View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1475_low_19 (Length: 201)

Name: NF1475_low_19
Description: NF1475
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1475_low_19
NF1475_low_19
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (1-201)||(42721050-42721251)
chr1 (1-201)||(15752040-15752241)
chr1 (1-201)||(10181972-10182173)
chr1 (3-201)||(41926174-41926373)
chr1 (1-201)||(2959759-2959960)
chr1 (1-197)||(9903018-9903215)
chr1 (1-201)||(18422662-18422863)
chr1 (1-201)||(47279200-47279401)
chr1 (6-201)||(34012346-34012542)
chr1 (1-201)||(16415656-16415858)
chr1 (1-201)||(27563869-27564071)
chr1 (5-201)||(48620648-48620845)
chr1 (2-201)||(15382944-15383144)
chr1 (1-201)||(4330290-4330493)
chr1 (1-201)||(27267164-27267362)
chr1 (1-201)||(38823225-38823426)
chr1 (5-200)||(27532949-27533144)
chr1 (1-176)||(32216091-32216267)
chr1 (1-138)||(27227449-27227587)
chr1 (28-201)||(11742342-11742515)
chr1 (2-201)||(28564746-28564946)
chr1 (2-201)||(30326917-30327117)
chr1 (1-201)||(238477-238677)
chr1 (1-197)||(10922742-10922939)
chr1 (1-201)||(19899733-19899934)
chr1 (1-201)||(37451297-37451497)
chr1 (19-201)||(14758052-14758235)
chr1 (1-201)||(47682458-47682658)
chr1 (2-201)||(8222142-8222339)
chr1 (5-201)||(32267045-32267242)
chr1 (1-201)||(23999358-23999559)
chr1 (1-201)||(31621518-31621718)
chr1 (3-176)||(3534968-3535142)
chr1 (1-201)||(15168100-15168308)
chr1 (1-190)||(30254446-30254635)
chr1 (1-201)||(39393394-39393596)
chr1 (2-187)||(51128884-51129070)
chr1 (1-200)||(7079027-7079238)
chr1 (5-201)||(1547298-1547487)
chr1 (1-200)||(33725564-33725764)
chr1 (5-190)||(37618860-37619050)
chr1 (1-201)||(28769664-28769865)
chr1 (2-134)||(25160710-25160843)
chr1 (1-176)||(40884849-40885025)
chr1 (32-200)||(3309160-3309329)
chr1 (1-176)||(46931447-46931621)
chr1 (1-190)||(27763275-27763463)
chr1 (69-201)||(21289676-21289816)
chr1 (1-115)||(22170808-22170923)
chr1 (4-94)||(38759652-38759742)
chr1 (123-201)||(30254869-30254946)
chr1 (152-197)||(22170769-22170814)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (1-201)||(6098493-6098694)
chr8 (1-201)||(16446850-16447051)
chr8 (1-201)||(37970494-37970695)
chr8 (1-201)||(36694941-36695142)
chr8 (6-201)||(34894981-34895177)
chr8 (1-201)||(5299921-5300122)
chr8 (5-197)||(38643996-38644189)
chr8 (5-201)||(465856-466053)
chr8 (1-201)||(9864162-9864363)
chr8 (1-201)||(1204941-1205142)
chr8 (1-201)||(27082813-27083014)
chr8 (2-200)||(12876124-12876323)
chr8 (1-201)||(11727038-11727239)
chr8 (31-201)||(10555207-10555378)
chr8 (1-201)||(13307637-13307838)
chr8 (11-201)||(1150090-1150281)
chr8 (1-197)||(16222881-16223078)
chr8 (1-201)||(43643570-43643771)
chr8 (1-201)||(23854406-23854607)
chr8 (28-200)||(34952033-34952206)
chr8 (2-201)||(31933862-31934062)
chr8 (1-201)||(40862433-40862634)
chr8 (2-189)||(41910964-41911153)
chr8 (1-155)||(1149607-1149762)
chr8 (28-201)||(41362532-41362703)
chr8 (1-201)||(30654558-30654759)
chr8 (1-201)||(7890932-7891124)
chr8 (2-189)||(8803793-8803974)
chr8 (1-141)||(39099094-39099235)
chr8 (1-139)||(1953963-1954104)
chr8 (1-136)||(44869576-44869712)
chr8 (1-111)||(33906316-33906427)
chr8 (1-91)||(4132661-4132750)
chr8 (2-146)||(43025771-43025916)
chr8 (1-112)||(35459686-35459798)
chr8 (28-101)||(7998409-7998483)
chr8 (26-115)||(33197949-33198031)
chr8 (100-200)||(4133085-4133183)
chr8 (1-66)||(18259233-18259298)
chr8 (151-201)||(15009256-15009306)
chr8 (169-201)||(23176764-23176796)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (1-201)||(37203073-37203274)
chr3 (1-201)||(11466830-11467031)
chr3 (1-201)||(37157714-37157914)
chr3 (1-201)||(46297731-46297932)
chr3 (1-201)||(52040891-52041093)
chr3 (1-201)||(4015466-4015667)
chr3 (1-201)||(34132941-34133142)
chr3 (6-201)||(51212955-51213151)
chr3 (1-201)||(35844332-35844534)
chr3 (1-201)||(39282659-39282859)
chr3 (2-201)||(3655172-3655372)
chr3 (2-201)||(26941230-26941430)
chr3 (28-201)||(11357360-11357535)
chr3 (28-201)||(22446060-22446235)
chr3 (1-184)||(3362276-3362462)
chr3 (1-167)||(42506044-42506211)
chr3 (1-201)||(53229121-53229323)
chr3 (1-201)||(48354947-48355148)
chr3 (2-201)||(22450974-22451174)
chr3 (2-200)||(21193613-21193812)
chr3 (8-201)||(29099361-29099555)
chr3 (1-193)||(2007948-2008139)
chr3 (1-201)||(44891513-44891704)
chr3 (3-201)||(40552230-40552429)
chr3 (1-140)||(43348325-43348464)
chr3 (16-190)||(44186485-44186660)
chr3 (1-201)||(7327451-7327653)
chr3 (36-201)||(20373300-20373466)
chr3 (1-201)||(32373478-32373677)
chr3 (1-186)||(45174524-45174713)
chr3 (1-184)||(4761617-4761802)
chr3 (1-101)||(33698260-33698360)
chr3 (1-183)||(47481546-47481729)
chr3 (1-201)||(24488931-24489132)
chr3 (5-113)||(29163912-29164021)
chr3 (1-200)||(25579746-25579946)
chr3 (1-176)||(33378754-33378930)
chr3 (5-146)||(14586643-14586785)
chr3 (2-147)||(24708085-24708231)
chr3 (28-201)||(27480375-27480549)
chr3 (1-190)||(54505825-54506014)
chr3 (1-167)||(21009771-21009938)
chr3 (1-115)||(46994630-46994745)
chr3 (5-201)||(43975861-43976055)
chr3 (1-115)||(53176146-53176261)
chr3 (28-201)||(40935997-40936170)
chr3 (1-94)||(22622687-22622780)
chr3 (1-174)||(38591727-38591905)
chr3 (2-201)||(54828671-54828870)
chr3 (1-101)||(11835596-11835697)
chr3 (1-99)||(36012246-36012345)
chr3 (1-90)||(1089811-1089901)
chr3 (65-130)||(53811695-53811767)
chr3 (148-201)||(55343401-55343454)
chr3 (130-201)||(2613896-2613967)
chr3 (2-51)||(20373214-20373263)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (1-201)||(11071195-11071397)
chr7 (5-201)||(22687229-22687426)
chr7 (1-201)||(21991626-21991827)
chr7 (3-200)||(44413351-44413550)
chr7 (28-201)||(31520721-31520894)
chr7 (2-201)||(27283734-27283934)
chr7 (1-201)||(7334784-7334985)
chr7 (5-201)||(12165742-12165939)
chr7 (1-201)||(32821023-32821224)
chr7 (2-201)||(43686031-43686230)
chr7 (1-201)||(18797319-18797518)
chr7 (1-201)||(37347012-37347212)
chr7 (1-201)||(38258535-38258736)
chr7 (1-201)||(41765048-41765249)
chr7 (1-201)||(30055516-30055718)
chr7 (1-201)||(5657451-5657652)
chr7 (1-141)||(15612729-15612870)
chr7 (1-201)||(24211731-24211932)
chr7 (2-201)||(4582909-4583109)
chr7 (1-201)||(27421350-27421550)
chr7 (5-201)||(8861275-8861472)
chr7 (2-201)||(9355797-9355997)
chr7 (1-201)||(37109862-37110065)
chr7 (9-200)||(48928275-48928466)
chr7 (1-184)||(10481611-10481796)
chr7 (1-201)||(23111180-23111383)
chr7 (9-201)||(48928542-48928734)
chr7 (1-201)||(17842554-17842757)
chr7 (28-189)||(26980325-26980487)
chr7 (1-201)||(31579034-31579240)
chr7 (1-201)||(10359184-10359385)
chr7 (1-201)||(32432447-32432643)
chr7 (2-201)||(6546509-6546709)
chr7 (1-201)||(25691514-25691716)
chr7 (26-190)||(29173541-29173706)
chr7 (28-187)||(12390627-12390787)
chr7 (1-101)||(37704248-37704348)
chr7 (7-201)||(33688238-33688432)
chr7 (1-102)||(15672732-15672833)
chr7 (1-121)||(44598736-44598857)
chr7 (28-167)||(32593186-32593325)
chr7 (68-201)||(26524364-26524498)
chr7 (5-73)||(26588058-26588126)
chr7 (1-84)||(37703468-37703551)
chr7 (29-115)||(43925178-43925264)
chr7 (66-176)||(35353123-35353235)
chr7 (28-184)||(38053493-38053642)
chr7 (1-84)||(46481099-46481182)
chr7 (87-174)||(34362205-34362292)
chr7 (149-201)||(8299205-8299257)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (1-201)||(29242125-29242326)
chr2 (1-201)||(33550973-33551174)
chr2 (2-201)||(4166937-4167137)
chr2 (5-184)||(27349930-27350109)
chr2 (1-201)||(4763643-4763847)
chr2 (1-201)||(19424615-19424816)
chr2 (6-201)||(33660360-33660556)
chr2 (1-201)||(4264064-4264265)
chr2 (1-190)||(19289310-19289500)
chr2 (1-193)||(3176962-3177155)
chr2 (5-201)||(19313867-19314063)
chr2 (2-201)||(26357592-26357792)
chr2 (1-201)||(36642001-36642204)
chr2 (1-183)||(43648232-43648415)
chr2 (1-201)||(17071724-17071925)
chr2 (5-201)||(43770830-43771026)
chr2 (1-201)||(44285964-44286165)
chr2 (1-201)||(4478383-4478581)
chr2 (2-201)||(37905724-37905925)
chr2 (1-115)||(41960941-41961056)
chr2 (2-201)||(17054084-17054284)
chr2 (1-201)||(31570721-31570922)
chr2 (7-201)||(39167356-39167551)
chr2 (2-190)||(33902094-33902281)
chr2 (1-176)||(33709219-33709395)
chr2 (1-190)||(2325365-2325547)
chr2 (1-201)||(44913677-44913880)
chr2 (1-115)||(45327821-45327936)
chr2 (5-146)||(5881609-5881750)
chr2 (1-201)||(41463837-41464038)
chr2 (1-190)||(11366368-11366558)
chr2 (46-201)||(13711479-13711635)
chr2 (28-146)||(7006935-7007054)
chr2 (1-201)||(18494268-18494456)
chr2 (2-98)||(31861971-31862067)
chr2 (1-115)||(41465602-41465717)
chr2 (1-201)||(35958924-35959112)
chr2 (34-113)||(19501760-19501839)
chr2 (1-76)||(18258274-18258349)
chr2 (72-189)||(41051263-41051382)
chr2 (152-201)||(41960898-41960947)
chr2 (169-201)||(27139021-27139053)
chr2 (169-201)||(18514772-18514804)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (1-198)||(23116181-23116379)
chr5 (28-201)||(1429131-1429305)
chr5 (1-201)||(12910365-12910571)
chr5 (1-201)||(5112273-5112473)
chr5 (2-201)||(36866777-36866977)
chr5 (1-201)||(38528196-38528396)
chr5 (1-201)||(699165-699366)
chr5 (1-197)||(5837574-5837771)
chr5 (1-201)||(22980808-22981009)
chr5 (1-201)||(25500885-25501086)
chr5 (1-201)||(19119874-19120075)
chr5 (2-190)||(31786606-31786795)
chr5 (5-201)||(32563164-32563361)
chr5 (2-201)||(40133400-40133600)
chr5 (5-201)||(7693245-7693442)
chr5 (1-201)||(30969283-30969484)
chr5 (6-201)||(35511441-35511637)
chr5 (1-201)||(8741845-8742047)
chr5 (1-201)||(26268089-26268290)
chr5 (1-201)||(27318446-27318647)
chr5 (1-201)||(33908248-33908449)
chr5 (1-155)||(23954748-23954904)
chr5 (5-201)||(9200248-9200445)
chr5 (28-201)||(14409313-14409486)
chr5 (5-176)||(28416490-28416662)
chr5 (1-201)||(31705571-31705771)
chr5 (2-201)||(22255196-22255397)
chr5 (2-201)||(36860438-36860639)
chr5 (5-201)||(39572834-39573031)
chr5 (1-201)||(7208823-7209024)
chr5 (28-184)||(24886136-24886293)
chr5 (1-184)||(14919487-14919671)
chr5 (1-201)||(35933917-35934112)
chr5 (5-190)||(22019658-22019844)
chr5 (1-201)||(43308611-43308812)
chr5 (1-201)||(15724505-15724704)
chr5 (32-198)||(8466763-8466929)
chr5 (1-190)||(27330332-27330520)
chr5 (1-159)||(6824438-6824599)
chr5 (1-201)||(21088725-21088926)
chr5 (1-201)||(22974041-22974242)
chr5 (1-201)||(35826443-35826643)
chr5 (1-142)||(15992499-15992641)
chr5 (1-201)||(8436981-8437181)
chr5 (5-166)||(42342783-42342942)
chr5 (1-176)||(17157990-17158165)
chr5 (1-98)||(35504484-35504581)
chr5 (1-201)||(13956321-13956505)
chr5 (2-77)||(5830032-5830107)
chr5 (62-176)||(25668690-25668804)
chr5 (131-201)||(26317774-26317844)
chr5 (5-66)||(25669737-25669797)
chr5 (1-69)||(2888404-2888472)
chr5 (132-183)||(22255608-22255659)
chr5 (80-201)||(11898017-11898139)
chr5 (169-201)||(5748443-5748475)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (1-201)||(36493684-36493884)
chr4 (1-201)||(25701051-25701253)
chr4 (5-201)||(37775684-37775879)
chr4 (1-201)||(35021030-35021231)
chr4 (1-201)||(33341410-33341614)
chr4 (1-201)||(37663736-37663935)
chr4 (1-201)||(19089448-19089649)
chr4 (1-201)||(9139262-9139461)
chr4 (8-201)||(34948099-34948293)
chr4 (1-193)||(17167736-17167929)
chr4 (1-193)||(17173313-17173506)
chr4 (5-201)||(32592108-32592305)
chr4 (1-200)||(19440643-19440843)
chr4 (2-201)||(28002982-28003182)
chr4 (1-201)||(55241100-55241300)
chr4 (5-201)||(55477890-55478091)
chr4 (3-201)||(46888154-46888353)
chr4 (1-198)||(6864053-6864251)
chr4 (1-201)||(25184128-25184329)
chr4 (1-197)||(38011873-38012070)
chr4 (1-201)||(49375981-49376183)
chr4 (1-201)||(47253764-47253956)
chr4 (1-199)||(23761089-23761287)
chr4 (1-190)||(29584195-29584383)
chr4 (2-201)||(34361488-34361687)
chr4 (5-201)||(4598008-4598203)
chr4 (1-201)||(32912575-32912776)
chr4 (1-201)||(50697257-50697457)
chr4 (1-190)||(42199755-42199945)
chr4 (1-201)||(879543-879744)
chr4 (1-201)||(27396631-27396832)
chr4 (1-155)||(4934197-4934353)
chr4 (9-200)||(33816536-33816728)
chr4 (1-200)||(7703533-7703725)
chr4 (1-201)||(5047961-5048161)
chr4 (42-201)||(50764747-50764905)
chr4 (8-190)||(54499239-54499424)
chr4 (1-108)||(1815409-1815517)
chr4 (5-201)||(30002631-30002820)
chr4 (1-201)||(35025591-35025784)
chr4 (1-115)||(32579548-32579662)
chr4 (1-115)||(17272069-17272180)
chr4 (11-201)||(39397933-39398115)
chr4 (1-95)||(3042741-3042835)
chr4 (1-201)||(37287748-37287944)
chr4 (123-201)||(4205131-4205209)
chr4 (131-201)||(53124302-53124372)
chr4 (124-201)||(4396341-4396418)
chr4 (102-175)||(23518400-23518473)
chr4 (31-75)||(46884133-46884177)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (1-190)||(7913-8103)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (1-195)||(94352-94547)
scaffold0002 (1-201)||(149-350)
scaffold0002 (1-159)||(408398-408556)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (1-201)||(7235003-7235203)
chr6 (1-201)||(4318790-4318992)
chr6 (1-201)||(29182178-29182380)
chr6 (1-201)||(21017080-21017281)
chr6 (2-200)||(15491631-15491830)
chr6 (5-176)||(33892975-33893146)
chr6 (1-201)||(1945848-1946050)
chr6 (1-201)||(5627406-5627607)
chr6 (2-201)||(7055184-7055384)
chr6 (1-201)||(3879907-3880108)
chr6 (1-201)||(30353326-30353527)
chr6 (32-201)||(8513248-8513419)
chr6 (2-201)||(6091152-6091351)
chr6 (32-201)||(6088923-6089094)
chr6 (1-201)||(20768101-20768298)
chr6 (41-186)||(33618864-33619010)
chr6 (86-201)||(18498448-18498565)
chr6 (169-201)||(3005394-3005426)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (1-201)||(11921-12125)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (2-167)||(267332-267499)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (1-187)||(43986-44173)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-187)||(154614-154801)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-201)||(145985-146186)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (32-73)||(100894-100935)
scaffold0009 (125-201)||(42363-42439)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42721251 - 42721050
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42721251 cttaagtgttatactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 42721152  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42721151 ggattgaacttttgatgttactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgatatagggctaacttcaccaaaaaaatcattttcatgact 42721052  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  42721051 tc 42721050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15752241 - 15752040
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15752241 cttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 15752142  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15752141 ggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactcactatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgact 15752042  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  15752041 tc 15752040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 10181972 - 10182173
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  10181972 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatga 10182071  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10182072 ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgttacgcactatattttttatgttacagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgact 10182171  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  10182172 tc 10182173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41926373 - 41926174
Alignment:
Q  3 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-ggg 101  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41926373 taagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactataggg 41926274  T
Q  102 actgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41926273 actgaacttgtgatgccactgtacaaacagtgggatattactcactatatttttgatgttatagtattaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttc 41926174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2959960 - 2959759
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  2959960 cttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatga 2959861  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2959860 ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttacttactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgact 2959761  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  2959760 tc 2959759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 9903018 - 9903215
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  9903018 cttaagtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgt 9903117  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 197  Q
    ||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9903118 ggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 9903215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18422863 - 18422662
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18422863 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatga 18422764  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18422763 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgact 18422664  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  18422663 tc 18422662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 47279401 - 47279200
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47279401 cttaagtgttacactttatgggatgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 47279302  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |||| || |||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  47279301 ggactgaactttcgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatagtataatgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgact 47279202  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  47279201 tc 47279200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 34012346 - 34012542
Alignment:
Q  6 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggact 104  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  34012346 gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgact 34012445  T
Q  105 gaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34012446 gaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcataaacgtcattttcatgacttc 34012542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16415858 - 16415656
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16415858 cttaagtattacaatatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatga 16415759  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaaca-gtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
     | ||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||    
T  16415758 tggctgaacttttgatgccactgtacaaacatttagggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgac 16415659  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  16415658 ttc 16415656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27563869 - 27564071
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  27563869 cttaagtgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcg 27563968  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttca-tcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
    | ||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | | ||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  27563969 gaactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactcactatatttttaaagttatagtgttaacttcactaaaaaaaatcattttcataac 27564068  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  27564069 ttc 27564071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48620845 - 48620648
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-atgggac 103  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  48620845 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 48620746  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||| || ||||||||  | |||||||||||| || |||||    
T  48620745 tgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatattgttaacttcacaagaaaagtcattttaataacttc 48620648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15383144 - 15382944
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  15383144 ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgat 15383045  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| || ||||    
T  15383044 gactgaacttttgatgacattgtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcatttttataactt 15382945  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  15382944 c 15382944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4330493 - 4330290
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  4330493 cttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatga 4330394  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagt-ggggtgttattcactatatttttgatgatatagtg-ctaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 197  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||| |||| |    
T  4330393 tgactgaacttttgatcccactgtacaaacattgggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgtttatcttcatcagaaaagtcattctcataa 4330294  T
Q  198 cttc 201  Q
    ||||    
T  4330293 cttc 4330290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27267164 - 27267362
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27267164 cttaagtgttgcactttgtggggtgttacactcaaaacaaggtag-attaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 27267262  T
Q  101 -gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||   ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  27267263 agactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcactacattttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgact 27267360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 38823426 - 38823225
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38823426 cttaagtgttacactttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 38823327  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||| ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| || | | | |||||||| ||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||    
T  38823326 ggattgaacttttgatgacactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttaaccagaaaagtcattctcatgact 38823227  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  38823226 tc 38823225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 200
Target Start/End: Original strand, 27532949 - 27533144
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gggac 103  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27532949 agtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggat 27533047  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| |||| ||||    
T  27533048 tgaacttttgatgccactgtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataactt 27533144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32216267 - 32216091
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  32216267 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacga 32216168  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttca 176  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32216167 ggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttca 32216091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 27227449 - 27227587
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27227449 cttaagtgttgcactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 27227548  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtg 138  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  27227549 ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtg 27227587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 201
Target Start/End: Original strand, 11742342 - 11742515
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggactgaacttttgattccactctacaa 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  11742342 acacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatgggactgaacttttgatgtcactgtacaa 11742441  T
Q  128 acagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||||||| | || | | ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||| |||||    
T  11742442 acagtggggtgttacttacaacacttttgataatatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttc 11742515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 28564746 - 28564946
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | |  |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  28564746 ttaagtgttacactttacggggtgttatgcttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgag 28564845  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||||||  ||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28564846 gactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattttcataactt 28564945  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  28564946 c 28564946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 30326917 - 30327117
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  30326917 ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgat 30327016  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    ||||||||||||||| | | | ||||||| || |||| ||| ||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  30327017 gactgaacttttgatgctattgtacaaacggttgggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaaattcacaaaaaaagtcatttttatgactt 30327116  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  30327117 c 30327117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 238477 - 238677
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |    
T  238477 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatgg 238576  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  || | |||||||||| || ||||| |||| | |||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  238577 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggatgttactcacaacatttttaatactatagtgttaacttcaccaaaaaagttattttcgtgact 238675  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  238676 tc 238677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10922939 - 10922742
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  10922939 cttaagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatga 10922840  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 197  Q
    ||| ||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  10922839 ggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatga 10922742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19899733 - 19899934
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19899733 cttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatga 19899832  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||  || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||    
T  19899833 gggttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattattatgact 19899932  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  19899933 tc 19899934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37451497 - 37451297
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |    
T  37451497 cttaagtgttacactttttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatactagag 37451398  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||| || |||||||| | | || |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  37451397 gactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttacttattacatttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaagtcatttttatgactt 37451298  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  37451297 c 37451297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14758235 - 14758052
Alignment:
Q  19 tggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gggactgaacttttgattc 117  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  14758235 tggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgc 14758136  T
Q  118 cactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||  |||||||||| | ||| || |||||| | |||||||| ||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  14758135 caccgtacaaacagttgtgtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 14758052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 47682458 - 47682658
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47682458 cttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 47682557  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggg-gtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| |||   ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  47682558 ggaatgaacttttgataccactgtacaagcagtgggagtgttactcacaacattttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcactctcatgac 47682655  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  47682656 ttc 47682658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8222339 - 8222142
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8222339 ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgag 8222240  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
     |||||||||||||| ||| | |   ||| ||| ||||||| ||| || |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||    
T  8222239 aactgaacttttgatgccattgt---aacggtgtggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaggtcatttttatgactt 8222143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32267242 - 32267045
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggac 103  Q
    ||||||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||     
T  32267242 agtgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggag 32267143  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  32267142 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatattgttaacttcacaaaaaaagtcattcttatgacttc 32267045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23999559 - 23999358
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  23999559 cttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatga 23999460  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    || |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||    
T  23999459 gggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcgttatattttttatgttgtagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgact 23999360  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  23999359 tc 23999358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 31621518 - 31621718
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31621518 cttaagtgtcacacttc-tggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 31621616  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||| ||||||| ||||  |||||| || |||||| || ||| || |  ||||||| ||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  31621617 ggactgaatttttgatgccaccgtacaaatagcggggtgctactcaatacacctttgatgttatagtgttgacttcactagaaaagtcattctcatgact 31621716  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  31621717 tc 31621718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3535142 - 3534968
Alignment:
Q  3 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-atggg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | |||    
T  3535142 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaagggg 3535043  T
Q  102 actgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttca 176  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||  ||||||| |||| | | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  3535042 actgaacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca 3534968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15168308 - 15168100
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15168308 cttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 15168209  T
Q  100 ggactgaacttttgattccac-------tctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatttt 192  Q
    |||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||| | |||||| || ||||  |||| |    
T  15168208 ggactgaacttttgatgccaccgtacaacgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaagcattct 15168109  T
Q  193 catgacttc 201  Q
    ||| |||||    
T  15168108 catcacttc 15168100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30254635 - 30254446
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | |  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  30254635 cttaagtgttacactttatagggtgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttga 30254536  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
    ||||||||||||||||  || | |||||||||| | || ||| ||| || |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  30254535 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-gtgtattactcattacatttttgatgttatattgttaacttcaacaaaaaagtcatt 30254446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39393596 - 39393394
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat- 98  Q
    ||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  39393596 cttaagtgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatg 39393497  T
Q  99 gggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
    |||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||  || ||| |||| | | |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||| ||    
T  39393496 gggattaaacttttgatgccactgtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattagaaaagtcattctcataac 39393397  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  39393396 ttc 39393394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 51129070 - 51128884
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       
T  51129070 ttaattgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataat 51128971  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtc 187  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||| |||| |||||| ||| || |||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  51128970 gactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtc 51128884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 7079027 - 7079238
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  7079027 cttaagtcttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatga 7079126  T
Q  101 -gactgaacttttgattccactctacaaacagtg-----------gggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtca 188  Q
     |||||||||||||||  || | |||||||||||           |||||||| |||| | | |||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7079127 tgactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtca 7079226  T
Q  189 ttttcatgactt 200  Q
    || |||||||||    
T  7079227 ttatcatgactt 7079238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1547487 - 1547298
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggac 103  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||        ||||||||||| | ||    
T  1547487 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctg--------atgatactatgagaac 1547396  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  1547395 tgaacttttgatgccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 1547298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 33725564 - 33725764
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  33725564 cttaaatgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatga 33725663  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||| ||||   | ||| |||||| || || ||| || | |||||||||||||| | | ||||||  | |||||||||| || |||||    
T  33725664 ggactgaacttttgatgccaccaaagaaatagtgggctgctactcaatacacttttgatgatatagcgttgacttcactagaaaagtcattctcttgact 33725763  T
Q  200 t 200  Q
    |    
T  33725764 t 33725764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 190
Target Start/End: Original strand, 37618860 - 37619050
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg--atactatg-gg 101  Q
    ||||||||||||| |||| | | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |     
T  37618860 agtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgaga 37618959  T
Q  102 actgaacttttgattccactctacaaacagtggggtg--ttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
    ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37618960 actgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatt 37619050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28769865 - 28769664
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtgggg-tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | ||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28769865 cttaagcgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatg 28769766  T
Q  100 -ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
     |||| |||| |||||| ||| | ||||||| || |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  28769765 aggaccgaacctttgatgccattgtacaaacggt-gggtgttactcattacatttttgatgtcatagtgttaacttcacaaaaaaagttatttttatgac 28769667  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  28769666 ttc 28769664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25160843 - 25160710
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25160843 ttaagtgttatactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgag 25160744  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtgg 134  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  25160743 gactgaacttttgatgccattgtacaaacggtgg 25160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40885025 - 40884849
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||  ||  | | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  40885025 cttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactatag 40884926  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttca 176  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||| ||| | ||||||    
T  40884925 ggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatggtgttgacttca 40884849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3309329 - 3309160
Alignment:
Q  32 ttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgattccactctacaaac 129  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||    
T  3309329 ttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaac 3309230  T
Q  130 agtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    ||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||| | || |||||||||| |||||||||    
T  3309229 agt-gggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgactt 3309160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 46931621 - 46931447
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || ||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  46931621 cttaagtgttacactttgtagggtgttacgct--gaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatga 46931524  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttca 176  Q
    || ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  46931523 gggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 46931447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 27763275 - 27763463
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| | || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  27763275 cttaagtattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatga 27763374  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
    || ||| |||||||||  || |||||||||  | |||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  27763375 gggctggacttttgatgtcattctacaaactat-gggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca-caaaaaaatcatt 27763463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289676
Alignment:
Q  69 cttgttaatctgatgaattgatgatactat-gggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcacta-------tatttttgatga 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||       |||| || ||||    
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttttattatttatga 21289717  T
Q  161 tatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  21289716 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 21289676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 22170923 - 22170808
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||     
T  22170923 cttaagtgttacactttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgt 22170824  T
Q  100 ggactgaacttttgat 115  Q
     |||||||||||||||    
T  22170823 agactgaacttttgat 22170808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 38759742 - 38759652
Alignment:
Q  4 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgata 94  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || |||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  38759742 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgata 38759652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30254946 - 30254869
Alignment:
Q  123 tacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  30254946 tacaaacagtggg-tgttatccattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattattatgacttc 30254869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22170814 - 22170769
Alignment:
Q  152 ttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 197  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22170814 ttttgatgttatagtgttaacttcattagaaaagtcattttcatga 22170769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 138; Significance: 2e-72; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 6098493 - 6098694
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6098493 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatgg 6098592  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6098593 ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgact 6098692  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  6098693 tc 6098694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 16446850 - 16447051
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16446850 cttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgg 16446949  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16446950 ggactaaacttttgatgccattatacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactttatcagaaaagtcattttcatgact 16447049  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  16447050 tc 16447051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 37970494 - 37970695
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  37970494 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatga 37970593  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    || |||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37970594 gggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgact 37970693  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  37970694 tc 37970695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 36694941 - 36695142
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36694941 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgg 36695040  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  36695041 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgact 36695140  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  36695141 tc 36695142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34895177 - 34894981
Alignment:
Q  6 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggact 104  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  34895177 gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgact 34895078  T
Q  105 gaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34895077 gaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttc 34894981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 5299921 - 5300122
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  5299921 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataa 5300020  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| || | || | | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5300021 ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtagagtgctacttacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattaaaaaagtcattctcatgact 5300120  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  5300121 tc 5300122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38644189 - 38643996
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg-gac 103  Q
    ||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38644189 agtgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagac 38644090  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 197  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  38644089 tgaacttttgatgccactagacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttgaccaaaaaagtcattctcatga 38643996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 466053 - 465856
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-atgggac 103  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  466053 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 465954  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  465953 tgaatttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatcgtgttaacttcaccacaaaagtcattttaatgacttc 465856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9864363 - 9864162
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  9864363 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatgg 9864264  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  9864263 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgact 9864164  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  9864163 tc 9864162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1205142 - 1204941
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  1205142 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatga 1205043  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  || | |||||||||||  |||||| |||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  1205042 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactcactacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgact 1204943  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  1204942 tc 1204941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27082813 - 27083014
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  27082813 cttaagtgttacactttgcggggtgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatga 27082912  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| | | ||||||    
T  27082913 ggactgaacttttaatgccactgcacaaacagtggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcagtctgatgact 27083012  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  27083013 tc 27083014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12876323 - 12876124
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12876323 ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgag 12876224  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||||||||||  || | |||||||||| |||||||| |||| | |||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12876223 gactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgactt 12876124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11727239 - 11727038
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  11727239 cttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatga 11727140  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | || | | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| |||    
T  11727139 ggactgaacttttgatgccactatacaaatagtggggtgttacttacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataact 11727040  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  11727039 tc 11727038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 201
Target Start/End: Original strand, 10555207 - 10555378
Alignment:
Q  31 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgattccactctacaaac 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || | |||||||    
T  10555207 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaac 10555306  T
Q  130 agtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||| |||||| ||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10555307 agtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttc 10555378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13307838 - 13307637
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  13307838 cttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatgg 13307739  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  13307738 ggactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgact 13307639  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  13307638 tc 13307637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Original strand, 1150090 - 1150281
Alignment:
Q  11 acactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaact 109  Q
    |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  1150090 acactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaact 1150189  T
Q  110 tttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||  |  | ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  1150190 tttgatgtcgttgtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttc 1150281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16223078 - 16222881
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  16223078 cttaagtgttacactttttggggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatga 16222979  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 197  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||| ||||||   || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| || |||||||||| ||||||    
T  16222978 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaactgtggggaactactcactatattttttatgttatagtgttaaattcaccagaaaagtcattctcatga 16222881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 43643570 - 43643771
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  43643570 cttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatga 43643669  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     || |||||||| |||  || | |||||||||| | |||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  43643670 agattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgact 43643769  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  43643770 tc 43643771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 23854406 - 23854607
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  23854406 cttaagtgttacactttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatga 23854505  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  || |  ||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23854506 ggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgact 23854605  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  23854606 tc 23854607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 200
Target Start/End: Original strand, 34952033 - 34952206
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-atgggactgaacttttgattccactctaca 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  34952033 acacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcactgtaca 34952132  T
Q  127 aacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    ||||||||| ||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  34952133 aacagtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgaccagaaaagtcattttaatgactt 34952206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 31933862 - 31934062
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  31933862 ttaagtgttacactttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataat 31933961  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||||||||||  || | || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||    
T  31933962 gactgaacttttgatgtcattgtataaagagtggggtgttactcattatatttttgatatcatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataactt 31934061  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  31934062 c 31934062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40862634 - 40862433
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||  |||||||||||| |||     
T  40862634 cttaagtgttacactttgtggagtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatga 40862535  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactata-tttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||  ||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  40862534 gactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagttattttcgtgact 40862435  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  40862434 tc 40862433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Original strand, 41910964 - 41911153
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  41910964 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtt 41911063  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagt-ggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcat 189  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |   || ||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  41911064 gactgaatttttgatgctactgttataatagtgggggtgttactcacgacacttttgatgatatagtattaacttcaccaaaaaaatcat 41911153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 1149607 - 1149762
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  1149607 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatga 1149706  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatattttt 155  Q
    |||| |||||||||||  || | ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||    
T  1149707 ggacagaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggttgttactcattacattttt 1149762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41362703 - 41362532
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgattccactctaca 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||| ||||    
T  41362703 acacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcactataca 41362604  T
Q  127 aacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||| |||   ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41362603 aatagtggggtgttactcactacattttt-atg--ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcataacttc 41362532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 30654558 - 30654759
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  30654558 cttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatga 30654657  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     | |||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| | | ||||||    
T  30654658 aggctgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcactcttatgact 30654757  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  30654758 tc 30654759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 7890932 - 7891124
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  7890932 cttaagtgttacacgttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatga 7891031  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||         ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  7891032 ggaccgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgt---------tatttttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaaagtcattctcatgact 7891122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Original strand, 8803793 - 8803974
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggg 101  Q
    |||||||||||||||| | |||| | || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      |    
T  8803793 ttaagtgttacactttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata------g 8803886  T
Q  102 actgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcat 189  Q
     |||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8803887 gctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcat 8803974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 39099094 - 39099235
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||| | |||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  39099094 cttaagtgtgatactttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatga 39099193  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgtta 141  Q
    |||||||||||||||| | | | |||||| ||||||||||||    
T  39099194 ggactgaacttttgatgctagtgtacaaagagtggggtgtta 39099235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 1953963 - 1954104
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtgggg-tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat-gatactat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1953963 cttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactat 1954062  T
Q  99 g-ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgt 139  Q
    | || ||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||    
T  1954063 gagggctgaacttttgatgccactgtccaaatagtagggtgt 1954104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 44869712 - 44869576
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44869712 cttaagtgttacactttgtgggg-acaacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatg 44869614  T
Q  100 -ggactgaacttttgattccactctacaaacagtgggg 136  Q
      || ||||||||||||  || | | ||||||||||||    
T  44869613 acgattgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtgggg 44869576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 33906427 - 33906316
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||  | | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33906427 cttaagtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 33906328  T
Q  100 ggactgaacttt 111  Q
     |||||||||||    
T  33906327 agactgaacttt 33906316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 4132661 - 4132750
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 91  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4132661 cttatgtgttacactttgtggggtgttacacttaaa-caaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 43025916 - 43025771
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||  |    
T  43025916 ttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatg 43025817  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcac 146  Q
     ||||||||||| || ||| | |||||| |||||||| ||| ||||    
T  43025816 aactgaacttttaataccattgtacaaagagtggggtattaatcac 43025771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 35459686 - 35459798
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||| | | |||||| | | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  35459686 cttaagtgttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatga 35459785  T
Q  100 ggactgaactttt 112  Q
    |||||||||||||    
T  35459786 ggactgaactttt 35459798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 7998483 - 7998409
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7998483 acacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatggg 7998409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 33198031 - 33197949
Alignment:
Q  26 taacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg-gactgaacttttgat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33198031 taacacttaaaacaaggtaggataaaat--------gtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgat 33197949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 200
Target Start/End: Original strand, 4133085 - 4133183
Alignment:
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||| |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  4133085 ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtcaggtattactcactatcttttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctgatgact 4133182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18259298 - 18259233
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgta 66  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  18259298 cttaggtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtatgataaaattaaattaaatgta 18259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15009306 - 15009256
Alignment:
Q  151 tttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  15009306 tttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttc 15009256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 201
Target Start/End: Original strand, 23176764 - 23176796
Alignment:
Q  169 taacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23176764 taacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttc 23176796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37203274 - 37203073
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  37203274 cttaagtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatga 37203175  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37203174 ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcatttttatgact 37203075  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  37203074 tc 37203073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11467031 - 11466830
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11467031 cttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 11466932  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | | ||  |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  11466931 ggactaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaacttcatcagaaaagtcattctcaagact 11466832  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  11466831 tc 11466830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37157914 - 37157714
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  37157914 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatga 37157815  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37157814 tgactgaacttttgatgccactgtac-aacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagccattttcatgact 37157716  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  37157715 tc 37157714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 46297731 - 46297932
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-tg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  46297731 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgg 46297830  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  46297831 ggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgact 46297930  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  46297931 tc 46297932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 52040891 - 52041093
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52040891 cttaagtgttacactatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 52040990  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaaca-gtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||| ||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||    
T  52040991 tgactgaacttttgatgccactatacaaacatttggggagttactcactacacttttgatgttatagtattaacttcaccagaaaagtcattctcatgac 52041090  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  52041091 ttc 52041093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4015667 - 4015466
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  4015667 cttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatga 4015568  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4015567 ggactgaacttttgatgtcactctacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgact 4015468  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  4015467 tc 4015466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34133142 - 34132941
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  34133142 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatgg 34133043  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  34133042 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgact 34132943  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  34132942 tc 34132941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 51212955 - 51213151
Alignment:
Q  6 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggact 104  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  51212955 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggact 51213054  T
Q  105 gaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
     |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  51213055 caacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttc 51213151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35844534 - 35844332
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat- 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35844534 cttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 35844435  T
Q  99 gggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
    |||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| || ||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||    
T  35844434 gggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacatttttgttgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattatcatgac 35844335  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  35844334 ttc 35844332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39282859 - 39282659
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  39282859 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatga 39282760  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||| | | |||||||| ||||||| ||| || |||| |||| ||||||||||||||    
T  39282759 gaactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtattactcac-acagttttgatgttatagtgttaattttatcagaaaaatcattttcatgact 39282661  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  39282660 tc 39282659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 3655172 - 3655372
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    |||||||||||| ||||||| || | || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3655172 ttaagtgttacattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 3655271  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3655272 gactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactttatcaaaaaagtcatttttatgactt 3655371  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  3655372 c 3655372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 26941230 - 26941430
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  26941230 ttaagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgag 26941329  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  26941330 gactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattataattttgattttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgactt 26941429  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  26941430 c 26941430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 201
Target Start/End: Original strand, 11357360 - 11357535
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgattccactctaca 126  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||    
T  11357360 acacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtaca 11357459  T
Q  127 aacagt-ggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  11357460 aacagtgggggtgttactcactatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 11357535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 201
Target Start/End: Original strand, 22446060 - 22446235
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat--gggactgaacttttgattccactctac 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||| |||    
T  22446060 acacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgccactgtac 22446159  T
Q  126 aaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatc-aaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22446160 aaa-agtggggtgttactcactatatttttgatgatataatgttaacttcaccaaaaaaagtcattttcatgacttc 22446235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3362462 - 3362276
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaa--gtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  3362462 cttaagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccat 3362363  T
Q  99 g-ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaa 184  Q
    | ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  3362362 gaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatgttactcactatatttctgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaa 3362276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 42506044 - 42506211
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42506044 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 42506143  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtg 167  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||| ||| || | |||||||| |||||||    
T  42506144 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtattactcattacaattttgatgttatagtg 42506211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 53229121 - 53229323
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  53229121 cttaagtgttacactttgtggggagttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatga 53229220  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtg-gggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
     ||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||  |||||| | |||||||| ||||||| ||| |||| || |||| | |||||||||||    
T  53229221 tgactgaacttttgatgcaactgtacaaacattgagggtgttgctcactacacttttgatgctatagtgttaatttcaccagaaaaataattttcatgac 53229320  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  53229321 ttc 53229323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48355148 - 48354947
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  48355148 cttaagtgttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatga 48355049  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    | |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  48355048 gaactgaacttttgatgccattgtacaaacaatggggtgttactcattacatttttaatattatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgact 48354949  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  48354948 tc 48354947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22451174 - 22450974
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gg 100  Q
    |||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22451174 ttaaatgttacacttactggggtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggg 22451075  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| || |||||| | |||||||| ||||||| | |||||| || |||| ||||| |||||||||    
T  22451074 gactgaacttttgatgccaccatacaaacagtgaggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 22450975  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  22450974 c 22450974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21193812 - 21193613
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gg 100  Q
    ||||||||||  |||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  21193812 ttaagtgttatcctttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggg 21193713  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||   | |||| |||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  21193712 gactgaacttttgatgtcactctacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgattcaacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 21193613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29099555 - 29099361
Alignment:
Q  8 gttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-atgggactga 106  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29099555 gttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactga 29099456  T
Q  107 acttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||| |||  |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  29099455 actttagatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacgacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttc 29099361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2008139 - 2007948
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  2008139 cttaagtgttacactttgtggagtgta-cacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgctatgg 2008041  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttc 193  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||| | | ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  2008040 ggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgttaacttca-aaaaaaaatcattttc 2007948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44891704 - 44891513
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  44891704 cttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgt 44891605  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||| |||||||||| ||         |||||||| ||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44891604 ggactaaacttttgatgcc---------acagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca-ccaaaaagtcattttcatgact 44891515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Original strand, 40552230 - 40552429
Alignment:
Q  3 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-gg 101  Q
    |||||||||||| ||||||| | | || |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  40552230 taagtgttacacgttgtgggatgttacgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgagg 40552329  T
Q  102 actgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||||||  || | ||||||| |||| |||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  40552330 actgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttctccaaaaaagtcattctcatgacttc 40552429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 43348464 - 43348325
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       
T  43348464 cttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaaa 43348365  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgtt 140  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  43348364 gactgaacttttgatgccactaaacaaacagtggggtgtt 43348325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 44186485 - 44186660
Alignment:
Q  16 ttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gggactgaacttttga 114  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44186485 ttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttga 44186584  T
Q  115 ttccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
    |  |||| || |||||| ||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  44186585 tgtcactgtataaacagcggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatt 44186660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 7327451 - 7327653
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7327451 cttaagtgttacactttgtggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatgg 7327550  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtg-ctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||| | ||| |||||| |||| | | |||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||| |||| ||    
T  7327551 ggactgaacttttgatgtcactgtacaaataatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgtttaacttcactaaaaaagtcattctcataac 7327650  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  7327651 ttc 7327653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373466
Alignment:
Q  36 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgattccactctacaaacagtgg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  || | ||||||||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 20373399  T
Q  135 ggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||| ||  || |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||    
T  20373400 ggtgttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttc 20373466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32373677 - 32373478
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-tg 99  Q
    ||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  32373677 cttaagtgtcacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgataccattg 32373578  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||   ||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||    
T  32373577 gggtggaacttttgatgccactgtacaaacagt--ggagttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttattggaaaagtcattctcatgact 32373480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 45174713 - 45174524
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat- 98  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45174713 cttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 45174614  T
Q  99 gggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttatt--cactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagt 186  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||| |  ||| | | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  45174613 gggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagt 45174524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 4761617 - 4761802
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtgggg-tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4761617 cttaagtgttatactttgtgggggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatg 4761716  T
Q  100 -ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaa 184  Q
     ||||||||||||||||  || | |||||||||||  |||||| ||| || |||||||||  ||||||  |||||||| |||||||    
T  4761717 aggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaagtgttactcattacatttttgatattatagtattaacttcaccaaaaaa 4761802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 33698360 - 33698260
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33698360 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactctgg 33698261  T
Q  101 g 101  Q
    |    
T  33698260 g 33698260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 47481729 - 47481546
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  |||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  47481729 cttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatga 47481630  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaa 183  Q
    || || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  47481629 gggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 47481546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 24488931 - 24489132
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  24488931 cttaagtgttacaccttgtgaggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatgg 24489030  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  || | | ||||||||||  ||||| |||| | |||||| ||  ||||||  ||||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  24489031 ggactgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtggaatgttactcacaacatttttaatactatagtcttaacttcacaaaaaaaatcattttcgtgact 24489130  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  24489131 tc 24489132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 29164021 - 29163912
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggac 103  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  29164021 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggac 29163922  T
Q  104 tgaacttttg 113  Q
    ||||||||||    
T  29163921 tgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25579946 - 25579746
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || |||||||| ||| |    
T  25579946 cttaagtgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatgg 25579847  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||| ||| |  |||||||||| | | |||||||| ||||||  |||||||| || |||| ||||| |||| |||    
T  25579846 ggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtagaatgttattcacaacacttttgatgctatagtattaacttcaccagaaaaatcattctcataact 25579747  T
Q  200 t 200  Q
    |    
T  25579746 t 25579746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 33378754 - 33378930
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  33378754 cttaagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatgg 33378853  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttca 176  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||| | ||||||  || |||||| | |||||||  ||||||| | ||||||    
T  33378854 ggactgaacttttgatgtcaccgtacaaatattggggtactactcactacacttttgatactatagtgttgacttca 33378930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 14586643 - 14586785
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-atgggac 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  14586643 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 14586742  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcac 146  Q
      ||||||||||  |||| || ||| |||| ||||||| ||||    
T  14586743 aaaacttttgatatcactgtataaatagtgaggtgttactcac 14586785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Original strand, 24708085 - 24708231
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagat--taagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708085 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 24708184  T
Q  100 -ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcact 147  Q
      |||||||||||||||  |||| |||  |||||| ||||||| |||||    
T  24708185 aagactgaacttttgatgtcactgtac--acagtgaggtgttactcact 24708231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 201
Target Start/End: Original strand, 27480375 - 27480549
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gggactgaacttttgattccactctaca 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  ||||    
T  27480375 acacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtaca 27480474  T
Q  127 aacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||| | || || || ||| |||| |||||||| ||||||| | |||| | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  27480475 aacaattggatgctactcattatacttttgatgttatagtgttgactttaccaaaaatatcattctcatgacttc 27480549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 54506014 - 54505825
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||| | || | |  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||     
T  54506014 cttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatga 54505915  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
    | ||||| |||||||  || |||| ||| | |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  54505914 ggctgaatttttgatgtcattctataaataatggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcatt 54505825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 21009771 - 21009938
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||| | || | |  |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  21009771 cttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatga 21009870  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtg 167  Q
    || |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  21009871 gggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtg 21009938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 46994630 - 46994745
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||     
T  46994630 cttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatga 46994729  T
Q  100 ggactgaacttttgat 115  Q
    ||||||||||||||||    
T  46994730 ggactgaacttttgat 46994745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 43975861 - 43976055
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggac 103  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  43975861 agtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggat 43975960  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    | ||||||||||  ||   |||||| ||||| ||| || |||||| | |||||||| ||||||| | |||   |||||||||||||| ||||||||||    
T  43975961 taaacttttgatgtcatcgtacaaatagtggagtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgact---tcaaaaaagtcattctcatgacttc 43976055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 53176261 - 53176146
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53176261 cttaagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 53176162  T
Q  100 ggactgaacttttgat 115  Q
    ||||||||||||||||    
T  53176161 ggactgaacttttgat 53176146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40936170 - 40935997
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgattccactctaca 126  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |    
T  40936170 acacttaaaaaaagtt-ggataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtata 40936072  T
Q  127 aacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||| || ||||||| || | | | |||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  40936071 aacaatgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttc 40935997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 22622687 - 22622780
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgata 94  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22622687 cttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38591905 - 38591727
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||     
T  38591905 cttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgt 38591806  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaa----acagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaactt 174  Q
    ||||| |||||||||| ||| | |||||    ||| || | ||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  38591805 ggacttaacttttgatgccattgtacaacaatacaatgagatgttactccctataattttgatgttatagtgttaactt 38591727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 54828671 - 54828870
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||      
T  54828671 ttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatgatgaattgatgatgctatgaa 54828770  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    || |||| |||||||  |  | |  |||| ||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||| | ||||| |||||||    
T  54828771 gaatgaatttttgatgtcgttgtttaaacggtggggtgttactcattacattttt-atgttatagtgttaactttaccaaaaaaattatttttatgactt 54828869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 11835596 - 11835697
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaa-attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 99  Q
    ||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11835596 cttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatgatactatg 11835695  T
Q  100 gg 101  Q
    ||    
T  11835696 gg 11835697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 36012345 - 36012246
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  36012345 cttaagtgttacattttgtgggatgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgatattatg 36012246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 1089901 - 1089811
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtgggg-tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  1089901 cttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagtcctgttgatctgataaattgat 1089811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 130
Target Start/End: Original strand, 53811695 - 53811767
Alignment:
Q  65 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggg-------actgaacttttgattccactctacaaaca 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  53811695 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggttatatactgaacttttgatgccactgtacaaaca 53811767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 201
Target Start/End: Original strand, 55343401 - 55343454
Alignment:
Q  148 atatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  55343401 atatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttc 55343454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2613967 - 2613896
Alignment:
Q  130 agtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||| ||||||| |||| | | ||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2613967 agtgtggtgttactcacaacacttttggtgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattttaatgacttc 2613896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Original strand, 20373214 - 20373263
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaa 51  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||    
T  20373214 ttaagtgttacactttatgggatattacgcttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11071397 - 11071195
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11071397 cttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatga 11071298  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagt-cattttcatgac 198  Q
    | ||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||||||    
T  11071297 gaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcgctatatttttgatgatatagtactaactttaccaaaaaaatacattttcatgac 11071198  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  11071197 ttc 11071195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22687426 - 22687229
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gggac 103  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22687426 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggac 22687327  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22687326 tgaacttttgataccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttc 22687229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21991827 - 21991626
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21991827 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 21991728  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| || | | | |||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  21991727 ggactgaacttttgatgacactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgact 21991628  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  21991627 tc 21991626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Original strand, 44413351 - 44413550
Alignment:
Q  3 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg-g 101  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  44413351 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggag 44413450  T
Q  102 actgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttca-tcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    || |||||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44413451 accgaacttttgatttcagtgtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattttcatgactt 44413550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 201
Target Start/End: Original strand, 31520721 - 31520894
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggactgaacttttgattccactctacaa 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  31520721 acacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatgggactgaacttttgatgtcactgtacaa 31520820  T
Q  128 acagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31520821 acaatggagtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttc 31520894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27283934 - 27283734
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  27283934 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgag 27283835  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| || ||||    
T  27283834 gactgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttataactt 27283735  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  27283734 c 27283734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7334985 - 7334784
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  7334985 cttaagtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatga 7334886  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    | ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||| || || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7334885 gaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatattttatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattctcacgact 7334786  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  7334785 tc 7334784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12165939 - 12165742
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac-tatgggac 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12165939 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggac 12165840  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||    
T  12165839 ttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaacgacttc 12165742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 32821023 - 32821224
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  32821023 cttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacga 32821122  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32821123 ggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatattgttaacttcaccaaaaaaatcattttcatgact 32821222  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  32821223 tc 32821224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43686230 - 43686031
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  43686230 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagg 43686131  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| | |||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  43686130 gactgaacttttgatgccattgtacaaacagt-gggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcacccaaaaagtcattttcgtgactt 43686032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18797518 - 18797319
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  18797518 cttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatga 18797419  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||| ||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18797418 ggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttttatg--ttagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgact 18797321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37347212 - 37347012
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||     
T  37347212 cttaagtgttacactttgtggagttta-cacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatga 37347114  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37347113 ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaaatcattttcatgact 37347014  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  37347013 tc 37347012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 38258736 - 38258535
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38258736 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 38258637  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||| ||||||||||||  || | ||||||| ||| ||||||| ||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  38258636 ggattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgact 38258537  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  38258536 tc 38258535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 41765048 - 41765249
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41765048 cttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 41765147  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  41765148 ggactggacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtattgactttatcagaaaagtcattctcatgact 41765247  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  41765248 tc 41765249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30055718 - 30055516
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30055718 cttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatga 30055619  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatc-aaaaaagtcattttcatgac 198  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||| || | |||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  30055618 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaaagtcattcttatgac 30055519  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  30055518 ttc 30055516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 5657451 - 5657652
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  5657451 cttaagtattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatga 5657550  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  5657551 agactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgact 5657650  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  5657651 tc 5657652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 15612729 - 15612870
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15612729 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatag 15612828  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgtta 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15612829 ggactgaacttttgatgccactctacaaacactggggtgtta 15612870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24211932 - 24211731
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||| |||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  24211932 cttaggtgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatga 24211833  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    || ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  24211832 gggctgaacttttgatgccattctataaacagtagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgact 24211733  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  24211732 tc 24211731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4583109 - 4582909
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  4583109 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggg 4583010  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||||||||||  || | |||||| |||||||||||| |||| | |||||||||  ||||||  |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  4583009 gactgaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtattaacttcaccagaaaagtcattttcgtgactt 4582910  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  4582909 c 4582909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27421350 - 27421550
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |    
T  27421350 cttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaatttatgatattatag 27421449  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||||||||||  || | |||||||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| |||||    
T  27421450 gactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattatcacgactt 27421549  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  27421550 c 27421550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8861472 - 8861275
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gggac 103  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8861472 agtgttacactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggac 8861373  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||| |||||||   | |||||||||| ||||||||||    
T  8861372 ttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgttaacttcgcgagaaaagtcattctcatgacttc 8861275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 9355797 - 9355997
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |    
T  9355797 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgag 9355896  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
     ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||  |||||| |||||||||    
T  9355897 aactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattgctcactacattttttatgctatagtgttaaattcaccaaaatggtcattctcatgactt 9355996  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  9355997 c 9355997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37110065 - 37109862
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggta--ggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37110065 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattat 37109966  T
Q  99 gg-gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 197  Q
       |||||||||||||||  || | ||||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37109965 aatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatga 37109866  T
Q  198 cttc 201  Q
    ||||    
T  37109865 cttc 37109862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Original strand, 48928275 - 48928466
Alignment:
Q  9 ttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggactgaac 108  Q
    ||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48928275 ttacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatgggactgaac 48928374  T
Q  109 ttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||  |||  |||||| ||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||||    
T  48928375 ttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 48928466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10481796 - 10481611
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10481796 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataa 10481697  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagt-ggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaa 184  Q
     ||||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  10481696 agactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttcattaaaaaa 10481611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23111383 - 23111180
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggata--aaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  23111383 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactac 23111284  T
Q  99 g-ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 197  Q
    |  |  |||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||    
T  23111283 gatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcacaatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcatga 23111184  T
Q  198 cttc 201  Q
    ||||    
T  23111183 cttc 23111180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 48928542 - 48928734
Alignment:
Q  9 ttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggactgaac 108  Q
    ||||||||| || ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48928542 ttacactttctgaggtgttacacttaaaataatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatgggactgaac 48928641  T
Q  109 ttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||  |||  |||||| ||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  48928642 ttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 48928734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 17842554 - 17842757
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggta--ggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || |||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17842554 cttaagtgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattat 17842653  T
Q  99 -gggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 197  Q
       |||||| ||||||||  || | ||||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17842654 aatgactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatga 17842753  T
Q  198 cttc 201  Q
    ||||    
T  17842754 cttc 17842757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26980487 - 26980325
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gggactgaacttttgattccactctaca 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26980487 acacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtaca 26980388  T
Q  127 aacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcat 189  Q
    ||| ||||||||||| |||| | | |||||||| |||| || |||||||| || |||||||||    
T  26980387 aaccgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccataaaagtcat 26980325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 31579034 - 31579240
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31579034 cttaagtgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 31579133  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactcta-----caaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttca 194  Q
     |||||||||||||||  || | ||      |||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | ||| | |    
T  31579134 agactgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaattattctta 31579233  T
Q  195 tgacttc 201  Q
    |||||||    
T  31579234 tgacttc 31579240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 10359184 - 10359385
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt-aagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  10359184 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatc 10359283  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     |||||||||||||||  |||| || ||| ||| || ||||| |||||| | |||||||| ||||    ||| || | || |||||||||| ||||||||    
T  10359284 agactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaggatgttactcactacacttttgatgctataagattaattttaccagaaaagtcattatcatgact 10359383  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  10359384 tc 10359385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32432643 - 32432447
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32432643 cttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgg 32432544  T
Q  101 -gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     |||||||||||||||  || | |||||||| |||||||||| |||| | |||||||     |||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  32432543 agactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcacaacatttttg-----atagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgact 32432449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6546709 - 6546509
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg- 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6546709 ttaagtgttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgga 6546610  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
     | | ||||||||||   ||| |||||| |||||||||||| || | | | |||||||| ||||||| ||||||||  | |||| ||||| | |||||||    
T  6546609 tagtaaacttttgatgttactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcactagaaaaatcattcttatgactt 6546510  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  6546509 c 6546509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 25691514 - 25691716
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||||||      
T  25691514 cttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataa 25691613  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggt-gttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||| |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||    
T  25691614 gaactgaactgttgatgccactgtacaaacagtgaggtaattactcacaatacttttgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattctcatgac 25691713  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  25691714 ttc 25691716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29173706 - 29173541
Alignment:
Q  26 taacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgattccactcta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | ||    
T  29173706 taacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgta 29173607  T
Q  125 caaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
    |||||||||| |||||| |||| | | |||||||  || |||| |||||||| || ||||||||||    
T  29173606 caaacagtggagtgttactcacaacacttttgatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 29173541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 12390627 - 12390787
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gggactgaacttttgattccactctaca 126  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||  ||||  |||    
T  12390627 acacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcactgcaca 12390726  T
Q  127 aacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtc 187  Q
    ||||||||| ||||| ||| || | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12390727 aacagtgggatgttactcattacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtc 12390787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 37704348 - 37704248
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37704348 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgg 37704249  T
Q  101 g 101  Q
    |    
T  37704248 g 37704248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 33688238 - 33688432
Alignment:
Q  7 tgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gggactg 105  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  33688238 tgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactg 33688337  T
Q  106 aacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||| || ||||| |||  | | |||||||| ||||||| |||||| | || |||||||||| |||| |||||    
T  33688338 aacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt-accagaaaagtcattctcataacttc 33688432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 15672732 - 15672833
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15672732 cttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgg 15672831  T
Q  101 ga 102  Q
    ||    
T  15672832 ga 15672833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 44598857 - 44598736
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  44598857 cttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgg 44598758  T
Q  100 ggactgaacttttgattccact 121  Q
    ||| |||| ||||||| |||||    
T  44598757 ggattgaatttttgatgccact 44598736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 32593186 - 32593325
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggactgaacttttgattccactctacaa 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  || ||    
T  32593186 acacttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgtgagactgaacttttgataccaccatataa 32593285  T
Q  128 acagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtg 167  Q
    ||||||||||| || |||||| | |||| ||| |||||||    
T  32593286 acagtggggtgctactcactacacttttaatgctatagtg 32593325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 201
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524498
Alignment:
Q  68 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagt 166  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||| ||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  167 gctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    | |||| ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  26524464 gttaacatcaccagaaaagtcattctcatgacttc 26524498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 73
Target Start/End: Original strand, 26588058 - 26588126
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgt 73  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26588058 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 37703468 - 37703551
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 84  Q
    |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37703468 cttaagtggtacactttgtgggatgttacacttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 43925264 - 43925178
Alignment:
Q  29 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgat 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43925264 cacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgat 43925178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35353235 - 35353123
Alignment:
Q  66 agtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gggactg-aacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatat 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||   |||||||| ||||||| || |||||| | |||||||| |||    
T  35353235 agtcttgttaatctgatgaattggtgatactatggggacagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacacttttgatgctat 35353136  T
Q  164 agtgctaacttca 176  Q
    |||| | ||||||    
T  35353135 agtgttgacttca 35353123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 38053642 - 38053493
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgattccactctaca 126  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||| | ||||||||||||||  || | ||||    
T  38053642 acacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgacactatgagaactgaacttttgatgtcattgtaca 38053551  T
Q  127 aacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaa 184  Q
    |||||| |||| ||| ||| || |||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||    
T  38053550 aacagtagggttttactcattacattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 38053493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 46481099 - 46481182
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 84  Q
    ||||||||||||||||| || | | | ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  46481099 cttaagtgttacactttatgagatgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 174
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362292
Alignment:
Q  87 tgatgatactatggga-ctgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaactt 174  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| ||||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 34362292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8299257 - 8299205
Alignment:
Q  149 tatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  8299257 tatttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttc 8299205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 130; Significance: 1e-67; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 29242125 - 29242326
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29242125 cttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatga 29242224  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  29242225 agactgaacttttgataccactgtacaaacagtggggtgttacgcactatattttttatgttatagttttaacttcaccaaaaaaaccattttcatgact 29242324  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  29242325 tc 29242326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 33550973 - 33551174
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33550973 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 33551072  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     ||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  33551073 agaccgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcattctcatgact 33551172  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  33551173 tc 33551174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4167137 - 4166937
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  4167137 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggg 4167038  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  4167037 gactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgactt 4166938  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  4166937 c 4166937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Original strand, 27349930 - 27350109
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggact 104  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27349930 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggact 27350029  T
Q  105 gaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaa 184  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  27350030 gaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactcacaacatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaa 27350109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4763847 - 4763643
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4763847 cttaagtgttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgg 4763748  T
Q  101 g-actgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatag---tgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatg 196  Q
    | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4763747 gaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactacagttttgttgatatagtgttgttaacttcatcagaaaagtcattttcatg 4763648  T
Q  197 acttc 201  Q
    |||||    
T  4763647 acttc 4763643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19424615 - 19424816
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19424615 cttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 19424714  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  19424715 ggactaaacttttgatgccactatataaacaatggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagccattctcatgact 19424814  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  19424815 tc 19424816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 33660360 - 33660556
Alignment:
Q  6 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggact 104  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  33660360 gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggact 33660459  T
Q  105 gaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||| |  | |||||||||||| ||||||||    
T  33660460 gaacttttgatgccactgtacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttaactagaaaagtcattttaatgacttc 33660556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 4264064 - 4264265
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4264064 cttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatgg 4264163  T
Q  101 -gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||| | || |||||||||| | ||||||    
T  4264164 agactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattatgatgact 4264263  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  4264264 tc 4264265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 19289310 - 19289500
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||     
T  19289310 cttaagtgttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtga 19289409  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
    | ||| ||||||||||  || | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19289410 gaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatt 19289500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3177155 - 3176962
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  3177155 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatga 3177056  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttc 193  Q
    ||||||||||||||||  || | |||||||||| | |||||| |||  | |||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  3177055 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgcgtgttactcaaaacatttttgatattatagtattaacttcatcagaaaagtcattttc 3176962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19314063 - 19313867
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggact 104  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19314063 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataggact 19313964  T
Q  105 gaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||||  |||| || ||| |||  ||||||| |||| | | |||||||| |||| || |||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  19313963 gaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttc 19313867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26357792 - 26357592
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gg 100  Q
    |||||||||||| |||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |  ||||  |    
T  26357792 ttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataag 26357693  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
     ||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26357692 aactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgactt 26357593  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  26357592 c 26357592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36642204 - 36642001
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaa--ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36642204 cttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactat 36642105  T
Q  99 g-ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 197  Q
    | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| || | | | |||||||| ||||||  ||| |||| || |||||||||| ||||||    
T  36642104 gaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtattaatttcaccagaaaagtcattctcatga 36642005  T
Q  198 cttc 201  Q
    ||||    
T  36642004 cttc 36642001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 43648232 - 43648415
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  43648232 cttaagtgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatga 43648331  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaa 183  Q
     |||||||||||||||  || | ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  43648332 tgactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaa 43648415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 17071724 - 17071925
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17071724 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 17071823  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
      || |||||||||||  || | |||||| | || | ||||| | |||| ||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  17071824 ataccgaacttttgatgtcattgtacaaataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgact 17071923  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  17071924 tc 17071925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 43770830 - 43771026
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-atgggac 103  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  43770830 agtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggac 43770929  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||    
T  43770930 tgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaa-tcattctaatgacttc 43771026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44286165 - 44285964
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  44286165 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaatttatgatactatgt 44286066  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||  || | | | |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||    
T  44286065 ggactaaacttttgatgccactatacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaaatcattcgcatgact 44285966  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  44285965 tc 44285964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4478581 - 4478383
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4478581 cttaagtgttacactttgtg-----ttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 4478487  T
Q  100 -ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttc-atga 197  Q
     ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  4478486 aggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaatatcattttctatga 4478387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37905925 - 37905724
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtgggg--tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37905925 ttaagtgttacactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 37905826  T
Q  100 -ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
     ||||||||||||||||  || | ||||||| ||||||||||| ||  || |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| || ||    
T  37905825 aggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaa-tcatttttataac 37905727  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  37905726 ttc 37905724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 41961056 - 41960941
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41961056 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgt 41960957  T
Q  100 ggactgaacttttgat 115  Q
    ||||||||||||||||    
T  41960956 ggactgaacttttgat 41960941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 17054084 - 17054284
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  17054084 ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaa 17054183  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
     || | |||||||||  || | |||||||| || | ||||| | |||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  17054184 taccgnacttttgatgtcattgtacaaacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgactt 17054283  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  17054284 c 17054284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 31570721 - 31570922
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  31570721 cttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgt 31570820  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||| |||||||||||| | || | | |||| ||| ||||||| ||| |||| || |||||| ||| |||| |||    
T  31570821 ggactgaacttttgatgtcactataaaaatagtggggtgttacttacaacacttttaatgttatagtgttaatttcaccagaaaagttattctcataact 31570920  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  31570921 tc 31570922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 39167356 - 39167551
Alignment:
Q  7 tgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactg 105  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  39167356 tgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactg 39167455  T
Q  106 aacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||  |||  || |||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  39167456 aacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttactcacaatacttttgatactattctgttaacttcatcaaaaaaatcattctcgtgacttc 39167551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33902281 - 33902094
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  33902281 ttaagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaatatagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgag 33902182  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||   ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  33902181 gactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtattactcactacattttttatg--ttagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 33902094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 33709219 - 33709395
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  33709219 cttaagtgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatgg 33709318  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttca 176  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| |||||| || | | | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  33709319 ggactgaacttttgatgtcactgtactaacagtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaacttca 33709395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 2325365 - 2325547
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||     
T  2325365 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgatactatga 2325456  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||| || |||| ||||| |||| || ||||||||  | ||||||||||    
T  2325457 ggactgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaacttcacgagaaaagtcatt 2325547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44913880 - 44913677
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtgggg-tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat- 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  44913880 cttaagtgttacactttgtgggggtgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 44913781  T
Q  99 -gggactgaacttttgattccactctacaaac-agtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatg 196  Q
     |||| ||||||||| ||  || | ||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||  || |||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  44913780 ggggattgaactttttatgtcattttacaaacaagtgaggtgttactcacaacatttttgatactacagtgttaacttca-cataaaagtcattttcgtg 44913682  T
Q  197 acttc 201  Q
    |||||    
T  44913681 acttc 44913677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 45327936 - 45327821
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||| |||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45327936 cttatgtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 45327837  T
Q  100 ggactgaacttttgat 115  Q
     |||||||||||||||    
T  45327836 tgactgaacttttgat 45327821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5881750 - 5881609
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-atgggac 103  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  5881750 agtgttacactttgtgaggtattacacttaaaacaaggtatgataaa-ttagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggac 5881652  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcac 146  Q
    | ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5881651 tcaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcac 5881609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 41463837 - 41464038
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  41463837 cttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaagtatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatga 41463936  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | |||||||  ||||||  |||||||| |||||| |||||| ||| ||||    
T  41463937 ggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgattttatagtattaacttcaccaaaaatgtcattctcacgact 41464036  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  41464037 tc 41464038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 11366368 - 11366558
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |   ||| |||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  11366368 cttaagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatga 11366467  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
    || |||||||||||||  || | |||||| |||| | ||||| ||| || |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  11366468 gggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcatt 11366558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13711635 - 13711479
Alignment:
Q  46 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattc 144  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  13711635 gataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactc 13711536  T
Q  145 actatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    || | | |||||||| |||| || |||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  13711535 acaacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctgatgacttc 13711479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Original strand, 7006935 - 7007054
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggg-actgaacttttgattccactctaca 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||    
T  7006935 acacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtaca 7007034  T
Q  127 aacagtggggtgttattcac 146  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  7007035 aacagtgggatgttactcac 7007054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 18494268 - 18494456
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  18494268 cttaagtgtgactctttgtgaggttta-cacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatga 18494366  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  |            ||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18494367 ggactgaacttttgatgtc------------gtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgact 18494454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 31862067 - 31861971
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31862067 ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 31861971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 41465717 - 41465602
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |    
T  41465717 cttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatag 41465618  T
Q  100 ggactgaacttttgat 115  Q
    ||||||||||||||||    
T  41465617 ggactgaacttttgat 41465602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35959112 - 35958924
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||             
T  35959112 cttaactgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaattatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatg--------- 35959023  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
      |||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35959022 --ctgaacttttaatgtcattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttatagtggcaacttcaccaaaaaagtcatttttatgactt 35958925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 113
Target Start/End: Original strand, 19501760 - 19501839
Alignment:
Q  34 aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gggactgaacttttg 113  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19501760 aaaacaaagtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 18258274 - 18258349
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 76  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18258274 cttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 189
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051382
Alignment:
Q  72 gttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgattccact-ctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgct 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||  ||||||| ||| | | |||||||| ||||||  |    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactggtacaaatagtgaagtgttatacacaacacttttgatgctatagtatt 41051362  T
Q  170 aacttcatcaaaaaagtcat 189  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  41051363 agcttcatcagaaaagtcat 41051382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41960947 - 41960898
Alignment:
Q  152 ttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41960947 ttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatttctatgacttc 41960898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 201
Target Start/End: Original strand, 27139021 - 27139053
Alignment:
Q  169 taacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27139021 taacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 27139053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 201
Target Start/End: Original strand, 18514772 - 18514804
Alignment:
Q  169 taacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18514772 taacttcatcaaaaaagtcattctcatgacttc 18514804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 127; Significance: 9e-66; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 23116181 - 23116379
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23116181 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgt 23116280  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | |||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23116281 aaactgaacttttgattccactgtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatgttataatgttaacttcataaaaaaagtcattttcatgac 23116379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 201
Target Start/End: Original strand, 1429131 - 1429305
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg-gactgaacttttgattccactctaca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||    
T  1429131 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtaca 1429230  T
Q  127 aacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1429231 aacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaagagtcattttcatgacttc 1429305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12910571 - 12910365
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  12910571 cttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatga 12910472  T
Q  100 ggactgaacttttgat-----tccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttca 194  Q
    ||||||||||||||||     |  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  12910471 ggactgaacttttgatgtcactgtactgtacaaacagtggggtgttacgcactatatttttgatgttatagttttaacttcaccaaaaaagtcattttca 12910372  T
Q  195 tgacttc 201  Q
    |||||||    
T  12910371 tgacttc 12910365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 5112273 - 5112473
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5112273 cttaagtgttgtactttgtggggttta-cacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatgg 5112371  T
Q  101 g-actgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5112372 ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgact 5112471  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  5112472 tc 5112473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36866977 - 36866777
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  36866977 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgg 36866878  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||    
T  36866877 gactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgactt 36866778  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  36866777 c 36866777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 38528196 - 38528396
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38528196 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 38528295  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||| ||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  38528296 gactgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaaccattttcatgactt 38528395  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  38528396 c 38528396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 699366 - 699165
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  699366 cttaagtattacactttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatga 699267  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  699266 tgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactagattttttatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcataact 699167  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  699166 tc 699165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5837771 - 5837574
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5837771 cttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgg 5837672  T
Q  101 -gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 197  Q
     ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| || ||||| || |||||||||| ||||||    
T  5837671 agactgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaccttcaccagaaaagtcattctcatga 5837574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22981009 - 22980808
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22981009 cttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 22980910  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  || |   ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||| |||| |||    
T  22980909 ggactgaacttttgatgtcattgctcaaacagtggggtattactcactgtatttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataact 22980810  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  22980809 tc 22980808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 25500885 - 25501086
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25500885 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatag 25500984  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||| ||||||||||  || | ||||||||||| |||||||||||| | | |||||||| ||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||    
T  25500985 ggacttaacttttgatggcagtgtacaaacagtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgact 25501084  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  25501085 tc 25501086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19120075 - 19119874
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19120075 cttaagtgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatgg 19119976  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |  | | | |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  19119975 ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccacaaaagtcattctcatgact 19119876  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  19119875 tc 19119874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Original strand, 31786606 - 31786795
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31786606 ttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 31786705  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |  |||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31786706 gattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggcagtgctcactacatttttcatgctatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatt 31786795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32563361 - 32563164
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-atgggac 103  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  32563361 agtgttacactttgtgggctgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggac 32563262  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||| |||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  32563261 tgaacttttgatgtcactgtacagacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaatcattttaatgacttc 32563164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40133600 - 40133400
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||    
T  40133600 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggg 40133501  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||| | |||||||||  |||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  40133500 gactgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactataatgttaacttcaccacaaaagtcattttcgtgactt 40133401  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  40133400 c 40133400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7693442 - 7693245
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggac 103  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | |||     
T  7693442 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggat 7693343  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  7693342 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttc 7693245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 30969283 - 30969484
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30969283 cttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 30969382  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  || | || ||| |||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||| || | || ||||| ||||||||    
T  30969383 ggactgaacttttgatgtcattgtataaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagataaatcattctcatgact 30969482  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  30969483 tc 30969484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 35511441 - 35511637
Alignment:
Q  6 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggact 104  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||    
T  35511441 gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgact 35511540  T
Q  105 gaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||| | | |||||| |||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35511541 gaacttttgatgtcactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttataatgttaacttcatcagaaacgtcattttcatgacttc 35511637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 8741845 - 8742047
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8741845 cttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgg 8741944  T
Q  101 -gactgaacttttgattccactctacaaacagt-ggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
     ||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||    
T  8741945 agactgaacttttgatgccattgtacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgac 8742044  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  8742045 ttc 8742047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26268290 - 26268089
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26268290 cttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgt 26268191  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| |||  | | |||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  26268190 ggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcaaaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgact 26268091  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  26268090 tc 26268089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27318446 - 27318647
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  27318446 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtga 27318545  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    | ||| ||||||||||  || | |||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| | ||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  27318546 gaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtgttactcactacattttttatgttttagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgact 27318645  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  27318646 tc 27318647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33908449 - 33908248
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  33908449 cttaagtgttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatga 33908350  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| || |||||| | |||||||||||||||| | |||||| || |||  ||||| ||||||||    
T  33908349 ggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggagtgctactcactacacttttgatgatatagtgttgacttcaccagaaagttcattctcatgact 33908250  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  33908249 tc 33908248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 23954748 - 23954904
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23954748 cttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgg 23954847  T
Q  101 -gactgaacttttgattccact-ctacaaacagtggggtgttattcactatattttt 155  Q
      |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23954848 aaactgaacttttgatgccactagtaaaaacagtggggtgttactcactatattttt 23954904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9200445 - 9200248
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggac 103  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  9200445 agtgttacactttgtggaatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggac 9200346  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    | ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  9200345 taaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagttattttaatgacttc 9200248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 201
Target Start/End: Original strand, 14409313 - 14409486
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggactgaacttttgattccactctacaa 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||  |    
T  14409313 acacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagactgaacttttgatgccaccgtatta 14409412  T
Q  128 acagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    | ||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| | |||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  14409413 agagtggggtgctactcactacatttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttc 14409486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 28416490 - 28416662
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg-gac 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||     
T  28416490 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagat 28416589  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttca 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||    
T  28416590 tgaacttttgattccactgtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgatattatagtgttaacttca 28416662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 31705571 - 31705771
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||||||||||| |||||| | | | || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31705571 cttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactagag 31705670  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    ||||| |||||||||  || | ||||||| || |||||||| ||  || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  31705671 gactggacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgactt 31705770  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  31705771 c 31705771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22255397 - 22255196
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | || |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  22255397 ttaagtgttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgag 22255298  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactata-tttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  22255297 aactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttgatgttataatgttaacttcaccaaaaaagttatttttatgact 22255198  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  22255197 tc 22255196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36860639 - 36860438
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaa-ggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| |    
T  36860639 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatgg 36860540  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  36860539 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgact 36860440  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  36860439 tc 36860438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39573031 - 39572834
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggac 103  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  39573031 agtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaac 39572932  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||  ||||||  |||||| |  | |||||||||| ||||||||||    
T  39572931 tgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatattatagtattaacttaactagaaaagtcattctcatgacttc 39572834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 7208823 - 7209024
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7208823 cttaagtgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactagag 7208922  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatc-aaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||| || |||||||| ||  |  |||||| ||| || | || |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  7208923 gactgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtgttactcgttgcattttttatgttacaatgttaacttcaccaaaaaaagtcatttttatgact 7209022  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  7209023 tc 7209024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24886293 - 24886136
Alignment:
Q  28 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgattccactctaca 126  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||    
T  24886293 acacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtaca 24886194  T
Q  127 aacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaa 184  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||    
T  24886193 aacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaa 24886136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 14919487 - 14919671
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  14919487 cttaagtattacaatttgtgaggtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatga 14919586  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaa 184  Q
    ||||||||||||||||  || | || |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  14919587 ggactgaacttttgatgtcattatataaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttataatgttaacttcatcaaaaaa 14919671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35934112 - 35933917
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaat-tagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35934112 cttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 35934013  T
Q  100 g-gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
    | ||||| ||||||||| |||||        |||| ||||||| |||| | | |||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  35934012 gtgactggacttttgatgccact-------aagtgaggtgttactcacaacacttttgattctatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattctcatgac 35933920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22019844 - 22019658
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-atgggac 103  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||    
T  22019844 agtgttatactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggac 22019745  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
    | ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||| |||| | | |||||||  ||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  22019744 ttaacttttgatgtcactatacaaacaatggggtgttactcacaacacttttgattctatagttttaacttcaccagaaaagtcatt 22019658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 43308611 - 43308812
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||   |||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  43308611 cttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatga 43308710  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttca-tcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||| | | |||||||||||| |||||||    
T  43308711 ggactgaacttttgatgccattgtacgaacagt-gggtgttattcattacatttttgatgttataatgttaactttactaaaaaaagtcattctcatgac 43308809  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  43308810 ttc 43308812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15724704 - 15724505
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||| || ||||||||| || || | | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15724704 cttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgg 15724605  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||| ||||||  || | || |||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  15724604 gactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataactt 15724506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8466929 - 8466763
Alignment:
Q  32 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gggactgaacttttgattccactctacaaaca 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |    
T  8466929 ttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccactgtacaaaga 8466830  T
Q  131 gtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
    | |||||||||||||| | | |||||||| || |||| |||||||| || |||||||||| |||||||    
T  8466829 g-ggggtgttattcacaacacttttgatgttacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgac 8466763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27330520 - 27330332
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  27330520 cttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatga 27330421  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
     ||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||| |||  | | |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  27330420 agactgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 27330332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 6824438 - 6824599
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  6824438 cttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatgatactatga 6824537  T
Q  100 ggactga--acttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatg 159  Q
     ||||||  |||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||| | | ||||||||    
T  6824538 agactgaacacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatg 6824599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 21088725 - 21088926
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| |    
T  21088725 cttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatgg 21088824  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatc-aaaaaagtcattttcatgac 198  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || |||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  21088825 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtcactcacaacattttttatactacagt-ttaacttcaccaaaaaaagtcattttcgtgac 21088923  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  21088924 ttc 21088926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 22974041 - 22974242
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| | || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||     
T  22974041 cttaagtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatga 22974140  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    | | ||||||||||||   | | ||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| |||    
T  22974141 gaattgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcattacttttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataact 22974240  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  22974241 tc 22974242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 35826443 - 35826643
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||| |||||||||||||| || | || |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  35826443 cttaagggttacactttgtggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatga 35826541  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||  |||||| ||| || |||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  35826542 ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagtattaacttcacaaaaaaagtcattatcatgact 35826641  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  35826642 tc 35826643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 15992499 - 15992641
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15992499 cttaagtgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 15992598  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttat 142  Q
     |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||    
T  15992599 agactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattat 15992641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8437181 - 8436981
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||  |||||||||  |||     
T  8437181 cttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatg-gttgatgatataatga 8437083  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||| || | ||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  8437082 ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgggatgttactcactacactttggaagctatagtgttaatttcaccaaaaaaatcattctcatgact 8436983  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  8436982 tc 8436981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 42342942 - 42342783
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggact 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  42342942 agtgttacactttgtggtgtattacacttaaaacaag-taagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggg--- 42342847  T
Q  105 gaa--cttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagt 166  Q
    |||   |||||||  |||| || |||||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||    
T  42342846 gaaattttttgatgtcactgtataaacagtggggtattactcacaacatttttgatgttatagt 42342783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 17157990 - 17158165
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  17157990 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataa 17158089  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttca 176  Q
     ||| |||||||||||  || | ||||||| |||| |||||| ||| || |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  17158090 tgac-gaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttca 17158165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 35504581 - 35504484
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35504581 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactat 35504484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 13956321 - 13956505
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||      
T  13956321 cttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaattgatgatac-at-- 13956417  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
                 || | | | ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13956418 -------------atgcaagtgtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatgagaaaagtcattttcatgactt 13956504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 5830107 - 5830032
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 77  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5830107 ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgttaat 5830032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25668804 - 25668690
Alignment:
Q  62 gtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggg-actgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatga 160  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||     
T  25668804 gtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgt 25668705  T
Q  161 tatagtgctaacttca 176  Q
    || |||| ||||||||    
T  25668704 ta-agtgttaacttca 25668690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 201
Target Start/End: Original strand, 26317774 - 26317844
Alignment:
Q  131 gtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26317774 gtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttc 26317844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 25669797 - 25669737
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgta 66  Q
    |||||||||||| |||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25669797 agtgttacactt-gtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgta 25669737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 2888404 - 2888472
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtc 69  Q
    ||||||||||||||||| |||  | | | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2888404 cttaagtgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaaattagattaagtgtagtc 2888472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22255659 - 22255608
Alignment:
Q  132 tggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaa 183  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22255659 tggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaa 22255608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898017
Alignment:
Q  80 gatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatc 178  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||  ||| |||||||| ||| |  | |||||||| |||| |  |||||| | |    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctataatattaactttacc 11898040  T
Q  179 aaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    | |||||| ||| ||||||||||    
T  11898039 agaaaagttattatcatgacttc 11898017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5748475 - 5748443
Alignment:
Q  169 taacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5748475 taacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttc 5748443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 122; Significance: 8e-63; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 36493684 - 36493884
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  36493684 cttaagtgttacactttgtggagttta-cacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatgg 36493782  T
Q  101 g-actgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    | ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  36493783 ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgact 36493882  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  36493883 tc 36493884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 25701051 - 25701253
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtgggg-tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25701051 cttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatg 25701150  T
Q  100 -ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
     ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||| || |||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  25701151 aggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtagggtgttactcactacacttttgatgttataatgttaactttaccaaaaaagtcattatcatgac 25701250  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  25701251 ttc 25701253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37775879 - 37775684
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggact 104  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  37775879 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggg-gg 37775781  T
Q  105 gaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  37775780 gaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttaatattatagtgctaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttc 37775684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 35021030 - 35021231
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  35021030 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacga 35021129  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||  |||||||||  ||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35021130 ggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgact 35021229  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  35021230 tc 35021231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33341614 - 33341410
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341614 cttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 33341515  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattc---actat-atttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatg 196  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||   || || | |||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||| |||||    
T  33341514 gactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttcctcgcaacaatcaattttgatgatatagtgttaatttcaccagaaaaatcattctcatg 33341415  T
Q  197 acttc 201  Q
    |||||    
T  33341414 acttc 33341410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 37663736 - 37663935
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37663736 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 37663835  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||| || | |||| |||   ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  37663836 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacagttttaatg--ttagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttatgact 37663933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19089448 - 19089649
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19089448 cttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 19089547  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||| || | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  19089548 ggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaagttattcttatgact 19089647  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  19089648 tc 19089649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9139461 - 9139262
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  9139461 cttaagtgttacactttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgg 9139362  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||| ||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9139361 ggattgaactttttatgtcactgtacaaacggtggggtgttactcac--tattttttatgctataacgttaacttcaccaaaaaagtcaatttcatgact 9139264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 34948099 - 34948293
Alignment:
Q  8 gttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactga 106  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34948099 gttacactttgtggggtgttgcactttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactga 34948198  T
Q  107 acttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||| ||||||||||    
T  34948199 acttttgatgccactttacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcgccagaaaagtcattctcatgacttc 34948293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17167929 - 17167736
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17167929 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatgg 17167830  T
Q  101 -gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttc 193  Q
     || ||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  17167829 agaatgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcattttc 17167736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17173506 - 17173313
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17173506 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatgg 17173407  T
Q  101 -gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttc 193  Q
     || ||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  17173406 agattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcattttc 17173313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32592305 - 32592108
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-atgggac 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  32592305 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 32592206  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| || | | | |||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32592205 tgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactctcaacacttttgatactgtagtgttaacttcatcaaaaaagtcattataatgacttc 32592108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 19440643 - 19440843
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | || |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19440643 cttaagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatga 19440742  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| |||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19440743 ggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcattacatttttgatgttatagtgttaacatcaccaaaaaagtcattctcatgact 19440842  T
Q  200 t 200  Q
    |    
T  19440843 t 19440843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 28002982 - 28003182
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  28002982 ttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgat 28003081  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||  || | |||| | |||||||| ||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||||    
T  28003082 gactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtactactgactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 28003181  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  28003182 c 28003182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 55241100 - 55241300
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| |    
T  55241100 cttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctt-atctgataaattgatgatactatgg 55241198  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | | | ||||||| |||||||  ||||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  55241199 ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgataatatagtattaacttcactagaaaagtcattctcatgact 55241298  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  55241299 tc 55241300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 55477890 - 55478091
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggac 103  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55477890 agtgttacacgttgtggggtgttacacttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 55477989  T
Q  104 tgaacttttgattccactct----acaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||  || | |    ||||||||||| |||||| ||  || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  55477990 tgaacttttgatgtcattgtacaaacaaacagtggagtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgact 55478089  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  55478090 tc 55478091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Original strand, 46888154 - 46888353
Alignment:
Q  3 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-ggg 101  Q
    ||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| |||    
T  46888154 taagtgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatgggg 46888253  T
Q  102 actgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  46888254 actgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatgttatagtattaacttcatcagaaaagttattttcttgacttc 46888353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6864251 - 6864053
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  6864251 cttaagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatga 6864152  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
    |||||| ||||||||| | | | |||||| ||| || ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6864151 ggactggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattcattaaatttttgatgttatagtgataacttcaccaaaaaagtcattctcatgac 6864053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25184329 - 25184128
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25184329 cttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatga 25184230  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     || |||||||| |||  || | |||||||||| | |||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  25184229 agattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgact 25184130  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  25184129 tc 25184128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38012070 - 38011873
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  38012070 cttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatgg 38011971  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 197  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||    
T  38011970 ggactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatga 38011873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 49376183 - 49375981
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49376183 cttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 49376084  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatca-aaaaagtcattttcatgac 198  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  49376083 agactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactcacgacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaaagtcattctcatgac 49375984  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  49375983 ttc 49375981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 47253956 - 47253764
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||        |||||||||||     
T  47253956 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctg--------atgatactatga 47253865  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||| | |||||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  47253864 ggactgaacttttgatgtcactgtataaacaat-gggtgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgact 47253766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23761287 - 23761089
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    ||||| ||| ||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23761287 cttaaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggtag-ataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 23761189  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||| |  | || ||||||| ||||||||    
T  23761188 ggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttacaagaatagtcattctcatgact 23761089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 29584195 - 29584383
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  29584195 cttaagtgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatga 29584294  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
     ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||  | | |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  29584295 agactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 29584383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 34361488 - 34361687
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggg 101  Q
    |||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| |||| |    
T  34361488 ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgag 34361587  T
Q  102 actgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
     |||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  34361588 gctgaacttttaatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttc 34361687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4598203 - 4598008
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-atgggac 103  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  || | |||||    
T  4598203 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagc-aggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggac 4598105  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  4598104 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaaca-ctttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttc 4598008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 32912575 - 32912776
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  32912575 cttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatga 32912674  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |  |||||||||||||  || |||||||| | | |||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  32912675 gtgctgaacttttgatatcattctacaaatactagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgact 32912774  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  32912775 tc 32912776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 50697457 - 50697257
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  50697457 cttaagtgttgcactttgtgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactagag 50697358  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
     | ||||||||||||  || | ||||||| || |||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||| | ||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  50697357 aattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttatattttttatgttatagtgtttacttcactaaaaaaatcatttttatgactt 50697258  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  50697257 c 50697257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42199945 - 42199755
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42199945 cttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 42199846  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
    || |||||||||| ||  || |||||||| | |||||| ||| ||| || |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  42199845 gggctgaactttttatgtcattctacaaataatggggtattactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcatt 42199755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 879543 - 879744
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  879543 cttaaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatga 879642  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     || | ||||||||||  || | |||||||| || ||||||| ||| || |||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| | ||| ||||||||    
T  879643 agattaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtttacttcaccaaaaaaattattctcatgact 879742  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  879743 tc 879744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27396832 - 27396631
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27396832 cttaagtgtgacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 27396733  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||  ||||||||||  || | |||||||||| |||||||| |||  | | |||| ||| |||| || |||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  27396732 ggacgaaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcataacacttttaatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgact 27396633  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  27396632 tc 27396631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 4934197 - 4934353
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  4934197 cttaagtgttacactttgtgaggtgttggacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatga 4934296  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagt-ggggtgttattcactatattttt 155  Q
    ||| |||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||    
T  4934297 ggattgaacttttgatgccagtgtacaaacaatgggggtgttactcactacattttt 4934353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Original strand, 33816536 - 33816728
Alignment:
Q  9 ttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg-gactgaa 107  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  33816536 ttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaa 33816635  T
Q  108 cttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||| ||||  || ||| |||| |||| || |||||| | |||||||| || | || | |||||| || |||| ||||| |||||||||    
T  33816636 cttttgatgccaccgtataaatagtgaggtgctactcactacacttttgatgctacaatgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 33816728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7703725 - 7703533
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||| |    
T  7703725 cttaagtgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctg--------atgatactatgg 7703634  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| | || | | |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  7703633 ggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgact 7703534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 5047961 - 5048161
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5047961 cttaagtgttacattttgcggg-tattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgg 5048059  T
Q  101 g-actgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    | ||||||||||||||  ||   ||||||||||| |||  || |||||| | |||||||| ||||| | | |||||| || |||| ||||| |||| |||    
T  5048060 gaactgaacttttgatatcatcgtacaaacagtgtggtcctactcactacacttttgatgttatagagttgacttcaccagaaaaatcattctcataact 5048159  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  5048160 tc 5048161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 50764905 - 50764747
Alignment:
Q  42 gtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgtt 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  50764905 gtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgtt 50764806  T
Q  141 attcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    | |||| | | ||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  50764805 actcacaacacttttgatg--ttagtgttaacttcatcaaaaaagttattctcatgacttc 50764747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Original strand, 54499239 - 54499424
Alignment:
Q  8 gttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gggactg 105  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  54499239 gttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactg 54499338  T
Q  106 aacttttgattccact-ctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
    ||||||||||  || |  ||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  54499339 aacttttgatgtcattagtacaaacggtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 54499424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1815517 - 1815409
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  1815517 cttaagtgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatga 1815418  T
Q  100 ggactgaac 108  Q
    |||||||||    
T  1815417 ggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 30002631 - 30002820
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggac 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||||||| |  |||    
T  30002631 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------tgatgatactaagaagac 30002722  T
Q  104 tgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||| | | |||||||| || |||| |||||||| || |||| ||||||| ||||||||    
T  30002723 tgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgctacagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgacttc 30002820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 35025591 - 35025784
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||        ||||||||||| |     
T  35025591 cttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaacaagataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatc--------tgatgatactacga 35025682  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||||||||||||||||  ||   || ||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||    
T  35025683 ggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattttcatgact 35025782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 32579662 - 32579548
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||| |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  32579662 cttaagagttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatga 32579563  T
Q  101 gactgaacttttgat 115  Q
    |||| ||||||||||    
T  32579562 gactaaacttttgat 32579548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 17272180 - 17272069
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||       
T  17272180 cttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatacta--- 17272084  T
Q  101 gactgaacttttgat 115  Q
    |||||||||||||||    
T  17272083 gactgaacttttgat 17272069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39398115 - 39397933
Alignment:
Q  11 acactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact-atgggactgaact 109  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||||| |   |||||||||    
T  39398115 acactttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgtt---------aattgatgatactgagaagactgaact 39398025  T
Q  110 tttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||  |||| |||||||| |||||||||| |||| | | |||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  39398024 tttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctaatgacttc 39397933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 3042835 - 3042741
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3042835 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgatac 3042741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37287944 - 37287748
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggta-taacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||  | ||||          
T  37287944 cttaagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatcttatgatattatga------ 37287851  T
Q  99 gggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatc-aaaaaagtcattttcatga 197  Q
     ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||| |||| |    
T  37287850 -ggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaaagtcattctcatta 37287752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4205209 - 4205131
Alignment:
Q  123 tacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4205209 tacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttc 4205131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 53124372 - 53124302
Alignment:
Q  131 gtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  53124372 gtggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttc 53124302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4396418 - 4396341
Alignment:
Q  124 acaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  4396418 acaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcatttttatgacttc 4396341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 23518400 - 23518473
Alignment:
Q  102 actgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttc 175  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||||| |||||||    
T  23518400 actgaatttttgatgccactgtattaacagtggggtgttagtcactacagttttaatgttatagtgttaacttc 23518473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Original strand, 46884133 - 46884177
Alignment:
Q  31 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgtta 75  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46884133 cttataacaagatatgataaaattagattaagtgtagtctcgtta 46884177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 119; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8103 - 7913
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8103 cttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 8004  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcatt 190  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8003 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatt 7913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 94352 - 94547
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  94352 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcatgaattgatgatagtatgg 94451  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcat 195  Q
    ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  94452 ggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcat 94547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 350 - 149
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  350 cttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatga 251  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||  || |||| |||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  250 ggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgact 151  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  150 tc 149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 408398 - 408556
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  408398 cttaagtgttccactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactagag 408497  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatg 159  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||| ||  ||||||| ||| || ||||||||||    
T  408498 gactgaacttttgatttcattttacaaacggtaaggtgttactcattacatttttgatg 408556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 7235003 - 7235203
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  7235003 cttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatga 7235102  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||| | |||||| |  |||||||||| |||| ||||    
T  7235103 gactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccggaaaagtcattctcataactt 7235202  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  7235203 c 7235203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 4318790 - 4318992
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 99  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4318790 cttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatg 4318889  T
Q  100 ggact-gaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
    ||  | |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||  | | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4318890 ggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcataacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgac 4318989  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  4318990 ttc 4318992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29182380 - 29182178
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtgggg-tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29182380 cttaagtgttacactttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatg 29182281  T
Q  100 g-gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgac 198  Q
    | |||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  29182280 gagactgaacttttgatgacactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcaataaaatcattctcatgac 29182181  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  29182180 ttc 29182178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 21017080 - 21017281
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  21017080 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgg 21017179  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||| | |||||||||| |||| | |||||| ||  || | || |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21017180 ggactgaacttttgatgccattgtacaaataatggggtgttactcacaacattttttatactacaatgttaacttcaccaaaaaagtcattttcgtgact 21017279  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  21017280 tc 21017281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15491830 - 15491631
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15491830 ttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 15491731  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||| | | |||||||| || | || ||||||||  | |||||||||| |||| ||||    
T  15491730 ggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttacaatgttaacttcacgagaaaagtcattctcataactt 15491631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 33892975 - 33893146
Alignment:
Q  5 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggact 104  Q
    |||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33892975 agtgttacactttgtggggtgttatacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggact 33893074  T
Q  105 gaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttca 176  Q
    |||||||| ||  || | |||||| |||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  33893075 gaacttttaatatcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca 33893146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1946050 - 1945848
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  1946050 cttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatga 1945951  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatc-aaaaaagtcattttcatgac 198  Q
    || |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| | |||||    
T  1945950 gggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaagtcattcttatgac 1945851  T
Q  199 ttc 201  Q
    |||    
T  1945850 ttc 1945848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5627607 - 5627406
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  5627607 cttaagtattacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatga 5627508  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    || |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  5627507 gggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgact 5627408  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  5627407 tc 5627406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 7055184 - 7055384
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    |||||||||||||||||| | || | ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  7055184 ttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgag 7055283  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
    | |||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||| | | ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  7055284 ggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggtgttactaattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgactt 7055383  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  7055384 c 7055384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 3879907 - 3880108
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-g 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  3879907 cttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgg 3880006  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    ||| ||||||||||||  || | |||||||||| |||||||| |||| | | |||||||  |||| || |||||||| || |||||||||| || |||||    
T  3880007 ggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcacaacacttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcgtgact 3880106  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  3880107 tc 3880108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 30353326 - 30353527
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30353326 cttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatgg 30353425  T
Q  101 -gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| | | ||| || | | | |||||||| |||| || |||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  30353426 agactgaactatcgatgccactgtacaaacagtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgact 30353525  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  30353526 tc 30353527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8513419 - 8513248
Alignment:
Q  32 ttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggg-actgaacttttgattccactctacaaac 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  8513419 ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 8513320  T
Q  130 agtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||||| |||| | | |||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  8513319 agtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 8513248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 6091152 - 6091351
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-g 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  6091152 ttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgag 6091251  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgactt 200  Q
     ||||||||||||||  || | |||||||| ||| |||||| |||||| |||||| ||| || | || |||||| | ||||||| | |||||||||||||    
T  6091252 tactgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactcactacattttttatgttaca-tgttaactttaccaaaaaaattattttcatgactt 6091350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6089094 - 6088923
Alignment:
Q  32 ttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg-gactgaacttttgattccactctacaaac 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6089094 ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaac 6088995  T
Q  130 agtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||| |||| |||| | | |||||||  ||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  6088994 agtggggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttc 6088923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20768298 - 20768101
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  20768298 cttaagtgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaa--gtaatcttgttaatctgatgaattaatgatactatga 20768201  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| | || || || |||||| | |||||||| ||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||    
T  20768200 ggactgaacttttgatgccact-aacaaacaat-ggatgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgact 20768103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33619010 - 33618864
Alignment:
Q  41 ggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||  |||||| | |||| ||     
T  33619010 ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttgc 33618911  T
Q  140 tattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagt 186  Q
    || |||||| | ||||||||  |||||| | |||||| || ||||||    
T  33618910 tactcactacacttttgatgcgatagtgttgacttcaccagaaaagt 33618864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498448
Alignment:
Q  86 ttgatgatactatg-ggactgaacttttgattccactctacaaacagt-ggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaa 183  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||  |||||| | |||||||| |||| || |||||||| ||  ||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccaggaa 18498466  T
Q  184 agtcattttcatgacttc 201  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  18498465 agtcattctcatgacttc 18498448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 201
Target Start/End: Original strand, 3005394 - 3005426
Alignment:
Q  169 taacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3005394 taacttcatcaaaaaagtcattctcatgacttc 3005426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12125 - 11921
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  12125 cttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatga 12026  T
Q  100 ggactgaacttttgattccact-ctacaaacagt-ggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattt-tcatg 196  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||||||| |||| | | |||| ||| ||| ||| ||| |||| || ||||||||||| |||||    
T  12025 ggactgaacttttgataccactgatacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttaatgttatggtgttaatttcaccagaaaagtcatttctcatg 11926  T
Q  197 acttc 201  Q
    |||||    
T  11925 acttc 11921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 267499 - 267332
Alignment:
Q  2 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |     
T  267499 ttaagtgttacactttgtgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattataga 267400  T
Q  101 gactgaacttttgattccactctac-aaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtg 167  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  267399 gactgaacttttgatgacactgtacaaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctatagtg 267332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44173 - 43986
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  44173 cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatga 44074  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtc 187  Q
    ||||||||||||| || ||| | ||||||||  ||||||||| ||| || |||||||||  ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  44073 ggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtc 43986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 154614 - 154801
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  154614 cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatga 154713  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtc 187  Q
    ||||||||||||| || ||| | ||||||||  ||||||||| ||| || |||||||||  ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  154714 ggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtc 154801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 82; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 145985 - 146186
Alignment:
Q  1 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg- 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  145985 cttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatga 146084  T
Q  100 ggactgaacttttgattccactctacaaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgact 199  Q
     | |||||||||||||  || |||||||| | |||||||||| ||| || |||||| ||| |||| || |||||| | ||||||| ||||| | ||||||    
T  146085 aggctgaacttttgatgtcattctacaaataatggggtgttactcattacattttttatgttataatgttaacttaaccaaaaaaatcattcttatgact 146184  T
Q  200 tc 201  Q
    ||    
T  146185 tc 146186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 100935 - 100894
Alignment:
Q  32 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgt 73  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  100935 ttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42439 - 42363
Alignment:
Q  125 caaacagtggggtgttattcactatatttttgatgatatagtgctaacttcatcaaaaaagtcattttcatgacttc 201  Q
    |||| |||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||||| || |||| | ||| ||||||||||    
T  42439 caaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaattattctcatgacttc 42363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University