View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14754_low_2 (Length: 673)

Name: NF14754_low_2
Description: NF14754
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14754_low_2
NF14754_low_2
[»] chr8 (81 HSPs)
chr8 (13-375)||(13969982-13970344)
chr8 (238-421)||(17081615-17081798)
chr8 (204-417)||(43276739-43276959)
chr8 (236-413)||(17115507-17115684)
chr8 (236-417)||(31478041-31478222)
chr8 (236-416)||(6338284-6338464)
chr8 (204-417)||(1893809-1894023)
chr8 (236-413)||(44827317-44827494)
chr8 (236-419)||(28716627-28716810)
chr8 (236-417)||(23676836-23677018)
chr8 (238-419)||(28709270-28709451)
chr8 (236-413)||(31581663-31581840)
chr8 (236-413)||(32541192-32541369)
chr8 (204-416)||(45141416-45141634)
chr8 (176-370)||(39746879-39747073)
chr8 (236-416)||(16422796-16422975)
chr8 (236-416)||(42142735-42142915)
chr8 (236-417)||(25023271-25023452)
chr8 (236-421)||(36681447-36681631)
chr8 (236-417)||(38171427-38171608)
chr8 (236-419)||(10618770-10618952)
chr8 (236-396)||(39871251-39871410)
chr8 (204-375)||(31688018-31688189)
chr8 (204-382)||(41313375-41313553)
chr8 (236-417)||(39702271-39702452)
chr8 (236-396)||(8270892-8271052)
chr8 (236-382)||(41693906-41694055)
chr8 (176-382)||(3427561-3427767)
chr8 (236-418)||(22877925-22878107)
chr8 (196-416)||(32099502-32099723)
chr8 (236-382)||(27781102-27781248)
chr8 (215-416)||(37587697-37587899)
chr8 (201-416)||(34395311-34395528)
chr8 (236-417)||(37560529-37560710)
chr8 (236-417)||(11298041-11298222)
chr8 (236-416)||(40223084-40223263)
chr8 (176-382)||(29189659-29189872)
chr8 (204-323)||(36112809-36112928)
chr8 (236-417)||(11741103-11741274)
chr8 (236-416)||(24652234-24652413)
chr8 (201-399)||(9210969-9211167)
chr8 (236-382)||(39320066-39320212)
chr8 (236-375)||(44157204-44157343)
chr8 (236-342)||(2642418-2642524)
chr8 (236-369)||(35243352-35243485)
chr8 (236-377)||(38780666-38780807)
chr8 (211-375)||(2855090-2855253)
chr8 (236-413)||(36590105-36590282)
chr8 (180-375)||(43849144-43849346)
chr8 (236-382)||(7378848-7378994)
chr8 (236-376)||(3511224-3511364)
chr8 (169-370)||(1363725-1363926)
chr8 (204-296)||(42203371-42203463)
chr8 (180-375)||(8436461-8436663)
chr8 (184-296)||(39677442-39677561)
chr8 (236-316)||(9370316-9370397)
chr8 (236-323)||(22957368-22957455)
chr8 (236-301)||(44263388-44263453)
chr8 (176-373)||(40045409-40045613)
chr8 (236-323)||(40551868-40551954)
chr8 (209-416)||(16831500-16831699)
chr8 (236-297)||(13888326-13888387)
chr8 (217-376)||(14649142-14649302)
chr8 (248-312)||(26293837-26293901)
chr8 (248-312)||(26307094-26307158)
chr8 (240-323)||(26036984-26037067)
chr8 (204-382)||(2732313-2732496)
chr8 (195-281)||(37801089-37801175)
chr8 (177-261)||(14171683-14171767)
chr8 (241-296)||(44318316-44318371)
chr8 (236-292)||(10651115-10651171)
chr8 (176-322)||(18410884-18411030)
chr8 (186-226)||(5320480-5320520)
chr8 (385-417)||(31688185-31688217)
chr8 (239-297)||(2773529-2773586)
chr8 (295-340)||(35151040-35151085)
chr8 (195-247)||(7117753-7117805)
chr8 (239-279)||(29725884-29725924)
chr8 (233-281)||(41123769-41123817)
chr8 (300-416)||(44262989-44263105)
chr8 (210-258)||(45152131-45152179)
[»] chr3 (113 HSPs)
chr3 (53-382)||(44947029-44947352)
chr3 (236-419)||(26540924-26541107)
chr3 (236-417)||(16127144-16127325)
chr3 (236-413)||(29081286-29081463)
chr3 (236-418)||(44845589-44845771)
chr3 (204-416)||(8872840-8873052)
chr3 (176-384)||(42217662-42217870)
chr3 (236-417)||(19948323-19948504)
chr3 (236-417)||(37088250-37088431)
chr3 (156-389)||(37489850-37490082)
chr3 (236-416)||(2579932-2580112)
chr3 (204-420)||(40479994-40480210)
chr3 (204-399)||(46247937-46248132)
chr3 (204-409)||(21707125-21707330)
chr3 (236-421)||(37528728-37528913)
chr3 (236-413)||(40563368-40563545)
chr3 (204-417)||(44748759-44748971)
chr3 (236-416)||(28676895-28677075)
chr3 (236-416)||(38185738-38185917)
chr3 (236-419)||(50499727-50499909)
chr3 (178-368)||(33897840-33898030)
chr3 (236-417)||(35499568-35499748)
chr3 (236-415)||(24536559-24536738)
chr3 (236-419)||(52857860-52858043)
chr3 (196-370)||(2598608-2598782)
chr3 (204-382)||(37713938-37714116)
chr3 (204-382)||(43525744-43525922)
chr3 (236-418)||(47897611-47897793)
chr3 (236-417)||(45345013-45345193)
chr3 (236-396)||(25570366-25570526)
chr3 (236-416)||(38891991-38892170)
chr3 (180-382)||(193398-193600)
chr3 (236-417)||(29718206-29718386)
chr3 (236-417)||(52166095-52166276)
chr3 (196-399)||(46318724-46318928)
chr3 (236-382)||(4240279-4240425)
chr3 (236-396)||(54672185-54672344)
chr3 (238-417)||(48378192-48378371)
chr3 (236-382)||(52794896-52795042)
chr3 (204-382)||(54541908-54542086)
chr3 (236-416)||(46972000-46972180)
chr3 (204-382)||(48942992-48943168)
chr3 (196-382)||(55305067-55305260)
chr3 (236-421)||(45368572-45368757)
chr3 (236-419)||(50317034-50317209)
chr3 (176-376)||(39719361-39719560)
chr3 (196-417)||(33391869-33392097)
chr3 (176-382)||(52595279-52595485)
chr3 (236-382)||(53779032-53779178)
chr3 (236-416)||(12063733-12063913)
chr3 (236-396)||(30864414-30864573)
chr3 (236-396)||(49853048-49853208)
chr3 (196-375)||(39876622-39876801)
chr3 (196-375)||(41246257-41246436)
chr3 (236-377)||(24628204-24628345)
chr3 (236-416)||(2121795-2121974)
chr3 (277-417)||(41785775-41785915)
chr3 (176-377)||(32026347-32026555)
chr3 (236-377)||(46627502-46627644)
chr3 (236-369)||(2851831-2851964)
chr3 (263-396)||(47173555-47173688)
chr3 (236-323)||(21603858-21603945)
chr3 (236-399)||(42465032-42465195)
chr3 (236-327)||(51003303-51003394)
chr3 (236-382)||(52225286-52225432)
chr3 (236-417)||(41518327-41518508)
chr3 (176-413)||(20450428-20450672)
chr3 (236-323)||(42497054-42497141)
chr3 (236-323)||(51709071-51709158)
chr3 (237-323)||(30548804-30548890)
chr3 (278-420)||(44545194-44545335)
chr3 (180-318)||(52868128-52868266)
chr3 (196-395)||(35100175-35100368)
chr3 (236-316)||(45693391-45693471)
chr3 (196-384)||(30814215-30814403)
chr3 (278-416)||(39469887-39470018)
chr3 (236-370)||(29203032-29203166)
chr3 (236-370)||(7041074-7041208)
chr3 (176-375)||(37713077-37713285)
chr3 (204-292)||(52931118-52931206)
chr3 (150-249)||(44810857-44810956)
chr3 (180-308)||(5506704-5506839)
chr3 (350-420)||(28394173-28394243)
chr3 (180-316)||(25146380-25146523)
chr3 (359-417)||(889679-889736)
chr3 (350-411)||(24536808-24536869)
chr3 (236-309)||(27446501-27446574)
chr3 (248-323)||(24350282-24350357)
chr3 (350-417)||(52363008-52363075)
chr3 (209-315)||(612120-612226)
chr3 (240-305)||(32982921-32982986)
chr3 (236-315)||(22257721-22257800)
chr3 (278-323)||(43740325-43740370)
chr3 (329-382)||(52788677-52788730)
chr3 (329-417)||(51950322-51950410)
chr3 (368-419)||(53779002-53779053)
chr3 (329-382)||(5505852-5505905)
chr3 (250-325)||(9338785-9338860)
chr3 (216-279)||(34785801-34785864)
chr3 (236-271)||(39470011-39470046)
chr3 (240-299)||(43359249-43359307)
chr3 (210-281)||(55118562-55118633)
chr3 (345-375)||(13285952-13285982)
chr3 (378-420)||(48942961-48943003)
chr3 (239-305)||(51980820-51980884)
chr3 (329-382)||(2187295-2187347)
chr3 (202-243)||(41538451-41538492)
chr3 (239-279)||(22978191-22978231)
chr3 (350-382)||(31558317-31558349)
chr3 (239-279)||(41888921-41888961)
chr3 (211-279)||(48747517-48747585)
chr3 (239-279)||(50938181-50938221)
chr3 (378-422)||(54542075-54542119)
[»] chr1 (98 HSPs)
chr1 (53-382)||(7780972-7781295)
chr1 (204-419)||(13121537-13121751)
chr1 (204-416)||(17046699-17046911)
chr1 (204-419)||(39826567-39826782)
chr1 (236-427)||(33524487-33524678)
chr1 (204-418)||(47134484-47134697)
chr1 (236-412)||(26204249-26204424)
chr1 (204-418)||(7710907-7711121)
chr1 (236-417)||(2497891-2498072)
chr1 (236-413)||(19898893-19899070)
chr1 (236-416)||(44909811-44909990)
chr1 (236-413)||(36301090-36301265)
chr1 (236-419)||(32368324-32368507)
chr1 (236-413)||(1917999-1918175)
chr1 (236-416)||(36838680-36838860)
chr1 (236-396)||(42064302-42064462)
chr1 (236-419)||(31150410-31150592)
chr1 (204-382)||(38967417-38967594)
chr1 (236-416)||(30721608-30721789)
chr1 (236-416)||(15313214-15313393)
chr1 (204-416)||(18347369-18347580)
chr1 (236-396)||(29586148-29586308)
chr1 (204-399)||(25601973-25602168)
chr1 (236-417)||(17499870-17500053)
chr1 (236-416)||(34319359-34319539)
chr1 (236-419)||(26843718-26843901)
chr1 (236-416)||(30774056-30774231)
chr1 (236-413)||(29704069-29704246)
chr1 (176-389)||(50540769-50540982)
chr1 (180-382)||(34086970-34087172)
chr1 (236-402)||(38676474-38676639)
chr1 (236-416)||(1507728-1507909)
chr1 (236-398)||(15348812-15348974)
chr1 (236-390)||(29374326-29374480)
chr1 (236-382)||(50351036-50351182)
chr1 (204-376)||(44718924-44719096)
chr1 (185-399)||(3660932-3661153)
chr1 (236-382)||(3270663-3270808)
chr1 (236-377)||(34318415-34318556)
chr1 (236-383)||(49220458-49220605)
chr1 (176-375)||(49240206-49240405)
chr1 (236-382)||(322869-323015)
chr1 (176-384)||(3391122-3391337)
chr1 (180-376)||(25134858-25135054)
chr1 (179-323)||(46056354-46056498)
chr1 (236-415)||(36043285-36043465)
chr1 (177-376)||(52703030-52703236)
chr1 (236-396)||(50171282-50171442)
chr1 (236-427)||(51422969-51423161)
chr1 (209-395)||(44956269-44956455)
chr1 (278-418)||(33561922-33562062)
chr1 (196-382)||(46369809-46370001)
chr1 (236-387)||(37703666-37703820)
chr1 (236-363)||(16085596-16085723)
chr1 (236-339)||(22098965-22099068)
chr1 (236-389)||(8221220-8221373)
chr1 (236-312)||(40887949-40888025)
chr1 (236-323)||(37672335-37672422)
chr1 (236-323)||(42614120-42614207)
chr1 (176-305)||(33151975-33152111)
chr1 (236-382)||(39583100-39583246)
chr1 (236-313)||(5697550-5697627)
chr1 (236-372)||(49185170-49185306)
chr1 (278-417)||(2479130-2479268)
chr1 (236-370)||(13570778-13570912)
chr1 (180-323)||(42963891-42964034)
chr1 (236-323)||(43727084-43727171)
chr1 (236-323)||(49822152-49822239)
chr1 (176-309)||(41004911-41005051)
chr1 (242-323)||(9769964-9770045)
chr1 (236-389)||(46087985-46088138)
chr1 (329-416)||(9169048-9169135)
chr1 (209-299)||(9169142-9169232)
chr1 (209-323)||(30495153-30495267)
chr1 (196-293)||(7024916-7025013)
chr1 (196-323)||(28429092-28429213)
chr1 (236-372)||(46928969-46929105)
chr1 (196-306)||(40719554-40719664)
chr1 (209-326)||(10628787-10628903)
chr1 (180-384)||(27659294-27659499)
chr1 (236-309)||(36379131-36379204)
chr1 (228-312)||(2028953-2029037)
chr1 (236-292)||(9894931-9894987)
chr1 (236-368)||(28868996-28869128)
chr1 (237-289)||(40935893-40935945)
chr1 (243-293)||(33632331-33632381)
chr1 (349-417)||(22099687-22099754)
chr1 (236-295)||(6814118-6814177)
chr1 (350-417)||(7024812-7024879)
chr1 (305-375)||(52071222-52071292)
chr1 (177-315)||(31259501-31259641)
chr1 (329-397)||(40719487-40719555)
chr1 (236-271)||(2479261-2479296)
chr1 (243-289)||(31434449-31434495)
chr1 (305-375)||(33632269-33632339)
chr1 (236-325)||(912714-912803)
chr1 (209-249)||(46087951-46087991)
chr1 (211-279)||(50814093-50814161)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (53-375)||(21894264-21894584)
chr6 (204-421)||(31099983-31100200)
chr6 (236-416)||(12297331-12297511)
chr6 (236-416)||(14227536-14227715)
chr6 (236-418)||(32731723-32731905)
chr6 (204-413)||(34232876-34233092)
chr6 (236-420)||(2442387-2442571)
chr6 (236-416)||(30811149-30811329)
chr6 (204-396)||(31451923-31452114)
chr6 (236-396)||(20804976-20805136)
chr6 (204-382)||(10856133-10856311)
chr6 (177-375)||(23648201-23648399)
chr6 (236-417)||(34685016-34685189)
chr6 (176-375)||(5301535-5301741)
chr6 (236-413)||(7317611-7317788)
chr6 (236-424)||(558326-558507)
chr6 (211-366)||(6104646-6104801)
chr6 (264-416)||(1806343-1806494)
chr6 (176-382)||(34439683-34439896)
chr6 (236-375)||(12432621-12432760)
chr6 (209-384)||(33453734-33453909)
chr6 (236-382)||(28076423-28076569)
chr6 (196-397)||(3636601-3636801)
chr6 (236-375)||(33540726-33540865)
chr6 (236-418)||(34903924-34904093)
chr6 (236-382)||(11015590-11015736)
chr6 (236-382)||(3108006-3108153)
chr6 (236-323)||(5681579-5681666)
chr6 (236-323)||(5943051-5943138)
chr6 (176-370)||(12140812-12141012)
chr6 (236-376)||(29823036-29823176)
chr6 (236-375)||(6709696-6709835)
chr6 (177-375)||(20563400-20563606)
chr6 (180-315)||(15591088-15591230)
chr6 (236-372)||(31049344-31049480)
chr6 (236-323)||(2970734-2970821)
chr6 (218-326)||(5893876-5893984)
chr6 (180-375)||(7292486-7292688)
chr6 (236-419)||(29414924-29415094)
chr6 (194-324)||(26561408-26561538)
chr6 (236-322)||(9896766-9896852)
chr6 (241-323)||(1225491-1225573)
chr6 (175-295)||(11443033-11443160)
chr6 (210-326)||(15131360-15131476)
chr6 (236-325)||(32563244-32563333)
chr6 (237-312)||(19415351-19415426)
chr6 (176-249)||(22756562-22756635)
chr6 (305-375)||(3832351-3832421)
[»] chr4 (127 HSPs)
chr4 (53-296)||(24954035-24954282)
chr4 (211-421)||(35777362-35777572)
chr4 (236-421)||(12233968-12234153)
chr4 (236-417)||(4517192-4517373)
chr4 (236-416)||(11600646-11600826)
chr4 (236-416)||(53407153-53407332)
chr4 (204-396)||(55495849-55496041)
chr4 (204-418)||(47417444-47417658)
chr4 (236-417)||(8829816-8829997)
chr4 (236-419)||(4392727-4392909)
chr4 (236-419)||(22038358-22038541)
chr4 (236-417)||(42116858-42117039)
chr4 (236-413)||(45906105-45906282)
chr4 (236-396)||(46895266-46895426)
chr4 (201-421)||(55828962-55829182)
chr4 (204-417)||(37115252-37115464)
chr4 (236-421)||(55764518-55764702)
chr4 (236-416)||(28307218-28307398)
chr4 (236-419)||(7706332-7706515)
chr4 (236-422)||(56372393-56372578)
chr4 (236-417)||(18582807-18582987)
chr4 (176-416)||(36196837-36197077)
chr4 (204-417)||(31678938-31679144)
chr4 (236-414)||(35822300-35822478)
chr4 (236-417)||(39087559-39087739)
chr4 (236-396)||(19513883-19514043)
chr4 (204-419)||(43225646-43225861)
chr4 (236-396)||(8941887-8942047)
chr4 (236-396)||(22892511-22892671)
chr4 (236-396)||(22944175-22944335)
chr4 (236-382)||(11151940-11152086)
chr4 (204-382)||(29663926-29664104)
chr4 (236-389)||(52669984-52670137)
chr4 (176-383)||(21633750-21633964)
chr4 (236-395)||(27397767-27397927)
chr4 (236-397)||(9043611-9043773)
chr4 (236-382)||(25440485-25440631)
chr4 (176-337)||(4465412-4465573)
chr4 (236-377)||(22430637-22430778)
chr4 (201-402)||(35580911-35581112)
chr4 (236-420)||(51011066-51011250)
chr4 (176-375)||(11050320-11050520)
chr4 (236-416)||(37970258-37970437)
chr4 (236-382)||(3009708-3009854)
chr4 (236-382)||(23867870-23868016)
chr4 (236-382)||(29413528-29413674)
chr4 (259-421)||(53273076-53273238)
chr4 (236-369)||(21369890-21370023)
chr4 (176-375)||(20511413-20511612)
chr4 (236-382)||(4939387-4939532)
chr4 (236-396)||(55856528-55856685)
chr4 (236-417)||(4355593-4355767)
chr4 (176-377)||(23113410-23113618)
chr4 (236-419)||(31338501-31338686)
chr4 (204-399)||(15635922-15636124)
chr4 (236-390)||(5465411-5465565)
chr4 (211-313)||(20148778-20148880)
chr4 (204-377)||(37831924-37832096)
chr4 (210-323)||(42085697-42085810)
chr4 (236-416)||(25235108-25235288)
chr4 (204-316)||(33005077-33005189)
chr4 (242-382)||(35468012-35468152)
chr4 (236-375)||(56270092-56270231)
chr4 (236-382)||(4391709-4391855)
chr4 (209-370)||(32101709-32101869)
chr4 (204-375)||(33114979-33115157)
chr4 (176-308)||(41864021-41864153)
chr4 (236-323)||(9031996-9032083)
chr4 (236-375)||(26826525-26826664)
chr4 (196-315)||(31435070-31435189)
chr4 (201-312)||(40497362-40497473)
chr4 (236-323)||(55358339-55358426)
chr4 (236-318)||(27185633-27185715)
chr4 (209-315)||(37047093-37047199)
chr4 (236-370)||(43078197-43078331)
chr4 (236-382)||(55684692-55684838)
chr4 (214-315)||(48056585-48056686)
chr4 (236-415)||(44442046-44442224)
chr4 (204-416)||(45780726-45780918)
chr4 (236-382)||(35190617-35190763)
chr4 (180-365)||(50502254-50502440)
chr4 (180-375)||(52707937-52708138)
chr4 (180-375)||(30562794-30562988)
chr4 (196-322)||(44525694-44525820)
chr4 (236-323)||(23162657-23162745)
chr4 (236-323)||(30366147-30366234)
chr4 (176-296)||(17715647-17715767)
chr4 (329-416)||(25199390-25199477)
chr4 (156-297)||(31011003-31011143)
chr4 (294-416)||(29656597-29656719)
chr4 (202-314)||(52713559-52713678)
chr4 (202-310)||(8716885-8716993)
chr4 (305-382)||(24954271-24954348)
chr4 (204-321)||(31953213-31953330)
chr4 (196-297)||(53224309-53224410)
chr4 (262-385)||(29656720-29656843)
chr4 (212-323)||(38048854-38048965)
chr4 (236-382)||(36008019-36008152)
chr4 (209-337)||(39068868-39068996)
chr4 (236-296)||(42124680-42124740)
chr4 (299-370)||(3932300-3932371)
chr4 (305-384)||(17715579-17715658)
chr4 (210-296)||(40119903-40119996)
chr4 (213-342)||(1031324-1031453)
chr4 (166-281)||(2320099-2320214)
chr4 (349-398)||(19169164-19169213)
chr4 (305-370)||(42124729-42124794)
chr4 (236-308)||(37337710-37337782)
chr4 (236-339)||(36486386-36486489)
chr4 (352-398)||(45520089-45520135)
chr4 (175-295)||(26443389-26443516)
chr4 (329-382)||(33005222-33005275)
chr4 (305-416)||(26443288-26443399)
chr4 (236-271)||(35842610-35842645)
chr4 (176-280)||(3932183-3932294)
chr4 (180-253)||(12928980-12929053)
chr4 (278-323)||(35842638-35842683)
chr4 (236-279)||(20530804-20530847)
chr4 (236-323)||(32948184-32948271)
chr4 (212-262)||(13054486-13054536)
chr4 (176-230)||(32948110-32948164)
chr4 (345-375)||(38489366-38489396)
chr4 (176-261)||(44375717-44375802)
chr4 (176-292)||(49239153-49239276)
chr4 (368-396)||(25440610-25440638)
chr4 (239-279)||(31624344-31624384)
chr4 (239-279)||(48953143-48953183)
[»] chr2 (89 HSPs)
chr2 (204-417)||(5039738-5039951)
chr2 (236-424)||(3377349-3377536)
chr2 (204-418)||(4038305-4038518)
chr2 (236-418)||(4453520-4453702)
chr2 (236-417)||(16486846-16487026)
chr2 (236-425)||(38579005-38579194)
chr2 (236-416)||(650777-650956)
chr2 (236-416)||(21865210-21865391)
chr2 (236-413)||(28382677-28382854)
chr2 (236-416)||(8688959-8689138)
chr2 (236-419)||(2546321-2546504)
chr2 (201-417)||(6760566-6760782)
chr2 (201-419)||(41796704-41796922)
chr2 (204-417)||(43135582-43135793)
chr2 (236-417)||(9886956-9887136)
chr2 (236-416)||(13111739-13111920)
chr2 (236-413)||(36712533-36712709)
chr2 (236-420)||(8815174-8815357)
chr2 (236-419)||(40024939-40025122)
chr2 (236-396)||(41322740-41322900)
chr2 (176-371)||(24019895-24020090)
chr2 (196-420)||(29514801-29515024)
chr2 (236-419)||(36999451-36999633)
chr2 (196-393)||(4385482-4385679)
chr2 (236-389)||(15521470-15521623)
chr2 (236-396)||(37356152-37356313)
chr2 (236-382)||(43507559-43507705)
chr2 (236-417)||(2266149-2266329)
chr2 (236-417)||(26911475-26911655)
chr2 (204-381)||(31616351-31616528)
chr2 (157-390)||(15250095-15250335)
chr2 (236-382)||(17263750-17263896)
chr2 (236-420)||(24402049-24402226)
chr2 (236-421)||(10839577-10839761)
chr2 (236-375)||(39167756-39167895)
chr2 (201-384)||(40869321-40869504)
chr2 (236-384)||(10393032-10393180)
chr2 (165-319)||(4055951-4056112)
chr2 (156-389)||(34884801-34885035)
chr2 (236-377)||(7400388-7400529)
chr2 (236-416)||(13527901-13528079)
chr2 (236-413)||(44275630-44275806)
chr2 (277-417)||(18212083-18212223)
chr2 (236-415)||(38880779-38880959)
chr2 (236-397)||(6232277-6232438)
chr2 (214-315)||(16669117-16669218)
chr2 (176-377)||(38842838-38843046)
chr2 (177-382)||(23356915-23357128)
chr2 (178-368)||(2221401-2221598)
chr2 (196-375)||(42132671-42132851)
chr2 (196-315)||(2758896-2759015)
chr2 (242-369)||(7213664-7213791)
chr2 (196-398)||(10727812-10728021)
chr2 (180-314)||(25071436-25071577)
chr2 (204-323)||(43285675-43285794)
chr2 (176-296)||(13761842-13761960)
chr2 (180-382)||(5520002-5520211)
chr2 (180-414)||(7823481-7823722)
chr2 (236-396)||(8339963-8340123)
chr2 (236-323)||(8070617-8070704)
chr2 (204-416)||(6153427-6153625)
chr2 (187-281)||(6807492-6807586)
chr2 (211-308)||(6222611-6222708)
chr2 (204-293)||(18710257-18710346)
chr2 (211-298)||(41877821-41877908)
chr2 (236-309)||(2047318-2047391)
chr2 (237-321)||(9053128-9053212)
chr2 (204-317)||(37674482-37674595)
chr2 (236-315)||(598956-599035)
chr2 (204-296)||(13351569-13351660)
chr2 (329-421)||(18710150-18710241)
chr2 (184-281)||(3337166-3337263)
chr2 (181-313)||(33850066-33850198)
chr2 (238-293)||(7569853-7569908)
chr2 (236-310)||(39675089-39675163)
chr2 (378-419)||(8702860-8702901)
chr2 (368-415)||(17263875-17263922)
chr2 (180-293)||(7511644-7511764)
chr2 (180-293)||(7515928-7516048)
chr2 (228-313)||(2689059-2689143)
chr2 (305-370)||(13351649-13351714)
chr2 (329-382)||(13761777-13761829)
chr2 (349-397)||(7569768-7569816)
chr2 (204-280)||(12738544-12738620)
chr2 (176-247)||(2757312-2757383)
chr2 (236-279)||(44525930-44525973)
chr2 (239-305)||(10361481-10361546)
chr2 (352-393)||(13564523-13564564)
chr2 (350-382)||(22375955-22375987)
[»] chr7 (81 HSPs)
chr7 (204-420)||(36436117-36436332)
chr7 (204-417)||(42375759-42375970)
chr7 (236-417)||(40637168-40637349)
chr7 (204-399)||(47587081-47587275)
chr7 (236-417)||(21741937-21742119)
chr7 (236-413)||(36246384-36246560)
chr7 (236-417)||(43134371-43134551)
chr7 (236-417)||(43254069-43254250)
chr7 (236-417)||(47470970-47471150)
chr7 (236-396)||(42587391-42587551)
chr7 (236-396)||(45686924-45687084)
chr7 (236-418)||(48313432-48313613)
chr7 (236-421)||(9487369-9487554)
chr7 (236-396)||(10312037-10312197)
chr7 (236-417)||(21254705-21254885)
chr7 (204-418)||(21313765-21313981)
chr7 (236-427)||(45222081-45222265)
chr7 (204-416)||(17192418-17192629)
chr7 (204-375)||(19831966-19832137)
chr7 (236-421)||(482990-483174)
chr7 (236-419)||(31511271-31511447)
chr7 (236-417)||(40258823-40259004)
chr7 (236-416)||(21374601-21374780)
chr7 (176-390)||(11465987-11466201)
chr7 (236-420)||(44743680-44743864)
chr7 (236-382)||(27089664-27089810)
chr7 (236-382)||(27188491-27188637)
chr7 (236-390)||(27655681-27655835)
chr7 (236-417)||(36407194-36407375)
chr7 (236-416)||(44596577-44596757)
chr7 (236-417)||(34709206-34709380)
chr7 (236-382)||(35587580-35587726)
chr7 (176-383)||(17844544-17844758)
chr7 (236-382)||(23029790-23029937)
chr7 (236-382)||(48832061-48832207)
chr7 (236-379)||(33026881-33027023)
chr7 (209-375)||(46757717-46757884)
chr7 (204-417)||(32168799-32168998)
chr7 (236-386)||(33203676-33203826)
chr7 (236-382)||(40106013-40106159)
chr7 (176-375)||(27869510-27869709)
chr7 (209-382)||(1342777-1342957)
chr7 (209-339)||(22642232-22642362)
chr7 (236-365)||(48590732-48590861)
chr7 (236-384)||(28425619-28425767)
chr7 (236-396)||(49148319-49148479)
chr7 (236-377)||(40893377-40893519)
chr7 (236-417)||(46879532-46879714)
chr7 (176-322)||(35000773-35000919)
chr7 (236-345)||(12345075-12345184)
chr7 (196-377)||(38481286-38481467)
chr7 (191-382)||(791289-791487)
chr7 (236-398)||(19757524-19757686)
chr7 (236-323)||(9485776-9485863)
chr7 (255-374)||(21316611-21316730)
chr7 (213-315)||(45672362-45672464)
chr7 (176-290)||(47584185-47584299)
chr7 (236-375)||(36612119-36612256)
chr7 (236-323)||(38531191-38531277)
chr7 (176-249)||(33609070-33609143)
chr7 (242-393)||(48620448-48620598)
chr7 (180-323)||(7884636-7884774)
chr7 (196-292)||(39698930-39699026)
chr7 (236-373)||(21740154-21740290)
chr7 (271-334)||(24170793-24170856)
chr7 (236-299)||(24170860-24170923)
chr7 (236-326)||(22621466-22621556)
chr7 (180-246)||(44072787-44072853)
chr7 (210-296)||(48729549-48729635)
chr7 (180-220)||(21358734-21358774)
chr7 (178-244)||(30699599-30699665)
chr7 (239-313)||(39229953-39230027)
chr7 (211-249)||(40893513-40893551)
chr7 (239-305)||(41406276-41406341)
chr7 (241-305)||(981425-981488)
chr7 (228-256)||(12651080-12651108)
chr7 (275-323)||(21358644-21358692)
chr7 (378-414)||(27089799-27089835)
chr7 (239-279)||(33979729-33979769)
chr7 (211-279)||(39709762-39709830)
chr7 (349-377)||(47584118-47584146)
[»] chr5 (84 HSPs)
chr5 (236-416)||(32382815-32382995)
chr5 (236-419)||(36685779-36685962)
chr5 (176-382)||(11100693-11100899)
chr5 (204-417)||(4221432-4221644)
chr5 (236-417)||(12774541-12774722)
chr5 (236-418)||(24793936-24794118)
chr5 (236-417)||(12713277-12713458)
chr5 (236-417)||(14647348-14647528)
chr5 (236-421)||(19525710-19525895)
chr5 (236-415)||(30299665-30299844)
chr5 (236-413)||(8023975-8024152)
chr5 (236-421)||(13228464-13228648)
chr5 (236-416)||(2236507-2236687)
chr5 (176-375)||(648538-648737)
chr5 (236-419)||(32381665-32381848)
chr5 (236-418)||(30412603-30412785)
chr5 (236-418)||(39744533-39744714)
chr5 (236-423)||(1174743-1174930)
chr5 (236-417)||(1711194-1711375)
chr5 (236-418)||(5591553-5591734)
chr5 (236-402)||(6603901-6604067)
chr5 (204-382)||(39246796-39246973)
chr5 (204-417)||(2671379-2671592)
chr5 (236-421)||(10697230-10697415)
chr5 (238-419)||(30774185-30774366)
chr5 (204-416)||(13156845-13157057)
chr5 (236-416)||(19956299-19956477)
chr5 (204-396)||(29392066-29392257)
chr5 (236-415)||(35236658-35236838)
chr5 (204-396)||(9587145-9587338)
chr5 (236-417)||(27130305-27130479)
chr5 (236-417)||(12363603-12363784)
chr5 (236-396)||(35639926-35640086)
chr5 (236-382)||(5997885-5998031)
chr5 (204-396)||(3669527-3669719)
chr5 (236-384)||(5381935-5382082)
chr5 (180-382)||(16474771-16474980)
chr5 (236-396)||(39275409-39275569)
chr5 (236-421)||(9160683-9160861)
chr5 (236-417)||(35235718-35235892)
chr5 (209-399)||(6893343-6893532)
chr5 (236-396)||(3037416-3037576)
chr5 (236-396)||(3670264-3670424)
chr5 (186-342)||(13936232-13936388)
chr5 (236-396)||(31168978-31169138)
chr5 (236-382)||(19347705-19347852)
chr5 (175-375)||(2497570-2497770)
chr5 (236-396)||(11663882-11664042)
chr5 (236-375)||(43402451-43402590)
chr5 (236-384)||(26699097-26699245)
chr5 (236-384)||(26968830-26968978)
chr5 (236-416)||(15443422-15443602)
chr5 (236-375)||(15530442-15530581)
chr5 (236-375)||(5521305-5521444)
chr5 (236-365)||(2178777-2178906)
chr5 (236-384)||(11062898-11063047)
chr5 (236-375)||(36027982-36028121)
chr5 (236-366)||(7651656-7651786)
chr5 (236-323)||(4379317-4379404)
chr5 (236-342)||(22977196-22977302)
chr5 (244-420)||(23920420-23920595)
chr5 (209-323)||(13921784-13921898)
chr5 (180-313)||(9627082-9627222)
chr5 (236-375)||(42323598-42323737)
chr5 (202-296)||(7896599-7896692)
chr5 (204-290)||(25872187-25872273)
chr5 (213-315)||(32321630-32321732)
chr5 (236-296)||(4657592-4657652)
chr5 (236-296)||(6349426-6349486)
chr5 (329-417)||(25872292-25872380)
chr5 (236-315)||(4875711-4875790)
chr5 (221-342)||(41471885-41472007)
chr5 (180-316)||(27005782-27005925)
chr5 (242-323)||(31407981-31408062)
chr5 (194-295)||(28812363-28812466)
chr5 (236-323)||(6280446-6280533)
chr5 (180-315)||(18480497-18480632)
chr5 (179-309)||(11780118-11780248)
chr5 (176-323)||(33694735-33694889)
chr5 (195-281)||(813769-813853)
chr5 (211-297)||(7157416-7157501)
chr5 (210-258)||(8638229-8638277)
chr5 (295-325)||(8645625-8645655)
chr5 (239-279)||(15524477-15524517)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (236-419)||(22558-22741)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (236-418)||(12717-12899)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (236-417)||(126760-126940)
[»] scaffold1632 (1 HSPs)
scaffold1632 (236-417)||(37-218)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (260-417)||(27158-27316)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (236-416)||(7024-7203)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (204-382)||(30145-30323)
scaffold0197 (236-418)||(28076-28267)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (236-382)||(192013-192159)
scaffold0009 (240-305)||(94351-94415)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (211-382)||(9230-9401)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (204-344)||(52989-53129)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (236-375)||(431265-431404)
scaffold0002 (236-315)||(119239-119318)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (236-375)||(63851-63990)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (211-316)||(84322-84427)
scaffold0016 (236-375)||(93386-93525)
scaffold0016 (378-421)||(93514-93556)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (201-312)||(4562-4673)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (204-323)||(5468-5586)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (236-377)||(72765-72907)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (242-389)||(8969-9115)
[»] scaffold0027 (2 HSPs)
scaffold0027 (236-293)||(41765-41822)
scaffold0027 (329-417)||(41838-41925)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (350-418)||(36319-36387)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (244-312)||(10833-10901)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (190-258)||(11846-11914)
[»] scaffold1360 (2 HSPs)
scaffold1360 (299-370)||(1295-1366)
scaffold1360 (176-280)||(1178-1289)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (194-324)||(59137-59266)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (209-242)||(32580-32613)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 81)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13970344 - 13969982
Alignment:
Q  13 agatgaatatatgaaaaatatgctccagtagnnnnnnnnnatttgaagagtactcgagtagttgagttgtactaattaaattggaagtatataggaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  13970344 agatgaatatatgaaaaatatgctcgagtagtttttttttatttgaagagtactcgagtagttgagttgtactaattaaattggaagtatataggaactg 13970245  T
Q  113 gaaacgtaggaacnnnnnnntatagagggaaaacatagaaaacgtaataaatgtgttttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataa 212  Q
    |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13970244 gaaacgtaggaacaaaaaaatatagagggaaaacatagaaaacgtaataaatgtgtgttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataa 13970145  T
Q  213 gggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13970144 gggtaaaaatggaagaaaatatgataagctataagctcaaacgctacttcgaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 13970045  T
Q  313 cgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13970044 cgtggtgaaaagacagtaccaaacagagcttttttgatcaaacgagcttataagctataagct 13969982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 238 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17081798 - 17081615
Alignment:
Q  238 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaaca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||    
T  17081798 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 17081699  T
Q  338 gagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17081698 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 17081615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 204 - 417
Target Start/End: Original strand, 43276739 - 43276959
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43276739 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 43276838  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagct-------tataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43276839 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 43276938  T
Q  397 ggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43276939 ggggttaaccaaacagaccct 43276959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 17115684 - 17115507
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  17115684 ataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 17115585  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17115584 cagagctttttttttcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 17115507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 31478222 - 31478041
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  31478222 ataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 31478123  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31478122 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctcttttggggttaaccaaacagaccct 31478041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 6338464 - 6338284
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  6338464 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaa 6338365  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6338364 cagagttttttttatcaaacgagcttataagctataagctagaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 6338284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 204 - 417
Target Start/End: Original strand, 1893809 - 1894023
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1893809 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 1893908  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtt 402  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1893909 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaacttttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtt 1894008  T
Q  403 aaccaaacagaccct 417  Q
      |||||||||||||    
T  1894009 tcccaaacagaccct 1894023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Original strand, 44827317 - 44827494
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  44827317 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 44827416  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44827417 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctcttttttgaggttaaccaaacaga 44827494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 28716810 - 28716627
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  28716810 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 28716711  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  28716710 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttgggttttcccaaacagaccctta 28716627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 23677018 - 23676836
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  23677018 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagttcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 23676919  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
     ||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23676918 gagaacttttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 23676836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 238 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 28709451 - 28709270
Alignment:
Q  238 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaaca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||    
T  28709451 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 28709352  T
Q  338 gagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  28709351 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttgggttttcccaaacagaccctta 28709270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 31581840 - 31581663
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  31581840 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 31581741  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  31581740 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttttggataaccaaacaga 31581663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 32541369 - 32541192
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  32541369 ataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 32541270  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32541269 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctactttttggggttaaccaaacaga 32541192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 204 - 416
Target Start/End: Original strand, 45141416 - 45141634
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45141416 aaataataagggtaaaattggaagaaaaggtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 45141515  T
Q  297 aaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45141516 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaaactctttttt 45141615  T
Q  397 ggggttaaccaaacagaccc 416  Q
     || ||||||||||||||||    
T  45141616 -ggattaaccaaacagaccc 45141634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 176 - 370
Target Start/End: Original strand, 39746879 - 39747073
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    ||||||||||||||  |  |||||  |||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39746879 tataaagggtaaaaaagaattttagataaaacaataagggtaaaattggaagaaaaaattataagctataagctcaaacgctacttggaatagcatctga 39746978  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctat 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  39746979 aaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcgtggtgaaaaaacattaccaaacagagcttttttggtcaaacgagcttataagctat 39747073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16422975 - 16422796
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||     ||| |||    
T  16422975 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatgatgaaaaagtgttactaaa 16422876  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16422875 cagagctttttttatcaaacgagcttataggctataagctaaaagctaaaagctctttttt-gggttaaccaaacagaccc 16422796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 42142735 - 42142915
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  42142735 ataagctataagctcaaacactatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 42142834  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    ||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42142835 cagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttgaggttaaccaaacagaccc 42142915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 25023452 - 25023271
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  25023452 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 25023353  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||    
T  25023352 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttttagtttcccaaacagaccct 25023271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Original strand, 36681447 - 36681631
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  36681447 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 36681546  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||    
T  36681547 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagttaaaagctctttttt-tagtttcccaaacagacccttagt 36681631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 38171427 - 38171608
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |     |||||||    
T  38171427 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaacaacttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaacaagtgttaccaaa 38171526  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38171527 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctcttttttggggtttcccaaacagaccct 38171608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 10618952 - 10618770
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  10618952 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 10618853  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    || | ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  10618852 caaaactttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctctttttt-tggtttcccaaacagaccctta 10618770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 39871410 - 39871251
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  39871410 ataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 39871311  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
     ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39871310 tagagcttttttg-tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 39871251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 204 - 375
Target Start/End: Original strand, 31688018 - 31688189
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31688018 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 31688117  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31688118 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 31688189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 204 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 41313553 - 41313375
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41313553 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 41313454  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41313453 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagtttataagctataagctaaaagct 41313375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39702452 - 39702271
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  39702452 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 39702353  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||  |||||||||||||    
T  39702352 cagagctttttatgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagttaaaagttcttttttttagtttcccaaacagaccct 39702271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8271052 - 8270892
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  8271052 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaa 8270953  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8270952 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaggtaaaaactaaaagctctttttt 8270892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 41693906 - 41694055
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||    
T  41693906 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaa 41694005  T
Q  336 cagagct---aatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41694006 cagagctaaaaattttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 41694055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 176 - 382
Target Start/End: Original strand, 3427561 - 3427767
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3427561 tataaaggataaaaatgaattttagataaaatattaagggtaaaaatggaagaaatattgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaa 3427660  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  || ||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||| |||||||||    
T  3427661 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaggtcatggtgaaaaagcattaccaaacagagctttttttgtcagacgagcttataacctataagct 3427760  T
Q  376 aaaagct 382  Q
    | |||||    
T  3427761 ataagct 3427767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 418
Target Start/End: Original strand, 22877925 - 22878107
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     |||||||    
T  22877925 ataagctataagctcaaacgctactgagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaa 22878024  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 418  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  22878025 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaagagctataagctcttttttgggtgttaccaaacagaccctt 22878107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 196 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 32099723 - 32099502
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| |||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32099723 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgt 32099624  T
Q  296 gaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagag-ctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttt 394  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||     || |||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32099623 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacagagattttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctataagctctttt 32099524  T
Q  395 ttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||  | |||||||||||||    
T  32099523 ttgggtgttaccaaacagaccc 32099502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27781248 - 27781102
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  27781248 ataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 27781149  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27781148 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 27781102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 215 - 416
Target Start/End: Original strand, 37587697 - 37587899
Alignment:
Q  215 gtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcg 314  Q
    |||||| || |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37587697 gtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctaaaagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataagctca 37587796  T
Q  315 tggtgaaaagacagtaccaaacagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||||     ||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  37587797 tggtgaaaaagtgttaccaaacagaacttttttttatcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 37587896  T
Q  414 ccc 416  Q
    |||    
T  37587897 ccc 37587899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 201 - 416
Target Start/End: Original strand, 34395311 - 34395528
Alignment:
Q  201 ttaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctg-aaaaatagcttataagctcgtgaaa 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34395311 ttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagttcaaacgctactttgaatagcttctgaaaaaatagcttataagctcgtgaaa 34395410  T
Q  300 taagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagag-ctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgg 398  Q
    |||||||||||||| |||| ||||     || |||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  34395411 taagctataagctcatggtcaaaaagtgttatcaaacagagtttttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttaa 34395510  T
Q  399 ggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||| |||||||||||||    
T  34395511 ggtttaccaaacagaccc 34395528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 37560529 - 37560710
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||     |||||||    
T  37560529 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagttcatgatcaaaaagtgttaccaaa 37560628  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  37560629 cagaactttttttgtgaaacgagcttataagctataagttaagagctaaaagctctttttttgagtttaccaaacagaccct 37560710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 11298041 - 11298222
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |   |||||||    
T  11298041 ataagctataagctcaaacgttatttggaatagcttctgaaaaatatcttataagctcgtgaaataagctataagctgatgatgaaaaaatgttaccaaa 11298140  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    ||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  11298141 cagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctataacctcttttttgggtgttaccaaacagaccct 11298222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 40223084 - 40223263
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      |||||||    
T  40223084 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatag-ttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaa--gtgttaccaaa 40223180  T
Q  336 cagagc--taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    ||||||  |  |||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  40223181 cagagctttttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 40223263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 176 - 382
Target Start/End: Original strand, 29189659 - 29189872
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataag-------ctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  29189659 tataatgggtaaaattggattttagataaaataataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagctgtaagctcaaacgctacttggaatag 29189758  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagct 368  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |  ||| ||||||||||  | | |||||||||| |||||||||    
T  29189759 cttcttaaaaataacatataagctcgtgaaataagctataagctcgtagtaaaaaaccgttactaaacagagcttttcttatcaaacgagtttataagct 29189858  T
Q  369 ataagctaaaagct 382  Q
    |||||||| |||||    
T  29189859 ataagctataagct 29189872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 204 - 323
Target Start/End: Original strand, 36112809 - 36112928
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36112809 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 36112908  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  36112909 ctataagctcatggtgaaaa 36112928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 11741103 - 11741274
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||  |      
T  11741103 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagattctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaa---agtatta-- 11741197  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
         ||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11741198 -----ctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctcttttttgagattaaccaaacagaccct 11741274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24652413 - 24652234
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  24652413 ataagctataagctcaaatgctacttgaaatagcttctaaaaaatggcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaag-tgttaccaaa 24652315  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||| ||   ||  |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  24652314 cagaactttctttgtcaaacgagcttataagctataagataagaggtaaaagctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 24652234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 201 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9211167 - 9210969
Alignment:
Q  201 ttaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9211167 ttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctcaaacgctacttgggatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaat 9211068  T
Q  301 aagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggg 399  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||     || ||||| |||||  |||  |||||| | ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  9211067 aagttataagctcatggtcaaaaagtgttatcaaacggagctttttttgtcaaacaaacttataagctataagctaagaattaaaagctcttttttggg 9210969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 39320066 - 39320212
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  39320066 ataagttataagctcgaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 39320165  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39320166 cagagctttttttgtcaaacgaatttataagctataagctaaaagct 39320212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44157343 - 44157204
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||    
T  44157343 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaa 44157244  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    ||||  |  |||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  44157243 cagaattttttttgtcagacgagcttataagctataagct 44157204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 342
Target Start/End: Original strand, 2642418 - 2642524
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | |||||||    
T  2642418 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaaatattaccaaa 2642517  T
Q  336 cagagct 342  Q
    |||||||    
T  2642518 cagagct 2642524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 369
Target Start/End: Original strand, 35243352 - 35243485
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||    
T  35243352 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaataacttataagctcgtgaaataagatataagctcgtggtgaaaagacatcactaaa 35243451  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagcta 369  Q
    |||||||  ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  35243452 cagagctttttttatcaaacaaatttataagcta 35243485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38780807 - 38780666
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  || |  ||||    
T  38780807 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtaaaataagttataagttcgtggtgaaaaatcattgtcaaa 38780708  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
    |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38780707 cagaactttttttatcaaacgagcttataagctataagctaa 38780666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 211 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2855253 - 2855090
Alignment:
Q  211 aagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataag 310  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2855253 aagggtaaagatggaggaaaaaataataagctataagctcaaacgctacttgaaataacttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataag 2855154  T
Q  311 ctcgtggtgaaaaga-cagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||| || ||| || | ||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  2855153 ctcgtggt-aagagatcattgccaaacagaacttttttg-tcaaacgaacttataagttataagct 2855090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 36590282 - 36590105
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  36590282 ataagcta-aagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaa 36590184  T
Q  336 cag-agctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    ||| |  |  |||  ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  36590183 cagaatttttttttgtcaaacgagtttataagctataaattaagagctaaaagctcttttttgggtgttaccaaacaga 36590105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 180 - 375
Target Start/End: Original strand, 43849144 - 43849346
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataa-------gctataagctcaaacgctacttggaatagcttc 272  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43849144 aagggtaaacatgggttttggttaaagtggtaagggtataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagcatc 43849243  T
Q  273 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataa 372  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||     ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  43849244 tgaaaaatagcttataagctcataaaataagctataagctcgttgtaaaaaattgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagttataa 43849343  T
Q  373 gct 375  Q
    |||    
T  43849344 gct 43849346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7378994 - 7378848
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |  |||||||    
T  7378994 ataagctataagctcaaacactacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaa 7378895  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  7378894 cagagcttcttttgtcagacgaacttataagctataaactataagct 7378848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3511364 - 3511224
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||  || |||||||    
T  3511364 ataagctataagttcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctacaagctcatggctaaaaagcattaccaaa 3511265  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagcta 376  Q
    | ||| |  |||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3511264 ctgagtttttttcgtcagacgaacttataagctataagcta 3511224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 169 - 370
Target Start/End: Original strand, 1363725 - 1363926
Alignment:
Q  169 tttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||  |||||  |||||| |||||| |||||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  1363725 tttaatttaaaaaggataaaaatgtattttagataaaataataaggataaaatggaaagaaaaaatgttaagctataagttcaaacgctacttagaatag 1363824  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagct 368  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | | |||||||||||  |  |||  |||||| ||||||||||||    
T  1363825 cgtctgaataatagcttataaactcgtgaaataagttataagctcatggtaaaaaaatattaccaaacagaaattttttagtcaaacaagcttataagct 1363924  T
Q  369 at 370  Q
    ||    
T  1363925 at 1363926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 296
Target Start/End: Original strand, 42203371 - 42203463
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42203371 aaataataagggtaaaattggaagaaaatgtgagaagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 42203463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 375
Target Start/End: Original strand, 8436461 - 8436663
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataa-------gctataagctcaaacgctacttggaatagcttc 272  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||       |||||||| ||||||| || ||| |||||| ||    
T  8436461 aagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaagggtataaatggaataaaacatgataagctataagctataagttcaaacgatatttgtaatagcatc 8436560  T
Q  273 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataa 372  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||  |  || ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8436561 tgaaaaataacttataagctcataaaataagctataagttcgttgtaaaaaatcgttatcaaacagagttttttttatcaaacgagcttataagctataa 8436660  T
Q  373 gct 375  Q
    |||    
T  8436661 gct 8436663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 39677561 - 39677442
Alignment:
Q  184 gtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaa 276  Q
    |||||| ||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39677561 gtaaaattggtttttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttttgaa 39677462  T
Q  277 aaatagcttataagctcgtg 296  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39677461 aaatagcttataagctcgtg 39677442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Original strand, 9370316 - 9370397
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat-aagctataagctcgtg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9370316 ataagctataagctcaaacgctacttgaaataacttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaagttataagctcgtg 9370397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22957455 - 22957368
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22957455 ataaactataaactcaaacactacttagaatagcttctgaaaaataacttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtaaaaa 22957368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44263453 - 44263388
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44263453 ataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaata 44263388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40045613 - 40045409
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    |||||||||||||  ||| ||| || |||||| || ||||||||| |||||||||| || |       |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40045613 tataaagggtaaatatggatttcaaataaaataatgagggtaaaattggaagaaaaaataaaaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatag 40045514  T
Q  269 cttctgaaaaat-agcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacag-taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataag 366  Q
    | |||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| |||  |||  ||  | |||||||||||    
T  40045513 cgtctgaaaaataagcttataagctagt-aaaaaagctataagctcttgatgaaaa-acagttaccaaacagggcttttttagtcctatgagcttataag 40045416  T
Q  367 ctataag 373  Q
    |||||||    
T  40045415 ctataag 40045409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40551954 - 40551868
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  40551954 ataaactataagctcaaacgctatctgaaatagcttctgaaaaatagc-tataagctcatgaaataagctataaactcatggtgaaaa 40551868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16831699 - 16831500
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    |||||||||||| | |||  |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||        |||||||    
T  16831699 ataagggtaaaactagaattaaaagtgagaagttataagctcaaacgctacttaaaatagcttatgaaaaatagcttataaactc--------agctata 16831608  T
Q  309 agctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaa 408  Q
    ||||| |||||||||     |||||||| || ||  |||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||  | |||||    
T  16831607 agctcatggtgaaaaagtgttaccaaactgaactttttttgtcaaacgaacttataagctataagttaagagctaaaaactctttttttggtgttaccaa 16831508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 236 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13888387 - 13888326
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13888387 ataagctataagcttaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtga 13888326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14649302 - 14649142
Alignment:
Q  217 aaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtg 316  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||| |||| ||   ||||||||||  ||||||| ||||  |||||     
T  14649302 aaaaatagaacaaaagataataagctataagttcaaacgctatttgaaataacgtctaaaaactaagctataagctcgcaaaataagttataccctcgtt 14649203  T
Q  317 gtgaaaagacag-taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagcta 376  Q
     ||||||||| | |||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14649202 atgaaaagactgttaccaaactgggcttttttcatcaaacgagcttataagctataagcta 14649142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26293901 - 26293837
Alignment:
Q  248 ctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 312  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  26293901 ctcaaacgctacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataaatttgtgaaataagctataagct 26293837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26307158 - 26307094
Alignment:
Q  248 ctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 312  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  26307158 ctcaaacgctacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataaatttgtgaaataagctataagct 26307094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 323
Target Start/End: Original strand, 26036984 - 26037067
Alignment:
Q  240 gctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  26036984 gctataaactcaaacgcaacttggaataacatctgaaaaataacttataaactcatgaaataaactataaactcgtggtaaaaa 26037067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 382
Target Start/End: Original strand, 2732313 - 2732496
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga----aa 299  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||| |||| | |||||||||||  | |||| || || |    ||    
T  2732313 aaataataagggtaaaaatggaataaaagatgataagatataagttcaaacaccacttgaaataacgtctgaaaaataagtaataaacttgtaaaattaa 2732412  T
Q  300 taagctataagctcgtggtgaaaagacag-taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| | || |||||||   || |||  |||||| | ||||||| ||||| ||||||||||    
T  2732413 taagttataagttcgtggtgaaaagaccgttatcaaacaggattatttttgtcaaacaaacttataaactatacgctaaaagct 2732496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 281
Target Start/End: Original strand, 37801089 - 37801175
Alignment:
Q  195 ttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaata 281  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||| | |||||||||    
T  37801089 ttttagttaaaataataagggtagaaatggaataaaagatgataagttataagttcaaacactgcttgtaatagcgtatgaaaaata 37801175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14171767 - 14171683
Alignment:
Q  177 ataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctactt 261  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||  |||||| |||| | ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14171767 ataaagggtgaaaatggattttagataaaataataaagataaaaatagaataaaaaatgataagctataagctcaaacgctactt 14171683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 44318371 - 44318316
Alignment:
Q  241 ctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44318371 ctataagctcaaatgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataagctcgtg 44318316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10651171 - 10651115
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10651171 ataagctataaactcaaacgctacttaaaattgcttctaaaaaatagcttataagct 10651115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18411030 - 18410884
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||| || |  || |||| || ||||| |||||| ||||| || | ||| |||||| | ||     
T  18411030 tataaagggtaaacatgagttttagttaaaatggtaagggtagaagtaaaataaaaaattataagttataaggtcaaatgccatttgaaatagcatatgg 18410931  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaa 322  Q
    ||||||   |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||    
T  18410930 aaaataagctataagctcgtgaaattaaatataagctcgtgatgaaa 18410884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 5320480 - 5320520
Alignment:
Q  186 aaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaa 226  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5320480 aaaagtgggttttagttaaaataataagggtaaaaatggaa 5320520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 417
Target Start/End: Original strand, 31688185 - 31688217
Alignment:
Q  385 aagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31688185 aagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 31688217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 297
Target Start/End: Original strand, 2773529 - 2773586
Alignment:
Q  239 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 297  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  2773529 agctataagctaaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaaaag-ttataagctcgtga 2773586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35151085 - 35151040
Alignment:
Q  295 tgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagag 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  35151085 tgaaataagttataagctcgtggtgaaaaaatattaccaaacagag 35151040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 247
Target Start/End: Original strand, 7117753 - 7117805
Alignment:
Q  195 ttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataag 247  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||    
T  7117753 ttttagttaaaataataagggtaaaggtagaagaaaaggtgataagctataag 7117805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 29725924 - 29725884
Alignment:
Q  239 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  29725924 agctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 29725884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 41123817 - 41123769
Alignment:
Q  233 atgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaata 281  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||    
T  41123817 atgataagttataagctcaaatgctatttgaaatagcgtctgaaaaata 41123769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 44263105 - 44262989
Alignment:
Q  300 taagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggg 399  Q
    |||||||||||||||| || ||||  |  |||||||||||| |  |||  ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||  |||||||     
T  44263105 taagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaacagagttttttttgtcagacgagcttataaactatcagctataagctataagcttctttttgga 44263006  T
Q  400 gttaaccaaacagaccc 416  Q
      | |||||||||||||    
T  44263005 tgttaccaaacagaccc 44262989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 45152179 - 45152131
Alignment:
Q  210 taagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgcta 258  Q
    |||||| |||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||    
T  45152179 taagggaaaaaatggaagaaaaagtggtaagttataagctcaaacgcta 45152131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 113)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 53 - 382
Target Start/End: Original strand, 44947029 - 44947352
Alignment:
Q  53 atttgaagagtactcgagtagttgagttgtactaattaaattggaagtatataggaaccagaaacgtaggaacnnnnnnntatagagggaaaacatagaa 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||                |||||||||||    
T  44947029 atttgaagagtactcgagtagttgagttgtactaattaaattggaagtatataggaactggaaacgtaggaacaaa-------------aaaacatagaa 44947115  T
Q  153 aacgtaataaatgtgttttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataa-------gctata 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  44947116 aacgtaataaatgtgttttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctata 44947215  T
Q  246 agctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaat 345  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  44947216 agctcaaacactgcttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctttt 44947315  T
Q  346 ttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44947316 tttatcaaacgagcttataagctataagctataagct 44947352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 26541107 - 26540924
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  26541107 ataagctgtaagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 26541008  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26541007 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 26540924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 16127144 - 16127325
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  16127144 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 16127243  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16127244 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaatcagaccct 16127325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Original strand, 29081286 - 29081463
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  29081286 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 29081385  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29081386 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 29081463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 236 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 44845771 - 44845589
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  44845771 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 44845672  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 418  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44845671 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaaactcttttttgaggttaaccaaacagaccctt 44845589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 204 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 8873052 - 8872840
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8873052 aaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 8872953  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||   | ||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  8872952 ctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacatagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggttt 8872853  T
Q  404 accaaacagaccc 416  Q
     ||||||||||||    
T  8872852 cccaaacagaccc 8872840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 42217870 - 42217662
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42217870 tataaagggtaaacatggattttaattaaaataataagggtaaaaatgagataaaatatgagaagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctga 42217771  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42217770 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagct 42217671  T
Q  376 aaaagctaa 384  Q
    | |||||||    
T  42217670 ataagctaa 42217662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 19948323 - 19948504
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  19948323 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaa 19948422  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19948423 cagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagctagaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 19948504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 37088431 - 37088250
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||    
T  37088431 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaa 37088332  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  37088331 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttcccaaaaagaccct 37088250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 156 - 389
Target Start/End: Original strand, 37489850 - 37490082
Alignment:
Q  156 gtaataaatgtgttttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacg 255  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  37489850 gtaataaaggtgttttaatatttaaaggttaaa-gttggttttaattaaaatgataagggttaaaatggaagaaaaaatgagaagctataagctcaaacg 37489948  T
Q  256 ctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaac 355  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  || |||| ||||||  |||  ||||||    
T  37489949 ctacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtggaaaatctttaacaaatagagctttttttgtcaaac 37490048  T
Q  356 gagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 389  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  37490049 aagcttataagctatcagctataagctataagct 37490082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 2579932 - 2580112
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  2579932 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 2580031  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  |||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2580032 cagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataaactaaaagctaaaagctcttttttagggttaaccaaacagaccc 2580112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 204 - 420
Target Start/End: Original strand, 40479994 - 40480210
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40479994 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtaaaataag 40480093  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||      
T  40480094 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcatttttgaggtgt 40480193  T
Q  404 accaaacagacccttag 420  Q
    |||||||||| ||||||    
T  40480194 accaaacagagccttag 40480210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 204 - 399
Target Start/End: Original strand, 46247937 - 46248132
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46247937 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 46248036  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggg 399  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46248037 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctcttttttggg 46248132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 204 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 21707330 - 21707125
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707330 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaaagctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 21707231  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||| ||| |||||||||     ||||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707230 ctataatctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgttaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttggggtta 21707131  T
Q  404 accaaa 409  Q
    ||||||    
T  21707130 accaaa 21707125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Original strand, 37528728 - 37528913
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  37528728 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 37528827  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  37528828 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagttaaaagctttttttttgggtttcccaaacagacccttagt 37528913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Original strand, 40563368 - 40563545
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  40563368 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 40563467  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  40563468 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctactttttggggataaccaaacaga 40563545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 204 - 417
Target Start/End: Original strand, 44748759 - 44748971
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748759 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 44748858  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  44748859 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacaagtttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-tggttt 44748957  T
Q  404 accaaacagaccct 417  Q
     |||||||||||||    
T  44748958 cccaaacagaccct 44748971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 28676895 - 28677075
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  28676895 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 28676994  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||    
T  28676995 cagagctttttttttcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttagggtttcccaaacataccc 28677075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 38185917 - 38185738
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  38185917 ataagctataagttcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 38185818  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38185817 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-aggttaaccaaacagaccc 38185738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 50499909 - 50499727
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||     |||||||    
T  50499909 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagcttatggtgaaaaagtgttaccaaa 50499810  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    || | ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50499809 caaaactttttttatcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagctctttttt-gggttaaccaaacagaccctta 50499727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 178 - 368
Target Start/End: Original strand, 33897840 - 33898030
Alignment:
Q  178 taaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaa 277  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33897840 taaagggtaaaaatggattttagataaaataataagggtacaataggaagaaaaaatgataagttataagttcaaacgctatttggaatagcgtctgaaa 33897939  T
Q  278 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagct 368  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  33897940 aatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacattaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagct 33898030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 35499748 - 35499568
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  35499748 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 35499649  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    ||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||    
T  35499648 cagagatttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct-tttttttgggtttcccaaacagaccct 35499568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 415
Target Start/End: Original strand, 24536559 - 24536738
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  24536559 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 24536658  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacc 415  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  24536659 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctctaagctaagagctaaaagctcttttttggagtttccgaaacagacc 24536738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 52858043 - 52857860
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  52858043 ataagctataagctcaaacgatacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaa 52857944  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  52857943 cagagctttttttgtaaaacgagcttataagctataaactaagagctaaaagctctttttttgggtttaccaaacagaccctta 52857860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 196 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2598782 - 2598608
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  2598782 tttaattaaactaataagggtaaaaatagaataaaagatcataagttataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagcttgt 2598683  T
Q  296 gaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctat 370  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2598682 gaaataagctataagtttgtggtgaaaaaacattaccaaacagagtttttttgatcaaacgagcttataagctat 2598608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 204 - 382
Target Start/End: Original strand, 37713938 - 37714116
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37713938 aaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 37714037  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37714038 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 37714116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 204 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 43525922 - 43525744
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43525922 aaataataaaggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 43525823  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43525822 ctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaacagagctttttttgtcaaatgagcttataagctataagctaaaagct 43525744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 418
Target Start/End: Original strand, 47897611 - 47897793
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     ||| |||    
T  47897611 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttactaaa 47897710  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 418  Q
    |||||||  |||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47897711 cagagctttttttgtcaaatgagtttataagctataaactaaaaggtaaaagctcttttttgcggttaaccaaacataccctt 47897793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 45345013 - 45345193
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  45345013 ataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 45345112  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  45345113 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaaactctttttt-tggtttcccaaacagaccct 45345193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25570526 - 25570366
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  25570526 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 25570427  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25570426 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 25570366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 38891991 - 38892170
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||    
T  38891991 ataagctataagctcaaatgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttataggctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaa 38892090  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  38892091 cagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagctctttttt-agattaaccaaacagaccc 38892170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 180 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 193600 - 193398
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  193600 aagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaagggtataaatggaataaaacatgataagctataagctcaaacgctacttgtaatagcatctgaaaaa 193501  T
Q  280 tagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaa 379  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||     ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  193500 tagcttataagctcataaaataagctataagctcgttgtaaaaaattgttaccaaacagagctatttttgtcaaacgagcttataagctataagctataa 193401  T
Q  380 gct 382  Q
    |||    
T  193400 gct 193398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 29718206 - 29718386
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    |||||||    
T  29718206 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgatgaaaag-tgttaccaaa 29718304  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||    
T  29718305 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaaactaaaagcttttttttttggtttcccaaacagaccct 29718386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 52166095 - 52166276
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     | |||||    
T  52166095 ataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttgccaaa 52166194  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    ||||| |  |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  52166195 cagagatttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgggtttaccaaacagaccct 52166276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 196 - 399
Target Start/End: Original strand, 46318724 - 46318928
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| ||||   |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46318724 tttagttagaataataagggtaaaattggagttaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 46318823  T
Q  296 gaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttt 394  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||     || |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  46318824 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacagagcttttttttatcaaacgagcttataagctataagctaagagataaaagctctttt 46318923  T
Q  395 ttggg 399  Q
    |||||    
T  46318924 ttggg 46318928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4240425 - 4240279
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  4240425 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 4240326  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4240325 cagagctttttttatcaaacgagcttataagttataagctaaaagct 4240279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Original strand, 54672185 - 54672344
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     || ||||    
T  54672185 ataaggtataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaa 54672284  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54672285 cagagct-tttttctcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctctttttt 54672344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 238 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 48378371 - 48378192
Alignment:
Q  238 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaaca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |   |||||||||    
T  48378371 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctatagactcgtggtgaaaaaatgttaccaaaca 48378272  T
Q  338 gagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    ||  |  |||  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||    
T  48378271 gatttttttttgtcaaatgagcttataagctataagctaagaggtaaaagctcttttttgggtgttaccaaagagaccct 48378192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 52795042 - 52794896
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     |||||||    
T  52795042 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggggaaaaagtgttaccaaa 52794943  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52794942 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 52794896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 204 - 382
Target Start/End: Original strand, 54541908 - 54542086
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54541908 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaaattataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 54542007  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||||| ||||||||| |   ||||||||| | ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54542008 ctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaacaaaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 54542086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 46972180 - 46972000
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  46972180 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaa 46972081  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    || |  |  |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  46972080 cataaatttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgagtttaccaaacagaccc 46972000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 48943168 - 48942992
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48943168 aaataataaggataaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 48943069  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||||| |||| ||||     |||||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48943068 ctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacaga--tttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 48942992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 196 - 382
Target Start/End: Original strand, 55305067 - 55305260
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 288  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||  |||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55305067 tttaaataaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttata 55305166  T
Q  289 agctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55305167 agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 55305260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 45368757 - 45368572
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||  |  |||||||    
T  45368757 ataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctataagcttgttgtaaaaaagcgttaccaaa 45368658  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    |||||||  |||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  45368657 cagagctttttttgtcagacgagcttataagctatcagctataagctataagctcctttttgggtgttaccaaacagacccttagt 45368572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Original strand, 50317034 - 50317209
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     | |||||    
T  50317034 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttgccaaa 50317133  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50317134 cagaactttttttatcaaacgagcttataagctat-------aagttaaaagctctttttt-gggttaaccaaacagaccctta 50317209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 176 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 39719560 - 39719361
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||      
T  39719560 tataatgggtaaaattggattttagataaaataataagggtaaaaatggaagaaaagataaaaagctataaactcaaacgctatttggaatagcttcttc 39719461  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||  || |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39719460 ataataacttataagctcgtgaaataagctataagcttgttgt-aaaaaacgttatcaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 39719362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33392097 - 33391869
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 288  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  |||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33392097 tttaattgaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgaaaaactataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 33391998  T
Q  289 agctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagc 388  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||     ||||||||||| ||  |||  |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |    
T  33391997 agctcatgaaataaactataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgaacttataagctctaagttaagagctaaaaac 33391898  T
Q  389 tcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  33391897 tcttttttgggtgttaccaaacagaccct 33391869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 176 - 382
Target Start/End: Original strand, 52595279 - 52595485
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52595279 tataaaggataaaaatggattttagataaaatattaagggtaaaaatggaagaaattttgagaagttataagctccaacgctacttggaatagcttctga 52595378  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  52595379 aaaatagcttataatcttgtgaaataagctataaactcatggtgaaaaaacattaccaaacataactttttttgtcagacgagcttataagctataagtt 52595478  T
Q  376 aaaagct 382  Q
    | |||||    
T  52595479 ataagct 52595485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 53779178 - 53779032
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  53779178 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 53779079  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||| ||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53779078 cagaactttttttgtcaaacgagcttataagctaaaagctaaaagct 53779032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 12063733 - 12063913
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||     |||||||    
T  12063733 ataagatataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagcttatggtcaaaaagtgttaccaaa 12063832  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    ||||  |  |||  |||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12063833 cagaattttttttgtcaaacaagtttataagctataaactaagagctaaaagctcttttttggagtttaccaaacagaccc 12063913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 30864573 - 30864414
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     |||||||    
T  30864573 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctaatggtgaaaaagtgttaccaaa 30864474  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    ||||  |  |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30864473 cagaattttttttgtcaaac-agcttataagctataaactaaaagttaaaagctctttttt 30864414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Original strand, 49853048 - 49853208
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  49853048 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 49853147  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
     | |||   |||  |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  49853148 gatagccttttttgtcaaacgagcttataagctataaggtaagagttaaaagctctttttt 49853208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 196 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39876801 - 39876622
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39876801 tttagttagaataataagggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 39876702  T
Q  296 gaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||     || |||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  39876701 gaaataagctataagctcatgatgaaaaagtgttatcaaacagagcttttttagtcaaacgaacttataagctataagct 39876622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 196 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41246436 - 41246257
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41246436 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 41246337  T
Q  296 gaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||     ||||||| ||| ||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41246336 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaatagaactttttttgtcaaacgagtttataagctataagct 41246257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 377
Target Start/End: Original strand, 24628204 - 24628345
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||    
T  24628204 ataagctataagttcaaatgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaa 24628303  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628304 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaa 24628345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2121974 - 2121795
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     || ||||    
T  2121974 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaa 2121875  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  |||| |||||| |   |||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  2121874 cagagcttttttg-tcaaacaaatctataagctataacctaagatctataagctcttttttaggtattaccaaacagaccc 2121795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 277 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 41785915 - 41785775
Alignment:
Q  277 aaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagcta 376  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   | || |||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  41785915 aaatagcctataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattatcaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagtta 41785816  T
Q  377 aaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41785815 aaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 41785775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 176 - 377
Target Start/End: Original strand, 32026347 - 32026555
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctata-------agctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    ||||||||||||||| || |||||  ||||||  |||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  32026347 tataaagggtaaaaggggattttagataaaatagtaagggcaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagttataagctcaaacgctacttggaatag 32026446  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagct 368  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  || || |||||||||||  |||  || ||||| ||||||||||    
T  32026447 catctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataaactataagctcgtggtgaaaaaccattatcaaacagagctttttttgtcgaacgaacttataagct 32026546  T
Q  369 ataagctaa 377  Q
    |||||||||    
T  32026547 ataagctaa 32026555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 377
Target Start/End: Original strand, 46627502 - 46627644
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||    
T  46627502 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaattagcttataacctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaa 46627601  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
    |||| | |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46627602 cagaacttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaa 46627644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2851964 - 2851831
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  2851964 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 2851865  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagcta 369  Q
    |||| ||  |||  |||||||| |||||||||||    
T  2851864 cagaactttttttgtcaaacgaacttataagcta 2851831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 263 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 47173688 - 47173555
Alignment:
Q  263 gaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagctta 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  || |||||||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  47173688 gaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagcgttatcaaacagaactttttttatcaaacgagctta 47173589  T
Q  363 taagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  47173588 taacctataagctaagagctataagctctttttt 47173555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21603945 - 21603858
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21603945 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaagtagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa 21603858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 399
Target Start/End: Original strand, 42465032 - 42465195
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||| |   |||||||    
T  42465032 ataagctataatctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataaacttgtgaaataagctataagctcatgccgaaaaaatgttaccaaa 42465131  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggg 399  Q
    || |  |  |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  42465132 cataattttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaagagctataagctcttttttggg 42465195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 51003394 - 51003303
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagaca 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51003394 ataagctataagctcaaacgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagaca 51003303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 52225432 - 52225286
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  52225432 ataagctataagctcaaacgctactttgaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaa 52225333  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||| ||  | |  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  52225332 cagaacttttgttgtcaaacgagcttataagctatgagctataagct 52225286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 41518508 - 41518327
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||  |  |||||||    
T  41518508 ataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagtttataagctcttgaaataagctataagctcattgtaaaaaagcgttaccaaa 41518409  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
     | ||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||  | | ||||||||||||    
T  41518408 gaaagctttttttatcagacgagcttataagctatcagctataaactataagctcttttttaggtgttatcaaacagaccct 41518327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 20450672 - 20450428
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagct-------caaacgctacttggaatag 268  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||| |||||    
T  20450672 tataaagggtaaatataagttttaattaaaataataagggtagaaatggaataaaagatgataaactataagttataagcacaaacgctacttgcaatag 20450573  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacag-taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagc 367  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||| || | ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||    
T  20450572 cgtctgaaaaataacttataagctcgtgaaataagttataaacttgttgt-aaaaaactgttaccaaacagagctttttttgtcagacgagcttataagc 20450474  T
Q  368 tataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||  |||| |||||| |||||| ||||| ||| |  |||||||||    
T  20450473 tatccgctataagctataagctcgttttttgggcttgccaaacaga 20450428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 42497141 - 42497054
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  42497141 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatgatgaaaa 42497054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 51709158 - 51709071
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  51709158 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaa 51709071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 237 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30548890 - 30548804
Alignment:
Q  237 taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30548890 taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaa 30548804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 278 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 44545335 - 44545194
Alignment:
Q  278 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     ||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44545335 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaa 44545236  T
Q  378 aagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttag 420  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  44545235 aagctaaaagctctttttt-tggtttcccaaacagacccttag 44545194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 318
Target Start/End: Original strand, 52868128 - 52868266
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    |||||||||| |||  || || |||||| | |||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  52868128 aagggtaaaactggtattcaaataaaataacaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagttataagctcaaacactacttgaaatagcttctcaaaaa 52868227  T
Q  280 tagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52868228 tagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggt 52868266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 196 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 35100368 - 35100175
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  35100368 tttagttagaataataagggtaaaattggaattaaaaatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaat--------ggctcgt 35100277  T
Q  296 gaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagc--taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttt 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||| | |  |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  35100276 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaaaactttttttttatcaaacgagcttataagctataagctaagaactaaaagcttttt 35100177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Original strand, 45693391 - 45693471
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  45693391 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagttcgtgaaataagctataagttcgtg 45693471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 196 - 384
Target Start/End: Original strand, 30814215 - 30814403
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||| ||| ||| ||||| |||||| |||||  |||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||    
T  30814215 tttagttagaataataagagtaaaattggaattaaaagtgaaaagttataagttcaaacgctacttggaatagtttccgaaaaatatcttataaactcgt 30814314  T
Q  296 gaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 384  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||| | ||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30814315 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaaaactttttttgtcaaacgagcttaaaagctataagctataagctaa 30814403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 278 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 39470018 - 39469887
Alignment:
Q  278 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39470018 aatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttttttggtcaaacgagcttataagctataagctaa 39469919  T
Q  378 aagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |       ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39469918 a-------agctcttttttagggttaaccaaacagaccc 39469887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 236 - 370
Target Start/End: Original strand, 29203032 - 29203166
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  |  |||||||    
T  29203032 ataagctataagctcaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcgttgtaaaaaaccgttaccaaa 29203131  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctat 370  Q
    ||||| |  |||  ||| |||| ||||||||||||    
T  29203132 cagagttttttttgtcagacgaacttataagctat 29203166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 236 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7041208 - 7041074
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |  |||||||    
T  7041208 ataaactataagcttaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaa 7041109  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctat 370  Q
    |||| ||  |||  ||| |||| ||||||||||||    
T  7041108 cagaactttttttgtcagacgaacttataagctat 7041074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Original strand, 37713077 - 37713285
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctata---------agctcaaacgctacttggaat 266  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||| ||||    
T  37713077 tataatgggtaaaa-tggattttagataaattaataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagttatataagctcaaacgctacttagaat 37713175  T
Q  267 agcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtac-caaacagagctaatttgatcaaacgagcttataa 365  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||  |  ||| |||||||||||  |||  ||||||||| ||||||    
T  37713176 aacttcttaaaaatagtttataagctcgtaaaataaactataagctcgttgtaaaaaaccgttactcaaacagagctttttttgtcaaacgagtttataa 37713275  T
Q  366 gctataagct 375  Q
    || |||||||    
T  37713276 gccataagct 37713285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 204 - 292
Target Start/End: Original strand, 52931118 - 52931206
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 292  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52931118 aaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagcttaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataacttataagct 52931206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 249
Target Start/End: Original strand, 44810857 - 44810956
Alignment:
Q  150 gaaaacgtaataaatgtgttttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagct 249  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| || ||||| || |||||    
T  44810857 gaaaacgtaatgagtgtgttttaatatataaagggtaaaggtgggttttaattaaaattataagcgtaaaattggaataaaaaattataagttaaaagct 44810956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5506839 - 5506704
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttc 272  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||  ||    
T  5506839 aagggtaaacatggattttagttaaagtggtaagggtataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatc 5506740  T
Q  273 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5506739 tgaaaaatagcttataagctcataaaataagctata 5506704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 350 - 420
Target Start/End: Original strand, 28394173 - 28394243
Alignment:
Q  350 tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttag 420  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  28394173 tcaaacgagcttataagttataaggtaaaagctaaaagctcttttttggggttaattaaacagactcttag 28394243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25146523 - 25146380
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaag-aaaag------atgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttc 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||      || ||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| ||    
T  25146523 aagggtaaaagtggattttaattaaaatagtaagggtaaaaatggaattaaaagtgaaaaattataagttataagttcaaacgttacttgaaatagcgtc 25146424  T
Q  273 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtg 316  Q
     ||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  25146423 agaaaaataagttataagttggtgaaataagttataagctcgtg 25146380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 359 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 889736 - 889679
Alignment:
Q  359 cttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  889736 cttataagctataagctaaaagctaaaagctct-ttttagggttaaccaaacagaccct 889679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 350 - 411
Target Start/End: Original strand, 24536808 - 24536869
Alignment:
Q  350 tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaaca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  24536808 tcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttggagtttcccaaaca 24536869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27446574 - 27446501
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 309  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27446574 ataagttataaactcagacgctatttgaaatagcttctgaaaaatagcatataaactcgtgaaataagctataa 27446501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 323
Target Start/End: Original strand, 24350282 - 24350357
Alignment:
Q  248 ctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24350282 ctcaaacgctaattgaaacagcgtctgaaaaataatttataaactcgtgaaataaactataagctcgtggtgaaaa 24350357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 52363075 - 52363008
Alignment:
Q  350 tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||    
T  52363075 tcaaacaagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttttagtttcccaaacagaccct 52363008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 612226 - 612120
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | || ||||||  |||||||||  | ||| || |||||    
T  612226 ataaaggtaaaaatgggacaaaagattataagctataagctcaaacgctacttgaaatggcgtatggaaaataagttataagcttctaaaagaaactata 612127  T
Q  309 agctcgt 315  Q
    |||||||    
T  612126 agctcgt 612120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Original strand, 32982921 - 32982986
Alignment:
Q  240 gctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagct 305  Q
    ||||||||||||| |  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32982921 gctataagctcaagcattacttgaaatagcttccgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagct 32982986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22257800 - 22257721
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    |||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  22257800 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcatttgaaaaataagcaataagcttatgaaataagctataaggtcgt 22257721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 323
Target Start/End: Original strand, 43740325 - 43740370
Alignment:
Q  278 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43740325 aatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtgaaaa 43740370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 52788730 - 52788677
Alignment:
Q  329 taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52788730 taccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 52788677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 51950410 - 51950322
Alignment:
Q  329 taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || ||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  51950410 taccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagttataagctaagagcgataaactcttttttaggtattaccaaacagaccct 51950322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 368 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 53779053 - 53779002
Alignment:
Q  368 tataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  53779053 tataagctaaaagctaaaagctctttttttaggtttcccaaacagaccctta 53779002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5505905 - 5505852
Alignment:
Q  329 taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5505905 taccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagct 5505852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 325
Target Start/End: Original strand, 9338785 - 9338860
Alignment:
Q  250 caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaga 325  Q
    ||||| ||||||| |||||| | | |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9338785 caaacactacttgaaatagcatttaaaaaataagttataagcttatgaaataagctataagctcgttgtaaaaaga 9338860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 279
Target Start/End: Original strand, 34785801 - 34785864
Alignment:
Q  216 taaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    ||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||    
T  34785801 taaaattggaagaaaataggaaaagctataagctcaaaagctacttgaaatagcatctcaaaaa 34785864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 39470046 - 39470011
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39470046 ataagctataaactcaaacgctacttggaatagctt 39470011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 299
Target Start/End: Original strand, 43359249 - 43359307
Alignment:
Q  240 gctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 299  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  43359249 gctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaaaagc-tataagctagtgaaa 43359307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 55118633 - 55118562
Alignment:
Q  210 taagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaata 281  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||    
T  55118633 taagggtaaaagtggaagaaaaaacaatatgctataaactcaaacgctacttaaaatagcgtctgtaaaata 55118562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13285982 - 13285952
Alignment:
Q  345 tttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13285982 tttgatcaaacgagcttataagctataagct 13285952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 48943003 - 48942961
Alignment:
Q  378 aagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttag 420  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  48943003 aagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagacccttag 48942961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 51980884 - 51980820
Alignment:
Q  239 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagct 305  Q
    ||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  51980884 agctataagttaaaaagctacttgaaatagcttctgaaaaa-agc-tataagctcgtgaaaaaagct 51980820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 382
Target Start/End: Original strand, 2187295 - 2187347
Alignment:
Q  329 taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2187295 taccaaacaaagcttttttg-tcaaacgagcttataggctataagctaaaagct 2187347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41538492 - 41538451
Alignment:
Q  202 taaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagcta 243  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  41538492 taaaataataagggtaaaattggaagaaaaaatgataagcta 41538451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22978231 - 22978191
Alignment:
Q  239 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  22978231 agctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 22978191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 350 - 382
Target Start/End: Original strand, 31558317 - 31558349
Alignment:
Q  350 tcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31558317 tcaaacgagcttataagctataagctcaaagct 31558349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41888961 - 41888921
Alignment:
Q  239 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  41888961 agctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 41888921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 48747585 - 48747517
Alignment:
Q  211 aagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    |||| ||||| |||||||||| || | |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  48747585 aaggttaaaattggaagaaaatataaaaagctataagcttaaaagctacttgaattagcttctcaaaaa 48747517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 279
Target Start/End: Original strand, 50938181 - 50938221
Alignment:
Q  239 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  50938181 agctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 50938221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 378 - 422
Target Start/End: Original strand, 54542075 - 54542119
Alignment:
Q  378 aagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagtg 422  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  54542075 aagctaaaagctcttttttagggtttcccaaacaaacccttagtg 54542119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 98)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 382
Target Start/End: Original strand, 7780972 - 7781295
Alignment:
Q  53 atttgaagagtactcgagtagttgagttgtactaattaaattggaagtatataggaaccagaaacgtaggaacnnnnnnntatagagggaaaacatagaa 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||                |||||||||||    
T  7780972 atttgaagagtactcgagtagttgagttgtactaattaaattggaagtatatagaaactggaaacgtaggaacaaa-------------aaaacatagaa 7781058  T
Q  153 aacgtaataaatgtgttttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataa-------gctata 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  7781059 aacgtaataaatgtgttttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatgaaagaaaagatgataagctataagctata 7781158  T
Q  246 agctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaat 345  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7781159 agctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctttt 7781258  T
Q  346 ttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7781259 tttatcaaacgagcttataagctataagctataagct 7781295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 204 - 419
Target Start/End: Original strand, 13121537 - 13121751
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121537 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 13121636  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13121637 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc-tttttggggtta 13121735  T
Q  404 accaaacagaccctta 419  Q
    ||||||||||||||||    
T  13121736 accaaacagaccctta 13121751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 204 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 17046911 - 17046699
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046911 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 17046812  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046811 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaaagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 17046712  T
Q  404 accaaacagaccc 416  Q
    |||||||||||||    
T  17046711 accaaacagaccc 17046699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 204 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 39826782 - 39826567
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39826782 aaataataagggtaaaattggaagaaaatgtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 39826683  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39826682 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttatggggtta 39826583  T
Q  404 accaaacagaccctta 419  Q
    ||||| ||||||||||    
T  39826582 accaatcagaccctta 39826567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 236 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 33524678 - 33524487
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  33524678 ataaactataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 33524579  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagtgttttt 427  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33524578 cagagctttttttatcaaacaagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccaaagtgttttt 33524487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 204 - 418
Target Start/End: Original strand, 47134484 - 47134697
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47134484 aaataataagggtaaaattagaagaaaaagtgataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataag 47134583  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47134584 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaggtaaaagctaaaagctctttttt-gggtta 47134682  T
Q  404 accaaacagaccctt 418  Q
    |||||||||||||||    
T  47134683 accaaacagaccctt 47134697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 26204424 - 26204249
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  26204424 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 26204325  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacag 412  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26204324 cagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-gggttaaccaaacag 26204249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 204 - 418
Target Start/End: Original strand, 7710907 - 7711121
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7710907 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 7711006  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| || ||||||     |||||||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  7711007 ctataagctcatgatgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggttt 7711106  T
Q  404 accaaacagaccctt 418  Q
     ||||||||||||||    
T  7711107 cccaaacagaccctt 7711121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2498072 - 2497891
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  2498072 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaa 2497973  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  2497972 cagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagctctattttagggttaactaaacagaccct 2497891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Original strand, 19898893 - 19899070
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  19898893 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 19898992  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||| ||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19898993 cagaactttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 19899070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 44909990 - 44909811
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  44909990 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 44909891  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44909890 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctc-tttttggggttaaccaaacagaccc 44909811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Original strand, 36301090 - 36301265
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     || ||||    
T  36301090 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaa 36301189  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36301190 cagagcttttttg-tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-gggttaaccaaacaga 36301265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Original strand, 32368324 - 32368507
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     |||||||    
T  32368324 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcatataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 32368423  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32368424 cagagctttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaagttaaaagctcttttttagggttaaccaaacagaccctta 32368507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1918175 - 1917999
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  1918175 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 1918076  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  1918075 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctacttttt-gggttaaccaaacaga 1917999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 36838680 - 36838860
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     |||||||    
T  36838680 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggagaaaaagtgttaccaaa 36838779  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  36838780 cagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagaccc 36838860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Original strand, 42064302 - 42064462
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  42064302 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 42064401  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064402 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 42064462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Original strand, 31150410 - 31150592
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||| ||    
T  31150410 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttacccaa 31150509  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  31150510 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct-tttttttgggtttcccaaacagaccctta 31150592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 204 - 382
Target Start/End: Original strand, 38967417 - 38967594
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967417 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 38967516  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967517 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttttttg-tcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 38967594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 30721608 - 30721789
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     |||||||    
T  30721608 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaa 30721707  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  30721708 cagagcttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagaccc 30721789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15313393 - 15313214
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  15313393 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaaaag-tgttaccaaa 15313295  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  15313294 cagagctttttttatcaaacgaacttataagctataagttaaaagctaaaagttctttttttgggtttcccaaacagaccc 15313214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 204 - 416
Target Start/End: Original strand, 18347369 - 18347580
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18347369 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacactacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataag 18347468  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||  |     
T  18347469 ctataagctcgtggtgaaaagacattaccaaacagagcttttttg-tcaaacaaacttataagctataagctataagctataagctcacttttgggtctt 18347567  T
Q  404 accaaacagaccc 416  Q
    | |||||||||||    
T  18347568 atcaaacagaccc 18347580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 29586308 - 29586148
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  29586308 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaa 29586209  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29586208 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 29586148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 204 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 25602168 - 25601973
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25602168 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 25602069  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggg 399  Q
    ||||||| || |||| ||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25602068 ctataaggtcatggtaaaaaagtgataccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataacctataagctaagagctaaaagctcttttttggg 25601973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 17499870 - 17500053
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  17499870 ataagctataagcttaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 17499969  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggg--gttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  17499970 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctctttttttttttgttaaccaaacagaccct 17500053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 34319539 - 34319359
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||     |||||||    
T  34319539 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaggtcatggtcaaaaagtgttaccaaa 34319440  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34319439 cagaactttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgggtttaccaaacagaccc 34319359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 26843901 - 26843718
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | || ||||    
T  26843901 ataagctataaactcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattatcaaa 26843802  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
     ||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||    
T  26843801 tagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctatttttttggattttccaaacagaccctta 26843718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 30774231 - 30774056
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||     |||||||    
T  30774231 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaacttatggtgaaaaagtgttaccaaa 30774132  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    ||||||    || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30774131 cagagc----tttatcaaacgaacttataagctataagttaaaagctaaaagctctttttt-gggttaaccaaacagaccc 30774056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Original strand, 29704069 - 29704246
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     |||||||    
T  29704069 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 29704168  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  29704169 cagagctttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaaattaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 29704246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 176 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 50540982 - 50540769
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50540982 tataaagggtaaacatggattttaattaaaataataagggtaaaaatgagataaaatatgagaagctataagctcaaacgctacttgtaatagcttctga 50540883  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||   | ||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  50540882 aaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagtttatggtgaaaaagtattaccaaacagaactttttttatcaaacgagtttataagctataagct 50540783  T
Q  376 aaaagctaaaagct 389  Q
    | ||| || |||||    
T  50540782 ataagttataagct 50540769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 34087172 - 34086970
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    |||||||||| |||  || || |||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  34087172 aagggtaaaactggtattcaaataaaataacaagggtaaaagtggaagaaaaaataataagctataagctcaaacgctacctggaatagcttctcaaaaa 34087073  T
Q  280 tagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  34087072 tagcttataagctcgtgaaattagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagagctttttttgtcagacgagcttataagctataagctataa 34086973  T
Q  380 gct 382  Q
    |||    
T  34086972 gct 34086970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 236 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 38676639 - 38676474
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  38676639 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagttcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 38676540  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtt 402  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38676539 cagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagttaaaagctaaaagct-ttttttggggtt 38676474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 1507728 - 1507909
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||     |||||||    
T  1507728 ataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactaatggtgaaaaagtgttaccaaa 1507827  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  1507828 cagagcttctttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 1507909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 236 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15348974 - 15348812
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  15348974 ataaactataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataatttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 15348875  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgg 398  Q
    || || |  ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15348874 catagttttttttatcaaacgagcttataagctataagcaaagagctaaaagctcttttttgg 15348812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 236 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 29374480 - 29374326
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||   | |||||||    
T  29374480 ataagctataagctcaaactctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcttgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaa 29374381  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc 390  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  29374380 cagagctttttttatcaaacgagcttataagctaaaagctataagctataagctc 29374326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 50351182 - 50351036
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  50351182 ataagctataacctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggttaaaaagtgttaccaaa 50351083  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50351082 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 50351036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 204 - 376
Target Start/End: Original strand, 44718924 - 44719096
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||  ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  44718924 aaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagttataagcttaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtaaaataag 44719023  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagcta 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||   ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44719024 ctataagctcgtggtgaaaagacattaccaaacagagctttttttgccaaacaagcttataagctataagcta 44719096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 185 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3661153 - 3660932
Alignment:
Q  185 taaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctata-------agctcaaacgctacttggaatagcttctgaaa 277  Q
    ||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3661153 taaaaatgggatttaaatgaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaa 3661054  T
Q  278 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     ||||||||||| ||  | |  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3661053 aatagcttataagctcgtgaaataagatataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaacttttgttgtcaaatgagcttataagctataagctaa 3660954  T
Q  378 aagctaaaagctcttttttggg 399  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  3660953 gaactaaaagctcttttttggg 3660932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3270808 - 3270663
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  3270808 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 3270709  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    ||||  |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3270708 cagattttttttg-tcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 3270663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 34318556 - 34318415
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  34318556 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagctataagctcgtggtgaaaaaccattaccaaa 34318457  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
    |||||||  |||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  34318456 cagagctttttttgtcgaacaagcttataagctataagctaa 34318415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 236 - 383
Target Start/End: Original strand, 49220458 - 49220605
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||     |||||||    
T  49220458 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctgtaagctcacggtgaaaaagtgttaccaaa 49220557  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagcta 383  Q
    ||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49220558 cagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagcta 49220605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Original strand, 49240206 - 49240405
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  49240206 tataaaggataaaaatggattttagataaaatattaagggtaaaaatggaagaacttttgagaagctataagctcaaacgctatttgaaatagcttctga 49240305  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||  || ||||||||||||||  |||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  49240306 aaaatagcttataagctcatgaaataagctataagttcatagtgaaaaagcattaccaaacagagctttttttgtcatacgaacttataagctataagct 49240405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 323015 - 322869
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  323015 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaa 322916  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||| ||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  322915 cagaactttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaagct 322869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3391337 - 3391122
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||       ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3391337 tataaagggtaaacatggattttaattaaaataataagggtaaaaatgggataaaatatgagaagctataagctataagcttaaacgttacttggaatag 3391238  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagct 368  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||   | ||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||||||    
T  3391237 cttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataaactataagttcatggtgaaaaagtattaccaaacagagctttttttatcaaacaaacttataagct 3391138  T
Q  369 ataagctaaaagctaa 384  Q
    |||  ||| |||||||    
T  3391137 atagactataagctaa 3391122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25135054 - 25134858
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  25135054 aagggcaaaagtgggttttaattaaaatagtaaggataataatgaaataaaaagtgataagctataagctcaaacactacttaaaatagcgtctgaaaaa 25134955  T
Q  280 tagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacag-taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagcta 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || | ||||||||||| ||  |||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25134954 tagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgttgt-aaaaaactgttaccaaacagaactttttttgtcagacgagcttataagctattagcta 25134858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 323
Target Start/End: Original strand, 46056354 - 46056498
Alignment:
Q  179 aaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaa 278  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  46056354 aaagggtaaaaatggattttaattaaagtgatgagggtaaaaatgaaacaaaagataataagctataagcttaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaa 46056453  T
Q  279 atagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  46056454 atatcttataagctcgtgaaataaactataagttcgtggtgaaaa 46056498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 415
Target Start/End: Original strand, 36043285 - 36043465
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacag-taccaa 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || | ||||||    
T  36043285 ataagctataagctcaaacgctacttagaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcatggtgaaaa-actgttaccaa 36043383  T
Q  335 acag-agctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacc 415  Q
    |||| |  |  |||  |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  36043384 acagaatttttttttgtcaaacgaacttatatgctataagctaagagctataagctcttttttgggtgttaccaaacagacc 36043465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 177 - 376
Target Start/End: Original strand, 52703030 - 52703236
Alignment:
Q  177 ataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagc 269  Q
    ||||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| | ||||       ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52703030 ataaagggtaaatatgacttttagttaaaataataagggtaaaaatgaaataaaagataaaaagctaaaagctataagctcaaacgctacttgaaatagc 52703129  T
Q  270 ttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaga-cagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagct 368  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||    
T  52703130 ttctgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggt-aagagagcattaccaaacagaattttttttgtcaaacgagcttataagct 52703228  T
Q  369 ataagcta 376  Q
    ||||||||    
T  52703229 ataagcta 52703236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Original strand, 50171282 - 50171442
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    |||||||    
T  50171282 ataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaggtgttaccaaa 50171381  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    ||||  |  |||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  50171382 cagaattttttttgtcaaacaagcttataagctataaattaaaagcgaaaagctttttttt 50171442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 236 - 427
Target Start/End: Original strand, 51422969 - 51423161
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||     || ||||    
T  51422969 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagtttataaactcgtgaaataagctataagttcatggtgaaaaagtgttatcaaa 51423068  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagtgttttt 427  Q
    |||| | |  ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    | ||||||||||||| || |||||||    
T  51423069 cagaacttttttttatcaaacaaacttataagctataagctaaaagttaaaagctcttttttgaatgttaccaaacagacccctaatgttttt 51423161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 44956455 - 44956269
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  44956455 ataagcgtaaaaatggaagaaaatatgataagttataagctcaaactctacttggaatagcatctgaaaaataacttataatctcgttaaataagctata 44956356  T
Q  309 agctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 395  Q
    ||||| |||| ||||  || |||||||| || ||  |||  |||||||||| |||||| |||  |||| |||||| |||||| ||||    
T  44956355 agctcatggtaaaaaaccattaccaaacggaactttttttgtcaaacgagcatataagttattcgctataagctataagctcgtttt 44956269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 278 - 418
Target Start/End: Original strand, 33561922 - 33562062
Alignment:
Q  278 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33561922 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaa 33562021  T
Q  378 aagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 418  Q
    |||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||    
T  33562022 aagctaaaagctcttttttttagtttcccaaacagaccctt 33562062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 46370001 - 46369809
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 288  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||  |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  46370001 tttaaataaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagctt--- 46369905  T
Q  289 agctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagag--ctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||||   |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46369904 agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 46369809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 37703820 - 37703666
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  37703820 ataagttataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 37703721  T
Q  336 cagag---ctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaag 387  Q
    |||||    |  |||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37703720 cagagtttttttttttgtcaaaccagcttataagctataagttaagagctaaaag 37703666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 363
Target Start/End: Original strand, 16085596 - 16085723
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||| || ||||    
T  16085596 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgtaaaatagactataagatcgtggtgaaaaaacattatcaaa 16085695  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttat 363  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  16085696 cagaacttttttgttcaaacgagcttat 16085723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22099068 - 22098965
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||    
T  22099068 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaa 22098969  T
Q  336 caga 339  Q
    ||||    
T  22098968 caga 22098965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Original strand, 8221220 - 8221373
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |  |||||||    
T  8221220 ataagctataaattcaaacgctatttggaatagtttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgttgtaaaaaaccgttaccaaa 8221319  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 389  Q
    |||||||  |||  ||| |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||    
T  8221320 cagagctttttttgtcagacgagcttataagctatccgctataagctataagct 8221373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 40888025 - 40887949
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40888025 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagctataagct 40887949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Original strand, 37672335 - 37672422
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37672335 ataagttataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa 37672422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Original strand, 42614120 - 42614207
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42614120 ataagctataacctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctagaagctcatggtgaaaa 42614207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33152111 - 33151975
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataag-------ctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||| |||||    
T  33152111 tataatgggtaaaattgaattttagataaaataataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagttacaagctcaaacgctacttgaaatag 33152012  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagct 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33152011 cttcttaaaaatagcttataagctcgtgaaataagct 33151975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 39583246 - 39583100
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||     |||||||    
T  39583246 ataaggtataaactcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgttaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 39583147  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    ||||  |  |||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39583146 cagaattttttttgtcaaacaaacttataagctataagctaaaagct 39583100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 236 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5697627 - 5697550
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctc 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5697627 ataaggtataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctc 5697550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 372
Target Start/End: Original strand, 49185170 - 49185306
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||     |||||||    
T  49185170 ataagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagcttgtgaaataagctataagcttatggtgaaaaagtgttaccaaa 49185269  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataa 372  Q
    |||| ||  |||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  49185270 cagaactttttttgtcaaacgagtttataaactataa 49185306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 278 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2479268 - 2479130
Alignment:
Q  278 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||     ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2479268 aatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatgataaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaa 2479169  T
Q  378 aagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  2479168 aagctaaaagctctttttt-tggtttcccaaacagaccct 2479130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 370
Target Start/End: Original strand, 13570778 - 13570912
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaga-cagtaccaa 334  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||    
T  13570778 ataagctataagttcaaacgctatttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagttcgtgaaataagctataagctcgt-gtgaaaagatcattactaa 13570876  T
Q  335 acagagctaatttgatcaaacgagcttataagctat 370  Q
    |||||| |  |||  ||| ||||| |||||||||||    
T  13570877 acagagttttttttgtcagacgagtttataagctat 13570912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 180 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 42964034 - 42963891
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    |||||||||| |||  || || |||||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42964034 aagggtaaaattggtattcaaataaaataataagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctgtaagctcaaacgctacttgaaatagcttctcaaaaa 42963935  T
Q  280 tagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| | |||||||    
T  42963934 tagcttataaactcgtaaaataaattataagctcatagtgaaaa 42963891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43727171 - 43727084
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43727171 ataagctataagttcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagtttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaa 43727084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Original strand, 49822152 - 49822239
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49822152 ataagctataagctcaaacgctacttgaaataacttctaaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa 49822239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 309
Target Start/End: Original strand, 41004911 - 41005051
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    ||||| || ||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  41004911 tataatggataaaattggattttagataaaataataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagctataagttcaaacgctacttgaaatag 41005010  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 309  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41005011 cttcttaaaaataacttataagctcatgaaataagctataa 41005051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 323
Target Start/End: Original strand, 9769964 - 9770045
Alignment:
Q  242 tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9769964 tataagctcaaacgttatttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa 9770045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Original strand, 46087985 - 46088138
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||    
T  46087985 ataagctacaagctcaaatattacttggaataacgtctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagttataagctcgtggcgaaaaaacattatcaaa 46088084  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 389  Q
    |||||||  | |  |||||||||||||||| ||||  |||| |||||| |||||    
T  46088085 cagagcttttctagtcaaacgagcttataaactatctgctataagctataagct 46088138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 329 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 9169135 - 9169048
Alignment:
Q  329 taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9169135 taccaaacagagctttttttttcaaacgaacttataagctataagctaaaagttaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 9169048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9169232 - 9169142
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9169232 ataagggtaaaattggaagaaaaagggagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagttggtgaaa 9169142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 323
Target Start/End: Original strand, 30495153 - 30495267
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    |||||||||||| |||||  |||  ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  30495153 ataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctgaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataaactctagaaataagctata 30495252  T
Q  309 agctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||| |||| ||||    
T  30495253 agctcatggtcaaaa 30495267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7025013 - 7024916
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 293  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7025013 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 7024916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 28429213 - 28429092
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| |||||  |||  ||| |||||||| ||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  28429213 tttatttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctatacgctcaaacgctacttg------cttctgaaaaatagcttataagctcgt 28429120  T
Q  296 gaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28429119 gaaataagctataagctcatggtgaaaa 28429092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 236 - 372
Target Start/End: Original strand, 46928969 - 46929105
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| |   ||  |||    
T  46928969 ataagctataagcacaaacgctaattagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagctataagttcttagtgaaaaaatgatattaaa 46929068  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataa 372  Q
    |||| ||  ||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  46929069 cagaactttttttatcaaacgagtttataaactataa 46929105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40719664 - 40719554
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| || ||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  40719664 tttagttagaataataagggtaaaactgaaattaaaagtgagaagctataaactcaaacgctacttgaaataacttctgaaaaatagtttataagctcgt 40719565  T
Q  296 gaaataagcta 306  Q
    |||||||||||    
T  40719564 gaaataagcta 40719554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 326
Target Start/End: Original strand, 10628787 - 10628903
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||    
T  10628787 ataaaggtaaaaatagaataaaaggtgataagttataagctcaaacgctacttgaaataatgtctgaaaaataagttataagctagtaaaataaactata 10628886  T
Q  309 agctcgtggtgaaaagac 326  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  10628887 agctcgt-gtgaaaagac 10628903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 384
Target Start/End: Original strand, 27659294 - 27659499
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    |||||||||  || |||||| | ||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||    
T  27659294 aagggtaaacatgagttttattcaaaataataagggtaaaaataagataaaagatgataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcgtttggaaaa 27659393  T
Q  280 tagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagac-agtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaa 378  Q
    ||   ||||| ||| ||||||||| |||||| |||| |   |||||| | ||||||||| | ||| |||  ||| |||||||||||||||||  |||| |    
T  27659394 taaactataaactcctgaaataagttataagttcgttgaataaagactattaccaaacaaaactatttttgtcatacgagcttataagctattcgctata 27659493  T
Q  379 agctaa 384  Q
    ||||||    
T  27659494 agctaa 27659499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 309
Target Start/End: Original strand, 36379131 - 36379204
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  36379131 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaataacttataaactcatgaaataaactataa 36379204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 312
Target Start/End: Original strand, 2028953 - 2029037
Alignment:
Q  228 aaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 312  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  2028953 aaaagatgataagttataatcttaaacggtacttgaaatagcgtctgaaaaatagtttataaactcgttaaataaactataagct 2029037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9894987 - 9894931
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9894987 ataaactataagctcaaacgctactttgaatagcgtctgaaaaatagcttataagct 9894931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 368
Target Start/End: Original strand, 28868996 - 28869128
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||  |  |||||||    
T  28868996 ataagctataagctcaaacgttacttgaaataatttcttaaaaataatttataagctcgtgaaataaactataaactcgttgtaaaaaacctttaccaaa 28869095  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagct 368  Q
    ||||  |   ||  |||||||||||||||||||    
T  28869096 cagatatttctttgtcaaacgagcttataagct 28869128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 289
Target Start/End: Original strand, 40935893 - 40935945
Alignment:
Q  237 taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataa 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40935893 taagctataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagtttataa 40935945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33632381 - 33632331
Alignment:
Q  243 ataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 293  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33632381 ataagctcaaacgctgtttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 33632331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 417
Target Start/End: Original strand, 22099687 - 22099754
Alignment:
Q  349 atcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||  |||||||||||||    
T  22099687 atcaaacgagcttataagctataagctaaaa-ctaaaagctcttttttttagtttcccaaacagaccct 22099754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6814177 - 6814118
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  6814177 ataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaataacttataagttcgt 6814118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 7024879 - 7024812
Alignment:
Q  350 tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  7024879 tcaaacgaacttataagctatatgctaagagctaaaagctcttttttaggtgttaccaaacagaccct 7024812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 375
Target Start/End: Original strand, 52071222 - 52071292
Alignment:
Q  305 tataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  52071222 tataagctcgtggtgaaaaaccattaccaaacagagctttttttgtcaaatgagcttataagctataagct 52071292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 315
Target Start/End: Original strand, 31259501 - 31259641
Alignment:
Q  177 ataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaaga--tgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctg 274  Q
    |||| |||||||| ||| |||||  |||||| | ||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | |     
T  31259501 ataatgggtaaaaatggattttagataaaataacaagggtagaaatagaagaaaaaaaatgataagctataagctcaaacgctatttgaaataacgttta 31259600  T
Q  275 aaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgt 315  Q
     ||||||   || |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31259601 gaaaataagctaaaagctcctgaaataaactataagctcgt 31259641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 40719555 - 40719487
Alignment:
Q  329 taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttg 397  Q
    |||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40719555 taccaaacagagtttgttttgtcaaacgagcttataaactataaactcaaagctaaaagctcttttttg 40719487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2479296 - 2479261
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2479296 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 2479261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 243 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31434495 - 31434449
Alignment:
Q  243 ataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataa 289  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31434495 ataagcttaaatcctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataa 31434449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33632339 - 33632269
Alignment:
Q  305 tataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    ||||||||| |||||||||  || |||||||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  33632339 tataagctcatggtgaaaaagcattaccaaacagagttttttttgtcaaacgaacttataagctataagct 33632269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 912803 - 912714
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaga 325  Q
    ||||| |||||||||||| | || ||| |||||  |||  |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  912803 ataagttataagctcaaatgttatttgaaatagtgtctagaaaataggatataagctcctgaaataagttataagctcgttgtaaaaaga 912714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 249
Target Start/End: Original strand, 46087951 - 46087991
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagct 249  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  46087951 ataagagtaaaattggaagaaaaaatgataagctataagct 46087991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 279
Target Start/End: Original strand, 50814093 - 50814161
Alignment:
Q  211 aagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| ||  |||||| ||| |||||    
T  50814093 aaggttaaaaatggaagaaaatatgaaaagctataagcttaaaagctaattaaaatagcatctaaaaaa 50814161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 53 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21894584 - 21894264
Alignment:
Q  53 atttgaagagtactcgagtagttgagttgtactaattaaattggaagtatataggaaccagaaacgtaggaacnnnnnnntatagagggaaaacatagaa 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  |||||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  21894584 atttgaagagtactcgagtagttgagttgtactaa----attggaagtatataggaactggaaacgtaggaacaaaaaaatatagagggaaaacatagaa 21894489  T
Q  153 aacgtaataaatgtgttttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctata------- 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           
T  21894488 aacgtaataaatgtgttttaatatataaagggtaagagtgggttttaattaaaatgataagcgtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctata 21894389  T
Q  246 agctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagag-ctaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||  |      
T  21894388 agctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataatctcgtggtgaaaaga------caaacagagttttt 21894295  T
Q  345 tttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21894294 tttggtcaaacgagcttataagctataagct 21894264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 204 - 421
Target Start/End: Original strand, 31099983 - 31100200
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31099983 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 31100082  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  31100083 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggttt 31100182  T
Q  404 accaaacagacccttagt 421  Q
    |||||||||| |||||||    
T  31100183 accaaacagagccttagt 31100200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 12297511 - 12297331
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  12297511 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 12297412  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297411 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaggtaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 12297331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 14227536 - 14227715
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  14227536 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 14227635  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14227636 caaagct-tttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 14227715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 236 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 32731905 - 32731723
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  32731905 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 32731806  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 418  Q
    |||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32731805 cagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagagcctt 32731723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 204 - 413
Target Start/End: Original strand, 34232876 - 34233092
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34232876 aaataataagggtaaaattggaagaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 34232975  T
Q  297 aaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34232976 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 34233075  T
Q  397 ggggttaaccaaacaga 413  Q
     ||| ||||||||||||    
T  34233076 tgggataaccaaacaga 34233092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 2442571 - 2442387
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  2442571 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 2442472  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttag 420  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||    
T  2442471 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttttagtttcccaaacagacccttag 2442387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 30811149 - 30811329
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||    
T  30811149 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaa 30811248  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  30811249 cagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaaactctttttttgggtttcccaaacagaccc 30811329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 204 - 396
Target Start/End: Original strand, 31451923 - 31452114
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31451923 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagct-taagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaacagcttataagctcgtgaaataag 31452021  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31452022 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 31452114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20805136 - 20804976
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  20805136 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 20805037  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20805036 cagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctctttttt 20804976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 204 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10856311 - 10856133
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10856311 aaataataagggtaaaattaaaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 10856212  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10856211 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 10856133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 177 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23648399 - 23648201
Alignment:
Q  177 ataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaa 276  Q
    ||||||||||||  ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  23648399 ataaagggtaaatttgacttttagttaaaataataagggtaaaaatggaacaaaagataaaaagctataagctcagaagctacttgaaatagcttctgaa 23648300  T
Q  277 aaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaga-cagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  23648299 aaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggt-aagagagcattaccaaacagagctttttttgtcaaacaagcttataagctataagct 23648201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 34685016 - 34685189
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||     |||||||    
T  34685016 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcat-gtgaaaatgtgttaccaaa 34685114  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34685115 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctat-------aagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 34685189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Original strand, 5301535 - 5301741
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaa-----agatg--ataagctataagctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||     ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5301535 tataaaggataaaaatggattttagataaaatattaagggtaaaaatggaagaaattttgagaagctataagctataagcttaaacgctacttggaatag 5301634  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagct 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||  ||| |||||||||||||||    
T  5301635 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaacattaccaaacagaactttttttgtcatacgagcttataagct 5301734  T
Q  369 ataagct 375  Q
    |||||||    
T  5301735 ataagct 5301741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Original strand, 7317611 - 7317788
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |   |||||||    
T  7317611 ataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaaatgttaccaaa 7317710  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||  ||   | |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  7317711 cagagctttttctgtgaaacgaacttataagctataagttaagagctaaaagctctttttttgagtttaccaaacaga 7317788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 558507 - 558326
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  558507 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 558408  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagtgtt 424  Q
    |||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  558407 cagagcttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct--------tttttttgggtttcccaaacagacccttagtgtt 558326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 211 - 366
Target Start/End: Original strand, 6104646 - 6104801
Alignment:
Q  211 aagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataag 310  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6104646 aagggtaaagatgaaagaaaaaatgataagctataagctcaaacgctacttgaaatagtatctgaaaaatagcttataagctcgcgaaataagctataag 6104745  T
Q  311 ctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataag 366  Q
    ||||||||||||   || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  6104746 ctcgtggtgaaagaccattaccaaacagagcttttttggtcaaacgagcttataag 6104801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 264 - 416
Target Start/End: Original strand, 1806343 - 1806494
Alignment:
Q  264 aatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttat 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||||| |  |||  ||||||||||||||    
T  1806343 aatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagattttttagtcaaacgagcttat 1806442  T
Q  364 aagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1806443 aagctataagctataagctaaaagctctttttt-gggttaaccaaacagaccc 1806494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 176 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 34439896 - 34439683
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||   |||       ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34439896 tataaaggataaaaatggattttagataaaatattaagggtaaaaatggaagaaattttgagaagctgtaagctataagctcaaacgttacttggaatag 34439797  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagct 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||||| |  |||  ||| |||||||||||||||    
T  34439796 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagagttttttttgtcagacgagcttataagct 34439697  T
Q  369 ataagctaaaagct 382  Q
    |||||||| |||||    
T  34439696 ataagctataagct 34439683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Original strand, 12432621 - 12432760
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  12432621 ataagctataagctcaaacgctacttggaatggcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 12432720  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    ||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12432721 cagagatttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 12432760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 209 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33453909 - 33453734
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    |||| ||||||| |||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33453909 ataacggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 33453810  T
Q  309 agctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 384  Q
    ||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  33453809 agctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataaactataagctataagctaa 33453734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28076569 - 28076423
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | |||||||    
T  28076569 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaa 28076470  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28076469 cagagctttttttgtcagacgagtttataagctataagctataagct 28076423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 196 - 397
Target Start/End: Original strand, 3636601 - 3636801
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| | |||  |||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3636601 tttagttagaataataagggtaaaactagaattaaaagtgagaagctataagttcaaaggctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 3636700  T
Q  296 gaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 395  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||     |||||||||||  |  |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3636701 gaaataagctataagcttatggtgaaaaagtgttaccaaacagaatttttttg-tcaaacaagcttataagctataagttaagagctaaaagctcttttt 3636799  T
Q  396 tg 397  Q
    ||    
T  3636800 tg 3636801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Original strand, 33540726 - 33540865
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     |||||||    
T  33540726 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagattataagctcgtgaaataagctataagcttatggtgaaaaagtgttaccaaa 33540825  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    ||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33540826 cagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 33540865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 34904093 - 34903924
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||| |||||||||     |||||||    
T  34904093 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct-------------ataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 34904007  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 418  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  34904006 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggagtttcccaaacagaccctt 34903924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11015736 - 11015590
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   | |||||||    
T  11015736 ataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctcaaaaatagcttgtaagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtattaccaaa 11015637  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    ||||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11015636 cagagttttttttgtcagacgagcttataagctataagctataagct 11015590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 3108006 - 3108153
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa-taagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaa 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||     ||||||    
T  3108006 ataagctataagctcaaacgctatttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaattaagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaa 3108105  T
Q  335 acagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    | ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3108106 atagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagct 3108153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5681666 - 5681579
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5681666 ataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa 5681579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5943138 - 5943051
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5943138 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa 5943051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 176 - 370
Target Start/End: Original strand, 12140812 - 12141012
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataa-------gctataagctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||       |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12140812 tataaagggtaaatatgaattttagttaaaataataagggtaaaaaaggaacaaaagataataagctataagctataagttcaaacgctacttgaaatag 12140911  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagct 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || ||| ||||| || |  |||| ||| |||||||||||||||    
T  12140912 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcatggtgaaaaagcattactaaacaaagtttttttg-tcatacgagcttataagct 12141010  T
Q  369 at 370  Q
    ||    
T  12141011 at 12141012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 376
Target Start/End: Original strand, 29823036 - 29823176
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| |   || ||||    
T  29823036 ataagctataagctcaaacgctactttgaatagcttttgaaaaataacttataagctcgcaaaataagctattagctcatggtgaaaaaatgttatcaaa 29823135  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagcta 376  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  29823136 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagcta 29823176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Original strand, 6709696 - 6709835
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  6709696 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataatttcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 6709795  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    ||||  |  |||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  6709796 cagaattttttttgtcaaacgaacttataagctataagct 6709835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 177 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20563606 - 20563400
Alignment:
Q  177 ataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataa-------gctataagctcaaacgctacttggaatagc 269  Q
    ||||||||||||  ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||       |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  20563606 ataaagggtaaatatgacttttagttaaaataataagggtaaaaatggaacaaaagataaaaaactaaaagctataagctcagatgctacttgaaatagc 20563507  T
Q  270 ttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaga-cagtaccaaacagagc-taatttgatcaaacgagcttataagc 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||| |    
T  20563506 ttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggt-aagagagcattatcaaacagagcttttttttatcaaacaagcttataaac 20563408  T
Q  368 tataagct 375  Q
    ||||||||    
T  20563407 tataagct 20563400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 180 - 315
Target Start/End: Original strand, 15591088 - 15591230
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttc 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||  |||       |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15591088 aagggtaaaagtggattttaattaaaataataagggtaaaattggaattaaaagtgacacgctataagttataagctcaaacgctacttgaagtagcttc 15591187  T
Q  273 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgt 315  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15591188 tgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcgt 15591230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31049480 - 31049344
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||    
T  31049480 ataagctataagctcaaacactatttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaa 31049381  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataa 372  Q
    || || |  |||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  31049380 caaagttttttttgtcagacgaacttataagctataa 31049344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2970821 - 2970734
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  2970821 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagattataagctcgtgaaataagctataaactcatggtaaaaa 2970734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 326
Target Start/End: Original strand, 5893876 - 5893984
Alignment:
Q  218 aaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtgg 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||    
T  5893876 aaaatggaataaaagatgataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctggaaaataagttataagctagtaaaataagctaaaagcttgtgg 5893975  T
Q  318 tgaaaagac 326  Q
    |||||||||    
T  5893976 tgaaaagac 5893984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 180 - 375
Target Start/End: Original strand, 7292486 - 7292688
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttc 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||  |||  |||       ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||     
T  7292486 aagggtaaaagtggattttaattaaaataataagagtaaaactggaattaaaagtgagacgctataagctataagctcaaacgttacttgaagtagctta 7292585  T
Q  273 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataa 372  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | || ||||  |  || |||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7292586 tgaaaaatagcttataagcttctgaaataagctataagctcattgtaaaaaagcgttatcaaacagagctttttttatccgacgagcttataagctataa 7292685  T
Q  373 gct 375  Q
    |||    
T  7292686 gct 7292688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Original strand, 29414924 - 29415094
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  29414924 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagctt-------------ataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 29415010  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  29415011 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctataaactcttttttaggtgttaccaaacagaccctta 29415094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 194 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26561538 - 26561408
Alignment:
Q  194 gttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||  | |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  26561538 gttttaattaaaatgataagggtaaaaataaaataaaaagtgataagtgaaaagctcaaacgctacttgaaatagcgtttgaaaaataagttataagctc 26561439  T
Q  294 gtgaaataagctataagctcgtggtgaaaag 324  Q
     |||||||| |||||||||||| || |||||    
T  26561438 ctgaaataaactataagctcgttgtaaaaag 26561408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9896852 - 9896766
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaa 322  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9896852 ataagctattaactcaaacgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataaactataagctcgtggtgaaa 9896766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 1225573 - 1225491
Alignment:
Q  241 ctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| || ||||||    
T  1225573 ctataagctcaaacgctacttgaaataacttctaaaaaatagcttataaacttgtgaaataaaatataagctcttgatgaaaa 1225491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11443160 - 11443033
Alignment:
Q  175 atataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagcta-------taagctcaaacgctacttggaata 267  Q
    |||||| ||| |||| ||| |||||  |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||| ||||    
T  11443160 atataatgggcaaaattggattttagataaaataataaggatataaatggaagaaaagatgataagttaaaagatataagctcaaacgctacttgaaata 11443061  T
Q  268 gcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |  |||| ||||||| ||||||||||||    
T  11443060 gagtctggaaaataggttataagctcgt 11443033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 210 - 326
Target Start/End: Original strand, 15131360 - 15131476
Alignment:
Q  210 taagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 309  Q
    ||||||||||  || || |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||   |||||| | || ||||||| |||||    
T  15131360 taagggtaaatttgaaaaaaaaaaagataagctatatgcttaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaaataagctataagttagtaaaataagttataa 15131459  T
Q  310 gctcgtggtgaaaagac 326  Q
    ||||||| |||||||||    
T  15131460 gctcgtgatgaaaagac 15131476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 325
Target Start/End: Original strand, 32563244 - 32563333
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaga 325  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  32563244 ataagttataatctcaaacactatttgaaatagcgtctgaaaaataaattataagcttctgaaataagttataagctcgttgtggaaaga 32563333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19415426 - 19415351
Alignment:
Q  237 taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    | |||||||||||| | ||||||||||    
T  19415426 taagctataaactcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaataagcaacaagctcgtgaaaaacgctataagct 19415351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22756635 - 22756562
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagct 249  Q
    ||||| |||||||| | | |||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22756635 tataatgggtaaaatttgtttttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgatagactataagct 22756562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 375
Target Start/End: Original strand, 3832351 - 3832421
Alignment:
Q  305 tataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    ||||||||||||||||||   || ||||||| |||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3832351 tataagctcgtggtgaaagaccattaccaaatagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 3832421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 6e-85; HSPs: 127)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 53 - 296
Target Start/End: Original strand, 24954035 - 24954282
Alignment:
Q  53 atttgaagagtactcgagtagttgagttgtactaattaaattggaagtatataggaaccag-aaacgtaggaacnnnnnnntatagagggaaaacataga 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||||       |||||||||||||||||||    
T  24954035 atttgaagagtactcgagtagttgagttgtactaa----attggaagtatataggaacttggaaacgcaggaacaaaaaaatatagagggaaaacataga 24954130  T
Q  152 aaacgtaataaatgtgttttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatg-------ataagctat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||    
T  24954131 aaacgtaataaatgtgttttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaacaaaagatgataagctataagctat 24954230  T
Q  245 aagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24954231 aagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtg 24954282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 211 - 421
Target Start/End: Original strand, 35777362 - 35777572
Alignment:
Q  211 aagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataag 310  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777362 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaaggtataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataag 35777461  T
Q  311 ctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaac 410  Q
    ||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777462 ctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaac 35777561  T
Q  411 agacccttagt 421  Q
    |||||| ||||    
T  35777562 agacccatagt 35777572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Original strand, 12233968 - 12234153
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  12233968 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 12234067  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12234068 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 12234153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 4517192 - 4517373
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  4517192 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaa 4517291  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4517292 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttgggattaaccaaacagaccct 4517373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 11600826 - 11600646
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  11600826 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 11600727  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    || ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11600726 catagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 11600646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 53407332 - 53407153
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  53407332 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 53407233  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53407232 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc-tttttggggttaaccaaacagaccc 53407153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 204 - 396
Target Start/End: Original strand, 55495849 - 55496041
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55495849 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 55495948  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55495949 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 55496041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 204 - 418
Target Start/End: Original strand, 47417444 - 47417658
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47417444 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctcaaacgctgcttggaatagcttatgaaagatagcttataagctcgtgaaataag 47417543  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47417544 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttt 47417643  T
Q  404 accaaacagaccctt 418  Q
     ||||||||||||||    
T  47417644 cccaaacagaccctt 47417658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 8829816 - 8829997
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  8829816 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 8829915  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8829916 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctcttttttggggtttcccaaacagaccct 8829997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Original strand, 4392727 - 4392909
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  4392727 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatgaaaa-tagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 4392825  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4392826 cagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctcttttttgaggttaaccaaacagaccctta 4392909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Original strand, 22038358 - 22038541
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  22038358 ataagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcctataagctcgagaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 22038457  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22038458 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttatggggttaaccaaacagaccctta 22038541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 42117039 - 42116858
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  42117039 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 42116940  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  42116939 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgaggtttcccaaacagaccct 42116858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 45906282 - 45906105
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  45906282 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 45906183  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  45906182 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaggtaaaagctactttttggggttaaccaaacaga 45906105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 46895426 - 46895266
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||    
T  46895426 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaa 46895327  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46895326 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 46895266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 201 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 55829182 - 55828962
Alignment:
Q  201 ttaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55829182 ttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaat 55829083  T
Q  301 aagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgggg 400  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||     ||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  55829082 aagttataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttggg 55828983  T
Q  401 ttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    || ||| ||||||||||||||    
T  55828982 tttaccgaacagacccttagt 55828962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 204 - 417
Target Start/End: Original strand, 37115252 - 37115464
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37115252 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 37115351  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||     
T  37115352 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttatatgctataagctaaaagctaaaaactctttttt-tggttt 37115450  T
Q  404 accaaacagaccct 417  Q
     |||||||||||||    
T  37115451 cccaaacagaccct 37115464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 55764702 - 55764518
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  55764702 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaa 55764603  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    |||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  55764602 cagagct-tttttttgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgggtttaccaaacagacccttagt 55764518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 28307398 - 28307218
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     || ||||    
T  28307398 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaa 28307299  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    | |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  28307298 ccgagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagaccc 28307218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7706515 - 7706332
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||     |||||||    
T  7706515 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtgaaaaagtgttaccaaa 7706416  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||  |||||||||||||||    
T  7706415 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttcttggttttcccaaacagaccctta 7706332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 56372578 - 56372393
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  56372578 ataagctataagctcaaacgctgcttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 56372479  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagtg 422  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||    
T  56372478 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-tggtttcccaaacagacccatagtg 56372393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 18582987 - 18582807
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     |||||||    
T  18582987 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 18582888  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  18582887 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-tggtttcccaaacagaccct 18582807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 176 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 36197077 - 36196837
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    ||||| || ||||| ||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36197077 tataatggataaaattggtttttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacactacttagaatagcttctga 36196978  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagac-agtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagc 374  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | || |||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  36196977 aaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggt-aagagacaattatcaaacagagctatttttgtcaaacgagcttataaactataagc 36196879  T
Q  375 taaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    || || ||| |||||| |||   ||| | |||||||||||||    
T  36196878 tataaactataagctcatttaatgggcttaccaaacagaccc 36196837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 204 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 31679144 - 31678938
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31679144 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 31679045  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31679044 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctat-------aagctaaaaactcttttttggggtta 31678952  T
Q  404 accaaacagaccct 417  Q
    |||||||| |||||    
T  31678951 accaaacaaaccct 31678938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 414
Target Start/End: Original strand, 35822300 - 35822478
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||     |||||||    
T  35822300 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataatctcgtgaaataagttgtaagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 35822399  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagac 414  Q
    ||||| |  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35822400 cagagttttttttgtcaaacgagcttataagttataagctaaaagctaaaagctcttttttgaggttaaccaaacagac 35822478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 39087559 - 39087739
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  39087559 ataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 39087658  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  39087659 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctagaagctaaaagctctttttt-aggttaaccaaacaaaccct 39087739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Original strand, 19513883 - 19514043
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  19513883 ataagctataagctaaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 19513982  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19513983 cagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 19514043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 204 - 419
Target Start/End: Original strand, 43225646 - 43225861
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43225646 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 43225745  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtt 402  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||| |  |||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  43225746 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttttttttgtcaaacaaacttataagctataagctaaaaactaaaagctctttttt-tggtt 43225844  T
Q  403 aaccaaacagaccctta 419  Q
      |||||||||||||||    
T  43225845 tcccaaacagaccctta 43225861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8942047 - 8941887
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  8942047 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 8941948  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8941947 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagttaaaagctctttttt 8941887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22892671 - 22892511
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  22892671 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaa 22892572  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22892571 cagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttt 22892511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22944335 - 22944175
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  22944335 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaa 22944236  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22944235 cagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttt 22944175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 11151940 - 11152086
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  11151940 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 11152039  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11152040 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 11152086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 204 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29664104 - 29663926
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29664104 aaataataagggtaaaattggatgaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacctggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataag 29664005  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29664004 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 29663926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 52670137 - 52669984
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  52670137 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 52670038  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 389  Q
    ||||| |  |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52670037 cagagttttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 52669984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Original strand, 21633750 - 21633964
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataa-------gctataagctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21633750 tataatgggtaaaattggtttttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctatttggaatag 21633849  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagct 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||| | ||  |||  |||||||| ||||||||||    
T  21633850 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtaagagaacattaccaaacaaaactttttttgtcaaacgaacttataagct 21633949  T
Q  369 ataagctaaaagcta 383  Q
    |||||||| ||||||    
T  21633950 ataagctataagcta 21633964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 236 - 395
Target Start/End: Original strand, 27397767 - 27397927
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  27397767 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 27397866  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagc-taaaagctcttttt 395  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27397867 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagcttataagctcttttt 27397927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 236 - 397
Target Start/End: Original strand, 9043611 - 9043773
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacag-taccaa 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |  | ||||||    
T  9043611 ataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtggaaaaagtgttaccaa 9043710  T
Q  335 acagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttg 397  Q
    ||| | ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9043711 acataactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttg 9043773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 25440485 - 25440631
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  25440485 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 25440584  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25440585 cagaactttttttatcaaacgagcttataagctaaaagctaaaagct 25440631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 176 - 337
Target Start/End: Original strand, 4465412 - 4465573
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4465412 tataaagggtaaatatgggttttatttaaaataataagggtaaaggtggaagaaaagatgataagctacaagctcaaacgctacttggaacagcgtctga 4465511  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaaca 337  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||||||||    
T  4465512 aaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcattgtaaaaagacgttaccaaaca 4465573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22430778 - 22430637
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||    
T  22430778 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaaccattatcaaa 22430679  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
     ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22430678 tagagctttttttatcgaacgagcttataagctataagctaa 22430637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 201 - 402
Target Start/End: Original strand, 35580911 - 35581112
Alignment:
Q  201 ttaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35580911 ttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctcaaacgctacttgaaatagcctctgaaaaatagtttataagctcgtgaaat 35581010  T
Q  301 aagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgggg 400  Q
    || |||||||||| |||| ||||     ||||||||||||||  |||  | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  35581011 aaactataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtgaaacgaacttataagctataagctaaaagttaaaagctctttttttggg 35581110  T
Q  401 tt 402  Q
    ||    
T  35581111 tt 35581112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 420
Target Start/End: Original strand, 51011066 - 51011250
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||     | |||||    
T  51011066 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagcttatggtgaaaaagtgttgccaaa 51011165  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttag 420  Q
     ||| | |  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  51011166 tagaacttttttttatcaaacgagcttataagttataagctagaagctaaaagctctttttt-gagttaaccaaacagacccttag 51011250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11050520 - 11050320
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11050520 tataaaggataaaaatggattttagataaaatattaagggtaaaaatggaaggaattttgagaagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctga 11050421  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttga-tcaaacgagcttataagctataagc 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  || ||||||||||||||  |||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  11050420 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagttcatggtgaaaaagcattaccaaacagagcttttttttgtcagacgagcttataagctataagc 11050321  T
Q  375 t 375  Q
    |    
T  11050320 t 11050320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37970437 - 37970258
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  37970437 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaa 37970338  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    ||||| |  |||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  37970337 cagagtttttttg-tgaaacgaacttataagctataagctaagagctaaaagctcatttttttggtttaccaaacagaccc 37970258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3009854 - 3009708
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |   |||||||    
T  3009854 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcaaggtaaaaaaatgttaccaaa 3009755  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3009754 cagagctttttttgtcaaacgagtttataagctataagctaaaagct 3009708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 23867870 - 23868016
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  23867870 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 23867969  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23867970 cagagctttttttgtcaaaagagcttataagctataagctaaaagct 23868016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29413674 - 29413528
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     |||||||    
T  29413674 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaa 29413575  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29413574 cagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 29413528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 259 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 53273238 - 53273076
Alignment:
Q  259 cttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgag 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||     ||||||| ||| ||  |||  |||||||||    
T  53273238 cttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaatagaactttttttgtcaaacgag 53273139  T
Q  359 cttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  53273138 cttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgaggttaaccaaacagacccatagt 53273076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 236 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21370023 - 21369890
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||    
T  21370023 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaa 21369924  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagcta 369  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  21369923 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagcta 21369890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20511612 - 20511413
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    ||||| || ||||| ||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20511612 tataatggataaaattggtttttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagttataagctcaaacgctacttggaatagcgtctga 20511513  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacag-taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagc 374  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || | || |||||||||    |||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  20511512 aaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcgttgt-aaaaaactgttatcaaacagagtgtttttggtcagacgaacttataagctataagc 20511414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 4939387 - 4939532
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    |||||||    
T  4939387 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaag-tgttaccaaa 4939485  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||| ||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4939486 cagaactttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagct 4939532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Original strand, 55856528 - 55856685
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  55856528 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaa 55856627  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    ||||||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  55856628 cagagc---ttttatcaaacaaacttataagctataagctaaaagttaaaagctccttttt 55856685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 4355593 - 4355767
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||    
T  4355593 ataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaa 4355692  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||| ||  |||  ||||||||  |||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4355693 cagaactttttttgtcaaacgaatttataagctat-------aagctaaaagctctttttttgggtttaccaaacagaccct 4355767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 176 - 377
Target Start/End: Original strand, 23113410 - 23113618
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataag-------ctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||||       ||||||||||||||||||||     
T  23113410 tataaagggtaaatatggattttaattaaaataataagggtaaaaatgggataaaatatgagaagttataagttataaactcaaacgctacttggaataa 23113509  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagct 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   | |||||| || || |  ||| ||||||||||||||||| ||    
T  23113510 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggcgaaaaagtattaccaatcaaagttttttttatcaaacgagcttataaact 23113609  T
Q  369 ataagctaa 377  Q
    |||||||||    
T  23113610 ataagctaa 23113618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Original strand, 31338501 - 31338686
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagaca--gtacca 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |   ||| |    
T  31338501 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagcccgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaaaatgttacta 31338600  T
Q  334 aacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||||  |||  |||||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |  | |||||| |||||||||    
T  31338601 aacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctatcagttaagagctataagctcttttttgagtgttaccaaatagaccctta 31338686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 204 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15636124 - 15635922
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15636124 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataaaatcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtg 15636025  T
Q  297 aaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||     ||||||||| ||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15636024 aaataagctataaactcatagtgaaaaagtgttaccaaacaaagctttttttatcaaacaagtttataagctataagctaagaggtaaaagctctttttt 15635925  T
Q  397 ggg 399  Q
    |||    
T  15635924 ggg 15635922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 390
Target Start/End: Original strand, 5465411 - 5465565
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | |||||||    
T  5465411 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaa 5465510  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc 390  Q
    |||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||| ||||||    
T  5465511 cagagcttttttttatcaaacgagcttat-agctaaaagctataaactataagctc 5465565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 211 - 313
Target Start/End: Original strand, 20148778 - 20148880
Alignment:
Q  211 aagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataag 310  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20148778 aagggtaaagatggaagaaaaaatgataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataag 20148877  T
Q  311 ctc 313  Q
    |||    
T  20148878 ctc 20148880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 204 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 37832096 - 37831924
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37832096 aaataataagggtaaag-tggaagaaaaagtgagaaactataacctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 37831998  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
    |||||| ||| |||| ||||     |||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37831997 ctataaactcatggtaaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaa 37831924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 210 - 323
Target Start/End: Original strand, 42085697 - 42085810
Alignment:
Q  210 taagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 309  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42085697 taagggtaaaattgaaagaaaaaatgataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaaaagcttataagctcgtgaaataagctataa 42085796  T
Q  310 gctcgtggtgaaaa 323  Q
    | ||||||||||||    
T  42085797 gttcgtggtgaaaa 42085810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 25235288 - 25235108
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |  |||||||    
T  25235288 ataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaa 25235189  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  |||  ||| |||| |||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||| |  | |||||||||||||    
T  25235188 cagagctttttttgtcagacgaacttataagctatcagctataaactataagctcctttttgtgtgttaccaaacagaccc 25235108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 204 - 316
Target Start/End: Original strand, 33005077 - 33005189
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33005077 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataag 33005176  T
Q  304 ctataagctcgtg 316  Q
    |||||||||||||    
T  33005177 ctataagctcgtg 33005189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 35468152 - 35468012
Alignment:
Q  242 tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagc 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||||      
T  35468152 tataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagatt 35468053  T
Q  342 taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35468052 tttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagct 35468012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Original strand, 56270092 - 56270231
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |   |||||||    
T  56270092 ataagctaaaagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaaatgttaccaaa 56270191  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    ||||| |  |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  56270192 cagagttttttttgtgaaacgagcttataagctataagct 56270231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 4391709 - 4391855
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |  |||||||    
T  4391709 ataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaa 4391808  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4391809 cagagctttttttgtcagacgagcttataagctatcagctataagct 4391855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 370
Target Start/End: Original strand, 32101709 - 32101869
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  32101709 ataagggtaaaattggaagaaaagataataagctataagctcaaacgctacttggaataacgtcttagaaatagtttataagctcgtgaaataagttata 32101808  T
Q  309 agctcgtggtgaaaagacag-taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctat 370  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| || |||  |||| ||| |||||||||||||||||    
T  32101809 agctcgtggt-aaaagaccgttaccaaatagggcttttttg-tcagacgagcttataagctat 32101869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 204 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33115157 - 33114979
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33115157 aaataataagggtaaaattggaagaaaaggtgagaagctataagctataagctcaaacgatacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 33115058  T
Q  297 aaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  33115057 aaataagctataagctcacggtaaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctaaaagct 33114979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 308
Target Start/End: Original strand, 41864021 - 41864153
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |    
T  41864021 tataatgggtaaaattggattttagataaaataataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataaacttaaacgctatttggaatagcttctta 41864120  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41864121 aaaatagcttataagttcgtaaaataagctata 41864153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Original strand, 9031996 - 9032083
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9031996 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa 9032083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26826664 - 26826525
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||     |||||||    
T  26826664 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatcgtgaaaaagtgttaccaaa 26826565  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    ||||| |  |||  |||||| | |||||||||||||||||    
T  26826564 cagagttttttttgtcaaacaaacttataagctataagct 26826525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 196 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31435189 - 31435070
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  31435189 tttaattaaactaataaaggtaaaaatggaataaaagatgataagttataacctcaaacgctacttggaatagcgtatgaaaaataacttataaactcgt 31435090  T
Q  296 gaaataagctataagctcgt 315  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31435089 gaaataagctataagctcgt 31435070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 201 - 312
Target Start/End: Original strand, 40497362 - 40497473
Alignment:
Q  201 ttaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40497362 ttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 40497461  T
Q  301 aagctataagct 312  Q
    ||| ||||||||    
T  40497462 aagttataagct 40497473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Original strand, 55358339 - 55358426
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  55358339 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaa 55358426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 318
Target Start/End: Original strand, 27185633 - 27185715
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27185633 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggt 27185715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 209 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37047199 - 37047093
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37047199 ataaggataaaaatggaagaaaatatgataagctataagctcaaacgctatttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctaaaataagctata 37047100  T
Q  309 agctcgt 315  Q
    |||||||    
T  37047099 agctcgt 37047093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 370
Target Start/End: Original strand, 43078197 - 43078331
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  43078197 ataagctataagctcaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagttataagctcgtggcgaaaaaacattaccaaa 43078296  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctat 370  Q
    |||| ||| ||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  43078297 cagatctatttttatcaaacaaacttataaactat 43078331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 55684838 - 55684692
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||  || |||||||    
T  55684838 ataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctagaagctcgttgtaaaaaagcattaccaaa 55684739  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    || ||||  |||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  55684738 caaagctttttttgtcagacgagcttataagctatcagctataagct 55684692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 214 - 315
Target Start/End: Original strand, 48056585 - 48056686
Alignment:
Q  214 ggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctc 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  48056585 ggtaaaaatggaataaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaataacttataagttcgtgaaataaactataagttc 48056684  T
Q  314 gt 315  Q
    ||    
T  48056685 gt 48056686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 44442224 - 44442046
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||     |||||||    
T  44442224 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatag-ttttaagctcgtgagataagcaataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 44442126  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacc 415  Q
    ||||  |  |||  |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  44442125 cagaattttttttgtcaaacgaacttataaattataagctaaaagttaaaagctcttttttggagtttctcaaacagacc 44442046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 204 - 416
Target Start/End: Original strand, 45780726 - 45780918
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  45780726 aaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataa-------------- 45780811  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
          |||| |||||||||     ||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45780812 ------gctcatggtgaaaaagtgttaccaaatagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttagggtta 45780905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 35190617 - 35190763
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||  |  |||||||    
T  35190617 ataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctacaaactcgttgtaaaaaagcgttaccaaa 35190716  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    ||||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35190717 cagagttttttttgtcagacgagcttataagctataagctataagct 35190763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 50502440 - 50502254
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaa-tgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaa 278  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||| || |||||||||   | |||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  50502440 aagggtaaaagtgggttttgataaaaaataataagggtagaagtggaagaaatattaataatccataagctcaaacactacttggaatagcgtctgaaaa 50502341  T
Q  279 atagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |  ||||||| | | ||  ||| |||||||||||||||||    
T  50502340 atagcttataagctcgtgaaataagctataaactcgttgtaaaaaaccgttaccaaagataactttttttatcaaacgagcttataa 50502254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 180 - 375
Target Start/End: Original strand, 52707937 - 52708138
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataag-------ctataagctcaaacgctacttggaatagcttc 272  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||| ||||||||       |||||||||||| || |||||| |||| | ||    
T  52707937 aagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaagggtataaatggaataaaacatgataagatataagctataagctcaa-cgttacttgtaataacatc 52708035  T
Q  273 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataa 372  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |  |||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  52708036 tgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcgttgtaaaaaatcgttaccaaacagagttttttctatcaaacgagcttataagctataa 52708135  T
Q  373 gct 375  Q
    |||    
T  52708136 gct 52708138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 180 - 375
Target Start/End: Original strand, 30562794 - 30562988
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    |||||||||  || |||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30562794 aagggtaaacatgagttttagttaaagtggtaagggtataaatggaataaaacatgataagctataagcttaaacgctacttgtaatagcatctgaaaaa 30562893  T
Q  280 tagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    ||||||||  |||| | ||||||| |||||| |||| || ||||  |  ||||||||| | ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30562894 tagcttat-tgctcataaaataagttataagttcgttgtaaaaaatcgttaccaaacataactttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 30562988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 196 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 44525820 - 44525694
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44525820 tttagttagaataataagggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttgaaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgt 44525721  T
Q  296 gaaataagctataagctcgtggtgaaa 322  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  44525720 gaaataagctataaactcatagtgaaa 44525694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23162745 - 23162657
Alignment:
Q  236 ataagctataagct-caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23162745 ataagctataagcttcaaaagctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggggaaaa 23162657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Original strand, 30366147 - 30366234
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  30366147 ataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagatataagctcatgatgaaaa 30366234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 176 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17715767 - 17715647
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    ||||||||||||||| || |||||  |||| |  |||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17715767 tataaagggtaaaaggggattttagataaattagtaagggcaaaagtggaagaaaaaacaataagctataatctcaaacgctacttggaatagcgtctga 17715668  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17715667 aaaatagcttataagctcgtg 17715647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 329 - 416
Target Start/End: Original strand, 25199390 - 25199477
Alignment:
Q  329 taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25199390 taccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacataccc 25199477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31011143 - 31011003
Alignment:
Q  156 gtaataaatgtgttttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacg 255  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| || ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  31011143 gtaataaaggtgttttaatatttaa-ggttaaagctgagttttaattaaaatgataagggtaaatatggaagaaaaaatgagaagttataagcttaaacg 31011045  T
Q  256 ctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 297  Q
     || || |||||| || | ||| |||||||||||||||||||    
T  31011044 atatttagaatagattttaaaatatagcttataagctcgtga 31011003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 416
Target Start/End: Original strand, 29656597 - 29656719
Alignment:
Q  294 gtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttt 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||  | |  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29656597 gtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttttcttgtcaaacgagcttaaaagctataaggtaagagctaaaagctcttt 29656696  T
Q  394 tttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    ||||||  | |||||||||||||    
T  29656697 tttgggtgttaccaaacagaccc 29656719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 202 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 52713678 - 52713559
Alignment:
Q  202 taaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcg 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||| | |    
T  52713678 taaaataataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagttataagctataagctcaaacgctacttagaatagtgtcttaaaaataacttataagtttg 52713579  T
Q  295 tgaaataagctataagctcg 314  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  52713578 tgaaataagttataagctcg 52713559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 310
Target Start/End: Original strand, 8716885 - 8716993
Alignment:
Q  202 taaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 301  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||   ||||||||  |||||||    
T  8716885 taaaataataagggtagaaatggaagaaaaaatgataaactataagctcaaacactacttgaaatagcctctggaaaataaactataagcttttgaaata 8716984  T
Q  302 agctataag 310  Q
    |||||||||    
T  8716985 agctataag 8716993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 305 - 382
Target Start/End: Original strand, 24954271 - 24954348
Alignment:
Q  305 tataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24954271 tataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacattgcttttttgatcaaacgagcttataagctataaactataagct 24954348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31953330 - 31953213
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  31953330 aaataataaaggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttgaaataatgtctaaaaaatagtttataaagtcgtgaaataag 31953231  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaa 321  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  31953230 ctataagtttgtggtgaa 31953213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 53224410 - 53224309
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||  |||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  53224410 tttagttagaataataagggtaaatctggaattaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataaactcgt 53224311  T
Q  296 ga 297  Q
    ||    
T  53224310 ga 53224309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 385
Target Start/End: Original strand, 29656720 - 29656843
Alignment:
Q  262 ggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagctt 361  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     || |||||||| ||  ||   ||||||||||||    
T  29656720 ggaatagcttctgaaaaataaattattagctcgtgaaataagctataagctcatggcgaaaaagtgttaacaaacagaactttttctgtcaaacgagctt 29656819  T
Q  362 ataagctataagctaaaagctaaa 385  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  29656820 ataagctataagctaagagctaaa 29656843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Original strand, 38048854 - 38048965
Alignment:
Q  212 agggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagc 311  Q
    |||| |||| || ||||| | |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||     
T  38048854 agggcaaaattgaaagaagaaatgataagctataaactcaaatgctatttggaatagcgtctgaaaaatagtttataaactcgtgaaataaattataagt 38048953  T
Q  312 tcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||| ||||||    
T  38048954 tcgtgatgaaaa 38048965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 36008019 - 36008152
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||             ||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  36008019 ataagctataaactcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaacagctt-------------ataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 36008105  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    ||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36008106 cagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 36008152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 39068996 - 39068868
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||| ||||||| |||||| |||| | |||||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||    
T  39068996 ataagggtaaaagtggacgaaaaaacaataagttataagatcaaacgttacttgaaatatcgtctgaaaaataagttataaactcctgaaataagttata 39068897  T
Q  309 agctcgtggtgaaaagacagtaccaaaca 337  Q
    ||||| | || ||| ||||||||||||||    
T  39068896 agctcattgtaaaaggacagtaccaaaca 39068868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 296
Target Start/End: Original strand, 42124680 - 42124740
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  42124680 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaagatagtttataagctcgtg 42124740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Original strand, 3932300 - 3932371
Alignment:
Q  299 ataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctat 370  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3932300 ataagctgtaagcccgtggtgaaaaaacattaccaaacagagcttttttgatcaaacgagcttataagctat 3932371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 305 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17715658 - 17715579
Alignment:
Q  305 tataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 384  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17715658 tataagctcgtggtgaaaaaccattaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagctaa 17715579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 40119996 - 40119903
Alignment:
Q  210 taagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctata-------agctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  40119996 taagggtaaaagtggaagaaaatatgataagctataggctacaagctcaaatgctacttggaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtg 40119903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1031453 - 1031324
Alignment:
Q  213 gggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 312  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||  ||  || |||||| |||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1031453 gggtaaaaattgtagaaaagatgataagctgtaagctcaaacaatatctgaaatagcgtctg-aaaataagttataaactcgtaaaataagctataagct 1031355  T
Q  313 cgtggtgaaaagacagt-accaaacagagct 342  Q
    |||  | ||||| |||| |||||||||||||    
T  1031354 cgttataaaaagccagtgaccaaacagagct 1031324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 2320214 - 2320099
Alignment:
Q  166 tgttttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaa 265  Q
    ||||||||  ||||||| |||||  || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| ||| |     
T  2320214 tgttttaaattataaagagtaaacatgagttttgattaaaatgataaggataaaaattgaagaaaaagtgataagttataaggtcaaacgctatttgaat 2320115  T
Q  266 tagcttctgaaaaata 281  Q
    || | |||||||||||    
T  2320114 tatcgtctgaaaaata 2320099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 398
Target Start/End: Original strand, 19169164 - 19169213
Alignment:
Q  349 atcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19169164 atcaaacgagcttataagctataagttaagagctaaaagctcttttttgg 19169213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 370
Target Start/End: Original strand, 42124729 - 42124794
Alignment:
Q  305 tataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctat 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  42124729 tataagctcgtggtgaaaaaacattaccaaacatagcttttttggtcaaacgagcttataagctat 42124794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37337782 - 37337710
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37337782 ataaactataagttcaaacgctacttgaagtagcttatgaaaaatagcttataagtacctgaaataagctata 37337710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 339
Target Start/End: Original strand, 36486386 - 36486489
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||  || |||||||||   | |||||||    
T  36486386 ataagctataagttcaaacgttacttaaaatagcttatgaaaaatagtttataagctcataaaataaactataaattcatggtgaaaaagtattaccaaa 36486485  T
Q  336 caga 339  Q
    ||||    
T  36486486 caga 36486489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 45520135 - 45520089
Alignment:
Q  352 aaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgg 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45520135 aaacgagcttataagctataagctaagagctaaaaactcttttttgg 45520089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26443516 - 26443389
Alignment:
Q  175 atataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaata 267  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||  |||  |||       |||| |||||||| ||||| |||||| | ||    
T  26443516 atattaagggtaaaagtggattttaattaaaataataaaggtaaaattggaattaaaagtgagacgttgtaagttataagcttaaacgttacttgaagta 26443417  T
Q  268 gcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26443416 gcttttgaaaaatagtttataagctcgt 26443389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 382
Target Start/End: Original strand, 33005222 - 33005275
Alignment:
Q  329 taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33005222 taccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 33005275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 26443399 - 26443288
Alignment:
Q  305 tataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaa 404  Q
    ||||||||||| || ||||  |  |||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||   | |    
T  26443399 tataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaacagaattttttttatcaaacgagcttataagctatctgctataagctataagctcttttttggatgtta 26443300  T
Q  405 ccaaacagaccc 416  Q
    ||||||||||||    
T  26443299 ccaaacagaccc 26443288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 271
Target Start/End: Original strand, 35842610 - 35842645
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35842610 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 35842645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 280
Target Start/End: Original strand, 3932183 - 3932294
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatg-------ataagctataagctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||       |||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  3932183 tataatgggtaaaattggattttagataaaataataagggtaaaaatgaaagaaaatatgataagctataagctataagctcaaatgctacttgaaataa 3932282  T
Q  269 cttctgaaaaat 280  Q
    | | ||||||||    
T  3932283 cgtttgaaaaat 3932294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12929053 - 12928980
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaa 253  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| || |||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  12929053 aagggtaaaagtgggttttgctaaaaataataagggtagaagtggaagaaatattgataagttataagctcaaa 12928980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 323
Target Start/End: Original strand, 35842638 - 35842683
Alignment:
Q  278 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  35842638 aatagcttataagctcgcgaaataatctataagctcatggtgaaaa 35842683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 279
Target Start/End: Original strand, 20530804 - 20530847
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  20530804 ataagctataagctcaaaagctacttggaataacttctcaaaaa 20530847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Original strand, 32948184 - 32948271
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||  || | ||||||| ||||| ||| || ||||||    
T  32948184 ataaactataagctcaaacgctatttagaatagcgtctgaaaaatactttataatatcataaaataagatataaactcatgatgaaaa 32948271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 13054486 - 13054536
Alignment:
Q  212 agggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttg 262  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13054486 agggtaaaaatgagagaaaatatgataagttataagctcaaaagctacttg 13054536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 230
Target Start/End: Original strand, 32948110 - 32948164
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaa 230  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32948110 tataaggggtaaaaatggattttaaataaaataataagggtaaaagtggaagaaa 32948164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38489396 - 38489366
Alignment:
Q  345 tttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38489396 tttgatcaaacgagcttataagctataagct 38489366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 261
Target Start/End: Original strand, 44375717 - 44375802
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctactt 261  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||  ||||||||||||| || || ||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||    
T  44375717 tataaaagataaaaatggattttagataaaatgataaggatataattggaagaaaagataacaagttataagttcaagcgctactt 44375802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 292
Target Start/End: Original strand, 49239153 - 49239276
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaaga-------tgataagctataagctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||| ||||| |||| |       | |||| ||||||| ||||||| |||||  |||||    
T  49239153 tataaagggtaaaaatggatttcgattaaaatagtaagggtaaaagtggaaaaaaaaacaataaattataaactataagttcaaacgttacttataatag 49239252  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagct 292  Q
    | |||||||||||| |||||||||    
T  49239253 cgtctgaaaaatagtttataagct 49239276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 368 - 396
Target Start/End: Original strand, 25440610 - 25440638
Alignment:
Q  368 tataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25440610 tataagctaaaagctaaaagctctttttt 25440638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 279
Target Start/End: Original strand, 31624344 - 31624384
Alignment:
Q  239 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  31624344 agctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 31624384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 48953183 - 48953143
Alignment:
Q  239 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  48953183 agctataagctcaaaagctacttgaaatagcttcttaaaaa 48953143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 89)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 204 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 5039951 - 5039738
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5039951 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 5039852  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    ||||||||||  ||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5039851 ctataagctcacggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttt 5039752  T
Q  404 accaaacagaccct 417  Q
     |||||||||||||    
T  5039751 cccaaacagaccct 5039738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 236 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 3377536 - 3377349
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  3377536 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 3377437  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagtgtt 424  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  3377436 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-gggttaaccaaacagacccatagtgtt 3377349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 204 - 418
Target Start/End: Original strand, 4038305 - 4038518
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4038305 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataacttataagctcgtgaaataag 4038404  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4038405 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttatcaaacgagcttgtaagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-gggtta 4038503  T
Q  404 accaaacagaccctt 418  Q
    |||||||| ||||||    
T  4038504 accaaacaaaccctt 4038518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 236 - 418
Target Start/End: Original strand, 4453520 - 4453702
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  4453520 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 4453619  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 418  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4453620 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagagcctt 4453702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16487026 - 16486846
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  16487026 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 16486927  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16486926 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-gggttaaccaaacagaccct 16486846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 425
Target Start/End: Original strand, 38579005 - 38579194
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  38579005 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 38579104  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagtgttt 425  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  38579105 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagttcttttttagggttaaccaaacagagcctaagtgttt 38579194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 650777 - 650956
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  650777 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 650876  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  650877 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagct-aaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 650956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21865391 - 21865210
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  21865391 ataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 21865292  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21865291 cagagcttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 21865210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Original strand, 28382677 - 28382854
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  28382677 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 28382776  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28382777 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctactttttggggttaaccaaacaga 28382854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 8688959 - 8689138
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  8688959 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 8689058  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8689059 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctc-tttttggggttaaccaaacagaccc 8689138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Original strand, 2546321 - 2546504
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  2546321 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggttaaaatttgttaccaaa 2546420  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  2546421 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtttctcaaacagaccctta 2546504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 201 - 417
Target Start/End: Original strand, 6760566 - 6760782
Alignment:
Q  201 ttaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6760566 ttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaat 6760665  T
Q  301 aagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgggg 400  Q
    ||||||||||||| |||| ||||     ||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  6760666 aagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgag 6760765  T
Q  401 ttaaccaaacagaccct 417  Q
    || ||||||||||||||    
T  6760766 tttaccaaacagaccct 6760782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 201 - 419
Target Start/End: Original strand, 41796704 - 41796922
Alignment:
Q  201 ttaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796704 ttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 41796803  T
Q  301 aagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgggg 400  Q
    ||||||||||||| |||| ||||     ||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||    
T  41796804 aagctataagctcatggtcaaaaagtgttacgaaacagagctttttttataaaacgagcttataaactataagctaagagctaaaagctctttttattgg 41796903  T
Q  401 ttaaccaaacagaccctta 419  Q
    || ||||||||||||||||    
T  41796904 tttaccaaacagaccctta 41796922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 204 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 43135793 - 43135582
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43135793 aaataataagggtaaaattcaaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 43135694  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| || ||||||     || |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  43135693 ctataagctcatgatgaaaaagtgttatcaaacagagctttttttatcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggg--ta 43135596  T
Q  404 accaaacagaccct 417  Q
    | ||||||||||||    
T  43135595 agcaaacagaccct 43135582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 9887136 - 9886956
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  9887136 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttatgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 9887037  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9887036 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-aggttaaccaaacagaccct 9886956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 13111739 - 13111920
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtacc-aa 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||| ||    
T  13111739 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 13111838  T
Q  335 acagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    ||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  13111839 acagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctattttttggggtttcccaaacagaccc 13111920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Original strand, 36712533 - 36712709
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  36712533 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 36712632  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  36712633 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-tggataaccaaacaga 36712709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 8815357 - 8815174
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  8815357 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 8815258  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttag 420  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  8815257 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaggctctttttt-gagttaaccaaatagacccttag 8815174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Original strand, 40024939 - 40025122
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  40024939 ataagctataagctcaaaggctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 40025038  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||| ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  40025039 cagaactttttttgtcaaacgagcttatatgctataagctaaaagctaaaagctcttttttggagtttcccaaacagaccctta 40025122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41322900 - 41322740
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  41322900 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 41322801  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41322800 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagataaaagctaaaagctctttttt 41322740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 176 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24020090 - 24019895
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||  |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24020090 tataatgggtaaaattggtttttagataaaataataatggtataaatggaataaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 24019991  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctata 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   || ||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  24019990 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggttagagatcattaccaaacaaagctttttttgtcaaacgagcttataagctata 24019895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 196 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 29515024 - 29514801
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 288  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||  |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29515024 tttaaataaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 29514925  T
Q  289 agctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  29514924 agctcgtgaaataagctataagctcttggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttttttg-tcaaacgagct-------tataagctaaaagctaaaagc 29514833  T
Q  389 tcttttttggggttaaccaaacagacccttag 420  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29514832 tcttttttggggttaaccaaatagacccttag 29514801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 36999633 - 36999451
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  36999633 ataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 36999534  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  36999533 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctctttttt-tggtttcccaaacagaccctta 36999451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 196 - 393
Target Start/End: Original strand, 4385482 - 4385679
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4385482 tttaattgaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttgaaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgt 4385581  T
Q  296 gaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttt 393  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||     ||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4385582 gaaataagctataaactcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttt 4385679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 15521623 - 15521470
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  15521623 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagttttaccaaa 15521524  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 389  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15521523 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 15521470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 37356313 - 37356152
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  37356313 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 37356214  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37356213 cagagctttttttggtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaaactctttttt 37356152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 43507559 - 43507705
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||    
T  43507559 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaa 43507658  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43507659 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 43507705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 2266149 - 2266329
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  2266149 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 2266248  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    ||||| |  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||  |||||||||||||    
T  2266249 cagagttttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaag-tttttttttgggtttcccaaacagaccct 2266329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 26911655 - 26911475
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  26911655 ataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 26911556  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
     |||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  26911555 gagagtttttttg-tcaaacgagcttataagctataagttaagagctaaaagctcttttttgggtgttaccaaacagaccct 26911475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 204 - 381
Target Start/End: Original strand, 31616351 - 31616528
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31616351 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 31616450  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagc 381  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31616451 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaaagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagc 31616528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 157 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15250335 - 15250095
Alignment:
Q  157 taataaatgtgttttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataa-------gct 249  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||       |||    
T  15250335 taataagtgtgtttaaatatataaggggtaaatgtgggttttaattaaaatgataagggtagaaatggaacaaaacatgacaagctataaactataagct 15250236  T
Q  250 caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttga 349  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||  |  |||      
T  15250235 caaacgctacttggaatagcgtctgaaaaataacttataagctcgagaaataagctataagctcgtggtgaaagaccattatcaaacagatttttttttg 15250136  T
Q  350 tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc 390  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  15250135 tcaaacgaacttataagctatctgctataagctataagctc 15250095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 17263750 - 17263896
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||    
T  17263750 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaacatgttaccaaa 17263849  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17263850 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctaaaagctaaaagct 17263896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 420
Target Start/End: Original strand, 24402049 - 24402226
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  24402049 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 24402148  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttag 420  Q
    |||||||  |||  |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  24402149 cagagctttttttgtcaaacgagct-------tataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagacccttag 24402226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Original strand, 10839577 - 10839761
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||     |||||||    
T  10839577 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctagtgaaataagatataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 10839676  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    |||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||| ||||    
T  10839677 cagagctttttttgtcaaacgagtttataagctataagctaaaagctaaaagttctttttt-tggtttcccaaacagacccgtagt 10839761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39167895 - 39167756
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  39167895 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 39167796  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39167795 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 39167756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 201 - 384
Target Start/End: Original strand, 40869321 - 40869504
Alignment:
Q  201 ttaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40869321 ttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaat 40869420  T
Q  301 aagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 384  Q
    ||||||||||||| |||||||||     ||||||||||| ||  |||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40869421 aagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaatgagcttataaactataagctataagctaa 40869504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 236 - 384
Target Start/End: Original strand, 10393032 - 10393180
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  10393032 ataagctataaactcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 10393131  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 384  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10393132 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagctaa 10393180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 165 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4056112 - 4055951
Alignment:
Q  165 gtgttttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagct-------caaacgct 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||       ||||||||    
T  4056112 gtgttttaatatataaagggcaaatgtgggttttaattaaaatgataaaggtaaaaatgaaataaaacatgataagctataagctataagttcaaacgct 4056013  T
Q  258 acttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtg 319  Q
    | |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4056012 atttggaatagtgtctgaaaaatagctaataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtg 4055951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 34885035 - 34884801
Alignment:
Q  156 gtaataaatgtgttttaatatataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaa-tggaagaaaagatgataagctataagctcaaac 254  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  34885035 gtaataaaggtgttttaatatttaaaggttaaagttaggttttaattaaaattataagggtaaaaaatggaagaaaaaatgagaagctataagctgaaac 34884936  T
Q  255 gctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaa 354  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  |  || ||||||||| |  |||  |||||    
T  34884935 actacttggaatagagtctgaaaaataggctataagctcgtgaaataaactataaactcgtggtggaaaacctttatcaaacagagttttttttgtcaaa 34884836  T
Q  355 cgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 389  Q
    | ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  34884835 caagcttataatctatcagctataagctataagct 34884801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 377
Target Start/End: Original strand, 7400388 - 7400529
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  7400388 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 7400487  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
    |||||||  |||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7400488 cagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataaactaa 7400529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 13527901 - 13528079
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||| ||||||||||    |||| ||    
T  13527901 ataagctataagttcaaacgttacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataaacttgtgaaataagttataaactcatggtgaaaaggtgttaccgaa 13528000  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  13528001 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctttttttt--ggttaaccaaacagaccc 13528079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 44275806 - 44275630
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||    
T  44275806 ataagctataagctcaaacgctaattggaataacttctgaaaaatagattataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtcaaaaagtgttaccaaa 44275707  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    || |  |  |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  44275706 cataatttttttg-tgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttaggtttaccaaacaga 44275630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 18212223 - 18212083
Alignment:
Q  277 aaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagcta 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  18212223 aaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaggta 18212124  T
Q  377 aaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18212123 aaagctaaaagctcctttttggggttaaccaaacagaccct 18212083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 415
Target Start/End: Original strand, 38880779 - 38880959
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  38880779 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaa 38880878  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacc 415  Q
    |||| | |  |||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  || ||||||||||||    
T  38880879 cagaacttttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagttaaaagctctttttttgaatttaccaaacagacc 38880959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 397
Target Start/End: Original strand, 6232277 - 6232438
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     |||||||    
T  6232277 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatatcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 6232376  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttg 397  Q
    ||||     |||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6232377 cagaatattttttgtcaaacgagcttataagttataagctaagagctaaaagctcttttttg 6232438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16669218 - 16669117
Alignment:
Q  214 ggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctc 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16669218 ggtaaaaatggaataaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctataagctc 16669119  T
Q  314 gt 315  Q
    ||    
T  16669118 gt 16669117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 176 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38843046 - 38842838
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||       ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  38843046 tataaagggtaaacatgaattttaattaaaataatatgggtaaaaatgggataaaatatgagaagttataagctataagttcaaacgctacttgaaatag 38842947  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagct 368  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   | |||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||||| ||    
T  38842946 cttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtgaaaaagtattaccaaacagagttttttttatcaaacgaacttataaact 38842847  T
Q  369 ataagctaa 377  Q
    |||||||||    
T  38842846 ataagctaa 38842838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 177 - 382
Target Start/End: Original strand, 23356915 - 23357128
Alignment:
Q  177 ataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagc 269  Q
    ||||||||||||  ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||       |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23356915 ataaagggtaaatttgacttttagttaaaataataagggtaaaaatggaacaaaagataaaaagctaaaagctataagctcagacgctacttgaaatagc 23357014  T
Q  270 ttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaga-cagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataag-c 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||| |    
T  23357015 ttctgaaaaatagcatataagctcgtgaaataagctataagctcgtggt-aagagagcattaccaaacatagctttttttgtcaaacgagcttataagcc 23357113  T
Q  368 tataagctaaaagct 382  Q
    ||||||||| |||||    
T  23357114 tataagctataagct 23357128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 178 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2221598 - 2221401
Alignment:
Q  178 taaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagct-------caaacgctacttggaatagct 270  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| |       |||||| |||||||||||||     
T  2221598 taaagggtaaaaatggattttagataaaataataagggtaaaataggaagaaaaaatgataagttataagttataagttcaaacgttacttggaatagcg 2221499  T
Q  271 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagct 368  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  2221498 tctgaaaaatagcttagaagctcgtgaaataaactataaactcatggtgaaaagacattaccaaacaaaacttcttttatcaaacgagcttataagct 2221401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42132851 - 42132671
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| || ||  |||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42132851 tttagttagaataataagggtaaaactgtaattaaaagtgagaagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 42132752  T
Q  296 gaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||    ||||||||||| | |  ||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  42132751 gaaataagctataagctcatgatgaaaaggtgttaccaaacagaacttttttttatcaaacaagtttataagctataagct 42132671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 196 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2759015 - 2758896
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  2759015 tttagttaaactaataagggtaaaaatggaataaaagatgataaattataagctcaaacgctacttggaatagcgtctaaaaaatagcttataagctcat 2758916  T
Q  296 gaaataagctataagctcgt 315  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  2758915 gaaataagttataagctcgt 2758896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 369
Target Start/End: Original strand, 7213664 - 7213791
Alignment:
Q  242 tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | || |||||||||     
T  7213664 tataagcacaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtattatcaaacagagt 7213763  T
Q  342 taatttgatcaaacgagcttataagcta 369  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  7213764 tttttttatcaaacgagcttataagcta 7213791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 10728021 - 10727812
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataag-------ctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 288  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10728021 tttaaataaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagtttttgaaaaatagcttata 10727922  T
Q  289 agctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagc 388  Q
    || |||||||||||||||||||||  || ||||||     || |||||||| ||  ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  10727921 agttcgtgaaataagctataagcttatgatgaaaaagtgttatcaaacagaactttttttatcaaacgggctaataagctataagctaaaagttaaaaac 10727822  T
Q  389 tcttttttgg 398  Q
    ||||||||||    
T  10727821 tcttttttgg 10727812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 180 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25071577 - 25071436
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttc 272  Q
    ||||||| || ||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||    
T  25071577 aagggtataaatggtttttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagtttc 25071478  T
Q  273 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25071477 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcg 25071436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43285794 - 43285675
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43285794 aaataataagggtaaaagtagaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcatgaaataag 43285695  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  43285694 ctataagctcatggtgaaaa 43285675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 176 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13761960 - 13761842
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  13761960 tataatgggtaaaattggtttttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttgg--taacttctga 13761863  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13761862 aaaatagcttataagctcgtg 13761842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 180 - 382
Target Start/End: Original strand, 5520002 - 5520211
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagcta-------taagctcaaacgctacttggaatagcttc 272  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||||||       ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  5520002 aagggtaaacgtgggttttacttaaagtggtaagggtataaatggaataaaatatgataagctatatgctataagctcaaacgctatttgtaatagcatc 5520101  T
Q  273 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataa 372  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||||  |  ||| |||||||| |  |||   ||||||||||||||||||||||    
T  5520102 tgaaaaatagcttataaactcataaaataagctataagctcgttgtaaaaaatcgttactaaacagagtttttttttacaaacgagcttataagctataa 5520201  T
Q  373 gctaaaagct 382  Q
    |||| |||||    
T  5520202 gctataagct 5520211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 414
Target Start/End: Original strand, 7823481 - 7823722
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaa-----gatg--ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttc 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||  |||     ||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  7823481 aagggtaaaagtggattttaattaaaataataagggtaaaactagaattaaaagtgagatgctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagctta 7823580  T
Q  273 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataa 372  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||| ||||  |  |||  ||| ||||| |||||||||||      
T  7823581 taaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctacaagctcgttgtaaaaagccattatcaagcagaattttttttgtcagacgagtttataagctatcc 7823680  T
Q  373 gctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagac 414  Q
    |||| |||||  |||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  7823681 gctataagctctaagctcttttttaggtgttaccaaacagac 7823722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8340123 - 8339963
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||| || ||||||     |||||||    
T  8340123 ataagctttaagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataaattcgtaaaataaactataagctcatgatgaaaaagtgttaccaaa 8340024  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||| ||  |||  |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8340023 cagaacttttttcgtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaagctctttttt 8339963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Original strand, 8070617 - 8070704
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  8070617 ataaactataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaa 8070704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 416
Target Start/End: Original strand, 6153427 - 6153625
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||             |||||    
T  6153427 aaataataagggtaaaattgaaagaaaaaatgagaagctataagctcaaacactacttggaataacttctgaaaaatagctt-------------ataag 6153513  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||| ||||     ||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |     
T  6153514 ctataagctcatggtaaaaaagttttaccaaacaaaacttttttg-tcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttggatgtt 6153612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 6807586 - 6807492
Alignment:
Q  187 aaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaata 281  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  6807586 aaagtgggttttagataaaataataagggtaaaattggaagaaaaaatgataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaata 6807492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 211 - 308
Target Start/End: Original strand, 6222611 - 6222708
Alignment:
Q  211 aagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6222611 aagggtaaagatgaaagcaaaaatgataagctataagttcaaatgctgcttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 6222708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 204 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18710346 - 18710257
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 293  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18710346 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctc 18710257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 211 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41877908 - 41877821
Alignment:
Q  211 aagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaa 298  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41877908 aagggtaaagattgaagaaaaaatgataagctataagctcaaacactacttgaaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaa 41877821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 309
Target Start/End: Original strand, 2047318 - 2047391
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2047318 ataagctataagctcaaacgctacttagaataacttctgaaaaatagcttataaactcatgaaataagctataa 2047391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 237 - 321
Target Start/End: Original strand, 9053128 - 9053212
Alignment:
Q  237 taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||    
T  9053128 taagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaagaatagtttataagctcgtgaaataaactattagttcatggtgaa 9053212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37674595 - 37674482
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||     
T  37674595 aaataataaggataaaagtggaagaaaaagtgagaagctataaactcaaacgctacttggaatagcgtctaaaatatagtttacaagctcgtgaaataaa 37674496  T
Q  304 ctataagctcgtgg 317  Q
     ||||| |||||||    
T  37674495 ttataaactcgtgg 37674482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 599035 - 598956
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgt 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||    
T  599035 ataaactataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagcttttgaaataaactataaactcgt 598956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 296
Target Start/End: Original strand, 13351569 - 13351660
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  13351569 aaataataagggtaaaattgaaagaaaaaataagaagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaatag-ttataaactcgtg 13351660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 329 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18710241 - 18710150
Alignment:
Q  329 taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||    
T  18710241 taccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctctttttt-tagtttcccaaacagacccttagt 18710150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3337263 - 3337166
Alignment:
Q  184 gtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaata 281  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||   || ||| |||| | |||||||||||    
T  3337263 gtaaaaatggattttagttaaagtgataagggtgaaaatgaaataaaagatgataagctataagctcaaatattatttgaaataacgtctgaaaaata 3337166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 313
Target Start/End: Original strand, 33850066 - 33850198
Alignment:
Q  181 agggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaat 280  Q
    ||||||||| |||  |||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | || | |||    
T  33850066 agggtaaaaatggactttaatcaaaatagtaaggttaaaagtggaagaaaaaacaataagctataaactcaaacgctacttgaaatagcgtatggagaat 33850165  T
Q  281 agcttataagctcgtgaaataagctataagctc 313  Q
    |   ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  33850166 aagctataaactagtgaaatacgctataagctc 33850198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7569908 - 7569853
Alignment:
Q  238 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7569908 aagctataagctcaaacgttacttaaaataacttctgaaaaatagcttataagctc 7569853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39675163 - 39675089
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataag 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  39675163 ataagttataagctcaaacgctacttgaagcagcttttgaaaaatatcttataaactcttgaaataagttataag 39675089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 419
Target Start/End: Original strand, 8702860 - 8702901
Alignment:
Q  378 aagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8702860 aagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagagcctta 8702901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 368 - 415
Target Start/End: Original strand, 17263875 - 17263922
Alignment:
Q  368 tataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  17263875 tataagctaaaagctaaaagctctttttttgggttttccaaacagacc 17263922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 293
Target Start/End: Original strand, 7511644 - 7511764
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatg-------ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttc 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||  |||  ||       |||||||||||||||||| ||||||   | ||||||     
T  7511644 aagggtaaaagtggattttaattaaaataataagagtaaaactgaaattaaaagtgtgacgctataagctataagctcaaatgctactctaagtagcttt 7511743  T
Q  273 tgaaaaatagcttataagctc 293  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7511744 tgaaaaatagcttataagctc 7511764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 293
Target Start/End: Original strand, 7515928 - 7516048
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatg-------ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttc 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||  |||  ||       |||||||||||||||||| ||||||   | ||||||     
T  7515928 aagggtaaaagtggattttaattaaaataataagagtaaaactgaaattaaaagtgtgacgctataagctataagctcaaatgctactctaagtagcttt 7516027  T
Q  273 tgaaaaatagcttataagctc 293  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7516028 tgaaaaatagcttataagctc 7516048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 313
Target Start/End: Original strand, 2689059 - 2689143
Alignment:
Q  228 aaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctc 313  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  2689059 aaaaaatgataagttataagttcaaacgctacttgaaatagcttttggaaaataaactat-agcttctgaaataagctataagctc 2689143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 370
Target Start/End: Original strand, 13351649 - 13351714
Alignment:
Q  305 tataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctat 370  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  13351649 tataaactcgtggtggaaaaacattaccaaacagaacttttttaatcaaacgagcttataagctat 13351714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 13761829 - 13761777
Alignment:
Q  329 taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13761829 taccaaacagagcttttttg-tcaaacgagcttataagctataagctataagct 13761777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 7569816 - 7569768
Alignment:
Q  349 atcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||    
T  7569816 atcaaacgagcttataagctataagctgagagttaaaagctcatttttg 7569768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 280
Target Start/End: Original strand, 12738544 - 12738620
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaat 280  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||| |||||||  |||||| | ||||||||    
T  12738544 aaataataagggtaaaaatggaataaaaaatggtaagttataaactcaaatgctacttaaaatagcgtatgaaaaat 12738620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2757383 - 2757312
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataag 247  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  2757383 tataatgggtataagtgaattttagataaaataataagggtaaaaatgaaagaaaaaatgataagttataag 2757312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 279
Target Start/End: Original strand, 44525930 - 44525973
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  44525930 ataagctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 44525973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10361546 - 10361481
Alignment:
Q  239 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagct 305  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  10361546 agctataagctaaaaaactacttgaaatagcttcttaaaaaaag-ttataagctcgtgaaaaaagct 10361481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 393
Target Start/End: Original strand, 13564523 - 13564564
Alignment:
Q  352 aaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttt 393  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  13564523 aaacgagcttataagctataagttaagagttaaaagctcttt 13564564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 350 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22375987 - 22375955
Alignment:
Q  350 tcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22375987 tcaaacgagcttataagctataagctataagct 22375955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 81)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 204 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 36436332 - 36436117
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36436332 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 36436233  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36436232 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacatagcttttttg-tcaaacgagcttataagatataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 36436134  T
Q  404 accaaacagacccttag 420  Q
    |||||||||||||||||    
T  36436133 accaaacagacccttag 36436117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 204 - 417
Target Start/End: Original strand, 42375759 - 42375970
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42375759 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 42375858  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     |||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42375859 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagtttttttg-tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-gggtta 42375956  T
Q  404 accaaacagaccct 417  Q
    |||||||| |||||    
T  42375957 accaaacataccct 42375970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 40637168 - 40637349
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     | |||||    
T  40637168 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttgccaaa 40637267  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    ||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40637268 cagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgaggttaaccaaacagaccct 40637349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 204 - 399
Target Start/End: Original strand, 47587081 - 47587275
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47587081 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 47587180  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggg 399  Q
    |||||||||| ||||||||||    |||||||||||| |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47587181 ctataagctcatggtgaaaag-tgttaccaaacagagttttttttatcagacgagtttataagctataagctaaaagctaaaatctcttttttggg 47587275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21742119 - 21741937
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  21742119 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttttaagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaa 21742020  T
Q  336 cag-agctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    ||| |  |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21742019 cagaatttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaatctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 21741937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Original strand, 36246384 - 36246560
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  36246384 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 36246483  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  36246484 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctacttttt-gggttaaccaaacaga 36246560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 43134551 - 43134371
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  43134551 ataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaa 43134452  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43134451 cagagcttttttg-tgaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttaccaaacagaccct 43134371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 43254250 - 43254069
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  43254250 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 43254151  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||    
T  43254150 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttttagtttcccaaacagaccct 43254069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 47470970 - 47471150
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||    
T  47470970 ataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaa 47471069  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47471070 cagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaacgctctttttt-gggttaaccaaacagaccct 47471150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Original strand, 42587391 - 42587551
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  42587391 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 42587490  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42587491 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 42587551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Original strand, 45686924 - 45687084
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  45686924 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 45687023  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45687024 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 45687084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 418
Target Start/End: Original strand, 48313432 - 48313613
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     ||||||     
T  48313432 ataagctataagctcaaaagctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaat 48313531  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 418  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48313532 cagagcttttttg-tcaaacgaacttataaactataacctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 48313613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 9487554 - 9487369
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||     |||||||    
T  9487554 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatagtaaaaaagtgttaccaaa 9487455  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    |||| ||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  9487454 cagaactttttttgtcagacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggagttaaccaaaccgaccgttagt 9487369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Original strand, 10312037 - 10312197
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  10312037 ataagatataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 10312136  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10312137 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 10312197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 21254705 - 21254885
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||     |||||||    
T  21254705 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatagtgaaaaagtgttaccaaa 21254804  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21254805 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctctttttt-aagttaaccaaacagaccct 21254885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 204 - 418
Target Start/End: Original strand, 21313765 - 21313981
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21313765 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagcttgtgaaataag 21313864  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagc--taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggt 401  Q
    |||||||||| |||||||||     |||||||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||      
T  21313865 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaagagctaaaagttcttttttgggta 21313964  T
Q  402 taaccaaacagaccctt 418  Q
    | |||||||||||||||    
T  21313965 ttaccaaacagaccctt 21313981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 427
Target Start/End: Original strand, 45222081 - 45222265
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  45222081 ataagctaaaagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaa 45222180  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagtgttttt 427  Q
    |||| ||  |||  |||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45222181 cagaactttttttgtcaaacgagcttataaactat-------aagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttaatgttttt 45222265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 204 - 416
Target Start/End: Original strand, 17192418 - 17192629
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17192418 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 17192517  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||| ||| ||||||||||    ||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  |     
T  17192518 ctataaactcatggtgaaaag-tgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgtt 17192616  T
Q  404 accaaacagaccc 416  Q
    |||||||||||||    
T  17192617 accaaacagaccc 17192629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 204 - 375
Target Start/End: Original strand, 19831966 - 19832137
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19831966 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 19832065  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19832066 ctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctaaaagct 19832137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Original strand, 482990 - 483174
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  482990 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaa 483089  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    || ||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  483090 caaagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttt-aagtttaccaaacagacccttagt 483174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 31511447 - 31511271
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  31511447 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 31511348  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    ||||| |  |||  |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31511347 cagagttttttttgtcaaacgagcttataagctat-------aagctaaaagctcttttttgaggttaaccaaacagaccctta 31511271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40259004 - 40258823
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     |||||||    
T  40259004 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 40258905  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    || ||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  40258904 catagctttttctgtcaaacaagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttgggtgttaccaaacagaccct 40258823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21374780 - 21374601
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  21374780 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 21374681  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    ||||  |  |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  21374680 cagaattttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc-tttttaaggttaaccaaacaaaccc 21374601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 176 - 390
Target Start/End: Original strand, 11465987 - 11466201
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    |||||||||||||| ||| | |||   |||||  ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11465987 tataaagggtaaaaatggatattagaaaaaatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaa 11466086  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||   | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11466087 aaaatagcttataagttcgtgaaataagctataagctcatggttaaaaagtattaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctaaaagct 11466186  T
Q  376 aaaagctaaaagctc 390  Q
    | || ||| ||||||    
T  11466187 ataaactataagctc 11466201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 236 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 44743864 - 44743680
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  44743864 ataagctataaactcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 44743765  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttag 420  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||| ||| ||||    
T  44743764 cagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaagagctaaaagcttttttttgggtgttaccaaacaaacctttag 44743680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 27089664 - 27089810
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  27089664 ataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 27089763  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27089764 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 27089810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27188637 - 27188491
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  27188637 ataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 27188538  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27188537 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 27188491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 236 - 390
Target Start/End: Original strand, 27655681 - 27655835
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||   | |||||||    
T  27655681 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcttgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaa 27655780  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc 390  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  27655781 cagagctttttttatcaaacgagcttataagctaaaagctataagctataagctc 27655835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 36407375 - 36407194
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  36407375 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaa 36407276  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||| ||  |||  | |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  36407275 cagaactttttttgtgaaacgaacttataagctataagctaagagttaaaagctctttttttgggtttaccaaacataccct 36407194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 44596757 - 44596577
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  44596757 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaa 44596658  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    ||||  |  |||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  44596657 cagaattttttttgtgaaacgagcttataaactataagctaagagctaaaagctctttttttaggtttaccaaaaagaccc 44596577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34709380 - 34709206
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     ||||| |    
T  34709380 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcatggtgaaaaagtgttaccaga 34709281  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||| | ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34709280 cagagcttttttagtcaaacaaact-------tataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 34709206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 35587726 - 35587580
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     || ||||    
T  35587726 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaa 35587627  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    ||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35587626 cagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 35587580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17844758 - 17844544
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaa-----agatg--ataagctataagctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||     ||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17844758 tataaaggataaaaatggattttagataaaatattaagggtaaaaatggaagaaattttgagaagctataagctataagctcaaacgctacttagaatag 17844659  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagct 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||| ||    
T  17844658 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaatagcattaccaaacagagctttttttgtcagacgagcttataaact 17844559  T
Q  369 ataagctaaaagcta 383  Q
    |||| ||| ||||||    
T  17844558 ataaactataagcta 17844544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23029937 - 23029790
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  23029937 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaataatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagcattaccaaa 23029838  T
Q  336 cagagctaa-tttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    || |||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23029837 caaagctaattttcgtcagacgagcttataagctataagctataagct 23029790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 48832061 - 48832207
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     |||||||    
T  48832061 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcacggtgaaaaagtgttaccaaa 48832160  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48832161 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctaaaagctaaaagct 48832207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 236 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33027023 - 33026881
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  33027023 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 33026924  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaa 379  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  33026923 cagagcttttttg-tcaaaggagcttataaactataaactaaaa 33026881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 209 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 46757884 - 46757717
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  46757884 ataaggataaaaatggaagaaaatatgataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagttata 46757785  T
Q  309 agctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttga-tcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    ||||||| || ||||  |  ||||||||||||||  |||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  46757784 agctcgttgtaaaaaagcgttaccaaacagagcttttttttgtcagacgagcttataagctataagct 46757717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 204 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32168998 - 32168799
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||    
T  32168998 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagctt--------------ataagctcgtgaaataag 32168913  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |     
T  32168912 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttgggcgtt 32168813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 386
Target Start/End: Original strand, 33203676 - 33203826
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  33203676 ataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 33203775  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaa 386  Q
    |||||||  |||  ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33203776 cagagctttttttgtcaaaggaacttataaactataaactaaaagctaaaa 33203826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 40106013 - 40106159
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  40106013 ataaactataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 40106112  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40106113 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctaagagctaaaagct 40106159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Original strand, 27869510 - 27869709
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||    
T  27869510 tataatgggtaaaaatggaatttagataaaataataagggtaataatggaagaaaaaacaataagctataaactcaaacgctacttggaataacgtccga 27869609  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||   || ||| ||||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27869610 aaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagcgggtggtgaaagaccattactaaacaggactttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 27869709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1342957 - 1342777
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctata-------agctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 301  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1342957 ataaggataaaaatggaagaaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagcttctgaaata 1342858  T
Q  302 agctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||||||||| || ||||  |  ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1342857 agctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaacagagctttttttgtcagacgagcttataagctataagctataagct 1342777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 339
Target Start/End: Original strand, 22642232 - 22642362
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22642232 ataagggtaaaaatagaagaaaatatgataagctataagctcaaatgctacttagaatagcgtttaaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctata 22642331  T
Q  309 agctcgtggtgaaaagacagtaccaaacaga 339  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  22642332 agctcgtggtgaaaaaccgttaccaaacaga 22642362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 48590861 - 48590732
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  48590861 ataagctataagctcaaacgctactttgaatagcttttgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 48590762  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataa 365  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  48590761 cagagctttttttatcaaacgagcttataa 48590732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 384
Target Start/End: Original strand, 28425619 - 28425767
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||    
T  28425619 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttatgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaaagttaccaaa 28425718  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 384  Q
    || | |   |||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28425719 caaaacattttttgtcaaacgagtttataagctataagctataagctaa 28425767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 49148479 - 49148319
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     ||| |||    
T  49148479 ataaactataagctcaaacgctgcttggaatagcttctgaaaaatagctcataagctcgtgaaataagctataagctcatggtggaaaagtgttactaaa 49148380  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  49148379 cagagctttttttgtcaaaaaagcttataagctattagctaagagctaaaagctttttttt 49148319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40893519 - 40893377
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaga-cagtaccaa 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||    
T  40893519 ataagctataagctcaaacgctacttgaaataggttctaaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcgtggtaaagagatcattaccaa 40893420  T
Q  335 acagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
    ||||| ||  |||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  40893419 acagaactttttttgtcaaacgaacttataagctataaactaa 40893377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 46879532 - 46879714
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |  ||||| |    
T  46879532 ataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaga 46879631  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||| |  |||  ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||| |  | ||||||||||||||    
T  46879632 cagagcttttttttgtcagacgaacttataagctatcagctataagctataagctcctttttgtgtgttaccaaacagaccct 46879714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 176 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 35000919 - 35000773
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    ||||||||||||||  || ||| |  |||| | |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35000919 tataaagggtaaaaacggatttcagataaagtaataagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctcaaacgctacttggaatagcatctga 35000820  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaa 322  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  35000819 aaaatagtttataaacttgtgaaataagctataagctcctgatgaaa 35000773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 345
Target Start/End: Original strand, 12345075 - 12345184
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||     |||||||    
T  12345075 ataagctataagctcaaatgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcttcgtgaaaaagtgttaccaaa 12345174  T
Q  336 cagagctaat 345  Q
    ||||||||||    
T  12345175 cagagctaat 12345184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 196 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38481467 - 38481286
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 295  Q
    |||| ||| ||| |||||| ||||| |||||  |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  38481467 tttagttagaataataaggataaaactggaattaaaagtgagaagttataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttatagactcgt 38481368  T
Q  296 gaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  38481367 gaaataagctataaattcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctgtttttgtcaaacgaacttataagctataagctaa 38481286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 191 - 382
Target Start/End: Original strand, 791289 - 791487
Alignment:
Q  191 tgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagc-------tcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagc 283  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  791289 tgggttttagttaaagtggtaaggttataaatggaataaaacatgataagctataagctataagttcaaacgctacttgtaatagcatctgaaaaatagc 791388  T
Q  284 ttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||  |  || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  791389 ttataagctcataaaataagctataagttcgttgtaaaaaatcgttatcaaacagagctttttttatcaaacgagcttataaactataaactataagct 791487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 398
Target Start/End: Original strand, 19757524 - 19757686
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||  |  || ||||    
T  19757524 ataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttttgaaaaatagcttataagctcctgaattaagctataagctcgttgtaaaaaagcgttatcaaa 19757623  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgg 398  Q
    || || |  |||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  19757624 catagttttttttgtcagacgagcttataagctattagctataagttataagctcttttttgg 19757686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9485863 - 9485776
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9485863 ataagctataagctcaaatgatacttgaaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa 9485776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 255 - 374
Target Start/End: Original strand, 21316611 - 21316730
Alignment:
Q  255 gctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||     |||||||||||| |  |||| |||||    
T  21316611 gctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttatgaaataagctataagctcatagtgaaaaagtgttaccaaacagagtttttttggtcaaa 21316710  T
Q  355 cgagcttataagctataagc 374  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21316711 cgagcttataagctataagc 21316730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 45672464 - 45672362
Alignment:
Q  213 gggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| |    
T  45672464 gggtaaaaatggaataaaagatgataaactataagctcaaacgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataagttcgtaaaataaattataagtt 45672365  T
Q  313 cgt 315  Q
    |||    
T  45672364 cgt 45672362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 47584299 - 47584185
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    |||||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  47584299 tataaagggtaaacatggatttgaattaaaataataagggtaaaaatgggataaaatatgagaagctataaactcaaacgctatttggaataacttctga 47584200  T
Q  276 aaaatagcttataag 290  Q
    ||||||| |||||||    
T  47584199 aaaatagtttataag 47584185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Original strand, 36612119 - 36612256
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || ||||  |  |||||||    
T  36612119 ataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctaaaaaatagcttataaactcctgaaataagctaaaagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaa 36612218  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    || | ||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  36612219 cataact--ttttgtcagacgagcttataagctataagct 36612256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Original strand, 38531191 - 38531277
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  38531191 ataagctataagctcaaacgctacttg-aataacttctgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagctattagatcatggtgaaaa 38531277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Original strand, 33609070 - 33609143
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagct 249  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  33609070 tataaagggtaaacatgggttttaattaaaataataagggtaaaaatgggacaaaagatgataagctataagct 33609143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 242 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 48620598 - 48620448
Alignment:
Q  242 tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagc 341  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||    ||||||||| ||     
T  48620598 tatatgctcaaacgctacttgaaatagtttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataaactataaactcatgatgaaaag-tgttaccaaacaaagt 48620500  T
Q  342 taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttt 393  Q
    |  ||   |||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  48620499 tttttccgtcaaacaagtttataaactataagctaagagctaaaaactcttt 48620448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 323
Target Start/End: Original strand, 7884636 - 7884774
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    |||||||||| |||  || || |||||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  7884636 aagggtaaaactggtattcaaataaaataataagggtaaaagtggaagaaaaaaa-ataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttcacaaaaa 7884734  T
Q  280 tagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    || |||    |||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  7884735 taactt----gctcgtaaaatacgctataagttcatggtgaaaa 7884774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 39699026 - 39698930
Alignment:
Q  196 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 292  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| || ||  |||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39699026 tttagttagaataataagggtaaaattgaaattaaaagtgagaagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttgtaagct 39698930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 373
Target Start/End: Original strand, 21740154 - 21740290
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||  |  |||||||    
T  21740154 ataagctataag-tcaaacgctatttcaagtagtttctgaaaaatagcttataaacttctgaaataagctataagcttgttgtaaaaaagcgttaccaaa 21740252  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataag 373  Q
    |||||||  ||| |||| | || |||||||||||||||    
T  21740253 cagagctttttttatcagatgaacttataagctataag 21740290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24170856 - 24170793
Alignment:
Q  271 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaa 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||    
T  24170856 tctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggtgaaaaaacattaccaa 24170793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24170923 - 24170860
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 299  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24170923 ataagttataagctcaagcactacttggaataatgtctgaaaaatagcttataagctcatgaaa 24170860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 326
Target Start/End: Original strand, 22621466 - 22621556
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagac 326  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||| ||||| || |||||||    
T  22621466 ataagttataagctcaaacgctgcttgaaataatgtctgaaaaataagttatgagctcctgaaataaactataatctcgttgtaaaaagac 22621556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44072853 - 44072787
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataa 246  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||||    
T  44072853 aagggtaaaagtggattttcattaaaataataagagtaaaaatgtaataaaaaatgataaactataa 44072787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 48729635 - 48729549
Alignment:
Q  210 taagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||  ||||||   ||||||||||||    
T  48729635 taagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagttataagctcaaatgctacttgaaatagcgtctagaaaataagatataagctcgtg 48729549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21358774 - 21358734
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaa 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21358774 aagggtaaaagtggattttaattaaaataataagggtaaaa 21358734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30699665 - 30699599
Alignment:
Q  178 taaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctat 244  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||| | | |||| ||||||||||||    
T  30699665 taaagggtaaaattgggttttacttaaaatggtgagggtataaataggataaaatatgataagctat 30699599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39230027 - 39229953
Alignment:
Q  239 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctc 313  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  39230027 agctataagctcaaacactatttaaaatagtatctgaaaaataagttataagttcgtgaaataggttataagctc 39229953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40893551 - 40893513
Alignment:
Q  211 aagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagct 249  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40893551 aagggtaaagatggaagaaaaaatgataagctataagct 40893513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 41406341 - 41406276
Alignment:
Q  239 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagct 305  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||| |||||    
T  41406341 agctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa-actttataagctagtgaaaaaagct 41406276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 981488 - 981425
Alignment:
Q  241 ctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagct 305  Q
    ||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  981488 ctataagataaaaggctacttgaaatagcttctcaaaaaaagct-ataagctcgtgaaaaaagct 981425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 228 - 256
Target Start/End: Original strand, 12651080 - 12651108
Alignment:
Q  228 aaaagatgataagctataagctcaaacgc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12651080 aaaagatgataagctataagctcaaacgc 12651108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21358692 - 21358644
Alignment:
Q  275 aaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  21358692 aaaaatagtttataaactcgtgaaataagctataagtttgtggtaaaaa 21358644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 378 - 414
Target Start/End: Original strand, 27089799 - 27089835
Alignment:
Q  378 aagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagac 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27089799 aagctaaaagctcttttttggggtttcccaaacagac 27089835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33979769 - 33979729
Alignment:
Q  239 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  33979769 agctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 33979729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 279
Target Start/End: Original strand, 39709762 - 39709830
Alignment:
Q  211 aagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  39709762 aaggttaaaattggaataaaatgtgaaaagctataagctcaaaagctacttgaattagcttcttaaaaa 39709830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 349 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 47584146 - 47584118
Alignment:
Q  349 atcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47584146 atcaaacgagcttataagctataagctaa 47584118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 84)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 32382995 - 32382815
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  32382995 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 32382896  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32382895 cagaactttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 32382815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 36685962 - 36685779
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  36685962 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 36685863  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36685862 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 36685779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 176 - 382
Target Start/End: Original strand, 11100693 - 11100899
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11100693 tataaagggtaaatatgggttttagttaaaataataagggtaaagatggaagaaaaaatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctga 11100792  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11100793 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgttgtaaaaagacgttaccaaacagagctttttttgtcagacgagcttataagctataagct 11100892  T
Q  376 aaaagct 382  Q
    | |||||    
T  11100893 ataagct 11100899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 204 - 417
Target Start/End: Original strand, 4221432 - 4221644
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4221432 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 4221531  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4221532 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-gagtta 4221630  T
Q  404 accaaacagaccct 417  Q
    ||||||||||||||    
T  4221631 accaaacagaccct 4221644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 12774722 - 12774541
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  12774722 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 12774623  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12774622 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtttcccaaacagaccct 12774541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 24794118 - 24793936
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  24794118 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 24794019  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 418  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24794018 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctactttttggggttaaccaaacagagcctt 24793936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 12713458 - 12713277
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  12713458 ataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 12713359  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12713358 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtttcccaaacagaccct 12713277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 14647348 - 14647528
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  14647348 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 14647447  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14647448 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-aggttaaccaaacagaccct 14647528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19525895 - 19525710
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  19525895 ataagctataagctcaaacgctgcttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaa 19525796  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    |||||||  |||  ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19525795 cagagctttttttgtcaaacgagtttataaactataaggtaaaagctaaaagctcttttttagggttaaccaaacagacccttagt 19525710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 236 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 30299844 - 30299665
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  30299844 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 30299745  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacc 415  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30299744 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaaactctttttttgggttaactaaacagacc 30299665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Original strand, 8023975 - 8024152
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  8023975 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 8024074  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 413  Q
    |||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8024075 cagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggataaccaaacaga 8024152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Original strand, 13228464 - 13228648
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  13228464 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaa 13228563  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  13228564 cagagcttttttg-tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggagtttcccaaacagacccctagt 13228648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 2236507 - 2236687
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  2236507 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 2236606  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    ||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  2236607 cagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagaccc 2236687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 648737 - 648538
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 275  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  648737 tataaaggataaaaatggattttagataaaatattaagggtaaaaatggaagaaattttgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctga 648638  T
Q  276 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  648637 aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagcattaccaaacagagctttttttgtcagacgagcttataagctataagct 648538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Original strand, 32381665 - 32381848
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  32381665 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 32381764  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    || || |  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  32381765 catagttttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtcaaccaaacataccctta 32381848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 236 - 418
Target Start/End: Original strand, 30412603 - 30412785
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||     |||||||    
T  30412603 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtgaaaaagtgttaccaaa 30412702  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 418  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  30412703 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctttttttttgggtttcccaaacagaccctt 30412785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 236 - 418
Target Start/End: Original strand, 39744533 - 39744714
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||| |||    
T  39744533 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttacaaaa 39744632  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 418  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  39744633 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-tggtttcccaaacagaccctt 39744714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 1174930 - 1174743
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  1174930 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaa 1174831  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagtgt 423  Q
    |||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  1174830 cagaactttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgggtttaccaaacagaccctaagtgt 1174743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 1711194 - 1711375
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||     |||||||    
T  1711194 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 1711293  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  1711294 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagaccct 1711375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 5591734 - 5591553
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  5591734 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagttcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 5591635  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 418  Q
    |||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  5591634 cagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-tggtttcccaaacagaccctt 5591553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 402
Target Start/End: Original strand, 6603901 - 6604067
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |   |||||||    
T  6603901 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcacggtgaaaaaatgttaccaaa 6604000  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtt 402  Q
    |||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6604001 cagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaaactcttttttggggtt 6604067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 204 - 382
Target Start/End: Original strand, 39246796 - 39246973
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39246796 aaataataagtgtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 39246895  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39246896 ctataagctcatggtgaaaag-tgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 39246973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 204 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2671592 - 2671379
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2671592 aaataataagggtaaaattgaaagaaaaagcgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataag 2671493  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   |||     
T  2671492 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagtttttttttttagttt 2671393  T
Q  404 accaaacagaccct 417  Q
     |||||||||||||    
T  2671392 cccaaacagaccct 2671379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 10697415 - 10697230
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  10697415 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaa 10697316  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    |||||||  |||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  10697315 cagagctttttttgtgaaatgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgggtttaccaaacaaacccttagt 10697230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 238 - 419
Target Start/End: Original strand, 30774185 - 30774366
Alignment:
Q  238 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaaca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||     |||||||||    
T  30774185 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagcttatggtcaaaaagtgttaccaaaca 30774284  T
Q  338 gagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  30774285 gagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgggtttaccaaagagaccctta 30774366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 204 - 416
Target Start/End: Original strand, 13156845 - 13157057
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13156845 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaaagctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataag 13156944  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtta 403  Q
    ||||||| |  |||||||||     ||||||||||||||  |||  |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  13156945 ctataagttaatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacaaacttataagctataaggtaaaagctaaaagctcttttttggggttt 13157044  T
Q  404 accaaacagaccc 416  Q
      |||||||||||    
T  13157045 ttcaaacagaccc 13157057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Original strand, 19956299 - 19956477
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  19956299 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaa-tagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 19956397  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  19956398 cagagctttttttgttaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-aggttaaccaaagagaccc 19956477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 204 - 396
Target Start/End: Original strand, 29392066 - 29392257
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29392066 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctatttggaatagcttttaaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 29392165  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||||| |||| ||||     ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29392166 ctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagagcttttttg-tcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagctctttttt 29392257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 415
Target Start/End: Original strand, 35236658 - 35236838
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  35236658 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaa 35236757  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacc 415  Q
    |||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  35236758 cagagcttttttttatgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttttggtttaccaaacagacc 35236838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 204 - 396
Target Start/End: Original strand, 9587145 - 9587338
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9587145 aaataataagggtaaaattggaataaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 9587244  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||||| |||||||||     || |||||||| | |  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9587245 ctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacagaacttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagctaaaagctctttttt 9587338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 27130479 - 27130305
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  27130479 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 27130380  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    ||||| |  |||  ||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27130379 cagagttttttttgtcaaaagagcttataagctat-------aagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 27130305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 12363603 - 12363784
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     |||||||    
T  12363603 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 12363702  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||| | |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  12363703 cagaacttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagttaaaagctcttttct-ggattaaccaaacagaccct 12363784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 35640086 - 35639926
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   | || ||||    
T  35640086 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtgaaaaagtattatcaaa 35639987  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35639986 cagagctttttttatcaaacgagcttataaattataagttaaaaactaaaagctctttttt 35639926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 5997885 - 5998031
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     |||||||    
T  5997885 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcacggtgaaaaagtgttaccaaa 5997984  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5997985 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 5998031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3669719 - 3669527
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3669719 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctactttgaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataag 3669620  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    ||| ||| |  |||| ||||     ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3669619 ctacaagtttatggtaaaaaagtgttaccaaacagagctttttttatcaaacgaacttataaactataagctaagagctaaaagctctttttt 3669527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 384
Target Start/End: Original strand, 5381935 - 5382082
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     |||||||    
T  5381935 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagttataagctcgtggtgaaaaagtgttaccaaa 5382034  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 384  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5382035 cagagcttttttg-tcaaacgagcttataagctataagctataagctaa 5382082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 180 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16474980 - 16474771
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttc 272  Q
    ||||||| || ||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  16474980 aagggtataaatggtttttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttc 16474881  T
Q  273 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaga-cagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctata 371  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  16474880 taaaaaatagcttataatctcgtgaaataaactataagctcgtggt-aagagaccattaccaaacagagctatttttgtcaaacgagtttataagctata 16474782  T
Q  372 agctaaaagct 382  Q
    ||||| |||||    
T  16474781 agctataagct 16474771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 39275569 - 39275409
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  39275569 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaa 39275470  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39275469 cagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctatttttt 39275409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Original strand, 9160683 - 9160861
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  9160683 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 9160782  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    |||||||  |||  |||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  9160783 cagagctttttttgtcaaacgagct-------tataagttaaaagctaaaagctctttttttgggtttcctaaacagacccttagt 9160861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 35235718 - 35235892
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  35235718 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 35235817  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    ||||| |  |||  |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  35235818 cagagttttttttgtcaaacgagct-------tataagctaaaagctaaaagctcttttttgggattttccaaacagaccct 35235892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 209 - 399
Target Start/End: Original strand, 6893343 - 6893532
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    |||||||||||| | |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6893343 ataagggtaaaactagaattaaaaatgagaagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaactagtttataagctcgtgaaataagctata 6893442  T
Q  309 agctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggg 399  Q
    ||||| |||| ||||     ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6893443 agctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagagcttttttg-tcaaacgagcttataaactataagctaagagctaacagctcttttttggg 6893532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Original strand, 3037416 - 3037576
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||     |||||||    
T  3037416 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtaaaaaagtgttaccaaa 3037515  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    || | ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3037516 catacctttttttatcaaacaagcttataagctataagttaaaagctaaaagctctttttt 3037576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3670424 - 3670264
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||     |||||||    
T  3670424 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagcgcatggtcaaaaagtgttaccaaa 3670325  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    ||||| |  |||  | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3670324 cagagttttttttgtgaaacgagctcataagctataagctaagagctaaaagctctttttt 3670264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 186 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13936388 - 13936232
Alignment:
Q  186 aaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagctt 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13936388 aaaagtgggttttaattaaaataataagggtaataatggaataaaaagtgataagctataagctcaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagctt 13936289  T
Q  286 ataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagct 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |  ||||||||||||||    
T  13936288 ataagctcatgaaataagctataagctcgttgtaaaaaaccgttaccaaacagagct 13936232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Original strand, 31168978 - 31169138
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     || ||||    
T  31168978 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaa 31169077  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    ||||| |  |||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31169078 cagagttttttttgtcaaacgaacttataaactataaactaaaagctaaaaactctttttt 31169138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19347852 - 19347705
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | |||||||    
T  19347852 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaa 19347753  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19347752 cagagcttttttttatcaaacgagcttataagctaaaagctataagct 19347705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 175 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2497770 - 2497570
Alignment:
Q  175 atataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctg 274  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  2497770 atattaagggtaaaagtggaatttaattaaaataataacggtaaaaatttaataaaagatgataagttataagctcaaacgctatttagaatagcttttg 2497671  T
Q  275 aaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagc 374  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  || ||||||| |||||   |||  | | |||||||||||||||||||||    
T  2497670 aaaaataacttataagctcgtgaaataagttataatctcatggtgaaaaagcattaccaaatagagcattttttgttagacgagcttataagctataagc 2497571  T
Q  375 t 375  Q
    |    
T  2497570 t 2497570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Original strand, 11663882 - 11664042
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||     |||||||    
T  11663882 ataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataaacttatggtcaaaaagtgttaccaaa 11663981  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 396  Q
    |||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11663982 cagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttt 11664042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43402590 - 43402451
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  43402590 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 43402491  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43402490 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 43402451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 384
Target Start/End: Original strand, 26699097 - 26699245
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  26699097 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcctctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 26699196  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 384  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26699197 cagagctttatttg-tcaaacgagcttataacctataagctataagctaa 26699245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 384
Target Start/End: Original strand, 26968830 - 26968978
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  26968830 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcctctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 26968929  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 384  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26968930 cagagctttatttg-tcaaacgagcttataacctataagctataagctaa 26968978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15443602 - 15443422
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     ||||||     
T  15443602 ataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaac 15443503  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    || | ||||  |  |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  15443502 caaaactaaacttgtcaaacgaacttataagctataaactaaaagttaaaaactctttttttgggtttcccagacagaccc 15443422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15530581 - 15530442
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  15530581 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 15530482  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    || || |  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15530481 catagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 15530442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5521444 - 5521305
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  5521444 ataagctataaactcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 5521345  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    ||||  |  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5521344 cagaattttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 5521305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2178906 - 2178777
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  2178906 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 2178807  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataa 365  Q
    ||||| |  |||  ||||||||||||||||    
T  2178806 cagagttttttttgtcaaacgagcttataa 2178777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 384
Target Start/End: Original strand, 11062898 - 11063047
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||     |||||||    
T  11062898 ataaactataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 11062997  T
Q  336 cagagc-taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 384  Q
    |||||| |  |||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11062998 cagagcttttttttgccaaacgagcttataagctataagctataagctaa 11063047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Original strand, 36027982 - 36028121
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  36027982 ataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 36028081  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    ||||| |  |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  36028082 cagagttttttttgtcaaacaagcttataagctataagct 36028121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7651786 - 7651656
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  7651786 ataagctataagctcaaacactacttgaaatagcttctgaaaaatagattataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 7651687  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataag 366  Q
    ||||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  7651686 cagagttttttttatcaaacgagcttataag 7651656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4379404 - 4379317
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4379404 ataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa 4379317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 236 - 342
Target Start/End: Original strand, 22977196 - 22977302
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  22977196 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatgaaaaatagtttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaa 22977295  T
Q  336 cagagct 342  Q
    |||||||    
T  22977296 cagagct 22977302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 244 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 23920595 - 23920420
Alignment:
Q  244 taagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacag-taccaaacagagct 342  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  23920595 taagttcaaacactacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcctggtg-aaagatagttaccaaacagagct 23920497  T
Q  343 aatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttag 420  Q
    | |||  ||| |||| ||||||||||||  |||| |||||  ||||| |||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  23920496 atttttgtcatacgaacttataagctatccgctataagct-taagcttttttttaggtgttaccaaacagacccttag 23920420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 209 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13921898 - 13921784
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 308  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13921898 ataaggataaaattagaagaaaaaatgataagttataagttcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagcttttaagctcgtgaaataagttata 13921799  T
Q  309 agctcgtggtgaaaa 323  Q
    || ||||||| ||||    
T  13921798 agttcgtggtaaaaa 13921784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 313
Target Start/End: Original strand, 9627082 - 9627222
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttc 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||  |||  |||       |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9627082 aagggtaaaagtggattttaattaaaataataagagtaaaattggaattaaaagtgagacactataagttataagctcaaacgctacttgaagtagcttc 9627181  T
Q  273 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctc 313  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9627182 tgaaaaatagcttataagcttctgaaataagctataagctc 9627222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Original strand, 42323598 - 42323737
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| |  ||||| ||| ||| |||||||    
T  42323598 ataagctataagctcaaacactacttagaatagcgtctgaaaaatagcttataaactcgtaaaatatgttataaggttatggtgcaaaaacattaccaaa 42323697  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||| ||  ||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  42323698 cagaactttttttatcagacgaatttataagctataagct 42323737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7896692 - 7896599
Alignment:
Q  202 taaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  7896692 taaaataataagggtaaaaatagaagaaaagattataagctataaactcaaacgctatttgaaatagcgtttg-aaaatagcttataagctcgtg 7896599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 290
Target Start/End: Original strand, 25872187 - 25872273
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataag 290  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25872187 aaataataagggtaaaattagaagaaaaggtgagaagctataagctcaaactctacttggaatagcttctgaaaaataaattataag 25872273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 315
Target Start/End: Original strand, 32321630 - 32321732
Alignment:
Q  213 gggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 312  Q
    ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  32321630 gggtaaatatggaataaaaaattataagctataagctcaaacgttatttgaaatagagtctgaaaaataagttgtaagttcgtgaaataagctataagct 32321729  T
Q  313 cgt 315  Q
    |||    
T  32321730 cgt 32321732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 296
Target Start/End: Original strand, 4657592 - 4657652
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4657592 ataagctataagctcaaactctacttgaaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtg 4657652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6349486 - 6349426
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  6349486 ataagctataagctcaaacgctacttagaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtg 6349426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 329 - 417
Target Start/End: Original strand, 25872292 - 25872380
Alignment:
Q  329 taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  25872292 taccaaacagagctttttttgtcaaatgagcttataagctataagctacgagctaaaagctcttttttgggtgttaccaaacagaccct 25872380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4875790 - 4875711
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||| |||||| |||||    
T  4875790 ataagctataagctcaaacgctactttgaatagcttttaaaaaatagcttataaactcctaaaataaactataaactcgt 4875711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 342
Target Start/End: Original strand, 41471885 - 41472007
Alignment:
Q  221 atggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtga 320  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||||   || |||||| |||||||||||| ||| | || ||||    
T  41471885 atggaagaaaaaataataagctataagctcaaacactatttgaaatagcgtctggaaaataagctaaaagctcctgaaataagctacaagtttgttgtga 41471984  T
Q  321 aaagacag-taccaaacagagct 342  Q
    |||||| | ||||||||||||||    
T  41471985 aaagactgttaccaaacagagct 41472007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Original strand, 27005782 - 27005925
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttc 272  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| ||||  |||  |||       ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |     
T  27005782 aagggtaaaagtggattttaattcaaataataaaggtaaaaagggaattaaaagtgaaaatttataagctataagctcaaacgttacttgaaatagcgtt 27005881  T
Q  273 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtg 316  Q
    || ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27005882 tggaaaataagttataagctcttgaaataagctataagttcgtg 27005925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31408062 - 31407981
Alignment:
Q  242 tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||    
T  31408062 tataatcttaaacgctaattggaatagcgtctgacaaatagcttataagctcgtgaaataagttattaactcgtgctgaaaa 31407981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 295
Target Start/End: Original strand, 28812363 - 28812466
Alignment:
Q  194 gttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaa--gatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagc 291  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| || ||  |||||| |||||||||||  |||||| |    
T  28812363 gttttaattaaaatgatatgggttaaaatggaagaaaaataatgataagttataagctcaaacgttattttaaatagcgtctgaaaaataagttataatc 28812462  T
Q  292 tcgt 295  Q
    ||||    
T  28812463 tcgt 28812466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Original strand, 6280446 - 6280533
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  6280446 ataagctataagcttaaatgctacttgaaataacttatgaaaaatagtttataaacccgtgaaataaactataagctcatgatgaaaa 6280533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 315
Target Start/End: Original strand, 18480497 - 18480632
Alignment:
Q  180 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||| || ||  |||  ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||| |||||    
T  18480497 aagggtaaaagtggattgtcattaaaataataaggataaaactgaaattaaaagtgagacgctataagctcaaatgctacttgagatagcgtctaaaaaa 18480596  T
Q  280 tagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgt 315  Q
    ||   |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18480597 taaactataagcttgtgaaataagatataagctcgt 18480632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 11780248 - 11780118
Alignment:
Q  179 aaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaa 278  Q
    |||||||||||  || ||||| ||||| | |||||||||||||||  | |||| || |||| ||||||||||||||| |||||  ||||   ||| ||||    
T  11780248 aaagggtaaaatcggattttagttaaagtaataagggtaaaaatgagacaaaaaattataaactataagctcaaacgttacttaaaataaagtctaaaaa 11780149  T
Q  279 atagcttataagctcgtgaaataagctataa 309  Q
    |||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  11780148 atagtttataagctcacgaaaaaagctataa 11780118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 33694889 - 33694735
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagct-------caaacgctacttggaatag 268  Q
    |||||||||||||  ||| |||| ||||||||  ||||||||||| || |||||||    ||||| ||||||||       |||||||||||| |||||     
T  33694889 tataaagggtaaatatggattttgattaaaatagtaagggtaaaagtgaaagaaaaagcaataagttataagctacagactcaaacgctacttcgaataa 33694790  T
Q  269 cttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
    | ||||||||||| ||||||| || || ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  33694789 cgtctgaaaaataacttataaacttgtaaaataaattataagctcgtggtaaaaa 33694735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 813853 - 813769
Alignment:
Q  195 ttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaata 281  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| | |||||||||    
T  813853 ttttaattaatatgataagggtaaaattggaagaaaaaat-ataagttataagtttaaac-ctacttgaaatagcgtatgaaaaata 813769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 297
Target Start/End: Original strand, 7157416 - 7157501
Alignment:
Q  211 aagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 297  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| | ||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  7157416 aagggtataaatggaagaaaatgtgaaaagctataagtttaaaagctatttgaaatagcttctcaaaaaaagc-tataagctcgtga 7157501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 258
Target Start/End: Original strand, 8638229 - 8638277
Alignment:
Q  210 taagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgcta 258  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8638229 taagagtaaaaatgaaagaaaaaatgataagctataagttcaaacgcta 8638277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 325
Target Start/End: Original strand, 8645625 - 8645655
Alignment:
Q  295 tgaaataagctataagctcgtggtgaaaaga 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8645625 tgaaataagctataagctcgtggtgaaaaga 8645655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15524517 - 15524477
Alignment:
Q  239 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  15524517 agctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 15524477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 236 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 22741 - 22558
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  22741 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 22642  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctta 419  Q
    |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22641 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttcgggttaaccaaacagaccctta 22558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 236 - 418
Target Start/End: Original strand, 12717 - 12899
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  12717 ataagctataacctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtcaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 12816  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 418  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  12817 cagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagaccctt 12899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 126760 - 126940
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  126760 ataagctataagctcaagcgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 126859  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  126860 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttctt-gggttaaccaaacagaccct 126940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1632 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1632
Description:

Target: scaffold1632; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Original strand, 37 - 218
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  37 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaa 136  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  137 cagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgagtttaccaaacagaccct 218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 260 - 417
Target Start/End: Original strand, 27158 - 27316
Alignment:
Q  260 ttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagcta-atttgatcaaacgag 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||| ||||  ||||  |||||||||    
T  27158 ttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacatagctttattttgtcaaacgag 27257  T
Q  359 cttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27258 cttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 27316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 7203 - 7024
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     |||||||    
T  7203 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaa 7104  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 416  Q
    |||| ||  |||  |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7103 cagaactttttttgtcaaacgaacttaaaagctataagctaaaaactaaaagctc-tttttgaggttaaccaaacagaccc 7024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 204 - 382
Target Start/End: Original strand, 30145 - 30323
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30145 aaataataagggtaaaattgaaagaaaatgtgagaagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataag 30244  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||||| |||||||||     |||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30245 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataaactataaactaaaagct 30323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 236 - 418
Target Start/End: Original strand, 28076 - 28267
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaa---------ataagctataagctcgtggtgaaaagac 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||| |||||||||       
T  28076 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaaaatagcttataagctataagctcatggtgaaaaagt 28175  T
Q  327 agtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 418  Q
      || |||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  28176 gttatcaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttgagtgttaccaaacagaccctt 28267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 192159 - 192013
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||    
T  192159 ataagctataagctcaaaagctacttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaa 192060  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  192059 cagagctttttttgtcatacgagcttataagctataagctataagct 192013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Original strand, 94351 - 94415
Alignment:
Q  240 gctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagct 305  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || |||||||| |||||| |||||    
T  94351 gctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaaatgc-tataagctagtgaaaaaagct 94415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 211 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9401 - 9230
Alignment:
Q  211 aagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataag 310  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  9401 aagggtaaagatggaagaaaaaatgataagctataagctcaaacactacttgaaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctatgag 9302  T
Q  311 ctcgtggtgaaaaga-cagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 382  Q
    |||||||| || ||| || || ||||||||| |  |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9301 ctcgtggt-aagagaccattaacaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataaggtataagctataagct 9230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 204 - 344
Target Start/End: Original strand, 52989 - 53129
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52989 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaatagg 53088  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||     ||||||||||||||||    
T  53089 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctaa 53129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 431404 - 431265
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  431404 ataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 431305  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||  |||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  431304 cagagctttttttgtcaaacgaacttataagctaaaagct 431265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 315
Target Start/End: Original strand, 119239 - 119318
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgt 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119239 ataagctataagctcaaactctacttggaataggatctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgt 119318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 63990 - 63851
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  63990 ataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 63891  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||| ||  |||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  63890 cagatctttttttgtcaaacgagcttaagagctataagct 63851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 211 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 84427 - 84322
Alignment:
Q  211 aagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataag 310  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  84427 aagggtagagatggaagaaaaaatgataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataag 84328  T
Q  311 ctcgtg 316  Q
    ||||||    
T  84327 ctcgtg 84322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Original strand, 93386 - 93525
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||     || ||||    
T  93386 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggttttaaagtgttatcaaa 93485  T
Q  336 cagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagct 375  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  93486 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctaaaagct 93525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 421
Target Start/End: Original strand, 93514 - 93556
Alignment:
Q  378 aagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttagt 421  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  93514 aagctaaaagctcttttttggg-ttaaccaaacagacccttagt 93556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 201 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4562
Alignment:
Q  201 ttaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4673 ttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 4574  T
Q  301 aagctataagct 312  Q
    ||| ||||||||    
T  4573 aagttataagct 4562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5586 - 5468
Alignment:
Q  204 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5586 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataacttataagctcgtgaaataag 5487  T
Q  304 ctataagctcgtggtgaaaa 323  Q
     ||||||||| |||| ||||    
T  5486 -tataagctcatggtaaaaa 5468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 377
Target Start/End: Original strand, 72765 - 72907
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaga-cagtaccaa 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||    
T  72765 ataagctataagctcaaacgctacttgaaataggttctaaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcgtggtaaagagatcattaccaa 72864  T
Q  335 acagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaa 377  Q
    ||||| ||  |||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  72865 acagaactttttttgtcaaacgaacttataagctataaactaa 72907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 242 - 389
Target Start/End: Original strand, 8969 - 9115
Alignment:
Q  242 tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagc 341  Q
    |||||||| ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  8969 tataagcttaaatgctacttgaaa-agtgtctgaaaaatagcttataaacttgtgaaataaactataagctcgtggtgaaaacccattaccaaacagagc 9067  T
Q  342 taatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 389  Q
    |  ||||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||| |||||    
T  9068 ttttttgatcaaataagcttataagctatccgctataagctataagct 9115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 293
Target Start/End: Original strand, 41765 - 41822
Alignment:
Q  236 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41765 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 41822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 329 - 417
Target Start/End: Original strand, 41838 - 41925
Alignment:
Q  329 taccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccct 417  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  41838 taccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt-tggtttcccaaacagaccct 41925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 36387 - 36319
Alignment:
Q  350 tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36387 tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctactttttggggttaaccaaacagagcctt 36319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10901 - 10833
Alignment:
Q  244 taagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10901 taagctcaaacgctatttggaatagcgtctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagct 10833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11914 - 11846
Alignment:
Q  190 gtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgcta 258  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11914 gtgggttttaataaaaatgataaggataaaaatggaataaaaaatgataagttataagctcaaacgcta 11846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1360
Description:

Target: scaffold1360; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 370
Target Start/End: Original strand, 1295 - 1366
Alignment:
Q  299 ataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctaatttgatcaaacgagcttataagctat 370  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1295 ataagctgtaagcccgtggtgaaaaaacattaccaaacagagcttttttgatcaaacgagcttataagctat 1366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 280
Target Start/End: Original strand, 1178 - 1289
Alignment:
Q  176 tataaagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatg-------ataagctataagctcaaacgctacttggaatag 268  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||       |||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  1178 tataatgggtaaaattggattttagataaaataataagggtaaaaatgaaagaaaatatgataagctataagctataagctcaaatgctacttgaaataa 1277  T
Q  269 cttctgaaaaat 280  Q
    | | ||||||||    
T  1278 cgtttgaaaaat 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 324
Target Start/End: Original strand, 59137 - 59266
Alignment:
Q  194 gttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 293  Q
    |||||| || |||| | |||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||||  |||||| ||||   ||||||||     
T  59137 gttttagtttaaattacaagggtaaaaatgagataaaa-atgataagctataagcttaaatgctatttaaaatagtgtctgaataataaactataagcta 59235  T
Q  294 gtgaaataagctataagctcgtggtgaaaag 324  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  59236 gtgaaataagttataagctcgtgatgaaaag 59266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32613 - 32580
Alignment:
Q  209 ataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagct 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32613 ataagggtaaaaatggaataaaagatgataagct 32580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University