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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF1477_low_10 (Length: 340)
Name: NF1477_low_10
Description: NF1477
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF1477_low_10 |
 |  |
|
| [»] scaffold0266 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr3 (32 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr8 (20 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0023 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr1 (16 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0302 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0076 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0218 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0106 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0162 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0139 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0369 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0215 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1711 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1542 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0529 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0420 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0141 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0124 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0622 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0361 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0084 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0066 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0456 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0589 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175815
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25175563 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
25175662 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25175663 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
25175762 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25175763 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca |
25175815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27653983
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27654235 |
catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat |
27654136 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27654135 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
27654036 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27654035 |
acatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
27653983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825752
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16826006 |
catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
16825907 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaac |
208 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16825906 |
taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac |
16825807 |
T |
 |
| Q |
209 |
taacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16825806 |
taacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
16825752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 340
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153777
Alignment:
| Q |
22 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23153458 |
catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
23153557 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
23153558 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
23153656 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23153657 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
23153756 |
T |
 |
| Q |
320 |
attatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23153757 |
attatgatgaagactaacccc |
23153777 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626053
Alignment:
| Q |
15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac |
114 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
14626377 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac |
14626278 |
T |
 |
| Q |
115 |
aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
14626277 |
aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
14626179 |
T |
 |
| Q |
215 |
caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
14626178 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaattcaaacaacatttgagaatttgtaaagtga |
14626079 |
T |
 |
| Q |
315 |
tgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14626078 |
agatgattgtgataataactaacccc |
14626053 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650105
Alignment:
| Q |
15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac |
114 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
1650352 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
1650253 |
T |
 |
| Q |
115 |
aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
214 |
Q |
| |
|
| ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
1650252 |
cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
1650154 |
T |
 |
| Q |
215 |
caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1650153 |
caattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagca |
1650105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657748
Alignment:
| Q |
22 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
1657999 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact |
1657901 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
|
||| | |||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
1657900 |
tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
1657802 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1657801 |
tgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
1657748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009439
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| | || || | || | |
|
|
| T |
35009702 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
35009603 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
35009602 |
caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
35009504 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35009503 |
tcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
35009439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862734
Alignment:
| Q |
22 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| || || ||||||| | | |||||||||||| ||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
15862484 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact |
15862581 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
|
||| | |||| || | || |||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
15862582 |
tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
15862680 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
15862681 |
tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat |
15862734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 280 - 340
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148326
Alignment:
| Q |
280 |
aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23148266 |
aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccc |
23148326 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 275
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666137
Alignment:
| Q |
79 |
aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat |
177 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| | |||| | ||||||||||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||||| ||||| |||||| | | |
|
|
| T |
29665941 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt |
29666038 |
T |
 |
| Q |
178 |
gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||| || |||||| || || | ||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
29666039 |
gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccat |
29666137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751688
Alignment:
| Q |
190 |
tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
27751603 |
tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat |
27751688 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Original strand, 29605612 - 29605696
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| Q |
175 |
tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||| || |||||||||||| |
|
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29605612 |
tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt |
29605696 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
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| Q |
177 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||| |||||||| || |||| || |||||||||||| |
|
|
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18629691 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
18629608 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17083282 - 17083200
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| Q |
175 |
tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaat |
257 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||| || || |||||||||||| |||||||| || |||| || |||||||||| |
|
|
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17083282 |
tatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
17083200 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 258
Target Start/End: Original strand, 18399144 - 18399184
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| Q |
218 |
ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt |
258 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
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18399144 |
ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
18399184 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426880
Alignment:
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110 |
Q |
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|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25426628 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
25426727 |
T |
 |
| Q |
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taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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|
| T |
25426728 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
25426827 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25426828 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
25426880 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12626
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12374 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
12473 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12474 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
12573 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12574 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
12626 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500151
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11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19499899 |
catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
19499998 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19499999 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
19500098 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19500099 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
19500151 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366481
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22366733 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat |
22366634 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22366633 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
22366534 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22366533 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
22366481 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18777995
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18778244 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
18778145 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
18778144 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
18778045 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattta |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
18778044 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
18777995 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073595
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21073847 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
21073748 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21073747 |
taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
21073648 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21073647 |
acatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
21073595 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507293
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
23506965 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
23507064 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
23507065 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
23507163 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23507164 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaatcttacaaa |
23507263 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23507264 |
atggagatgattatgataaagactaacccc |
23507293 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443398
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
43443647 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat |
43443548 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43443547 |
caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
43443448 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattta |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
43443447 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta |
43443398 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4199985
Alignment:
| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4200237 |
catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
4200138 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4200137 |
caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
4200038 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4200037 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca |
4199985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182480
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27182810 |
catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
27182711 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |
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|
| T |
27182710 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaatta |
27182612 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27182611 |
tcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
27182512 |
T |
 |
| Q |
309 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27182511 |
aaatgatgatgattatgatgaagactaacccc |
27182480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010089
Alignment:
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110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
27009841 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | |||||| | |
|
|
| T |
27009941 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca |
27010040 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
27010041 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
27010089 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053762
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Q |
| |
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|
| T |
22054096 |
catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
22053997 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22053996 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
22053898 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || |
|
|
| T |
22053897 |
tcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaatttca |
22053798 |
T |
 |
| Q |
309 |
aa----atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22053797 |
aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccc |
22053762 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18530997
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
18531330 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
18531231 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || | |||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
18531230 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
18531132 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-attcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||| ||||||||||| || || |
|
|
| T |
18531131 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaacattcataccacatttgaaaaattgca |
18531032 |
T |
 |
| Q |
309 |
aaatgatgat---gattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18531031 |
aaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccc |
18530997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188284
Alignment:
| Q |
63 |
atcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttat |
162 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| ||||||| |
|
|
| T |
29188483 |
atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat |
29188385 |
T |
 |
| Q |
163 |
catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagc |
262 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
29188384 |
catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc |
29188285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939540
Alignment:
| Q |
22 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |
|
|
| T |
34939289 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaatgact |
34939387 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
|
||| | |||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
34939388 |
tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
34939486 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
34939487 |
tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat |
34939540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623232
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20623085 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
20623184 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20623185 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
20623232 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233528
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21233675 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
21233576 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21233575 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
21233528 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900408
Alignment:
| Q |
129 |
aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac |
228 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25900552 |
aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac |
25900453 |
T |
 |
| Q |
229 |
aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc |
273 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25900452 |
aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc |
25900408 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536460
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
16536313 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata |
16536412 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16536413 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
16536460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37053007
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37052860 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
37052959 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37052960 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
37053007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Original strand, 29918127 - 29918212
Alignment:
| Q |
175 |
tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||| || |||||||| |||| || |||||||| || |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29918127 |
tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt |
29918212 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Original strand, 32950862 - 32950951
Alignment:
| Q |
179 |
aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||| || || || |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
32950862 |
aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat |
32950951 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190482
Alignment:
| Q |
15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa |
55 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29190522 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa |
29190482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21310792 - 21310709
Alignment:
| Q |
177 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||| || || ||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21310792 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
21310709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5450926 - 5450844
Alignment:
| Q |
177 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt |
258 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
5450926 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt |
5450844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 17471844 - 17471803
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat |
52 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17471844 |
catcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcat |
17471803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 258
Target Start/End: Original strand, 16595713 - 16595753
Alignment:
| Q |
218 |
ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt |
258 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16595713 |
ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
16595753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886661
Alignment:
| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19886913 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
19886814 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19886813 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
19886714 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19886713 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
19886661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 340
Target Start/End: Original strand, 462743 - 463066
Alignment:
| Q |
16 |
tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca |
115 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
462743 |
tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca |
462842 |
T |
 |
| Q |
116 |
acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc |
215 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
462843 |
acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc |
462941 |
T |
 |
| Q |
216 |
aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
462942 |
aattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat |
463041 |
T |
 |
| Q |
316 |
gatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
463042 |
gatgattatgataaagactaacccc |
463066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891572
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8891242 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
8891341 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |
|
|
| T |
8891342 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaatta |
8891440 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
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| T |
8891441 |
tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
8891540 |
T |
 |
| Q |
309 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8891541 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
8891572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627247
Alignment:
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110 |
Q |
| |
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| T |
20627576 |
catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat |
20627477 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
20627476 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
20627378 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-tttacaa |
309 |
Q |
| |
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| T |
20627377 |
tcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataatcataattcatacaatatttgaaaattttacaa |
20627278 |
T |
 |
| Q |
310 |
aatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
20627277 |
aatgatgatgattatgataaagactaacccc |
20627247 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982373
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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| T |
36982704 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
36982604 |
caacaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaatta |
36982506 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- |
307 |
Q |
| |
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|
| T |
36982505 |
tcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
36982406 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
36982405 |
aaaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
36982373 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396653
Alignment:
| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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| T |
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catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
17396817 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
17396816 |
taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
17396717 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
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| T |
17396716 |
tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
17396653 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794638
Alignment:
| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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| T |
19794967 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt |
19794868 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
19794867 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
19794769 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
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| T |
19794768 |
ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttg-aaatttaca |
19794670 |
T |
 |
| Q |
309 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
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| T |
19794669 |
aaataatgatgattatgatgaagactaacccc |
19794638 |
T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642892
Alignment:
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110 |
Q |
| |
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|
|
| T |
43643220 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat |
43643121 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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||| ||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
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|
| T |
43643120 |
taataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
43643022 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
43643021 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca |
43642922 |
T |
 |
| Q |
309 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacc |
338 |
Q |
| |
|
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| T |
43642921 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacc |
43642892 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341318
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110 |
Q |
| |
|
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|
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catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
24341552 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaatta |
24341454 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24341453 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca |
24341354 |
T |
 |
| Q |
309 |
aa----atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
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| T |
24341353 |
aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265390
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110 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| | || || | || | |
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|
| T |
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catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
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|
| T |
25265553 |
caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
25265455 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25265454 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
25265390 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
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Q |
| |
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|
| T |
7508107 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaa- |
7508009 |
T |
 |
| Q |
110 |
ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| || | |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |
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| T |
7508008 |
ttaacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
7507910 |
T |
 |
| Q |
210 |
aacatcaattcatgca |
225 |
Q |
| |
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| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7507909 |
atcatcaattcatgca |
7507894 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
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Q |
| |
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||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
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|
| T |
19689548 |
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T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
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Q |
| |
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|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
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227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
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|
| T |
23820187 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
23820286 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23820287 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
23820334 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
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227 |
Q |
| |
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||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
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|
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aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
14906488 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14906487 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
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Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| | |||| || |||||||||||||| |
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|
| T |
20015127 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg |
20015226 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
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Q |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22775288 - 22775206
Alignment:
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177 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt |
258 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||| || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22775288 |
tgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22775206 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22780666 - 22780584
Alignment:
| Q |
177 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt |
258 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||| || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22780666 |
tgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22780584 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 179 - 258
Target Start/End: Original strand, 43646059 - 43646139
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179 |
aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt |
258 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| || ||| || || ||| ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
43646059 |
aacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaatt |
43646139 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
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Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357906
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Q |
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catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
47357754 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
47357853 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
47357854 |
acatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
47357906 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246760
Alignment:
| Q |
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110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13246430 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
13246529 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
13246530 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
13246628 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13246629 |
tcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
13246728 |
T |
 |
| Q |
309 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13246729 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
13246760 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644467
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10644219 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
10644318 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
10644319 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
10644418 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
10644419 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
10644467 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118177
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
54118507 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc |
54118408 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
54118407 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
54118309 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
54118308 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca |
54118209 |
T |
 |
| Q |
309 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
54118208 |
aaataatgatgattatgatgaagactaacccc |
54118177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 111 - 336
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122213
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| Q |
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taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
121989 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
122087 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
122088 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
122187 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgatgatgattatgataaagactaa |
336 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
122188 |
atgatgatgattatgataaagactaa |
122213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048221
Alignment:
| Q |
19 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
13048477 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca |
13048378 |
T |
 |
| Q |
119 |
acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |
|
|
| T |
13048377 |
acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa |
13048278 |
T |
 |
| Q |
219 |
tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13048277 |
tcatgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat |
13048221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675018
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
15675352 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
15675253 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
15675252 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
15675154 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || |
|
|
| T |
15675153 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca |
15675054 |
T |
 |
| Q |
309 |
aa----atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15675053 |
aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccc |
15675018 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104179
Alignment:
| Q |
79 |
aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatg |
178 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| || |
|
|
| T |
10104445 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg |
10104347 |
T |
 |
| Q |
179 |
aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--ta |
276 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
10104346 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaatta |
10104247 |
T |
 |
| Q |
277 |
atcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10104246 |
tgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680463
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
26680201 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
26680300 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
26680301 |
caactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
26680398 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26680399 |
ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
26680463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115865
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
31115629 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
31115728 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
31115729 |
caacaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
31115827 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttgg |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
31115828 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
31115865 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488825
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10488678 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
10488777 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10488778 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
10488825 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327926
Alignment:
| Q |
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aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16328073 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
16327974 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16327973 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
16327926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 340
Target Start/End: Original strand, 33240900 - 33241034
Alignment:
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212 |
catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
33240900 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaa |
33240999 |
T |
 |
| Q |
310 |
a----atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33241000 |
aaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccc |
33241034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111492
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa |
108 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
111395 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa |
111492 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
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Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885570
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79 |
aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat |
177 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||| ||||||| | || |||||| || |||| ||| |||||||||| ||||| | |||| | | |
|
|
| T |
40885749 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagca-aagttcaccaattgagcataat-ttcataacttgacatttatacatacttt |
40885652 |
T |
 |
| Q |
178 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
40885651 |
gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt |
40885570 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
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Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132648
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| Q |
243 |
agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa |
336 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31132545 |
agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgataattatgatgaagactaa |
31132644 |
T |
 |
| Q |
337 |
cccc |
340 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
31132645 |
cccc |
31132648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
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Target Start/End: Original strand, 15044992 - 15045074
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| Q |
177 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt |
258 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15044992 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
15045074 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
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11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa |
55 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10104494 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa |
10104450 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15109432 - 15109350
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| Q |
177 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt |
258 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
15109432 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt |
15109350 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:
Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3517
Alignment:
| Q |
13 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
3843 |
tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
3744 |
T |
 |
| Q |
113 |
acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
3743 |
acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
3645 |
T |
 |
| Q |
213 |
atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat |
312 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3644 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataatcaaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaat |
3545 |
T |
 |
| Q |
313 |
gatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3544 |
gaagatgattatgacaaagactaacccc |
3517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1453
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
1124 |
catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
1223 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
1224 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
1322 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaa |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1323 |
ttatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa |
1422 |
T |
 |
| Q |
310 |
aatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1423 |
aatgatgatgattatgataaagactaacccc |
1453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842496
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
14842824 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
14842725 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
14842724 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaatta |
14842626 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
310 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
14842625 |
tcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa |
14842526 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14842525 |
gtgaagatgattatgataaagactaacccc |
14842496 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316471
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |
|
|
| T |
55316219 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
55316318 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
55316319 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
55316418 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
55316419 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
55316471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270327
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |
|
|
| T |
41270075 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
41270174 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41270175 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta |
41270274 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
41270275 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
41270327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050138
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||| |
|
|
| T |
2049810 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat |
2049909 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
2049910 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
2050008 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
2050009 |
tcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattgatacaacatttgaaatttcacaaa |
2050108 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2050109 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
2050138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030082
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
12030410 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat |
12030311 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | ||||||||| || ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
12030310 |
taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
12030212 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
310 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12030211 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaa |
12030112 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
12030111 |
atgatgatgattatgataatgattaacccc |
12030082 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 340
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839223
Alignment:
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22 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
13838905 |
catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
13839004 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
13839005 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca |
13839103 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13839104 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatga |
13839203 |
T |
 |
| Q |
321 |
ttatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13839204 |
ttatgatgaagactaacccc |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821366
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11 |
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110 |
Q |
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| T |
16821139 |
catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
16821238 |
T |
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| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
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| T |
16821239 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
16821338 |
T |
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| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||||||||||| |
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| T |
16821339 |
tcatcaatttatgcatacaaacataaca |
16821366 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975722
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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| T |
13975985 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
13975886 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
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| T |
13975885 |
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13975786 |
T |
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| Q |
211 |
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275 |
Q |
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| T |
13975785 |
tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
13975722 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15858986
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
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| T |
15859287 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt |
15859188 |
T |
 |
| Q |
111 |
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210 |
Q |
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| T |
15859187 |
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15859089 |
T |
 |
| Q |
211 |
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308 |
Q |
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| T |
15859088 |
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15858990 |
T |
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| Q |
309 |
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312 |
Q |
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|||| |
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| T |
15858989 |
aaat |
15858986 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861068
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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| T |
45860805 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
45860904 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
45860905 |
taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca |
45861004 |
T |
 |
| Q |
211 |
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275 |
Q |
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| T |
45861005 |
tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
45861068 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158008
Alignment:
| Q |
10 |
acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa |
109 |
Q |
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| T |
51158282 |
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51158183 |
T |
 |
| Q |
110 |
ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
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| T |
51158182 |
ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
51158084 |
T |
 |
| Q |
210 |
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285 |
Q |
| |
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| T |
51158083 |
atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaatt |
51158008 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954890
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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| T |
13955153 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
13955054 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
13955053 |
taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca |
13954954 |
T |
 |
| Q |
211 |
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275 |
Q |
| |
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| T |
13954953 |
tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
13954890 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936634
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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| T |
15936890 |
catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
15936791 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
15936790 |
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15936692 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat |
268 |
Q |
| |
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| T |
15936691 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat |
15936634 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744052
Alignment:
| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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|
| T |
16744377 |
catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
16744278 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
16744277 |
caactataacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacactta |
16744180 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
310 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16744179 |
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16744080 |
T |
 |
| Q |
311 |
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338 |
Q |
| |
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||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16744079 |
atgatgatgattatggtaaagactaacc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938476
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catcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaa |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
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catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa |
15938630 |
T |
 |
| Q |
114 |
caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca |
213 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15938629 |
caacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
15938531 |
T |
 |
| Q |
214 |
tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat |
268 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15938530 |
tcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat |
15938476 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 263
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615085
Alignment:
| Q |
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atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac |
114 |
Q |
| |
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| T |
15614838 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac |
15614937 |
T |
 |
| Q |
115 |
aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
214 |
Q |
| |
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| T |
15614938 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat |
15615036 |
T |
 |
| Q |
215 |
caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
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|
| T |
15615037 |
caattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagca |
15615085 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912483
Alignment:
| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |
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|
| T |
17912744 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt |
17912645 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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||| ||||| || | |||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| || |
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|
| T |
17912644 |
caactacaacatatca--aattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
17912547 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17912546 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
17912483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 229 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260758
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229 |
aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata |
328 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19260869 |
aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata |
19260770 |
T |
 |
| Q |
329 |
aagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
19260769 |
aagactaacccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 340
Target Start/End: Original strand, 19231981 - 19232112
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212 |
catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattt-aca |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
| T |
19231981 |
catcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcaca |
19232080 |
T |
 |
| Q |
309 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19232081 |
aaatgatgatgattaagataaagactaacccc |
19232112 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449238
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128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
2449385 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
2449286 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
2449285 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984763
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
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|||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
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|
| T |
47984650 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
47984749 |
T |
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| Q |
111 |
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124 |
Q |
| |
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| T |
47984750 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994050
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| Q |
11 |
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110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
47993937 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
47994036 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttag |
124 |
Q |
| |
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|
|
| T |
47994037 |
caacaacaacttag |
47994050 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 11 - 124
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
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| T |
48003224 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
48003323 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttag |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
48003324 |
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48003337 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012623
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
48012510 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
48012609 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttag |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
48012610 |
caacaacaacttag |
48012623 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11986262 - 11986173
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| Q |
179 |
aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||| |||||| || ||| || ||||||| || || |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11986262 |
aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat |
11986173 |
T |
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Target: chr3; HSP #26
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Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
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| Q |
218 |
ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14080715 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
14080756 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468555
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat |
52 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15468596 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcat |
15468555 |
T |
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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4145898 - 4145814
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| Q |
175 |
tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| || ||| || || ||||||||| || |||||||| || |||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
4145898 |
tatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaattt |
4145814 |
T |
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Target: chr3; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Original strand, 30207380 - 30207462
Alignment:
| Q |
177 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt |
258 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||| || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30207380 |
tgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
30207462 |
T |
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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6228710 - 6228625
Alignment:
| Q |
175 |
tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||| |||||| || |||||||| || |||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
6228710 |
tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt |
6228625 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Original strand, 22275209 - 22275250
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat |
52 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
22275209 |
catcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcat |
22275250 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14059254 - 14059214
Alignment:
| Q |
218 |
ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt |
258 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14059254 |
ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
14059214 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989661
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10989410 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
10989509 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10989510 |
ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
10989608 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10989609 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
10989661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437710
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
2437457 |
catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat |
2437556 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2437557 |
taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
2437656 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa |
264 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2437657 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa |
2437710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 340
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16212094
Alignment:
| Q |
13 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta |
112 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
16211768 |
tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta |
16211867 |
T |
 |
| Q |
113 |
acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| || | |
|
|
| T |
16211868 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatc |
16211966 |
T |
 |
| Q |
213 |
atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat |
312 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
16211967 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaat |
16212066 |
T |
 |
| Q |
313 |
gatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16212067 |
gatgatgattatgataaagactaacccc |
16212094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060294
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3059966 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
3060065 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| || |
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|
| T |
3060066 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta |
3060164 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3060165 |
tcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaa |
3060264 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3060265 |
atgatgatgattatgataaagacttacccc |
3060294 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13911024
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13911277 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
13911178 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
13911177 |
caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
13911078 |
T |
 |
| Q |
210 |
aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13911077 |
aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca |
13911024 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13036947
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13037277 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc |
13037178 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| || |
|
|
| T |
13037177 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaatta |
13037079 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13037078 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
13036979 |
T |
 |
| Q |
309 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
13036978 |
aaatgatgatgattatggtgaagactaacccc |
13036947 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13572924
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
13572676 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
13572775 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | |||| | |
|
|
| T |
13572776 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca |
13572875 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
13572876 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
13572924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580674
Alignment:
| Q |
16 |
tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca |
115 |
Q |
| |
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| T |
11580997 |
tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca |
11580898 |
T |
 |
| Q |
116 |
acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc |
215 |
Q |
| |
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| T |
11580897 |
acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
11580799 |
T |
 |
| Q |
216 |
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311 |
Q |
| |
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| T |
11580798 |
aattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattatgcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaa |
11580699 |
T |
 |
| Q |
312 |
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336 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11580698 |
tgatgatgattatgataaagactaa |
11580674 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36052994
Alignment:
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11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
36052667 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
36052766 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
36052767 |
taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataatta |
36052862 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
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| T |
36052863 |
tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca |
36052962 |
T |
 |
| Q |
309 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36052963 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
36052994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253842
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
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catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
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| T |
18253998 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
18253900 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18253899 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat |
18253842 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292338
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| Q |
17 |
caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa |
116 |
Q |
| |
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|
| T |
25292595 |
caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga |
25292496 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca |
216 |
Q |
| |
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|||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | || || |
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| T |
25292495 |
caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca |
25292397 |
T |
 |
| Q |
217 |
attcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25292396 |
attcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat |
25292338 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481031
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| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |
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|
| T |
47481294 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt |
47481195 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
47481194 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
47481096 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47481095 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
47481031 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478987
Alignment:
| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
16479213 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat |
16479114 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||| || |||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
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|
| T |
16479113 |
taaaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
16479015 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16479014 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
16478987 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293279
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| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | |
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|
| T |
7293017 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
7293116 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||| | | ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
7293117 |
caacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
7293214 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7293215 |
ttattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
7293279 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321278
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
13321014 |
catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
13321113 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaa-caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaattatacaa |
207 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13321114 |
caacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa |
13321211 |
T |
 |
| Q |
208 |
ctaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca |
274 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13321212 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca |
13321278 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516490
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Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11516343 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
11516442 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11516443 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
11516490 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441564
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aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15441711 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
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T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15441611 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
15441564 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262129
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aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
30262276 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
30262177 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
30262176 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
30262129 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 295900
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ataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcac |
253 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||| | | || || ||| |
|
|
| T |
296087 |
ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacac |
295988 |
T |
 |
| Q |
254 |
gaatttagcaacaatcatccataat-caaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
295987 |
gaatttagcaacaattattcattatgcaaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccc |
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T |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #20
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
36024372 |
agttggagcacgaatttagaaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaa |
36024471 |
T |
 |
| Q |
337 |
cccc |
340 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
36024472 |
cccc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
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tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt |
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||| |||||||| || |||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
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tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
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T |
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|
|||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
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agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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agttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
14423639 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193651
Alignment:
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10 |
acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa |
109 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
16193980 |
acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa |
16193881 |
T |
 |
| Q |
110 |
ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
| |
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|||||||||| || | | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | |
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|
| T |
16193880 |
ttaacaacaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatt |
16193782 |
T |
 |
| Q |
210 |
aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa |
309 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
16193781 |
atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaattcatacaatatttgaaaatttacca |
16193682 |
T |
 |
| Q |
310 |
aatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16193681 |
aatgatgatgattatgataaagactaacccc |
16193651 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30120974
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
30120722 |
catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
30120821 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30120822 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
30120921 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30120922 |
acataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
30120974 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222753
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
222943 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
222844 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
222843 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
222753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736376
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
736566 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
736467 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
201 |
Q |
| |
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|
|
| T |
736466 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
736376 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860271
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
860461 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
860362 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
860361 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
860271 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674392
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |
|
|
| T |
16674644 |
catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
16674545 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
16674544 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
16674445 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16674444 |
acataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca |
16674392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373401
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
43373731 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
43373632 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
43373631 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataatta |
43373533 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43373532 |
tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca |
43373433 |
T |
 |
| Q |
309 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43373432 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
43373401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928725
Alignment:
| Q |
22 |
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121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
24929043 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact |
24928944 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
24928943 |
tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
24928845 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24928844 |
tgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatga |
24928745 |
T |
 |
| Q |
321 |
ttatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24928744 |
ttatgataaagactaacccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844576
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21844824 |
catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat |
21844725 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
21844724 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
21844625 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
21844624 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
21844576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851969
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21852217 |
catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat |
21852118 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
21852117 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca |
21852018 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
21852017 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
21851969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16404909
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| | |
|
|
| T |
16405235 |
catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt |
16405136 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||| |||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
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|
| T |
16405135 |
taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
16405040 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16405039 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac- |
16404941 |
T |
 |
| Q |
309 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16404940 |
aaataatgatgattatgatgaagactaacccc |
16404909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774258
Alignment:
| Q |
15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac |
114 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
6774505 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
6774406 |
T |
 |
| Q |
115 |
aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
214 |
Q |
| |
|
|| ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
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|
| T |
6774405 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
6774307 |
T |
 |
| Q |
215 |
caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| |
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|
| T |
6774306 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca |
6774258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 263
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549233
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15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac |
114 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||| |
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|
| T |
24548986 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac |
24549085 |
T |
 |
| Q |
115 |
aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
214 |
Q |
| |
|
|| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
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|
| T |
24549086 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
24549184 |
T |
 |
| Q |
215 |
caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| |
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|
| T |
24549185 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca |
24549233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907214
Alignment:
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Q |
| |
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|
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22907476 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
22907377 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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||| ||||| | | ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || |
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|
| T |
22907376 |
caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
22907279 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22907278 |
ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
22907214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345832
Alignment:
| Q |
22 |
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121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
17345581 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact |
17345679 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
|
||| | |||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
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|
| T |
17345680 |
tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
17345778 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
17345779 |
tgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat |
17345832 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238350
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
5238203 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
5238302 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5238303 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
5238350 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661248
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24661395 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
24661296 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24661295 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
24661248 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685809
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
43685662 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
43685761 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
43685762 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
43685809 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
| Q |
139 |
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201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
691970 |
tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
691908 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 259
Target Start/End: Original strand, 26011658 - 26011741
Alignment:
| Q |
177 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||| ||||||||| |||||||| || |||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
26011658 |
tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
26011741 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48926
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48598 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
48697 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
48698 |
tagcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
48796 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48797 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
48896 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48897 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
48926 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36320
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36093 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat |
36192 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36193 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
36292 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
36293 |
acatcaattcatacatacaaacataaca |
36320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931673
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
20931345 |
catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
20931444 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
20931445 |
taacaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
20931543 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
20931544 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaa |
20931643 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20931644 |
atgaggatgattatgataaaggctaacccc |
20931673 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394550
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
41394222 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca |
41394321 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
41394322 |
taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaatta |
41394420 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41394421 |
tcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
41394520 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41394521 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
41394550 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072388
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |
|
|
| T |
5072640 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
5072541 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5072540 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
5072441 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5072440 |
acatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
5072388 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601118
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |
|
|
| T |
18601370 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
18601271 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18601270 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
18601171 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18601170 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagca |
18601118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913358
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20913037 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aat |
20913129 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
20913130 |
taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
20913228 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
20913229 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaagcaaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaa |
20913328 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20913329 |
atgaggatgattacgataaagactaacccc |
20913358 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893560
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
20893889 |
catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc |
20893790 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |
|
|
| T |
20893789 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaatta |
20893691 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20893690 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaa-ttaca |
20893592 |
T |
 |
| Q |
309 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20893591 |
aaatgatgatgattatgatgaagactaacccc |
20893560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844383
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37844714 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
37844615 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||| || ||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |||||| | |
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| T |
37844614 |
taacaacaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
37844516 |
T |
 |
| Q |
210 |
aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac |
307 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |
|
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| T |
37844515 |
atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcac |
37844416 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
37844415 |
aaaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
37844383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 337
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20446007
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | |
|
|
| T |
20445679 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt |
20445778 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20445779 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
20445877 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattt-ac |
307 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20445878 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcac |
20445977 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaaatgatgatgattatgataaagactaac |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20445978 |
aaaatgatgatgattatgataaagactaac |
20446007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 336
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531770
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | |
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|
| T |
20531444 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt |
20531543 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
20531544 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
20531642 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
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| T |
20531643 |
tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca |
20531742 |
T |
 |
| Q |
309 |
aaatgatgatgattatgataaagactaa |
336 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20531743 |
aaatgatgatgattatgataaagactaa |
20531770 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228061
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| Q |
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110 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
22227908 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |
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|
| T |
22227909 |
taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
22228007 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa |
264 |
Q |
| |
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|||||||||||||| | || |||||| || || ||||||||||||||||| |
|
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| T |
22228008 |
tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
22228061 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232758
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
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|
| T |
22232506 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
22232605 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
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|
| T |
22232606 |
taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
22232704 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa |
264 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || |||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22232705 |
tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
22232758 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 263
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116506
Alignment:
| Q |
15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcaaattaa |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
2116258 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa |
2116357 |
T |
 |
| Q |
114 |
caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca |
213 |
Q |
| |
|
||| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
2116358 |
caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
2116456 |
T |
 |
| Q |
214 |
tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2116457 |
tcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagca |
2116506 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 263
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051674
Alignment:
| Q |
77 |
ataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata |
176 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45051489 |
ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt |
45051587 |
T |
 |
| Q |
177 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
45051588 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagca |
45051674 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452755
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
51452608 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
51452707 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
51452708 |
caaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat |
51452755 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 258
Target Start/End: Original strand, 16646118 - 16646158
Alignment:
| Q |
218 |
ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt |
258 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16646118 |
ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
16646158 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Original strand, 45051446 - 45051486
Alignment:
| Q |
15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa |
55 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
45051446 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaa |
45051486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 5999
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
6326 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t |
6228 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
6227 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
6129 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
6128 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa |
6029 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6028 |
gtgaaaatgattatgataaagactaacccc |
5999 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0175 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:
Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 891
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||||| | |
|
|
| T |
1218 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaa-t |
1120 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| | || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
1119 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
1021 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
1020 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgtaaa |
921 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
920 |
gtgaagatgattatgataaagactaacccc |
891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:
Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9206
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
8878 |
catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
8977 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
8978 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
9076 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
310 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9077 |
tcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataagcaaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaa |
9176 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9177 |
atgaagatgattatgataaagactaacccc |
9206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12441
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
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Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
12115 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt |
12214 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
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| T |
12215 |
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12311 |
T |
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| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaa |
309 |
Q |
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| T |
12312 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaatttcatacagcatttg-aaagttacaa |
12410 |
T |
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| Q |
310 |
aatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
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| T |
12411 |
aattaagatgattatgataaagactaacccc |
12441 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
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Target Start/End: Original strand, 42997 - 43224
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
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| T |
42997 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat |
43096 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
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| T |
43097 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
43196 |
T |
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| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
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| T |
43197 |
tcatcaattcatgcatagaaacataaca |
43224 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 340
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172233
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22 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
121 |
Q |
| |
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| T |
171916 |
catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact |
172015 |
T |
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| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
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| T |
172016 |
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172114 |
T |
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| Q |
222 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat |
321 |
Q |
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| T |
172115 |
tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat |
172214 |
T |
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| Q |
322 |
tatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
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| T |
172215 |
tatgataaagactaacccc |
172233 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 340
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177936
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catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
121 |
Q |
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| T |
177619 |
catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact |
177718 |
T |
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| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
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| T |
177719 |
tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca |
177817 |
T |
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| Q |
222 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat |
321 |
Q |
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| T |
177818 |
tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat |
177917 |
T |
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| Q |
322 |
tatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
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| T |
177918 |
tatgataaagactaacccc |
177936 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0218 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
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Target: scaffold0218; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 4996
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Q |
| |
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| T |
5324 |
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5225 |
T |
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| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
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| T |
5224 |
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5126 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatttacaa |
309 |
Q |
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| T |
5125 |
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5026 |
T |
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| Q |
310 |
aatgatgatgattatgataaagactaaccc |
339 |
Q |
| |
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| T |
5025 |
aatgataatgattatgataaagactaaccc |
4996 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19537
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110 |
Q |
| |
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| T |
19206 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt |
19305 |
T |
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| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
19306 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
19404 |
T |
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| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- |
307 |
Q |
| |
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| T |
19405 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
19504 |
T |
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| Q |
308 |
aaaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||||| |
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| T |
19505 |
aaaattatgatgattatgatgaagactaacccc |
19537 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21553
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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| T |
21290 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt |
21389 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
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| T |
21390 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
21488 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21489 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
21553 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0106 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:
Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Original strand, 41733 - 42057
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atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac |
114 |
Q |
| |
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| T |
41733 |
atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac |
41832 |
T |
 |
| Q |
115 |
aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
214 |
Q |
| |
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| T |
41833 |
aacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcat |
41931 |
T |
 |
| Q |
215 |
caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga |
314 |
Q |
| |
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|
| T |
41932 |
caattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga |
42031 |
T |
 |
| Q |
315 |
tgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
42032 |
tgatgattatgataaagaccaacccc |
42057 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247375
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22 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
121 |
Q |
| |
|
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| T |
247694 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
247595 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
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| T |
247594 |
tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca |
247496 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
319 |
Q |
| |
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| T |
247495 |
tgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
247396 |
T |
 |
| Q |
320 |
attatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
247395 |
attatgataaagactaacccc |
247375 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
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Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37176 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc |
37077 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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|
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| T |
37076 |
caaccacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaatta |
36978 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
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|
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| T |
36977 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca |
36878 |
T |
 |
| Q |
309 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36877 |
aaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
36846 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26349
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| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26678 |
catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc |
26579 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
26578 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaatta |
26480 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatttacaa |
309 |
Q |
| |
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| T |
26479 |
tcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa |
26380 |
T |
 |
| Q |
310 |
aatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26379 |
aatgatcatgattatgataaagactaacccc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8180
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Q |
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aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata |
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T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
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Q |
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8227 |
caaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
8180 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0772 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:
Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 268
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5785
Alignment:
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35 |
acccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattca |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5552 |
acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca |
5651 |
T |
 |
| Q |
135 |
cccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat |
234 |
Q |
| |
|
|| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5652 |
ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat |
5751 |
T |
 |
| Q |
235 |
aacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat |
268 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5752 |
aacatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat |
5785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128104
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
128431 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaa-t |
128333 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||| || || |||||||| |||| |||||| || ||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
128332 |
taacaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
128234 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
128233 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaa |
128134 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
128133 |
atgaagatgattatgataaagactaacccc |
128104 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31700
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31928 |
catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
31829 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31828 |
caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact |
31729 |
T |
 |
| Q |
210 |
aacatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31728 |
aacatcaattcatgcattcaaacataaca |
31700 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 35 - 283
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
35 |
catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
134 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
135 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
234 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
235 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123096
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
123427 |
catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc |
123328 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
123327 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
123229 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
123228 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgcaaatttaca |
123129 |
T |
 |
| Q |
308 |
aaaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
123128 |
aaaattatgatgattatggtgaagactaacccc |
123096 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 340
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272353
Alignment:
| Q |
17 |
caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa |
116 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| | |
|
|
| T |
272031 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca |
272130 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||| |
|
|
| T |
272131 |
caacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatca |
272229 |
T |
 |
| Q |
217 |
attcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatg |
316 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
272230 |
attcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatg |
272329 |
T |
 |
| Q |
317 |
atgattatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
272330 |
atgattatgataaagactaacccc |
272353 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48443
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
48187 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
48286 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
48287 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
48385 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48386 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat |
48443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64527
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
64780 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
64681 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
64680 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
64581 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatc-----aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
64580 |
tcatcaatataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
64527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Original strand, 107747 - 108003
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
107747 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
107846 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
107847 |
taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
107945 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
107946 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat |
108003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
| Q |
218 |
ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattta |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89905 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
89863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:
Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21115
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
21367 |
catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat |
21268 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || || |
|
|
| T |
21267 |
taacaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataatta |
21169 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa |
264 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21168 |
tcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa |
21115 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 14086
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
14312 |
catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat |
14213 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || || |
|
|
| T |
14212 |
tatcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataatta |
14114 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14113 |
tcatcaattcatgcatacagacataaca |
14086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 301
Target Start/End: Original strand, 148721 - 149012
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
148721 |
catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
148820 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
148821 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
148919 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa |
301 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
148920 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa |
149012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 337
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9180
Alignment:
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11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
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Q |
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| T |
8849 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt |
8948 |
T |
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| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
8949 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
9047 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
308 |
Q |
| |
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| T |
9048 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaatacataccacatttgaaaaattgca |
9147 |
T |
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| Q |
309 |
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337 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
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| T |
9148 |
aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaac |
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Q |
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agcatgaatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccc |
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T |
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Target: scaffold0018; HSP #1
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Q |
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T |
 |
| Q |
229 |
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328 |
Q |
| |
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||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata |
51129 |
T |
 |
| Q |
329 |
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336 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
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| T |
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aagactaa |
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T |
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Target: scaffold0022; HSP #1
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110 |
Q |
| |
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|
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catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
5368 |
T |
 |
| Q |
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210 |
Q |
| |
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| T |
5367 |
taacaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
5269 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgca |
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Q |
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|||||||||||||| |
|
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5268 |
tcatcaattcatgca |
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T |
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Target: scaffold0369; HSP #1
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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| T |
3722 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatca-tttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
| |
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| T |
3822 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
3920 |
T |
 |
| Q |
210 |
aacatcaattcatgca |
225 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |
|
|
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3921 |
atcatcaattcatgca |
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T |
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atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac |
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Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |
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9497 |
T |
 |
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214 |
Q |
| |
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|| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
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| T |
9496 |
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9398 |
T |
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| Q |
215 |
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238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
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caattcatgcatacaaacataaca |
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Target: scaffold0215; HSP #2
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atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
16494 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
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T |
 |
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115 |
aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
214 |
Q |
| |
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|| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
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| T |
16394 |
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16296 |
T |
 |
| Q |
215 |
caattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
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16295 |
caattcatgcatacaaacataaca |
16272 |
T |
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Target: scaffold0028; HSP #1
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aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |
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|
| T |
89600 |
aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac |
89501 |
T |
 |
| Q |
229 |
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326 |
Q |
| |
|
||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
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| T |
89500 |
aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatga |
89401 |
T |
 |
| Q |
327 |
taaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |
|
|
| T |
89400 |
tgaagactaacccc |
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Q |
| |
|
|||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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107835 |
catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat |
107736 |
T |
 |
| Q |
322 |
tatgataaagactaacccc |
340 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
107735 |
catgatgaagactaacccc |
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T |
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Target: scaffold1711; HSP #1
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Q |
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|
|||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1450 |
caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca |
1351 |
T |
 |
| Q |
217 |
attcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1350 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
1304 |
T |
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Target: scaffold1542; HSP #1
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || || |||||||||| || ||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
797 |
catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc |
698 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | ||||||||| || || ||||| |||| |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
697 |
taacagtaacttagca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
599 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
598 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
534 |
T |
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Target: scaffold0075; HSP #1
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| || || || |||||| | ||||| |
|
|
| T |
34724 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat |
34625 |
T |
 |
| Q |
110 |
ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | ||||||||| || || ||||| |||| ||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
34624 |
tcaacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
34526 |
T |
 |
| Q |
210 |
aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
34525 |
atcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat |
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T |
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Target: scaffold0078 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
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Target: scaffold0078; HSP #1
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
37328 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc |
37229 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||| ||||| | | ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
37228 |
caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
37131 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37130 |
ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
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T |
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Target: scaffold0125 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
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Target: scaffold0125; HSP #1
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
41648 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
41747 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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||||||||| ||| | ||||||||| || | |||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
41748 |
caacaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
41846 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
41847 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat |
41911 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Name: scaffold0529
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Target: scaffold0529; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 2966 - 3215
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atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaattaa |
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Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| || || || |||||| | ||||| | || |
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| T |
2966 |
atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa |
3065 |
T |
 |
| Q |
114 |
caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca |
213 |
Q |
| |
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| T |
3066 |
caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
3164 |
T |
 |
| Q |
214 |
tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa |
264 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3165 |
tcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
3215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 13506 - 13769
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| | || || | || | |
|
|
| T |
13506 |
catcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
13605 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||||||| | || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
13606 |
caacaacaacatagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
13704 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13705 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
13769 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:
Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 9
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
115 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat |
16 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaac |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
15 |
taacaac |
9 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:
Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48620
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
48514 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat |
48613 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaac |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
48614 |
taacaac |
48620 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0420 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:
Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13480 - 13325
Alignment:
| Q |
107 |
aaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13480 |
aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
13382 |
T |
 |
| Q |
207 |
actaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca |
263 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13381 |
attatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagca |
13325 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:
Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27058
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26911 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
27010 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27011 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
27058 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 268
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22796
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22656 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
22755 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat |
268 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22756 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat |
22796 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1582
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1729 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
1630 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1629 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
1582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:
Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9479
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9382 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa |
9479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0361 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:
Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 275
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3453
Alignment:
| Q |
182 |
atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
3360 |
atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat |
3453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Original strand, 3210 - 3264
Alignment:
| Q |
13 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaa |
67 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
3210 |
tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaa |
3264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:
Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 56195 - 56106
Alignment:
| Q |
179 |
aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| ||||||| || || |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
56195 |
aacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat |
56106 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:
Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 259
Target Start/End: Original strand, 8174 - 8257
Alignment:
| Q |
177 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||| || ||| || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8174 |
tgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
8257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
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Target Start/End: Complemental strand, 2399 - 2317
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| Q |
177 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt |
258 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2399 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
2317 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:
Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 45198 - 45244
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| Q |
179 |
aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
45198 |
aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
45244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:
Target: scaffold0456; HSP #1
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| Q |
218 |
ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1587 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
1546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456; HSP #2
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| Q |
218 |
ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8732 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
8691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
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Target: scaffold0058; HSP #1
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| Q |
218 |
ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt |
259 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
70348 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt |
70307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:
Target: scaffold0589; HSP #1
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| Q |
218 |
ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt |
258 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8011 |
ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
8051 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:
Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
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218 |
ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt |
258 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3525 |
ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
3565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University