View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14742_high_3 (Length: 510)

Name: NF14742_high_3
Description: NF14742
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14742_high_3
NF14742_high_3
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (20-496)||(13446681-13447161)
chr5 (20-496)||(13419135-13419610)
chr5 (20-494)||(13426027-13426501)
chr5 (19-327)||(13412958-13413266)
chr5 (45-370)||(13453764-13454089)
chr5 (38-327)||(13393562-13393851)
chr5 (81-327)||(13385377-13385623)
chr5 (19-327)||(13389136-13389444)
chr5 (28-333)||(13373039-13373344)
chr5 (28-333)||(13378835-13379140)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (25-333)||(47601119-47601427)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (28-267)||(28430528-28430767)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 13447161 - 13446681
Alignment:
Q  20 aagtctcgtgatggcactatcacctatggaggtttctccgactcaatggttgcagacgagcactttgtgattcgcattcctgatagcttacctcttgatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13447161 aagtctcgtgatggcactatcacctatggaggtttctccgactcaatggttgcagacgagcactttgtgattcgcattcctgatagcttacctcttgatg 13447062  T
Q  120 gtgccggtcctcttctttgcgctggagtcacagtgtatagtcctcttagacattttggactcgacaagcctggtatgaatataggagttgtaggtcttgg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13447061 gtgccggtcctcttctttgcgctggagtcacagtgtatagtcctcttcgacattttggactcgacaagcctggtatgaatataggagttgttggtcttgg 13446962  T
Q  220 tggacttggtcatatggctgtgaaatttgctaaagcttttggtgctaaagtgactgtaattagtacgtcgcctaaaaaggaaaaggaagcaatagaacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13446961 tggacttggtcatatggctgtgaaatttgctaaagcttttggtgctaaagtgaccgtaattagtacgtcgcctaaaaaggaaaaggaagcaatagaacac 13446862  T
Q  320 ttaggagcagactcgtttctagtaagccgcgatccagaacagatgcaggtatatgattcatttgattaatttctgaatttttattatttcagaaattgat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13446861 ttaggagcagactcgtttctagtaagccgcgatccagaacagatgcaggtatatgattcatttgattaatttctgaattttcattatttcagaaattgat 13446762  T
Q  420 aatgt----taatcaagaaactaatattgtacaacgttttataggctgcaacgagtactttgaatggcattattgacacag 496  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13446761 aatgttaattaatcaagaaactaataatgtacaacattttataggctgcaacgagtactttgaatggcattattgacacag 13446681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 20 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 13419610 - 13419135
Alignment:
Q  20 aagtctcgtgatggcactatcacctatggaggtttctccgactcaatggttgcagacgagcactttgtgattcgcattcctgatagcttacctcttgatg 119  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13419610 aagtatcgtgatggcaccgtcacatatggaggttactccgactcaatggttgcagacgagcactttgtgattcgcattcctgatagcttacctcttgatg 13419511  T
Q  120 gtgccggtcctcttctttgcgctggagtcacagtgtatagtcctcttagacattttggactcgacaagcctggtatgaatataggagttgtaggtcttgg 219  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13419510 ctgccggtcctcttctttgcgctggaatcacagtgtatagtcctcttcgacattttgaactcgacaagcctggtatgaatataggtgttgttggtcttgg 13419411  T
Q  220 tggacttggtcatatggctgtgaaatttgctaaagcttttggtgctaaagtgactgtaattagtacgtcgcctaaaaaggaaaaggaagcaatagaacac 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  13419410 tggacttggccatatggctgtgaaatttgcaaaagctttcggtgctaatgtgaccgtaattagtacatcgcctcacaaagaaaaggaagcaatagaacac 13419311  T
Q  320 ttaggagcagactcgtttctagtaagccgcgatccagaacagatgcaggtatatgattcatttgattaatttctgaatttttattatttcagaaattgat 419  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  | ||||| ||||||||      
T  13419310 ttgggagctgactcgtttctagtaagccgcgatcctgatcagatgcaggtatatgattcatttgattcatttgtgaa-ttaaaatattttagaaattggc 13419212  T
Q  420 aatgttaatcaagaaactaatattgtacaacgttttataggctgcaacgagtactttgaatggcattattgacacag 496  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13419211 aatggtaatcaataaactaatattgtacaacatttcatagactgcaatgggtactttgaatggtattattgacacag 13419135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 20 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 13426501 - 13426027
Alignment:
Q  20 aagtctcgtgatggcactatcacctatggaggtttctccgactcaatggttgcagacgagcactttgtgattcgcattcctgatagcttacctcttgatg 119  Q
    |||| |||||||||||   |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13426501 aagtatcgtgatggcagcgtcacatatggaggttattccgactcaatggttgcagatgagcactttgtgattcgcattcctgatagcttacctcttgatg 13426402  T
Q  120 gtgccggtcctcttctttgcgctggagtcacagtgtatagtcctcttagacattttggactcgacaagcctggtatgaatataggagttgtaggtcttgg 219  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13426401 ttgccggtcctcttctttgcgctggagtcacagtgtatagtcctcttcgtcattttcaactcgacaagcctggtatgaatataggcgttgttggtcttgg 13426302  T
Q  220 tggacttggtcatatggctgtgaaatttgctaaagcttttggtgctaaagtgactgtaattagtacgtcgcctaaaaaggaaaaggaagcaatagaacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||     
T  13426301 tggacttggtcatatggctgtgaaattcgccaaagcttttggtgctaatgtaacagtaattagtacatcgcctagcaaagaaaaggaagcgatagaacat 13426202  T
Q  320 ttaggagcagactcgtttctagtaagccgcgatccagaacagatgcaggtatatgattcatttgattaatttctgaatttttattatttcagaaattgat 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||| ||     
T  13426201 ttaggagctgactcgtttctagtaagccgcgatccagatcagatgcaggtatatgattcatttgattgatttgcgaa-tttcattatttcagaaatcgag 13426103  T
Q  420 aatgttaatcaagaaactaatattgtacaacgtttt-ataggctgcaacgagtactttgaatggcattattgacac 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  13426102 aatgttaatcaagaaactaatattgtacaacgttttaataggctgcaatgggtactttgaatggtattatcgacac 13426027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13413266 - 13412958
Alignment:
Q  19 caagtctcgtgatggcactatcacctatggaggtttctccgactcaatggttgcagacgagcactttgtgattcgcattcctgatagcttacctcttgat 118  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||     
T  13413266 caagtatcgtgatggaaccgtcacttatggaggttactccgactcaatggttgcagacgagcactttgtgattcgcattcctgacaacatacctcttgaa 13413167  T
Q  119 ggtgccggtcctcttctttgcgctggagtcacagtgtatagtcctcttagacattttggactcgacaagcctggtatgaatataggagttgtaggtcttg 218  Q
      ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||    
T  13413166 tttgctggtcctctcctttgtgctggtgtcaccgtatatagtcctcttcgattttttggactcgataagcctggtttacatataggtgttgttggtcttg 13413067  T
Q  219 gtggacttggtcatatggctgtgaaatttgctaaagcttttggtgctaaagtgactgtaattagtacgtcgcctaaaaaggaaaaggaagcaatagaaca 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13413066 gtggacttggccatatggctgtgaaatttgccaaagctttcggtgctaatgttaccgtaattagtacatcgcctaacaaagaaaaggaagcaatagaaca 13412967  T
Q  319 cttaggagc 327  Q
    |||||||||    
T  13412966 cttaggagc 13412958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13454089 - 13453764
Alignment:
Q  45 atggaggtttctccgactcaatggttgcagacgagcactttgtgattcgcattcctgatagcttacctcttgatggtgccggtcctcttctttgcgctgg 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||  || | |||||| ||||| |||||    
T  13454089 atggaggcttctctgactcaatggtttccgacgagcactttgtgtttcgcattccagatcagttacctcttgatgcagctgctcctctcctttgtgctgg 13453990  T
Q  145 agtcacagtgtatagtcctcttagacattttggactcgacaagcctggtatgaatataggagttgtaggtcttggtggacttggtcatatggctgtgaaa 244  Q
      | || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13453989 gataaccgtatatagtcctcttcgacattttggactcgacaagcctgatatgaatataggtgttgttggtcttggtggacttggccatatggccgtgaaa 13453890  T
Q  245 tttgctaaagcttttggtgctaaagtgactgtaattagtacgtcgcctaaaaaggaaaaggaagcaatagaacacttaggagcagactcgtttctagtaa 344  Q
    || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||    
T  13453889 ttcgccaaagctttcggtgctaatgtgaccgtaattagtacatcacctaaaaaggaaaaggaagcattagaacacttacgagcggactcatttctaataa 13453790  T
Q  345 gccgcgatccagaacagatgcaggta 370  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||    
T  13453789 gccgtgatccaaagcagatgaaggta 13453764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 327
Target Start/End: Original strand, 13393562 - 13393851
Alignment:
Q  38 atcacctatggaggtttctccgactcaatggttgcagacgagcactttgtgattcgcattcctgatagcttacctcttgatggtgccggtcctcttcttt 137  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||| |||||   ||| | |||||| ||||    
T  13393562 atcacatatggagggtactctgactcaatggttgcagatgagcactttatagttcacattcctgatggcttaccacttgaatctgctgctcctctccttt 13393661  T
Q  138 gcgctggagtcacagtgtatagtcctcttagacattttggactcgacaagcctggtatgaatataggagttgtaggtcttggtggacttggtcatatggc 237  Q
    | || ||  | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||  |||     
T  13393662 gtgccggtattactgtgtatagtcctcttcgatattttggactcgacaagcctggtatgaatataggtattgttggtcttggtggacttggtcacttggg 13393761  T
Q  238 tgtgaaatttgctaaagcttttggtgctaaagtgactgtaattagtacgtcgcctaaaaaggaaaaggaagcaatagaacacttaggagc 327  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || || || || || |||||||||||| || |||||||    
T  13393762 tgtgaagtttgcaaaagcttttggagctaatgtaacagtaattagtacatcacccaacaaagagaaagaagcaatagaaaacctaggagc 13393851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 81 - 327
Target Start/End: Original strand, 13385377 - 13385623
Alignment:
Q  81 actttgtgattcgcattcctgatagcttacctcttgatggtgccggtcctcttctttgcgctggagtcacagtgtatagtcctcttagacattttggact 180  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| | ||||| ||||| | ||| |  ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  13385377 acttcgtggttcacattcctgatggattaccacttgaagctgctgcacctctcctttgtgctgggatcactgtgtacagtcctcttagatactttggact 13385476  T
Q  181 cgacaagcctggtatgaatataggagttgtaggtcttggtggacttggtcatatggctgtgaaatttgctaaagcttttggtgctaaagtgactgtaatt 280  Q
    |||||| |||||| |  || | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13385477 cgacaaacctggtcttcatgtcggtgttgttggtcttggtgggcttggtcacatggctgtgaaatttgccaaagcttttggtgctaatgtgaccgtaatt 13385576  T
Q  281 agtacgtcgcctaaaaaggaaaaggaagcaatagaacacttaggagc 327  Q
    ||||| ||  |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13385577 agtacatctgctagcaaagaaaaggaagcaaaagaacacttaggagc 13385623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 327
Target Start/End: Original strand, 13389136 - 13389444
Alignment:
Q  19 caagtctcgtgatggcactatcacctatggaggtttctccgactcaatggttgcagacgagcactttgtgattcgcattcctgatagcttacctcttgat 118  Q
    ||||| ||| ||||| || | ||| ||||||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||| |||||||||| | ||||| |||||     
T  13389136 caagtatcgcgatggaacgagcacatatggaggttattctgactcattggttgcagatgagaacttcgtggttcacattcctgatggattaccacttgaa 13389235  T
Q  119 ggtgccggtcctcttctttgcgctggagtcacagtgtatagtcctcttagacattttggactcgacaagcctggtatgaatataggagttgtaggtcttg 218  Q
    | ||| |  ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |   |||||| ||||| |||||||    
T  13389236 gctgctgcacctctcctttgtgctgggatcactgtgtacagtcctcttagatattatggactcgataaacctggtcttcgtataggtgttgttggtcttg 13389335  T
Q  219 gtggacttggtcatatggctgtgaaatttgctaaagcttttggtgctaaagtgactgtaattagtacgtcgcctaaaaaggaaaaggaagcaatagaaca 318  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  || || || |||||||| || || || || || || ||||||||||||||    
T  13389336 gtgggcttggtcacatggctgtgaaatttgccaaagcatttggtgcgattgtaacagtgattagtacatcacccaacaaagagaaagaagcaatagaaca 13389435  T
Q  319 cttaggagc 327  Q
    |||||||||    
T  13389436 cttaggagc 13389444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13373344 - 13373039
Alignment:
Q  28 tgatggcactatcacctatggaggtttctccgactcaatggttgcagacgagcactttgtgattcgcattcctgatagcttacctcttgatggtgccggt 127  Q
    |||||| || ||||| |||||||| | ||| ||  | ||||||||  |||| ||||| ||||| || |||||||||  |||||| |||||||  || | |    
T  13373344 tgatggaacaatcacatatggaggctactctgataccatggttgcccacgaacacttcgtgatccgtattcctgatgccttaccacttgatgccgctgct 13373245  T
Q  128 cctcttctttgcgctggagtcacagtgtatagtcctcttagacattttggactcgacaagcctggtatgaatataggagttgtaggtcttggtggacttg 227  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||| | | | ||||||||||  ||||||||||| |  || | || || || |||||||||||| | |    
T  13373244 cctcttctttgtgcggggatcacagtatatagccctttgaaatattttggacttaacaagcctggtttacatgtgggtgtggttggtcttggtggattag 13373145  T
Q  228 gtcatatggctgtgaaatttgctaaagcttttggtgctaaagtgactgtaattagtacgtcgcctaaaaaggaaaaggaagcaatagaacacttaggagc 327  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || || || || || || ||||| ||  | |||||||| || ||||||||||||||    
T  13373144 gtcatatggctgtgaaatttaccaaagcttttggtgctaatgtaacagtgataagcacttctcctaacaaaaagaaggaagccattgaacacttaggagc 13373045  T
Q  328 agactc 333  Q
     |||||    
T  13373044 tgactc 13373039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13379140 - 13378835
Alignment:
Q  28 tgatggcactatcacctatggaggtttctccgactcaatggttgcagacgagcactttgtgattcgcattcctgatagcttacctcttgatggtgccggt 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| | |||||||  ||||| |||||| |  | || ||||| |||  |||| | ||||||| ||||| |    
T  13379140 tgatggcactatcacatatggaggctactctgacaccatggttgtcgacgaacactttattgtccgtattcccgatgccttatcacttgatgctgccgct 13379041  T
Q  128 cctcttctttgcgctggagtcacagtgtatagtcctcttagacattttggactcgacaagcctggtatgaatataggagttgtaggtcttggtggacttg 227  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||  | | |||||||||| | ||||| |||||  || ||||||| || || |||||||||||| | |    
T  13379040 cctctcctttgtgctgggatcacagtgtatagcccaatgaaacattttggatttgacaaacctggactgcatataggtgtggttggtcttggtggattag 13378941  T
Q  228 gtcatatggctgtgaaatttgctaaagcttttggtgctaaagtgactgtaattagtacgtcgcctaaaaaggaaaaggaagcaatagaacacttaggagc 327  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||||||| ||| || |||||  | ||||| || ||||| ||  | |||||||| || |||| |||||||||    
T  13378940 gtcatatggctgtgaagttcgccaaagcctttggtgttaaggtaactgtggtaagtacttctcctaacaaaaagaaggaagccattgaacgcttaggagc 13378841  T
Q  328 agactc 333  Q
     |||||    
T  13378840 tgactc 13378835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47601427 - 47601119
Alignment:
Q  25 tcgtgatggcactatcacctatggaggtttctccgactcaatggttgcagacgagcactttgtgattcgcattcctgatagcttacctcttgatggtgcc 124  Q
    |||||||||||| | ||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| | || || ||||| | | |     
T  47601427 tcgtgatggcaccaccacatacggaggttactctgactcaatggttgtagacgagcactttgtggttcacattcccgatggtttgccacttgaagctact 47601328  T
Q  125 ggtcctcttctttgcgctggagtcacagtgtatagtcctcttagacattttggactcgacaagcctggtatgaatataggagttgtaggtcttggtggac 224  Q
    | |||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  47601327 gctcctcttctttgtgccggtatcacagtgtatagtcctcttcgatattttggactcgataaacctggtatgcatataggtgttgttggtcttggtggac 47601228  T
Q  225 ttggtcatatggctgtgaaatttgctaaagcttttggtgctaaagtgactgtaattagtacgtcgcctaaaaaggaaaaggaagcaatagaacacttagg 324  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||| ||||  ||||||    
T  47601227 ttggtcacatggctgttaagtttgctaaagcttttggggctaatgtgactgtaattagtacatcacctaacaaagaaaaagaagcaagagaatgcttagg 47601128  T
Q  325 agcagactc 333  Q
    ||| |||||    
T  47601127 agctgactc 47601119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 28430528 - 28430767
Alignment:
Q  28 tgatggcactatcacctatggaggtttctccgactcaatggttgcagacgagcactttgtgattcgcattcctgatagcttacctcttgatggtgccggt 127  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||||  | |||||   |||||||||  |||||||  ||||| |||||||||||| ||| | |    
T  28430528 tgatggcaccatcacatatggaggctactccgacacaatggtcaccgacgaaagctttgtgatcagcattccaaatagcctacctcttgatgctgcagct 28430627  T
Q  128 cctcttctttgcgctggagtcacagtgtatagtcctcttagacattttggactcgacaagcctggtatgaatataggagttgtaggtcttggtggacttg 227  Q
    ||||| || ||||| ||  |||| |||||||| ||| | | | |||||||||| || || |||    || |  |||| || || ||||||||||||||||    
T  28430628 cctctcctctgcgccgggatcacggtgtatagccctttgaaatattttggacttgataaacctaacttgcaattaggtgtggttggtcttggtggacttg 28430727  T
Q  228 gtcatatggctgtgaaatttgctaaagcttttggtgctaa 267  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28430728 gtcatatggctgtgaaatttgccaaagcttttggtgctaa 28430767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University