View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14776_low_19 (Length: 388)

Name: NF14776_low_19
Description: NF14776
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14776_low_19
NF14776_low_19
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (1-204)||(23701819-23702022)
chr4 (237-388)||(1756771-1756926)
chr4 (237-388)||(31969712-31969867)
chr4 (237-388)||(54189576-54189731)
chr4 (211-388)||(38055157-38055343)
chr4 (239-385)||(44379197-44379347)
chr4 (236-388)||(27488655-27488811)
chr4 (237-388)||(19913637-19913792)
chr4 (237-388)||(20877078-20877233)
chr4 (237-388)||(23776466-23776621)
chr4 (237-388)||(28032719-28032874)
chr4 (237-388)||(35490780-35490935)
chr4 (237-388)||(50055108-50055263)
chr4 (211-388)||(45424541-45424727)
chr4 (240-388)||(23704216-23704368)
chr4 (240-388)||(43289967-43290119)
chr4 (237-388)||(8591099-8591254)
chr4 (237-388)||(11639585-11639740)
chr4 (237-388)||(15241035-15241190)
chr4 (237-388)||(44784924-44785079)
chr4 (242-388)||(53717471-53717621)
chr4 (237-386)||(37968766-37968919)
chr4 (237-388)||(6688634-6688783)
chr4 (237-388)||(19164980-19165134)
chr4 (240-388)||(50353835-50353987)
chr4 (237-388)||(14987823-14987978)
chr4 (237-388)||(16700812-16700967)
chr4 (237-388)||(30423572-30423726)
chr4 (237-388)||(54412659-54412814)
chr4 (247-388)||(27536111-27536256)
chr4 (237-388)||(2481415-2481570)
chr4 (241-388)||(6611367-6611518)
chr4 (237-388)||(37464752-37464907)
chr4 (237-388)||(40428727-40428882)
chr4 (237-388)||(48909877-48910032)
chr4 (237-388)||(52139234-52139389)
chr4 (279-388)||(23269053-23269162)
chr4 (239-388)||(27583639-27583792)
chr4 (241-388)||(16703856-16704007)
chr4 (279-388)||(47632112-47632221)
chr4 (237-388)||(53353090-53353249)
chr4 (208-388)||(1617081-1617270)
chr4 (240-388)||(40680045-40680197)
chr4 (237-385)||(53875688-53875840)
chr4 (217-373)||(28360436-28360602)
chr4 (254-388)||(33703889-33704027)
chr4 (279-388)||(44375922-44376031)
chr4 (237-388)||(38071330-38071482)
chr4 (240-384)||(30171614-30171762)
chr4 (238-388)||(8932185-8932339)
chr4 (240-388)||(15669217-15669369)
chr4 (237-388)||(55344832-55344987)
chr4 (241-351)||(50053478-50053592)
chr4 (320-388)||(53408137-53408206)
chr4 (281-350)||(51780763-51780832)
chr4 (344-388)||(23261893-23261937)
chr4 (293-346)||(55344724-55344777)
chr4 (341-388)||(48748197-48748244)
chr4 (358-388)||(9595909-9595939)
chr4 (358-388)||(50055301-50055331)
chr4 (237-286)||(23265870-23265919)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (237-388)||(39260365-39260520)
chr1 (211-388)||(25897374-25897560)
chr1 (211-380)||(29288149-29288327)
chr1 (237-388)||(16052127-16052282)
chr1 (237-388)||(20089502-20089657)
chr1 (237-388)||(29078547-29078702)
chr1 (237-388)||(52753166-52753321)
chr1 (239-388)||(38829102-38829255)
chr1 (237-388)||(26580289-26580444)
chr1 (211-388)||(46760966-46761152)
chr1 (211-388)||(970543-970731)
chr1 (240-388)||(33510518-33510670)
chr1 (237-388)||(1168534-1168689)
chr1 (237-388)||(1940766-1940921)
chr1 (237-388)||(5215416-5215571)
chr1 (237-388)||(1170463-1170618)
chr1 (238-388)||(2347688-2347843)
chr1 (237-388)||(8079728-8079883)
chr1 (237-388)||(23498491-23498646)
chr1 (237-388)||(26663289-26663444)
chr1 (241-388)||(41928514-41928665)
chr1 (217-388)||(40149479-40149649)
chr1 (237-388)||(52696822-52696977)
chr1 (242-388)||(7145244-7145393)
chr1 (211-388)||(42370814-42371000)
chr1 (239-388)||(17591721-17591874)
chr1 (240-388)||(40092525-40092677)
chr1 (237-388)||(12682851-12683006)
chr1 (237-388)||(43905685-43905840)
chr1 (242-388)||(32671615-32671765)
chr1 (240-388)||(17587524-17587676)
chr1 (240-388)||(19715180-19715332)
chr1 (241-388)||(8120904-8121055)
chr1 (237-388)||(15203143-15203298)
chr1 (242-388)||(6765495-6765645)
chr1 (238-388)||(51359236-51359389)
chr1 (237-386)||(2473753-2473906)
chr1 (237-388)||(13996742-13996897)
chr1 (279-388)||(49146249-49146358)
chr1 (243-388)||(15717822-15717970)
chr1 (212-386)||(46409436-46409621)
chr1 (237-388)||(15554171-15554318)
chr1 (279-368)||(29695753-29695842)
chr1 (334-388)||(38171951-38172005)
chr1 (281-350)||(23322897-23322966)
chr1 (237-331)||(52086298-52086396)
chr1 (241-319)||(38171867-38171949)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (237-388)||(25999416-25999571)
chr3 (240-388)||(8042638-8042790)
chr3 (237-388)||(46452167-46452322)
chr3 (237-388)||(37698148-37698303)
chr3 (237-388)||(38856121-38856276)
chr3 (237-388)||(42307910-42308065)
chr3 (242-388)||(32244153-32244303)
chr3 (217-388)||(21581045-21581225)
chr3 (237-388)||(12117663-12117818)
chr3 (237-388)||(42104976-42105131)
chr3 (237-388)||(15520147-15520302)
chr3 (237-388)||(35226475-35226630)
chr3 (237-388)||(22174995-22175150)
chr3 (211-385)||(25494293-25494476)
chr3 (237-388)||(54870179-54870334)
chr3 (242-388)||(29445521-29445671)
chr3 (242-388)||(32359292-32359442)
chr3 (241-388)||(24835704-24835855)
chr3 (241-388)||(44609338-44609489)
chr3 (237-388)||(50528957-50529112)
chr3 (240-388)||(20842353-20842505)
chr3 (237-376)||(2895213-2895356)
chr3 (237-388)||(15520664-15520819)
chr3 (237-388)||(20699177-20699332)
chr3 (239-388)||(38933975-38934128)
chr3 (237-386)||(54534335-54534486)
chr3 (237-385)||(44688789-44688940)
chr3 (279-388)||(53028291-53028400)
chr3 (237-388)||(48925008-48925161)
chr3 (237-384)||(34700369-34700520)
chr3 (261-388)||(16354398-16354529)
chr3 (237-388)||(26122842-26122997)
chr3 (241-356)||(35643249-35643368)
chr3 (319-388)||(24366143-24366212)
chr3 (279-388)||(12915980-12916089)
chr3 (241-339)||(50529827-50529929)
chr3 (326-388)||(13696914-13696976)
chr3 (237-333)||(49128077-49128177)
chr3 (359-388)||(50528887-50528916)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (237-388)||(20726824-20726975)
chr6 (237-388)||(6086618-6086773)
chr6 (237-388)||(26704358-26704513)
chr6 (237-388)||(2837578-2837733)
chr6 (237-388)||(26946895-26947050)
chr6 (237-388)||(30691884-30692039)
chr6 (239-388)||(1153628-1153781)
chr6 (237-388)||(3347542-3347697)
chr6 (237-388)||(3955785-3955940)
chr6 (240-387)||(9459599-9459750)
chr6 (237-388)||(21893488-21893643)
chr6 (211-388)||(18613540-18613726)
chr6 (283-388)||(33464412-33464517)
chr6 (251-388)||(28199527-28199667)
chr6 (237-386)||(35198317-35198469)
chr6 (237-388)||(17261092-17261247)
chr6 (212-386)||(34887313-34887496)
chr6 (211-388)||(16307027-16307213)
chr6 (240-388)||(11167276-11167428)
chr6 (237-363)||(52869-52999)
chr6 (293-388)||(53001-53096)
chr6 (240-388)||(30698948-30699100)
chr6 (240-282)||(33463737-33463779)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (237-388)||(36736-36891)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (237-388)||(1579070-1579225)
chr5 (237-388)||(1605590-1605745)
chr5 (237-388)||(9008076-9008231)
chr5 (237-388)||(27420892-27421047)
chr5 (237-388)||(27679188-27679343)
chr5 (241-388)||(33991178-33991329)
chr5 (240-388)||(1165620-1165772)
chr5 (237-388)||(8374358-8374512)
chr5 (237-388)||(16737466-16737621)
chr5 (237-388)||(24105690-24105845)
chr5 (211-388)||(16069356-16069542)
chr5 (237-388)||(4120971-4121126)
chr5 (237-388)||(33491215-33491370)
chr5 (242-386)||(5203011-5203159)
chr5 (241-388)||(3386505-3386656)
chr5 (212-388)||(31883148-31883333)
chr5 (240-388)||(38598469-38598621)
chr5 (237-388)||(3921615-3921770)
chr5 (211-388)||(26602961-26603137)
chr5 (240-388)||(19358563-19358715)
chr5 (241-388)||(20992165-20992316)
chr5 (237-388)||(35782663-35782818)
chr5 (279-388)||(27025036-27025145)
chr5 (237-386)||(31410510-31410663)
chr5 (237-334)||(20992354-20992455)
chr5 (217-340)||(33284642-33284774)
chr5 (349-388)||(35420443-35420482)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (237-387)||(1108310-1108464)
chr2 (217-388)||(33906066-33906246)
chr2 (237-388)||(31517234-31517389)
chr2 (240-388)||(19383954-19384106)
chr2 (237-384)||(3873267-3873418)
chr2 (242-388)||(42937755-42937906)
chr2 (240-388)||(18806903-18807055)
chr2 (237-388)||(4232161-4232316)
chr2 (241-388)||(26323205-26323356)
chr2 (242-388)||(30270698-30270848)
chr2 (237-385)||(5733430-5733582)
chr2 (261-388)||(2178788-2178919)
chr2 (211-388)||(28329858-28330042)
chr2 (242-388)||(4016075-4016225)
chr2 (237-388)||(19901157-19901311)
chr2 (240-383)||(6174852-6174999)
chr2 (237-388)||(16066313-16066468)
chr2 (241-388)||(39635487-39635638)
chr2 (237-388)||(1482922-1483076)
chr2 (237-388)||(16588795-16588950)
chr2 (239-388)||(851030-851183)
chr2 (242-388)||(429852-430002)
chr2 (237-351)||(30420223-30420341)
chr2 (242-388)||(44947568-44947711)
chr2 (281-351)||(3585369-3585439)
chr2 (241-351)||(42446625-42446739)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (212-388)||(144397-144582)
chr8 (237-388)||(14422736-14422891)
chr8 (237-388)||(18594570-18594725)
chr8 (237-388)||(39206619-39206774)
chr8 (237-388)||(10836774-10836929)
chr8 (237-388)||(29938094-29938249)
chr8 (241-388)||(33278437-33278588)
chr8 (211-388)||(24113185-24113371)
chr8 (208-388)||(13110403-13110592)
chr8 (237-388)||(2042543-2042698)
chr8 (237-388)||(4035880-4036035)
chr8 (237-388)||(34679476-34679631)
chr8 (211-388)||(6144292-6144478)
chr8 (240-388)||(22260649-22260801)
chr8 (237-388)||(35118050-35118205)
chr8 (237-388)||(38167174-38167329)
chr8 (237-386)||(34842386-34842539)
chr8 (237-386)||(39218810-39218963)
chr8 (242-388)||(7774802-7774952)
chr8 (242-384)||(34998919-34999065)
chr8 (242-388)||(44804963-44805113)
chr8 (241-388)||(41575550-41575701)
chr8 (242-388)||(7791449-7791599)
chr8 (242-388)||(7812033-7812183)
chr8 (242-386)||(5320602-5320750)
chr8 (211-363)||(33287069-33287230)
chr8 (279-378)||(28639361-28639460)
chr8 (279-385)||(9807339-9807445)
chr8 (279-388)||(36491236-36491345)
chr8 (237-385)||(42571627-42571776)
chr8 (237-384)||(8021752-8021895)
chr8 (237-356)||(40117903-40118026)
chr8 (279-383)||(66203-66308)
chr8 (237-339)||(26783801-26783907)
chr8 (242-351)||(2322068-2322181)
chr8 (237-283)||(5005199-5005245)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (236-388)||(24792341-24792497)
chr7 (237-388)||(42673497-42673648)
chr7 (241-388)||(933321-933472)
chr7 (237-388)||(3511355-3511510)
chr7 (237-388)||(33359099-33359254)
chr7 (237-388)||(7164216-7164371)
chr7 (237-388)||(12101187-12101342)
chr7 (237-388)||(22649703-22649858)
chr7 (211-388)||(43067982-43068168)
chr7 (209-388)||(48865639-48865820)
chr7 (237-388)||(30181033-30181188)
chr7 (242-388)||(25748524-25748674)
chr7 (239-388)||(36890839-36890992)
chr7 (237-385)||(20346520-20346672)
chr7 (237-388)||(42965005-42965160)
chr7 (237-385)||(42204186-42204339)
chr7 (240-388)||(5280895-5281047)
chr7 (244-388)||(8630705-8630853)
chr7 (240-388)||(12097599-12097751)
chr7 (237-388)||(4347305-4347460)
chr7 (237-386)||(6394783-6394936)
chr7 (211-388)||(16894516-16894692)
chr7 (217-388)||(1803033-1803213)
chr7 (253-388)||(9452638-9452777)
chr7 (237-388)||(32041574-32041729)
chr7 (237-388)||(38866576-38866731)
chr7 (237-386)||(4477332-4477485)
chr7 (237-388)||(15655944-15656099)
chr7 (237-388)||(33846538-33846688)
chr7 (237-388)||(43156745-43156900)
chr7 (240-388)||(17753635-17753787)
chr7 (279-388)||(46134313-46134422)
chr7 (261-388)||(46891348-46891479)
chr7 (239-346)||(19828304-19828415)
chr7 (241-388)||(43021589-43021736)
chr7 (242-351)||(37005857-37005970)
chr7 (237-286)||(37705012-37705061)
chr7 (239-351)||(43405054-43405170)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (237-388)||(25-180)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (237-388)||(22970-23125)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (237-388)||(3741-3896)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (211-388)||(10238-10424)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (241-388)||(145264-145415)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (251-388)||(25-165)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (242-388)||(314-464)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 23701819 - 23702022
Alignment:
Q  1 ctaaatttgcattaatcaaccggttgaattagaagagaactaaggatgcagtaactaaccttgtcattgaatgatcgatgagaatgtgttcgttggttgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23701819 ctaaatttgtattaatcaaccggttgaattagaagagaactaaggatgcagtgactaaccttgtcattgaatgatcgatgagaatgtgttcgttggttgt 23701918  T
Q  101 ttatacttttaggttgggaaaagataagaatttggagcggtggttatgcttggcagttctgagtgagctcttttaggtctccggttagtgctaacaaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23701919 ttatacttttaggttgggaaaagataggaatttggagcagtggttatgcttggcagttctgagtgagctcttttaggtctccggttagtgctaacaaatt 23702018  T
Q  201 ctgt 204  Q
    ||||    
T  23702019 ctgt 23702022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1756926 - 1756771
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1756926 tgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 1756827  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756826 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 1756771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 31969712 - 31969867
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  31969712 tgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaata 31969811  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969812 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 31969867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 54189576 - 54189731
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  54189576 tgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 54189675  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189676 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 54189731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Original strand, 38055157 - 38055343
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||||||||    
T  38055157 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 38055256  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055257 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 38055343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 239 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 44379347 - 44379197
Alignment:
Q  239 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 334  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44379347 ggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgcttatgtcatattttaataag 44379248  T
Q  335 cctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatg 385  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44379247 cctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatg 44379197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 236 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27488811 - 27488655
Alignment:
Q  236 ctgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaat 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27488811 ctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaat 27488712  T
Q  332 aagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27488711 aagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 27488655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19913792 - 19913637
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  19913792 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 19913693  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913692 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 19913637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 20877078 - 20877233
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  20877078 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 20877177  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20877178 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttacgtaa 20877233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23776621 - 23776466
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23776621 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 23776522  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23776521 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggatcttatgaatttatgtaa 23776466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 28032874 - 28032719
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28032874 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtatcataagctgcttatgccatattttaata 28032775  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28032774 agtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 28032719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 35490935 - 35490780
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35490935 tgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaata 35490836  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35490835 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 35490780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 50055263 - 50055108
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  50055263 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatggtttcataagctgcttatgccatattttaata 50055164  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055163 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 50055108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 45424727 - 45424541
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacctg-----ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||      ||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  45424727 cccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 45424628  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424627 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 45424541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23704368 - 23704216
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  23704368 gcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagc 23704269  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704268 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 23704216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 43290119 - 43289967
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  43290119 gcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 43290020  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43290019 ctaaattttcagcttaccctctggcttaataaggagcttatgaatttatgtaa 43289967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8591254 - 8591099
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  8591254 tgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatatgttaata 8591155  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591154 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 8591099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 11639740 - 11639585
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11639740 tgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 11639641  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639640 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 11639585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15241190 - 15241035
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  15241190 tgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 15241091  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15241090 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 15241035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 44785079 - 44784924
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44785079 tgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaata 44784980  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44784979 agcctaaactttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaa 44784924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 53717621 - 53717471
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  53717621 ttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccctattttaataagcct 53717522  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717521 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 53717471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 237 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 37968919 - 37968766
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  37968919 tgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaata 37968820  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37968819 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgt 37968766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 6688783 - 6688634
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||      |||||||||||||||||||||    
T  6688783 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc------tgcttatgccatattttaata 6688690  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688689 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 6688634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19165134 - 19164980
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataag-catttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaat 331  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  19165134 tgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccata-tttaat 19165036  T
Q  332 aagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19165035 aagcctaaattttcagcttaccctc-ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 19164980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Original strand, 50353835 - 50353987
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  50353835 gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatgatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 50353934  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50353935 ctaatttttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 50353987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 14987823 - 14987978
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  14987823 tgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 14987922  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14987923 agcctaaattttcagcttaccctcttgcttaacaatgagcttatgaatttatgtaa 14987978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 16700812 - 16700967
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  16700812 tgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 16700911  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16700912 agcctaaattttcagcttaccctctagcttaacaaggagcttataaatttatgtaa 16700967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 30423726 - 30423572
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  30423726 tgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaata 30423627  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30423626 agcataaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagctta-gaatttatgtaa 30423572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 54412659 - 54412814
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||     ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||    
T  54412659 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattctaata 54412758  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54412759 agtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcatatgaatttatgtaa 54412814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 247 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27536256 - 27536111
Alignment:
Q  247 tacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaatt 342  Q
    |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536256 tactcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaatt 27536157  T
Q  343 ttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536156 ttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 27536111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2481570 - 2481415
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  2481570 tgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 2481471  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481470 agccaaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 2481415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 6611518 - 6611367
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||    
T  6611518 cttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgtcatattttgataagcc 6611419  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6611418 taaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 6611367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 37464752 - 37464907
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37464752 tgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 37464851  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37464852 agcctaaattttcagtttaccctccggtttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 37464907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 40428882 - 40428727
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||    
T  40428882 tgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttataccatattttgata 40428783  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428782 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 40428727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 48909877 - 48910032
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  48909877 tgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaaca 48909976  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48909977 aacctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 48910032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 52139234 - 52139389
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| ||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  52139234 tgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 52139333  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52139334 agcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaa 52139389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 279 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269053
Alignment:
Q  279 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatga 378  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 23269063  T
Q  379 atttatgtaa 388  Q
    ||||||||||    
T  23269062 atttatgtaa 23269053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 239 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27583792 - 27583639
Alignment:
Q  239 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 334  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||     ||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  27583792 ggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgcataagctgcttatgccatattttcataag 27583693  T
Q  335 cctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27583692 cctaaatttttagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 27583639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Original strand, 16703856 - 16704007
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttg----ggtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16703856 cttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 16703955  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16703956 taaattttcagtttatcctccggcttaacaaggagcctataaatttatgtaa 16704007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 279 - 388
Target Start/End: Original strand, 47632112 - 47632221
Alignment:
Q  279 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatga 378  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47632112 taaataaaaatagcttctcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 47632211  T
Q  379 atttatgtaa 388  Q
    ||||||||||    
T  47632212 atttatgtaa 47632221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 53353090 - 53353249
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  53353090 tgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 53353189  T
Q  333 ----agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53353190 tataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttatgtaa 53353249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 208 - 388
Target Start/End: Original strand, 1617081 - 1617270
Alignment:
Q  208 aggcccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatca 298  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||     | ||||||||| |  ||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||  ||||||    
T  1617081 aggcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatca 1617180  T
Q  299 tagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1617181 tagtttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 1617270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 40680197 - 40680045
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||     ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  40680197 gcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttcataagc 40680098  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40680097 ctaaatttttagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaa 40680045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 385
Target Start/End: Original strand, 53875688 - 53875840
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||||    
T  53875688 tgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttttataagctgcttatgtcatatttcaata 53875787  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatg 385  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53875788 agcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatg 53875840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 217 - 373
Target Start/End: Original strand, 28360436 - 28360602
Alignment:
Q  217 tggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||     |||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||    
T  28360436 tggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttat 28360535  T
Q  308 atgttgcttatgccat-attttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagct 373  Q
    | | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28360536 aagctgcttatgccattatttttataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 28360602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 254 - 388
Target Start/End: Original strand, 33703889 - 33704027
Alignment:
Q  254 ataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagct 349  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || |  |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703889 ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagct 33703988  T
Q  350 taccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703989 tatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 33704027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 279 - 388
Target Start/End: Original strand, 44375922 - 44376031
Alignment:
Q  279 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  44375922 taaataaaaatagtttatcatagtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaaaaaagagcttatga 44376021  T
Q  379 atttatgtaa 388  Q
    ||||||||||    
T  44376022 atttatgtaa 44376031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38071482 - 38071330
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38071482 tgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 38071383  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||| ||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071382 agcctgaattttcagtttac---ggggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 38071330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 240 - 384
Target Start/End: Original strand, 30171614 - 30171762
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||    
T  30171614 gcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttataccatatttcaataagc 30171713  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttat 384  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  30171714 ctaaattttcagcttaccttccggtttaacaaggagcttatgaatttat 30171762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 238 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8932339 - 8932185
Alignment:
Q  238 gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataa 333  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| |||||||||    ||||| ||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  8932339 gggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttaacgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataa 8932240  T
Q  334 gcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
     |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8932239 acctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggaacttatgaatttatgtaa 8932185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Original strand, 15669217 - 15669369
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  15669217 gcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatactttaataagc 15669316  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15669317 ctaaattttcagcttaccgtccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 15669369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 55344987 - 55344832
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    ||||| |||||||| || |||  |||| |||| |||||||||||||    
T  55344987 tgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatatttgcatgagttgtttataccatattttaata 55344888  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344887 agccaaaattttcagcttaccatccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 55344832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 241 - 351
Target Start/End: Original strand, 50053478 - 50053592
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttggg----taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  50053478 cttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtc 50053577  T
Q  337 taaattttcagctta 351  Q
    |||||||||| ||||    
T  50053578 taaattttcatctta 50053592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 320 - 388
Target Start/End: Original strand, 53408137 - 53408206
Alignment:
Q  320 ccatattttaataagcctaaattttcagcttaccc-tctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53408137 ccatattttattaagcctaaattttcagcttacccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 53408206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 51780832 - 51780763
Alignment:
Q  281 aataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 350  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51780832 aataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcccaaattttaagctt 51780763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23261937 - 23261893
Alignment:
Q  344 tcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23261937 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 23261893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 55344777 - 55344724
Alignment:
Q  293 ttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 346  Q
    |||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55344777 ttatcatattttcatgagttgtttatgccatattttaataagccaaaattttca 55344724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 341 - 388
Target Start/End: Original strand, 48748197 - 48748244
Alignment:
Q  341 ttttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48748197 ttttcagcataccctccgtcttaataaggagcttatgaatttatgtaa 48748244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 9595939 - 9595909
Alignment:
Q  358 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595939 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 9595909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 388
Target Start/End: Original strand, 50055301 - 50055331
Alignment:
Q  358 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055301 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 50055331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23265919 - 23265870
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa 286  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23265919 tgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa 23265870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 39260520 - 39260365
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39260520 tgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaata 39260421  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260420 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 39260365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Original strand, 25897374 - 25897560
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||    
T  25897374 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 25897473  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897474 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 25897560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 211 - 380
Target Start/End: Original strand, 29288149 - 29288327
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  29288149 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 29288248  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaat 380  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288249 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaat 29288327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 16052127 - 16052282
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16052127 tgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 16052226  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052227 agcctgaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 16052282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 20089502 - 20089657
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  20089502 tgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 20089601  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089602 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 20089657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 29078547 - 29078702
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29078547 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 29078646  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078647 aacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 29078702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 52753321 - 52753166
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  52753321 tgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctacttatgccatattttaata 52753222  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753221 agcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 52753166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 239 - 388
Target Start/End: Original strand, 38829102 - 38829255
Alignment:
Q  239 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  38829102 ggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttgtgccatattttaataag 38829201  T
Q  335 cctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829202 cctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 38829255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26580444 - 26580289
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaa----ataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26580444 tgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 26580345  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580344 agcctaaattttcagcttaccttctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 26580289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Original strand, 46760966 - 46761152
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||    
T  46760966 cccgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 46761065  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46761066 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 46761152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 970731 - 970543
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcata- 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||     
T  970731 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatat 970632  T
Q  301 -gtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  970631 agtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 970543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Original strand, 33510518 - 33510670
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33510518 gcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 33510617  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510618 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 33510670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 1168534 - 1168689
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1168534 tgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 1168633  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1168634 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaa 1168689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1940921 - 1940766
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  1940921 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgtttatgtcatattttaata 1940822  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940821 agcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 1940766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 5215416 - 5215571
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5215416 tgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaata 5215515  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215516 agcctaaattttcagcttaacttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 5215571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1170618 - 1170463
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  1170618 tgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 1170519  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1170518 agcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaa 1170463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 238 - 388
Target Start/End: Original strand, 2347688 - 2347843
Alignment:
Q  238 gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatatttt-aata 332  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||    
T  2347688 gggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttttaata 2347787  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2347788 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaa 2347843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8079883 - 8079728
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  8079883 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctacttatgccatattttaata 8079784  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8079783 agcctaagttttcagcttaccctctggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaa 8079728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 23498491 - 23498646
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  23498491 tgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttcatcatagtttcataagttgcttatatcatattttaata 23498590  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23498591 agcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 23498646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 26663289 - 26663444
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||     ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  26663289 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaata 26663388  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663389 agcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 26663444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 41928665 - 41928514
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  41928665 cttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcc 41928566  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928565 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 41928514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 217 - 388
Target Start/End: Original strand, 40149479 - 40149649
Alignment:
Q  217 tggattgacttattttgacctgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgtt 312  Q
    ||||||||||||||||||     ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| ||| | |    
T  40149479 tggattgacttattttga-----gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagct 40149573  T
Q  313 gcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40149574 gcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagtttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 40149649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 52696822 - 52696977
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  52696822 tgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 52696921  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696922 agcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 52696977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 7145244 - 7145393
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7145244 ttatctactcccataagcctttttaaaagtgtt-gggtaaataaacaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcct 7145342  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145343 aaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 7145393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 42371000 - 42370814
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || |  |||||||||    
T  42371000 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaacttatcatag 42370901  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42370900 tttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 42370814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 239 - 388
Target Start/End: Original strand, 17591721 - 17591874
Alignment:
Q  239 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 334  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  17591721 ggcttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataag 17591820  T
Q  335 cctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591821 cctaaatttccagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 17591874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Original strand, 40092525 - 40092677
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  40092525 gcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 40092624  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40092625 ctaaattttcagcttatcttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 40092677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 12682851 - 12683006
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  12682851 tgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttcata 12682950  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12682951 agcctaaatctttagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaa 12683006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 43905685 - 43905840
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43905685 tgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 43905784  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43905785 agcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttacgtaa 43905840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 32671615 - 32671765
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  32671615 ttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctacttatgccatattttaataagcct 32671714  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32671715 aaattttcaacttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 32671765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 17587676 - 17587524
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    || || |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17587676 gcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgcttatgccatattttaataagc 17587577  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17587576 ctaaattttcagcttacactctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 17587524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19715332 - 19715180
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||     ||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  19715332 gcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattgtttcataagctgcttatgtcatattttaataagc 19715233  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19715232 ctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 19715180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Original strand, 8120904 - 8121055
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||     
T  8120904 cttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagct 8121003  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8121004 taaattttcagtttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 8121055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 15203143 - 15203298
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  15203143 tgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatatttcaata 15203242  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203243 agcctaaattttcagccaaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 15203298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 6765495 - 6765645
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  6765495 ttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatattttcatgagctgcttatgtcatattttaataagcct 6765594  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6765595 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaa 6765645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 238 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 51359389 - 51359236
Alignment:
Q  238 gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataa 333  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  51359389 gggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatcatagtttcataaggtgcttatgccatattttaataa 51359291  T
Q  334 gcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51359290 gcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagtttatgaatttatgtaa 51359236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 386
Target Start/End: Original strand, 2473753 - 2473906
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||    
T  2473753 tgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaata 2473852  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  2473853 agcctaaattttcagcttaccctcctacttaacaaggagcttatgaatttatgt 2473906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 13996897 - 13996742
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    ||||| |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13996897 tgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttataatggtttcataagctgcttatgccatattttaata 13996798  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13996797 agcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaa 13996742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 279 - 388
Target Start/End: Original strand, 49146249 - 49146358
Alignment:
Q  279 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatga 378  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  49146249 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcatcttaccctccggcttaacaaagagcttatga 49146348  T
Q  379 atttatgtaa 388  Q
    ||||||||||    
T  49146349 atttatgtaa 49146358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 243 - 388
Target Start/End: Original strand, 15717822 - 15717970
Alignment:
Q  243 tatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagccta 338  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15717822 tatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagtttcataagctgcttatgccataatttaataagccta 15717920  T
Q  339 aattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15717921 aattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgattttatgtaa 15717970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 212 - 386
Target Start/End: Original strand, 46409436 - 46409621
Alignment:
Q  212 ccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagt 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||     || |||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  46409436 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 46409535  T
Q  303 ttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggc--ttaacaaggagcttatgaatttatgt 386  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  46409536 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttacccttcgacaattaacaaggagcttatgaatttatgt 46409621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15554318 - 15554171
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |  | | |||   ||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  15554318 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaat-agcat---ttcataaactgctgatgccatattttaataagcc 15554223  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15554222 taaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 15554171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 279 - 368
Target Start/End: Original strand, 29695753 - 29695842
Alignment:
Q  279 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaag 368  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29695753 taaataaaaataatttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaag 29695842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 388
Target Start/End: Original strand, 38171951 - 38172005
Alignment:
Q  334 gcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38171951 gcctaaattttcagcttatcctccggcttaagaatgagcttatgaatttatgtaa 38172005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23322966 - 23322897
Alignment:
Q  281 aataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  23322966 aataaaaatagtttatcataatttcataagctgcttatgtcatactttaataagcgcaaattttaagctt 23322897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 331
Target Start/End: Original strand, 52086298 - 52086396
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat----aaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaat 331  Q
    |||| |||||| || |||||| | ||||||| |||||||||||||||    |||||||  |||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  52086298 tgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttatcataatttcataagctgcttatgccataatttaat 52086396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 319
Target Start/End: Original strand, 38171867 - 38171949
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatg 319  Q
    ||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||    || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  38171867 cttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtttatcatagtttcataagctgcttatg 38171949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 25999416 - 25999571
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25999416 tgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 25999515  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999516 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 25999571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Original strand, 8042638 - 8042790
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8042638 gcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 8042737  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042738 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 8042790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 46452322 - 46452167
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46452322 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaata 46452223  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46452222 agcctaaattttcagctcaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 46452167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 37698303 - 37698148
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  37698303 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 37698204  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698203 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 37698148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 38856121 - 38856276
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38856121 tgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 38856220  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856221 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 38856276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 42308065 - 42307910
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  42308065 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 42307966  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307965 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 42307910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 32244153 - 32244303
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  32244153 ttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagctt 32244252  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244253 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 32244303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 217 - 388
Target Start/End: Original strand, 21581045 - 21581225
Alignment:
Q  217 tggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||    
T  21581045 tggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcat 21581144  T
Q  308 atgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581145 aagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 21581225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12117818 - 12117663
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12117818 tgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgcttatgtcatattttaata 12117719  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12117718 agcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 12117663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 42105131 - 42104976
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  42105131 tgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 42105032  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42105031 agcctaaattttcagcttaccctcatgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 42104976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15520302 - 15520147
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||  ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  15520302 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatcgtttcataaactgcttatgccatattttaata 15520203  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520202 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 15520147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 35226475 - 35226630
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa---aat-agtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35226475 tgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 35226574  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  35226575 agcctaaattttcagcttaccctccagcctaacaaggagcttatgaatttatgtaa 35226630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22175150 - 22174995
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22175150 tgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 22175051  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175050 agcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 22174995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 211 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25494476 - 25494293
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||    
T  25494476 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 25494377  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatg 385  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25494376 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatg 25494293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 54870334 - 54870179
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  54870334 tgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatcgtttcataagctgcttatgtcatattttaata 54870235  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870234 agcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 54870179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 29445521 - 29445671
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||    
T  29445521 ttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccctattttaataagcct 29445620  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29445621 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 29445671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 32359292 - 32359442
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32359292 ttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcct 32359391  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32359392 aaattttcagcttaccctccagcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 32359442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24835855 - 24835704
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    ||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  24835855 cttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcc 24835756  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24835755 taaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 24835704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 44609489 - 44609338
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  44609489 cttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 44609390  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44609389 taaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaa 44609338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 50528957 - 50529112
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  50528957 tgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 50529056  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50529057 agcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaa 50529112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 20842505 - 20842353
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || |  |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  20842505 gcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataagctgcttatatcatattttaataagc 20842406  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842405 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 20842353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 376
Target Start/End: Original strand, 2895213 - 2895356
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  2895213 tgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 2895312  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895313 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttat 2895356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 15520664 - 15520819
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15520664 tgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 15520763  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15520764 agcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttttgtaa 15520819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 20699177 - 20699332
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20699177 tgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 20699276  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20699277 agcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttaggaatttttgtaa 20699332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 239 - 388
Target Start/End: Original strand, 38933975 - 38934128
Alignment:
Q  239 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 334  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  38933975 ggcttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataag 38934074  T
Q  335 cctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
     |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934075 tctaaatttccagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 38934128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 54534486 - 54534335
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||| |||| ||| | |||||||||||||||  ||||    
T  54534486 tgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggttt-ataagctgcttatgccatattc-aata 54534389  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54534388 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 54534335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 385
Target Start/End: Original strand, 44688789 - 44688940
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||     ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  44688789 tgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg-catattttaata 44688887  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatg 385  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  44688888 agcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatg 44688940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 279 - 388
Target Start/End: Original strand, 53028291 - 53028400
Alignment:
Q  279 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatga 378  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53028291 taaataaaaatagcttatcatattttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 53028390  T
Q  379 atttatgtaa 388  Q
    ||||||||||    
T  53028391 atttatgtaa 53028400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 48925161 - 48925008
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttggg----taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  48925161 tgggtttatctacttccataagcttttttaa--aagtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgtttatgtcatattttaata 48925064  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    || ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48925063 agtctaaatttttagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 48925008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 237 - 384
Target Start/End: Original strand, 34700369 - 34700520
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  34700369 tgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 34700468  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttat 384  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34700469 agcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaagaagcttatgaatttat 34700520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 261 - 388
Target Start/End: Original strand, 16354398 - 16354529
Alignment:
Q  261 tttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 356  Q
    ||||||| ||||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16354398 tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgccatgttttaataagcctaaattttcagcttatcctc 16354497  T
Q  357 tggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354498 ctgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 16354529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 26122842 - 26122997
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| ||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||    
T  26122842 tgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaata 26122941  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26122942 agcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagtagcttatgaatttacgtaa 26122997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 241 - 356
Target Start/End: Original strand, 35643249 - 35643368
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  35643249 cttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcc 35643348  T
Q  337 taaattttcagcttaccctc 356  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  35643349 taaattttgagcttaccctc 35643368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 319 - 388
Target Start/End: Original strand, 24366143 - 24366212
Alignment:
Q  319 gccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24366143 gccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 24366212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 279 - 388
Target Start/End: Original strand, 12915980 - 12916089
Alignment:
Q  279 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatga 378  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12915980 taaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatgtcatatttaaataagcttaagttttcagcttaccctccggtttaagaaagagtttatga 12916079  T
Q  379 atttatgtaa 388  Q
    ||||||||||    
T  12916080 atttatgtaa 12916089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 241 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 50529929 - 50529827
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  50529929 cttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaatgagcc 50529830  T
Q  337 taa 339  Q
    |||    
T  50529829 taa 50529827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 326 - 388
Target Start/End: Original strand, 13696914 - 13696976
Alignment:
Q  326 tttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13696914 tttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttgtgtaa 13696976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 333
Target Start/End: Original strand, 49128077 - 49128177
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat----aaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| | |||||  ||||||| | |||||||||||||    |||||||  ||||| || ||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  49128077 tgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataacttatcgtaatttcataagctgcttatgctatattttaata 49128176  T
Q  333 a 333  Q
    |    
T  49128177 a 49128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 50528916 - 50528887
Alignment:
Q  359 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528916 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 50528887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 20726824 - 20726975
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20726824 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaaaataacttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 20726923  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726924 taaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 20726975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 6086773 - 6086618
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  6086773 tgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 6086674  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086673 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 6086618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26704513 - 26704358
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26704513 tgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 26704414  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704413 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 26704358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 2837578 - 2837733
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  2837578 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcatgagctgctcatgccatattttaata 2837677  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837678 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 2837733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26947050 - 26946895
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  26947050 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 26946951  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946950 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 26946895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 30691884 - 30692039
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30691884 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 30691983  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691984 agcctaaattttcagcttaccatctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 30692039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 239 - 388
Target Start/End: Original strand, 1153628 - 1153781
Alignment:
Q  239 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1153628 ggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataag 1153727  T
Q  335 cctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1153728 cctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggtgcttatgtatttatgtaa 1153781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3347697 - 3347542
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  3347697 tgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 3347598  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347597 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 3347542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3955940 - 3955785
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  3955940 tgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgctatattttaata 3955841  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955840 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 3955785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 240 - 387
Target Start/End: Original strand, 9459599 - 9459750
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9459599 gcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 9459698  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgta 387  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459699 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgta 9459750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 21893488 - 21893643
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaata----aaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21893488 tgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 21893587  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893588 agcctaatttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 21893643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Original strand, 18613540 - 18613726
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     || |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||    
T  18613540 cccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatag 18613639  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    || |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613640 ttccataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 18613726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 283 - 388
Target Start/End: Original strand, 33464412 - 33464517
Alignment:
Q  283 taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaattt 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33464412 taaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaattt 33464511  T
Q  383 atgtaa 388  Q
    ||||||    
T  33464512 atgtaa 33464517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 251 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 28199667 - 28199527
Alignment:
Q  251 tccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 346  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28199667 tccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttca 28199569  T
Q  347 gcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199568 gcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 28199527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 237 - 386
Target Start/End: Original strand, 35198317 - 35198469
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  35198317 tgggcttatctacttccataagc-tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaata 35198415  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 386  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35198416 agcctaaattttcagtttactctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgt 35198469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 17261247 - 17261092
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    ||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  17261247 tgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatattttcataagctgcttatgctatattttaata 17261148  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17261147 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaa 17261092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 212 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 34887496 - 34887313
Alignment:
Q  212 ccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagt 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||     ||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||    
T  34887496 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 34887397  T
Q  303 ttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 386  Q
    |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34887396 ttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctaatgaatttatgt 34887313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16307213 - 16307027
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacctg-----ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||      ||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||     |||||||||| || |||||||||    
T  16307213 cccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcatag 16307114  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16307113 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 16307027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Original strand, 11167276 - 11167428
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    |||||| || || ||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  11167276 gcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagc 11167375  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167376 ctaaattttcagcttacccaccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 11167428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 363
Target Start/End: Original strand, 52869 - 52999
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  52869 tgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 52968  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggctta 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52969 agcctaaattttcagcttaccctctggctta 52999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 293 - 388
Target Start/End: Original strand, 53001 - 53096
Alignment:
Q  293 ttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53001 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 53096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 30699100 - 30698948
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    |||||| || ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  30699100 gcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttttattagctgcttatgccatattttaataagc 30699001  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30699000 ctaaattttcagcttaccctccgacttaacaatgagcttatgaatttatgtaa 30698948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 282
Target Start/End: Original strand, 33463737 - 33463779
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa 282  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33463737 gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 36736 - 36891
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  36736 tgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 36835  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36836 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 36891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 1579070 - 1579225
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1579070 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 1579169  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579170 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 1579225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1605745 - 1605590
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1605745 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 1605646  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605645 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 1605590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 9008231 - 9008076
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9008231 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 9008132  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008131 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 9008076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 27420892 - 27421047
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27420892 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 27420991  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27420992 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 27421047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27679343 - 27679188
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27679343 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 27679244  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679243 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 27679188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Original strand, 33991178 - 33991329
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33991178 cttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcc 33991277  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33991278 taaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 33991329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1165772 - 1165620
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1165772 gcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagc 1165673  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165672 ctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 1165620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8374512 - 8374358
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8374512 tgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 8374413  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8374412 agcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatg-atttatgtaa 8374358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16737621 - 16737466
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16737621 tgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 16737522  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737521 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 16737466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24105845 - 24105690
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  24105845 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 24105746  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105745 agcctaaattatcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 24105690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Original strand, 16069356 - 16069542
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacctg-----ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||      |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||    ||||||||| |||||||||    
T  16069356 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatag 16069455  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069456 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 16069542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 4120971 - 4121126
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4120971 tgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 4121070  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121071 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 4121126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33491370 - 33491215
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  33491370 tgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttttgccatattttaata 33491271  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491270 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 33491215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 242 - 386
Target Start/End: Original strand, 5203011 - 5203159
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  5203011 ttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcct 5203110  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 386  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5203111 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 5203159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3386656 - 3386505
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3386656 cttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 3386557  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3386556 taaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcctatgaatttatgtaa 3386505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 388
Target Start/End: Original strand, 31883148 - 31883333
Alignment:
Q  212 ccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagt 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||     || ||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  31883148 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 31883247  T
Q  303 ttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883248 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 31883333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38598621 - 38598469
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38598621 gcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 38598522  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598521 ctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 38598469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 3921615 - 3921770
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||     ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3921615 tgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 3921714  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3921715 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaaaaaggagcttatgaatttatgtaa 3921770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26603137 - 26602961
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacctgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttca 306  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||     ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||    
T  26603137 cccgtttggattggcttattttga-----gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 26603043  T
Q  307 tatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26603042 taaactgcttatgccatattttaataagcataatttttcagtttactctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 26602961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Original strand, 19358563 - 19358715
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  19358563 gcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttagtaagc 19358662  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358663 ctaaattttcagcttaccctccaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 19358715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 20992316 - 20992165
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    |||||||||| | |||||  ||||||| ||||||||||||||||||    |||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  20992316 cttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcatagtttcataagctgattatgccatattttaataagcc 20992217  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992216 taaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 20992165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 35782818 - 35782663
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35782818 tgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 35782719  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctg-gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35782718 agcttaaattttcagcctaccctccgtgctt-acaaggagcttatgaatttatgtaa 35782663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 279 - 388
Target Start/End: Original strand, 27025036 - 27025145
Alignment:
Q  279 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatga 378  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  27025036 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccattttttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttataa 27025135  T
Q  379 atttatgtaa 388  Q
    ||||||||||    
T  27025136 atttatgtaa 27025145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 237 - 386
Target Start/End: Original strand, 31410510 - 31410663
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| ||||||||  |||||||  ||||||| |||||||| |||||    ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  31410510 tgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatcatagttttataagctgcttatgccatatttcaata 31410609  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 386  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31410610 agcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgt 31410663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 237 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20992455 - 20992354
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20992455 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 20992356  T
Q  333 ag 334  Q
    ||    
T  20992355 ag 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33284774 - 33284642
Alignment:
Q  217 tggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttggg----taaataaaaatagtttatcatagtttcat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  |    ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  33284774 tggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagttttat 33284675  T
Q  308 atgttgcttatgccatattttaataagcctaaa 340  Q
    |   ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33284674 aaactgcttataccatatttcaataagcctaaa 33284642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 349 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 35420482 - 35420443
Alignment:
Q  349 ttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35420482 ttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 35420443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 237 - 387
Target Start/End: Original strand, 1108310 - 1108464
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1108310 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaata 1108409  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgta 387  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108410 agcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgta 1108464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 217 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33906246 - 33906066
Alignment:
Q  217 tggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||    
T  33906246 tggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcat 33906147  T
Q  308 atgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33906146 aagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaa 33906066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 31517389 - 31517234
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  31517389 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaata 31517290  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31517289 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaatttatgtaa 31517234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19384106 - 19383954
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  19384106 gcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgtttatgccatattttaataagc 19384007  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19384006 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 19383954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3873418 - 3873267
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaaa----tagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3873418 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 3873319  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttat 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3873318 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttat 3873267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 42937755 - 42937906
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataa-gcc 336  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  42937755 ttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataaagcc 42937854  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937855 taaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 42937906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18807055 - 18806903
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  18807055 gcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagc 18806956  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806955 ctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 18806903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 4232316 - 4232161
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |    
T  4232316 tgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttcaca 4232217  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4232216 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 4232161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26323356 - 26323205
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26323356 cttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 26323257  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323256 taaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 26323205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 30270848 - 30270698
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaa----atagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  30270848 ttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcct 30270749  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30270748 aaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 30270698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 385
Target Start/End: Original strand, 5733430 - 5733582
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggt----aaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||    ||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  5733430 tgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 5733529  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatg 385  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5733530 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatg 5733582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2178919 - 2178788
Alignment:
Q  261 tttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 356  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178919 tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 2178820  T
Q  357 tggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178819 tgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 2178788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 28330042 - 28329858
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||    
T  28330042 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 28329943  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28329942 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacc--ctagcttaacaaggagcatatgaatttatgtaa 28329858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 4016075 - 4016225
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggt----aaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    |||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4016075 ttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcct 4016174  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016175 aaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 4016225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19901311 - 19901157
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa---aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataa 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  19901311 tgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgccatatttcaataa 19901212  T
Q  334 gcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19901211 gcctaaattttcagcccacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 19901157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 240 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 6174999 - 6174852
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||    
T  6174999 gcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcattaagc 6174900  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaattta 383  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6174899 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaattta 6174852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16066468 - 16066313
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||| ||| ||||||  ||||| |  |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16066468 tgggcttatctgctttcataagtcttttttaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 16066369  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16066368 agcctaaattttcagcttaccctctgatttaataaggagcttatgaatttatgtaa 16066313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Original strand, 39635487 - 39635638
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaaa----tagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    ||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||    
T  39635487 cttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcc 39635586  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39635587 taaattttcagcttaccctccggcttaacaacgagcttatcaatttatgtaa 39635638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1483076 - 1482922
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1483076 tgggcttatctact-ccataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgtttcataagctgcttatgccatattttaata 1482978  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1482977 agcctaaattttcagtttacccttcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 1482922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16588950 - 16588795
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |  |||||||||||||||    ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  16588950 tgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgcttatgccatattttcata 16588851  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16588850 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaattaatgtaa 16588795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 239 - 388
Target Start/End: Original strand, 851030 - 851183
Alignment:
Q  239 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa--aatagt--ttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 334  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||   |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  851030 ggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataattttataagctgcttatgccatattttaataag 851129  T
Q  335 cctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851130 cttaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 851183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 429852 - 430002
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  429852 ttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataatttcataagttgcttatgcgatattttaataagcct 429951  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||| |||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  429952 aaattttcaacttacaattcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 430002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 237 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30420341 - 30420223
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30420341 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataggttcataagctgcttatgccatattttaata 30420242  T
Q  333 agcctaaattttcagctta 351  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30420241 agcctaaattttcagctta 30420223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 44947711 - 44947568
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||        ||    
T  44947711 ttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattt-------gct 44947619  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  44947618 aaattttcagtttaccctccggcttaacaagaagtttatgaatttatgtaa 44947568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 351
Target Start/End: Original strand, 3585369 - 3585439
Alignment:
Q  281 aataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 351  Q
    |||||||| | ||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  3585369 aataaaaacaatttatcacaatttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattatgagctta 3585439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 42446739 - 42446625
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat----aaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||    ||||| |  |||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||      
T  42446739 cttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatcacaatttcataagctgcttatgccatattttaataagat 42446640  T
Q  337 taaattttcagctta 351  Q
     ||||||| ||||||    
T  42446639 caaattttaagctta 42446625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 212 - 388
Target Start/End: Original strand, 144397 - 144582
Alignment:
Q  212 ccgtctggattgacttattttgacc-----tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaa----ataaaaatagtttatcatagt 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| |     ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  144397 ccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtttatcatagt 144496  T
Q  303 ttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144497 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 144582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 14422736 - 14422891
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14422736 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 14422835  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422836 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 14422891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 18594570 - 18594725
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  18594570 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 18594669  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594670 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 18594725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 39206619 - 39206774
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39206619 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 39206718  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206719 agtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 39206774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 10836929 - 10836774
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  10836929 tgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaata 10836830  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836829 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 10836774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 29938094 - 29938249
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29938094 tgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 29938193  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938194 agcctaaattttcagcttaccctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 29938249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Original strand, 33278437 - 33278588
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33278437 cttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 33278536  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278537 taaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 33278588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24113371 - 24113185
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||    
T  24113371 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatcatag 24113272  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113271 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 24113185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 208 - 388
Target Start/End: Original strand, 13110403 - 13110592
Alignment:
Q  208 aggcccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatca 298  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||     ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||||    
T  13110403 aggcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 13110502  T
Q  299 tagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13110503 tagtttaataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgagtttatgtaa 13110592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2042698 - 2042543
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  2042698 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 2042599  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042598 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 2042543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 4035880 - 4036035
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4035880 tgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 4035979  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4035980 agcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 4036035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 34679631 - 34679476
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttg----ggtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  34679631 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttataccatattttaata 34679532  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34679531 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaa 34679476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 6144478 - 6144292
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||||||||    
T  6144478 cccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 6144379  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144378 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 6144292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22260801 - 22260649
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat----aaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22260801 gcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcctagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 22260702  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260701 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 22260649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 35118205 - 35118050
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  35118205 tgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 35118106  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35118105 agcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaa 35118050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38167329 - 38167174
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaaa----tagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38167329 tgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 38167230  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38167229 agcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaa 38167174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 237 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 34842539 - 34842386
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  34842539 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaata 34842440  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 386  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34842439 agcctaaatttccagcttacccaccgtcttaacaaggagcttattaatttatgt 34842386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 237 - 386
Target Start/End: Original strand, 39218810 - 39218963
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  39218810 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatcatagcttcataagctgcttatgccatatttcaata 39218909  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39218910 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctgatgaatttatgt 39218963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 7774802 - 7774952
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||| |    
T  7774802 ttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagctt 7774901  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7774902 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 7774952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 242 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34999065 - 34998919
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34999065 ttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcct 34998966  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttat 384  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34998965 aaattttcagcttgccctccggcttaacaaggagcttatgaatttat 34998919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 44805113 - 44804963
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |     ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  44805113 ttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcct 44805014  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805013 aaattttcaacttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 44804963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Original strand, 41575550 - 41575701
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||    ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  41575550 cttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcc 41575649  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41575650 taaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 41575701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 7791449 - 7791599
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| |    
T  7791449 ttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagctt 7791548  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7791549 aaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 7791599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 7812033 - 7812183
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| |    
T  7812033 ttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagctt 7812132  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7812133 aaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 7812183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 386
Target Start/End: Original strand, 5320602 - 5320750
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  5320602 ttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatcatagtttcataagttgcttatgtcatgtttcaataagcct 5320701  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 386  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5320702 aaattttcaacttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 5320750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 211 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33287230 - 33287069
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  33287230 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatag 33287131  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggctta 363  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33287130 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctagctta 33287069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 279 - 378
Target Start/End: Original strand, 28639361 - 28639460
Alignment:
Q  279 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatga 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  28639361 taaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacatagagcttatga 28639460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 279 - 385
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807445
Alignment:
Q  279 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatga 378  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatga 9807438  T
Q  379 atttatg 385  Q
    |||||||    
T  9807439 atttatg 9807445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 279 - 388
Target Start/End: Original strand, 36491236 - 36491345
Alignment:
Q  279 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatga 378  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  36491236 taaataaaaacagcttatcatagtttcataacttgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaagaagcttatga 36491335  T
Q  379 atttatgtaa 388  Q
    ||||||||||    
T  36491336 atttatgtaa 36491345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 237 - 385
Target Start/End: Original strand, 42571627 - 42571776
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa---aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataa 333  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||      
T  42571627 tgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaat-- 42571724  T
Q  334 gcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatg 385  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42571725 gcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaaggaacttatgaatttatg 42571776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 384
Target Start/End: Original strand, 8021752 - 8021895
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  8021752 tgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 8021851  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttat 384  Q
    ||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8021852 agcctaaattttca--------tccggcttaacaaggagcttatgagtttat 8021895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 237 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40118026 - 40117903
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  40118026 tgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 40117927  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctc 356  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  40117926 agcttaaattttcagcttaccctc 40117903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 279 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 66308 - 66203
Alignment:
Q  279 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctct-ggcttaacaaggagcttatg 377  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  66308 taaataaaaataacttataatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagtttaaattttcagcttaccctttcggcttaacaaggagcttatg 66209  T
Q  378 aattta 383  Q
    ||||||    
T  66208 aattta 66203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26783907 - 26783801
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaaa----tagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26783907 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 26783808  T
Q  333 agcctaa 339  Q
    |||||||    
T  26783807 agcctaa 26783801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2322181 - 2322068
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat----aaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||    ||||| || |||||| | ||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||    
T  2322181 ttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagcttatcacaatttcataagctgcttatatcatattttgataagcct 2322082  T
Q  338 aaattttcagctta 351  Q
    ||||||| ||||||    
T  2322081 aaattttaagctta 2322068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 283
Target Start/End: Original strand, 5005199 - 5005245
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  5005199 tgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaat 5005245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 236 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24792497 - 24792341
Alignment:
Q  236 ctgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaat 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24792497 ctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaat 24792398  T
Q  332 aagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792397 aagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 24792341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 42673497 - 42673648
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  42673497 tgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 42673596  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673597 taaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 42673648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Original strand, 933321 - 933472
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  933321 cttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 933420  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933421 taaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 933472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 3511355 - 3511510
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaata----aaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3511355 tgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 3511454  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511455 agcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 3511510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33359254 - 33359099
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  33359254 tgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 33359155  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359154 agcctaaattttcagcttaccctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 33359099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 7164216 - 7164371
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7164216 tgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 7164315  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164316 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 7164371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12101342 - 12101187
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12101342 tgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 12101243  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101242 agcctaaattttcagcttaccctatggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 12101187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22649858 - 22649703
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22649858 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaata 22649759  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22649758 agcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 22649703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 43068168 - 43067982
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||    
T  43068168 cccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 43068069  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068068 tttcataagcttcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 43067982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 209 - 388
Target Start/End: Original strand, 48865639 - 48865820
Alignment:
Q  209 ggcccgtctggattgacttattttgacctgggcttatctacttccataagcattttt---aagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatag 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  48865639 ggcccgtttggattgacttattttga-----gcttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 48865733  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865734 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaacatcaggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 48865820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 30181188 - 30181033
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30181188 tgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 30181089  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30181088 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaa 30181033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Original strand, 25748524 - 25748674
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25748524 ttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcct 25748623  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748624 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 25748674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 239 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 36890992 - 36890839
Alignment:
Q  239 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 334  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36890992 ggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagttgcttatgccatatttcaataag 36890893  T
Q  335 cctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36890892 cctaagttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 36890839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 385
Target Start/End: Original strand, 20346520 - 20346672
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20346520 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 20346619  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatg 385  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346620 agtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatg 20346672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 42965160 - 42965005
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  42965160 tgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 42965061  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965060 agcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 42965005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 237 - 385
Target Start/End: Original strand, 42204186 - 42204339
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataag-catttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaat 331  Q
    ||||||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42204186 tgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaat 42204285  T
Q  332 aagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatg 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204286 aagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatg 42204339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Original strand, 5280895 - 5281047
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  5280895 gcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagc 5280994  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5280995 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 5281047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 244 - 388
Target Start/End: Original strand, 8630705 - 8630853
Alignment:
Q  244 atctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaa 339  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8630705 atctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 8630804  T
Q  340 attttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8630805 attttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 8630853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12097751 - 12097599
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||    
T  12097751 gcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctacttatgtcatattttaataagc 12097652  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097651 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 12097599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 4347305 - 4347460
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  4347305 tgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaccatagtttcataagctgcttatgccatattttaaca 4347404  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347405 agcctaaattttcagcttaccctcgagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 4347460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 237 - 386
Target Start/End: Original strand, 6394783 - 6394936
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  6394783 tgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaata 6394882  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 386  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6394883 agcctaaattttcagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 6394936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16894692 - 16894516
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacctgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttca 306  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||     ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  16894692 cccgtttggattggcttattttga-----gcttatctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagtttatcatagtttca 16894598  T
Q  307 tatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16894597 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcaacttaacagggagcttatgaatttatgtaa 16894516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 217 - 388
Target Start/End: Original strand, 1803033 - 1803213
Alignment:
Q  217 tggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||    
T  1803033 tggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcat 1803132  T
Q  308 atgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    | | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1803133 aagctgcttatacgatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaa 1803213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 253 - 388
Target Start/End: Original strand, 9452638 - 9452777
Alignment:
Q  253 cataagcatttttaagggtgtttgggtaaataa----aaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 348  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452638 cataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgtctatgccatattttaataagcctaaattttcagc 9452737  T
Q  349 ttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452738 ttacactccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 9452777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 32041574 - 32041729
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||    
T  32041574 tgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttcata 32041673  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32041674 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttataaatttatgtaa 32041729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 38866576 - 38866731
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  38866576 tgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaata 38866675  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38866676 agcataaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaa 38866731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 237 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4477485 - 4477332
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||    ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  4477485 tgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaata 4477386  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 386  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4477385 agcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 4477332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 15655944 - 15656099
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15655944 tgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 15656043  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15656044 agcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaa 15656099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33846688 - 33846538
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  33846688 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgtcatattttaata 33846589  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846588 agcctaaattttcagctta-----gggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 33846538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 43156745 - 43156900
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | || ||||| || |||| ||||    
T  43156745 tgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatggcaaatttcaata 43156844  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  43156845 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagaacttatgaatttatgtaa 43156900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 240 - 388
Target Start/End: Original strand, 17753635 - 17753787
Alignment:
Q  240 gcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagc 335  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||  | ||||||||||||||    ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17753635 gcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaacatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 17753734  T
Q  336 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17753735 ctaaatttttagcttacccttcaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 17753787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 279 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 46134422 - 46134313
Alignment:
Q  279 taaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatga 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  46134422 taaataaaaatagtttattatagtttcataagctgtttacgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatta 46134323  T
Q  379 atttatgtaa 388  Q
    ||||||||||    
T  46134322 atttatgtaa 46134313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 46891479 - 46891348
Alignment:
Q  261 tttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 356  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  46891479 tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcatagttttataagctgcttatgtcatattttaattagcctaaattttcagcttaccctt 46891380  T
Q  357 tggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46891379 cagcttaacaaggagcttatgagtttatgtaa 46891348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 239 - 346
Target Start/End: Original strand, 19828304 - 19828415
Alignment:
Q  239 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgg----gtaaataaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 334  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19828304 ggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaattgcttatgccatattttaataag 19828403  T
Q  335 cctaaattttca 346  Q
    || |||||||||    
T  19828404 ccaaaattttca 19828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 43021736 - 43021589
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||||    ||||  |||| ||||||||||| | |||||||| |||||||   |    |    
T  43021736 cttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataacttattatagtttcataagctgcttatggcatatttcggt----c 43021641  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43021640 taaattttcagcttactctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 43021589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 37005970 - 37005857
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat----aaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||    |||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  37005970 ttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagcttatcgtaatttcataagctgcttatgctatattttaataaggct 37005871  T
Q  338 aaattttcagctta 351  Q
    || |||| ||||||    
T  37005870 aattttttagctta 37005857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 286
Target Start/End: Original strand, 37705012 - 37705061
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa 286  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37705012 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa 37705061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 351
Target Start/End: Original strand, 43405054 - 43405170
Alignment:
Q  239 ggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaat----aaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataag 334  Q
    |||||||||||| | |||||  ||||||| || ||||||||||||    |||||||| ||||| || ||||||| |||| || | | |||||||||||||    
T  43405054 ggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcgtaatttcataagttgtttctactatattttaataag 43405153  T
Q  335 cctaaattttcagctta 351  Q
    || || |||| ||||||    
T  43405154 cccaattttttagctta 43405170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 180 - 25
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  180 tgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 81  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80 atcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 25  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23125 - 22970
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23125 tgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 23026  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23025 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 22970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 388
Target Start/End: Original strand, 3741 - 3896
Alignment:
Q  237 tgggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3741 tgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 3840  T
Q  333 agcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3841 agcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 3896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 211 - 388
Target Start/End: Original strand, 10238 - 10424
Alignment:
Q  211 cccgtctggattgacttattttgacct-----gggcttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaa----taaaaatagtttatcatag 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  10238 cccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 10337  T
Q  302 tttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10338 tttcataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 10424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 145415 - 145264
Alignment:
Q  241 cttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcc 336  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  145415 cttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcc 145316  T
Q  337 taaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  145315 taaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttataaatttatgtaa 145264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 251 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 165 - 25
Alignment:
Q  251 tccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 346  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  165 tccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttca 67  T
Q  347 gcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66 gcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 25  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 464 - 314
Alignment:
Q  242 ttatctacttccataagcatttttaagggtgtttgggtaaataaa----aatagtttatcatagtttcatatgttgcttatgccatattttaataagcct 337  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| |    
T  464 ttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagctt 365  T
Q  338 aaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 388  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  364 aaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University