View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1476_low_3 (Length: 325)

Name: NF1476_low_3
Description: NF1476
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1476_low_3
NF1476_low_3
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (9-325)||(19886484-19886811)
chr2 (9-212)||(11231162-11231368)
chr2 (9-212)||(22513009-22513215)
chr2 (9-212)||(28775631-28775837)
chr2 (9-212)||(24685605-24685811)
chr2 (9-132)||(24826523-24826646)
chr2 (59-240)||(12728590-12728772)
chr2 (59-240)||(16935791-16935973)
chr2 (59-240)||(17006451-17006633)
chr2 (101-240)||(23777963-23778103)
chr2 (59-240)||(8944044-8944226)
chr2 (59-240)||(34824673-34824855)
chr2 (59-240)||(42177845-42178027)
chr2 (96-240)||(3798516-3798661)
chr2 (101-240)||(12641560-12641700)
chr2 (59-240)||(12635744-12635926)
chr2 (59-204)||(23774370-23774516)
chr2 (235-322)||(17396724-17396811)
chr2 (101-204)||(5888548-5888652)
chr2 (190-310)||(25265406-25265537)
chr2 (237-325)||(462840-462927)
chr2 (235-310)||(7507916-7507991)
chr2 (235-325)||(24341461-24341550)
chr2 (237-310)||(36982515-36982588)
chr2 (235-310)||(20627385-20627460)
chr2 (235-310)||(43643029-43643104)
chr2 (235-325)||(19794776-19794865)
chr2 (147-212)||(21142121-21142187)
chr2 (235-325)||(8891344-8891433)
chr2 (59-132)||(25213372-25213446)
chr2 (235-310)||(19689473-19689548)
chr2 (235-310)||(23820187-23820262)
chr2 (235-310)||(14906512-14906587)
chr2 (236-310)||(20015127-20015201)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (9-325)||(12476-12803)
chr5 (9-325)||(21073418-21073745)
chr5 (9-325)||(18777815-18778142)
chr5 (9-325)||(22366303-22366631)
chr5 (9-325)||(19500001-19500327)
chr5 (9-325)||(4199808-4200135)
chr5 (9-325)||(25426730-25427057)
chr5 (9-325)||(43443221-43443545)
chr5 (9-310)||(29188108-29188419)
chr5 (34-325)||(27009943-27010244)
chr5 (9-240)||(10777794-10778028)
chr5 (9-212)||(21932205-21932411)
chr5 (9-212)||(21938375-21938581)
chr5 (9-212)||(35582262-35582468)
chr5 (9-212)||(22882908-22883114)
chr5 (9-212)||(36989594-36989800)
chr5 (34-216)||(7425546-7425729)
chr5 (58-240)||(11211940-11212123)
chr5 (59-240)||(35790974-35791156)
chr5 (34-240)||(17471438-17471646)
chr5 (59-240)||(23514759-23514941)
chr5 (59-212)||(1219396-1219550)
chr5 (59-204)||(23328791-23328937)
chr5 (59-204)||(24616395-24616541)
chr5 (59-204)||(24712771-24712917)
chr5 (59-204)||(24745789-24745935)
chr5 (9-132)||(11343008-11343133)
chr5 (235-325)||(23507067-23507156)
chr5 (235-325)||(22053905-22053994)
chr5 (235-325)||(18531139-18531228)
chr5 (9-132)||(16105967-16106092)
chr5 (190-302)||(34939401-34939524)
chr5 (235-325)||(27182619-27182708)
chr5 (235-310)||(20623085-20623160)
chr5 (235-310)||(21233600-21233675)
chr5 (235-310)||(16536313-16536388)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (9-325)||(10644321-10644647)
chr4 (59-325)||(47357756-47358030)
chr4 (34-212)||(15287096-15287275)
chr4 (34-204)||(22351915-22352086)
chr4 (34-240)||(18169168-18169375)
chr4 (34-212)||(15294205-15294384)
chr4 (96-212)||(17145570-17145687)
chr4 (101-212)||(18248444-18248556)
chr4 (59-240)||(7131941-7132123)
chr4 (59-240)||(20000921-20001103)
chr4 (101-240)||(19020684-19020824)
chr4 (59-204)||(26339253-26339399)
chr4 (110-212)||(8378377-8378480)
chr4 (235-325)||(13048293-13048383)
chr4 (139-240)||(22738467-22738568)
chr4 (237-325)||(121991-122078)
chr4 (235-325)||(10104322-10104411)
chr4 (235-325)||(15675161-15675250)
chr4 (34-132)||(14952085-14952183)
chr4 (235-325)||(31115731-31115820)
chr4 (235-325)||(13246532-13246621)
chr4 (101-175)||(9795490-9795564)
chr4 (235-325)||(54118316-54118405)
chr4 (235-310)||(26680316-26680391)
chr4 (59-133)||(14996444-14996518)
chr4 (239-307)||(40885630-40885698)
chr4 (235-310)||(10488678-10488753)
chr4 (235-310)||(16327998-16328073)
chr4 (101-134)||(8378491-8378524)
chr4 (190-239)||(33240898-33240947)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (9-325)||(27653806-27654133)
chr6 (34-325)||(25175665-25175968)
chr6 (112-325)||(16825678-16825904)
chr6 (9-212)||(16376197-16376403)
chr6 (9-212)||(16383521-16383727)
chr6 (9-309)||(14625953-14626264)
chr6 (9-212)||(10488925-10489131)
chr6 (9-240)||(22251390-22251624)
chr6 (9-240)||(22225562-22225796)
chr6 (101-310)||(1650022-1650240)
chr6 (9-208)||(19299467-19299669)
chr6 (19-212)||(16555973-16556169)
chr6 (19-212)||(16632529-16632725)
chr6 (34-240)||(16232090-16232297)
chr6 (34-204)||(29869627-29869798)
chr6 (34-240)||(18086674-18086881)
chr6 (59-240)||(1556203-1556385)
chr6 (59-212)||(19610244-19610398)
chr6 (59-240)||(23977967-23978149)
chr6 (9-117)||(16814821-16814930)
chr6 (101-240)||(13620712-13620852)
chr6 (190-310)||(35009455-35009586)
chr6 (235-325)||(23153549-23153638)
chr6 (190-302)||(1657764-1657887)
chr6 (190-302)||(15862595-15862718)
chr6 (105-239)||(29666072-29666208)
chr6 (59-132)||(4991396-4991470)
chr6 (190-238)||(27751624-27751672)
chr6 (190-239)||(23153645-23153694)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (9-325)||(43099-43426)
scaffold0076 (9-212)||(39329-39535)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (9-325)||(13910847-13911175)
chr7 (9-310)||(16478786-16479097)
chr7 (9-325)||(10989511-10989840)
chr7 (34-325)||(13572778-13573079)
chr7 (9-325)||(2437559-2437888)
chr7 (9-212)||(7822954-7823160)
chr7 (9-212)||(7830265-7830471)
chr7 (9-212)||(27176659-27176865)
chr7 (9-212)||(27101461-27101667)
chr7 (9-212)||(27108809-27109015)
chr7 (9-212)||(38783553-38783759)
chr7 (34-240)||(18979872-18980079)
chr7 (34-240)||(15927766-15927973)
chr7 (34-240)||(15950641-15950849)
chr7 (101-325)||(18253761-18253996)
chr7 (59-240)||(15759990-15760172)
chr7 (59-240)||(13758568-13758750)
chr7 (101-183)||(15862174-15862257)
chr7 (96-240)||(14250811-14250956)
chr7 (101-204)||(16418731-16418835)
chr7 (101-204)||(10000288-10000392)
chr7 (190-325)||(47481047-47481192)
chr7 (101-240)||(48622584-48622724)
chr7 (235-323)||(36052768-36052855)
chr7 (235-322)||(25292410-25292496)
chr7 (190-325)||(16211868-16212013)
chr7 (235-325)||(11580811-11580900)
chr7 (190-310)||(13321131-13321263)
chr7 (240-310)||(3060082-3060152)
chr7 (235-325)||(13037086-13037175)
chr7 (58-132)||(15516719-15516793)
chr7 (235-310)||(7293132-7293207)
chr7 (235-310)||(11516343-11516418)
chr7 (235-310)||(15441636-15441711)
chr7 (235-310)||(30262201-30262276)
chr7 (235-284)||(296038-296087)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (9-325)||(36195-36522)
scaffold0023 (12-223)||(169736-169949)
scaffold0023 (59-240)||(153883-154065)
scaffold0023 (235-324)||(48701-48789)
scaffold0023 (190-239)||(48796-48845)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (9-325)||(21844394-21844722)
chr8 (9-325)||(21851787-21852115)
chr8 (9-325)||(30120824-30121152)
chr8 (9-310)||(24549098-24549409)
chr8 (9-310)||(6774083-6774393)
chr8 (37-325)||(16674245-16674542)
chr8 (9-212)||(271184-271390)
chr8 (9-212)||(644530-644736)
chr8 (9-212)||(830265-830471)
chr8 (9-211)||(15318983-15319188)
chr8 (9-211)||(15499352-15499557)
chr8 (9-212)||(22088618-22088824)
chr8 (59-240)||(22006134-22006316)
chr8 (59-240)||(13720804-13720986)
chr8 (59-212)||(13662141-13662295)
chr8 (59-240)||(16195429-16195611)
chr8 (96-240)||(16872964-16873109)
chr8 (238-325)||(222754-222841)
chr8 (238-325)||(736377-736464)
chr8 (238-325)||(860272-860359)
chr8 (235-325)||(43373540-43373629)
chr8 (235-310)||(16193788-16193863)
chr8 (235-323)||(16405047-16405134)
chr8 (190-302)||(17345693-17345816)
chr8 (235-311)||(24928863-24928939)
chr8 (238-299)||(691909-691970)
chr8 (235-310)||(5238203-5238278)
chr8 (235-310)||(22907286-22907361)
chr8 (235-310)||(24661320-24661395)
chr8 (235-310)||(43685662-43685737)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (9-325)||(31498-31826)
scaffold0008 (237-310)||(128243-128316)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (34-325)||(55316321-55316622)
chr3 (34-325)||(41270177-41270478)
chr3 (58-325)||(16821241-16821517)
chr3 (9-212)||(1467563-1467769)
chr3 (9-240)||(49232634-49232868)
chr3 (9-240)||(12264615-12264850)
chr3 (9-208)||(12812071-12812273)
chr3 (101-310)||(15614950-15615168)
chr3 (34-212)||(22275435-22275615)
chr3 (59-240)||(15468216-15468398)
chr3 (59-240)||(25058937-25059119)
chr3 (101-310)||(15936553-15936774)
chr3 (59-240)||(18896920-18897102)
chr3 (59-240)||(18911191-18911373)
chr3 (101-310)||(15938395-15938616)
chr3 (101-240)||(12902008-12902148)
chr3 (59-216)||(5228535-5228692)
chr3 (235-322)||(13975793-13975880)
chr3 (235-322)||(45860910-45860997)
chr3 (101-239)||(54651656-54651795)
chr3 (59-325)||(14842446-14842722)
chr3 (235-325)||(51158090-51158179)
chr3 (235-322)||(13954961-13955048)
chr3 (235-325)||(15859096-15859185)
chr3 (237-325)||(2049912-2049999)
chr3 (101-240)||(44229183-44229323)
chr3 (235-310)||(17912554-17912629)
chr3 (237-310)||(12030221-12030294)
chr3 (235-310)||(13839010-13839085)
chr3 (235-310)||(16744187-16744262)
chr3 (59-133)||(8268609-8268683)
chr3 (59-133)||(8275709-8275783)
chr3 (235-310)||(2449310-2449385)
chr3 (190-239)||(12030163-12030212)
chr3 (190-239)||(13839092-13839141)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (34-321)||(1153-1450)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (34-325)||(5072237-5072538)
chr1 (9-240)||(18059582-18059816)
chr1 (9-212)||(17004864-17005070)
chr1 (9-240)||(17148765-17149000)
chr1 (62-325)||(22227911-22228185)
chr1 (62-325)||(22232608-22232882)
chr1 (139-325)||(18601071-18601268)
chr1 (9-216)||(38054915-38055125)
chr1 (101-310)||(45051539-45051757)
chr1 (9-208)||(19962323-19962525)
chr1 (101-310)||(2116371-2116589)
chr1 (59-204)||(22035681-22035827)
chr1 (96-237)||(46523590-46523731)
chr1 (59-204)||(7640810-7640956)
chr1 (190-310)||(20931461-20931592)
chr1 (190-310)||(20913146-20913277)
chr1 (235-310)||(41394338-41394413)
chr1 (58-132)||(15861284-15861358)
chr1 (235-325)||(20893698-20893787)
chr1 (235-325)||(20445781-20445870)
chr1 (235-325)||(20531546-20531635)
chr1 (235-310)||(51452608-51452683)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (30-310)||(13171-13460)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (9-325)||(20937-21265)
scaffold0139 (9-324)||(13883-14209)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (34-325)||(64372-64678)
scaffold0026 (101-310)||(107863-108084)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (59-325)||(137-411)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (43-212)||(29388-29558)
scaffold0213 (9-69)||(29565-29626)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (59-325)||(3065-3341)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (101-310)||(9266-9484)
scaffold0215 (101-310)||(16164-16382)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (9-212)||(31535-31741)
scaffold0107 (149-240)||(39844-39935)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (59-310)||(5088-5351)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (59-325)||(3824-4102)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (34-204)||(6831-7002)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (59-212)||(10624-10778)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (34-212)||(7306-7486)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (59-240)||(1390-1572)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (59-240)||(1451-1633)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (34-202)||(23600-23769)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (34-237)||(2593-2799)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (235-325)||(5630-5720)
scaffold0772 (190-239)||(5727-5776)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (9-132)||(130880-131005)
scaffold0028 (235-309)||(89526-89600)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (101-204)||(7443-7547)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (101-240)||(10257-10397)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (235-325)||(1226-1315)
scaffold0266 (235-325)||(3654-3743)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (101-204)||(12045-12149)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (190-310)||(36929-37060)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (190-325)||(19308-19453)
scaffold0195 (190-325)||(21392-21537)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (237-325)||(148823-148910)
scaffold0025 (235-325)||(8951-9040)
scaffold0025 (190-239)||(9047-9096)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (101-212)||(54100-54212)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (237-310)||(8994-9067)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (190-310)||(8196-8327)
scaffold0162 (237-325)||(26489-26576)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (190-310)||(41764-41895)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (101-239)||(45229-45369)
scaffold0066 (101-239)||(54615-54755)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (139-214)||(3637-3712)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (235-310)||(48303-48378)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (34-125)||(154282-154373)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (235-325)||(6136-6225)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (235-325)||(1028-1117)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (190-310)||(12229-12360)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (237-310)||(5135-5208)
[»] scaffold0132 (3 HSPs)
scaffold0132 (190-310)||(13622-13753)
scaffold0132 (101-174)||(13779-13855)
scaffold0132 (100-132)||(42677-42709)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (101-240)||(34076-34216)
scaffold0012 (235-325)||(247514-247603)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (190-325)||(41831-41976)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (237-309)||(51256-51328)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (101-175)||(13268-13342)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (235-325)||(123236-123325)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (28-132)||(17136-17241)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (190-325)||(34476-34621)
scaffold0075 (101-174)||(34374-34450)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (235-310)||(172021-172096)
scaffold0001 (235-310)||(177724-177799)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (235-310)||(272141-272216)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (235-310)||(606-681)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (190-239)||(3388-3437)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (235-310)||(22656-22731)
scaffold0141 (235-310)||(26911-26986)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (235-310)||(1654-1729)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (235-310)||(37138-37213)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 19886484 - 19886811
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886484 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 19886583  T
Q  109 ggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19886584 ggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgt 19886683  T
Q  209 gatgttatgtttgtaggcatgaattgatg-----------attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||||||    
T  19886684 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgcta 19886783  T
Q  298 aattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  19886784 aagtggtgaatttctcctaagttgttgt 19886811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 11231162 - 11231368
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  11231162 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 11231261  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  11231262 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 11231361  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  11231362 tgtgatg 11231368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 22513009 - 22513215
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  22513009 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 22513108  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  22513109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 22513208  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  22513209 tgtgatg 22513215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 28775631 - 28775837
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  28775631 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 28775730  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  28775731 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 28775830  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  28775831 tgtgatg 28775837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 24685605 - 24685811
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  24685605 gagaagaacaaaagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 24685704  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  24685705 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 24685804  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  24685805 tgtgatg 24685811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 24826523 - 24826646
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||     
T  24826523 gagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaaa 24826622  T
Q  109 ggggttagttattatcataatcat 132  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  24826623 ggggttagtcatcatcataatcat 24826646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12728772 - 12728590
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  12728772 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 12728673  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  12728672 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 12728590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16935973 - 16935791
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16935973 taggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 16935874  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  16935873 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 16935791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17006633 - 17006451
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17006633 taggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 17006534  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  17006533 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 17006451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 101 - 240
Target Start/End: Original strand, 23777963 - 23778103
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  23777963 aaggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 23778062  T
Q  200 tcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||||    
T  23778063 tcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgatt 23778103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8944226 - 8944044
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8944226 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 8944127  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  8944126 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 8944044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34824855 - 34824673
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  34824855 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 34824756  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  34824755 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 34824673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Original strand, 42177845 - 42178027
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  42177845 taggggctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 42177944  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  42177945 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 42178027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 240
Target Start/End: Original strand, 3798516 - 3798661
Alignment:
Q  96 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 194  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||    
T  3798516 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 3798615  T
Q  195 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  3798616 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgatt 3798661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 101 - 240
Target Start/End: Original strand, 12641560 - 12641700
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||    
T  12641560 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 12641659  T
Q  200 tcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  12641660 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgatt 12641700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Original strand, 12635744 - 12635926
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  12635744 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgtt 12635843  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  12635844 gtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 12635926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23774516 - 23774370
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||| || |||||||    
T  23774516 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgtt 23774417  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23774416 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 23774370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 235 - 322
Target Start/End: Original strand, 17396724 - 17396811
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17396724 atgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 17396811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Original strand, 5888548 - 5888652
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5888548 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 5888647  T
Q  200 tcttg 204  Q
    |||||    
T  5888648 tcttg 5888652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 25265406 - 25265537
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatga-----------ttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  25265406 aaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtga 25265505  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  25265506 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 25265537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 462927 - 462840
Alignment:
Q  237 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  462927 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 462840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 7507916 - 7507991
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  7507916 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt 7507991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 24341461 - 24341550
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24341461 atgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 24341550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 310
Target Start/End: Original strand, 36982515 - 36982588
Alignment:
Q  237 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  36982515 gattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 36982588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 20627385 - 20627460
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||  |||||||| |||||||||||||    
T  20627385 atgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 20627460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 43643029 - 43643104
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  43643029 atgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 43643104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 19794776 - 19794865
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19794776 atgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 19794865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21142187 - 21142121
Alignment:
Q  147 tttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatg 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21142187 tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatg 21142121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8891433 - 8891344
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8891433 atgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 8891344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25213446 - 25213372
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaagga-taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 132  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25213446 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 19689473 - 19689548
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  19689473 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23820262 - 23820187
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  23820262 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 14906512 - 14906587
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  14906512 atgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20015201 - 20015127
Alignment:
Q  236 tgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  20015201 tgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12803 - 12476
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12803 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 12704  T
Q  109 ggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12703 ggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgt 12604  T
Q  209 gatgttatgtttgtaggcatgaattgatg-----------attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||||||    
T  12603 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgcta 12504  T
Q  298 aattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  12503 aagtggtgaatttctcctaagttgttgt 12476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 21073418 - 21073745
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073418 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 21073517  T
Q  109 ggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21073518 ggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgt 21073617  T
Q  209 gatgttatgtttgtaggcatgaattgatg-----------attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||           |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  21073618 gatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgcta 21073717  T
Q  298 aattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||    
T  21073718 aagtggtgaatttcttctaagttgttgt 21073745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 18777815 - 18778142
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||||||    
T  18777815 gagaagaacaagagggttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataattaacttcaaaggtaag 18777914  T
Q  109 ggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgt 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18777915 ggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgt 18778014  T
Q  209 gatgttatgtttgtaggcatgaattgatg-----------attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  18778015 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgcta 18778114  T
Q  298 aattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778115 aattggtgaatttctcctaagttgttgt 18778142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 22366303 - 22366631
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  22366303 gagaagagcaagagggttgaagggaagctttagcaatcaagtggggtgacctaggagttgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 22366402  T
Q  108 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctg 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22366403 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 22366502  T
Q  208 tgatgttatgtttgtaggcatgaattgatg-----------attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  22366503 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 22366602  T
Q  297 aaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366603 aaattggtgaatttctcctaagttgttgt 22366631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19500327 - 19500001
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  19500327 gagaagaacaagagagttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaag 19500229  T
Q  109 ggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgt 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  19500228 ggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttgctgt 19500129  T
Q  209 gatgttatgtttgtaggcatgaattgatg-----------attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  19500128 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgcta 19500029  T
Q  298 aattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  19500028 aagtggtgaatttctcctaagttgttgt 19500001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 4199808 - 4200135
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  4199808 gagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaag 4199907  T
Q  109 ggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgt 208  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  4199908 ggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgt 4200007  T
Q  209 gatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  4200008 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgcta 4200107  T
Q  298 aattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||    
T  4200108 aattggtgaatttctcttatgttgttgt 4200135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25427057 - 25426730
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaag-gataatcaacttcaaaggtaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  | || |||||||||||||||||||||    
T  25427057 gagaagagcaagagggttgaagggaagcttaaagaatcaagtgggtaac-taggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggtaa 25426959  T
Q  108 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctg 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25426958 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 25426859  T
Q  208 tgatgttatgtttgtaggcatgaattgatg-----------attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  25426858 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 25426759  T
Q  297 aaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25426758 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgt 25426730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 43443221 - 43443545
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 108  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  43443221 gagaagagcatgagggttgaagggaagctt-aggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaag 43443319  T
Q  109 ggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgt 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43443320 ggggttagtgattatcataatcatgtgtaa--ttgcatattctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgt 43443417  T
Q  209 gatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||     
T  43443418 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctc 43443517  T
Q  298 aattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43443518 aattggtgaatttcttctaagttgttgt 43443545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 29188108 - 29188419
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  29188108 gagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 29188207  T
Q  108 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctg 207  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| |||    
T  29188208 gggggttagtgattattataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactg 29188305  T
Q  208 tgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||    
T  29188306 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 29188405  T
Q  297 aaattggtgaattt 310  Q
     |||||||||||||    
T  29188406 caattggtgaattt 29188419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27010244 - 27009943
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27010244 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 27010145  T
Q  134 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaatt 233  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27010144 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 27010046  T
Q  234 gatgat-----------tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 322  Q
    ||||||           |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27010045 gatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgt 27009946  T
Q  323 tgt 325  Q
    |||    
T  27009945 tgt 27009943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 10777794 - 10778028
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  10777794 gagaagaacaagagagttgaaggggaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaaggataatcatcttcaaaggta 10777893  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  10777894 aggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 10777993  T
Q  206 tgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  10777994 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 10778028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 21932205 - 21932411
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  21932205 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 21932304  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  21932305 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 21932404  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  21932405 tgtgatg 21932411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 21938375 - 21938581
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  21938375 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 21938474  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  21938475 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 21938574  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  21938575 tgtgatg 21938581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35582468 - 35582262
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  35582468 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 35582369  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  35582368 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 35582269  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  35582268 tgtgatg 35582262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 22882908 - 22883114
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  22882908 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgggaaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaagata 22883007  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||    
T  22883008 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttgc 22883107  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  22883108 tgtgatg 22883114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 36989594 - 36989800
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  36989594 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 36989693  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||    
T  36989694 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctagc 36989793  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  36989794 tgtgatg 36989800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7425729 - 7425546
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425729 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 7425630  T
Q  134 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttat 216  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7425629 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttat 7425546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 240
Target Start/End: Original strand, 11211940 - 11212123
Alignment:
Q  58 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgt 156  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  11211940 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 11212039  T
Q  157 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  11212040 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 11212123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Original strand, 35790974 - 35791156
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  35790974 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 35791073  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  35791074 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgatt 35791156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Original strand, 17471438 - 17471646
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 132  Q
    ||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17471438 agcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 17471537  T
Q  133 gtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaa 231  Q
    ||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  |||||||    
T  17471538 gtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaa 17471637  T
Q  232 ttgatgatt 240  Q
    |||||||||    
T  17471638 ttgatgatt 17471646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23514941 - 23514759
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  23514941 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 23514842  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  23514841 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 23514759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 212
Target Start/End: Original strand, 1219396 - 1219550
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1219396 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 1219495  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  1219496 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 1219550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23328937 - 23328791
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  23328937 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 23328838  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23328837 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 23328791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24616541 - 24616395
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  24616541 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24616442  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24616441 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 24616395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24712917 - 24712771
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  24712917 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24712818  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712817 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 24712771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24745935 - 24745789
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  24745935 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24745836  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24745835 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 24745789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11343133 - 11343008
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||| || |||||  |||||||||||    
T  11343133 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcagaggttagggttaatcttcttcaaaggta 11343034  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcat 132  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  11343033 agggggttagtttttatcataatcat 11343008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23507156 - 23507067
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23507156 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 23507067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 22053905 - 22053994
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22053905 atgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 22053994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 18531139 - 18531228
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18531139 atgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 18531228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16106092 - 16105967
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  || ||| |||||  |||| ||||||    
T  16106092 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggta 16105993  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcat 132  Q
    |||||||||||  |||||||||||||    
T  16105992 agggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34939524 - 34939401
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat-----------tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  34939524 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtga 34939425  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattg 302  Q
    ||||||||  |||||||| |||||    
T  34939424 agttatgaaaattgtgctcaattg 34939401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 27182619 - 27182708
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27182619 atgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 27182708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20623160 - 20623085
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  20623160 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 21233600 - 21233675
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  21233600 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16536388 - 16536313
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  16536388 atgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10644647 - 10644321
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 107  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644647 gagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgatctaggagctgaagtgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 10644548  T
Q  108 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctg 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644547 gggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctg 10644450  T
Q  208 tgatgttatgtttgtaggcatgaattga-----------tgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||           |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644449 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 10644350  T
Q  297 aaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644349 aaattggtgaatttctcctaagttgttgt 10644321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 59 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 47358030 - 47357756
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttg 158  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  47358030 taggagctgaattgaagcaagagttg-ggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttcctcatgttg 47357934  T
Q  159 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatg-----------attgttggtg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||           ||||||||||    
T  47357933 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtg 47357834  T
Q  248 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357833 aaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 47357756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Original strand, 15287096 - 15287275
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15287096 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15287195  T
Q  134 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatg 212  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||    
T  15287196 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatg 15287275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 204
Target Start/End: Original strand, 22351915 - 22352086
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22351915 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 22352014  T
Q  133 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 204  Q
     |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22352015 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttg 22352086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18169375 - 18169168
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 132  Q
    ||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||| || |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169375 agcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaa-ggtaagggggttagttattatcataatcat 18169277  T
Q  133 gtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaa 231  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  |||||||    
T  18169276 gtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaa 18169177  T
Q  232 ttgatgatt 240  Q
    |||||||||    
T  18169176 ttgatgatt 18169168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Original strand, 15294205 - 15294384
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294205 agctttaggaatgaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15294304  T
Q  134 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatg 212  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||    
T  15294305 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatg 15294384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 17145570 - 17145687
Alignment:
Q  96 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 194  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  17145570 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaatt 17145669  T
Q  195 cgtgctcttgctgtgatg 212  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  17145670 cgtgctcttactgtgatg 17145687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18248556 - 18248444
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttg-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18248556 aaggtaagggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgc 18248457  T
Q  200 tcttgctgtgatg 212  Q
    |||||||||||||    
T  18248456 tcttgctgtgatg 18248444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Original strand, 7131941 - 7132123
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  |  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  7131941 taggagctgaattgaagcaagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 7132040  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  7132041 atatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 7132123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20001103 - 20000921
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  20001103 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 20001004  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  20001003 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgatt 20000921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 101 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19020824 - 19020684
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  19020824 aaggtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 19020725  T
Q  200 tcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  19020724 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 19020684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26339399 - 26339253
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  26339399 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 26339300  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26339299 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 26339253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378377
Alignment:
Q  110 gggttagttattatcataatcatgtgtaattttg-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 8378381  T
Q  209 gatg 212  Q
    ||||    
T  8378380 gatg 8378377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 13048293 - 13048383
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13048293 atgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgt 13048383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22738568 - 22738467
Alignment:
Q  139 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||    
T  22738568 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 22738469  T
Q  239 tt 240  Q
    ||    
T  22738468 tt 22738467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 122078 - 121991
Alignment:
Q  237 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  122078 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 121991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 10104322 - 10104411
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10104322 atgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 10104411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 15675161 - 15675250
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15675161 atgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 15675250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14952183 - 14952085
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14952183 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31115820 - 31115731
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31115820 atgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattatgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgt 31115731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13246621 - 13246532
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13246621 atgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 13246532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9795564 - 9795490
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 175  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9795564 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 9795490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 54118316 - 54118405
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  54118316 atgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 54118405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26680391 - 26680316
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  26680391 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaattt 26680316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14996518 - 14996444
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996518 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttttaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 14996444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 307
Target Start/End: Original strand, 40885630 - 40885698
Alignment:
Q  239 ttgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  40885630 ttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatga-aattatgctcaattggtgaa 40885698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10488753 - 10488678
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  10488753 atgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 16327998 - 16328073
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  16327998 atgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8378524 - 8378491
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgt 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8378524 aaggtaaggggattagttattatcataatcatgt 8378491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33240947 - 33240898
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat 239  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33240947 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 33240898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 27653806 - 27654133
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| ||    
T  27653806 gagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtgag 27653905  T
Q  109 ggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgt 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  27653906 ggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctgt 27654005  T
Q  209 gatgttatgtttgtaggcatgaattgatg-----------attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 297  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  27654006 gatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgcta 27654105  T
Q  298 aattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654106 aattggtgaatttctcctaagttgttgt 27654133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25175968 - 25175665
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaag-gataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25175968 agctttcggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattaccataatcat 25175870  T
Q  133 gtgtaattttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaa 231  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25175869 gtataattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaa 25175770  T
Q  232 ttgatg-----------attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagtt 320  Q
    ||||||           |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175769 ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagtt 25175670  T
Q  321 gttgt 325  Q
    |||||    
T  25175669 gttgt 25175665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 112 - 325
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16825904
Alignment:
Q  112 gttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgat 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 16825777  T
Q  212 gttatgtttgtaggcatgaattgatg-------------attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaa 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  16825778 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaa 16825877  T
Q  299 attggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16825878 attggtggatttctcctaatttgttgt 16825904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 16376197 - 16376403
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  16376197 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 16376296  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  16376297 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 16376396  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  16376397 tgtgatg 16376403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 16383521 - 16383727
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  16383521 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 16383620  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  16383621 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 16383720  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  16383721 tgtgatg 16383727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 309
Target Start/End: Original strand, 14625953 - 14626264
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  14625953 gagaagaacaagagggttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaag 14626052  T
Q  109 ggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctc--atgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | | ||| ||  |||||  ||||||| || || || | | ||| | ||||  ||  |||||||||||||||||    
T  14626053 ggggttagttattatcacaatcatct-tcactttacaaattctcaaatgttgtttg-aattgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgct 14626150  T
Q  207 gtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||     
T  14626151 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgt 14626250  T
Q  296 taaattggtgaatt 309  Q
      ||||||||||||    
T  14626251 gcaattggtgaatt 14626264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10489131 - 10488925
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  10489131 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 10489032  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  10489031 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 10488932  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  10488931 tgtgatg 10488925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 22251390 - 22251624
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||    
T  22251390 gagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 22251489  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  22251490 tgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 22251589  T
Q  206 tgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  22251590 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 22251624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 22225562 - 22225796
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||    
T  22225562 gagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 22225661  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |    
T  22225662 tgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctttc 22225761  T
Q  206 tgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  22225762 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 22225796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 101 - 310
Target Start/End: Original strand, 1650022 - 1650240
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 200  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  1650022 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 1650119  T
Q  201 cttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 289  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |    
T  1650120 cttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaa 1650219  T
Q  290 ttgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  1650220 ttgtgctcaattggtgaattt 1650240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19299669 - 19299467
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  19299669 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 19299570  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  19299569 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 19299470  T
Q  206 tgt 208  Q
    |||    
T  19299469 tgt 19299467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 16555973 - 16556169
Alignment:
Q  19 agagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttag 116  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555973 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16556072  T
Q  117 ttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16556073 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatg 16556169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 16632529 - 16632725
Alignment:
Q  19 agagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttag 116  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632529 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16632628  T
Q  117 ttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16632629 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatg 16632725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16232297 - 16232090
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232297 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 16232198  T
Q  134 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaat 232  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||    
T  16232197 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 16232098  T
Q  233 tgatgatt 240  Q
    ||||||||    
T  16232097 tgatgatt 16232090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 204
Target Start/End: Original strand, 29869627 - 29869798
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29869627 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttgatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 29869726  T
Q  133 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 204  Q
     |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29869727 ttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 29869798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Original strand, 18086674 - 18086881
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18086674 agctttagaaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattagtataatcatg 18086773  T
Q  134 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaat 232  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |  ||||||||    
T  18086774 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaat 18086873  T
Q  233 tgatgatt 240  Q
    ||||||||    
T  18086874 tgatgatt 18086881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1556385 - 1556203
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1556385 taggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 1556286  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  1556285 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 1556203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19610398 - 19610244
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  19610398 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgtt 19610299  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  19610298 gtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 19610244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23978149 - 23977967
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  23978149 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 23978050  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  23978049 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgatt 23977967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 117
Target Start/End: Original strand, 16814821 - 16814930
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 107  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  16814821 gagaagagcaagaggtttgaagggaagctttagcaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 16814920  T
Q  108 gggggttagt 117  Q
    | ||||||||    
T  16814921 gagggttagt 16814930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 240
Target Start/End: Original strand, 13620712 - 13620852
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  13620712 aaggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 13620811  T
Q  200 tcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  13620812 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 13620852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 35009455 - 35009586
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatga-----------ttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  35009455 aaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtga 35009554  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  35009555 agttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt 35009586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23153638 - 23153549
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23153638 atgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 23153549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 302
Target Start/End: Original strand, 1657764 - 1657887
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatga-----------ttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||           ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  1657764 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtga 1657863  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattg 302  Q
    ||||||||  |||||||| |||||    
T  1657864 agttatgaaaattgtgctcaattg 1657887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15862718 - 15862595
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat-----------tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |    
T  15862718 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgtga 15862619  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattg 302  Q
    ||||||||  |||||||| |||||    
T  15862618 agttatgaaaattgtgctcaattg 15862595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29666208 - 29666072
Alignment:
Q  105 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 202  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||  ||| |||||||||||||    
T  29666208 taagtgggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctct 29666109  T
Q  203 tgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat 239  Q
     ||||||||||||| ||  || | |||||||||||||    
T  29666108 agctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgat 29666072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4991470 - 4991396
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaagga-taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 132  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4991470 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27751672 - 27751624
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatga 238  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27751672 aaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatga 27751624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23153694 - 23153645
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat 239  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23153694 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 23153645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 43426 - 43099
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 107  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43426 gagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgatctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 43327  T
Q  108 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgca-ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 206  Q
    |||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43326 gggggttagttactatcacaaaca--tgtaattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 43229  T
Q  207 gtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 295  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43228 gggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgc 43129  T
Q  296 taaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43128 taaattggtgaatttctcctaagttgttgt 43099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39535 - 39329
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  39535 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 39436  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  39435 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 39336  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  39335 tgtgatg 39329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 13910847 - 13911175
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  13910847 gagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaag 13910946  T
Q  109 ggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgt 208  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  13910947 ggggttattgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttgt 13911046  T
Q  209 gatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||     
T  13911047 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctc 13911146  T
Q  298 aattggtgaatttctcct-aagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13911147 aattggtgaatttctcctaaagttgttgt 13911175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 16478786 - 16479097
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 107  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16478786 gagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggtaa 16478885  T
Q  108 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctg 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  16478886 gggggttagtgattatcataatca--tttaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctcttactg 16478983  T
Q  208 tgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 296  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||    
T  16478984 cgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 16479083  T
Q  297 aaattggtgaattt 310  Q
     |||||||||||||    
T  16479084 caattggtgaattt 16479097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10989840 - 10989511
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggtt-gaagggaagctttaggaatcaagtg-ggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10989840 gagaagatcaagagtgttagaaggggagcttgaggaatcaagtgaggtgacataggagcttaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggta 10989741  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 206  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  10989740 tgggggttagtgattatcataatcatgtataattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgct 10989641  T
Q  207 gtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10989640 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 10989541  T
Q  296 taaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989540 tcaattggtgaatttctcctaagttgttgt 10989511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13573079 - 13572778
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13573079 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 13572980  T
Q  134 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaatt 233  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13572979 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 13572881  T
Q  234 ga-----------tgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 322  Q
    ||           |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13572880 gatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 13572781  T
Q  323 tgt 325  Q
    |||    
T  13572780 tgt 13572778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2437888 - 2437559
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||    
T  2437888 gagaagaacaggagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 2437789  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |    
T  2437788 agggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgtt 2437689  T
Q  207 gtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||     
T  2437688 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgt 2437589  T
Q  296 taaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2437588 tcaattggtgaatttttcctaagttgttgt 2437559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7823160 - 7822954
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  7823160 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 7823061  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  7823060 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 7822961  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  7822960 tgtgatg 7822954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7830471 - 7830265
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  7830471 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 7830372  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  7830371 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 7830272  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  7830271 tgtgatg 7830265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27176865 - 27176659
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  27176865 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 27176766  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  27176765 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 27176666  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  27176665 tgtgatg 27176659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 27101461 - 27101667
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  27101461 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 27101560  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  27101561 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 27101660  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  27101661 tgtgatg 27101667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 27108809 - 27109015
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  27108809 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 27108908  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  27108909 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 27109008  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  27109009 tgtgatg 27109015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 38783553 - 38783759
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  38783553 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 38783652  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  38783653 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 38783752  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  38783753 tgtgatg 38783759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Original strand, 18979872 - 18980079
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18979872 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 18979971  T
Q  134 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaat 232  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||    
T  18979972 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 18980071  T
Q  233 tgatgatt 240  Q
    ||||||||    
T  18980072 tgatgatt 18980079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15927973 - 15927766
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927973 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15927874  T
Q  134 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaat 232  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |  ||||||||    
T  15927873 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15927774  T
Q  233 tgatgatt 240  Q
    ||||||||    
T  15927773 tgatgatt 15927766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Original strand, 15950641 - 15950849
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 132  Q
    ||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950641 agcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 15950740  T
Q  133 gtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaa 231  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  |||||||    
T  15950741 gtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaa 15950840  T
Q  232 ttgatgatt 240  Q
    |||||||||    
T  15950841 ttgatgatt 15950849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 101 - 325
Target Start/End: Original strand, 18253761 - 18253996
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  18253761 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 18253860  T
Q  200 tcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 288  Q
    ||   |||| ||| |||||||||| ||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||      
T  18253861 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 18253960  T
Q  289 attgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18253961 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 18253996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Original strand, 15759990 - 15760172
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  15759990 taggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 15760089  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  15760090 gtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 15760172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13758750 - 13758568
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13758750 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13758651  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  13758650 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgatt 13758568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15862257 - 15862174
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862257 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 240
Target Start/End: Original strand, 14250811 - 14250956
Alignment:
Q  96 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 194  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  14250811 cttctaaggtaagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaatt 14250910  T
Q  195 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  14250911 cgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 14250956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16418835 - 16418731
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16418835 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 16418736  T
Q  200 tcttg 204  Q
    |||||    
T  16418735 tcttg 16418731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Original strand, 10000288 - 10000392
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10000288 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaaattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgc 10000387  T
Q  200 tcttg 204  Q
    |||||    
T  10000388 tcttg 10000392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 47481047 - 47481192
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat-----------tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||           |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47481047 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 47481146  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||| |||  |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  47481147 agttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 47481192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 240
Target Start/End: Original strand, 48622584 - 48622724
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  48622584 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 48622683  T
Q  200 tcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    |||| |||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  48622684 tcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgatt 48622724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 235 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 36052855 - 36052768
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgtt 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  36052855 atgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtt 36052768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 235 - 322
Target Start/End: Original strand, 25292410 - 25292496
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  25292410 atgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaa-ttctcctaggttgt 25292496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16212013 - 16211868
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgat-----------gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||||||           ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16212013 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgata 16211914  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16211913 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 16211868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 11580811 - 11580900
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11580811 atgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 11580900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13321263 - 13321131
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat-----------tgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgt 276  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  13321263 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgt 13321164  T
Q  277 taagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
     |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  13321163 caagttatga-aattgtgctcaattggtgaattt 13321131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3060152 - 3060082
Alignment:
Q  240 tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||| |||| || ||||||||||    
T  3060152 tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattt 3060082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 13037086 - 13037175
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13037086 atgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 13037175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 132
Target Start/End: Original strand, 15516719 - 15516793
Alignment:
Q  58 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 132  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15516719 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaatgtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7293207 - 7293132
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  7293207 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 7293132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11516418 - 11516343
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  11516418 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 15441636 - 15441711
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  15441636 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 30262201 - 30262276
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  30262201 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 284
Target Start/End: Original strand, 296038 - 296087
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttat 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||    
T  296038 atgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36522 - 36195
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36522 gagaagagcaagagggttgaaggaaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggtaag 36423  T
Q  109 ggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgt 208  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||    
T  36422 ggggttaatgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtagt 36323  T
Q  209 gatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 297  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||           |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  36322 gatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgcta 36223  T
Q  298 aattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36222 aattggtgaatttctcctaagttgttgt 36195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 169736 - 169949
Alignment:
Q  12 aagaacaagagggttgaagg-gaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagg 109  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  169736 aagaacaagagagttgaaggcgaagcttgaggaatcaagtggggtgacataagagctgaattgaagcaagggttagtgataatcatcttcaaaagtaagg 169835  T
Q  110 gggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtg 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  169836 gggttagtgattatcataatcatgtataattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 169935  T
Q  210 atgttatgtttgta 223  Q
    ||||||||||||||    
T  169936 atgttatgtttgta 169949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Original strand, 153883 - 154065
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  153883 taggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 153982  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  153983 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 154065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 235 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48789 - 48701
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||  |||||||| | ||||||||||| | |||||||||||    
T  48789 atgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttg 48701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 48845 - 48796
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat 239  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  48845 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 48796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 21844394 - 21844722
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaaggg--aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21844394 gagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaacggta 21844493  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844494 agggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 21844592  T
Q  207 gtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21844593 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21844692  T
Q  296 taaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844693 tcaattggtgaatttctcctaagttgttgt 21844722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 21851787 - 21852115
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaaggg--aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21851787 gagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 21851886  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21851887 agggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 21851985  T
Q  207 gtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||           ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21851986 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21852085  T
Q  296 taaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852086 tcaattggtgaatttctcctaagttgttgt 21852115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30121152 - 30120824
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  30121152 gagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagtaagggttagagataatcatcttcaaaggtaag 30121053  T
Q  109 ggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctg 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30121052 ggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 30120953  T
Q  208 tgatgttatgtttgtaggcatgaatt-----------gatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30120952 tgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 30120853  T
Q  297 aaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120852 caattggtgaatttctcctaagttgttgt 30120824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24549409 - 24549098
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 107  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24549409 gagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttctaaggtaa 24549310  T
Q  108 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctg 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||    
T  24549309 gggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactg 24549212  T
Q  208 tgatgttatgtttgtaggcatgaattga-----------tgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||    
T  24549211 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 24549112  T
Q  297 aaattggtgaattt 310  Q
     |||||||||||||    
T  24549111 caattggtgaattt 24549098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 6774083 - 6774393
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 107  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  6774083 gagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 6774181  T
Q  108 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctg 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||    
T  6774182 gggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactg 6774279  T
Q  208 tgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||    
T  6774280 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 6774379  T
Q  297 aaattggtgaattt 310  Q
     |||||||||||||    
T  6774380 caattggtgaattt 6774393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 325
Target Start/End: Original strand, 16674245 - 16674542
Alignment:
Q  37 tttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgt 136  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  || ||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  16674245 tttaggaatcaagtgggtgacttatgagctgaattgaagcaagagttgagt-taatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta- 16674342  T
Q  137 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaatt--- 233  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||       
T  16674343 atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttat 16674442  T
Q  234 --------gatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674443 gttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgt 16674542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 271184 - 271390
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  271184 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 271283  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  271284 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 271383  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  271384 tgtgatg 271390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 644736 - 644530
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  644736 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 644637  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  644636 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 644537  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  644536 tgtgatg 644530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 830471 - 830265
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  830471 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 830372  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  830371 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 830272  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  830271 tgtgatg 830265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 211
Target Start/End: Original strand, 15318983 - 15319188
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  15318983 gagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 15319082  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  15319083 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 15319182  T
Q  206 tgtgat 211  Q
    ||||||    
T  15319183 tgtgat 15319188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 211
Target Start/End: Original strand, 15499352 - 15499557
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  15499352 gagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 15499451  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  15499452 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 15499551  T
Q  206 tgtgat 211  Q
    ||||||    
T  15499552 tgtgat 15499557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 22088618 - 22088824
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  22088618 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 22088717  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  22088718 agggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 22088817  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  22088818 tgtgatg 22088824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Original strand, 22006134 - 22006316
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22006134 taggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 22006233  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  22006234 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 22006316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Original strand, 13720804 - 13720986
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13720804 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13720903  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  13720904 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 13720986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 212
Target Start/End: Original strand, 13662141 - 13662295
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13662141 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13662240  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatg 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  13662241 gtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 13662295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16195611 - 16195429
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||  || |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16195611 taggagttgaattgaagcaagagtttgggttaatcatcttctaaggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 16195512  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||| |||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||    
T  16195511 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgatt 16195429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 240
Target Start/End: Original strand, 16872964 - 16873109
Alignment:
Q  96 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 194  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||    
T  16872964 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 16873063  T
Q  195 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  16873064 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgatt 16873109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 238 - 325
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222841
Alignment:
Q  238 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 222841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 238 - 325
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736464
Alignment:
Q  238 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 736464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 238 - 325
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860359
Alignment:
Q  238 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 860359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 43373540 - 43373629
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43373540 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 43373629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 16193788 - 16193863
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  16193788 atgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 16193863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 323
Target Start/End: Original strand, 16405047 - 16405134
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  16405047 atgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtt 16405134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17345816 - 17345693
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat-----------tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||           |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  17345816 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtga 17345717  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattg 302  Q
    ||||||||  |||||||| |||||    
T  17345716 agttatgaaaattgtgctcaattg 17345693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 311
Target Start/End: Original strand, 24928863 - 24928939
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  24928863 atgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttc 24928939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 299
Target Start/End: Original strand, 691909 - 691970
Alignment:
Q  238 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  691909 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5238278 - 5238203
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  5238278 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 22907286 - 22907361
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  22907286 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22907361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 24661320 - 24661395
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  24661320 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43685737 - 43685662
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  43685737 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 31498 - 31826
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaag 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| |||||    
T  31498 gagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaatgtaag 31597  T
Q  109 ggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgt 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||    
T  31598 ggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtggt 31697  T
Q  209 gatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 297  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||           |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||     
T  31698 gatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctc 31797  T
Q  298 aattggtgaatttctcct-aagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31798 aattggtgaatttctcctaaagttgttgt 31826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 237 - 310
Target Start/End: Original strand, 128243 - 128316
Alignment:
Q  237 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||    
T  128243 gattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggcgaattt 128316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 55316622 - 55316321
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  55316622 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaaaggggttagttattatcacaatcatg 55316523  T
Q  134 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaatt 233  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55316522 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 55316424  T
Q  234 g-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 322  Q
    |           ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55316423 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 55316324  T
Q  323 tgt 325  Q
    |||    
T  55316323 tgt 55316321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41270478 - 41270177
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41270478 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 41270379  T
Q  134 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaatt 233  Q
    |  | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41270378 ta-atttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 41270280  T
Q  234 g-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 322  Q
    |           ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41270279 gatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 41270180  T
Q  323 tgt 325  Q
    |||    
T  41270179 tgt 41270177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 58 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16821517 - 16821241
Alignment:
Q  58 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgtt 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  16821517 ctaggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgtt 16821420  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||           ||||||||||||    
T  16821419 gtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggt 16821320  T
Q  247 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821319 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 16821241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 1467563 - 1467769
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  1467563 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 1467662  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  1467663 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 1467762  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  1467763 tgtgatg 1467769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49232868 - 49232634
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  49232868 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctatgagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 49232769  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  49232768 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 49232669  T
Q  206 tgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  49232668 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 49232634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 12264615 - 12264850
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt--gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| | | ||  |  |||||| ||||||||||    
T  12264615 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttggggtgacctaggagctgaattgaagcaaaggttgggattaatcatcttcaaaggt 12264714  T
Q  106 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  12264715 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 12264814  T
Q  205 ctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    |||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  12264815 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 12264850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12812273 - 12812071
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||    
T  12812273 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaactttaaaggta 12812174  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  12812173 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 12812074  T
Q  206 tgt 208  Q
    |||    
T  12812073 tgt 12812071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15615168 - 15614950
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 200  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||    
T  15615168 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgct 15615071  T
Q  201 cttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgat-----------gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 289  Q
    ||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  15615070 cttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaata 15614971  T
Q  290 ttgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  15614970 tggtgctcaattggtgaattt 15614950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22275615 - 22275435
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 132  Q
    ||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275615 agcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaaaagttaaggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 22275516  T
Q  133 gtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatg 212  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  22275515 gtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 22275435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Original strand, 15468216 - 15468398
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgt-gtaattttgcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  15468216 taggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgtt 15468315  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  15468316 gtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 15468398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25059119 - 25058937
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  25059119 taggagctgaattgaagcaaaaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgtt 25059020  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  25059019 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 25058937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 101 - 310
Target Start/End: Original strand, 15936553 - 15936774
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  15936553 aaggtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 15936652  T
Q  200 tcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 288  Q
    ||   |||| ||| |||||||||| ||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||      
T  15936653 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15936752  T
Q  289 attgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  15936753 attgtgctcaattggtgaattt 15936774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Original strand, 18896920 - 18897102
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||    
T  18896920 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttccaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgtt 18897019  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  18897020 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 18897102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18911373 - 18911191
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  18911373 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 18911274  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  18911273 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 18911191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 101 - 310
Target Start/End: Original strand, 15938395 - 15938616
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||| |||||    
T  15938395 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgc 15938494  T
Q  200 tcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 288  Q
    ||   |||| ||| ||||||||||  |||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||      
T  15938495 tccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15938594  T
Q  289 attgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  15938595 attgtgctcaattggtgaattt 15938616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 240
Target Start/End: Original strand, 12902008 - 12902148
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||    
T  12902008 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgc 12902107  T
Q  200 tcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  12902108 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgatt 12902148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5228692 - 5228535
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||     
T  5228692 taggagctgaattgaaacaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtg 5228593  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttat 216  Q
     ||||||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5228592 ttatgaaaatgggttgatgaac-attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttat 5228535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 322
Target Start/End: Original strand, 13975793 - 13975880
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13975793 atgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 13975880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 45860997 - 45860910
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45860997 atgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 45860910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 54651795 - 54651656
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||    
T  54651795 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 54651696  T
Q  200 tcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat 239  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |  |||||||||||||||    
T  54651695 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgat 54651656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 325
Target Start/End: Original strand, 14842446 - 14842722
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctca--tgt 156  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | | | ||||||  ||||||  |||    
T  14842446 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatct-tcactttgcaaattctcaaatgt 14842544  T
Q  157 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattga-----------tgattgttgg 245  Q
    ||||||||  || | | ||| | ||||  ||  ||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||           ||||||||||    
T  14842545 tgtatgaat-tgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttgg 14842643  T
Q  246 tgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14842644 tgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 14842722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 51158090 - 51158179
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  51158090 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 51158179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 235 - 322
Target Start/End: Original strand, 13954961 - 13955048
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13954961 atgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgt 13955048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 15859096 - 15859185
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15859096 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 15859185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2049999 - 2049912
Alignment:
Q  237 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2049999 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 2049912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44229323 - 44229183
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  ||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  44229323 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaattttttcatttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgc 44229224  T
Q  200 tcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  44229223 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 44229183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 17912554 - 17912629
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  17912554 atgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaattt 17912629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 310
Target Start/End: Original strand, 12030221 - 12030294
Alignment:
Q  237 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||   ||||||| |||||||||||||    
T  12030221 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaagttgtgctcaattggtgaattt 12030294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13839085 - 13839010
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  13839085 atgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 13839010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 16744187 - 16744262
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  16744187 atgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16744262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 133
Target Start/End: Original strand, 8268609 - 8268683
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268609 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 133
Target Start/End: Original strand, 8275709 - 8275783
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8275709 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8275783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 2449310 - 2449385
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  2449310 atgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 239
Target Start/End: Original strand, 12030163 - 12030212
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat 239  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  12030163 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 12030212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13839141 - 13839092
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat 239  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13839141 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 13839092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 321
Target Start/End: Original strand, 1153 - 1450
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1153 agctttaggaatcaagttggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaggggggttagttattatcacaatcatg 1252  T
Q  134 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaatt 233  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1253 ta-atttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 1351  T
Q  234 g-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttg 321  Q
    |           ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1352 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 325
Target Start/End: Original strand, 5072237 - 5072538
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5072237 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaagattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 5072336  T
Q  134 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaatt 233  Q
    |  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5072337 ta-atttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaatt 5072435  T
Q  234 g-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 322  Q
    |           ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5072436 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 5072535  T
Q  323 tgt 325  Q
    |||    
T  5072536 tgt 5072538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 18059582 - 18059816
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||    
T  18059582 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 18059681  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  18059682 agggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 18059781  T
Q  206 tgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  18059782 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 18059816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17005070 - 17004864
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  17005070 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 17004971  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  17004970 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 17004871  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  17004870 tgtgatg 17004864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17149000 - 17148765
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  17149000 gagaagaacaagagggttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacataggagctgaattgaagcaagggttggggataatcaacttcaaaggta 17148901  T
Q  107 aggggg-ttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||    
T  17148900 aggggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttg 17148801  T
Q  205 ctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
     ||| ||||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  17148800 ttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgatt 17148765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22228185 - 22227911
Alignment:
Q  62 gagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgta 160  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22228185 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22228086  T
Q  161 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaa 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||           ||||||||| |||||    
T  22228085 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22227986  T
Q  250 attacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||   ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  22227985 attacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgt 22227911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22232882 - 22232608
Alignment:
Q  62 gagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgta 160  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22232882 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22232783  T
Q  161 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaa 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||           ||||||||| |||||    
T  22232782 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22232683  T
Q  250 attacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||   ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  22232682 attacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgt 22232608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 139 - 325
Target Start/End: Original strand, 18601071 - 18601268
Alignment:
Q  139 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattg---- 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        
T  18601071 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 18601170  T
Q  235 -------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
           ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601171 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgt 18601268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 38054915 - 38055125
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  38054915 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 38055014  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| || |    
T  38055015 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgcttttac 38055114  T
Q  206 tgtgatgttat 216  Q
    |||||||||||    
T  38055115 tgtgatgttat 38055125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 101 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45051757 - 45051539
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 200  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |    
T  45051757 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtg--attttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgtt 45051660  T
Q  201 cttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattga-----------tgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 289  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |    
T  45051659 cttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 45051560  T
Q  290 ttgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  45051559 ttgtgctcaattggtgaattt 45051539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 208
Target Start/End: Original strand, 19962323 - 19962525
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  19962323 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 19962422  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  19962423 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 19962522  T
Q  206 tgt 208  Q
    |||    
T  19962523 tgt 19962525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2116589 - 2116371
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 200  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  2116589 aaggtaaaggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 2116492  T
Q  201 cttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattga-----------tgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 289  Q
     || ||||||||||||||||||| |||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |    
T  2116491 tttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 2116392  T
Q  290 ttgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  2116391 tggtgctcaattggtgaattt 2116371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22035827 - 22035681
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||    
T  22035827 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgtt 22035728  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22035727 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 22035681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 46523731 - 46523590
Alignment:
Q  96 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattc 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||    
T  46523731 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattc 46523632  T
Q  196 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatg 237  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||  |  |||||||||||||    
T  46523631 gtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 46523590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Original strand, 7640810 - 7640956
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  7640810 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 7640909  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7640910 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 7640956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20931592 - 20931461
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgat-----------gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20931592 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgata 20931493  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20931492 agttatgaaaattgtgctaaattggtgaattt 20931461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20913277 - 20913146
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgat-----------gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20913277 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgata 20913178  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  20913177 agttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt 20913146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41394413 - 41394338
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  41394413 atgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 41394338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 132
Target Start/End: Original strand, 15861284 - 15861358
Alignment:
Q  58 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 132  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15861284 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 20893698 - 20893787
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20893698 atgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 20893787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20445870 - 20445781
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||| |||||  |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20445870 atgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 20445781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20531635 - 20531546
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||| |||||  |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20531635 atgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 20531546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 51452683 - 51452608
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  51452683 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 310
Target Start/End: Original strand, 13171 - 13460
Alignment:
Q  30 gggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataat 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13171 gggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggaactgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataat 13270  T
Q  130 catgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatg 229  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  13271 ca--tgtaatttttcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatg 13368  T
Q  230 aattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || ||||| |||||||||||||    
T  13369 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt 13460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 20937 - 21265
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||| |||||||||||    
T  20937 gagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggta 21036  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |    
T  21037 agggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgtt 21136  T
Q  207 gtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 295  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||           ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||    
T  21137 gtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgagc 21236  T
Q  296 taaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21237 tcaattggtgaattt-tcctaagttgttgt 21265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 13883 - 14209
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||| |||||||||||    
T  13883 gagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggta 13982  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | || |||||||||||||    
T  13983 agggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttg-ctaaatcgtgctcttgct 14081  T
Q  207 gtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 295  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  14082 gtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgc 14181  T
Q  296 taaattggtgaatttctcctaagttgttg 324  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14182 tcaattggtgaattt-tcctaagttgttg 14209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 325
Target Start/End: Original strand, 64372 - 64678
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  64372 agcttaaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 64471  T
Q  134 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaatt 233  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  64472 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaatt 64570  T
Q  234 ----------------gatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaa 317  Q
                     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  64571 atattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaa 64670  T
Q  318 gttgttgt 325  Q
    ||||||||    
T  64671 gttgttgt 64678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 101 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 108084 - 107863
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  108084 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 107985  T
Q  200 tcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 288  Q
    ||   |||| ||| |||||||||| ||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |      
T  107984 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaa 107885  T
Q  289 attgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  107884 attgtgctcaattggtgaattt 107863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 59 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 411 - 137
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttg 158  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  |  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||     
T  411 taggagctgaattgaagcgagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcaaaatcatgt--aattttgcattg-ctcatgtta 315  T
Q  159 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattga-----------tgattgttggtg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||||||||||||    
T  314 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtg 215  T
Q  248 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  214 aaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgt 137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29558 - 29388
Alignment:
Q  43 aatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  29558 aatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctt 29459  T
Q  142 tgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29458 tgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatg 29388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 29626 - 29565
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaa 69  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29626 gagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaa 29565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3341 - 3065
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttg 158  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3341 taggagctgaattgaagcaagagtttcggttaatcttcttctaaggtaagggggttaattattatcataattatgtacaattttgcattttctcatgttg 3242  T
Q  159 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattga-----------tgattgttggtg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||           ||||||||||||    
T  3241 tatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtg 3142  T
Q  248 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3141 aaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 3065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 101 - 310
Target Start/End: Original strand, 9266 - 9484
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9266 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 9363  T
Q  201 cttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 289  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |    
T  9364 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 9463  T
Q  290 ttgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  9464 tggtgctcaattggtgaattt 9484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 101 - 310
Target Start/End: Original strand, 16164 - 16382
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16164 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 16261  T
Q  201 cttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 289  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |    
T  16262 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16361  T
Q  290 ttgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  16362 tggtgctcaattggtgaattt 16382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31741 - 31535
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  31741 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 31642  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  31641 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 31542  T
Q  206 tgtgatg 212  Q
    |||||||    
T  31541 tgtgatg 31535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39844
Alignment:
Q  149 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||  ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgatt 39844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 310
Target Start/End: Original strand, 5088 - 5351
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||    
T  5088 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgtt 5187  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||           ||||||||||||    
T  5188 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 5287  T
Q  247 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  5288 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt 5351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4102 - 3824
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  4102 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttctaaggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 4003  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |  ||||||||||           ||||||||||||    
T  4002 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 3903  T
Q  247 gaaattacatgttcaaatatgt-aaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3902 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 3824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7002 - 6831
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7002 agctttacgaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 6903  T
Q  133 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 204  Q
     |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6902 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 212
Target Start/End: Original strand, 10624 - 10778
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10624 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 10723  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  10724 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Original strand, 7306 - 7486
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 132  Q
    ||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7306 agcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 7405  T
Q  133 g-tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatg 212  Q
    | |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||| |||||||    
T  7406 gttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctcttgttgtgatg 7486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Original strand, 1390 - 1572
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||  || ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1390 taggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 1489  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  1490 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 1572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Original strand, 1451 - 1633
Alignment:
Q  59 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1451 taggagctgaattgaagcaagggtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 1550  T
Q  158 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||| |||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  1551 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgatt 1633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 202
Target Start/End: Original strand, 23600 - 23769
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23600 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggaactgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagttaagggggttagttattatcatattcaat 23699  T
Q  133 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 202  Q
     |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23700 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctct 23769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2799 - 2593
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 132  Q
    ||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2799 agcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 2700  T
Q  133 gtgtaa--ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatga 230  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |  ||||||    
T  2699 gtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctcttgccgtgatgctattttcttgtgcatga 2600  T
Q  231 attgatg 237  Q
    |||||||    
T  2599 attgatg 2593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5720 - 5630
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5720 atgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgt 5630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5776 - 5727
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat 239  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5776 aaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgat 5727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 131005 - 130880
Alignment:
Q  9 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||    
T  131005 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggcataatcatcttcaaaggta 130906  T
Q  107 agggggttagttattatcataatcat 132  Q
    |||||||||||  |||||||||||||    
T  130905 agggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 309
Target Start/End: Original strand, 89526 - 89600
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  89526 atgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7547 - 7443
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7547 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 7448  T
Q  200 tcttg 204  Q
    |||||    
T  7447 tcttg 7443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 240
Target Start/End: Original strand, 10257 - 10397
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||    
T  10257 aaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 10356  T
Q  200 tcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  10357 tcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgatt 10397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1315 - 1226
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1315 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 1226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 3654 - 3743
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  3654 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgt 3743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Original strand, 12045 - 12149
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12045 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttcattt-ctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtg 12143  T
Q  199 ctcttg 204  Q
    ||||||    
T  12144 ctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 36929 - 37060
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat-----------tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36929 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 37028  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  37029 agttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt 37060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19453 - 19308
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgat-----------gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19453 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 19354  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19353 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 19308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21537 - 21392
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgat-----------gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21537 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 21438  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21437 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 21392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 148910 - 148823
Alignment:
Q  237 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  148910 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 148823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9040 - 8951
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9040 atgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 8951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9096 - 9047
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat 239  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9096 aaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 9047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 54212 - 54100
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 199  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  54212 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 54113  T
Q  200 tcttgctgtgatg 212  Q
    |||| ||||||||    
T  54112 tcttactgtgatg 54100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9067 - 8994
Alignment:
Q  237 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  9067 gattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 8196 - 8327
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattg-----------atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||           ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  8196 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaatgtga 8295  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  8296 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 325
Target Start/End: Original strand, 26489 - 26576
Alignment:
Q  237 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26489 gattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 26576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41895 - 41764
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat-----------tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  41895 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtga 41796  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  41795 agttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt 41764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 45369 - 45229
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtg 198  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  45369 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 45270  T
Q  199 ctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat 239  Q
    | |||| ||||||| ||| ||  |  |||||||||||||||    
T  45269 cccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgat 45229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 54755 - 54615
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtg 198  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  54755 aaggtaaggtggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 54656  T
Q  199 ctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat 239  Q
      |||||||||||| ||| ||  |  |||||||||||||||    
T  54655 tccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgat 54615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3637
Alignment:
Q  139 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgtt 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  3712 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgtt 3637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 48378 - 48303
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  48378 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 48303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 125
Target Start/End: Original strand, 154282 - 154373
Alignment:
Q  34 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  154282 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatca 154373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 6136 - 6225
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6136 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 6225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 1028 - 1117
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  1028 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgt 1117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12360 - 12229
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat-----------tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||           ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  12360 aaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgata 12261  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  12260 agttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt 12229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 310
Target Start/End: Original strand, 5135 - 5208
Alignment:
Q  237 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  5135 gattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 5208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13753 - 13622
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat-----------tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  13753 aaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtga 13654  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||| |||  |||||||| ||||| |||||||    
T  13653 agttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 13622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13855 - 13779
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttga 174  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| || || ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  13855 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgtttatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttga 13779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 42709 - 42677
Alignment:
Q  100 aaaggtaagggggttagttattatcataatcat 132  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42709 aaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 240
Target Start/End: Original strand, 34076 - 34216
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtg 198  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||  |||||||||    
T  34076 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtg 34174  T
Q  199 ctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgatt 240  Q
    |||||||||||| | ||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  34175 ctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgatt 34216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 247514 - 247603
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  247514 atgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgt 247603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41976 - 41831
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat-----------tgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  41976 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgata 41877  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    | || |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  41876 atttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 41831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 309
Target Start/End: Original strand, 51256 - 51328
Alignment:
Q  237 gattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  51256 gattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Original strand, 13268 - 13342
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 175  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13268 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 123236 - 123325
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  123236 atgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgt 123325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 17136 - 17241
Alignment:
Q  28 aagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcat 126  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||  | |||||    
T  17136 aaggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataataatcttctaaggtaagggggttagtcttcatcat 17235  T
Q  127 aatcat 132  Q
    ||||||    
T  17236 aatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 34476 - 34621
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatga-----------ttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 278  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  34476 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaatatga 34575  T
Q  279 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 325  Q
    |||| |||  ||||| || ||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  34576 agttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgt 34621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Original strand, 34374 - 34450
Alignment:
Q  101 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttga 174  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  34374 aaggtaagagggttagttattatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttga 34450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 172096 - 172021
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  172096 atgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt 172021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 177799 - 177724
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  177799 atgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt 177724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 272216 - 272141
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  272216 atgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt 272141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 606 - 681
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||  ||||| || |||||||||||||    
T  606 atgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt 681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3437 - 3388
Alignment:
Q  190 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtaggcatgaattgatgat 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  3437 aaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgat 3388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22731 - 22656
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  22731 atgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26986 - 26911
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  26986 atgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 1654 - 1729
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  1654 atgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 37138 - 37213
Alignment:
Q  235 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  37138 atgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University