36574608 aagggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttctacc--tttccccaatctctccaataaacaagacactcgataattt 36574705  T
Q  402 tcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  36574706 tcactcacctaaggtgtttacaaatgttttccaac 36574740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 298 - 426
Target Start/End: Original strand, 4538627 - 4538755
Alignment:
Q  298 tacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatg 397  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4538627 tacaaatgggttacaagaaattagcttaaaaaatttcataaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatg 4538726  T
Q  398 attttcactcacccaaggtgtttacaatt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4538727 attttcactcacccaaggtgtttacaatt 4538755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 300 - 425
Target Start/End: Original strand, 24525985 - 24526111
Alignment:
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaac-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  24525985 caaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagacactcaatga 24526084  T
Q  399 ttttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24526085 ttttcactcacccaaggtgtttacaat 24526111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20344064 - 20343897
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagt 308  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||    
T  20344064 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 20343967  T
Q  309 tacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20343966 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 20343897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 430
Target Start/End: Original strand, 3904624 - 3904836
Alignment:
Q  218 ccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaa 316  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  3904624 ccagttcggtccaacaatgacctactctgagggagagattgatctctctgatc-actatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagtgttacaagaa 3904722  T
Q  317 attagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaag 414  Q
    ||||  ||||||| |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  3904723 attacattcaataggctctcaaagaacaaaacctaatttcta-ccattttcccaatctcttcctaagaacaagagactcaatga-tttcactcgcccaag 3904820  T
Q  415 gtgtttacaattgttt 430  Q
    |||||||||| |||||    
T  3904821 gtgtttacaaatgttt 3904836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24790009 - 24789841
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||   |||    
T  24790009 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaagagtttttacaaaagggatacaaa-atgtt 24789911  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  24789910 acaagaaattagctttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttaccc-ttttcccaatcttaccaa 24789841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 372 - 479
Target Start/End: Original strand, 6360073 - 6360179
Alignment:
Q  372 ctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccctt 471  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6360073 ctcaccaatgaacaagtcactca-tgattttcattctcccaaggtgtttaaaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccctt 6360171  T
Q  472 agcctttg 479  Q
    ||||||||    
T  6360172 agcctttg 6360179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 6592340 - 6592509
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |    
T  6592340 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-g 6592438  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6592439 ttacaagaaattagcttgac-aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccca-tttcccaatctcaccaa 6592509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 18388760 - 18388929
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |    
T  18388760 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-g 18388858  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18388859 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 18388929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 18392196 - 18392365
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |    
T  18392196 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-g 18392294  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18392295 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 18392365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 307
Target Start/End: Original strand, 24525505 - 24525598
Alignment:
Q  213 ttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgag 307  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24525505 ttgacccagttccgtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgag 24525598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 6594558 - 6594727
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |    
T  6594558 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-g 6594656  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6594657 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 6594727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 348 - 425
Target Start/End: Original strand, 2761439 - 2761516
Alignment:
Q  348 ctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2761439 ctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaatgtgtttacaat 2761516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 32060322 - 32060493
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaa---gagatacaaatg 305  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   | |||||||  |    
T  32060322 tgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaaggggatacaagag 32060421  T
Q  306 agttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
     ||||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32060422 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 32060493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 293
Target Start/End: Original strand, 1560671 - 1560749
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1560671 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 1560749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 286 - 479
Target Start/End: Original strand, 1360226 - 1360422
Alignment:
Q  286 cttacaaagagatacaaatgag--ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac-caaaga 382  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| ||| || | | ||  || |||||||||||||  ||||||||||||||  | | ||    
T  1360226 cttacaaagagatacaaaaaagggttacaagaaattcgcttcaacaagttctccaagacaaaacctaatttctacct-ttttcccaatctcattccatga 1360324  T
Q  383 acaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaa-ccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || ||||||    
T  1360325 acaagagactcaatgattt-cactcaccaaaggtgtttcccaattgtttttcaactctagaatctaaccccccaaaagagaaccaatccatatcctttg 1360422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18396488 - 18396393
Alignment:
Q  209 aatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa 303  Q
    |||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  18396488 aatgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaatgaattctttataaagagatacaaa 18396393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 362 - 425
Target Start/End: Original strand, 24514912 - 24514974
Alignment:
Q  362 ttttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24514912 ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaat 24514974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 30814603 - 30814530
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 285  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30814603 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 30814530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 271 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 27073925 - 27073778
Alignment:
Q  271 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttccca 369  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||  |  ||||||||| ||||| |||    
T  27073925 cactgtcaacgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaataaactcataacgaacaaaacatatttctaccaatttt-cca 27073827  T
Q  370 atctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 418  Q
    || ||  || |||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27073826 atgtcttcccaagaacaaaagattcaatga-tttcactcatccaaggtgt 27073778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 271 - 418
Target Start/End: Original strand, 27204388 - 27204535
Alignment:
Q  271 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttccca 369  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||  |  ||||||||| ||||| |||    
T  27204388 cactgtcaacgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaataaactcataacgaacaaaacatatttctaccaatttt-cca 27204486  T
Q  370 atctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 418  Q
    || ||  || |||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27204487 atgtcttcccaagaacaaaagattcaatga-tttcactcatccaaggtgt 27204535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 251 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 5116733 - 5116625
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccct 349  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||| |||||| || ||  | | |||||| |||    
T  5116733 agagatttatctctccaattcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggtttacaataaattatcttcaacaaactatccaagaacaaacct 5116634  T
Q  350 aatttctac 358  Q
    |||||||||    
T  5116633 aatttctac 5116625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 436
Target Start/End: Original strand, 5514113 - 5514234
Alignment:
Q  315 aaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccc-taatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaa 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||| | |||| | |||||| | || |||||| | ||||||||||||||||||| | ||    
T  5514113 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacataatttctactcttttttc-aatctctcaaatgaacaagaaactcaatgattttcactcatcgaa 5514211  T
Q  414 ggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  5514212 ggtgtttacaagtgtttcccaac 5514234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 299
Target Start/End: Original strand, 5513661 - 5513755
Alignment:
Q  204 caagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagata 299  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  5513661 caagaaatgtttacccagttcagtccaaa-ttgacctactctggaggtgagattgat-tctccaattcagtgtcaatgagttctttacaaagagata 5513755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 359
Target Start/End: Original strand, 43363518 - 43363622
Alignment:
Q  258 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaa--gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaattt 354  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| | | |||||| ||||||||    
T  43363518 gatctatccacttcactatcaatgagttatttacaaatagagatacaaaagagttacaataaattagtttcaacaagctctccaagaacaaacctaattt 43363617  T
Q  355 ctacc 359  Q
    |||||    
T  43363618 ctacc 43363622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Original strand, 4510339 - 4510396
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  4510339 tgttgtgaattcgga-ctcaaatttcacaccaatacaaac----tatgatgtgtggagcaagt 4510396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Original strand, 4512181 - 4512238
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  4512181 tgttgtgaattcgga-ctcaaatttcacaccaatacaaac----tatgatgtgtggagcaagt 4512238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 408 - 479
Target Start/End: Original strand, 23794023 - 23794093
Alignment:
Q  408 acccaaggtgtttacaa-ttgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||    
T  23794023 acccaatgtgtttacaaattgtttttcaactctagaatctaaccac--aaaatgaaccaaccattagcctttg 23794093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 379
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562173
Alignment:
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagcttgac-aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 1562173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 101
Target Start/End: Original strand, 41317237 - 41317279
Alignment:
Q  58 ctgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41317237 ctgttgtgaattc-gaactcaaatctcacaccaatacaaactat 41317279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 430
Target Start/End: Original strand, 30843389 - 30843451
Alignment:
Q  368 caatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttt 430  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||    
T  30843389 caatctctccaatgaacaagatactcaatgattttaactcatctaaggtgtttacaaatgttt 30843451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 2360897 - 2360945
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaag 178  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  2360897 caagtgcatatcaaaaccacaattcaac-caaggaataaacaagataaag 2360945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 365
Target Start/End: Original strand, 3047335 - 3047401
Alignment:
Q  298 tacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccatttt 365  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||  | |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  3047335 tacaaatgagttacaagaaatcaactt--aaaagctcacaaagaacaagacctaatttctacccatttt 3047401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30814770 - 30814713
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||    
T  30814770 tgttgtgaattcgga-ctcaaatttcacaccagtacaaa----atatgatgtgtggagcaagt 30814713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 7574 - 7229
Alignment:
Q  129 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7574 caagtgcatagcaaaaccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtc 7477  T
Q  229 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 328  Q
    ||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  7476 caa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 7378  T
Q  329 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 428  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  7377 aagctcacaaagaacaaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattg- 7280  T
Q  429 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7279 tttccagctctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 7229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 7703 - 7644
Alignment:
Q  59 tgttgtgaatt-ctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatatgatgtgtggagcaagt 121  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  7703 tgttgtgaatttcggaactcaaatttcacaccaatacaaac----tatgatgtgtggagcaagt 7644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 133 - 479
Target Start/End: Original strand, 17927 - 18268
Alignment:
Q  133 tgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaa 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17927 tgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggaataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcgatccaaa 18025  T
Q  233 cttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagc 332  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18026 cttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagc 18124  T
Q  333 tcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  18125 tcacaatgaacaaccctaatttctaccaattttcccactctcaccaatgaacaaaacactc-atgattttcactctcccaaagtgtttacaattg-tttc 18222  T
Q  433 caactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18223 caactctataatctaacc-ccaaaagagaaccaactcttagtctttg 18268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 101
Target Start/End: Original strand, 17793 - 17835
Alignment:
Q  59 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactat 101  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17793 tgttatgaattctggactcaaatttcacaccaatacaaactat 17835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 211 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 11725 - 11459
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11725 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 11626  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11625 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 11527  T
Q  411 caaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 479  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11526 caaggtgtttacaa-tgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacctttagcctttg 11459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 218 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 114763 - 114557
Alignment:
Q  218 ccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaa 317  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  114763 ccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagcgttacaagaaa 114664  T
Q  318 ttagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtg 417  Q
    |||||||  | ||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  114663 ttagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtg 114565  T
Q  418 tttacaat 425  Q
    ||||||||    
T  114564 tttacaat 114557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 266 - 479
Target Start/End: Original strand, 80338 - 80550
Alignment:
Q  266 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatttt 365  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  80338 caattcactatctatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 80437  T
Q  366 cccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaacca 465  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  80438 cccaatctcagcaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttcacaattgtttcctaactctagaatctaacccccaaaatagaacca 80536  T
Q  466 acccttagcctttg 479  Q
    ||||||||||||||    
T  80537 acccttagcctttg 80550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 149098 - 149311
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  149098 tgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaa 149196  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  149197 caagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccc 149296  T
Q  411 caaggtgtttacaat 425  Q
    |||||||||||||||    
T  149297 caaggtgtttacaat 149311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 434701 - 434477
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  434701 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 434602  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatttt-cccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  434601 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 434503  T
Q  410 ccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||    
T  434502 ccaaggtatttacca-tgttttccaac 434477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 358
Target Start/End: Original strand, 490360 - 490468
Alignment:
Q  251 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccct 349  Q
    ||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| | |    
T  490360 agagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaactt 490459  T
Q  350 aatttctac 358  Q
    |||||||||    
T  490460 aatttctac 490468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 425
Target Start/End: Original strand, 20405 - 20629
Alignment:
Q  200 acaccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 299  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20405 acaccaaaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaagagttcttacaaagagata 20503  T
Q  300 caaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 399  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||    
T  20504 caaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaacctaatttctgctcattttcccaatctcaccaatgaataataaactcaatgat 20603  T
Q  400 tttcactcacccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20604 tttcactcacccaaggtgtttacaat 20629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1083 - 871
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||    
T  1083 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttgtt-caaagagatacaaaagggtta 985  T
Q  311 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 409  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  984 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcacc-aagaacaagacactcaatgattttcactca- 887  T
Q  410 ccaaggtgtttacaat 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  886 ccaaggtgtttacaat 871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 11161 - 11375
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  11161 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 11260  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactca 408  Q
    |||||||||||| ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11261 acaagaaattagattttacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcacc-aagaacaagacactcaatgatttacactca 11359  T
Q  409 cccaaggtgtttacaat 425  Q
     ||||||||||||||||    
T  11360 -ccaaggtgtttacaat 11375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 425
Target Start/End: Original strand, 8735 - 8949
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  8735 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 8834  T
Q  310 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactca 408  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  8835 acaagaaattagattttataagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcacc-aagaacaagacactcaatggtttacactca 8933  T
Q  409 cccaaggtgtttacaat 425  Q
     ||||||| ||||||||    
T  8934 -ccaaggtctttacaat 8949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 126 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10740 - 10468
Alignment:
Q  126 aatcaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagg-gagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttc 224  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||| | ||| | | ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10740 aatcaagtgtatagtaaaactacaatctaat-caaagaataaacaagataaaagagagtagaggaaag-ataacaacaccaagaaatgtttacccagttc 10643  T
Q  225 ggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 324  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||      
T  10642 ggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaataaattagc-a 10545  T
Q  325 caataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 401  Q
    |||  ||||||||| |||| ||||||||||| || |  |||| |||||||||| || |||||| |||||||| |||||    
T  10544 caa-gagctcacaaagaacaaaccctaatttatatctttttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaaagattt 10468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 208 - 438
Target Start/End: Original strand, 27439 - 27670
Alignment:
Q  208 aaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatga 306  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||   | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  27439 aaatgtttacctaattcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttatttacaaagagatacaaatga 27538  T
Q  307 gttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttca 404  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||||  | |||||||||| | ||||| |||||||  ||  ||||||| | |||||| || |||||    
T  27539 gttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaacaatacataatttctactc-ttttcacaatctcttccctagaacaagagactcaaaga-tttca 27636  T
Q  405 ctcacccaaggtgtttacaattgttttccaactc 438  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27637 ctcatccaaggtgtttacaaatgtttcccaactc 27670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 2604 - 2773
Alignment:
Q  211 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatgag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | |    
T  2604 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagag-g 2702  T
Q  308 ttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2703 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 2773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Original strand, 3731 - 3895
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  3731 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 3829  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||  | | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3830 agaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 3895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6436 - 6272
Alignment:
Q  216 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |  |||||    
T  6436 acccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagggcttaca 6338  T
Q  313 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 379  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6337 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 6272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 25175 - 25002
Alignment:
Q  258 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttct 356  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| || ||| ||| ||||||  ||| |||||    
T  25175 gatctctctacttcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaattaccttcaacaaactctcaaagaacaaaactagtttct 25076  T
Q  357 acccattttccc-aatctcacca-aagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttt 430  Q
    | |||||||||| |||||   ||   || ||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25075 a-ccattttcccgaatcttgtcatgtgatcaacagactcaatga-tttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 25002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 472
Target Start/End: Original strand, 1594 - 1657
Alignment:
Q  409 cccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccctta 472  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1594 cccaaggtgttttctaattgtttcccaactctagaatctaacc-ccaaaagagaaccaacactta 1657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0129 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 436
Target Start/End: Original strand, 19117 - 19163
Alignment:
Q  389 cactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  19117 cactcaatgattttcactcacccaa-gtgtttacaaatgtttcccaac 19163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University